1Y64A

Bni1p formin homology 2 domain complexed with atp-actin
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
369
structure length
356
Chain Sequence
b'ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structural basis of actin filament nucleation and processive capping by a formin homology 2 domain
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Structural protein
total genus 76
structure length 356
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1y64A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1y64A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1y64A03
4O8KA 4CBUA 2V51B 5AQYA 4GY2B 1OKJA 3VGMA 2DPNA 1Q18A 1XC3A 3FFKB 2ASPA 4FWRA 2FF6A 3HTVA 5F2RA 3WEEB 1BOTO 4BQZA 3VEYA 5KPZA 4NO7A 1NGEA 2A3ZA 2Q0RA 4JD2B 2V7YA 3CJAA 5AQFA 3O8MA 4BRQA 3IMXA 4H5TA 5BREA 2P9IA 3VERA 4K42A 3MDQA 1DEJA 4FWKA 4BVOA 3ENHA 4H5RA 5AQLA 4WQ4C 1WOQA 4IZ9A 2W40A 1BG3A 1CZAN 1HKGA 1QHAA 3CJCA 2YHYA 3FZKA 2P9SB 2P9KA 4BR2A 1TUUA 2GEMA 5AQZA 1K8KB 4BROA 3CJ7A 1GLFO 3HBTA 3MN5A 2QWNA 4CZKA 4BREA 4BRDA 1NGHA 3CJ1A 4CZEA 1WUAA 2FLOA 3WXLA 5FPEA 4B1WB 1YUWA 4H0XB 4BRKA 4H0OA 5KQ8A 3ULEB 2ASMA 3VEWA 4H03B 2FXUA 4BR7A 3WUHA 1MDUB 3C7NA 1BWFO 4FWLA 4B1VA 1NGGA 2YJEA 1GLAG 5FPMA 3U8XA 5BR9A 3D2EB 3LDPA 2A5XA 2HF3A 2QWOA 4BRMA 1IG8A 3DWLA 3SLCA 2VYPA 4A62A 1MWMA 5LY3A 4JD2A 3MCPA 3U9DA 2A41A 4DQ8A 4XH1A 4IXCA 4CZLA 3QBWA 3GE1A 5FPDA 2QWMA 3LM2A 4J8FA 3WT0A 4BRNA 1QQOA 3VOVA 2P9UA 4E1JA 3W3DA 3MN6A 2H3GX 3EZWA 2AP1A 3AAPA 5AZIA 3SMPA 4CBWA 4JNEA 2A42A 3IFRA 1K8KA 3KVGA 2Q2RA 2D0OA 5AQIA 4IO8A 4PKIA 4C23A 2A6AA 5AR0A 5AQXA 4FPBA 2WUSA 4A61A 5EY4A 1J6ZA 3CQYA 4JAXA 3ULEA 4BR5A 4B9QA 3DAWA 4M63C 2UYTA 3EO3A 1Z05A 3TPQA 3QFPA 4PL8A 3D2EA 3VEOA 4NB4A 4CD1A 3CJBA 3WQTA 5JICA 2ITMA 2E2NA 3LDNA 3JXUA 2P9KB 4M7YA 5BRHA 4EAHD 2IVPA 2FSNA 3CERA 4CZJA 4EHTA 4CZFA 4WYBA 3VF2A 2W41A 5AQNA 1NMDA 3HM8A 2YI1A 3ZETB 4B1YB 2QWPA 3FLCO 1NGFA 2ZWHA 1NGCA 5EX5A 4FO0A 3MMVA 2D0PA 1U2VA 4CZIA 3QMLA 4K41A 5JLFA 1IJJA 5EOYA 3UE5A 1NLVA 3KHYA 2FSJA 1QQMA 4H0PA 3A5MC 4QS8A 3C7NB 4PKGA 5AQRA 2CGKA 3D7EO 4Y0WA 4DCHA 3GL1A 1C0GA 4CBXA 2ZGZA 3C0BA 3O1WA 4ISGA 2J4RA 5AQHA 3M1FA 4YDUA 2P9LA 1D4XA 2F9TA 4FSVA 5ADXA 3VENA 1GLJO 1H1VA 4M7XA 4CZHA 2YCHA 3BP8A 2GUPA 4EIAA 1XUPO 3P4IA 2VWBA 2E2QA 5AQPA 5AQVA 3EL2A 2P9UB 3BEXA 5E26A 3VF4A 4BRLA 2Q0UA 5AQJA 3CIPA 4XH4A 4FWMA 5AZIB 2E88A 3L4IA 4K25A 3AAQA 1BU6O 5BPMA 4H0TB 1ZXOA 2F9WA 3IDHA 3JS6A 3ZETA 4A2BA 4BVPA 5BN9A 4KBOA 2D1KA 3GOIA 1ESVA 4DB3A 1V4SA 5AQOA 2ASOA 4WQ4A 1JCFA 3H45C 1R59O 4AM7A 1G99A 1S3XA 3FZHA 3WXIA 4QS7A 1NBWA 2Q97A 3A8YA 4FPAA 2CGLA 4ISFA 2BTFA 3WQUA 3DXKA 4HTLA 3ATVA 2Q36A 3O6WA 3ZEUB 4CD3A 2IIRA 3VEVA 1HJOA 4JHDA 3KZBA 5LJWA 2P9PB 4BC2A 1HX1A 1V4TA 3FZLA 4LC9B 3BUZB 1YAGA 3ZX0A 1ATRA 1LCUA 1LOTB 2NZTA 3A0IX 4FWQA 1ZC6A 5BPNA 5JMVA 4IWVA 1X9JA 2YHWA 1U2VB 4FWNA 3G25A 5ELZA 3O5BA 3FGUA 3DJCA 3UKRA 5AFUA 2P9NB 1HKBA 4IJAA 5E84A 2BUPA 4BR4A 3LM9A 2CGJA 4WQ5C 3A5OC 5CE3A 1BUPA 1E4GT 1NGAA 4CI6A 5KPTA 2P9LB 3W0LA 5LJVA 4MLEA 3FZMA 2GTDA 2ZF5O 3RSEB 5JLHA 5AQTA 4CZGA 1JCEA 5BPLA 2FSKA 4B1ZA 1HPMA 1TYQB 3VESA 5BRDA 3FE1A 3U4LA 2V7ZA 2VCPA 1C0FA 4BR0A 2E8AA 4H0VB 3ZEUA 3UKUB 4CZMA 4FWSA 4I6MA 3WXKA 4BRAA 3LDOA 2P9PA 1NM1A 1Z6RA 2I7NA 3VEZA 3VETA 4BGAA 4PKHA 2OANA 1GLLO 4BRHA 3L0QA 5AQSA 4AM6A 2QWQA 1SAZA 2Q31A 3R6MA 2PBDA 1X3NA 2P9NA 2QW9A 4FL9A 2YJFA 1XQSC 2NLXA 3DXKB 4BG9A 3SJHA 2QWLA 3LL3A 5AZJB 1NGJA 4JHDB 5AQKA 1SQKA 2HOEA 3QICA 4XEIA 3L6QA 1BA1A 1ATNA 3H6EA 3ZX2A 5BN8A 2CH6A 3RSEA 2IVNA 2CH5A 3UB5A 3VPZA 1TYQA 2QXLA 1T6CA 3LDQA 3SMSA 4HWIA 1NGIA 4BRPA 2E1YA 2E1ZA 4H5VA 3UKRB 3UKUA 1MA9B 1GLEG 1GLBG 1MWKA 2ZGYA 3VGKA 1T44A 5KQDA 1RDWX 4DHYA 4RTFD 4F9OA 1NGDA 3O4WA 3R9PA 1RGIA 2PAVA 3D2FA 3I8BA 3QBXA 4FOIA 3U9ZA 1DKGD 3A5LC 4MO4A 5BRFA 4K43A 1YXQA 2KHOA 5EXWA 1T6DA 1KAXA 3S41A 2V52B 3DXMA 3CJ9A 3H3OB 5AQUA 4MO5A 3BF1A 5ADXH 4Z94A 2YHXA 3VF6A 5I9EB 3HI0A 3CETA 5AZJA 4EFHA 3O80A 1NWKA 3WXJA 2D4WA 2FF3B 4I6MB 3VGLA 1HUXA 4BC5A 3ZX3A 2QM1A 1TUYA 3EN9A 4RWTA 1RFQA 3EKUA 3FR0A 1EQYA 4IJNA 1KAYA 1GLCG 2GELA 1QZ6A 3H3NO 1ATSA 3H1VX 3O1BA 3ATUA 3OHRA 3QFUA 1DGKN 4H0YB 3WEEA 2E2PA 4EHUA 4A2AA 3FZFA 5AQQA 5AQWA 4MLHA 5AQMA 1X3MA 3BF3A 3CQXA 3HSCA 3H1QA 1JCGA 5B8HA 1NGBA 1KXPA 4H5WA 4BR9A 3CHWA 1GLDG 1BA0A 4FWOA 1QZ5A 3QB0A 3CI5A 2E20A 3H46O 3TU5A 5KPRA 4XH5A 4FWPA 2P9SA 3HZ6A 4BRIA 3ID8A 3AY9A 4BC3A 3MN9A 2HF4A 2IVOA 1QQNA 3GG4A 3SK3A 4WQ5A 3LDLA 1S22A 3MK6A 4B1UB 1KAZA 2AA4A 4ISEA 4H5NA 3GDQA 1BO5O 4BRGA 4BRCA 1BDGA 1Y64A 2GWKA 3O08A 4RCHA 4PL7A 4FOEA 5AQGA 3R8EA 5AFUH 4BGBA 3D2FB 2P9IB 3M6GA 5F1XA 2A40A 2QWRA 3IUCA 1HLUA 5TKYA 1YVNA 2E2OA 3A5NC 3DXMB 3GBTA 1ZBSA 2I7PA 4GNIA 3M3ZA 3MN7A 4QS9A 4B1XB 5FPNA 5EVZA 1E4FT 1U6ZA 4L3QA 4CJ7A 2EWSA 3QDKA 3B8AX 3VEXA 1SZ2A 4YDUC 2GWJA 1P8ZA 3ENOA 4BRFA 3AARA 3J8AA 2NRHA 4BG8A 4BQLA 2Q1NA 5F0XA 3I33A 1HKCA 2HMPA 4JN4A 4O5FA 3F9MA 3EKSA 4BC4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3D0PA 2V51B 4DTMA 5AQYA 2DPNA 4JI1K 4FM0A 1N6QA 3FFKB 3HTVA 5F2RA 1BOTO 2KW4A 4JKBA 1JL1A 3WNGA 2Q0RA 5AQFA 3O8MA 4CK1A 2HMIA 4GKJK 1RDDA 1Q8IA 3DLKA 4CJ3A 4H5TA 5BREA 3VERA 3MDQA 2UU9K 1VSFA 4H5RA 4IZ9A 1BG3A 1CZAN 1HKGA 4LFCK 1GOCA 3JYTA 3LP2A 4TSXA 4E7LA 2P9KA 4B3MK 2A1RA 1KFDA 4CFDA 4DU1A 5AQZA 4JS4A 5KI6A 3ZSYA 3CJ7A 2YNGA 2HHIA 1GLFO 4KO0A 1WBBA 4CZKA 3T69A 2HBKA 3CJ1A 4CZEA 1WUAA 2FLOA 1OVYA 3CM5A 1YUWA 2O8FA 2KZMA 4BRKA 5KQ8A 4CJUA 3VEWA 3VTIA 5HOOA 3RMDA 2FXUA 1T8EA 1MDUB 2I5JA 1BWFO 4LSLA 4B1VA 1NGGA 2YJEA 4KTQA 4RW9A 1JXBA 1SKWA 1WN7A 3D2EB 1JLCA 4BRMA 1IKXA 3DWLA 3SLCA 3CCJN 2VYPA 4M3YA 4JD2A 4JI6K 3MCPA 2NRZA 5CY4A 4FJ9A 4JKGA 3GE1A 3PV8A 4W5NA 4JKDA 3ZSVA 1U47A 3SZ2A 3EE9A 4E1JA 5TKWA 3THXB 2H3GX 3EZWA 4MDBA 4CBWA 4FJKA 4CJTA 4JNEA 1XC9A 2Q2RA 4I2PA 3QO9A 3KK3A 1N8RO 5AQXA 4DTNA 2WUSA 3U3GA 4DR6K 4A5AA 1J6ZA 3CQYA 1NJIO 1DTTA 1D9DA 1TK8A 4C8OA 3ZYYX 2XY5A 1LWEA 1RTDA 3BGRA 1RCHA 3O9TA 3EO3A 1IG9A 4GV6A 1FXXA 3QFPA 5E41A 5KRSA 4BE0A 3WQTA 5JICA 1YIJN 3ZSQA 3LDNA 2P9KB 4KHUA 4EHTA 4CZFA 4N56A 4CF8A 1NMDA 3HM8A 3MCAB 1S9GA 1S1WA 3DLBA 3L2RA 1NGFA 3HSTB 2JLEA 3DLLL 2ZWHA 2O8DA 3TAFA 5HRSA 3MMVA 2W6LA 2D0PA 4CZIA 5JLFA 1LAWA 3KHYA 4ICLA 4B9VA 2QEXN 1QQMA 4H0PA 3MXJA 1JKHA 4Y0WA 4DWIA 4CBXA 3BZCA 3CCSN 3THWA 4RW8A 2ZGZA 5C2DA 3J7YP 2J4RA 4Z0UA 4B9SA 3OBYA 2F96A 1D4XA 2F9TA 1LAVA 4KAZA 3MX2A 3VENA 1GLJO 3BP8A 4EIAA 5J2NA 3V4IA 3MECA 4JKGB 5D3GA 1LWCA 3P4IA 2E2QA 4OLAA 3EL2A 2OA8A 2BE2A 2HVIA 1C1BA 3BEXA 2Q0UA 5AQJA 3L2UA 4IEEA 4XH4A 3MWTA 1R0AA 2E88A 1YT3A 4K25A 1RT3A 4BE1A 1NK5A 1ZBLA 2RKIA 3AAQA 4M3RA 5C2FA 4H0TB 2F9WA 5HP1A 1UWBA 1TL3A 3GOIA 1L3TA 5M1FA 4WQ4A 3TAQA 2OPPA 3H45C 4AM7A 3DOKA 3KD5E 2D5RA 3WXIA 3TWHA 2G8UA 4DV2K 4QS7A 3A8YA 3QIPA 1D9FA 2VQEK 3ATVA 4ELVA 3O6WA 4CD3A 3Q7BA 1RTHA 3AA3A 2P9PB 3U3YA 3C95A 1V4TA 1YAGA 3ZX0A 3JSMA 4FJHA 4C8MA 1ZC6A 2O8DB 4LH4A 5I42A 4EZ9A 1X9JA 1CXQA 3F73A 3G25A 2P51A 1VSKA 3O5BA 1VQON 5IWAK 3FGUA 3DJCA 3UKRA 1SL2A 1QTMA 2HW3A 1MU2A 2P9NB 1VSEA 3K9JA 4IJAA 4CF1A 4J2DA 2QKBA 5KRTA 3THWB 3AO2A 3IS9A 3LDSA 3BZKA 4LY7A 4WQ5C 3LPTA 3A5OC 3EEQA 4CI6A 3OS2A 3MX5A 3W0LA 1W0HA 1VRTA 1WSIA 2ZF5O 4CZGA 1JCEA 1TYQB 1UAXA 3D45A 1NMNA 3FE1A 4PY5A 4CJ5A 1NJWA 3U4LA 1C0FA 3SAGA 2E8AA 2ITGA 1ITGA 3ZEUA 1YI2N 4F4KA 3UIQA 2X6NA 4CF2A 3WXKA 3LDOA 5A2QO 1NM1A 1Z6RA 3G10A 2OCEA 2NRWA 3VETA 1NK9A 3K9KA 4M3ZA 1GLLO 5AQSA 3K59A 1UA1A 4AM6A 3V9SA 3QEXA 4ZHRA 2Q31A 3R6MA 4PWDA 5M1PA 1FJGK 4J2EA 1WSFA 2X74A 3Q7CA 4W5QA 1XQSC 2OTJN 3O9UA 4FK0A 4DV1K 3QICA 1CLQA 4X62K 4XEIA 2P5OA 1BA1A 1ATNA 1HPZA 2UXCK 1N34K 3QIOA 1TK5A 2CH5A 4FZXC 5HL7L 2Z1GA 4HUGA 2WOMA 4YOYA 1VQMN 4DSLA 3SBTA 4BRPA 2GX9A 3S5TA 3UKRB 4FJLA 2KFNA 1YVUA 4CEQA 1RDWX 5HLFA 3KK1A 3O4WA 4BEBA 4CEBA 1RGIA 1HNVA 4FOIA 5T7BA 3V9WA 3G0ZA 3U9ZA 3A5LC 4UQGA 3C6TA 4JK8A 3PUFA 5EXWA 2V52B 4OKKA 1XMQK 3QERA 1Z25A 2D0AA 5AQUA 3QETA 3BF1A 4HCBA 2HSTA 3HI0A 3RMBA 4KHNA 4EFHA 2HNYA 1LWFA 1TUYA 4JEPA 1VQNN 1JJ2M 3CCLN 1G15A 1RT7A 4FLWA 3I8DA 4E89A 3LP1A 2ZM6K 2GELA 3O1BA 2Q3SA 3ATUA 3NVMA 4E7KA 3QFUA 1EX4A 4FJMA 3O9QA 3KK7A 2B5JA 3RVCA 3LZJA 3AVCA 4EP4A 1T3VA 4IOXA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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