4RWTA

Structure of actin-lmod complex
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
369
structure length
369
Chain Sequence
ALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIREDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAKSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Mechanisms of leiomodin 2-mediated regulation of actin filament in muscle cells.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-5C
total genus 107
structure length 369
sequence length 369
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4rwtA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4rwtA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4rwtA03
3UKRA 3A0IX 4CJ7A 3MN5A 3ZEUB 1QQOA 5FPEA 3M3ZA 2IVNA 2GUPA 4CI6A 1MDUB 1YAGA 3ZETB 2A42A 3CERA 5JLFA 5AZIA 1ESVA 3CIPA 1X3MA 3A5NC 4Y0WA 2E1ZA 2QWNA 3MK6A 3QDKA 3HM8A 3H1VX 1DEJA 2GEMA 3DXKA 2Q0UA 3S41A 1X3NA 2QWRA 5FPMA 3U4LA 3RSEA 1GLCG 1GLBG 2A41A 3UKRB 4FWNA 3ZEUA 1YXQA 1MWKA 3D7EO 4JNEA 1HKGA 4B1UB 2E1YA 4XEIA 2A3ZA 4H5VA 2UYTA 5F0XA 5EY4A 5AQZA 3ULEB 1GLDG 2ZWHA 4ISEA 1E4GT 4K25A 4HWIA 4EFHA 3TPQA 4NB4A 4YDUC 4QS8A 4FWQA 5AQQA 1BG3A 3FE1A 1X9JA 2CGKA 1NGAA 3SLCA 1XC3A 3R8EA 3BF1A 3DXKB 3LM2A 3H45C 5BN8A 1NGFA 5KPRA 2E2NA 3SJHA 4FOIA 5AQSA 3WUHA 1QZ5A 1V4TA 4MLHA 1NM1A 4CBWA 4JN4A 4A2BA 2VCPA 5EXWA 3ZX3A 4B1ZA 2QXLA 3MN7A 4BC5A 3VEZA 4GY2B 2NLXA 4FOEA 4BRKA 3QFUA 3ULEA 5AQGA 3H3OB 4JHDB 4WQ5C 3WXLA 3MN6A 5AQPA 3QBXA 1K8KA 3VEXA 5ELZA 5BN9A 4CZKA 2AA4A 3I8BA 4BC3A 5AQNA 2E2OA 3ATUA 2GELA 4H0PA 2I7PA 2ASOA 2V7YA 4EHUA 1Q18A 2A6AA 2P9SA 2P9UB 4DB3A 3BP8A 3SMPA 4AM6A 4BRDA 4DHYA 1U6ZA 5LJWA 4BR9A 2FXUA 1MWMA 3FZHA 3IFRA 5BPNA 4BRNA 2E20A 1Y64A 3BEXA 4BR2A 3QBWA 1HPMA 3AY9A 4XH1A 2ITMA 3R6MA 4H0TB 1BO5O 2YCHA 3AAQA 4QS7A 3SMSA 4BRLA 2BUPA 1QHAA 4JHDA 3CJAA 1G99A 2KHOA 5AQIA 3O5BA 2QWQA 1LOTB 4BC4A 5FPDA 3WXJA 1K8KB 3GBTA 4LC9B 4BQLA 5AQHA 4ISGA 2P9IA 1HX1A 4FWMA 1D4XA 2P9SB 2P9UA 3ID8A 4E1JA 3DXMA 1RFQA 3FZKA 3MMVA 3TU5A 2ZGZA 3KHYA 1NWKA 4B9QA 3VGLA 5E26A 4BRMA 3CQYA 4JAXA 4XH5A 3VEWA 2P9PA 4YDUA 3EKUA 3IMXA 2PAVA 2CH6A 4FWSA 4BGBA 4CZEA 3WXIA 2FF6A 3H6EA 4FWLA 2VWBA 4MO5A 3ZX0A 5AQUA 2FSJA 2W41A 3B8AX 1JCGA 4H0OA 3HZ6A 5F2RA 4EHTA 1KAYA 3VOVA 1DKGD 2P9IB 4A2AA 1SAZA 4M63C 3CJBA 1C0GA 1BUPA 5ADXH 3J8AA 3DXMB 2GTDA 1T6DA 3VERA 1NLVA 4H5RA 4BR0A 4AM7A 3I33A 1R59O 1T6CA 4FPBA 2P9PB 3O08A 4WYBA 5AQOA 2CH5A 4RWTA 1QZ6A 3UB5A 3VF4A 3A8YA 5ADXA 3QICA 1Z6RA 4L3QA 3LM9A 5JLHA 4M7XA 3M1FA 4MLEA 2FLOA 4O8KA 2HF3A 4CBXA 1SZ2A 3LDOA 5AQJA 3QB0A 5FPNA 3DJCA 1ATNA 2HF4A 3EKSA 4CD3A 4CD1A 2F9WA 3VPZA 2DPNA 5F1XA 5B8HA 1ATRA 1S22A 4FWRA 5AQMA 3VF6A 4BRHA 3H1QA 1MA9B 1XQSC 3M6GA 2D0PA 4BG9A 2GWKA 1NGGA 3LDQA 4BROA 4CZFA 2V52B 1CZAN 4IJNA 4WQ4C 2A40A 4H5WA 1BOTO 4PKGA 3JXUA 4QS9A 1GLAG 2FSNA 4BRFA 1ZC6A 4FL9A 1HLUA 2NZTA 4HTLA 3VGMA 2QW9A 2YHXA 3WQUA 2F9TA 1E4FT 3LDLA 4FWPA 2V7ZA 3GG4A 4H0XB 4EAHD 5AFUA 3ENHA 1IJJA 1QQNA 1NGDA 1S3XA 2AP1A 3FFKB 1V4SA 2OANA 2VYPA 3IDHA 3A5LC 5LY3A 4IJAA 4MO4A 4BRQA 2Q2RA 5AQVA 1KAZA 3CJCA 3HTVA 5BPMA 4BRIA 2YHYA 4H5NA 3UE5A 2QWOA 2E88A 5BRFA 5BR9A 3D2EA 4BR7A 1NGCA 3U9DA 4BR5A 1HKCA 2QWPA 3VETA 5AQFA 2D0OA 2D4WA 3VEOA 4BC2A 3QMLA 3JS6A 4B1WB 5AQKA 3KZBA 3W0LA 3W3DA 3VEVA 4BQZA 2Q0RA 3F9MA 3O1BA 2FF3B 5CE3A 4XH4A 1BU6O 4IO8A 4I6MB 1YVNA 3ZX2A 3D2FA 1EQYA 3EL2A 4FWOA 2J4RA 1SQKA 3L6QA 5AQXA 3VENA 3O4WA 4EIAA 1JCEA 1J6ZA 3LL3A 3A5MC 3D2EB 3MCPA 3FGUA 2BTFA 3LDNA 3AAPA 5KQ8A 3KVGA 2P9KA 1KAXA 4IWVA 5AFUH 3VF2A 5AZJA 3OHRA 3BF3A 3L0QA 3QFPA 2QWLA 2W40A 2P9NB 3C7NA 4NO7A 4KBOA 1OKJA 4BVPA 4FWKA 1NGHA 3CJ9A 3H46O 2D1KA 1H1VA 5JICA 2Q31A 1GLJO 2ZF5O 4I6MA 3D2FB 3FZLA 3CQXA 4BRAA 2E2QA 1C0FA 1ZXOA 3DWLA 3FZFA 5AQWA 5KPTA 3FR0A 3ATVA 4H0YB 4PKHA 1BDGA 4F9OA 5BPLA 1BWFO 3BUZB 1ZBSA 1HKBA 3WEEA 2IIRA 2V51B 5LJVA 2P9KB 4B1YB 4IXCA 2A5XA 5AZJB 3MDQA 3ENOA 4B1VA 4B1XB 3H3NO 5JMVA 4H5TA 3FLCO 4J8FA 4CZHA 2P9NA 3C7NB 3O1WA 5AR0A 4K42A 4DCHA 1NMDA 1GLEG 2P9LB 2FSKA 3GDQA 5AQRA 5BRDA 3HBTA 3U8XA 1XUPO 3AARA 4FPAA 3P4IA 4ISFA 4DQ8A 2QWMA 3HI0A 5EVZA 3CETA 5E84A 2WUSA 4FO0A 1TUYA 3CI5A 4IZ9A 5AQYA 4C23A 4CZGA 4H03B 4PKIA 3GE1A 3WXKA 4PL7A 4BRCA 3O80A 3WEEB 1TYQA 3CJ7A 4WQ4A 3VESA 2PBDA 3O6WA 1HUXA 4RTFD 3GOIA 1HJOA 4RCHA 2YI1A 3LDPA 3WT0A 3IUCA 1RDWX 1TUUA 2I7NA 1U2VB 1NGJA 4BR4A 1NGEA 4BGAA 2HOEA 1WOQA 1IG8A 4GNIA 5TKYA 2H3GX 4CZIA 3EN9A 1GLLO 2P9LA 1KXPA 3GL1A 3SK3A 3CJ1A 5KPZA 5AQTA 5EX5A 2QM1A 2IVPA 2Q36A 2ASPA 3A5OC 3DAWA 2CGJA 4BRPA 2YJEA 3UKUB 3EO3A 1GLFO 4CBUA 4CZJA 1TYQB 1BA1A 1ATSA 1QQMA 4WQ5A 3WQTA 4BG8A 1YUWA 5BRHA 4H0VB 2YJFA 4BRGA 5I9EB 1U2VA 3VGKA 1NGBA 4CZLA 1RGIA 1T44A 2ASMA 3L4IA 2Q1NA 5EOYA 3MN9A 4JD2A 5AQLA 5KQDA 2CGLA 1Z05A 4A61A 1WUAA 3CHWA 3G25A 1LCUA 4PL8A 4BREA 2ZGYA 3UKUA 4O5FA 2Q97A 4BVOA 3EZWA 3ZETA 3U9ZA 5BREA 3C0BA 2E8AA 4M7YA 1BA0A 5AZIB 3R9PA 4CZMA 3HSCA 4FSVA 4A62A 1DGKN 1NGIA 1P8ZA 4K43A 4Z94A 2E2PA 2YHWA 3O8MA 2GWJA 2HMPA 2NRHA 4JD2B 2EWSA 2IVOA 3FZMA 1JCFA 1NBWA 3VEYA 3RSEB 4K41A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GV9A 1U45A 4CJ7A 3MN5A 2QKBA 1QQOA 4AILC 4ILJA 2IVNA 1Q9XA 5IWAK 3ZETB 1RCHA 1VK0A 3HVTA 1FKPA 3WNEA 4DFPA 4B8CA 3K9KA 2HBJA 3MK6A 3QDKA 1S5JA 3L2VA 1BQNA 2Q0UA 3S41A 1NJWA 3TAQA 4E1MA 2QWRA 1SKRA 3U4LA 3G71N 1GLCG 1GLBG 1NOYA 2G8VA 4FWNA 3D7EO 4JNEA 4FJ8A 4B3OA 4FJKA 2A3ZA 5EY4A 5AQZA 3ULEB 4ISEA 4KKOA 4K25A 3SV3A 3QEPA 4EFHA 4FK2A 4NB4A 4TSXA 4YDUC 5AQQA 1X9JA 2CGKA 1NGAA 3R8EA 5D3GA 4C1NK 4RW4A 4M3XA 2NRZA 2E2NA 1LV5A 4A57A 4R5PA 1O1WA 3TTFA 3ZSOA 3F73A 1QZ5A 4CK2A 1RBRA 4JN4A 4CF0A 1RT1A 1T03A 5SWMA 1SV5A 4A2BA 5EXWA 3SNNA 4B1ZA 3VEZA 4CVNE 4CEAA 4C1NI 4GY2B 4FOEA 3ULEA 3H3OB 1NK0A 3CCMN 4KH6A 4CJ5A 1WSGA 4IO9L 3T1YK 3PIOL 4CF9A 4CZKA 5AQNA 3ATUA 2ASOA 2V7YA 4EHUA 2B6AA 2P9UB 1YTAA 4KAZA 3VTHA 4QCLA 4DB3A 4CESA 3KK2A 2HHSA 3CQ8A 2O8CA 4NLBA 4DV4K 4OVLA 1Y64A 4LF6K 4OLAA 1N6QA 3R6MA 4H0TB 1BO5O 2YCHA 4IFYA 1U4BA 3VQCA 3M8SA 4JHDA 5AQIA 1UA0A 3KWGA 1EETA 1LOTB 3WXJA 2KFNA 3HXMA 4DQRA 1VSJA 3N4PA 4OJRA 4LFAK 4N76A 2P9UA 3MMVA 4KFBA 3VEWA 1LAWA 2P9PA 5HP1A 1YTUA 1RT6A 3F9KA 3IMXA 3SI6A 1ZBHA 3DLGA 3OYCA 1VQ7N 1EO1A 2OZSA 2E5LK 3NGIA 1WN7A 1KQSM 1OH6A 2O8FB 1S72N 3KK1A 3OYEA 4FWLA 3ZX0A 2W41A 3CFRA 4FZYA 5F2RA 4C8MA 4Z4CA 2X78A 3D6RA 4R79A 1T3VA 4M63C 1TV6A 1C0GA 1BUPA 5ADXH 3J8AA 3MECA 4CEBA 2YHBA 1NLVA 4H5RA 4BR0A 4AM7A 1LAVA 3EY1A 4DLEA 3QO9A 5JS1A 3O08A 4AQYK 5AQOA 2CH5A 5I42A 1QZ6A 5CZ2A 3CG7A 3UB5A 2FBTA 2G8FA 3NGYA 1Z6RA 1Q86O 4E7JA 5I3UA 4M7XA 3M1FA 3ID6A 4DTMA 2QKKA 4O8KA 1QSSA 4CBXA 4FLTA 1SZ2A 1RBVA 2GX9A 1QTMA 4OKEA 1S9EA 2DPNA 5F1XA 3LP3A 4BY9C 1X1PA 4E89A 5AJ3K 1BGXT 1L3UA 2D0PA 3KK3A 2DFEA 2GWKA 4BROA 2FC0A 3N4QA 3O9TA 1CZAN 4CIFA 2A40A 4H5WA 4JKGB 4J2EA 3ZT4A 1XWLA 4XIUA 3VGMA 4DFJA 3MXIA 4HUGA 1KC8O 1E4FT 3C6AA 5CHIA 4DV5K 4H0XB 2X74A 3VQAA 4EAHD 4CJPA 4JI0K 3HP9A 1NGDA 5LL6Z 4CK3A 2HW3A 2OANA 3PX4A 1IBKK 3A5LC 5LY3A 1UOCA 5GAHP 2XY6A 2Q2RA 4I2QA 3MX5A 3HTVA 4JKGA 3OYKA 4H5NA 3ALYA 3P83D 5BR9A 4BR7A 1ZBIA 3SQ4A 1JXBA 4DR7K 4ZTFA 3QMLA 4B1WB 5AQKA 4CJSA 4J2AA 2Q0RA 3AA4A 1XNQK 2IGIA 4KRFA 5CE3A 5HLFA 5KTQA 4DV2K 3O4NA 3K5LA 1EQYA 2VGNA 4CGIA 4FWOA 1RDUA 4YOWA 1SQKA 2A1SA 2WONA 2F4VK 3FGUA 3LDNA 3KVGA 3MWTA 4JKHA 3CF5L 4IWVA 3PSIA 1JL1A 3QNNA 3L0QA 3QFPA 2HHQA 2W40A 5LMNK 1DLOA 2P9NB 1D9FA 4YOUA 4KBOA 5H1SQ 3H46O 1H1VA 5EU7A 5BR8K 3D2FB 1C0UA 3K2PA 1YIJN 1Q81O 1JLFA 4KV8A 3BDPA 3DWLA 3FZFA 5KPTA 4FM1A 3FR0A 1L5UA 4ZHRA 1WSFA 3BUZB 3WEEA 3RRGA 1YJ9N 4CHQA 4DSJA 1RT3A 5AZJB 4DU4A 4E0DA 3MDQA 3NMUA 4B1XB 3H3NO 5JMVA 1SS6A 4HCBA 3FLCO 4X66K 4DSKA 2P9NA 3O1WA 2BE2A 4K42A 4BDZA 1HRHA 3R1XA 1NMDA 2G8HA 1GLEG 2FSKA 3GDQA 5BRDA 2RN2A 4ISFA 4JK9A 1QHTA 4CECA 5EVZA 5E84A 4FO0A 4CJRA 3V9ZA 5HRPA 3KD5E 2XHBA 4IOXA 4BRCA 3WEEB 3CJ7A 3O3GA 3O6WA 3GOIA 1BCOA 5DMRA 2XRIA 3TANA 3EYZA 1RDWX 2F7TA 1U2VB 1VSDA 2HMIA 1JLBA 4BR4A 4NYNA 3ZSYA 3HSTB 2DFFA 3K5NA 2HOEA 4DTJA 1NMNA 4CZIA 4CF2A 2P9LA 3CXCM 1KXPA 3SK3A 4A5BA 3AO1A 5AQTA 3D45A 3QEIA 5EX5A 1C1BA 4RW9A 4KB1A 4OPKA 2CGJA 3P5JA 3OYAA 3K59A 1GLFO 4EZ6A 3CMAN 1ATSA 1QQMA 4WQ5A 5HRSA 4GKJK 3BY5A 1TL3A 5C2DA 1Q82O 4O55A 4CZLA 3VQEA 2P5GA 1RGIA 2ASMA 4OGEA 4DTPA 3L4IA 5CY4A 5DM7L 1XC9A 5FLXO 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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