4QS9A

Arabidopsis hexokinase 1 (athxk1) mutant s177a structure in glucose-bound form
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
461
structure length
450
Chain Sequence
b'WGRVLAILKAFEEDCATPISKLRQVADAMTVEMHAGLASDGGSKLKMLISYVDNLPSGDEKGLFYALDLGGTNFRVMRVLLGGKQERVVKQEFEEVSIPPHLMTGGSDELFNFIAEALAKFVATECEDFHLPEGRQRELGFTFAFPVKQTSLSSGSLIKWTKGFSIEEAVGQDVVGALNKALERVGLDMRIAALVNDTVGTLAGGRYYNPDVVAAVILGTGTNAAYVERATAIPKWHGLLPKSGEMVINMEWGNFRSSHLPLTEFDHTLDFESLNPGEQILEKIISGMYLGEILRRVLLKMAEDAAFFGDTVPSKLRIPFIIRTPHMSAMHNDTSPDLKIVGSKIKDILEVPTTSLKMRKVVISLCNIIATRGARLSAAGIYGILKKLGRDQKSVIAMDGGLFEHYTQFSECMESSLKELLGDEASGSVEVTHSGIGAALLAASHSLYLE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Hexokinase-1
publication title Biochemical and structural study of Arabidopsis hexokinase 1
pubmed doi rcsb
source organism Arabidopsis thaliana
molecule tags Transferase
total genus 155
structure length 450
sequence length 461
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4qs9A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4qs9A01
5KQ8A 3FZFA 3HM8A 4BR5A 3CIPA 3DXMB 1QQNA 1JCGA 3HBTA 3VGKA 1BO5O 4DHYA 2E8AA 3FGUA 3VEZA 5F2RA 3GE1A 1MWKA 2V7YA 4BR7A 3UE5A 2QXLA 2E2NA 1C0GA 2E88A 3ENHA 5AQZA 1KAXA 5AQXA 2NRHA 5EOYA 2Q31A 1WUAA 3O1BA 3QICA 3SMSA 1GLEG 1T6DA 3CERA 3ID8A 1OKJA 5E84A 1ZXOA 3QFUA 3H45C 1HPMA 3O6WA 1U2VB 2DPNA 3SK3A 4QS9A 5LJVA 4WYBA 4BRKA 5BPMA 1NMDA 5AQJA 4BVOA 3VF6A 3AARA 1P8ZA 1GLLO 2A42A 1JCFA 5FPEA 4IZ9A 4NO7A 2ZWHA 5AQYA 2A6AA 3D2FB 5JLHA 1GLDG 1HLUA 4I6MA 4YDUA 3W3DA 3DXKA 3HTVA 3D7EO 2A41A 3AAQA 4IXCA 4B1VA 3EZWA 4BRGA 5BN8A 3MN5A 2Q0UA 2P9SA 4B1WB 4BQZA 3CJCA 3GBTA 1LOTB 4JD2A 1YUWA 4EFHA 4IJNA 3HI0A 1BWFO 3AAPA 2YHYA 4H5VA 2D4WA 4H0VB 1TUYA 2FLOA 4JHDA 2FF6A 5EX5A 4BC2A 1ZC6A 2VCPA 4WQ5A 5FPNA 3CJAA 3ULEA 1HJOA 3O1WA 3H3OB 3ZEUA 3CETA 5AQTA 3H1QA 1NGJA 3BEXA 4H5RA 1S3XA 4FL9A 2HF4A 3I33A 3LDQA 4M7YA 4BRCA 1T6CA 2PBDA 2VYPA 2P9IA 4O5FA 4CZMA 1ATRA 3QDKA 3F9MA 4H0YB 4A2BA 3EO3A 1ESVA 4BROA 1TYQB 3VPZA 3VEWA 4BRFA 3DXMA 4CD1A 3DWLA 4BR2A 5AQFA 3C0BA 5AQOA 2BUPA 4AM7A 3MCPA 2E1ZA 5BR9A 2CGLA 3U8XA 2E20A 2V51B 2FSNA 1XC3A 1NGHA 2QM1A 2HMPA 4H5NA 4IO8A 1RGIA 4CZJA 2FF3B 4FSVA 3TU5A 4IJAA 2D1KA 4FWPA 1T44A 3O4WA 4BREA 3MN6A 5AQWA 3CJ9A 4RWTA 3VF2A 2Q2RA 5AR0A 1CZAN 1NGIA 3CQYA 5AFUH 1BDGA 5EXWA 1HUXA 1K8KA 1QQOA 3IFRA 4GNIA 3EKUA 3WXKA 4FPBA 1Q18A 1YXQA 3EL2A 4XH4A 3CI5A 4PL8A 4A61A 2P9UA 4WQ4C 1BOTO 3O08A 5KQDA 3WT0A 1Z05A 2Q36A 5BPLA 4RCHA 4CI6A 1QZ6A 3C7NA 4DB3A 5LJWA 3FZHA 3GDQA 4KBOA 2IVOA 3BF1A 1RDWX 4BRQA 2GUPA 1BUPA 3H46O 5KPTA 2P9KB 3LM9A 2KHOA 1E4FT 3ATUA 2NLXA 1WOQA 1YAGA 5AFUA 2P9NB 3VENA 2YHWA 4ISEA 4JN4A 1YVNA 3CJ7A 2NZTA 5AQKA 1GLFO 4EIAA 3VETA 3LM2A 4CBWA 4BRMA 1ATNA 1NGFA 3QMLA 4PKHA 2E1YA 2GWJA 2IVNA 1QQMA 5FPDA 2E2QA 2QWQA 1XQSC 2D0OA 3QBXA 4CZGA 3GG4A 2FSKA 1NGAA 4A2AA 3LDNA 4M63C 4FWMA 2Q97A 2H3GX 1RFQA 3KHYA 3FR0A 3H6EA 4RTFD 3VOVA 3WEEB 3GL1A 1TYQA 3U9ZA 3MN9A 3I8BA 1NBWA 4BC4A 4GY2B 1NGBA 2ZF5O 3IMXA 1MA9B 5BRHA 3VGMA 1MWMA 5AQLA 5AZIB 5AQHA 4BGAA 4XH5A 4BVPA 2EWSA 1TUUA 2I7NA 3TPQA 4F9OA 3EKSA 3VF4A 2QWNA 1QZ5A 3A5LC 5BPNA 4BC5A 2FSJA 3WXIA 4J8FA 2QWRA 3LL3A 3LDLA 4L3QA 3M6GA 5ADXA 3MK6A 4CJ7A 1DEJA 4CBUA 1GLJO 2CGJA 3ENOA 4H03B 1Z6RA 4B1XB 2IVPA 2YCHA 3CHWA 3VEOA 4FWQA 1HKBA 2ZGYA 1QHAA 2AP1A 4Y0WA 5FPMA 1R59O 4BRLA 1J6ZA 4B1ZA 5AQUA 3GOIA 1GLAG 5F1XA 1IG8A 3W0LA 3VESA 3VEVA 4CZEA 2F9TA 5AZJB 3BUZB 4AM6A 4FOIA 2E2PA 2V52B 3R9PA 4DQ8A 4XH1A 2Q0RA 1X9JA 3OHRA 3QFPA 4FPAA 4FO0A 5BRFA 5BRDA 3CJBA 3CQXA 2ZGZA 1HKCA 4BG9A 4BRHA 5JICA 1KAZA 4K25A 4I6MB 1NLVA 1H1VA 2CGKA 4MLEA 4H0TB 1NGDA 1U2VA 2W40A 2GWKA 2F9WA 2WUSA 1NGGA 2P9SB 3WEEA 4YDUC 4QS7A 2GEMA 2PAVA 4JD2B 5EVZA 4BR9A 2ASPA 3SMPA 3A0IX 3D2FA 3QBWA 4FWKA 3L4IA 3HSCA 3UB5A 5KPRA 2J4RA 4K43A 5AQIA 4BQLA 5LY3A 2HOEA 4H0PA 5AZIA 3U9DA 1JCEA 1ATSA 3QB0A 4WQ5C 3ATVA 5BREA 1U6ZA 3EN9A 4C23A 3FE1A 1BA1A 4BRDA 1SZ2A 5AQPA 3ZX2A 4PL7A 2D0PA 5AQVA 5F0XA 1SQKA 4MO5A 1KXPA 5TKYA 2YI1A 4NB4A 2BTFA 2A40A 3VEXA 3ZETB 4FWOA 4HWIA 4HTLA 3A5NC 4DCHA 1X3NA 3H1VX 3A5MC 2CH5A 3H3NO 5AQRA 4FWNA 2V7ZA 3BF3A 4B1YB 1NGCA 2QWMA 2YJEA 4H0OA 3KZBA 3L0QA 4LC9B 1DKGD 4O8KA 4FWRA 2P9PB 1GLCG 2P9LB 3VEYA 4MO4A 2CH6A 5ADXH 1GLBG 3M1FA 3BP8A 3WXJA 4EHTA 3ZX3A 5AZJA 1HKGA 3SJHA 4A62A 2IIRA 4K41A 3UKUB 3UKRB 4BR0A 4CZHA 3D2EB 1K8KB 3A8YA 3RSEB 5I9EB 3FLCO 1EQYA 5JMVA 3DJCA 2Q1NA 2P9UB 5AQMA 3LDPA 4K42A 4CD3A 3DAWA 4Z94A 3MN7A 3WUHA 2E2OA 1V4TA 3C7NB 4H0XB 1HX1A 1DGKN 4ISFA 5AQGA 4CZLA 3J8AA 5BN9A 5CE3A 2OANA 3AY9A 2W41A 3JS6A 4WQ4A 4B1UB 4FOEA 4MLHA 4BRIA 1NWKA 3MMVA 4FWSA 4B9QA 3WXLA 3O80A 3FZLA 5AQQA 3M3ZA 1BA0A 1SAZA 3IUCA 5AQSA 4E1JA 3P4IA 3L6QA 3SLCA 3KVGA 2P9KA 3WQTA 5B8HA 4BG8A 1E4GT 1ZBSA 4CZFA 3JXUA 2ITMA 2P9NA 4EHUA 3R6MA 4BR4A 2YJFA 2VWBA 1NM1A 3VERA 4H5TA 1BG3A 2YHXA 1G99A 5JLFA 3FZMA 1LCUA 3ZX0A 1IJJA 1MDUB 2QWOA 1NGEA 5E26A 3ZETA 2GTDA 3HZ6A 3FZKA 1BU6O 4QS8A 4CZIA 1V4SA 3DXKB 2A3ZA 5AQNA 4BGBA 3FFKB 1X3MA 4JNEA 5ELZA 2UYTA 4BRNA 3CJ1A 4BC3A 1C0FA 2GELA 1S22A 2QWPA 3G25A 2FXUA 4CZKA 2I7PA 2P9PA 2A5XA 1D4XA 2P9LA 3R8EA 3A5OC 4H5WA 3LDOA 4JHDB 2QW9A 4EAHD 2ASMA 4BRAA 1Y64A 3UKUA 3ULEB 3UKRA 3ZEUB 5KPZA 3D2EA 2HF3A 3B8AX 3RSEA 4FWLA 4BRPA 4PKIA 3U4LA 4CBXA 3S41A 2QWLA 2AA4A 4JAXA 4XEIA 2ASOA 3MDQA 4IWVA 1KAYA 4ISGA 2P9IB 3IDHA 3O5BA 1XUPO 4M7XA 4PKGA 3VGLA 3O8MA 3WQUA 5EY4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OBYA 5KQ8A 3NAEA 3RR8A 2D0BA 3FZFA 4B9LA 4DV4K 3HBTA 3VGKA 2GX9A 1XMQK 1VAZA 3IKMA 4B9SA 3O9SA 3S9HA 3ENHA 2Y1JA 4GVEA 1YVUA 4U7BA 4DLGA 4PA1A 2HW3A 4KHUA 2FC0A 2DFFA 4KTQA 5IT9O 4EP4A 1JLQA 3QICA 2B4JA 2IOCA 1OKJA 5E84A 3TSQA 2W6LA 2HBKA 3HVTA 3SK3A 2XHBA 4LFCK 5BPMA 3NH0A 4BVOA 4GMJB 3VQ8A 3R1XA 4IZ9A 4OX9K 1HQEA 4CEBA 1GLDG 1RT3A 3O9TA 4EP5A 3W3DA 3D7EO 3AAQA 5BN8A 5J1EA 4JS4A 2Q0UA 5FRNA 4CF9A 4IEEA 3OY9A 1VSLA 2OTJN 4JD2A 3HOTA 1JJ2M 4KHPK 1BWFO 1D5AA 1KTQA 2YHYA 3VQ7A 2D4WA 5EX5A 4BC2A 1ZC6A 3K59A 3ULEA 3M8QA 1RCHA 3NGIA 4GKKK 1W9HA 1WAFA 4LFBK 3ZSQA 2NRXA 1EWQA 3AA3A 3EZ5A 2F8SA 5KGWA 2XY7A 3MEGA 3DM2A 3LDQA 5E41A 4M7YA 5HRNA 3AV9A 4DR4K 4W5OA 2HBLA 4FLXA 3SQ4A 2P9IA 4JI4K 3QDKA 4Z4IA 3HM9A 4JI3K 1TYQB 3VPZA 3TSUA 1RTHA 4CD1A 4CEDA 4AM7A 4F3OA 2E1ZA 2CGLA 3OYGA 1IKXA 2E20A 5DK5A 4C8MA 1XC3A 3G71N 1IKVA 2HHSA 3S3NA 4CJ5A 2NUBA 4IO9L 1NK4A 4CEZA 1I94K 3TARA 4M42A 4M3ZA 3CJ9A 1XHZA 4ZTJA 1U47A 1CZAN 3CQYA 4NXMK 4IOAL 4FM2A 2ZJQL 3AVKA 1QQOA 4DUYK 4FPBA 3NF6A 1NOYA 4EZ9A 1TVRA 4JKAA 3B6OA 4B8AB 5AJ3K 3WT0A 2Q36A 4LF7K 4RCHA 2KZMA 4FZYA 4FLUA 4FVMA 2P5GA 5DM6L 3LM9A 3ID6A 3ATUA 2NLXA 5AFUA 1T03A 1YVNA 2NZTA 3F9KA 1RBSA 3C65A 1XC9A 3TAEA 3KK7A 4ICLA 4AH9A 1K6YA 3TAGA 2GBZA 1CLQA 4PKHA 2E1YA 4KTZA 4JRPA 2QWQA 2D0OA 4LF8K 3CPWM 4KO0A 1TK8A 3GG4A 3LP1A 1NGAA 3KWIA 3DRSA 3DLHA 4LSNA 3RMBA 3KHYA 1WBDA 4HVJA 4BWMA 3AVLA 1TYQA 4JKFA 2RF2A 1NBWA 4G1QA 4DV3K 1RBRA 2HBJA 1WSEA 2FBTA 2P5OA 4GY2B 2G8VA 3ZSRA 4CJSA 4R79A 3SBTA 4BGAA 3UIQA 3DMJA 3VN5A 3R3LA 2I7NA 3TPQA 4F9OA 4B3OA 3EKSA 4OPJA 2HHQA 2QWNA 2F7TA 2VG5A 1GOBA 1KFDA 4FJXA 1TAQA 4BC5A 2FSJA 2QWRA 4W5RA 3LL3A 4L3QA 5ADXA 2Z1GA 4CJ7A 3SNNA 3VEOA 2YCHA 4YOVA 4CW7B 3LZJA 3RRGA 1CXUA 1HKBA 3HOSA 1C1CA 2AP1A 5FPMA 3M8SA 1NJIO 2NNWA 3GOIA 1TV6A 4JV5K 4CF0A 2W6KA 4BWJA 4NXNK 3P39A 4E1NA 4CK2A 4AM6A 4OPKA 1MU2A 4F2SA 3M8RA 3V9SA 3AVCA 4CJVA 4XH1A 1YIJN 4DR6K 3SV3A 3QFPA 4CERA 1L3VA 1SL1A 5BRDA 4OPAA 1EX4A 3CD6N 1I39A 4BRHA 2FBYA 1FXXA 4FJ9A 1NLVA 1H1VA 4FJGA 2O4IA 4BDPA 1J5EK 4KKOA 3HXMA 2GWKA 2WUSA 2IS3A 3LWMA 2GEMA 2PAVA 3MCAB 4A57A 4NLCA 5GIPA 4LD0A 1IBMK 4IBNA 3CCRN 2ASPA 3SMPA 2WFBA 3OYAA 3AVBA 1N36K 1S1UA 3ZLJA 2KQ2A 1ATSA 4WQ5C 4Y1CA 3OS2A 1VSHA 1TKZA 4Z4GA 5AQPA 2WBNA 3EE9A 3I55N 3ZT1A 3KLIA 2YI1A 3ZETB 1YITN 4DCHA 1X3NA 3A5MC 5KGXA 3H3NO 3BF3A 4HHTA 2YJEA 2VGNA 4LC9B 4O8KA 1LW2A 4GKJK 4JK9A 4DS4A 4FJHA 3THXB 3O4QA 2CH6A 4BY9C 1GLBG 3M1FA 3BP8A 1S5JA 4CJRA 4Z4CA 1C1BA 4WF9L 3TABA 4CE9A 1YI2N 4JEPA 3QNNA 4BR0A 3MXMA 4CZHA 4WFNL 4E7JA 4WFBL 3RSEB 5C0YA 4KHSA 5I9EB 5C2FA 1WAJA 5J2MA 3LDPA 1Z26A 4K42A 3DAWA 3WUHA 4DQIA 2XY8A 5BN9A 3AY9A 4B3RK 2ZQBA 1NWKA 4B9QA 3SUNA 2P1JA 3OYHA 1C6VA 5AQQA 4AHCA 2O8EB 2IDOA 3M3ZA 3V9ZA 2HSTA 1NJXA 1YJWN 1EP4A 3IUCA 5AQSA 4YOXA 2P9KA 4BG8A 1E4GT 5DM7L 4CZFA 4EHUA 3O3HA 1WB9A 3R6MA 5EU7A 3ALYA 2VQFK 4DSKA 1NM1A 3L2VA 3VERA 3O9RA 1JKHA 4DR1K 5HOOA 4FLZA 3NF9A 4JS5A 3RMAA 1IJJA 1KVCA 2QWOA 3ZETA 4NYNA 4N41A 3CCSN 3C6UA 1JL2A 1BU6O 3ZYYX 1VSMA 3FFKB 4AQYK 4JNEA 2WONA 2QA4N 3SAFA 1C0FA 2FXUA 4CZKA 2HHTA 2GV9A 2YNGA 3THXA 4PHTX 3R8EA 4B3MK 3I56N 3OS1A 3LDOA 4CEOA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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