3EKSA

Crystal structure of monomeric actin bound to cytochalasin d
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
DEEVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structures of monomeric actin bound to cytochalasin D.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein
molecule keywords Actin-5C
total genus 122
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3eksA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3eksA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3eksA03
4BQZA 3M6GA 2NLXA 4HTLA 4DQ8A 4AM7A 3R9PA 3D2FA 3BP8A 5BREA 3FZMA 3DWLA 3UKUB 1WUAA 5AQNA 2YCHA 3FZLA 1U6ZA 1NGEA 3I8BA 4BREA 4H5TA 4IJAA 5ELZA 3DXMA 3WT0A 3LL3A 4BGBA 4BRMA 3HI0A 1BU6O 1T6CA 4FWPA 4MO5A 5E84A 2E1ZA 2Q31A 3ULEA 2GTDA 3UE5A 5LJWA 1NM1A 2ZF5O 1HLUA 3QFUA 1ZXOA 3KHYA 4ISGA 4M7XA 4A2BA 2QWMA 5AQIA 3WXIA 4JD2B 1KXPA 4KBOA 4YDUC 5CE3A 4BR4A 2P9LB 3MDQA 4I6MA 3LDQA 3WQTA 2ASPA 2E2NA 4FO0A 5AQLA 2ASMA 4WQ5A 1X3NA 3VEZA 4B1VA 5EXWA 5I9EB 3EKUA 2VWBA 3H1VX 1G99A 3QFPA 5JLFA 3CQXA 4BR0A 1NGFA 2AP1A 1KAZA 4PKIA 5E26A 2V51B 5BN8A 3WQUA 1YXQA 1DGKN 4FSVA 3FLCO 1TYQA 3GE1A 1SQKA 1ATSA 2CH5A 3CIPA 2ITMA 3VF6A 5F1XA 3EO3A 2ASOA 3ZEUB 2BUPA 5AQPA 3R6MA 5AR0A 2HF3A 1X9JA 3WEEA 4BRHA 2HMPA 2A40A 3QBXA 3VEYA 3R8EA 3SLCA 4CI6A 3SJHA 3ZEUA 3AY9A 3DXKA 3LM2A 1ZBSA 5KPZA 5BPNA 1GLAG 1C0GA 3FE1A 1NWKA 3I33A 5JICA 5KQ8A 4BR7A 1RDWX 4JN4A 1NGJA 4CZFA 1GLDG 2QWNA 5AZJB 2W41A 4XH1A 4CZGA 4YDUA 4B1UB 4CZLA 3O8MA 5EY4A 4K42A 3FFKB 3GOIA 4BRNA 2A3ZA 2Q36A 2A6AA 4IWVA 4H5RA 4BC5A 3CJ9A 5FPDA 3CETA 3MK6A 4CZJA 1NGHA 4MLHA 3A8YA 1SZ2A 3ZETA 4IO8A 3QMLA 4JHDB 5AQTA 4BRFA 4K43A 2GUPA 4EIAA 2PAVA 1XC3A 1ESVA 2F9WA 4JD2A 2NZTA 4BC4A 3A5OC 2P9KA 1S3XA 5EVZA 1JCGA 3ZX2A 1BWFO 2P9LA 2QWQA 4FL9A 3KZBA 3BF3A 2OANA 1ZC6A 4EHUA 3TU5A 3EKSA 1HPMA 4FWOA 4BRLA 3VGLA 4NB4A 3O4WA 4Y0WA 2HOEA 3EL2A 2Q0UA 5AQKA 1LCUA 3O1BA 2GWKA 3IFRA 4CBWA 3J8AA 5LY3A 4FWMA 5AQHA 1NLVA 1YUWA 2E2PA 2YJFA 4IJNA 3DXKB 1QQMA 2P9SB 2IVNA 2H3GX 5AQFA 5AQYA 4XH4A 4H5NA 4BRIA 1IJJA 4H5WA 3WEEB 4FWQA 3ENOA 4RCHA 1HX1A 5AQRA 5AQUA 4BR5A 1Q18A 3D2EB 4MO4A 1J6ZA 3VEWA 4BG9A 4H0XB 4ISFA 1NGDA 1GLLO 3U9DA 3VERA 5AQGA 5EX5A 3LM9A 1GLJO 2YHXA 3H6EA 3QDKA 3A5MC 5ADXA 4ISEA 4B1WB 4HWIA 3A5NC 3F9MA 3HTVA 1P8ZA 2A5XA 2CH6A 1BUPA 3M3ZA 3MCPA 4XH5A 4E1JA 1TUYA 3SMSA 2NRHA 5AQVA 1QQNA 4J8FA 1RGIA 1NBWA 2V52B 1Y64A 3VF2A 3VOVA 4CD1A 3FZFA 2AA4A 4LC9B 2Q2RA 4H0YB 4IZ9A 3GL1A 1DKGD 1BA1A 3DAWA 5KQDA 3KVGA 1Z6RA 1DEJA 1KAXA 1NGAA 5BRHA 4K41A 4BRCA 3EZWA 4JNEA 2BTFA 2V7ZA 2P9NB 3WXJA 1BO5O 1GLBG 4FWNA 2FXUA 2QXLA 4PKHA 3M1FA 4MLEA 4B1XB 4GNIA 3B8AX 3G25A 2IIRA 5BPMA 4JAXA 4H0PA 2I7PA 2FLOA 1GLFO 1NGBA 3H45C 3MMVA 4RWTA 5AQSA 4Z94A 1S22A 3U8XA 4CBUA 2YJEA 4C23A 4EHTA 2E2OA 2P9PA 1U2VA 3CJBA 2ZWHA 1KAYA 2Q1NA 3DXMB 3IMXA 4H0TB 1ATNA 2FSNA 4BRQA 4A2AA 3QICA 2E1YA 2GEMA 3C7NB 4DHYA 4CBXA 2VYPA 3AAQA 1NGGA 3O80A 3WUHA 5BPLA 4BROA 2D0OA 5FPMA 4BG8A 3FGUA 2Q0RA 3O08A 2QWPA 2I7NA 1MWMA 4AM6A 3S41A 3VEXA 4CZMA 3CJ1A 3MN7A 4EFHA 1U2VB 3EN9A 2DPNA 1C0FA 4PL8A 3UKRB 3D2EA 1T44A 4K25A 3BF1A 1K8KA 4B1YB 2UYTA 4NO7A 4BC2A 4BRGA 4A62A 4FWRA 3CQYA 1BOTO 4DCHA 4H0VB 1OKJA 1D4XA 3OHRA 3WXLA 5BR9A 2D0PA 4B1ZA 2IVPA 2E88A 4BR9A 5BRDA 3BUZB 2IVOA 5TKYA 5AQOA 5BN9A 1ATRA 5AZIA 4FOEA 4H03B 2P9SA 3W0LA 1SAZA 3BEXA 4H0OA 4FWKA 4BRPA 3QB0A 3H3NO 3IDHA 2QWOA 3CI5A 3LDNA 3SMPA 3DJCA 2PBDA 1GLCG 5LJVA 3RSEB 2ZGZA 3LDOA 2P9KB 3MN9A 2P9UA 3ATVA 1JCFA 1QQOA 2ZGYA 3A5LC 3AARA 3VF4A 2FF6A 2YHWA 3P4IA 3VETA 3AAPA 4FWLA 4DB3A 3VGKA 4JHDA 2QWRA 1HKCA 1MA9B 1R59O 4BVOA 3H1QA 4FPBA 1H1VA 2QW9A 4XEIA 1GLEG 5AZIB 2VCPA 4CD3A 2E20A 3MN6A 4CZIA 3GBTA 4A61A 4QS9A 2V7YA 3CHWA 3D7EO 5EOYA 5AQWA 4BRDA 3LDPA 4RTFD 3O5BA 3ZETB 1V4TA 1RFQA 5AQXA 4QS7A 3UB5A 5AQZA 4O5FA 4FOIA 3U4LA 3O1WA 2A42A 1E4GT 3H46O 4WQ4C 3VEVA 1JCEA 2QM1A 2D1KA 1BA0A 4PKGA 3QBWA 4F9OA 1QHAA 1E4FT 2E8AA 3W3DA 4H5VA 3FZHA 1HUXA 3L4IA 1LOTB 2KHOA 1T6DA 2F9TA 3ULEB 3CERA 4BR2A 1MDUB 5AZJA 3U9ZA 4IXCA 4M7YA 3GDQA 4BRKA 5KPTA 2W40A 4EAHD 5JLHA 3ZX0A 2YHYA 5B8HA 2FF3B 1BG3A 5BRFA 3VPZA 1K8KB 1HKBA 4CZEA 5ADXH 3SK3A 5F2RA 3D2FB 3VEOA 3HM8A 1TUUA 3ID8A 3VGMA 5FPEA 5FPNA 4FWSA 3WXKA 2WUSA 2D4WA 1TYQB 2CGLA 4FPAA 3C7NA 4B9QA 3HZ6A 4BRAA 2EWSA 3JS6A 4CJ7A 2P9PB 2QWLA 3H3OB 4GY2B 4CZHA 2Q97A 2A41A 3CJ7A 2P9NA 2FSJA 1NGIA 3ZX3A 2P9UB 4CZKA 5KPRA 1Z05A 3L6QA 1HKGA 4I6MB 4O8KA 4WQ4A 3JXUA 3C0BA 4BGAA 5F0XA 3LDLA 2J4RA 1YVNA 1EQYA 4BVPA 1XQSC 1NGCA 3RSEA 5AFUH 3MN5A 1QZ5A 1X3MA 1QZ6A 4QS8A 3L0QA 2CGKA 5JMVA 5AQQA 1BDGA 3ENHA 3GG4A 4L3QA 4M63C 3O6WA 1XUPO 4BC3A 5AQMA 5AQJA 3TPQA 2P9IA 2E2QA 3CJCA 3A0IX 1HJOA 2GWJA 2GELA 3FR0A 4BQLA 1MWKA 4WYBA 1V4SA 2YI1A 1IG8A 3CJAA 3VESA 3ATUA 5AFUA 4WQ5C 2P9IB 4PL7A 2CGJA 3HSCA 1NMDA 3FZKA 3UKRA 2HF4A 1YAGA 3HBTA 3VENA 1CZAN 3IUCA 3UKUA 1WOQA 2FSKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3M6GA 4FXDA 4KHWA 1REVA 3BP8A 2G8KA 4DSIA 4IKFA 1VSDA 2O8FB 5AQNA 5HRPA 5C12A 3OA9A 1NGEA 3I8BA 4BREA 3IAYA 4IJAA 1S1TA 4JKFA 4FJHA 4DSKA 1EX4A 4FJLA 2Q31A 2XRIA 1TV6A 1WSEA 2IOCA 5LJWA 1VQ7N 2ZF5O 1VAZA 5C24A 1ZXOA 4RW8A 4N5SA 4ISGA 1BGXT 2UU9K 3KK3A 5DM7L 4YDUC 4CGIA 1UAXA 3OY9A 4I6MA 3QO9A 2UXCK 5SWMA 5D3GA 1WNSA 2ASMA 1X3NA 4RG8A 5I9EB 4DR6K 4BR0A 3LP2A 1NGFA 1XWLA 2AP1A 1KAZA 2WOMA 1X9WA 1JLQA 4DS4A 3ZT2A 3SUOA 4DQQA 4FSVA 3WXMB 1L5UA 3FLCO 3OBWA 1U4BA 1XNRK 3CIPA 3EO3A 4DUZK 3H08A 4X65K 1OH5A 3OYAA 2HMPA 1FK9A 2QA4N 2FBYA 3CG7A 3DXKA 1NWKA 4L8RB 4BR7A 4JN4A 1ZBLA 3MEDA 2QWNA 3KLHA 2W41A 4B3OA 1W97L 4YDUA 4CEZA 4CZLA 1KD1O 1DLOA 4IO9L 4CF2A 3HM9A 1CZ9A 4C1NK 2Q36A 1QHTA 2A6AA 2AJQA 4IWVA 4H5RA 4E19A 1FKOA 1NGHA 2O8CB 4IO8A 3QMLA 5JS1A 3OYNA 5AQTA 4BEBA 3NH2A 4BRFA 3TR8A 4RW9A 4K43A 2GUPA 2HBLA 1KCFA 1ESVA 4JD2A 2O8DB 3A5OC 4C8MA 1S3XA 2WC9A 5EVZA 2OPRA 4E1NA 1BWFO 3K9KA 2QWQA 2VQEK 3PUFA 3BF3A 1VQ6N 3RWUA 3TU5A 4FWOA 3TTFA 4BRLA 1RT7A 3VGLA 4JKDA 3O4WA 4CHOA 4U67L 4Y0WA 3SAFA 3LP0A 4HCCA 1T3VA 4AF1A 1LCUA 2GWKA 2ZJPL 2FBTA 3J8AA 5LY3A 4XJXA 2NUBA 4DKWA 1NLVA 1YUWA 4DTOA 1S1VA 3CM6A 1UA0A 1D9DA 4QAGA 2RE2A 3HXMA 1HNZK 1XC9A 3VQQA 3WEEB 5AQRA 4HUFA 3PY8A 3AVCA 2HB5A 3VEWA 4YY3K 1VSKA 2KFNA 3ZT0A 1RBTA 3DOLA 2YNGA 3AVBA 1GLJO 2G8VA 3A5MC 5ADXA 4ISEA 3V6DA 1GOAA 5A2QO 3F9MA 4EP5A 2CH6A 2KLAA 1BCOA 3ZT3A 3ZSQA 3MCPA 4ELTA 1TK8A 4CGDA 3SMSA 4KAZA 1Y64A 2AA4A 3FZFA 4LC9B 2Q2RA 3IRXA 4IZ9A 4DTMA 3GL1A 1DKGD 4CJ5A 2O8BA 3VN5A 1NGAA 1L3UA 4CECA 1TL3A 2RPIA 2X6SA 3OYMA 1UOCA 2V7ZA 3E01A 3V1RA 4FWNA 2FXUA 3OS2A 4GNIA 1JLFA 2EHGA 4KHYA 3O4NA 4JI8K 3ALYA 3TAQA 2F7TA 3KLGA 4LSLA 2RN2A 3OW2M 3U8XA 1JLAA 4FJ7A 3SUNA 1R0AA 1U2VA 4H4OA 2XY7A 1RBSA 4LF7K 1KAYA 2Q1NA 3DXMB 3VQDA 1NOZA 1ATNA 1I3AA 4DV6K 4BRQA 4FJMA 2E1YA 2GEMA 3C7NB 3WNHA 3MX5A 1HNVA 3VQ6A 1NK8A 4B3MK 4FM2A 2D0OA 3HRGA 3VQEA 3O08A 4FJJA 3OYEA 4E7IA 1WSHA 3CJ1A 4B8AB 3TAPA 3EN9A 1TAQA 1C0FA 2Z1GA 3OVNA 5T7BA 1T44A 4K25A 3BF1A 1K8KA 2Z1IA 4E7JA 4LD0A 3OS1A 3G6EN 4GMJB 1D4XA 1WLJA 3Q7CA 5BR9A 2IVPA 1RTJA 4I7FA 1Z26A 3D45A 4CGGA 4YOXA 1JLEA 5BN9A 3OBYA 3UIQA 4K8XA 4HTUA 4C8LA 4DR4K 4H03B 1NG9A 5CYQA 5AJ3K 1BI4A 1ZBUA 4KFBA 3KK1A 2HSTA 2QWOA 3CI5A 3G10A 3LANA 3RSEB 2OTLN 1DTQA 2XHBA 1HRHA 3C6AA 2P9UA 3ATVA 3CCQN 1QSLA 4FJNA 3TAFA 4JI7K 4DV3K 3AVKA 4NXNK 3P4IA 3VETA 3AAPA 3THXB 3RRGA 5EU7A 4JHDA 3CC4N 1N8RO 4BVOA 3JYTA 3DM2A 4JRQA 4XEIA 5AZIB 2VCPA 3TTCA 4WFBL 4G9ZA 1I94K 3VQAA 4CZIA 3S9HA 1QTMA 2HBMA 2V7YA 4DU4A 4KHNA 4N76A 4KI4A 5FROA 3ZETB 3TSPA 1NJYA 5AQXA 1T7PA 3K57A 3VQ5A 1CZBA 4F9OA 2D1KA 1BA0A 4PKGA 1QHAA 3W3DA 1GOBA 2DFEA 4U7BA 3THVA 2IS3A 4H8KA 2O8FA 3ULEB 3RR7A 1MDUB 5AZJA 4CJ3A 5GIPA 4IXCA 3GDQA 1Z25A 4NLCA 4CEBA 3EE8A 3BY5A 3CCVN 1YT3A 4DR5K 2HHUA 2FF3B 3OS0A 4OPKA 3VPZA 2O8EB 2IGIA 2P1JA 1HKBA 4IEEA 3V4IA 3D2FB 4CEOA 1VQKN 4EZ9A 5J2QA 4X62K 1WBBA 1HNXK 2RKIA 2WUSA 4X66K 3QERA 1TYQB 3C7NA 4OO1J 1WAFA 4ILJA 4BRAA 3NF7A 4E7KA 3C6UA 4CJ7A 1DTTA 4F3TA 4B3TK 3CJ7A 2P9NA 2FSJA 3ZX3A 4WCEL 4OLBA 1Z05A 4KHPK 3CMEN 4I6MB 3OYLA 4OPJA 5KI6A 2BH1A 4BGAA 3HL8A 4M3TA 5F0XA 1XNQK 2HHVA 2LSNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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