1WOQA

Crystal structure of inorganic polyphosphate/atp-glucomannokinase from arthrobacter sp. strain km at 1.8 a resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
253
structure length
253
Chain Sequence
NAPLIGIDIGGTGIKGGIVDLKKGKLLGERFRVPTPQPATPESVAEAVALVVAELSARPEAPAAGSPVGVTFPGIIQHGVVHSAANVDKSWLNTDIDALLTARLGRPVEVINDADAAGLAEARYGAGAGVKGTVLVITLGTGIGSAFIFDGKLVPNAELGHLEIDGHDAETKASAVARERDGLSWDEYSVLLQRYFSHVEFLFSPELFIVGGGISKRADEYLPNLRLRTPIVPAVLRNEAGIVGAAIEIALQH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Inorganic polyphosphate/ATP-glucomannokinase
publication title Crystal Structure of Bacterial Inorganic Polyphosphate/ATP-glucomannokinase: INSIGHTS INTO KINASE EVOLUTION
pubmed doi rcsb
source organism Arthrobacter sp.
total genus 80
structure length 253
sequence length 253
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.63: Polyphosphate--glucose phosphotransferase.
pdb deposition date 2004-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1woqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1woqA01
4FPBA 3VGKA 4BVOA 2P9KA 5FPDA 1SZ2A 4LC9B 3H3OB 1RDWX 4CD3A 1X3MA 2QM1A 3EKUA 1DKGD 1T44A 4JD2B 3LDPA 1BG3A 3VF4A 3SK3A 4BGAA 3IUCA 2CGKA 2NZTA 5AQMA 1U6ZA 4WQ5C 3C7NB 4JN4A 5ADXA 2GTDA 2E2NA 3CI5A 3VGLA 4ISEA 1TYQA 5F0XA 1ATNA 4BREA 1CZAN 3J8AA 5BRDA 2HMPA 2Q36A 1BU6O 3CQYA 3H46O 1D4XA 3OHRA 2E2OA 3TPQA 2FSNA 1YXQA 4BQZA 4PKGA 1NGAA 5AQUA 5AQVA 3A8YA 1NGDA 3S41A 2E1YA 4BQLA 4FWOA 4NB4A 5TKYA 5AQNA 2QWLA 3W0LA 3QMLA 4CZIA 1QQMA 3QFPA 3WEEA 4PL8A 4H0XB 5EY4A 5BPMA 2D0PA 3KVGA 4CZJA 4IJAA 3VENA 4CJ7A 3ZETA 1QQNA 4FWRA 4CBWA 5AQQA 2YHYA 1NGEA 3FFKB 2P9LA 1NGBA 3BUZB 4EHUA 3QFUA 2P9KB 2WUSA 3GE1A 3DJCA 3ZEUA 2VYPA 4BRCA 1ZC6A 1SAZA 4FWSA 2HF3A 2PAVA 1BWFO 3QBXA 3FR0A 1NWKA 5EVZA 4K41A 2E8AA 3VOVA 3A5OC 3UKRB 3CJ1A 3I33A 4MO5A 2KHOA 3UKUB 4B1YB 4B1UB 4B9QA 2E1ZA 2VWBA 3LL3A 4BC4A 3G25A 4J8FA 2QWOA 4BRFA 4DCHA 3A5MC 4CZMA 4A2AA 4H5NA 3RSEA 3D2FA 4O5FA 4BC5A 5LY3A 1NGCA 1RGIA 3KZBA 1ESVA 3VERA 3LDLA 2D1KA 3VEWA 2AP1A 3C0BA 3WEEB 4QS7A 3L6QA 4BRKA 3FZFA 5BREA 5AQIA 1G99A 2DPNA 1C0FA 3IDHA 3ZETB 2E2QA 4FSVA 4M7XA 2P9LB 5EX5A 2ZGYA 2A3ZA 3JS6A 3WXIA 4ISFA 2BTFA 3TU5A 2H3GX 4XEIA 4WQ5A 4BRAA 3R9PA 4CBUA 2I7NA 5AQSA 1YAGA 2E20A 4BRLA 2IVNA 3DXMA 2PBDA 3U9DA 4B1WB 2HF4A 1HKCA 1Q18A 5AQFA 1NBWA 3U4LA 3O80A 4DB3A 4Z94A 1QQOA 3WXLA 3WT0A 1KXPA 2P9UB 3UB5A 5B8HA 5KPTA 4E1JA 2E2PA 5FPNA 2AA4A 3O5BA 2OANA 5BPLA 3VETA 4IO8A 1BO5O 3LM2A 4WYBA 3ZX3A 3HTVA 4BRHA 3VEYA 4RTFD 3ZX0A 3RSEB 3D2FB 3VEXA 2ASOA 4CD1A 2CH5A 1JCGA 1OKJA 2Q2RA 4O8KA 2FLOA 2UYTA 2F9WA 3ID8A 2QWMA 3ULEB 1BA1A 1QZ6A 4PL7A 3FLCO 4BRMA 4BR7A 1IG8A 4JHDA 4A61A 5I9EB 3DWLA 3UE5A 3WXJA 3VGMA 1NMDA 1T6DA 4CZKA 5AFUA 3H1QA 1BDGA 4BRIA 4QS9A 5CE3A 2ITMA 3MDQA 3CIPA 3UKRA 3GL1A 5AQJA 3P4IA 3FZHA 3ATVA 3SJHA 3UKUA 1S22A 2YHXA 3IFRA 3QBWA 3L4IA 4Y0WA 4IJNA 4PKIA 5AQGA 5AZIB 3CJ7A 2P9PB 3DXMB 4H0TB 4B1XB 2Q97A 4WQ4A 2Q1NA 3HBTA 2V51B 3CJAA 4GY2B 5BN9A 3EL2A 2IIRA 4L3QA 5AQLA 4CZLA 3QDKA 4B1ZA 4CBXA 4BR5A 4BC2A 1XQSC 4FPAA 3BF1A 2YJEA 5FPMA 3AAPA 4CZEA 2GELA 3MK6A 1KAYA 4JHDB 1NM1A 2YI1A 2Q0UA 1T6CA 2QW9A 2V7YA 3VEZA 1ATSA 3LDQA 1GLFO 3O08A 4HTLA 3JXUA 3CERA 4FO0A 4H5VA 1KAZA 4H0PA 5EOYA 1HPMA 3HI0A 2P9UA 1E4GT 2A41A 3DAWA 4WQ4C 3AARA 4KBOA 4H0YB 2VCPA 5BRHA 5ADXH 2FF3B 4H0VB 4BGBA 4RCHA 1GLCG 3MN6A 4CZHA 4M63C 2FXUA 3ENOA 4BROA 2EWSA 1WOQA 2E88A 3BP8A 3VEOA 2W41A 2ZGZA 3O1WA 4YDUA 1V4SA 2V7ZA 3ULEA 3ENHA 4H0OA 1C0GA 1NGGA 5AQWA 3ZX2A 3A5LC 2D4WA 4JNEA 3LM9A 4GNIA 4BR4A 3O4WA 2CGLA 1J6ZA 1XC3A 3A0IX 1GLBG 1TUYA 3FGUA 4NO7A 2IVPA 1MWMA 2P9SB 5AZIA 2QWRA 4IXCA 5KQDA 2P9PA 4BR0A 1NGFA 1JCEA 4FWQA 4XH5A 3M6GA 5JMVA 1DEJA 4MO4A 3GG4A 1IJJA 3CETA 5KQ8A 4YDUC 1EQYA 3EO3A 3LDNA 2FF6A 3FE1A 2CGJA 3AY9A 4BR2A 1DGKN 3W3DA 2F9TA 3GOIA 5AZJA 3MN5A 5KPRA 4H03B 1GLLO 4EAHD 1K8KB 5EXWA 1V4TA 1X3NA 3HSCA 4FWNA 3DXKB 3SMSA 4DQ8A 1TUUA 1HUXA 4XH1A 1Z6RA 3QICA 3H45C 2P9NA 3GBTA 4BRNA 1LOTB 3H6EA 2P9IB 1NGIA 3CHWA 3I8BA 3MN7A 2ASMA 1HX1A 4ISGA 2QWQA 1NGHA 3R6MA 1BA0A 5BPNA 3O8MA 5E84A 4BG9A 2D0OA 2QWNA 5JLHA 4FWLA 4FOIA 3IMXA 3BF3A 1BUPA 3CJCA 5FPEA 1SQKA 4IWVA 1H1VA 1U2VA 2FSKA 5AQKA 4BRGA 2GWKA 4RWTA 3B8AX 3EN9A 2W40A 5BN8A 2YHWA 1YVNA 1HKBA 2QXLA 4H5RA 3A5NC 4FL9A 4DHYA 3FZLA 1GLEG 5LJVA 1KAXA 2A42A 3AAQA 5AZJB 1QHAA 3BEXA 3KHYA 4FWKA 4AM7A 3VPZA 2YCHA 4BG8A 1BOTO 5JICA 1RFQA 2YJFA 4EHTA 5LJWA 1GLJO 2P9SA 1YUWA 4FWMA 5AQZA 4EIAA 2P9NB 1HLUA 3CJ9A 1MA9B 3LDOA 1P8ZA 2I7PA 4F9OA 3U8XA 2J4RA 1R59O 4H5TA 5KPZA 4I6MA 4BRDA 1QZ5A 3WXKA 5AFUH 2V52B 4EFHA 5AQHA 3CQXA 1HKGA 1ATRA 1Z05A 2FSJA 4IZ9A 1NGJA 2ASPA 1GLDG 1K8KA 3MN9A 3VF2A 5F1XA 1MDUB 1U2VB 3D2EA 3M3ZA 1TYQB 3MMVA 5AQOA 2ZWHA 4BRQA 3U9ZA 4BRPA 3DXKA 5AQYA 3D7EO 3GDQA 3VESA 5F2RA 1S3XA 2QWPA 5E26A 2NRHA 1ZXOA 4K25A 2P9IA 2GUPA 2A6AA 3SMPA 2CH6A 1E4FT 5AQRA 3L0QA 4JAXA 3HZ6A 2GWJA 2Q31A 3WQUA 5BRFA 3M1FA 4C23A 4K42A 4AM6A 3SLCA 5JLFA 1HJOA 3F9MA 4HWIA 4JD2A 4M7YA 3R8EA 4A2BA 4B1VA 2A40A 4BC3A 2Q0RA 3ATUA 2IVOA 3C7NA 2ZF5O 2NLXA 1XUPO 3VEVA 2A5XA 1NLVA 2HOEA 4FWPA 4PKHA 3FZMA 4K43A 1MWKA 4H5WA 3H1VX 4FOEA 3WUHA 3VF6A 1LCUA 4XH4A 5AQTA 4I6MB 3MCPA 4CI6A 5BR9A 4CZGA 1X9JA 1Y64A 3EZWA 3ZEUB 4QS8A 4MLEA 3H3NO 3EKSA 1JCFA 5ELZA 4BVPA 1WUAA 4A62A 3D2EB 5AQPA 5AQXA 3CJBA 3HM8A 4CZFA 4BR9A 3QB0A 3WQTA 3O1BA 2BUPA 1ZBSA 4MLHA 5AR0A 3FZKA 1GLAG 3O6WA 2GEMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5J1EA 3NF7A 4IOXA 1RDBA 2LSNA 2Y1IA 4IDHA 3M8QA 4LC9B 2E6LA 2FC0A 1T44A 3LDPA 2VWJA 3SJJA 4WQ5C 2HNYA 3AVAA 5M1FA 2E2NA 4IEEA 3CI5A 1T3VA 5M1KA 4ELUA 3Q7BA 2ATQA 2JWKA 5BRDA 3THWB 3K5NA 2QEXN 4E89A 5C2DA 2FSNA 4CJLA 1U04A 4EP5A 4U7BA 5AQUA 4CF8A 4E7KA 2E1YA 1Q81O 5TKYA 3PV8A 3ZSQA 4PQUA 3TSQA 4LH5A 5EY4A 5JS2A 2D0PA 1NNEA 4B9VA 3OY9A 3IRXA 1RBVA 4CJ7A 5CY4A 1DTQA 3AVMA 4FW2A 4A5AA 4FJXA 2P9LA 2HHVA 1NGBA 1IKYA 3ITHA 4DLGA 5KGWA 4F2RA 5M1NA 3N4QA 1S6PA 4BE2A 4IBNA 2HF3A 1G15A 4CEZA 1EXQA 2RPIA 4E7JA 1KLMA 2WONA 4K41A 2E8AA 4CJUA 1RT7A 3CJ1A 4DTNA 3VQAA 5H1SQ 3UKUB 2E1ZA 4CIFA 3G4SN 4OPAA 3G25A 3LAKA 2OA8A 4CEEA 3QESA 4M41A 4J8FA 4DCHA 4E7HA 4CFAA 2QKBA 3MX2A 1RTDA 3CCRN 3ZYYX 3CCLN 2BE2A 3LDLA 5C2FA 2AP1A 3QEPA 3K9JA 4BRKA 5SZTA 4HHTA 1G99A 3K5OA 2DPNA 3Q7CA 4JKDA 3V81A 3ZETB 1BI4A 3PO4A 3TABA 3CF5L 1Q9XA 1EKEA 1D9DA 1BQMA 2DFHA 3AVHA 2UUBK 2F7TA 3D6RA 4WQ5A 4XEIA 1C0TA 3EYZA 1WB9A 1I39A 1VHXA 3SPZA 1EETA 4DUZK 3VA3A 4B1WB 4IFVA 4ZTFA 4DLEA 3MX5A 4DTOA 3U4LA 3O80A 1KXPA 3UB5A 5KPTA 1WSFA 3NVMA 5FPNA 4JI5K 5BPLA 3VETA 2O8EA 4JI7K 3LM2A 3ZX3A 4AQYK 1GOBA 4DQPA 3BY5A 3D2FB 4O44A 2ASOA 2FLOA 3L2UA 4FYDA 1WSEA 3ULEB 1YIJN 1BA1A 4FJKA 1IG8A 4A61A 3K58A 1YTAA 2ZE2A 1RT3A 2ZD1A 1KFSA 1GOAA 1NMDA 1T6DA 1BDGA 4CJSA 3KTQA 2HB5A 4JLHA 4CEBA 4KHNA 3DRPA 5AQJA 1N32K 1VQ4N 3IFRA 3QBWA 1Q9YA 1SL1A 3VQ5A 3HOSA 5GAGP 1TVRA 3THVA 4IDKA 3T1YK 3TSUA 4BDZA 4U67L 4H0TB 4B1XB 2Q97A 3LZIA 1IH7A 4YOTA 4WQ4A 4DR4K 4DKWA 3HK2A 1VSEA 5HRPA 2O8CB 3LPUA 2V51B 3CJAA 3B6PA 1TK5A 1N34K 1VQ8N 1ZBHA 1CZ9A 2IIRA 2KLAA 3CCVN 3MCAB 5IT9O 4Z0UA 4HUGA 1YF5L 4FPAA 1HPZA 4CZEA 2GELA 5DMRA 1T6CA 2QW9A 4FZYA 1JLGA 3AVCA 3LDQA 1GLFO 1KSPA 4ZHRA 3CXCM 3L4QA 1KAZA 3TSPA 1IO2A 5EOYA 4DQQA 3HI0A 4JKEA 5GIOA 3AVBA 1E4GT 1QQCA 3HXMA 5ADXH 1RTHA 3DLGA 3PUFA 1C1BA 4CFCA 3CG7A 3VTIA 3MN6A 4M63C 2EWSA 2E88A 2YNHA 3UIQA 2W41A 2ZGZA 4YDUA 1V4SA 1NOZA 2V7ZA 3C6TA 4KRFA 1NJYA 4WFAL 1LV5A 4FLWA 4DF8A 2ZM6K 4RW6A 3EEQA 2D4WA 3P38A 4DU3A 5C25A 3KJVA 1HNWK 1J6ZA 4XIUA 4LF9K 3AA3A 4IOAL 2B5JA 4B9SA 3THYB 4B8AB 4JKFA 1JL1A 2P9PA 1BQNA 4JKGA 1RT2A 1JCEA 4FLVA 3IG1A 4XH5A 3M6GA 4G9ZA 2QI2A 4G1QA 1RBSA 3OA9A 4FLUA 2OTLN 3AO2A 1IJJA 3S9HA 1JLEA 2A1RA 1NJWA 3CETA 2O8FA 3CPWM 1YITN 4O0JA 3FE1A 4YOXA 3W3DA 3ZT0A 2NRVA 4FLTA 5EXWA 1VSFA 1X3NA 3T69A 2D0CA 3SMSA 3CYMA 4DQ8A 1TV6A 5AJ3K 1Z6RA 2OPSA 3WNGA 3H45C 4BWJA 4RW7A 4CHNA 4CEFA 2BH1A 3CHWA 3MN7A 1UWBA 2ASMA 3R6MA 1NJIO 4O4GA 5D3GA 3CC7N 5E84A 4BG9A 4CJKA 4DR3K 3IAYA 4MQ3A 3LAMA 3DYAA 3BF3A 3O3FA 2IGIA 1S5JA 3DM2A 2Z1JA 4IWVA 4RWTA 3ID6A 3ZSXA 2QK9A 4CHOA 2ITGA 1HKBA 2QXLA 4OGCA 3NBPA 2HHQA 3QNNA 1OVQA 4DHYA 1K9MO 5LJVA 5AZJB 3SPYA 1S1XA 1ASVA 1M90O 3KK1A 1NKBA 1S9GA 4AILC 3H08A 4FWMA 4CJ3A 2UXCK 1I3AA 5LMUK 3RMCA 3LZJA 3LDOA 1P8ZA 2I7PA 3VQPA 2PYJA 3U8XA 2YNFA 4CIEA 4RG8A 4H5TA 3V9WA 5KPZA 4B9LA 5AQHA 2YKNA 1ATRA 1Z05A 4F3OA 2FSJA 4ILHA 2KQ2A 3BZKA 1EX4A 2ASPA 1GLDG 2O8BA 1K8KA 2HBLA 3RMBA 4JYAK 1U2VB 4B9NA 3M3ZA 3ZT2A 1ASUA 4BRQA 4BRPA 3DXKA 4K8ZA 1EP4A 3GDQA 3VESA 2DY4A 4M3ZA 5F2RA 3VQ9A 2I5JA 2QWPA 5E26A 2NRHA 1XHZA 1ZXOA 3KLIA 1E4FT 5AQRA 4AHUA 1QTMA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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