3CC7N

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation c2487u
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cc7N00
2ZJQL 1W2BM 1KD1O 2ZJRL 5JVHL 4UY8O 1ILYA 3CC2N 3CC7N 1M1KO 1YITN 4WCEL 3I56N 1VQNN 3CCJN 3CCQN 1VQKN 1KC8O 5HL7L 1YJWN 3CMAN 1QVGM 4WF9L 5H1SQ 4IO9L 5GAHP 4U67L 1YIJN 3DLLL 4WFBL 3CCLN 1VQLN 3CCEN 1VQ7N 3CCVN 1QVFM 3OW2M 1K9MO 1VQPN 4WFAL 1VQ6N 3J7ZO 3PIPL 1S72N 1Q7YO 1Q86O 1YHQN 1Q82O 5GAEP 5GAGP 2OTJN 5DM7L 1VQON 1YJNN 3G4SN 5JVGL 3G6EN 1K73O 3CC4N 1VQ4N 2QA4N 1VQ5N 5GADP 3CMEN 3CCSN 1VQMN 1K8AO 1YJ9N 1KQSM 1N8RO 1NJIO 3I55N 1M90O 3CPWM 3CXCM 4IOCL 3CCUN 4WFNL 3CCMN 2OTLN 1VQ9N 1VQ8N 5DM6L 4IOAL 3PIOL 3CD6N 3CCRN 2ZJPL 1JJ2M 1OVYA 2QEXN 1YI2N 3CF5L 1Q81O 5MLCQ 3G71N
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3G10A 1RDWX 3O3FA 3VQAA 4LH4A 1TK8A 2ZJRL 1NGGA 1RTHA 3IG1A 3C94A 4BRDA 4PWDA 2F8SA 4DTRA 3FLCO 3QETA 2OYQA 1IKVA 4AHCA 4DF4A 4FLUA 4E7IA 3QEXA 1VSMA 4KHPK 1NJWA 1NJYA 3U9ZA 4BRPA 4FK0A 4DR7K 4RW4A 3MX2A 3SYZA 3UKRB 2GELA 1KAXA 4XIUA 1OH7A 3ULEB 3O9TA 3SMSA 4CF1A 2E5LK 2O8EB 4CIFA 5C2DA 2E2PA 4BG9A 4KHQA 4FWNA 3I8DA 3DMJA 5CHIA 2NZTA 4OLAA 4FJGA 5LMNK 2YJFA 3AVIA 1RBSA 2HMPA 4X66K 3SZ2A 3QNNA 3VTHA 2OZSA 4W5RA 3DLRA 3C6AA 2QTDA 3V6DA 1ATNA 3BY5A 3G4SN 3RMAA 3L2VA 1NU0A 2VWKA 2O8CB 2QWLA 4DTSA 1NK4A 1QQOA 5CYMA 1RDDA 3F2KA 4RW6A 4DLGA 2HF3A 1GLJO 5SZTA 3HK2A 4H03B 4IOCL 5KGWA 4CJLA 2XY5A 3TSPA 4CZKA 2UYTA 2HHWA 1T05A 3FZMA 1S1UA 4DR4K 3RMBA 4CZLA 4GKJK 4CFDA 3OHRA 3AA4A 3NVMA 3LANA 3KLFA 3RMCA 3M5RA 1YI2N 2E4LA 1KTQA 3V9SA 4DTOA 2HOEA 3OS2A 3NGYA 2P9SB 3AVJA 1HJRA 3KK1A 2KKZA 3VGKA 2Q1NA 3OYAA 2QXFA 4KHWA 1D9FA 3R9PA 3V81A 1WAJA 3ENBA 3T1AA 4IDKA 4Y0WA 4BRGA 4CZHA 2NRZA 2A41A 2FBYA 4DQ8A 4YDUA 4KB1A 4KH6A 2GX9A 4Z4FA 3T3FA 4BR7A 4I2PA 2DFFA 3V9ZA 3VA0A 3MN5A 1LOTB 4OGEA 4NCBA 1WSHA 3T1YK 3RSEB 4CEZA 4CGJA 1IBMK 4IFEA 1YIJN 3OYCA 1NWKA 3KLGA 3TARA 4V19S 3L2QA 2EHGA 4O44A 1NGAA 3AVBA 4M63C 3EO3A 4IZ9A 4F9OA 2D4WA 3THYB 4DWIA 3W0LA 4Z94A 2P9NB 2X6NA 1NOZA 3M8PA 3P83D 4CJ4A 3KD1E 3L2UA 4PL8A 2IDOA 2VWBA 1VRTA 1S9GA 4I9LA 3RSEA 5AQWA 2QW9A 1XHZA 4CHNA 4DU3A 2NRRA 1YJNN 4FPBA 3PSIA 1TVRA 3SBTA 3MXJA 2E2QA 3GL1A 1HQUA 2UXDK 1HPZA 3R6MA 4HTLA 4KHUA 4F3OA 5AQYA 3THYA 5TKWA 1CZAN 2P9NA 1BWFO 3WNGA 4AF1A 1ZYQA 1C0UA 1JLCA 3C0BA 4BRNA 1JLEA 4PKHA 2P9KA 3ZT1A 4E0DA 4FZXC 1SL1A 4PQUA 4ZTJA 1P90A 2NRVA 2XY6A 2P9PB 3SK3A 4O5FA 4BRQA 5GIPA 2OTLN 2QWPA 4ICLA 1BDGA 1ZBLA 3AVMA 3OYEA 4FLYA 2WFBA 1VSJA 3MCPA 4JKFA 2ZWHA 4LF5K 1RBVA 1NBWA 2DFEA 4LC9B 3DXKB 5F0XA 1L3TA 3CJ9A 5CZ1A 1ATSA 4K8XA 1LW0A 1VSDA 4K0KK 2UUAK 3MMVA 5TKYA 4A59A 5MLCQ 5IWAK 2Q0UA 3OBWA 4FWSA 3OYHA 1CLQA 4CZFA 4IG3A 3R3LA 4HCBA 3MN6A 3EEQA 4UY8O 4O5BA 3OYLA 3O08A 4LH5A 3SQ4A 2F4VK 1MWMA 3LZJA 4IOXA 5HROA 4DQIA 3VQ9A 1XHXA 3LP2A 3LM2A 2HNYA 4IO9L 4BE1A 3PO5A 1B9DA 1TKXA 4KI4A 3QINA 3ZEUB 3B6OA 4ISFA 3K0SA 3AO2A 3O80A 1JKHA 2V52B 1VSEA 3ZSRA 1VQ6N 4EZ9A 3J7ZO 4DFMA 2QXLA 4JKGB 2YNFA 4B1UB 2AJQA 3RRHA 4EAHD 4NB4A 5BPLA 3HPHA 4RW9A 5GAGP 3ZEUA 2WTUA 1RDAA 2GTDA 4DR6K 1NGHA 3T19A 2A5XA 4PUOA 2KTQA 4H5RA 4AHTA 4FJ5A 2HVHA 2F9TA 3PY8A 1X3NA 3I33A 1TKTA 4NYFA 1ZC6A 4M3XA 1NK6A 1REVA 3D6RA 1NGJA 1J6ZA 3HL8A 2WBNA 4CGGA 2ZE2A 1X9SA 4DG1A 3G25A 4KTQA 2G8FA 4NCGA 3VGLA 1RT6A 2O8DB 3E66A 3N4QA 3SJHA 3NGZA 2YCHA 4DV6K 1QQMA 5EVZA 4CFCA 1X9MA 2ASOA 2HSTA 1ESVA 4FM2A 4H0VB 1WUAA 4O55A 3C6HA 3V9UA 4YOXA 2RKIA 1U2VA 3OA9A 3E01A 3WQTA 3TTFA 3NMUA 2IOCA 3A0IX 2E1YA 1D8YA 1BCMA 3OYJA 1NGFA 3OYFA 3NH2A 1HUXA 4CHPA 1TK0A 2UU9K 4A62A 3MN7A 1NMNA 5AQFA 1YITN 1YVUA 1TK5A 1DLOA 2E8AA 4BC5A 2QWQA 2P51A 1ASWA 1KC8O 3C65A 5AFUH 3TAGA 3SPYA 4HUFA 2FBVA 1XNQK 3A2FA 1RTJA 4F2RA 3AAQA 2Y1IA 1JL1A 3KWGA 4KH5A 4K8ZA 4OPAA 1DKGD 1RDCA 4L8RB 4B1YB 4JAXA 4HTUA 1HNVA 1S1XA 1VQPN 1ITGA 4KKOA 4B8AB 4FXDA 3EYZA 4LF6K 3PIPL 3I0SA 2A42A 4RCHA 2YHYA 2ITGA 3HBTA 4MO5A 5C0YA 3K57A 4JI0K 1Q82O 3L3UA 1B92A 1ZBHA 1OVQA 4W5OA 2NRXA 3SNNA 1EWQA 3KTQA 3LDQA 1N34K 3CC4N 4DQSA 4E1MA 1NKEA 4YFUA 2HHSA 3VEXA 4DTJA 3HOTA 1XQSC 1S9EA 4K43A 2FSNA 1NKBA 5HP1A 5AQJA 3V1RA 2IVNA 4LF9K 3MWPA 4RW8A 3D0PA 2YHBA 3MEGA 1BA0A 3CCUN 3KKRA 4CJ5A 4DFKA 3SUQA 2UUBK 3BF3A 1RT7A 1J54A 4Z0UA 3QEPA 5LL6Z 1YAGA 2XRIA 5AZJB 1XWLA 4CJWA 4FWMA 4YHHK 4Z4IA 2Z1JA 1S22A 3WQUA 4BG8A 3TSUA 5AQIA 3THXB 4CJTA 4BE0A 3ENOA 4QOZB 3KD5E 2P9LB 4QS7A 4O8UA 2ZJQL 4E1JA 4KHNA 3CFPA 1GLFO 2BDPA 3NF8A 2FSKA 1BA1A 4DR2K 4OKJA 5KTQA 3RR8A 2KFNA 4WCEL 5AZJA 3WXLA 3CCJN 4HVJA 4IFYA 2VQFK 4BROA 4AHSA 4A57A 5BPMA 2QWRA 3TPQA 2F9WA 3ZSWA 4J2AA 4DSIA 2HB5A 3ZT4A 1HKBA 3DOKA 3ZYYX 4BR2A 4DUZK 4FVMA 2BE2A 3L4IA 3C95A 2Q0RA 3EKUA 3ATUA 1UOCA 4IO8A 1TKZA 1Q7YO 5AQVA 5BR9A 3TR8A 3WUHA 5LJVA 4O8KA 3TSQA 4W5TA 1HNXK 1JLFA 4CF8A 1C0FA 4JD2A 3TWHA 1C0TA 1QTMA 3L4QA 3OY9A 2QA4N 2FLOA 1JLGA 4JI5K 3QB0A 2UXCK 1HNIA 3CCSN 1VQMN 1Y97A 3D2EB 4OKKA 3M3ZA 3ITHA 2G8VA 1T3VA 4I6MA 3CXCM 5J2NA 2KZZA 3QDKA 3CYMA 3TAMA 1NK0A 1EWRA 1SS6A 4KFBA 2R7YA 4JRQA 1VQ9N 1B9FA 4DR5K 3GOIA 5JLFA 4W5NA 3VQ6A 4CFAA 3HM8A 3NF6A 4ILGB 2Z1HA 2BTFA 5ADXH 4EHTA 3PIOL 5AQGA 4DQQA 5AZIB 1ZBFA 4XEIA 1UA1A 4LD0A 5LY3A 3VERA 4B9VA 4CHOA 3BUZB 4EIAA 1RNHA 2DFHA 3D2EA 4FJIA 4KHYA 3ZX0A 1VRUA 4DF8A 1SQKA 4JKDA 4B1VA 1V4TA 3LM9A 3QICA 1WSIA 1XC3A 4FK4A 1KD1O 3O4NA 4Q5VA 1FK9A 1EETA 2QWMA 3H3OB 1I94K 2RE2A 3JXUA 4BRHA 3SQ0A 5JICA 5LJWA 2ZF5O 5AZIA 3EZ5A 1RT3A 1OH5A 4B3MK 1GLDG 5AQNA 4BR5A 3WNFA 1QSYA 2VGMA 2W6KA 5M1QA 3VTIA 1HYZA 3GDQA 4JHDB 4M3UA 4JNEA 1RCHA 1TKDA 3BZCA 4HCCA 4CJUA 1S1TA 2PYLA 4WQ4A 2HHXA 1JLAA 4C1NK 4JI8K 3HXMA 1QZ6A 4FJHA 1D5AA 4LF4K 3SV3A 3TI0A 2F8TA 4B8CA 4CESA 1QHTA 4BRCA 1VSHA 4W5QA 1A5WA 4BDYA 4ID5A 4BY9C 1E4GT 4PA1A 3HYFA 4OPKA 5JMVA 3CMEN 2Z1IA 5BN9A 3DXMB 4KI6A 4CJ7A 4F3TA 5F2RA 1YJ9N 4X62K 4PY5A 4BRKA 1N8RO 2ZM6K 1GOAA 5FPEA 4H0TB 3PX0A 1LAVA 3CCMN 4GY2B 3VF4A 1QHAA 2WOMA 3UKRA 3QIOA 5AQSA 4CECA 3A5LC 3OYMA 4WE1A 1NNEA 3ULEA 1N33K 4IOAL 2O8EA 4FW2A 1Q9XA 3OTOK 1T6DA 2ETJA 3NVKA 3DXMA 5I42A 3ZSYA 4DSJA 2I7NA 2XY7A 1GLEG 4IJAA 4DU4A 3AGRA 3DLKA 5CR4A 5ADXA 4B9UA 2AP1A 3MX5A 3SUNA 3SV4A 3CJAA 1HLUA 3AVKA 3GE1A 4CIGA 3AVNA 3H1VX 4DTNA 4YORA 1ILYA 2O8CA 4DTUA 1KVAA 3OS0A 1U49A 2G8IA 3DRSA 2W40A 5BRDA 3O8MA 4CCHA 1SKRA 4FLTA 4ISEA 5AQKA 4C8OA 1LAWA 1K8KB 3CM5A 4IEIA 3GG4A 5KRTA 5JLHA 4Y1DA 4FJ9A 3DLLL 4DQRA 3J7AP 4B9MA 1MA9B 1VQLN 4CBWA 4C8LA 5AQHA 3VESA 3HSCA 2GUPA 4O0IA 4E7KA 5IT9O 5C42A 3MXIA 4MLHA 3W3DA 4CZIA 3VEZA 4MQ3A 3VEYA 5M1PA 1NKCA 4DSEA 4MFBA 2P5GA 2P9UB 2BH1A 3AA2A 4XH1A 3TAPA 2O8FB 4JYAK 1V4SA 3SUOA 4JK8A 2I7PA 1K8KA 3CQ8A 2P9SA 1JCFA 3F5TA 4DU1A 1QSSA 4M42A 3M8SA 3VQCA 3H08A 3M1FA 3KJVA 3SAHA 3KZBA 3LP3A 1C0GA 3ZSVA 2IGIA 4M3ZA 1YVNA 3WT0A 3V9WA 3F73A 2ATQA 4M3WA 2J4RA 1IKWA 3AVFA 2P9UA 4C1NI 1N6QA 4KH4A 1VAZA 2O8FA 3CPWM 4IKFA 2IS3A 2HBKA 4QCLA 4J2BA 4FWOA 2NLXA 3NE6A 4F8RA 4NXMK 3DRRA 1A5XA 1OKJA 4DR3K 4F2SA 2CGJA 3QESA 5FPMA 1MWKA 4KB0A 1LW2A 1IKYA 4GKKK 2RF2A 4CZEA 2W41A 1ATRA 4BR9A 4OX9K 1TGOA 4YDUC 3G71N 5FRMA 3VQ5A 1W2BM 3PUFA 3U4LA 1BHLA 4CJ3A 2FXUA 3V4IA 4E1NA 4B08A 3TANA 4AQYK 4M7YA 1DTTA 1UA0A 4FK2A 3V1QA 3DWLA 3OYDA 1RT1A 5HL7L 1NGIA 2HHQA 1KAYA 2E2NA 2KZMA 1GLCG 2QWOA 4OGCA 4AHRA 2QWNA 4WYBA 4BDZA 1KRPA 3SMPA 2KFZA 2V51B 2P9PA 2E6MA 4DV2K 5SWMA 1W0HA 3L8BA 1NK9A 2HHTA 3IMXA 4FWRA 4DSKA 4Q0BA 3ZX2A 3OW2M 2OPQA 4B9LA 2Q31A 4BRIA 3IKMA 1KVCA 4WQ5A 3SI6A 3DXKA 2VCPA 4CJEA 1BIUA 3ASMA 3BGRA 2LSNA 1ZXOA 3CERA 1CZ9A 2XY8A 5GAEP 2V7ZA 2OTJN 5DM7L 1VQON 3HPGA 3KKSA 1XUPO 4LSNA 2BGGA 4KO0A 4KRFA 3ZETB 4KV8A 1VQ4N 3J81O 4I2QA 3V9XA 1LWFA 1K6YA 4QS8A 4BWJA 3CG7A 1RBTA 4YY3K 3BF1A 4DV0K 4YOUA 2O8BB 2HW3A 1SV5A 2O4GA 4M41A 4CERA 4DCHA 3SJJA 1T8EA 4BREA 3FFIA 3QFPA 4CIEA 3JSMA 1R59O 2ZJPL 4NYNA 3QEIA 4CI6A 4JKGA 3WXIA 3LWMA 3EKSA 1L3UA 3TTDA 1WSJA 3MCAB 3NHGA 3QERA 3KLIA 4EZ6A 4M45A 1GOBA 4CZJA 4I9QA 1T7PA 3QBWA 3VQ7A 3VQ4A 4X65K 1HNWK 3DM2A 4H0YB 1QE1A 5BPNA 3QIPA 2E2OA 1C1CA 4GV6A 3HRGA 3L2WA 5KRSA 1X3MA 3KK2A 2PYJA 3T1HK 3ULDA 3U3GA 2YNHA 3HPOA 1L5UA 3P4IA 2YNIA 3FZFA 3G0ZA 3LWLA 4U67L 1SL2A 1DTQA 2O8DA 4JKAA 2KQ2A 1IV0A 5LMUK 3ZSOA 3LDLA 4CF2A 4DV5K 3VMFB 3HT3A 1JXEA 4CF0A 2HBMA 4E19A 4Z4HA 5CE3A 2JLEA 4DTXA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2ZJQ L;  1W2B M;  1KD1 O;  2ZJR L;  5JVH L;  4UY8 O;  1ILY A;  3CC2 N;  3CC7 N;  1M1K O;  1YIT N;  4WCE L;  3I56 N;  1VQN N;  3CCJ N;  3CCQ N;  1VQK N;  1KC8 O;  5HL7 L;  1YJW N;  3CMA N;  1QVG M;  4WF9 L;  5H1S Q;  4IO9 L;  5GAH P;  4U67 L;  1YIJ N;  3DLL L;  4WFB L;  3CCL N;  1VQL N;  3CCE N;  1VQ7 N;  3CCV N;  1QVF M;  3OW2 M;  1K9M O;  1VQP N;  4WFA L;  1VQ6 N;  3J7Z O;  3PIP L;  1S72 N;  1Q7Y O;  1Q86 O;  1YHQ N;  1Q82 O;  5GAE P;  5GAG P;  2OTJ N;  5DM7 L;  1VQO N;  1YJN N;  3G4S N;  5JVG L;  3G6E N;  1K73 O;  3CC4 N;  1VQ4 N;  2QA4 N;  1VQ5 N;  5GAD P;  3CME N;  3CCS N;  1VQM N;  1K8A O;  1YJ9 N;  1KQS M;  1N8R O;  1NJI O;  3I55 N;  1M90 O;  3CPW M;  3CXC M;  4IOC L;  3CCU N;  4WFN L;  3CCM N;  2OTL N;  1VQ9 N;  1VQ8 N;  5DM6 L;  4IOA L;  3PIO L;  3CD6 N;  3CCR N;  2ZJP L;  1JJ2 M;  1OVY A;  2QEX N;  1YI2 N;  3CF5 L;  1Q81 O;  5MLC Q;  3G71 N; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3G10 A;  1RDW X;  3O3F A;  3VQA A;  4LH4 A;  1TK8 A;  2ZJR L;  1NGG A;  1RTH A;  3IG1 A;  3C94 A;  4BRD A;  4PWD A;  2F8S A;  4DTR A;  3FLC O;  3QET A;  2OYQ A;  1IKV A;  4AHC A;  4DF4 A;  4FLU A;  4E7I A;  3QEX A;  1VSM A;  4KHP K;  1NJW A;  1NJY A;  3U9Z A;  4BRP A;  4FK0 A;  4DR7 K;  4RW4 A;  3MX2 A;  3SYZ A;  3UKR B;  2GEL A;  1KAX A;  4XIU A;  1OH7 A;  3ULE B;  3O9T A;  3SMS A;  4CF1 A;  2E5L K;  2O8E B;  4CIF A;  5C2D A;  2E2P A;  4BG9 A;  4KHQ A;  4FWN A;  3I8D A;  3DMJ A;  5CHI A;  2NZT A;  4OLA A;  4FJG A;  5LMN K;  2YJF A;  3AVI A;  1RBS A;  2HMP A;  4X66 K;  3SZ2 A;  3QNN A;  3VTH A;  2OZS A;  4W5R A;  3DLR A;  3C6A A;  2QTD A;  3V6D A;  1ATN A;  3BY5 A;  3G4S N;  3RMA A;  3L2V A;  1NU0 A;  2VWK A;  2O8C B;  2QWL A;  4DTS A;  1NK4 A;  1QQO A;  5CYM A;  1RDD A;  3F2K A;  4RW6 A;  4DLG A;  2HF3 A;  1GLJ O;  5SZT A;  3HK2 A;  4H03 B;  4IOC L;  5KGW A;  4CJL A;  2XY5 A;  3TSP A;  4CZK A;  2UYT A;  2HHW A;  1T05 A;  3FZM A;  1S1U A;  4DR4 K;  3RMB A;  4CZL A;  4GKJ K;  4CFD A;  3OHR A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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