2E2NA

Crystal structure of sulfolobus tokodaii hexokinase in the apo form
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
298
structure length
298
Chain Sequence
MMIIVGVDAGGTKTKAVAYDCEGNFIGEGSSGPGNYHNVGLTRAIENIKEAVKIAAKGEADVVGMGVAGLDSKFDWENFTPLASLIAPKVIIQHDGVIALFAETLGEPGVVVIAGTGSVVEGYNGKEFLRVGGRGWLLSDDGSAYWVGRKALRKVLKMMDGLENKTILYNKVLKTINVKDLDELVMWSYTSSCQIDLVASIAKAVDEAANEGDTVAMDILKQGAELLASQAVYLARKIGTNKVYLKGGMFRSNIYHKFFTLYLEKEGIISDLGKRSPEIGAVILAYKEVGCDIKKLIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Sulfolobus tokodaii
publication title Crystal structures of an ATP-dependent hexokinase with broad substrate specificity from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus tokodaii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEXOKINASE
total genus 109
structure length 298
sequence length 298
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2006-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2nA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2nA01
2E1ZA 4EHTA 2QWLA 1LOTB 1HLUA 2Q0RA 5FPDA 3BF3A 2GWJA 3FZLA 5EVZA 2ASOA 4FWRA 4CBWA 3LM2A 3UKRB 4BR0A 1V4SA 1WUAA 5F1XA 4FL9A 2GTDA 4CZGA 1ATNA 2FSNA 2FSJA 5BN8A 2F9WA 1MDUB 4M63C 4BREA 4WQ5A 2PAVA 3O5BA 1CZAN 3ID8A 1MWKA 4DB3A 4BRKA 5KPTA 3GL1A 4ISGA 2VYPA 1BO5O 1NGCA 2YJFA 3QBWA 1IG8A 5AQQA 4GNIA 3H1VX 4XEIA 5AQVA 3GOIA 4JD2A 4B1VA 3AAQA 3ATVA 4CZFA 4BRAA 3CERA 3FE1A 1HKCA 1JCGA 2IIRA 3U8XA 4B1UB 3O8MA 3UKUA 3F9MA 3GG4A 3M6GA 4CD1A 3H1QA 1MWMA 2ZGYA 4PL7A 4H5TA 2A5XA 3H6EA 3KZBA 5BPMA 4BROA 4J8FA 3A5LC 3DXMB 3VPZA 3CJBA 2NZTA 3HM8A 3D2FA 1NGFA 4BRDA 1R59O 3CJAA 4JD2B 3DWLA 2H3GX 3HZ6A 5FPMA 3ZEUA 4B1XB 3M3ZA 4BVOA 1U2VA 1NGJA 1YAGA 2Q36A 3GE1A 2F9TA 1X3MA 3L6QA 4IZ9A 5AQWA 2CGKA 2V7ZA 3MCPA 3FFKB 5AQZA 4Y0WA 4FWQA 4LC9B 4CZKA 4CZMA 2BUPA 5EX5A 4QS7A 5AFUA 1NWKA 3BUZB 3CETA 3MN7A 4O8KA 2GEMA 4BG8A 3D2FB 2A40A 4H0TB 4BRLA 2D1KA 2KHOA 4BR2A 3ATUA 3CQYA 1RDWX 2A41A 3C0BA 1HUXA 3CJ1A 1U2VB 3KVGA 3MK6A 2CH6A 2HF4A 4L3QA 5AQYA 3I33A 1QQOA 2P9NA 3QDKA 3DJCA 1MA9B 3IFRA 3IUCA 3FLCO 2HMPA 3DXKA 1IJJA 5AR0A 5I9EB 1T6CA 5AQNA 1HKBA 3VEWA 3BEXA 1ZBSA 5KPZA 1TUYA 4CZIA 3L4IA 1GLDG 3VEVA 2I7NA 3EL2A 2YHXA 5F0XA 4H5WA 4K41A 2VCPA 1S3XA 1NGHA 1QZ6A 3ZETA 1TYQA 2P9NB 4O5FA 3VF6A 4BG9A 4I6MA 1NGDA 3ENOA 3CJCA 4BQLA 2ZF5O 2FSKA 3DXKB 2D0OA 3O6WA 4IWVA 3H46O 1DKGD 2AP1A 4FPAA 5BR9A 4PL8A 2V51B 4CBXA 3VESA 1NMDA 3FZFA 2OANA 3HI0A 3S41A 4XH4A 1GLAG 3GBTA 3LM9A 5LJVA 4JNEA 3CI5A 5EY4A 3ENHA 2PBDA 2ZGZA 5BPNA 2Q97A 3VOVA 1TYQB 3FGUA 5ADXH 1DGKN 3UE5A 3WQUA 4K42A 4IJNA 3U4LA 4I6MB 4H5RA 4XH1A 4BGAA 2WUSA 4GY2B 4FWSA 2FXUA 3VEZA 1GLCG 1YVNA 4Z94A 2IVNA 4WYBA 4BRFA 2P9KA 1GLFO 2J4RA 2ITMA 5ELZA 1E4FT 1ZXOA 1T6DA 3A5MC 4H0PA 3LL3A 1XUPO 3AAPA 4CZEA 2HOEA 4YDUC 3BF1A 4B1WB 3MN5A 4FWLA 3FR0A 3VF2A 4BC5A 4PKGA 1BA0A 4CZLA 4C23A 3VGLA 4RTFD 1S22A 3EKUA 2P9KB 3U9DA 5AQIA 2GUPA 1Q18A 3D2EA 3GDQA 3LDPA 1C0GA 1NGBA 4ISFA 4H5NA 5AQXA 4EIAA 2E2OA 5AQFA 3AARA 3CIPA 2NRHA 1EQYA 2E8AA 2E88A 1HPMA 2QWRA 1BU6O 2YCHA 3VEOA 1YUWA 1T44A 5JLFA 4WQ4C 3WXKA 3WXLA 2QM1A 5EOYA 4MLEA 1NBWA 3UKUB 3FZKA 3VEYA 4FO0A 1DEJA 3O1WA 3G25A 2FF3B 1BOTO 3D2EB 4CZHA 4E1JA 5KPRA 3A5OC 2GELA 1ESVA 4DCHA 4MO5A 4H03B 3QBXA 4BRIA 5JICA 2VWBA 3A0IX 1NGGA 3VF4A 3WT0A 3R8EA 2Q1NA 4CZJA 5BPLA 1QHAA 2QWOA 1GLLO 3ZEUB 4FSVA 3UB5A 2QXLA 4BRMA 5JLHA 5AQMA 1QQMA 4BR9A 4BRHA 5E26A 3SJHA 2A6AA 4H0VB 3EO3A 1BUPA 3MN6A 3IMXA 1QZ5A 4BQZA 3SK3A 3O80A 4B1YB 4WQ5C 5AQOA 5B8HA 2GWKA 4IXCA 3MDQA 5AQKA 5AQHA 3ZX0A 4JHDA 3WUHA 1NGEA 2CGLA 1ATSA 2FLOA 3H3NO 3HSCA 1RFQA 5AQPA 3QICA 3WEEA 4M7XA 2NLXA 5LY3A 3BP8A 5KQDA 2YHWA 3JXUA 3LDLA 3C7NA 4H0OA 4BGBA 1K8KA 3VETA 3VENA 5EXWA 2P9LA 1ZC6A 1HJOA 4A2AA 4HTLA 4BRNA 2P9PA 4RCHA 2UYTA 2ZWHA 2DPNA 5JMVA 5F2RA 2Q31A 4PKHA 2A42A 4FWOA 3A5NC 2E2QA 2P9UA 3O08A 3OHRA 4BR7A 3WEEB 5AZJA 4EHUA 2V7YA 5FPNA 5BRDA 3QB0A 5KQ8A 1SQKA 3ULEA 3B8AX 3M1FA 4JAXA 3ZETB 3C7NB 5AQJA 1K8KB 3AY9A 3RSEA 3QFUA 1H1VA 1GLJO 2E20A 1Z05A 1HX1A 4B9QA 3O4WA 2P9PB 3EKSA 4MO4A 1U6ZA 3EZWA 5BRFA 1NGIA 2HF3A 2I7PA 1RGIA 2Q2RA 3TPQA 1JCFA 2IVOA 4EAHD 4BRCA 2P9UB 2E2NA 5AZJB 5ADXA 3A8YA 3ULEB 1E4GT 4BR5A 3H45C 3WXJA 1KAYA 3RSEB 1P8ZA 1V4TA 1WOQA 2CH5A 4DHYA 4FOEA 2QWQA 3W0LA 3MMVA 3CHWA 2D0PA 3L0QA 4H5VA 4IO8A 2BTFA 3SMSA 2FF6A 2D4WA 4BVPA 2ASMA 3DXMA 4IJAA 4AM7A 4CD3A 2IVPA 3CQXA 4H0XB 3QFPA 3WQTA 4FWPA 4JN4A 5LJWA 3FZMA 1Y64A 4CJ7A 4QS9A 4FWKA 4FOIA 2YHYA 3R9PA 1YXQA 3KHYA 3LDNA 4K25A 4FWMA 3WXIA 1NM1A 4A2BA 4BR4A 5BRHA 5AQGA 4QS8A 4A61A 5E84A 1XC3A 4ISEA 3U9ZA 4BRGA 1KXPA 5AFUH 1G99A 4NB4A 3SMPA 4BRQA 3H3OB 1X3NA 1BA1A 1XQSC 3O1BA 1X9JA 4A62A 1J6ZA 2QWMA 4BC2A 1D4XA 5AQRA 3P4IA 3VGMA 2A3ZA 4FWNA 4BC3A 3VERA 2ASPA 4NO7A 2V52B 2YJEA 1QQNA 4PKIA 3VEXA 3VGKA 3CJ7A 3J8AA 2W40A 1NLVA 3HTVA 3LDQA 2Q0UA 5BN9A 1BG3A 1SZ2A 5CE3A 2QWNA 1GLBG 2P9SA 2QW9A 4YDUA 1HKGA 4FPBA 4M7YA 3CJ9A 3IDHA 4KBOA 2YI1A 2P9IA 1BWFO 4B1ZA 5TKYA 3ZX3A 3ZX2A 3I8BA 3SLCA 2AA4A 4DQ8A 1GLEG 5BREA 4EFHA 3MN9A 3R6MA 5AQLA 5AZIA 3HBTA 4JHDB 1OKJA 4RWTA 1KAXA 4K43A 4CI6A 3DAWA 3JS6A 1SAZA 2P9SB 4F9OA 2EWSA 3D7EO 3LDOA 2W41A 1BDGA 1TUUA 3QMLA 4H0YB 4WQ4A 2P9IB 3UKRA 5AQSA 1ATRA 2QWPA 1KAZA 4BC4A 2E2PA 3W3DA 4AM6A 3EN9A 2P9LB 4HWIA 3TU5A 2CGJA 4MLHA 5AZIB 1LCUA 3FZHA 5FPEA 1C0FA 5AQTA 1JCEA 1NGAA 5AQUA 1Z6RA 4XH5A 4BRPA 2E1YA 4CBUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NCAA 4X66K 3FZLA 4GVMA 4CBWA 1VRUA 4FWRA 4NLCA 4JI4K 4JI5K 1V4SA 1JLQA 5KI6A 3ZSVA 4CHPA 2FBXA 2GTDA 4GV6A 4E89A 2F9WA 1VQ6N 3EE9A 4RW8A 3TAEA 1JXBA 3LP0A 1CZAN 4DB3A 4KI4A 1NOYA 2HHSA 5KPTA 1VQMN 4DTJA 4M3ZA 2Y1JA 3GL1A 4ISGA 4KV8A 5GINA 1BO5O 1KVCA 3K5LA 1TL1A 1RT1A 3QBWA 1S1XA 1XC9A 1SL2A 2XRIA 1YIJN 4F3OA 2YNGA 2GUIA 4J2EA 1NJXA 3CERA 4FJHA 1W0HA 3D6RA 3VTHA 3M6GA 4FJ9A 3H1QA 2YNFA 3DLBA 3H6EA 2F7TA 3NF7A 1XWLA 5BPMA 4BROA 3AO2A 4FLTA 2E5LK 3CJBA 5C25A 1VHXA 3V9UA 3CJAA 4JD2B 3ZEUA 3M3ZA 4U7BA 3BY5A 1YAGA 1NK0A 1EP4A 3D0PA 4C1NK 4B08A 3QERA 3L6QA 4KH5A 1JL1A 3CMAN 3K9KA 2V7ZA 5AQZA 2NRXA 2IOCA 5EX5A 3PUFA 4E1NA 3LZJA 5SZTA 1SL0A 4LF8K 1W2BM 3D2FB 5DK5A 3MEGA 4LSLA 3K5MA 2HHWA 1WB9A 4CECA 3C0BA 3KVGA 3NF8A 2HF4A 5AQYA 3K58A 3I33A 4FK0A 1IO2A 1QQOA 2ITGA 4CEDA 3IUCA 2HMPA 2JLEA 5AR0A 2NRWA 4FJNA 4C8KA 4JS5A 3NE6A 1T6CA 5AQNA 4AILC 3OYEA 1C0MA 3NVMA 3VA3A 1S1WA 1TUYA 3NGYA 3L4IA 1GLDG 1D8YA 3EL2A 3RR7A 4H5WA 2FC0A 2O8EA 4DV5K 1RT4A 1NGHA 1K8AO 3ZETA 4O5FA 2P9NB 3AA3A 1TKXA 3OYHA 4IFYA 3THXB 3PSFA 1VSEA 1BISA 3CJCA 4BQLA 3SPZA 3DXKB 3O6WA 4HVJA 1DKGD 4FPAA 3VQDA 3SQ1A 2V51B 4BWJA 4CBXA 3BDPA 5C12A 1NMDA 2FBYA 3FZFA 1BI4B 2OANA 3HI0A 2EHGA 5BR8K 3KJVA 1NKEA 1LWEA 1S9GA 4JKBA 1HPZA 2RPIA 4AHCA 5FRNA 3CI5A 3L4QA 3ENHA 2ZGZA 1TYQB 4N56A 4K8XA 3UE5A 3WQUA 3K9JA 4K42A 3U4LA 1N34K 3OYNA 2OTLN 2FXUA 4JK7A 3VEZA 4Z94A 2IVNA 4WYBA 1ASVA 3E9LA 1TKTA 1TGOA 2FBTA 3A5MC 1Z25A 4I2PA 3LL3A 3LWLA 4I2QA 2DTUA 2JGUA 2HHTA 3K5OA 3AAPA 3C94A 2HOEA 2QK9A 5KGWA 3BF1A 4B1WB 1IKVA 4PKGA 1KFSA 4DR4K 1FKOA 2RKIA 1K6YA 4CGJA 3VMFB 1S22A 4FVMA 4RG8A 2ETJA 1REVA 2UXDK 1M1KO 2HB5A 1U48A 3PIPL 1Q18A 4LH5A 3GDQA 4E7LA 1NGBA 4DSKA 4H5NA 3CCLN 2QTDA 4EIAA 5CZ2A 2NRHA 1EQYA 2E8AA 4W5NA 1C0TA 2QWRA 3AVIA 3LALA 4DS4A 1BU6O 3KK7A 3JSMA 4KREA 1T44A 4WQ4C 4BACA 4PHTX 1KCFA 5EOYA 4IG0A 4CF8A 3AO5A 4FO0A 5I3UA 4J2BA 5C0YA 3O1WA 3V9SA 3O3HA 4FVUA 2FF3B 4KB0A 1BOTO 3CCQN 1N33K 4CEBA 4CZHA 4E1JA 4BDPA 3I8DA 3A5OC 4N76A 2GELA 2FBVA 4O44A 4MO5A 2HHQA 4DFKA 3OJUA 1NGGA 1ZBIA 4DQRA 3KWGA 4QOZB 3R8EA 4CZJA 4B9NA 4FYDA 5C15A 3IKMA 1QQMA 3T7ZA 3CCMN 2QEXN 5CYQA 1HNIA 1IBKK 3KKRA 3MN6A 3IMXA 4FW1A 3AGRA 3OS0A 4BQZA 3O80A 3OYCA 4FLXA 1NGEA 2CGLA 3SV4A 3DI6A 2FLOA 1KC8O 1VQNN 4CHYA 1RFQA 2O8DB 1YTUA 1YT3A 3WNGA 4M3WA 5LY3A 3E01A 4YFUA 1TK8A 3G71N 4DLEA 3LDLA 3C7NA 2OZSA 4ELVA 2EX3A 4NCGA 2R7YA 3EZ5A 3HP6A 4CK1A 2HW3A 4DKWA 4HTLA 4JKGB 2Y1IA 2P9PA 1C1AA 4RCHA 3HVTA 1C6VA 1Z26A 3LDSA 2A42A 2E2QA 5FPNA 5BRDA 4FJIA 5CY4A 3ULEA 3T1AA 3RWUA 3B8AX 5GAHP 4IOAL 2F8TA 1S6PA 4TSXA 3M8QA 4JRPA 2E20A 4DMNA 2ATQA 3M5RA 2I7PA 3TPQA 1WNSA 2IVOA 3OYKA 3MXIA 4BRCA 2P9UB 3TAPA 4WE1A 3AVNA 1NK8A 2X74A 4YOYA 1GOCA 4M3TA 4DV0K 3WXJA 1P8ZA 4FCYA 3HSTB 2CH5A 4CF9A 4DHYA 4O0JA 4WF9L 3L0QA 3K59A 3PX4A 2BTFA 4JEPA 3LPUA 2I5JA 2ASMA 4CVNE 4QAGA 3OYAA 1NK5A 4CEAA 3H08A 5H1SQ 4CEQA 4CJVA 1XI1A 5LJWA 1F21A 2G8HA 3AA5X 4FZYA 1KLNA 4DSFA 3LP2A 4C8NA 4FWKA 2KZZA 4B9VA 3F5TA 4K25A 4DTXA 1NM1A 5DMRA 4BR4A 4FJXA 5BRHA 5AQGA 5LL6Z 1XC3A 4ISEA 3O4NA 4DQSA 4QCLA 2IC3A 4I7FA 1TK5A 4EP4A 4C8LA 3LP1A 1KSPA 1QS4A 1X3NA 3H3OB 3OY9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3ZSW A;  5CZ1 A;  4DG1 A;  4W5T A;  4BC2 A;  3HO1 A;  3J81 O;  4E7K A;  3PX0 A;  1KVA A;  3P4I A;  1T3V A;  4FWN A;  3P38 A;  4NO7 A;  3P1G A;  3CYM A;  1LAV A;  5HP1 A;  1QQN A;  3MWP A;  1WAJ A;  2KW4 A;  5HRN A;  3VGK A;  2NNW A;  2XY5 A;  3IRX A;  3MED A;  1YI2 N;  4F4K A;  2W40 A;  1NLV A;  5BN9 A;  4B9U A;  1M90 O;  5CE3 A;  3SAF A;  2QW9 A;  3VTI A;  2O8C B;  3T69 A;  1HKG A;  3CPW M;  1I39 A;  2ZE2 A;  4CGI A;  3SV3 A;  3CCE N;  4ELU A;  4GKK K;  4CEO A;  3KLG A;  3SQ4 A;  4DV6 K;  1A5W A;  4JHD B;  3THY A;  3HOT A;  2GX9 A;  1KAX A;  2QKK A;  2D5R A;  4F9O A;  2EWS A;  3D7E O;  2BGG A;  4WQ4 A;  1TUU A;  4H0Y B;  2VGN A;  2QKB A;  3C6H A;  2HBM A;  1ATR A;  2VG6 A;  4UQG A;  4BC4 A;  2E2P A;  3QLH A;  4KHS A;  1VRT A;  2YHB A;  1XMQ K;  3TAG A;  4DQP A;  3TU5 A;  4ELT A;  3FZH A;  3WNH A;  5K14 A;  3C65 A;  4Q0B A;  5AQU A;  3T1Y K;  4DSE A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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