3C65A

Crystal structure of bacillus stearothermophilus uvrc 5' endonuclease domain
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
160
structure length
152
Chain Sequence
GSHMLGERLGIPAPRRIEAFDNSNIYGADPVSALVVFLDGKPAKKEYRKYKVKTVAGPNDYETMREVVRRRYTRVLKEGLPLPDLIIIDGGKGHLSAVRDVLENELGLDVPLAGLSELLAGDPPDVVPLDRQSQEFYLLQRIQDEVHRFAVM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords UvrABC system protein C
publication title Crystal Structure of Bacillus stearothermophilus UvrC 5' endonuclease domain
rcsb
source organism Bacillus stearothermophilus
molecule tags Hydrolase
total genus 44
structure length 152
sequence length 160
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08459 UvrC_HhH_N UvrC Helix-hairpin-helix N-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.340 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3c65A00
3C65A 2NRTA 2NRWA 2NRZA 2NRXA 2NRRA 2NRVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KXPA 3VTIA 3RVCA 4DQPA 3OYAA 3H1VX 1XNQK 1QSSA 3AVMA 1HNXK 4F3TA 2QWMA 5KGWA 3PX0A 4FM1A 2X6NA 3ZT4A 5DMRA 4CHQA 3OYIA 3A5NC 1J9AA 4JLHA 3THYA 4LY7A 4CZLA 5AR0A 3AVKA 4YOTA 1T7PA 3KWIA 1SUQA 4CZJA 1DTTA 3F9MA 3VQ6A 3P39A 3F9KA 3KLFA 4FWMA 4B9NA 4GNIA 3E1YA 3LP3A 4A2BA 4FZYA 2GUPA 3CG7A 1U47A 1XUPO 3JS6A 3K5LA 3DXMB 4MO4A 1ZBLA 3HYFA 5CYQA 2A40A 1WOQA 1BA1A 4DUZK 3RTVA 2G8KA 4BR4A 4FJLA 4WQ5C 4BACA 1W7AA 2A1RA 2KW4A 2CH5A 3DLKA 2YKNA 5BPNA 3B6PA 3OHRA 1ZYQA 3VQ4A 4A61A 4DR6K 3MX5A 1GLLO 3VQ7A 1UA1A 3UE5A 2FF3B 4LF4K 3L2WA 5HL7L 4IO8A 3OJUA 3D2FA 3QBWA 3M3ZA 3GL1A 1GOBA 1QHTA 4Q0BA 2GWJA 3O9TA 3O3HA 3TARA 4ZTFA 3LZIA 4CK1A 4B3TK 4FLXA 3VESA 3C6UA 4CHZA 4ZTJA 5ADXH 4CHOA 1P90A 1BO5O 4BY9C 4DUYK 3BEXA 3MECA 4ILGB 4OLBA 2Z1IA 1C0MA 4CBXA 3KIOA 4JI3K 3E01A 4N56A 1WN7A 1U6ZA 1HPZA 4BDZA 1LCUA 2O4IA 4W5TA 4OGEA 2R7YA 2XY5A 2QKKA 3ZSXA 3NMUA 4O5BA 2NRTA 4BGAA 1VQNN 4OLAA 2V7ZA 5AQJA 4NLCA 3VGLA 5ADXA 5HRNA 1BU6O 4CHPA 1VSEA 1WSGA 4BDYA 1W0HA 4FJ7A 4FYDA 2KFZA 4DQRA 3BUZB 4I2PA 3MN5A 5MLCQ 3SQ2A 3THXA 4Z4HA 2ZGZA 1DLOA 4K43A 1M1KO 1YJWN 2W40A 1W2BM 4QS8A 4DTRA 3K9JA 4DTUA 4FWNA 2OPSA 4B08A 3H6EA 4IFEA 4B8AB 1JLCA 3ITHA 4KTZA 3CCSN 3R6MA 3HK2A 1RDDA 3V1RA 1VHXA 3OYFA 2PZSA 3O1BA 5C0YA 2PYLA 1C1AA 3DAWA 4CEBA 2BE2A 4JKCA 2W41A 1VQ5N 4CD1A 4JHDA 3VQEA 3D2EB 1S72N 1HJRA 2IOCA 2P9NA 3MXJA 4DV5K 1BL3A 2YHXA 4BVPA 4YHHK 3S41A 1X3MA 4BDPA 4H03B 3FZFA 2KHOA 2HNZA 3VPZA 2IGIA 4B1ZA 1JL2A 2V52B 3V6DA 5AQPA 1Q8IA 3SUNA 2P9SA 4FXDA 4XH5A 5LY3A 1Y64A 5HROA 5KPTA 3AARA 3O9UA 1T3VA 4M3UA 4WQ4A 5BN9A 1YITN 4JI5K 3CQYA 4A5BA 1QTMA 4JI8K 5AQWA 4M63C 4OPAA 5DM6L 1OH6A 1RT2A 4I7FA 3WQTA 4CERA 4DQSA 3O9RA 3TTFA 4CJLA 3FFKB 3MEEA 4YOVA 4CZFA 3WXKA 2O4GA 4FVMA 1ASWA 1UWBA 3SAFA 1HNIA 3VERA 5FPMA 2P9PB 4Z94A 2GV9A 2X6SA 2Y1IA 4CIFA 4PKIA 1U45A 1RNHA 4OKJA 3W0LA 5JS1A 1TAUA 1O13A 3F2KA 2XRIA 3V1OA 4FK2A 3LM9A 4CEDA 1ZBIA 4DTJA 4LF8K 4CJVA 3VQBA 3TWHA 3VA0A 1Q82O 4ISGA 2QWPA 1NGCA 3EO3A 4DB3A 2QWLA 1P8ZA 1UA0A 3MCAB 1N6QA 4BRQA 1CLQA 3SBGA 3ZSWA 3ENBA 4O8KA 4C8KA 1VQMN 1VSKA 3EZ5A 4FJGA 2OTJN 3I33A 2UUBK 3K57A 2V51B 5LJWA 1S6PA 1EWRA 2HBLA 3O8MA 4Z4CA 4K0KK 1GLDG 1NK0A 1Y97A 4CJKA 2O8CA 3OYGA 5J2MA 3VEXA 3VQAA 1HRHA 3O3FA 4JS5A 3SQ0A 3CC7N 1TAQA 1K9MO 4N5SA 3ASMA 5KRTA 3NF6A 3RSEB 1IG8A 3K9KA 3DLLL 2PYJA 1VRTA 3HJFA 1NK8A 4X66K 2HNDA 3MDQA 4JKGA 3IG1A 3QEVA 2VQFK 1QVGM 2KZZA 2FBVA 5AQMA 4NXNK 3LP2A 5FPDA 5EXWA 4MDAA 3SLCA 4G1QA 1SAZA 2XY6A 4CGFA 3QDKA 1TL1A 4KHNA 1S22A 1JLBA 3SUOA 4CF0A 3UKRB 1GOAA 4OKEA 3MWTA 4LH4A 2IVOA 1CZ9A 2FBTA 3HPHA 3I0RA 1KLNA 4BRPA 1WBDA 4W5QA 3ENHA 3LP0A 3K5NA 2ASOA 2UYTA 3G0ZA 3L3VA 4DR3K 2H3GX 4UY8O 1RDCA 1YF5L 4IFYA 4BR5A 4CI6A 1NJIO 3NGYA 5CE3A 1C1CA 1RTDA 1TKXA 2QWOA 4CJSA 3J81O 4HVJA 1Q9XA 3LL3A 1VQ7N 1VSHA 1HNZK 4FJIA 4CBWA 2X78A 1BQNA 3CJ7A 3V1QA 2HBJA 1NGAA 2O8FB 1QSYA 5FROA 3OW2M 1KRPA 3ULDA 3C6AA 4WFAL 3CJCA 3VF2A 4DU3A 1NK9A 4CJRA 3V9WA 4OPKA 4Z0UA 1VQ4N 3HL8A 3A0IX 2IIRA 3ULEB 2HVIA 4DSEA 4DMNA 1ATNA 2A3ZA 3ZSYA 4FJ9A 3KK7A 2NZTA 5IT9O 3CCEN 4JYAK 4C23A 5M1OA 3UKUA 5JS2A 4AF1A 4HWIA 2YKMA 4CZMA 1D5AA 2ETJA 1LW2A 3VEWA 4RW6A 3RWUA 2YNIA 1VK0A 4LF6K 3PUFA 3NBPA 1JJ2M 3OYJA 4BROA 1IH7A 4M41A 3R1XA 5J2PA 3MX2A 1WSFA 2E2NA 4GV3A 3QERA 5KI6A 1ASVA 3JXUA 3OY9A 1JLQA 2YHYA 4O0IA 2F9TA 3AVAA 1E4GT 1S9EA 3EL2A 4DLEA 4I6MA 3I0SA 4K25A 3V9ZA 1REVA 2PY5A 3CCJN 2JWLA 4AILC 4DQQA 3SV3A 3WXMB 4DG1A 3DI6A 1A5WA 5GINA 4W5RA 1XMOK 1GLFO 3TSUA 4ICLA 1ATRA 4FJMA 4BRLA 1L3VA 1W9HA 1K8KB 2ASPA 3AV9A 1V4TA 5K14A 1RCHA 4K8ZA 2GWKA 2UXDK 3G10A 1XQSC 3OYDA 4OX9K 2NRVA 3P4IA 3CI5A 4RG8A 3CJ9A 4JEPA 4B3MK 4FLTA 4H5WA 3IS9A 1WSJA 3THWA 4FOIA 1NK7A 2FLOA 3LWMA 1RDAA 3O5BA 4N47A 5FRNA 4RW7A 2VG6A 1NWKA 1BI4B 3HSCA 1ZC6A 5LMNK 4KTQA 4OPJA 2RHKA 3U6FA 3OJSA 3V9SA 5KGXA 2P9KA 2YX6A 4DKWA 1TK8A 4FM0A 3R9PA 3DLHA 2ZE2A 1S5JA 1HQEA 3MWPA 3SMSA 4FVUA 4CHNA 2YNGA 4H4OA 4KHUA 1C0GA 2CH6A 1RFQA 5AQFA 3NGZA 2UUCK 2HBMA 4M7XA 3ZCMA 1EETA 1FKOA 2P9UA 3VETA 4FPAA 2BDPA 4ZHRA 1KVBA 4EZ6A 1RBVA 5IWAK 5GAGP 4AM7A 4HCCA 3VEVA 2A1SA 5EX5A 3DOLA 2VYPA 4H0OA 3RR8A 2QW9A 4EIAA 2OZSA 3BF3A 1RILA 4BG8A 4DTOA 1HUXA 3SAHA 4X65K 4LSNA 4WF9L 3CYMA 1S1VA 1BISA 4O55A 3NVKA 4CZHA 1U2VB 5M1PA 5BN8A 2NRXA 3LDPA 2ZGYA 3IKMA 4CJTA 3P31A 2F8SA 2E4LA 1KC8O 2NUBA 4BR2A 5CZ2A 3OYCA 3N4QA 4AHSA 5LJVA 4Y1CA 4DR1K 3SYZA 3CETA 1BA0A 3G25A 4X64K 3HRGA 4RW8A 1JLGA 1S9GA 1HYVA 3ZT3A 4RW4A 3DXMA 1QQOA 4FWSA 1O1WA 3PSFA 1MA9B 2P9IA 4PL7A 3ZX2A 4X62K 4DLGA 3V9XA 4CBUA 3KVGA 3TAFA 1E3MA 4CGJA 3CCRN 3NVMA 3S3NA 4KTWA 3LPTA 4AHTA 3G6EN 3KKSA 2XY8A 1SKSA 4E1MA 4FJ5A 1ILYA 3DWLA 4XEIA 5JICA 3J80O 3HOSA 4JD2A 4C8MA 5I3UA 5AZJA 4M45A 1NK4A 5AQZA 1KFSA 3FZHA 3ZSRA 1S3XA 2IVNA 3H1QA 5JLHA 3OYLA 2QWQA 1X1PA 5T7BA 3OS0A 3HO1A 4JI4K 3OYBA 5M1KA 4MQ3A 3EE9A 1RT7A 3KWGA 3VF6A 2VWBA 2GBZA 4IFVA 2VWKA 2ITGA 2ZJQL 1BOTO 2HNYA 3QESA 2HHUA 2CGKA 3MXIA 1D9DA 4Y1DA 3J7YP 3VQQA 2KLAA 4CZEA 3A2FA 1YXQA 4NYFA 4LF9K 1BCOA 1U04A 4DFKA 3KD1E 4DS4A 3V9UA 4C8LA 3AY9A 3NGIA 2JGUA 3T3FA 2DPNA 2E2OA 2Q36A 1LWCA 2G8UA 3M8QA 1NMDA 2OZMA 2D0CA 3OBYA 3ZSVA 5M1FA 1HYSA 1LW0A 1JLAA 2ZF5O 5AQOA 4TSXA 4MO5A 4PQUA 1K8AO 3R8EA 4LF7K 4EAHD 3SZ2A 1TUYA 4CECA 4OJRA 3BZCA 3A5OC 3S9HA 4O5FA 2IS3A 3RMAA 2ZD1A 4NB4A 2ITMA 3QEWA 3CQ8A 3PY8A 4KB1A 4IOXA 4BVOA 5HRSA 2A6AA 4IOCL 3AVGA 5H1SQ 4JI2K 4DTMA 2F4VK 1NGHA 3MN9A 3GOIA 4H5VA 3THYB 4A59A 3KKRA 3TAQA 4I9LA 3WNHA 4MFBA 4LFCK 4FCYA 3D2EA 4U67L 4QOZB 1BIZA 3E9OA 3GE1A 1QSLA 4BRKA 5GAEP 2GTDA 1OH8A 1E4FT 1YVUA 4JKDA 4CCHA 4Z4FA 3CF5L 4M7YA 1YUWA 3ATUA 3A8YA 2ASMA 3OA9A 2BANA 2HF4A 3FR0A 2P9LB 1G15A 3KLEA 5BR8K 2OPPA 4PWDA 4IJAA 1WSIA 1U49A 4WFBL 1HNVA 3V81A 4UQGA 1N8RO 3ZT0A 2D0OA 3BP8A 3KHYA 2O8EA 5AFUH 3G4SN 1X9JA 2QEXN 1Z05A 5AQGA 3MAQA 3VA3A 3TAEA 3AVCA 3ISNC 3U9DA 3D2FB 1TKZA 4CJ5A 1T44A 1LWEA 3OYMA 4JN4A 3WNGA 1NK5A 3P38A 2P9PA 3C65A 4EHUA 4C8OA 1L3TA 5AFUA 1QE1A 1GLEG 3QEXA 4B9LA 4FWQA 3WNFA 4GVEA 1RBRA 1S1XA 4H0VB 4XH4A 3O3GA 2VWJA 3KK3A 2V7YA 1NKEA 3VGKA 4PA1A 3IFRA 3JAMO 1SKWA 4H4MA 5AQKA 3H3NO 4DCHA 1IBMK 4J2DA 3PSIA 3I8DA 4CZKA 3SUQA 2P5OA 4A57A 3CJBA 2RKIA 4CGHA 1RGIA 4BRDA 3C7NA 3HVRA 4E1JA 4IBNA 3DLBA 1N32K 4ISFA 3T69A 1FW6A 1VSDA 3VF4A 5AZIB 3ZT1A 3A5MC 5EU7A 4BC3A 4DR4K 4CEQA 1BIUA 2HHTA 2YV0X 3NH1A 4E7HA 3PX4A 4XIUA 2DFEA 4C1NK 3O4WA 1BUPA 2BTFA 3DRPA 3QMLA 2E6LA 3CCMN 3CIPA 2Q31A 3TI0A 1XC3A 3DXKA 3H46O 1H1VA 3IRXA 3AVHA 3CERA 3AAQA 4B9VA 3QETA 4IEIA 1I94K 1QZ6A 2QKBA 4FOEA 2F8TA 4CEZA 4DSLA 4WQ4C 1EKEA 3IUCA 1EWQA 3OS2A 2P9NB 1SL1A 1Q18A 5AQYA 2WFBA 4HHTA 3PLAA 2P1JA 1D4XA 3W3DA 3UKRA 3K58A 1EO1A 4JKAA 2HB5A 4AHVA 4B9QA 1S1UA 4B1VA 2QXFA 2CGLA 4ELTA 4RWTA 2DFHA 4DR2K 4DQIA 5D3GA 3J7ZO 3CFPA 4YOXA 4I9QA 2HF3A 3AGKA 3HSTB 5GAHP 1RT3A 5J2NA 5TKYA 4CJ4A 1IG9A 3PV8A 4JV5K 2QWRA 4CJWA 4NCBA 5J2QA 2HMIA 1TGOA 3Q7CA 2F7TA 4F3OA 2DFFA 4CFAA 3QEPA 3VQ5A 4JRQA 5EVZA 1RTJA 2D0BA 4M3YA 1VSLA 3HP9A 2OYQA 3HOTA 2Z1GA 2ZJRL 3M8RA 1ITGA 3DMJA 1GLBG 4FWOA 3KJVA 4JK7A 2G8IA 4E19A 3ULEA 5AQTA 3AO1A 5C12A 2RE2A 4KRFA 3NDKA 1WAFA 4AHCA 4R5PA 2JWKA 3D45A 3HBTA 4N41A 4E89A 3O1WA 4E0DA 1HKGA 2P51A 1MWMA 2FF6A 3EY1A 1HKCA 3AO4A 1VQLN 5CR4A 2Q0UA 3AVJA 4DR7K 4AM6A 3BF1A 3K2PA 3T19A 1ASUA 3S3OA 2E2QA 4IXCA 4CESA 2YHAA 2G8HA 3L2RA 1LOTB 5I9EB 2B4JA 2JLEA 1F21A 1LV5A 1KAYA 1NOZA 5F2RA 4BG9A 1Z6RA 2O8BB 4O4GA 3I8BA 4GV6A 5JMVA 3SI6A 3QICA 1HKBA 1KFDA 2O8CB 4NCAA 2HHHK 1S6QA 4FLYA 1KLMA 4KHPK 3L8BA 5AQXA 3WXJA 3C95A 5AQHA 4BWMA 4KH6A 4IWVA 2IAJA 3SAGA 3T1AA 4DU1A 4KPYA 3F73A 1K8KA 4KB0A 3WT0A 2NNWA 5FRMA 2W6KA 4JKGB 3VQCA 1WUAA 1CXUA 4CEEA 3QLHA 1A5VA 1S1TA 2E20A 2LSNA 2FSNA 1KAZA 2XY7A 3ZSZA 4Z4EA 4DSJA 1TUUA 2YJFA 2VGMA 1KVCA 4CF8A 3VGMA 4RCHA 5BRDA 2IC3A 4CIGA 5KPZA 1EXQA 1C0UA 3AVFA 3BGRA 3P83D 4KI6A 3TAMA 4B9TA 1RDUA 2ZQBA 4JKFA 2AA4A 2IDOA 4DR5K 4E7LA 3EEQA 3K5MA 1KSPA 4FM2A 1OKJA 1BWFO 1HX1A 3TR8A 3CC2N 1BHLA 4AHUA 3HM9A 3VQ8A 4IDHA 1VQPN 4FJ8A 3NHGA 1YTUA 3QIPA 1KAXA 4OPHA 4ELUA 2YNHA 1ZBUA 1FJGK 1J6ZA 1YJNN 3O4QA 2HSTA 2FC0A 4J2EA 1C0TA 4MLHA 1ESVA 1VSIA 1G99A 4E7IA 1RBTA 5FDLA 3C6HA 3MN7A 2D1KA 1B92A 4KHQA 4L8RB 4KV8A 1TYQA 3C6TA 4CW7B 1KTQA 1WB9A 1RT4A 5E26A 4KO0A 3NH2A 3VOVA 3UKUB 4LD0A 1T6CA 3AO5A 3WXLA 5FPEA 5KRSA 3EYZA 4B8CA 3LDSA 2ZJPL 1HQUA 3ZEUA 1QHAA 2XO7A 1WNSA 1QQCA 2QWNA 1HR0K 4CZIA 4J2BA 1VRUA 4IO9L 2A42A 2D0AA 4AQYK 2E6MA 2A5XA 1SKRA 4DFMA 3NFAA 3QEIA 3WEEA 4K42A 2HBKA 5AQNA 4WFNL 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3C65 A;  2NRT A;  2NRW A;  2NRZ A;  2NRX A;  2NRR A;  2NRV A; 
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 1KXP A;  3VTI A;  3RVC A;  4DQP A;  3OYA A;  3H1V X;  1XNQ K;  1QSS A;  3AVM A;  1HNX K;  4F3T A;  2QWM A;  5KGW A;  3PX0 A;  4FM1 A;  2X6N A;  3ZT4 A;  5DMR A;  4CHQ A;  3OYI A;  3A5N C;  1J9A A;  4JLH A;  3THY A;  4LY7 A;  4CZL A;  5AR0 A;  3AVK A;  4YOT A;  1T7P A;  3KWI A;  1SUQ A;  4CZJ A;  1DTT A;  3F9M A;  3VQ6 A;  3P39 A;  3F9K A;  3KLF A;  4FWM A;  4B9N A;  4GNI A;  3E1Y A;  3LP3 A;  4A2B A;  4FZY A;  2GUP A;  3CG7 A;  1U47 A;  1XUP O;  3JS6 A;  3K5L A;  3DXM B;  4MO4 A;  1ZBL A;  3HYF A;  5CYQ A;  2A40 A;  1WOQ A;  1BA1 A;  4DUZ K;  3RTV A;  2G8K A;  4BR4 A;  4FJL A;  4WQ5 C;  4BAC A;  1W7A A;  2A1R A;  2KW4 A;  2CH5 A;  3DLK A;  2YKN A;  5BPN A;  3B6P A;  3OHR A;  1ZYQ A;  3VQ4 A;  4A61 A;  4DR6 K;  3MX5 A;  1GLL O;  3VQ7 A;  1UA1 A;  3UE5 A;  2FF3 B;  4LF4 K;  3L2W A;  5HL7 L;  4IO8 A;  3OJU A;  3D2F A;  3QBW A;  3M3Z A;  3GL1 A;  1GOB A;  1QHT A;  4Q0B A;  2GWJ A;  3O9T A;  3O3H A;  3TAR A;  4ZTF A;  3LZI A;  4CK1 A;  4B3T K;  4FLX A;  3VES A;  3C6U A;  4CHZ A;  4ZTJ A;  5ADX H; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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