1NGEA

Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein atp hydrolytic activity, ii. structure of the active site with adp or atp bound to wild type and mutant atpase fragment
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFSLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(acting on acid anhydrides)
molecule keywords HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
publication title Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment.
pubmed rcsb
source organism Bos taurus
total genus 125
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 1994-05-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1ngeA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngeA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngeA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1ngeA04
2PAVA 4GY2B 1NGDA 3ZX3A 5FPEA 3H46O 1IJJA 2F9TA 3FLCO 1Z6RA 3H6EA 4BC3A 5AQWA 1BA1A 4K43A 3W3DA 3WUHA 1J6ZA 3WEEB 5FPNA 2OANA 1BDGA 2P9UA 2A40A 1MWMA 3O1BA 3CJCA 3F9MA 4WQ4C 4I6MB 4IZ9A 3U9DA 4DCHA 4K25A 2E88A 3BUZB 3MDQA 1BUPA 4AM6A 4B9QA 4JD2A 2CGJA 4BR7A 3RSEB 3D7EO 4K42A 1ZXOA 1OKJA 3WEEA 2YHXA 2YCHA 3A0IX 4XH4A 3VPZA 1RGIA 3LDQA 1YXQA 3VOVA 4KBOA 2NRHA 5ADXH 3VENA 4BGAA 2E2NA 5E84A 3RSEA 1HJOA 4MLHA 1GLAG 2GEMA 4CJ7A 1NGBA 4BRHA 2ZF5O 4IO8A 1WOQA 4CZHA 3GDQA 2FXUA 1IG8A 4DHYA 2V51B 3D2FB 1Z05A 4A2AA 4A62A 4IJAA 4WQ5A 2V7ZA 4B1VA 3U9ZA 4BRGA 3WQTA 3AAPA 5AQSA 1T6CA 1RFQA 4ISEA 4CZJA 3A5LC 1DGKN 4FOIA 4BQLA 1NM1A 3BP8A 4F9OA 1C0GA 4FPAA 2Q36A 5AR0A 2CH6A 3IFRA 3H3NO 2GELA 3J8AA 4FWLA 5BPLA 1HX1A 1G99A 5F1XA 1QQMA 2GTDA 2BUPA 3LDPA 2P9KB 4CZEA 4DB3A 4BG8A 3QMLA 2GUPA 5JLHA 3MN5A 1QQOA 4A61A 3FZFA 5AQNA 5AQUA 3AY9A 3LDOA 3CJAA 3GL1A 3FFKB 4BGBA 3VEYA 4BC5A 1E4FT 2W41A 4B1YB 1NWKA 1X9JA 2AA4A 2P9KA 4FWRA 3QBXA 4BG9A 3ATUA 1U2VB 3H1QA 1GLLO 3ULEA 4H0TB 1NGFA 3LDNA 5JMVA 3HTVA 2QWNA 4BR9A 3HM8A 4Z94A 3EN9A 4LC9B 3O5BA 1X3MA 5AQHA 3JS6A 3UE5A 3ZX2A 5AQRA 4H0VB 2E8AA 2NLXA 3CIPA 3D2EB 2P9IB 4BR4A 4HWIA 1XC3A 2Q2RA 4PL7A 4CZMA 5BRDA 3VF6A 3KZBA 1KAZA 3DXKA 5AZIB 2FSKA 2P9PA 5KPRA 2AP1A 3UKUA 3QICA 3WXLA 1NBWA 3ZX0A 1C0FA 2HOEA 3R6MA 4JHDA 3FZKA 4CBWA 5BREA 1EQYA 2FSNA 3WXJA 4EFHA 4WQ4A 3FZLA 5AQFA 5AZIA 3SK3A 3CERA 3M6GA 1X3NA 5ELZA 1QQNA 4H0OA 3CJBA 4CZFA 5EX5A 4H0XB 2Q1NA 4BRCA 3GBTA 3G25A 2ASOA 4CBXA 1MA9B 2E1ZA 1BU6O 3SMPA 2E2QA 5AQOA 4FO0A 2P9LB 1NGAA 3KVGA 2E2OA 5FPDA 3MN7A 1YVNA 1S3XA 5AQYA 2A41A 4RWTA 5AQIA 2Q97A 4CD3A 1KAYA 3FR0A 3MN6A 1K8KB 2IVOA 2IVPA 4RCHA 5FPMA 1ATNA 3FE1A 4J8FA 4H5RA 3ID8A 4I6MA 4BROA 4BRKA 4H0PA 2DPNA 2FF6A 3CQXA 1SZ2A 4XEIA 4CI6A 4B1UB 1K8KA 3CJ7A 5AZJB 2IVNA 4FL9A 4NB4A 4YDUC 2ITMA 1MDUB 2A5XA 3R8EA 2FLOA 5F2RA 3CJ9A 2CH5A 3TPQA 3U8XA 1NGCA 2QWPA 1DEJA 4FWOA 3ATVA 4IXCA 3DXMB 2KHOA 1BG3A 5BN9A 3B8AX 2VCPA 4PKHA 3UB5A 3VF2A 3D2FA 4CZIA 2V7YA 4PL8A 1GLCG 2D4WA 2HMPA 1DKGD 1H1VA 2E20A 2VYPA 1ATSA 1V4SA 3BF1A 3EL2A 4BRQA 3M3ZA 3VEZA 3EO3A 2YJEA 1P8ZA 2FF3B 5BRFA 4FSVA 3C7NB 1U6ZA 3FZHA 1QZ6A 5LJWA 2E2PA 5LY3A 3VETA 4BR2A 5KPTA 4BVOA 3P4IA 5BR9A 2VWBA 1GLFO 1SAZA 4B1WB 1NGEA 1MWKA 5E26A 3L0QA 4DQ8A 4JAXA 4EAHD 4BRLA 1BO5O 3CETA 2P9SB 5AQMA 4BRPA 1NGJA 3AAQA 3UKRB 2CGLA 1NLVA 3CI5A 3IMXA 4QS8A 2I7PA 4M63C 3ZEUB 2ZWHA 2NZTA 4K41A 4M7XA 1TUUA 3I8BA 3MN9A 4FWSA 3CQYA 3KHYA 4FWMA 3QDKA 5AQGA 4BC4A 4JN4A 2UYTA 2D0OA 1HLUA 3ZEUA 5AQLA 1U2VA 1WUAA 2H3GX 1NMDA 1NGHA 4MO5A 4CD1A 5AQXA 1TYQB 4BREA 3O08A 1GLBG 3MK6A 5BPMA 5KPZA 3D2EA 2P9IA 4IWVA 3HSCA 5EXWA 1YAGA 2QWMA 3QFPA 5AQKA 3GE1A 5EVZA 1GLJO 2BTFA 4BQZA 4BRNA 3VEVA 4BVPA 1ATRA 3CJ1A 2Q0RA 4PKGA 2EWSA 4NO7A 5AQZA 3VGLA 4EHTA 2ASMA 3AARA 3O8MA 2YJFA 3ENHA 1KXPA 2D0PA 3QB0A 2QWOA 1BWFO 3WXIA 2YI1A 4JNEA 3BF3A 5AQQA 2QM1A 3A8YA 4FOEA 4FWPA 5AQPA 2QWLA 2IIRA 2HF4A 3WQUA 2A3ZA 3GG4A 4JD2B 3C0BA 5TKYA 3VEWA 5KQ8A 2P9LA 4L3QA 4M7YA 3IUCA 2Q31A 4BR0A 2QXLA 2ASPA 3H1VX 3HZ6A 4YDUA 3ZETB 4XH1A 4QS9A 3DWLA 5EOYA 3LM2A 4ISGA 4BRMA 1NGGA 4H5NA 1D4XA 3HI0A 4PKIA 3SMSA 4FWNA 3VEOA 5KQDA 3ENOA 1Y64A 3S41A 1R59O 4H5WA 2E1YA 2Q0UA 5JLFA 3BEXA 3LM9A 5F0XA 4E1JA 3A5NC 1HPMA 1GLEG 2YHWA 1JCFA 3VF4A 4MO4A 5BRHA 3FGUA 5JICA 1JCEA 3ZETA 4A2BA 2QWQA 3HBTA 3JXUA 2GWJA 3CHWA 2YHYA 1HKCA 3M1FA 1E4GT 3DJCA 3SLCA 1XQSC 1ZC6A 2FSJA 3LL3A 5CE3A 4B1ZA 5I9EB 4C23A 2D1KA 4BRAA 5AZJA 4QS7A 3A5MC 2QWRA 4FWKA 4H0YB 3EKSA 4BRFA 5LJVA 2WUSA 3QFUA 4H5TA 2ZGYA 4EIAA 4BR5A 1T44A 3DXMA 1ZBSA 1GLDG 3VERA 3LDLA 5AQJA 4CBUA 1NGIA 1ESVA 2F9WA 5AQVA 3MCPA 1TUYA 1BOTO 1CZAN 3FZMA 4IJNA 3QBWA 5AFUA 4FPBA 1XUPO 1HKGA 4H03B 3U4LA 3WXKA 4ISFA 2CGKA 3C7NA 3L4IA 3VGMA 4WQ5C 1KAXA 1QZ5A 2A6AA 3IDHA 4FWQA 3EZWA 3VGKA 5EY4A 1QHAA 3O80A 4MLEA 3WT0A 2P9NB 3W0LA 3VEXA 2PBDA 3ULEB 4H5VA 5AQTA 2P9SA 4WYBA 4AM7A 2GWKA 3UKRA 4CZGA 1RDWX 1SQKA 1T6DA 3O4WA 2V52B 4GNIA 1JCGA 4B1XB 1Q18A 3EKUA 1LCUA 2P9NA 1V4TA 3I33A 2ZGZA 4HTLA 1HKBA 2J4RA 3DXKB 5BPNA 3H3OB 5AFUH 3R9PA 2P9PB 2W40A 3MMVA 3UKUB 1BA0A 3A5OC 3L6QA 3SJHA 3GOIA 4JHDB 1TYQA 3OHRA 4O5FA 4Y0WA 5BN8A 4EHUA 3O6WA 1LOTB 3VESA 4BRDA 2I7NA 4CZKA 4O8KA 4BC2A 3TU5A 2A42A 3DAWA 2QW9A 3H45C 4CZLA 1YUWA 4BRIA 4RTFD 1S22A 3O1WA 2HF3A 2P9UB 5B8HA 5ADXA 1HUXA 4XH5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2PAVA 4GY2B 2GV9A 1YT3A 5FPEA 3H46O 5C24A 1VSMA 4DR7K 3HP9A 4AHSA 1YITN 2GBZA 5HOOA 1WSHA 2A1SA 2P9UA 3K0SA 4KHYA 2A40A 1MWMA 2KKZA 2WOMA 1YIJN 1HQUA 2ZD1A 2YNHA 4DV7K 4FLYA 4DTPA 3CMEN 3NGIA 1KLNA 2OPRA 4DCHA 3MDQA 3VTIA 1BUPA 4FW2A 4BR7A 2O4IA 3K59A 2JLEA 4K42A 1RTHA 1OKJA 2KSKA 3CCSN 3G0ZA 4XH4A 1TGOA 4HHTA 1X9SA 2OPSA 3O9UA 3THXB 1C1BA 4N76A 2NRHA 5ADXH 3CYMA 3EY1A 4BGAA 5KRSA 3RSEA 1HJOA 3AVFA 4MLHA 3CG7A 2GEMA 3PY8A 3VQ6A 1NJIO 4E7KA 4AHVA 5D3GA 2ZF5O 3O9SA 3TAQA 3DMJA 4Q5VA 1FXXA 4DHYA 2V51B 3D2FB 4CFDA 1LWEA 4IJAA 4DQPA 2QA4N 2KJAA 2N69A 3DLEA 4DMNA 2WFBA 3PX0A 4RW8A 4E0DA 1IV0A 2KPYA 1Z25A 1KV0A 1T6CA 4ISEA 4E19A 1WT7A 4UAFE 1NPIA 4TSXA 3A5LC 1N6QA 4XJXA 1DGKN 4BQLA 1NM1A 4F9OA 3RMBA 4DWIA 4DV6K 4FLUA 4Z0UA 2Q36A 5AJ3K 2CH6A 4CF9A 2GELA 1L3SA 3CC7N 2UXCK 1G99A 3CCRN 2KFZA 3LDPA 2P9KB 3NDKA 3QEVA 4BG8A 3FZFA 5AQNA 5CHIA 3NGZA 3HM9A 3QERA 4IFVA 1ZBIA 3FFKB 1LQHA 1E4FT 1X9JA 1I2VA 1RBUA 1NJWA 4FWRA 3Q7BA 1QSYA 1XMQK 4BG9A 3H1QA 2G8UA 4CJRA 3IG1A 5JMVA 2LY5A 4BR9A 5E41A 4BE2A 1W7AA 1N34K 1W97L 2D0AA 1X3MA 4N5SA 5AQRA 4H0VB 1ZYWA 4BDPA 1XC3A 4PL7A 1RT1A 4M3TA 2JDQD 2WC9A 1JLAA 4RW7A 5HRRA 3VF6A 1WNSA 3RRGA 3S5TA 3V9SA 5GAEP 3RWUA 4YOVA 2P9PA 5KPRA 4HCBA 3THWA 4LF6K 4NCAA 4M3WA 3ZX0A 2VWJA 4EZ9A 1EWQA 1YTAA 1LW0A 1SS6A 5BREA 3WXJA 3O3FA 1WSGA 5AZIA 3EE8A 3SK3A 3CERA 5ELZA 1QQNA 3SQ4A 4CZFA 2Q1NA 1QS4A 3E9LA 1QSSA 5TKWA 4FZYA 1MA9B 3SMPA 4LD0A 4FO0A 4CW7B 3DLLL 1HR0K 3CCLN 1HNIA 3U6FA 4CE9A 2F8SA 2Q97A 1WSFA 3SNNA 1KAYA 4FM0A 4OLAA 3WNFA 1NK5A 4RCHA 5JVGL 4WCEL 4FJNA 4BRKA 2E3GA 5FROA 5GAGP 2LR3A 1VNBA 1TAQA 3K9JA 2F4VK 2NRWA 3E1YA 1OH5A 3JYTA 3L4QA 4CJWA 3THXA 3AVMA 4CVNE 4NB4A 1O1WA 2ITMA 4FJ8A 3U3GA 3R8EA 4OKEA 2FLOA 3U8XA 3CJ9A 1M90O 3TPQA 3VQPA 1KC8O 4FWOA 1IBMK 3DOKA 3O9RA 1BG3A 1Q9YA 1FW6A 3VF2A 2G8KA 3D2FA 4AH9A 3RMCA 4Z4CA 1GLCG 4IKFA 1VSFA 2HMPA 3O9TA 4CK3A 1CZ9A 3VQEA 3BK3C 1ZVGA 1P8ZA 2E3FA 4FSVA 4I7FA 4M3XA 4B9MA 2VGMA 3FZHA 2NRTA 2E2PA 2IC3A 2D56A 3PSFA 4BR2A 4FM2A 4GV3A 1GLFO 4B1WB 5KTQA 4DQ8A 4BRLA 3AAQA 1Q82O 4I9QA 4RW9A 4YOXA 3MX2A 2NZTA 1TUUA 3OYAA 1AYJA 4LFCK 1WB9A 4FWSA 1ZBUA 1LWCA 4WE1A 1HRHA 4BWMA 3R3LA 4FWMA 4BC4A 4JN4A 2UYTA 1HLUA 4UADE 2XY6A 2OA8A 4MO5A 4B3TK 4HVJA 5AQXA 3S3OA 5KPZA 2F96A 5HLFA 1YAGA 5HRSA 2QWMA 3QFPA 4O4GA 1NOZA 1NU0A 4DUZK 2AJQA 3CQ8A 5EVZA 4DQQA 3SUOA 4CERA 2ITGA 3VEVA 4DG1A 4DQRA 5I42A 1ATRA 4PKGA 1SKRA 4NO7A 5AQZA 1B9FA 5EU7A 1D8YA 1KXPA 1KRPA 4FJXA 4ILHA 5FRMA 1BWFO 4IDKA 2FBYA 2YI1A 1RDAA 4EP4A 3BF3A 5AQQA 4FJKA 2YKMA 3OYBA 5AQPA 2HF4A 3GKUA 3WQUA 1MYNA 2A3ZA 2XO7A 3RMAA 3NF6A 4FLVA 5BR8K 4KI6A 1JXCA 1I6GA 3ZT3A 1RBSA 2FBVA 2QXLA 1VK0A 3WNEA 4AHUA 4CJKA 3QESA 3CCUN 4ILGB 4H5NA 1D4XA 4PKIA 4FWNA 1Y64A 3QIPA 3S41A 4HCCA 1K9MO 3O3GA 3T19A 1VSIA 3ZSRA 3A5NC 1HPMA 3BGRA 4CJUA 4K8ZA 4MO4A 1OMYA 5BRHA 3KC6A 5JICA 2HBLA 1WSJA 1SUQA 1TL1A 2QWQA 3ZETA 2X74A 2KZMA 2YV0X 1NK0A 1BI4B 2HB5A 3VA3A 4CQKA 4DTSA 4KTZA 2D1KA 3AVCA 3K5OA 4DR3K 4ILJA 4LH5A 3KD1E 3KP0A 1BHLA 3V81A 4F2RA 2QWRA 1D9FA 2W42A 3M8SA 3PV8A 4ID5A 1IKXA 4BRFA 5LJVA 1C0TA 4DLEA 3LPUA 4KH6A 3NVKA 3SV3A 4E3SA 4EIAA 2YNFA 3MECA 4X64K 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2PAV A;  4GY2 B;  2GV9 A;  1YT3 A;  5FPE A;  3H46 O;  5C24 A;  1VSM A;  4DR7 K;  3HP9 A;  4AHS A;  1YIT N;  2GBZ A;  5HOO A;  1WSH A;  2A1S A;  2P9U A;  3K0S A;  4KHY A;  2A40 A;  1MWM A;  2KKZ A;  2WOM A;  1YIJ N;  1HQU A;  2ZD1 A;  2YNH A;  4DV7 K;  4FLY A;  4DTP A;  3CME N;  3NGI A;  1KLN A;  2OPR A;  4DCH A;  3MDQ A;  3VTI A;  1BUP A;  4FW2 A;  4BR7 A;  2O4I A;  3K59 A;  2JLE A;  4K42 A;  1RTH A;  1OKJ A;  2KSK A;  3CCS N;  3G0Z A;  4XH4 A;  1TGO A;  4HHT A;  1X9S A;  2OPS A;  3O9U A;  3THX B;  1C1B A;  4N76 A;  2NRH A;  5ADX H;  3CYM A;  3EY1 A;  4BGA A;  5KRS A;  3RSE A;  1HJO A;  3AVF A;  4MLH A;  3CG7 A;  2GEM A;  3PY8 A;  3VQ6 A;  1NJI O;  4E7K A;  4AHV A;  5D3G A;  2ZF5 O;  3O9S A;  3TAQ A;  3DMJ A;  4Q5V A;  1FXX A;  4DHY A;  2V51 B;  3D2F B;  4CFD A;  1LWE A;  4IJA A;  4DQP A;  2QA4 N;  2KJA A;  2N69 A;  3DLE A;  4DMN A;  2WFB A;  3PX0 A;  4RW8 A;  4E0D A;  1IV0 A;  2KPY A;  1Z25 A;  1KV0 A;  1T6C A;  4ISE A;  4E19 A;  1WT7 A;  4UAF E;  1NPI A;  4TSX A;  3A5L C;  1N6Q A;  4XJX A; 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