3EKSA

Crystal structure of monomeric actin bound to cytochalasin d
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
b'DEEVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-5C
publication title Crystal structures of monomeric actin bound to cytochalasin D.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein
total genus 122
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3eksA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3eksA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3eksA03
3O6WA 3ZX2A 2E88A 1LCUA 1NGBA 3UKRA 1BUPA 3H3OB 4FWSA 1R59O 3D2EA 2ITMA 3O8MA 3VENA 1TUYA 2CGJA 4CBUA 3CETA 3ZEUA 1JCEA 4A2BA 5AQJA 5AZJB 3VEVA 1BA0A 1OKJA 4FOEA 1DKGD 2FSNA 1XC3A 3KVGA 4BRQA 5KPTA 4NO7A 3A5MC 5E26A 4BR2A 5AQMA 1ATRA 1NGJA 2A42A 2FLOA 4MLEA 3SJHA 4BC2A 1JCGA 1IG8A 3U4LA 2YHWA 4A2AA 5BPMA 4B1XB 5ELZA 2QXLA 4B9QA 3VEOA 4FWQA 4CZLA 3JXUA 4CZGA 1NBWA 3QMLA 2E2OA 4IXCA 3FZLA 3VPZA 1U2VB 2EWSA 3HM8A 4B1YB 2E20A 3DJCA 2P9KA 1QQMA 3ATUA 1RFQA 1XUPO 3UKRB 3QB0A 3ZETB 3D2EB 4WQ4C 5KQ8A 2Q31A 1IJJA 1QHAA 4H0PA 2W40A 3ZEUB 4BRHA 3UKUB 1SZ2A 4KBOA 4JNEA 1NM1A 3A8YA 3FZKA 5FPNA 1J6ZA 4QS8A 3FGUA 4FOIA 4IJNA 2YHYA 5ADXH 4CZFA 3CJBA 3ULEA 1KXPA 3GE1A 2NLXA 5AQPA 4CZHA 1T44A 3GOIA 4ISEA 1DEJA 3H1QA 3LM2A 5AQSA 1NGCA 4H0YB 4RCHA 5BPLA 5JLFA 1NGAA 3EL2A 4BGBA 4GNIA 1BO5O 5LY3A 4EHUA 3TU5A 4C23A 4BRNA 4CJ7A 4FSVA 3IDHA 1QZ5A 1X3MA 2Q0UA 2AP1A 2P9KB 3KZBA 3QDKA 1MDUB 4IWVA 3U9ZA 2YHXA 3AY9A 3L6QA 2ASPA 2A40A 2OANA 2P9IA 5KPZA 2E1ZA 4MO4A 3MN6A 2P9NA 3MMVA 2D0PA 1HJOA 2Q97A 4LC9B 4K42A 3WQUA 4YDUC 4CD1A 5EVZA 3CQXA 2VCPA 1GLDG 2KHOA 1GLLO 2HMPA 3ULEB 5BREA 1V4TA 2HF3A 4J8FA 3GL1A 1T6CA 3VESA 1ATSA 3DXMA 1T6DA 4BRAA 4M7YA 4FPAA 4H5TA 4WQ5A 4O5FA 4B1ZA 1HPMA 4BRLA 5AQQA 4RWTA 4CZMA 4Y0WA 1GLCG 1C0FA 2BTFA 1DGKN 5E84A 1RDWX 4BC5A 2E2QA 4FWNA 2WUSA 2IIRA 2CH6A 4XH5A 5EY4A 5BN9A 4BQZA 4H5VA 2NZTA 3DXKA 3FE1A 1HLUA 2HOEA 3ZX3A 2P9IB 4H5RA 2ZGYA 4BG9A 5AQFA 3R9PA 4CD3A 3GDQA 1BWFO 1GLBG 4CZJA 3D7EO 3VEWA 2D4WA 4BRIA 3LM9A 5AQIA 4PL8A 4CBWA 4XH4A 3CJ7A 2J4RA 2GUPA 3ZETA 4FWRA 1HKGA 3DXMB 2HF4A 4B1VA 2IVOA 3UKUA 1HKCA 4M7XA 3HTVA 5ADXA 5AQOA 1P8ZA 4GY2B 2UYTA 4BRCA 1K8KA 3ENHA 4EFHA 2YJEA 4IO8A 4H03B 3M6GA 3L4IA 1U6ZA 4B1WB 3W3DA 1HUXA 2F9WA 1HX1A 1NMDA 3DXKB 3O08A 4M63C 1YVNA 2NRHA 3B8AX 4K25A 5AQTA 4I6MA 3U9DA 5AQWA 5JICA 5BR9A 3LDLA 3CHWA 3G25A 3M3ZA 5BRFA 1ESVA 2GTDA 4FL9A 5AR0A 3VGKA 4MLHA 1HKBA 1S22A 3HSCA 4L3QA 3R8EA 3CQYA 3WT0A 1BA1A 3EN9A 2H3GX 4O8KA 1QQNA 2Q0RA 5AQZA 3SK3A 4CZIA 2YI1A 4BG8A 3H6EA 2QWNA 3MN7A 1K8KB 5FPDA 3CI5A 1S3XA 2A6AA 1MA9B 2YCHA 2CGLA 1ZBSA 4JN4A 2FSKA 4YDUA 3AAQA 3MDQA 3FR0A 3QICA 3FZHA 2AA4A 3HZ6A 4ISGA 5BRDA 5AQXA 3VETA 4I6MB 4QS7A 3VEZA 3WXLA 5AQUA 3VOVA 3KHYA 5BRHA 3DAWA 3J8AA 4FPBA 5KQDA 3WQTA 2FXUA 4FWOA 2ZF5O 4H0OA 2QWLA 4DHYA 3O4WA 1NLVA 3VERA 1TYQB 3H46O 2V52B 5AQYA 1WUAA 2QWMA 3FLCO 5F0XA 3W0LA 4BVPA 3BF1A 4MO5A 1NGHA 4AM6A 2E8AA 2ZWHA 4BC4A 3WXIA 3C7NA 3VF6A 5AQVA 2QWQA 2ZGZA 3L0QA 2P9UA 1EQYA 2QM1A 1YXQA 3MCPA 4CZEA 2IVPA 3QBWA 2A41A 4BRGA 3EKUA 4HWIA 4BR0A 4PL7A 5TKYA 2VWBA 3SMSA 2Q1NA 2QWRA 4PKIA 3H45C 5FPMA 3WXJA 4QS9A 3VF2A 2IVNA 5EOYA 2ASMA 4EAHD 2E1YA 1NGGA 4RTFD 5I9EB 4EIAA 3CJ9A 3QFUA 4BRFA 3CERA 2GWKA 4BROA 1MWMA 3ID8A 3UB5A 4BR9A 2GELA 1E4GT 4FWPA 3LDQA 3C7NB 1NWKA 1BOTO 2P9UB 4EHTA 3OHRA 3EO3A 2I7PA 3A0IX 3S41A 1Z6RA 2V7YA 3IUCA 4FWKA 3WEEA 2V7ZA 2A3ZA 5AQLA 4BRMA 2CGKA 4BRPA 2A5XA 4BR7A 2CH5A 2FF6A 3MN9A 1CZAN 4PKGA 1KAZA 4WQ4A 3A5OC 2FF3B 3P4IA 3SMPA 1NGIA 4H5NA 3CJAA 1BU6O 3GBTA 3EKSA 4BR4A 3LDNA 4WQ5C 3ATVA 4XH1A 4JD2A 4Z94A 3BF3A 4BQLA 4K43A 4IZ9A 5BPNA 4F9OA 2YJFA 3MK6A 3QBXA 2GWJA 5AZIA 4JHDA 3WXKA 4A62A 3IMXA 1YAGA 1G99A 2P9LA 3AARA 4DB3A 5AFUA 1LOTB 4H5WA 1Q18A 3R6MA 3LDOA 3VGLA 3RSEA 2E2NA 1KAXA 3VGMA 3WEEB 1TYQA 4BREA 1WOQA 3AAPA 3O5BA 3JS6A 1GLJO 4CBXA 3I8BA 4FO0A 2QWPA 4CI6A 5AQNA 3CJCA 2QW9A 3DWLA 2P9SA 3IFRA 2E2PA 4E1JA 3D2FA 4DCHA 4JD2B 1SAZA 5LJVA 2P9PA 3A5NC 1QQOA 3WUHA 1GLEG 2FSJA 5AQGA 2F9TA 1C0GA 4HTLA 5AZIB 1RGIA 3VEYA 3A5LC 4JHDB 1BG3A 3HI0A 2Q2RA 1V4SA 1ZXOA 2P9LB 3FZFA 4NB4A 5B8HA 5JMVA 5F2RA 3MN5A 3O80A 3RSEB 3GG4A 5AFUH 4BR5A 2I7NA 3U8XA 5LJWA 2BUPA 5CE3A 3EZWA 4DQ8A 1JCFA 4BC3A 1MWKA 3LL3A 4FWLA 5F1XA 3LDPA 3ZX0A 1GLFO 5EXWA 4IJAA 1TUUA 3ENOA 3O1WA 4CZKA 3UE5A 1KAYA 2PBDA 2PAVA 2P9SB 2DPNA 3F9MA 3VF4A 3VEXA 3D2FB 2VYPA 1SQKA 3FFKB 1QZ6A 1X3NA 2P9PB 3C0BA 2D0OA 1GLAG 5AQHA 4H0VB 4PKHA 1BDGA 3SLCA 4BRDA 2V51B 3O1BA 2D1KA 2ASOA 3I33A 2Q36A 4A61A 5JLHA 3FZMA 1NGDA 5EX5A 5KPRA 4XEIA 4BRKA 3BP8A 5BN8A 3BEXA 5AZJA 4FWMA 4H0TB 1D4XA 1H1VA 5AQKA 3HBTA 2QWOA 1YUWA 4K41A 4JAXA 3H1VX 1Y64A 2W41A 5AQRA 3BUZB 3CJ1A 1ATNA 3M1FA 3QFPA 4ISFA 2GEMA 4WYBA 4AM7A 3H3NO 1X9JA 1E4FT 1Z05A 4BVOA 2P9NB 5FPEA 1NGFA 3CIPA 1NGEA 3TPQA 4H0XB 1U2VA 4BGAA 4B1UB 1XQSC 1ZC6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BE2A 3O6WA 3V1RA 4KI4A 5KRTA 1MU2A 3OVNA 4DV5K 3D2EA 2ITMA 1RT4A 3VQBA 5C0YA 4DTMA 1BA0A 1VSLA 2FSNA 1XC3A 2B5JA 4BRQA 5E26A 3A5MC 3L2VA 2G8KA 3SJHA 4J2EA 2VG6A 4F8RA 4BC2A 1IG8A 3U4LA 4DTOA 4HCCA 3TI0A 4JI5K 4B1XB 3HP9A 3VEOA 4CZLA 3JXUA 3C6HA 4N41A 2E2OA 3KLGA 1S1VA 4UQGA 4FJ5A 3SV3A 3QIPA 4WE1A 2PYJA 4C8MA 3ZSZA 3MXMA 2X78A 4GKJK 1QQMA 1RFQA 3KD5E 2W6KA 3AVGA 1RTDA 3CCJN 4KKOA 3HO1A 1IJJA 2ZE2A 1HRHA 5CYQA 1XNQK 1SZ2A 4KBOA 4X62K 1NM1A 4BDYA 3FZKA 5HP1A 3G71N 3KLIA 1IG9A 3NF9A 3AVMA 4QS8A 5ADXH 3GE1A 4CZHA 3S5TA 4KHYA 4DR7K 3H1QA 4FLTA 2IC3A 3OJUA 4FCYA 4BGBA 4DU3A 4FJLA 4CJTA 3OA9A 4PY5A 4M41A 4CJ7A 1X3MA 2AP1A 1CXQA 1RNHA 2YHXA 4KRFA 3L6QA 2OANA 2QTDA 3AVCA 3MECA 2R7YA 1TKZA 1DLOA 1I3AA 2E1ZA 3TARA 5M1QA 3U6FA 2P9NA 4W5QA 1IKYA 3G0ZA 1CLQA 2VWKA 4YDUC 3DRRA 1RDCA 3WNEA 3V1QA 3OYNA 4NXNK 2VCPA 1GLDG 3H08A 3KTQA 2G8FA 4CJWA 2HF3A 3Q7CA 3ZSYA 3P83D 4YOYA 1ATSA 3PSIA 2O4IA 1RTJA 4BRAA 4H5TA 4O5FA 2BANA 4BRLA 3MXIA 4RWTA 4Y0WA 4GW6A 1K73O 4CJPA 1C0FA 1Z26A 4F2SA 1RDWX 4W5TA 1IO2A 4B3TK 2YV0X 3KD1E 3THWA 1L3SA 4H5VA 4LF8K 4M45A 3AA4A 3ZX3A 2KZMA 2P9IB 4H5RA 1L3VA 3RMBA 4B9LA 2OA8A 5FDLA 4E1MA 3R9PA 3GDQA 4CF2A 4E3SA 1WAJA 3P39A 2D4WA 1YVUA 4BRIA 3LPTA 4PL8A 2J4RA 4FWRA 3NH2A 2HF4A 2KLAA 4B1VA 1C6VA 1HKCA 3R3LA 1S5JA 3CYGA 3HTVA 1JLCA 4JKEA 2O8FB 2KW4A 3E9OA 2UYTA 4LD0A 4DR4K 3ENHA 2YJEA 4CJQA 3AA5X 3W3DA 3ZCMA 3TSUA 3O08A 3CC2N 4M63C 4YY3K 4B9UA 2NRHA 1G15A 3DLKA 5AQTA 4I6MA 1FK9A 2A1RA 3F5TA 4ELUA 5BR9A 5CZ2A 4MDAA 3ZSQA 4KTWA 4OJRA 4DV7K 4LF7K 5AR0A 3VGKA 3AVFA 4MLHA 1HJRA 1XMQK 3R8EA 2HHSA 3R1XA 3BGRA 4FJXA 1T05A 2QK9A 4YOTA 1VQNN 3KLEA 2YI1A 1C1BA 1K8KB 1KLMA 1CZBA 1WNSA 3CI5A 4JK8A 1S3XA 1X9WA 2G8VA 2HBMA 2YCHA 1EXQA 4JN4A 1RT2A 3PV8A 4CECA 3AAQA 3DLRA 1ASUA 4IG0A 1VRTA 4OPJA 3VEZA 3DRSA 1E3MA 3MWPA 5GIOA 3K5OA 2FXUA 4FWOA 3VQ7A 2ZF5O 4H0OA 2G8HA 4PA1A 3O4WA 1NLVA 4DV4K 1OH6A 1VHXA 2RHKA 2HHTA 1WUAA 3FLCO 1ZBIA 4AM6A 3PLAA 2OZSA 3C7NA 5AQVA 3TAEA 4CHPA 1WSEA 1N32K 3QBWA 4ID1A 4HWIA 1RBVA 4Z4EA 4BR0A 3C94A 1VAZA 4DTUA 2VWBA 4PWDA 2QWRA 4PKIA 5FPMA 3DRPA 3CCVN 4QS9A 1RT6A 1WBBA 2IVNA 1K6YA 2HBKA 2YHBA 3VQCA 4A57A 1TK0A 3AO2A 1TAUA 4IFEA 4EIAA 4NCBA 1S1UA 2HBLA 4OGEA 4Q0BA 3VA3A 1E4GT 3KKSA 1WSFA 1NWKA 1Q82O 2C1GA 3DM2A 4FM1A 1VQ9N 3A0IX 2HHWA 4B9VA 4RW8A 3ZT3A 2HW3A 5AQLA 3HVTA 3SBGA 3MEDA 3NH0A 2A5XA 4OLBA 1CZAN 2HNZA 1KAZA 4YOWA 3CCEN 4KREA 3P4IA 4DQSA 1RTIA 4C1NI 4PQUA 5DM6L 3V9UA 1I94K 1ZBUA 3JAMO 4EP4A 2KFNA 4WFAL 3L2WA 4BQLA 3I55N 4K43A 4WFBL 4IZ9A 5BPNA 4KH4A 4F9OA 2Z1JA 3K57A 4KFBA 4HCBA 5AZIA 2IAJA 1ASWA 2VGNA 3WXKA 4A62A 3EY1A 1G99A 5AFUA 3AARA 1EETA 1LOTB 4JKHA 4KH5A 1Q18A 3LDOA 3VGLA 1VRUA 2E2NA 1KAXA 2D0CA 1S9EA 5KTQA 4N76A 5FRMA 2UU9K 4CEZA 3J7AP 2GUIA 3O5BA 4JRQA 4CBXA 3I8BA 4FO0A 2E4LA 2QW9A 1WB9A 1Q9XA 3LDSA 4M3XA 2P9SA 3V9WA 3LP2A 3D2FA 4O0JA 4DCHA 1SAZA 4DLEA 5LJVA 2P9PA 3HSTB 3A5NC 3NAEA 1S1TA 2F9TA 3P1GA 5IWAK 4JHDB 1VK0A 1BG3A 2GV9A 2P9LB 3O3FA 4KO0A 4NB4A 5B8HA 1BCOA 3MN5A 4JK9A 3PIPL 3GG4A 3U8XA 2ATQA 1TV6A 5LJWA 5CE3A 1A5WA 2ITGA 1LWFA 5F1XA 3OJSA 4KHSA 4B3SK 3CC7N 5EXWA 4DV2K 4IJAA 3N4QA 2PBDA 2OPQA 4WCEL 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4CHN A;  4BRF A;  3CER A;  3MWT A;  3EEQ A;  4JI2 K;  4BRO A;  3E66 A;  4BR9 A;  1S1X A;  3BDP A;  4FZY A;  1EKE A;  5HBM A;  1TK5 A;  3C7N B;  1BOT O;  3DOK A;  4DWI A;  4JKB A;  5CZ1 A;  1HNX K;  2JLE A;  3S41 A;  2V7Y A;  3WEE A;  2V7Z A;  4CGJ A;  4BRP A;  3NF8 A;  4BR7 A;  2CH5 A;  2FF6 A;  3ID6 A;  3NGZ A;  4GV3 A;  2F8S A;  4PKG A;  4KI6 A;  3VQA A;  1P90 A;  4CEO A;  2P1J A;  4WQ4 A;  3OYJ A;  4AHU A;  1C0U A;  2FF3 B;  3SV4 A;  4GVE A;  3CQ8 A;  4Z4G A;  4CEE A;  4H5N A;  3CJA A;  4FLZ A;  3NGI A;  3SPY A;  3RR8 A;  3V9Z A;  3GBT A;  4XH1 A;  3QEW A;  3O3H A;  4DR3 K;  3VQP A;  3NMU A;  3BF3 A;  3K0S A;  3OBY A;  3MEE A;  1K8A O;  1RDU A;  1YAG A;  1TKT A;  4H5W A;  4DQR A;  4M3T A;  1XHZ A;  3RSE A;  3VGM A;  2HB5 A;  3RMA A;  4CGG A;  4F3O A;  1O1W A;  3AAP A;  3OW2 M;  3JS6 A;  3V9X A;  1GLJ O;  3K5N A;  1RT5 A;  3AVN A;  3NVM A;  4CF1 A;  3CJC A;  3DWL A;  1VSD A;  3IFR A;  4E1J A;  4CHY A;  3KK3 A;  4R5P A;  3PIO L;  3THY A;  3CCM N;  1QQO A;  3PX4 A;  2P5G A;  4FXD A;  1GLE G;  3AV9 A;  5GIN A;  5AZI B;  4XJX A;  5FLX O;  1NK9 A;  3IAY A;  5C12 A;  4EP5 A;  1QSY A;  3LZI A;  4FJ9 A;  5JVH L;  4DSE A;  3SAF A;  2BUP A;  1U04 A;  1ASV A;  4DQ8 A;  4BC3 A;  1VQ8 N;  1VSK A;  4FWL A;  4UY8 O;  1C1C A;  2PY5 A;  4DFJ A;  4M3Z A;  3L8B A;  1K9M O;  3O1W A;  4CZK A;  3UE5 A;  2PAV A;  1M90 O;  2P9S B;  2DPN A;  3D2F B;  2HHI A;  3ZT0 A;  4U67 L;  3S3M A;  1SQK A;  3P38 A;  4YOR A;  2P9P B;  2QKB A;  4C8K A;  1XMO K;  4JYA K;  4JI0 K;  4O0I A;  4NYF A;  4NCA A;  2YKN A;  3SLC A;  3TR8 A;  3L2Q A;  2D1K A;  2BGG A;  2ASO A;  3RMD A;  1KCF A;  3F9K A;  3QIN A;  1YIJ N;  1UOC A;  2OTJ N;  2Q36 A;  3VMF B;  1J54 A;  4IG3 A;  5JLH A;  5EX5 A;  4K8X A;  5KPR A;  3L3V A;  5AZJ A;  2ZJP L;  3THX A;  1YJ9 N;  3CCL N;  2IOC A;  1D4X A;  1H1V A;  3ULD A;  1JXB A;  2UUA K;  1JKH A;  4JAX A;  3H1V X;  1Y64 A;  3CJ1 A;  3DMJ A;  3PO5 A;  4CJR A;  3MX5 A;  4WYB A;  3H3N O;  4CGH A;  1XC9 A;  2JWK A;  3NE6 A;  2OYQ A;  2A1S A;  5CR4 A;  1OH8 A;  4BGA A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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