The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
25
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sequence length |
115
|
structure length |
115
|
Chain Sequence |
KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKF
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Inhibition of translation initiation complex formation by GE81112 unravels a 16S rRNA structural switch involved in P-site decoding.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
30S ribosomal protein S2
|
| molecule tags |
Translation
|
| total genus |
25
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| structure length |
115
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| sequence length |
115
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-03-22 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Ribosomal protein S11 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5LMU K; 3T1H K; 4JV5 K; 4JI1 K; 2UXD K; 4X64 K; 4X66 K; 4B3R K; 4YHH K; 4LFB K; 2VQF K; 4LFC K; 2UU9 K; 4DV1 K; 4X65 K; 3J7Y P; 4V19 S; 2VQE K; 4JI2 K; 1HNW K; 4K0K K; 1N33 K; 4DR4 K; 3JAM O; 2E5L K; 4DUZ K; 4GKK K; 4LF9 K; 4JI3 K; 4JI8 K; 1N32 K; 4DR5 K; 5FLX O; 2UUA K; 1J5E K; 4OX9 K; 2F4V K; 1N36 K; 3J7A P; 1XNQ K; 4JYA K; 4DR6 K; 4LF8 K; 2UXB K; 1XMQ K; 4KHP K; 1N34 K; 4DV4 K; 4LF4 K; 2UUC K; 4DR3 K; 5IT9 O; 4DV0 K; 4DV5 K; 4CVN E; 1HNX K; 4X62 K; 4B3T K; 5AJ3 K; 4LF6 K; 3T1Y K; 4DR2 K; 4LF7 K; 4DR1 K; 1XNR K; 4CW7 B; 5IWA K; 2UUB K; 3J81 O; 4AQY K; 1XMO K; 5BR8 K; 2ZM6 K; 4B3S K; 4B3M K; 2UXC K; 1I94 K; 4LFA K; 4JI0 K; 4JI7 K; 4DUY K; 3OTO K; 1HNZ K; 5A2Q O; 5LL6 Z; 4DV6 K; 1IBK K; 1IBL K; 4JI6 K; 4DV2 K; 1IBM K; 4NXM K; 4DV7 K; 1FJG K; 5LMN K; 4NXN K; 4JI4 K; 2HHH K; 4YY3 K; 4JI5 K; 4DR7 K; 4GKJ K; 4LF5 K; 4DV3 K; 1HR0 K; 3J80 O; #chains in the Genus database with same CATH topology 1RBS A; 1RDW X; 4CGD A; 1QQM A; 5DM6 L; 3CXC M; 3OYI A; 3ZSZ A; 3ZEU A; 3ALY A; 4CJ4 A; 3NCI A; 4DFK A; 1JCG A; 1MA9 B; 3U8X A; 1TV6 A; 4OGE A; 3U3Y A; 2VGM A; 2G8K A; 1D8Y A; 3HPO A; 3TAM A; 3VQ6 A; 1VQ9 N; 5LJV A; 5FRM A; 3LAM A; 1C1B A; 1RT3 A; 4ILJ A; 4JI8 K; 4CHQ A; 4I7F A; 3MEG A; 4CJF A; 4CF9 A; 5CR4 A; 3AAP A; 1VSJ A; 4OKJ A; 4M3Y A; 3MCA B; 2OPQ A; 1VK0 A; 3VQ7 A; 4Z4I A; 1JLC A; 1ASV A; 2ZE2 A; 4KFB A; 3CD6 N; 4ISG A; 1NMN A; 1K73 O; 4M63 C; 3P83 D; 4JKC A; 2QM1 A; 3WNH A; 2ZJQ L; 3SUP A; 1WSI A; 1NM1 A; 3HRG A; 1YTA A; 3KKR A; 3F9M A; 1VSI A; 3AVH A; 1NGC A; 2HOE A; 2PFU A; 2FBT A; 3DLE A; 1VSF A; 4IO8 A; 1IKY A; 2QWM A; 3FGU A; 1RBV A; 1K6Y A; 1ITG A; 2ZM6 K; 4GY2 B; 4F3O A; 1ZYQ A; 4B3M K; 3SJH A; 2KFZ A; 4DG1 A; 1NKE A; 4LFA K; 1EQY A; 4JI0 K; 5HLF A; 4YOV A; 4ILG B; 5DM7 L; 1DEJ A; 3I56 N; 4DF4 A; 2A1R A; 3OYA A; 2PAV A; 3IAY A; 3LWL A; 3HYF A; 1C1A A; 3OS2 A; 1LV5 A; 4O4G A; 3CHW A; 3VMF B; 1RDA A; 1HLU A; 3CFO A; 4JI4 K; 3RR7 A; 5J2M A; 5J2Q A; 4DV3 K; 4WCE L; 5GIO A; 1T6D A; 1W9H A; 2RN2 A; 2R7Y A; 2O4G A; 4A62 A; 3WNG A; 2E1Z A; 3MXM A; 1YT3 A; 4DSI A; 2VCP A; 5JVG L; 2GEL A; 5KPZ A; 3VQ5 A; 4N41 A; 4MLH A; 4ICL A; 1VQ5 N; 3MK6 A; 4DU1 A; 3P31 A; 1D9F A; 3AV9 A; 3W0L A; 1KAY A; 1Q82 O; 3A5L C; 3FFK B; 1X3M A; 3LPT A; 3KK2 A; 1NKC A; 2O8E A; 4MQ3 A; 1B9D A; 2P9K B; 3ASM A; 3L4I A; 4BR9 A; 3VEZ A; 3VET A; 4DMN A; 4PWD A; 4EIA A; 3CCU N; 1YJ9 N; 1KLM A; 4E19 A; 4DSK A; 1KAZ A; 4CJ7 A; 3E1Y A; 2KZZ A; 3VQQ A; 1NGA A; 3ZT1 A; 4JD2 B; 1FK9 A; 2UUC K; 2HND A; 4O8U A; 3D2F B; 3QLH A; 3DMJ A; 4DV5 K; 1N6Q A; 4A5A A; 4X62 K; 1Q7Y O; 1ESV A; 2XRI A; 3H46 O; 5AQU A; 3FZL A; 4FJM A; 2YKM A; 3SYZ A; 2HHU A; 4FWL A; 3T3F A; 1VQO N; 3TU5 A; 2KTQ A; 4FJ8 A; 4CW7 B; 4DTP A; 2X78 A; 1A5V A; 2ZGY A; 2H3G X; 2HF3 A; 4DS5 A; 5BR8 K; 2W6L A; 4M3T A; 3SAG A; 4JKB A; 3AVB A; 3OYG A; 1E4G T; 4BRC A; 4CFD A; 3WUH A; 3DJC A; 4DV6 K; 3JXU A; 2A5X A; 2ZF5 O; 4DV2 K; 4BDZ A; 4Q5V A; 4NXM K; 1VHX A; 3AO4 A; 3PX0 A; 1I3A A; 2Q2R A; 4YY3 K; 4GKJ K; 3M8R A; 4CZI A; 3O3G A; 4KHY A; 2HHT A; 1CZA N; 4CGF A; 3RTV A; 2FC0 A; 5M1F A; 3T1A A; 3SK3 A; 4FLU A; 2KHO A; 2IVP A; 4IZ9 A; 4JLH A; 3OYE A; 4Y1C A; 3LL3 A; 1NK4 A; 2OZM A; 1EET A; 1QHA A; 4FJ7 A; 1S1V A; 4JS4 A; 3CIP A; 3LDQ A; 1M90 O; 4NB4 A; 4FM2 A; 2JLE A; 1SL2 A; 1Y64 A; 1QTM A; 4BGB A; 1NGI A; 2QI2 A; 4O5B A; 4L3Q A; 1X9S A; 1LW0 A; 1NGH A; 1R59 O; 5CE3 A; 4OVL A; 4CJP A; 3PSF A; 5KQ8 A; 3VTH A; 3ZSY A; 5AZI A; 3VN5 A; 3ZSV A; 3ULD A; 4DQR A; 3SZ2 A; 5KGX A; 2V7Y A; 3HM9 A; 1RTI A; 4LY7 A; 2P5G A; 1TGO A; 4DFM A; 4JYA K; 4BRP A; 4CJS A; 2IIR A; 3CQX A; 4DV4 K; 5JMV A; 2PZS A; 1RBR A; 3ZX2 A; 1DLO A; 1NK8 A; 1BWF O; 4PKH A; 4H4M A; 3UB5 A; 4KHU A; 3VF2 A; 1NK6 A; 2HBK A; 2QWP A; 5CZ1 A; 1SUQ A; 4DTJ A; 4CZF A; 3O9R A; 4W5T A; 3A0I X; 4K41 A; 3NH1 A; 4AM6 A; 4W5N A; 5AQV A; 3C6H A; 1X1P A; 4LF6 K; 3H08 A; 4B08 A; 1WSJ A; 4C8K A; 1ATS A; 4NLC A; 1KVC A; 3VEY A; 1IKX A; 2CGJ A; 4Y1D A; 3PO5 A; 3CJB A; 3ZEU B; 2E8A A; 4DS4 A; 2OPR A; 3CI5 A; 1OH8 A; 4OPH A; 4J2A A; 4E7J A; 1HJR A; 4FXD A; 4B9S A; 1NK9 A; 4DWI A; 1Z05 A; 1YF5 L; 4RWT A; 4IFV A; 4H4O A; 3KD1 E; 4KPY A; 2QWR A; 5JLF A; 4J2B A; 2E6M A; 2AA4 A; 3C6A A; 1KQS M; 3NGY A; 4B9N A; 2VG7 A; 2DFH A; 2OTJ N; 2QWL A; 3EE8 A; 1WSF A; 3MN5 A; 3HPG A; 1JL2 A; 3VEW A; 4DF8 A; 5BPM A; 2VG6 A; 2KLA A; 5BRF A; 1IG9 A; 2Q1N A; 1D4X A; 4JV5 K; 3O9S A; 4ID5 A; 1QZ6 A; 3GOI A; 2E2O A; 3DLG A; 1NGG A; 4DQI A; 5JVH L; 3MN6 A; 4EFH A; 3QIP A; 1NNE A; 5AQG A; 3AGR A; 3P5J A; 2NRH A; 1KFD A; 3WXI A; 4YFU A; 2HVI A; 2LSN A; 2RE2 A; 2A40 A; 4K8Z A; 1NOZ A; 3K9K A; 2IVO A; 4B9U A; 4C8O A; 3P38 A; 3ENO A; 2YKN A; 4JK7 A; 3ZSR A; 2O4I A; 1BA0 A; 4KAZ A; 4M45 A; 1UOC A; 5JIC A; 4BRO A; 1RDB A; 1L3T A; 2RF2 A; 2E2Q A; 1ZXO A; 2ZJP L; 4IEE A; 4CK3 A; 4HUF A; 1BG3 A; 2WTU A; 3CM6 A; 2A6A A; 3WXJ A; 1SL1 A; 1BCO A; 2EX3 A; 3CQ8 A; 3K5O A; 4CEF A; 3QEW A; 3O4W A; 4FJJ A; 4HTL A; 2O8C A; 1BI4 A; 1VQP N; 1M1K O; 1A5W A; 4FJK A; 5B8H A; 1RT1 A; 2G8W A; 3TAF A; 4CF0 A; 1Z6R A; 3MN9 A; 4RW8 A; 4Y0W A; 3C7N A; 1S5J A; 2JWL A; 2RKI A; 2FSK A; 1BU6 O; 3O1B A; 1DGK N; 4Z4F A; 4O8K A; 4M41 A; 1NJI O; 1SAZ A; 2QA4 N; 2NUB A; 5EY4 A; 5E84 A; 2PYL A; 2IDO A; 1J6Z A; 3OA9 A; 2O8E B; 3DLH A; 1BDG A; 1CZB A; 1S3X A; 3DXK B; 3THX A; 1NK5 A; 2KQ2 A; 2FF6 A; 1GOB A; 3TTC A; 3NF7 A; 4LH5 A; 3CJA A; 4AF1 A; 4JN4 A; 1W7A A; 2FLO A; 3NVM A; 4FL9 A; 1BQN A; 4YDU C; 1TK8 A; 2OCE A; 1XC9 A; 3L3V A; 4X65 K; 3CJC A; 1NBW A; 4OJR A; 3SQ1 A; 4OKE A; 4EZ9 A; 4BAC A; 3WNF A; 1K9M O; 4JI2 K; 3MX5 A; 4XIU A; 4DB3 A; 3CG7 A; 4JKF A; 3I55 N; 4FJI A; 2HNY A; 1B92 A; 2IOC A; 1ILY A; 5AFU A; 4K8X A; 4QS8 A; 5KQD A; 5DK5 A; 1VRU A; 3B6O A; 1VQN N; 4BC2 A; 3RWU A; 1HUX A; 3AAQ A; 5BN9 A; 4NO7 A; 3T69 A; 1XNQ K; 1JJ2 M; 4W5Q A; 2D0C A; 4N5S A; 4WYB A; 3AGK A; 4E3S A; 1J9A A; 2E4L A; 3C6T A; 1NOY A; 2NRX A; 4B9T A; 1C1C A; 1U4B A; 2WUS A; 4QS7 A; 3ZCM A; 3HJF A; 5FPN A; 3VGM A; 3PX4 A; 5C24 A; 1RFQ A; 1U2V A; 1Y97 A; 5EU7 A; 4BRM A; 1VSD A; 3CCL N; 3ULE A; 3MDQ A; 1JKH A; 3NMU A; 3HK2 A; 4DR2 K; 2BGG A; 3DWL A; 3CFP A; 3VPZ A; 4ELV A; 3KD5 E; 2DPN A; 5IWA K; 3TTD A; 4I2Q A; 5AQZ A; 5AQM A; 3U3G A; 3K57 A; 2OAN A; 3O1W A; 4GMJ B; 1U49 A; 1OVQ A; 4CJV A; 1HKC A; 4KKO A; 2IS3 A; 1GOA A; 3SV3 A; 3OVN A; 2BAN A; 4DTS A; 1XHZ A; 5AZI B; 1DTQ A; 1IBL K; 2YNF A; 4JI6 K; 4CF8 A; 4H0Y B; 4W5O A; 4FWQ A; 4I9L A; 1FJG K; 3SQ2 A; 2P9L A; 3A2F A; 3LP3 A; 3AVK A; 5EOY A; 4QCL A; 4NXN K; 1N8R O; 3UKR B; 2CGL A; 1NGD A; 4E7I A; 3OYL A; 2IGI A; 4AH9 A; 2QXF A; 4EP5 A; 3VGL A; 2Z1H A; 4KH4 A; 3M1F A; 4CZK A; 1IV0 A; 4IFE A; 5I42 A; 4FLT A; 1VSL A; 3U6F A; 1LW2 A; 1ZC6 A; 1RDD A; 4DFP A; 4BRI A; 3BF3 A; 3IDH A; 4BE1 A; 4V19 S; 2IAJ A; 4JKD A; 3BUZ B; 2VQE K; 1W2B M; 4AHS A; 3GL1 A; 1NGE A; 3RRH A; 2PY5 A; 5AQP A; 4JEP A; 4CJ3 A; 4MO4 A; 4FJX A; 2V7Z A; 3R9P A; 4G9Z A; 4NYN A; 2FBV A; 2YJE A; 3EO3 A; 1O13 A; 1KAX A; 4DR6 K; 2D0A A; 4DU4 A; 2P51 A; 4R79 A; 3EKS A; 1YVU A; 1YJW N; 1LWE A; 3CPW M; 2P9N A; 3LDO A; 1T44 A; 4BDY A; 3CYM A; 3KLE A; 4DLE A; 5KTQ A; 4BR7 A; 1KTQ A; 2Q0U A; 1SQK A; 4BRD A; 3HVR A; 3AVA A; 3O4Q A; 1E3M A; 1HKG A; 3DLK A; 4M3R A; 3DLL L; 3G4S N; 4FLZ A; 2O8D A; 2FXU A; 5GIN A; 4UQG A; 4WFA L; 1JLF A; 3WQU A; 4KHQ A; 1QVF M; 1U45 A; 1X9M A; 3AVI A; 3VQC A; 3OYH A; 4RG8 A; 1NG9 A; 2F9W A; 1RT6 A; 3QDK A; 1I94 K; 4DUY K; 4FWO A; 1TUU A; 4WQ4 C; 4CGG A; 1LCU A; 1FXX A; 2E2N A; 5C15 A; 1HKB A; 3WNE A; 3V6D A; 1G15 A; 4CEB A; 5BRD A; 1C0U A; 3KLI A; 1S9E A; 3RR8 A; 1BCM A; 3LP2 A; 4DR7 K; 3QIC A; 2F96 A; 3QEX A; 2IC3 A; 4E0D A; 4AHU A; 3NAE A; 4B1Y B; 2VWK A; 3EKU A; 3UKU A; 5LMU K; 4YOR A; 5BR9 A; 1WB9 A; 4JKE A; 4FJH A; 1NGF A; 3HOS A; 3T7Z A; 4F2S A; 4H5R A; 3C6U A; 3L3U A; 1NK0 A; 2O8B A; 4CEE A; 5HRS A; 3V9W A; 2X6N A; 1GOC A; 1Q8I A; 5C25 A; 4KBO A; 4WFN L; 1RBT A; 4I9Q A; 2O8C B; 1BI4 B; 1TYQ A; 5H1S Q; 4K0K K; 3K5N A; 3VEX A; 2E5L K; 5AZJ A; 2VWB A; 3VF6 A; 2OZS A; 4GKK K; 1A5X A; 3K0S A; 2WBN A; 4HWI A; 2D0O A; 1FKO A; 5BPL A; 3K5L A; 1RT4 A; 5J2N A; 2UUA K; 3C7N B; 4CER A; 3L2Q A; 4CD1 A; 2QTD A; 4BRA A; 3F5T A; 4A61 A; 4LF4 K; 3VEO A; 1KVA A; 3CCJ N; 4CEZ A; 4F9O A; 2P1J A; 4J2E A; 4CJU A; 4LD0 A; 4CVN E; 3EN9 A; 3HL8 A; 3PIP L; 3ZYY X; 3BP8 A; 3VEV A; 4CEO A; 3THX B; 1S22 A; 2ASP A; 4PA1 A; 4CIE A; 4O0I A; 5ADX H; 3K2P A; 4AHT A; 3CME N; 1RCH A; 3FZK A; 1QSS A; 4WFB L; 2XHB A; 1WUA A; 5AQS A; 2KW4 A; 3B6P A; 4FOI A; 4ZTJ A; 3OYK A; 2P9I A; 3A8Y A; 4B3S K; 4CF2 A; 3CC2 N; 3CJ9 A; 3NDK A; 3QET A; 1T05 A; 1HNZ K; 5A2Q O; 1Q81 O; 2Q36 A; 4CBX A; 4B1Z A; 1GLJ O; 1IJJ A; 3O6W A; 2NNW A; 3V81 A; 4BRL A; 3CET A; 1IBM K; 3VER A; 4CHO A; 2W40 A; 1NMD A; 3B8A X; 3SJJ A; 2NRT A; 1V4S A; 3MEE A; 2HHW A; 4KH5 A; 3HP9 A; 3SPY A; 4BRN A; 2CH6 A; 4XH1 A; 2HBJ A; 1UA0 A; 3DXM A; 4OKK A; 3V1O A; 1HRH A; 4ELU A; 5FPE A; 4BC4 A; 1KSP A; 3S9H A; 2FSN A; 4BRH A; 3PO4 A; 5M1P A; 3TAN A; 1U48 A; 1U2V B; 5C2F A; 1IH7 A; 3ULE B; 3E01 A; 3L2V A; 3OY9 A; 2P9U A; 3CER A; 1HPM A; 3OS1 A; 3LPU A; 1JXB A; 4BRF A; 4N76 A; 4C1N I; 1NK7 A; 3AO2 A; 4KB1 A; 4DR4 K; 5AQY A; 1RNH A; 2JWK A; 3PV8 A; 1ZBU A; 4O44 A; 5KPR A; 2ITM A; 3ZX3 A; 1NJY A; 4DR5 K; 4BDP A; 5AQN A; 2D0P A; 4JKH A; 4F3T A; 3VF4 A; 2GBZ A; 3VQ8 A; 3THW A; 3CF5 L; 3C65 A; 3SBT A; 4IEI A; 5M1K A; 3AY9 A; 2E20 A; 1R0A A; 4BR0 A; 4KRE A; 3H3O B; 1N34 K; 2PBD A; 5EX5 A; 4BWJ A; 2B6A A; 4FPB A; 4NCG A; 3FFI A; 3D45 A; 2HHV A; 2P9L B; 4RTF D; 3CCM N; 1WBB A; 3OW2 M; 1HQU A; 4AHV A; 5C2D A; 4YDU A; 4BG8 A; 4AHR A; 2WON A; 1BOT O; 1BO5 O; 2E1Y A; 2HST A; 1IO2 A; 2P9P A; 1Q9X A; 4O5F A; 3FE1 A; 3EZ5 A; 3MAQ A; 2P5O A; 4CI6 A; 3AAR A; 1C0T A; 4PHT X; 4QAG A; 4AQY K; 3DLR A; 1WSH A; 2GX9 A; 4A59 A; 3ZLJ A; 3H1Q A; 4WQ5 C; 2Z1I A; 1OH5 A; 2GEM A; 5AQK A; 1ZBS A; 5CZ2 A; 3C94 A; 2XO7 A; 3CCV N; 4DKW A; 5ELZ A; 1Q18 A; 5DMR A; 1WOQ A; 4BVP A; 2DFF A; 2QWN A; 3AVN A; 3MWP A; 3O5B A; 4K43 A; 5T7B A; 1ZBH A; 4IJN A; 4Z4E A; 2G8H A; 4DQQ A; 1NLV A; 1SKW A; 4BRG A; 4H5W A; 3M3Z A; 4AIL C; 4OGC A; 3ID8 A; 4LF5 K; 2NRZ A; 3ENH A; 4UY8 O; 4DLG A; 1XWL A; 3T1H K; 3A5N C; 1GLE G; 2P9N B; 3AA2 A; 4IJA A; 3NF8 A; 4W5R A; 3L2R A; 2B5J A; 4LFB K; 4FWP A; 3MXI A; 2A42 A; 3HT3 A; 4FWN A; 1YAG A; 2UU9 K; 4YOW A; 1XI1 A; 3HSC A; 4G1Q A; 2O8D B; 4JKG A; 4EHT A; 1VQ7 N; 2Q97 A; 3CJ1 A; 1TKT A; 2O8F A; 3PX6 A; 3DRS A; 3L2U A; 4JKA A; 4M7Y A; 1KD1 O; 4DTU A; 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