3EKSA

Crystal structure of monomeric actin bound to cytochalasin d
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
DEEVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Actin-5C
publication title Crystal structures of monomeric actin bound to cytochalasin D.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein
total genus 122
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3eksA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3eksA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3eksA03
3I8BA 2Q36A 4WQ5C 3EKSA 5ADXH 3G25A 5AQMA 5BREA 5JMVA 5EXWA 5JICA 4CZHA 1RFQA 4J8FA 3JXUA 4BG9A 3FZHA 3EN9A 4M7XA 1NLVA 5AQZA 1JCEA 4C23A 2Q0UA 4QS9A 2CGKA 3A8YA 4O5FA 4XH5A 2E8AA 2FF3B 3UKRA 3ZX3A 4BRPA 4A2AA 2FXUA 4B1XB 2EWSA 3SJHA 1KAXA 3C7NA 3FR0A 3CERA 1V4TA 4MLEA 4ISGA 1KXPA 4CBXA 4M63C 4WQ4A 3WXLA 2VYPA 3HTVA 4RWTA 3UB5A 5AFUH 4K41A 3IFRA 3QMLA 1XUPO 3B8AX 4A61A 4Z94A 4AM7A 5F2RA 4ISEA 5BRFA 3P4IA 3VEXA 3LDNA 2E20A 4K43A 4H5VA 1GLBG 3FZKA 2QXLA 3H1VX 3VPZA 3WXIA 2E2PA 1MDUB 4B1ZA 4FOIA 2QWNA 1GLAG 1G99A 3M3ZA 3LL3A 5AQJA 5AQQA 3UKUA 3FE1A 2FF6A 2NLXA 2I7NA 2ITMA 4BR2A 3D7EO 4BRGA 4BRKA 4BRDA 5AQNA 1NGBA 4CZGA 1GLFO 1NGJA 1S22A 3SMSA 5ADXA 3O6WA 3RSEA 3R8EA 4FWLA 4GNIA 3MMVA 4XH1A 3ULEA 2W40A 4FWRA 2P9IB 3R6MA 3ZEUA 2KHOA 4B1UB 5KPTA 2D0OA 3GG4A 3BF1A 5FPDA 4JD2B 3D2FB 3O1WA 3U8XA 1QQMA 4YDUC 2D4WA 3H45C 2E1ZA 3U9ZA 1NWKA 3VEYA 4HTLA 4L3QA 5B8HA 5KQDA 3CHWA 4FWQA 5AQXA 5AQWA 3I33A 4DCHA 1QHAA 3GL1A 3O5BA 5AFUA 1Q18A 4B9QA 2P9SA 3MDQA 4I6MA 5EOYA 4IJAA 4PL8A 3FFKB 4IZ9A 5AQGA 3MN9A 4BRHA 4CZIA 3M6GA 3U9DA 5KQ8A 3M1FA 3F9MA 3BP8A 5AQFA 3LDQA 1V4SA 4JN4A 3WEEB 5F0XA 2P9PB 3U4LA 1ESVA 5AZIA 1U2VA 2QWLA 1TYQB 1IG8A 4JHDA 5EX5A 2UYTA 1T6DA 2A3ZA 1YUWA 3D2EB 3OHRA 3DXKA 4MLHA 4IXCA 3MN5A 3VGKA 2AA4A 3TU5A 5AQSA 4CBWA 4E1JA 1Z6RA 1QZ5A 4BR4A 1ATRA 1WUAA 5BPLA 3AY9A 5JLFA 3ID8A 3KZBA 4WYBA 3IDHA 2A5XA 4FPBA 4BVPA 1LOTB 2IVPA 3CQXA 4IWVA 1XC3A 1T6CA 3QBXA 4Y0WA 4EIAA 4YDUA 2YHWA 3UKRB 4BRAA 2GELA 3MK6A 3L6QA 1BA0A 3DXMA 1GLEG 4BR7A 3AAQA 4PKGA 4CD3A 3C7NB 2A42A 1CZAN 3VETA 1NGGA 3ZX2A 5AQYA 1HX1A 1J6ZA 1NGEA 5BR9A 1NGCA 4LC9B 5FPMA 3JS6A 4FL9A 4BRMA 4EHUA 3IUCA 3EO3A 4CZFA 3ZETA 1R59O 4AM6A 4BRFA 1GLDG 3SLCA 1NM1A 2BUPA 2BTFA 3ZX0A 4DB3A 2ZGZA 5AQKA 4PKIA 5F1XA 2E88A 5BN8A 4BGBA 4H5NA 3LDLA 1JCFA 4BRIA 4BC2A 2ZF5O 3FZFA 2DPNA 3GOIA 1NGHA 4K25A 5TKYA 4BGAA 3EL2A 3A5OC 5AR0A 2GWJA 4BRNA 1D4XA 2W41A 2GTDA 4PKHA 3O08A 1HUXA 1HLUA 1NGAA 3RSEB 2Q0RA 4BC3A 1K8KA 1GLLO 5JLHA 1HKBA 1JCGA 1C0GA 4WQ5A 4XEIA 3ZEUB 4NO7A 5BPNA 4FPAA 5BRHA 2CGJA 3A5NC 3W3DA 3HM8A 5AQRA 3AAPA 2ZWHA 2V7YA 2NRHA 4H0XB 3CJ7A 1MA9B 5AZJA 1TUYA 4FWPA 2CGLA 1BWFO 2QW9A 3AARA 2Q97A 4BRCA 5AQIA 5AQHA 1WOQA 2P9NA 3LDPA 3LM2A 3EZWA 4BREA 2V52B 2VWBA 4B1YB 1NGFA 1HPMA 3VF2A 4DQ8A 4PL7A 2IVOA 2P9SB 3CJBA 4O8KA 2P9UB 3W0LA 4BR5A 2YCHA 4FWSA 3CJCA 2P9KB 5AQUA 4H0YB 1TUUA 4BR9A 4CZJA 5ELZA 1OKJA 2HF4A 3H6EA 3WXJA 4KBOA 3O8MA 5BPMA 5AZIB 2QM1A 1U2VB 3VF6A 5AQOA 3VF4A 3WXKA 4BRLA 2I7PA 3CJ9A 4JHDB 4CZMA 3A5LC 3R9PA 4BRQA 3QFPA 5E84A 3QDKA 3ENHA 4WQ4C 4H5WA 1QQNA 1H1VA 1MWMA 3VEOA 4XH4A 1EQYA 2CH6A 2ASMA 1YXQA 3O1BA 2J4RA 1XQSC 5FPNA 4BVOA 3GDQA 3CQYA 4H5TA 4A2BA 1RGIA 3LDOA 2A40A 4CI6A 4QS7A 2ZGYA 4EHTA 3VOVA 4CJ7A 2P9LA 2H3GX 4H0PA 2QWMA 3WUHA 1NMDA 2ASPA 1YVNA 3H3OB 1BU6O 4ISFA 3J8AA 3H3NO 3WQUA 3FZMA 1Z05A 3CETA 2FSJA 5AQPA 4H0VB 5LY3A 2D1KA 3CJAA 3L0QA 3WT0A 5BRDA 1RDWX 4RCHA 1NGIA 3ENOA 3HSCA 1LCUA 4DHYA 1NBWA 4B1VA 4FSVA 4GY2B 3O80A 2FSNA 3ZETB 1MWKA 3KHYA 4K42A 2YJEA 3VENA 1ZBSA 3GBTA 1KAYA 3HZ6A 4FO0A 5CE3A 5KPZA 3KVGA 3VEZA 2ASOA 1YAGA 4NB4A 2GUPA 2YI1A 1E4FT 3BEXA 4F9OA 2QWOA 3FGUA 4H0OA 4IJNA 3UKUB 5AQVA 3SMPA 3TPQA 2F9WA 2PBDA 3UE5A 3EKUA 3ATVA 4FOEA 1DGKN 2VCPA 4CZKA 1SZ2A 2E2OA 3VERA 2D0PA 4JNEA 1K8KB 4JAXA 5E26A 1ZC6A 1GLJO 4BQLA 3VEVA 3H1QA 4CBUA 2FLOA 1BA1A 2Q31A 2E2NA 3ATUA 3QFUA 4M7YA 2OANA 1ATNA 3ULEB 1DKGD 4BROA 2E2QA 2Q2RA 3LM9A 3DWLA 3DAWA 4CZEA 1C0FA 1X3MA 1QZ6A 1SAZA 4H5RA 3HI0A 2E1YA 4BQZA 3H46O 4FWKA 4RTFD 5AZJB 3FLCO 1BDGA 5EY4A 4MO5A 2HF3A 3L4IA 3VEWA 4BC5A 2IIRA 1NGDA 3MN6A 2P9NB 3SK3A 2PAVA 2QWPA 1X3NA 3FZLA 2V51B 1T44A 1BOTO 2A6AA 4IO8A 3QBWA 3O4WA 4H0TB 5KPRA 2NZTA 1KAZA 4B1WB 2GWKA 4FWNA 1BG3A 3VESA 1DEJA 5EVZA 4I6MB 2P9IA 3CJ1A 2QWRA 1U6ZA 4FWOA 2YJFA 1HKCA 2YHYA 5BN9A 2F9TA 4JD2A 3D2FA 3QICA 3A5MC 4BC4A 1ATSA 1BO5O 1SQKA 3DJCA 3BUZB 4EAHD 2WUSA 5AQTA 3C0BA 5I9EB 1HJOA 1GLCG 2YHXA 4CD1A 4QS8A 3WQTA 2P9UA 3CI5A 3DXKB 3VGMA 4CZLA 2HMPA 3A0IX 1IJJA 1P8ZA 1Y64A 1ZXOA 2P9KA 4MO4A 5FPEA 3IMXA 2QWQA 2AP1A 2Q1NA 3QB0A 2P9LB 2A41A 1QQOA 2IVNA 4EFHA 2GEMA 3MCPA 4HWIA 4A62A 4BG8A 4FWMA 2V7ZA 1BUPA 2HOEA 3WEEA 2P9PA 3BF3A 4H03B 2CH5A 3GE1A 3CIPA 1X9JA 1S3XA 3VGLA 2FSKA 3DXMB 1TYQA 1E4GT 5LJWA 3HBTA 3D2EA 3S41A 3MN7A 5AQLA 4BR0A 5LJVA 1HKGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NCBA 3G25A 5HL7L 5AQMA 5JMVA 5EXWA 2NRVA 1RT4A 1RFQA 1U45A 2ATQA 3JXUA 3K9JA 4BG9A 5M1NA 4JLHA 1SKRA 4C23A 1SV5A 2CGKA 3TI0A 3A8YA 3CMAN 3KJVA 3HO1A 2FF3B 4A2AA 3C6HA 2EWSA 2IS3A 4B08A 3SQ0A 1KAXA 2NNWA 1RT6A 3SBGA 1QSSA 4JKDA 4CK2A 3C94A 3C65A 3QINA 3ZYYX 4LFCK 4Z94A 1O1WA 4DF8A 4AM7A 1QVGM 4ISEA 4CEQA 3F5TA 4FW2A 1ZBIA 5HROA 3LWMA 3FZKA 2QXLA 3H1VX 3VPZA 2UU9K 4JK8A 3NF8A 3L2UA 3NAEA 4J2AA 3C95A 3M3ZA 3LL3A 3O9UA 3UKUA 3ZSOA 1RDUA 3DLRA 4FYDA 2I7NA 3CCSN 1VSIA 4BRGA 1HNZK 4BRDA 4FCYA 4DTOA 1GLFO 1NGJA 4CJVA 3KIOA 3O6WA 1NOYA 1XHZA 3R8EA 4FWLA 4GNIA 3J7AP 3CF5L 4BEBA 3QIPA 3VQ7A 2Q3SA 5JS1A 3VN5A 4B9NA 4CJ5A 1BL3A 5FPDA 1ASUA 2P1JA 4C8NA 3H45C 1Q9YA 1NWKA 3N4QA 4HTLA 4CW7B 3MEEA 4O5BA 5KQDA 3K5MA 4RW9A 3T7ZA 4CK1A 1QHAA 1Q18A 1NU0A 2F8TA 3MDQA 5EOYA 4KH4A 5GADP 3NH0A 4E7HA 1KVBA 4CJPA 1IG9A 2OA8A 5GINA 3FFKB 4BECA 5M1FA 4MDBA 4IZ9A 3HYFA 3EE9A 3ZCMA 4FJGA 3OTOK 3AO3A 3BP8A 2Y1JA 3LDQA 1V4SA 1XC9A 4GKKK 1K6YA 4DR2K 1ESVA 5AZIA 4AQYK 1U2VA 1Q81O 5SWMA 2A3ZA 5FROA 1M1KO 3L3VA 3DXKA 4KHUA 4IXCA 4OJRA 4IEEA 1S1WA 4YORA 5AQSA 4BY9C 3AVFA 1WSEA 2Z1JA 1WSIA 3VMFB 1ATRA 1WUAA 4BWMA 5JLFA 3ID8A 1J53A 4FJXA 4FPBA 4CFAA 2O8EA 1J54A 1LOTB 3EYZA 2E4LA 3SUQA 4IWVA 4CEOA 2JWLA 1T6CA 3QBXA 3TSPA 3LAMA 1ITGA 1HQUA 4YDUA 3OS0A 4KB0A 4BRAA 2GELA 1Q7YO 3ZT0A 4PQUA 1RTJA 5C42A 3ALYA 4BR7A 3AAQA 2B6AA 4XIUA 4CD3A 2ZJQL 4M3UA 5AQYA 3SZ2A 3SQ4A 1VQ6N 5LL6Z 1NGEA 3JS6A 4BRMA 3PO4A 3CCQN 4GMJB 4CHZA 1S5JA 5C15A 1N5YA 3G10A 4EZ9A 3E9LA 2BTFA 1HNXK 3MXMA 4TSXA 3ZSWA 4PKIA 1IBKK 1NJWA 3NFAA 4JI5K 1S9GA 1QVFM 3AVIA 4BGBA 3LDLA 4OPAA 3LP1A 4BRIA 2ZF5O 4ILHA 4CJLA 2PYLA 4DV1K 1TL1A 2DPNA 3DOLA 1VQ8N 1NGHA 3F2KA 4HHTA 1VQ9N 2VQFK 3DLBA 4HCCA 4BGAA 3EL2A 2YX6A 4BRNA 5AR0A 4JRQA 1JLGA 2W41A 3KTQA 3OBWA 4OPHA 2HHWA 3KK3A 1C0GA 3C6UA 4JKAA 5KRSA 3L3UA 1EO1A 2F4VK 3AVCA 5BRHA 2DFHA 2ZE2A 3W3DA 3MX5A 2KFNA 1MA9B 2WFBA 4QCLA 4FJMA 2RE2A 1XHXA 2XY8A 2I5JA 3EZWA 4BREA 4DS4A 3NDKA 4JK9A 2VWBA 4DQ8A 1UAXA 4AHUA 2BANA 1YI2N 1K9MO 1L3TA 3CJCA 1ILYA 1VQPN 4H0YB 4Z4FA 3SQ1A 4Q5VA 5JVHL 1YJ9N 4RW7A 3WXJA 3O8MA 2DFFA 5HP1A 2E6LA 5AZIB 3NF7A 1U2VB 3RRHA 3VF4A 4KI4A 3CJ9A 3A5LC 3OYAA 2HB5A 3TAEA 4FLZA 5E84A 4Z4EA 4H5WA 2KTQA 1LW0A 2UXBK 1IKWA 3CC2N 3KKSA 2D0AA 3T3FA 3AA2A 1YIJN 4CGHA 5C12A 4FW1A 4B9MA 3GDQA 2O8EB 1RGIA 4B9TA 4QS7A 1HQEA 2H3GX 3S3MA 4IBNA 3AVNA 3WUHA 1TV6A 1NKBA 1X9WA 3CCRN 4DU1A 5HBMA 4DV3K 3CMEN 2W6LA 1Z05A 3VQ5A 2FSJA 2F7TA 2KW4A 3CJAA 3L0QA 4JKBA 3AO2A 1RDWX 3B6PA 1T03A 1VSMA 4DTPA 2HBKA 5CYMA 4DHYA 1RT5A 1HNWK 1IKYA 2HBLA 3M8QA 4FO0A 4FJ7A 2O8FA 4DV4K 2ASOA 3CFPA 2NRWA 2YI1A 3S5TA 2FBTA 4EZ6A 3KLEA 4A5AA 5AQVA 3VA3A 2PBDA 3EKUA 2KLAA 4GKJK 1TK5A 3HPOA 1M90O 4ICLA 4E0DA 1VQLN 3SNNA 1T7PA 3Q7CA 4O55A 4CF8A 1REVA 3H1QA 4JI4K 4CBUA 4DSKA 5IT9O 1ATNA 2G8HA 4DS5A 1YHQN 3VQAA 2PYJA 3HRGA 3DWLA 2IC3A 4BACA 3CCJN 1QZ6A 1SAZA 3DLKA 3H46O 3T69A 3JSMA 4BDZA 1N6QA 1BDGA 4V19S 5EY4A 4MO5A 3MEGA 4IFYA 3NCIA 4X62K 1KSPA 3VEWA 4M45A 4BC5A 3SK3A 2PAVA 3AA4A 4CFBA 3DYAA 4Z4GA 1X3NA 3G71N 2V51B 3PLAA 2ZJRL 1VRTA 4FLTA 3THWA 1NJIO 2NZTA 2VQEK 4B1WB 3AVMA 4E7JA 1VSEA 4K8ZA 4E1MA 2A1SA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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