4QS9A

Arabidopsis hexokinase 1 (athxk1) mutant s177a structure in glucose-bound form
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
461
structure length
450
Chain Sequence
WGRVLAILKAFEEDCATPISKLRQVADAMTVEMHAGLASDGGSKLKMLISYVDNLPSGDEKGLFYALDLGGTNFRVMRVLLGGKQERVVKQEFEEVSIPPHLMTGGSDELFNFIAEALAKFVATECEDFHLPEGRQRELGFTFAFPVKQTSLSSGSLIKWTKGFSIEEAVGQDVVGALNKALERVGLDMRIAALVNDTVGTLAGGRYYNPDVVAAVILGTGTNAAYVERATAIPKWHGLLPKSGEMVINMEWGNFRSSHLPLTEFDHTLDFESLNPGEQILEKIISGMYLGEILRRVLLKMAEDAAFFGDTVPSKLRIPFIIRTPHMSAMHNDTSPDLKIVGSKIKDILEVPTTSLKMRKVVISLCNIIATRGARLSAAGIYGILKKLGRDQKSVIAMDGGLFEHYTQFSECMESSLKELLGDEASGSVEVTHSGIGAALLAASHSLYLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Biochemical and structural study of Arabidopsis hexokinase 1
pubmed doi rcsb
source organism Arabidopsis thaliana
molecule tags Transferase
molecule keywords Hexokinase-1
total genus 155
structure length 450
sequence length 461
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4qs9A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4qs9A01
2E2OA 2PAVA 5FPMA 2P9UB 2I7NA 5AR0A 4XH1A 4ISEA 3SMPA 2E2PA 2FF6A 4H5VA 1BUPA 1ZC6A 4JAXA 4BRDA 4H03B 4FPAA 5AZIB 3L4IA 3FZKA 4BGAA 2V7YA 3EL2A 3QBWA 5F2RA 1HX1A 1BWFO 3A5LC 4CZGA 4C23A 3FR0A 3M3ZA 1HPMA 1NGFA 2HMPA 4JD2B 2IVNA 5BRDA 1NGCA 1S3XA 1WUAA 3ATUA 5AQNA 3ENOA 3MN6A 5BN8A 2KHOA 3CJBA 2QWRA 3FFKB 2FSNA 1NGBA 4BC3A 2NRHA 2I7PA 2CGJA 5E26A 5CE3A 1KAXA 2QWLA 4CZEA 5FPNA 2OANA 3H1VX 3QICA 4PL8A 1TUYA 4WYBA 5BPMA 2DPNA 4BRNA 1C0FA 3UB5A 2E88A 1E4FT 1DGKN 3DXKB 4H0TB 5EX5A 2IVOA 5LY3A 3WXLA 1JCGA 4H0PA 1SZ2A 1HKGA 2ITMA 1T44A 3CJ1A 3WT0A 1JCEA 1GLBG 1HLUA 1YVNA 1XQSC 3FLCO 3JS6A 3U4LA 4CI6A 2A41A 1S22A 4CZKA 2VYPA 5BPLA 5FPDA 3W0LA 5ADXH 4FWSA 1SQKA 1U2VA 3VGKA 3MMVA 4YDUC 5BREA 3VEYA 1BOTO 1G99A 4FPBA 1NGIA 3HTVA 3ULEB 4BRQA 2A42A 4ISGA 4CZFA 4K41A 3LDNA 1ATRA 3A5NC 3WQUA 2J4RA 2F9TA 4IXCA 4B1XB 1Y64A 4B9QA 2A40A 3AAQA 2A3ZA 3CJCA 4BRIA 1OKJA 4WQ5C 5FPEA 5AQMA 1H1VA 2ZGZA 2E2QA 4PKGA 3VEXA 3QFUA 1MWMA 3SMSA 5B8HA 3CJ9A 4FWLA 3CETA 1NGGA 3U9DA 3VENA 4BC2A 3GDQA 1QQNA 3LDPA 4CBXA 2HOEA 4EHTA 5AQWA 3GOIA 2P9PA 1X9JA 2GELA 4BR4A 4NO7A 3CJAA 3LM9A 2P9UA 4FWOA 1ATNA 1NM1A 4BVPA 3DAWA 2Q0RA 5AQJA 3QMLA 1C0GA 3I33A 4FWMA 3D2EB 4O5FA 3FZLA 1RDWX 2CGLA 1NGHA 2P9IA 4IZ9A 3ZETA 1MWKA 2QWQA 3WXJA 3CERA 4CBUA 3ZX0A 4FWNA 4HWIA 3D2FB 4EFHA 4PKIA 4K42A 4BRPA 2D4WA 3M6GA 4WQ4C 5EVZA 2FSJA 2P9SB 3KZBA 1RFQA 1X3NA 5KPTA 5AFUH 2QM1A 5AQXA 1KAZA 1XC3A 3KHYA 5KPZA 5AQKA 3MN5A 3BF3A 1BG3A 1NGDA 3VEOA 4FWKA 3GL1A 4BQLA 2ZGYA 4JHDA 1SAZA 3DXMB 3JXUA 3TU5A 2FXUA 3IUCA 3HBTA 3WXIA 1NGJA 4BREA 5KQ8A 1MA9B 4A2AA 5LJVA 5BPNA 2E1ZA 5AQGA 3VETA 3O4WA 3VPZA 3C7NA 3D2FA 3CI5A 3QBXA 2P9KA 3AY9A 5AZIA 3UKRB 2BTFA 2HF3A 2E1YA 1K8KB 2D0OA 3ATVA 3EKUA 5KQDA 1KAYA 2IVPA 1NLVA 3VF2A 4PKHA 1HJOA 4FO0A 1RGIA 1T6DA 4XEIA 4F9OA 1V4SA 4FOIA 2YJEA 3ZEUB 2CH6A 3O8MA 3O80A 4O8KA 3EN9A 3R6MA 4H5NA 3CJ7A 3IFRA 4WQ4A 4E1JA 4PL7A 5AQOA 3WXKA 3IMXA 4H5TA 3CHWA 4H0YB 4B1WB 4RCHA 4BRCA 5EXWA 2P9PB 2QWPA 3ZX3A 4DB3A 3WQTA 4H5WA 1BU6O 3LM2A 3QDKA 3WEEA 4FWRA 1IG8A 4A62A 4BG8A 4I6MA 2EWSA 4H5RA 1GLFO 4BR2A 4XH4A 3DJCA 4IO8A 4B1YB 3A5MC 1KXPA 3DWLA 4EHUA 3ENHA 2NLXA 2V52B 3VESA 3WUHA 4AM6A 1TYQA 1BDGA 3ZX2A 2D1KA 2P9NB 5JLFA 5AQRA 3GE1A 4FWQA 1X3MA 5KPRA 3D2EA 4MLEA 4I6MB 1QQMA 1YXQA 3UKRA 3O6WA 1E4GT 3DXKA 4IJNA 3HSCA 3UE5A 2CGKA 2E20A 5EY4A 4BRAA 3BUZB 3H3OB 2W40A 3GG4A 1GLEG 1T6CA 2E8AA 3H3NO 5TKYA 3VEZA 4B1ZA 3CQYA 3A5OC 3W3DA 2ASMA 2GEMA 1Q18A 4FWPA 5EOYA 3UKUA 4GNIA 4EAHD 1NWKA 5LJWA 2V7ZA 4HTLA 3FZFA 3AARA 2AP1A 1ZXOA 3O1BA 3VGMA 3EZWA 2QW9A 4BR9A 2PBDA 5BR9A 2E2NA 4JN4A 3SJHA 4DCHA 1J6ZA 1BA0A 3L0QA 5I9EB 3S41A 3FGUA 5AQUA 1WOQA 5AQQA 3VF4A 2IIRA 4IJAA 4M7XA 4NB4A 2ZF5O 3WEEB 4BC4A 4RTFD 3O08A 4LC9B 5AQZA 1YUWA 1ZBSA 1U2VB 3R9PA 4BRLA 3SLCA 3M1FA 4JHDB 2P9KB 4QS8A 2Q36A 3H6EA 2FLOA 2P9LA 3H45C 3F9MA 1TUUA 2ASPA 4CD1A 3VEVA 2ASOA 2H3GX 1NBWA 3A8YA 4BG9A 5AQYA 1BO5O 1NGAA 2QXLA 3FE1A 4L3QA 3R8EA 1QQOA 3C0BA 3UKUB 4BRGA 2VWBA 1U6ZA 4H0OA 5F0XA 3FZMA 1ESVA 1GLCG 2FF3B 2QWNA 3SK3A 4EIAA 1Z05A 1QZ6A 4CZLA 5JMVA 1BA1A 1NMDA 3EKSA 3RSEB 2WUSA 2QWMA 5JLHA 3CIPA 3IDHA 1Z6RA 1GLLO 2P9NA 3BEXA 1HKCA 5F1XA 1HUXA 2YI1A 2YHWA 2VCPA 5AQPA 5AQIA 5AQLA 3KVGA 4QS7A 1V4TA 1GLJO 5AFUA 3LL3A 5AQHA 5BRFA 4JNEA 3FZHA 3DXMA 1LOTB 3G25A 3H46O 2YCHA 4BR5A 3B8AX 3RSEA 1GLAG 3MCPA 2Q31A 3P4IA 4IWVA 4BRFA 2GWKA 2CH5A 2V51B 2A6AA 4M63C 2P9IB 1NGEA 3ZETB 2P9SA 1D4XA 1QZ5A 2UYTA 3EO3A 3LDQA 4WQ5A 5ADXA 4J8FA 3HI0A 4K25A 1K8KA 5BN9A 3VEWA 1JCFA 2GTDA 1TYQB 2Q1NA 4DHYA 1MDUB 1ATSA 4Z94A 4CBWA 4B1VA 4CZHA 2YHYA 3VGLA 3O1WA 5BRHA 4K43A 2FSKA 5AQVA 3BF1A 2F9WA 3GBTA 3ID8A 4Y0WA 4A2BA 4GY2B 4AM7A 3H1QA 2YHXA 2AA4A 1QHAA 3U9ZA 3A0IX 2ZWHA 1R59O 1CZAN 4CZMA 1P8ZA 1IJJA 2Q0UA 4CJ7A 4MO5A 3HM8A 4CD3A 3QFPA 3MDQA 4BVOA 4CZIA 3BP8A 5AQFA 1DEJA 3MN9A 3ZEUA 2GUPA 4BR7A 4BC5A 2BUPA 3MN7A 1HKBA 4YDUA 1EQYA 5AZJA 3U8XA 4A61A 3AAPA 3O5BA 4H0VB 3MK6A 4MO4A 3LDLA 5AZJB 4FL9A 4BR0A 1LCUA 4ISFA 4QS9A 1YAGA 4XH5A 4H0XB 2GWJA 3C7NB 3J8AA 3VF6A 1GLDG 5JICA 4BRHA 3L6QA 3ULEA 1DKGD 3TPQA 3HZ6A 4M7YA 4KBOA 2YJFA 4FOEA 1XUPO 3CQXA 4BGBA 2P9LB 5AQSA 4MLHA 5AQTA 3VOVA 4B1UB 2HF4A 5E84A 3LDOA 4BRKA 4RWTA 3I8BA 4JD2A 4FSVA 4BRMA 3D7EO 4BQZA 2W41A 4BROA 2NZTA 3VERA 2D0PA 2Q2RA 5ELZA 4DQ8A 3QB0A 3OHRA 2A5XA 2Q97A 2QWOA 4CZJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HP6A 5FPMA 4FVUA 4JYAK 3RMBA 2FC0A 1LAVA 4FJIA 1T05A 4H5VA 1BUPA 4XIUA 4FLXA 5C15A 4BRDA 4YFUA 3WXMB 5CZ1A 2YX6A 3TSUA 4UQGA 5C25A 3HSTB 4CGJA 4FK2A 1HX1A 1BWFO 4O8UA 5J1EA 3AA4A 1HPMA 1NGFA 2BANA 3V1OA 1RILA 2DY4A 2LSNA 5AQNA 3PX0A 3PY8A 1JLGA 2KHOA 3CJBA 1HR0K 1IV0A 3FFKB 4LSNA 3SQ4A 4M3ZA 2I5JA 3K58A 3TARA 2AJQA 4O4GA 5E26A 4CJTA 2QWLA 4CZEA 4DV1K 1QVGM 4X65K 3M8RA 4DV4K 4WYBA 4DV0K 3NH2A 4BRNA 4IG3A 2E88A 2XRIA 3DXKB 2IVOA 4YNQA 5LY3A 4M3YA 2HW3A 4CFCA 1RT7A 4EZ9A 2ZM6K 3CF5L 3MECA 1D5AA 4CJ3A 4DTNA 1EETA 1IBMK 3K57A 1OH5A 2O8DA 4CFAA 3K0SA 3SAFA 5KI6A 4CI6A 4CZKA 2A41A 5HRNA 5ADXH 4FWSA 4YDUC 5JS2A 4NYNA 2Q3SA 4FPBA 4IDHA 4AH9A 3HT3A 4BRQA 1WAJA 4BDYA 5J2QA 3A5NC 1VSHA 4B1XB 3NHGA 4B9QA 4HUEA 4CFDA 4JI4K 1BQMA 4F2RA 3CJCA 1CLQA 1WSGA 4WQ5C 3RRHA 4CJEA 2GX9A 3VEXA 3QFUA 1T8EA 1MWMA 4N41A 4E3SA 3V1RA 4DS5A 3CJ9A 4FWLA 4KHNA 3QNOA 4OGEA 1NGGA 2XY5A 3AO1A 1BCOA 2GV9A 3AVKA 4O44A 3T7ZA 3M8PA 4NO7A 3LDSA 1TL3A 2UU9K 3TAGA 2UXDK 4BVPA 1NM1A 4OGCA 5AQJA 3QMLA 4FJKA 4FWMA 3CC2N 4O5FA 4FZXC 2CGLA 2P9IA 4IZ9A 3G6EN 1GOCA 3C94A 4CJSA 3HPOA 4IEIA 4HWIA 1EO1A 4BDZA 1W0HA 4K42A 3LZJA 4UY8O 2RKIA 1NOZA 3B6OA 4DSIA 2QM1A 5AQXA 4B9TA 5KPZA 5AQKA 1KFSA 3BF3A 1BG3A 1NGDA 4DR3K 3S9HA 1TKZA 4CGFA 3QINA 5M1OA 3VEOA 2ZGYA 4OJRA 3SI6A 5M1FA 4ILHA 3DXMB 4WFBL 2FXUA 3C6HA 3OYAA 4BREA 3RMDA 2D0CA 1B92A 3DMJA 4U7BA 2UUCK 4NCGA 3OJSA 3C7NA 3CI5A 3QBXA 2P9KA 5AZIA 2HHQA 3OYIA 2HF3A 2ITGA 2GBZA 3CFOA 3J81O 5KQDA 1KAYA 2IVPA 3F5TA 1RBUA 4ELUA 1NJZA 4FXDA 4DTUA 3KKRA 4JKEA 4F9OA 3C6UA 4FOIA 1YT3A 2YJEA 3OY9A 4Q5VA 3CYMA 3O8MA 4O8KA 3EN9A 3R6MA 3CJ7A 3IFRA 3CFRA 4NXNK 2HB5A 4FJMA 1FKPA 3N4PA 3S3OA 1HNWK 3IMXA 1UA0A 2BE2A 1VSKA 4DV3K 4W5OA 1XWLA 4RCHA 4BRCA 5IT9O 3ZX3A 4FLWA 4Z4EA 4KTZA 5FRNA 1IG8A 4A62A 1S1VA 2EWSA 2B6AA 4XH4A 1JKHA 1OVQA 3HJFA 4B1YB 4A57A 4EHUA 2V52B 4AM6A 3L3VA 4JLHA 4H8KA 3P31A 4KHPK 2D0AA 1BDGA 1NK8A 2P9NB 3B6PA 5HROA 3AVGA 4KHSA 2KZMA 1O13A 3BGRA 1YXQA 3UKRA 3NVMA 1QQCA 4O55A 1D9FA 4CJUA 4FZZA 5GADP 2CGKA 4FM0A 4BRAA 3BUZB 4U67L 4O0IA 2OZSA 5T7BA 1Q82O 2IC3A 3W3DA 2ASMA 3S3NA 2DFFA 4JI1K 3RMCA 5EOYA 1XC9A 3UKUA 2G8FA 4DTMA 4Y1DA 4DSLA 4CEOA 5J2PA 3AARA 3AVCA 4OVLA 4BR9A 5FRMA 3PIOL 3AA2A 2HHXA 3SV3A 3MXMA 4CJFA 3SJHA 5BR9A 4FM1A 3VQPA 1BA0A 3LPTA 5I9EB 4X66K 3S41A 4CJPA 1WSHA 1VQLN 3TR8A 5DM6L 4JI7K 2ZF5O 3WEEB 3L8BA 2NUBA 4BRLA 2X78A 4JHDB 2UUAK 2G8KA 3H6EA 4LSLA 1J5OA 4OPJA 3DM2A 4FVMA 2P9LA 3VMFB 1JLQA 3H45C 4W5RA 4IO9L 1OH7A 1NBWA 3OW2M 3P1GA 5AQYA 4KRFA 2HHSA 2PY5A 2YV0X 3R8EA 3C0BA 2VWBA 2IOCA 4H0OA 4JS5A 3OTOK 5F0XA 4Z4HA 3OYMA 1EX4A 4OKKA 1VQON 1A5XA 4C8LA 1QZ6A 2YHAA 2QWMA 2RE2A 3CM6A 1Z6RA 3AVLA 3BEXA 3HYFA 1NK4A 1BL3A 1HUXA 4KH4A 1W97L 2VCPA 3KVGA 4QS7A 5KRSA 1GLJO 2P5OA 4C8NA 1C0MA 3QO9A 2XO7A 3SCXA 1C1CA 3BZCA 4KH6A 4JI8K 3HOTA 4PHTX 3E9LA 1HNXK 1VAZA 2CH5A 4DUYK 3KIOA 2V51B 3J7YP 4B9VA 2A6AA 1XI1A 1YJNN 4M63C 2P9IB 1NGEA 1EWQA 1QZ5A 2UYTA 3EO3A 3LDQA 4K8ZA 5BN9A 1M1KO 3O9QA 4E1NA 1YITN 1ATSA 4DS4A 4JK8A 3IKMA 4C8MA 2FSKA 3CCMN 1JL2A 3VQ5A 4OLAA 5SZTA 5C0YA 3GBTA 3ID8A 4Y0WA 3V9UA 4EZ6A 2KZZA 3OYDA 4YOUA 1NKCA 1QHAA 2G8WA 4OKEA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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