4RWTA

Structure of actin-lmod complex
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
369
structure length
369
Chain Sequence
ALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIREDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAKSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-5C
publication title Mechanisms of leiomodin 2-mediated regulation of actin filament in muscle cells.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 107
structure length 369
sequence length 369
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4rwtA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4rwtA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4rwtA03
3HZ6A 4DCHA 4JN4A 4H5VA 4BGBA 5CE3A 3WT0A 3VF6A 2J4RA 1X3NA 3LDNA 4BROA 4FOEA 3O1BA 1RFQA 5AQGA 2YI1A 2Q0RA 4PL7A 5AQHA 1WUAA 4CZFA 2Q36A 3DJCA 4IO8A 1X9JA 3TPQA 1U2VB 1CZAN 3VOVA 1HX1A 4BR5A 3UKRB 4XH4A 4BG9A 3FLCO 2HF3A 3GG4A 4FL9A 1Z05A 2P9NA 2W40A 2PAVA 2HF4A 5AFUA 2QM1A 4MLHA 4GY2B 4CZGA 1T6CA 2VYPA 3SLCA 2V51B 1BDGA 4BRHA 4BRCA 3A5OC 1BO5O 3JXUA 3L4IA 3A5NC 2YJFA 2BTFA 1ZXOA 4BRKA 3DAWA 2P9PA 2E8AA 3BF3A 2F9WA 3MDQA 1NGHA 1NWKA 2H3GX 5E84A 4NB4A 4CD3A 1MA9B 4FPBA 3CQXA 4DB3A 2ASOA 5EVZA 3L0QA 2YHWA 5AQMA 3VEWA 5BREA 1TUYA 2P9UB 1JCFA 2FSKA 3GE1A 4IJNA 4CJ7A 5AQYA 1SZ2A 1XC3A 3H1VX 2CH6A 1RDWX 3IMXA 5BPNA 2FSNA 2I7PA 3I33A 2VCPA 4GNIA 1J6ZA 3QBXA 1X3MA 3C7NB 3H46O 2ZGZA 2NZTA 2D4WA 1QZ6A 1HKBA 2YHYA 4L3QA 1V4TA 4EAHD 3VEVA 5BRFA 4JHDB 5AQXA 3UKUA 3F9MA 4BRQA 3VERA 2P9LB 3EL2A 3AAQA 4WQ4A 3DXKA 2IVNA 3RSEB 2E2OA 5BN8A 1GLEG 3J8AA 4A2AA 4K25A 2P9KB 4CZLA 2E2PA 3QFUA 3DXMA 3CERA 4FWOA 3A5LC 4BC5A 4CI6A 2QWRA 1S22A 1LCUA 3U4LA 2Q1NA 4H0PA 5F2RA 3O8MA 4WYBA 3RSEA 2A42A 1G99A 1GLBG 3MN9A 1YUWA 1R59O 1ESVA 3CETA 3ID8A 5AQVA 5BPLA 5AQPA 3B8AX 3O08A 2DPNA 3WUHA 1NGAA 4FWPA 3CJ7A 1ATRA 4BVOA 3ZETA 3U9DA 4B1VA 3P4IA 5E26A 1RGIA 1ZC6A 4JD2A 1K8KB 4CZMA 4PL8A 3M1FA 3D2EA 2OANA 5AFUH 3ZEUB 3R9PA 2V52B 2A41A 3IFRA 4EHTA 3QICA 4FWQA 4A61A 2I7NA 3EZWA 3GBTA 1QQNA 3CIPA 3QFPA 4HWIA 5AQOA 1C0GA 4H5NA 4WQ5A 2QWQA 3CJCA 3VGMA 5TKYA 3LM2A 4O5FA 4CD1A 2ASMA 5EX5A 5BRDA 3SMPA 3MN6A 5F0XA 1SAZA 1GLFO 1K8KA 4RTFD 3H45C 4K43A 4M7XA 5AQIA 4JNEA 2UYTA 4XH1A 4LC9B 4BVPA 3EKUA 4B1WB 3LM9A 2E2QA 2QWLA 4BRDA 2GUPA 2GWKA 4BR4A 4FWNA 3CJ1A 4FWLA 2HOEA 4AM7A 4FWSA 2A3ZA 3WXJA 2NRHA 3GDQA 5AZIB 2Q2RA 1E4GT 1LOTB 2PBDA 2V7ZA 3VEOA 3EO3A 2D0PA 5AQSA 2QW9A 3VGLA 3VENA 2E2NA 4BC2A 4CZIA 1QHAA 1U2VA 4FOIA 2QWNA 4J8FA 1Y64A 5AQZA 4RWTA 3UKRA 2ITMA 4CZHA 1XUPO 3CJBA 4BC4A 3G25A 3C0BA 4CBUA 3AAPA 4FWRA 4H5TA 1DEJA 2YHXA 4BRNA 3FZKA 5FPDA 2CH5A 4BRIA 3QBWA 3MCPA 3WEEB 2IIRA 5JMVA 4I6MB 4BG8A 5AQQA 4FSVA 3ULEB 2A6AA 1V4SA 5BRHA 3CI5A 3O1WA 1YAGA 1OKJA 3O6WA 3H6EA 4NO7A 4C23A 1HLUA 3ZX3A 5ADXA 3MMVA 1NMDA 3H1QA 3EKSA 1XQSC 5B8HA 2HMPA 3SK3A 2A5XA 4IXCA 2P9UA 3D7EO 4IJAA 3HTVA 2FF6A 3FR0A 3KVGA 5KQDA 1NGCA 5KPZA 3SJHA 4BR0A 3IUCA 1QQOA 3M6GA 3VEZA 4BC3A 3W0LA 3BP8A 3C7NA 3ATUA 2P9SB 3VESA 1QQMA 2P9IB 3W3DA 1NBWA 3GL1A 3VPZA 2D0OA 4H0TB 1ATSA 3HI0A 2CGLA 4H0XB 4JHDA 2P9LA 4BRMA 1MWKA 2E1YA 4MLEA 1TYQB 2FLOA 1T6DA 4BRAA 3KZBA 4BRGA 1NGEA 1BG3A 1KAXA 3FZLA 3SMSA 5AQWA 1HKCA 3VETA 3LDOA 3U9ZA 1JCEA 1JCGA 5LJWA 2P9KA 3D2FB 1NGGA 1GLCG 1Z6RA 4YDUC 5EOYA 4ISEA 3S41A 2QWOA 3CQYA 5AZJB 3LDQA 3U8XA 3O4WA 1GLJO 5LY3A 3ENHA 3FE1A 5BN9A 4PKGA 5EY4A 2BUPA 4FWMA 2ZWHA 3O80A 4E1JA 3A8YA 4H0OA 4B1UB 4IWVA 3VEYA 4H03B 4BQZA 2AA4A 3FZFA 5ELZA 3WXIA 3AARA 4BRLA 3LDPA 2EWSA 1HKGA 2QWMA 1Q18A 4K41A 3FZHA 1GLLO 2QWPA 2W41A 1BUPA 2WUSA 3UB5A 1BA0A 4H0YB 1NLVA 3MK6A 3H3OB 4BRPA 2P9NB 3VGKA 3ZEUA 3CJAA 1HUXA 3WQUA 4CZKA 5JLFA 3TU5A 2GELA 3R8EA 2NLXA 1ATNA 1BA1A 2GEMA 3O5BA 5LJVA 4MO4A 2P9PB 4ISGA 4BRFA 4K42A 5KQ8A 1HPMA 5ADXH 1ZBSA 3ZX2A 5KPRA 2A40A 4H5RA 3FZMA 4B1YB 4XEIA 1NM1A 4B1XB 4Y0WA 5EXWA 4M7YA 4FPAA 3WXLA 4BQLA 3A5MC 1H1VA 3FGUA 3BF1A 3I8BA 1QZ5A 1E4FT 4JAXA 3VF4A 3BUZB 3CHWA 3IDHA 4Z94A 1NGJA 2ZGYA 4FO0A 5AZIA 4A62A 3R6MA 1MWMA 1YXQA 4IZ9A 4CZJA 2Q0UA 1SQKA 4H5WA 4B1ZA 1D4XA 1IJJA 2V7YA 4RCHA 1NGBA 3UKUB 5BPMA 3HM8A 1U6ZA 3WXKA 2IVPA 4DHYA 4CBXA 4BR7A 1KAYA 3DXKB 1KXPA 4AM6A 4WQ4C 1BU6O 1KAZA 1T44A 2YCHA 5JICA 3GOIA 5FPMA 3MN5A 4KBOA 2KHOA 1NGIA 1P8ZA 3WEEA 4I6MA 3ZX0A 3DXMB 2F9TA 3ULEA 1DGKN 2FF3B 4EFHA 5AQLA 4EIAA 5FPEA 1S3XA 2CGKA 5AQKA 3FFKB 3KHYA 4BR2A 1NGDA 1GLAG 1DKGD 4FWKA 2ASPA 1YVNA 3ATVA 4QS8A 5AQFA 4O8KA 3M3ZA 5AQTA 3VEXA 2AP1A 3CJ9A 2VWBA 3A0IX 4BREA 2IVOA 4CBWA 4PKHA 1EQYA 3MN7A 3ZETB 3L6QA 2FSJA 4PKIA 3JS6A 5I9EB 2P9SA 3VF2A 2P9IA 2Q97A 4MO5A 4JD2B 2CGJA 4CZEA 5AR0A 5KPTA 1IG8A 2YJEA 4B9QA 2GWJA 2Q31A 1TUUA 4M63C 1C0FA 3D2EB 4BGAA 4EHUA 5AQRA 1BWFO 2QXLA 4BR9A 3UE5A 4F9OA 3EN9A 3AY9A 1TYQA 3OHRA 3BEXA 4H0VB 5BR9A 4QS9A 3HBTA 3QB0A 5AQUA 4XH5A 5AQJA 2E1ZA 3D2FA 3QMLA 4WQ5C 4HTLA 4YDUA 2ZF5O 3WQTA 5JLHA 5F1XA 2GTDA 3LL3A 2E88A 4A2BA 1NGFA 2D1KA 1HJOA 2E20A 4QS7A 5AZJA 3H3NO 5FPNA 2FXUA 3LDLA 4ISFA 3QDKA 1GLDG 1MDUB 1WOQA 1BOTO 3ENOA 3HSCA 4DQ8A 5AQNA 3DWLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3E9PA 1Q81O 3HZ6A 3VQ8A 1P90A 4JN4A 2DFFA 2X6SA 4PWDA 3AVJA 4FOEA 2NNWA 2YI1A 2LSNA 5AQHA 4W5RA 4GVMA 2ZQBA 1WUAA 1SKRA 4CZFA 4L8RB 4C8KA 4IO8A 4LY7A 1CZAN 3WNHA 3J7AP 3UKRB 5J2MA 4JS5A 1N6QA 3FLCO 2HF3A 3GG4A 2P9NA 4JKBA 4IFYA 3OYAA 3LAKA 3K58A 4E1MA 3SLCA 4B3MK 1HYZA 2G8UA 2VGNA 3HK2A 1Z25A 3JXUA 1SUQA 2BTFA 4B9NA 1J9AA 3ZT2A 1BGXT 2RHKA 5GAEP 1NWKA 3RTVA 2OPRA 4LF6K 4E1NA 2HNZA 4W5NA 2QEXN 1Q8IA 5EVZA 3L0QA 3K5LA 1YTAA 2VG7A 1JCFA 2FSKA 1NK8A 1BL3A 2QXFA 3P5JA 1XHZA 2VCPA 4KHQA 3OJUA 2NRXA 3SUOA 4DS4A 3RR7A 4CFDA 1QZ6A 2VG5A 3R3LA 4BECA 1V4TA 3S3OA 3DYAA 4FJMA 1KLMA 3EL2A 4YOXA 3AAQA 4TSXA 3DXKA 2IVNA 2E2OA 1VQ8N 2IDOA 4FLYA 4K25A 3C94A 2NRRA 4DQPA 3QFUA 3DXMA 3KWIA 4GV6A 3ZCMA 4BC5A 1BIZA 3J7ZO 4A5BA 4DV4K 3H08A 3NF7A 2Q1NA 4JI3K 4H0PA 3O8MA 4AILC 3RSEA 4B9SA 2DFHA 3MN9A 1GLBG 1HR0K 1XNRK 1YUWA 3OBWA 5AQVA 3TTDA 4OO1J 3B8AX 3O9SA 1NGAA 4FWPA 3T19A 3P39A 2BDPA 1ATRA 4BVOA 4PY5A 1S1TA 4B3OA 3T3FA 1JLGA 3PO4A 4A57A 3TR8A 2A1RA 5FRMA 1ZC6A 4CGDA 3PX4A 5CR4A 4R5PA 4LH5A 4NCAA 4IEEA 4CK2A 3V4IA 2A41A 4BE0A 4JRPA 3EZWA 4F3TA 1YJNN 4IG3A 3AV9A 3T69A 3KK7A 2XY8A 5TKYA 3SPZA 2WFBA 3ASMA 3SUPA 2ATQA 5C15A 3QNNA 3NDKA 4LFAK 2ASMA 5BRDA 3SMPA 1SAZA 3VQEA 1S9EA 3VQ4A 3HT3A 3CCQN 4FVUA 2UYTA 4BVPA 3L2VA 3EKUA 4B1WB 4W5OA 1VQ9N 1OVQA 3N4QA 1QHTA 4BE1A 3IAYA 4XJXA 3L2RA 4B9VA 3CJ1A 4FWLA 3OYDA 4M3YA 2HSTA 3M8SA 4F3OA 4FWSA 2D5RA 3GDQA 4DTUA 4H4OA 1LOTB 4JS4A 3O3GA 3VGLA 2E2NA 1QHAA 2IGIA 1HJRA 4GW6A 4CK1A 4J8FA 5HRNA 5AQZA 4RWTA 4M3UA 3L4QA 4CZHA 4ILGB 2YHBA 4KB0A 4BC4A 4NXMK 1DEJA 3AA3A 1KVBA 2KW4A 2F8TA 3BGRA 4BRIA 2PYJA 3OS1A 1VSJA 1NK6A 3NMUA 1T8EA 3M8RA 4FSVA 3ULEB 4I2PA 5BRHA 3O1WA 3O6WA 4A5AA 3HPOA 1HLUA 3AO2A 3ZX3A 3MMVA 1NMDA 2PFUA 3P38A 3SK3A 1T3VA 1KCFA 2Z1HA 3D7EO 4KB1A 3FR0A 3KVGA 1NGCA 3SJHA 4JK7A 3VEZA 2RE2A 3AGKA 3PX6A 2D0BA 4H8KA 3W0LA 1NG9A 1RT5A 3ZSRA 3C7NA 2NUBA 3TAEA 4IFVA 5CYQA 5LMUK 1W9HA 2VG6A 3K9JA 3ZT3A 3V9SA 3MAQA 4DV5K 1CXQA 4CEQA 3E9OA 1T6DA 3KZBA 4BY9C 2KQ2A 1KAXA 3MWPA 2XHBA 3VETA 3LDOA 4GV3A 4DTPA 4E89A 1Z6RA 2O8CB 1RTHA 3KLHA 4MQ3A 5LY3A 4OPKA 4JRQA 1TKXA 3FE1A 1OH5A 4LFCK 3KJVA 1M1KO 5EY4A 1JLCA 3UIQA 2YKNA 3O9QA 2VQEK 1NK7A 3A8YA 2YNGA 3FZFA 1TL1A 2HNYA 3IKMA 4BRLA 1SKSA 1EP4A 2A1SA 2RN2A 1GLLO 1BUPA 1TAUA 1BA0A 4H0YB 3RMCA 4F8RA 2P9NB 4E7LA 3K59A 4CECA 2PYLA 1HUXA 3WQUA 2JLEA 5JLFA 4PUOA 4B08A 2D0AA 2Q3SA 1BA1A 2GEMA 3D45A 5SWMA 2WTUA 3O5BA 4KFBA 4MO4A 4BRFA 4ISGA 4DSJA 1HPMA 1WSIA 1ZBSA 3OYJA 1Q86O 4LF7K 4H5RA 4B1XB 1DTQA 3VQQA 1NMNA 3FGUA 3BF1A 4EP5A 4M3ZA 1JL1A 1SL0A 1YTUA 4FO0A 5AZIA 2HBJA 1BCOA 3RVCA 4CZJA 1KVCA 4MFBA 4B1ZA 3J80O 2V7YA 3TAFA 2RF2A 1JJ2M 4UY8O 4ZTFA 1ZBFA 5I3UA 3HM8A 1U6ZA 3WXKA 1JL2A 2HHSA 4DHYA 4CBXA 3CCEN 3DXKB 4WQ4C 1BU6O 5C24A 1W0HA 5GAHP 4CGGA 1W97L 2PY5A 4FK4A 1T44A 1QQCA 3EYZA 4CEDA 3DXMB 3M8PA 2HVIA 3DLEA 1NK5A 5AQLA 1WN7A 1EWRA 1W2BM 4DTRA 1WBDA 5AQKA 3FFKB 4KH5A 4FLWA 1GLAG 1Q7YO 4O8KA 1SS6A 4EZ6A 1SL2A 3AVAA 3NAEA 2BE2A 4JYAK 3Q7CA 5C42A 2AP1A 3AVIA 3CJ9A 1HRHA 4CBWA 4PKHA 4FLTA 3I56N 1VQ6N 3CC4N 3OYMA 4K0KK 5I9EB 1EX4A 2E6MA 2OYQA 2P9IA 2Q97A 4CF0A 2VWJA 4CZEA 5AR0A 2YJEA 2GWJA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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