5AQIA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqiA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqiA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqiA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqiA04
3O6WA 4WYBA 1NLVA 3TPQA 4QS9A 3R6MA 1TYQA 3H6EA 3ZX0A 3ENHA 3VEVA 4BRHA 3FZLA 2YCHA 1ZC6A 2ZF5O 2V7ZA 4K41A 2VCPA 3D2EB 2AA4A 4H0YB 4CZEA 4BR5A 1ZXOA 1CZAN 4BR0A 4CZMA 3O1WA 5AFUA 4BR4A 3A5LC 4CZGA 2Q0RA 5AQHA 1LCUA 1QQOA 3U9ZA 4O8KA 5E84A 4CZLA 3M3ZA 2FXUA 3H46O 1KAYA 1NM1A 4BRDA 4FWKA 5FPDA 4IZ9A 2F9TA 2E1ZA 4RTFD 1OKJA 2J4RA 1NGBA 1E4GT 4FOEA 5ADXA 3P4IA 4MLHA 3FLCO 1MDUB 5BRHA 1GLLO 2HOEA 1NGGA 4WQ5C 1X3MA 1TUYA 3EO3A 4AM6A 5F1XA 4BRMA 1E4FT 3QICA 2E2NA 5KPRA 1T44A 3EL2A 3VEXA 5TKYA 4NB4A 2IVOA 3CJAA 5AQIA 1RDWX 3ZEUB 4JD2B 4PKIA 3BF3A 3R8EA 2P9KA 5KPZA 4CI6A 3QFUA 5AQKA 2D4WA 2BUPA 2BTFA 4E1JA 3VEZA 1NGCA 1J6ZA 3FZHA 4IJAA 2KHOA 3HSCA 3DWLA 3VGKA 2QWMA 5ELZA 5EXWA 2VYPA 3FGUA 4FOIA 4Y0WA 3FR0A 3VGLA 2GELA 3CJ7A 3BUZB 2PAVA 3RSEA 4BRKA 3WEEB 3VESA 5EY4A 2CH6A 1SZ2A 5AQJA 3KVGA 5AZIA 1KAXA 3JXUA 1HPMA 4QS8A 3C7NA 3UE5A 2EWSA 3I33A 1IJJA 1NBWA 1WUAA 1BOTO 3GBTA 3ZETB 2P9SB 5AQFA 2A3ZA 1K8KA 4I6MB 3KZBA 3A5MC 3ULEB 2QWNA 4C23A 2P9UA 4F9OA 3ID8A 4EHUA 4A2BA 3U8XA 3WQTA 1NGDA 3H3OB 4IXCA 5BRDA 4WQ5A 1T6CA 1D4XA 3L6QA 1SQKA 2HMPA 1IG8A 1TUUA 2W40A 3MN5A 3O5BA 4FWMA 2F9WA 4CZHA 5AQYA 4ISGA 3UKRB 4BR2A 3AY9A 1T6DA 4EHTA 3A5OC 2P9LB 3H45C 1JCEA 4CD3A 3O80A 1GLAG 2YJFA 5FPEA 3AAPA 1C0FA 3DXKA 2P9NB 4JHDA 5JLHA 4H5WA 3BF1A 3IFRA 1HJOA 3TU5A 5AZJB 2HF3A 2PBDA 5JICA 4FWNA 4IWVA 3RSEB 1ATNA 3GL1A 4CZIA 5EOYA 1Z05A 1ESVA 4CZKA 1YVNA 3WXLA 4BQZA 1U6ZA 3LL3A 4RWTA 3VERA 3EZWA 3LM2A 4M63C 1NGHA 1BUPA 4B1ZA 3DXMB 3J8AA 2FSKA 4QS7A 2IVNA 5AQOA 4FWOA 4BREA 1Q18A 2E8AA 3VGMA 3SJHA 2GUPA 5KQDA 2P9IA 5AQUA 5AQMA 4BRGA 1U2VA 3FZMA 1ZBSA 4BRNA 3GDQA 1DEJA 3HZ6A 4GY2B 3HTVA 4MO4A 3WT0A 2ZGYA 1BO5O 1Y64A 4XEIA 4K25A 4PKHA 1HKCA 4BG9A 2VWBA 2YHXA 1YUWA 4FWRA 3QB0A 5KQ8A 3D2FA 1GLBG 3L4IA 2A42A 3O1BA 4EAHD 1BU6O 5FPMA 4MLEA 2H3GX 4B9QA 3U4LA 3GE1A 4J8FA 4BROA 2CGLA 3CJ9A 3VF6A 1BA1A 1QZ5A 2ITMA 4LC9B 4CJ7A 2P9PB 4IJNA 5BR9A 5BN8A 2ASPA 1H1VA 3DAWA 2NZTA 2E2QA 4H0OA 3A0IX 4FSVA 3CERA 3CI5A 4YDUA 2ZWHA 1TYQB 3BEXA 5BPMA 3HI0A 4BVPA 3CQYA 2OANA 3OHRA 4H5VA 3M1FA 4JAXA 1HLUA 4DB3A 3S41A 4K42A 3MDQA 4EFHA 5AR0A 2D0PA 3F9MA 3UKUA 4GNIA 2FF3B 3I8BA 3W3DA 4WQ4C 1U2VB 4BRQA 4BRLA 2GEMA 3MN7A 4B1WB 4BRPA 4FPAA 3L0QA 2QWLA 5F0XA 3D7EO 4NO7A 1GLEG 2V52B 4BC3A 1RGIA 4ISFA 1Z6RA 3ZX3A 4H5TA 5JLFA 1QZ6A 3M6GA 3CHWA 1V4TA 1NMDA 3D2FB 3EKSA 5JMVA 2A6AA 2V51B 4EIAA 3VEWA 2ZGZA 3CJBA 4JNEA 2NLXA 3QBXA 2YHYA 2V7YA 2QM1A 2E2PA 5AQVA 5AQNA 4H5RA 3LDNA 3LM9A 1BWFO 2WUSA 1GLFO 4H0VB 1GLDG 1LOTB 4BRCA 2DPNA 2P9KB 1BG3A 3D2EA 3WXIA 4FL9A 3WUHA 2CGJA 4BR9A 3CJCA 3MMVA 3ENOA 3H1QA 5I9EB 1NWKA 4FWSA 4BRAA 5EVZA 5BRFA 3CQXA 1SAZA 2Q0UA 4AM7A 4FWPA 4FPBA 4B1VA 4BG8A 1MWMA 4YDUC 2W41A 3ZX2A 1R59O 1YXQA 4XH1A 1QHAA 4H0PA 4BC2A 4WQ4A 4BGBA 2FSNA 5AZIB 5BPLA 2CGKA 3C7NB 1KXPA 3ATUA 1NGEA 2QWOA 3FE1A 5AQXA 3A8YA 3C0BA 3VPZA 1DKGD 3GOIA 1XQSC 4BRIA 2YI1A 3EKUA 2A41A 5LY3A 1K8KB 3SMPA 4CD1A 4K43A 2P9UB 3W0LA 2D0OA 2FSJA 4MO5A 3ZEUA 2YHWA 4JD2A 3VENA 3U9DA 2FF6A 3SK3A 3EN9A 4ISEA 3LDLA 4PL7A 1DGKN 2A5XA 4A2AA 4BC4A 4H0XB 4H0TB 2CH5A 4PKGA 5LJVA 1GLCG 3VEOA 4B1XB 3H3NO 3DXKB 4H5NA 3QBWA 2I7PA 4JHDB 4H03B 3JS6A 3UB5A 4BQLA 2E1YA 4M7XA 4XH5A 3WEEA 3MK6A 3WXJA 2Q36A 3LDPA 5BN9A 4B1UB 2Q97A 4KBOA 5EX5A 3O4WA 3WQUA 1NGJA 3O08A 1G99A 4DHYA 5LJWA 1BDGA 4BR7A 4JN4A 3ZETA 1V4SA 2P9SA 2Q2RA 3VETA 3GG4A 3H1VX 4IO8A 2UYTA 3IDHA 3VOVA 4I6MA 5AQSA 3ULEA 1BA0A 2QWQA 1MWKA 2YJEA 3QDKA 3ATVA 4CBXA 5AQRA 3G25A 5E26A 1MA9B 1HUXA 2P9IB 4A62A 3O8MA 1RFQA 4RCHA 2GTDA 4HWIA 1JCGA 1JCFA 3FZKA 3CIPA 4XH4A 4CBWA 4BC5A 3BP8A 1X3NA 4O5FA 3UKRA 4CBUA 2QWPA 3SMSA 4FO0A 5AQTA 2P9LA 5AQWA 5CE3A 4BGAA 2I7NA 3IUCA 2P9NA 5B8HA 1S22A 2HF4A 2NRHA 5AZJA 2IVPA 3HBTA 5BPNA 1HKGA 1NGIA 1HKBA 4L3QA 2AP1A 4CZFA 1ATRA 3QMLA 3LDOA 1NGAA 1ATSA 3A5NC 2ASOA 5AFUH 1C0GA 5KPTA 4Z94A 3CETA 3AARA 1KAZA 3MCPA 3IMXA 5BREA 3MN9A 1HX1A 2QWRA 5FPNA 2GWKA 3AAQA 3DXMA 1GLJO 3FZFA 2E20A 2E2OA 2GWJA 3FFKB 4DCHA 3VEYA 5AQLA 2A40A 3UKUB 2E88A 4FWQA 2D1KA 3CJ1A 1WOQA 3LDQA 5ADXH 1YAGA 3B8AX 5AQGA 3VF4A 5F2RA 4PL8A 3R9PA 2Q1NA 1NGFA 3DJCA 2Q31A 3MN6A 4HTLA 4M7YA 3VF2A 4DQ8A 1QQNA 4A61A 2ASMA 3HM8A 4BVOA 3SLCA 5AQZA 1X9JA 4FWLA 1P8ZA 2QXLA 4B1YB 2IIRA 3QFPA 3KHYA 1QQMA 1XC3A 5AQQA 3WXKA 5AQPA 2QW9A 2FLOA 1S3XA 4BRFA 4CZJA 1XUPO 2P9PA 1EQYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HNXK 1NLVA 5LL6Z 3TPQA 1K9MO 5C10A 3ZX0A 3VEVA 3FZLA 1EKEA 4NCBA 2HBJA 4WCEL 2GBZA 2KW4A 5SWMA 4OPHA 4CZEA 4BDZA 3O1WA 1BIUA 5AFUA 4F2RA 4BR4A 4CZGA 4KPYA 4DV6K 1I2UA 3T3FA 2KKZA 1TKDA 3OY9A 1QQOA 4O8KA 4FJ9A 1IBKK 4FM1A 3LP1A 4KH5A 4KTWA 4JRPA 4IZ9A 2E1ZA 4GV3A 1BQNA 4BECA 3H08A 3D45A 1JLEA 4FOEA 5CZ2A 5ADXA 4B9NA 1NOZA 4RG8A 3U3GA 3FLCO 1MDUB 1GLLO 2HOEA 3HSTB 3O9QA 3MEDA 2UUCK 4AM6A 2KLAA 5F1XA 2YILA 3PX6A 4BRMA 1K8BA 4YOUA 3S3NA 2P5GA 3CCUN 1T44A 2LY6A 3VEXA 1U4BA 5TKYA 1SL0A 1W9HA 1GOAA 2IVOA 1NU0A 4FLVA 4JD2B 4R79A 3R8EA 2E3GA 5KPZA 4DFMA 1N5YA 1NJZA 4JKGB 1TKZA 3ASMA 4U67L 2BUPA 4CJ5A 1RTHA 4K8ZA 1FXXA 5JENA 4H8KA 4IJAA 2ZM6K 3LP2A 2QWMA 5EXWA 4Y0WA 3FR0A 2QTDA 3L2QA 4IDHA 4X62K 2PAVA 2VY6A 4BRKA 1ITGA 2HHTA 3WEEB 3S5TA 5AZIA 3JXUA 4M3WA 1T0ZA 3V81A 4O55A 3EE9A 2OTJN 1WUAA 3WNEA 1T7AA 5AQFA 2QEXN 1ZFUA 4YORA 4JV5K 1NJWA 1ZBHA 4I6MB 4JI5K 2DTUA 3ULEB 4FW1A 4CJVA 3NHGA 1NGDA 2UXDK 1NKCA 1D9FA 4CIFA 1J53A 4WQ5A 1GPSA 3TAQA 1IG8A 3MN5A 3CCSN 2F9WA 3O9RA 3ZT0A 4CFBA 3A5OC 3H45C 4CD3A 1VQMN 1S1UA 5FPEA 3DXKA 1HYZA 4JHDA 3KLHA 4FJMA 3BF1A 4DV7K 1QSSA 3NF9A 1HJOA 5CHIA 1L3SA 3F73A 5M1KA 2E3FA 5JICA 4FWNA 3RSEB 4KI4A 4CESA 4JKBA 4JKEA 2O8EA 1RBTA 2NRZA 3O9SA 4CZIA 5JVHL 3L56A 4FLTA 3TAMA 4E19A 2OYQA 4FJHA 3LWMA 3MCAB 1CN2A 4GW6A 2FBVA 2LT8A 4ID1A 2Z1IA 4RWTA 3EZWA 2G2KA 4UQGA 4B1ZA 2DFHA 4O44A 4QS7A 4JEPA 1WWNA 4C1NI 2X74A 3SV4A 3SJHA 2GUPA 3ZSVA 2HNDA 1LWFA 3VQ7A 4IEIA 4A59A 4CEBA 5C0YA 4E7HA 1C55A 4DSKA 4E0DA 3HZ6A 3DOKA 1BO5O 2GX9A 1RBVA 3K9KA 1CXQA 4PHTX 3F9KA 4BG9A 1HKCA 2VWBA 4FM2A 3QEIA 1YUWA 1EP4A 3QB0A 1EWQA 3SAHA 2HNZA 3S3OA 4ILGB 1YJ9N 4EAHD 5FPMA 2DFFA 4MLEA 4EP4A 3PUFA 4BROA 2CGLA 1DLOA 3LP3A 1QZ5A 4RW8A 2KFZA 1YJWN 3V9ZA 4OPKA 1H1VA 2NZTA 2E2QA 4JI7K 3CERA 4BVPA 3HI0A 3OYGA 4H5VA 1HLUA 4CVNE 3S41A 4DWIA 3QEXA 3KP1A 2D0PA 1B9FA 4M3TA 4CF9A 4GNIA 4B3TK 4JS5A 4WQ4C 2O8BB 1U2VB 1U45A 4BWJA 3C6TA 4BRQA 2GEMA 4FPAA 4GV6A 3L0QA 3OYHA 1RT5A 3D7EO 2KYQA 1GLEG 3DRSA 2D5RA 2WC9A 4CJ4A 3SI6A 1Z6RA 3V1QA 3ZX3A 4DV5K 3M6GA 4BE1A 4M3RA 3D2FB 2UUAK 3SBGA 4EIAA 3AVKA 3VEWA 2ZGZA 3PY8A 2QM1A 2E2PA 3DRRA 3HP9A 4DTNA 4H5RA 5HL7L 1EETA 2QKKA 3KD5E 3RMAA 1RILA 4F2SA 1X9SA 1EXQA 1GLFO 3L2UA 4FVMA 4KHSA 1SN4A 4Y1CA 3AVNA 3DLEA 1S1VA 4FJLA 1KQSM 4CQKA 4BR9A 1BI4A 5KRSA 4DTJA 1S6PA 3E9OA 5EVZA 1I2VA 5BRFA 1WSIA 3SUOA 1SAZA 4FJ7A 2Q0UA 3E9LA 3K5OA 4DU4A 4A5BA 4FWPA 4FPBA 4B1VA 4BG8A 3SCXA 5GAHP 4JLHA 3DLBA 1R59O 4XH1A 3RTVA 4H0PA 3THYA 2XY5A 1QHTA 5CYMA 2FSNA 5AZIB 4BGBA 5BPLA 3ATUA 2K35A 2YV0X 4CJTA 3A8YA 4BRIA 3VPZA 1T7EA 4IEEA 2N69A 3HOSA 5EU7A 1C0MA 4HHFA 4J2BA 4M3YA 3LPTA 4K43A 2A7TA 3W0LA 2FSJA 2F96A 4MO5A 4NYNA 3CCEN 3V9XA 3LPUA 2ITGA 3K5LA 4FXDA 2PFUA 4CGDA 4CJ3A 2E2FA 2A5XA 4A2AA 4B3SK 3KK3A 2HHUA 1LAWA 1I39A 1UWBA 2VG5A 4B8CA 3AVJA 2UXBK 1IH7A 3DXKB 2IAJA 4H5NA 3QBWA 4JHDB 2YX6A 3WXJA 3MK6A 1OMYA 1NMNA 1FH3A 3CC4N 1Q8IA 3MWTA 3R1XA 3O08A 2O8EB 3KOXA 4DHYA 3AVIA 4HCCA 3ZETA 5C2DA 3VETA 3GG4A 2UYTA 3IDHA 1VQ9N 3NF8A 3B6PA 3RR7A 1BA0A 1BCOA 1YJNN 4CF8A 4CBXA 2HHVA 5AQRA 4N47A 3OYMA 3I55N 3NH2A 2E6MA 4FLWA 1HUXA 3O8MA 4RCHA 1WT7A 2GTDA 4HWIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1HNX K;  1NLV A;  5LL6 Z;  3TPQ A;  1K9M O;  5C10 A;  3ZX0 A;  3VEV A;  3FZL A;  1EKE A;  4NCB A;  2HBJ A;  4WCE L;  2GBZ A;  2KW4 A;  5SWM A;  4OPH A;  4CZE A;  4BDZ A;  3O1W A;  1BIU A;  5AFU A;  4F2R A;  4BR4 A;  4CZG A;  4KPY A;  4DV6 K;  1I2U A;  3T3F A;  2KKZ A;  1TKD A;  3OY9 A;  1QQO A;  4O8K A;  4FJ9 A;  1IBK K;  4FM1 A;  3LP1 A;  4KH5 A;  4KTW A;  4JRP A;  4IZ9 A;  2E1Z A;  4GV3 A;  1BQN A;  4BEC A;  3H08 A;  3D45 A;  1JLE A;  4FOE A;  5CZ2 A;  5ADX A;  4B9N A;  1NOZ A;  4RG8 A;  3U3G A;  3FLC O;  1MDU B;  1GLL O;  2HOE A;  3HST B;  3O9Q A;  3MED A;  2UUC K;  4AM6 A;  2KLA A;  5F1X A;  2YIL A;  3PX6 A;  4BRM A;  1K8B A;  4YOU A;  3S3N A;  2P5G A;  3CCU N;  1T44 A;  2LY6 A;  3VEX A;  1U4B A;  5TKY A;  1SL0 A;  1W9H A;  1GOA A;  2IVO A;  1NU0 A;  4FLV A;  4JD2 B;  4R79 A;  3R8E A;  2E3G A;  5KPZ A;  4DFM A;  1N5Y A;  1NJZ A;  4JKG B;  1TKZ A;  3ASM A;  4U67 L;  2BUP A;  4CJ5 A;  1RTH A;  4K8Z A;  1FXX A;  5JEN A;  4H8K A;  4IJA A;  2ZM6 K;  3LP2 A;  2QWM A;  5EXW A;  4Y0W A;  3FR0 A; 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