3CC7N

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation c2487u
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cc7N00
3PIOL 3CCMN 1VQ8N 1VQMN 5MLCQ 1VQLN 5GAGP 1JJ2M 3CMAN 1NJIO 1M90O 1YITN 1VQPN 1M1KO 1Q7YO 1YIJN 3CD6N 1YHQN 1K9MO 1QVGM 3DLLL 3G4SN 1KQSM 5JVHL 1VQ5N 3CCLN 1VQKN 5H1SQ 3CCRN 1KD1O 4UY8O 3CF5L 1VQ9N 5HL7L 1N8RO 3PIPL 5DM7L 2ZJQL 2OTJN 3CCJN 1Q82O 4WFBL 2QEXN 3CCEN 1OVYA 1VQNN 3G6EN 3CCQN 1S72N 4IOAL 1KC8O 4WF9L 1VQON 5GAEP 3CXCM 1YI2N 3CC2N 2QA4N 1VQ6N 5GAHP 1K8AO 3CC7N 1VQ7N 3I55N 3CCVN 5JVGL 2ZJRL 3CCUN 1Q86O 2OTLN 3I56N 5DM6L 4WFAL 1K73O 4WFNL 3CMEN 4IO9L 1YJNN 3OW2M 1YJWN 1QVFM 4IOCL 3CPWM 1W2BM 4U67L 3G71N 2ZJPL 4WCEL 3J7ZO 1ILYA 5GADP 1VQ4N 3CC4N 1Q81O 3CCSN 1YJ9N
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3P38A 2O4GA 4BDZA 4DTMA 1YVUA 3QNNA 3ATUA 4WQ5A 3T1AA 3VA3A 3LP0A 1FKOA 1TKZA 3VQBA 3V9SA 1FJGK 3QEIA 4CJEA 2RHKA 3K2PA 1K9MO 4FW1A 3MCPA 5M1NA 1WSFA 4IDKA 4YOUA 5J2MA 3WXLA 4DTPA 1HX1A 4JI8K 3KD5E 2ITGA 3DXKA 4IWVA 4FJNA 3HTVA 4M3TA 5HL7L 4LFCK 4OO1J 3AA2A 2HOEA 1N34K 3RMDA 4GVMA 3E66A 5KRTA 4DFPA 3I0SA 3SCXA 3QEPA 4BR0A 1BCMA 4M3XA 3B8AX 3M8PA 4B8CA 1IBMK 3LDPA 2OPQA 5BPNA 2QWRA 5C12A 1XHZA 3LAMA 2HHWA 2JWKA 1ZBFA 4Y1DA 1CZBA 4X64K 3NVMA 3AVBA 3A5NC 5BR8K 4IKFA 3AGKA 1K8KA 3EKSA 4FW2A 4ISGA 5GIPA 1LWFA 2KQ2A 4DLGA 3SV4A 1G15A 4B9NA 3EKUA 5K14A 3VEZA 3I0RA 3EN9A 3OW2M 4W5QA 3NF6A 1NK0A 4LC9B 3H1VX 5HP1A 3MEDA 2UU9K 1XUPO 1QZ6A 2E88A 4FZXC 2V51B 3L8BA 2HF4A 3OS2A 1BG3A 1EKEA 2IGIA 3O08A 1EX4A 2NNWA 3K5OA 4B9TA 4FM0A 4W5TA 4PY5A 3QEVA 1BIZA 1W7AA 1O1WA 4KV8A 4DKWA 1U45A 4AM6A 3CJ1A 3N4PA 1CLQA 4CCHA 1QHTA 1KCFA 1Z6RA 4IEEA 3S9HA 4B08A 1U6ZA 4KHNA 3O9QA 3RSEB 3RMAA 3OTOK 5MLCQ 2P9UB 2QWLA 4G9ZA 3L2WA 4E89A 3AVGA 1JJ2M 3PSIA 2KLAA 3TAQA 4KAZA 2HHVA 4H0XB 2P9IA 3OYKA 4JS4A 4K8ZA 5J1EA 4CBWA 5JS1A 1L3UA 4CZGA 4BC4A 1NWKA 1L3SA 1UWBA 4BACA 3CD6N 4CF0A 2NLXA 4DQIA 4A2BA 4JKFA 5M1FA 3OJUA 1BOTO 4FJJA 1NNEA 1RILA 4K42A 4E7IA 3ZETB 2WUSA 4CJ4A 1JLAA 5CYQA 4CGFA 3PY8A 2ZF5O 3VF2A 4JKAA 1BUPA 2ASMA 2P9LA 3CQYA 5LJVA 5FPEA 3KK3A 1TAUA 4Q5VA 3QETA 4X66K 2Z1JA 1KSPA 1Q82O 3VMFB 4DSIA 3T69A 4KHQA 3O9UA 3TR8A 4G1QA 3MEEA 4A5BA 1ZYQA 1BHLA 1RDAA 4Z4GA 1KAZA 1SKSA 2HHUA 4QAGA 2DPNA 4PUOA 1EWRA 4DQQA 4BE0A 2YKNA 2FBXA 4YOTA 4QS7A 5BREA 4DHYA 3KWIA 3ITHA 4EAHD 4CE9A 3ZT0A 1HNXK 1DKGD 4FSVA 4DF4A 1Z05A 4JNEA 4OPAA 2UUBK 1KVAA 4B1UB 4YDUC 4CHYA 1P8ZA 1S6PA 5JS2A 3MCAB 2G8VA 2P5GA 1NBWA 2ZWHA 4H5NA 1NGCA 4CGJA 3O3HA 4OGEA 3GE1A 4FLVA 2LSNA 1A5XA 3DLRA 2HBMA 4JV5K 4U7BA 2P9NA 5BRFA 4AHCA 4CZEA 5HLFA 4NYFA 3MECA 4JLHA 5KPTA 3HJFA 2P9KB 4IZ9A 4QCLA 2G8UA 4K25A 3SUPA 4GNIA 1M90O 4CJ5A 1OH5A 1YITN 3T19A 3T3FA 5IWAK 5I42A 3DWLA 3EEQA 1HKGA 3KZBA 3BY5A 1K8KB 4EP5A 4B3TK 4AILC 5BN8A 4GKJK 3VA0A 2VG6A 1JCGA 3BP8A 3PX6A 4J2BA 4H0VB 2YHAA 2BE2A 2NZTA 3DOLA 3ZYYX 5E84A 4ELUA 5AQSA 1WNSA 4FM1A 1BI4B 3BGRA 4XH1A 3HM8A 1NJXA 5CR4A 1YJ9N 3QFPA 3OYAA 4WFBL 4KB0A 1XNQK 1GLCG 2FF3B 5DK5A 1GLAG 4XH4A 3D2EB 1VSMA 3CFOA 4I2PA 5C2DA 1YI2N 3VTHA 1LW0A 2HF3A 3RR7A 4BRQA 1GLJO 4KH4A 4OVLA 1QQMA 3K58A 1WLJA 4F2SA 3C7NA 4PL8A 1JLEA 4Y0WA 3HPOA 3OYJA 3LP1A 1WAFA 5AQHA 5HRRA 1ATSA 3MWPA 4H8KA 4IJAA 1E4FT 4AHTA 4BRDA 2A6AA 1BL3A 2YI1A 3CYMA 3J7ZO 3DRPA 4B3MK 3VN5A 3HSCA 2I5JA 1X9MA 4LFBK 4BC5A 2JLEA 4JRQA 5AQQA 3LZJA 1O13A 4CECA 1NMDA 4HCCA 1TAQA 3SPZA 4CF1A 3SAHA 1DGKN 2FBVA 2GWJA 4A5AA 2P9LB 1LWEA 4ICLA 1SQKA 3PIOL 3CJBA 1UA1A 2ZD1A 3O9RA 4MO5A 5HBMA 4IG3A 4I6MB 3WNEA 2FF6A 4I7FA 4DR4K 1FK9A 1YAGA 4CHOA 3V1OA 2G8HA 3SAFA 3DLHA 4CERA 1ZXOA 3WEEA 5FRNA 4JKCA 3GL1A 1FW6A 2WFBA 2AJQA 2UYTA 5AZJB 2QXFA 1SKRA 3IS9A 4ID1A 3TU5A 4NCAA 1RDWX 3HOSA 3QICA 4H5RA 3CJAA 3K9KA 5SZTA 4J2AA 4IBNA 1LWCA 3NFAA 3CJCA 2QWQA 4CVNE 3W0LA 2NRTA 3M5RA 2YHYA 3UKRA 3QO9A 1GLFO 2O4IA 5BN9A 3NMUA 4BQLA 3EZ5A 3LPTA 5F1XA 3IFRA 3LWLA 1J54A 2ZE2A 4IFYA 5SWMA 1U47A 5GAEP 3OYMA 2P9NB 3AVFA 4BRNA 3D45A 5AFUH 4BG9A 1GOAA 2AA4A 1KAYA 4B1WB 4Z4EA 5F2RA 1T6CA 4N76A 3OYEA 3VQ5A 3DAWA 1HLUA 5HRNA 3CIPA 4FLUA 2HVIA 5T7BA 2PY5A 1S3XA 1C0UA 1T6DA 5A2QO 1WUAA 3VQ4A 4OKEA 4H0PA 5JLHA 3LL3A 5EXWA 2E2OA 1ILYA 4CJVA 3SPYA 4JI1K 3S3MA 4CJSA 1MWMA 3B6OA 4IDHA 4BVPA 1TV6A 3DLKA 1V4TA 3EE9A 1K6YA 2V7ZA 4NLBA 3DLBA 3MXIA 2E2QA 2W42A 4CF9A 4A57A 3DJCA 1RTIA 4H5WA 3KKRA 1C1CA 3O80A 1VK0A 3L3VA 3O3FA 3PX4A 3PO4A 1KLMA 3WT0A 4B1XB 2G8KA 5BPMA 1EO1A 3NF9A 4CJ7A 3FFIA 1Q9YA 4FJ9A 1Y97A 4FZZA 1U04A 1Q18A 1X9JA 4CD1A 4MLEA 4JRPA 1SS6A 4CGIA 2WONA 1QVGM 3D7EO 2FBYA 3O4NA 4JI7K 2O8DB 1YF5L 4YFUA 3H08A 4RG8A 4UY8O 2W40A 3IRXA 3AO3A 1GLLO 3P4IA 4DLEA 1MA9B 3GOIA 2QW9A 2VQEK 4M63C 4E7LA 4NLCA 3AVKA 4DU3A 1NGIA 3CCJN 4C8KA 4GV3A 3BUZB 1NGFA 4J2EA 4B9UA 5AQIA 3IUCA 3G6EN 3LDLA 3JXUA 3LDNA 3U3YA 1NMNA 5J2NA 3D2FB 3MX5A 3KWGA 3VQ7A 4DR5K 2UUCK 1CXUA 3CXCM 4CBXA 2DFHA 2VYPA 3SJHA 5JVGL 3F5TA 3FZMA 2VQFK 3SNNA 3LDOA 3LDSA 5AR0A 4K0KK 4GV6A 3CQ8A 3ID6A 3RSEA 4BRMA 3OJSA 3I8BA 3DMJA 3L2UA 4BG8A 4CJRA 1YJWN 1LW2A 1ESVA 4JHDB 4GY2B 4Z4CA 2J4RA 3OYFA 3C6AA 4DTSA 1DLOA 3ZX2A 4WCEL 3WEEB 2Z1HA 4DV5K 1ZBLA 3VQDA 5J2PA 1CXQA 4F9OA 2EWSA 4B3SK 4Z94A 3KKSA 1JCEA 3CCSN 5CYMA 3ZETA 1RFQA 3NGYA 1ATRA 4HUEA 4MFBA 2YKMA 3VQEA 3ZSRA 4CIFA 1KAXA 1EP4A 4CEFA 5HRPA 3V9XA 4HCBA 2V52B 3UKRB 1NK5A 3CJ9A 1C0GA 3AO5A 1NJIO 4B9SA 3TAGA 3VQ6A 4YOYA 1VQPN 2NRXA 4XH5A 2HHTA 3V9ZA 4BRCA 1WSHA 4LSNA 4WQ4C 4C23A 2HBKA 4W5RA 3ENHA 3K57A 3GG4A 4JI4K 3VESA 3KK1A 1LV5A 4DTRA 4LD0A 4CF2A 4CD3A 2HMPA 3H3NO 4HTUA 4K41A 4CW7B 4BRHA 1VAZA 1ITGA 5DM7L 1XMOK 1WSEA 3NAEA 1NLVA 1RT3A 1VSJA 2DFEA 4N5SA 2E2NA 4H0YB 1Q8IA 1KFSA 2QK9A 2P9SA 1TGOA 3CCEN 4H0OA 1YTUA 1EWQA 4OGCA 4I2QA 4RTFD 1HYSA 2G8WA 5AQZA 4IOAL 3DM2A 3NH0A 4FWNA 3TAEA 2EHGA 2ZQBA 2EX3A 5EY4A 5GAHP 5FPDA 4PHTX 4C8OA 2A42A 3EE8A 2ZGYA 2WTUA 4KO0A 1TKDA 4M3WA 4WFAL 1ZC6A 1NKEA 2HW3A 4E7HA 2X6SA 2P9KA 4CZFA 4FJ5A 2NRRA 4DU1A 4OKKA 4PKIA 3HYFA 4JKEA 3KLGA 1VQ4N 3H6EA 2QWNA 1QSSA 4IEIA 3ID8A 5AQRA 3F2KA 5HRSA 3R1XA 2D0BA 5CZ2A 3BDPA 5AQUA 3OS1A 1RBUA 1EQYA 4CBUA 4RW9A 2HMIA 4C1NI 2KKZA 3MXJA 4M3ZA 2QM1A 4CJFA 3K9JA 3PSFA 2P5OA 1X9WA 2HSTA 1JLCA 1BI4A 1T3VA 3E9LA 3WNGA 1VQLN 1OKJA 3AA5X 4F3OA 4BR5A 4M45A 3OY9A 1IBLK 3TAFA 1JLBA 3DYAA 4BRPA 2Z1GA 4KB1A 3M1FA 1IV0A 4ELTA 3D2EA 3KIOA 3AVLA 4KH6A 3AAPA 3AGRA 2HNDA 4DUYK 3NGZA 3ZT1A 5ADXH 4O5BA 1IKWA 3PIPL 1TKTA 4DV3K 1RBTA 1T44A 1RNHA 3QBXA 3J81O 3T7ZA 3JAMO 5C42A 3UKUB 1XWLA 1TYQA 5KPZA 4LF4K 3KD1E 5AFUA 1D4XA 3OYNA 4JKGA 4F3TA 2YX6A 2X74A 3QERA 4B9QA 3CCQN 4FJKA 2RKIA 3OYLA 2FXUA 4KI6A 3V81A 1VSIA 4KHPK 4PWDA 2XY6A 2GEMA 1HYZA 1IG8A 3CPEA 3A5OC 5B8HA 4FJ8A 4I9LA 4R79A 4OLBA 3I33A 3HSTB 2HHHK 1IO2A 5EU7A 3O1BA 1QSLA 3AARA 4U67L 3MN7A 3J80O 3FFKB 4I6MA 4M3YA 2G8FA 3FE1A 4TSXA 3QIPA 3HK2A 2CGJA 3HVRA 1XC3A 1NG9A 3ZX0A 2JWLA 1B92A 4FWKA 4HVJA 4J2DA 3H1QA 2O8FB 2FLOA 3TPQA 4FPBA 4JD2A 1T03A 5AZJA 4B8AB 2PBDA 1RDBA 2R7YA 2P9SB 4DR1K 5HROA 3LALA 3RMBA 4B1YB 2E4LA 1FXXA 3MX2A 4BQZA 1C6VA 1F21A 3PUFA 5KTQA 2XY5A 2BGGA 1KTQA 3G0ZA 1W9HA 3C0BA 5FPNA 5CHIA 4HHTA 4F8RA 3DLLL 4FPAA 1WSIA 2A40A 3RTVA 2X78A 3CI5A 3ALYA 4O8KA 4MDAA 3LWMA 4B3RK 4CEAA 3ZX3A 5KGXA 1SV5A 4KTZA 1QTMA 5BPLA 4LF9K 1ATNA 1MU2A 1N8RO 2VWBA 3U8XA 3TAPA 4BR7A 2ZJQL 1DEJA 1T8EA 2KHOA 4IOXA 3AVJA 3M6GA 4CEZA 5KPRA 4EZ9A 1QHAA 2PZSA 4NXNK 1RDUA 3WXJA 2IOCA 1OVYA 2ATQA 4W5OA 5D3GA 4PL7A 1RTHA 5JICA 4M42A 4CFDA 1S72N 3VF4A 1KXPA 4BR4A 1JXBA 1J5EK 2VGMA 5JMVA 2QXLA 3I55N 3CCVN 2ZJRL 3K59A 2IAJA 1NJWA 3I56N 4ILHA 3OA9A 1D5AA 2Y1JA 4DSKA 1K73O 4H03B 4WFNL 4EP4A 4RWTA 1NGGA 5GIOA 4LY7A 2Q31A 1QVFM 2D5RA 3M8QA 1SKWA 3TTCA 1IBKK 4BRGA 4JI5K 4EFHA 5LJWA 4IJNA 2GUIA 3P31A 4X65K 4KBOA 4NB4A 4OJRA 5GADP 3KHYA 1C1AA 1CZ9A 4RW4A 2D4WA 1RT4A 2GV9A 4CHPA 3C6HA 5AQOA 3CC4N 3U9DA 2O8DA 4DV7K 4ELVA 4CIGA 1Q81O 3WQUA 4L3QA 5AQXA 3VGKA 3UB5A 3BZCA 4JEPA 1RT1A 3V1QA 1TYQB 4PKHA 4FK4A 5CZ1A 2F4VK 4CEEA 2UXBK 4CFCA 2HHQA 1TL1A 1OH8A 2HBJA 2W6KA 3FZHA 4OPKA 1VSHA 4JKGB 4F2RA 1S9GA 4CHQA 4JI3K 5AQVA 1SAZA 2F9TA 5CE3A 4ILJA 3VQ8A 4FJMA 5IT9O 3D2FA 4F4KA 1S1WA 3J8AA 1KQSM 5AJ3K 3CCLN 2OA8A 2OPRA 4M7XA 2CGKA 4K43A 2Q36A 3RMCA 3C65A 4IFVA 4NO7A 1KD1O 3E01A 1LAVA 3VGLA 2YCHA 3RRGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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