2E2NA

Crystal structure of sulfolobus tokodaii hexokinase in the apo form
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
298
structure length
298
Chain Sequence
b'MMIIVGVDAGGTKTKAVAYDCEGNFIGEGSSGPGNYHNVGLTRAIENIKEAVKIAAKGEADVVGMGVAGLDSKFDWENFTPLASLIAPKVIIQHDGVIALFAETLGEPGVVVIAGTGSVVEGYNGKEFLRVGGRGWLLSDDGSAYWVGRKALRKVLKMMDGLENKTILYNKVLKTINVKDLDELVMWSYTSSCQIDLVASIAKAVDEAANEGDTVAMDILKQGAELLASQAVYLARKIGTNKVYLKGGMFRSNIYHKFFTLYLEKEGIISDLGKRSPEIGAVILAYKEVGCDIKKLIS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords HEXOKINASE
publication title Crystal structures of an ATP-dependent hexokinase with broad substrate specificity from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus tokodaii.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus tokodaii
molecule tags Transferase
total genus 109
structure length 298
sequence length 298
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2006-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2nA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2nA01
2Q36A 2P9KB 4EAHD 4DCHA 4PL8A 4BROA 2FLOA 2PBDA 4QS8A 4IJNA 2J4RA 3DWLA 4J8FA 1WOQA 2P9UA 4H0OA 3GBTA 2QWPA 5AQZA 3UE5A 4CZLA 1HKBA 2V7YA 5AQLA 1GLEG 2FSKA 4NO7A 1YAGA 3HM8A 5AQFA 1BG3A 3QICA 3QBXA 1NGGA 2ZGYA 1E4GT 4CD3A 3A5MC 5ADXA 4RCHA 3MMVA 1XC3A 1EQYA 2GUPA 4M7YA 4B1ZA 1ZBSA 2HOEA 3WXKA 1YXQA 4B9QA 1NM1A 2A5XA 4FWSA 1SQKA 4FOEA 1ATRA 4H0XB 4K43A 5AFUA 4IWVA 4BC5A 3UKUB 2A42A 4BRQA 3A5NC 3VEXA 2NZTA 3VEWA 3WQTA 3ZETB 4BR5A 2QXLA 3MN9A 1NMDA 2W40A 4PKHA 5BRHA 4CZGA 4BRPA 4DB3A 3VEYA 3TU5A 4O5FA 3VF4A 3WXJA 4B1UB 1SAZA 5BR9A 3QDKA 2FF6A 3ZX2A 4WQ4C 1GLAG 1QZ6A 3L0QA 4MLHA 3CERA 3O5BA 3LDLA 4XEIA 2IVNA 2YJFA 2V52B 3VEOA 5LJWA 5AQOA 1NBWA 1TYQA 3WEEA 4JD2B 4K25A 4L3QA 1T6CA 1ATNA 1BU6O 4I6MA 3HZ6A 4BR2A 2PAVA 3ENOA 3UKRA 3A8YA 3CQXA 2I7NA 3UB5A 3DXKB 4CZJA 3VGLA 3IFRA 3GG4A 4BGBA 3KVGA 4CJ7A 1H1VA 4GY2B 5BPLA 2W41A 1X3NA 3D2FA 4C23A 1GLCG 1RGIA 1NGAA 3ZX3A 2E1ZA 2P9SB 3CJAA 3LM9A 4YDUA 3EZWA 1NWKA 3D2EB 4K41A 3FZFA 4QS9A 1BA1A 1ZXOA 3CJ7A 3QMLA 1HKCA 1C0GA 2P9IB 1T44A 1HPMA 2ZF5O 3G25A 4CZFA 1GLLO 4CZHA 4FWLA 4ISFA 3M6GA 3L4IA 2OANA 2QWQA 2QW9A 4HWIA 2YJEA 3ATUA 5EXWA 1HX1A 1OKJA 5I9EB 2QM1A 1P8ZA 2YHYA 4FWMA 3CI5A 4BRDA 5EX5A 5AR0A 4H5WA 4KBOA 3S41A 3VERA 2Q31A 4FWKA 1JCGA 3ZEUB 1K8KB 3CETA 3W3DA 1XUPO 3WT0A 5BRFA 3O08A 5KQ8A 2ASOA 3F9MA 4BRLA 1G99A 4BG9A 5JMVA 4Y0WA 3FGUA 4CD1A 1BA0A 4A2AA 1NGHA 4BRMA 1QZ5A 1HLUA 3HBTA 4MLEA 3CQYA 3VESA 4BC3A 3M3ZA 1BO5O 4H03B 1NGDA 4HTLA 1Q18A 3ULEA 3H1VX 3UKUA 5EOYA 4DHYA 3CJBA 3SMSA 3BF1A 2V51B 2P9LB 5KPRA 4BRFA 3SJHA 3L6QA 3ZETA 4CBUA 3JXUA 2QWRA 5AQNA 3VEVA 2GEMA 3A5LC 3CJ9A 3BEXA 5F2RA 5E26A 4K42A 3BF3A 1XQSC 3RSEB 1X9JA 1SZ2A 2F9TA 4CZMA 1KAZA 4IO8A 4IXCA 4H5TA 4WQ4A 5BREA 4JD2A 4WQ5C 5AZIB 2CGLA 1KXPA 1LOTB 4IZ9A 4ISGA 2E2QA 5ELZA 1NGEA 3SMPA 3WQUA 3LDNA 4BREA 3H1QA 2CGJA 3DXKA 3EKUA 4QS7A 5EVZA 3JS6A 2E2PA 1E4FT 5FPEA 5BN9A 2A40A 5BRDA 3O6WA 3ATVA 3C7NB 4H5VA 5AQHA 4FPBA 2D1KA 1GLDG 1QQMA 2CGKA 3H6EA 4B1VA 4BRAA 3P4IA 3VEZA 2P9SA 3VETA 1MDUB 5AQGA 3LM2A 4FWPA 2IVPA 2E20A 3D2EA 1D4XA 4H0TB 3AARA 4PL7A 1GLFO 2P9IA 4CI6A 5FPNA 3MN5A 3EL2A 1CZAN 1HJOA 3LDQA 2WUSA 2YCHA 1NGBA 1TUUA 3R9PA 3CIPA 2E1YA 2Q2RA 4FWQA 4BRIA 4BRKA 3R8EA 5B8HA 1NGJA 4FO0A 1LCUA 4CBWA 2VYPA 2P9PB 4XH1A 1S3XA 2V7ZA 4Z94A 2A6AA 1U2VB 3MK6A 1K8KA 4M63C 3ZEUA 4BRGA 4IJAA 1JCEA 3GE1A 1GLBG 1Z05A 3FR0A 3U4LA 1R59O 2HMPA 4JHDB 3MN6A 4JN4A 3DXMB 1S22A 2P9KA 4MO5A 4CBXA 4BQLA 3I8BA 4BRNA 4JNEA 3MCPA 3QFUA 4FWOA 4A61A 3WXLA 5AQMA 5LJVA 4O8KA 4B1XB 5BPMA 4LC9B 3VOVA 3FZHA 4FWRA 1T6DA 4H5NA 3HSCA 4CZEA 2P9LA 3AAQA 5ADXH 4PKIA 5AQSA 2DPNA 2D0OA 4FWNA 5BPNA 5JICA 3UKRB 1NGFA 5TKYA 1YVNA 4A2BA 2E2NA 1JCFA 4XH5A 3EKSA 2A41A 5AQXA 4H5RA 3RSEA 5AFUH 3EO3A 3HI0A 2I7PA 1RFQA 4JAXA 3BP8A 3BUZB 2ZWHA 5AZIA 4F9OA 3O1BA 3H3OB 2P9NB 3VF2A 2BTFA 2GTDA 1NLVA 4A62A 3ZX0A 4WQ5A 2GELA 3FZKA 3CHWA 3R6MA 4B1YB 1BOTO 3C0BA 2EWSA 4H0YB 1WUAA 2IVOA 3QFPA 1J6ZA 4AM7A 5E84A 1MA9B 3FLCO 3O8MA 3C7NA 3J8AA 3DJCA 2FSJA 2ASPA 1MWKA 1BUPA 4BR9A 2VCPA 3U8XA 4GNIA 1X3MA 1NGIA 1ATSA 1DGKN 2YHWA 5AQIA 4FL9A 4BGAA 1TUYA 3TPQA 1ZC6A 5AZJB 3MDQA 5AQJA 3O80A 4EHTA 3B8AX 5EY4A 1IG8A 4WYBA 4MO4A 2Q0UA 2Q97A 4PKGA 1DEJA 3CJCA 3U9ZA 1QHAA 5FPDA 2D4WA 1BDGA 5AQQA 2E88A 3FFKB 3VGKA 3FZMA 2QWLA 3WXIA 2P9PA 2IIRA 4BVOA 2Q1NA 5AQYA 3ULEB 3ENHA 1HUXA 2ASMA 1U2VA 4BC4A 2P9UB 1QQOA 4EIAA 2H3GX 5JLFA 4BR4A 3SK3A 1KAXA 4BC2A 1IJJA 1KAYA 4JHDA 3LDOA 3CJ1A 3DXMA 2E8AA 5KPZA 3IUCA 2AA4A 3VPZA 2A3ZA 3GDQA 1V4TA 1NGCA 2QWNA 1C0FA 5AQPA 3LDPA 3O4WA 3LL3A 2KHOA 2NLXA 4M7XA 2GWJA 3VF6A 3WUHA 2D0PA 3W0LA 3M1FA 4EFHA 3H46O 5AQVA 3GOIA 1GLJO 4BRCA 2FSNA 3VENA 3GL1A 1BWFO 1U6ZA 4BR0A 5KQDA 3FZLA 5AQWA 5AQUA 4B1WB 4CZKA 2NRHA 5F0XA 3O1WA 4RTFD 2FF3B 4EHUA 3KHYA 3H3NO 1HKGA 3H45C 2YI1A 2ITMA 3I33A 1DKGD 3IMXA 2CH5A 1ESVA 4FOIA 4BG8A 4BVPA 3ID8A 1RDWX 2P9NA 5FPMA 4H0PA 5AQTA 1QQNA 4NB4A 3A5OC 4RWTA 3VGMA 5AQRA 5CE3A 1TYQB 2GWKA 3FE1A 3U9DA 2VWBA 4FSVA 3WEEB 4DQ8A 4I6MB 2UYTA 4H0VB 4BQZA 3A0IX 5KPTA 3EN9A 4E1JA 3QBWA 3QB0A 2CH6A 5LY3A 2HF4A 2ZGZA 5BN8A 2F9WA 4YDUC 1MWMA 2YHXA 2E2OA 3D2FB 4AM6A 3D7EO 3AY9A 3SLCA 3DAWA 4FPAA 2AP1A 4BR7A 5AQKA 5AZJA 3MN7A 2QWOA 3IDHA 4XH4A 1Z6RA 3HTVA 3KZBA 3OHRA 2QWMA 3AAPA 2FXUA 4CZIA 5F1XA 1YUWA 2HF3A 1V4SA 1Y64A 2Q0RA 4BRHA 4ISEA 5JLHA 2BUPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2P9KB 4PL8A 4DF4A 2PYJA 3CCRN 4YOXA 1C1AA 2PBDA 4KO0A 4Y1DA 3IKMA 3DWLA 1NKCA 3KLIA 3GBTA 5HLFA 3NF9A 3OYCA 4KHPK 2D0CA 4PHTX 5AQFA 4CVNE 1KLNA 2ETJA 4CGDA 1SL0A 1N34K 3P31A 4RCHA 1ITGA 3PY8A 2O8CB 4CHOA 2GUPA 5KTQA 5C0YA 3B6PA 3OY9A 4DSKA 4CIGA 1WSGA 3G0ZA 1JXEA 1ATRA 2VGMA 1ZBUA 1ILYA 2A42A 4JEPA 1LV5A 3S3NA 1Y97A 3A5NC 4CCHA 1U48A 1YF5L 3OYIA 3CCUN 1T03A 4E89A 3MN9A 2HHQA 2WONA 4PKHA 3K59A 1TVRA 4DB3A 1TK5A 3VEYA 3L2RA 1BIUA 3LANA 3EYZA 3K5OA 3ZX2A 3L0QA 2UU9K 3O5BA 4WFBL 4M3YA 3LDLA 2YJFA 1YT3A 4X65K 4L3QA 4YY3K 3CFPA 1ATNA 4I6MA 4IOAL 2PAVA 3UKRA 3A8YA 2BH1A 3ITHA 1UOCA 4XIUA 3VQ4A 1F21A 3HP6A 2W42A 1H1VA 4GY2B 2W41A 1G15A 3D2FA 3L8BA 3SUNA 1GLCG 4I9QA 1P90A 2X6NA 4DMNA 4LFAK 3EZWA 3BDPA 4C8MA 4CEZA 1BA1A 1WSFA 3AO4A 4K0KK 3G25A 2ZM6K 2NRTA 3IG1A 3THXB 1DLOA 1B9FA 1YTAA 4DTPA 2QW9A 4JI1K 4DSEA 2YJEA 2JWLA 1HX1A 4FJIA 1ZBIA 4N47A 3C6HA 2YHYA 3NVKA 2IOCA 5LMNK 4KB0A 1VSLA 4H5WA 3VERA 2Q31A 3DLGA 4GV3A 1JCGA 4OKKA 1K8KB 3W3DA 3L2VA 1RT4A 1XUPO 4YNQA 3HOSA 2QK9A 4FM0A 4B8CA 5JMVA 4Y0WA 1NJWA 5HL7L 4A2AA 4BRMA 2PY5A 4FZZA 1HLUA 1SV5A 1NK0A 4DV4K 3VESA 3ID6A 3VQ5A 4HTLA 4F2SA 2QI2A 4M3RA 2XY7A 3AGRA 3UKUA 3CJBA 5H1SQ 1VQPN 3OTOK 3CPWM 3MEEA 5KPRA 3CFOA 3L6QA 3QEXA 3ZETA 4CBUA 3JXUA 4FK2A 2XRIA 1KVBA 3DMJA 1NKBA 4KV8A 5AQNA 4DUZK 3ENBA 3M5RA 3VTHA 1RT5A 4DSJA 3LWLA 1IV0A 1QSYA 2F9TA 4CZMA 4WQ4A 2KZMA 5BREA 4OJRA 3TAPA 4JD2A 2O8EA 2CGLA 5ELZA 3KK7A 4ISGA 3R3LA 4B9SA 1NGEA 4LD0A 2WC9A 3LDNA 5CYMA 3EKUA 4KHYA 5HP1A 4QS7A 3RMAA 4E7KA 4DFPA 2VG5A 4BE1A 5BN9A 4A57A 4C8LA 2A40A 5BRDA 1U47A 4CEEA 2RN2A 3C7NB 4H5VA 5AQHA 4CJPA 2D1KA 1GLDG 3L2UA 1D5AA 2CGKA 4KAZA 4BRAA 1RT1A 3RRGA 2EHGA 4R79A 3VETA 3OW2M 1WB9A 5AQGA 2IVPA 2O4GA 1UA1A 3DLHA 3DOKA 1X9SA 1S5JA 3OYJA 3G6EN 1WSEA 3EL2A 4X66K 1D9DA 1FKPA 2YCHA 4B8AB 2NRZA 1TV6A 3R9PA 1VQ8N 1TKXA 1L3SA 4E7LA 3KIOA 4FWQA 1WSHA 4JKCA 4Z4EA 1SUQA 4FO0A 4JLHA 4CBWA 3O9SA 3KKRA 1CLQA 3HXMA 4JKDA 2ITGA 5SZTA 2V7ZA 4Z94A 4B9LA 1WSIA 3MK6A 4LFCK 5DM7L 4NCAA 1RTDA 2HMIA 3KK2A 3GE1A 4DS5A 4DS4A 1GLBG 3NAEA 4GKJK 4AQYK 2P5OA 2WBNA 2HMPA 4JHDB 4FJ5A 2P9KA 4CBXA 2HBKA 1QHTA 4BQLA 3QINA 3OYHA 3MCPA 3QFUA 3TAMA 2DY4A 3WXLA 1C1CA 1RCHA 3FZHA 4FWRA 1T6DA 4H5NA 2D0AA 3PUFA 3AO2A 2PZSA 3NH0A 4B9UA 1TAQA 1N33K 2DFHA 5TKYA 4A2BA 2GUIA 4DV2K 1NG9A 3SQ0A 5SWMA 1EO1A 1BHLA 3DI6A 3P38A 4O5BA 3LZIA 3AVGA 3QO9A 3E9LA 2ZWHA 2A1RA 3H3OB 4Q5VA 2Y1JA 1NLVA 4A62A 1A5VA 3R6MA 3CXCM 1OVYA 4H0YB 1RBTA 1MA9B 3J8AA 3SPYA 3DRRA 3TI0A 4DV0K 2ASPA 1QTMA 1MWKA 4KTWA 1BUPA 3D6RA 4HTUA 2HHSA 4CGGA 3V9ZA 3U8XA 4FJLA 4IG3A 4GNIA 4AHTA 1ATSA 3SBTA 3K58A 1TUYA 1JLEA 1S6QA 1ZC6A 5AZJB 3O80A 2B6AA 4JI8K 3O9RA 4MO4A 3OBYA 1IBMK 2RF2A 2Q97A 4ILHA 3FZMA 3OYAA 1S9GA 3AA4A 4W5QA 4NCGA 1R0AA 2QXFA 4IKFA 3ENHA 2G8UA 1RBVA 1QQOA 4EIAA 3CCMN 2DFFA 3SK3A 3VQCA 4ELUA 1IJJA 1KAYA 4CK2A 1C6VA 3AVNA 3IUCA 3D45A 2AA4A 2A3ZA 1C0FA 5AQPA 3O4WA 4NXMK 2WTUA 3Q7BA 5CY4A 2NLXA 4M7XA 1YJ9N 1QSLA 1TK0A 4IG0A 4CJQA 1ZBFA 3DLEA 1GLJO 3HVRA 2FSNA 3VENA 5IT9O 2PYLA 4DTSA 2Q3SA 5M1PA 5AQWA 4FM2A 2HHWA 3H08A 3LWMA 1VQNN 4CZKA 3O1WA 2FF3B 2YHBA 3HVTA 4ELVA 4AILC 1CZ9A 5KI6A 2CH5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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