1WOQA

Crystal structure of inorganic polyphosphate/atp-glucomannokinase from arthrobacter sp. strain km at 1.8 a resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
253
structure length
253
Chain Sequence
NAPLIGIDIGGTGIKGGIVDLKKGKLLGERFRVPTPQPATPESVAEAVALVVAELSARPEAPAAGSPVGVTFPGIIQHGVVHSAANVDKSWLNTDIDALLTARLGRPVEVINDADAAGLAEARYGAGAGVKGTVLVITLGTGIGSAFIFDGKLVPNAELGHLEIDGHDAETKASAVARERDGLSWDEYSVLLQRYFSHVEFLFSPELFIVGGGISKRADEYLPNLRLRTPIVPAVLRNEAGIVGAAIEIALQH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Arthrobacter sp.
publication title Crystal Structure of Bacterial Inorganic Polyphosphate/ATP-glucomannokinase: INSIGHTS INTO KINASE EVOLUTION
pubmed doi rcsb
molecule keywords Inorganic polyphosphate/ATP-glucomannokinase
total genus 80
structure length 253
sequence length 253
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.63: Polyphosphate--glucose phosphotransferase.
pdb deposition date 2004-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1woqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1woqA01
1Z6RA 4PKGA 3TPQA 1HKCA 4FWOA 4I6MA 4BG8A 3VEYA 2NLXA 2CGKA 2P9NA 2E2QA 4CZHA 1QZ5A 2Q36A 3FZLA 1U6ZA 1GLBG 2P9NB 2FSKA 2W40A 4H5NA 1D4XA 3JXUA 4M63C 4XH4A 3IFRA 1QQMA 1H1VA 4J8FA 3FE1A 4DB3A 2IVNA 3O6WA 4FOIA 4BGBA 5BRDA 1NGEA 4IZ9A 4H5RA 4EHUA 4EIAA 3M1FA 1BA0A 3OHRA 5AQOA 4AM6A 3ZX3A 3FZFA 2GUPA 3QBWA 3KHYA 5ADXH 3GE1A 4K42A 4B1WB 4BRQA 3I8BA 4IJAA 3M6GA 3QICA 4QS8A 3DXKB 1GLCG 3C0BA 3D2EA 2A3ZA 1HUXA 5LJVA 5EOYA 4YDUA 3GG4A 1XUPO 2CH5A 4LC9B 4AM7A 1TUYA 5E26A 3LM9A 1YUWA 1NGAA 1IJJA 1X9JA 4H0OA 1WOQA 4B1VA 2P9UA 3AAQA 3H3NO 4WQ4A 3ATUA 3GDQA 3WXKA 2V51B 5KQ8A 4H0VB 3ULEB 2V52B 3BUZB 5BREA 1OKJA 2ZF5O 3CERA 2E1ZA 2Q2RA 4FSVA 3O1BA 4FWMA 3WXLA 3VESA 1EQYA 1IG8A 2P9UB 4H5WA 3DXMA 2BUPA 3CJAA 1MDUB 1S22A 4JD2A 1G99A 1GLAG 1BA1A 5AQXA 2AA4A 4FWKA 5AQYA 3DXMB 1NMDA 3U4LA 1QHAA 4JD2B 3ENHA 5EY4A 1XC3A 4FWRA 4GNIA 1ATRA 4K41A 4XEIA 2NRHA 4A61A 1SQKA 1WUAA 3FFKB 3FGUA 4PKHA 2A6AA 4JHDA 3L0QA 5BPMA 2GWJA 2QWOA 2P9IA 1JCGA 4IO8A 3LDQA 2P9SA 2NZTA 5AQVA 5BPLA 1HLUA 3CI5A 4ISFA 4BRIA 1KAZA 3H45C 4Y0WA 4QS7A 2FLOA 3VEWA 3DAWA 3SMSA 3A5LC 4B1XB 2P9IB 2P9SB 1NGBA 4BQLA 3DWLA 1NGIA 3WUHA 5LJWA 3R8EA 1MWKA 4BROA 3VF6A 4A2BA 3FR0A 2VWBA 5BR9A 1CZAN 1RFQA 2Q97A 1DEJA 3ZEUB 5KQDA 3GBTA 2ITMA 5F0XA 3HI0A 3VENA 5FPMA 3RSEA 4CBXA 4CBWA 3J8AA 2F9WA 3QB0A 2D1KA 2QW9A 2A41A 2GELA 3UKUA 3HBTA 3W3DA 3M3ZA 5AQZA 4FL9A 4B1ZA 1HKGA 1NGCA 3CJCA 3P4IA 2ASMA 2GWKA 4KBOA 3RSEB 5CE3A 3EO3A 3UB5A 5TKYA 3LDNA 3EN9A 2Q0UA 2P9LB 2HF4A 4BC3A 5AQKA 2ASOA 3UKUB 3AAPA 4B9QA 3AARA 2FSJA 3QMLA 4FO0A 3MDQA 5EX5A 4CZIA 2P9KB 3A5MC 1KAXA 3WT0A 4XH5A 3LL3A 5LY3A 3DXKA 5BN9A 3FZHA 3U9DA 2FSNA 2AP1A 4GY2B 2D4WA 4O8KA 3VF4A 3CETA 3ZX2A 3O5BA 1QQOA 3GL1A 1Y64A 3SJHA 4DHYA 3B8AX 3U8XA 1LCUA 3BP8A 2YHYA 3CJ1A 1MWMA 2Q0RA 1TYQA 4BR4A 3VERA 4EFHA 4L3QA 4FWNA 2VYPA 2OANA 2UYTA 3CJ7A 2D0PA 3ULEA 2J4RA 3QBXA 3L6QA 4EHTA 3SMPA 1TYQB 3ATVA 5AQNA 3EKUA 3EL2A 3LDPA 4CZEA 1NGFA 1QQNA 5AQGA 3R9PA 3HTVA 3VETA 3D7EO 2GTDA 1DKGD 4ISGA 1QZ6A 2E2NA 2QWRA 1S3XA 3ENOA 4E1JA 3C7NA 2F9TA 1YAGA 4FPBA 3HSCA 3HZ6A 2IVOA 2E2PA 3WXJA 1HJOA 4BR0A 3W0LA 1BUPA 5ADXA 1GLLO 2BTFA 1Z05A 4A2AA 1E4FT 4FWLA 5AQWA 1HPMA 3C7NB 2YCHA 3D2FA 4FOEA 5AQMA 1NLVA 4JNEA 4CI6A 5BPNA 2YJFA 4BC2A 5AQJA 4BRPA 5FPNA 4BRCA 3MK6A 5AQIA 2VCPA 2EWSA 4BGAA 3D2FB 5AQSA 3VEXA 5AQTA 4FWPA 4DQ8A 3O1WA 5AQPA 2V7ZA 3MCPA 1NBWA 1ZC6A 4O5FA 3VOVA 5AFUH 5KPRA 2A40A 3LDLA 1V4SA 2ASPA 4NB4A 3BEXA 4H5TA 4XH1A 4IJNA 3EKSA 2YJEA 3IUCA 4A62A 4BG9A 1NGDA 2QM1A 3UKRB 3MN5A 1KAYA 3CIPA 1BDGA 2YI1A 3A0IX 3ZEUA 2I7NA 4BR2A 3CJ9A 2H3GX 3VF2A 5FPDA 4BR9A 1YVNA 2CGLA 1NGJA 2E88A 5ELZA 4FWSA 4IXCA 4H5VA 5BRHA 4IWVA 1YXQA 2E2OA 3VGKA 4PKIA 5B8HA 3QFUA 1BOTO 3FZKA 2QWNA 5JICA 1NGGA 3CJBA 5AZJB 5JLHA 4CZFA 5EVZA 4BREA 1V4TA 3SK3A 3SLCA 3O08A 3S41A 4CD1A 4CD3A 1C0GA 3VGLA 4BVOA 1U2VB 2QWLA 2P9LA 5AQRA 3IDHA 3JS6A 3HM8A 1HKBA 1SAZA 4WQ5C 2W41A 4BRAA 4PL7A 1TUUA 2A42A 2P9KA 3VEVA 4C23A 3FLCO 2QWQA 3O8MA 1BU6O 3R6MA 5I9EB 2Q31A 3F9MA 2YHWA 3MN9A 5JLFA 2I7PA 4FPAA 1LOTB 3CHWA 3H6EA 4RTFD 3IMXA 4I6MB 4B1UB 3WQTA 3A8YA 5F1XA 3LDOA 2FF6A 1X3MA 4QS9A 5JMVA 3H1VX 4EAHD 2ZGYA 3H46O 3DJCA 5AQQA 1RGIA 1GLJO 3ID8A 1X3NA 3FZMA 3TU5A 5BN8A 4K43A 4ISEA 1BWFO 3KZBA 5AQHA 3UE5A 1BO5O 5AQLA 5EXWA 3WXIA 4RCHA 2IIRA 4CZKA 4BRMA 4MLHA 1T44A 4CBUA 3A5NC 3MMVA 2QWMA 3VPZA 4MO5A 3VGMA 4F9OA 4RWTA 1HX1A 2V7YA 4MO4A 4CZGA 4JN4A 3ZETA 2IVPA 5E84A 5AZIA 2DPNA 1ZXOA 2E20A 4DCHA 4BRGA 4BRKA 5FPEA 3D2EB 4CZMA 5KPTA 2FXUA 1NWKA 4BC5A 1RDWX 4H0XB 3ZETB 1NM1A 2PBDA 5AZIB 3CQXA 4BC4A 4BRHA 3O80A 1T6DA 3I33A 1P8ZA 3GOIA 2HF3A 1Q18A 4CJ7A 3BF3A 1R59O 2E8AA 3G25A 3MN6A 1C0FA 2YHXA 4BR7A 4H0TB 2QWPA 1T6CA 2GEMA 3UKRA 4YDUC 5F2RA 3WEEA 4M7YA 1J6ZA 2Q1NA 4BRNA 2HMPA 3QDKA 1JCFA 1ATNA 3EZWA 4BQZA 4BVPA 3A5OC 5KPZA 4WQ4C 1KXPA 4H03B 3WEEB 3H1QA 4CZLA 4WQ5A 2PAVA 4HTLA 3WQUA 3KVGA 3O4WA 4CZJA 1ESVA 3H3OB 5AQFA 5BRFA 1BG3A 5AR0A 3MN7A 5AZJA 3ZX0A 2A5XA 3LM2A 1GLEG 1SZ2A 4FWQA 1JCEA 1K8KA 2QXLA 4K25A 1ZBSA 3VEOA 1U2VA 4PL8A 3U9ZA 1MA9B 2WUSA 4NO7A 1GLDG 4HWIA 4JHDB 4WYBA 3QFPA 4BR5A 3BF1A 4BRDA 1GLFO 1E4GT 2ZGZA 1K8KB 3L4IA 4M7XA 2KHOA 2P9PA 4BRLA 4H0YB 1NGHA 2FF3B 1DGKN 4MLEA 2E1YA 2CGJA 4BRFA 4Z94A 4B1YB 5AFUA 1XQSC 4H0PA 2CH6A 1ATSA 2D0OA 3CQYA 2HOEA 2ZWHA 4JAXA 3VEZA 2P9PB 3AY9A 5AQUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2W6KA 3J7YP 3VEYA 3RMBA 1XWLA 3VQ7A 4GV6A 1QZ5A 4DTRA 1TKTA 4O4GA 3KD5E 4CJ4A 2P9NB 5DM7L 1D4XA 3JXUA 3I55N 4J2DA 1NG9A 3IFRA 4AILC 1EWRA 4BDZA 4RG8A 3K0SA 1H1VA 4J8FA 3AO4A 3FE1A 4DB3A 3IKMA 1S1WA 3VMFB 4BGBA 1KLNA 4V19S 5DMRA 4KAZA 5BRDA 2IOCA 2QXFA 4CECA 1BCOA 3NAEA 1ZYQA 1YT3A 2GUPA 4JLHA 4IO9L 4KV8A 3GE1A 4CFDA 4CCHA 4BE2A 4B9UA 1RDBA 3RRHA 4HUFA 1QSYA 1HUXA 4CGJA 4DMNA 1RCHA 1LWFA 3E66A 2KW4A 3GG4A 4JI1K 4AM7A 4YOTA 3JYTA 1UA0A 1IKWA 1SL2A 1YUWA 3CMAN 1X9JA 1RT6A 1LW2A 3H08A 3BZCA 3KWGA 4WQ4A 3AAQA 3HT3A 5KQ8A 2YX6A 4IOAL 3ULEB 3BUZB 3LDSA 1OKJA 4YNQA 2E1ZA 2Q2RA 3WXLA 3O1BA 2Z1HA 1OVYA 1N33K 1NOYA 2P9UB 2PZSA 3RTVA 1J53A 3RMAA 3DXMA 5J2PA 1VAZA 1S22A 1DLOA 2OTLN 1TKXA 2AA4A 2WONA 5JVHL 4JD2B 3ENHA 5CYQA 3VQ6A 4GNIA 4K41A 2DFEA 4XEIA 5J2MA 3OYNA 2QTDA 1JL1A 1I39A 1Q7YO 4JKHA 3BGRA 3BZKA 3FGUA 4ID5A 5KTQA 3L0QA 2HHXA 2GWJA 1U48A 1JCGA 3KLEA 4CJQA 2P9SA 1HLUA 3CI5A 4Y0WA 4CJLA 3VEWA 1KQSM 3PX4A 3ITHA 4B1XB 1IBLK 4PQUA 1RT3A 4DTJA 4ZTJA 3KKRA 4CJ3A 1NGIA 1OH8A 4Z4FA 3V4IA 3R8EA 1MWKA 2NRZA 1YVUA 3FR0A 3RMDA 2VWBA 5BR9A 1DEJA 3HOSA 2NRRA 4A5AA 3GBTA 1KFSA 5J1EA 3THXA 2HW3A 1HYZA 4LSLA 1GOAA 4W5NA 4JI0K 1HNVA 2HHHK 2OPPA 2F9WA 5A2QO 1D5AA 2QW9A 1NJYA 1HKGA 4KBOA 2GWKA 4B9SA 1W97L 3TTCA 3EO3A 3ZSVA 3SPZA 3UB5A 5TKYA 2YHBA 3OA9A 1ASWA 4LF8K 4ID1A 5AQKA 3AVHA 3OJUA 2NNWA 4E3SA 2OTJN 1BIUA 1P90A 3MDQA 5EX5A 2P9KB 3E1YA 3M8PA 5LY3A 3CCJN 5BN9A 1K8AO 2FSNA 2AP1A 3HPHA 1LWCA 4CIFA 4E1MA 5JVGL 1QQOA 3GL1A 4JI5K 3B8AX 4CHYA 3U8XA 3SV4A 2HHQA 4N56A 4JKCA 3CD6N 1JLGA 3T1AA 1MWMA 1VQLN 4EFHA 4FWNA 1T8EA 4FJKA 4E19A 2EHGA 2X6NA 3ULEA 3VQ5A 3QBXA 2UUBK 3DLBA 1BL3A 1TYQB 1KLMA 4FZZA 3G6EN 4M3WA 4KTWA 3AVLA 4O5BA 3VETA 4CK3A 3QNOA 1U4BA 1VQ9N 3D7EO 1QVFM 1DKGD 4ISGA 4DR2K 3C6HA 5KGXA 4ILHA 3C7NA 2F9TA 1RDAA 3LPTA 3HZ6A 5FDLA 1BHLA 2DFHA 4KH6A 4IG0A 3DYAA 3L3VA 1KVAA 2P5OA 5AQWA 3ZSRA 5H1SQ 4GV3A 3HL8A 3CCUN 3D2FA 3N4PA 4H4OA 5BPNA 2NRXA 4BRPA 5FPNA 4B3OA 4L8RB 2NUBA 3THWB 3DLEA 3K2PA 2BANA 3VEXA 1BIZA 3AVAA 4N47A 4DQ8A 4CEAA 4B3SK 2DTUA 2V7ZA 1ZC6A 4O5FA 4WCEL 2Z1GA 3K5LA 3BEXA 2RN2A 4IJNA 2YJEA 3IUCA 4BG9A 3SAGA 1HJRA 3CIPA 4DFJA 4FZXC 1N34K 5FLXO 1ZBFA 3O9TA 4FW1A 1RTDA 4JS5A 3VF2A 1OH6A 1ASUA 5FPDA 4BR9A 1YVNA 2CGLA 4IXCA 2E6MA 2E2OA 1BOTO 2QWNA 5JICA 3HJFA 1IG9A 3QESA 5JLHA 2B6AA 1Z25A 1L3TA 3SK3A 3SLCA 3AA4A 3S41A 3VGLA 2PYLA 3F2KA 3A2FA 4CFBA 4LH4A 1QQCA 4BRAA 4JYAK 4PL7A 4DV5K 1NK6A 4NYNA 4CF9A 2P9KA 1D8YA 3FLCO 3O8MA 1BU6O 5HRRA 3VQQA 4CGDA 5I9EB 4J2BA 3F9MA 2F7TA 4ICLA 4CEEA 5JLFA 4BE1A 1NU0A 2I7PA 1LOTB 4Z0UA 3OBYA 4Q0BA 4EP5A 3QLHA 2P1JA 2UXCK 5KI6A 4DQQA 3PV8A 4CEBA 3KK3A 2HSTA 1QS4A 5DK5A 2HBKA 4FJ9A 1LAWA 2HBJA 3DRPA 3ID8A 1X3NA 3WNGA 1JLAA 4E7HA 2WTUA 2HVHA 4ISEA 3RRGA 5AQHA 1BO5O 3VN5A 4FVUA 2JWLA 1M90O 4EZ9A 2IIRA 3I0RA 1T44A 1KVBA 1HNZK 3A5NC 3L2WA 4E0DA 4CEQA 4CEDA 4B9MA 4LH5A 4KI6A 2HBMA 4LFBK 3RVCA 4PA1A 1L3UA 4YY3K 1HNXK 4I2QA 5AZIA 5GAEP 4DCHA 5M1FA 3D2EB 3BY5A 1WAJA 1NWKA 2FXUA 4ILGB 4BC5A 3THWA 1FKOA 4JKAA 4HCBA 3CQXA 3SBGA 4BRHA 4BDPA 3O9UA 3T19A 1P8ZA 3GOIA 1YITN 4CHZA 2D5RA 1R0AA 3SI6A 1HNIA 1VQKN 4CJ7A 3J7AP 5GINA 4BR7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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