3EKSA

Crystal structure of monomeric actin bound to cytochalasin d
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
DEEVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of monomeric actin bound to cytochalasin D.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-5C
molecule tags Contractile protein
source organism Drosophila melanogaster
total genus 122
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3eksA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3eksA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3eksA03
1GLEG 4BC3A 3AARA 3CJBA 3W0LA 3R6MA 5AQTA 3VESA 3D2EA 3S41A 3CERA 5BRHA 2PBDA 4PL7A 4CBXA 3G25A 1NGJA 5EVZA 2FF3B 1R59O 1YUWA 4H0PA 5AQUA 2I7NA 5JLHA 4B1UB 2EWSA 4BC4A 4DCHA 2V51B 1E4GT 1U2VB 3U9DA 3C7NB 4CZLA 4EHTA 3ZEUA 2E88A 1JCGA 2GTDA 3VGKA 2CGLA 2YHWA 4QS8A 4XH4A 4BR4A 1SQKA 3O1WA 4FWPA 1Q18A 4IWVA 2CH5A 2P9IA 3LDOA 1GLCG 2D0OA 1NLVA 1TUYA 2F9TA 2UYTA 1HKCA 3HBTA 5BRFA 2WUSA 5KPZA 4YDUA 3WXKA 3VGLA 1JCEA 3HZ6A 1NGGA 3WQTA 4H0OA 2A40A 2NZTA 2E20A 2D0PA 2DPNA 5AQFA 4BRNA 2P9LA 5BREA 5AQOA 3LDNA 3UKUA 2YCHA 3VF6A 1NMDA 1NGHA 1YAGA 2P9SB 4CBWA 3GE1A 3QDKA 4CD3A 4XEIA 3LM2A 1J6ZA 3O08A 4IJAA 3WXIA 3D7EO 1MWMA 5TKYA 4K41A 3L0QA 5B8HA 3IFRA 3DXMA 4NB4A 4BVPA 1NGAA 4DHYA 4BRLA 3CI5A 3JXUA 1ZXOA 2IVNA 1P8ZA 4FOEA 1XC3A 1U2VA 3SK3A 3C7NA 1V4SA 5AQLA 4CZFA 2HOEA 4BVOA 4CD1A 3FZMA 1C0GA 1C0FA 2AA4A 2AP1A 2E1ZA 2ZGZA 4ISEA 2IVOA 5FPEA 4DB3A 3MN7A 1IJJA 1GLLO 4BRCA 2FLOA 3EKUA 3VEYA 4BG9A 1TUUA 3L4IA 4FSVA 1MWKA 4WQ4A 3DAWA 3QBWA 4CBUA 4BREA 3C0BA 3CJ7A 5EY4A 3VEOA 1HLUA 3EZWA 5AQJA 3P4IA 5BN9A 3DXKA 2QWNA 3FGUA 3VEXA 3M6GA 4H0TB 4BRIA 1BDGA 4K25A 4IJNA 3MN9A 3EN9A 5AQGA 3CETA 5I9EB 4CZEA 2P9SA 3EO3A 4CZJA 4H03B 4LC9B 1NM1A 5EXWA 4RTFD 2QWRA 1NGBA 1SAZA 4JHDB 3H1VX 2Q1NA 5BPNA 3EKSA 3LDQA 1XQSC 4I6MB 2P9NB 5AQQA 4BRKA 1SZ2A 5E26A 2P9UA 3WT0A 4FWRA 2W40A 1BA0A 1GLDG 1HKGA 5AQHA 2F9WA 4H0XB 5AFUA 3D2FB 4H5VA 4C23A 2E1YA 4BRGA 4BC2A 2ZGYA 3CQXA 3OHRA 3M1FA 2QWMA 4A61A 4KBOA 2IVPA 3BP8A 4BRMA 2GELA 4JD2A 1ATNA 2GUPA 2P9PA 2VWBA 3QICA 1BWFO 4IZ9A 1HX1A 2ZF5O 2ZWHA 4L3QA 3ULEB 5FPDA 5AQZA 2D4WA 5FPNA 4CZMA 1DEJA 2A41A 5AQRA 4BC5A 4BGAA 4EIAA 3AAPA 3QFUA 2QM1A 3HTVA 3O1BA 1ATSA 3MK6A 1X9JA 4Y0WA 2FSJA 3I33A 4FWQA 5AQNA 4BRQA 5AZIB 4QS9A 1GLFO 2CH6A 4FO0A 1OKJA 3R9PA 2I7PA 3AAQA 3EL2A 4H5TA 3IMXA 4H5WA 3IDHA 4GNIA 5E84A 4BGBA 4BQZA 4B9QA 4I6MA 2P9NA 4M7YA 3H46O 3O4WA 3BF3A 3O5BA 4CZHA 4NO7A 3FR0A 4FPAA 4FWKA 3MMVA 3QMLA 1TYQB 3VPZA 3VEVA 3D2FA 4MLEA 4BRHA 3DWLA 3WUHA 1BA1A 1BG3A 4H5RA 3QB0A 1G99A 2ASPA 2V52B 2H3GX 3A0IX 1GLAG 5AQYA 3SMSA 3TU5A 4EHUA 3CJCA 3RSEB 5FPMA 5LJWA 4WYBA 3A5OC 3H1QA 3H3OB 4WQ5A 3ID8A 4FWNA 1ZC6A 3WXLA 4MLHA 3ULEA 1Y64A 3VF4A 2HF4A 4A2AA 1NGIA 3CHWA 4BR5A 3J8AA 5BN8A 5AQXA 1RFQA 3VOVA 3I8BA 3KZBA 3CQYA 4YDUC 3BUZB 4CJ7A 3GOIA 3ATVA 5KPRA 1HJOA 5JLFA 5ADXH 1RDWX 5AZIA 3VF2A 3F9MA 3H45C 1KAZA 2E8AA 4B1VA 1X3MA 3CJAA 5AQKA 3ZX2A 1ZBSA 4H5NA 4RCHA 3M3ZA 5CE3A 2QWQA 5JMVA 2E2OA 4M63C 4XH5A 2E2NA 3H6EA 1LCUA 4GY2B 1K8KB 5EOYA 5BR9A 4FWMA 2OANA 2QWPA 2P9IB 4CZGA 1MDUB 2FSNA 2NLXA 2Q31A 2Q2RA 3GBTA 3ZX3A 2Q0UA 3FZLA 4B1ZA 5KQ8A 1D4XA 2CGKA 5F0XA 3RSEA 3ZX0A 4PKGA 1HKBA 5AQPA 5F2RA 1KAYA 2J4RA 4EAHD 1NGCA 4QS7A 2YJEA 4MO5A 1GLBG 1IG8A 5AQWA 5AZJB 1Z6RA 3A5LC 1X3NA 4FWLA 1BUPA 4FL9A 3WEEB 5F1XA 4FWSA 1LOTB 3ATUA 3MCPA 3UE5A 4J8FA 4E1JA 3MN6A 2YJFA 4BROA 4JAXA 2BUPA 4B1XB 3H3NO 5EX5A 4PKHA 4WQ4C 1BO5O 4BRFA 4DQ8A 2YHXA 3ZETB 3DXMB 1JCFA 1YVNA 2P9KB 1DGKN 3ENOA 4FPBA 2ITMA 4JN4A 2GEMA 4BRAA 1HUXA 1T44A 2HMPA 2V7ZA 3A5MC 3R8EA 1NGFA 3UKRB 2A42A 3HM8A 4PL8A 3GDQA 5KQDA 5JICA 4K43A 1XUPO 4BR9A 2BTFA 4CI6A 3O80A 3VENA 4JHDA 3UB5A 3SJHA 1K8KA 3B8AX 1CZAN 4K42A 3U8XA 3VEWA 3GL1A 2FXUA 3WXJA 4HWIA 3FFKB 3FLCO 3W3DA 4CZKA 2NRHA 4IXCA 1EQYA 2QWLA 3VGMA 4BQLA 3KHYA 3QBXA 3U9ZA 2KHOA 4EFHA 1DKGD 4BRDA 3O8MA 3BEXA 5BRDA 4RWTA 2YI1A 1U6ZA 3DXKB 4AM6A 3FE1A 4Z94A 5AZJA 5KPTA 3WQUA 3A5NC 4FOIA 3HSCA 4ISGA 1BOTO 2D1KA 3MN5A 4PKIA 1WOQA 2A6AA 2E2PA 3HI0A 3WEEA 3LM9A 2GWJA 1QQNA 2IIRA 5AQIA 4ISFA 2VCPA 4MO4A 1ESVA 4B1YB 5BPMA 2CGJA 1YXQA 3FZHA 1T6CA 1T6DA 2Q0RA 3LL3A 3ZETA 1NBWA 3VERA 4A2BA 2P9KA 2P9UB 3SMPA 4O5FA 4M7XA 5LY3A 3AY9A 3LDPA 3KVGA 1QZ6A 3CJ9A 3MDQA 1E4FT 5AQVA 1NGEA 3UKRA 4B1WB 3IUCA 4A62A 1QZ5A 4BR7A 1H1VA 3D2EB 1S22A 3ENHA 4HTLA 1NWKA 3BF1A 1HPMA 1QQOA 2Q97A 2QXLA 4H0VB 4BR0A 3SLCA 1MA9B 4BR2A 1KXPA 4JD2B 1V4TA 2P9PB 3ZEUB 2GWKA 3GG4A 3DJCA 3VETA 1ATRA 4XH1A 3LDLA 5LJVA 1WUAA 4BG8A 4F9OA 1TYQA 2A3ZA 2ASOA 4O8KA 1QQMA 2A5XA 4IO8A 5AQMA 5AFUH 1QHAA 3L6QA 2ASMA 5ELZA 1GLJO 5ADXA 2V7YA 1KAXA 1BU6O 4AM7A 2FF6A 1S3XA 3A8YA 5AR0A 3CJ1A 3FZFA 3CIPA 2W41A 4CZIA 1RGIA 2VYPA 2HF3A 2PAVA 3FZKA 4BRPA 5BPLA 4H0YB 4WQ5C 2P9LB 2FSKA 3VEZA 3O6WA 4FWOA 3UKUB 2Q36A 3JS6A 2E2QA 2QW9A 2QWOA 3TPQA 1NGDA 3U4LA 5AQSA 3QFPA 2YHYA 1Z05A 4JNEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DR6K 4O0IA 2WBNA 3ZSXA 3NGIA 4XJXA 1RT6A 3D2EA 3S41A 3CERA 1QTMA 3OS1A 4B3MK 4H0PA 4KHUA 4B1UB 2EWSA 3ITHA 1U2VB 1N32K 3PO4A 4WFNL 3C7NB 4CZLA 4HHTA 1HJRA 2GTDA 3VGKA 3MECA 4AHVA 4OVLA 4BR4A 4KTZA 3S3MA 2KKZA 1KLNA 4FWPA 1Q18A 4JEPA 5I3UA 2PYLA 1GLCG 3TABA 4GKJK 2F9TA 5BRFA 4DQQA 2HHTA 3D0PA 2WUSA 1XC9A 4CF0A 1RDUA 5CZ1A 3RWUA 1NGGA 4H0OA 2VGMA 4CHYA 2P9LA 1D8YA 4JI5K 1NJWA 3Q7CA 2FBYA 4Q0BA 5AQOA 3LDNA 3O9QA 2YCHA 3VF6A 1XHXA 1QQCA 1NMDA 3SQ4A 3PSIA 1LAVA 1TGOA 3WXIA 3H08A 5B8HA 1WLJA 3LPUA 1QS4A 3L2QA 3D45A 4M3UA 4O5BA 1NMNA 1VSFA 3JXUA 3NH1A 4CGGA 4FOEA 4CJ3A 1TAUA 1U2VA 4U7BA 3KLHA 3G0ZA 3C7NA 1V4SA 5AQLA 3SK3A 3RMAA 1NK0A 2HOEA 1VHXA 3FZMA 5MLCQ 4B9UA 5KGXA 5FPEA 4DB3A 1BIZA 4AHCA 2FLOA 4BG9A 2IS3A 4FSVA 4JV5K 3DAWA 4ELTA 4KI4A 4BREA 2IDOA 3EZWA 2JWKA 1C1CA 3E9PA 1OH7A 4DUZK 5CR4A 3DXKA 1YF5L 2QWNA 4BRIA 4H0TB 1VQNN 2F8TA 2XY5A 2RPIA 4FCYA 4IJNA 3ZSRA 3TAPA 3EN9A 3C94A 5I9EB 1U48A 4YOTA 5GAEP 3RRHA 3S3OA 1NJXA 4DR4K 4RTFD 4LH4A 4AH9A 1XNRK 1SAZA 2ZJPL 1EETA 3THXA 3H1VX 1CZ9A 1NJYA 3EKSA 1BIUA 3ULDA 2P9NB 1SZ2A 2ZE2A 1W7AA 4H0XB 1RT7A 3NAEA 2D0AA 4BECA 2PYJA 2ZGYA 3VQAA 3C6TA 4M3ZA 4CJ4A 1RNHA 4OKEA 4B9VA 3TI0A 2WTUA 1HNIA 3R3LA 3M1FA 2QWMA 3C95A 3CQ8A 1FK9A 2W42A 2UUBK 4BRMA 2HNZA 2GELA 1ATNA 2GUPA 2VWBA 1WSGA 4JS5A 4DV3K 3PX4A 3ZSOA 2ZF5O 3CC7N 4X66K 5AQZA 2D4WA 4Z0UA 4FZXC 5HOOA 2HBKA 3V6DA 2QK9A 3O1BA 3OYHA 2YKMA 3U6FA 4L8RB 2Q3SA 4CESA 1O1WA 3SZ2A 1LV5A 3QIPA 3R9PA 3CCQN 2I7PA 1LAWA 5CYMA 5KI6A 3WNFA 2P5GA 4BGBA 3AVKA 2P9NA 4M7YA 5H1SQ 1A5VA 4Z4EA 3P39A 2WFBA 1OH6A 5C2FA 3CCEN 3EZ5A 2HMIA 4PQUA 1HYSA 1TYQB 3ZSVA 4BRHA 2BGGA 1G99A 3VA0A 2V52B 3A0IX 3G71N 1GLAG 3T19A 3TU5A 4CJVA 5E41A 3DLGA 3RSEB 3MXIA 4AILC 4FJ8A 3A5OC 3AVCA 4WQ5A 2DY4A 3OBYA 3LALA 3HXMA 4MLHA 4W5TA 1VSLA 3J81O 3P31A 3VF4A 4A2AA 3NBPA 3RRGA 3KWIA 1RFQA 3OYDA 1VQON 4FJLA 4IDHA 3DMJA 3F5TA 1VQ7N 5KPRA 1RDWX 4F3TA 1Q7YO 3F9MA 3VN5A 3ZYYX 2UUCK 4LD0A 1X3MA 3CJAA 3D6RA 1FKOA 3JSMA 3ZX2A 1N33K 1ZBSA 3OYLA 3WNEA 3C6UA 5HROA 5I42A 4RCHA 1Q9XA 4R5PA 3F9KA 1EWQA 3M8RA 2G8VA 4GY2B 4LF4K 3AO4A 3CCRN 4CZGA 3N4PA 2NLXA 4M42A 2PFUA 4Q5VA 1UAXA 4KH5A 3K5LA 3RSEA 1JL2A 1RDCA 2J4RA 3VQDA 4MDBA 4LSNA 2OPQA 4K8ZA 4PWDA 4NXMK 3NH2A 3A5LC 4E3SA 1K6YA 4FJNA 4LH5A 1LOTB 3V1QA 4E1JA 4J8FA 3G10A 3MN6A 3EEQA 1ZBLA 5FROA 4JAXA 4J2DA 1OH8A 3F2KA 4MQ3A 3E9LA 4M3TA 4JI2K 2HHWA 3K9JA 3ZETB 1HPZA 3DXMB 1DT9A 1JCFA 3O9UA 4J2EA 4FJKA 4FPBA 1DLOA 2ITMA 3TSUA 4HTUA 3LP1A 5LMNK 3R8EA 1VAZA 3A5MC 3QEPA 1NGFA 1L3UA 4DFPA 4B9NA 3UKRB 2HBLA 2A42A 4CJPA 3GDQA 4CJQA 3RMDA 3O80A 5BR8K 3VENA 4OO1J 4K42A 1SS6A 2VWJA 4AQYK 2VG6A 1HNVA 3VQQA 3QNNA 2NRHA 4DF8A 2QWLA 1YHQN 3A2FA 5FRNA 2E6LA 3CYMA 3OYFA 2KHOA 4CEEA 4EFHA 4XIUA 4BRDA 3MAQA 3OYAA 1W9HA 3K5NA 4KB0A 1GOBA 4RWTA 4A5AA 4DLEA 4FJ9A 3E66A 3SBTA 1IV0A 1DTQA 3AVHA 4PKIA 2F4VK 3Q7BA 1RTDA 4UQGA 4ISFA 5C10A 2VCPA 3THVA 1UOCA 3IRXA 1WN7A 3LZJA 3CC4N 1QSYA 5FRMA 4Z4GA 3ZETA 4LFBK 4I9QA 4DV2K 1ZBFA 1I94K 3L2RA 4HUGA 1TL1A 4UY8O 1BI4A 3UKRA 4B1WB 5CHIA 3IUCA 3DLHA 1H1VA 1LWCA 1N36K 4C1NI 4HTLA 3ENHA 2F96A 4JI3K 1BGXT 1JLQA 1ASWA 3ZCMA 3O4NA 1HPMA 2Q97A 4DTNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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