4H0XB

Crystal structure of nad+-ia(e380a)-actin complex
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Iota toxin component Ia
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
molecule tags Toxin/structural protein
total genus 121
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0xB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0xB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0xB03
3EO3A 3SMPA 5KPZA 2E8AA 2QWMA 4MO4A 1QQMA 4O5FA 5BPNA 3VEXA 3VF2A 3SMSA 4IWVA 3EKSA 5AQNA 1BA1A 2FSJA 2WUSA 5AFUH 3O1WA 5AZIB 2P9PA 5AQOA 4JD2A 1Z6RA 4O8KA 2AP1A 2VCPA 3UKRA 4CD3A 3FE1A 4BC5A 3A5NC 3O80A 4CZLA 3DXKA 1K8KA 3FZLA 3IUCA 3UKUB 3GL1A 3W3DA 4H5VA 4XH5A 1U2VB 1JCFA 3AY9A 3DWLA 2YJEA 3M1FA 1BDGA 1WUAA 2P9KA 1HJOA 4B1YB 3CJ1A 3A5OC 1ESVA 2E1YA 3QB0A 1G99A 1NGCA 3WEEB 1Y64A 2Q0UA 4BVPA 2H3GX 4EHUA 2V51B 1E4FT 3A5LC 2YHXA 4BRDA 4BR5A 1YXQA 3O1BA 4BC2A 4BRMA 5AZJA 3GBTA 2EWSA 2Q36A 4QS8A 4BVOA 4QS9A 3I33A 2A6AA 3O08A 1TUUA 4WQ5A 1XC3A 4YDUC 3VOVA 1S3XA 5FPEA 2P9SB 3FZMA 3U9ZA 1HLUA 4BRLA 3CIPA 5FPNA 3EKUA 2GEMA 2GTDA 2FSKA 4FWOA 4BR0A 1BA0A 3JXUA 2ASOA 3UE5A 1RGIA 2GUPA 3QFPA 3VGLA 1HKGA 1NGAA 4KBOA 3BF1A 5KPRA 4K42A 2HF4A 3U4LA 3GOIA 5ELZA 4PL7A 1HUXA 4BG9A 5AZIA 3FR0A 1MWMA 3ZX2A 1Q18A 5BRHA 1BO5O 2CH6A 4H5TA 2PAVA 2P9UB 5AQIA 2P9IB 2QM1A 3WXLA 5KQDA 4BGAA 3MK6A 4XH4A 4A61A 3WT0A 1NGBA 2VYPA 3UKUA 3D2EB 5EX5A 1RDWX 4GNIA 1MWKA 1U2VA 1HX1A 4BR9A 3CHWA 3IFRA 3MMVA 3VEWA 2ZF5O 4BRPA 4DB3A 5AQHA 5AR0A 2YHWA 4HTLA 5AQWA 5AQQA 5E84A 4L3QA 2A5XA 2YJFA 3LM2A 5AQTA 5F0XA 3CI5A 1LCUA 3OHRA 2E20A 3WEEA 3EZWA 5AQXA 3J8AA 1V4SA 1NMDA 5BPMA 5F2RA 5I9EB 5B8HA 3MN6A 4I6MB 4BR4A 3VERA 3FZFA 4FWKA 3AARA 5BRDA 2HF3A 2ITMA 3VETA 5AQGA 5AFUA 2BUPA 3FGUA 3VF6A 4CZIA 3CQXA 4H0PA 4M7YA 4A2BA 3CJ7A 1NGEA 3ENHA 5LJWA 3H45C 4AM7A 1ZBSA 3DXMB 2D0OA 4CZHA 2P9SA 4ISFA 3DJCA 1X9JA 3C7NB 3R6MA 5JLHA 5AQYA 1TYQB 4IJNA 4ISGA 2QWNA 3S41A 4BRHA 5E26A 1NGDA 1NGHA 3VEZA 4BRCA 4CZGA 2V7ZA 4JNEA 1DGKN 4B9QA 4BRFA 3FLCO 3QMLA 4Z94A 1X3NA 4NO7A 3LDPA 4EIAA 5EY4A 2D1KA 2CH5A 4PKHA 5AQLA 4FWNA 1DKGD 2AA4A 1WOQA 4JHDB 3MN5A 4H0OA 4MO5A 3VENA 2W40A 3QDKA 1C0FA 2GELA 1RFQA 4IXCA 3VEOA 2QWPA 2P9UA 2IVPA 1D4XA 2P9IA 5AQMA 4FWQA 4FPAA 1JCGA 2P9NB 5AQKA 4B1VA 4EFHA 1P8ZA 5FPMA 3WXKA 4EHTA 1ATRA 1BU6O 3QBXA 4FWLA 5BREA 1J6ZA 3MCPA 4DHYA 4B1XB 3O8MA 2P9LB 3D2FB 4JAXA 3L6QA 1U6ZA 3GE1A 2FSNA 1NLVA 4DCHA 1V4TA 4FL9A 4CZMA 2FF6A 1YUWA 3HTVA 3RSEB 3ZX3A 4CZJA 3QICA 5EXWA 4WQ4A 4A2AA 4CZKA 1CZAN 4I6MA 2QW9A 1IJJA 4FPBA 1T6CA 3H3OB 2FXUA 4BRIA 3VGKA 5AQRA 4AM6A 3ZETB 2QWQA 2ASMA 3LDQA 3G25A 1TUYA 4WYBA 1HKCA 3DXMA 3MN9A 4BREA 4LC9B 3FFKB 3C7NA 3LDNA 4GY2B 3GDQA 3HI0A 4PL8A 1TYQA 2E2PA 3FZHA 4WQ5C 4BR2A 4MLEA 2IVNA 2A3ZA 2UYTA 3BUZB 3H3NO 3KVGA 3L4IA 4BRAA 3M6GA 1EQYA 2P9PB 4H5WA 2NLXA 3CJAA 3F9MA 4FOEA 4JHDA 1KAXA 3ATVA 3AAQA 4FWPA 4BRQA 4BQZA 4BROA 1SAZA 2CGJA 1GLAG 1H1VA 1DEJA 3UKRB 3SLCA 5LJVA 2YCHA 3DXKB 2YI1A 3DAWA 1NGFA 3WQUA 2QWOA 5ADXH 3HSCA 3IMXA 5AQZA 4CBXA 1HPMA 4FWSA 2I7NA 3VGMA 1S22A 2P9NA 3UB5A 4B1ZA 4C23A 4CI6A 2CGKA 2KHOA 3KHYA 4QS7A 1QQNA 1BOTO 3WXJA 4BC4A 5KQ8A 3FZKA 5AQFA 1YAGA 2P9LA 1KXPA 3HBTA 1R59O 4A62A 4BRNA 4K43A 3L0QA 3I8BA 4H03B 5AQJA 3D7EO 2F9WA 2PBDA 3RSEA 5BPLA 4PKIA 3ULEB 4IJAA 3C0BA 3VEYA 1BWFO 2D4WA 1ZC6A 1GLCG 5AQSA 3HZ6A 2F9TA 3ATUA 3IDHA 2YHYA 2GWJA 1KAZA 2A40A 3H1QA 3ZEUB 4BRGA 2FF3B 3O6WA 4FWRA 4H5NA 4IO8A 3R8EA 3ZETA 5BRFA 4F9OA 5CE3A 3GG4A 1GLFO 2A42A 2Q0RA 4NB4A 3VPZA 1GLLO 2Q31A 5JICA 4BQLA 1YVNA 3LDOA 1OKJA 3M3ZA 2OANA 3VF4A 4CZFA 2ZGZA 3BP8A 2E2OA 4E1JA 4BRKA 3ENOA 4FOIA 1BG3A 2E2QA 4M7XA 3H46O 4BC3A 4FWMA 3U9DA 4RCHA 4K25A 3SJHA 3O4WA 4CJ7A 3W0LA 1LOTB 3TPQA 2QXLA 4H0TB 5LY3A 4B1UB 3CETA 3D2EA 2IIRA 3P4IA 4CD1A 1GLDG 3LDLA 2HOEA 1NM1A 2NRHA 5F1XA 4JN4A 2HMPA 3EN9A 1SQKA 3CJ9A 1QQOA 1QHAA 2V52B 3ZX0A 2IVOA 4K41A 4MLHA 3A5MC 1ATNA 1QZ6A 2BTFA 2NZTA 3A8YA 1E4GT 1T44A 3BEXA 4YDUA 2QWLA 1NGJA 2W41A 3JS6A 2VWBA 3A0IX 5AQUA 3MN7A 3WUHA 1KAYA 3ULEA 5BR9A 1GLJO 4EAHD 5EOYA 2ZWHA 4H0XB 5TKYA 5KPTA 3EL2A 4WQ4C 4ISEA 4XEIA 3ZEUA 2V7YA 1NWKA 1QZ5A 4H0YB 3LL3A 4IZ9A 4B1WB 3SK3A 4RTFD 2ZGYA 2Q97A 5FPDA 2A41A 2Q1NA 3WQTA 5BN8A 4Y0WA 5ADXA 3QFUA 4M63C 1GLBG 4HWIA 2E88A 4JD2B 2FLOA 1XQSC 3U8XA 2GWKA 3LM9A 3CQYA 1ATSA 1Z05A 1K8KB 4BR7A 2Q2RA 5EVZA 1X3MA 1NGIA 3B8AX 4FSVA 1IG8A 4J8FA 2D0PA 3CJBA 4XH1A 2P9KB 2ASPA 3AAPA 3ID8A 1XUPO 1HKBA 1ZXOA 3VEVA 3WXIA 2J4RA 2QWRA 3MDQA 2CGLA 3H6EA 3BF3A 4CZEA 5JLFA 5AQVA 5JMVA 3D2FA 1JCEA 4H5RA 5BN9A 3O5BA 4FO0A 1BUPA 3CJCA 4CBWA 5AQPA 2I7PA 4CBUA 3KZBA 4RWTA 1T6DA 1NBWA 1MDUB 4DQ8A 5AZJB 2E1ZA 3QBWA 3R9PA 3TU5A 4H0VB 4BGBA 3VESA 3H1VX 3CERA 1GLEG 2E2NA 4BG8A 1NGGA 4PKGA 1MA9B 2DPNA 3HM8A 1SZ2A 1C0GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SBGA 4WF9L 3S5TA 2E8AA 1SS6A 3QINA 3C6AA 4DTOA 5AQNA 3KK1A 2P9PA 4GV3A 4GVEA 4CFBA 4FJHA 2YHAA 2OPPA 1A5WA 4BDZA 3WNGA 4LF5K 3ZSXA 2NRWA 1Y97A 3SPZA 3SUQA 4PUOA 2XHBA 1HJOA 2IC3A 4FYDA 3OS1A 4LF9K 1VSIA 1IBLK 1HNZK 1G99A 2HHVA 1D9FA 2VG5A 3VQEA 2Q0UA 3QO9A 4BVPA 2P5OA 1E4FT 3AVJA 3O1BA 3C6TA 1S9GA 2UUBK 3NH1A 3PY8A 2R7YA 3OW2M 3F5TA 1QQCA 4X62K 2Y1JA 1RBUA 4KREA 1M1KO 4Y1DA 2A6AA 3ZSVA 1TUUA 1DLOA 4YDUC 2E6MA 1S3XA 5GIPA 3J81O 3FZMA 5C2FA 1EWQA 4CHNA 4BRLA 3J7ZO 4J2DA 4AHRA 2GEMA 5IT9O 1FKOA 4IDHA 3EY1A 5TKWA 1VK0A 1VQNN 2GUPA 3VGLA 1BIZA 1LW0A 1UA1A 4BY9C 1NGAA 1VRTA 4K42A 4FJ8A 5ELZA 3O9SA 4OKEA 2PYJA 3HSTB 3JYTA 3ISNC 4BG9A 1YTAA 3FR0A 1MWMA 4KH4A 1RT4A 3ZX2A 3MEGA 1Q18A 3V9UA 1VQ4N 4Z4EA 2AJQA 3TARA 1OH8A 3WXLA 2DFFA 2KW4A 1IKXA 1TV6A 4LF6K 3P83D 2WBNA 3ID6A 3TI0A 3PO5A 3V81A 3KK3A 2YHWA 2QXFA 2QKKA 3NAEA 2X6NA 4L3QA 2BANA 4FJGA 5F0XA 3SQ1A 3CI5A 1LCUA 5I42A 3HOTA 4G9ZA 4CEAA 3T19A 3NVKA 1NMDA 3OVNA 3R3LA 5I9EB 3CPWM 4I6MB 5FRMA 1JL2A 3LALA 4PQUA 4JI7K 4FWKA 4DV3K 3AARA 3NFAA 5BRDA 1TVRA 1WSEA 4CERA 3TAGA 1UWBA 4DQQA 3CQXA 4H0PA 4A2BA 4B3SK 1NGEA 1VSMA 4E7HA 3DXMB 4CZHA 2Z1IA 3DJCA 1YTUA 1X9JA 3C7NB 3R6MA 5JLHA 5AQYA 3HRGA 3S41A 4BRHA 5E26A 3ULDA 1T8EA 4DR1K 2NRZA 4NCAA 4B9QA 4Z94A 3FLCO 4JS5A 1X3NA 4NO7A 4C8NA 5EY4A 4FWNA 1YT3A 1DKGD 4H0OA 4KHWA 4PHTX 3L3UA 4IEIA 4F2RA 2W40A 3QDKA 3NMUA 4CIGA 2GELA 5C12A 3CCSN 1D9DA 2C1GA 1RFQA 4IXCA 4B9LA 2NUBA 1HQEA 2FC0A 1M90O 1JCGA 4B1VA 1CXQA 1MU2A 4RW4A 1ATRA 4FWLA 4B1XB 3T1HK 4NXMK 3L6QA 3AVLA 1TAQA 4M45A 4O0IA 1V4TA 4FL9A 4A5AA 2OTJN 3HTVA 3RSEB 4CZJA 1K6YA 3O9UA 3KTQA 4I6MA 3OS0A 5GAGP 1XI1A 3J7YP 3G25A 3DXMA 3MN9A 3C7NA 4CEEA 3GDQA 3HI0A 4PL8A 2G8HA 5J2PA 2UXCK 3QNNA 2WFBA 4B8AB 1HQUA 3O3FA 1K9MO 2O8CB 4ILJA 1WLJA 1TL3A 3DLRA 3H3NO 1W97L 3TAFA 1S9EA 4DS4A 1KCFA 5CZ2A 5HRNA 4H4OA 4H5WA 3CJAA 1CZ9A 4DTPA 4BRQA 4PY5A 1LAVA 4BROA 3UKRB 1H1VA 3SLCA 5J2MA 4FJ5A 2YI1A 5ADXH 2QWOA 1K8AO 1HPMA 4FWSA 4DFJA 2I7NA 3D45A 3UB5A 4C23A 1C0MA 2CGKA 3KHYA 3N4QA 3M5RA 4CJ3A 1YAGA 1VQPN 1KXPA 3AO3A 1R59O 4BDYA 3LANA 4C8MA 3L0QA 4I9QA 4GV9A 4LFBK 3I8BA 3D7EO 3OA9A 2PBDA 3ALYA 3E66A 3RSEA 5C25A 3OYCA 4DU4A 4M3UA 3VEYA 5D3GA 1BWFO 3MXJA 3HZ6A 3IDHA 1BCOA 2YHYA 4AHCA 1RDDA 3ZEUB 4W5QA 4BRGA 3ZYYX 4FK4A 4IO8A 3R8EA 2UXDK 4F9OA 1GLFO 4NB4A 5JICA 3LDOA 3VF4A 1VQMN 4CZFA 4A57A 4NLCA 3DI6A 1NOYA 4RW8A 4MDBA 2O8CA 2XRIA 3NHGA 4DV4K 4FWMA 4AHUA 3TTDA 4K25A 3E9OA 3W0LA 5HRSA 3TPQA 5I3UA 1SL0A 3D2EA 4WFNL 2IIRA 3DLGA 4JN4A 4ILGB 1VQKN 3K57A 3EN9A 4FK0A 1SQKA 3HP9A 1N5YA 1QQOA 2G8FA 3OYHA 1XNQK 4KKOA 4DR4K 4FJKA 3A8YA 2BTFA 4B9TA 1IH7A 3SQ0A 1E4GT 1T44A 1NOZA 3RMAA 3BEXA 2QWLA 3JS6A 3ZSWA 1WB9A 3A0IX 5AQUA 4B3MK 5M1FA 2UXBK 2F7TA 4UQGA 3O4NA 2W6KA 1KLNA 4CW7B 4IOXA 4CHOA 2PYLA 4O0JA 5EOYA 3HYFA 4LFCK 1EP4A 1TK8A 4DTJA 1VQLN 3EL2A 1EXQA 1IBKK 3ZEUA 4XEIA 1U45A 1NWKA 4OPAA 1TGOA 3SK3A 3P39A 4YOTA 2PFUA 2A41A 2Q1NA 4Z4HA 4CF8A 4LY7A 4F8RA 3QFUA 2G8WA 1GLBG 2O8EA 2E88A 4JD2B 2GWKA 3G10A 4KTQA 3EZ5A 3LM9A 3SQ4A 3CQYA 3VQ9A 2IS3A 4DSIA 1K8KB 5IWAK 1U04A 1X3MA 3OYJA 3TAMA 1NGIA 3MWTA 3OYFA 2BE2A 2PZSA 4FXDA 2D0AA 3CJBA 2OTLN 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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