1WUAA

The structure of aplyronine a-actin complex
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
367
structure length
357
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure basis for antitumor effect of aplyronine a
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 113
structure length 357
sequence length 367
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1wuaA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1wuaA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1wuaA03
2NRHA 5FPMA 3HTVA 1XUPO 3ENHA 1X3NA 5AZIB 1NGHA 3QMLA 3MN9A 3H3NO 2QM1A 4RTFD 3ULEB 4AM6A 1Q18A 1RGIA 3IFRA 5KPTA 4BR2A 1ATRA 1MWKA 2FSNA 5ADXA 4PKHA 4GNIA 3C0BA 1T44A 4FPBA 3GOIA 5JLFA 4EHUA 1LOTB 3A5OC 4MLEA 2P9PB 4IJNA 3LM9A 4B1WB 2AA4A 3BP8A 3DXMA 1QZ5A 2D1KA 3JS6A 2EWSA 1U2VA 4JD2B 2Q0UA 3DWLA 2DPNA 4MLHA 3MDQA 5AQPA 3UB5A 1U6ZA 4BVOA 4BQZA 1C0GA 2HOEA 2E20A 3O08A 4XH5A 2VYPA 4BR7A 5AQQA 3SK3A 2Q0RA 2P9LA 1GLCG 1R59O 4BR0A 3AAPA 5BR9A 4WQ4C 5AZIA 3W0LA 1IG8A 2ASOA 3L6QA 2KHOA 1NM1A 4BG9A 2W41A 3UKUA 5E26A 4E1JA 3ULEA 2E2OA 3RSEB 5AQXA 3DXKB 2YJEA 4H5WA 2QWRA 2A42A 1V4TA 2QWLA 3VEYA 5EXWA 3P4IA 4DHYA 1S22A 3GE1A 4ISGA 4MO5A 3FZHA 2P9NB 4Y0WA 4BR9A 2P9PA 3AARA 2W40A 4L3QA 2CH6A 2P9KB 2HMPA 3M1FA 5AQNA 3KVGA 4BRQA 1YVNA 2D0PA 2HF3A 2HF4A 4M63C 4B9QA 4GY2B 4CZJA 2Q36A 5BN8A 1SZ2A 4PKIA 1NMDA 4KBOA 5AQZA 3CJAA 2CH5A 5AQLA 3I33A 3GG4A 2PBDA 1QHAA 4PKGA 5AQKA 3JXUA 3VGKA 4CJ7A 2E1ZA 1RFQA 4CZEA 3KZBA 1E4FT 1OKJA 3LDQA 3J8AA 5LY3A 3C7NA 1MA9B 1E4GT 3R9PA 1RDWX 1BWFO 3RSEA 4A61A 4BRFA 4H5VA 3DXKA 3TPQA 1NWKA 4WQ5C 2OANA 3WXJA 4CBUA 2YI1A 3LDNA 2P9NA 3DAWA 2ASPA 3ATUA 2P9KA 5AQJA 4CI6A 2A6AA 1NGBA 3DJCA 1JCEA 4H5TA 3HBTA 2P9SB 3QFUA 2ZGYA 1GLLO 4RWTA 1HX1A 2I7PA 3BF3A 3O4WA 2GTDA 4EAHD 4DCHA 1GLEG 2ZGZA 5F1XA 2ZWHA 4XEIA 3H6EA 1NGCA 4A62A 2Q2RA 4CZFA 4FO0A 1NGGA 5AQRA 1HKCA 3CQXA 4BR4A 4CBWA 3AAQA 3IUCA 3CI5A 4K41A 3H45C 2Q1NA 3S41A 3WXLA 3HSCA 2E1YA 3CJ7A 1NGAA 2FSJA 3FZMA 3CQYA 1ATSA 3SMPA 1H1VA 4FL9A 2NZTA 2CGLA 3CJ9A 4BC2A 5KQDA 4H5NA 5EOYA 3LDLA 3W3DA 5JMVA 4BC5A 4BREA 5F2RA 3VEZA 2P9UB 3HI0A 4CZHA 5LJWA 1BDGA 3ID8A 4H0XB 1HLUA 2QWMA 4BG8A 2P9SA 3U9ZA 4QS9A 3G25A 5I9EB 4JN4A 1HKBA 3FZFA 4I6MB 5AQSA 4BGAA 4BQLA 1X3MA 5LJVA 4WYBA 3VGLA 5AQUA 2GWJA 2ASMA 3VEXA 4O5FA 3LDPA 1IJJA 2ZF5O 4XH1A 3FZKA 4BC4A 4IO8A 3A5LC 5AR0A 3U9DA 5BRFA 4CBXA 5BRHA 3LDOA 4IXCA 5TKYA 5FPDA 3D2FB 2P9IB 1BOTO 5EVZA 5AQFA 4FWOA 3QFPA 4O8KA 4YDUC 4LC9B 3VF4A 2YCHA 3CJ1A 4BRPA 5BN9A 4CZMA 1MWMA 3QBWA 1NGJA 4K25A 1ZBSA 3VF2A 2P9UA 5F0XA 4B1UB 1J6ZA 3MCPA 4FWMA 1DEJA 2IVNA 3H1QA 4FPAA 2D0OA 5BPMA 2E2NA 4I6MA 4JAXA 2YHYA 2H3GX 4JD2A 4BGBA 3IDHA 5KPZA 3VETA 3F9MA 4BRLA 4FOIA 2FXUA 1S3XA 3WXIA 4WQ4A 4CZLA 3EKUA 4DQ8A 2YJFA 4K43A 2NLXA 3WXKA 3B8AX 1TUUA 3TU5A 3FZLA 3WUHA 4B1VA 2I7NA 3U4LA 3D2FA 5BRDA 4H0TB 1SAZA 1HJOA 2P9IA 3ENOA 1QQOA 1BA0A 4H5RA 4CZKA 1EQYA 2VCPA 3EO3A 3ZETB 3FLCO 2V52B 5AQMA 5JLHA 3H46O 3IMXA 3A5MC 4FSVA 5AFUH 4NB4A 4ISEA 2A40A 3HM8A 1ESVA 1DGKN 1T6DA 5AQHA 5EY4A 2AP1A 3VESA 1BA1A 3QBXA 4ISFA 5ELZA 1NLVA 3VOVA 1NBWA 2QXLA 2PAVA 3VERA 4PL7A 3GBTA 2YHXA 3EKSA 5EX5A 1Z6RA 1QZ6A 3UE5A 2Q31A 2ITMA 2CGJA 2GEMA 1KAXA 2Q97A 3O1WA 3QB0A 5AQWA 4BRDA 4F9OA 4BRKA 3I8BA 4BRNA 3FFKB 1HKGA 3UKRB 3FE1A 1SQKA 2FF3B 3FR0A 2E88A 5FPEA 3VEOA 2D4WA 5AZJB 3L4IA 5KPRA 3SLCA 3SJHA 2QWPA 1K8KB 1ZXOA 2YHWA 1NGFA 4M7YA 1LCUA 1YAGA 5KQ8A 1KAYA 3BEXA 3ZETA 4EIAA 3DXMB 3ZEUB 4RCHA 2A5XA 2E2PA 2IVOA 3CIPA 3H3OB 4A2BA 2GWKA 2IVPA 4AM7A 3O1BA 2F9TA 3VPZA 4BRCA 2FLOA 4FWPA 1T6CA 1GLAG 1XC3A 4FOEA 1TYQB 4EHTA 2IIRA 2QW9A 5AQYA 5AQGA 3UKRA 5ADXH 3UKUB 1BG3A 1WUAA 3QICA 4FWKA 3U8XA 5AZJA 1ATNA 4IZ9A 3ZX3A 5JICA 2UYTA 1K8KA 4H0VB 5BREA 3MMVA 5E84A 2QWNA 2FSKA 2QWQA 1JCGA 1P8ZA 5CE3A 3ZEUA 3ATVA 3EZWA 3BUZB 3ZX2A 3CETA 1X9JA 4PL8A 3MN7A 3FGUA 1JCFA 3CJBA 4FWSA 1YXQA 1KAZA 5FPNA 3VEWA 4JHDB 3L0QA 1NGIA 4Z94A 1GLDG 5B8HA 3OHRA 1TYQA 2A41A 3A8YA 1C0FA 3C7NB 1WOQA 3R8EA 1YUWA 2E8AA 2F9WA 3GDQA 3HZ6A 4B1XB 2WUSA 4NO7A 1GLJO 1QQMA 2V51B 3MN6A 1CZAN 4FWNA 4QS8A 3H1VX 4IWVA 4C23A 1TUYA 2BUPA 4YDUA 3CERA 3A0IX 3CJCA 4M7XA 2J4RA 1GLBG 4FWQA 3O8MA 4CZIA 1NGEA 2VWBA 4FWRA 4H0YB 1QQNA 3GL1A 3WEEB 2E2QA 1G99A 3M3ZA 3VGMA 1HUXA 3VEVA 3LL3A 4QS7A 4XH4A 4BC3A 3QDKA 5BPLA 3O6WA 1XQSC 4HWIA 3EN9A 3D2EB 1BUPA 4JHDA 3WQUA 5AFUA 3A5NC 2CGKA 4MO4A 1ZC6A 5AQOA 4BR5A 4B1ZA 4BRAA 4H0PA 3VF6A 4B1YB 2BTFA 1BU6O 3VENA 5AQTA 3D7EO 4EFHA 1BO5O 3LM2A 3ZX0A 2GUPA 3CHWA 4HTLA 1V4SA 1MDUB 1D4XA 3R6MA 2FF6A 5AQIA 3WQTA 4BVPA 4BRGA 2V7YA 1KXPA 3WT0A 3M6GA 4BRIA 4CD3A 4H0OA 3AY9A 4WQ5A 4DB3A 5BPNA 1HPMA 4IJAA 4A2AA 3WEEA 1NGDA 3O5BA 4K42A 4BRHA 4BROA 1U2VB 4CZGA 2QWOA 3D2EA 4FWLA 4H03B 2A3ZA 3MN5A 1DKGD 1Z05A 4J8FA 4CD1A 1Y64A 3KHYA 4BRMA 2V7ZA 3EL2A 2GELA 3BF1A 2P9LB 3MK6A 4JNEA 3O80A 1GLFO 3SMSA 5AQVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LAWA 4JI2K 2AJQA 1NGHA 3QMLA 4I7FA 4RTFD 4AM6A 1Q18A 1RGIA 1BI4B 3IFRA 4DU3A 4BR2A 2PY5A 3L8BA 2FSNA 4JS4A 4GNIA 4RW4A 5DM6L 3PV8A 3KLEA 2KW4A 2UUBK 3BP8A 1QSSA 3JS6A 5CY4A 2EWSA 4CJRA 4GV9A 3AVMA 2Q0UA 3DWLA 3CMAN 1WSIA 3MDQA 4M3ZA 3J7YP 1ZBUA 2VYPA 1C1BA 4BR7A 5AQQA 2P9LA 4BR0A 5BR9A 1EXQA 2ASOA 3R3LA 3DLRA 3TI0A 3KK3A 5E26A 4LY7A 4DR5K 3V6DA 1BI4A 1S9GA 3DXKB 4JKGB 4DS4A 3K58A 3AA4A 2QWLA 1V4TA 4DHYA 3PIPL 1S22A 3SQ1A 3GE1A 3KTQA 4Y0WA 3QEWA 3AO2A 4L3QA 2CH6A 4OGEA 2HMPA 3M1FA 4AHRA 3C6AA 1VSHA 1TKDA 4BRQA 3KK1A 1HMVA 5JENA 2D0PA 4B9QA 3E01A 5H1SQ 4OO1J 2Q36A 4OKKA 2HNDA 4PKIA 2F96A 1NMDA 2CH5A 4PKGA 2PBDA 5M1KA 1RDDA 5M1PA 3VGKA 3SV3A 2E1ZA 4JI5K 4CZEA 3G6EN 3LDQA 1HQEA 1CZ9A 4W5RA 2JGUA 4CF2A 4FM0A 4YOUA 3CCLN 1VQ6N 4B3SK 4FZXC 3DXKA 3TPQA 4JKGA 4C8OA 1NWKA 1NOZA 2UUCK 2OANA 3L2VA 4IFYA 2YI1A 2WBNA 3DAWA 2ASPA 4B08A 3TAQA 3T19A 3ATUA 1U48A 2WC9A 1NGBA 2A6AA 1BIZA 1S1WA 1N36K 1JLCA 1HRHA 2Z1IA 1N8RO 3QFUA 2I7PA 2GTDA 1RTJA 4FJGA 4DQRA 3H6EA 4CZFA 1VSDA 4BR4A 4KKOA 3IUCA 3CI5A 2KZZA 3HP9A 4N56A 4E89A 5C12A 3THYB 2Q1NA 3AVFA 3CJ7A 3K9JA 4FCYA 1IKXA 4CIEA 1ATSA 3FFIA 1RDUA 4U67L 4FL9A 4MDBA 2NZTA 2CGLA 5KQDA 3V1OA 4H5NA 2O8FB 4PA1A 4CF0A 3F2KA 5F2RA 3VQ8A 3O9SA 3HI0A 4DUYK 1HLUA 4IFEA 2QWMA 4E3SA 5I9EB 3V81A 1HKBA 4I6MB 1C0TA 4CECA 5HRNA 3VGLA 3VQCA 4PUOA 1TK8A 3LDPA 1IJJA 4XH1A 4LF9K 4XJXA 1VQPN 4CJ3A 5AR0A 3U9DA 4CF9A 3LDOA 4IXCA 5TKYA 4JI7K 4B3OA 2XHBA 4DTRA 4N76A 1NK6A 2O8FA 3CJ1A 4BE0A 1NJWA 3HVRA 4DLEA 3HRGA 3QBWA 3VF2A 1J6ZA 2B6AA 4FWMA 3MWTA 3SPYA 1FW6A 5CR4A 3NAEA 2RPIA 2E2NA 3QIPA 4I6MA 2YHYA 3O3HA 3MXMA 1G15A 4BGBA 1SL1A 2EHGA 3OYKA 3LZJA 2QEXN 1A5VA 3F73A 4BRLA 4FOIA 4UQGA 1S3XA 3WXIA 2UUAK 4CZLA 3EKUA 3HYFA 3B8AX 1TUUA 3P38A 3TU5A 4B1VA 3U4LA 4GW6A 4PQUA 4W5TA 1BA0A 4CZKA 4ZTJA 4WFNL 1E3MA 1VQKN 4BDZA 3EYZA 3HPGA 5JS1A 2Y1IA 3A5MC 4FSVA 4NB4A 1T8EA 1QS4A 3QEPA 2A40A 2WOMA 2X74A 4Y1DA 1T6DA 3SPZA 1BA1A 4DTSA 4CEDA 1NJXA 1HNIA 1WSFA 4CJEA 4H4OA 2B5JA 2QXLA 3VERA 4PL7A 5KRSA 3GBTA 2PZSA 4FZYA 3QEXA 3O9QA 4X62K 3EKSA 4CEFA 3N4QA 3UE5A 2ITMA 1VRUA 2CGJA 4CFAA 2Q97A 3I8BA 3FFKB 4E7IA 3NF9A 4CGJA 3FE1A 1SQKA 2FF3B 1RBSA 5FPEA 3I0SA 5AZJB 3KD1E 3SLCA 1DT9A 1KRPA 4O0JA 5JVHL 2YHWA 4DR3K 1WNSA 4M7YA 1YAGA 1C0UA 4OPJA 1QSYA 1UWBA 3TSPA 4EIAA 3ZEUB 3TSQA 1ZYQA 1EP4A 3IRXA 1HQUA 2HHTA 5J2PA 4AM7A 3P5JA 4KTWA 2FLOA 1YI2N 1J54A 3E9OA 1XC3A 2E5LK 2ZJRL 1XHZA 2HHUA 1B92A 2X6SA 4FJXA 4EHTA 4DTXA 3UKUB 3CC7N 4DWIA 4F4KA 3B6PA 2W42A 1NK8A 1JLBA 4EP4A 5AZJA 1LW0A 4IZ9A 3VQDA 3D6RA 2QWNA 5FLXO 1X1PA 4GKKK 2QWQA 1P8ZA 4CEEA 3ZEUA 3ATVA 3EZWA 1X9JA 3MN7A 4DTMA 3JAMO 3PY8A 4DV3K 3ZLJA 3CJBA 4FWSA 2HNZA 3MEGA 2FBVA 3VEWA 4DTJA 1O13A 4JKHA 4Z94A 2RE2A 2KQ2A 2EX3A 5B8HA 3VQBA 4E7KA 1IO2A 3C7NB 1WOQA 2E8AA 4B1XB 4NO7A 3C95A 1GLJO 3H1VX 3TAEA 1SV5A 3CJCA 1EWRA 3TANA 1BHLA 4NXNK 4JV5K 3O8MA 2VWBA 5BR8K 3RMBA 2HHXA 3WEEB 3SJJA 3QLHA 3M3ZA 1Q8IA 1BCMA 4CJSA 4QS7A 4JKDA 4OPHA 4HUFA 1RBTA 1XQSC 2XY6A 1EWQA 3EN9A 1P90A 5C10A 3HOTA 4ELVA 4M42A 4DV6K 2BTFA 3VENA 4CERA 4DG1A 1BO5O 1W0HA 4X64K 3LM2A 1VQMN 3AO3A 5HRRA 4DQQA 5IT9O 5HOOA 1RBVA 1D4XA 3R6MA 1L5UA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4JKC A;  1CZA N;  5KRT A;  4IWV A;  5SZT A;  2WTU A;  1BL3 A;  3AGK A;  1VRT A;  3CXC M;  4FWQ A;  4DF4 A;  3CCJ N;  3OJS A;  1NGE A;  5A2Q O;  3JSM A;  2E2Q A;  1VSE A;  3VGM A;  1HUX A;  3LL3 A;  4JI1 K;  4FLY A;  5DM7 L;  1JL2 A;  3QDK A;  3ZT1 A;  5M1F A;  3PX4 A;  3T7Z A;  4B9L A;  4JHD A;  1IBK K;  3A5N C;  1S1X A;  3TAG A;  2CGK A;  5AQO A;  4BR5 A;  4WF9 L;  4B1Z A;  4BRA A;  4H0P A;  3N4P A;  1EET A;  2HHW A;  3SAH A;  3HT3 A;  3D7E O;  1KCF A;  3S3M A;  4DQS A;  3MED A;  3HL8 A;  4FJI A;  1V4S A;  1F21 A;  1TVR A;  5AQI A;  2XY7 A;  4J2D A;  3WQT A;  4BRG A;  3KK2 A;  4C1N K;  3HP6 A;  5CYM A;  1N32 K;  4BRI A;  3BY5 A;  4KHQ A;  5C42 A;  5BPN A;  2ZQB A;  2OCE A;  2P5O A;  1BQN A;  4F2R A;  1NGD A;  2IAJ A;  4BRO A;  3OS1 A;  4CZG A;  4I9Q A;  1Y97 A;  5JVG L;  4CHZ A;  1IKW A;  1YTA A;  1HPZ A;  3MN5 A;  4O4G A;  2YNH A;  1HYV A;  4AHU A;  3CYM A;  4FJK A;  2NUB A;  3BF1 A;  2P9L B;  3CME N;  4EZ9 A;  3O80 A;  5KPZ A;  3SMS A;  4FW2 A;  5AQV A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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