4QS9A

Arabidopsis hexokinase 1 (athxk1) mutant s177a structure in glucose-bound form
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
461
structure length
450
Chain Sequence
b'WGRVLAILKAFEEDCATPISKLRQVADAMTVEMHAGLASDGGSKLKMLISYVDNLPSGDEKGLFYALDLGGTNFRVMRVLLGGKQERVVKQEFEEVSIPPHLMTGGSDELFNFIAEALAKFVATECEDFHLPEGRQRELGFTFAFPVKQTSLSSGSLIKWTKGFSIEEAVGQDVVGALNKALERVGLDMRIAALVNDTVGTLAGGRYYNPDVVAAVILGTGTNAAYVERATAIPKWHGLLPKSGEMVINMEWGNFRSSHLPLTEFDHTLDFESLNPGEQILEKIISGMYLGEILRRVLLKMAEDAAFFGDTVPSKLRIPFIIRTPHMSAMHNDTSPDLKIVGSKIKDILEVPTTSLKMRKVVISLCNIIATRGARLSAAGIYGILKKLGRDQKSVIAMDGGLFEHYTQFSECMESSLKELLGDEASGSVEVTHSGIGAALLAASHSLYLE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Biochemical and structural study of Arabidopsis hexokinase 1
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hexokinase-1
source organism Arabidopsis thaliana
molecule tags Transferase
total genus 155
structure length 450
sequence length 461
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4qs9A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4qs9A01
4WQ4A 3WEEB 4HTLA 1NGEA 4BROA 4B1VA 1MA9B 4IJAA 2ZF5O 5AQMA 1EQYA 2WUSA 1XUPO 3B8AX 2Q0RA 3VGMA 2P9LA 3ATUA 3CHWA 2Q36A 3WXLA 1NMDA 1BA0A 1GLEG 5BN9A 5AQIA 5AQVA 4BRAA 4BVOA 3FFKB 4H0YB 1NLVA 1E4GT 2E2QA 5AQKA 3VEXA 5BPNA 2H3GX 4DCHA 2QWMA 4O8KA 1C0FA 3R8EA 3BEXA 1IG8A 2FSNA 2IVOA 2P9IA 3LDOA 4ISFA 4BRIA 5FPNA 4CZIA 1KAZA 1WOQA 4JHDB 2P9NA 3CQYA 3WXJA 2D4WA 2HMPA 1U2VA 4CD1A 1J6ZA 4BVPA 3QBXA 4E1JA 4BR9A 2E1ZA 3ZETB 4DB3A 2QM1A 3BF1A 4EHUA 2QW9A 4FOEA 3H3NO 4IWVA 2ZGYA 2GWJA 3D2EB 3WT0A 5TKYA 5JICA 1QZ6A 3AY9A 4BR4A 3FZHA 4B9QA 3BP8A 4CJ7A 4NO7A 2GELA 3F9MA 1K8KA 5FPDA 5AFUA 3SMSA 5AQTA 3FZLA 4B1XB 5BR9A 3HBTA 4JD2A 3VGLA 1NGAA 1NWKA 4M7XA 4FOIA 4BR2A 3CJ1A 4K43A 1HUXA 5E26A 4DHYA 3RSEB 3UKUA 3R6MA 1JCGA 2A6AA 3U9DA 4A2BA 4H5VA 4IJNA 1T44A 4CI6A 3MN5A 1NGDA 4EFHA 3VEVA 2D0PA 4J8FA 5AZIB 2GTDA 2E88A 1T6DA 3A5LC 1ATRA 5AQNA 1BDGA 3ZEUA 1RFQA 3DWLA 4BG9A 3U4LA 3O1BA 3A0IX 1JCEA 2QWPA 3EN9A 1YAGA 1YXQA 3QFPA 5B8HA 2ZWHA 2HF3A 4FWNA 1GLAG 1Q18A 3HSCA 4XH1A 3LDLA 3O08A 1DKGD 1HLUA 4FWSA 3FE1A 1IJJA 3HM8A 5EX5A 5LJVA 2Q97A 3QDKA 3JS6A 3O80A 2NLXA 5EXWA 3IUCA 1QHAA 3CJAA 3GL1A 1G99A 2A42A 3A5OC 5AQWA 4QS7A 3VEOA 3ENOA 3H46O 5AQYA 3GE1A 3I33A 2P9UB 2ASOA 2HF4A 4GY2B 4H0VB 3UKRB 3ULEB 1HKGA 1TYQB 2QWOA 4L3QA 1XQSC 2KHOA 2P9PA 2YCHA 4FO0A 2D0OA 3DXKB 4EAHD 4RWTA 5BREA 4BRQA 4H5TA 4BQLA 3EL2A 3HZ6A 3I8BA 4PKIA 3HI0A 1NGGA 1CZAN 2E1YA 5ADXH 1U6ZA 5BPMA 2CGJA 4BRGA 4M63C 4LC9B 1NGFA 4EIAA 2V52B 3ID8A 1BOTO 1LCUA 5KPTA 2YHYA 2CH6A 3MN6A 4CBWA 3UE5A 2PAVA 3FZKA 2E8AA 4FWOA 2QWQA 4IO8A 4FWPA 4BRMA 1GLLO 1BO5O 4I6MB 2V7ZA 3P4IA 4YDUA 3MK6A 5F2RA 3O6WA 3H1VX 4QS8A 3VF4A 3O4WA 5AQGA 2GWKA 4H5RA 3ZX0A 3EKUA 4RTFD 1JCFA 4BRNA 3KHYA 3LDQA 1X3NA 1GLJO 1R59O 4H0OA 3A5MC 3UB5A 2VCPA 2P9KA 4H0PA 2Q31A 3MCPA 1RGIA 4B1YB 3MN7A 3DXMA 3O5BA 3VEZA 1GLFO 2OANA 4YDUC 3ZX3A 2PBDA 3VENA 1TUYA 3U8XA 3VETA 3ENHA 1NGIA 3S41A 2A41A 1QQMA 5EOYA 3EKSA 3WXIA 2YHXA 1QZ5A 1V4SA 5LJWA 1ATNA 5AQOA 4FPAA 5BPLA 3C7NB 2UYTA 4H5NA 1BWFO 2CGKA 4CZFA 4H5WA 5ELZA 5AZJB 4B1WB 4BC2A 4Y0WA 4FWLA 5LY3A 1SAZA 3IMXA 3GDQA 2NZTA 4K42A 3CIPA 2NRHA 4WQ5C 3VESA 3TPQA 4NB4A 3L6QA 2GEMA 2E20A 4FSVA 4PKHA 3TU5A 2IVNA 3LL3A 4BR7A 2AP1A 4CZGA 1NGCA 2I7PA 5AQQA 4AM7A 5ADXA 3M3ZA 2P9LB 3LM9A 5AQFA 2P9SA 2W41A 4IZ9A 5KPZA 3DXKA 4B1ZA 1BA1A 4BR5A 5F0XA 3WEEA 4CZHA 2YHWA 4BGAA 1H1VA 1NM1A 3FZMA 1ESVA 3VF2A 4MO4A 3L0QA 5AQPA 1Y64A 1HX1A 2P9IB 2ASPA 3WQUA 2P9NB 3VF6A 4CZLA 4BRCA 5AQSA 2Q0UA 1YVNA 2F9TA 4CZMA 4MLHA 1TUUA 3FZFA 3ZX2A 5EY4A 3KVGA 5BRDA 1C0GA 5F1XA 3W0LA 2BUPA 2FLOA 1KAYA 4FWKA 3D2FB 4JHDA 3MN9A 4CZJA 1DEJA 1T6CA 3O1WA 1NGBA 4BC5A 1ZC6A 1K8KB 3ZETA 1LOTB 5CE3A 3ATVA 5BRHA 3CJ7A 1HKBA 3VERA 1P8ZA 5I9EB 1BU6O 3D2EA 3SK3A 3VEWA 4MO5A 5FPEA 3CQXA 3MDQA 1BUPA 4C23A 4PL8A 3AARA 3JXUA 4BRHA 4CZEA 4F9OA 5AFUH 5AQUA 4Z94A 1YUWA 4QS9A 4FL9A 2EWSA 3IDHA 3SMPA 1Z6RA 4XEIA 3ZEUB 5JLHA 3RSEA 3C0BA 4H0TB 5AQLA 3LDNA 2FSJA 3J8AA 2VYPA 2Q2RA 2F9WA 5KQ8A 4M7YA 3DAWA 3LM2A 3H3OB 4BC4A 3G25A 2FF3B 2E2OA 4WYBA 4PL7A 5AZIA 5BRFA 1HJOA 3BUZB 2A3ZA 3H1QA 4JNEA 3QFUA 3H45C 2Q1NA 2HOEA 4WQ4C 4A2AA 3CJBA 4WQ5A 1ATSA 2FXUA 2BTFA 1GLBG 5KPRA 4A62A 5AQRA 1NBWA 1DGKN 1OKJA 4RCHA 4JN4A 1MDUB 2YI1A 3CETA 3QICA 1SQKA 3A8YA 3WUHA 4AM6A 4BR0A 3M1FA 4O5FA 2E2NA 3VPZA 5AQZA 4HWIA 4BRDA 4BRLA 5AR0A 1QQOA 4BC3A 2P9PB 1MWMA 2V51B 1RDWX 1GLDG 1HPMA 1SZ2A 4FWRA 3SLCA 4BRPA 3FLCO 3D2FA 3W3DA 2P9UA 2ASMA 3H6EA 1HKCA 1NGHA 4FWMA 3QMLA 2J4RA 1KAXA 2IIRA 4IXCA 3UKRA 3ULEA 1E4FT 2QWLA 3L4IA 4FWQA 2FF6A 1XC3A 1TYQA 3KZBA 2D1KA 4GNIA 3VGKA 4A61A 1MWKA 4KBOA 4MLEA 4CBUA 1GLCG 1S22A 3FGUA 3OHRA 4FPBA 4K25A 3SJHA 4H0XB 4BGBA 4CZKA 1NGJA 5AQHA 2QWNA 2YJFA 5AQJA 2QWRA 1X9JA 3IFRA 4XH4A 1WUAA 4ISEA 5E84A 3FR0A 1Z05A 3EZWA 4BRKA 2W40A 3CJCA 2FSKA 2DPNA 3M6GA 3U9ZA 4PKGA 2A40A 3WXKA 3WQTA 3O8MA 5JMVA 1U2VB 4CD3A 5AQXA 2P9KB 4BREA 5BN8A 3QB0A 4I6MA 1S3XA 3DXMB 3A5NC 3AAPA 2E2PA 3D7EO 3QBWA 4ISGA 1V4TA 4JAXA 1BG3A 4K41A 4DQ8A 3VOVA 3AAQA 2VWBA 1KXPA 3R9PA 3CI5A 1ZXOA 2I7NA 2A5XA 2AA4A 2ZGZA 3DJCA 4BG8A 5EVZA 5FPMA 2ITMA 2V7YA 3GOIA 4H03B 4JD2B 5JLFA 3CERA 1QQNA 3MMVA 2YJEA 1X3MA 3BF3A 4BQZA 3UKUB 1ZBSA 2IVPA 3CJ9A 3HTVA 3GBTA 2GUPA 3LDPA 3C7NA 4CBXA 5AZJA 2QXLA 5KQDA 2CH5A 4B1UB 4EHTA 4BRFA 2P9SB 3VEYA 2CGLA 4XH5A 3GG4A 3EO3A 1D4XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3V9UA 2VG5A 1M90O 1QSSA 2AJQA 4B1VA 4IJAA 2ZF5O 5AQMA 1XUPO 3B8AX 3NMUA 1RNHA 3CHWA 4C8KA 3ISNC 2O4IA 1BA0A 4JEPA 1D8YA 1UA0A 1S1TA 4PUOA 2NNWA 1VRUA 5GIPA 4EZ6A 3VEXA 4DV2K 2H3GX 4DCHA 4CEFA 5C24A 4CJLA 4FJ8A 1C0FA 5HRRA 3CCJN 4ISFA 1IG8A 3LDOA 1YVUA 4CZIA 4F3OA 1TL3A 3CQYA 1WSJA 3LP1A 5J2QA 1QS4A 2JWKA 2UXCK 4PA1A 1SL0A 1J6ZA 4BVPA 4F8RA 4FW2A 2HB5A 3LZJA 5A2QO 3AGRA 3BF1A 4ILGB 4CIGA 1DLOA 1RT4A 3CD6N 3V9SA 1SL1A 1QZ6A 3H08A 3AY9A 3TWHA 3O4QA 3FZHA 1VAZA 3K59A 2OPQA 1K8KA 5AFUA 4AF1A 3THXB 4M7XA 4FOIA 4FM1A 3MWPA 4DHYA 4X66K 4HUFA 3UKUA 4W5OA 4FLVA 2IAJA 3WNHA 2IGIA 5BR8K 1TAUA 4C8OA 4CVNE 4EFHA 1T05A 3VQ8A 3HSTB 5AZIB 2XY8A 1EXQA 3ZT3A 1EX4A 3VQ6A 3ZEUA 3G6EN 5DMRA 4YOXA 1RFQA 2YNHA 2ITGA 4DR3K 4BG9A 4YHHK 1RTJA 3LAMA 1JLQA 4NLBA 1HRHA 4CESA 4FWNA 1DT9A 4XH1A 2BANA 1IJJA 3HM8A 5J2NA 1OH5A 2B6AA 5GINA 2F4VK 1NOYA 5HRPA 3J81O 2ZJRL 4DTMA 1IG9A 1QHAA 2BGGA 1G99A 4DS5A 4JKGB 1CXQA 3VEOA 5M1KA 1KTQA 1LW0A 2P9UB 4FLXA 3QETA 3B6PA 2ASOA 4CHZA 5KTQA 3DLEA 4JKHA 4DFPA 3V1QA 3P31A 4YOUA 3VQ9A 2YCHA 4KAZA 1W2BM 5BREA 4O44A 4PKIA 4YY3K 4CGHA 2E1YA 2O8FA 5ADXH 5BPMA 1EO1A 1HNXK 1NGFA 4EIAA 3OYJA 2D0CA 4FLWA 2V52B 2BDPA 3ZLJA 5KPTA 1W7AA 3DM2A 2YHYA 1RDBA 4KHWA 1T7PA 4MQ3A 3QNNA 5C0YA 4FJ7A 4FWOA 1NOZA 1BCMA 4I6MB 1RT3A 1T3VA 1GOBA 4M3ZA 3ZX0A 3PSIA 4BRNA 3PO5A 3LDQA 1B9FA 1VK0A 1BQMA 3MXIA 3PLAA 1I39A 3O5BA 1EWQA 1GLFO 3CC4N 2KTQA 3VENA 1TUYA 3U8XA 3ENHA 2Z1HA 3WXIA 2YHXA 2YHBA 4DV6K 2HNDA 3NGYA 4CZFA 5AZJB 1WN7A 4CF2A 1SAZA 2F96A 2F8SA 3U6FA 1YI2N 3OYFA 3C95A 2QKKA 1B9DA 2PYJA 2HHWA 4BR7A 1KFDA 1NGCA 4LFBK 2VQEK 3DRRA 4RW4A 5TKWA 2A1SA 3AA2A 4JKDA 2G8IA 3DLGA 4B1ZA 1KQSM 4BR5A 3L8BA 2IOCA 1X9SA 2EX3A 4BGAA 4AQYK 2ZE2A 1R0AA 3VTHA 4DSLA 1Y64A 3TTFA 2P9IB 4HUEA 1VSIA 2HHXA 2YNIA 3ID6A 4CZLA 5AQSA 5M1PA 1GOAA 4MLHA 3KLIA 3FZFA 3C6UA 5EY4A 3KVGA 1C0GA 4DV4K 1WLJA 3W0LA 2BUPA 1S5JA 3L2QA 3C94A 5JVHL 1DEJA 4KI4A 4ILJA 4CEZA 3MCAB 1S9EA 4NCAA 1I3AA 4GV9A 3SQ1A 1LOTB 3AV9A 1TKDA 3Q7CA 3VERA 1P8ZA 3OYCA 4IG0A 4I2QA 3S3NA 1T03A 3MDQA 1BUPA 1U47A 2UU9K 3CMAN 3TSQA 1S1VA 1N36K 5AQUA 3LDSA 1KVAA 4Z94A 1JLBA 5T7BA 4E7HA 5EU7A 3DLHA 4KHPK 5IWAK 3VQ4A 4XEIA 2W6LA 2WFBA 1Y97A 4IOXA 3ZSOA 4LSNA 4H0TB 4FJGA 2G8HA 2ZJQL 4E7JA 3J8AA 2Q2RA 2F9WA 4B9SA 1L3VA 2E2OA 2NRZA 4PL7A 3CCEN 1RBSA 3L2UA 5DK5A 3OBYA 3K5MA 4LF8K 1HYVA 3SI6A 3OYBA 4DSJA 3NF6A 4JKBA 3VQDA 4CGIA 3MX2A 4ZTFA 2HOEA 3T19A 3OVNA 1BI4A 2XY7A 5C15A 3LP2A 1LWFA 3NF9A 4YORA 2O8DB 5AQRA 1NBWA 3CETA 3PIOL 2RPIA 3SPZA 3QESA 4AM6A 5KRSA 3MECA 3VPZA 1KD1O 1VQ5N 3E66A 1DTQA 2P9PB 3ITHA 2O8EB 3R3LA 3ZT0A 4FWRA 3LWLA 1HKCA 1OH7A 3UKRA 2QWLA 4FWQA 5J2MA 4EP5A 2YNGA 3OBWA 4LY7A 2X78A 4RG8A 1IKVA 4OO1J 3SJHA 4H0XB 5AQHA 3OA9A 2P1JA 5AQJA 1VRTA 2QWRA 3BZCA 1JXEA 1JL1A 4Q5VA 1C0MA 1UA1A 3M6GA 5CYMA 4IOAL 1HR0K 1RBTA 3WQTA 3EZ5A 2VWJA 4G1QA 4CD3A 1KFSA 4Z4CA 2P9KB 3HP9A 3L3UA 4JKEA 2KKZA 3DXMB 2QEXN 3AAPA 2ATQA 4LF7K 1QE1A 4K41A 4DQ8A 4LFCK 2NRTA 4OPJA 1KXPA 4CJ3A 3OS0A 1HYZA 2A5XA 3VQAA 4A57A 2ZGZA 4KREA 4BG8A 5EVZA 3TANA 1T8EA 2G8VA 4B3RK 5FDLA 3OJSA 1TAQA 4UY8O 1RBUA 1UWBA 1B92A 4I2PA 2IVPA 3CM6A 4CJVA 4EP4A 4NXMK 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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