3UKUA

Structure of arp2/3 complex with bound inhibitor ck-869
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
415
structure length
399
Chain Sequence
b'AGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869
rcsb
molecule keywords ACTIN-LIKE PROTEIN 3
molecule tags Structural protein
total genus 123
structure length 399
sequence length 415
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ukuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ukuA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ukuA03
3MCPA 3W3DA 5AQPA 3VEZA 2ZF5O 4PL8A 3CQYA 3VEVA 3EN9A 3FZKA 2A42A 2VCPA 3KVGA 1T6DA 3CI5A 4FWPA 2F9WA 3MDQA 1NWKA 3CJ7A 1X9JA 2E2PA 4BRCA 4B1ZA 1NGFA 4ISEA 1BOTO 4BR5A 1MDUB 3QFUA 2CGLA 2IVOA 3WEEA 1GLEG 3DXKB 3FZMA 3H6EA 4BR4A 1Z6RA 2E88A 1EQYA 2Q31A 4DB3A 2DPNA 2QWPA 3HSCA 5AQKA 3GBTA 2E2NA 1G99A 4A61A 1TUUA 4FWRA 4FWNA 2E8AA 1CZAN 5AZJB 4BROA 4DCHA 3BF1A 1QQNA 3GDQA 1H1VA 2HMPA 4XH5A 4B1YB 2FF3B 2YI1A 4H0PA 1BA1A 3CJAA 2YJFA 2D4WA 5AQZA 1C0FA 1R59O 2F9TA 4ISFA 5AQJA 4PL7A 3QMLA 5AZIA 4WQ5A 4BR2A 2P9UB 4XH1A 3DJCA 3VEYA 2ZWHA 3C0BA 4BG8A 3AAQA 3O80A 4GY2B 2WUSA 5BPLA 1TYQA 4BC3A 3RSEB 4BRNA 2NZTA 3MN9A 1YVNA 3FFKB 4GNIA 1KAXA 1NBWA 1S22A 3EL2A 3UB5A 4FWOA 2QM1A 5AQVA 3VGLA 4A2BA 2BTFA 3SMSA 1ATNA 2Q2RA 2V7YA 4H03B 5KPTA 3C7NA 1E4GT 1XQSC 2FLOA 4JN4A 4CZMA 2QWRA 1QZ5A 1HKCA 4AM7A 3FGUA 1T6CA 3O5BA 4JNEA 3DXMB 1GLBG 2IVPA 3FZLA 2P9PA 2FXUA 1Y64A 4CBWA 5F1XA 3D7EO 1K8KB 1NGIA 2D0PA 3A5OC 4CZEA 2J4RA 3ATVA 4WQ4A 4BREA 4CZLA 3WXKA 2QWOA 3S41A 4QS9A 5AQTA 3WEEB 3VF4A 4BR7A 3GG4A 3VEWA 2FF6A 3DXKA 3AARA 3L6QA 1DEJA 1D4XA 5E84A 3UKUB 3IUCA 3R6MA 2H3GX 3P4IA 2QWQA 5AQRA 2FSNA 3VETA 2ITMA 4BRLA 1LCUA 4HWIA 1GLDG 2FSJA 5AR0A 4K25A 5BRDA 4FOEA 1DGKN 1HJOA 4QS7A 4EHUA 2OANA 2ZGYA 3HI0A 1KAYA 3H3OB 5AQUA 4BRDA 5KPRA 1QHAA 4BGAA 5AZIB 1XUPO 3LDPA 5I9EB 4PKHA 1GLCG 4I6MA 4IJAA 3LDQA 4B1XB 5TKYA 2V7ZA 5BPMA 3A5MC 5LY3A 1TYQB 2I7PA 4B9QA 3BUZB 3CJ9A 3U9DA 3G25A 2NRHA 5AQYA 1QQMA 4CI6A 4A2AA 3SMPA 3M1FA 3CQXA 1U2VA 4PKIA 4BRAA 5B8HA 1WOQA 4EIAA 2Q1NA 1YUWA 3C7NB 4YDUC 3L0QA 1NGHA 4BRPA 4IJNA 5CE3A 3DXMA 3BP8A 2P9PB 5ELZA 3TU5A 1GLLO 2P9SB 3BEXA 4CZIA 1K8KA 3AY9A 2GTDA 5EVZA 4FWSA 3A8YA 4O5FA 1C0GA 3IFRA 1P8ZA 4BRGA 1SZ2A 3QFPA 4H0TB 4JD2A 5EXWA 1X3MA 2P9KA 4BC4A 4BRFA 4BQZA 2E1ZA 3VGMA 3HTVA 3UKUA 1BU6O 3MMVA 5JLHA 4H5NA 3VESA 3D2FA 1HKBA 2P9NA 2PAVA 3O08A 3O1BA 2GWJA 4BRQA 4BVPA 3WT0A 4MLEA 4CZHA 3M3ZA 4ISGA 4PKGA 2GWKA 2AA4A 3LM9A 3HZ6A 3KHYA 2E2OA 3JXUA 4EFHA 5AQGA 3LDLA 5FPEA 3EKSA 5BREA 4FOIA 2D0OA 3A5LC 3FZHA 1HLUA 3R9PA 5LJWA 5AQSA 4I6MB 4K42A 1HKGA 3FE1A 4MLHA 4NO7A 2P9IA 2EWSA 4FO0A 4LC9B 1BA0A 4IWVA 1TUYA 1GLJO 1JCFA 4H5WA 5AQWA 3W0LA 2V52B 3TPQA 1ZBSA 1ATRA 2QW9A 1BDGA 3VPZA 3HBTA 3VEOA 5E26A 5AQHA 3SK3A 5EOYA 4B1WB 1U2VB 1NGBA 2V51B 3CETA 4H5VA 2VWBA 3CHWA 3MN5A 1NGGA 2QWMA 3H45C 4CZGA 3VGKA 1RFQA 4HTLA 3O6WA 3O4WA 2P9SA 3O8MA 4BRIA 4FWMA 4CZFA 4BRHA 1MWMA 3VENA 3H46O 4JD2B 2P9KB 3OHRA 2CGJA 1XC3A 1GLFO 3ZETA 2CH5A 3FZFA 4QS8A 3WUHA 3D2FB 2P9NB 4EAHD 5FPDA 3AAPA 2E1YA 2YCHA 4FWKA 5AQLA 4RWTA 1QZ6A 1NGAA 2W40A 3UKRB 1MA9B 3FLCO 4H0XB 3CJBA 3GL1A 5BRFA 3DWLA 3VERA 1IJJA 3ZX3A 4CD3A 2E2QA 2UYTA 3H1VX 3VEXA 1NLVA 4RCHA 4CD1A 4CZKA 1RDWX 3FR0A 4JHDB 1DKGD 1NMDA 3MN6A 3I33A 3CJ1A 1BUPA 2P9IB 2HF3A 2AP1A 4CBUA 5EX5A 4BGBA 2D1KA 3SJHA 3H1QA 1JCEA 1ZXOA 4CJ7A 3ZX2A 1QQOA 5BR9A 3O1WA 5AFUA 4K41A 4BR0A 2PBDA 4M7YA 3B8AX 2ZGZA 3ULEA 3D2EA 2CH6A 1NGJA 3R8EA 4FL9A 3QDKA 4F9OA 3ENHA 3VOVA 3IDHA 1NM1A 1J6ZA 2Q36A 1NGDA 1KAZA 3WQTA 4H0OA 5AQQA 2I7NA 2QWLA 3U9ZA 2YHXA 4BRKA 3HM8A 3ZETB 1OKJA 2YJEA 4H0VB 5AQFA 1JCGA 3M6GA 5JICA 5ADXA 4H5RA 1SQKA 1V4TA 5JMVA 1RGIA 3ZEUA 3WXIA 4YDUA 3L4IA 2A41A 3EO3A 4CZJA 2HF4A 2HOEA 4NB4A 3VF2A 4IXCA 5BN9A 5JLFA 4JAXA 4DHYA 3ENOA 4AM6A 3UKRA 4FWLA 5F0XA 1HX1A 3GOIA 1V4SA 4CBXA 5AQNA 4RTFD 4BQLA 4BR9A 4BC5A 3MN7A 4WQ5C 1ATSA 4M7XA 4IZ9A 4JHDA 2VYPA 1BG3A 1NGCA 3H3NO 3IMXA 4BVOA 2P9LB 3WXJA 2BUPA 3CERA 1ZC6A 5LJVA 3QBWA 1X3NA 3ID8A 3VF6A 3F9MA 1GLAG 2GEMA 1HUXA 4H5TA 5KPZA 3LDNA 4XH4A 4K43A 1S3XA 4M63C 5BN8A 3ULEB 3ATUA 4BRMA 4L3QA 3D2EB 5KQ8A 4FSVA 3KZBA 4IO8A 4B1UB 5AQIA 1YAGA 4WQ4C 4H0YB 4B1VA 1Q18A 1MWKA 4Y0WA 3QBXA 2A6AA 2IIRA 2IVNA 2ASPA 1SAZA 5AFUH 1LOTB 4BC2A 5F2RA 3CIPA 3UE5A 2A3ZA 5EY4A 5FPMA 3EZWA 2W41A 2A40A 3ZEUB 2NLXA 4DQ8A 2YHYA 1BO5O 4A62A 4FPBA 5BRHA 2GELA 2CGKA 4MO5A 2GUPA 5BPNA 1YXQA 3ZX0A 3BF3A 2YHWA 2Q0UA 3A5NC 4O8KA 3QICA 1IG8A 4MO4A 4C23A 1U6ZA 3U4LA 3JS6A 4EHTA 1T44A 3LL3A 5ADXH 3SLCA 2Q0RA 2E20A 2P9LA 3MK6A 4E1JA 3CJCA 3WXLA 4Z94A 5AZJA 3I8BA 1HPMA 1Z05A 2FSKA 4FPAA 3DAWA 5AQOA 3GE1A 3U8XA 1BWFO 3A0IX 3LM2A 4WYBA 3WQUA 2ASOA 2KHOA 2Q97A 5AQXA 3J8AA 2P9UA 2A5XA 3LDOA 3QB0A 3EKUA 5FPNA 1NGEA 2ASMA 1E4FT 1WUAA 4KBOA 5AQMA 5KQDA 3RSEA 1ESVA 4BG9A 2QWNA 1KXPA 4J8FA 4XEIA 4FWQA 2QXLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LAWA 4JI0K 1L3VA 3AO4A 3EN9A 2A42A 5BR8K 2WOMA 1C1AA 3DRPA 3HK2A 3F2KA 1T6DA 3I56N 1C1BA 2F9WA 2GV9A 3MDQA 4DKWA 4V19S 1DLOA 3OA9A 4B1ZA 1NGFA 4ISEA 3Q7CA 3KWGA 2G8FA 1NMNA 4O5BA 4LD0A 3E9OA 5HRNA 4KB1A 1GLEG 1SS6A 3H6EA 1ZBHA 4BR4A 3KTQA 4QCLA 2Q31A 1L3UA 5AQKA 4BE1A 5M1PA 4DQSA 1WSHA 1CZAN 2E8AA 3VQDA 3BGRA 1IV0A 1LV5A 3GDQA 2BGGA 1H1VA 4XH5A 4B1YB 1VRTA 2O4IA 2FBVA 4AHTA 3CJAA 2YJFA 1J5OA 4R5PA 3NH2A 1T8EA 4RW4A 2F9TA 3QMLA 3VTIA 2NRVA 2F8TA 1RILA 1VAZA 1EX4A 4M42A 3KKRA 4UY8O 3O80A 1BGXT 5BPLA 4RG8A 1FXXA 1MU2A 4FCYA 3MN9A 4IG3A 3CQ8A 4GNIA 1KAXA 2QXFA 2OCEA 4FWOA 3HPOA 3T1YK 4CJRA 4F8RA 4A2BA 4EZ9A 1ATNA 2Q2RA 2RKIA 2V7YA 3AO3A 3THXA 4DWIA 1HKCA 3FGUA 1T6CA 3SUPA 1D5AA 2XY8A 1QVGM 2GUIA 3DXMB 2FXUA 1CLQA 5F1XA 3D7EO 1NGIA 2F8SA 1J54A 4J2BA 3AVBA 4CZEA 3TAFA 4CZLA 1HNVA 1TL3A 3WEEB 3MXIA 4I9QA 2WONA 1RDBA 3L6QA 1D4XA 3IUCA 1VSHA 3R6MA 4F3OA 1KFDA 2FSNA 3DRRA 4MDAA 2FSJA 4K25A 3CMAN 3THWB 4EHUA 2ZGYA 4NYFA 3HI0A 1YI2N 3H3OB 5AQUA 4BRDA 5KPRA 2YNGA 1C6VA 3K0SA 4DSJA 2Y1JA 1NJIO 5I9EB 4JKEA 2BH1A 5TKYA 1RT1A 5BPMA 1NOYA 2W6LA 1TKTA 1VSKA 1X9WA 3BUZB 2HHSA 1RT6A 3CJ9A 2IC3A 4JS5A 2Z1GA 1T05A 3OW2M 1QQMA 3EYZA 4M3YA 4IFEA 4CEAA 3CQXA 4BRAA 3CM6A 3CPEA 3C7NB 4YDUC 4G9ZA 4CJFA 3L0QA 1K8AO 3OYLA 4KFBA 4AF1A 5CE3A 3DXMA 3TU5A 3SJJA 5M1QA 4WE1A 2E4LA 4BWJA 3NHGA 1BCOA 1YJWN 2GTDA 4OPKA 1NKBA 1D9FA 5EVZA 4BY9C 2XY5A 1P8ZA 4DS4A 2YKNA 1S6QA 4FW2A 3C6AA 2E1ZA 2ZJRL 3CXCM 5JLHA 3MMVA 3LALA 4E19A 5C12A 4DR5K 4DFJA 1L3SA 1HKBA 2P9NA 4DV6K 3O1BA 5J1EA 3C6TA 1U47A 3M3ZA 4O0IA 4JKBA 1FKPA 2E2OA 3HP9A 3JXUA 4EFHA 2NRWA 3LDLA 3EKSA 5M1FA 3DOLA 2D0OA 3KD5E 4Z4HA 3DLGA 5LJWA 1EWRA 5C42A 4DQPA 4NO7A 1JL2A 3EE9A 1J53A 4FZYA 4LC9B 2O8BB 4DV1K 1GLJO 3AO1A 3N4PA 4LH5A 4CEZA 2V52B 4JI3K 1BDGA 1U48A 4ELUA 3DLEA 5J2NA 4N5SA 4LY7A 3SK3A 4GVEA 2KZZA 2V51B 2VWBA 3CHWA 2UUAK 2QWMA 3K9KA 1LAVA 2KW4A 3NGIA 4HUEA 3O6WA 1T03A 3I55N 4FWMA 1NK4A 4BRHA 4DUYK 3DLKA 2UXCK 2E6MA 3CF5L 4JRQA 1TVRA 5IWAK 3ITHA 4ID5A 1XC3A 3F5TA 4CIEA 1GLFO 2CH5A 1N32K 3D2FB 3BZCA 5CY4A 1FW6A 4GMJB 3AAPA 2YCHA 4FWKA 2BANA 4C8MA 4ID1A 3UKRB 4I2QA 4W5TA 3ZSWA 4BDYA 1VQON 3NF9A 4DFPA 1VQLN 5BRFA 2E2QA 1NLVA 4CD1A 4JHDB 2VQEK 1DKGD 2HHIA 3MN6A 3VQ8A 3O9QA 4AHVA 3VQPA 1BUPA 3AO5A 2ZQBA 1OVYA 1IG9A 2D1KA 1U04A 3H1QA 2B6AA 1B9DA 1T3VA 3P83D 4CJ7A 5FDLA 3ID6A 3ZLJA 1VK0A 1CZBA 5AFUA 1EP4A 4CEEA 4K41A 4BR0A 4M7YA 2ZGZA 4E1NA 2FBYA 2ZD1A 2FC0A 4DUZK 3VA3A 1VQ7N 4G1QA 3VTHA 3V6DA 3R8EA 3AVMA 5I3UA 4DTSA 5CZ2A 2UXDK 3V9SA 3MX2A 3IDHA 2PYJA 3M5RA 1HYVA 3J7ZO 1SKRA 3I8DA 1KAZA 3WQTA 4H0OA 3AVAA 4OPHA 5AQQA 3SV4A 5MLCQ 1YJ9N 4FK0A 2HHXA 2QWLA 2C1GA 3J81O 1XHXA 4CK2A 4IBNA 2RPIA 1OKJA 2YJEA 1TKZA 1JCGA 1TGOA 1O13A 1NK6A 3L4IA 2A41A 3HVTA 4CW7B 4CJTA 2HOEA 4AM6A 3UKRA 4FWLA 4DV3K 3GOIA 3SAFA 4IDHA 4E7IA 3C6HA 5T7BA 3KLHA 4BQLA 3L3UA 3E66A 4WQ5C 3HOSA 1NJYA 4LH4A 3LWMA 4Z4GA 4IG0A 5KGWA 3QEXA 4IZ9A 4JHDA 1BG3A 3IMXA 4FJLA 2BUPA 4GV3A 4FJ8A 4FLXA 2NRTA 3C95A 3AVLA 3F9MA 4DV4K 2GBZA 4Z0UA 1K6YA 3M8PA 4H5TA 1N6QA 1S1UA 3K58A 4LFCK 3LDNA 4XH4A 1B92A 3MX5A 1ITGA 1TV6A 2QKBA 3C65A 3KK7A 3LPTA 4L3QA 3D2EB 1TK8A 4KHQA 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4GY2B 3CMEN 2WUSA 4M45A 1YHQN 4LSNA 1XWLA 1S1XA 1TYQA 5GINA 2BE2A 4BC3A 3V9WA 1S1WA 2NZTA 3V1QA 3FFKB 3K5OA 1GOAA 4WFAL 4CESA 1RTJA 3NGZA 2ZE2A 4E7KA 2BTFA 2HVIA 5KPTA 4JV5K 3PLAA 4CZMA 3G6EN 4AM7A 3AVNA 4JNEA 5LL6Z 1GLBG 3HP6A 1GOBA 4F3TA 5JVHL 1Y64A 3LAKA 4ZHRA 3S41A 3IAYA 3KLEA 1DEJA 1N33K 3AA2A 3ZSQA 3SUOA 5GIPA 2H3GX 2P5OA 4B8AB 1TK0A 3OJUA 3SNNA 3VETA 1GLDG 4DU1A 5AR0A 3P5JA 5BRDA 1DGKN 1HJOA 2HBKA 5GAGP 5SWMA 1HQUA 3KD1E 4PUOA 1X9MA 1QHAA 3P39A 3AA4A 1QVFM 1CXQA 4AQYK 4NCGA 3HRGA 3Q7BA 2Y1IA 4PKHA 4I6MA 1SUQA 3LDQA 3OYMA 1VSIA 3T1AA 2I7PA 3OBYA 4ILGB 4DQQA 1JXEA 3U9DA 3G25A 3DLLL 3V81A 4KHWA 4CCHA 3G0ZA 3AVIA 4HTUA 2F96A 4YORA 3WNGA 3K5MA 3NVKA 3TAPA 5IT9O 3THXB 4EIAA 2Q1NA 1YUWA 4JKFA 4O55A 1NGHA 3VQ6A 1HJRA 4F2RA 3SAHA 5J2PA 4FLYA 5ELZA 3CCEN 2P9SB 3BEXA 3WNFA 4FJ9A 1IKYA 3A8YA 4O5FA 5K14A 3IFRA 4BRGA 1SZ2A 5CYQA 4C1NI 1FK9A 2P9KA 4BC4A 4BQZA 3VGMA 1BU6O 1L5UA 3PSFA 4H5NA 4FM1A 1NK7A 2OPPA 2NNWA 5C24A 4CZHA 3KIOA 4PKGA 4IOXA 3WNEA 2UU9K 1BHLA 3QEPA 5AQGA 3PV8A 3L2QA 3VQ5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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