5AQIA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 121
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqiA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqiA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqiA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqiA04
3LDLA 3QBWA 4CBWA 2ASOA 4B1WB 3SK3A 3LL3A 5AFUA 4CZIA 3MN7A 1RGIA 2ASMA 2D0PA 1S22A 4FWMA 5AQYA 3A5OC 1ESVA 3TU5A 3ENOA 5AZJA 1JCGA 4A2AA 3FE1A 2AA4A 2QXLA 1BO5O 4H03B 1E4FT 1EQYA 2ZGYA 3O5BA 2YHYA 1KAZA 3HTVA 4BRMA 2AP1A 5EOYA 1ATNA 2Q0UA 3UB5A 4HWIA 4BR2A 5CE3A 1CZAN 5AQNA 3M1FA 1SAZA 1BA1A 4IXCA 2GWJA 5EY4A 2FF3B 3HI0A 3VF6A 4FPBA 5BRFA 1HLUA 2W41A 2YHWA 3OHRA 3RSEA 5FPNA 2DPNA 1P8ZA 4BQZA 1NGIA 3AY9A 3ENHA 4BRHA 4WQ5C 4CI6A 3O1BA 3ZETA 1XUPO 2E2OA 1X9JA 1YXQA 2IVNA 1GLJO 3LDNA 2NLXA 1Z6RA 3A5LC 4ISFA 3UE5A 3VF2A 4B1ZA 4FWKA 5AQZA 1HKCA 4I6MB 5LJVA 2FSJA 2P9IA 3R8EA 4CZEA 1ATRA 4CZHA 4H0PA 4B1VA 5AQIA 4RCHA 4BROA 4YDUC 4BC3A 3FGUA 4WQ4C 3VGKA 4A62A 3UKUB 3EL2A 4BGAA 3O4WA 5KPRA 3GE1A 5AQSA 2P9PB 3SMPA 4H0VB 4H0XB 3A0IX 3VF4A 2QWOA 4NB4A 5AQOA 3ZX3A 3JXUA 3DWLA 2CGJA 5JLFA 4QS9A 5BRHA 3WEEB 2HF3A 2A40A 2QW9A 1ATSA 3FZMA 3LDPA 3HM8A 1YVNA 4K43A 4BR0A 3FFKB 5AR0A 4BRIA 4IJNA 3ATUA 1BG3A 3BEXA 3LM9A 4PKIA 1DGKN 4E1JA 2E2QA 3CQYA 1S3XA 3FLCO 2E1ZA 4RTFD 5AZJB 3EZWA 2VYPA 1ZXOA 2P9UA 2A41A 3WUHA 4BC2A 5E84A 3FZLA 3MK6A 5FPDA 4FWOA 3D2FA 2KHOA 1Q18A 3D2EA 1X3NA 1NGAA 1YAGA 2FF6A 4H5NA 4XEIA 3SMSA 3U9ZA 3CJBA 4I6MA 2Q2RA 2QWMA 1K8KA 3IFRA 3CJCA 3ZX2A 1HX1A 4B1YB 4DB3A 4NO7A 2NZTA 4BRCA 3ZEUA 3TPQA 4EFHA 3DXMB 5LY3A 3UKUA 4A2BA 4FOIA 4FWQA 1BOTO 2P9KA 1D4XA 4BR7A 4IZ9A 2E20A 3UKRA 3GL1A 5FPEA 3WEEA 1QZ5A 3ZETB 4IWVA 3FZHA 3LDQA 5AQFA 3EO3A 4BRFA 4BC4A 4RWTA 1GLBG 3BF3A 5BRDA 3C7NB 2J4RA 4CZFA 3FR0A 2V51B 5JICA 4BRKA 2UYTA 1GLEG 2BTFA 3WT0A 1LCUA 1RDWX 1IG8A 3VEZA 2P9IB 5I9EB 1GLAG 4FO0A 4BRNA 3C0BA 5BPNA 2V7ZA 3CIPA 4FWSA 5EXWA 4LC9B 5AQPA 4IO8A 1JCEA 3G25A 3L0QA 4ISEA 2GELA 3H46O 2FLOA 2P9LA 4Z94A 1KAXA 1NWKA 5EVZA 4K25A 5BR9A 3B8AX 3WQTA 2GTDA 3A5NC 3BUZB 1KAYA 3QFUA 2ZWHA 3DXMA 1NMDA 3U4LA 4WQ5A 3IUCA 5AQGA 5AQTA 3MN5A 3S41A 4BGBA 2E8AA 3O1WA 4BRQA 3L6QA 4L3QA 3KVGA 5AQMA 3MMVA 4BG8A 4MO4A 5JMVA 2IVPA 5AQRA 1NBWA 5ELZA 2P9UB 2IIRA 5AFUH 2FXUA 3C7NA 4CBXA 2BUPA 3D2FB 5FPMA 4GY2B 3D2EB 3GBTA 1WUAA 2ITMA 1Z05A 2ZGZA 1G99A 3VENA 5E26A 4YDUA 3AARA 3H1VX 2QM1A 1K8KB 3EKUA 4WQ4A 3VEVA 5AQKA 2I7PA 4FWRA 2E2PA 4IJAA 1GLLO 3ZEUB 4H5RA 3W0LA 4BREA 3GG4A 4CZGA 2P9KB 3AAQA 1ZC6A 3AAPA 3I8BA 4H0OA 3UKRB 4AM6A 4M7YA 5JLHA 2D1KA 3GDQA 3SLCA 4GNIA 2YCHA 3VOVA 1U2VB 4BC5A 1SQKA 4PKGA 2GWKA 3F9MA 2A6AA 5KQ8A 3U9DA 4BRLA 3WXIA 5AQHA 3CI5A 3DJCA 3SJHA 4H0TB 1OKJA 2CH5A 3P4IA 1T44A 3GOIA 5F2RA 5KPTA 2OANA 4DQ8A 4CJ7A 2P9LB 1KXPA 2A3ZA 4XH5A 4A61A 1NGDA 3CQXA 4B9QA 2V52B 1NGBA 2YJFA 2VCPA 4M63C 3QBXA 1HKBA 3A5MC 2YJEA 2Q1NA 3WQUA 3CJ9A 3DXKA 2YI1A 2E2NA 1T6CA 4O8KA 1NM1A 1QQMA 4QS7A 2A5XA 4KBOA 4C23A 4B1UB 4XH1A 4BRAA 2FSKA 1U2VA 1BA0A 2Q0RA 3M6GA 1T6DA 3LM2A 1HKGA 1HPMA 1YUWA 2E88A 2CGKA 1TUUA 2P9SA 3BP8A 4H0YB 2PAVA 3IMXA 4BRGA 5AQUA 5BPLA 1QHAA 4FWNA 5B8HA 2CH6A 3QB0A 2Q97A 1Y64A 1HUXA 4FPAA 4JHDA 2WUSA 1QQOA 3LDOA 4PL7A 2E1YA 1MDUB 4O5FA 4J8FA 2QWPA 3CJ1A 2P9NA 2VWBA 3ATVA 2QWLA 3IDHA 5ADXA 4K42A 5F1XA 3O08A 3R6MA 4BRDA 1RFQA 2A42A 3QICA 3ULEA 3VEXA 4FSVA 1XC3A 2PBDA 1IJJA 3FZFA 3ZX0A 1SZ2A 1X3MA 1BWFO 4EHUA 2ASPA 2CGLA 4ISGA 4AM7A 5LJWA 2W40A 3CJ7A 1DEJA 3M3ZA 3HZ6A 1HJOA 2FSNA 1NGJA 1DKGD 5AQJA 1MWKA 4DHYA 1V4TA 4FWLA 1U6ZA 4K41A 2GUPA 3HSCA 2HOEA 4EAHD 2HF4A 4BR5A 1BU6O 4H5TA 4FWPA 3QFPA 3R9PA 3MN9A 5TKYA 1R59O 4CZJA 3CETA 3J8AA 3EN9A 3BF1A 4HTLA 3KZBA 2F9WA 1C0GA 5AQVA 2GEMA 1WOQA 2IVOA 4H5WA 3VGLA 5AQQA 3W3DA 3L4IA 5AQXA 4JAXA 1NGGA 3DXKB 4MLHA 1GLFO 1NGHA 4H5VA 1E4GT 3HBTA 2QWRA 3VEYA 4JD2B 4PKHA 4DCHA 5ADXH 4PL8A 5AQWA 4BR4A 1C0FA 1NGCA 4CZMA 3WXJA 4FOEA 1ZBSA 2D0OA 4WYBA 4JNEA 4CZLA 4Y0WA 1BUPA 3U8XA 3DAWA 3QDKA 4B1XB 1JCFA 2P9SB 2Q31A 4BQLA 1TYQB 3KHYA 4MO5A 5AZIB 1MA9B 4MLEA 3FZKA 4EIAA 4JHDB 3MN6A 1XQSC 3VEWA 4CZKA 2NRHA 3I33A 3O8MA 1NGEA 2P9NB 2Q36A 1H1VA 4XH4A 3WXKA 3VESA 3D7EO 2HMPA 5BN9A 1J6ZA 1MWMA 2I7NA 3CERA 3CHWA 3A8YA 3ULEB 3VERA 2V7YA 4M7XA 2D4WA 2QWQA 4CD1A 2EWSA 3H3NO 4BR9A 3MDQA 3H1QA 3H3OB 4CD3A 5KQDA 4QS8A 3ID8A 5BREA 2H3GX 5EX5A 1QZ6A 4JD2A 3QMLA 1GLCG 3WXLA 3VEOA 3H6EA 5BPMA 3CJAA 3VETA 4BVPA 1QQNA 2ZF5O 4BVOA 4CBUA 1BDGA 1TUYA 3JS6A 3O6WA 4F9OA 5KPZA 1NLVA 3EKSA 3VPZA 5AQLA 4BRPA 4BG9A 1GLDG 3RSEB 1TYQA 4EHTA 5BN8A 3VGMA 1NGFA 2QWNA 2P9PA 5AZIA 4FL9A 3H45C 4JN4A 2YHXA 3O80A 5F0XA 1LOTB 1V4SA 2F9TA 3MCPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HK2A 3QBWA 4NYNA 4CEDA 1O13A 1DJTA 3MN7A 1T1TA 5I3UA 5AQYA 3PSFA 4DQQA 2IC3A 4Q5VA 3A5OC 5CY4A 4C8NA 2B6AA 1JKZA 5AZJA 3J7YP 3R3LA 4A2AA 4DSFA 2YNHA 1QSYA 1RT3A 4CESA 3HTVA 3OS0A 1KFDA 1NMNA 1M90O 4DV2K 3HT3A 4KH6A 2FBVA 1T7PA 2O8BB 4FLVA 1JLFA 1KVAA 3RMBA 4E0DA 3M1FA 1SAZA 4Z4IA 3OJSA 3VQ6A 5HRNA 4LFAK 3KJVA 4IXCA 2GWJA 4CEAA 1O1WA 5M1KA 2FF3B 1R0AA 1IBKK 1HLUA 4CERA 3DLHA 4JI6K 3B6PA 4DU3A 1Q9XA 1KSPA 2O8FB 5CZ1A 4OKEA 4KHQA 3AY9A 4DFPA 2G8VA 5KGWA 5D3GA 4CFDA 3QNOA 1TKTA 3ZETA 3RTVA 2IVNA 4FCYA 1BCOA 1RDDA 2F8TA 1YI2N 3CQ8A 3UE5A 1IKWA 3VF2A 4B1ZA 4FWKA 3QLHA 3DMJA 3R8EA 4OKKA 2O8CA 3K57A 4CHOA 1CN2A 2D0BA 4BC3A 5M1QA 4AF1A 4BGAA 1J5OA 2KLAA 2G2KA 5KPRA 4CHYA 1JLCA 2P9PB 3HYFA 2QWOA 3ZX3A 1LQIA 1U47A 5JLFA 4QS9A 5BRHA 3AA3A 1WSJA 1ZBUA 1HNXK 4LF9K 4K43A 1XRSB 1YVNA 1RBRA 4BR0A 1NG9A 4BRIA 4E1NA 5C42A 1EKEA 3BEXA 1XMOK 1S1UA 1KD1O 3O9UA 3DOLA 5MLCQ 1NKCA 4HTUA 3O9TA 1ZXOA 1F21A 1GPTA 2A41A 4NXNK 4WF9L 3O4QA 1P0AA 3V1RA 3T19A 4BC2A 2DY4A 3VQ9A 1Q18A 4M3RA 1X3NA 4H5NA 1QVFM 3ALYA 1OZZA 2QWMA 3IFRA 2KBHA 3HSTB 3I8DA 2PYLA 3K0SA 1XHXA 1I39A 4DQRA 2HBKA 3F9KA 1KVCA 4A2BA 4FOIA 1WBDA 1BOTO 4IZ9A 3QEPA 4W5NA 3GL1A 3AO5A 2NY9X 4AEIA 2OZSA 1W7AA 1B7DA 3NF9A 3VMFB 2VG6A 4JRQA 2J4RA 2YC1C 3F2KA 3ITHA 2IOCA 3FR0A 2V51B 4FK4A 4DR6K 4C1NK 3VEZA 3JSMA 1GLAG 2YNFA 4IBNA 3I56N 3C0BA 1K9MO 4FWSA 1BIUA 4AHUA 4JK8A 3SUNA 4IO8A 3G25A 3H46O 2FLOA 2JDQD 4KH5A 4Z94A 3WQTA 2D0CA 3A5NC 2O4GA 4Y1DA 1KAYA 4KHSA 1DTTA 4RW4A 4H4MA 4OGEA 4JI5K 3HP6A 3C6HA 2OTJN 5DMRA 2W6KA 3AVNA 3ZSYA 4BRQA 4F3OA 5KRTA 3MMVA 4HUGA 5AQRA 5EU7A 1NBWA 3HXMA 5ELZA 2P9UB 4DS5A 3NE6A 3QETA 3PX4A 4ILJA 3OYCA 2BUPA 5FPMA 4Z0UA 4GY2B 4JKHA 3CM6A 4CIGA 3H1VX 4WQ4A 2QM1A 1K8KB 4CJQA 3U3YA 2ETJA 4KHUA 3VEVA 3ZT4A 5AQKA 4HUFA 4FWRA 2E2PA 1W2BM 2LSNA 1L5UA 2YNGA 1LW2A 2RE2A 3W0LA 2VGMA 3BK3C 4FLWA 3QNNA 4GMJB 1HNZK 3RWUA 3MXMA 4H0OA 3UKRB 4R5PA 2D1KA 3GDQA 3OYDA 3VQ5A 4BC5A 3OYAA 2D5RA 5T7BA 2I5JA 3NF8A 4PKGA 2HHVA 3F9MA 1X1PA 1C0TA 5KQ8A 3V9XA 1WSIA 3WXIA 4HHFA 1RT6A 1RT7A 4IFYA 2N66A 4K8XA 3LP0A 5KPTA 1N6QA 1XNQK 2OANA 4HHTA 1YTUA 3FFIA 4OX9K 4XH5A 4KB1A 1TL3A 2KSKA 4A61A 4B9QA 4M63C 2VCPA 3SUOA 4ILGB 1L3SA 5HRSA 4N76A 3CJ9A 4NCGA 3DXKA 3VTIA 4ID1A 3SNNA 3AVHA 2VG5A 3ZYYX 1B9FA 1REVA 1IBMK 4PWDA 4B1UB 1CXQA 1S5JA 4JRPA 4LH5A 2FSKA 5HL7L 1N5YA 1YT3A 2Q0RA 3ENBA 3M6GA 3AO1A 1J9AA 3CCQN 3OBYA 2E88A 2HHUA 3BP8A 5FRNA 4CJEA 1CHZA 3LAMA 5BPLA 1IKVA 2NRTA 2Q97A 1VAZA 1VHXA 2MBKA 4JKGB 4LD0A 1SN1A 4JEPA 3QO9A 3I0SA 4PL7A 3CFRA 5A2QO 1ZUTA 3NVKA 3L56A 2QWPA 5C12A 1XHZA 4QAGA 1YITN 3SBTA 2G8UA 5GINA 4DWIA 2QWLA 1NJIO 1FJGK 4B9TA 5C0YA 2VWJA 2O8DA 4FSVA 1XC3A 3KOWA 2A1RA 3ZX0A 1SZ2A 2XHBA 2P1JA 2ASPA 4LSNA 2CGLA 3RRHA 4DQIA 4AHRA 3HZ6A 3KLFA 3TAGA 1Q82O 4DFKA 3QINA 2NY8X 4DQSA 1VQPN 3E9LA 3HSCA 1JL1A 2WFBA 1W97L 4DV1K 1HQEA 2F96A 3U6FA 4FZXC 1LAVA 2YKNA 3CCEN 4CW7B 4LFBK 1R59O 3ZT3A 4CZJA 3CETA 3J8AA 1ASWA 3VQ8A 3CPEA 1PTXA 4FLXA 3KZBA 3OYEA 2KZMA 3KKSA 3T7ZA 1JLGA 4CGIA 1NKEA 4O4GA 4IDHA 2MZ0A 3W3DA 3WNEA 3C95A 3J7AP 4MLHA 1E4GT 3HBTA 2QWRA 3VEYA 3DLGA 3HRGA 5ADXH 1RILA 5M1OA 5AQWA 3LP3A 2ZE2A 1WAJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3HK2 A;  3QBW A;  4NYN A;  4CED A;  1O13 A;  1DJT A;  3MN7 A;  1T1T A;  5I3U A;  5AQY A;  3PSF A;  4DQQ A;  2IC3 A;  4Q5V A;  3A5O C;  5CY4 A;  4C8N A;  2B6A A;  1JKZ A;  5AZJ A;  3J7Y P;  3R3L A;  4A2A A;  4DSF A;  2YNH A;  1QSY A;  1RT3 A;  4CES A;  3HTV A;  3OS0 A;  1KFD A;  1NMN A;  1M90 O;  4DV2 K;  3HT3 A;  4KH6 A;  2FBV A;  1T7P A;  2O8B B;  4FLV A;  1JLF A;  1KVA A;  3RMB A;  4E0D A;  3M1F A;  1SAZ A;  4Z4I A;  3OJS A;  3VQ6 A;  5HRN A;  4LFA K;  3KJV A;  4IXC A;  2GWJ A;  4CEA A;  1O1W A;  5M1K A;  2FF3 B;  1R0A A;  1IBK K;  1HLU A;  4CER A;  3DLH A;  4JI6 K;  3B6P A;  4DU3 A;  1Q9X A;  1KSP A;  2O8F B;  5CZ1 A;  4OKE A;  4KHQ A;  3AY9 A;  4DFP A;  2G8V A;  5KGW A;  5D3G A;  4CFD A;  3QNO A;  1TKT A;  3ZET A;  3RTV A;  2IVN A;  4FCY A;  1BCO A;  1RDD A;  2F8T A;  1YI2 N;  3CQ8 A;  3UE5 A;  1IKW A;  3VF2 A;  4B1Z A;  4FWK A;  3QLH A;  3DMJ A;  3R8E A;  4OKK A;  2O8C A;  3K57 A;  4CHO A;  1CN2 A;  2D0B A;  4BC3 A;  5M1Q A;  4AF1 A;  4BGA A;  1J5O A;  2KLA A;  2G2K A;  5KPR A;  4CHY A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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