4EIAA

Activator of the 2-hydroxyisocaproyl-coa dehydratase from clostridium difficile without nucleotide
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
MYTMGLDIGSTASKGVILKNGEDIVASETISSGTGTTGPSRVLEKLYGKTGLAREDIKKVVVTGYGRMNYSDADKQISELSCHARGVNFIIPETRTIIDIGGQDAKVLKLDNNGRLLNFLMNDKCAAGTGRFLDVMAKIIEVDVSELGSISMNSQNEVSISSTCTVFAESEVISHLSENAKIEDIVAGIHTSVAKRVSSLVKRIGVQRNVVMVGGVARNSGIVRAMAREINTEIIVPDIPQLTGALGAALYAFDEAKESQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Activator of 2-hydroxyisocaproyl-CoA dehydratase
publication title On the ATP-Dependent Activation of the Radical Enzyme (R)-2-Hydroxyisocaproyl-CoA Dehydratase.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium difficile
molecule tags Electron transport
total genus 74
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4eiaA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4eiaA01
5AFUH 1NWKA 3CI5A 1V4TA 2P9SA 2A41A 3WXKA 4BG8A 1GLEG 5KQ8A 2A40A 2IVOA 3O1WA 2Q0UA 4EIAA 1MWMA 5BRFA 5EVZA 3FE1A 5BRDA 4FPBA 4BRKA 3D2FA 1NGCA 4NB4A 2NRHA 2ZF5O 4PKGA 5EX5A 5E26A 5CE3A 3WXLA 5EOYA 2HF4A 3U8XA 3IMXA 4B1ZA 1XUPO 3CQXA 1JCFA 5BR9A 1E4GT 5KQDA 1NGAA 1ESVA 2WUSA 1ZBSA 2P9KA 5BREA 5JLFA 3MCPA 1R59O 4H0VB 5AZIB 1KXPA 4CZLA 2E2NA 1OKJA 3MN5A 2GEMA 2CH5A 3VEXA 3ENHA 4BRAA 5EY4A 4AM7A 1GLBG 4FWPA 1SAZA 1K8KB 4BQZA 5AQPA 4DCHA 3IUCA 1QQNA 3BUZB 2UYTA 3VENA 4CJ7A 3QBWA 3WUHA 3B8AX 3M3ZA 1BA1A 4L3QA 4BVOA 1C0GA 2QWQA 4H0TB 1NGEA 1U6ZA 3H46O 2FSJA 3CHWA 3GG4A 1U2VB 1YVNA 5E84A 5KPZA 4FWQA 3SK3A 3A5MC 1ZC6A 2YHWA 1WUAA 3HM8A 5AQMA 4DB3A 4LC9B 4Y0WA 4EAHD 1QQMA 2QW9A 3HTVA 4IJAA 3BEXA 3O8MA 4C23A 5AFUA 2ZGYA 1BOTO 3C7NA 3MMVA 3LM2A 4IO8A 2BTFA 3CJBA 4PL8A 5AR0A 3VF2A 2QM1A 4YDUC 4BRQA 1BDGA 2A5XA 5AQRA 2BUPA 4BGBA 3P4IA 4MO5A 4MLHA 5JICA 3EKSA 4JD2B 5AQJA 2E1YA 2V7ZA 4I6MA 3DXMA 3QBXA 4WQ5A 4WQ4A 3UKUB 4FPAA 1NGDA 3HI0A 5TKYA 2HMPA 5BN8A 1NLVA 5BN9A 2F9WA 2IIRA 4FWRA 1DKGD 1HX1A 5AQVA 3WEEB 4EFHA 2HOEA 5BPMA 3H6EA 3VGKA 4XH5A 2EWSA 3UE5A 3LDLA 3QFPA 2Q2RA 4H5RA 1HJOA 4BC4A 3LDNA 3H3OB 1MWKA 3EL2A 4CZEA 4RCHA 3QFUA 4JNEA 3CJ7A 3BP8A 2D0OA 3LDOA 3QDKA 1SQKA 3A5NC 1NM1A 1RGIA 3O08A 3ATUA 2YHYA 5LJVA 2ITMA 1BWFO 1KAXA 3SMSA 5BPLA 2QWNA 5AQTA 4CI6A 3BF1A 3BF3A 3RSEA 4CBUA 1LOTB 4FO0A 4F9OA 1T44A 3GE1A 3UKRB 1Z05A 3GDQA 4BRFA 1ATRA 1GLDG 3CJ9A 5F2RA 1IG8A 1TYQB 2J4RA 2FSKA 2FSNA 3LDPA 1TUYA 3MN6A 3WXJA 3H1VX 1TUUA 1V4SA 2P9IA 4PKHA 4CBWA 1GLJO 3CETA 2GTDA 3FLCO 2VWBA 4BRPA 2E2PA 2P9PB 4MLEA 4FOIA 4GY2B 2GUPA 3R9PA 1NMDA 4H5WA 2PAVA 5KPRA 2V7YA 5FPMA 4FWLA 4BR5A 4CZKA 3EN9A 1NGHA 4IWVA 3M1FA 2GELA 2P9SB 1H1VA 2P9LA 1RFQA 1BA0A 5BRHA 3AAPA 3ZX3A 4BR4A 1RDWX 2KHOA 1MA9B 1DEJA 3SMPA 3OHRA 4RWTA 3DAWA 1KAZA 3D2FB 4H03B 2A6AA 1HKGA 3JS6A 2P9NB 4ISGA 4BR2A 3MK6A 3UB5A 3EKUA 4IZ9A 4BRCA 4FWNA 1CZAN 3O4WA 1BUPA 2ASOA 4DHYA 1YUWA 4H0XB 4BRIA 2P9KB 3ZX0A 3CJAA 1C0FA 3GBTA 3W0LA 2ASPA 4CZGA 3WQUA 2E88A 2ASMA 4O5FA 3DJCA 3FR0A 4ISEA 3L4IA 3M6GA 2ZWHA 4CZHA 4QS8A 4A62A 4H5VA 4HWIA 4BROA 4Z94A 4IXCA 1SZ2A 1BO5O 2QWRA 4BRHA 3FZHA 3ULEA 1ZXOA 3AY9A 3L0QA 4YDUA 3TPQA 5AQFA 3I33A 3ATVA 2YJEA 2W40A 3JXUA 1QZ5A 4HTLA 3VESA 5AQZA 3VGMA 2QWLA 3FFKB 4CD3A 1NGFA 4M63C 5AQXA 2E2OA 3IDHA 3A8YA 5AQHA 3H3NO 2NZTA 3FZKA 3VEYA 1EQYA 3L6QA 2QWOA 5FPDA 2E8AA 3LDQA 3C7NB 3DXKA 2HF3A 3ZETB 3KVGA 4BRDA 3U9ZA 2E20A 4GNIA 4K42A 5AQUA 4BC3A 1S3XA 1DGKN 4QS7A 4JHDA 2VYPA 4IJNA 2YCHA 3WT0A 3AARA 5AQKA 3FZFA 5AZJA 3VPZA 5KPTA 3DWLA 4I6MB 5ADXH 2V52B 1BG3A 4XEIA 1Z6RA 3F9MA 4XH1A 5B8HA 3KZBA 4B1UB 3O6WA 4FSVA 5FPNA 3HBTA 3WQTA 3SLCA 5JLHA 4H0OA 1HKBA 2DPNA 3MN7A 1X3NA 4FWMA 1HLUA 4B1YB 4BR0A 2P9UA 3ENOA 5F1XA 1NGBA 2PBDA 2AA4A 3D2EA 3VETA 3ZEUA 3VEOA 1GLAG 3GL1A 3O5BA 4BRMA 4B1WB 2CGLA 2GWKA 4QS9A 3TU5A 4BRGA 2YHXA 2FLOA 3H45C 4JN4A 3VF4A 4CZIA 5AQQA 1D4XA 3ZX2A 4EHTA 2D1KA 4E1JA 2CGKA 3A5OC 4KBOA 1NGIA 4A61A 5AQGA 1T6CA 4K43A 3RSEB 3VEWA 2FXUA 4H5NA 2A42A 2QWMA 4A2BA 1YAGA 3R8EA 3LM9A 4CBXA 5LY3A 3EO3A 5AZIA 3VOVA 5ELZA 4BR9A 4RTFD 2QWPA 2Q0RA 4K41A 4BGAA 5LJWA 3LL3A 4FWKA 1GLCG 1KAYA 1K8KA 2D0PA 2E1ZA 3WXIA 3C0BA 1HKCA 4BC5A 2P9IB 5AQWA 2P9NA 3CJ1A 1HPMA 3HZ6A 2Q36A 2F9TA 4PL7A 3VERA 5ADXA 2Q97A 1MDUB 2H3GX 1LCUA 5EXWA 1U2VA 3U4LA 3EZWA 2P9LB 5AQNA 2Q31A 1S22A 4B9QA 3FGUA 3CJCA 4B1XB 3H1QA 1NGJA 2V51B 4H5TA 2IVNA 1QZ6A 1X9JA 4M7YA 3S41A 1Q18A 4MO4A 1WOQA 4CZJA 3MN9A 5AQYA 3VEVA 1P8ZA 5I9EB 5AQLA 2QXLA 1IJJA 4BR7A 1NBWA 3ID8A 1YXQA 4M7XA 4CZMA 4AM6A 4BRNA 5BPNA 2W41A 4EHUA 3FZMA 4WYBA 2GWJA 4A2AA 3W3DA 2YJFA 4JD2A 5AQOA 5FPEA 5AQIA 3UKUA 3QMLA 2A3ZA 3CQYA 2I7NA 1X3MA 3A0IX 4FWOA 4XH4A 4H0YB 4BQLA 3ULEB 3ZETA 3WEEA 2AP1A 4PKIA 4JAXA 4BVPA 3VGLA 1NGGA 5AQSA 4B1VA 3IFRA 3U9DA 3O1BA 1GLFO 1JCEA 1T6DA 1Y64A 3HSCA 1XQSC 3R6MA 2IVPA 4BG9A 1XC3A 3AAQA 1QQOA 2E2QA 3GOIA 1E4FT 3DXMB 2NLXA 4ISFA 4WQ5C 4WQ4C 5F0XA 4FOEA 5JMVA 4O8KA 2Q1NA 3DXKB 2OANA 2ZGZA 3FZLA 3MDQA 4H0PA 4BC2A 3G25A 1G99A 4BREA 4K25A 3KHYA 3UKRA 4FWSA 4JHDB 2I7PA 4BRLA 4J8FA 3VEZA 2D4WA 2CH6A 1ATSA 3QB0A 1HUXA 3D7EO 5AZJB 3VF6A 4CZFA 1TYQA 1J6ZA 4NO7A 1GLLO 1QHAA 3J8AA 4CD1A 3CERA 4FL9A 3CIPA 2FF6A 1JCGA 2YI1A 2CGJA 2P9UB 4DQ8A 3SJHA 2FF3B 1ATNA 2P9PA 3D2EB 3ZEUB 3QICA 2VCPA 1BU6O 3O80A 3A5LC 3I8BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JKCA 3V9UA 3E9PA 1ZBLA 4KKOA 3CI5A 1S72N 5LMUK 3T1AA 1L3SA 3RR7A 2A40A 3O1WA 1C1BA 3OA9A 1VQPN 3FE1A 5BRDA 4FPBA 4BRKA 1JLBA 1NGCA 3NGIA 2A1RA 1RT7A 3VA0A 3EE8A 3U3YA 3U8XA 2HF4A 4LSNA 1XUPO 2WBNA 2WUSA 2Z1GA 4CEZA 5KI6A 1EWQA 1KXPA 4CZLA 2E2NA 5BR8K 1C0TA 3P5JA 2F7TA 4BRAA 4FWPA 4CGJA 3IUCA 4DCHA 3FFIA 2UYTA 1JLGA 3SAGA 3M3ZA 1S1UA 3V4IA 4JI5K 3SV3A 1B9FA 1C0GA 1NGEA 5GIOA 3H46O 3CFRA 3THWA 4B3OA 3TAPA 4FWQA 4AHRA 1WUAA 4M3RA 1S9GA 4LC9B 3T3FA 2X78A 3KK2A 4K8ZA 2XY7A 1W7AA 3HL8A 4ZTJA 3VN5A 4C23A 5GIPA 3I56N 2O8EB 4DFMA 4E89A 1FW6A 4Z4CA 2HVIA 3KTQA 1WSIA 5CYQA 3CMAN 2VWKA 4GMJB 4YDUC 3ZCMA 3NAEA 3THYB 2YNHA 4DSJA 4KH6A 4BGBA 3MWPA 3LP0A 4MO5A 2UU9K 2E1YA 2V7ZA 4WQ5A 3QBXA 4IFVA 3MWTA 1JL2A 1U48A 1NG9A 4CFDA 3PSFA 5FLXO 3HSTB 3AO4A 5AQVA 5M1OA 3H6EA 1HPZA 3UE5A 3QFPA 2Z1JA 4H5RA 4ELTA 2JGUA 4JKGA 4M3ZA 2YKMA 3EL2A 3ZSOA 4CZEA 5KGXA 4CJWA 3CJ7A 1B92A 2IS3A 1R0AA 1Q86O 3QDKA 4V19S 4FLVA 3CXCM 4M3XA 2ITMA 5C24A 5BPLA 5AQTA 4CBUA 1LOTB 4F9OA 1KVCA 4LH4A 4CVNE 3OVNA 2D0CA 1YJ9N 1FJGK 3QNOA 3L4QA 1C0MA 3NH0A 2W6LA 2HHTA 1HNIA 1TKXA 3LANA 3SUQA 3NF8A 3MN6A 2X6SA 1WSEA 4DS5A 3H1VX 1TUUA 4OGCA 4LFAK 4CBWA 4L8RB 2JLEA 4Z0UA 4E7HA 2DY4A 5KPRA 1TKDA 4H4OA 5HOOA 4IWVA 4DTUA 4IG3A 1VQ7N 3L8BA 2P9LA 4LSLA 4MDAA 3RWUA 2DFEA 4BR4A 5KRTA 3T1YK 2EHGA 1RT5A 3OHRA 4RWTA 1A5WA 3D2FB 4H03B 2A6AA 4O4GA 3LWMA 5J2MA 3EKUA 4IZ9A 4BRCA 3O4WA 3K0SA 4FK2A 3TAEA 4H0XB 2P9KB 3ZX0A 2IC3A 4CJUA 1C0FA 2E6LA 2G8VA 4LY7A 4PHTX 3EE9A 2RPIA 3LP1A 4QS8A 4EP4A 2ZQBA 4H5VA 4BROA 4CCHA 3C6TA 4GVEA 3OYIA 3TTCA 4BE1A 4GKJK 3FZHA 4H8KA 3TPQA 5AQFA 1LW0A 3I33A 3E9LA 5I3UA 3AVKA 2YJEA 3KKSA 3JXUA 5AQZA 4J2AA 3FFKB 3RRHA 3K9KA 4U67L 3TANA 3H3NO 4CK2A 3VEYA 2QWOA 3LDQA 3C7NB 5FROA 4KB1A 1OVYA 2DFHA 3V9WA 1OH6A 3KVGA 2E20A 5AQUA 2HBMA 1DGKN 4FJ7A 4GV9A 5JVHL 4IJNA 3O4NA 1DLOA 5AQKA 5M1QA 4OLBA 3FZFA 4B9LA 1QVFM 3K9JA 4O5BA 5KPTA 3F9KA 5SZTA 3L3UA 1C1CA 3O6WA 4C8MA 4FSVA 3HBTA 4H0OA 4RW6A 2O8FB 2WONA 1HLUA 3MECA 3N4PA 4BR0A 5M1KA 3T7ZA 3L2UA 3AGKA 5MLCQ 5F1XA 1SL1A 1NGBA 4BRMA 4B1WB 2CGLA 4LH5A 3TU5A 4CIGA 1YVUA 3H45C 3SAFA 1I94K 4JN4A 4CGGA 1ZBFA 3SPZA 1D4XA 4EHTA 3DLLL 3G6EN 3ZSYA 4GV3A 2QKBA 3RSEB 4DUYK 1RBTA 4H5NA 3EY1A 1GOCA 3V9ZA 3G71N 4IOXA 1BIUA 4ELVA 3OS0A 5LY3A 1YI2N 4E1MA 4RW9A 3ITHA 4DKWA 4DFKA 5KTQA 4KREA 3KKRA 1K8KA 2D0PA 2E1ZA 3WXIA 3SBTA 3VA3A 3C0BA 3I55N 4BC5A 4KHWA 3EEQA 1HPMA 4DR2K 3HZ6A 5HRSA 3VERA 3HXMA 1X1PA 4KHSA 2H3GX 4KFBA 2Z1IA 3U4LA 1BIZA 3EZWA 4DR6K 4B9QA 1IH7A 1RTDA 3QEWA 3F2KA 4H5TA 4CJQA 3S41A 4CZJA 3ZSVA 3P83D 1YT3A 3CC7N 1IJJA 4BR7A 2VQFK 2O4GA 4JI2K 4CK3A 2XY8A 4M7XA 3KLIA 5KRSA 5GAEP 4QAGA 3C95A 5AQOA 4F4KA 1J53A 3DRRA 1S5JA 2I7NA 4KH4A 1QS4A 3ULEB 3TTFA 3O9SA 1X9MA 4JAXA 4YNQA 4GV6A 3VQ7A 4IO9L 5J2QA 4KHQA 5CY4A 4OLAA 1BQMA 3HSCA 4CF1A 3TABA 4BG9A 1XC3A 3AAQA 1QQOA 2E2QA 3GOIA 3PUFA 3M5RA 1REVA 4XIUA 4X66K 2Q1NA 2OANA 5CZ1A 3MDQA 3OYGA 1NK8A 1WBDA 3TSPA 3OW2M 2F8SA 4ELUA 4FLYA 1VSKA 3UKRA 4FJXA 3HJFA 4LF9K 3VEZA 4Z4GA 4BWMA 3VQCA 4DTPA 1ASUA 3C6HA 1ATSA 4CJRA 3NHGA 3QEVA 3KK1A 4WF9L 4HTUA 3KD1E 3VQ8A 1QHAA 3OYCA 1VQON 2YI1A 4DV7K 4CECA 3Q7BA 5C10A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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