3BF3A

Type iii pantothenate kinase from thermotoga maritima complexed with product phosphopantothenate
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
248
structure length
248
Chain Sequence
MDPMYLLVDVGNTHSVFSITEDGKTFRRWRLSTGVFQTEDELFSHLHPLLGDAMREIKGIGVASVVPTQNTVIERFSQKYFHISPIWVKAKNGCVKWNVKNPSEVGADRVANVVAFVKEYGKNGIIIDMGTATTVDLVVNGSYEGGAILPGFFMMVHSLFRGTAKLPLVEVKPADFVVGKDTEENIRLGVVNGSVYALEGIIGRIKEVYGDLPVVLTGGQSKIVKDMIKHEIFDEDLTIKGVYHFCFG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Thermotoga maritima
publication title Structural basis for substrate binding and the catalytic mechanism of type III pantothenate kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Type III pantothenate kinase
total genus 77
structure length 248
sequence length 248
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2007-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3bf3A01
3.30.420.490 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3bf3A02
1U2VA 2ASOA 4FWLA 3CJAA 2P9KA 2W41A 4BC2A 4CZKA 3LDQA 4BRHA 1BA0A 5TKYA 3CJ1A 4FWKA 1GLDG 3O8MA 3VERA 4NO7A 2VWBA 3WQUA 4WQ4C 1QHAA 2Q31A 1P8ZA 3TU5A 5AQGA 1C0GA 3VETA 2GEMA 4BR7A 2QWNA 3ZEUA 2E1ZA 2OANA 4CD3A 3ZETB 3P4IA 4CZGA 5EOYA 1GLAG 2AP1A 3SJHA 3ZX2A 3VGMA 5JMVA 1X9JA 5AQTA 5AQXA 3IDHA 4LC9B 4NB4A 4CZEA 2Q0UA 3TPQA 3VF2A 2P9IA 4BRLA 3JXUA 3F9MA 4I6MA 4ISGA 5F0XA 4BC5A 4BR0A 1HJOA 2HF3A 2A5XA 3FZKA 3FFKB 3BP8A 2P9PA 3HBTA 3UKRA 4BQZA 5BPLA 5JLFA 5KPTA 4EFHA 3M3ZA 4MLEA 1SZ2A 3LDPA 3KHYA 4GY2B 3R6MA 3D2FB 1KXPA 1NWKA 4CBWA 2GELA 1MDUB 5EY4A 1NGJA 2A40A 1XUPO 3O1BA 2P9UB 3VENA 1HKGA 2GWJA 4H0OA 3BF1A 2NRHA 5AQSA 3DJCA 3LM2A 4IWVA 4B1ZA 2KHOA 5FPEA 4XEIA 5JICA 1U2VB 2P9KB 4ISEA 4XH5A 4JN4A 4EHUA 3UKUA 1MA9B 1ZC6A 3AAQA 3CJBA 1NMDA 3WT0A 5AQZA 3GE1A 4HTLA 4WQ5C 2Q2RA 2FSJA 4FWQA 4M7YA 5AZIA 3LDNA 3H46O 4FOIA 4H0XB 4FWNA 1NGFA 4FL9A 3ENOA 4CZHA 3EZWA 1NGEA 5AQKA 3QBXA 4Y0WA 3VGLA 2YJFA 3L4IA 3WXJA 1YXQA 1BUPA 5KQDA 4BRGA 4BQLA 1YUWA 2FF3B 3QFPA 4B9QA 3HM8A 4CZLA 1U6ZA 2ZGYA 4FWPA 3EO3A 3I33A 3I8BA 3DAWA 1RGIA 2HF4A 1Y64A 4CD1A 2P9IB 3DXMB 2QWOA 1GLFO 4RWTA 4I6MB 2GUPA 2FF6A 3H1VX 3WXIA 3MN9A 1HUXA 4DQ8A 5BRHA 4BR4A 4H0PA 3CIPA 3O4WA 2P9PB 4H0VB 3RSEA 3UKRB 1GLJO 5CE3A 4IJAA 3ATVA 2QWMA 3CERA 1BU6O 1HKCA 4IXCA 3SLCA 2P9LA 3ULEA 4QS7A 1OKJA 5FPNA 2QWLA 1T6DA 1K8KB 3G25A 4BG9A 1ESVA 1E4GT 3W0LA 2E1YA 4DB3A 3CETA 5AQLA 2ITMA 4PKGA 3R9PA 4B1UB 4BG8A 4BRIA 2YHWA 3ZX0A 3EKUA 4CZFA 1GLEG 3WUHA 3GBTA 1GLBG 2Q36A 1Q18A 3GL1A 3UKUB 2I7PA 4MLHA 3LDLA 4GNIA 4DHYA 1TUYA 1MWKA 2I7NA 5LJVA 4JNEA 1NGIA 2J4RA 4YDUC 5AZIB 4IO8A 2IVPA 1LCUA 5E84A 1NGBA 3QDKA 4B1XB 1KAZA 2F9WA 5AQWA 2Q0RA 4B1WB 4BRNA 5EXWA 3DXMA 4BR9A 4BRCA 3JS6A 4CZIA 3IUCA 5F1XA 2UYTA 4H5VA 5KPZA 3O5BA 5I9EB 2VCPA 3FE1A 3MN7A 3CJ9A 1WOQA 4H5WA 4EAHD 4F9OA 1ATNA 1K8KA 5ADXH 3VEZA 1T6CA 4MO5A 4BR2A 3BUZB 5BR9A 3A5OC 3FGUA 2QXLA 1BO5O 2YCHA 5AQIA 4CI6A 4BROA 4BR5A 1TYQA 2D0OA 3A5MC 3RSEB 4EHTA 4FSVA 4WQ4A 3QB0A 5AFUA 1BG3A 1SQKA 4BRMA 1ATSA 3O80A 2P9LB 3QBWA 3ULEB 1Z6RA 3ID8A 3D7EO 1JCGA 1ZBSA 2QWQA 3CQYA 2GTDA 4H5RA 3CI5A 3D2EA 4J8FA 3VPZA 3EN9A 2A3ZA 5AQYA 2A6AA 3MMVA 4Z94A 4RCHA 3EKSA 2CH5A 5LJWA 1QZ5A 2ASMA 3IMXA 1E4FT 5AZJA 3M6GA 4FPAA 3LM9A 4H0TB 4K25A 4KBOA 3VGKA 1J6ZA 5F2RA 4CBUA 4O5FA 2F9TA 3EL2A 3VEVA 1HX1A 3HI0A 1IG8A 3WEEA 3CQXA 3VOVA 3KZBA 3QMLA 2E88A 3MCPA 4BRQA 1HPMA 4FWMA 3L6QA 4PL8A 1KAXA 3ENHA 2CH6A 1CZAN 3GG4A 5BPMA 2E2OA 3U8XA 3IFRA 1SAZA 4L3QA 4FPBA 4WYBA 2CGKA 3FR0A 2NZTA 3R8EA 1H1VA 2D1KA 2FXUA 4JD2A 5B8HA 1T44A 2YHXA 2QWRA 4BGAA 1LOTB 2P9SA 2QWPA 3ZX3A 4WQ5A 3O1WA 1TYQB 1V4TA 5LY3A 5AQVA 1C0FA 4BRAA 5AQMA 1NLVA 5ELZA 1R59O 3C7NA 4CBXA 1X3NA 3FZHA 4FO0A 4H03B 4RTFD 2AA4A 2YJEA 4A2BA 1NGCA 2ASPA 3SMPA 1JCEA 3A5LC 1ATRA 5AQNA 3DXKA 1QQMA 2H3GX 5JLHA 4E1JA 4ISFA 3VEXA 4FWRA 3KVGA 3WXLA 1BA1A 3D2EB 2V7ZA 4MO4A 1EQYA 3BF3A 4XH4A 4JHDA 1D4XA 5FPMA 2IVOA 3HSCA 2V7YA 3FLCO 3B8AX 5KQ8A 2DPNA 3OHRA 2FSKA 3A5NC 4BRFA 2V52B 3VF4A 5E26A 4BVPA 3H3NO 5AZJB 4FOEA 4A2AA 1TUUA 2W40A 1S22A 3J8AA 4M63C 2P9NA 1NGGA 2IIRA 2E8AA 5AFUH 4BGBA 4BREA 1S3XA 3WEEB 1GLCG 2ZGZA 4AM7A 5AQPA 4DCHA 3A8YA 5BRDA 1BWFO 3MN6A 2CGJA 2D4WA 2ZF5O 4C23A 4IZ9A 2BUPA 1QZ6A 3CJ7A 1XC3A 3H45C 3WXKA 4PKHA 3LL3A 4K41A 2A42A 1QQOA 4H5TA 4BVOA 3CJCA 5AQHA 3WQTA 3U9ZA 4JD2B 5KPRA 3VEWA 3M1FA 4BC4A 4HWIA 5AQOA 3H1QA 1NGAA 2P9SB 3FZFA 3U4LA 4CJ7A 4EIAA 1HLUA 4YDUA 2GWKA 5EVZA 1G99A 3U9DA 1ZXOA 2Q97A 2EWSA 4BC3A 3C7NB 4FWOA 3A0IX 1NBWA 2PBDA 4K43A 4M7XA 5AQJA 1BDGA 1WUAA 3DXKB 3BEXA 4QS8A 3ATUA 1DGKN 1NGHA 3AAPA 3FZMA 4BRPA 5AQFA 5BPNA 2A41A 3AY9A 1Z05A 2PAVA 3UB5A 4JHDB 4CZJA 4PKIA 2V51B 4B1YB 5AQQA 2E20A 2WUSA 3VF6A 5ADXA 5BN8A 4JAXA 1NGDA 4K42A 2ZWHA 3S41A 5AQUA 3VEOA 1RDWX 2Q1NA 2IVNA 3VESA 3ZETA 5FPDA 1NM1A 5AR0A 3GDQA 1YVNA 2YHYA 3L0QA 3O08A 4BRDA 3AARA 3SMSA 2P9NB 4QS9A 2BTFA 2E2NA 3FZLA 4XH1A 5BREA 1DKGD 1KAYA 4BRKA 1GLLO 2HOEA 3ZEUB 1YAGA 4B1VA 3HZ6A 4FWSA 3C0BA 3QFUA 2D0PA 4O8KA 2E2PA 3MDQA 3GOIA 1JCFA 5BRFA 2QM1A 1QQNA 2HMPA 3VEYA 4H0YB 1DEJA 4AM6A 4IJNA 2CGLA 3MN5A 3D2FA 1HKBA 5EX5A 5BN9A 2FLOA 2VYPA 1IJJA 2YI1A 3UE5A 2QW9A 1MWMA 3O6WA 3QICA 4H5NA 3CHWA 4A62A 1XQSC 2P9UA 3H3OB 4A61A 3DWLA 3HTVA 2FSNA 5AQRA 3H6EA 3W3DA 3SK3A 2NLXA 1V4SA 1BOTO 1X3MA 4PL7A 1RFQA 2E2QA 3MK6A 3LDOA 4CZMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FWLA 1RBTA 3I8DA 3V4IA 4CZKA 3LDQA 1BA0A 3DLKA 3LPUA 3T3FA 1LWFA 4NXNK 1Q82O 5TKYA 2EHGA 3LALA 3ZSQA 2YV0X 2HBLA 1WAJA 3VERA 3BZKA 3AVAA 4NO7A 3M8SA 3DOLA 3QNNA 4LF5K 3M8QA 1NJWA 3E9PA 1L3SA 1M90O 4L8RB 3T1AA 1P8ZA 5JS1A 1WSFA 3SNNA 3O3FA 3ZETB 3LAKA 4KRFA 3CCLN 1X9SA 4Z4EA 3SJHA 3TSPA 5JMVA 1X9JA 2W6LA 1UA0A 5AQXA 4CHQA 4JI2K 4DFPA 3RR7A 2KFZA 3VF2A 3N4QA 4CEZA 1HNZK 2X78A 4FM2A 4B3MK 3KD5E 4JLHA 2O8DB 2A5XA 3FZKA 3BP8A 3VQQA 3HBTA 2B6AA 3LDPA 3L3UA 3NDKA 4B9MA 4FJKA 4KHNA 1NWKA 1JXBA 4J2DA 5HROA 1XC9A 3VENA 4FJMA 2GWJA 4H0OA 4DR7K 3Q7CA 3K2PA 4FYDA 3ZSXA 3O4QA 2DY4A 1IV0A 3MCAB 1NNEA 4CJKA 4IEIA 3TAQA 2HW3A 4FK0A 5FPEA 2O8FA 4DQQA 3CC7N 3HM9A 4X66K 4HUFA 4BWJA 1NMDA 2ZJPL 3ZLJA 1WAFA 5GADP 3K9JA 1FJGK 3OYMA 5CHIA 3LDNA 4CJVA 2PZSA 2PYJA 4FWNA 3SQ4A 4CZHA 4KHUA 3JAMO 5SWMA 4Z4IA 4Y0WA 2F8SA 1DTQA 3SQ1A 1L5UA 3WXJA 1YXQA 1BUPA 1NK9A 4BRGA 2ZGYA 4FWPA 2VGNA 1RT7A 4DWIA 4HCBA 4CD1A 3K9KA 1GLFO 4N5SA 4WFBL 2GUPA 5JVGL 3CC4N 1WLJA 4CHNA 3LWLA 3ZT4A 3J7ZO 4HCCA 4KPYA 4H0VB 1VSKA 3RSEA 4FJGA 3HT3A 1GLJO 5CE3A 4DFKA 4IJAA 4GW6A 2QWMA 4CEDA 4C8OA 2HBJA 4GV6A 4IOCL 5JVHL 1FK9A 4O55A 4ID1A 2P5OA 1E4GT 1RBUA 4E3SA 2A1SA 3AVKA 4JI6K 5E41A 1YF5L 4PKGA 2QXFA 4CJQA 3IKMA 3KK7A 3V9ZA 2O8FB 1J5OA 1BIZA 4CZFA 2VG6A 4LFCK 3WUHA 1GLBG 3GL1A 4QCLA 1CLQA 4GNIA 3LDLA 1TUYA 2I7NA 1EX4A 1QSSA 1D5AA 2EX3A 5KGXA 5HRRA 1LCUA 1NGBA 2QEXN 3R3LA 4B1XB 2F9WA 4BRNA 2Q0RA 3DXMA 5IWAK 2KLAA 4BRCA 4G1QA 4DSJA 3IUCA 4DTJA 2RE2A 1RCHA 3VA3A 2ETJA 2VCPA 4BY9C 4N56A 2OCEA 3MN7A 4KI4A 1ZBLA 2DFHA 1WOQA 1QHTA 4H5WA 4OKKA 1ATNA 5I42A 1S1UA 2Z1GA 4AILC 1K8KA 4BR2A 1EWRA 4CI6A 2QXLA 1BO5O 2YCHA 1NK6A 4BR5A 3HK2A 1TYQA 2D0OA 3C6TA 3CCSN 3RSEB 4EHTA 3QB0A 5KGWA 3O80A 5M1QA 2QI2A 4CJFA 4FJLA 3M5RA 3AA2A 1JCGA 3LPTA 3LZJA 2F8TA 4KV8A 5GAGP 2AJQA 1TKXA 1HYSA 3LP2A 4C8KA 4CJEA 4FJIA 3AVJA 3ULDA 1RTHA 1X9MA 4UQGA 4EP5A 2BGGA 1LW0A 3MMVA 2VQEK 3S3MA 4DU1A 1IKWA 3A2FA 4M41A 1IBLK 4K25A 4KBOA 3VGKA 3E9LA 3EE8A 5M1FA 4E7IA 1BQMA 2FBTA 4DTUA 3CFRA 1EWQA 2E88A 4BRQA 1NJIO 4PL8A 4ZTJA 3WNHA 3RMAA 3ENHA 2IAJA 2B5JA 1RT2A 5BPMA 2E2OA 4N41A 4NCGA 3D0PA 3T1YK 1S1VA 3V1RA 4L3QA 4FPBA 4KHYA 4WYBA 1EXQA 2HMIA 5B8HA 3L2RA 1HNWK 1T44A 4CFDA 2YHXA 4RG8A 2QWRA 1LOTB 1KTQA 4DTOA 5FDLA 3NH1A 4GKKK 3MAQA 1TYQB 2HHSA 2GBZA 3QIOA 3OYJA 4OKJA 3CCMN 4F3TA 2ASPA 3SMPA 4LF6K 4CJUA 3DXKA 1OH7A 2P1JA 4N76A 4DSEA 3PIOL 1BA1A 2E6MA 2V7ZA 1EQYA 4KTWA 1OH8A 3M8PA 5GIPA 2IS3A 2IVOA 2V7YA 2E6LA 4HUEA 2ATQA 3J7YP 4KTQA 4G9ZA 4Z0UA 3VF4A 4AHRA 3TTDA 2Q3SA 4JKAA 3MXIA 1VQ8N 1HQEA 3SAGA 5CYQA 4E7HA 2OTLN 1XNRK 4M63C 1NGGA 1BQNA 2E8AA 5AFUH 4C8MA 1HYZA 1S3XA 1Z25A 2ZGZA 4AM7A 4DV2K 2YHAA 1C0TA 3A8YA 2HHQA 4I9LA 3MN6A 5M1NA 2RKIA 3PSIA 2D4WA 2UXDK 2WBNA 3CJ7A 2OZSA 4R5PA 3OYEA 5HLFA 1S9EA 4M3ZA 3NF8A 1FKOA 4CHOA 1VSEA 3CCVN 1S72N 3OW2M 3TAFA 1SUQA 3K59A 1QVFM 2O8CA 3U4LA 4OGCA 5C10A 4YDUA 1G99A 3U9DA 2Q97A 4FWOA 4M7XA 4M3XA 3THWA 3DXKB 4DQRA 4QS8A 3ATUA 1UOCA 1NGHA 4BRPA 5AQFA 4XIUA 1SKSA 3OYNA 4PKIA 2V51B 4LFAK 4WF9L 1QE1A 3DLHA 4JAXA 3CFPA 4K42A 5FRNA 4JI7K 3RMDA 5AQUA 1W97L 2Q1NA 3VESA 3AA3A 3L0QA 3O08A 4B3SK 3AARA 1A5VA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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