1WUAA

The structure of aplyronine a-actin complex
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
367
structure length
357
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structure basis for antitumor effect of aplyronine a
pubmed doi rcsb
total genus 113
structure length 357
sequence length 367
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1wuaA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1wuaA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1wuaA03
3EKUA 3B8AX 4FWQA 3LDPA 5FPDA 3L6QA 1QQOA 1XC3A 2CGLA 2V7ZA 4FO0A 2P9LA 3AARA 4BR7A 4XEIA 2P9IB 2BUPA 3P4IA 1HKCA 3D2FB 3LM2A 4H0PA 4RTFD 2IVPA 4FWSA 1NM1A 4B1VA 3HTVA 2KHOA 4B1WB 3VEVA 4A2AA 3W3DA 3A0IX 3EZWA 4H0TB 3R6MA 3VENA 5E26A 2P9KB 4BC5A 4PL7A 4PKIA 2E88A 1V4SA 4XH5A 1TYQA 4BREA 4IZ9A 4BR5A 4CBXA 3IMXA 1Z6RA 4BR0A 3WXJA 3FGUA 4BROA 1ATSA 3O4WA 4FPBA 2I7NA 1QHAA 3SLCA 1R59O 2QXLA 4WQ5C 4Y0WA 1OKJA 1SQKA 2YJEA 1C0GA 4JN4A 3GE1A 3WEEA 4L3QA 5LJVA 2VYPA 3LM9A 2E20A 4BVOA 3WXLA 3CHWA 3D2EB 3A5OC 4JD2A 1HX1A 4RWTA 2ZGYA 1NGJA 3CJBA 3L0QA 1QZ5A 3MN6A 3HBTA 4MO5A 3MN7A 3QBXA 4RCHA 2W41A 3RSEA 5AQIA 3G25A 2A6AA 2OANA 2W40A 2P9LB 4MO4A 4EAHD 4E1JA 4K41A 2FF3B 5FPEA 1U2VB 5AFUA 5BRHA 2YI1A 4JAXA 4DCHA 1GLFO 5AQRA 4BC2A 5AQMA 3MN5A 3FZLA 5LJWA 4DHYA 1YVNA 2ITMA 4M63C 2ASMA 3QB0A 3GL1A 5JLFA 4F9OA 3FZFA 1TYQB 1JCFA 3ENHA 3UB5A 4CD3A 1LOTB 4IO8A 3VEXA 2WUSA 2NLXA 3LDOA 3EL2A 3O08A 1SZ2A 4NB4A 4WYBA 4FOEA 3CIPA 5AFUH 3CQXA 5AR0A 2YHXA 5E84A 3WEEB 5ADXH 1CZAN 3FZMA 3CJCA 1RGIA 2A41A 5AQZA 2QWRA 3JXUA 1MDUB 2HF4A 4JD2B 2P9NB 3DXKA 4JHDA 2Q0UA 1X9JA 3ATVA 2P9KA 2FSKA 3IUCA 4QS7A 2DPNA 2QWLA 4MLEA 4B1ZA 4WQ4C 3HM8A 3RSEB 3CJ1A 1DKGD 3GOIA 2F9TA 3CJAA 4BRCA 2GWJA 5AQOA 3A5MC 1NMDA 4H03B 3O1BA 1WOQA 1YXQA 5EX5A 1WUAA 3CJ9A 2ZF5O 2QWQA 2V51B 3MK6A 2CGKA 3FLCO 1GLLO 3VF6A 4EHUA 5BR9A 5AQKA 1GLAG 4A62A 3H46O 3LDNA 4CZKA 1JCEA 2A5XA 2Q97A 5LY3A 3ENOA 4CZHA 3WXKA 3AAQA 1S22A 2E2NA 3I8BA 1NGAA 5FPMA 4BRFA 4DQ8A 1U2VA 4PKHA 1HUXA 3IDHA 3CI5A 4AM7A 1GLJO 1XQSC 4YDUA 4BC3A 4BR9A 2Q0RA 1T6DA 2FSNA 1IG8A 3DXKB 3DXMB 4BRDA 2NRHA 1GLBG 4JHDB 1HJOA 4BRLA 1BA1A 2D0OA 4FPAA 1NGCA 1NGDA 3LDQA 1DEJA 3ID8A 2NZTA 4BRNA 5BPMA 3FFKB 1YUWA 4FSVA 3VEZA 2Q36A 3H1VX 3HSCA 3ATUA 4CZGA 1NGFA 1GLEG 3A5NC 3H3OB 3ZX0A 4BGBA 5AQVA 4BRGA 1BO5O 3O5BA 5AQYA 1GLCG 5AQFA 4QS9A 3VETA 1X3MA 3IFRA 1NGBA 3QMLA 3WT0A 1MWKA 2P9NA 3UE5A 2ASOA 4H5WA 2YJFA 4BRAA 1DGKN 3FE1A 4B1XB 1Q18A 4DB3A 3MDQA 5B8HA 1NGEA 5AQUA 3H45C 5BRFA 5AQPA 4K42A 1ATNA 3OHRA 3SMPA 2H3GX 1KAYA 2IIRA 4EFHA 3FZKA 3R9PA 1JCGA 3CERA 5BPLA 1QQNA 2VCPA 5KPZA 5ADXA 2GELA 1RFQA 3GDQA 4BG8A 2Q1NA 3VGLA 5AQNA 3VEOA 3H3NO 3WUHA 1KXPA 1SAZA 4K43A 3C0BA 3HI0A 4BR2A 5JLHA 4PKGA 3W0LA 4BRMA 2QWPA 4ISGA 2Q31A 4B1UB 3BF1A 3CETA 5JICA 3O1WA 2E2OA 3VESA 4FOIA 4MLHA 2GTDA 3BEXA 3F9MA 3KZBA 3O80A 3KVGA 4H5VA 5AQXA 4BRQA 4QS8A 5AZIB 1NGIA 3VGKA 4PL8A 3C7NA 3HZ6A 5AZJA 3MN9A 1ATRA 3QFUA 4FWLA 5AQSA 4YDUC 4NO7A 1ZXOA 3DXMA 5AQQA 1NWKA 1TUUA 3QFPA 4IJNA 3JS6A 3DAWA 1NBWA 3QICA 3UKUB 3VF2A 5EVZA 4FWPA 3QBWA 1C0FA 1S3XA 1V4TA 3H6EA 1Y64A 2D0PA 1BOTO 1X3NA 3J8AA 2IVNA 4O5FA 4CBWA 5EXWA 1BDGA 3VPZA 5AQJA 3LL3A 3TPQA 1HLUA 2HMPA 5F0XA 4B9QA 2QM1A 4A61A 4XH4A 2GUPA 3BUZB 3SK3A 3FR0A 4BGAA 4EHTA 2P9PB 4CBUA 3KHYA 4H0VB 4CZLA 4HWIA 4AM6A 1QZ6A 5CE3A 3LDLA 3C7NB 2QWNA 5AZJB 2A42A 4CZFA 4H5RA 3WXIA 4BQZA 3U9ZA 3AY9A 3ZETA 2FLOA 4CJ7A 3S41A 1D4XA 1XUPO 1P8ZA 3U8XA 4BVPA 4BRKA 1ZBSA 1YAGA 3UKRB 1E4GT 3A5LC 4H5TA 1MA9B 4XH1A 4H0YB 4ISFA 1ESVA 1K8KB 2E2QA 2YCHA 2D1KA 4ISEA 3D7EO 3VEYA 1BA0A 5F2RA 1RDWX 4GY2B 5AZIA 5EOYA 2E1YA 4C23A 3BF3A 5AQLA 5BN9A 3WQUA 2BTFA 1NGGA 4FWRA 4WQ4A 3CJ7A 5AQHA 5I9EB 4IJAA 4CZEA 3CQYA 3EN9A 4EIAA 2J4RA 4KBOA 1LCUA 1HKBA 2P9UA 3UKUA 2UYTA 1KAXA 5TKYA 3ULEB 3MCPA 5KPTA 3I33A 1IJJA 1H1VA 2E2PA 3M1FA 3O6WA 2GEMA 2IVOA 5FPNA 5BREA 4I6MA 3ZX3A 5EY4A 3SMSA 3U4LA 2FSJA 4LC9B 4M7XA 4BG9A 3ZETB 2HF3A 4M7YA 3R8EA 4JNEA 2P9SA 4IWVA 1BG3A 2PBDA 1ZC6A 4FWKA 2F9WA 3AAPA 3ZEUA 4BRHA 4BRPA 5AQWA 2D4WA 3EKSA 2CH6A 3DWLA 3DJCA 3TU5A 1U6ZA 4H5NA 4Z94A 2I7PA 2CGJA 2QWMA 5KQDA 2CH5A 2YHWA 3VERA 1NGHA 4A2BA 3BP8A 3MMVA 2V52B 3H1QA 2P9PA 5ELZA 2Q2RA 4BRIA 3M3ZA 3SJHA 1Z05A 1NLVA 2ZGZA 3GBTA 2GWKA 4HTLA 1T44A 2P9UB 3UKRA 3A8YA 5KQ8A 4WQ5A 3U9DA 1T6CA 1G99A 3EO3A 5BRDA 2AA4A 4CZIA 1QQMA 4BQLA 2A3ZA 2P9IA 2V7YA 1K8KA 3M6GA 5BPNA 3D2FA 3VOVA 1KAZA 4O8KA 3O8MA 4J8FA 3ZX2A 4CI6A 4B1YB 4I6MB 3VF4A 2FXUA 1BU6O 2AP1A 3VGMA 4CD1A 2ASPA 1EQYA 3QDKA 2P9SB 4CZJA 2VWBA 4FL9A 3L4IA 2HOEA 3ZEUB 4FWMA 2A40A 4BC4A 4K25A 3VEWA 2EWSA 4FWOA 3FZHA 3WQTA 5KPRA 1BWFO 2ZWHA 2YHYA 3GG4A 4H0XB 4GNIA 3ULEA 1HKGA 2FF6A 4BR4A 4CZMA 1MWMA 5BN8A 5F1XA 1TUYA 1J6ZA 2QW9A 4FWNA 3D2EA 2PAVA 4H0OA 1BUPA 5AQTA 2E1ZA 2E8AA 4IXCA 2QWOA 5AQGA 1HPMA 5JMVA 1GLDG 1E4FT
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3F5TA 1SL2A 3DLEA 1WAJA 3DOLA 1BGXT 1XC3A 1HQEA 4FO0A 2QA4N 4XEIA 2HBKA 2P9IB 3O9RA 4BE7B 2BUPA 3P4IA 4HHTA 1YJ9N 3LM2A 3MWTA 4DFKA 2IVPA 4ILGB 2RPIA 3DLBA 4B1WB 3UIQA 3VQ7A 4ID5A 3VENA 4A57A 3AVFA 4H4MA 1BIZA 4CJQA 4LF7K 4KH4A 3TSPA 4PL7A 3I56N 1IKWA 2E88A 4XH5A 4IZ9A 3IMXA 1Z6RA 1LW2A 4U7BA 2QTDA 5M1NA 3NH2A 1QHAA 3NF7A 1R59O 2QXLA 4N41A 4CJFA 1EWQA 4Y0WA 3SQ0A 1N36K 4CEOA 3NGIA 3C65A 4L3QA 3LM9A 2E20A 4BVOA 4GV6A 3L2VA 4JI3K 1C0MA 4WE1A 1HX1A 4RWTA 1OVQA 4KTQA 2ZGYA 3SUPA 4HCBA 1XNRK 4UQGA 3RSEA 4KHNA 3G25A 4G1QA 4CHNA 3K5NA 3SJJA 2P9LB 1YITN 3TTFA 4LY7A 1ZYQA 4CESA 1OH8A 5FPEA 4B8AB 4CFDA 4DCHA 4BC2A 5AQMA 2I5JA 3CCLN 5FROA 4JKDA 5LJWA 5FRMA 1YVNA 4M63C 2ASMA 1JXBA 4Z4GA 3VQDA 5A2QO 3IRXA 4IO9L 1D9FA 4NCGA 4F9OA 4O0IA 4CEEA 1S1TA 1JCFA 2P1JA 3E66A 3VN5A 1XI1A 4JKGA 5LMUK 2O8EA 3T1YK 1SZ2A 1NKCA 2OTJN 1WSHA 1TKDA 2YHXA 3WEEB 4ILJA 1S1WA 1NMNA 4O0JA 3JXUA 2ZD1A 1B9FA 2Q0UA 2HW3A 5C24A 2FSKA 2DPNA 3M5RA 4MLEA 1RT1A 4WQ4C 3CJ1A 1DKGD 3ZSXA 5AJ3K 3CJAA 1SL1A 2GWJA 2IGIA 3LWMA 1F21A 1X9SA 4NCAA 2A1SA 3THWA 3PSIA 5CZ2A 3FLCO 1GLLO 5BR9A 3OA9A 3I0SA 1EO1A 3TI0A 1YTUA 2XHBA 4CZKA 2A5XA 3K5LA 3QNNA 5IT9O 4K8XA 2GV9A 4B3MK 4DQRA 1W7AA 3WXKA 3QEWA 1S22A 4FJLA 3V81A 3ZSQA 4CJ4A 4BRFA 1HUXA 4EP4A 4ZTJA 1UWBA 5SZTA 4BR9A 4BC3A 1N5YA 4FJNA 1KLNA 1ILYA 1TKXA 3DXKB 4OX9K 4E0DA 5H1SQ 3LANA 1NGCA 4LFBK 4JLHA 3ID8A 4BRNA 5IWAK 3HSCA 3A5NC 3NBPA 3TAGA 3CMEN 3H3OB 1K6YA 1IH7A 4IFEA 2FC0A 1BO5O 2Z1HA 2KLAA 3Q7CA 3SAHA 3OYBA 1FJGK 3NHGA 1VK0A 1X3MA 4KHWA 3VQQA 4CJLA 4DTUA 1NNEA 3PIOL 4DQQA 1TL3A 4DTJA 1K73O 3FE1A 4DS5A 4ZTFA 4OO1J 4DB3A 4DSFA 2EHGA 4DV5K 4ZHRA 4FM0A 1RTHA 3OHRA 3SMPA 1VQMN 1KAYA 4CJUA 4BDYA 3QEXA 5BPLA 3DRPA 4I2PA 5ADXA 4ILHA 1EXQA 3AGRA 4YOVA 3VMFB 5AQNA 3H3NO 1BIUA 1KXPA 4K43A 1UA1A 1U49A 4ISGA 4KI6A 2Q31A 3DLGA 4DWIA 3P5JA 5JENA 1KD1O 3OYHA 3OW2M 3AO2A 2VG5A 1UAXA 3AVIA 4NLCA 5M1FA 4MLHA 1BCOA 2GTDA 3F9MA 4M45A 3O80A 3DLLL 4LH4A 4BRQA 5AZIB 3CFRA 4PL8A 3C7NA 1L5UA 3HZ6A 1Z26A 1KVCA 2IS3A 2OPRA 4FWLA 4NCBA 4YDUC 1ZXOA 4FLUA 3P39A 4IG3A 3IKMA 3C95A 1I3AA 4FWPA 1YJWN 5C15A 1EETA 5DMRA 4JKAA 1N34K 1V4TA 3H6EA 3BDPA 1Y64A 4EP5A 4NXMK 3MEEA 3NH1A 3T69A 2F4VK 4CGHA 4DV7K 1UOCA 4CBWA 4FM2A 2UU9K 1GOAA 3OJUA 1S9EA 4LH5A 1QSSA 3SI6A 2P51A 4DQPA 1HLUA 4B3OA 3KLEA 4O8UA 2GUPA 5GAGP 3ZSWA 4DR1K 4IOXA 3DRSA 4EHTA 4I2QA 5KGWA 1W9HA 3WNEA 3O9SA 4CZLA 2NUBA 4CHOA 5CE3A 1T7PA 3EZ5A 3KJVA 1HMVA 2QWNA 3HPGA 2RKIA 4CZFA 1RDCA 3WXIA 1NK6A 3S41A 1C1BA 3U8XA 4GV3A 1ZBSA 1MA9B 2UXCK 3ZT2A 1HNXK 4ISFA 1QS4A 1JLEA 3AVGA 1K8KB 4DSJA 2LSNA 1TAQA 2G8UA 4F2SA 4CHYA 4E7IA 1BA0A 5F2RA 5AZIA 2E1YA 3ZT3A 5AQLA 1OH7A 3PX4A 3JAMO 4FWRA 3HOTA 1HPZA 1JLAA 4FJHA 4IJAA 5C0YA 3EN9A 4RW9A 2XY8A 2O8DB 3KLGA 4BDZA 4EZ9A 3LP0A 3J7AP 5HRNA 4Z0UA 4IEIA 4ELVA 3N4QA 1KAXA 5KPTA 4K0KK 4FZZA 3O6WA 4RW4A 2GEMA 2IVOA 4WFBL 4KPYA 4H8KA 1X1PA 1VQ6N 5EY4A 4JI5K 1S6QA 3SMSA 4M7XA 4BG9A 3ZETB 2R7YA 4JNEA 2F7TA 2QEXN 1QSYA 2CH6A 3DJCA 3THXA 2YHWA 4CJ3A 5CHIA 3MMVA 3C94A 4RW8A 5DM6L 3R1XA 4FLWA 5LL6Z 4JI4K 4BRIA 3SJHA 3AA5X 1QQCA 3HP9A 3GBTA 2HNYA 4E1NA 3KK3A 1WSFA 4HTUA 1Q7YO 4N47A 2F96A 1BQMA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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