3CC7N

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation c2487u
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cc7N00
2ZJPL 1YJNN 1Q82O 1N8RO 3DLLL 5DM7L 1JJ2M 2ZJRL 1VQ6N 1K73O 1QVGM 5GAHP 3G4SN 3CCLN 2OTLN 1Q86O 4WCEL 3CD6N 3CC7N 1VQNN 3I56N 3CCEN 2ZJQL 3PIOL 3CXCM 1ILYA 1KD1O 5JVHL 1VQKN 1VQ7N 1YIJN 1QVFM 5GAGP 1M90O 3CCRN 3J7ZO 1S72N 3CC4N 4WF9L 4IOAL 5JVGL 1YITN 1Q81O 1YI2N 4IOCL 1K9MO 1K8AO 3CPWM 3G6EN 1Q7YO 3CCVN 5GADP 1VQ8N 4WFBL 3CF5L 3OW2M 5DM6L 3CCMN 5MLCQ 2OTJN 1OVYA 1VQPN 2QA4N 4WFAL 1VQON 4WFNL 3CCQN 1KQSM 1VQ5N 1YJ9N 1VQ9N 1VQMN 1NJIO 3CCUN 1VQLN 1YJWN 1YHQN 4UY8O 1KC8O 3G71N 1VQ4N 3CMEN 3I55N 5GAEP 3PIPL 3CMAN 3CCJN 5H1SQ 4IO9L 1W2BM 3CC2N 3CCSN 5HL7L 1M1KO 2QEXN 4U67L
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2KW4A 5AFUA 1HX1A 4X62K 3TAEA 4JD2B 4PL7A 3H08A 4KI6A 1NLVA 2I5JA 4LY7A 1VSLA 4ILHA 4FWNA 3NAEA 2R7YA 4DU4A 1NGBA 2IGIA 1KCFA 5HRRA 4IG0A 3QLHA 4EHTA 4CHYA 4I9QA 3OYKA 3TSPA 3WXKA 2HHSA 4KAZA 2RF2A 3KJVA 4A59A 3AA2A 4DF4A 1JKHA 2WC9A 3IRXA 3GG4A 3VQ5A 3TTDA 4BRHA 5JVHL 1K8KA 4A2BA 3SQ1A 2P9SB 2NRRA 1QVFM 4LSLA 4BRKA 1N36K 2G8FA 2D0PA 3AVHA 4WF9L 3CQ8A 3F5TA 1WBDA 3ULEB 1I39A 5AQQA 5SZTA 3OYDA 2A6AA 1K9MO 1WSIA 1S1WA 1UA1A 4CF2A 1WSHA 4FJIA 2QKBA 3CI5A 4DTSA 3MDQA 4G9ZA 4AH9A 3AO1A 2W41A 3BP8A 3EKSA 3THYB 4BQLA 1OKJA 2PZSA 1P90A 4FPAA 3SV4A 1DT9A 4Z94A 2D0BA 3V9SA 3HRGA 3CYMA 1HYVA 1VQON 3FR0A 4DQRA 2OYQA 4M63C 4OVLA 5AQWA 1ATSA 2Y1JA 4IWVA 5J2QA 1OH6A 2A3ZA 3V9WA 4KKOA 1C1CA 3AO4A 2QXFA 1RTDA 4CZFA 1SQKA 3RR7A 3VERA 2HHWA 4H03B 3O9TA 3I55N 4I7FA 5H1SQ 3LDNA 4ELTA 4CHPA 2OZMA 3FZLA 3L2QA 3DXKB 1HR0K 4MLEA 4CEBA 3SYZA 3DI6A 3RMDA 3MECA 1IO2A 1QHTA 2ZJRL 4ZTJA 3S3OA 3VEXA 1W9HA 3ALYA 4BRPA 3QNOA 1Y64A 3K9KA 3NVKA 1BQNA 4E7LA 2V7YA 3NF7A 3CCLN 3G10A 5LY3A 3NFAA 3DMJA 3VQQA 4BGAA 5EU7A 1NWKA 4E7HA 1U48A 3SUQA 1HNVA 4M3RA 3VGLA 3VGMA 1J6ZA 2OPRA 3SAGA 2HNDA 4PKGA 3OYMA 3SCXA 1XC3A 4LFCK 4OPKA 4JI8K 4B1VA 1JLCA 2ZGZA 3BZCA 4IFEA 3J7ZO 4GV6A 2ATQA 1VSIA 4BC2A 5J2NA 4FK0A 2GX9A 2P9NB 3CC4N 4BC3A 3QERA 1TGOA 2EWSA 2ZWHA 3C95A 1VHXA 2IS3A 3QETA 3ZSXA 3CJBA 1HKGA 2D0AA 5AQSA 5GIPA 2QKKA 4H4MA 2J4RA 1BCMA 1U2VA 1TVRA 4AQYK 3CF5L 3HM8A 3HTVA 4EHUA 5K14A 2DTUA 1QQNA 1S3XA 1SL1A 4FW1A 2F9TA 4JHDA 1OVYA 4CI6A 3ID8A 4EP5A 3QFUA 4BREA 4B1WB 1IKXA 3E1YA 1SV5A 3ENHA 4DQ8A 2YNGA 2A5XA 2P9PB 5AZJA 3CFRA 4LH5A 3VTIA 1YJWN 1VRUA 3AVJA 1X9SA 2P5OA 5CZ2A 2PYJA 3I33A 1TK0A 3DRRA 2OANA 3HSCA 1GOAA 2Z1JA 3HYFA 3TARA 3TANA 2E1YA 4XH4A 3NE6A 3G25A 2Q31A 1I94K 2AP1A 3CC2N 4DUZK 2HF3A 1KFDA 3HBTA 1NBWA 2HHVA 5JMVA 3CJCA 4FLUA 3LM2A 2YNIA 1QHAA 1FW6A 3HJFA 3QO9A 3TSUA 1JLAA 2KZZA 3PX4A 3LAMA 4CZKA 1K73O 4CZEA 5BPMA 4GV9A 2IVNA 3O4NA 3NF8A 4E7IA 2CGJA 4PA1A 3JS6A 4CJEA 3K0SA 3EL2A 5AQFA 4CJ7A 3L6QA 1S6QA 4CGHA 1NGJA 3ZT0A 3IAYA 1HJOA 3ZEUA 3ZSWA 4K41A 4B3MK 4C8KA 4M41A 3ULDA 4NCBA 3OBWA 3TU5A 3C6HA 2WOMA 4BRMA 1VQ7N 1ATNA 3PSFA 3M8PA 2O8BB 3P83D 1BI4A 4KTWA 4IZ9A 3TAMA 2O4IA 4JEPA 4B9LA 2JLEA 3VETA 4GKJK 1FK9A 4CGFA 1Q81O 1WSJA 1QSSA 3J7AP 1N5YA 5HROA 4WQ4A 2HSTA 3UKUB 5AQZA 4KTQA 4H5VA 4WFBL 5C2FA 4DF8A 4IEEA 3V6DA 3LM9A 4G1QA 4CZGA 1XMQK 2DY4A 5FRNA 3OYNA 2RHKA 4WE1A 2KZMA 1RTHA 1J9AA 2BH1A 3VF2A 1VQ5N 1OVQA 4DU3A 3P5JA 4BQZA 4KHYA 4A2AA 1NK9A 4JK7A 3A5NC 3MWPA 5GINA 3MEGA 1YT3A 2Q1NA 1NGCA 4KV8A 3M5RA 4IO8A 3THWA 3T1YK 4LF4K 3KWGA 4BG9A 2Z1GA 3O1BA 3P1GA 2ZJPL 1LWEA 3AA5X 4GW6A 1EKEA 2P9LA 3LANA 1TUYA 1SUQA 4DU1A 3MCAB 4CJQA 3QEWA 4CECA 3ZYYX 4FWMA 3DM2A 3ZSRA 3ZETA 4MDAA 3TAFA 1C0MA 4OKKA 2HNYA 4IDKA 3AVLA 1Q86O 2O8EA 3OYEA 3T7ZA 3H3NO 3QESA 4E1JA 4CZMA 4KH4A 4GKKK 2G8VA 4DV0K 3PIOL 1C0FA 3VENA 1T6CA 5DMRA 2BGGA 4RW8A 4E7KA 3K5OA 3U8XA 1VQKN 5M1OA 1D8YA 3LL3A 3HP9A 2YCHA 3B8AX 4B3SK 3L3UA 4M3ZA 4BDZA 4EZ6A 3OTOK 1VSDA 2FC0A 5KQ8A 3LP1A 5FPDA 3V1RA 1RT2A 3A8YA 1YITN 3VESA 3L2RA 4FJHA 5C2DA 3QMLA 4BROA 1YI2N 4IOCL 4M3UA 1BU6O 2BE2A 3AO3A 4CZJA 5AQUA 2FSNA 4LF6K 4KO0A 3D0PA 4DR7K 1MDUB 4CJ4A 4WQ5A 1U45A 2B4JA 3O1WA 3L2UA 1WN7A 4V19S 4DR5K 3OHRA 1S1VA 3M8QA 4K25A 1KRPA 4XEIA 2NRWA 3VQ7A 3OA9A 3KK1A 2HBLA 1JXBA 4N41A 1VQPN 4FOIA 4A5AA 4BRAA 3VEZA 1D4XA 4CF9A 3MEDA 4FWKA 4CJRA 3T3FA 1WSGA 1VQ9N 2P51A 3VEOA 3ENOA 1T3VA 3HPGA 1Q9XA 1MWMA 1T44A 1RDAA 3FLCO 2HHUA 3HK2A 4C1NK 1XWLA 3EKUA 3L4QA 1EQYA 3QEXA 4K42A 3AVBA 5LJVA 3SI6A 2F96A 1RT7A 5M1QA 3UIQA 4F9OA 2E2QA 4E1MA 3IMXA 4M3WA 4FW2A 4DS4A 3LDOA 3CFPA 1S1UA 2KHOA 2Q97A 1BCOA 4LD0A 3G4SN 3VQ9A 1U47A 4IFYA 3RMBA 1NM1A 4B1ZA 1LWFA 1HYSA 4JKGA 4DSKA 4DTNA 3O3GA 2O8FB 1KSPA 3SAFA 3CCEN 1C0GA 3DXMB 2YX6A 1NGAA 4FLZA 2NRZA 4FPBA 4NYNA 3HPOA 2HW3A 3FZMA 3OY9A 2VWJA 5HRSA 3VQBA 1WB9A 2XY5A 3BY5A 4OGCA 4F3OA 2YHXA 3BZKA 3IS9A 2HHTA 5KGWA 1BO5O 3VOVA 4JYAK 1BDGA 3QEIA 4YOXA 2QXLA 4N76A 4JI3K 4RWTA 5J1EA 3VN5A 4GV3A 2YJEA 3FGUA 4EIAA 3SJHA 2JWKA 3K9JA 3G6EN 2G8WA 4Z4GA 3TAQA 1VQ8N 3NH0A 5C24A 2WTUA 3VEYA 2IOCA 2NRHA 3C6UA 1TYQB 4Q5VA 5JLFA 1XI1A 3L8BA 4WFAL 1VSEA 5AFUH 4RW7A 1D5AA 2P5GA 2ZGYA 3THXA 2BTFA 2HHXA 2O8DB 1VSKA 2F9WA 4FVUA 1EWQA 3SAHA 1TKTA 1ZXOA 4H5NA 1KC8O 4AHSA 4J2EA 5FPMA 4DSEA 2YKMA 3N4QA 1XQSC 4WQ4C 4YOVA 3HOSA 4CF1A 1HKCA 2IVPA 3K59A 4ISGA 3H3OB 2I7NA 3NVMA 3ZX3A 2UUCK 3S9HA 1Q82O 2UUAK 3CPEA 4HUEA 5IWAK 1NJZA 3V9XA 3ZCMA 3O9UA 3UB5A 3BF1A 2Q0UA 2DFFA 4BWJA 1RDDA 1UA0A 2ZQBA 4RTFD 3L4IA 3T1AA 1XHXA 1QQOA 4FZYA 3QICA 2IAJA 2NRTA 1S6PA 3V1OA 1WSFA 3OYJA 3V9UA 1UAXA 2D4WA 4BDYA 3THVA 3O8MA 2E8AA 1NMNA 3AVIA 3HPHA 4JI7K 5BR9A 3QIPA 3F2KA 1TV6A 3SBGA 5AQPA 4YY3K 4DV3K 4OLBA 3FFIA 5AZIA 2HNZA 2HMPA 3HXMA 3RMAA 4CERA 4CHZA 1T05A 4LC9B 4TSXA 4CK3A 2P9PA 1NGIA 5C25A 4BE1A 1SKSA 2B6AA 3D6RA 3O08A 4GVEA 5KI6A 1L3SA 1K6YA 2FBYA 1ZBUA 4LFAK 2NNWA 3U4LA 3QB0A 3UE5A 4DLEA 3ATUA 1OH8A 3PSIA 2QW9A 3CPWM 1P8ZA 5GADP 4K43A 3EO3A 4IXCA 2KFZA 1N6QA 1C0UA 3SJJA 1L3VA 5BRHA 5TKYA 5HOOA 3OJUA 3AA4A 1ESVA 2QA4N 1WBBA 1X9JA 3RWUA 3LDSA 4DV6K 4CJLA 1IKYA 5C15A 5AQRA 3VPZA 3M6GA 1NU0A 3CCUN 1NK8A 4BR4A 4H5TA 2Y1IA 4CJKA 2P9KB 4B3OA 1QZ6A 2EX3A 3CMEN 1UWBA 2I7PA 4C8NA 4X65K 4WQ5C 2QI2A 2VGMA 3MXJA 4FOEA 4OKJA 3DOLA 4U67L 1T6DA 3B6OA 3NGZA 3LWMA 3AGKA 4DR6K 3K5NA 1ITGA 3U6FA 3JSMA 4I2PA 1REVA 3P31A 1N34K 1TK8A 1IKVA 1UOCA 4FJKA 3TTCA 3ZT4A 5IT9O 4B08A 2HVHA 3S41A 2E20A 3QEVA 1WAFA 2YHWA 2G8HA 3SK3A 3T19A 2DFEA 3TTFA 3VQPA 2FBVA 4CEAA 4DV1K 1BOTO 4ID1A 1JLQA 3A5MC 4FYDA 2HHQA 4H0TB 1HNZK 4KHQA 3QNNA 1SS6A 3VQCA 3PX0A 3K5LA 4JK9A 4DFPA 1S72N 2XY7A 1QE1A 3Q7CA 1HJRA 1EP4A 1NK0A 5D3GA 2GELA 3TI0A 4IOAL 3AVFA 4E3SA 1LWCA 4DR2K 2W42A 3OYHA 4K8XA 5ELZA 3ASMA 4A61A 1LAVA 4BRDA 1YVNA 2P9IA 1NOYA 2UYTA 4QAGA 4CBWA 4JI6K 4OO1J 1MA9B 2CH6A 2Q36A 3PLAA 4L3QA 4R79A 1KLNA 4LH4A 3H6EA 4B1UB 1U6ZA 2ZM6K 3BF3A 3IDHA 2Q3SA 4OPJA 3P4IA 2D5RA 3QINA 4O44A 3ATVA 2E6MA 1O1WA 5HRNA 4KRFA 4CIEA 3F9KA 2G8IA 4I6MA 3O3HA 4UY8O 3OYBA 2A40A 2P9UA 4KHSA 1VQ4N 4HCBA 3VQ4A 1GLFO 3CMAN 3NBPA 2JWLA 1H1VA 4CGIA 2E2NA 1W2BM 4B8CA 2FBXA 5AQKA 4YHHK 4IBNA 3VA3A 5HL7L 4BRFA 3GE1A 3LPUA 3HM9A 5FRMA 5SWMA 2F8SA 3D2FB 4Z4CA 3AAPA 5ADXH 4J8FA 1DTQA 1LOTB 4KHNA 2QWRA 4JI0K 4B1XB 4FM2A 1RBSA 4FJNA 1XHZA 2G8KA 4UQGA 3OS0A 1RFQA 1LCUA 2X6SA 1LV5A 1VSJA 5BPNA 4ILGB 3ZSZA 1CLQA 3RSEA 1NK7A 4CEEA 4O5BA 4F3TA 4NXMK 3SLCA 1RCHA 4R5PA 4H0VB 3QFPA 4BDPA 5CHIA 3CG7A 1U04A 4LSNA 3DRSA 3DWLA 3W3DA 5BPLA 1WSEA 3LDLA 3DLEA 3MMVA 2W6KA 1GOCA 2BUPA 3I0RA 1YIJN 3OYCA 3NH2A 3AO2A 3L2WA 3AARA 3OYIA 4DSFA 3FZKA 1HNIA 3D2EA 1BQMA 4M7XA 3O3FA 2DFHA 2XO7A 4FWRA 4JK8A 4CHNA 1K8KB 5C10A 3T69A 4DUYK 4YOYA 1KFSA 5I9EB 3ISNC 4BR0A 3VQ6A 4CJSA 1BL3A 1CXUA 2B5JA 3M8SA 3AVNA 2ZF5O 5ADXA 5AJ3K 1KVCA 3ZT3A 4DHYA 3AV9A 2YHBA 1HNXK 4FM1A 5KQDA 3C7NA 4NXNK 4B9UA 3MCPA 1RT6A 1EXQA 3K58A 1JCGA 3WNEA 1X9WA 3CJ7A 3KVGA 4BG8A 2VGNA 2VG5A 1RBVA 1Z05A 4NLBA 1O13A 3B6PA 2XHBA 4CHQA 4KTZA 5AQVA 3V81A 4IG3A 2WFBA 1RDCA 4HWIA 2ITMA 4FJJA 3DLKA 3EN9A 4JV5K 1RTJA 1E4FT 4O8UA 1WAJA 4J2AA 3HT3A 1NNEA 2O8FA 2HBJA 4HVJA 1T7PA 5GIOA 4O0JA 3DXMA 4C8LA 3L0QA 3J81O 3WEEA 5I3UA 1RBRA 4X66K 4FL9A 2GUPA 3V1QA 5JS1A 4FJXA 4ID5A 4BR9A 3M1FA 4OJRA 3AVGA 3BGRA 1QVGM 3BUZB 5KRTA 3VQEA 4DQSA 1EWRA 1NK4A 5M1FA 2PYLA 4DKWA 3SPYA 3UKRA 4EAHD 4DV2K 4N5SA 1VSHA 4C1NI 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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