1WOQA

Crystal structure of inorganic polyphosphate/atp-glucomannokinase from arthrobacter sp. strain km at 1.8 a resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
253
structure length
253
Chain Sequence
NAPLIGIDIGGTGIKGGIVDLKKGKLLGERFRVPTPQPATPESVAEAVALVVAELSARPEAPAAGSPVGVTFPGIIQHGVVHSAANVDKSWLNTDIDALLTARLGRPVEVINDADAAGLAEARYGAGAGVKGTVLVITLGTGIGSAFIFDGKLVPNAELGHLEIDGHDAETKASAVARERDGLSWDEYSVLLQRYFSHVEFLFSPELFIVGGGISKRADEYLPNLRLRTPIVPAVLRNEAGIVGAAIEIALQH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Inorganic polyphosphate/ATP-glucomannokinase
publication title Crystal Structure of Bacterial Inorganic Polyphosphate/ATP-glucomannokinase: INSIGHTS INTO KINASE EVOLUTION
pubmed doi rcsb
source organism Arthrobacter sp.
molecule tags Transferase
total genus 80
structure length 253
sequence length 253
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.63: Polyphosphate--glucose phosphotransferase.
pdb deposition date 2004-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1woqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1woqA01
1V4SA 2P9UA 1RDWX 3ATUA 2ASOA 3JXUA 4JN4A 4QS8A 5BPNA 1BWFO 3UKRB 4K41A 1QZ5A 3WXLA 1KAYA 5FPMA 4BRGA 4BRIA 1U2VA 1YXQA 3GOIA 2P9LA 4B1UB 3HBTA 2CH5A 3SJHA 4BRMA 1NGJA 2V51B 3SK3A 3HM8A 4KBOA 4A2AA 4K42A 4FWKA 1IG8A 4PKGA 5KQDA 4PL7A 2ITMA 1WUAA 1CZAN 2FXUA 3UKUA 5FPNA 4IJNA 1HPMA 3MDQA 2AP1A 1ATNA 4BGAA 4XH4A 3ZEUB 3EO3A 4RWTA 3U9ZA 3OHRA 2V52B 1NWKA 3AAQA 3VESA 1BU6O 3DAWA 3L0QA 4B1VA 1OKJA 4Y0WA 4ISGA 2PAVA 1LOTB 4DQ8A 4BR4A 1SAZA 2IVNA 3TU5A 2YHXA 1NGHA 1GLAG 2FLOA 2F9TA 5BN9A 1RGIA 2NRHA 2P9KA 3H1QA 3LDQA 2UYTA 2P9NA 3ENHA 2GEMA 1Z05A 4FWNA 5BPLA 4FWMA 4RTFD 1QQOA 4CD1A 3BF1A 1XUPO 3EZWA 2QWRA 2D0PA 3VF6A 1HKCA 2D4WA 3DWLA 2QWNA 3DXMA 4WQ4A 3HZ6A 3QDKA 2PBDA 3UE5A 1Q18A 1QZ6A 3QBWA 3C7NA 3QB0A 4MO5A 3LM2A 3KVGA 4PKHA 4BRHA 1K8KA 1T6CA 4B1YB 3R6MA 1GLFO 1Y64A 3KZBA 4LC9B 2CGKA 5AR0A 1ZC6A 3ULEA 1KAZA 3CJAA 1J6ZA 3RSEB 3FZLA 4HWIA 4IZ9A 1BG3A 2ASPA 1XC3A 2A5XA 4CI6A 1GLCG 3VPZA 2P9IB 3MN6A 1ZXOA 3P4IA 4GY2B 5AQMA 5AFUA 2YHWA 3L6QA 2ZGZA 1NGBA 2E2QA 5AQLA 4F9OA 5EVZA 1X3NA 2DPNA 2Q2RA 2BUPA 2A40A 4BGBA 4CZHA 5BRDA 3DXKB 1E4FT 1YAGA 3H1VX 2E1YA 2A3ZA 1HX1A 5AQSA 4B1WB 3I8BA 1GLDG 1HKGA 4FWQA 3U9DA 1GLJO 4FWPA 3IDHA 5F0XA 3WQUA 1ZBSA 2FSKA 3DJCA 1KAXA 3M3ZA 3D2EB 1KXPA 4BR2A 3FLCO 3M1FA 2FF6A 3CJ1A 5AQJA 4AM7A 4WQ4C 4M7XA 5FPEA 5KQ8A 5BR9A 1DEJA 2CGJA 4NB4A 4J8FA 2FSNA 4I6MA 5AQVA 2HMPA 4H0VB 2P9PA 2V7ZA 1BOTO 1JCGA 3ATVA 5AQZA 4BC2A 2Q36A 5AQUA 4BVOA 1NGAA 3BF3A 3D7EO 3QMLA 3FR0A 3UKRA 5FPDA 1S22A 3H6EA 3QICA 3HSCA 2IIRA 3WXIA 5AQHA 3WUHA 4L3QA 4BRCA 5AQKA 3FZFA 3MN7A 4XH1A 2QWLA 3EN9A 1BA0A 2Q1NA 3CJ9A 4CBUA 2H3GX 4E1JA 1MWMA 5AQRA 2VYPA 3MN5A 4EHUA 1T6DA 4WQ5A 4CD3A 3H46O 3O8MA 3CQYA 4CZGA 3ZEUA 4Z94A 2NLXA 3QFUA 4BQLA 2I7PA 4BRNA 3LDPA 3M6GA 3WQTA 2A6AA 3LM9A 4JHDB 1TUYA 4BR9A 2OANA 4FWOA 1NGGA 3KHYA 5AQXA 3L4IA 4JHDA 2QWMA 5I9EB 4M7YA 5KPZA 3FFKB 4H0YB 3ZX0A 4IXCA 3VEXA 4BRPA 2QW9A 2E8AA 2VCPA 1P8ZA 3VEVA 4FOEA 1DKGD 5BPMA 3UB5A 5AQIA 4CZMA 3BUZB 4FOIA 4CZFA 3U4LA 4WYBA 4QS9A 1JCFA 5EXWA 1R59O 2V7YA 3HTVA 2P9SB 4AM6A 1EQYA 4XEIA 5BREA 5BRHA 3D2FB 3AY9A 4QS7A 1SQKA 1HLUA 3LDLA 4EAHD 3WEEB 4A2BA 4CZLA 3A0IX 5E26A 3SLCA 4RCHA 3S41A 4BR7A 4H5NA 4O5FA 4ISEA 3WEEA 3ZX3A 3H3OB 5JMVA 4BVPA 4H5TA 1YUWA 4FSVA 2E2NA 3RSEA 4ISFA 3VF2A 3QFPA 4BR5A 1MDUB 4WQ5C 4H0XB 1WOQA 4B9QA 3IUCA 3FZHA 2P9IA 3R8EA 5KPRA 5AQGA 1BA1A 2CH6A 2ZGYA 3ZETB 4BREA 2QXLA 1HKBA 5AQOA 4FPBA 5AQQA 4H5RA 3VENA 4B1ZA 3AAPA 3A5MC 1V4TA 5AFUH 3O6WA 1NBWA 2IVOA 2YJEA 3VF4A 4CZKA 1D4XA 3EKSA 4H5WA 4JD2B 1QQNA 2QWPA 4FPAA 2IVPA 2KHOA 4YDUA 2Q0UA 4EHTA 3DXKA 3I33A 3O5BA 2BTFA 2HF3A 2E20A 3O1WA 4JD2A 5AQNA 3EKUA 1TYQB 2I7NA 5AQTA 5AZJB 3AARA 4BRAA 4BC5A 1NM1A 3O1BA 3CHWA 1NGDA 3VGLA 2Q0RA 3R9PA 1JCEA 5AQPA 2E2OA 3D2EA 2NZTA 4IWVA 3CETA 2GELA 2HF4A 3WXJA 2ZWHA 3VETA 5KPTA 2AA4A 3SMPA 3ZX2A 3CJ7A 2D1KA 3EL2A 4BG9A 4BRFA 3ID8A 2P9UB 2Q97A 3VOVA 2F9WA 1NGCA 4CZEA 4NO7A 5B8HA 4BRKA 4JAXA 1U2VB 2W41A 4EIAA 5EX5A 2P9LB 1NGEA 5JLHA 1IJJA 1QQMA 1RFQA 4K25A 3O80A 1MWKA 2E2PA 4FWLA 5AQYA 1BO5O 3VGKA 1NGFA 3LDNA 3UKUB 3B8AX 1ESVA 3A5LC 3IMXA 3VEWA 4YDUC 2W40A 4A61A 3VEYA 4CJ7A 5ELZA 3QBXA 5JICA 3CIPA 4DB3A 3GDQA 3FZKA 5CE3A 3CI5A 4FL9A 2E1ZA 1E4GT 1ATRA 1XQSC 5JLFA 4H0PA 3A8YA 1Z6RA 4PKIA 1LCUA 1T44A 2QM1A 2FSJA 3BEXA 5EOYA 5ADXA 1C0FA 3MK6A 2P9KB 4CZIA 3WXKA 1S3XA 1X3MA 3F9MA 2GTDA 2P9NB 4GNIA 3TPQA 3H3NO 4BQZA 3VGMA 2YI1A 3W0LA 4HTLA 5ADXH 2FF3B 3FGUA 4H03B 4XH5A 2YJFA 5TKYA 2P9SA 3A5NC 3MMVA 2A41A 2J4RA 4FWSA 1HUXA 4H0OA 2A42A 1C0GA 5E84A 3D2FA 4BR0A 4DHYA 3DXMB 1YVNA 4CBWA 4BG8A 3VEZA 4B1XB 1NMDA 5LY3A 3C7NB 2QWOA 1K8KB 5F2RA 3A5OC 4IJAA 2YCHA 4CBXA 3BP8A 3U8XA 4BC3A 4C23A 3ULEB 4A62A 2ZF5O 5BRFA 3H45C 1BDGA 3GL1A 1DGKN 3GBTA 3SMSA 4H0TB 1HJOA 1GLEG 3JS6A 5LJWA 3FZMA 1ATSA 2QWQA 2VWBA 3HI0A 3ZETA 3C0BA 5BN8A 3CJCA 4MO4A 3O08A 4MLHA 2GWJA 4IO8A 4CZJA 1H1VA 1GLLO 4FO0A 2ASMA 1NLVA 4BROA 5LJVA 4K43A 2Q31A 4JNEA 4BRQA 1TUUA 3LL3A 3ENOA 2EWSA 2GWKA 5EY4A 4BRLA 3IFRA 3W3DA 5AQFA 3WT0A 1TYQA 1QHAA 3VERA 5AZIB 3GG4A 4BRDA 5AZJA 1GLBG 3CERA 4FWRA 2CGLA 4EFHA 5AZIA 2YHYA 3GE1A 4DCHA 2GUPA 3FE1A 3G25A 5F1XA 4BC4A 4M63C 2HOEA 2WUSA 3J8AA 3CJBA 3VEOA 3MN9A 3LDOA 3O4WA 1NGIA 2D0OA 1G99A 1MA9B 4I6MB 1SZ2A 1X9JA 4PL8A 5AQWA 2E88A 2P9PB 4H5VA 4MLEA 4O8KA 3CQXA 3MCPA 1U6ZA 1BUPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1V4SA 2B5JA 3JXUA 4QS8A 2ASOA 4JN4A 4F3OA 2O8CB 3CQ8A 1KAYA 5FPMA 3OTOK 4LY7A 3VQAA 4BRMA 2D0BA 4EZ9A 4A2AA 4O5BA 4BACA 3P38A 4PKGA 4O55A 1VQ5N 3J7AP 3KK1A 4KI6A 3QEXA 1D5AA 4IJNA 1HPMA 3MDQA 4BGAA 4XH4A 3ZEUB 3EO3A 3IS9A 3M8QA 3VQ9A 2V52B 5CHIA 4CEDA 3D0PA 2OPSA 1HQUA 1J53A 4OVLA 4Y0WA 1LWEA 1SAZA 4B8AB 2PYLA 2IVNA 1NGHA 1HYVA 2F9TA 3CYMA 5BN9A 2NRHA 3MXIA 2F96A 4M3RA 4JK7A 4FJIA 3ENHA 1ZBUA 1U48A 3U3YA 3SAHA 1HRHA 4JKGA 3RMCA 4JKDA 3HM9A 3QNOA 3VF6A 2D0PA 2Z1JA 2BE2A 3DXMA 4JI8K 4DTPA 4DF4A 3O9TA 5CZ1A 4DR5K 5K14A 4MO5A 3E01A 4DFJA 4IDKA 4B1YB 3OYDA 1VQKN 1A5VA 1C1BA 1KFSA 4GKKK 3RSEB 4IZ9A 3CFPA 1BG3A 3THXA 3PIOL 4CJVA 3OYFA 2JLEA 5GIOA 5GAHP 1VQON 1S1UA 4F2SA 3VPZA 1OVQA 3MN6A 1ZXOA 3SAGA 1XI1A 5SWMA 4JYAK 4CGIA 4F8RA 3AO3A 5SZTA 1NGBA 4FJ5A 4CJFA 2RPIA 5AQLA 4F9OA 3T1YK 2E4LA 3AVIA 5EVZA 2DPNA 1M90O 3SBTA 3DLGA 5C12A 4C8KA 1YJ9N 1U47A 4B1WB 3RR7A 3S3MA 3UIQA 1RDCA 1HKGA 1GLJO 1LAWA 4FWPA 3ZSXA 5F0XA 3QERA 3DJCA 4I9LA 1KXPA 4B9NA 3CPEA 2O4GA 3FLCO 5AQJA 4BR2A 1XWLA 4AM7A 4WQ4C 4M7XA 5FPEA 3HL8A 4PQUA 1DEJA 4JI1K 3THWA 4MDAA 3ENBA 3T3FA 2IS3A 5AQVA 4O0JA 4KHWA 2HMPA 4FJ7A 4DSJA 1BOTO 5AQZA 2Q36A 3OYKA 4EZ6A 2QK9A 2Y1JA 3FR0A 4FW2A 2HHHK 1NKEA 2KW4A 4CEQA 3KLEA 3WXIA 1LWCA 4CEFA 1U49A 1VRTA 1HNWK 2ZM6K 2X6SA 3MN7A 3TANA 1NK0A 3VQPA 2Q1NA 2BANA 3CJ9A 4E1JA 3TAQA 1MWMA 1VHXA 4DG1A 3OJUA 2OA8A 4WQ5A 3CFOA 4BE2A 4HCCA 4OPKA 2ZJRL 5DM6L 3AA3A 3ID6A 3PO4A 1A5WA 2NLXA 3KTQA 3WQTA 5BR8K 2BH1A 3TTCA 3WNFA 4CEZA 4IEEA 2OANA 3CC4N 3KHYA 3HSTB 4G1QA 2KTQA 3ZX0A 4BRPA 2QW9A 1GOBA 1ASUA 2E8AA 2RE2A 5CR4A 4DV1K 4FM0A 4IOCL 4LFAK 3DMJA 5BPMA 3KIOA 4Z4GA 3VQ7A 3BUZB 4FOIA 1GOCA 1JCFA 2GUIA 1WSGA 2V7YA 2UUAK 4FVMA 2P9SB 4I9QA 4DTSA 4XEIA 4LFCK 5BRHA 1IV0A 4MQ3A 4CJLA 4EAHD 4FLTA 3AVBA 2PY5A 4CZLA 4HUGA 4N47A 1JLQA 2E2NA 4JI0K 2QKKA 3O9RA 3VF2A 1YTUA 3CC7N 2HW3A 4CFAA 4CHOA 1WOQA 1RT7A 3IUCA 5GADP 2G8WA 3AVFA 3K2PA 3ZETB 2ZGYA 1P90A 1Q8IA 4FPBA 4E1MA 3LWLA 2BGGA 4DSLA 2DTUA 3ZSRA 3EKSA 4NYFA 2VG5A 2HBJA 3L8BA 3S3OA 3DXKA 1TKDA 1N34K 4CIFA 2BTFA 2E20A 5AQNA 5AQTA 1C6VA 4A59A 3THYB 1J54A 4KFBA 3V9XA 3SQ0A 4GVEA 4B9TA 2UXDK 4BDYA 5AQPA 2E2OA 3D2EA 2NZTA 1TAUA 4CJKA 3QINA 2HBMA 4FK0A 2HF4A 3KLIA 3TWHA 3KLGA 4DU4A 1VQ7N 3V6DA 4ZTFA 3SMPA 1VQ4N 4M3TA 3QEPA 1N8RO 4ZHRA 4RW9A 4BRFA 3PY8A 2HHQA 3KKRA 2P5GA 4LSNA 1YITN 1HNZK 2HMIA 1U2VB 2W41A 5HLFA 5EX5A 3K0SA 4OLAA 1NOYA 4OPAA 4NCBA 1JJ2M 1QQMA 2Z1GA 2VWJA 1WSJA 1NGFA 1VSJA 4CJEA 3UKUB 3B8AX 1ESVA 4A61A 4CJ7A 1SKRA 5ELZA 1Q81O 5JICA 3CIPA 4DLGA 3CI5A 3VQEA 1W97L 4N76A 3T69A 2DY4A 3G10A 5GIPA 5JLFA 1QVGM 3A8YA 4DQIA 1LCUA 5C15A 5EOYA 5ADXA 1C0FA 4CERA 4YOWA 1X3MA 2UUBK 5MLCQ 2YI1A 4JI2K 5C24A 3J81O 4JKFA 4XH5A 3NAEA 1HUXA 4H0OA 1C0GA 4BR0A 2O8FA 3F73A 3VEZA 4B9MA 1FW6A 3TSQA 1CZBA 4X62K 1JLCA 4U67L 2YNHA 1RNHA 3E1YA 3A5OC 4IJAA 4BC3A 3ULEB 2ZF5O 4Y1DA 1HJOA 4RW4A 4H4MA 1IKVA 4F4KA 5LJWA 4DU3A 3FZMA 5FLXO 3C0BA 3SNNA 4MO4A 1S1VA 3LANA 3O08A 4MLHA 3NMUA 1NK6A 3CCRN 1H1VA 4FO0A 1NMNA 2ASMA 3OYLA 2Q31A 5C2DA 4JNEA 3LL3A 3DLBA 3ENOA 3OY9A 4LF6K 3MX5A 2X74A 4LFBK 1FKPA 4N56A 3IFRA 1KSPA 5AZJA 3GG4A 1Q9XA 4CGDA 3CC2N 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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