3SJHA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-29) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 18-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp-latrunculin a
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein, protein binding
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 120
structure length 357
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3sjhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3sjhA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3sjhA03
1HPMA 3H1VX 2FSKA 2YHWA 2YCHA 1IJJA 1NGGA 3LM2A 3UKRA 5BRFA 2FSNA 3O80A 2A6AA 4BRFA 4BQLA 5EX5A 5BREA 2QWLA 2QW9A 1QQOA 2EWSA 1TUUA 2HMPA 4BRNA 1JCGA 1ATSA 3CJCA 2Q36A 2GUPA 2FLOA 4H5VA 1MWMA 1GLAG 4FWLA 4BG9A 3CJ9A 3R6MA 1E4GT 1T6CA 2QM1A 4CD1A 1YXQA 5EVZA 4BRCA 4BC3A 4EIAA 1U2VB 2I7PA 3A0IX 3CJ7A 4IJNA 4EAHD 4CD3A 2CGKA 4XH1A 5AQFA 4H5NA 1GLCG 3H3NO 2GELA 5AQNA 5LY3A 3VEVA 2QWNA 4FWQA 2P9LB 3CJBA 5LJVA 3FE1A 5AZIB 3J8AA 1U2VA 3GG4A 1HJOA 2A40A 3HM8A 3FFKB 3HSCA 4ISFA 1Z6RA 2NZTA 4JHDA 1IG8A 5EOYA 2H3GX 4BR7A 4FOIA 3VEYA 1H1VA 1XC3A 5BRHA 2Q97A 1HLUA 2P9SA 2ZGYA 4MLHA 2CGJA 1NGEA 2ZGZA 4ISEA 5JICA 1KAZA 2E8AA 4FWSA 4K42A 1NMDA 1BU6O 2V7ZA 4XH4A 1Q18A 4JHDB 3L0QA 2E2PA 1BA1A 3D2EB 2UYTA 2GWKA 2P9UA 3UKRB 2HF3A 2Q2RA 5JLFA 4DQ8A 4Y0WA 2OANA 3H46O 3QB0A 3R8EA 3KZBA 2CH6A 1V4SA 3WEEB 2E2OA 3O4WA 4L3QA 3S41A 3U4LA 2DPNA 3D2EA 3MDQA 2WUSA 2Q0RA 1D4XA 3LDLA 3EO3A 5F1XA 5BN8A 5BR9A 3O08A 3SMPA 2QWQA 2QWMA 4CJ7A 3VEXA 1J6ZA 1R59O 4H0TB 1ATNA 4KBOA 2CH5A 3CERA 4FSVA 1GLEG 3UKUA 3MN5A 4PKIA 3H3OB 5KPTA 5KPZA 1S3XA 3ENOA 4IWVA 4CBUA 3FLCO 5JLHA 1RFQA 2AA4A 2ASOA 4BVPA 2Q0UA 4MO5A 3LL3A 2A5XA 1WUAA 2IVOA 4CBXA 3U9DA 2W40A 3UKUB 3QDKA 3ULEB 2V51B 3CHWA 1T6DA 3VENA 2E1ZA 3DJCA 3O1WA 4IZ9A 3FZMA 5AZJB 3JS6A 4JNEA 2YJFA 4PKHA 5I9EB 4NO7A 3QFPA 3DXMB 4H0YB 1XQSC 5AQWA 3M1FA 5BRDA 4E1JA 4BR9A 3H1QA 3VGLA 3MK6A 5AQSA 3ID8A 3KHYA 3U8XA 4DCHA 2E2QA 5BPMA 1HKCA 3SJHA 4EFHA 4H0PA 2D0PA 4BRQA 3ATVA 1QHAA 4FWMA 3ZX2A 5EXWA 2ZWHA 4BR0A 4M7XA 2BUPA 2PAVA 4IJAA 4O5FA 5JMVA 3D7EO 4F9OA 5B8HA 5AQQA 4CI6A 3R9PA 1OKJA 2FXUA 1EQYA 4LC9B 4CZLA 3BEXA 3DXKB 4QS8A 4WQ5C 1BO5O 4BC5A 4BREA 3IFRA 4DHYA 4WYBA 3B8AX 4QS7A 5AQHA 3AAPA 5AQGA 4BG8A 3VEWA 5KQDA 4B9QA 4BRHA 4B1XB 3D2FA 2NLXA 4XH5A 2QWPA 5ADXA 4J8FA 3C7NB 1NLVA 3DXKA 3VGKA 2E20A 3OHRA 4Z94A 1NGBA 4FPBA 3WT0A 3L4IA 1GLBG 1XUPO 4I6MB 2AP1A 1DGKN 3FR0A 2J4RA 2BTFA 4BRPA 4PL7A 1ATRA 3BP8A 4FOEA 4CZFA 5F2RA 4BC4A 1SAZA 3LDOA 3LDQA 3AY9A 3C7NA 2FF6A 5AQKA 4GNIA 3ZEUA 4PKGA 2P9KA 5F0XA 1NGFA 2P9PA 2ASMA 4FWNA 4K43A 1TYQA 4BR4A 3A5LC 4DB3A 2FSJA 3KVGA 3CIPA 2ZF5O 2VYPA 3MCPA 2A42A 3VGMA 3L6QA 4EHTA 3MMVA 1QZ5A 2P9KB 1ZXOA 4M7YA 1KXPA 2E2NA 3MN9A 4QS9A 4H5RA 1E4FT 2A3ZA 2ITMA 4B1VA 5AR0A 4YDUC 3VF2A 2IVNA 3GL1A 3I8BA 3BF3A 3VERA 3QICA 3WEEA 4A2BA 2E1YA 1NGIA 1NGAA 1S22A 1X3MA 2YHXA 2P9IB 5E84A 3U9ZA 5ELZA 2D0OA 4O8KA 3VESA 5TKYA 1ESVA 4BROA 4CZEA 5EY4A 5AQUA 3VF6A 1GLDG 2FF3B 3ZETA 1T44A 3GOIA 4JD2B 4A62A 3QBXA 5FPEA 2W41A 3SK3A 1NGDA 4FWPA 3IDHA 3HI0A 3QFUA 4BRGA 4WQ4A 1QQNA 4BQZA 2P9SB 1NWKA 3IMXA 1G99A 1V4TA 2D4WA 4XEIA 2QWRA 1X9JA 4JD2A 4HTLA 4IXCA 4CZIA 2A41A 1YAGA 1QQMA 4PL8A 4IO8A 4EHUA 3EL2A 3EKSA 2KHOA 3FZLA 2P9PB 5AQJA 5BPNA 3CJAA 1TYQB 5AFUA 5AZIA 3G25A 4K41A 5AQLA 2P9NB 3A8YA 4B1ZA 5AZJA 3AAQA 1HX1A 3W0LA 3O8MA 4RCHA 5AQIA 4NB4A 3H45C 4FL9A 3C0BA 2V7YA 1C0GA 1DKGD 4BGAA 1LCUA 4GY2B 1HKGA 5KQ8A 3LDNA 4A61A 2F9WA 1SZ2A 1MA9B 1ZC6A 5AQXA 4CZMA 3CJ1A 2QWOA 1BDGA 3O6WA 1RGIA 3CI5A 2V52B 1YUWA 4H0VB 4BVOA 1BG3A 3VOVA 1CZAN 1NGJA 3QBWA 2QXLA 2P9UB 1GLFO 3ENHA 1MWKA 3VF4A 4AM6A 3TU5A 1YVNA 4H5TA 3O5BA 3GE1A 4WQ5A 4RWTA 3MN6A 4HWIA 3SMSA 5CE3A 2GWJA 3WQUA 3ATUA 4CZHA 4H0OA 1GLJO 4C23A 2F9TA 3M3ZA 1Z05A 5AQTA 3P4IA 2E88A 3WXJA 1X3NA 5AQOA 3ULEA 4B1YB 2PBDA 4K25A 3O1BA 5AFUH 2ASPA 2HOEA 3BF1A 5KPRA 2I7NA 1BUPA 4MLEA 3CETA 3AARA 3WXIA 3HBTA 3DWLA 3TPQA 2GTDA 4JN4A 4B1WB 3VETA 5FPDA 1NBWA 3DAWA 4FWOA 4ISGA 3CQYA 3WXKA 2HF4A 2VCPA 3ZX3A 1JCFA 4CZGA 5AQMA 4A2AA 5AQZA 4H0XB 3GBTA 3M6GA 3JXUA 2D1KA 4CZJA 4BC2A 3FZFA 3LDPA 4AM7A 5AQRA 1QZ6A 1BA0A 3H6EA 2YJEA 1JCEA 4RTFD 2IIRA 1HKBA 4M63C 4BRAA 1ZBSA 5BN9A 4CBWA 5FPNA 4FPAA 4BGBA 5ADXH 4YDUA 1K8KB 3SLCA 4BRMA 5LJWA 3I33A 1HUXA 2NRHA 1DEJA 3VEOA 4BRKA 4FWKA 3UB5A 3WXLA 4FO0A 3BUZB 3VEZA 2GEMA 1GLLO 3FZHA 1Y64A 3D2FB 1NM1A 1KAYA 3CQXA 5AQYA 3WQTA 1K8KA 5FPMA 3EN9A 3RSEA 2P9IA 4BR2A 4I6MA 5BPLA 3EZWA 3LM9A 3MN7A 1BOTO 4WQ4C 3A5NC 4H03B 3VPZA 3ZETB 1WOQA 2YHYA 4BRIA 1MDUB 1P8ZA 3RSEB 2YI1A 3ZEUB 5E26A 1RDWX 3EKUA 1BWFO 3HZ6A 2P9LA 4FWRA 4JAXA 3FZKA 3HTVA 1NGCA 1KAXA 3A5MC 3UE5A 4H5WA 1C0FA 3FGUA 2IVPA 3W3DA 4B1UB 3IUCA 3DXMA 3F9MA 1LOTB 4BRLA 2Q31A 5AQPA 1U6ZA 3WUHA 3GDQA 2VWBA 3ZX0A 3A5OC 4MO4A 1NGHA 4BRDA 5AQVA 2Q1NA 2P9NA 4BR5A 2CGLA 1TUYA 1SQKA 3QMLA 4CZKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RT5A 4YOUA 2FSKA 1OVYA 1IJJA 3UKRA 3AVKA 4F3OA 1ITGA 1RCHA 2A6AA 3O80A 4BRFA 5GINA 5EX5A 2QW9A 3RMCA 2EWSA 4M3RA 4BRNA 3EZ5A 1MWMA 1GLAG 1T6CA 4CD1A 5EVZA 4JV5K 1LWFA 4BC3A 4EIAA 1U49A 1U2VB 2QK9A 1YT3A 1RDDA 3QIPA 4XH1A 5AQFA 1C1BA 1J5OA 3H3NO 5AQNA 5LY3A 3ZCMA 1CZ9A 4NYFA 3I8DA 3DLRA 5LJVA 3GG4A 3QO9A 3FFKB 3D6RA 4DR6K 3HPHA 4JHDA 1IG8A 4FOIA 4X64K 4W5RA 1J54A 1H1VA 1HLUA 1WSGA 3MX5A 1RDBA 3O9QA 4ISEA 3VQ6A 1KAZA 4CIFA 4K42A 4XH4A 1Q18A 1HNZK 2PYJA 3IRXA 2E2PA 3QEPA 3U3YA 3S9HA 3D0PA 2GWKA 4AHSA 4LD0A 3UKRB 4OPKA 2HF3A 4DQ8A 2ZJQL 2X6NA 2OANA 3QB0A 3V9ZA 3S41A 2HBKA 2YKNA 1L3UA 4Z0UA 2WUSA 3OYGA 3QLHA 3UIQA 3LDLA 4CHYA 3OYJA 2HHHK 3V9SA 5F1XA 3K5OA 5CYQA 5BR9A 4KPYA 2QWQA 2Z1HA 4FLZA 4CHQA 1ATNA 5IWAK 3HSTB 5DM6L 1Q81O 4FSVA 3UKUA 3E9OA 3QEXA 4PKIA 3H3OB 1RTJA 5KPZA 2IC3A 1FKPA 3LAMA 3ENOA 4CHZA 2YNHA 1BCOA 1RFQA 3O4QA 3ULDA 2F8TA 3ZT1A 4MO5A 4B08A 3LL3A 4ID5A 3U9DA 2W40A 3QDKA 3AVJA 4FCYA 2Z1JA 1RDAA 3DJCA 5HRPA 3MCAB 1S6QA 4ELUA 1TL3A 1YIJN 3JS6A 4FJXA 4JNEA 4BWMA 3AVBA 4UY8O 4B9MA 4JKGA 5I9EB 3DXMB 4QAGA 3M1FA 5BRDA 4CJTA 3KLGA 3CCUN 2C1GA 2O4IA 3KK2A 1I94K 3J7ZO 1TK5A 2VG6A 3OY9A 5AQSA 4OLBA 4IFVA 4G9ZA 3CCSN 2E2QA 3KLIA 4KRFA 4CGFA 4EFHA 4KB1A 4H0PA 2UXBK 4M3UA 3OYMA 1N32K 4FLTA 2ZWHA 4M7XA 3KIOA 2BUPA 3NVMA 4TSXA 3SNNA 1N8RO 5JMVA 3D7EO 4LSNA 2FXUA 4Z4FA 3AVFA 4O8UA 3ZLJA 4WYBA 3B8AX 4FZZA 2Y1JA 3PO5A 2P5GA 3DOKA 5KQDA 4C8NA 4B9QA 1KFDA 4FM1A 3HXMA 4B1XB 3D2FA 4XH5A 2QWPA 1L5UA 5GIOA 1NLVA 3AVMA 4Z94A 5M1FA 1NGBA 1VSEA 4PY5A 3MEEA 4AF1A 5KRSA 4CIGA 3LDSA 4JI4K 3NCIA 5LMUK 3U6FA 5F2RA 4CE9A 4E7HA 3NF7A 3OW2M 3C7NA 2HMIA 3SAHA 4CJUA 2Z1IA 4PKGA 3NH1A 5F0XA 4NCBA 3ZSQA 4MDBA 4FJJA 2ASMA 4K43A 1D9DA 4NYNA 4BR4A 4AHRA 4DB3A 4HTUA 3KVGA 4DR3K 4DSKA 3MCPA 2A42A 3AA2A 3QEWA 4EHTA 3CCRN 3KD5E 1QZ5A 4N5SA 3V81A 4M7YA 1KVAA 3PX0A 2E2NA 3SQ2A 4H5RA 1E4FT 5AR0A 2O4GA 4YDUC 2IVNA 3GL1A 3BF3A 3VERA 4FJMA 1QS4A 3J7YP 4B9TA 3LP1A 2XHBA 4FJNA 1S22A 1BQNA 4DR5K 4HUEA 4O8KA 3TAFA 1S9GA 2JWKA 3OYAA 3LAKA 2FBXA 1XI1A 3VF6A 1WN7A 5K14A 5C10A 4CF9A 1S1UA 4PA1A 5HLFA 4BY9C 3ZETA 4LF9K 4FLUA 4JD2B 1ZYQA 2W41A 4MQ3A 3HI0A 3AGKA 3QFUA 1HYSA 5C25A 4AHUA 4ELTA 1QQNA 2KKZA 1HYZA 3ENBA 5MLCQ 1VSHA 3LPTA 4K8XA 3SV3A 3K58A 4PUOA 2A41A 1VQ4N 4PL8A 3DLBA 3EL2A 3EKSA 2KHOA 1RT2A 2DY4A 4ZTJA 5FDLA 1W2BM 3DOLA 3A8YA 4B1ZA 3O4NA 3CCEN 3O8MA 3H45C 2NRTA 4KH5A 3WXMB 3HRGA 1DKGD 1UAXA 4GY2B 1HKGA 4OPHA 3ZSVA 3HOTA 1NKEA 3L3VA 3LDNA 5FLXO 1JXEA 1SZ2A 1MA9B 5AQXA 2O8CA 3A2FA 1HNVA 3O6WA 5C2DA 4ELVA 2V52B 5M1KA 1B9FA 3OYLA 2HVHA 4KHUA 1ZBIA 2VGNA 1CZAN 3HK2A 2QXLA 1GLFO 3ENHA 4U7BA 3TSQA 4RWTA 3GE1A 1Q82O 3MN6A 2HHUA 1E3MA 2GWJA 4X65K 4CZHA 4H0OA 4IG0A 2QXFA 3QETA 3HO1A 3M3ZA 1LV5A 3P4IA 3RMDA 3HM9A 1X3NA 3G4SN 3SBTA 3LWLA 1FK9A 1ASWA 3NGIA 3WNGA 5KPRA 3BF1A 3AO1A 2I7NA 4JI3K 3L2VA 1IKXA 4LF5K 3HBTA 4B3TK 3DWLA 3MAQA 2G8FA 4B1WB 3NFAA 1JKHA 3DRPA 3SBGA 3CQYA 1QE1A 4CF0A 3ZX3A 4CZGA 3MEGA 4DR7K 4CGIA 3JXUA 4DR1K 2KQ2A 4BC2A 2IOCA 3LDPA 3VQCA 2F4VK 3DI6A 4JK8A 4CIEA 3TAPA 2RE2A 4M45A 1JCEA 2OPRA 1HKBA 4M63C 4CBWA 5FPNA 3OS1A 4DV6K 4FPAA 4KH6A 3TAMA 4R79A 3DYAA 5ADXH 4DTPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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