2E2NA

Crystal structure of sulfolobus tokodaii hexokinase in the apo form
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
298
structure length
298
Chain Sequence
MMIIVGVDAGGTKTKAVAYDCEGNFIGEGSSGPGNYHNVGLTRAIENIKEAVKIAAKGEADVVGMGVAGLDSKFDWENFTPLASLIAPKVIIQHDGVIALFAETLGEPGVVVIAGTGSVVEGYNGKEFLRVGGRGWLLSDDGSAYWVGRKALRKVLKMMDGLENKTILYNKVLKTINVKDLDELVMWSYTSSCQIDLVASIAKAVDEAANEGDTVAMDILKQGAELLASQAVYLARKIGTNKVYLKGGMFRSNIYHKFFTLYLEKEGIISDLGKRSPEIGAVILAYKEVGCDIKKLIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of an ATP-dependent hexokinase with broad substrate specificity from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus tokodaii.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus tokodaii
molecule tags Transferase
molecule keywords HEXOKINASE
total genus 109
structure length 298
sequence length 298
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2006-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2nA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2nA01
3ATUA 4B1YB 2NLXA 4BG8A 4H0PA 3CJ7A 5KPTA 1OKJA 1C0FA 4WQ4C 3WUHA 5AZJA 1C0GA 1MA9B 2E8AA 4BRGA 4FWRA 3VEOA 3D2FA 2E2PA 3LDOA 2GTDA 4AM7A 1NGEA 3A8YA 3VENA 3GBTA 4BQZA 1DEJA 3LM2A 2CH6A 3DXMB 4CZGA 1GLDG 3H1VX 2CGLA 4BG9A 3IDHA 2ZGYA 2D4WA 5EY4A 3VF2A 3VOVA 2YHYA 3M3ZA 1DGKN 2ASOA 2QWNA 4FWOA 3ULEA 4JN4A 4A62A 2P9SA 3QDKA 4Y0WA 4BVOA 5BRDA 3QBWA 4M7XA 1WUAA 3ZX2A 1HX1A 1Z6RA 5AQVA 3WXLA 3WQUA 4FOEA 3GE1A 3ZEUB 2A40A 3SMSA 4FWNA 3QMLA 1QHAA 5E26A 4EIAA 1Y64A 3I33A 2UYTA 4M63C 3W3DA 3EL2A 3QICA 3D2EA 3HI0A 4KBOA 1TUUA 2E1ZA 4QS9A 4DHYA 5AFUH 1IJJA 3RSEA 2P9NA 3O1BA 3M1FA 4CZHA 4H5VA 1LOTB 1BDGA 5LY3A 2F9TA 1KAXA 1LCUA 1HLUA 2P9UB 3CHWA 2EWSA 2Q2RA 1H1VA 2D0PA 3TU5A 2A3ZA 4CZMA 2QWMA 3WT0A 2V7ZA 5JLFA 4BGAA 2P9PB 3O8MA 5EX5A 4BQLA 4BR5A 4ISGA 1HJOA 3QFPA 4H0XB 2Q97A 1ATSA 1BO5O 4BR0A 2A5XA 3KVGA 3WQTA 3WXIA 5BRHA 4H5RA 4XH4A 1ZBSA 2V52B 3VF4A 4B1XB 3ID8A 1RDWX 2NRHA 3HBTA 3MDQA 4PL8A 4F9OA 2QWOA 1NGHA 3CERA 4BR9A 1ATNA 4BRKA 2PBDA 3FR0A 3QB0A 1IG8A 1QQMA 4IWVA 4C23A 1HPMA 2BTFA 4YDUC 5F0XA 2QM1A 1EQYA 4CD1A 1X9JA 3BEXA 3LDQA 4FWSA 3H3NO 1KAYA 3H45C 4JD2B 2DPNA 5AQMA 2FSJA 4H0TB 1NGBA 2QWLA 3D2EB 3OHRA 3VF6A 4CZLA 5AQGA 3GOIA 5BPMA 4K42A 2H3GX 1KAZA 3U9ZA 1NMDA 3O5BA 4BRDA 1RFQA 1SAZA 4CZKA 2A41A 4IJNA 3AAQA 3EKSA 1XUPO 3CI5A 5BN8A 5F1XA 5JICA 4FSVA 5BN9A 4BR7A 4PKIA 2FSNA 3L0QA 3LL3A 4JAXA 1S3XA 4H0VB 5AZIB 5AZIA 4CBXA 2HF3A 3LDPA 5ADXA 1S22A 4FO0A 2ASMA 3BUZB 2V7YA 4JHDA 1ZXOA 2FXUA 2HOEA 3CJBA 3VEXA 4XH1A 2VCPA 3MMVA 4RCHA 4BR2A 1WOQA 4EAHD 1X3MA 3EZWA 5AQZA 2Q31A 1K8KA 5BR9A 3L4IA 4GY2B 2KHOA 4BROA 1YAGA 3EN9A 5FPEA 4MLHA 3VESA 1U6ZA 3IMXA 2HMPA 4CD3A 1SQKA 3HM8A 4J8FA 1GLBG 4I6MA 3J8AA 4DCHA 2D1KA 3ZETB 2E20A 3G25A 3WXJA 3D7EO 3A5NC 3WXKA 4DB3A 1V4TA 1T44A 3DXKA 1QQNA 4FWLA 2IIRA 3QBXA 1MWMA 4CBUA 4DQ8A 4IXCA 2FSKA 3FZMA 2P9KA 3SJHA 3DXKB 4BRAA 2W40A 3VEYA 2P9PA 2BUPA 1NGIA 4BRCA 5KPRA 4CZFA 3AARA 3EKUA 5AQUA 3R8EA 3VEZA 2AA4A 3FE1A 3BF1A 4BRIA 1QZ6A 4CBWA 2YHWA 4BRMA 3MN9A 4JHDB 5JLHA 4EHTA 3CJAA 1ATRA 2GEMA 5LJWA 3U8XA 4A2AA 4FL9A 1Q18A 5F2RA 4YDUA 4CZIA 3O80A 3HTVA 3BP8A 3QFUA 4Z94A 1BA0A 3CQXA 4CJ7A 3LM9A 1K8KB 1XQSC 3CJ1A 4BRFA 2Q0RA 1D4XA 4FPAA 2ITMA 5EXWA 2QWPA 3FFKB 3VGLA 2GWJA 5AQTA 1HUXA 2E88A 2A42A 4ISEA 4FWMA 5ADXH 2WUSA 5AFUA 3KHYA 2NZTA 1XC3A 3CIPA 3HSCA 1GLCG 1YUWA 3ULEB 4BC2A 1R59O 3M6GA 5BPNA 4H0OA 2IVPA 5LJVA 1NM1A 1NGAA 3SLCA 4LC9B 1QZ5A 5AQHA 3R6MA 1JCEA 4BC3A 4PKHA 5AQPA 3SK3A 2IVOA 4BC4A 2ZWHA 3JS6A 5AQSA 4H0YB 4MLEA 2QW9A 1MWKA 2GELA 5E84A 5EVZA 3C0BA 2Q1NA 2CGJA 1P8ZA 3TPQA 2ZGZA 3A5MC 3BF3A 3H6EA 1BA1A 1TUYA 2F9WA 5AQFA 4O8KA 3FZFA 3UKRB 1NBWA 3FLCO 4K43A 1E4FT 4RTFD 3VEWA 3MCPA 1T6CA 5I9EB 4WQ5C 2ASPA 1JCGA 2P9UA 2ZF5O 3ZETA 4I6MB 3UE5A 1G99A 1NGCA 1HKCA 1BUPA 3FGUA 3P4IA 4B1WB 4BVPA 3ENHA 2FF6A 3U4LA 4BRNA 3MN7A 2E1YA 4BREA 3R9PA 3GDQA 3AAPA 3EO3A 4A61A 3IUCA 2I7NA 3GL1A 2P9NB 3CJCA 3WEEA 1BG3A 3B8AX 3VETA 5AQKA 3W0LA 3MK6A 4CI6A 2P9IA 4FWKA 4B1ZA 3UB5A 1BWFO 4BRQA 2J4RA 2E2OA 2P9SB 5AQOA 3ZX3A 4K41A 4FPBA 3CETA 1QQOA 2PAVA 1TYQA 2GWKA 5AQWA 4ISFA 2QXLA 2P9LA 4JNEA 4GNIA 4IZ9A 3CQYA 1E4GT 1CZAN 3ZEUA 5KQ8A 2YI1A 2YHXA 2AP1A 1YVNA 1NLVA 3I8BA 4EFHA 4MO5A 3F9MA 2FF3B 3DWLA 4QS7A 3SMPA 1GLAG 2IVNA 3UKUB 4BC5A 1GLLO 4WQ4A 4K25A 3U9DA 5KPZA 3D2FB 3O1WA 5BREA 5KQDA 2CH5A 2A6AA 3C7NB 4M7YA 4AM6A 1V4SA 4BRHA 3AY9A 4XH5A 2VWBA 4JD2A 4L3QA 1Z05A 1U2VB 5EOYA 3FZLA 3H46O 1SZ2A 4IJAA 3LDNA 3H3OB 1ESVA 2GUPA 1MDUB 1U2VA 2E2NA 3JXUA 3LDLA 4H03B 3MN6A 5AZJB 3GG4A 2CGKA 2P9LB 3ZX0A 3C7NA 5AR0A 1GLEG 1NGJA 1TYQB 4PL7A 4O5FA 1T6DA 4EHUA 1NWKA 2D0OA 3H1QA 5ELZA 2FLOA 2Q0UA 3VEVA 3IFRA 3UKUA 4BGBA 2P9IB 5AQRA 2OANA 2E2QA 3HZ6A 3O4WA 4E1JA 4MO4A 5AQJA 1BU6O 4PKGA 5AQYA 1JCFA 3KZBA 4CZEA 2QWQA 4IO8A 1BOTO 3A5OC 1HKBA 1KXPA 2I7PA 4RWTA 4NB4A 5BPLA 4QS8A 3A5LC 1DKGD 5FPDA 3RSEB 4CZJA 5FPNA 1RGIA 3FZKA 3DJCA 3DAWA 2QWRA 4BRLA 3O08A 1GLFO 4HWIA 3ENOA 5FPMA 2YJFA 3WEEB 1J6ZA 2P9KB 2V51B 2Q36A 4HTLA 1X3NA 5CE3A 1NGFA 1ZC6A 4A2BA 1NGGA 4H5TA 3O6WA 3VERA 5AQLA 2VYPA 4H5NA 5TKYA 4WYBA 2YJEA 4FWPA 4XEIA 2HF4A 3VPZA 3DXMA 5BRFA 3L6QA 3MN5A 5AQNA 4NO7A 2YCHA 4FOIA 5AQQA 3CJ9A 5AQIA 4B1VA 4B9QA 1NGDA 3FZHA 5JMVA 4H5WA 3S41A 3ATVA 4BRPA 3UKRA 3VGKA 1YXQA 4FWQA 4BR4A 4B1UB 5AQXA 4WQ5A 1GLJO 3VGMA 5B8HA 1HKGA 3A0IX 2W41A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VSJA 4B1YB 4BG8A 3OYNA 4WQ4C 1C0FA 4BRGA 1B9DA 1C1BA 2E2PA 3NHGA 2HBKA 5J1EA 5KTQA 3KWIA 1RBVA 4AM7A 4KTQA 3OYBA 4CECA 1RTDA 1D9DA 3T1HK 2HMIA 4CEEA 4FJ7A 2CH6A 4CZGA 4BG9A 3IDHA 2ZGYA 1Q81O 4CEOA 5M1PA 3VOVA 5J2QA 4FWOA 4CEQA 4HHTA 1K8AO 1GOBA 3HP9A 4KTZA 3QBWA 1WUAA 1VQNN 1YVUA 3OY9A 5AQVA 4C8MA 4DF8A 4FOEA 3HPGA 4FWNA 3VQQA 1TKZA 3ISNC 1JLBA 1RDDA 4B9NA 3V81A 4CJWA 4CEFA 4U7BA 4N5SA 3CG7A 1T7PA 4H5VA 1BDGA 2F9TA 1LCUA 3PX6A 1RT6A 1H1VA 2D0PA 1L3TA 3CYMA 2WC9A 4IG0A 4JI2K 3CFPA 5JLFA 2JWKA 2YV0X 1L3VA 3LDSA 3KTQA 1HJOA 4H0XB 3PSFA 4FLVA 4CHPA 2Q97A 3HVTA 1BO5O 4CJ5A 4JI7K 5JS1A 3JAMO 1TK8A 3OYHA 3CM5A 4K8ZA 2A5XA 1VQLN 3DLRA 1OVYA 2Q3SA 3VTHA 3D45A 2NRHA 4PL8A 1NGHA 4M41A 1RBTA 2VWJA 1KC8O 2FBVA 2NRRA 4GV9A 3OYCA 1ATNA 2PBDA 3QB0A 1QQMA 3LWLA 1EQYA 3BEXA 3WNFA 3LDQA 3CCEN 1KAYA 4JD2B 2IC3A 2FSJA 4H0TB 3VQ7A 4LF7K 3CPEA 2QWLA 3D2EB 3VQ8A 3V6DA 4Y1DA 5BPMA 4K42A 3AVNA 2O8DB 4DQPA 2E4LA 3NGZA 1NMDA 4QOZB 3TAPA 3L8BA 1EO1A 2O4GA 1RFQA 3DI6A 4DTOA 4CZKA 3TSQA 3EKSA 5F1XA 4FSVA 3DYAA 5GAHP 2FSNA 2P5GA 1XMOK 4BWMA 4I9QA 4FZXC 4CBXA 4CFCA 4FJ5A 4FLTA 4CJPA 3KK7A 2ZJQL 5TKWA 1ZXOA 2HOEA 1T3VA 4J2EA 2PZSA 1NU0A 1LW0A 4CHQA 5HRSA 2VCPA 3MMVA 4RCHA 2Q31A 2FBTA 2PYLA 3LZIA 3ALYA 2KHOA 1QVGM 4WCEL 2G8IA 3EN9A 3HPHA 3VESA 1XNRK 1VSEA 4CJTA 4ZTJA 3KIOA 5JVHL 4B3RK 2D1KA 5C24A 4KHUA 1YTAA 3G25A 1NOYA 4FYDA 3V9ZA 3D7EO 4DKWA 3WXKA 3SUPA 2G8VA 5DK5A 1VQ6N 3TI0A 3NH1A 1IH7A 1SL0A 3ZT2A 3O9TA 2QI2A 4CBUA 3WNHA 1UAXA 4IXCA 2YKMA 4DV2K 3JYTA 3PX4A 3AO5A 2W40A 4LF9K 2P9PA 2Y1IA 5KPRA 4CZFA 3AARA 3VEZA 1OH6A 3E1YA 5BR8K 4BRIA 1WLJA 4Z4CA 4EHTA 3CJAA 1ATRA 3U8XA 4KB0A 1ILYA 3P5JA 3DLKA 4CJRA 4CZIA 3HTVA 2KLAA 4DFKA 3RWUA 4HVJA 4BDZA 4ID1A 5EU7A 3OYLA 3CQXA 3AVJA 4JRPA 1K8KB 4FPAA 5EXWA 1UA0A 3FFKB 2UXDK 1VQ7N 1X1PA 4FK4A 4DSFA 2VG6A 3M8SA 1HUXA 2RE2A 4EP5A 2WUSA 3KHYA 2NZTA 1XC3A 3HSCA 4BC2A 2FBYA 5SWMA 5LJVA 1NGAA 4X66K 2OCEA 3SLCA 1HQUA 4JKAA 3NAEA 1JCEA 4A57A 4PKHA 1S6PA 1KFSA 2IVOA 4OPAA 4BC4A 2ZWHA 4A59A 3DLHA 4HTUA 2GELA 5E84A 1T03A 4ELTA 3C0BA 4AHSA 5A2QO 2YNHA 5M1NA 4BE0A 3OS1A 2F7TA 1VQ9N 3BF3A 4KFBA 2F9WA 1YF5L 4CEDA 1JJ2M 5IWAK 3D0PA 1VQ5N 1J54A 3VEWA 3MCPA 4CIEA 2OZSA 4WF9L 5I9EB 4DTSA 3NVKA 4GKJK 3PUFA 4BVPA 1IKXA 4Q0BA 1VK0A 2FF6A 1NK4A 3U4LA 3HOSA 4BREA 3S3NA 1R0AA 3EO3A 4A61A 2P9NB 1VQKN 3WEEA 1LWFA 3B8AX 3RRGA 4CGGA 4JS4A 3W0LA 1QHTA 4FWKA 4B1ZA 2WOMA 3IRXA 4Z0UA 4FK0A 1FK9A 2E2OA 4FW2A 5AQOA 4QCLA 1XWLA 4FPBA 5HRNA 4NYFA 1QQOA 2PAVA 4ZHRA 1K6YA 4MQ3A 1IG9A 2QXLA 3L2UA 3LWMA 3LAMA 4GNIA 5SZTA 4IZ9A 3CQYA 1KD1O 2UU9K 2YI1A 1WSHA 2YHXA 3IKMA 2AP1A 4DSIA 4JEPA 3WNGA 5CHIA 4Z4FA 3AVLA 4K25A 3FFIA 3L3UA 2CH5A 2A6AA 1NJXA 2P5OA 3S3MA 4BRHA 1I94K 1RBRA 2ITGA 1WSJA 4ELVA 5D3GA 5EOYA 4DUYK 4OKJA 3LDNA 1TGOA 1LWEA 4K0KK 1UOCA 2GUPA 3SI6A 1ASVA 4IFVA 3CCQN 1MDUB 2E2NA 3JXUA 2D0CA 1Q86O 2CGKA 2P9LB 3VTIA 4Z4HA 4OGEA 1NGJA 4Z4EA 4EHUA 4AF1A 3J80O 3DMJA 2D0OA 3DOLA 5ELZA 2FLOA 3SQ0A 1FXXA 1S6QA 5LMNK 3LPTA 1C0UA 1REVA 1VRTA 5AQRA 3V9SA 3E66A 2E2QA 3OYIA 1HJRA 3F9KA 3SAGA 4CZEA 3PO5A 2QWQA 4OX9K 3A5OC 1HKBA 1KXPA 3E9PA 4RW4A 1VAZA 5BPLA 1DT9A 3A5LC 1J53A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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