4EIAA

Activator of the 2-hydroxyisocaproyl-coa dehydratase from clostridium difficile without nucleotide
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
MYTMGLDIGSTASKGVILKNGEDIVASETISSGTGTTGPSRVLEKLYGKTGLAREDIKKVVVTGYGRMNYSDADKQISELSCHARGVNFIIPETRTIIDIGGQDAKVLKLDNNGRLLNFLMNDKCAAGTGRFLDVMAKIIEVDVSELGSISMNSQNEVSISSTCTVFAESEVISHLSENAKIEDIVAGIHTSVAKRVSSLVKRIGVQRNVVMVGGVARNSGIVRAMAREINTEIIVPDIPQLTGALGAALYAFDEAKESQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Clostridium difficile
publication title On the ATP-Dependent Activation of the Radical Enzyme (R)-2-Hydroxyisocaproyl-CoA Dehydratase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Activator of 2-hydroxyisocaproyl-CoA dehydratase
total genus 74
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4eiaA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4eiaA01
5AQSA 4CBUA 2VYPA 4MLHA 5BN8A 4BRMA 4JNEA 3QBXA 1YAGA 2P9IA 3L4IA 3VOVA 2Q36A 3CHWA 1NGGA 3M1FA 5CE3A 4BRCA 1MWKA 5AQKA 4FPBA 3VEXA 1NMDA 1ESVA 3A8YA 4CBWA 3SJHA 3D2FA 4BR7A 4BRDA 5KPZA 2E88A 3ULEB 2ASOA 4H5WA 4F9OA 5AQIA 2A40A 2ASMA 3EKSA 4FO0A 2P9KA 4B1YB 3ZETB 1ZBSA 2E2PA 3IFRA 1JCGA 3C0BA 4CZKA 3BUZB 1C0GA 3VGKA 4H5TA 1XC3A 4EAHD 1SZ2A 5BREA 2V52B 3QBWA 4FWOA 2E2QA 5AFUA 4FOEA 3CIPA 4BG8A 5F2RA 3CJAA 2V51B 1ZC6A 4H0VB 2QWMA 2D4WA 3ZEUA 3QICA 3DAWA 2FLOA 4JAXA 3VPZA 4H0TB 3DXMA 5ADXA 3M3ZA 3VGLA 3WXLA 4FWQA 2YHWA 2W40A 2P9NB 2QWRA 4BVOA 2P9SB 4M7YA 3A5LC 2ZWHA 3VEOA 3BF3A 1QQNA 4A2AA 2P9LB 2HF4A 2V7ZA 1K8KA 5LY3A 5AQOA 4LC9B 3CJ7A 3CJBA 4H0PA 3MN9A 4BR4A 2P9IB 1NGAA 5JLHA 1IJJA 1HKCA 1XQSC 1NGIA 2BUPA 5AQZA 4PL7A 5KPRA 1V4TA 1ATNA 3CI5A 4EHTA 4FWSA 2QWNA 3RSEA 2P9UB 4GNIA 3H3NO 3WEEA 3A5MC 1BA0A 2A6AA 4B1XB 2CGJA 3SK3A 2EWSA 3GBTA 4CZEA 1BA1A 2J4RA 5BRHA 4CZFA 1Z6RA 4B9QA 5JICA 2FSNA 1S22A 4KBOA 2E1ZA 3LDOA 4WQ5A 4YDUC 3VERA 3GE1A 4RTFD 4BROA 1YVNA 2ZGZA 3DXMB 5AQJA 3VF2A 2FSJA 5AQRA 3EO3A 3I8BA 3W3DA 3MMVA 4FWMA 1MDUB 3FZLA 2YHXA 1S3XA 5AZIB 1JCFA 4JD2A 1X3NA 3JXUA 4FPAA 4BREA 2H3GX 1DEJA 3FR0A 1TYQB 2QM1A 4E1JA 3HM8A 1MWMA 2AP1A 4FSVA 4M7XA 3CJCA 4IO8A 3LDNA 2ITMA 1HLUA 1GLEG 4Z94A 5AZJB 3H46O 2Q1NA 2NLXA 3IDHA 1KXPA 1Z05A 3AAPA 5E26A 4WYBA 5EXWA 1GLDG 5JLFA 1BU6O 1BDGA 3C7NB 4IWVA 4QS7A 3O80A 3O1BA 4BGAA 4A62A 2E8AA 5AQVA 1G99A 1D4XA 3H1VX 4CZLA 1HKBA 5FPDA 4B1UB 3MDQA 2BTFA 3A0IX 4EFHA 5BRFA 4YDUA 3U4LA 3AAQA 3FE1A 5I9EB 2F9WA 3P4IA 1ATSA 3GOIA 1XUPO 2A41A 3SLCA 2FXUA 3DXKB 2YHYA 3SMPA 4AM6A 4H0XB 3VEVA 2IVNA 5AQGA 3LM2A 5EVZA 4BG9A 1T6CA 2IVPA 3ENHA 3HI0A 3VEYA 2D0PA 1GLLO 3TU5A 1LOTB 4XH4A 4NO7A 4BR0A 1T6DA 3WUHA 1MA9B 1KAYA 3CQYA 4BRAA 4WQ5C 1R59O 2OANA 5BN9A 3D2EB 3DWLA 3O5BA 4DB3A 2HMPA 4CZHA 4K41A 5LJVA 3R8EA 2KHOA 1NBWA 3UKRB 4BR9A 2QWPA 2HOEA 3LDQA 3UKUA 4PL8A 3ZX3A 5BPNA 3SMSA 4B1WB 3WXKA 4QS8A 4K25A 2NZTA 3KVGA 1BO5O 2YCHA 3FGUA 4RWTA 3ATVA 4B1VA 1Y64A 4I6MA 4BRNA 3CJ9A 3D2FB 3FLCO 4Y0WA 5AQYA 3VETA 3CQXA 5AQPA 3WXJA 3LDPA 5EX5A 4PKGA 3VF6A 2P9KB 3QFPA 4O8KA 2PBDA 2GELA 3FZHA 4A61A 2QWQA 2Q97A 3GG4A 4BR5A 2DPNA 4GY2B 5FPNA 2QWLA 1KAXA 1X9JA 4FWNA 3LDLA 1V4SA 1QZ6A 2GEMA 5LJWA 1RDWX 5BPMA 5BPLA 4EHUA 1HKGA 4IZ9A 1GLCG 3ZEUB 4NB4A 1EQYA 1RFQA 3HZ6A 4BRKA 3BEXA 2IVOA 1CZAN 2QW9A 1QHAA 3MK6A 4IJNA 3WQUA 3J8AA 1JCEA 3O6WA 4H5RA 4B1ZA 3O8MA 1E4FT 3ULEA 4RCHA 1K8KB 4BC3A 5KQDA 4BQLA 3IMXA 4ISGA 4QS9A 4L3QA 1QQMA 5EOYA 2FF3B 3DJCA 3UE5A 4A2BA 3U8XA 3ATUA 4IXCA 3MN5A 3JS6A 3D7EO 3BF1A 5FPEA 4XH1A 4BRPA 4EIAA 3GL1A 3FZKA 1NLVA 2ZF5O 3WQTA 1P8ZA 4BR2A 5AR0A 3RSEB 1TUYA 4CZIA 5AQHA 3M6GA 3WEEB 4XH5A 3L6QA 1NGJA 2E2NA 3VF4A 2VCPA 5JMVA 1ATRA 2QWOA 3QB0A 4AM7A 1BWFO 3H3OB 4WQ4A 2GWKA 1ZXOA 2W41A 3GDQA 2ZGYA 3LL3A 2P9NA 4DCHA 3B8AX 2P9SA 2Q31A 3H1QA 3MCPA 3O1WA 5ELZA 4BGBA 2P9LA 5BR9A 3CERA 5AQUA 3R9PA 3F9MA 5KQ8A 2CGKA 3VEWA 1T44A 3O08A 1X3MA 4H5NA 4JN4A 4BRFA 2ASPA 4HWIA 4JD2B 3QMLA 2PAVA 3I33A 2YJEA 1NGHA 3AARA 1TUUA 3H45C 1NGDA 2GWJA 4FOIA 5AQQA 3UB5A 1YXQA 2I7NA 4ISEA 1NGCA 4MO5A 1HX1A 2F9TA 3KZBA 5AQLA 3WT0A 2P9UA 4CZJA 3VESA 4H0OA 4BRIA 3H6EA 5AQNA 4BVPA 4BRGA 5TKYA 1WUAA 3ID8A 4O5FA 2FSKA 1C0FA 2HF3A 5E84A 3QDKA 4BQZA 2I7PA 5AQTA 1DGKN 3ENOA 2IIRA 1LCUA 4C23A 3G25A 1BOTO 4MO4A 3U9ZA 1NGFA 4CD1A 3KHYA 3WXIA 4JHDA 5FPMA 5AZIA 3A5NC 5F1XA 4IJAA 3S41A 1KAZA 4PKIA 4CJ7A 2E1YA 3EZWA 3QFUA 3FZFA 5B8HA 1TYQA 3L0QA 1BUPA 1E4GT 4MLEA 2CH6A 2D0OA 4DQ8A 2NRHA 2P9PA 3CJ1A 3MN6A 5AQWA 4WQ4C 5AQMA 2Q0RA 5AZJA 4FL9A 1HUXA 2Q0UA 1NWKA 1RGIA 1U2VA 4DHYA 1QZ5A 1GLJO 1YUWA 4FWKA 3C7NA 3MN7A 2YJFA 1SAZA 2GTDA 1J6ZA 3LM9A 5EY4A 5KPTA 3U9DA 2WUSA 3EN9A 1U6ZA 2CGLA 1GLFO 3ZX2A 3ZX0A 4H03B 2YI1A 2UYTA 1GLAG 3IUCA 4FWPA 5F0XA 2VWBA 3FZMA 3O4WA 3VENA 4K43A 3UKUB 1OKJA 1HPMA 2GUPA 2V7YA 2A3ZA 2CH5A 3FFKB 2D1KA 3ZETA 4BC4A 1GLBG 1IG8A 4BRQA 4CI6A 4ISFA 4BC5A 3R6MA 3TPQA 4CZMA 3DXKA 4BRHA 1Q18A 2E2OA 2QXLA 5AQXA 5AFUH 4I6MB 2A42A 1NM1A 1SQKA 4CZGA 1H1VA 3EL2A 4FWRA 4XEIA 4JHDB 5ADXH 3AY9A 2FF6A 4BC2A 4H0YB 2A5XA 2AA4A 3VEZA 1DKGD 1WOQA 5BRDA 3OHRA 3A5OC 1BG3A 4CD3A 2P9PB 2E20A 4H5VA 3CETA 3HTVA 3HSCA 1HJOA 4HTLA 3D2EA 4K42A 5AQFA 3EKUA 4M63C 1U2VB 4FWLA 1NGBA 1NGEA 3HBTA 4PKHA 4BRLA 1QQOA 3BP8A 2Q2RA 4J8FA 3W0LA 4CBXA 3UKRA 3VGMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5GAEP 5AQSA 2F4VK 3AVAA 4BRMA 1TGOA 3QBXA 3SAGA 4Z4EA 1BI4A 4OVLA 4CERA 3ZSWA 3VTHA 1JLCA 3NF6A 5AQKA 1NMDA 3D2FA 3ULEB 4DSEA 1WSIA 2A40A 4FO0A 2ZJQL 1VQON 1JCGA 1T7PA 3THYB 3L2RA 4LF6K 1QSYA 1RDAA 4MDAA 3VQDA 4I2QA 1WB9A 1EO1A 4JS5A 4FWOA 2RF2A 4BG8A 3CIPA 5F2RA 4RW7A 2QWMA 3QICA 4JAXA 3K5NA 5ADXA 3M5RA 3VQAA 3WXLA 2VG7A 4JRPA 4FXDA 1RT2A 2W40A 2P9NB 2QWRA 3SJJA 5D3GA 3F9KA 2YHBA 2ZWHA 3SQ1A 1HPZA 4ICLA 4CEBA 4A2AA 1NK5A 4GVMA 2HF4A 5LY3A 5IWAK 5AQOA 3CJ7A 4JKCA 5KGWA 3MN9A 3DLEA 1D5AA 3CM5A 3TSUA 3HOTA 1HKCA 2LSNA 1TK5A 2B4JA 4LY7A 5AQZA 3QLHA 3DLHA 1LAWA 4MFBA 2R7YA 1VQ9N 2NRWA 3H08A 2QWNA 1O13A 4M3TA 2P9UB 4GNIA 3A5MC 4KKOA 3CCMN 4B1XB 3OYGA 2CGJA 2E5LK 3L4QA 4TSXA 4BE1A 4CZFA 5JICA 2AJQA 2E1ZA 4YDUC 4F8RA 5HBMA 2ZGZA 4EP5A 2ZJRL 2Z1HA 2F96A 2D5RA 4KHQA 4M42A 4FWMA 1MDUB 4JD2A 4ILJA 3C94A 3K59A 4CFBA 3F2KA 1S9GA 3FR0A 2QKKA 2QM1A 4JYAK 4RW8A 2VG6A 1RBSA 3JYTA 4B9TA 2HMIA 1WSJA 3FFIA 4IDKA 3AO4A 1X9MA 2YNFA 3T1AA 4NYFA 1KXPA 4CHPA 2XY7A 5E41A 2XO7A 4QCLA 2X6NA 3OYBA 3G4SN 4OPHA 3C6AA 1BDGA 2IC3A 2F8TA 4ID5A 1YJWN 2YX6A 3T7ZA 4LH4A 2A1SA 1HKBA 2GX9A 3LDSA 5FPDA 2DY4A 4EZ9A 3B6PA 4YDUA 1IBLK 4J2EA 3U4LA 1BHLA 4PHTX 3LPTA 4LF5K 2FBYA 4JKDA 3HYFA 4AHVA 2B5JA 5HOOA 1HJRA 1ATSA 4CHOA 1XUPO 1X9SA 3DXKB 2YHYA 3TTCA 1U04A 3VEVA 3IKMA 3OYKA 1XHZA 3O3HA 3L3UA 1KLMA 2P1JA 3QNOA 3ENHA 3VEYA 3K57A 3ZT2A 5HROA 1S6PA 4DTMA 3TU5A 3TAGA 3VQPA 3NGZA 1EETA 4CJRA 4Z4FA 1WLJA 4WQ5C 4B9VA 2E6LA 1XC9A 2KZZA 3D0PA 1RT7A 1Z26A 3RR8A 4CJKA 2O8FB 3LP2A 4DB3A 3ID6A 3RMAA 2G8IA 1QVGM 3R8EA 3RVCA 3T1YK 3D45A 4CFDA 4DSFA 1IG9A 3SMSA 4MDBA 3NF7A 3E1YA 4DU1A 2NZTA 3TANA 4B08A 4CGJA 3PLAA 3V9UA 4RWTA 1CXUA 1Y64A 4BRNA 3G10A 3CQXA 5EX5A 4PKGA 4FLZA 1Q9YA 4OKEA 4BR5A 1KC8O 5FROA 5A2QO 5GADP 4M3UA 3LDLA 1V4SA 1QZ6A 2GEMA 2OYQA 1IBMK 1EX4A 4EHUA 3HPHA 1HKGA 4IZ9A 3SZ2A 2Y1JA 4LH5A 3CFOA 3QEWA 1NK6A 1EQYA 2HBKA 4F3TA 3AVMA 4KHWA 1E3MA 3BEXA 4H4MA 4BDPA 2NRXA 3OYNA 2UXDK 3J8AA 3MXJA 3O6WA 3KTQA 3I8DA 4B1ZA 3NCIA 4CJTA 4CHNA 3CFPA 3KK7A 4RCHA 4BQLA 3V1OA 1RT6A 4JRQA 4L3QA 3V1QA 3MXMA 5HRPA 3THWA 2UUBK 2FF3B 3UE5A 4A2BA 4KAZA 4DV2K 4AHRA 2O8BA 3CQ8A 3MN5A 5SWMA 3SV4A 3FZKA 3JSMA 4W5OA 2ZF5O 4EP4A 3RSEB 4F4KA 1VQ6N 1NGJA 3VF4A 4UQGA 3QB0A 1BWFO 4B3MK 4DUYK 3GDQA 1GOBA 1MU2A 4RW6A 3B8AX 1WSEA 4DQPA 3H1QA 4BGBA 5ELZA 4CGIA 4WCEL 4FM2A 3O9QA 4ZHRA 4LSNA 4BRFA 2G8WA 4HWIA 4KH4A 1B92A 3QMLA 3LZIA 1TKDA 4LF7K 3AARA 2GWJA 4FOIA 3UB5A 5C25A 3WNEA 4AHUA 4W5QA 2G8KA 2HHQA 4KHYA 1NGCA 3OYEA 3KZBA 3WT0A 1QVFM 3I55N 4BRIA 4BVPA 3VQ5A 1X1PA 4DTPA 1L3UA 1HNZK 2RN2A 5TKYA 2KFNA 4HUGA 3QDKA 1DGKN 4KTZA 2IIRA 4CE9A 3O9SA 1C0UA 3OYFA 2KLAA 3M8RA 1YITN 2UUAK 3TR8A 4JHDA 3WXMB 5AZIA 3EE8A 5F1XA 2JGUA 1REVA 2E1YA 1WSGA 4KFBA 1NJIO 3QFUA 1KRPA 2X6SA 3L0QA 3AVHA 1VSKA 3VN5A 3SAFA 4WFNL 4DTOA 5LL6Z 2HHTA 3SUQA 5C2DA 1HYZA 3QEVA 2O8EB 3MN6A 4E1NA 4LFBK 1YI2N 5AZJA 4NLBA 2ATQA 4IO9L 1YUWA 4C8OA 4C8NA 2GTDA 1J6ZA 4DF4A 2P51A 2WUSA 4AHSA 2QK9A 2CGLA 1GLFO 2D0AA 1EXQA 3ZX2A 2UYTA 1Q82O 4IOCL 3K0SA 3OS1A 1HPMA 1EWQA 3AO5A 1DT9A 2JWKA 2HBMA 3ZETA 4BC4A 4CI6A 3SUPA 3AA3A 2W42A 3TPQA 4BRHA 1RDUA 2QXLA 5AFUH 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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