2E2NA

Crystal structure of sulfolobus tokodaii hexokinase in the apo form
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
298
structure length
298
Chain Sequence
MMIIVGVDAGGTKTKAVAYDCEGNFIGEGSSGPGNYHNVGLTRAIENIKEAVKIAAKGEADVVGMGVAGLDSKFDWENFTPLASLIAPKVIIQHDGVIALFAETLGEPGVVVIAGTGSVVEGYNGKEFLRVGGRGWLLSDDGSAYWVGRKALRKVLKMMDGLENKTILYNKVLKTINVKDLDELVMWSYTSSCQIDLVASIAKAVDEAANEGDTVAMDILKQGAELLASQAVYLARKIGTNKVYLKGGMFRSNIYHKFFTLYLEKEGIISDLGKRSPEIGAVILAYKEVGCDIKKLIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords HEXOKINASE
publication title Crystal structures of an ATP-dependent hexokinase with broad substrate specificity from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus tokodaii.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus tokodaii
molecule tags Transferase
total genus 109
structure length 298
sequence length 298
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2006-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2nA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2nA01
4HWIA 1TYQA 2P9PB 4BRGA 3O8MA 4JHDA 2HOEA 4PKIA 1GLLO 1ZXOA 2P9KA 4BG8A 2A42A 2KHOA 3VOVA 5AFUA 5AQTA 4AM7A 1YXQA 4DCHA 3ZETA 4BVOA 5I9EB 4CBXA 4H0OA 5CE3A 1BG3A 2FXUA 4A2AA 2VCPA 1WUAA 2E2NA 1S3XA 3CJ1A 4BVPA 4CZLA 4BRHA 1NLVA 3EZWA 3ATVA 1NGDA 3D2FA 4CZHA 3WT0A 3CETA 3H1QA 3LDLA 4K43A 3VF2A 3VGLA 5AQYA 2FF3B 4RTFD 1XUPO 3WXLA 5LJWA 3LDQA 1E4GT 3QFPA 1LCUA 2PAVA 4H03B 2CGLA 2IVOA 1ZC6A 3QICA 3ENHA 3WUHA 3DXMA 3J8AA 4BR4A 5AQJA 3IFRA 5AZIB 3U9DA 2QXLA 2A6AA 5BRDA 2A41A 3H3NO 1SAZA 4DB3A 4JD2B 1NGEA 1ATSA 5AQXA 5AQZA 1NBWA 2YHXA 2ZWHA 2E20A 3FGUA 3QDKA 3EKUA 4BRCA 1GLAG 2HF3A 4FWPA 1MA9B 5AQVA 4RWTA 1NGHA 5AQQA 4IJNA 4CJ7A 2GTDA 1YVNA 2DPNA 2NLXA 1LOTB 3EL2A 4A2BA 3KVGA 3QBXA 4XH4A 5JMVA 2F9TA 1HX1A 3FFKB 4BRNA 4PKGA 5EVZA 2CH6A 2E1YA 2PBDA 3ZX3A 4PL8A 3VF6A 3D2EB 3CJ9A 4JNEA 4BRLA 2NRHA 5EXWA 5AQSA 3B8AX 4FPAA 4BGBA 2YJFA 3GOIA 4QS9A 3AAPA 1TYQB 2VYPA 1MWKA 4EFHA 1QHAA 4BG9A 4JHDB 2D0OA 2P9KB 4CD3A 1GLJO 3ENOA 3WXKA 1U2VA 2A5XA 2Q97A 4CZKA 2E2OA 3QB0A 3ZETB 3MCPA 5KPTA 2V7YA 2V7ZA 3WQUA 5F0XA 4BRDA 5AFUH 1NGJA 3WXJA 4CZIA 4H5TA 1EQYA 3IDHA 4LC9B 4BRFA 1G99A 1YAGA 4BC2A 3GE1A 4H0VB 3S41A 3D2FB 4CZJA 3DAWA 4B1VA 4K25A 3MK6A 2ZF5O 2GWJA 3R8EA 3IMXA 4MLHA 2J4RA 3EN9A 2QW9A 3H6EA 2QWNA 4B1YB 1QZ6A 3SJHA 4CBUA 2Q31A 4BRMA 4E1JA 3LDPA 4H5VA 4BR5A 2QWRA 4IJAA 4PKHA 2CGJA 2D1KA 5KQ8A 3VERA 3DXMB 4BQZA 1NGIA 5AQIA 4WQ4A 3MN7A 5AQUA 3C7NA 1V4TA 1BU6O 1X9JA 3SLCA 3VEZA 1NM1A 3HM8A 5AZJA 4BROA 3O4WA 1BA0A 3DWLA 3AY9A 4A61A 2Q36A 1QQOA 4H5WA 1C0GA 3VEWA 5JLFA 5B8HA 1X3MA 1RGIA 3MDQA 5AQFA 3H3OB 1WOQA 1C0FA 3LDNA 4FWSA 4FPBA 4H0YB 5AQMA 1BDGA 5BR9A 3R6MA 3EO3A 2P9IA 3HI0A 2UYTA 1OKJA 1NGCA 3ZX2A 2GEMA 4MLEA 5BRHA 1RFQA 4QS7A 2ASMA 4CD1A 3FZFA 1DEJA 1BO5O 3H46O 2EWSA 3JS6A 1KAYA 3FR0A 2W41A 1IJJA 5AQHA 3H1VX 5KPZA 1U2VB 4BR2A 4FWKA 1GLCG 4FWQA 4HTLA 3VPZA 1GLBG 1RDWX 3A0IX 2QWMA 4J8FA 3M3ZA 3ZEUA 1Z05A 4BGAA 5JLHA 4DQ8A 5BN8A 3GG4A 4ISGA 4H0TB 3CERA 2A40A 2ITMA 4FOEA 3A5LC 3CHWA 4ISEA 4WQ5C 3TPQA 2P9LA 4JN4A 4WQ5A 5KPRA 4BC5A 3CJ7A 4BC3A 3LM9A 3VENA 2QWOA 3FZLA 4GNIA 1YUWA 3AARA 3UE5A 4BRQA 2BUPA 2QWPA 1H1VA 4MO5A 4FWOA 1GLEG 3D7EO 3SMSA 2A3ZA 4EHUA 3CJBA 3GBTA 3EKSA 3HZ6A 5BPNA 1MWMA 3CJCA 3VGMA 1QQNA 2HMPA 2WUSA 5BN9A 3C7NB 1HUXA 2P9UA 3UKRA 4Y0WA 4QS8A 3JXUA 1ESVA 5AZJB 3L6QA 4BRPA 5TKYA 3KZBA 3KHYA 4ISFA 3SK3A 3DJCA 4B1WB 5AQWA 5AQNA 3OHRA 3O1BA 4K41A 5LY3A 2GWKA 2FSNA 3O6WA 2GELA 4CZFA 3CQXA 4B9QA 4BREA 3O08A 2P9IB 1HKGA 3CJAA 4GY2B 1Q18A 3O80A 1NGAA 2NZTA 5EY4A 1TUUA 5FPEA 1HKBA 3G25A 3L4IA 1BOTO 4C23A 1TUYA 2ASPA 2Q0UA 3L0QA 4IO8A 3VETA 4KBOA 3U9ZA 4I6MA 3M6GA 2FF6A 1BUPA 5JICA 3FZMA 1DKGD 3BF3A 3VEOA 3I8BA 3TU5A 1NGFA 4MO4A 5ELZA 3VEVA 2I7PA 2VWBA 3A5OC 3GL1A 4O5FA 3R9PA 4WQ4C 2Q1NA 4H0XB 4XH5A 3LL3A 2QWLA 4PL7A 3ZEUB 5KQDA 1D4XA 3VESA 3F9MA 4DHYA 5FPMA 4CZMA 3O5BA 1K8KA 3UKUA 2AP1A 2YHWA 4AM6A 2AA4A 3HBTA 1J6ZA 3QFUA 4BR9A 4O8KA 1HJOA 1XC3A 1SZ2A 3CI5A 3ZX0A 1BWFO 4XH1A 1KAXA 2P9LB 5FPDA 3H45C 3VGKA 3RSEA 1ATNA 1Y64A 2V51B 1P8ZA 4BRKA 2P9NA 2IVNA 2GUPA 4BC4A 3MN6A 4FWNA 2OANA 5LJVA 3A5MC 3HTVA 3FE1A 4FWRA 2E8AA 2HF4A 5AQLA 2FSKA 3LDOA 1X3NA 1Z6RA 4F9OA 4NB4A 2Q0RA 3BEXA 2P9SA 2QM1A 2YCHA 2ZGYA 4H5NA 5BPLA 2E2QA 5ADXA 3A8YA 1BA1A 2P9UB 3UKRB 3BP8A 1JCGA 3VF4A 3ULEA 3WXIA 3O1WA 4EAHD 5AQRA 5AR0A 4BRIA 4CBWA 2IVPA 1U6ZA 4RCHA 1HPMA 3MMVA 2CGKA 2FLOA 4EIAA 1R59O 3ATUA 1ATRA 2F9WA 4BR7A 1S22A 3LM2A 2CH5A 3CQYA 4H5RA 4M63C 3WEEA 2E88A 2P9PA 1SQKA 3ID8A 5E26A 4FL9A 1GLFO 4FO0A 4I6MB 2YI1A 4CI6A 1ZBSA 2D0PA 3I33A 2ZGZA 4CZGA 2I7NA 4CZEA 3M1FA 4B1ZA 5F1XA 5BREA 1KAZA 4B1XB 1DGKN 2E1ZA 1XQSC 4BQLA 4Z94A 3VEYA 3MN9A 5FPNA 3BF1A 5AQPA 1JCEA 3U4LA 1GLDG 3MN5A 3UKUB 1K8KB 1T6CA 3UB5A 4JAXA 5BRFA 3CIPA 3A5NC 1NGGA 3U8XA 1V4SA 3DXKB 1T44A 4BRAA 4FWLA 4FWMA 5AQGA 5F2RA 3RSEB 3P4IA 3HSCA 1QZ5A 2P9NB 2H3GX 4XEIA 2BTFA 5EX5A 1CZAN 5AQOA 1KXPA 1NGBA 3FZKA 3QBWA 3QMLA 5AZIA 4H0PA 5AQKA 3IUCA 4JD2A 4IXCA 2P9SB 2YHYA 2ASOA 1JCFA 5E84A 4A62A 4EHTA 1NWKA 2V52B 4M7YA 3VEXA 5BPMA 3ULEB 1E4FT 2YJEA 4B1UB 3FLCO 2D4WA 2W40A 3AAQA 3WQTA 4K42A 4NO7A 5ADXH 2E2PA 4FOIA 3W3DA 4IWVA 2FSJA 1NMDA 1QQMA 4M7XA 1HLUA 3GDQA 4IZ9A 1HKCA 4L3QA 3W0LA 4FSVA 3FZHA 3SMPA 1T6DA 3C0BA 1MDUB 3D2EA 4WYBA 3BUZB 2QWQA 5EOYA 2Q2RA 3DXKA 4YDUC 1IG8A 4YDUA 2IIRA 3WEEB 4BR0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZM6K 4AILC 4F3TA 2FBYA 4B3OA 1BQNA 4RW8A 1NK8A 2P9KA 1RBUA 2HBMA 1EETA 4FJLA 5AFUA 5AQTA 4WFAL 5LMUK 3OVNA 1T03A 5D3GA 1KQSM 3U3YA 3EEQA 4H0OA 4QCLA 4A2AA 3DI6A 3LP2A 2P5OA 1S3XA 4BVPA 4N56A 3HPOA 3EZWA 5J1EA 3ATVA 1NK0A 1NGDA 4JK7A 4WFBL 4FJIA 4JLHA 3VQ4A 4X65K 3CETA 3H1QA 3O9SA 4JKHA 3CMEN 5AQYA 2FF3B 3WXLA 1XUPO 4DSJA 4JS4A 4C8LA 1W2BM 4N5SA 4B3MK 2W42A 4H03B 4IG3A 2XY6A 3J8AA 3MWTA 4E3SA 1VAZA 2QXLA 3NCIA 3L2VA 1D9FA 1NGEA 3AA4A 3MEEA 5AQXA 4KHPK 2YHXA 3EE9A 4LD0A 2ZWHA 2E20A 4BRCA 1NGHA 1LOTB 3NBPA 1YF5L 4A2BA 3KVGA 4Z4FA 4GV6A 1XC9A 3T7ZA 3FFKB 4ELUA 2PBDA 1C1BA 3ZX3A 4CF1A 4C8KA 4JNEA 4DUYK 5EXWA 3E9LA 4L8RB 4CIFA 2G8IA 5MLCQ 2O8EA 3F73A 5HOOA 1QHAA 2P9KB 4CD3A 3E01A 2HHHK 2A5XA 1LAWA 1KVBA 4OPKA 2RKIA 1CXQA 1WAJA 4KB0A 1J54A 3WQUA 1NK5A 1NGJA 4O0IA 3L8BA 4CZIA 1EQYA 4CJSA 4BRFA 4BC2A 4H0VB 4RW6A 3MCAB 4FJMA 4Z4IA 4LFAK 5JS2A 2ZF5O 3CFPA 3R8EA 4B3TK 1HQEA 1VSEA 3IMXA 2PFUA 4MLHA 3B6PA 1QVFM 3VQ9A 4CGHA 1QZ6A 4OPAA 4CBUA 1YHQN 3IS9A 1M1KO 4DSIA 3TSUA 2VWKA 2QWRA 4KHNA 3CC4N 2HBJA 4PKHA 1Z26A 4E0DA 3CXCM 4C8NA 2KFNA 4CEAA 4WQ4A 3AVMA 3C7NA 3KKSA 1WBBA 1V4TA 4CCHA 1X9JA 3D0PA 2D5RA 3CF5L 5AZJA 3O4WA 2KKZA 4RG8A 4A61A 1QQOA 1TV6A 3KLFA 4KI4A 1XMQK 3VEWA 4DV4K 2Z1GA 1IKXA 4CE9A 3TI0A 3H3OB 4H0YB 4FWSA 4CJVA 3OA9A 1ZBUA 4I9LA 2QEXN 5M1KA 3R6MA 5C12A 2P9IA 4LFBK 3OY9A 3SQ4A 3AO2A 2ZE2A 4FK0A 3ZX2A 4MLEA 3CCQN 2P1JA 3TTFA 2DFFA 4BE0A 4B3RK 2IAJA 2X6NA 1RT6A 3VQEA 3O9TA 3K57A 2O8EB 2W41A 2RE2A 3J7AP 1HYZA 5AQHA 1S9GA 2KTQA 5HLFA 4JRQA 4FWQA 3HXMA 1GLBG 3QIOA 4LH5A 4DTNA 2QWMA 4J8FA 3M3ZA 3AVKA 3TTDA 4X64K 3V6DA 4AHSA 2EHGA 5JLHA 3EZ5A 3THYA 3L2RA 3VN5A 1S1XA 3QEXA 3VQ8A 1DT9A 4DQ8A 5BN8A 3GG4A 4ISGA 4KB1A 1WSJA 3TPQA 2IOCA 4A59A 4JN4A 2E6LA 1NKBA 5KPRA 4BC3A 1N8RO 1I94K 2OTJN 3FZLA 3P83D 1N36K 4IEIA 4CFAA 4CIEA 1TK8A 4C8OA 1H1VA 2QWPA 1D9DA 3PV8A 4FWOA 1KFDA 1VSHA 4EHUA 1T05A 3HZ6A 4IDKA 5BPNA 5HBMA 4F8RA 3LWMA 4CECA 2G8WA 3VGMA 2HW3A 3C7NB 4CJ3A 4Y0WA 3JXUA 1ESVA 1TKZA 5AZJB 5TKYA 3SAGA 3KHYA 4FJJA 3NGZA 3DJCA 3CPWM 1JLQA 1EWRA 5AQNA 4LH4A 2KFZA 5JVGL 3ASMA 3O6WA 3QETA 3V9UA 5DM6L 3S3MA 2P9IB 1HKGA 1RTJA 3HVRA 1Q18A 1C1CA 4KHYA 1TUUA 3G25A 1IH7A 4DSLA 4C23A 2WONA 4IO8A 2B5JA 3U9ZA 4I6MA 4CJQA 1SS6A 3TAEA 3FZMA 1NG9A 1DKGD 2NRRA 3BF3A 3VEOA 4FM2A 5JS1A 3TU5A 1NGFA 2G8FA 3ZT1A 3VQ5A 2I7PA 2VWBA 3A5OC 3GL1A 3MAQA 2RPIA 3OJSA 1A5VA 2WBNA 4PL7A 4B8AB 3V9XA 3QEPA 4QOZB 3HOTA 4F4KA 3THYB 2YHWA 4AM6A 5CR4A 1J6ZA 3LPTA 1KTQA 3HPHA 2VGMA 3SV3A 4CHYA 4YORA 1RTDA 4KO0A 3VGKA 2FBVA 3RSEA 3MEDA 1Q81O 3AVJA 4BRKA 2O8CA 2P9NA 4DF8A 5LJVA 1EO1A 4OGEA 1BL3A 2UU9K 1WSGA 3DRRA 4JI0K 1HNZK 1X3NA 4F9OA 4NB4A 1NJZA 3LZJA 2NRXA 4KH4A 1IKVA 4MDAA 3NMUA 1BA1A 3O1WA 5AQRA 5AR0A 4BRIA 4YOWA 1TL3A 3QINA 1Q9YA 2IVPA 4DFPA 1U6ZA 1I39A 3ID6A 4HVJA 3PLAA 1EP4A 3DLRA 3IKMA 2FLOA 4CJ4A 3DMJA 1ATRA 4BR7A 4YOUA 3SQ0A 3BZCA 4KH5A 3LAMA 3TAGA 4DTRA 1Q8IA 2P9PA 1SQKA 4YOXA 2P5GA 4OX9K 5FDLA 4I6MB 4J2AA 4KPYA 2D0PA 3E1YA 1W0HA 3VTIA 1EXQA 4Y1CA 5F1XA 1J5EK 5BREA 1T8EA 2E1ZA 1XQSC 4R79A 1IV0A 1Q82O 5C25A 1VQPN 3O3FA 1M90O 1U49A 1JCEA 3U4LA 3MN5A 2XY8A 3EYZA 4JAXA 3L3UA 4B08A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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