3SJHA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-29) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 18-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp-latrunculin a
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Contractile protein, protein binding
source organism Drosophila melanogaster
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 120
structure length 357
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3sjhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3sjhA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3sjhA03
1WUAA 5AQHA 1D4XA 2QWRA 3O80A 5BRFA 3MN9A 4BC5A 4CZGA 1ATRA 3WXLA 4H5VA 4BC2A 2E88A 2IVOA 3FLCO 1HKBA 3GBTA 3EZWA 4H0TB 3A5OC 5E84A 4H0YB 4FOIA 2PBDA 5EXWA 2VWBA 2V7ZA 1NMDA 3LDOA 2BTFA 3HBTA 4B9QA 3SJHA 4M7XA 4Z94A 3MMVA 4KBOA 1X3MA 4WQ4C 2P9KB 3FGUA 3I33A 3O1WA 5KPTA 2P9IA 3HI0A 4CZIA 2GTDA 2A40A 4BGAA 2QWNA 3UKUA 2VCPA 2F9TA 3LM2A 1CZAN 1MDUB 3W3DA 1ZBSA 3CI5A 3FZFA 4B1UB 5BPLA 4IWVA 3DWLA 5AQTA 3SMPA 4K25A 1NGCA 4B1YB 3VF2A 4A2AA 1NGIA 3O5BA 2NZTA 3ZETB 3GE1A 5EOYA 4FSVA 3D7EO 2P9LB 3VF4A 4JD2A 3VPZA 2P9PA 5ELZA 5AQPA 5AQVA 3A8YA 3BP8A 3IUCA 1NGAA 4BRNA 2Q36A 3FE1A 3DAWA 4M7YA 3VEVA 2GWJA 1SQKA 3A5NC 2FSNA 4H0XB 1X3NA 4HTLA 3DXKA 1U2VB 4BR0A 5AQFA 4FWNA 4BQLA 3MN6A 2QM1A 2FXUA 3M1FA 5KPRA 4BQZA 4BREA 1C0FA 4HWIA 4YDUC 4BC4A 2V51B 3H3OB 2P9UA 3KZBA 3MN7A 3VEWA 3WEEA 3FZMA 3FZHA 2Q97A 3DXMA 3DJCA 3VEOA 4JNEA 4BROA 3VOVA 2A5XA 4PKHA 3LM9A 4PKGA 2A41A 3ATUA 1HLUA 4FOEA 3VERA 1TYQA 4GY2B 3SK3A 4O5FA 4BRDA 2YJFA 4FWKA 4CBUA 4CZMA 1JCFA 1QZ6A 2YI1A 3L4IA 3VGLA 4DB3A 1SAZA 4FL9A 3BF1A 1SZ2A 3WT0A 5BN8A 3TPQA 1DEJA 5KQ8A 1XUPO 4B1ZA 2GUPA 2ZWHA 4YDUA 1S22A 2YHWA 3S41A 3IFRA 3QMLA 4FWSA 1NGFA 3ZX3A 1BU6O 2E2PA 1T6DA 1OKJA 3R8EA 3UB5A 5LY3A 1K8KB 3VEZA 1E4FT 4WQ5C 3D2FB 2AA4A 5TKYA 4BRHA 4EHUA 2I7PA 4K43A 4A62A 4BRIA 4BRFA 3GG4A 5JLFA 3KHYA 5AQOA 5BN9A 3AARA 5FPDA 4EHTA 3U4LA 4IJNA 2V7YA 1BO5O 1RGIA 4NB4A 1MWMA 3UKRA 1NGBA 2QWMA 2P9NB 4L3QA 4EFHA 5AFUA 4BVPA 3L6QA 4H5NA 3WXKA 4ISEA 3GOIA 2J4RA 4IZ9A 4CZKA 2A6AA 4FPBA 4M63C 1KXPA 3LDQA 3OHRA 3AAQA 1QQNA 2ZGYA 3J8AA 4IXCA 1NGHA 1ATSA 5AQMA 3R6MA 4CJ7A 2IVNA 4H0PA 4WQ5A 5AZIA 4XEIA 1NM1A 2D0OA 3P4IA 5I9EB 3H45C 5AFUH 3LDPA 5BRHA 5AQUA 4CD1A 5AQIA 3QDKA 1YXQA 3FR0A 1IJJA 3FZLA 4ISFA 3WUHA 1ZXOA 1BWFO 1TUYA 4CZHA 1GLAG 3UE5A 2D0PA 2E2NA 4Y0WA 3F9MA 1X9JA 4BRCA 2NRHA 4LC9B 3AAPA 3M3ZA 3ZX0A 4BG8A 1NWKA 4FWQA 2QWPA 4K41A 1NGEA 4IO8A 4I6MA 1MA9B 3CIPA 4H5WA 3IDHA 5CE3A 4B1VA 1RFQA 4F9OA 1BA0A 2ZGZA 3VEYA 3FZKA 4O8KA 3VEXA 3ZEUA 1HUXA 3CJ9A 3LL3A 3C7NA 5AR0A 4BR2A 5AQXA 4JHDA 3QBWA 2YHXA 3VGMA 2I7NA 5AZIB 2W41A 2P9IB 1EQYA 2D1KA 3VENA 4IJAA 4EIAA 5AQQA 2HF3A 1HPMA 3UKUB 2W40A 1Q18A 5AQWA 4MLEA 2E2QA 1NLVA 4C23A 4RCHA 3B8AX 1IG8A 1KAXA 2ZF5O 2YJEA 4PL7A 1DGKN 1HKGA 5AQRA 1YUWA 2OANA 1HX1A 5B8HA 2UYTA 2YCHA 3H1QA 3M6GA 4BR9A 1Z05A 3EKSA 3EO3A 3IMXA 3D2EA 3BEXA 5AQSA 2P9SA 4H0VB 2IIRA 3A0IX 1BOTO 3ULEA 4JD2B 2P9PB 1G99A 1NGGA 2QWOA 3ENHA 3L0QA 3O6WA 2BUPA 3O1BA 3VETA 5AZJA 1T44A 5EVZA 3ATVA 2A42A 2NLXA 4JN4A 5JICA 3DXKB 5LJVA 2DPNA 3VF6A 3U9ZA 1J6ZA 4BGBA 4QS7A 1LOTB 2E1YA 3LDLA 3HTVA 5FPNA 2ASPA 3G25A 4CBWA 2P9UB 1RDWX 3JXUA 3WEEB 4E1JA 5AQJA 5BPMA 4GNIA 1V4SA 3EKUA 1QQOA 3DXMB 4BR5A 5F1XA 1H1VA 2H3GX 4A61A 3HSCA 4DHYA 2FSJA 3BUZB 3C0BA 5BR9A 5AQGA 1Z6RA 2QWQA 5LJWA 5E26A 1WOQA 1KAZA 2V52B 4NO7A 1TYQB 5F0XA 3MDQA 3ENOA 1DKGD 3CERA 2Q31A 2FF3B 4BRMA 1V4TA 2P9SB 3HM8A 1ATNA 1HKCA 3WXJA 4DCHA 1BG3A 1GLFO 2GEMA 4WYBA 2A3ZA 2ASOA 1XQSC 2CH6A 1YVNA 3GDQA 2Q0UA 1QQMA 3GL1A 4EAHD 5JLHA 1NGJA 3ZETA 5KQDA 2Q1NA 3LDNA 3EL2A 5EX5A 5AQNA 4B1XB 4BRKA 4CD3A 4CI6A 4MLHA 2VYPA 2HF4A 4XH4A 2P9LA 3CJ7A 1GLEG 4H0OA 4CZEA 4FWLA 4FWRA 4H5RA 4CZFA 3CJCA 3KVGA 1E4GT 4BC3A 2ASMA 1NBWA 4RTFD 4MO4A 3ZX2A 4K42A 3CHWA 2ITMA 1QHAA 1U2VA 4BVOA 5BREA 3RSEA 3BF3A 4BRQA 4PL8A 3UKRB 2YHYA 5BRDA 3O4WA 2CGJA 1XC3A 5ADXA 3A5LC 4BRGA 4H03B 1S3XA 1ZC6A 2D4WA 3FFKB 3SMSA 2QXLA 2CH5A 3MK6A 4BRPA 3CJ1A 4FPAA 3TU5A 3R9PA 2HOEA 1GLJO 4AM7A 4CBXA 4XH1A 1P8ZA 2F9WA 1BA1A 5AQLA 3QB0A 1JCGA 2QW9A 1MWKA 2AP1A 3QFUA 4PKIA 5ADXH 3AY9A 3CQYA 3CETA 1BDGA 2E2OA 3CQXA 4AM6A 2PAVA 3ID8A 3A5MC 3U9DA 3VESA 4CZLA 4QS8A 4WQ4A 1JCEA 2Q0RA 1GLLO 4BRLA 4J8FA 1QZ5A 3W0LA 5KPZA 4A2BA 4XH5A 3RSEB 3VGKA 3CJAA 3QFPA 5AQYA 2HMPA 4FWOA 4FO0A 1TUUA 5JMVA 1HJOA 1K8KA 1YAGA 4I6MB 1U6ZA 3D2FA 4QS9A 3EN9A 3MCPA 5F2RA 3JS6A 3O8MA 4H5TA 2FSKA 2QWLA 1GLCG 2GWKA 1BUPA 3ZEUB 2CGKA 4RWTA 2WUSA 4BR7A 1GLBG 1R59O 3C7NB 4JHDB 3WQUA 2E20A 5FPMA 3SLCA 2GELA 3H6EA 3CJBA 5EY4A 5BPNA 2FLOA 2P9NA 5FPEA 2Q2RA 3MN5A 3QICA 3H1VX 1GLDG 3I8BA 4CZJA 3HZ6A 1NGDA 1T6CA 2FF6A 3U8XA 4MO5A 4ISGA 3WQTA 5AQZA 3QBXA 2P9KA 5AQKA 4BG9A 1C0GA 4BRAA 3O08A 4JAXA 3H46O 3D2EB 1ESVA 2EWSA 2CGLA 2E1ZA 3ULEB 3WXIA 4DQ8A 2IVPA 1KAYA 1Y64A 4FWMA 5AZJB 3H3NO 2KHOA 1LCUA 4B1WB 4FWPA 4BR4A 2E8AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SL2A 5AQHA 3NF9A 4JK7A 3V6DA 4DLGA 2HHHK 2UU9K 4BC5A 4CZGA 4BC2A 2IVOA 3FLCO 2OTLN 3HO1A 1HKBA 2HBMA 3OA9A 4HHTA 4H0TB 5SZTA 3E9PA 4FOIA 3LANA 3KTQA 1NMDA 4GKKK 3LDOA 4DWIA 4JKHA 4B9QA 1BCMA 4CEEA 4J2EA 3HP9A 4Z94A 1Y97A 1X3MA 2IGIA 3TABA 2P9IA 4FM2A 3CYGA 4E7JA 1Q81O 2RHKA 2XO7A 3ULDA 1CZAN 3MAQA 3T7ZA 3W3DA 3CI5A 5BPLA 2O8FA 5AQTA 4Z4GA 1NG9A 4Q0BA 4CCHA 4WFAL 1VSDA 4B1YB 3VF2A 3MXJA 1NGIA 5TKWA 1ZBIA 4B9MA 4B3RK 2P9LB 4YOTA 2NRZA 2VG7A 3VPZA 3A8YA 3BP8A 2QXFA 4R5PA 1YI2N 1YVUA 4M7YA 3VEVA 1IKYA 3Q7CA 3VQAA 3LALA 4BR0A 1UA1A 4BQLA 3MN6A 3M1FA 1WBBA 3RRHA 4E7KA 4M3UA 4BREA 4DLEA 4DSIA 1C0FA 4YDUC 4LF6K 2E6MA 3AV9A 3AO4A 2O8BA 3OYMA 3DJCA 3VEOA 3J81O 1CXQA 3VQ7A 1VQ9N 2X78A 3PIPL 4E1NA 3LM9A 3PX4A 1VQ6N 2A41A 3PO5A 2NRXA 4BRDA 3SK3A 3VQ5A 4O5FA 4DFKA 3C94A 4CEOA 3CC7N 2O8CA 4CBUA 3CMAN 3AVIA 4DR4K 5IT9O 3P5JA 3SCXA 3BF1A 2C1GA 5JENA 4OVLA 4YDUA 1FK9A 4KHSA 3RMAA 1BU6O 4DF8A 1SKWA 4K8ZA 3MCAB 3SNNA 3AVCA 3D2FB 2AA4A 5TKYA 1E3MA 3NFAA 3DRRA 1WB9A 5JLFA 1UA0A 4BDZA 5BN9A 3AARA 3MWTA 3OYCA 4CERA 4DV1K 3DM2A 4I7FA 1NGBA 1XHXA 3DRPA 3ZSXA 4CHNA 3VN5A 4EFHA 3U3YA 4CF9A 3JSMA 3OS2A 4CE9A 2J4RA 1SL0A 3NHGA 1FKOA 3AAQA 1RILA 5HRNA 1ATSA 1IBKK 4C8MA 1UWBA 1LW2A 3WNHA 3OS0A 2KFZA 3P4IA 5KGXA 3H45C 4GV3A 3SQ1A 4CD1A 2RE2A 2UUBK 1TL3A 1YXQA 3K5OA 3FR0A 3C6AA 4ISFA 3WUHA 4IG3A 2QKKA 2UXDK 1TUYA 1GLAG 3L2WA 3UE5A 2BANA 2FBVA 3F9MA 3AO3A 4GVEA 3SJJA 5LMUK 3KIOA 4AHCA 4DQRA 1SUQA 1TK8A 2HHWA 4B3SK 4CK1A 4B9VA 4V19S 1IO2A 4FVMA 1RFQA 1BA0A 2JGUA 1D8YA 3FZKA 3AVHA 1M90O 1OH6A 5AR0A 5HRSA 1S9EA 2YHXA 2B4JA 4DTNA 1Q9XA 3OVNA 4DFJA 2IC3A 2HF3A 1NKBA 1WSFA 2E2QA 4MLEA 3MEGA 4C23A 4U7BA 3OYNA 5JS2A 1KAXA 1RT4A 2ZF5O 5C2FA 4DUYK 2HHTA 1SV5A 4PL7A 4EZ6A 3CFPA 4CK3A 1YUWA 2HHXA 4J2AA 4GVMA 4CESA 1TAUA 2YCHA 3ZT2A 4BR9A 4RW7A 3CCRN 2G8VA 3VA3A 4DTRA 1RDCA 5JVGL 3IMXA 3QEXA 1RT1A 3TR8A 2HVIA 3KWGA 1BOTO 3VQPA 1G99A 1NGGA 2QWOA 1N34K 1ZBLA 4LH4A 3N4QA 5EVZA 4Y1CA 4DV7K 2A42A 3ID6A 3DXKB 4A57A 2IDOA 2DPNA 1K73O 3U9ZA 4QS7A 1QTMA 2QI2A 4DQPA 1VK0A 2P9UB 3JXUA 3WEEB 2YX6A 1N36K 5JS1A 5BPMA 4FLZA 1BQMA 1QQOA 3DXMB 4BR5A 4K0KK 5F1XA 4FJHA 1H1VA 2H3GX 4A61A 3KLHA 1QE1A 3ZSQA 2F8SA 4YOWA 1TKDA 3IS9A 3KK1A 2QWQA 4CF0A 4DV3K 1ATNA 1L3SA 5J2QA 4KAZA 4DTJA 5KRTA 1BG3A 1GLFO 2KW4A 2FC0A 1XQSC 2CH6A 2NRWA 1YVNA 4CHZA 1FJGK 4QOZB 4JYAK 2KFNA 4NLCA 3CYMA 3SUPA 4NLBA 1BI4B 4YFUA 2Q0UA 4PQUA 1L3TA 5JLHA 3CCUN 5CZ1A 3ZETA 3EL2A 4BRKA 5AQNA 4OX9K 4MLHA 3SAFA 3CJ7A 4FWLA 2OPPA 4BC3A 2YHAA 5HL7L 3AO5A 1VQ7N 2ITMA 4KHYA 4DUZK 4FJ7A 3AVBA 4GV6A 4CHQA 4ILGB 1OVQA 1U2VA 4A59A 3V81A 4BVOA 5K14A 4BRQA 4YHHK 2HB5A 4FZXC 3NBPA 2XY8A 3KK7A 3D6RA 1X9MA 3HPHA 3CFOA 4JKCA 3SPYA 1S3XA 2HNDA 4CEQA 4BRPA 3CJ1A 3TU5A 3AVJA 1W2BM 3LDSA 3QIPA 3K9JA 3WNEA 4CEAA 3TAEA 4CBXA 1BA1A 5AQLA 4JEPA 3QESA 2OZSA 2UXCK 3BZKA 4JV5K 2AP1A 5H1SQ 3ASMA 4PKIA 4CGHA 1C1CA 5KI6A 4GW6A 3CQXA 3TAPA 4KH6A 1I3AA 3ENBA 3ID8A 3VESA 2YKMA 5C15A 4N47A 1RT3A 5C12A 3RMCA 4BRLA 3L4QA 4FJKA 1RBVA 4A2BA 1ZBHA 3CJAA 3QFPA 5AQYA 4M3YA 3RWUA 4KI6A 4KHPK 5J2PA 4FJ9A 4JKFA 4I6MB 1U6ZA 4CHPA 3EN9A 4DQSA 4KHUA 2IS3A 2VG5A 1Q82O 2GWKA 2GV9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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