4RWTA

Structure of actin-lmod complex
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
369
structure length
369
Chain Sequence
ALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIREDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAKSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-5C
publication title Mechanisms of leiomodin 2-mediated regulation of actin filament in muscle cells.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Structural protein
total genus 107
structure length 369
sequence length 369
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4rwtA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4rwtA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4rwtA03
2V51B 2ZGYA 3FLCO 4EHUA 2P9LB 4CBUA 5AQQA 1ESVA 4DQ8A 1QQNA 3EZWA 1KAZA 1GLCG 1RFQA 2I7NA 4QS7A 3KVGA 3SMPA 5AQJA 4XH1A 1RGIA 5AQYA 4FWQA 4CD3A 5AQLA 3ENOA 4IJAA 3GL1A 1U6ZA 4IJNA 3ULEB 5BREA 2IVOA 5KPRA 2V52B 2IVPA 3ZETA 4WQ5A 5JLHA 3EL2A 2ASOA 4PKIA 3GG4A 5I9EB 1YVNA 2E2OA 5FPMA 1TUUA 4H0XB 1K8KA 1LCUA 3UKRA 4K41A 2A3ZA 5AQUA 2A41A 5AZJA 3O5BA 3R8EA 3M1FA 4XH5A 2YJFA 2CH5A 1MDUB 4IXCA 3L0QA 2HOEA 4FWSA 1V4TA 2P9PA 2W40A 4BRKA 1TYQA 5AZIA 1GLFO 4WQ5C 1X3NA 4DB3A 4H0PA 4K42A 3CERA 3DXKB 5ELZA 2GWKA 3FR0A 5AQHA 5BPLA 4FO0A 4PL7A 2YCHA 4BQLA 4BROA 1BUPA 2FLOA 5EVZA 3QBWA 3AAQA 1T44A 2EWSA 1XC3A 4A2AA 3VGMA 5JMVA 3ZX2A 1NGAA 3AAPA 5EXWA 3MK6A 1D4XA 5BN8A 2E2NA 1ZBSA 1HUXA 1HKBA 3H46O 4B1WB 5LY3A 3EKUA 1GLEG 3MN6A 5AQZA 1YXQA 1HJOA 1DGKN 3W0LA 4CI6A 2Q31A 3A5NC 3CJ9A 2ZF5O 4FPAA 2QWMA 4O8KA 3SK3A 3FZLA 3JS6A 4H0YB 3O6WA 1QQMA 5JLFA 4EAHD 5EY4A 3R6MA 4YDUC 3FE1A 2GTDA 3LM2A 1ZC6A 1JCEA 2HF4A 1Q18A 3B8AX 4BG9A 3GBTA 3VPZA 4WQ4A 2IIRA 1HPMA 3D2FA 1IJJA 1TUYA 1KAXA 2V7ZA 3CI5A 4LC9B 4B1XB 4BG8A 5FPDA 5KQDA 2P9NA 3WT0A 1GLBG 4H5WA 2QW9A 2D0OA 4EIAA 3IFRA 3ENHA 4JHDA 4PKGA 4H0OA 5AFUH 3ZEUA 4FWMA 5AQSA 2OANA 3R9PA 3W3DA 4NB4A 3CETA 3LDLA 4BGBA 4BRAA 2P9IA 3H1VX 2ASPA 1XQSC 4H5VA 4RCHA 3DAWA 4RWTA 4HWIA 4FWNA 3D2EA 3A5OC 4L3QA 3D7EO 3GDQA 5BPMA 2QWLA 1HX1A 4CBWA 3BUZB 4PKHA 2HF3A 4BRQA 5KPZA 3HSCA 3IUCA 1T6CA 3WQUA 4BRLA 3DXMA 4XH4A 4BC4A 4CZFA 5AQWA 4I6MA 2P9PB 3UE5A 3O8MA 3QFUA 1SAZA 2CGLA 3U4LA 3VENA 2Q0UA 4ISEA 2P9UB 3SJHA 1SZ2A 3U9ZA 3VESA 2FSNA 1RDWX 3A0IX 1H1VA 2E1ZA 5AQRA 3VF6A 4C23A 2D1KA 3BF1A 2P9SA 3VEXA 1P8ZA 1NGEA 1OKJA 3CHWA 4BVOA 4BRDA 3MN5A 3C0BA 4E1JA 2W41A 3RSEB 5F1XA 4B1VA 1JCGA 4JAXA 3FGUA 3FFKB 4B9QA 3HBTA 4O5FA 3HZ6A 4GY2B 3JXUA 1E4GT 4BREA 1NGDA 4JN4A 1ATNA 2QWPA 2QXLA 1U2VA 1LOTB 2YJEA 3DWLA 4FWPA 3CJBA 3M6GA 4CZMA 2P9KA 4FPBA 3SLCA 4NO7A 5B8HA 1ATSA 4CZHA 1YAGA 4BR9A 3LL3A 3C7NB 5AQMA 4M7YA 5BPNA 1Z6RA 4FOEA 3D2FB 2PBDA 4WYBA 3A5MC 3I33A 3VETA 2PAVA 1MA9B 2NZTA 4YDUA 4IO8A 3QB0A 5KPTA 3EN9A 1NMDA 5FPNA 5FPEA 2ZWHA 3LDQA 4QS9A 3KZBA 1GLDG 1S22A 1NGFA 3J8AA 3LDOA 1BA1A 3VEWA 3EO3A 4JD2B 1KAYA 2BTFA 3MN7A 4MO5A 3HM8A 1C0GA 2YI1A 3AY9A 3LDPA 4CZIA 3TU5A 3ULEA 5JICA 3KHYA 3U8XA 4I6MB 4BR7A 3GOIA 1BDGA 4J8FA 2CGKA 2DPNA 2Q0RA 2VWBA 2GWJA 1HKGA 3DJCA 5EX5A 1XUPO 5AQPA 4H5TA 3H45C 4ISGA 2QWQA 1GLLO 3CQXA 2P9SB 5ADXH 4M7XA 3FZMA 4Y0WA 1QQOA 4A61A 3FZKA 4MLHA 4IZ9A 1YUWA 3OHRA 3DXKA 4FWOA 4CD1A 3ZETB 5AQTA 1HLUA 3U9DA 3VEYA 1NGCA 1DKGD 3VOVA 1WUAA 2Q2RA 3S41A 3EKSA 3VEOA 4RTFD 3I8BA 4BRPA 1K8KB 3UKRB 4CZEA 1C0FA 2FF3B 1BA0A 5AZJB 4AM7A 5KQ8A 5BRHA 2E88A 1T6DA 2A6AA 2P9KB 1TYQB 4QS8A 1NBWA 3CIPA 2Q36A 5AZIB 3IDHA 1BOTO 3H3OB 2E2PA 3BF3A 3IMXA 1NWKA 4CZGA 1DEJA 2CH6A 2YHWA 5AR0A 5AFUA 3FZHA 2FXUA 3VF2A 3F9MA 3WQTA 1SQKA 3A5LC 3L6QA 2CGJA 3VEZA 5AQFA 3UKUA 5CE3A 2AA4A 2Q1NA 1WOQA 4K25A 3ATVA 5E84A 2FSKA 2HMPA 4BRIA 5F0XA 4H5RA 3MMVA 3WUHA 3WEEA 5AQXA 4B1UB 1X9JA 4BC2A 4XEIA 3BEXA 3HI0A 2D4WA 2V7YA 1X3MA 4BR5A 3HTVA 1BWFO 2QWNA 5BRFA 3M3ZA 4EFHA 3VGKA 5F2RA 1NM1A 2NLXA 2VYPA 1IG8A 3BP8A 1Z05A 5AQKA 3WXJA 4H0VB 4DCHA 3CQYA 3SMSA 2BUPA 2YHXA 2AP1A 4JNEA 4BC3A 4MLEA 1QZ5A 4FWLA 2ZGZA 5EOYA 4A2BA 2A42A 2A40A 5LJWA 4DHYA 4FSVA 2IVNA 3H1QA 5BN9A 4B1YB 4BRFA 3QICA 4PL8A 1MWKA 5AQNA 3CJ7A 2P9NB 4BRNA 2F9WA 2GUPA 4CZKA 4K43A 3ATUA 4M63C 4BVPA 2WUSA 4JHDB 3QMLA 5LJVA 2P9LA 3MN9A 2J4RA 1EQYA 2GEMA 2P9UA 3ZEUB 4CJ7A 4IWVA 1NGJA 1ATRA 3LDNA 4KBOA 2P9IB 3VERA 3P4IA 2GELA 3LM9A 1J6ZA 5AQVA 3D2EB 3G25A 5BRDA 4HTLA 3AARA 4GNIA 1QZ6A 4MO4A 5AQOA 2QWRA 3WXKA 4BQZA 4BRMA 4BRGA 3A8YA 3DXMB 1V4SA 2FSJA 4B1ZA 3RSEA 2FF6A 3CJCA 1ZXOA 3FZFA 5AQGA 3VEVA 2KHOA 4BRHA 1E4FT 1S3XA 4FWRA 4CBXA 1GLJO 2NRHA 3UB5A 3O1WA 1G99A 1NGIA 3CJ1A 4H0TB 4H5NA 2ITMA 3GE1A 1BO5O 1MWMA 2QWOA 3VGLA 3ZX0A 1R59O 3ZX3A 3QFPA 2E8AA 3QDKA 2QM1A 3O80A 2H3GX 2D0PA 4BC5A 2E20A 3TPQA 5BR9A 1Y64A 3QBXA 2Q97A 3UKUB 2UYTA 3C7NA 4BR0A 1NLVA 4BRCA 4H03B 3WEEB 4Z94A 4FWKA 3O08A 2YHYA 2VCPA 2E2QA 2A5XA 3ID8A 3WXLA 3L4IA 1U2VB 2I7PA 3MCPA 5E26A 3MDQA 3O1BA 4BR4A 3VF4A 1NGGA 1BG3A 2ASMA 3H3NO 4FOIA 5TKYA 4FL9A 4BR2A 5ADXA 5AQIA 1CZAN 4CZJA 2E1YA 4WQ4C 4JD2A 2F9TA 3WXIA 4EHTA 4AM6A 1HKCA 1GLAG 1JCFA 4ISFA 1NGHA 4A62A 3O4WA 4BGAA 4F9OA 1NGBA 3H6EA 1KXPA 1QHAA 3CJAA 4CZLA 1BU6O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2V51B 3IS9A 4UQGA 2HHIA 4O4GA 1QQNA 3EZWA 1JLCA 2I7NA 1FKPA 3SMPA 3SI6A 3LP3A 4JV5K 4JI5K 4FWQA 4JKFA 4CD3A 5AQLA 3DLGA 3GL1A 1U6ZA 2IVOA 2IVPA 4G1QA 5JLHA 2ASOA 1TVRA 4BACA 1W0HA 4DSKA 1U48A 3OYCA 2EX3A 4K41A 4E7JA 3ENBA 3UIQA 4XH5A 4IG3A 3L0QA 2HOEA 1V4TA 2RF2A 4H8KA 1D8YA 3SNNA 1BCOA 4JEPA 1X3NA 4DB3A 4CVNE 3CERA 2GWKA 5AQHA 3WNHA 5D3GA 5BPLA 4FO0A 4PL7A 2YCHA 2KKZA 1VQ5N 4BROA 4OPAA 4X64K 3AAQA 4E7IA 1JLAA 3LAKA 4CF1A 3CFOA 3CCSN 1WSGA 4K8XA 2NUBA 3AAPA 1Q81O 4K8ZA 3I56N 3LWMA 2E5LK 1D4XA 1M1KO 1GOCA 4B1WB 5LY3A 5SWMA 4DQQA 1GLEG 5FLXO 2KW4A 4E89A 3A5NC 2QXFA 2ZF5O 1NK5A 3SK3A 3LDSA 3FZLA 4Y1DA 4B8AB 2YNHA 1JL2A 4YOXA 2NNWA 4I2QA 4FJMA 4H0YB 5JLFA 3CCMN 3R6MA 3VQ8A 4O55A 1VSMA 2B6AA 3LM2A 3AA4A 4DR4K 4DV1K 3J81O 1KTQA 4KH4A 4BG9A 3GBTA 1OH7A 1VQKN 1X1PA 3E9OA 4F4KA 1VSFA 2XY5A 3V1OA 2V7ZA 1TUYA 3CI5A 1LAWA 3P1GA 3VQQA 4AHVA 5FPDA 3OS0A 2HW3A 3WT0A 1GLBG 1OVYA 4B9TA 3O4NA 3ENHA 4PKGA 2UXBK 3EZ5A 4H0OA 5AFUH 4EZ9A 2DFHA 2XY7A 1HQUA 5AQSA 3OYDA 5CY4A 4NB4A 4BGBA 2WOMA 3CCUN 4XJXA 1KFSA 3L3UA 2OZMA 4RCHA 4RWTA 4HWIA 4FWNA 1NOYA 3A5OC 1HNXK 2HF3A 5KPZA 5M1KA 3WQUA 3DXMA 4XH4A 2P9PB 4QAGA 1BISA 3O8MA 1SAZA 3VENA 4WFBL 2JWKA 2P9UB 2HHTA 1QSYA 1BCMA 4CJEA 3PX0A 1H1VA 5AQRA 3VF6A 5GAEP 4KREA 2HBLA 3VEXA 3KD5E 4MQ3A 4BRDA 1VSLA 1IBLK 4N56A 1KLMA 1VQ9N 4DV0K 3FGUA 3FFKB 3HBTA 3CMAN 2FBVA 3T1YK 3SZ2A 4KTQA 2VQFK 2E4LA 1E4GT 1ATNA 2QWPA 1U2VA 1RTHA 4FCYA 3SBTA 3LPUA 3P5JA 3M6GA 1Q7YO 4M3TA 3SLCA 5B8HA 1ATSA 4DV2K 1GOAA 2X6SA 5J2NA 2YNIA 4FJNA 5AQMA 3OYNA 4FK0A 5BPNA 2HSTA 2G8KA 4A5AA 3A5MC 3RR7A 3F9KA 3CCEN 3KLFA 5FPEA 1HNWK 4NXMK 2WBNA 3LDQA 4F3TA 1S72N 2G8VA 4RG8A 1NGFA 1RDAA 1WLJA 2UXCK 1TKZA 1BA1A 4JLHA 1RBUA 1TK8A 4KI4A 2OPPA 1C0GA 3TU5A 1HNVA 2Z1HA 5TKWA 5JICA 5J2MA 3MEGA 3KHYA 3OYMA 4CHQA 4FJ9A 2HBMA 3D45A 5FRMA 3GOIA 5M1FA 4IOAL 4FXDA 1HYZA 2O8CA 1RBSA 2CGKA 3TAQA 1EWQA 4JKBA 3BZCA 2DPNA 2Q0RA 4DQRA 1HYSA 3G0ZA 1DTTA 3DJCA 1ZBHA 4ISGA 3ULDA 2QWQA 3CQXA 1YIJN 4OGCA 5ADXH 4A61A 3VEYA 3QIOA 5I3UA 2HHUA 1WUAA 4NCBA 4HTUA 4RTFD 4ELUA 3T3FA 3DYAA 1IBKK 1BA0A 4FJLA 2Z1JA 2HVIA 1T6DA 4KRFA 2LSNA 4DV4K 4Q0BA 1W7AA 1NBWA 2Q36A 3IG1A 3FFIA 4JKEA 3IDHA 2OTJN 4DF4A 3CYGA 1YJNN 1BOTO 2E2PA 3IMXA 4CZGA 1QSLA 4NYNA 2O8DA 2CH6A 1SKWA 3FZHA 3DLKA 4OGEA 3WQTA 2XY8A 4N5SA 1SQKA 3L6QA 5AQFA 5C12A 2XO7A 5CE3A 1RDCA 2BH1A 4AQYK 3TAMA 4LFBK 4LF5K 2FSKA 3QINA 1VSIA 1T3VA 4DQSA 4XEIA 3PSIA 3TAEA 3RRHA 1J53A 3TTDA 4ELVA 3HTVA 4EFHA 5F2RA 1NM1A 3BP8A 3WXJA 3HJFA 3F2KA 3QEXA 4FW2A 2AP1A 4IFYA 1FK9A 4MLEA 4FWLA 4FLYA 3S5TA 5LJWA 2HHWA 2RN2A 5BN9A 4CJUA 2HVHA 3NVMA 3QICA 1TAUA 1VSEA 5EU7A 2F9WA 4CZKA 5CYMA 3ATUA 4FLWA 1TK0A 4B9UA 4BVPA 1UWBA 2NRVA 5LJVA 4YORA 1KCFA 4MDAA 3AVBA 4KBOA 2G8WA 4Z4FA 4IDHA 2GELA 2OYQA 5AQVA 3OYHA 4A57A 1NG9A 1LWFA 2HBKA 3G25A 4NYFA 3AARA 5FRNA 3O9QA 3L2UA 3C6AA 3Q7BA 3WXKA 4BRMA 4BRGA 3DXMB 3HPGA 4IO9L 2FF6A 3CJCA 3E01A 3SQ1A 5AQGA 1E4FT 4CBXA 4IFEA 1NKCA 3O1WA 1G99A 4N47A 3U6FA 2ITMA 3BGRA 3GE1A 5FDLA 1LAVA 4LF7K 5AJ3K 1C0TA 3OYFA 1R59O 3JYTA 3KK2A 1UA1A 5KGWA 2E8AA 3MX2A 2ZJQL 4BC5A 2PYJA 3QBXA 2UYTA 3SAFA 1RTJA 4CEDA 1RBVA 4X65K 1B92A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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