4EIAA

Activator of the 2-hydroxyisocaproyl-coa dehydratase from clostridium difficile without nucleotide
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
MYTMGLDIGSTASKGVILKNGEDIVASETISSGTGTTGPSRVLEKLYGKTGLAREDIKKVVVTGYGRMNYSDADKQISELSCHARGVNFIIPETRTIIDIGGQDAKVLKLDNNGRLLNFLMNDKCAAGTGRFLDVMAKIIEVDVSELGSISMNSQNEVSISSTCTVFAESEVISHLSENAKIEDIVAGIHTSVAKRVSSLVKRIGVQRNVVMVGGVARNSGIVRAMAREINTEIIVPDIPQLTGALGAALYAFDEAKESQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Activator of 2-hydroxyisocaproyl-CoA dehydratase
publication title On the ATP-Dependent Activation of the Radical Enzyme (R)-2-Hydroxyisocaproyl-CoA Dehydratase.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium difficile
molecule tags Electron transport
total genus 74
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4eiaA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4eiaA01
5KPZA 2NRHA 4BVPA 1NGCA 3HI0A 1GLJO 3ZX3A 5LY3A 1SQKA 4FWPA 1CZAN 1YUWA 4B9QA 3KHYA 4IO8A 1ZBSA 3UE5A 1NMDA 3QBWA 3DWLA 1U2VB 4BRFA 3KVGA 4WQ4A 1X3NA 3MCPA 3ZEUA 4BR4A 5AFUA 3VEVA 3WQUA 5AQTA 4WQ4C 3A5NC 3MN7A 4I6MA 2CH5A 5E84A 1Q18A 3MN5A 3DXKA 1HKCA 3VF2A 3C0BA 4PL7A 1BO5O 3W0LA 3GE1A 5AQJA 5I9EB 2CGJA 3VESA 3VEOA 3M6GA 2E2PA 4H03B 3MDQA 2YHYA 1QZ6A 4XEIA 2F9WA 4CZHA 3CQXA 5KPTA 1SAZA 2P9SA 5AQIA 4JD2A 2HMPA 4B1UB 3WEEA 3QFUA 3AY9A 4B1ZA 4CBWA 5FPNA 4NO7A 1U6ZA 5AQRA 3VPZA 2QWQA 4FWMA 2YHWA 5AQFA 2ZWHA 2A5XA 1HKBA 1GLAG 1ZXOA 4GY2B 1NGHA 3VF6A 4PKIA 4I6MB 5AQLA 3CJBA 2GELA 3DXKB 4XH1A 1MWKA 1NGJA 3CJAA 4IWVA 4BQZA 4EHUA 3ENOA 5AR0A 4JNEA 2YI1A 4QS8A 3LDLA 4H0PA 1BDGA 4H5TA 4K41A 5BREA 4QS7A 3I8BA 2BUPA 3TU5A 2HOEA 5KPRA 4CI6A 1QQOA 2UYTA 2QM1A 2CGKA 3QB0A 4MO4A 4CZEA 2IVNA 2Q36A 4A61A 3WEEB 1NWKA 2FF3B 2H3GX 2A41A 1ATSA 1NGBA 2FSJA 5AQGA 4IJAA 5AQZA 3RSEB 3R6MA 1Z05A 3O1WA 3VEYA 2GEMA 1SZ2A 3OHRA 3CI5A 5EX5A 5EVZA 5BRFA 3QFPA 1Z6RA 4BRNA 2E8AA 3EL2A 1ESVA 1EQYA 3H3OB 3FR0A 1RDWX 4IXCA 4BROA 3LDPA 4FWRA 2NZTA 2D0PA 5LJWA 1MA9B 3UKRA 4H0TB 2E2NA 4XH5A 3EKUA 4YDUA 5BRDA 4CD1A 4BRDA 5ADXH 3HBTA 1BU6O 3O8MA 4YDUC 3FE1A 4GNIA 2P9IA 4CZFA 4A2AA 3WUHA 2D1KA 3ATUA 4CD3A 5BPMA 4FOEA 2P9UA 1KXPA 4BRHA 1NGDA 3FZHA 3GDQA 5KQ8A 1NGAA 3LM9A 4A62A 3WQTA 1QQMA 2E1YA 3C7NA 2F9TA 4H5NA 5F2RA 1D4XA 3ATVA 2KHOA 5AQSA 4K42A 4EHTA 1ATRA 3G25A 1OKJA 3WT0A 2V51B 1H1VA 1DKGD 3EKSA 4HTLA 4BVOA 2QWOA 4EIAA 3QICA 3A5OC 1K8KA 1BG3A 2QWRA 2Q97A 4BRAA 2OANA 4O8KA 3VETA 4B1WB 3JS6A 4BR2A 3P4IA 1HKGA 2GUPA 4B1XB 1C0FA 5AQNA 2P9UB 4JHDB 1P8ZA 1NGEA 1S22A 2YCHA 4FWSA 2WUSA 4FPAA 4FWOA 2ASOA 3ENHA 4BC2A 2ZGYA 3GBTA 5AZIA 3O6WA 2V7YA 2ASPA 3C7NB 3CJ9A 3J8AA 3U9ZA 2QWNA 1GLFO 1MDUB 2FLOA 4BREA 2DPNA 5ADXA 3U8XA 3LDQA 4DB3A 4BG8A 4DQ8A 4BRKA 3F9MA 3SMSA 3I33A 4BRLA 5JLHA 1NGGA 3O5BA 3ZEUB 2QWPA 3O1BA 2HF4A 3HTVA 3IFRA 3FZLA 1NLVA 4ISEA 3CJ7A 5JICA 1K8KB 3EO3A 5AQHA 5BPNA 4BR5A 3CERA 5KQDA 5F0XA 4BR9A 4H5VA 3DXMA 5AQXA 3FLCO 2CH6A 3D2EA 2VWBA 4H5WA 3VEZA 4K25A 3H1QA 4MO5A 4F9OA 4FSVA 5AZIB 5EY4A 1XUPO 1GLCG 3VGLA 1NM1A 4AM6A 4IZ9A 2FSNA 2P9SB 2QXLA 2D4WA 2ASMA 4O5FA 4JD2B 5F1XA 1S3XA 3FZKA 3VF4A 4FWQA 3SJHA 3L6QA 1TUYA 3CHWA 2PAVA 3DAWA 3SK3A 4K43A 5BRHA 3W3DA 1TYQA 2IVOA 2P9LA 3MMVA 5BN8A 5AQVA 1HPMA 1GLEG 3IUCA 4AM7A 1NGFA 1V4TA 4JN4A 4CZKA 2Q31A 2ZGZA 4A2BA 2VYPA 5JLFA 4FWLA 3FGUA 2D0OA 2FF6A 3DXMB 2E20A 3VERA 2P9NA 3D2EB 2P9PA 1HUXA 4B1YB 1LOTB 3HM8A 3VEWA 4CZJA 5AZJA 1T6DA 4FO0A 5BN9A 3WXKA 2QWMA 4BR0A 3S41A 4FWKA 4CZIA 3EZWA 2E2QA 2Q2RA 3DJCA 3ZX0A 4EAHD 4PL8A 4DHYA 1E4FT 4BC3A 2HF3A 1TYQB 1IJJA 2P9LB 2A3ZA 5BR9A 3A8YA 2E1ZA 1T6CA 3H3NO 4BRQA 2QW9A 4IJNA 5LJVA 2IVPA 5FPDA 4RCHA 3H45C 3QDKA 3H46O 5B8HA 3M3ZA 1KAXA 3ULEA 1X9JA 3VOVA 3LM2A 4XH4A 1V4SA 3UKRB 4CJ7A 4H0VB 3ZETA 3FZMA 4WQ5A 3AARA 1BUPA 1XC3A 1LCUA 5CE3A 1BOTO 4WQ5C 2A42A 2AA4A 3CETA 1IG8A 2P9IB 3FZFA 3ZX2A 3MN6A 1HX1A 2VCPA 1DEJA 2P9KA 3MN9A 2PBDA 3M1FA 2V52B 5JMVA 4RWTA 3A5LC 1BWFO 1Y64A 3QMLA 4BRMA 1JCFA 1DGKN 2A6AA 3D2FA 4H0YB 1HJOA 2GTDA 3VGKA 3AAPA 3D7EO 2YJEA 4JAXA 2ITMA 3BF1A 3ULEB 2ZF5O 1XQSC 2YHXA 4FPBA 2NLXA 5E26A 5AQMA 4MLHA 1NBWA 4CBXA 2YJFA 1R59O 3ZETB 2IIRA 3GG4A 4FOIA 3UB5A 4RTFD 4C23A 5AQOA 3BF3A 4CZGA 1TUUA 4ISFA 4Y0WA 4J8FA 2FSKA 1WOQA 4DCHA 1KAZA 1QHAA 1QZ5A 3A5MC 2A40A 5AQKA 4BRIA 1NGIA 4WYBA 3CIPA 4CZLA 2P9KB 1GLLO 4CZMA 4PKHA 3RSEA 1X3MA 4QS9A 1E4GT 3ID8A 3LDOA 4BQLA 1RFQA 3VEXA 2QWLA 3L0QA 4BRPA 1GLBG 3U9DA 3D2FB 5TKYA 3WXJA 1GLDG 2GWJA 5AQQA 3O08A 1C0GA 4FWNA 2V7ZA 4M7YA 2W40A 5FPMA 1G99A 3LL3A 3R9PA 1YAGA 3SLCA 3UKUA 4BC5A 1RGIA 5AQWA 4B1VA 4CBUA 3HSCA 3O4WA 3QBXA 4HWIA 4M7XA 5AQPA 4NB4A 2AP1A 4M63C 5EXWA 3KZBA 3R8EA 4H0OA 4H0XB 1JCEA 5BPLA 2I7PA 1HLUA 3CJ1A 4PKGA 4BR7A 3LDNA 1YXQA 5EOYA 2BTFA 4FL9A 1YVNA 5AQYA 5AFUH 3WXIA 4MLEA 1WUAA 3A0IX 1ZC6A 2I7NA 3GOIA 2Q0RA 4BGBA 3GL1A 1BA0A 3O80A 4BGAA 3CJCA 2J4RA 3MK6A 2E2OA 3SMPA 2E88A 3H1VX 4H5RA 4BRGA 2Q1NA 4L3QA 3BP8A 3UKUB 1BA1A 3IMXA 2EWSA 5ELZA 4BG9A 1J6ZA 3U4LA 4Z94A 1U2VA 3H6EA 3TPQA 4E1JA 3EN9A 1T44A 3CQYA 1KAYA 3B8AX 3JXUA 1MWMA 3FFKB 1JCGA 2W41A 2GWKA 4BRCA 3VGMA 4ISGA 4LC9B 1QQNA 3BEXA 3HZ6A 2P9NB 4BC4A 2P9PB 4JHDA 4EFHA 3BUZB 1ATNA 3VENA 3AAQA 2Q0UA 5AZJB 3L4IA 2FXUA 3IDHA 2CGLA 4KBOA 5AQUA 5FPEA 3WXLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BVPA 1NGCA 3ZX3A 5LY3A 5FLXO 1JXEA 1EWRA 3UE5A 3QBWA 2RKIA 4CF8A 3QEXA 1S1XA 3VA3A 2O8DB 4OPAA 3V9ZA 2RF2A 4YFUA 4DU1A 4ID1A 2HBJA 4WQ4C 3U6FA 3RVCA 2CH5A 5E84A 1XNQK 4FW2A 3VF2A 3RMDA 4PL7A 1BO5O 3WNFA 3PUFA 3GE1A 4DV0K 3SBGA 3NH2A 4YOUA 3NVKA 3CCQN 2HMIA 4Z4EA 4BE1A 3CG7A 3MCAB 4GV9A 2HW3A 4CGGA 3QFUA 3AY9A 4CBWA 4CGHA 5EU7A 2UXCK 3PX6A 1S72N 4UY8O 3VTIA 3SQ1A 4J2EA 1HKBA 1GLAG 4DR7K 2O8BA 5JVGL 3EE9A 4DV3K 1YHQN 1OH5A 5AQLA 1MWKA 5AR0A 4QS8A 2O4IA 1BDGA 2BUPA 4W5TA 3TU5A 3OYLA 2QM1A 4FXDA 2G8KA 1TKXA 4Z4IA 5I3UA 4CZEA 1O13A 4A61A 4O44A 4PHTX 3QNNA 2PYJA 1ATSA 1S6PA 3RSEB 4CJ5A 3NGYA 2DTUA 1VQ5N 1Z05A 4DR6K 2EHGA 4MFBA 2O8BB 3CI5A 2ZD1A 5LMUK 3T7ZA 5KRTA 4CEZA 5AJ3K 1ESVA 1EQYA 4IXCA 3FR0A 1Q9XA 1BCOA 1BI4A 3T69A 3MX2A 4FWRA 2D0PA 5LJWA 1MA9B 4ZTFA 4ID5A 1HPZA 4H0TB 1OH6A 4DR4K 4B3TK 4KTZA 5ADXH 4DTSA 4KHYA 1KVBA 2ZJRL 3L4QA 3OYBA 4DQSA 4GNIA 3VQ9A 3O3GA 3IG1A 1KSPA 3G10A 3HOTA 4NXMK 1VSJA 3T1AA 4YNQA 4CD3A 5BPMA 4FOEA 2P9UA 2D0BA 1HQUA 2HHTA 1O1WA 1KXPA 4BRHA 3M8SA 4KB1A 3Q7CA 3GDQA 5KQ8A 4JI0K 1NGAA 3TSUA 5C42A 1VSKA 1ZBLA 2WONA 3OBWA 2F9TA 2HNYA 5KRSA 3G0ZA 4DV5K 3WXMB 4KPYA 3TI0A 2KHOA 1X9WA 1VQKN 4OJRA 4EHTA 3IRXA 4YHHK 3NDKA 4CK3A 3PY8A 4E7IA 3EKSA 4HTLA 5HROA 4M3RA 2QWOA 4MDBA 4M3YA 3J7AP 2QWRA 4BRAA 2OANA 1VSLA 3F2KA 3P4IA 1W7AA 4BDPA 2O8CA 3K57A 3P1GA 4FJ5A 3J7ZO 2P9UB 4F4KA 4JHDB 1NGEA 2YCHA 2P5OA 2WUSA 4CFDA 4FWOA 3CCRN 2ZGYA 3GBTA 2F8TA 4W5RA 3O6WA 1L3SA 3U9ZA 1MDUB 1EWQA 2KFZA 1FJGK 4BG8A 4BWJA 3I56N 1I3AA 4DTRA 3OJUA 3I33A 3CF5L 4BRLA 4UQGA 3THWA 4KFBA 1DT9A 4DMNA 3FZLA 3E1YA 4ISEA 3CJ7A 4LH4A 1XHZA 2Z1HA 3HM9A 2O8CB 1T05A 1J53A 4IOXA 2FBVA 4CF1A 3D2EA 4KTWA 4K25A 3L2QA 3O9TA 4FSVA 1U49A 3CFOA 4CEBA 3F5TA 3QETA 2FSNA 1BISA 2D4WA 3PSFA 2ASMA 3E9PA 4DTUA 1D8YA 4DTJA 4NCBA 3CHWA 1Q86O 2D5RA 4FYDA 2PAVA 5J2QA 4PQUA 4FJIA 4DV4K 3VQQA 2IVOA 2P9LA 3THWB 1QSSA 1GLEG 3RR8A 4AM7A 3ALYA 4CHOA 1N36K 2YKNA 3OYFA 2ZGZA 4A2BA 2VYPA 5JLFA 2D0OA 4Z0UA 3VERA 2P9NA 3D2EB 4I9LA 3LAKA 5C25A 1T6DA 3MWTA 5CYQA 3CPWM 1T03A 3WXKA 1XI1A 2KZMA 2X6NA 4YOYA 5HRPA 4QOZB 1VK0A 4EAHD 1N33K 1KD1O 2O4GA 1E4FT 3EZ5A 2P9LB 5BR9A 1X9SA 1VRTA 3HO1A 5GAHP 3H3NO 3HPOA 4ELUA 4BRQA 5KGXA 5LJVA 5A2QO 4RCHA 3LALA 3H46O 3RMBA 3NVMA 4XH4A 4G1QA 3OVNA 3MEDA 5CE3A 1RT7A 1IBMK 5M1OA 4DFMA 4IDKA 4WQ5C 4CE9A 3CETA 2EX3A 4R79A 1YJNN 3VQAA 3DMJA 3JAMO 3OTOK 1EETA 4CEEA 3SPYA 3AVGA 1YF5L 1C1AA 4FLVA 1OH8A 2GBZA 3VQCA 1DGKN 1SL0A 4H0YB 4AHRA 2FBTA 2GTDA 4CEDA 3AVLA 2HNDA 1WB9A 3ID6A 4FJNA 3CQ8A 1XQSC 2NLXA 1YT3A 2QK9A 1QQCA 4CBXA 3MWPA 4FOIA 1IV0A 1TL3A 3SQ4A 1IKVA 3TAEA 4GV3A 4LF4K 5IT9O 4ISFA 4J8FA 4DCHA 2E6LA 1NGIA 4DG1A 2UUBK 3HOSA 4H4MA 1NU0A 2Z1IA 3OY9A 1X3MA 4QS9A 4BQLA 3QO9A 3O4QA 2QWLA 1KLMA 1TAUA 2KZZA 3K9JA 3KK7A 2UUCK 1GLDG 3O08A 3A2FA 3CCJN 4HUEA 4OX9K 2ZJQL 4CF2A 1OVYA 4FM1A 3ZT0A 4CBUA 4HWIA 4M7XA 1YI2N 2OYQA 2HB5A 4M63C 5EXWA 2F4VK 3N4PA 1IO2A 3R8EA 5HRSA 4H0XB 1JCEA 3F9KA 4AHTA 4BR7A 3LDNA 5EOYA 4X62K 3VQEA 4FL9A 4FLTA 4IOAL 2VG5A 3WXIA 1ZC6A 2Q0RA 3T19A 3GL1A 1BA0A 3MECA 1UA0A 1SKWA 2J4RA 3SMPA 2W6KA 3H1VX 4M3WA 4CGDA 1F21A 4RG8A 1BA1A 3IMXA 2EWSA 2QEXN 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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