5AQIA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
total genus 121
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqiA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqiA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqiA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqiA04
3ZX0A 3CIPA 2DPNA 3UE5A 1V4TA 3H1QA 3QBWA 3GE1A 1MA9B 3M6GA 4O8KA 1SZ2A 1U2VB 3R6MA 5BRFA 3CERA 3O8MA 4K25A 4CZLA 3FZLA 3IMXA 4M7YA 4JD2B 1NGCA 5BPMA 3EN9A 3ZX3A 1T6DA 4BRQA 1NGHA 3A5NC 3FLCO 2Q1NA 4CZIA 1TUUA 4CZHA 5AQQA 2QWQA 5BRHA 5AQPA 4JHDB 2P9IA 3CJ9A 4JNEA 2VCPA 1GLCG 4BRKA 1QQMA 3UB5A 2QWOA 2P9KB 3BEXA 3QDKA 2GELA 2AA4A 1GLAG 4BC5A 4EIAA 2P9LA 3QMLA 4WQ5C 4B1VA 3L0QA 3H3NO 3VF2A 3HTVA 4IO8A 4H0VB 1YVNA 4CZGA 5FPEA 3M1FA 2P9PA 3AY9A 2GWJA 2NZTA 1TUYA 4BC4A 5CE3A 1RGIA 2A6AA 4XH5A 1MWMA 5LJWA 4XH4A 4MLHA 3IFRA 4CZMA 1X3NA 1NWKA 1Q18A 1S22A 5LY3A 3DXMA 5BREA 4FWLA 1SQKA 1HX1A 3QB0A 3WEEA 2F9TA 5BPNA 1H1VA 3A5LC 2YI1A 3FFKB 4IZ9A 2P9NA 3LM9A 4B1UB 1D4XA 3VEYA 5AQTA 4J8FA 5AQYA 4WQ4C 1ESVA 5AZIA 4M63C 3U9DA 4CBWA 4HWIA 4MO5A 3KVGA 4BR2A 4H5VA 5AQGA 5AQIA 3TPQA 4Z94A 2FLOA 3WXKA 4FO0A 4K42A 4DB3A 3SMPA 2D1KA 2EWSA 3CHWA 2H3GX 2A41A 4AM6A 1QZ5A 3O80A 1NGAA 2QWMA 5BPLA 3A8YA 4NB4A 4WQ4A 1T6CA 3D2EB 3GBTA 2E2QA 2V51B 3A5MC 3WQUA 1MDUB 4B1YB 1BA0A 4YDUC 1QQNA 2CGKA 3A5OC 4CD3A 1BA1A 5F2RA 1NBWA 4C23A 2QWRA 2HOEA 4ISFA 4RWTA 3GDQA 2E2NA 3H1VX 1RDWX 1JCEA 1YXQA 2E2OA 3O6WA 4YDUA 2P9UB 1ZXOA 2YJFA 5JLHA 3MK6A 4BRIA 1BOTO 3W0LA 3HSCA 2ZGYA 1HLUA 2Q31A 4BR5A 1TYQA 2ASMA 4DCHA 1KAXA 3GL1A 1BUPA 4GNIA 2PAVA 3R8EA 4PL7A 4MLEA 5AFUH 1E4GT 2Q0RA 4BVPA 2P9IB 3LDQA 2FF6A 3GOIA 4CBUA 3CJ1A 4H0PA 3FZFA 5EXWA 4BRLA 3U4LA 4FOIA 4BRNA 4XEIA 5AQUA 3O5BA 4WYBA 2W40A 3JS6A 3HM8A 2GWKA 4FL9A 3CJBA 4BRGA 2P9LB 5ADXA 1ATRA 2D4WA 4FWNA 3BUZB 4O5FA 3MN6A 1NGGA 3VETA 2ZF5O 1GLDG 4BC2A 1Z05A 3VEOA 2CGLA 2GUPA 3LL3A 2P9PB 3ZEUA 1NGJA 1ATSA 2GEMA 4BRPA 4CJ7A 2D0OA 4CI6A 5JICA 3EKSA 5EY4A 4H0YB 3DXMB 4BQLA 1U6ZA 2IVOA 4Y0WA 3VGLA 3SMSA 3VESA 3WEEB 3DWLA 3MN5A 3D2FA 2HF3A 1EQYA 4PKHA 2P9NB 4B1ZA 4NO7A 1NM1A 3U8XA 4BG8A 5AZIB 5KPTA 4QS7A 2WUSA 4A62A 5AQWA 3BF1A 5AQNA 4BRAA 4BR0A 4FWMA 3FGUA 5AZJA 4E1JA 4CBXA 2V7YA 3IDHA 4FPBA 4BRDA 3VEWA 2VYPA 3KZBA 3L6QA 5KQDA 3TU5A 2ASOA 5LJVA 4PKIA 3MMVA 4QS9A 3VENA 2AP1A 1V4SA 3ID8A 3WT0A 1C0FA 2I7NA 2QWPA 3I33A 5E26A 3LM2A 1DEJA 4RTFD 3MN7A 3CJCA 1R59O 2W41A 4L3QA 4FWPA 4IWVA 3ATUA 5AQRA 2ASPA 3O1BA 4BGBA 3F9MA 2J4RA 4H03B 3ULEA 3AARA 2Q2RA 4FWOA 3WQTA 3HZ6A 4K43A 5FPDA 1DKGD 3QFPA 3B8AX 1NGFA 1JCGA 1KAYA 3S41A 1CZAN 3LDPA 1K8KA 1HJOA 3WUHA 4CZKA 1IG8A 1TYQB 3CJ7A 3FZHA 4LC9B 2CH6A 4H5RA 2I7PA 5BRDA 4BC3A 4BRHA 3D7EO 3VPZA 2YJEA 4I6MA 3CQYA 2BTFA 1OKJA 4BG9A 5AQJA 1KAZA 2UYTA 3RSEA 4H5TA 2E8AA 5I9EB 4BVOA 3O1WA 3QFUA 5EX5A 5FPMA 3OHRA 3VEXA 4H5WA 3ENHA 3LDOA 2Q36A 2CGJA 1BDGA 5AQKA 1P8ZA 2QM1A 5AQXA 3WXJA 2IVPA 1NGBA 5KQ8A 2P9SA 4BR9A 2IIRA 1S3XA 4BRMA 1ATNA 2ZWHA 3ZEUB 1BG3A 3P4IA 1XUPO 2QW9A 3BF3A 2Q0UA 1MWKA 3EL2A 3VF6A 1NMDA 3WXLA 4BGAA 5F0XA 1SAZA 1NGIA 3JXUA 1XC3A 2HF4A 3EKUA 3KHYA 3C7NA 3QBXA 3VERA 1GLBG 2OANA 3D2FB 1LOTB 3CJAA 3UKUA 4AM7A 2QWNA 2A3ZA 5TKYA 1WOQA 3HBTA 1NLVA 3FE1A 3A0IX 3QICA 4RCHA 3H46O 4XH1A 2FSNA 1HUXA 3DXKA 4H0TB 4B9QA 4FWKA 4JN4A 5AZJB 4B1WB 5AQLA 3MCPA 4FWRA 1HKGA 3ENOA 4FOEA 3UKRA 3EZWA 2FF3B 2V52B 3BP8A 3IUCA 1QQOA 3LDNA 3MN9A 4FPAA 5ELZA 2NLXA 5AQZA 3ZETA 3O4WA 3DAWA 4KBOA 3VGKA 1X9JA 5ADXH 4A2BA 2E88A 2Q97A 2YHWA 5KPRA 3LDLA 2E20A 4CZJA 3ULEB 2E1YA 2A40A 1U2VA 4FWSA 4JAXA 3I8BA 3VGMA 1IJJA 4JD2A 4ISGA 3EO3A 2V7ZA 3W3DA 5EOYA 1K8KB 1Z6RA 4A2AA 1HPMA 4GY2B 5AQMA 1HKBA 3R9PA 4BRCA 4BQZA 3SJHA 1YUWA 1KXPA 4JHDA 5AQFA 3GG4A 4CD1A 4QS8A 4FWQA 1GLLO 4IJAA 3ZX2A 4I6MB 2E2PA 2YHXA 4WQ5A 3H6EA 2P9KA 4BR7A 5JMVA 2VWBA 3RSEB 5AQOA 1NGDA 3HI0A 4HTLA 2FSKA 1C0GA 3VEZA 2ITMA 3L4IA 1X3MA 4CZEA 5B8HA 2E1ZA 2A42A 1HKCA 1YAGA 5AQHA 4K41A 4ISEA 4DQ8A 4EAHD 1XQSC 4CZFA 5BR9A 2P9SB 2NRHA 3O08A 1GLJO 3H3OB 2IVNA 3CETA 4IXCA 2KHOA 2QXLA 5BN9A 4BROA 3U9ZA 5KPZA 1Y64A 3AAQA 2YCHA 2YHYA 5JLFA 5AQSA 4IJNA 5AQVA 3C7NB 1ZBSA 5F1XA 5AFUA 1QZ6A 1E4FT 3UKUB 1J6ZA 1NGEA 3DJCA 3C0BA 1JCFA 5BN8A 1BU6O 3FZKA 3ATVA 4H0XB 4DHYA 1T44A 4BRFA 4M7XA 3FZMA 3VF4A 5AR0A 4H0OA 4EHTA 4H5NA 3VOVA 5FPNA 2HMPA 2GTDA 1ZC6A 3DXKB 3G25A 4BREA 1WUAA 2FSJA 2D0PA 5EVZA 4BR4A 1GLFO 4A61A 3D2EA 1GLEG 3FR0A 1BO5O 2QWLA 4PL8A 3WXIA 3UKRB 1BWFO 2A5XA 3M3ZA 3H45C 4F9OA 2PBDA 3CQXA 5E84A 3AAPA 1G99A 4EFHA 4EHUA 1QHAA 2CH5A 2FXUA 3SK3A 4B1XB 4PKGA 2F9WA 2BUPA 1DGKN 3SLCA 3ZETB 2ZGZA 4MO4A 3VEVA 1RFQA 4FSVA 3J8AA 1LCUA 2P9UA 3MDQA 3CI5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DPNA 5GAEP 4ILJA 1L4VA 3KHWA 2HHVA 2UUBK 3M6GA 4BE2A 1SZ2A 4E0DA 3TAPA 3DMJA 4K25A 3SNNA 1MYNA 1HJRA 1K6YA 4M7YA 1T6DA 4B3RK 4AHCA 4ID1A 1RDAA 4KHQA 3IG1A 3AO4A 1I6GA 1KVCA 1TUUA 2XO7A 1HNZK 2XY6A 1S9EA 5K14A 3KK2A 5AQPA 2P9IA 3QETA 4YOVA 3F5TA 4C8MA 1DT9A 2GX9A 4CECA 1NRBA 2P5GA 4UAEF 3OJUA 2D56A 1I39A 3LP1A 1TL1A 3SV3A 1GLCG 3I0SA 3QEWA 4AHSA 4OKEA 1B7DA 1JLCA 1GLAG 4BC5A 4WCEL 3CMAN 3QMLA 4WQ5C 1GOCA 3NH2A 3ZYYX 5CY0A 3VF2A 1YIJN 3K9KA 4NXNK 4O0IA 4TSXA 3QLHA 1NK7A 2A6AA 5LJWA 3NH1A 3IFRA 2KFZA 4X66K 1DJTA 4DS5A 3QB0A 4CESA 4CJWA 1XMOK 3L2QA 3VQ9A 1H1VA 4FZXC 3TAFA 1NJXA 1JLEA 5C2FA 3NH0A 4B1UB 3VEYA 3E7UX 5AQTA 4J8FA 2O8FA 1QVFM 4HWIA 2LR3A 1B92A 4MO5A 4Z94A 3SUNA 3WXKA 3VQBA 4DB3A 4JRQA 2EWSA 3E66A 3QIPA 2LY5A 5LMNK 2A41A 1KRPA 2YNHA 3AVIA 4W5TA 5M1QA 2VQFK 3O80A 3OYJA 1VQMN 2QWMA 4FJ5A 4HHTA 4FJKA 4DU4A 2N2QA 3WQUA 1MDUB 4FK2A 1JLFA 1QQNA 3L2UA 1BA1A 4DV2K 4PQUA 1Q8IA 4AHRA 2QWRA 4C23A 4KAZA 3BGRA 4CJTA 1VAZA 1NPIA 4RWTA 2EHGA 4OPHA 5CYQA 4HTUA 3OYKA 1I94K 1WBBA 1VQ6N 3N4QA 4BDZA 4YDUA 1JLBA 1ZXOA 4BWMA 3MK6A 4WE1A 3S9HA 4V1DC 2A1SA 4BRIA 3CM6A 1LV5A 3HSCA 4IFEA 3RR8A 1YITN 1C1CA 2O8EB 1TYQA 4X64K 4PA1A 2ASMA 3DOKA 4DCHA 2XY7A 3C94A 2GMOA 3V9SA 3R8EA 3WNEA 2BGGA 4DWIA 3HOSA 4PL7A 4MLEA 4JLHA 1UGLA 2KBJA 1RBVA 4CEAA 4H0PA 4FJXA 1SKSA 5EXWA 1L3VA 4XEIA 4CGIA 1EP4A 1T8EA 2VG5A 3JS6A 2QKKA 5JS2A 3TSPA 3ZSVA 4AHUA 1NJWA 1ATRA 4IEEA 1M90O 2D4WA 2B5JA 3BUZB 2OZMA 1EWRA 2OCEA 3VQDA 3LL3A 2P9PB 1U45A 1ATSA 1JKHA 4KTZA 4B9SA 4CI6A 1TGOA 3LAMA 3K0SA 4I9QA 1S6PA 4JEPA 2BH1A 3VGLA 1OH7A 3WEEB 1X9SA 1NOYA 4DV7K 2HF3A 1QVGM 4OPAA 1NM1A 4BG8A 5AZIB 3P39A 1RT3A 2Q3SA 1ZVEA 5KPTA 2N69A 4CJ4A 1K9MO 4A62A 1IBKK 2VWKA 3KOWA 1HYZA 4FWMA 2ZJRL 5AZJA 4OPJA 1VNAA 3IDHA 3G10A 3EE8A 2GBZA 3KLEA 1OVQA 5J2PA 5KTQA 1TKTA 3R2VA 3BDPA 1WMTA 3MMVA 1JJ2M 4EZ9A 1C0FA 2I7NA 1C55A 5CY4A 5E26A 1DEJA 4DFPA 4V19S 2BANA 3KP0A 4NLCA 4Z0UA 5C0YA 1R59O 1QSLA 3DI6A 2W41A 1BCOA 5IT9O 2G8WA 3EY1A 4H03B 1DTTA 4IFVA 3S3MA 1T1TA 3WQTA 4MDAA 3HZ6A 2UXCK 1T7EA 1EETA 3QFPA 3T3FA 3TAMA 3D45A 1WBDA 1KAYA 4JI1K 1CZAN 4CZKA 1K8KA 1HJOA 1NKCA 2Z1JA 1J5OA 2ETJA 2OTLN 4B9MA 5BRDA 2I7PA 4F8RA 5J2NA 4OGEA 4DV6K 2YJEA 1SN4A 1VRTA 4CHYA 2SN3A 4I6MA 3PV8A 2PY5A 4FZYA 4BG9A 4YOXA 4IG0A 1YJ9N 4C8NA 1BCGA 1KAZA 4H5TA 4YHHK 1J9AA 1J54A 1VHXA 4W5NA 2KJAA 5EX5A 3OHRA 3VEXA 4BEBA 3V1OA 4H5WA 3ENHA 3LDOA 1RT5A 2CGJA 2Q36A 1I2VA 3LAKA 4CIEA 4DSJA 2QM1A 1D8YA 5JS1A 1N36K 5KQ8A 4BR9A 2IIRA 2GV9A 1WNSA 4CE9A 1ATNA 3E9LA 4LF6K 3ZEUB 4CJ5A 3MXJA 4JI8K 4O5BA 3BF3A 4YORA 3ZLJA 1MWKA 2NRWA 3VF6A 4BGAA 3RTVA 4BDPA 4GV3A 3L3UA 2HF4A 4B8AB 2O4GA 3VERA 3D2FB 4EZ6A 2QWNA 3L4QA 1RBUA 2NRVA 1WOQA 1U49A 3FE1A 4RCHA 3MAQA 2HHSA 3VQQA 1Z26A 3NF6A 1I6FA 3DXKA 4H0TB 4FWKA 2IOCA 3OYHA 1O13A 4LSLA 2E4LA 3ENOA 4A5BA 5JENA 4FOEA 4A59A 3NE6A 3EZWA 4FLTA 3R3LA 2B4JA 3BP8A 1TVRA 1XC9A 3MN9A 1B3CA 4J2DA 2NLXA 2HHWA 3DAWA 3ISNC 1XRSB 4FXDA 3VGKA 1X9JA 1C1BA 3KK1A 4N47A 2YNIA 2PYLA 4C8KA 5HRSA 3LDLA 2E20A 4XJXA 3KK7A 1N6QA 5C42A 2HBLA 5M1PA 3TTCA 2KBKA 3MEGA 3O3FA 5GINA 3EZ5A 4FWSA 3MX5A 4IOXA 4DSEA 2YILA 2KZMA 4BE7B 5EOYA 3S5TA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2DPN A;  5GAE P;  4ILJ A;  1L4V A;  3KHW A;  2HHV A;  2UUB K;  3M6G A;  4BE2 A;  1SZ2 A;  4E0D A;  3TAP A;  3DMJ A;  4K25 A;  3SNN A;  1MYN A;  1HJR A;  1K6Y A;  4M7Y A;  1T6D A;  4B3R K;  4AHC A;  4ID1 A;  1RDA A;  4KHQ A;  3IG1 A;  3AO4 A;  1I6G A;  1KVC A;  1TUU A;  2XO7 A;  1HNZ K;  2XY6 A;  1S9E A;  5K14 A;  3KK2 A;  5AQP A;  2P9I A;  3QET A;  4YOV A;  3F5T A;  4C8M A;  1DT9 A;  2GX9 A;  4CEC A;  1NRB A;  2P5G A;  4UAE F;  3OJU A;  2D56 A;  1I39 A;  3LP1 A;  1TL1 A;  3SV3 A;  1GLC G;  3I0S A;  3QEW A;  4AHS A;  4OKE A;  1B7D A;  1JLC A;  1GLA G;  4BC5 A;  4WCE L;  3CMA N;  3QML A;  4WQ5 C;  1GOC A;  3NH2 A;  3ZYY X;  5CY0 A;  3VF2 A;  1YIJ N;  3K9K A;  4NXN K;  4O0I A;  4TSX A;  3QLH A;  1NK7 A;  2A6A A;  5LJW A;  3NH1 A;  3IFR A;  2KFZ A;  4X66 K;  1DJT A;  4DS5 A;  3QB0 A;  4CES A;  4CJW A;  1XMO K;  3L2Q A;  3VQ9 A;  1H1V A;  4FZX C;  3TAF A;  1NJX A;  1JLE A;  5C2F A;  3NH0 A;  4B1U B;  3VEY A;  3E7U X;  5AQT A;  4J8F A;  2O8F A;  1QVF M;  4HWI A;  2LR3 A;  1B92 A;  4MO5 A;  4Z94 A; 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