4RWTA

Structure of actin-lmod complex
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
369
structure length
369
Chain Sequence
b'ALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIREDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAKSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-5C
publication title Mechanisms of leiomodin 2-mediated regulation of actin filament in muscle cells.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Structural protein
total genus 107
structure length 369
sequence length 369
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4rwtA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4rwtA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4rwtA03
5AQKA 3CJ9A 1HKGA 4H0VB 3UKRA 4CZIA 5LJWA 1E4FT 4IZ9A 5AQIA 1K8KA 3CERA 3HSCA 3SK3A 3A5OC 3B8AX 2YJFA 4JN4A 4Z94A 3H1QA 2E20A 4MO5A 3TU5A 2E2NA 3IUCA 4CZJA 1NMDA 2H3GX 3ATUA 2P9SB 4WQ4A 3AARA 1JCEA 4BR4A 4CZKA 3KVGA 3L6QA 2YJEA 1SAZA 3BF3A 5AQOA 3ZETA 5LY3A 4FPAA 4BQLA 4J8FA 4IJAA 3D2EB 5EVZA 3UKUB 1BOTO 3HTVA 3ZX2A 1BG3A 2Q1NA 4FWPA 4PKIA 3VPZA 4EHUA 4MLEA 1GLLO 4CZHA 4IO8A 4H5WA 2FXUA 5TKYA 4BGAA 1GLCG 1ZXOA 2QWMA 3O4WA 4FWQA 5BRFA 5AQMA 3MK6A 4B1UB 1XC3A 1NWKA 2FSKA 3LDQA 3VEYA 4EFHA 2P9PA 3LDPA 4H5NA 1EQYA 1E4GT 2QWPA 2HOEA 2A3ZA 3QMLA 2QWNA 3CJBA 4K41A 1S22A 4JD2A 5AZIA 3VERA 4CI6A 4QS8A 3J8AA 3HM8A 3ID8A 2QWOA 4FWKA 1NLVA 3M1FA 3CIPA 1BO5O 1BWFO 2A40A 2Q2RA 4FL9A 3TPQA 3ZX3A 3FZLA 4FO0A 3VGLA 4AM7A 2D1KA 1DKGD 1YUWA 1MDUB 2QWQA 4BVPA 4CZEA 1ATSA 4BRCA 1IG8A 3A0IX 3JXUA 1WOQA 2NZTA 3DXMA 2P9IA 3WUHA 3CJ7A 2I7NA 2W41A 3DXKA 2D0OA 4QS9A 3FZKA 3A5NC 3O1WA 3HBTA 3U9ZA 5AQJA 3ZX0A 2CGKA 3VENA 5AQLA 5E26A 2ASPA 5BRHA 5AQRA 3DJCA 4HTLA 2E2PA 4BRLA 5FPDA 3BF1A 5B8HA 1U6ZA 4WQ5C 5JLFA 1JCGA 1NGDA 2Q36A 4XEIA 3A5MC 2V51B 2V52B 3AAQA 4JHDB 5AQTA 4NB4A 3BP8A 3R6MA 5AQYA 3QFPA 4DQ8A 3M3ZA 4GY2B 1CZAN 3H3OB 2P9SA 3O5BA 1IJJA 3VETA 4QS7A 3ENHA 4PL7A 4BRDA 2NLXA 1Z6RA 3MMVA 4EIAA 1QHAA 1QQNA 5KQ8A 5AZJB 5ADXH 3D2EA 4XH5A 4BGBA 1TYQB 4FOIA 1NGIA 4B1VA 4ISGA 2FLOA 4JAXA 1ZC6A 2V7ZA 2QWLA 4K43A 4GNIA 2P9UB 4FWSA 2YHWA 1ZBSA 5AQXA 4FOEA 2IIRA 1ESVA 4DHYA 1QQMA 3EL2A 1SZ2A 4BRMA 5F0XA 4B1XB 1V4SA 4BC5A 4F9OA 3LDOA 3QICA 3VF6A 1HPMA 1WUAA 5JICA 3D7EO 4BRNA 3QB0A 4BR2A 2P9LB 3SMPA 4A2AA 1NGFA 2E1YA 2VCPA 4A62A 1P8ZA 4H5TA 1YXQA 4ISEA 3ATVA 2A42A 2ASMA 1C0FA 3C7NB 4BC2A 2PBDA 3FLCO 1LOTB 4XH4A 2BUPA 5I9EB 3FZHA 1J6ZA 1Q18A 1GLFO 3CQXA 3WQUA 1NGGA 4YDUA 1RFQA 1HX1A 4BC4A 5AQPA 3EO3A 3QBXA 3UB5A 4FWRA 4O8KA 4PKGA 3UKRB 5EY4A 5FPNA 2A41A 3LL3A 1GLJO 1K8KB 2UYTA 3I8BA 1HKCA 4M7XA 2E8AA 3O1BA 1GLBG 2OANA 4BR9A 1XUPO 1MWMA 3HI0A 3VESA 3VEZA 3IMXA 3MN6A 1DEJA 2ZGZA 3QBWA 4BROA 3A5LC 1X3MA 1ATRA 3CJ1A 3AY9A 1NM1A 2YHXA 5AQZA 3WXKA 1RGIA 3OHRA 2GWJA 1HLUA 3U8XA 3VEWA 5KQDA 3VEOA 3ULEA 3GBTA 3EZWA 3S41A 5AFUA 3ZEUB 2J4RA 2A5XA 2AP1A 4A2BA 3D2FB 5AQUA 3DAWA 1NGEA 4DCHA 5AQVA 2IVPA 5EXWA 2I7PA 1X9JA 2ZF5O 2AA4A 4JHDA 4KBOA 2WUSA 4JNEA 4BR0A 4RTFD 1NGAA 3H1VX 1NGCA 1T6CA 2VWBA 2CH6A 2P9PB 2E1ZA 2VYPA 5AQGA 1QZ5A 3MN5A 3R9PA 2Q31A 2NRHA 5AZJA 5AQQA 4BRKA 5BRDA 1HJOA 2IVOA 4H0XB 4ISFA 1ATNA 5JMVA 1TYQA 2Q0RA 4JD2B 3VOVA 1JCFA 1SQKA 3ENOA 5CE3A 3FZFA 1S3XA 1BDGA 3H46O 4L3QA 3EN9A 2P9UA 5F1XA 2E2OA 3MDQA 2IVNA 3WEEB 4CZMA 3W0LA 1KXPA 1QZ6A 3P4IA 3WQTA 3MCPA 2ZWHA 4H0TB 4PKHA 4O5FA 4BRFA 1NGHA 1Z05A 3QDKA 3JS6A 5BR9A 3LM2A 2F9WA 3GG4A 1C0GA 1GLEG 2QM1A 5AR0A 3EKUA 5F2RA 4LC9B 5KPZA 1NGJA 2GTDA 4B1ZA 4RWTA 5ELZA 5BN8A 4M7YA 2FSJA 3H45C 5ADXA 3DXMB 3FGUA 5AQSA 1G99A 5KPRA 3R8EA 3DWLA 3LDNA 3UKUA 4E1JA 1BU6O 3WXIA 3BUZB 1BUPA 5LJVA 1XQSC 2F9TA 5AQNA 4XH1A 4FWLA 1KAXA 2QW9A 2FSNA 3IDHA 4CBUA 1BA1A 2P9KB 2HF3A 1R59O 2GEMA 3L0QA 4WYBA 1X3NA 4C23A 4CZLA 3CQYA 3I33A 4BC3A 4RCHA 4BQZA 4BREA 4BRIA 2D4WA 3FZMA 3VGKA 4BVOA 1NGBA 3O80A 5EOYA 3WXJA 3F9MA 4MO4A 4CD3A 4FSVA 1T44A 2GUPA 2FF3B 2CGLA 3RSEB 4BR5A 3C0BA 2GELA 2PAVA 4BG9A 4H0OA 2QWRA 2QXLA 3W3DA 3M6GA 4IWVA 4WQ4C 2Q0UA 3CETA 3MN7A 2E2QA 4FPBA 3VGMA 3CJCA 1T6DA 4I6MB 1U2VB 4B9QA 2P9NB 2CH5A 3CI5A 5AQFA 2HF4A 4CJ7A 4IJNA 3ZEUA 4IXCA 3D2FA 4FWNA 3VEVA 3AAPA 4BRPA 2E88A 3H3NO 3WXLA 5BPLA 4M63C 3U4LA 2D0PA 4BRQA 5EX5A 3VF4A 3CHWA 5BPMA 2DPNA 3O8MA 2FF6A 2GWKA 4HWIA 2A6AA 5FPEA 3CJAA 4YDUC 3ZETB 1KAYA 3IFRA 1H1VA 4K25A 4MLHA 2ZGYA 1D4XA 2YCHA 3SMSA 3VEXA 3U9DA 4CBXA 4BRGA 4FWMA 3KZBA 4H5RA 4BRHA 4H0PA 5JLHA 5KPTA 1YVNA 1V4TA 1NBWA 2EWSA 1LCUA 3EKSA 3WEEA 3LM9A 4EAHD 4EHTA 1RDWX 2CGJA 3A8YA 4NO7A 3GDQA 4CZFA 5AQHA 3BEXA 4PL8A 4CBWA 1HUXA 3O6WA 4H03B 2ITMA 1MA9B 3GE1A 4WQ5A 5AFUH 2ASOA 1YAGA 5E84A 5BPNA 1DGKN 4A61A 3GL1A 5AZIB 4BR7A 1Y64A 4CZGA 1GLAG 1TUUA 4DB3A 3VF2A 2V7YA 2HMPA 3HZ6A 5BN9A 3QFUA 2P9KA 5FPMA 5AQWA 1KAZA 2W40A 2KHOA 4H0YB 3UE5A 3SJHA 1OKJA 3ULEB 3WT0A 4CD1A 2P9IB 2P9LA 3LDLA 2Q97A 3FFKB 3L4IA 3FR0A 1GLDG 1QQOA 1TUYA 3DXKB 4AM6A 5BREA 3SLCA 4BG8A 4BRAA 3GOIA 3C7NA 2YI1A 2BTFA 3RSEA 1HKBA 4H5VA 1MWKA 4FWOA 4K42A 3MN9A 4B1WB 3H6EA 1BA0A 4Y0WA 3O08A 3FE1A 3G25A 3KHYA 4I6MA 1U2VA 2YHYA 4B1YB 2P9NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CJ9A 2OYQA 1KVBA 2DY4A 4I9QA 3UKRA 3G0ZA 4LFBK 3ZSXA 5LJWA 5M1NA 2Z1JA 3A5OC 2E20A 4NYFA 2H3GX 1I3AA 1LV5A 3QIPA 4CF9A 4Z4CA 4CZKA 3KVGA 2Z1HA 3NF6A 2D0CA 4EZ6A 1S1WA 4HUEA 4J8FA 4IJAA 2XO7A 1L3UA 3M8SA 3ZX2A 2Q1NA 1KVCA 1T05A 4MLEA 4DLEA 4CK2A 1GLLO 2ITGA 4CZHA 3IG1A 4BGAA 3MK6A 3VQAA 4B1UB 3CCEN 3ZSVA 3TAQA 4HVJA 1KTQA 3MXMA 3VQPA 4B9TA 4J2AA 2A3ZA 1JLQA 3CJBA 3IAYA 4JD2A 2O8FA 4QS8A 3CCUN 4JK8A 2IAJA 1VSMA 3ULDA 4FWKA 3O9TA 4JK7A 4KHYA 1BO5O 4I2QA 3TSQA 3FZLA 3QINA 2RKIA 4AM7A 1XMOK 2D1KA 2XY8A 3THVA 3A0IX 2JWKA 5KGXA 3VQ9A 5KTQA 5M1FA 3NGYA 3WUHA 3CJ7A 4YOUA 1S1TA 4DR3K 1RT3A 3DXKA 2BANA 3MAQA 5HRSA 3U9ZA 3DOLA 2CGKA 1EWRA 4JI6K 5JS1A 3VENA 1VSIA 1TKTA 4JEPA 5HRPA 1C0TA 5BRHA 3E9OA 2E2PA 4NXMK 4JK9A 4JI0K 5FPDA 4DTPA 2KTQA 3G71N 3SQ2A 1VSFA 3O3HA 4FLYA 4CJLA 4BDYA 1U6ZA 4FJJA 1VQON 2B4JA 4WQ5C 3NF7A 5FRNA 4DKWA 4KPYA 4JHDB 1EP4A 4NB4A 4BECA 1RT4A 2KLAA 3L2RA 3OYAA 4B3OA 4DR7K 1S6PA 4KKOA 1K8AO 3VETA 4GMJB 1QVGM 5A2QO 1RBSA 5M1PA 4DU4A 4ID5A 5IT9O 3D0PA 2QTDA 4CFAA 4CJSA 4JI4K 1EO1A 3MMVA 2NUBA 1UA0A 4FJ5A 5MLCQ 3SNNA 1DLOA 3D2EA 1TYQB 4FOIA 1NGIA 4RW8A 3OYNA 4CHPA 4HCCA 4FLWA 3S3NA 1ZC6A 3PUFA 4K43A 1VQ7N 4CJRA 2YHWA 5AQXA 2NRZA 4JV5K 1IBLK 2IIRA 1NK7A 3QLHA 3KKRA 1B9FA 3J7ZO 3O4NA 4BC5A 1WSEA 4CHZA 3AVNA 3DLEA 3QICA 1SKRA 4AQYK 3CM5A 5CZ1A 4BR2A 2P9LB 3SMPA 4A2AA 4JLHA 2I5JA 5CY4A 2XRIA 3PIOL 2E6MA 1YIJN 4BC2A 2A1SA 1RDUA 3THWA 3OYDA 1J6ZA 4DV3K 3CQXA 1TKXA 2OZMA 1XHXA 4CF0A 3KK1A 4BC4A 4ID1A 3ZCMA 5AQPA 3EO3A 1SS6A 3C65A 4CJTA 3UB5A 2O8BA 4DR1K 4O8KA 3UKRB 4WFAL 1SL1A 3OS1A 4OPAA 1GLBG 3HXMA 4CGDA 4DSIA 4E7LA 3O4QA 3AO2A 3HI0A 3VEZA 3T1YK 3IMXA 2RHKA 1DEJA 2DFHA 2KQ2A 2ZGZA 2ZE2A 2O8DB 4E7IA 1BCOA 4BROA 4BACA 1LAVA 1X3MA 1ATRA 3R1XA 3OYEA 1O1WA 1NM1A 4EP5A 3S9HA 5HP1A 5AQZA 1NK6A 5J2MA 1ZBLA 2IOCA 3L8BA 3VEWA 2AP1A 1QSYA 3KJVA 1TAQA 3SV4A 4KB0A 4KBOA 2WUSA 4CGJA 2QXFA 4BR0A 5J2PA 1HYZA 1QVFM 4AHVA 1KLNA 4DTXA 3PX6A 2VYPA 3R9PA 1X9MA 1D8YA 2NRHA 5BRDA 3QNNA 1IBKK 3KKSA 1VRUA 1ZYQA 5TKWA 4JD2B 1CZ9A 3TTFA 1S3XA 1P90A 2DFEA 4HCBA 3C95A 3EN9A 2P9UA 1JLEA 2E2OA 2HVIA 3E9LA 1OH8A 3ASMA 2G8KA 3LZIA 4O5FA 4OLAA 3QDKA 3JS6A 3SQ1A 2UXDK 3GG4A 1GLEG 4LD0A 4FVUA 2GTDA 4M45A 5BN8A 3BZKA 3I56N 4M7YA 2B6AA 1NJYA 5AQSA 1M1KO 1G99A 3B6OA 3DWLA 2ZJRL 1BUPA 2YHBA 1YJWN 3BDPA 1Q82O 1OVYA 4XH1A 5HRNA 1REVA 4JKHA 1HPZA 4JI7K 2O4GA 3IDHA 4CBUA 1JLCA 3DLGA 1DT9A 2P51A 2YNIA 1X3NA 5HL7L 1A5VA 4BC3A 4BREA 2OPQA 3ZSRA 3FZMA 3ZT3A 4PUOA 3T69A 2F8SA 1NGBA 5H1SQ 4B3MK 3OS0A 4M3UA 4Z4IA 4LF9K 1WB9A 1VQ8N 1B92A 1RBTA 1T44A 2FF3B 3RSEB 1WAFA 4DR6K 2GELA 4CHOA 5HOOA 2W6LA 4CIEA 3M6GA 1WLJA 2O8CA 2PYLA 3NAEA 3VGMA 3CJCA 1T6DA 5M1QA 3QERA 4DFMA 3U6FA 1DTQA 3RR8A 1RTHA 4NLCA 4IXCA 3D2FA 1RILA 4X64K 1LWEA 2EX3A 4IG0A 5C24A 2E88A 1HNXK 4DTMA 5BPLA 3U4LA 1FK9A 3VQBA 4BRQA 2IC3A 2DPNA 1BI4A 1ASUA 2UUBK 3CC2N 2HNDA 2A6AA 5FPEA 2HHWA 2KZZA 3ZETB 4CJPA 2XY7A 3IFRA 1I94K 2G8IA 1K6YA 4E19A 1WAJA 1FKOA 4MLHA 1GOAA 4M42A 4H4MA 4CBXA 2O4IA 2ZJQL 4JKGA 3ID6A 4DSLA 5GAEP 1YVNA 3KD5E 3EKSA 3KLHA 4EHTA 4CF1A 1HQEA 4V19S 4NYNA 3T1AA 4IFYA 4PL8A 4B8CA 4OX9K 4OJRA 4FJNA 5DM7L 4DTOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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