1NGEA

Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein atp hydrolytic activity, ii. structure of the active site with adp or atp bound to wild type and mutant atpase fragment
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFSLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
publication title Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment.
pubmed rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Hydrolase(acting on acid anhydrides)
total genus 125
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 1994-05-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1ngeA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngeA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngeA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1ngeA04
4FWKA 1GLLO 2GWJA 4BREA 2ASPA 2FLOA 4H0XB 4HTLA 4CZGA 3O08A 2FSJA 4EFHA 4A2BA 1MDUB 5KPRA 4JD2B 4ISFA 3P4IA 1ATNA 3FZFA 1U2VB 5AQNA 2P9SA 4FL9A 3FZLA 4BRMA 4GNIA 3GDQA 2E1ZA 2IIRA 4M63C 4BC3A 3HI0A 3QFPA 5AQGA 3HSCA 1OKJA 2FSKA 1X3NA 2A6AA 2KHOA 3DXMA 5I9EB 1GLEG 4H03B 5BPMA 2Q31A 2ZGZA 3KHYA 2P9NB 3LDNA 5AQQA 3EZWA 4MLEA 1HJOA 3O4WA 3AAPA 5BR9A 2CGJA 3VERA 2NLXA 1NMDA 4BRCA 3O1WA 3IUCA 3EKSA 3H3NO 3RSEA 3LM9A 5F1XA 3AY9A 3HZ6A 2E2OA 3HTVA 5BRHA 1Z6RA 3A5NC 4CZMA 4KBOA 5EVZA 3BF1A 4LC9B 1EQYA 4EAHD 1NGBA 2E8AA 5AQPA 3EN9A 3H45C 4YDUC 4CJ7A 5B8HA 4CZHA 2E2QA 5AQSA 3MCPA 2A40A 4K25A 3M1FA 3WUHA 3GOIA 1GLAG 4H0YB 2GWKA 1TYQA 4YDUA 4ISEA 3BP8A 3QBXA 5AZJB 1GLJO 1HPMA 3ZX2A 1X3MA 4BC5A 5TKYA 4H5WA 2H3GX 1NGFA 1DEJA 1Y64A 4Y0WA 4WQ5C 3O8MA 3ZEUA 3TU5A 3CHWA 3IMXA 4FWPA 1QZ6A 1R59O 4CD3A 4O8KA 3CJ7A 4CZLA 1S3XA 1D4XA 3U9ZA 1QQNA 4WQ5A 3H6EA 4DQ8A 5AFUA 2V7ZA 4FWSA 1NLVA 2VCPA 4BROA 4BG8A 3VEXA 1X9JA 4XEIA 2QWQA 2E2NA 2P9KA 2P9UA 2CH5A 5BRDA 3UKRA 5EXWA 3D7EO 3FZMA 2PBDA 4MO5A 4O5FA 3WXLA 4JAXA 4JHDB 1JCGA 1YVNA 3SLCA 1NGAA 1C0FA 2E88A 3CJAA 3G25A 4FPAA 5KPTA 4BRNA 1HX1A 3WEEA 4EHUA 4GY2B 4BG9A 3FE1A 1CZAN 3W3DA 4AM6A 2A42A 3A0IX 2BUPA 2HOEA 1GLBG 4WQ4C 3ULEA 5BRFA 3UKUB 3MN6A 3ENHA 4PKGA 3WXKA 1E4GT 2YJEA 2YI1A 3KZBA 5AQFA 3MN5A 4WQ4A 4B1VA 3D2EB 3HM8A 1JCEA 1U6ZA 2FSNA 1BOTO 1DGKN 2EWSA 3AARA 4CZIA 2ZWHA 5AQVA 3CQXA 5AQKA 3C7NA 1GLCG 4CZEA 3C0BA 2PAVA 3H1VX 4PL7A 3QMLA 5AQIA 2YCHA 3U4LA 2P9PA 3VF6A 2Q36A 3LDOA 2NRHA 4PKHA 2HF3A 2AP1A 4NB4A 4BRFA 5CE3A 4K43A 2F9TA 2DPNA 2FXUA 4B1WB 5AQHA 2AA4A 3DXMB 4BRDA 1SAZA 2A5XA 2A41A 3CJ1A 4K42A 3AAQA 4BQLA 2QWOA 4PKIA 2E2PA 1XUPO 3FFKB 1S22A 1ESVA 3VETA 1BWFO 3HBTA 3B8AX 5F0XA 3LDPA 4HWIA 4IXCA 2QWMA 2CGKA 4BR9A 3WQUA 3CI5A 3O5BA 3QBWA 5AQRA 3SK3A 2QWPA 1QQMA 1HKBA 1E4FT 2CGLA 1ZXOA 4I6MA 5LJWA 3WQTA 4FOEA 4BGAA 1IJJA 3L6QA 4JD2A 1HUXA 4NO7A 3LDQA 2VWBA 3ZX0A 2D4WA 4PL8A 5AQXA 5BREA 1U2VA 1TYQB 3EL2A 1BUPA 3UB5A 4A2AA 2Q1NA 1NGEA 2P9IB 4IWVA 3EKUA 4DHYA 2W41A 3D2FB 5AQUA 3DJCA 4B1UB 4DCHA 3ZETA 3MDQA 1T6CA 4CZKA 4BR7A 3ZEUB 4FSVA 2QXLA 2P9NA 1NGCA 4QS8A 3BEXA 3ATVA 3A5OC 1BG3A 3R8EA 4BR5A 2QWLA 3QFUA 3CJCA 3DWLA 2Q0UA 5AFUH 4FWQA 3IFRA 1NWKA 3VGLA 2CH6A 3M6GA 5AZIB 4BRQA 2Q97A 4BGBA 3H46O 2P9KB 2D0PA 2V52B 5JLFA 4FWRA 1V4SA 3VEZA 2D0OA 3DXKB 4H5VA 1KAZA 2ZGYA 1H1VA 2VYPA 1IG8A 1K8KA 3KVGA 4BVPA 1YUWA 4MO4A 1ATSA 3L4IA 5FPEA 3A8YA 1C0GA 1V4TA 2IVPA 3SJHA 4K41A 4F9OA 4Z94A 1SQKA 3VEYA 5AQYA 3F9MA 4FWNA 3VF4A 5AZJA 1YXQA 1TUUA 4BRIA 2HF4A 2QW9A 4C23A 3ULEB 3VPZA 1NM1A 3ATUA 3O1BA 1G99A 4B1XB 1RFQA 4H5TA 5FPNA 3SMSA 1KAXA 2YHWA 4BC2A 2GTDA 3I33A 3I8BA 4H0PA 1DKGD 5AQMA 2NZTA 1BDGA 2Q0RA 4H5NA 3GE1A 5ADXA 2QWNA 1T6DA 4QS7A 1RGIA 5AQTA 2IVNA 3QDKA 3VEOA 3FZKA 4FOIA 4RCHA 4RWTA 1WOQA 2HMPA 3VOVA 4FWMA 2P9LA 3LL3A 4M7XA 2ITMA 3FGUA 3LDLA 1ZC6A 2P9PB 4BRGA 4JNEA 1NGHA 2I7PA 4FO0A 3JS6A 1KXPA 2P9SB 3MN7A 3BUZB 4IJAA 4M7YA 3QICA 4MLHA 1QHAA 1NGJA 2ASMA 1KAYA 3CJ9A 2FF6A 2ASOA 3FZHA 1HKCA 5LY3A 1LCUA 3CIPA 1BO5O 2IVOA 3UKUA 1MA9B 5ELZA 4H5RA 3CQYA 4H0TB 5KPZA 3O6WA 4B9QA 4BR2A 3QB0A 2OANA 4I6MB 3D2EA 3JXUA 3RSEB 1MWKA 2BTFA 5AQLA 1JCFA 4AM7A 2V51B 4RTFD 2A3ZA 5JICA 3UE5A 5EX5A 2W40A 5EY4A 3CJBA 4BRKA 4DB3A 2WUSA 4BR4A 3L0QA 3J8AA 4CI6A 3ID8A 1T44A 2YHXA 3IDHA 5E84A 2UYTA 5AR0A 1BA1A 3ZX3A 4IO8A 3ZETB 1YAGA 5BPNA 5E26A 1P8ZA 4H0VB 3GL1A 5KQDA 4A62A 1TUYA 4QS9A 4BRAA 5AQOA 5JLHA 4FWOA 1WUAA 3VENA 1SZ2A 4BR0A 3WXIA 4CBUA 3GG4A 5LJVA 4B1ZA 3WXJA 3OHRA 5FPMA 1QQOA 1J6ZA 3A5LC 3H1QA 2ZF5O 2J4RA 5BN8A 4BC4A 3ENOA 3W0LA 1GLFO 1K8KB 4CBXA 1RDWX 2I7NA 5BN9A 2P9UB 3BF3A 1HKGA 5AQZA 4IZ9A 3UKRB 2GEMA 1GLDG 1HLUA 1BA0A 2P9IA 2YHYA 3D2FA 4H0OA 4E1JA 3WEEB 1XQSC 3VGKA 3M3ZA 2E1YA 4FPBA 3MMVA 1QZ5A 3MN9A 4L3QA 4BRHA 2D1KA 4EIAA 4CBWA 4JN4A 5ADXH 3CERA 3VF2A 3H3OB 4XH4A 4BQZA 5FPDA 3LM2A 2V7YA 4EHTA 1NGIA 1MWMA 3VEVA 4A61A 4BRPA 5KQ8A 1XC3A 2P9LB 5JMVA 3FR0A 3EO3A 3WT0A 1Q18A 2YJFA 5AZIA 1NGDA 3VGMA 1NBWA 1Z05A 5BPLA 1ATRA 3CETA 3SMPA 2FF3B 4IJNA 2GELA 3O80A 4J8FA 3MK6A 3C7NB 3TPQA 3R6MA 5F2RA 4B1YB 3DXKA 3DAWA 3R9PA 5AQJA 3VESA 4XH1A 4WYBA 1NGGA 4CZFA 2F9WA 5EOYA 3U8XA 4XH5A 1BU6O 4JHDA 2E20A 2QM1A 3VEWA 1ZBSA 4ISGA 4CD1A 1LOTB 2GUPA 5AQWA 3U9DA 3FLCO 2Q2RA 4BVOA 3S41A 4BRLA 3A5MC 4CZJA 4FWLA 2QWRA 3GBTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GLLO 4BREA 3M5RA 1ZBFA 2HW3A 4H0XB 4CZGA 4CJRA 3DLHA 5KRSA 4B9MA 3ITHA 3RMBA 4UAEF 1LQQA 5AQNA 2P9SA 1K8AO 2ITGA 5C2DA 3GDQA 3HI0A 3QERA 4B9SA 5AQGA 4ZTFA 3HSCA 4B9UA 2FSKA 1L3TA 1BL3A 5C25A 5BPMA 4DQIA 1SUQA 2WOMA 2YEOA 3DRSA 3EZWA 4FLVA 1XMQK 1ASWA 4GV3A 3AAPA 5BR9A 4WF9L 1FK9A 3VERA 1L3VA 3O1WA 3SNNA 3VQCA 3IUCA 4M3UA 1U04A 1X9WA 3RSEA 1RBUA 1QHTA 5LMNK 4DTJA 3AY9A 5KTQA 5CHIA 5C15A 3A5NC 4KRFA 1U49A 1LQIA 5EVZA 4LC9B 1NGBA 4X65K 3EN9A 3H45C 4YDUC 2FBTA 4ZHRA 4CZHA 3NH1A 4CIGA 3TAEA 2O4IA 3M1FA 3GOIA 4CFDA 3KOXA 4HHFA 1NK6A 4YDUA 1RT5A 4KHYA 5AZJB 1HPMA 3TARA 4LF6K 3DMJA 5JS2A 3V1QA 1RT6A 1X3MA 3CFOA 3TTDA 5TKYA 4Y0WA 1GOCA 3AVLA 3TU5A 1WNSA 3IMXA 4IFVA 4CD3A 2YBRC 3ZSYA 4U67L 5C12A 3CJ7A 2GX9A 3ZT1A 1BI4A 2O8FA 3H6EA 2HVHA 1T7EA 4DQ8A 2LY5A 2DTUA 2V7ZA 1NLVA 4BROA 1NK9A 4BG8A 3M8PA 3DLEA 4CEOA 2O8CB 2P9KA 3V9SA 2P9UA 2CH5A 4FJMA 3G4SN 3ZT3A 4YY3K 1QS4A 5AJ3K 3CJAA 4JS5A 4BRNA 3ALYA 4EHUA 3V1OA 1YITN 3FE1A 1CZAN 1HQUA 4AM6A 2HOEA 1GLBG 5BRFA 1D8YA 1BK8A 4I9QA 4JEPA 4ICLA 1E4GT 2XHBA 2YJEA 4LFCK 1ZBLA 3QIPA 1KCFA 3MN5A 2OYQA 1U6ZA 3VQ4A 1BOTO 1DGKN 4RG8A 4E7IA 3DLGA 5AQVA 4JV5K 3CQXA 1GLCG 3H1VX 3OYKA 2E5LK 2A1SA 3U4LA 3JAMO 1NU0A 2Q36A 3LDOA 3SUNA 2NRHA 4PKHA 1YTUA 4K43A 3PY8A 2LJMA 2DPNA 4B1WB 4BRDA 1YJWN 4E1NA 3LPUA 3CJ1A 3C95A 1S1TA 4K42A 3VQAA 2QWOA 3EEQA 2N2RA 5F0XA 2DFEA 3RMAA 4JI7K 2QWMA 3NHGA 1T8EA 2KJAA 4BE0A 1S1XA 1OH6A 4KHWA 1KQSM 2HHSA 3SPZA 4V19S 3J7ZO 3P5JA 1K8BA 1KC8O 1SN4A 4DTMA 2YHAA 5IWAK 1GPTA 5LJWA 4HVJA 1X9MA 1B3CA 2PFUA 4PL8A 5BREA 1LV5A 4FZYA 2JDQD 1IKYA 2Q1NA 1NNEA 4W5QA 2PYLA 4B3SK 2NY9X 1VQ4N 3D2FB 1S6PA 1DQ7A 1XI1A 3KC6A 4C8KA 4CZKA 3J7YP 2G8FA 1ZYWA 4QS8A 3ZT0A 1YF5L 3A5OC 3J80O 3L2QA 4BR5A 4MDBA 3QFUA 3S5TA 1BCGA 1OMYA 2F8SA 1BIUA 3UIQA 3PSFA 1RILA 3OW2M 4Z4EA 3TSUA 4CJVA 2NUBA 5AZIB 3KHWA 2Q97A 4BGBA 5K14A 3H46O 3QEWA 2V52B 3O3GA 4RW9A 1J54A 5GINA 3VEZA 3TSPA 5EU7A 3ISNC 1ILYA 1H1VA 1LAVA 3L4IA 1C0GA 3BK3C 2X6SA 5AZJA 3KLGA 1RT3A 3KKRA 4G1QA 2QW9A 2VGNA 3ULEB 4C23A 3VPZA 2G8VA 1G99A 3SAGA 4IEIA 2UU9K 2PYJA 3CM6A 1AYJA 1LQHA 2NZTA 1JLGA 1WN7A 3KOYA 1RGIA 5GIOA 3VEOA 1VQPN 3K0SA 4ELVA 4KKOA 4CEBA 3DLKA 3TAGA 5CYMA 3LDLA 2HHTA 2RKIA 4U7BA 4BRGA 2O8CA 5IT9O 1NKBA 4M7YA 2D56A 1M90O 4MLHA 1NGJA 3CJ9A 2F7TA 3L2UA 3SZ2A 4Z0UA 1N5YA 4R5PA 4XIUA 3OS1A 1C1BA 2YHBA 3MX2A 4PHTX 1RDCA 2EX3A 4H0TB 1I2VA 3O6WA 3AO2A 4BDZA 4I6MB 4PY5A 4EP5A 2O8EB 3U3YA 4C1NK 3K5MA 3CFRA 2V51B 3UE5A 5EX5A 2RF2A 4DB3A 4DTXA 2KW4A 4BR4A 3L0QA 3VQ9A 4CI6A 4A57A 1S1WA 2VGMA 2KBKA 3OBWA 5E84A 1I2UA 1NJYA 3ZSVA 1Q86O 3LAMA 2FBYA 3ZX3A 4IO8A 1TAQA 4MFBA 3M8SA 3EYZA 4C8LA 4CJ4A 4DSKA 1WT7A 4PUOA 3G71N 2XRIA 1TUYA 3NFAA 1YVUA 5JLHA 4FK2A 4FWOA 4F2RA 4GV9A 3QEVA 3F5TA 3WXIA 4AHTA 4B1ZA 3OHRA 3RR7A 4FLYA 1J6ZA 1A5WA 1SS6A 2ZF5O 4FZZA 3WNGA 3JYTA 4KHPK 4WFBL 1UWBA 1VNAA 4DR1K 3IRXA 4FJHA 3WXMB 3ENOA 4BC4A 3RMDA 3KLFA 3SCXA 3SPYA 3NF7A 3S3OA 2P51A 4IZ9A 3IG1A 4CGJA 4G9ZA 3WNFA 4F3OA 4JK8A 4BWMA 4DV0K 1BA0A 3AVHA 5DK5A 1OH8A 1NJXA 3IKMA 1S1VA 3AO5A 3D2FA 3VTIA 1IBKK 1HNIA 4I2QA 2D1KA 4RW6A 5ADXH 3CERA 3VF2A 2BDPA 3H3OB 4XH4A 2IOCA 1G15A 4EHTA 2P9LB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1GLL O;  4BRE A;  3M5R A;  1ZBF A;  2HW3 A;  4H0X B;  4CZG A;  4CJR A;  3DLH A;  5KRS A;  4B9M A;  3ITH A;  3RMB A;  4UAE F;  1LQQ A;  5AQN A;  2P9S A;  1K8A O;  2ITG A;  5C2D A;  3GDQ A;  3HI0 A;  3QER A;  4B9S A;  5AQG A;  4ZTF A;  3HSC A;  4B9U A;  2FSK A;  1L3T A;  1BL3 A;  5C25 A;  5BPM A;  4DQI A;  1SUQ A;  2WOM A;  2YEO A;  3DRS A;  3EZW A;  4FLV A;  1XMQ K;  1ASW A;  4GV3 A;  3AAP A;  5BR9 A;  4WF9 L;  1FK9 A;  3VER A;  1L3V A;  3O1W A;  3SNN A;  3VQC A;  3IUC A;  4M3U A;  1U04 A;  1X9W A;  3RSE A;  1RBU A;  1QHT A;  5LMN K;  4DTJ A;  3AY9 A;  5KTQ A;  5CHI A;  5C15 A;  3A5N C;  4KRF A;  1U49 A;  1LQI A;  5EVZ A;  4LC9 B;  1NGB A;  4X65 K;  3EN9 A;  3H45 C;  4YDU C;  2FBT A;  4ZHR A;  4CZH A;  3NH1 A;  4CIG A;  3TAE A;  2O4I A;  3M1F A;  3GOI A;  4CFD A;  3KOX A;  4HHF A;  1NK6 A;  4YDU A;  1RT5 A;  4KHY A;  5AZJ B;  1HPM A;  3TAR A;  4LF6 K;  3DMJ A;  5JS2 A;  3V1Q A;  1RT6 A;  1X3M A;  3CFO A;  3TTD A;  5TKY A;  4Y0W A;  1GOC A;  3AVL A;  3TU5 A;  1WNS A;  3IMX A;  4IFV A;  4CD3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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