4RWTA

Structure of actin-lmod complex
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
369
structure length
369
Chain Sequence
ALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIREDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAKSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
source organism Drosophila melanogaster
publication title Mechanisms of leiomodin 2-mediated regulation of actin filament in muscle cells.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-5C
total genus 107
structure length 369
sequence length 369
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4rwtA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4rwtA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4rwtA03
2P9KA 1Y64A 2V51B 2QM1A 4BGBA 3C7NA 2P9IA 2IIRA 3D2EA 1NGCA 1DKGD 3UKRB 2V52B 3FE1A 5AQKA 4B1YB 3O4WA 2YHXA 3SLCA 4FOEA 3TPQA 4BR5A 1HUXA 2YHYA 3VOVA 3IFRA 3VETA 2P9SB 4I6MA 4XEIA 4FWOA 3UB5A 2D0PA 4CZKA 4FWRA 2GEMA 2A3ZA 4A62A 2QWLA 3MN5A 3HSCA 4LC9B 2E1ZA 3BUZB 3FZLA 3AAPA 4PKIA 2CGJA 2Q1NA 4BVOA 3CJBA 4BVPA 5CE3A 3CI5A 2V7ZA 3LDLA 1EQYA 4DQ8A 4RWTA 1G99A 2HMPA 3HI0A 2P9KB 4BRLA 3LL3A 4Z94A 2YCHA 3C7NB 5AZJA 2P9IB 3D2EB 2QWMA 4MO4A 5AQOA 3BF1A 5AQFA 4BRMA 1NGGA 3VERA 4H5WA 3UKUA 2DPNA 3CERA 1QQNA 4PKGA 3A5NC 3W3DA 5AQXA 3CIPA 4I6MB 3VENA 2E8AA 3O08A 3H3OB 5AQSA 1TUUA 3AARA 3D7EO 3VGKA 3A5MC 4CZLA 4BC5A 4BR0A 1H1VA 4NB4A 1MDUB 3FLCO 1HKBA 3P4IA 1J6ZA 2FF3B 4FWNA 4FPAA 3FZHA 2ASMA 3VGLA 2BTFA 3CJCA 2YI1A 4FWLA 4K43A 5BPMA 4L3QA 5AZJB 2P9NA 4BR4A 5B8HA 3I33A 4CI6A 1NWKA 3ENOA 1BDGA 3U9ZA 2FSJA 3KHYA 1DGKN 3UKUB 3U9DA 4CZFA 3MCPA 1BWFO 1ESVA 1ZC6A 5AQPA 3VEWA 3JS6A 5JLHA 3GDQA 3HZ6A 1HKGA 1KAXA 4CZIA 4IO8A 4CD1A 3HBTA 5JICA 3A5OC 4FWSA 3O5BA 4A2BA 1C0FA 1MA9B 1NGAA 2EWSA 4H5NA 5BN9A 5EVZA 2A40A 3H1QA 1JCEA 3MK6A 1SZ2A 2P9NB 5EY4A 1P8ZA 5BPNA 5AQQA 1NGIA 3AY9A 3FZFA 4H0VB 4B1UB 4JNEA 5LY3A 1GLLO 3QICA 2J4RA 5TKYA 4FWQA 3QBWA 5AQYA 4EHUA 3MMVA 4NO7A 4BRIA 1NGBA 5AFUH 5KPZA 1LOTB 3JXUA 4H0OA 4XH4A 5FPNA 4BC3A 1ATNA 4FL9A 2VYPA 2QXLA 3DXMA 1QQMA 2GWKA 3M6GA 3H6EA 4B1VA 1GLAG 4BQLA 4ISFA 2HF4A 3VF6A 3WXIA 4B1WB 5AQMA 3D2FB 4M7YA 3A0IX 2KHOA 1ATSA 4HTLA 2ZGZA 3L6QA 3H3NO 4DCHA 1XUPO 1NBWA 2E2PA 4C23A 2D1KA 3MN7A 5FPDA 1NGJA 4H5RA 2HF3A 4WQ4A 4BRFA 3IMXA 3U8XA 2IVNA 2A41A 3WXKA 1BOTO 4MO5A 5KPTA 3DXMB 2NRHA 3O1WA 3EO3A 3RSEA 2P9PA 2F9WA 3ATVA 3ULEA 4FO0A 1IG8A 2PBDA 2CH5A 5AQUA 1C0GA 4BRHA 3WEEA 5AQTA 1WUAA 1KXPA 2UYTA 4HWIA 3HM8A 2CGKA 1YXQA 4J8FA 3FZMA 3EKUA 4BC4A 2FXUA 3QB0A 4F9OA 4XH5A 4GY2B 2CH6A 4BG8A 3BF3A 1HLUA 4FWPA 1KAYA 1RFQA 2QWOA 3WT0A 4BREA 1MWMA 1OKJA 1ZBSA 3GOIA 4JD2A 4K41A 4CBWA 3SK3A 2HOEA 4JN4A 4WQ5A 3LM2A 4BR2A 3QMLA 1BU6O 2P9PB 3ID8A 4PKHA 3RSEB 2VCPA 2GELA 4WQ4C 3ULEB 3ATUA 4QS7A 2BUPA 2YJEA 1BG3A 5EX5A 3W0LA 3WEEB 4EAHD 4RTFD 1BA0A 1NMDA 2PAVA 5AQIA 4CZMA 2WUSA 2ASPA 3LDPA 4H0XB 2W40A 5E84A 4DB3A 3ZETA 5EXWA 3WUHA 4M7XA 3CHWA 2QWQA 4JD2B 3O6WA 4EFHA 4CBUA 4EIAA 1Q18A 2IVPA 5AQLA 2FLOA 1GLEG 1TYQA 2QWNA 3EN9A 3LM9A 3MN9A 2FSNA 2E2QA 1TUYA 3CETA 5FPMA 4CZEA 1NGFA 1NM1A 1GLDG 4WQ5C 4BQZA 5KQDA 2A6AA 1QZ5A 3QFUA 3O80A 3BEXA 2NLXA 1RDWX 2QWRA 3WXJA 4RCHA 3WQTA 4DHYA 2I7NA 2Q2RA 3D2FA 4KBOA 3GL1A 3F9MA 4BR9A 5F0XA 3DAWA 1V4TA 3FZKA 4FPBA 4MLHA 3VPZA 2E2OA 3UE5A 1LCUA 5BPLA 4H0PA 1GLCG 5F1XA 2GWJA 3EZWA 5AQJA 3ZETB 4BR7A 3CJAA 2AP1A 5ADXA 4BRPA 4A61A 1MWKA 3FR0A 5FPEA 3VEZA 1TYQB 4BRAA 1T6CA 3O8MA 1RGIA 1QZ6A 1NGDA 3FFKB 4H5VA 4CZJA 2Q36A 4FWMA 4GNIA 3R9PA 5BN8A 5KPRA 4FSVA 2F9TA 4H0YB 3VEVA 5ADXH 3EL2A 3H45C 1IJJA 3GBTA 5AQGA 1D4XA 3SMPA 4E1JA 3IDHA 5AQRA 4CD3A 5I9EB 3AAQA 3J8AA 5AR0A 3B8AX 4K42A 5AQZA 1X3NA 2GTDA 1XQSC 1ZXOA 3GG4A 3DXKA 2IVOA 2P9UA 2YHWA 3VEXA 1E4GT 3CJ1A 4IXCA 2P9LA 2E88A 1HKCA 3KZBA 3S41A 1NGEA 3C0BA 5F2RA 4IJNA 3ENHA 3GE1A 1U2VA 5AQNA 3ZX0A 3ZEUB 4Y0WA 2E1YA 1GLJO 3LDQA 4BRGA 1YVNA 3CJ7A 2I7PA 3ZX3A 2NZTA 5E26A 1SAZA 2QWPA 3KVGA 5BRHA 1YAGA 4JAXA 3FGUA 3M3ZA 2A42A 4M63C 3CQXA 3R8EA 1GLBG 2Q97A 1YUWA 2ZGYA 1E4FT 4H03B 5EOYA 3DWLA 1X9JA 3OHRA 2Q0RA 2H3GX 3DXKB 2P9UB 4BROA 3MN6A 4A2AA 4CZHA 2P9LB 3H46O 3G25A 5LJVA 3LDOA 4ISGA 3L4IA 2A5XA 3DJCA 3VEOA 1U2VB 5AQVA 2Q31A 3WXLA 2ITMA 3VESA 1Z6RA 4B1XB 1BO5O 2W41A 4H0TB 2OANA 4CJ7A 3WQUA 4BRNA 4WYBA 3TU5A 4AM6A 3R6MA 4QS8A 1BUPA 2ZF5O 1DEJA 3QFPA 2FF6A 1BA1A 1GLFO 1K8KA 5ELZA 3VEYA 3MDQA 3QBXA 4BG9A 5JLFA 4EHTA 4XH1A 4PL8A 4YDUA 3SMSA 3A5LC 1HPMA 1NLVA 4JHDA 4FOIA 1T44A 3A8YA 3BP8A 3L0QA 3EKSA 1HX1A 1NGHA 5AZIA 4B9QA 3M1FA 4K25A 2YJFA 1QHAA 4BGAA 3IUCA 5LJWA 3I8BA 1JCGA 4PL7A 1U6ZA 1WOQA 4BC2A 5BREA 2CGLA 1T6DA 5BRFA 5AQWA 5AQHA 3O1BA 4BRDA 4H5TA 3LDNA 1K8KB 5JMVA 2Q0UA 4BRKA 1XC3A 5KQ8A 3ZX2A 4AM7A 2FSKA 2QW9A 3CJ9A 4BRCA 3HTVA 4ISEA 4JHDB 1S22A 5AFUA 1CZAN 2E20A 1JCFA 4YDUC 5AZIB 3UKRA 4BRQA 2ZWHA 1ATRA 1S3XA 4O5FA 1X3MA 3ZEUA 3VF4A 1QQOA 3SJHA 4CBXA 1Z05A 5BRDA 2P9SA 5BR9A 2E2NA 4IJAA 3VGMA 3CQYA 4IWVA 4MLEA 4QS9A 2GUPA 2ASOA 4O8KA 2VWBA 3H1VX 1R59O 1KAZA 4CZGA 4FWKA 1V4SA 4IZ9A 2AA4A 2D4WA 3U4LA 4B1ZA 2V7YA 3QDKA 2D0OA 1SQKA 3VF2A 1HJOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IRXA 1Y64A 1IKXA 2V51B 4BGBA 2QKKA 3D2EA 3FE1A 3O9QA 1WSEA 4FOEA 4CJVA 4DSFA 1YF5L 1IBMK 3VQEA 2D0PA 1VHXA 4DQPA 2GEMA 1NNEA 1UWBA 4A62A 1DTQA 4CERA 1RTIA 2JWLA 1EETA 3HSCA 4LC9B 3JAMO 3LZIA 3BUZB 1VSHA 1F21A 4PKIA 3E1YA 3CJBA 3DLBA 3HSTB 2V7ZA 1EQYA 2NRXA 4RWTA 4DR2K 4L8RB 1U49A 3LL3A 4Z94A 5AZJA 2P9IB 4IDHA 4DQRA 3EEQA 3BF1A 5CY4A 3UKUA 1NK0A 1M1KO 3W3DA 5AQXA 4I6MB 5GAEP 3VQCA 3O08A 3ASMA 5AQSA 3CG7A 3D7EO 2VWJA 3A5MC 4LFCK 3TAFA 3TR8A 3K2PA 2D0BA 1NK4A 4KHSA 2FF3B 3D0PA 5CR4A 3CCSN 3KWIA 2NNWA 4BECA 2BTFA 4FWLA 2YI1A 1SL1A 2P9NA 2VGMA 4JKDA 3I33A 4BR4A 4CI6A 2IDOA 3K9KA 1NWKA 3T1HK 1KVCA 4DV7K 2PZSA 5IT9O 1C0TA 2Z1GA 3CMEN 3ISNC 4FJXA 3U9DA 3MCPA 3L2QA 3JS6A 1NJWA 3HZ6A 1OH8A 4M45A 1YI2N 3TTCA 4JKFA 4CEQA 4IO8A 3AVFA 3HBTA 5JICA 3I56N 3A5OC 4LF4K 3J80O 2BDPA 1C1CA 2EWSA 5EVZA 2A40A 4Y1DA 2BGGA 2WBNA 3ZSOA 1RNHA 3D45A 1P8ZA 4WE1A 4JKAA 3FZFA 1LV5A 4JNEA 1GLLO 3QICA 2GBZA 2J4RA 3HO1A 5AQYA 2W42A 4NO7A 5AFUH 4CJEA 4AHSA 4CJ3A 1U45A 2ZQBA 3VQDA 3PO5A 3KLFA 4H0OA 1JLAA 4FK4A 5FDLA 4CGGA 4FJGA 4DTXA 2G8WA 1IO2A 2GV9A 3V1QA 2FC0A 4KRFA 3SUNA 1RTDA 4W5NA 3M6GA 1CXQA 1EP4A 2XHBA 1GLAG 2VQEK 4BQLA 4FLYA 3VF6A 4KI4A 3P1GA 2HB5A 4B1WB 4DTSA 3PX4A 4FLWA 2VG6A 3D2FB 4M7YA 3A0IX 3SZ2A 5KGXA 1SUQA 4HTLA 3L6QA 4NXMK 4DCHA 2VG7A 4DV6K 1HNWK 1BI4B 2E2PA 4C23A 4CF0A 2D1KA 5FPDA 2NUBA 3CFOA 3S3OA 5CZ1A 1S1WA 5CZ2A 3NBPA 2IVNA 4DQIA 3ZSYA 4JI4K 3ZT1A 2NRHA 3ZT3A 2WONA 4XJXA 4YNQA 2F9WA 3ULEA 4DMNA 2CH5A 4B8CA 1QE1A 1KTQA 4HWIA 4GVMA 3OYJA 1X9MA 1OVQA 4LY7A 3FZMA 3QB0A 1RBVA 4GY2B 2DFHA 1HLUA 2QWOA 3S9HA 1TK5A 1MWMA 3GOIA 3OYGA 4JK8A 3T1AA 3CCLN 1JXEA 3QEVA 3I55N 1IBKK 4AHRA 2G8FA 4FW2A 1BU6O 2P9PB 2YHBA 2IOCA 5HL7L 4CJSA 4EP4A 3RRGA 1WSGA 2HNZA 3W0LA 3QNOA 1JXBA 4RTFD 1VSMA 1S1TA 3SV4A 4FJ9A 1RDBA 2WUSA 4YHHK 1S72N 5LMNK 2PFUA 4DSEA 3OYFA 5C12A 5E84A 4DB3A 4KHWA 3DOKA 2XO7A 4JD2B 1ITGA 1JL2A 3OW2M 5J2PA 2IVPA 5AQLA 4JKGB 3IAYA 3EN9A 3C94A 2E2QA 3P38A 4JKBA 3TANA 5FPMA 3RVCA 2UXDK 5KQDA 4BQZA 1Q7YO 3RMCA 1I94K 2HW3A 2AJQA 5C2FA 4DUZK 1RDWX 1BISA 4DHYA 4IOCL 2E5LK 2Q2RA 1VRUA 3MXJA 1IV0A 3VQAA 3OS1A 4FM1A 3NGYA 3VPZA 2E2OA 3UE5A 5BPLA 1SS6A 5F1XA 5ADXA 4BRPA 4A61A 1Z26A 3AGRA 3UIQA 1KLMA 3DLEA 3QLHA 1RGIA 4CGDA 3FFKB 4FJ7A 1WN7A 4FWMA 4IG0A 3R9PA 4HCCA 2F9TA 1O1WA 4CEZA 2HBLA 4X65K 3GBTA 5AQGA 3KJVA 4IFVA 3AA5X 4JKEA 4E1JA 1BQMA 1K9MO 5AQRA 5HBMA 1HNZK 5I9EB 1RTHA 4YOVA 3CC4N 3B8AX 2GTDA 1XQSC 3TI0A 2YHWA 2P9UA 1E4GT 4DTMA 3KZBA 1FKOA 3ENHA 4F2RA 3GE1A 4DS5A 2W00A 1U2VA 4GV6A 3NH1A 3ZX0A 4DTUA 2D0CA 3OYMA 2NRZA 3CXCM 4BRGA 4B3OA 1NK7A 2I7PA 3F2KA 3ZX3A 2NZTA 1QVFM 5E26A 1SAZA 1RTJA 3KVGA 5BRHA 4JAXA 3FGUA 4M63C 4LFAK 2Q97A 1WAJA 1X9JA 3PLAA 2X78A 2H3GX 1A5WA 1KQSM 4CZHA 1BIZA 1QHTA 3P39A 4OO1J 3G25A 3KLGA 5LJVA 2DY4A 2HNDA 3L4IA 4ISGA 2PYJA 2O8DA 1LAWA 3VEOA 1CZ9A 1HNIA 3WXLA 3HP6A 4KHQA 3KLIA 4A59A 1BO5O 3PSFA 1W97L 3TU5A 3R6MA 3O3FA 2ZF5O 4C1NK 2OPRA 4CVNE 3DLHA 3O9RA 4BACA 1BA1A 1S6PA 4CIEA 4O8UA 1VQ8N 3VQQA 4ILJA 3AVNA 1HQEA 4AHVA 3PIPL 3G71N 3A5LC 2HHVA 2A1RA 4JHDA 1NGHA 4E19A 4B9SA 4BEBA 1C1BA 1D8YA 2YJFA 1QHAA 1W7AA 5JENA 4BGAA 3IUCA 1U6ZA 1WOQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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