2FSNA

Crystal structure of ta0583, an archaeal actin homolog, complex with adp
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
325
structure length
310
Chain Sequence
MVVVGLDVGYGDTKVIGVDGKRIIFPSRWAVTIPVLSTDGGQTKFIYGKYASGNNIRVPQGDGRLASKEAFPLIAAALWESGIHVDLVIGSGTPLGTFDLEVKAAKEALENKVLTVTGPEGEVRQFNITRLIMRPQGVGAALYLLNQGIIEQQPGYGVVIDVGSRTTDVLTINLMDMEPVVELSFSLQIGVGDAISALSRKIAKETGFVVPFDLAQEALSHPVMFRQKQVGGPEVSGPILEDLANRIIENIRLNLRGEVDRVTSLIPVGGGSNLIGDRFEEIAPGTLVKIKPEDLQFANALGYRDAAERS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of an archaeal actin homolog
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
source organism Thermoplasma acidophilum
molecule keywords hypothetical protein Ta0583
total genus 71
structure length 310
sequence length 325
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF17989 ALP_N Actin like proteins N terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fsnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fsnA01
3FZKA 3D2EB 3F9MA 3VF6A 2QWPA 5AQHA 5AQJA 4CZGA 2FSKA 4RTFD 3VESA 4M7XA 5AFUA 2W41A 3B8AX 4FWKA 3GG4A 4H0PA 5F2RA 1TYQA 3AAQA 5AZJB 4CZIA 2GTDA 4H5NA 3ZX0A 1NWKA 1T44A 5JICA 3BUZB 2GWKA 2IVNA 5AQZA 3CQXA 1BUPA 2FSNA 1E4FT 2V7YA 4EHTA 3ZEUB 3FZMA 3EN9A 4CD3A 3QMLA 4FO0A 5AQTA 1BU6O 3ATVA 4JHDB 1BO5O 3H45C 3UKUB 3MCPA 4ISEA 2PBDA 3VEWA 2Q0RA 4BC5A 4CZJA 3O8MA 3JS6A 4O8KA 4BQZA 1SQKA 3FR0A 2ZGZA 2VYPA 2YJFA 4JNEA 5EXWA 5E26A 1ATNA 4MO5A 1KAZA 3ULEB 2P9PB 1TUUA 3C7NA 1QZ6A 4WQ5C 1U2VB 2CGLA 4B1VA 2D1KA 1LCUA 2ASMA 1NGAA 2ASOA 1KAXA 2D4WA 4FWLA 1KAYA 1T6CA 5LJVA 5EVZA 3UKUA 4BRCA 3QB0A 1ESVA 2Q31A 4O5FA 3CI5A 3U9DA 2QWQA 2E1YA 3ATUA 2E88A 3A8YA 3VF2A 4DB3A 3FGUA 3UB5A 3MN6A 5BN8A 4FWOA 2A3ZA 5BPMA 3VPZA 4M63C 1U2VA 4A62A 1BA1A 4CBUA 2Q97A 3QFPA 2QW9A 3GBTA 4BR4A 4BRQA 2YCHA 1NGFA 3MN9A 3HZ6A 5BN9A 1GLAG 3R8EA 3VERA 3M3ZA 1RDWX 1V4SA 3LL3A 5KPRA 4BRKA 2F9TA 4BR0A 4HTLA 3UE5A 1WOQA 4B1UB 2FLOA 2OANA 5BPNA 3H46O 3DXKB 3VF4A 3MK6A 4FWNA 4MLEA 2BTFA 3UKRB 3VEVA 3WXKA 4ISFA 5AQGA 1YAGA 5BRDA 4BRDA 3FE1A 1X3MA 1U6ZA 1GLBG 3C0BA 5AQPA 2CGKA 3A5MC 1TYQB 3WQUA 4BQLA 4FOIA 1T6DA 2YHYA 2A41A 3GDQA 3ZX2A 1NBWA 4CI6A 1TUYA 4H0OA 1S22A 3DXKA 4FL9A 2FSJA 4H5VA 2GWJA 5F1XA 1GLJO 5AQNA 3VGLA 2IVOA 4BC3A 3VGMA 4RCHA 3IMXA 4B1YB 3DAWA 1J6ZA 1HUXA 1R59O 1D4XA 5BRFA 5CE3A 5FPEA 1CZAN 4K42A 5KPZA 4YDUC 2D0OA 4C23A 4FPAA 4A2AA 4H5RA 3BF3A 3EZWA 4IZ9A 5AQOA 4WYBA 3HM8A 4JD2A 4CBXA 5B8HA 3MDQA 2GELA 5TKYA 4A61A 3DJCA 3C7NB 3AARA 3W0LA 5AQVA 3A0IX 4BRLA 5AZIA 2HF3A 2FF6A 5FPDA 5JLFA 5EX5A 4IJNA 4EIAA 4E1JA 5BR9A 2E1ZA 4BGAA 4BR2A 3GE1A 4QS8A 1GLFO 5AQRA 1E4GT 2ZGYA 4PKGA 4AM7A 2V52B 4MO4A 4PKIA 4BR7A 3H1QA 2QWOA 1ZC6A 4CJ7A 4H5WA 3FFKB 1V4TA 1GLCG 3ZX3A 3QICA 2ITMA 3FZHA 4B9QA 5KPTA 3LDQA 3MN7A 5E84A 3VEXA 2P9SA 1GLLO 2E20A 1SAZA 1HKBA 2EWSA 4NB4A 2CH5A 1NLVA 4FWMA 4IXCA 1MDUB 3CETA 4K25A 1HX1A 1NMDA 4DCHA 1C0FA 2E2NA 2QXLA 3O80A 4PKHA 2V51B 4EFHA 3QBXA 1JCEA 2BUPA 2ASPA 4WQ5A 2P9NA 3WT0A 3LDPA 2QWNA 3L4IA 5BPLA 3S41A 3LM9A 1LOTB 1BDGA 2E2QA 2P9IA 5BREA 3IFRA 4BRFA 2YHWA 2Q0UA 4EAHD 3EL2A 1K8KA 4BG9A 3CJ7A 3R6MA 4H03B 1NGCA 4BVOA 2A42A 4WQ4C 4H0VB 1ZXOA 3QFUA 1H1VA 1NGJA 3SMPA 3D7EO 1XQSC 3O1BA 4BRMA 2YJEA 3VOVA 2I7PA 3IUCA 1QZ5A 4H0YB 3L6QA 3I8BA 3BP8A 5ELZA 3WUHA 1MA9B 1JCGA 5AQWA 1HJOA 2J4RA 1HKGA 2P9KA 4BROA 1QHAA 4PL8A 3DXMB 2NLXA 3QDKA 3BF1A 5JMVA 4J8FA 1Z6RA 3LDLA 3DWLA 4B1XB 3AY9A 3U8XA 4BC4A 5LY3A 3FZFA 3GL1A 3HI0A 3VENA 1X9JA 3CERA 3EKSA 4BRIA 3VGKA 4JD2B 2H3GX 4M7YA 4QS9A 4RWTA 3U9ZA 1QQNA 2Q36A 4GNIA 1RGIA 3CJBA 3FZLA 1DKGD 4FWPA 4AM6A 1G99A 3O6WA 3LDOA 3O5BA 1GLEG 5AZIB 4IWVA 3WXJA 4BRHA 3WXIA 1NGIA 3M1FA 1DGKN 3BEXA 2GEMA 4H0XB 4BVPA 3GOIA 3DXMA 4A2BA 3IDHA 1NGHA 4IO8A 3QBWA 3HTVA 5KQDA 2AP1A 5AQSA 5AQYA 3VEZA 1BA0A 4F9OA 2YHXA 1BOTO 3SK3A 1HPMA 3O08A 2CGJA 3RSEA 4BGBA 4NO7A 4BG8A 1OKJA 5EOYA 2PAVA 3ZETA 4YDUA 2A6AA 2P9SB 5FPNA 4CZHA 2P9LA 1P8ZA 1Y64A 1C0GA 3SLCA 4HWIA 3A5LC 3H1VX 3M6GA 4MLHA 3G25A 2CH6A 4ISGA 2QWMA 2A40A 2KHOA 3O1WA 2DPNA 1HLUA 4K41A 1ATSA 2FF3B 3WEEA 5AQFA 2IVPA 2NZTA 2VWBA 4IJAA 1X3NA 2P9NB 2QM1A 3D2FA 4BREA 4FWRA 4FWSA 1MWKA 3A5NC 3CJAA 3LDNA 4K43A 4BR5A 3KVGA 3HBTA 2P9UB 5AQXA 1BG3A 4FWQA 5KQ8A 2IIRA 1SZ2A 1XUPO 3D2EA 4BRNA 3H6EA 5AQMA 2P9IB 3H3NO 5AQKA 3WQTA 1YXQA 4I6MB 4Z94A 1WUAA 2HF4A 1HKCA 2A5XA 3CQYA 3VEOA 4GY2B 1K8KB 4XH1A 3R9PA 5ADXH 1Q18A 2F9WA 3W3DA 5AZJA 4H5TA 1RFQA 3U4LA 4EHUA 3EO3A 4L3QA 2YI1A 1DEJA 2W40A 3OHRA 4KBOA 5FPMA 4B1WB 4JAXA 4FOEA 1QQMA 2HMPA 2P9UA 3ZEUA 4BRPA 3A5OC 2P9KB 2HOEA 2Q2RA 3WXLA 4JHDA 2GUPA 4I6MA 5ADXA 5AR0A 3CJCA 1ATRA 4DQ8A 3LM2A 3VETA 1NGEA 3KHYA 3J8AA 1NGBA 1QQOA 4CZLA 4CD1A 3HSCA 4CZEA 1XC3A 5AQIA 3L0QA 2QWRA 3SJHA 1Z05A 3ULEA 4XEIA 1JCFA 2P9PA 5F0XA 3TPQA 2E8AA 1YVNA 3MMVA 3JXUA 5AQQA 1S3XA 2FXUA 2ZF5O 5EY4A 1MWMA 5I9EB 1ZBSA 3ID8A 4WQ4A 2ZWHA 4QS7A 4BRAA 3MN5A 2AA4A 3ENOA 4CZMA 3O4WA 2NRHA 2VCPA 3H3OB 5AQLA 4FPBA 2V7ZA 3TU5A 2E2OA 5BRHA 1IJJA 3P4IA 3CJ1A 4H0TB 4CZFA 4CZKA 4BR9A 3CIPA 2Q1NA 3RSEB 3FLCO 1EQYA 4XH5A 4LC9B 4Y0WA 1BWFO 1NGDA 1NGGA 3SMSA 5AQUA 3ZETB 2UYTA 5JLHA 1KXPA 3I33A 2P9LB 1YUWA 2WUSA 3AAPA 4B1ZA 4FSVA 3EKUA 3VEYA 5AFUH 2I7NA 4CBWA 2E2PA 4XH4A 4PL7A 2D0PA 3WEEB 2QWLA 4BRGA 3CHWA 3D2FB 5LJWA 1IG8A 4JN4A 4BC2A 1GLDG 4DHYA 3CJ9A 3UKRA 3ENHA 1NM1A 3KZBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3D2EB 3F9MA 3I0RA 4HUFA 4N5SA 5AQJA 5KRSA 1NK8A 2D0BA 4M3XA 3KK7A 2FSKA 1RT5A 3VQ7A 3PX0A 5AFUA 4FZXC 3AVJA 2HHHK 2W41A 3B8AX 4O44A 3CCLN 3K5OA 4NXNK 1UWBA 3LALA 3AAQA 2KLAA 4ILJA 2GTDA 3BZCA 1R0AA 3M8SA 1NWKA 1BISA 5JICA 3OYKA 4LF7K 3NF9A 2RPIA 4JYAK 3T1YK 1NK0A 1W7AA 3ATVA 3CMAN 5FLXO 3H45C 3UKUB 5E41A 3SQ4A 1RT1A 3NVMA 4CCHA 4NCAA 4BC5A 1FXXA 4DMNA 3P38A 3O8MA 2ZM6K 2GV9A 4CEFA 1SQKA 2HHXA 4DTJA 2VYPA 1S6QA 1A5WA 1Z25A 3ZT1A 3WXMB 4M41A 2HB5A 3C65A 3QIOA 2O4IA 4B8CA 1ZBFA 3RMCA 3LP2A 2D1KA 1LCUA 2ASMA 1KAXA 2D4WA 1XMQK 1FKOA 3HP6A 1HYZA 4BRCA 3OS1A 4B9UA 1WBDA 2Q31A 1LWCA 3U9DA 3C94A 1L3TA 1YT3A 1L3SA 3CG7A 4KTZA 3VF2A 4CJSA 1X9SA 4KAZA 4DB3A 4JK9A 3CCSN 3PX6A 3KK3A 1C0TA 3HVRA 5BPMA 1C0UA 3VPZA 4QOZB 1NK5A 3E01A 1W9HA 4OPAA 2Q97A 3NH0A 3QFPA 4DR2K 3G10A 3NAEA 3HOSA 3R8EA 4ZTFA 4U7BA 1RDWX 5KPRA 2FBTA 4H4OA 4DR5K 2F9TA 1LW2A 4HTLA 1WOQA 4FLUA 3CFRA 2FLOA 1YITN 3VF4A 1WBBA 4H4MA 4MLEA 3TSPA 3KK2A 4ISFA 4I7FA 1YAGA 3ZSYA 1VQ9N 2UUAK 3FE1A 2Z1HA 1J9AA 1S1UA 2CGKA 1NU0A 4KTWA 3TR8A 2D5RA 1Q7YO 1ZYQA 3HM9A 1NMNA 4CF1A 1IG9A 3NF6A 1S22A 4EZ9A 3THXA 3MX5A 3VGLA 3OW2M 4FK2A 3IMXA 4DV3K 3O3HA 3DRPA 3RR8A 1R59O 1D4XA 4CJLA 5BRFA 1LV5A 4Z4EA 4CEBA 2QKBA 1CZAN 3G4SN 4ID1A 2FC0A 1HQUA 5AQOA 4IZ9A 3F73A 4JD2A 1VSLA 4GV6A 2GELA 4NCGA 5K14A 3OYNA 3P31A 3W0LA 5AQVA 3KWGA 2HF3A 3KIOA 5JLFA 2XY8A 3LAMA 4EIAA 1D9DA 3KTQA 3OYDA 3KLHA 3N4PA 2E1ZA 5CYQA 4X64K 3NF7A 3PO5A 1XC9A 1RTIA 1GLFO 3PX4A 1X9MA 4DFJA 2ZGYA 4PKGA 2V52B 1Q9YA 2IC3A 1BI4B 1KSPA 4W5RA 4DR1K 1GLCG 3ZX3A 4JK7A 1ITGA 2OPPA 1SAZA 3AA2A 4DQSA 3QINA 1A5XA 3CETA 2NRTA 1HX1A 1NMDA 1C0FA 4YY3K 1O1WA 3OVNA 4GKKK 3ALYA 5GAEP 3RRGA 2BUPA 2QWNA 3L4IA 3K5NA 3C6HA 2HVIA 2UU9K 3SZ2A 2WFBA 3LM9A 3O9UA 1S9EA 4FJXA 2P9IA 4CEDA 5BREA 3THWA 3EZ5A 4FJNA 3BY5A 5C10A 4E0DA 1K8KA 3CJ7A 1VQPN 3LZJA 1M90O 2A42A 4WQ4C 4JRQA 4L8RB 2BDPA 4LH4A 2HMIA 1Q81O 2NNWA 3SMPA 3ZCMA 3D7EO 2DFFA 4FM0A 3IUCA 3V1RA 1RDDA 3D6RA 5GAHP 1ASVA 3HRGA 2DY4A 1HYVA 1JCGA 1HKGA 1QHAA 4PL8A 4W5OA 3DXMB 4LY7A 3BF1A 1RT2A 1NOZA 4IDKA 2UUBK 3OJSA 3AVNA 1VQNN 1B9DA 4CGDA 4KB1A 5C25A 4IFYA 3QO9A 3LANA 3VENA 1RTHA 4FLWA 3VGKA 3DLBA 1VQKN 5GADP 4F4KA 1RGIA 3UIQA 3FZLA 3QIPA 1XHZA 1G99A 1QE1A 4DTNA 3LDOA 4BRHA 3AVKA 1DGKN 3BEXA 1KLNA 4H0XB 4BVPA 3SYZA 3GOIA 3BZKA 1Q9XA 5KTQA 5KQDA 4KI4A 1VQ8N 3M8RA 4E7IA 1BA0A 3PUFA 1BOTO 4FJ5A 1KC8O 3O08A 3OYFA 3V9WA 4BGBA 3OYMA 3ID6A 1TV6A 4Z0UA 3ZETA 1BQNA 1TK0A 1XNRK 4C8KA 2PZSA 4ICLA 2A6AA 5FPNA 4CVNE 4U67L 3G25A 2CH6A 2QWMA 4QAGA 4DUZK 3DI6A 2KHOA 3P83D 3SI6A 1YVUA 4C8OA 2NZTA 1X3NA 1RT4A 4FWRA 4CW7B 4IFEA 3V4IA 2XRIA 4DR7K 4BR5A 2HHQA 2O8DA 3HBTA 1W97L 1BG3A 4KFBA 5DMRA 1XUPO 2A1SA 3SUQA 1UOCA 2VWJA 4C8NA 1YXQA 2UXBK 4B9SA 1WUAA 2HF4A 1IBLK 3L2RA 4XH1A 4YOVA 1N6QA 4B3RK 1TKTA 1ZBUA 1OVYA 5AZJA 4EP4A 5AJ3K 2ZD1A 2QTDA 2X6NA 2G8IA 4B1WB 4KBOA 1LW0A 4JAXA 4FOEA 1QQMA 4OVLA 1ZBHA 2RN2A 1VSEA 3V9ZA 2ZJRL 4BRPA 3AVBA 1QVFM 4LF9K 2HOEA 3QNNA 4OLAA 1FK9A 4MDBA 5AR0A 3DOLA 5JS1A 4DQ8A 3M5RA 4G1QA 3VETA 4DV1K 3L2VA 1NGBA 4CD1A 3HSCA 3T1AA 4GV3A 2HNDA 3B6OA 3SJHA 3DLLL 4HUEA 4RW4A 3OYIA 3MMVA 1RBVA 4RG8A 4YFUA 4KI6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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