3EKSA

Crystal structure of monomeric actin bound to cytochalasin d
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
DEEVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-5C
publication title Crystal structures of monomeric actin bound to cytochalasin D.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein
total genus 122
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3eksA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3eksA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3eksA03
3LDPA 4BRAA 4AM7A 3CI5A 4BR4A 4BR9A 2P9NB 4B1XB 4FPBA 2IVPA 5AZIB 3HM8A 5AQGA 3W0LA 2D1KA 3QFPA 5LJVA 3WQUA 5KQDA 3GL1A 1NGHA 3WXLA 2KHOA 5KPZA 2BUPA 2UYTA 3S41A 3O5BA 4BRKA 5AQNA 5BPNA 1K8KA 4CJ7A 3SMPA 3A5LC 5JMVA 1KAZA 4HWIA 3EL2A 5EY4A 3IMXA 3D2EB 5AFUH 1ATNA 1NMDA 3B8AX 2H3GX 3UKUB 2IVOA 4BQZA 1BDGA 3HTVA 5E84A 3SMSA 1E4GT 3EN9A 3MN6A 2ASPA 3H45C 5F0XA 3AARA 4BRIA 5AQRA 3FZFA 2CGKA 3ZX3A 1T6CA 1NGDA 3ENHA 1KAYA 3L0QA 3O4WA 2P9LA 3ZETA 3CJ1A 4BVPA 1XQSC 1MWMA 2ZF5O 3A5MC 5AQIA 4BR2A 3HSCA 3EO3A 4JHDA 2A41A 1T6DA 2PAVA 3CQYA 1G99A 3O1WA 2YCHA 4H0TB 3U4LA 3WUHA 3QFUA 4BRNA 2Q2RA 4CBWA 2Q0RA 4F9OA 1U2VA 3SLCA 4FWNA 2P9KB 1V4TA 4IZ9A 1BUPA 1GLJO 3KZBA 4IJNA 3D2FA 5F1XA 3GBTA 4H0XB 1MDUB 2P9PB 4BROA 1HUXA 5FPEA 3FR0A 1QHAA 4FOEA 4BRHA 2E20A 3RSEA 4H03B 1YAGA 1HLUA 3VESA 4O5FA 3CHWA 4CZEA 2P9IA 1NM1A 4FSVA 2DPNA 2FF6A 1X3MA 3IFRA 5AQKA 5ADXA 1V4SA 3ENOA 1GLFO 2I7NA 5BN8A 5FPMA 3ZX2A 3VETA 5AQQA 3SJHA 3MCPA 3CERA 2FF3B 3AAPA 4CD1A 3CJBA 2QWMA 2IIRA 2ZWHA 3CJ9A 4H0YB 4H5WA 5AQHA 1EQYA 3H3OB 3H6EA 1SZ2A 3ATUA 5AQVA 4PKGA 5AR0A 3DXMB 2CH6A 2QWRA 4CI6A 1HJOA 3TPQA 1J6ZA 2E2NA 5AQZA 3U9ZA 4B1VA 4CZLA 4JNEA 2NZTA 2ASMA 3VEWA 4BC3A 3FZKA 3O1BA 4BRDA 2CGLA 1GLLO 1JCFA 4DHYA 5AQMA 3O8MA 2Q36A 1ESVA 4K41A 3U9DA 4CZMA 2A6AA 4CZIA 4MO5A 2D4WA 5AZJA 1QQNA 1D4XA 5AFUA 2HMPA 1RFQA 4WQ5C 4XH1A 1TUUA 2P9UB 3FZHA 2FSNA 2E2QA 1ATSA 3H1VX 3M1FA 3ZX0A 3HZ6A 2QWPA 2P9SB 4IJAA 4DQ8A 2QWNA 3CJAA 1GLAG 1RDWX 3OHRA 5AQSA 4EFHA 3VENA 3J8AA 3SK3A 3MK6A 3MMVA 4CBXA 3VEZA 4YDUA 4B1UB 1NGFA 3DXKA 5ELZA 2QW9A 4FWRA 2F9TA 4JD2B 4CZJA 2W41A 2YHWA 3A0IX 1NGGA 2FLOA 4CZGA 4WQ4A 3WXIA 5TKYA 4JAXA 2E1YA 2YJFA 3WEEA 4A62A 3QB0A 2Q0UA 3BF3A 4PKHA 4CBUA 5JLHA 4DB3A 4AM6A 5B8HA 5KPTA 3VPZA 4H0OA 3VGLA 4BC5A 4RCHA 4BR5A 4MLEA 3EKSA 3MN5A 3VEYA 2YHYA 1TUYA 5JLFA 2J4RA 4BRLA 3LL3A 4CD3A 1BA1A 2Q31A 3R8EA 5BR9A 1S22A 3LM9A 1BWFO 4DCHA 5EVZA 3U8XA 1K8KB 1MWKA 3LDQA 4ISEA 3ULEA 1DKGD 4C23A 1IG8A 3GG4A 4FWLA 3WT0A 3UKRA 1NGEA 4H0PA 2IVNA 1XC3A 2Q1NA 4MLHA 5FPNA 3BP8A 4GY2B 4A61A 1NLVA 3VGMA 4FWOA 3VF2A 1T44A 2QWOA 1HKCA 3EZWA 3VF4A 5BPMA 3O08A 4GNIA 4BRFA 2P9LB 4H5RA 4I6MA 3ZETB 1SAZA 3WEEB 3L4IA 1LOTB 3HI0A 4BR7A 4JHDB 4FWMA 3BF1A 5AQFA 4LC9B 4CZFA 4E1JA 2ASOA 1HX1A 1U6ZA 3WQTA 3ATVA 4XEIA 5BPLA 3KHYA 4QS9A 4Y0WA 4NB4A 2E2OA 4FWKA 3O6WA 3AAQA 3M3ZA 2P9NA 1U2VB 4H5VA 4K42A 5AQJA 1RGIA 3TU5A 2QXLA 1KXPA 4PKIA 3UKRB 2GUPA 4BR0A 2A3ZA 3D2FB 5EX5A 2E2PA 5CE3A 1Z05A 3H46O 4BRCA 4Z94A 2A40A 3ID8A 4FPAA 1LCUA 4ISFA 3RSEB 2HF3A 1H1VA 5AQUA 4EHUA 1E4FT 2GWJA 5I9EB 1R59O 2P9IB 1C0FA 3CIPA 3UE5A 2BTFA 1Z6RA 3D2EA 1BA0A 4H0VB 3BUZB 3R6MA 4IWVA 3LM2A 3KVGA 3UKUA 1GLEG 3A8YA 3QBXA 4B1ZA 4BGAA 1BO5O 1JCGA 1ZXOA 2HOEA 5AQPA 1JCEA 4M63C 1NGBA 4J8FA 3VEXA 3UB5A 1DEJA 2AA4A 5EOYA 3QMLA 3A5OC 1TYQA 1YUWA 2E88A 2PBDA 2QWQA 2A5XA 3VOVA 4JN4A 1HKGA 5LY3A 1ZC6A 1QZ5A 2VYPA 1IJJA 1ZBSA 3LDLA 2D0OA 4PL7A 3MN9A 3WXJA 2YJEA 2V7ZA 5AQWA 1WUAA 4BVOA 1C0GA 1QQOA 4B1YB 3A5NC 3D7EO 4XH5A 1QQMA 3I33A 1NGCA 5BRFA 4ISGA 4BRPA 2CGJA 1HKBA 2OANA 2VCPA 3FGUA 4RTFD 3MN7A 3VERA 4H5TA 2P9KA 4MO4A 4XH4A 2V51B 4CZHA 3H1QA 3DAWA 4QS7A 1BU6O 4BRGA 3FZLA 3R9PA 4H5NA 4WQ5A 4CZKA 2P9PA 5AZJB 2F9WA 4BC2A 1X3NA 3GE1A 3IUCA 4IXCA 3VEVA 5LJWA 2CH5A 5AQOA 5KPRA 2ITMA 4PL8A 1TYQB 2WUSA 3IDHA 3EKUA 3O80A 3JXUA 4WYBA 4K25A 1YVNA 3DWLA 3CJ7A 1WOQA 1SQKA 1NGAA 3WXKA 3DJCA 1QZ6A 2AP1A 3DXKB 3FZMA 3QDKA 5BN9A 4A2BA 4A2AA 3L6QA 2NRHA 2E1ZA 3JS6A 1P8ZA 1YXQA 5KQ8A 2NLXA 2VWBA 5F2RA 2ZGYA 4IO8A 5EXWA 4FWQA 4FL9A 2V7YA 1NGJA 2FSKA 4NO7A 4BQLA 1ATRA 1NWKA 5JICA 4B1WB 5BRHA 3DXMA 1KAXA 1XUPO 1Q18A 3BEXA 4BC4A 2GWKA 4RWTA 2FSJA 5BREA 4FOIA 1BG3A 3G25A 4K43A 4L3QA 3M6GA 3ZEUA 2FXUA 3C7NA 4BGBA 3HBTA 2GEMA 1BOTO 1MA9B 1Y64A 2YI1A 1NBWA 3FLCO 3GOIA 3MDQA 4BRQA 2I7PA 1X9JA 2V52B 3AY9A 5BRDA 2HF4A 2A42A 5AQXA 5AZIA 2D0PA 1GLCG 5AQLA 4BREA 3ULEB 3I8BA 4FWPA 2ZGZA 1NGIA 2P9UA 3CQXA 4FO0A 5AQYA 3VEOA 2GTDA 3P4IA 3QICA 4BG9A 2QM1A 3C0BA 2P9SA 3VGKA 2Q97A 5AQTA 3W3DA 4EIAA 3QBWA 4FWSA 3CJCA 3FFKB 3LDNA 3GDQA 2W40A 4KBOA 4BRMA 4BG8A 4I6MB 4EAHD 5ADXH 2YHXA 2EWSA 1S3XA 4YDUC 1GLDG 3H3NO 1DGKN 4JD2A 4O8KA 2E8AA 2GELA 3VF6A 4B9QA 4EHTA 1CZAN 4M7XA 3CETA 3ZEUB 4M7YA 1GLBG 3LDOA 3FE1A 3F9MA 5E26A 3C7NB 4QS8A 4WQ4C 4HTLA 5FPDA 1OKJA 2QWLA 1HPMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NK0A 1VQ4N 2QA4N 3SV3A 5AZIB 2XY7A 5AQGA 4CERA 2D1KA 5LJVA 4DU4A 3RR7A 2KHOA 1FKPA 3K58A 1BHLA 5KPZA 2UYTA 3P5JA 4KI6A 4BRKA 2R7YA 4FW1A 4K8ZA 3NH1A 4CJ7A 3TSQA 4FJKA 4LH5A 3KD5E 1VHXA 2FBVA 3TI0A 1I39A 5EU7A 1N34K 3B8AX 3VQBA 3ZSYA 4XIUA 3UKUB 3AA5X 4RW4A 4Q5VA 3EN9A 3MN6A 1T3VA 1ASVA 3ZX3A 4DLGA 1T6CA 2WFBA 3ENHA 1KAYA 4CJ5A 2DFHA 1TKTA 1RBVA 3M8QA 1NK6A 4FJGA 3KKSA 3O9SA 2ZF5O 1TL1A 1L3TA 4CF1A 3O3FA 4FM2A 5M1NA 4E7KA 3QETA 3V6DA 4DS4A 2HHSA 4IKFA 1G99A 3EEQA 1XHZA 2W42A 1VAZA 4OJRA 4H0TB 1EKEA 1QQCA 2IAJA 3C65A 2YX6A 2Q0RA 4FWNA 4ELUA 1TKDA 1RBRA 3KLGA 1U4BA 4FK2A 4IJNA 4J2BA 2YNIA 4H0XB 4BROA 3CCJN 5FPEA 3FR0A 1QHAA 4CJLA 3ITHA 4FOEA 2E20A 3RSEA 3VN5A 1Q8IA 1HLUA 1SKWA 2E6MA 2G8UA 4FSVA 3J80O 1JL1A 1WSJA 3HP6A 2FF6A 4KHPK 4CGDA 3ENOA 3HK2A 5BN8A 2I7NA 4O0JA 3DRPA 2O8BB 2OTJN 4CD1A 3CJBA 2KFNA 3RWUA 1A5VA 3RMCA 3OYMA 1UAXA 4H0YB 4LF5K 4DFJA 5AQHA 3H3OB 3DRRA 4F4KA 1VSKA 1SZ2A 2X74A 3VQ4A 4PKGA 5AR0A 4FVMA 3WNFA 2CH6A 3EYZA 3T1AA 3OW2M 4G9ZA 3ZSWA 2E2NA 3CCMN 2HVIA 2A1RA 5AQZA 3SUOA 1RBSA 3VA3A 4EZ9A 4GV6A 1UOCA 3VEWA 2JGUA 4BRDA 3P83D 4B3RK 5AQMA 5GAEP 4CZMA 4I9QA 2A6AA 2HVHA 2XHBA 1VK0A 3I55N 3HVTA 3IRXA 5J1EA 3OYLA 4CEZA 1F21A 1W0HA 3ZX0A 4PHTX 3CMAN 1VSMA 4BDYA 1REVA 4IJAA 4DQ8A 3KK1A 2O8EB 1WSHA 3CJAA 3OHRA 3AVCA 4Z4FA 3VENA 3CCVN 3SK3A 4HCCA 3AVHA 4I9LA 3SQ4A 3MK6A 3K5LA 1NGFA 1T7PA 2P1JA 3P38A 5CHIA 4CZJA 3SAGA 3S9HA 2FLOA 4B9NA 4WQ4A 3WXIA 3DMJA 1W2BM 3ENBA 4FJ9A 2E1YA 3LAKA 3LZIA 3T1HK 4PKHA 4ZTJA 3WNGA 4AM6A 3TSPA 5KPTA 5SWMA 1ASUA 5KRSA 1UA0A 3VGLA 1IBKK 1NNEA 3MN5A 2UU9K 1TUYA 5JLFA 3N4QA 3HL8A 3LL3A 3R8EA 4E72A 3DLBA 5HBMA 3THWB 4AHVA 1VQ6N 1K8KB 1T8EA 4J2AA 1MWKA 4FLTA 2BANA 4Q0BA 4E1MA 1IG8A 4FWLA 1SL2A 3UKRA 1NGEA 4X66K 2Y1JA 3KK2A 3BP8A 4CGGA 4DU1A 3TAQA 1ZBUA 3THXB 3IKMA 2NRZA 2QWOA 5A2QO 1S5JA 3EZWA 3VF4A 2QKBA 3QERA 2P9LB 4CJUA 3CPEA 3WEEB 5CYQA 5LMUK 3TWHA 3HI0A 4BDZA 4LF6K 4LC9B 3BZCA 4XEIA 5BPLA 4FVUA 3KHYA 1BQMA 3VQ7A 4M3UA 1KRPA 3NF7A 2B5JA 3AAQA 2HBJA 1U2VB 4CHNA 1M90O 2ATQA 2KZMA 3ZSOA 2A3ZA 3D2FB 1OVYA 4UY8O 5EX5A 4O4GA 1QSSA 1XHXA 3ID8A 3SQ1A 4UQGA 3RMBA 3E9PA 1RTIA 4ISFA 3SCXA 1H1VA 5AQUA 4EHUA 1E4FT 1R59O 3UE5A 4DSFA 2IGIA 1Z6RA 4CCHA 1RDAA 4IWVA 1JKHA 3BUZB 3EE8A 1SV5A 4ID5A 3UKUA 1I94K 1HJRA 3A8YA 3A2FA 3QBXA 2F7TA 3O4QA 3LZJA 5AQPA 1JCEA 4LD0A 4CJ4A 4KI4A 2AA4A 5HLFA 4PY5A 3QMLA 4LFAK 2OPSA 1YUWA 2PBDA 2QWQA 2UUCK 4FLZA 3S5TA 3OY9A 5MLCQ 4JN4A 1HKGA 2OCEA 1ZC6A 2YKNA 1QZ5A 2PFUA 3WXJA 5JENA 1WUAA 2YNHA 5I3UA 1HNWK 1QQOA 1X1PA 3D7EO 2WOMA 5FRNA 1QQMA 3AV9A 3I33A 4BRPA 2CGJA 2E4LA 2VCPA 4DSJA 4FZYA 3MN7A 4H5TA 4MO4A 4DWIA 3O9QA 3H1QA 4C8NA 5M1FA 4BRGA 4DKWA 3G10A 4FK4A 1KVAA 3C6AA 5C15A 3IUCA 1JLFA 4DFPA 1TL3A 3VEVA 5HRPA 5KPRA 3F9KA 4BWJA 2Z1HA 1OH6A 1S1WA 2WUSA 3EKUA 3O80A 3PSIA 3CD6N 5KTQA 1RT2A 1KLNA 4LSLA 5KGXA 5C2FA 3CJ7A 3CCEN 3T3FA 2O8BA 1NGAA 1VQ7N 3WXKA 2AP1A 3FZMA 3QDKA 4A2AA 4FJ5A 2NRHA 3JSMA 4A5AA 4KB0A 1YXQA 2NLXA 2VWBA 4EP4A 5F2RA 4CJQA 4AF1A 3I8DA 2RN2A 4FL9A 1NGJA 4NO7A 1ATRA 2YNGA 4B1WB 1KSPA 1O1WA 3PX4A 3AVKA 3K5NA 3BEXA 4BC4A 3DOKA 3SBGA 1BG3A 1S6QA 3AA4A 3M6GA 4DR3K 1BI4B 3TAPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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