3EKSA

Crystal structure of monomeric actin bound to cytochalasin d
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
DEEVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords Actin-5C
publication title Crystal structures of monomeric actin bound to cytochalasin D.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 122
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3eksA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3eksA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3eksA03
1GLDG 1NBWA 2E88A 2ZWHA 3CERA 3ZX3A 4NB4A 2HF3A 4H5WA 4CZLA 5FPMA 1J6ZA 4FSVA 1WUAA 2CGJA 3DXKA 5BPMA 2I7NA 5AQKA 4BRAA 4I6MB 4A61A 4MLHA 4EHUA 3MN9A 3M3ZA 1GLLO 4CZEA 4DHYA 3P4IA 4GNIA 3EKUA 4K42A 4GY2B 3CHWA 5JICA 1ATNA 2P9NA 4BRLA 3I33A 3R6MA 1IG8A 2J4RA 2GTDA 2Q2RA 3EO3A 3VOVA 1LCUA 4BC5A 2AA4A 3H3NO 1DGKN 3A5NC 4L3QA 3EN9A 1RDWX 3W0LA 3WUHA 3ZETB 3GDQA 5AZIB 3WT0A 1X3NA 5AQSA 3O80A 3WEEB 2HMPA 4FL9A 2QXLA 3UB5A 1GLAG 3LDNA 2P9LA 2P9UA 2VYPA 3DAWA 4CBUA 2IVNA 1NGCA 2E20A 4E1JA 3CI5A 1ATRA 4BRDA 4CZFA 5AQWA 5BREA 2A5XA 3ID8A 4XEIA 3H6EA 4CI6A 1K8KB 4BRQA 2DPNA 5AQQA 3VGKA 2YHYA 4H5RA 4XH1A 2EWSA 3MDQA 2V7YA 3SMPA 1BOTO 3H45C 1U6ZA 2CH5A 3O1WA 3H46O 4IXCA 1ZC6A 3LM9A 3WXIA 4B1XB 4CZMA 5AQXA 3VENA 2FSJA 1YXQA 3FR0A 1H1VA 2YJEA 4PL7A 3QBWA 2ASOA 4EAHD 4KBOA 4WQ4A 4FPBA 4CD1A 1NWKA 2H3GX 1BA1A 5AQMA 2E1ZA 2QWMA 4K43A 1XC3A 2KHOA 4O5FA 4AM7A 2D1KA 1QQNA 3SK3A 3DXMB 4K25A 4PKIA 4BVPA 3D2FB 1HPMA 1QQMA 1QZ5A 5F1XA 1BU6O 2AP1A 2A6AA 3QMLA 2F9TA 2FLOA 5BR9A 3FZLA 4DQ8A 3HI0A 1XQSC 3CJAA 3O08A 4H5TA 2YJFA 3VEYA 4B1UB 4BRCA 1TUYA 2D0PA 4JD2A 2ZGYA 3M6GA 1HKBA 1MA9B 2A42A 2IVOA 4IZ9A 2FSKA 1RGIA 3UKRB 4BRNA 2V7ZA 2E8AA 4Z94A 4RWTA 4H03B 2QWLA 3CETA 4WQ5C 3S41A 3SMSA 3EL2A 1JCEA 3A5OC 5EXWA 4JNEA 3TPQA 3L4IA 3A0IX 4FO0A 2FSNA 3SLCA 3J8AA 1ZXOA 1JCGA 3DJCA 3QBXA 4BRHA 3LDLA 4JHDB 1BUPA 1OKJA 3ULEB 2Q0UA 3A5LC 4C23A 2P9IB 4EIAA 3FE1A 5E26A 1GLCG 2V51B 1X9JA 3KZBA 1U2VA 1Q18A 5BN8A 1QHAA 3ATVA 2YHWA 4H0XB 1G99A 1QZ6A 3D2EA 4A2BA 2FXUA 1GLBG 3GBTA 4IO8A 1Z05A 5AQGA 3A5MC 3O4WA 3WXKA 4FWRA 5JLFA 4Y0WA 2BUPA 2P9KA 3TU5A 4BROA 5AQHA 5AQRA 3WQTA 2CGLA 5KQDA 3GL1A 5AQLA 4EFHA 5AR0A 4B1YB 3WXLA 1GLEG 1NLVA 4K41A 4MO4A 3C7NB 3ZEUA 3VGLA 3LDQA 5FPEA 4FWQA 2P9NB 1BDGA 4FWMA 3QFPA 4CBWA 1NGHA 2CGKA 4BC2A 2W40A 5AZIA 2E2QA 5EVZA 2QWNA 2ITMA 5I9EB 1LOTB 1BWFO 3MCPA 3LDOA 3HZ6A 3WEEA 1C0FA 5KPZA 3D7EO 3QDKA 4B1ZA 3U9DA 2WUSA 2P9SA 3SJHA 3VF6A 3H3OB 2CH6A 1KAZA 1E4GT 3O6WA 2P9LB 2P9UB 5E84A 2A3ZA 5TKYA 1JCFA 3ZX0A 4CZKA 1HLUA 4QS8A 5BRFA 1WOQA 2P9PB 1HUXA 3U4LA 5B8HA 1HKCA 3AAPA 4B1VA 4BRIA 5ADXA 5KQ8A 3FZKA 4ISGA 3FZMA 4H0TB 5F2RA 5AQUA 4MLEA 4BREA 4CJ7A 5KPRA 3CQXA 3MN6A 2F9WA 2QWQA 4LC9B 1SAZA 5AZJA 5LJWA 1YUWA 5AQYA 3O1BA 2IVPA 3CJ9A 3BF1A 3A8YA 3UKUA 3CIPA 4A62A 1MWKA 3RSEB 3QICA 4BGAA 3H1QA 2E2OA 4IWVA 4YDUA 2A40A 4FWSA 2PBDA 3AARA 4ISEA 1S22A 4FWNA 2E2PA 5JMVA 3GG4A 1BA0A 1NGFA 4BQZA 3BF3A 4BG9A 3D2FA 5AFUH 5EY4A 3QB0A 5AQOA 4F9OA 3LL3A 2GEMA 1Y64A 1BO5O 4H0VB 3VEWA 1TYQA 4AM6A 4HTLA 3LDPA 5LY3A 3HTVA 4B9QA 5AQTA 1DKGD 3AY9A 3MK6A 3I8BA 3C0BA 2D0OA 3GOIA 3GE1A 5ADXH 1HJOA 3BEXA 1NGDA 1NM1A 2Q1NA 5EX5A 5LJVA 4FWLA 3U8XA 4IJNA 5EOYA 1HKGA 1P8ZA 4RCHA 1KAYA 3IUCA 1MWMA 4NO7A 3R9PA 4DCHA 1CZAN 4J8FA 2D4WA 2NLXA 1NGGA 1NMDA 2A41A 3O8MA 4FWOA 1EQYA 4H0YB 5AQFA 3BP8A 1XUPO 4JHDA 3VEOA 2FF6A 2BTFA 4JAXA 4JN4A 2HF4A 4M7YA 1NGEA 3LM2A 3VF4A 3BUZB 3G25A 1GLFO 3VERA 2GUPA 1IJJA 2ASMA 3ENHA 3QFUA 4H5VA 4BVOA 3MN7A 4PKHA 3W3DA 3EKSA 1YAGA 1U2VB 4I6MA 4FWKA 3VF2A 3IFRA 4H0PA 2I7PA 2QM1A 4HWIA 4XH4A 2E2NA 3DXKB 4PKGA 1TUUA 3D2EB 1HX1A 4EHTA 5BPLA 3R8EA 2QWPA 3VEXA 3JXUA 3FZHA 5CE3A 3HBTA 5AQIA 2IIRA 4CZGA 1X3MA 5JLHA 2P9KB 3VESA 1Z6RA 4WYBA 2QWOA 1C0GA 2ZGZA 4M7XA 2UYTA 4CZJA 5ELZA 2GWKA 4QS7A 2E1YA 5AQVA 2NZTA 3C7NA 3KHYA 3KVGA 5AFUA 3ZETA 4FWPA 4BR7A 2QWRA 4QS9A 3CQYA 3MN5A 3HSCA 3ZEUB 1NGIA 4O8KA 2PAVA 4CZIA 3MMVA 4WQ4C 2NRHA 5AQPA 4BC3A 1K8KA 3F9MA 1YVNA 1DEJA 2P9SB 2P9PA 1ZBSA 5AQJA 4BRPA 3VPZA 4CBXA 4YDUC 4BR9A 5F0XA 3H1VX 4H5NA 4MO5A 4A2AA 5BPNA 1KAXA 4B1WB 3IMXA 4DB3A 1MDUB 4BQLA 3L6QA 5KPTA 1SZ2A 4BRGA 3DXMA 2QW9A 3RSEA 3DWLA 1NGBA 2Q97A 2VWBA 5AQNA 3FGUA 3EZWA 1R59O 3FLCO 4XH5A 5AZJB 4FPAA 3VEZA 2YHXA 3UKUB 1V4TA 1GLJO 2ASPA 1NGJA 3UE5A 2FF3B 4ISFA 4CD3A 2Q0RA 2GELA 1T6CA 3ZX2A 4BGBA 3O5BA 4H0OA 5BN9A 4BRFA 3VETA 4BR4A 3FZFA 3VGMA 2Q36A 3UKRA 3JS6A 3OHRA 3ATUA 4JD2B 1ATSA 2HOEA 3WXJA 1BG3A 5AQZA 4BR5A 3HM8A 4IJAA 4CZHA 1TYQB 3WQUA 2ZF5O 4FOEA 3VEVA 2YI1A 3IDHA 4FOIA 3AAQA 1KXPA 1S3XA 2YCHA 5BRHA 1D4XA 4BC4A 4M63C 1V4SA 3B8AX 4BRKA 1RFQA 1SQKA 3FFKB 1T6DA 2W41A 5FPDA 1T44A 2OANA 3ENOA 4BR0A 3CJ7A 5FPNA 1ESVA 3ULEA 2P9IA 2GWJA 2V52B 3L0QA 1E4FT 4RTFD 3U9ZA 4WQ5A 3M1FA 4BR2A 3CJBA 2Q31A 3CJ1A 4BRMA 4BG8A 3CJCA 5BRDA 4PL8A 1NGAA 1QQOA 2VCPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GLDG 1TVRA 1TL3A 4BWMA 3QNOA 4RW9A 3CERA 4YFUA 3HSTB 2HF3A 3LAKA 5D3GA 4FSVA 3DXKA 2WTUA 1Q82O 4E3SA 5FRNA 3M3ZA 4CFBA 3M8SA 3P4IA 4FJMA 4YOVA 1BCOA 2FBVA 1UA0A 1Q9XA 2P9NA 3I33A 4LFCK 2J4RA 1NK9A 4BC5A 3V1RA 1NKCA 4JLHA 4E1NA 2RE2A 3AVAA 3VQ6A 3EN9A 1RDWX 4KPYA 3WUHA 3ZETB 3WT0A 1X3NA 5HRSA 5AQSA 4FL9A 3UB5A 3IS9A 3LDNA 3U3GA 2P9LA 4CEOA 4CBUA 3K5LA 2IVNA 1NK5A 2XY6A 4CZFA 5AQWA 3OYAA 3VA3A 2A5XA 1C1AA 1S1TA 1WSHA 3VGKA 2IC3A 4XH1A 2EWSA 2V7YA 1BOTO 1RDDA 3O1WA 2Z1HA 1ZC6A 5LMNK 1N36K 1NJYA 4ELUA 1H1VA 5GIPA 2YJEA 1Q7YO 2HMIA 4AHTA 1L3VA 4LF7K 1WAFA 3O9TA 2G8KA 1LWEA 3QEXA 2QWMA 2KHOA 1RTHA 2D1KA 3MCAB 4E1MA 3DLHA 3V9UA 4ID5A 2F9TA 2FLOA 4YY3K 4B1UB 4BRCA 1TUYA 4JD2A 2ZGYA 3NMUA 1VAZA 2A42A 3K0SA 3CM6A 4M3ZA 3UKRB 3AVHA 4WQ5C 2HBLA 4BDYA 1JCEA 3A5OC 3HJFA 4DU3A 5KGXA 2HNZA 3A0IX 3TSPA 1XMQK 1UAXA 3DMJA 5KRTA 2D0AA 4IKFA 1I3AA 3RR8A 4GVMA 3QBXA 3ZSRA 4JHDB 4CF8A 3A5LC 1OVQA 2P9IB 2UUBK 1GLCG 2V51B 4KH5A 3V4IA 5BN8A 3AVJA 3NGZA 3ATVA 3D2EA 3ZSOA 2HHVA 1RBSA 4IO8A 3KIOA 1Z05A 1VSIA 2W6KA 1QVFM 4JK9A 3PLAA 4KHNA 4Y0WA 2DFFA 3NVKA 1VSHA 5CY4A 3K5NA 4IBNA 1VSDA 3P83D 4JEPA 1W2BM 1I39A 1VQ7N 1W9HA 2IOCA 2O8EB 5KQDA 4DS4A 4EFHA 2RF2A 3C6AA 5AR0A 3CCVN 4C8MA 3RVCA 2RKIA 4CK1A 4BE0A 2I5JA 3LDQA 2X6SA 3DYAA 3N4QA 4DR5K 3QFPA 1VQ8N 1FXXA 3OYKA 3C95A 1EXQA 4J2AA 4OGEA 5AZIA 4DLEA 4B3MK 4OVLA 1U04A 3WEEA 4G9ZA 1QS4A 3D7EO 3ULDA 3SJHA 3VF6A 4CESA 2NRTA 4IG0A 1K6YA 3HK2A 4FJNA 3V9XA 4N76A 3O6WA 5CR4A 1JLGA 1HNIA 5BRFA 4CZKA 4QS8A 3U4LA 5B8HA 4N5SA 3TTFA 2VG5A 2W00A 5F2RA 5AQUA 2IAJA 4MLEA 4YHHK 4FJXA 5KPRA 2B5JA 3CQXA 2F9WA 4LC9B 3SNNA 1YUWA 4RW8A 1W7AA 3A8YA 1TAQA 1RT7A 3DLEA 4BGAA 3QICA 5GAGP 4GV9A 4FXDA 4YDUA 3AVBA 5C2DA 4FWSA 3AARA 1S22A 3RMAA 3LZJA 4MFBA 3BF3A 3MX2A 3ZSQA 1RDCA 2GV9A 5AFUH 1S72N 3HVTA 2HHHK 5EY4A 4HTUA 4DTNA 3LL3A 1LWFA 1BO5O 1C0TA 3MEGA 1Q86O 3CG7A 3LDPA 3SCXA 1K9MO 4CJRA 3NBPA 2FC0A 5GADP 2NNWA 2JGUA 3F5TA 4DSJA 1RNHA 3AO5A 3C0BA 3LPTA 4ICLA 4I2QA 3I0SA 2HVIA 3BEXA 3R1XA 1U49A 3MEDA 4FWLA 3JSMA 1A5XA 4M3RA 5M1FA 4CJLA 4JK7A 4FJKA 2OPPA 1HKGA 1P8ZA 4ELTA 2NLXA 4DTJA 2VG6A 1NMDA 5DMRA 2A41A 4OPKA 4HUEA 3OYCA 4FWOA 3VEOA 1EETA 3ZT2A 3L2UA 2FF6A 3TSQA 4JN4A 1U4BA 3TAGA 2NRRA 2HW3A 4GW6A 1IJJA 3ENHA 1YJNN 1XC9A 3VTHA 4H5VA 4FJIA 2BE2A 4NXMK 4PKHA 2KZMA 4FM1A 4C8NA 3TTCA 3IFRA 4JS5A 2JWKA 2OA8A 3QNNA 1LV5A 4MQ3A 1RBVA 4JKBA 4CF1A 1RT4A 3KD5E 2IIRA 4CZGA 3DI6A 5JLHA 2P9KB 3KK7A 3VESA 3KKSA 1S1UA 4WYBA 2ZQBA 1C0GA 4CIEA 3ZSZA 3WNHA 1NMNA 3HXMA 1Q9YA 2GWKA 1RCHA 1VSKA 5KRSA 2QWRA 2YNHA 3K2PA 3CQYA 1HYSA 1NJZA 3CCLN 3HSCA 4BWJA 3EE9A 2XHBA 3T1HK 1RILA 4CJEA 3MMVA 3SV4A 2NRHA 5AQPA 4DMNA 2X6NA 2E6MA 1KTQA 2VGMA 2XY5A 4DQRA 4W5RA 3O4NA 4FVMA 4O0IA 4V19S 4BR9A 3THYA 5DK5A 2O8BA 4OKEA 4JK8A 4B1WB 1J5EK 2FBXA 4DB3A 1KVBA 3L6QA 1IBLK 2JLEA 1SZ2A 4BRGA 4HCBA 1ASUA 1NGBA 1R59O 3FLCO 4M41A 3BZCA 3CFPA 3UKUB 3NHGA 1EX4A 1WNSA 1CXQA 1GLJO 2D0CA 4NYNA 3UE5A 2R7YA 2FF3B 3L4QA 4ISFA 2LSNA 2HHSA 3DLKA 1IKWA 1YTAA 1FKPA 2Z1JA 1L3UA 4H0OA 4BRFA 3VETA 4BR4A 4B8CA 3CC7N 3ATUA 2G8IA 1ATSA 2HOEA 1BG3A 2YV0X 2VG7A 2RHKA 4JKEA 4CZHA 1FW6A 4JKAA 4H8KA 3WQUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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