3SJHA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-29) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 18-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp-latrunculin a
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein, protein binding
total genus 120
structure length 357
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3sjhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3sjhA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3sjhA03
5AQNA 3G25A 3KHYA 2Q2RA 4PKHA 1XC3A 3A5MC 1IG8A 5AQJA 3LDLA 3WUHA 4H5WA 3SK3A 4CZJA 5KPTA 3WEEB 1GLEG 3QBWA 2Q36A 4CI6A 3GL1A 3HSCA 3MN9A 3VOVA 3QDKA 4A61A 2GELA 4BREA 5AQXA 1YUWA 3IFRA 2P9LB 1ZC6A 3VGKA 3EKSA 1ATSA 4I6MB 5AZJB 3UE5A 1BWFO 4EHUA 3VETA 3MN7A 5AQUA 3FE1A 2E8AA 2FLOA 1DEJA 3LDQA 2P9SA 5F0XA 5E84A 5F2RA 4ISEA 4BGAA 4BRKA 5BRDA 3VENA 2YJEA 3EKUA 4BC5A 1NGDA 2E2NA 4JHDB 4EFHA 3VF4A 1P8ZA 5BPNA 3CJ1A 3WEEA 4RTFD 5AQMA 4BG8A 1BOTO 1T6DA 2P9PB 4CZIA 4CBXA 2UYTA 5AQHA 2P9LA 2YJFA 5I9EB 4RWTA 4BR7A 4BROA 5AZJA 3JS6A 4XEIA 3VGLA 3VEVA 4BRQA 1E4FT 5AQTA 2A5XA 1NBWA 3WQUA 1RFQA 1BUPA 4BGBA 1GLCG 5AQQA 3CJBA 5AQRA 3B8AX 3IDHA 5AQZA 2QXLA 1MWKA 3AARA 4CZHA 2P9KB 2FXUA 2VWBA 3FR0A 4JHDA 1KAYA 2HF3A 1U2VB 1BA1A 1X9JA 1NGGA 1S22A 1Y64A 2ZGZA 3A5OC 4RCHA 4WQ4C 5E26A 5AQOA 4MLHA 1K8KB 4ISGA 3A8YA 1NLVA 4C23A 4K25A 3H6EA 3WXLA 5LJVA 1QZ6A 1ATNA 2P9UB 1KAZA 3VERA 1QHAA 5AQPA 1ZBSA 2Q0UA 3CJCA 1DKGD 1HJOA 4H0VB 4BR5A 4Y0WA 4EAHD 3QB0A 3L6QA 4J8FA 4YDUC 5AQSA 4JNEA 3W3DA 1RGIA 1BG3A 4WQ5C 1U2VA 2ITMA 3CJ9A 3GBTA 4HTLA 2YHWA 1SAZA 3D2FB 4BRLA 3VEZA 4IJNA 3LDPA 5B8HA 1K8KA 3QBXA 3DAWA 3O80A 4FWRA 3CHWA 5LJWA 3WXIA 3GG4A 2IVPA 2P9UA 1XQSC 3ZEUB 5BRFA 3J8AA 4PL7A 4FWPA 2E1ZA 2QWLA 4FWMA 4FPBA 2F9TA 3DJCA 1NM1A 4IO8A 2QWNA 3O6WA 4FWNA 4FOEA 3DXKB 5EOYA 4H0PA 3TU5A 3HZ6A 3CETA 3VF2A 3D2FA 3RSEB 5KPZA 1KAXA 5F1XA 4GNIA 4KBOA 2GWJA 3U9DA 2P9SB 4MLEA 4O8KA 1MA9B 2F9WA 2FF6A 3IUCA 4JD2B 5FPEA 4M7XA 3A5NC 2E1YA 5FPNA 1QQMA 3BF1A 4FL9A 4A2BA 2A40A 1C0FA 1NGEA 3ATUA 3R8EA 3R9PA 3SMSA 5AQVA 3QMLA 3ZEUA 1HPMA 3ATVA 2FSNA 5AFUA 1NGFA 1OKJA 3HBTA 4XH1A 1S3XA 4H5NA 1TUYA 4PKGA 2W41A 1BO5O 5AQWA 3DXKA 1YAGA 2QWQA 3RSEA 4BC2A 4BR2A 4H03B 4MO4A 1NMDA 3D2EB 2QWPA 3S41A 3SMPA 3I33A 5AQYA 3H3NO 4BRHA 4JD2A 3VGMA 1JCGA 3MK6A 1LOTB 4IXCA 4WQ4A 4BRFA 1ESVA 3LDOA 2ZF5O 2E2PA 4B1XB 3AAPA 5BREA 4BRNA 3ENHA 4FOIA 2Q1NA 1E4GT 3HI0A 2HF4A 3L4IA 4XH4A 2D1KA 2YCHA 4BQZA 2E88A 2P9NB 3VEYA 4CZMA 5BN8A 1NGHA 1GLJO 4BR4A 2PBDA 2E2QA 5JICA 4YDUA 5BN9A 3D2EA 4BVOA 4JN4A 1T44A 4WQ5A 1NWKA 1H1VA 1Z05A 3CJ7A 4FSVA 4H5RA 1X3MA 1SQKA 2Q31A 5JLHA 2IVOA 2BTFA 2D4WA 2A3ZA 4QS9A 1NGBA 3OHRA 4M63C 4WYBA 2ZGYA 4NB4A 2VYPA 2DPNA 3H3OB 3JXUA 3QFUA 4CZFA 2P9NA 3ENOA 2I7NA 4FWOA 1GLLO 4BVPA 2V7YA 1ZXOA 3KZBA 4B1YB 2IVNA 2OANA 2J4RA 3U8XA 5AQKA 5EVZA 3A0IX 2GWKA 5BR9A 3F9MA 3H46O 3VEWA 5KQDA 3M3ZA 1R59O 4BQLA 2QWOA 4QS7A 4BRMA 2D0OA 3EL2A 5AZIB 4F9OA 5TKYA 4K43A 1KXPA 4FO0A 1J6ZA 5EY4A 4BG9A 2ASOA 3FZKA 4A62A 4NO7A 3U9ZA 3FZFA 3MN6A 3H1QA 3VF6A 5CE3A 3QFPA 1RDWX 2QWRA 3EO3A 2IIRA 1HKGA 4H0YB 4FPAA 3TPQA 3BUZB 4B1UB 4FWKA 1ATRA 3R6MA 3CQYA 3GDQA 4FWSA 1WUAA 5AZIA 2A6AA 3LDNA 2FSJA 2ASPA 1MWMA 3DWLA 3EZWA 3O5BA 3ZX3A 4BRIA 4CZKA 2YHXA 5EXWA 1GLAG 2NZTA 5ADXH 3L0QA 4CZGA 1IJJA 1QZ5A 4BRCA 5AFUH 3VEOA 1QQNA 3O1BA 4L3QA 3A5LC 1GLBG 5AR0A 3CJAA 2E2OA 5ADXA 1Z6RA 3EN9A 4PKIA 3O4WA 4DHYA 4B1ZA 1GLDG 1YVNA 3FGUA 4DB3A 1HLUA 1X3NA 5AQGA 4Z94A 3VESA 2NRHA 4CZLA 4QS8A 5JLFA 2GTDA 1QQOA 4B1WB 3C7NB 3U4LA 1LCUA 2W40A 1YXQA 3O1WA 3FZMA 4H5TA 4CD3A 3VPZA 4CJ7A 3CI5A 2P9IB 1NGJA 2BUPA 3CERA 3D7EO 3LM2A 3UKRB 1TUUA 3I8BA 1NGIA 2AP1A 4BRDA 1BU6O 3C0BA 3ZX0A 2ZWHA 2V7ZA 1T6CA 2CGLA 2QWMA 2A41A 4AM7A 4BR0A 4B9QA 2NLXA 3H1VX 3M6GA 4K42A 3GOIA 1GLFO 3SJHA 2GEMA 2EWSA 3BP8A 4HWIA 1WOQA 3C7NA 5KPRA 2ASMA 2HMPA 4DQ8A 4FWLA 2V52B 4EIAA 2HOEA 4PL8A 4BC4A 2P9IA 1HUXA 3O08A 2VCPA 3SLCA 2QM1A 1G99A 1EQYA 3UKRA 3CQXA 4O5FA 4GY2B 1C0GA 4FWQA 4LC9B 4CBWA 4I6MA 3IMXA 2QW9A 3HTVA 1U6ZA 2YI1A 3CIPA 4IJAA 1SZ2A 5FPDA 1Q18A 2CH5A 5LY3A 3LM9A 3WQTA 4CBUA 2A42A 3ZETB 1MDUB 2D0PA 4H0TB 4A2AA 3MMVA 3UKUB 4BRAA 3FLCO 4DCHA 3KVGA 2I7PA 1CZAN 2P9PA 1NGCA 4JAXA 2H3GX 3DXMB 3M1FA 4BRPA 2CH6A 4MO5A 1HX1A 3MDQA 3AAQA 3LL3A 3QICA 4K41A 4BR9A 1HKCA 3H45C 3WT0A 2CGJA 5KQ8A 3ID8A 2CGKA 2YHYA 4XH5A 5BRHA 1D4XA 3HM8A 1JCFA 3BF3A 3AY9A 2P9KA 1TYQB 4E1JA 3ZETA 2FSKA 1DGKN 3WXKA 5FPMA 3VEXA 4AM6A 1BDGA 5AQIA 4M7YA 3UKUA 5EX5A 2Q0RA 5ELZA 2E20A 5AQLA 4EHTA 3UB5A 2GUPA 3ULEB 2V51B 2AA4A 4BRGA 4B1VA 3P4IA 3FZHA 2KHOA 3FZLA 5BPLA 1NGAA 4BC3A 4H5VA 3DXMA 3MN5A 1XUPO 3ZX2A 1V4SA 4H0OA 5AQFA 4IWVA 2Q97A 4CD1A 1JCEA 1V4TA 4ISFA 4H0XB 1HKBA 2PAVA 3MCPA 3GE1A 3BEXA 1TYQA 4CZEA 3W0LA 2WUSA 4IZ9A 3O8MA 5BPMA 2FF3B 1BA0A 3WXJA 3ULEA 3FFKB 5JMVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XC3A 1S6QA 2F8SA 3H08A 4CEOA 1IG8A 4W5TA 4B9TA 4FJ9A 4KV8A 3L4QA 4DQQA 3AVLA 4CI6A 3DOKA 4FK4A 3MN9A 3QDKA 4A61A 5AQXA 3SQ2A 5HRSA 2P9LB 3VQPA 2VWJA 1ZC6A 3VGKA 3PIPL 4Z4GA 1ATSA 4I6MB 3B6OA 2HVIA 3FE1A 4PUOA 3PX6A 1O1WA 2HBKA 3LDQA 5F0XA 4N47A 4WE1A 4BRKA 4FZYA 3VQ8A 4YOVA 2HNYA 3EKUA 3NFAA 1NGDA 4JHDB 4ELUA 4OO1J 4BDPA 1XHXA 3CJ1A 1WSFA 1WNSA 3WEEA 1T6DA 3NBPA 5AQHA 4LH4A 2YJFA 4BR7A 3K5NA 2E6LA 5BR8K 4BRQA 4O8UA 3HRGA 2AJQA 1I39A 1RFQA 3HXMA 1BUPA 3P5JA 4BGBA 2HSTA 3OVNA 5AQZA 1MWKA 4CIFA 5SZTA 4CK2A 1KAYA 2HF3A 1JL2A 2JWKA 2VWKA 3OYMA 2ZGZA 4F3OA 4RCHA 4WQ4C 4OGEA 4DR7K 4E7KA 1EKEA 2WTUA 2OTLN 3OYGA 4K8ZA 3H6EA 3WXLA 3DOLA 2P9UB 3VERA 1QHAA 4ELVA 5AQPA 3NF7A 2HNZA 1DKGD 3RRHA 4OPHA 4KFBA 2W42A 5HP1A 4J8FA 4YDUC 3MXMA 1EO1A 3W3DA 1TK8A 1L3VA 1C1AA 3IG1A 4HTLA 1SAZA 4AF1A 3D2FB 4E3SA 4CGHA 3SAHA 5B8HA 4FM0A 3KD1E 2UXDK 3DAWA 3WXIA 2RPIA 5MLCQ 1DTTA 4NXMK 2Z1GA 4N76A 1J5OA 2QTDA 3RR7A 1SKWA 5BRFA 3J8AA 1HYVA 3K9JA 4IEIA 1Q82O 1NM1A 3TARA 1U48A 2QWNA 3O6WA 4FWNA 2ZJQL 1N36K 4I9LA 4FOEA 5KRTA 3CCSN 2O8EB 1QSLA 4FVUA 4NYFA 1JLCA 4CF0A 3RSEB 1KAXA 4GNIA 2GWJA 4X62K 3RMBA 4KHQA 4MLEA 1RTIA 3AVIA 4DTUA 5CYQA 2G8IA 1S9EA 2FF6A 3IUCA 1YI2N 3AVAA 3BF1A 5A2QO 1C0FA 3VQDA 3OYBA 4AQYK 5AFUA 4L8RB 4HCBA 1Q86O 3O9SA 4CGDA 3SAGA 3AVNA 1VSMA 2QWQA 4E89A 4CJKA 3Q7CA 4BR2A 4H03B 2E4LA 3MCAB 4HTUA 4CIEA 3CG7A 4M3XA 1ZBHA 3OS0A 3OYAA 2QWPA 3S41A 3I33A 3H3NO 4JKCA 4JD2A 1NKBA 4CJUA 4CEQA 3J80O 3SUQA 2O8DA 4IXCA 3L3VA 4WQ4A 1WAJA 3LDOA 4CVNE 4E7IA 1VSLA 3DRSA 4FOIA 3EYZA 1T3VA 4C8MA 4XH4A 2D1KA 2YCHA 1N6QA 1XNQK 2E88A 1RDDA 5I42A 4N41A 3VN5A 1VQ7N 2PBDA 1VQ5N 5FRMA 3SV4A 3VQAA 3LPUA 2P5OA 4YDUA 1X9WA 1REVA 4O55A 4DV7K 1ZBIA 3KD5E 1WB9A 3CJ7A 4H5RA 3TAQA 1NK6A 4A5AA 1VRTA 3PO5A 4CHPA 2QK9A 2D4WA 4QS9A 5J2QA 4V19S 2ZGYA 4DG1A 2GBZA 1J9AA 2VYPA 2DPNA 3QFUA 4LH5A 1C6VA 1EETA 2I7NA 3RWUA 1GLLO 1JLEA 1KVBA 3KZBA 4IDHA 2OANA 2J4RA 3U8XA 5EVZA 3A0IX 3J81O 3H46O 3A2FA 1FJGK 2WFBA 4FLUA 3M3ZA 1R59O 1RILA 5DM7L 1S9GA 4YOYA 3T3FA 3THYB 4FJJA 3CC4N 1TK0A 4IOCL 1WSHA 5EY4A 4CE9A 2BDPA 3FZKA 1IKYA 4CJ3A 2KQ2A 3MWPA 3CFOA 4GKKK 3DMJA 3QFPA 2QWRA 1HKGA 3TPQA 4JK8A 3HVRA 3BGRA 3AVCA 5M1KA 3P31A 1JXEA 4LF6K 5AZIA 3VQ4A 1T03A 2FSJA 3CMEN 3NMUA 3EZWA 1WN7A 3ZX3A 3SUPA 3VQ9A 2GX9A 4PWDA 3L8BA 2NZTA 3AVMA 4JKGB 1K8AO 4HCCA 3LP1A 3EN9A 4DHYA 2C1IA 4B1ZA 1YVNA 3LP3A 1X3NA 4W5RA 2X74A 5AQGA 1NK7A 1M1KO 1VQMN 3OYEA 1QQOA 3CD6N 3U4LA 1VQPN 1YXQA 1ASWA 4CJ7A 1VSFA 4W5QA 1NGJA 3QNOA 3KK1A 1XHZA 3UKRB 5GAEP 2X6SA 3J7ZO 4W5OA 1T6CA 4BR0A 4FLWA 3PIOL 3KK7A 1WBBA 3SJHA 3CFPA 4BDYA 3BP8A 2XRIA 4LFBK 4FK0A 4CHOA 2ASMA 1JLGA 2RHKA 4DV1K 1NJWA 1WSGA 2P9IA 2VG5A 1HUXA 1G99A 1EQYA 4GY2B 3D0PA 1W0HA 3IMXA 2QW9A 3AA2A 3HTVA 1U6ZA 1KFDA 3WXMB 1TKXA 1Q18A 5LY3A 3ZSXA 2A42A 3V6DA 1N8RO 4AHCA 4GV6A 1MDUB 2D0PA 3E66A 4PA1A 5AJ3K 5HRRA 3FLCO 4ILJA 2P9PA 1IV0A 5DM6L 3DLHA 1NKEA 4FYDA 2H3GX 3RTVA 4DU1A 4Q5VA 1RT3A 2NNWA 5FROA 3DXMB 1XI1A 4KTQA 4KHYA 2YNHA 4GV9A 3MDQA 3AA4A 1YITN 1HKCA 2CGJA 3G0ZA 1JL1A 4FJHA 2F96A 5C24A 1HYSA 1B9DA 1SV5A 1A5WA 4FXDA 3VQEA 3AY9A 1RBVA 3PX4A 3AGRA 4HUFA 3ZETA 2FSKA 5FPMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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