4QS9A

Arabidopsis hexokinase 1 (athxk1) mutant s177a structure in glucose-bound form
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
461
structure length
450
Chain Sequence
WGRVLAILKAFEEDCATPISKLRQVADAMTVEMHAGLASDGGSKLKMLISYVDNLPSGDEKGLFYALDLGGTNFRVMRVLLGGKQERVVKQEFEEVSIPPHLMTGGSDELFNFIAEALAKFVATECEDFHLPEGRQRELGFTFAFPVKQTSLSSGSLIKWTKGFSIEEAVGQDVVGALNKALERVGLDMRIAALVNDTVGTLAGGRYYNPDVVAAVILGTGTNAAYVERATAIPKWHGLLPKSGEMVINMEWGNFRSSHLPLTEFDHTLDFESLNPGEQILEKIISGMYLGEILRRVLLKMAEDAAFFGDTVPSKLRIPFIIRTPHMSAMHNDTSPDLKIVGSKIKDILEVPTTSLKMRKVVISLCNIIATRGARLSAAGIYGILKKLGRDQKSVIAMDGGLFEHYTQFSECMESSLKELLGDEASGSVEVTHSGIGAALLAASHSLYLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Hexokinase-1
publication title Biochemical and structural study of Arabidopsis hexokinase 1
pubmed doi rcsb
source organism Arabidopsis thaliana
molecule tags Transferase
total genus 155
structure length 450
sequence length 461
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4qs9A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4qs9A01
3A8YA 1JCEA 1Z6RA 1NBWA 1BA1A 4BRPA 4XH1A 3M3ZA 1JCFA 4BRLA 2E20A 3FZMA 2DPNA 3J8AA 3CJ1A 2P9LA 1YXQA 1OKJA 2A5XA 2QWPA 3SK3A 3HSCA 3R9PA 4H0YB 4CZLA 5AQPA 5TKYA 2ZGZA 2VYPA 3MN5A 1GLLO 1NGCA 4BC4A 4B1XB 4H0VB 4Y0WA 4GNIA 4MO4A 3FFKB 3FZFA 1XUPO 3O5BA 3FE1A 2QWRA 5AQOA 2D4WA 2BUPA 2FSNA 4CI6A 4BGBA 4BVPA 3ATUA 4B1UB 5AQKA 3WUHA 4IJNA 1KXPA 1ZBSA 3ZETB 3H46O 3HBTA 4ISEA 5AZJB 2ZWHA 3G25A 1K8KA 4FWMA 3BF3A 4CBWA 1NGGA 4CBUA 1ATRA 5KPRA 3MN7A 3S41A 3VEZA 1NGBA 2I7NA 3DXMB 3QBWA 2HF4A 4JHDA 3U4LA 4F9OA 2GUPA 4BGAA 3FLCO 4DQ8A 4EHUA 3FGUA 4FWSA 2UYTA 1SQKA 5AQSA 2Q1NA 2IVPA 4BR0A 3IFRA 1JCGA 5KQ8A 3QFPA 3VEWA 1YAGA 2FSKA 2GELA 3EKUA 3FZKA 2IVNA 3CQXA 1NGAA 1GLBG 1GLDG 5AZIB 1NGFA 3HTVA 3MN9A 4FSVA 5AQZA 1C0GA 3VGKA 1QQNA 3LDPA 2WUSA 4BRFA 5AQJA 3VGLA 3AAQA 1GLEG 3CJCA 4JAXA 3VGMA 3P4IA 3DXMA 2P9KA 3SLCA 3AAPA 4LC9B 3TPQA 2QM1A 5AQWA 1WUAA 5AQYA 5JMVA 3LDNA 4C23A 1MDUB 4HTLA 3U9DA 1Q18A 1X9JA 2A6AA 1U2VB 3WXJA 4CD1A 2ZF5O 4CZHA 2A3ZA 4WQ4A 3H3NO 3EL2A 2NZTA 2P9IA 4BQLA 4QS7A 3ZEUB 3C0BA 2Q36A 4CZMA 1S22A 4EAHD 2YJFA 1BDGA 2PAVA 5AZIA 2F9WA 4K41A 4GY2B 4BR7A 1QZ6A 4BC5A 2NRHA 3KVGA 4BR5A 3ZX0A 5JLHA 2A41A 5JLFA 3VESA 3VEOA 3QBXA 1QQOA 2ZGYA 3ATVA 4H0TB 3QMLA 2FLOA 3FZLA 2Q97A 4BRGA 4CZFA 1U2VA 3A5LC 5ADXH 3JXUA 1GLCG 4BRCA 5BRDA 4FWPA 4WYBA 4ISFA 5BRFA 1T6DA 4WQ4C 3WEEB 1NGEA 2GTDA 3ZEUA 1H1VA 4BQZA 1D4XA 1K8KB 2Q2RA 2V7YA 3FR0A 3CJBA 3BEXA 3HI0A 5BREA 3MN6A 3WT0A 2QWLA 2YHWA 5AQHA 2A42A 2YI1A 1LOTB 3QB0A 2V51B 1BA0A 1J6ZA 5AFUH 5JICA 4JHDB 3ENHA 2E2OA 3JS6A 3VOVA 4BRAA 3GDQA 3QDKA 5BN9A 1RGIA 3GL1A 4WQ5A 3GBTA 3HM8A 3IUCA 1NGHA 3H1VX 4IO8A 5BPLA 3H45C 4BRDA 2P9NA 4PKHA 3OHRA 2H3GX 3CJ7A 4H5WA 3GG4A 2J4RA 3UE5A 4FPBA 5KPTA 5FPNA 2YHYA 1HPMA 1BG3A 2VCPA 2CH5A 2E2QA 3MMVA 3WEEA 5B8HA 1HUXA 3ZX2A 4FOIA 3EZWA 4J8FA 1NMDA 1R59O 2ASOA 1T44A 4CBXA 1HLUA 1E4FT 5AQNA 4CZEA 1BWFO 2BTFA 3D2EB 5E84A 2P9KB 2PBDA 3B8AX 2E2PA 4Z94A 1LCUA 2D0OA 4FPAA 1QZ5A 4AM6A 1KAZA 4PKIA 4A61A 4FO0A 3L4IA 5BPMA 2V52B 3LDLA 2W41A 3VEXA 1GLJO 3D2FB 2P9IB 4WQ5C 4NB4A 3U9ZA 3HZ6A 2ASMA 4I6MB 3LM2A 1QHAA 2CGJA 4DHYA 2FXUA 3O8MA 5F2RA 1YUWA 1HKCA 5KPZA 1HKBA 1TUYA 2Q0RA 3A0IX 3EN9A 3L0QA 4BC2A 3AY9A 4MLHA 4B1YB 4IWVA 2AP1A 4CZGA 4BRMA 5AQGA 5EOYA 1TYQB 3D2EA 3A5MC 3SJHA 2ASPA 1E4GT 2CGKA 4MLEA 4H5TA 3C7NB 5AQRA 1RFQA 2D1KA 3ENOA 1CZAN 3KZBA 1Z05A 2OANA 4CZJA 3VETA 4CZKA 1ZC6A 3A5OC 3AARA 3D2FA 3CI5A 2QWOA 1MA9B 2CH6A 2I7PA 3LDOA 3LDQA 3CQYA 4CZIA 3VENA 4I6MA 4IJAA 4YDUC 4BC3A 3VERA 1HJOA 2NLXA 2KHOA 1ZXOA 4FWOA 3WQUA 1V4SA 5BPNA 5LJWA 4PKGA 3DAWA 4BREA 1X3MA 2QWNA 3LL3A 1NGJA 1C0FA 2EWSA 5AQXA 1TYQA 3W0LA 2P9UB 1NLVA 1XQSC 2P9NB 3C7NA 3EKSA 2Q0UA 4B1ZA 3EO3A 3TU5A 3DXKB 4EIAA 5E26A 5AQUA 3D7EO 1DEJA 1IG8A 5EX5A 5BR9A 2HMPA 3O6WA 4H0PA 4XH4A 2E2NA 3M1FA 4E1JA 2GWJA 3WXLA 4AM7A 5AFUA 4DB3A 3W3DA 4RCHA 4EHTA 4FWRA 5EVZA 3BP8A 1BUPA 5FPMA 3CJAA 4EFHA 4BR4A 4FWQA 4FWLA 3I33A 5AQTA 2VWBA 4BRQA 5KQDA 4M7XA 4HWIA 5LJVA 4NO7A 4PL7A 2CGLA 3H3OB 3ZX3A 4L3QA 2P9UA 3FZHA 4IXCA 4FOEA 3WQTA 3WXIA 4BRKA 4BVOA 3GE1A 3IDHA 3DXKA 4RTFD 3A5NC 4KBOA 3VPZA 1NM1A 4O5FA 4H5RA 3ULEA 2P9PB 4JN4A 1U6ZA 3RSEA 2P9SA 1SAZA 3H1QA 1WOQA 1EQYA 4K42A 1ATSA 4DCHA 5F0XA 1BO5O 5AQLA 3UKUA 3CHWA 2E88A 4QS8A 4JNEA 5LY3A 4FWNA 4BRIA 4CJ7A 1HKGA 5AQMA 2GEMA 3BUZB 1IJJA 1DGKN 1V4TA 1BU6O 3BF1A 3I8BA 5EXWA 2QW9A 4BRHA 2FF3B 1P8ZA 2YHXA 3F9MA 3MK6A 3R8EA 4JD2B 2E8AA 3LM9A 1DKGD 4H0OA 1XC3A 3MDQA 4YDUA 5EY4A 4A62A 3QICA 5BN8A 4K25A 3M6GA 5BRHA 2IVOA 4B1WB 1TUUA 2ITMA 4FL9A 2P9PA 3UB5A 5I9EB 4B1VA 3WXKA 1NGIA 3CJ9A 4H03B 1KAYA 3H6EA 4M7YA 3SMSA 1SZ2A 3L6QA 2Q31A 1YVNA 2QWMA 4A2BA 1MWMA 3O4WA 1KAXA 3GOIA 2FSJA 1T6CA 5AR0A 4H5VA 3QFUA 3O1BA 3SMPA 5ELZA 5AQIA 3CIPA 3VEYA 2FF6A 3ZETA 3DJCA 2QWQA 3UKRB 5AQFA 5AZJA 3KHYA 4PL8A 4JD2A 1BOTO 1NWKA 4MO5A 4BR9A 1S3XA 2GWKA 3VF2A 4H5NA 3R6MA 2A40A 4IZ9A 4A2AA 4B9QA 5FPEA 2D0PA 4CD3A 5AQVA 4O8KA 3VF4A 1HX1A 2E1ZA 3ID8A 1ESVA 2V7ZA 4FWKA 5CE3A 5ADXA 2F9TA 1X3NA 2IIRA 4XEIA 4BG9A 2P9LB 4ISGA 1G99A 1NGDA 4BROA 4H0XB 4RWTA 3CETA 4M63C 3VF6A 5F1XA 3CERA 2YCHA 3O80A 3IMXA 1RDWX 4BR2A 2AA4A 3DWLA 4QS9A 1QQMA 3MCPA 3UKRA 3VEVA 4K43A 3ULEB 4BG8A 5AQQA 2QXLA 2W40A 2HF3A 3RSEB 1GLAG 2P9SB 3O08A 1ATNA 5FPDA 1Y64A 2E1YA 4XH5A 4BRNA 2YJEA 1MWKA 3O1WA 3UKUB 1GLFO 2HOEA 3U8XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BGXT 3O3HA 2P5GA 1NBWA 3SYZA 4BDPA 4BRLA 3M3ZA 2E20A 1I3AA 3FZMA 5C12A 4CK1A 3QEPA 3HSCA 3R9PA 3NF6A 4DR5K 5TKYA 2VYPA 1WAFA 2Z1JA 3DM2A 1GLLO 4OLBA 1J5OA 1S9EA 2O8BB 4B9LA 4FJMA 1A5VA 4LF6K 4AILC 1CLQA 4MO4A 4ZTFA 2IS3A 4DLEA 5M1KA 5JS1A 1KD1O 3FE1A 5AQOA 2BUPA 3VQQA 3EEQA 3CCJN 2BH1A 1JL2A 3P1GA 5AQKA 3ZCMA 1KXPA 1VSLA 3WNEA 4KREA 3H46O 3HBTA 1B9DA 4ISEA 3TANA 3NFAA 4YOWA 4B9VA 1NGGA 1YTAA 4CBUA 5KPRA 3PIOL 1NGBA 4JHDA 3NF8A 1KFDA 4C8MA 3FLCO 4J2BA 1RT4A 4FWSA 1IBKK 5AQSA 3CQ8A 3IFRA 5M1OA 2HSTA 4C1NI 5KQ8A 4PHTX 1VQON 1SV5A 1A5WA 3THYA 4GVEA 3NGYA 3FZKA 2IVNA 1NK4A 2KW4A 3CQXA 4IEEA 1GLBG 1NGAA 3MN9A 3SNNA 3VGKA 1TGOA 3LDPA 3CFOA 5K14A 3OYFA 4FJJA 1E3MA 4IOXA 1UOCA 3VGLA 1GLEG 1KTQA 3NGZA 3DXMA 3SLCA 4LC9B 2QM1A 5AQWA 4C23A 4M3YA 1WSHA 4O0IA 3CM5A 4KV8A 1X9JA 1U2VB 3MEDA 1T05A 1NJWA 4CZHA 3EL2A 3TAGA 4JKBA 3ZEUB 1BCMA 3C0BA 1N8RO 1VQKN 4EAHD 3HJFA 1NJXA 2PAVA 2FBYA 3SI6A 5M1FA 2NRHA 1XMOK 2ITGA 1KVCA 4CF1A 3ZX0A 3VQBA 3VN5A 5JLHA 5JLFA 3VESA 3AO2A 1NG9A 2IOCA 3B6OA 3Q7CA 2XO7A 2HHXA 3V9UA 4YOVA 3AVFA 3THXA 4O0JA 5CYMA 3CCLN 5BRFA 5I3UA 1XI1A 2E6MA 1H1VA 1D4XA 3K58A 3HI0A 4CJQA 1TKXA 3MN6A 3WT0A 2QWLA 1NKBA 1NNEA 1N36K 3RR7A 1LOTB 4CEFA 2V51B 1BA0A 1J6ZA 2YHBA 4DKWA 3JS6A 3V9WA 4KH6A 3VOVA 3KLHA 3LAKA 3QDKA 1L3VA 1REVA 1NGHA 4IO8A 3H45C 4BRDA 2P9NA 4XIUA 5FPNA 1TKTA 4WF9L 3RRHA 1BG3A 2VCPA 3LALA 1IBLK 1N32K 1YJNN 3WEEA 5B8HA 4LF4K 1HUXA 4FLZA 4FOIA 3SV3A 3EZWA 2QA4N 1R59O 4CJ5A 1WAJA 4DQSA 4CBXA 4CEAA 5AQNA 4PY5A 4CZEA 1KRPA 3N4PA 4GVMA 3B8AX 4B8CA 2E2PA 1LV5A 3L2WA 1T8EA 1VQ8N 3O3GA 4I9LA 5BPMA 1C0TA 3EYZA 1RNHA 3V9XA 3SAFA 3VEXA 4CFCA 1WSEA 1QE1A 3U9ZA 4BDYA 5FDLA 2G8FA 5J1EA 5SZTA 3L8BA 4NYNA 5F2RA 1HKCA 4DQRA 3ENBA 3K9JA 1NK6A 4CJPA 5C0YA 4CEQA 1KVBA 1BQMA 3KKRA 2Z1IA 4BRMA 4FJKA 4JI4K 2B4JA 2RE2A 3LWLA 3J7ZO 3DRPA 4BWJA 2EX3A 1LAWA 3KLIA 2ASPA 4H5TA 5AQRA 3HP6A 3T1YK 3ENOA 3AVCA 1CZAN 1QSLA 3KZBA 2OANA 3LDSA 4CZJA 4GKJK 3THWB 4WFAL 1XNRK 3TAQA 3TABA 3PSFA 3P31A 1MA9B 3V1RA 2HW3A 3V9ZA 4J2AA 1IKWA 3LDQA 3CQYA 2UUAK 3VENA 4I6MA 3M8QA 4DS4A 4CJKA 4YDUC 1BCOA 3QIOA 4O8UA 4K0KK 1EX4A 4FWOA 5BPNA 3P5JA 1TAQA 3DAWA 4PKGA 3F9KA 2QWNA 3LL3A 2EWSA 1TYQA 1B9FA 4YOUA 2P9UB 4Z4GA 3AVGA 2Q0UA 3DI6A 1UA1A 2O8FB 2F7TA 4K8ZA 3TU5A 2PYLA 1BQNA 2Z1HA 1DEJA 1VQ6N 3O3FA 4KHNA 4DB3A 2HHVA 4RCHA 5CZ2A 1BUPA 1BI4B 4HUEA 3I33A 2IDOA 2ZD1A 1T03A 4CIEA 4CE9A 1HNZK 4YFUA 1K73O 2DY4A 3PY8A 2RKIA 4DFJA 4M7XA 3K5MA 1NK5A 4FLYA 5LJVA 1DTTA 3K2PA 4PL7A 3ZX3A 5J2NA 4ILGB 3P83D 2E5LK 4BVOA 4DTSA 3IDHA 4RTFD 3L2UA 3U3GA 3RRGA 4KAZA 1EWQA 3VPZA 1U49A 3AGKA 4IFYA 3ULEA 3ZSXA 3TSUA 2P9PB 4JN4A 4MQ3A 1U6ZA 3CMAN 3RSEA 5I42A 2P9SA 1JLBA 1SAZA 3H1QA 1WOQA 2UUBK 2P5OA 1ATSA 3ISNC 3UKUA 3TAFA 1TL3A 4FK0A 2E88A 4DSJA 4QS8A 1FJGK 1KLMA 4RW7A 3O9SA 4FWNA 4BRIA 4JI1K 3F5TA 3OYKA 1XWLA 1IJJA 1ASWA 2YNIA 3QEVA 2YHXA 3L4QA 3EE8A 1SKSA 4JD2B 2Z1GA 4CHYA 2YHAA 3LM9A 4E3SA 4H0OA 1BISA 3MDQA 4YDUA 5BN8A 2W42A 4K25A 4AF1A 3ID6A 5I9EB 3CJ9A 2KZMA 4QOZB 4JKGB 2FBTA 1RT5A 3VQ8A 1J9AA 3K57A 2D5RA 2Q31A 3V1QA 3SQ4A 2O8CB 3O4QA 3BDPA 4A2BA 1XC9A 1EO1A 1KAXA 3VQDA 3GOIA 3MX2A 3O9QA 1T6CA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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