4H0XB

Crystal structure of nad+-ia(e380a)-actin complex
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Toxin/structural protein
molecule keywords Iota toxin component Ia
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
total genus 121
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0xB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0xB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0xB03
3BF1A 4EHUA 1HKCA 2P9NA 5AQGA 3D2EB 5AQWA 1NGAA 2F9WA 3LDOA 3BF3A 4BC4A 4CZGA 5KPTA 3VERA 1U2VA 3GOIA 4BRHA 4CZLA 5BRHA 4WQ5C 5FPDA 2P9UB 1HPMA 1LOTB 3ZX0A 1E4FT 4FWPA 1E4GT 5FPEA 1NGIA 4BC3A 2PAVA 3IDHA 4IO8A 4NB4A 4I6MB 2QWLA 3GDQA 4L3QA 3C7NB 2NRHA 2P9IB 2QWNA 3D2FA 4E1JA 3OHRA 3WEEB 3A0IX 2P9LB 2FXUA 3LM9A 2E2PA 4K25A 2P9PA 1NM1A 3GBTA 3O08A 2A6AA 1KAXA 2FSNA 1S22A 1GLFO 3M1FA 1Z6RA 3ENOA 3FGUA 4CZFA 3FR0A 2UYTA 4JHDA 2QWOA 3FZKA 3FFKB 3I8BA 1CZAN 5AQLA 3VGMA 4BR7A 3QFUA 5LY3A 2V51B 3M6GA 4DHYA 5AQOA 3WUHA 2YHWA 5BPNA 4BRLA 5AR0A 3DWLA 4H0TB 5ELZA 4ISGA 2PBDA 4WYBA 4BRMA 3D7EO 4F9OA 4FWMA 3JS6A 1G99A 2W40A 4BRQA 2H3GX 4BVOA 4H5WA 3VETA 1ESVA 3EO3A 3AARA 5E84A 1H1VA 2P9SB 4PKHA 3UKUB 3VGKA 5JLHA 4BGBA 4FWKA 4B9QA 3VESA 1GLJO 3WXIA 3AAPA 3RSEA 2IVNA 2A5XA 2GWKA 2Q0UA 1K8KA 2J4RA 1SZ2A 1KAZA 4K42A 1IG8A 4CBUA 4B1ZA 3QFPA 2E20A 2QXLA 4B1XB 1ATSA 5E26A 4DQ8A 2FSKA 3QICA 4YDUA 3R6MA 2HF4A 3VEVA 1QZ6A 3VGLA 5ADXH 4M7YA 2GELA 3JXUA 5AQKA 3LL3A 2AP1A 4QS8A 3ZEUB 4CBWA 5AQRA 3ZETB 5BPMA 4RWTA 3C0BA 2E2OA 4FPAA 2W41A 1XC3A 4FL9A 2KHOA 1QQOA 2GEMA 5AQSA 2ITMA 5JLFA 5BREA 1BO5O 3QB0A 1BG3A 3O6WA 1HKGA 1D4XA 1QHAA 1C0GA 2DPNA 3DJCA 3VF2A 3CJ9A 4BRDA 2GTDA 1HUXA 4FWNA 4H0VB 2A41A 4FWRA 3A5OC 3CJ1A 1BU6O 3H1QA 4BRFA 1S3XA 3TU5A 1QQMA 5F0XA 3MN9A 4B1VA 3CJAA 5AQFA 2HMPA 2A3ZA 2V52B 4EHTA 2P9NB 5AQPA 1P8ZA 5FPNA 3A8YA 1ATNA 4XH5A 1BWFO 5AQXA 5EY4A 4H0OA 3DXKA 3CQXA 3CERA 4BRKA 5I9EB 3VOVA 1U2VB 3MCPA 1MWKA 4O8KA 1SAZA 3U9DA 3WQTA 1Q18A 4KBOA 4MO5A 1JCEA 3CETA 3VF6A 4BRPA 5KPRA 1RDWX 4BR4A 3O1BA 4GNIA 2V7YA 3WXJA 2CH5A 4WQ4A 3IUCA 2Q0RA 5AFUA 4MLHA 3D2FB 3CJCA 4BREA 3G25A 1HX1A 5JMVA 4NO7A 2CGLA 3LM2A 5BN9A 3O8MA 2Q31A 4PKGA 2P9PB 2ZF5O 5AZIB 2FLOA 4BRGA 2F9TA 3ID8A 5CE3A 1QQNA 4QS9A 4BC5A 3HBTA 4BR9A 3KVGA 3FZHA 1EQYA 4M63C 2Q36A 4A61A 4PKIA 3DAWA 1TYQA 4QS7A 4JD2B 5F1XA 1TUUA 3KZBA 1RFQA 4FOIA 5LJVA 1GLCG 4BQZA 4K41A 3TPQA 5BN8A 3VEXA 4B1YB 4FOEA 4CZMA 1NGGA 3L6QA 3GE1A 3CJ7A 1BA1A 4CJ7A 4FO0A 3MMVA 1JCGA 2FF3B 2YHYA 1GLLO 3UKRA 5AQJA 3P4IA 3QBXA 1J6ZA 1YUWA 2QWMA 3ULEA 2YJFA 3I33A 1MDUB 5AQVA 4MLEA 4BRIA 5EVZA 2P9SA 2A42A 3CJBA 3L4IA 5AZJA 4BR2A 3RSEB 3IMXA 2BTFA 1K8KB 2ASPA 2ZGZA 3BP8A 2D4WA 3HM8A 1NGCA 5BRDA 2GWJA 3CIPA 1Z05A 4CD3A 4EFHA 3MDQA 1C0FA 5AQNA 4BQLA 3O5BA 1HJOA 1GLDG 3FZLA 3WXLA 4YDUC 3HSCA 1ATRA 4M7XA 4CI6A 3MK6A 1NGJA 4BG9A 1WUAA 4JAXA 1OKJA 1DKGD 2E1ZA 3O1WA 2YI1A 2BUPA 5AQQA 2E8AA 2P9KB 4FSVA 2IVOA 1NBWA 4HWIA 1NLVA 5FPMA 4BR0A 3EN9A 4IZ9A 4BC2A 4B1WB 3EL2A 4Z94A 4JN4A 1XUPO 3VEZA 2IIRA 3F9MA 5AQMA 4EAHD 3DXMA 3O4WA 3MN7A 4CZEA 3SLCA 2GUPA 5KPZA 3HZ6A 4EIAA 2I7NA 1TUYA 1U6ZA 2CGKA 4RCHA 4A62A 3LDNA 1GLEG 3D2EA 3LDPA 4AM6A 3W3DA 2Q1NA 3VPZA 4K43A 3ENHA 3DXKB 4JNEA 2Q97A 2P9UA 4WQ5A 1NGFA 5ADXA 5TKYA 1X3NA 3CHWA 3A5LC 3QBWA 4I6MA 4H0PA 3CQYA 4IWVA 4CZHA 1NGBA 3J8AA 2QM1A 1DEJA 1NMDA 2VWBA 1DGKN 2YCHA 2D1KA 3C7NA 3VF4A 4FPBA 2P9IA 2YJEA 4DCHA 2QWQA 4C23A 4WQ4C 3VEOA 4PL7A 3EKUA 4PL8A 3WEEA 2P9LA 1V4SA 4BRCA 3ZX2A 4BRNA 2CGJA 1YVNA 3A5MC 3SMSA 3BEXA 1NGEA 2HF3A 4BGAA 1MA9B 4O5FA 1NGHA 5AQIA 2Q2RA 3UE5A 2A40A 5JICA 2EWSA 3EKSA 3EZWA 1KXPA 3MN6A 2ZGYA 3FLCO 4JHDB 1T44A 4H5NA 3AAQA 3CI5A 1SQKA 5AZIA 1GLAG 2WUSA 2D0OA 1R59O 3O80A 2VYPA 2D0PA 3A5NC 3GL1A 2YHXA 1ZBSA 4FWLA 3H45C 2CH6A 2ASMA 4IJNA 4XEIA 1RGIA 1TYQB 1YAGA 2QW9A 4CBXA 5AQZA 4MO4A 4RTFD 3H6EA 2VCPA 4FWSA 4H03B 3FZFA 4JD2A 2AA4A 4H0YB 3LDLA 3M3ZA 1NWKA 4FWQA 1KAYA 1GLBG 3H1VX 3HI0A 2NLXA 2V7ZA 4GY2B 4H5VA 4ISFA 2HOEA 3VEYA 1LCUA 4CZKA 1QZ5A 1IJJA 3VEWA 2OANA 4XH4A 2ASOA 3UKRB 4XH1A 4J8FA 5KQ8A 3UKUA 1XQSC 3ULEB 4LC9B 4A2AA 3SK3A 2E88A 5AQYA 4CZIA 4BVPA 3BUZB 1X3MA 5EOYA 5AZJB 3U8XA 3QDKA 1HLUA 3KHYA 5KQDA 1X9JA 4H0XB 3ATVA 2ZWHA 3QMLA 5AQHA 3MN5A 3W0LA 3B8AX 4A2BA 4BRAA 5LJWA 2FF6A 4IXCA 4B1UB 2QWRA 5F2RA 3WT0A 3WQUA 4CD1A 1T6CA 2FSJA 5BR9A 3L0QA 5AQTA 3U9ZA 3H46O 5EXWA 3S41A 4BR5A 3ZEUA 1ZXOA 2I7PA 4CZJA 1T6DA 1Y64A 2QWPA 3ZETA 3FZMA 5AQUA 3ZX3A 1V4TA 4H5TA 1JCFA 3HTVA 3WXKA 3ATUA 4AM7A 3UB5A 1BDGA 2P9KA 1ZC6A 5AFUH 1BA0A 1NGDA 3R9PA 3R8EA 4HTLA 1BOTO 5EX5A 4FWOA 1BUPA 3AY9A 4BROA 3U4LA 2NZTA 3GG4A 3IFRA 3VENA 3H3NO 3SJHA 2E2NA 3FE1A 1WOQA 2E2QA 4ISEA 1HKBA 2E1YA 5BRFA 4H5RA 4DB3A 2IVPA 3DXMB 3H3OB 4Y0WA 1YXQA 3LDQA 1MWMA 5B8HA 4BG8A 4IJAA 3SMPA 5BPLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CR4A 2P9NA 3CMAN 4NYNA 4CVNE 2D0BA 3TR8A 4KHWA 2F4VK 1NGAA 2F9WA 4BC4A 4E1NA 3KK1A 1U4BA 4B9MA 4BRHA 5BRHA 3ZX0A 5HROA 3SBTA 2PAVA 1QSYA 2QI2A 1I39A 4I6MB 4F4KA 3PY8A 2E6LA 1M90O 1VQKN 4FJ5A 4L3QA 3HPOA 1S6PA 5JS2A 4CJFA 3C7NB 3VQQA 2P9IB 4K8ZA 3O3FA 3EE8A 3THVA 3OHRA 3WEEB 3A0IX 2P9LB 4O44A 4E7HA 5DM6L 2P9PA 3GBTA 1KAXA 3A2FA 3MX2A 4DR4K 3LALA 4GKJK 4RG8A 2AJQA 4Y1CA 3FFKB 2XRIA 3VGMA 2HHXA 1JLCA 4DS4A 2V51B 3M6GA 1B92A 3AVKA 3WUHA 3VMFB 1RTHA 4BRLA 3DWLA 4FM1A 4F8RA 5A2QO 3D7EO 4WFBL 2XHBA 2KZMA 1G99A 4A57A 4JRQA 2W40A 2JGUA 1RDBA 4M45A 2H3GX 4BVOA 1EO1A 3T69A 3VETA 1D8YA 1ESVA 1VK0A 1S1UA 4PUOA 4DV3K 5HP1A 4QCLA 4G1QA 4CJ4A 3VTHA 2OZMA 1T3VA 4KTWA 3PX4A 1VHXA 4FXDA 1TL3A 3CCVN 2A5XA 1K8KA 1VSEA 1KAZA 2QEXN 3KIOA 4LF9K 4CBUA 2OTLN 2QXLA 4W5QA 5E26A 1JLAA 3EY1A 3S9HA 3NGIA 4CGJA 1TV6A 3TAGA 3VEVA 5ADXH 4M41A 1B9DA 3K59A 5HBMA 3LL3A 2AP1A 4CBWA 4BE1A 3ZETB 3VQ8A 5FDLA 4FPAA 3ZSXA 1O13A 4DSKA 2KHOA 1OH7A 4DV0K 3DRSA 1TVRA 3ZSOA 4JI3K 1BISA 1BO5O 3QB0A 3QERA 3CCSN 5JVGL 4G9ZA 3NVKA 1HKGA 1D4XA 1QHAA 3VF2A 2DPNA 3QLHA 1VQLN 2GTDA 1HUXA 3CCJN 3SI6A 4FWNA 2B6AA 2A41A 3SQ4A 1F21A 3RR8A 1WN7A 5IT9O 4KB0A 3DOLA 4OKEA 1LWEA 4BRFA 3VQ6A 3MN9A 1X9WA 4DSFA 2HMPA 2W00A 2P9NB 5AQPA 5FPNA 4I2QA 3A8YA 1ATNA 4YOYA 4WF9L 4GV9A 3DXKA 3VQAA 3CERA 3NF9A 4FM0A 4F2RA 4W5NA 3E9OA 4O8KA 4AQYK 3ID6A 3DLEA 2KFZA 2FBXA 4KBOA 3D45A 3L2UA 3CETA 4A5BA 4YORA 4YOTA 4BRPA 4GNIA 2CH5A 1RNHA 4N5SA 2P1JA 2HHSA 2HBLA 5J2NA 4L8RB 1X9SA 4CJWA 1HX1A 1KFDA 1HPZA 4IO9L 2OCEA 2ZJQL 1J5EK 5BN9A 1WBBA 4CECA 1IBMK 4E1MA 4PKGA 2P9PB 4J2AA 3SUPA 3MXJA 4E3SA 4JI6K 3HBTA 4BR9A 2HNYA 4LF7K 3FZHA 1I3AA 3V1QA 4B9TA 4FOIA 5LJVA 1KLMA 3OS2A 5HRPA 3KLIA 4X66K 4XIUA 1HNXK 1VSMA 3VEXA 1WSJA 4FOEA 1YI2N 4CF0A 3CJ7A 3HO1A 3BDPA 1JCGA 2FF3B 1OH8A 1GLLO 5AQJA 3MECA 1SKWA 2F8TA 2O8CA 3I33A 1MDUB 2E6MA 4KHPK 4BRIA 2P9SA 4BECA 4IDHA 3B6PA 3LP3A 2RN2A 5AZJA 2XO7A 2PFUA 3IMXA 4JS5A 2BTFA 1K8KB 2ASPA 2ZGZA 3BP8A 3NH2A 2WONA 3CIPA 1Z05A 1NJIO 3EYZA 3IS9A 3S3MA 3FZLA 3OTOK 3HSCA 1ATRA 4CI6A 2G8WA 2C1IA 4BG9A 1WUAA 2LSNA 1RDAA 3CPEA 2WTUA 3OYHA 4IG3A 4NXNK 5AQQA 4HHTA 1IV0A 3JYTA 1X9MA 5CY4A 2IVOA 4FJHA 4C1NI 1NLVA 2NRRA 3CCLN 4BR0A 1QHTA 3L2RA 4BC2A 4N76A 5SZTA 4B1WB 1WLJA 2GV9A 4CF2A 3ZSQA 4CK1A 2IIRA 1VQMN 3DOKA 4FK2A 2OPQA 3SZ2A 4KB1A 1VAZA 3O4NA 1NK9A 3MN7A 4JRPA 1XWLA 2GUPA 3HVTA 4FLYA 5KPZA 4OGEA 5IWAK 4EIAA 1L5UA 2I7NA 1TUYA 3K5LA 4FYDA 2B4JA 1N34K 4M3YA 1GLEG 4IEIA 1VSDA 4H8KA 2QA4N 5J2QA 2Q1NA 4FJMA 2Z1JA 2YNGA 1CZBA 1YTUA 4LF6K 3DXKB 4HCBA 4JNEA 2Q97A 3PX6A 2XY5A 1X3NA 1UA1A 3BZCA 1IBLK 4CJQA 4IWVA 4CZHA 3QNNA 4PHTX 4W5RA 2QM1A 1DGKN 2YCHA 3SQ1A 1VSHA 4FPBA 2YJEA 3VN5A 1S5JA 3T1HK 4C23A 4WQ4C 4FJJA 3SPZA 1IH7A 1V4SA 3E01A 1JKHA 3SMSA 3PSFA 1NGEA 1MA9B 1YT3A 2RHKA 1HQUA 2BE2A 3HRGA 2A40A 4WFNL 3AA3A 3EKSA 3EZWA 4OLAA 2HHHK 5JENA 4CIEA 4MFBA 1T44A 1SQKA 1C1BA 1GLAG 2D0OA 1R59O 3MXMA 2A1RA 3CCMN 3U6FA 4AH9A 4FVUA 2YNHA 4RTFD 3KLEA 2WOMA 2AA4A 4CJ3A 5LMNK 2BH1A 4AILC 1E3MA 1TK0A 4CJLA 1S72N 2YKMA 4DKWA 2NLXA 4ISFA 4YNQA 1N33K 2PYJA 5M1KA 2HW3A 4XH4A 4F2SA 2ASOA 4XH1A 3V9SA 4MQ3A 1XQSC 4CK2A 3NF6A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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