5AQIA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 121
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqiA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqiA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqiA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqiA04
2F9TA 2Q31A 4B1VA 1QHAA 5AQUA 1BG3A 1GLEG 4BRMA 2GUPA 3HTVA 4CI6A 4EFHA 4BR7A 3EZWA 3MDQA 1RFQA 3H1QA 5JLHA 2QWMA 3QB0A 2QWOA 4XH1A 5AQYA 1GLCG 3I33A 3A5LC 5CE3A 4EHTA 3DXKA 3IDHA 5KPZA 4H0PA 5I9EB 3H6EA 4BR5A 3CETA 5JLFA 1V4SA 5AQKA 2D4WA 2EWSA 2ZWHA 1ZBSA 4PL8A 4BQLA 4BGAA 3TPQA 5BPMA 4JHDB 2OANA 1NGGA 4NB4A 4BVPA 5BR9A 3LDQA 2IIRA 3VERA 4JN4A 2P9PA 4QS9A 4BRIA 2P9SB 5AQLA 2HMPA 4BRGA 2D0PA 2A5XA 4YDUC 5AQQA 3BP8A 3VOVA 5KQ8A 3WXIA 5FPMA 4RWTA 4BRFA 2AA4A 2P9UB 3OHRA 1DGKN 2FSJA 1RGIA 3LDOA 4KBOA 2V51B 3GBTA 4MO5A 1HPMA 5AQOA 3UKRB 5AQXA 3C7NB 4RTFD 1YUWA 1MWKA 2FF6A 4A61A 5AQMA 3P4IA 4B9QA 1GLJO 4BRQA 4BR9A 5AQPA 5JICA 5TKYA 1HX1A 1QZ6A 1ZC6A 1BA1A 2NLXA 3LL3A 3JXUA 5FPEA 1SQKA 4FWNA 4EIAA 3FE1A 2ZGYA 4EAHD 3WQUA 3FGUA 4H5WA 4CJ7A 3D2EA 2GWKA 4BVOA 4K41A 1TUUA 4FWOA 1BDGA 3HI0A 2ASOA 3UB5A 1LOTB 3M6GA 5BREA 1KAYA 1NGEA 3DXKB 4MLHA 3FFKB 4DB3A 2ASMA 1Z6RA 3BEXA 2DPNA 5AQIA 3DXMB 4JHDA 2Q36A 5AZJB 1X3NA 1Q18A 3VENA 1DKGD 3EN9A 3KZBA 2WUSA 1WUAA 2P9SA 2QWLA 4DHYA 1GLLO 2CGLA 1BWFO 3FZLA 3U9DA 3O1BA 2D1KA 3BF1A 2YI1A 4XH4A 4B1YB 5E84A 2A42A 1R59O 2P9PB 3B8AX 3D2FA 3QFPA 3VEZA 2E1YA 5JMVA 1YAGA 2E1ZA 3FR0A 4WQ4A 4BQZA 5AQGA 5EXWA 2Q2RA 3CHWA 5BRHA 3SLCA 5BPNA 3MK6A 4O5FA 2V7ZA 4DCHA 3SMPA 1NGHA 3UKRA 2J4RA 3C7NA 5AR0A 2A40A 5LJVA 3CQYA 3O08A 4A2BA 1ATRA 2ITMA 3CJ1A 4K43A 3CJ9A 2QM1A 3CI5A 3ZETB 4CZMA 3WQTA 1HUXA 4FSVA 4WQ5C 3R6MA 2A41A 2E2PA 2E20A 2P9KB 4L3QA 1SAZA 4BREA 3KHYA 4A62A 4PL7A 3VGKA 4GNIA 3U4LA 4IJAA 4M7YA 4BC4A 3QBXA 1JCFA 3D2EB 4IJNA 3DWLA 3ID8A 4H0OA 1QZ5A 3ENHA 1BA0A 1NMDA 5ELZA 4CD1A 3DXMA 5AZJA 4FOEA 3KVGA 4B1UB 3ZX3A 1X3MA 3WUHA 1T44A 3BUZB 5F1XA 1RDWX 1QQOA 3WXLA 4IZ9A 4BGBA 2Q0RA 2HF3A 1NGAA 1ATNA 4JNEA 1BO5O 2D0OA 4XEIA 4CZEA 1G99A 5BPLA 4QS8A 4E1JA 1T6CA 3MN6A 4FWMA 3F9MA 3L4IA 2KHOA 5LJWA 3L0QA 3D2FB 3ATVA 4WYBA 5AQVA 5AFUA 4FWPA 2FLOA 4BRAA 1HLUA 1CZAN 2QWRA 2P9LA 2Q1NA 2YHXA 1GLFO 3GL1A 3ZETA 3FZMA 5AQRA 4IWVA 3LM2A 3R9PA 3A8YA 1NGIA 3M3ZA 1WOQA 2P9KA 3ULEB 1MDUB 1ZXOA 4BRKA 4FO0A 3VESA 3IMXA 1XQSC 3VPZA 4C23A 1BUPA 3MN9A 2P9NA 5ADXA 3QBWA 3GE1A 3CJBA 1NGDA 1IJJA 1D4XA 3LDLA 3VEOA 3MN5A 2A3ZA 3CJAA 3HBTA 2GEMA 4H5VA 4BRNA 3L6QA 3H45C 1U6ZA 3RSEB 3ATUA 4H5RA 2YCHA 1SZ2A 3H3NO 3R8EA 1HKBA 3EKSA 2W40A 3EO3A 3ZEUA 3W3DA 4BC2A 1T6DA 4HWIA 3A5OC 2IVNA 3VF2A 3CJ7A 1NWKA 2FSNA 1Y64A 2CGJA 3VEYA 3O6WA 4B1XB 3H3OB 1HKCA 4CZIA 1S22A 3UKUB 2QWPA 3VEXA 4CBXA 2PBDA 3ENOA 3O80A 4H5NA 4FWLA 1ESVA 4PKGA 4CD3A 3W0LA 1KAXA 1GLBG 1J6ZA 3O1WA 1K8KB 5AFUH 5EVZA 3LDNA 1YXQA 3AAPA 5KPRA 2E88A 5AQZA 3CIPA 4IXCA 1TUYA 5AQNA 3JS6A 2CGKA 4K25A 5E26A 2IVOA 2P9LB 1XUPO 4FPAA 4H03B 3C0BA 4HTLA 4CZKA 2W41A 5FPDA 3WEEB 1NGCA 1MWMA 3ULEA 5KPTA 3QDKA 4FWSA 2CH5A 3CQXA 5EX5A 5FPNA 4BC3A 1JCEA 2I7PA 2FF3B 3UE5A 3IFRA 3M1FA 4H0YB 1HJOA 1KXPA 1P8ZA 3HSCA 4ISEA 4M7XA 2NRHA 3GDQA 3ZX0A 5ADXH 3VETA 1YVNA 2P9NB 4CZJA 3EKUA 4RCHA 3I8BA 3VF6A 2VCPA 2FSKA 1C0FA 3O5BA 1OKJA 4O8KA 4PKHA 5BRDA 2VWBA 3RSEA 2PAVA 4BRDA 3H46O 4LC9B 4B1WB 5EOYA 2A6AA 4BRLA 2YHYA 4H0VB 5AZIB 4JD2A 2GWJA 2Q97A 5B8HA 3J8AA 1HKGA 2CH6A 1NBWA 1ATSA 4FOIA 5AQWA 3O8MA 3ZEUB 1NGFA 3UKUA 3AY9A 2Q0UA 1NGJA 2UYTA 4BG8A 5AQSA 5AQTA 5AQFA 2P9IA 3CJCA 4YDUA 2HOEA 1S3XA 1K8KA 3WXJA 3QFUA 1X9JA 3VEVA 4ISFA 3DAWA 3D7EO 3A0IX 4I6MB 3H1VX 2ASPA 4BR0A 3GOIA 2E2NA 3AAQA 2QW9A 3WEEA 1E4FT 1IG8A 2V52B 5F2RA 3ZX2A 1E4GT 3SK3A 2HF4A 3QICA 4H0XB 3U9ZA 3EL2A 4AM7A 2QWNA 3VGMA 1BU6O 4BC5A 1EQYA 3A5MC 1U2VB 4BR4A 5F0XA 3HZ6A 4H0TB 5AQHA 2BUPA 3VF4A 4QS7A 2GTDA 4CZGA 4BRPA 2YJFA 4MLEA 4A2AA 1TYQB 3SMSA 3A5NC 1JCGA 1KAZA 5AQJA 2E2QA 1QQNA 2FXUA 1H1VA 2E8AA 1NLVA 4M63C 4B1ZA 1Z05A 5AZIA 4FWKA 4BG9A 4AM6A 4K42A 1GLAG 3QMLA 1V4TA 2ZGZA 4BR2A 4ISGA 1C0GA 5BN8A 2GELA 2AP1A 3CERA 3MCPA 3FZKA 3BF3A 4JD2B 4F9OA 5KQDA 4H5TA 4FL9A 3U8XA 2QXLA 4FWRA 3WXKA 4BRHA 5EY4A 3FZHA 2ZF5O 3LDPA 2H3GX 4JAXA 3TU5A 4J8FA 4Z94A 1NGBA 3IUCA 3O4WA 2P9IB 2V7YA 4I6MA 3GG4A 1XC3A 1QQMA 4BRCA 5LY3A 4Y0WA 3FZFA 3S41A 4XH5A 3MMVA 4CZFA 2VYPA 2I7NA 4CZHA 4CBUA 5BRFA 4GY2B 1U2VA 2E2OA 2F9WA 2IVPA 3WT0A 4DQ8A 4MO4A 4IO8A 1BOTO 1DEJA 4WQ5A 5BN9A 2P9UA 4WQ4C 4BROA 3HM8A 3VGLA 3VEWA 3MN7A 3FLCO 2YJEA 3SJHA 1LCUA 3AARA 4FWQA 4CZLA 1TYQA 2YHWA 2BTFA 4CBWA 1GLDG 1NM1A 2NZTA 3LM9A 3G25A 4NO7A 4EHUA 1MA9B 3DJCA 4PKIA 2QWQA 4FPBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2F9TA 2Q31A 1QHAA 4DS5A 3G0ZA 1GLEG 4LF4K 3S3MA 3HP6A 2NY8X 4EFHA 1X9MA 4BR7A 1VQ4N 3MDQA 4KH6A 4R79A 4LD0A 3QEXA 3H1QA 4HCCA 1TGOA 1JLCA 2XY5A 4AF1A 4W5OA 4CEZA 5AQYA 1QE1A 1N33K 3I56N 3I33A 3KD5E 4EHTA 4KI4A 3DXKA 2KGQA 1S1WA 1DTTA 3IDHA 4O5BA 1OH5A 2PYJA 4G9ZA 5KPZA 2ZM6K 3VQDA 1PE4A 5M1KA 2NRRA 4EP5A 2F96A 1NU0A 2D4WA 1Q86O 1HYZA 1NKCA 1ZBSA 4PL8A 4BGAA 1NGGA 5CHIA 2HVIA 3MECA 5CYMA 2NRXA 5LMUK 1C56A 5CY4A 4QS9A 4BRIA 3THVA 2EHGA 4O55A 4CE9A 2A5XA 4LFBK 2D5RA 1DT9A 4RWTA 2B3CA 4DR7K 4HE7A 2HNZA 1NJWA 2FSJA 3RMAA 1RGIA 3VQ5A 1NK7A 1C0TA 4AILC 2ZE2A 2HMIA 1GOBA 3C7NB 2E5LK 1TKDA 4RTFD 2FF6A 3EEQA 5AQMA 1TL3A 4BR9A 5AQPA 1U45A 3VA3A 3D0PA 1RILA 2NLXA 3OYNA 5I42A 3CFOA 4FWNA 1XI1A 5AJ3K 4CF1A 4OLAA 1VQKN 5H1SQ 1TUUA 1L3UA 4CESA 3TAPA 4JRQA 1B3CA 2VGNA 5BREA 4YOWA 3BZKA 1NGEA 4E7KA 4OKJA 2JWKA 3NF9A 2ASMA 2KZZA 1T8EA 4KB0A 3KOYA 4H4MA 3NF8A 3KWGA 4DF8A 1REVA 3KZBA 4OX9K 3ZT3A 1WUAA 2P9SA 4CEDA 4GVEA 2UUAK 4DQIA 4M3XA 2D1KA 4KHYA 4XH4A 4B1YB 3K57A 2P9PB 1R59O 1XWLA 2VWKA 1JL1A 3QFPA 3VEZA 3CCVN 3LPTA 1N32K 1GOAA 1JLQA 3RRGA 1D8YA 2WTUA 3K58A 1RBVA 5BPNA 3MK6A 4W5RA 4ICLA 4M3YA 4LFAK 4CJWA 2HB5A 2VG5A 1ATRA 1KVCA 3CJ1A 2ITMA 4CJPA 2DY4A 3CJ9A 1A5WA 4CZMA 3CI5A 2KLAA 2F4VK 3SUNA 4J2AA 2RHKA 3R6MA 2A41A 2E20A 3HRGA 3EZ5A 1VSKA 4A62A 4PL7A 1E3MA 1ZU3A 1CZBA 4IJAA 3CC7N 3PIPL 4ELUA 4JI6K 3E66A 3ENHA 1BHLA 1BA0A 4HCBA 4FM2A 1Z26A 4DTUA 3DXMA 3HSTB 2E6LA 4LH4A 2KZMA 2YNHA 1L5UA 3DRRA 3NH0A 1TK8A 3CMAN 1QQOA 3WXLA 1NE5A 1NGAA 1ATNA 4FLTA 5FDLA 4JNEA 1BO5O 4XEIA 3R2VA 4CZEA 2GMOA 2DFHA 2UXBK 3NDKA 5HRRA 1CXUA 2HBJA 5GADP 4FJ8A 4K8XA 4FWPA 1VSIA 4YOYA 3CC2N 2YNGA 2VQFK 1BQNA 4JI4K 1GLFO 4HUFA 4I7FA 5JS2A 4B9NA 5AQRA 3PSMA 3AVJA 4IWVA 4KHPK 1JXBA 4I2PA 5GAHP 1NGIA 3M3ZA 2P9KA 3ULEB 1WSHA 1ASUA 3M8SA 4C23A 1YT3A 1W2BM 3MN9A 3K2PA 4A57A 3GE1A 1NGDA 4JI2K 1IJJA 3VEOA 4BE0A 2BRZA 4FK4A 2DTUA 2KBJA 2F8SA 3PUFA 4DV3K 5GAGP 4BRNA 5HBMA 1JLFA 1HQEA 2SN3A 1U6ZA 3D6RA 2YCHA 1HNWK 1QHTA 3LDSA 4DR3K 3DLLL 3W3DA 1T6DA 4CF9A 2JLEA 4HWIA 1VK0A 3VF2A 4CHYA 3OYGA 3CJ7A 1R0AA 1Y64A 2CGJA 4DTPA 1RT5A 4LF8K 1ZBHA 3H3OB 3HJFA 1HKCA 3VQEA 2YC1C 4CBXA 3KK2A 2PBDA 2O8FB 3O80A 4H5NA 1ESVA 1N36K 1J6ZA 4JKHA 3O1WA 1K8KB 4B8CA 1XMQK 3LDNA 2Y1IA 2HHVA 2E88A 3I0SA 2NRWA 3ASMA 3NVKA 3TAMA 2P9LB 1XUPO 2Z1HA 3SPZA 2HHUA 4HTLA 4DU1A 2B6AA 2W41A 2Z1GA 3OYCA 1NGCA 3NF7A 4KHNA 2OZSA 2QTDA 2LI7A 3QDKA 3THYA 3PX4A 4BC3A 3UE5A 2FF3B 4CGIA 4DG1A 3M1FA 2HBLA 4H0YB 4AH9A 2WOMA 4OVLA 2LN8A 1KTQA 3ZX0A 1B7DA 3SF4D 1RNHA 4RCHA 3HL8A 3I8BA 3E1YA 4E72A 3ID6A 1RDUA 1YTAA 1C0FA 3H46O 2A6AA 2OPSA 1WSJA 1T03A 3AVAA 5AZIB 3MXJA 2YHAA 1I2UA 4JD2A 5B8HA 4DWIA 4OPAA 1J5OA 3HO1A 3QNOA 5AQWA 2KKZA 3O8MA 4G1QA 4FJJA 3AY9A 3AO1A 4F3TA 1GPTA 5AQSA 2P9IA 2E2FA 2XHBA 1C0MA 4C1NK 1S3XA 3P5JA 1QSYA 3JSMA 2GL1A 3WXJA 3CM5A 2XO7A 3T7ZA 4M45A 2ZJQL 4ISFA 1QS4A 4HUGA 3V9ZA 3FFIA 2ASPA 4BR0A 3CYGA 3AAQA 4RW7A 4WFAL 4J2DA 3KJVA 4DFJA 1E4GT 5SWMA 1O13A 1SEGA 4WF9L 4BDZA 4CHOA 3ZLJA 4CJTA 1BQMA 4CJQA 5DM6L 3HZ6A 2G8VA 3SUOA 5FRMA 4QS7A 4CGFA 1OMYA 2YILA 1NOYA 4M41A 4Y1CA 3IS9A 3SZ2A 3DRPA 2RE2A 1SKSA 3SMSA 5AQJA 2E2QA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2F9T A;  2Q31 A;  1QHA A;  4DS5 A;  3G0Z A;  1GLE G;  4LF4 K;  3S3M A;  3HP6 A;  2NY8 X;  4EFH A;  1X9M A;  4BR7 A;  1VQ4 N;  3MDQ A;  4KH6 A;  4R79 A;  4LD0 A;  3QEX A;  3H1Q A;  4HCC A;  1TGO A;  1JLC A;  2XY5 A;  4AF1 A;  4W5O A;  4CEZ A;  5AQY A;  1QE1 A;  1N33 K;  3I56 N;  3I33 A;  3KD5 E;  4EHT A;  4KI4 A;  3DXK A;  2KGQ A;  1S1W A;  1DTT A;  3IDH A;  4O5B A;  1OH5 A;  2PYJ A;  4G9Z A;  5KPZ A;  2ZM6 K;  3VQD A;  1PE4 A;  5M1K A;  2NRR A;  4EP5 A;  2F96 A;  1NU0 A;  2D4W A;  1Q86 O;  1HYZ A;  1NKC A;  1ZBS A;  4PL8 A;  4BGA A;  1NGG A;  5CHI A;  2HVI A;  3MEC A;  5CYM A;  2NRX A;  5LMU K;  1C56 A;  5CY4 A;  4QS9 A;  4BRI A;  3THV A;  2EHG A;  4O55 A;  4CE9 A;  2A5X A;  4LFB K;  2D5R A;  1DT9 A;  4RWT A;  2B3C A;  4DR7 K;  4HE7 A;  2HNZ A;  1NJW A;  2FSJ A;  3RMA A;  1RGI A;  3VQ5 A;  1NK7 A;  1C0T A;  4AIL C;  2ZE2 A;  2HMI A;  1GOB A;  3C7N B;  2E5L K;  1TKD A;  4RTF D;  2FF6 A;  3EEQ A;  5AQM A;  1TL3 A;  4BR9 A;  5AQP A;  1U45 A;  3VA3 A;  3D0P A;  1RIL A;  2NLX A;  3OYN A;  5I42 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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