1WOQA

Crystal structure of inorganic polyphosphate/atp-glucomannokinase from arthrobacter sp. strain km at 1.8 a resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
253
structure length
253
Chain Sequence
NAPLIGIDIGGTGIKGGIVDLKKGKLLGERFRVPTPQPATPESVAEAVALVVAELSARPEAPAAGSPVGVTFPGIIQHGVVHSAANVDKSWLNTDIDALLTARLGRPVEVINDADAAGLAEARYGAGAGVKGTVLVITLGTGIGSAFIFDGKLVPNAELGHLEIDGHDAETKASAVARERDGLSWDEYSVLLQRYFSHVEFLFSPELFIVGGGISKRADEYLPNLRLRTPIVPAVLRNEAGIVGAAIEIALQH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Bacterial Inorganic Polyphosphate/ATP-glucomannokinase: INSIGHTS INTO KINASE EVOLUTION
pubmed doi rcsb
source organism Arthrobacter sp.
molecule tags Transferase
molecule keywords Inorganic polyphosphate/ATP-glucomannokinase
total genus 80
structure length 253
sequence length 253
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.63: Polyphosphate--glucose phosphotransferase.
pdb deposition date 2004-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1woqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1woqA01
4BR4A 4FWPA 1NGAA 4I6MB 5AZJA 1GLLO 4WQ4C 5EVZA 3H46O 1SZ2A 1TUYA 4M7YA 1XQSC 1HKBA 4H5TA 2E20A 2ZGZA 4FPBA 4K25A 2HMPA 3SK3A 4MLEA 4JN4A 4BRNA 4XEIA 3JXUA 3LM9A 2AA4A 4H0YB 3ZETB 4A62A 2IIRA 2ASMA 3WXKA 1T44A 1BO5O 4H5WA 4KBOA 3U9ZA 5BR9A 4JAXA 3GE1A 4AM7A 2E2QA 4BR5A 2QWMA 1X3MA 4B1UB 5BPNA 3IDHA 3EKUA 2AP1A 4CBUA 3AAPA 5EXWA 4B1ZA 4EFHA 2V7ZA 1NBWA 4BC3A 4BR7A 5B8HA 3VEOA 2P9PA 1GLJO 4Y0WA 3EN9A 1LOTB 3QICA 3QMLA 4CZLA 5ADXH 1BA0A 4MO5A 3AY9A 3LDQA 2GELA 4GY2B 1HJOA 1YAGA 4BRMA 5AQMA 3R8EA 2GEMA 4CZFA 3O6WA 2P9SB 2D0PA 4CI6A 1U2VA 4ISGA 3A5LC 4DHYA 1ZBSA 3CHWA 4XH4A 1GLBG 3CQYA 1V4SA 2P9IB 3H1QA 2Q1NA 1IJJA 2D0OA 2CGLA 3A5NC 4XH1A 5AZIA 2Q36A 2KHOA 5FPEA 3U8XA 3BP8A 1GLEG 4DB3A 3FE1A 2QWQA 5LY3A 4JD2B 3ULEA 4MLHA 3FFKB 5E26A 4PKGA 5BRHA 2Q97A 4BGBA 4B9QA 4FWMA 4BR0A 3QBXA 5BRFA 1OKJA 4WQ4A 4H0VB 5TKYA 3L4IA 2OANA 4BRCA 1Y64A 2FSJA 5AQJA 2P9UB 1KAXA 4HTLA 3M6GA 3TPQA 3VEYA 4CZGA 4BVOA 2FF6A 3WUHA 5JICA 3SJHA 5AR0A 1NWKA 4BC4A 1XUPO 3LDOA 1NGBA 4NB4A 1WUAA 3A5OC 1YUWA 4RWTA 2P9NA 1HLUA 5F2RA 1JCFA 3VEVA 1V4TA 4XH5A 1QZ5A 4CZIA 1XC3A 3CQXA 3ZEUB 4M7XA 3CJ1A 3L0QA 1NLVA 2E2NA 4FWOA 5AZIB 1JCEA 1NGCA 2ZF5O 3O4WA 3R9PA 1RFQA 2FSKA 3F9MA 4IXCA 4FOIA 2VYPA 5EOYA 3WEEA 4BRGA 3ULEB 1J6ZA 5BN9A 3ZX0A 3H45C 4A2AA 2GTDA 2I7PA 3TU5A 3VEZA 3FZKA 1ESVA 3G25A 3IFRA 3DXMA 4IJAA 1ATSA 5AQHA 3RSEB 4M63C 5BPMA 2BUPA 3LM2A 2IVNA 1NGIA 3D2EA 1NGJA 1ZXOA 4RCHA 1X3NA 4BROA 1TYQB 2EWSA 3UB5A 1IG8A 3UKUA 3ID8A 2QXLA 5AQTA 1TUUA 2CGKA 2D1KA 5AQRA 4H0TB 5AQVA 4I6MA 5AZJB 3ATVA 3LL3A 3W3DA 4IWVA 3WT0A 5F0XA 3CIPA 1E4GT 5JLHA 3JS6A 3KVGA 4B1YB 4EHUA 3FR0A 3MK6A 3O1WA 4H0PA 4IZ9A 3A8YA 1QQOA 2FLOA 1QQMA 3UKRB 4CZJA 3CJ7A 1EQYA 5AQZA 3H3OB 5AQUA 2V52B 3DJCA 2FF3B 4H5RA 1Z6RA 2NLXA 2PAVA 2YI1A 3WXJA 4F9OA 2QWPA 4AM6A 1Z05A 2YHWA 5AQLA 3IMXA 2ZWHA 3CJCA 3O8MA 4FL9A 5AQFA 3CETA 1C0FA 4O8KA 5FPDA 3FZMA 1JCGA 4YDUA 5KQ8A 2ASOA 3VETA 3GDQA 3WQUA 5CE3A 3H6EA 1NGGA 1X9JA 2E1YA 1ATRA 2WUSA 1BUPA 3WQTA 3UE5A 2E1ZA 4JHDA 4BR2A 3L6QA 3R6MA 4BRQA 3AARA 3O08A 3H3NO 3ZEUA 2NRHA 2HOEA 1NMDA 2E2PA 3GG4A 4RTFD 3ENHA 1QHAA 1NGEA 5BREA 2FXUA 4BQLA 4BG9A 2QWLA 1S3XA 3C0BA 3GBTA 4BRLA 4CZEA 2IVOA 1R59O 2QWOA 3CJBA 4H0XB 4K43A 1NGDA 4H03B 1GLFO 3VGMA 3I8BA 2E2OA 3DXKB 1BOTO 2BTFA 1KXPA 2P9KB 5LJWA 3DAWA 1G99A 5JMVA 2NZTA 4ISEA 2A3ZA 3KZBA 5EX5A 5KPZA 5FPMA 1E4FT 3CI5A 4A61A 3VERA 3C7NB 2IVPA 4QS7A 1HUXA 2ASPA 4LC9B 1U2VB 3UKUB 2W40A 5ADXA 5AQWA 4IO8A 3SLCA 3MN5A 1D4XA 4WQ5A 2P9IA 2F9TA 5BRDA 4WYBA 1MWKA 4BQZA 1KAYA 5AFUH 2H3GX 3MN6A 1BG3A 1CZAN 3VENA 1GLCG 3WXLA 1RDWX 2Q31A 4H0OA 5KPRA 5I9EB 5FPNA 1YXQA 4YDUC 5ELZA 2J4RA 4A2BA 3H1VX 2ZGYA 4CZKA 2GWJA 4FWLA 4NO7A 3ZX3A 4WQ5C 1SAZA 1WOQA 4BRFA 3P4IA 3M3ZA 3WEEB 2YJFA 3CJ9A 4BC2A 2A41A 3SMSA 3MCPA 3MMVA 4FOEA 5AQSA 2YHYA 4B1WB 3HI0A 2Q0RA 5BPLA 3D2FA 3HZ6A 3MDQA 2VWBA 1GLAG 3FZFA 4FSVA 1MA9B 3AAQA 5BN8A 3C7NA 4J8FA 3I33A 2E8AA 3DXMB 3ATUA 3EZWA 1HPMA 5AQOA 1ZC6A 5AQKA 3LDPA 1BA1A 3KHYA 4BGAA 3O80A 3VEWA 2QWNA 4H5VA 2P9NB 2V7YA 1U6ZA 3UKRA 3ENOA 4L3QA 1S22A 2QM1A 3O5BA 4MO4A 2GUPA 4BVPA 4BRIA 2YCHA 5KQDA 4CZHA 5AQPA 3VPZA 4JNEA 1QQNA 2CH5A 4CBXA 2HF4A 4DCHA 4QS8A 4BRHA 2DPNA 1DKGD 4EHTA 2Q0UA 4CZMA 5AQIA 4FPAA 1T6DA 3QB0A 5LJVA 2PBDA 4FWNA 4H5NA 4PKIA 5AQXA 4IJNA 4BR9A 4E1JA 5AFUA 3QBWA 1YVNA 4EAHD 1LCUA 2P9SA 1H1VA 4K42A 4PL7A 1RGIA 1HKGA 2A40A 2QWRA 3VGKA 4BRPA 4K41A 2A42A 2QW9A 1KAZA 1MWMA 3D2FB 2I7NA 3WXIA 3FGUA 4BRKA 3CJAA 3VF2A 2ITMA 1C0GA 1NGHA 3B8AX 3VOVA 3ZX2A 2UYTA 3BF3A 3FZLA 1DEJA 3U9DA 1BWFO 4C23A 2A5XA 3HSCA 4CD3A 3BF1A 2Q2RA 4QS9A 3GL1A 3VGLA 2P9LA 4JD2A 2YHXA 5KPTA 1DGKN 4CD1A 1SQKA 5E84A 3SMPA 1GLDG 3ZETA 1T6CA 3DXKA 4FWKA 3A0IX 3QFPA 2P9KA 3VF6A 5F1XA 4BREA 1HKCA 3MN9A 5AQGA 2D4WA 3QDKA 2YJEA 3D2EB 3VESA 2P9UA 2A6AA 3BEXA 3LDLA 3RSEA 1K8KA 4HWIA 3HTVA 3CERA 3EL2A 4CJ7A 3VEXA 3HBTA 4BC5A 4EIAA 2W41A 5AQNA 4PKHA 4O5FA 1P8ZA 3QFUA 1ATNA 2FSNA 3MN7A 4FWSA 3FZHA 2V51B 2CH6A 3W0LA 1BU6O 2VCPA 2CGJA 1Q18A 3HM8A 3OHRA 5AQYA 3J8AA 2GWKA 2F9WA 4FO0A 4JHDB 3D7EO 3GOIA 3U4LA 3M1FA 4B1XB 3EKSA 4FWRA 2P9LB 3VF4A 4ISFA 4BRAA 4DQ8A 4Z94A 4CBWA 1NM1A 3A5MC 5JLFA 5EY4A 4PL8A 4B1VA 1NGFA 1MDUB 3S41A 3DWLA 1QZ6A 2HF3A 3O1BA 2P9PB 3FLCO 3IUCA 2E88A 4FWQA 3EO3A 1HX1A 4GNIA 1BDGA 3BUZB 5AQQA 4BRDA 4BG8A 1K8KB 1TYQA 3LDNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3L2RA 4FK4A 1TUYA 3K2PA 1XQSC 1KLMA 3IS9A 2UU9K 1TVRA 1HKBA 4H5TA 2QI2A 2VG5A 2HMPA 3V9UA 2OYQA 3CCEN 4JN4A 3V6DA 2NRWA 2VQEK 3V1OA 2HVHA 4A62A 2IIRA 4CGFA 4NCBA 5KI6A 3WXKA 1T44A 4H5WA 3AVKA 3U9ZA 4W5TA 5BR9A 3P5JA 1X1PA 4JAXA 3SUPA 3GE1A 4E7KA 3O3HA 4CJEA 4B1UB 2AP1A 3AAPA 1VSDA 4CJRA 4B1ZA 3AO2A 3VEOA 4EP5A 2P9PA 4Y0WA 3O3GA 1HNWK 2GELA 4DSJA 4CJSA 4A5BA 2GEMA 4CZFA 3O6WA 1ZBSA 1GLBG 3BZCA 3QERA 4B9NA 3ZSQA 3HSTB 2Q1NA 1YJ9N 1IJJA 1OVYA 4PY5A 3OTOK 3DMJA 2KHOA 1CZ9A 3IG1A 3K57A 1GLEG 3O4QA 2QWQA 5LY3A 4MLHA 2O8BA 3NH0A 4PKGA 3ZSRA 5HP1A 2Q3SA 4LF5K 1B9DA 4KREA 4BR0A 1J5EK 1VQON 2ETJA 5BRFA 1OKJA 1S5JA 5TKYA 3L4IA 4DTPA 4U67L 5AQJA 3K0SA 5GAHP 4IOCL 2EX3A 1WN7A 3LAKA 3L2QA 2NUBA 4B9TA 4O44A 1LWCA 3NF7A 4NB4A 3BY5A 4YOVA 1IKVA 4RWTA 2F4VK 5GADP 3C6UA 3VEVA 3VN5A 3K5LA 5M1QA 3CQXA 2G8WA 2NRTA 3J7ZO 3DI6A 2HMIA 4JYAK 3O9SA 4M7XA 3CJ1A 3L0QA 5D3GA 2E2NA 5AZIB 3PSFA 3TSUA 1OVQA 3VQEA 1N5YA 5I42A 4LSNA 3R9PA 1RFQA 3AO1A 3OYEA 1TAQA 4YOTA 3WEEA 3T19A 2YX6A 4FW2A 3ZX0A 2ZD1A 4OPAA 2I7PA 2P5GA 1ZYQA 3LAMA 2DFEA 1ESVA 4W5NA 3DXMA 4LFAK 3CCSN 5FDLA 3LM2A 3PSIA 4HTUA 5HRRA 3S3MA 3AA4A 2IAJA 1ZXOA 1X3NA 1LAVA 3CFOA 3ID8A 3WNGA 3T1HK 2QXLA 1RBUA 3E66A 5AQTA 1TUUA 4R5PA 4JK8A 4JRQA 5AQRA 2OTJN 4H0TB 4H8KA 1YJWN 2FC0A 1SKRA 4IWVA 5CYQA 4ZTJA 2D0AA 2YNFA 3G4SN 1ZBIA 4R79A 3O1WA 4IZ9A 1IBLK 3KWIA 3OYLA 1QQMA 4JKAA 5AQZA 3I8DA 2OZMA 2FF3B 3NCIA 3SUOA 1WNSA 2PAVA 1FKPA 2YI1A 1BISA 5AQLA 3IMXA 3ZT0A 4FL9A 1K8AO 4ELUA 3WNEA 1JCGA 1KVAA 1VSMA 1IKWA 3TAPA 1A5XA 1NGGA 1X9JA 3L6QA 3R6MA 1DTQA 3SUQA 3H3NO 2E6MA 1ITGA 1NKEA 3DRRA 4N47A 2BANA 2Z1JA 3KD5E 1LWEA 5JVHL 3E9LA 3ENHA 4I9QA 2G8IA 1FXXA 2O8EA 1NGEA 4M3ZA 4B3OA 4CJTA 2F96A 4C8LA 1Q82O 4BRLA 1YTUA 3VQDA 4O0JA 4CIFA 5HLFA 4BACA 1RDAA 4O0IA 2KZMA 4OPKA 4K43A 4H0XB 4H03B 3I8BA 2DFFA 2E2OA 3DXKB 2G8HA 1BOTO 1KXPA 2VG7A 5GIOA 3I0SA 5C42A 4FM0A 1HYZA 2A3ZA 3L4QA 5EX5A 1E4FT 3IKMA 1E3MA 5LMUK 4QS7A 2IVPA 4GMJB 4A59A 1HUXA 4F3TA 3MX5A 3CC4N 3QINA 4CJLA 4IO8A 1U49A 1XC9A 2ATQA 2F9TA 4CEOA 3HVRA 4IFEA 1YITN 1K9MO 3AVFA 1ILYA 4GKJK 1BG3A 1VSIA 1WSEA 3VENA 1GLCG 1HR0K 5KPRA 1UWBA 1YXQA 4YDUC 1RNHA 3TANA 1NJWA 4CCHA 3OYNA 3OYIA 3QO9A 2G8VA 1S6QA 1TAUA 1SAZA 1KVCA 3M3ZA 4NCGA 3L3VA 3WEEB 3CJ9A 2WC9A 1HYVA 4JKDA 3G71N 3MMVA 4WFAL 4PA1A 3KKSA 4DWIA 5CZ2A 1VQ6N 4F8RA 3DRPA 4FYDA 4DV6K 1L3TA 3RR8A 4X62K 3AAQA 3CFRA 4CF8A 3TI0A 3LDPA 1BA1A 1RTHA 4KB0A 4ID5A 3O80A 1O1WA 3SAFA 1W97L 3HOSA 1HQEA 4BVPA 4CECA 4G9ZA 1VSKA 5GINA 1W2BM 1S9EA 5AQPA 4CBXA 4E7HA 3DLGA 3L2VA 1IKYA 4QS8A 4BRHA 3OS0A 1T6DA 2XHBA 3HYFA 4BWMA 5AQXA 5KRSA 1RT5A 4H4OA 3RMAA 4M3UA 1HKGA 4Z4FA 4JI7K 3VA0A 2QW9A 1KAZA 3D2FB 4ZHRA 1HNXK 4I9LA 2Z1HA 4DSLA 1C0GA 4DR6K 4GKKK 1NGHA 3BF3A 1VK0A 4ILHA 1BWFO 4JI0K 4C23A 2A5XA 2Y1JA 4HCBA 4CD3A 3V9WA 4BDPA 4LF4K 3CMAN 3VGLA 4CD1A 3ZETA 5SZTA 4IOAL 4M3WA 1VQ7N 1JLCA 3AO5A 3P1GA 4GV9A 2VGNA 3MN9A 3N4PA 1T3VA 1IG9A 3LWLA 3NAEA 4OX9K 3OYBA 2P9UA 3NMUA 1VQNN 2A6AA 3BEXA 1ZBFA 3ZT4A 5C10A 4HWIA 3HO1A 3S9HA 1X9MA 4CF0A 3EL2A 5JS1A 4C8MA 1RBTA 1L3VA 3ZT1A 3C94A 4CERA 4X66K 3BZKA 2W41A 5AQNA 1VQ9N 1JL2A 2WFBA 4O5FA 3NVKA 3QFUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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