3SJHA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-29) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 18-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp-latrunculin a
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
b'TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein, protein binding
total genus 120
structure length 357
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3sjhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3sjhA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3sjhA03
3H6EA 3KHYA 4LC9B 3EL2A 2P9NB 1YXQA 5F2RA 3D2FA 3P4IA 4H03B 3GBTA 4JD2A 3VOVA 4PL7A 3A5OC 4NB4A 3DXMB 2YI1A 1C0GA 3WEEB 1NGDA 3ATVA 2QWPA 1HKGA 3VEYA 4QS7A 1XC3A 4B1YB 3SLCA 2DPNA 4ISFA 1SQKA 1BOTO 1NBWA 1E4FT 2J4RA 3VERA 1EQYA 2GELA 1GLAG 3VGLA 1ESVA 3M3ZA 2FSJA 2UYTA 4FOEA 2P9SB 4PKHA 2YHWA 3O08A 4JN4A 3GOIA 5CE3A 5KPRA 2P9IA 3OHRA 4BRMA 3L6QA 1NWKA 3O80A 3RSEB 5AQXA 2PAVA 3WXIA 1GLJO 4BC2A 1K8KB 3GL1A 4H0VB 4BG9A 1MDUB 3VEWA 1HKBA 1T6DA 4BGBA 4EIAA 3ZETB 5AQSA 3H3NO 5BN9A 4IO8A 2Q97A 4CI6A 4BR5A 5AQQA 3CQYA 3BUZB 3LM2A 3VENA 5BPLA 1MWMA 2P9PA 4FWKA 1NGCA 4BREA 2A40A 3VPZA 4IXCA 4RTFD 4PL8A 2P9NA 2NLXA 5BRFA 3D2EB 3SK3A 3MDQA 4BRFA 3O4WA 3UKUB 3CJAA 4O8KA 2E20A 5KQDA 3DXMA 4H0TB 4BROA 1NGJA 3GE1A 1NGAA 4M63C 1NGGA 5I9EB 3O5BA 3CJ1A 3CETA 1NGFA 1YUWA 2ASPA 1TUUA 3I33A 2A6AA 4XH5A 5ADXH 3C7NA 4BRLA 5AQKA 2E1ZA 2GUPA 3D2FB 2FSKA 5LJVA 4IJNA 3AARA 4XEIA 5AFUA 3MCPA 2QM1A 1TUYA 4I6MB 5BRHA 4JD2B 1ZBSA 3R8EA 2QW9A 2V7YA 3IMXA 4FO0A 3FGUA 4PKGA 5EXWA 4Z94A 5JMVA 3RSEA 4J8FA 4L3QA 1KAYA 5FPEA 2GTDA 1K8KA 2ZGZA 5AQUA 4CBXA 4CZMA 2Q31A 1IG8A 5AQNA 5FPNA 4B1WB 2QWLA 5BPMA 1IJJA 2ZWHA 3BEXA 4B1VA 3C0BA 1WOQA 3VGMA 4CZFA 3D2EA 5BR9A 2KHOA 1QQOA 3UKUA 2P9IB 4CJ7A 3HM8A 2GWJA 4BG8A 1BWFO 1BO5O 3BF1A 3A5LC 2D4WA 5AQWA 5EX5A 3LDNA 5AQPA 4CD1A 4FPAA 3FZFA 5AQTA 2E8AA 1GLDG 3HTVA 4BQZA 2P9PB 3VETA 4F9OA 3VF2A 2BTFA 3CQXA 4FWPA 4CZEA 1U6ZA 2FLOA 1QQMA 3EKUA 2W41A 4CBWA 4BRPA 4JNEA 3VGKA 4B1XB 5EY4A 2AA4A 4I6MA 2Q0RA 3HSCA 4EAHD 2I7NA 3WXLA 3HZ6A 4H5TA 1JCEA 3U8XA 3CJCA 4WQ4A 4M7XA 4WQ5C 5KPZA 2Q2RA 3O8MA 1RDWX 3C7NB 3QICA 2QWOA 4BR9A 4DHYA 3EKSA 4FSVA 4RCHA 3TPQA 3JXUA 1GLBG 3FR0A 4YDUA 3WXJA 3U4LA 4FWQA 4BRGA 5BREA 2CGJA 5E26A 2CGKA 1JCGA 1R59O 3I8BA 3DXKA 4H5WA 2D1KA 3VF6A 3ZX0A 4H5VA 4WQ4C 3GDQA 3MK6A 2ZF5O 5AQMA 3FZMA 4DCHA 2FXUA 1NGEA 1ATSA 3CJBA 3AY9A 3ZX3A 4DB3A 1KAXA 2YCHA 3M6GA 4WYBA 3FFKB 1HUXA 1S3XA 1SZ2A 2IIRA 3IFRA 2V51B 4YDUC 1T6CA 4JHDB 3FZKA 3HBTA 4BRIA 3UKRA 3J8AA 3O1BA 5KQ8A 3LDPA 1WUAA 3BF3A 1HPMA 3WT0A 2IVNA 2QWRA 2WUSA 3H45C 1X3MA 3A0IX 4QS8A 3SMSA 2F9WA 3A5MC 2FF3B 1CZAN 5JLHA 3EO3A 1S22A 4NO7A 3W3DA 3CIPA 2E2PA 4H0PA 3R9PA 2YJFA 4BR4A 2ASMA 2F9TA 3MN7A 5FPDA 4BGAA 1Z05A 3MN5A 1DEJA 3UB5A 1BU6O 4O5FA 5JICA 2NRHA 1XQSC 3MN9A 2YHXA 3WXKA 3A5NC 4CZJA 1GLLO 4BC4A 3VEXA 5F0XA 3EN9A 4MLEA 1HJOA 5AZIA 4AM6A 3LDLA 3L0QA 4FWMA 5AQVA 4CZHA 4EHUA 1TYQB 4MLHA 4A2BA 1DGKN 2W40A 4BVPA 3FLCO 4RWTA 2QWMA 5BPNA 2ASOA 1ZC6A 4FWRA 4FOIA 5AQHA 4B9QA 1X9JA 5BN8A 3LM9A 1ZXOA 1JCFA 5AQRA 3G25A 4K42A 4JHDA 3D7EO 3O1WA 1HLUA 2CH5A 2HF4A 3DXKB 4BC5A 3O6WA 4CZKA 2BUPA 3AAQA 1MWKA 3DJCA 4AM7A 2P9KB 3WQUA 4FL9A 3M1FA 3WUHA 3QDKA 4WQ5A 3U9DA 2QXLA 4ISGA 4KBOA 5AFUH 3ENHA 1GLFO 3CI5A 1NGIA 5FPMA 1MA9B 3IUCA 1BA1A 1Q18A 2GEMA 4IWVA 3KVGA 3ZEUB 1Y64A 3S41A 3UE5A 5BRDA 5AQOA 4A61A 5AQGA 3TU5A 3UKRB 2E2OA 2E2NA 4A62A 4BRHA 2VYPA 4CZGA 4ISEA 3CERA 5ELZA 4EHTA 1HX1A 3ATUA 4FWSA 2P9UA 5AZJB 2HF3A 2D0OA 1NLVA 3QB0A 3FZLA 1P8ZA 2P9LA 5F1XA 2E88A 1V4TA 1TYQA 4BRDA 5TKYA 4IJAA 4BRKA 1YVNA 4C23A 2VCPA 4QS9A 1SAZA 4H0YB 2CGLA 3R6MA 4EFHA 5EVZA 4H5RA 1E4GT 4BRNA 2A3ZA 5B8HA 1Z6RA 2ZGYA 3H1VX 1KXPA 3LDOA 4MO4A 1QHAA 3CHWA 5AQZA 3LDQA 3JS6A 5AR0A 1QQNA 2P9KA 4BVOA 5AZIB 4K43A 1XUPO 4FWNA 2VWBA 2GWKA 3ULEB 4E1JA 3AAPA 4CBUA 5LJWA 3LL3A 1YAGA 4JAXA 2V52B 3VEOA 4IZ9A 1ATNA 5ADXA 3VF4A 1H1VA 4FPBA 3VEZA 4B1ZA 3ZEUA 2A41A 2E2QA 5AQYA 2IVPA 1BDGA 3IDHA 5AQJA 2Q0UA 3F9MA 1KAZA 3WQTA 1QZ6A 4BQLA 4GNIA 4PKIA 3QFPA 4CZIA 3CJ7A 3KZBA 3U9ZA 5AZJA 1GLEG 4BRAA 3EZWA 4HTLA 3GG4A 3MMVA 1U2VB 4K25A 2V7ZA 3ZX2A 3QFUA 1D4XA 1QZ5A 1X3NA 1BUPA 4BRQA 3H3OB 3VESA 4A2AA 4H0OA 2HOEA 1J6ZA 3HI0A 3VEVA 2AP1A 1HKCA 3WEEA 5AQIA 3DWLA 3W0LA 4H5NA 4CZLA 1V4SA 5AQLA 4DQ8A 2A5XA 2P9UB 1LCUA 3BP8A 4M7YA 1BG3A 2P9LB 3ULEA 2E1YA 2NZTA 3B8AX 3H1QA 3A8YA 2FSNA 4H0XB 2P9SA 3SMPA 3DAWA 1G99A 4XH1A 1ATRA 2QWNA 1RFQA 1NGHA 2OANA 1RGIA 2Q1NA 3ID8A 2YHYA 3FZHA 1BA0A 5AQFA 2IVOA 5KPTA 2Q36A 2H3GX 1LOTB 1NM1A 3ZETA 4FWLA 3L4IA 1C0FA 2HMPA 2YJEA 2A42A 1OKJA 5E84A 4K41A 4MO5A 3MN6A 4BRCA 2ITMA 1U2VA 4Y0WA 1NGBA 4XH4A 3ENOA 2EWSA 4CD3A 2FF6A 1NMDA 5EOYA 5LY3A 2PBDA 4BR7A 4FWOA 3FE1A 4GY2B 1T44A 2I7PA 2CH6A 1GLCG 2QWQA 1DKGD 3QBWA 3QMLA 3SJHA 4BC3A 3QBXA 3CJ9A 2D0PA 3H46O 5JLFA 4BR0A 4B1UB 4BR2A 4HWIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AA4A 3LWLA 2HHQA 3E1YA 3CFRA 1Q9XA 1GOCA 2A1SA 4B9MA 3VQ8A 4H03B 3TARA 1WB9A 1JLEA 4LF7K 4IOXA 4JD2A 2PYLA 1RNHA 3WEEB 1KSPA 4O5BA 3PO5A 3DLRA 1HKGA 1S9GA 3MX2A 2DPNA 4ISFA 3RRHA 4M41A 3VERA 1E4FT 4K8XA 3OVNA 3LANA 4DV1K 1Q7YO 1Q82O 3IS9A 4FOEA 3LPUA 2BH1A 4CJ4A 3T19A 1TL1A 4Q5VA 4CF9A 4JN4A 3GOIA 1NWKA 1FKPA 1C6VA 4OPAA 4BC2A 4OKEA 5FLXO 4BDPA 4CIEA 2VGMA 4H0VB 5HRPA 3VEWA 4FJGA 1T6DA 4BGBA 4FJXA 3H3NO 2Q97A 4CIGA 4CI6A 1ZBHA 3LM2A 3VENA 5HP1A 1MWMA 2D0CA 2P9PA 3RRGA 2HW3A 4BREA 2A40A 3M8PA 5I3UA 4JI3K 2NLXA 3BZKA 3D2EB 1NKEA 1RT7A 4FLVA 4F2SA 4XJXA 1VSJA 4KREA 1JLQA 4H0TB 4CEFA 3J7ZO 1SKRA 2XY6A 4FM0A 4DQRA 3B6PA 3VN5A 1YUWA 2FBTA 1QSYA 4ILHA 5M1PA 3AVNA 1TKDA 2E1ZA 2GUPA 3D2FB 3OYFA 4XEIA 5AFUA 1X9WA 3CC2N 4E19A 1IKYA 2YKNA 3SJJA 1ZBSA 4AHRA 3AO3A 3OY9A 3K59A 4DTXA 3NMUA 3M8QA 3IMXA 3AGKA 1SKSA 3ZLJA 4M3ZA 3RSEA 4L3QA 4FVUA 3VQCA 2GTDA 2ZGZA 4OPJA 2Q31A 3V9SA 4C8MA 1IG8A 5AQNA 4DV3K 4NXNK 1VSFA 1N6QA 2JGUA 3NH0A 1JLCA 3BEXA 5J2PA 4E72A 2HNYA 2KHOA 3UKUA 1YJ9N 2P9IB 3HM8A 2GWJA 4G9ZA 3BF1A 3C6AA 4B9UA 4CGFA 4JKBA 2E8AA 2O8BB 4JKAA 3HTVA 4DQIA 4X62K 4Z4IA 1EKEA 4DSKA 1VQKN 3OYCA 4FJ9A 3CQXA 1SL2A 2YNIA 4CZEA 4HUEA 4RW6A 4DV0K 1O1WA 1T03A 3D6RA 4JNEA 2AA4A 4I6MA 2DFHA 3HSCA 3LAMA 5C15A 1U4BA 4KI4A 3OYBA 4AH9A 4JKFA 3U8XA 4LF4K 2ZJPL 3V6DA 4M3TA 4OX9K 2PFUA 4MDBA 4M7XA 2KKZA 2QKBA 4RW9A 1QSLA 3C7NB 4ZTFA 3EKSA 4NLCA 4FSVA 4CGJA 1S1WA 2X6NA 4CJ5A 3JXUA 1VSDA 3FR0A 4R79A 3R3LA 4FWQA 1ITGA 1VSHA 5BREA 1B92A 2RPIA 4M42A 1LAWA 4H5WA 3RVCA 4B9SA 3C95A 4WFBL 2ZF5O 5AQMA 4IOAL 4DCHA 1N36K 1NGEA 1ATSA 1NK9A 2YCHA 3M6GA 1XWLA 1IKXA 3ZT4A 3IFRA 1F21A 1T6CA 4JI5K 3NF8A 3J8AA 3O1BA 3K58A 3LZIA 3WT0A 1RDAA 2IVNA 1IBMK 3OYDA 2XHBA 1CZAN 5JLHA 3PSIA 4H0PA 4EP4A 1NG9A 2OPRA 2ASMA 4KKOA 3SCXA 4KTZA 4DV2K 2F9TA 4KH6A 1LWEA 3CQ8A 1RCHA 4O5FA 3CPEA 3MAQA 3WXKA 3CYMA 3C6TA 4CFDA 3L0QA 3O9SA 4HTUA 1UA0A 1S1TA 4G1QA 1HPZA 4A2BA 1YTUA 3NF6A 2C1IA 1DGKN 4FZXC 3SAGA 2W40A 3S3OA 4JK7A 4BVPA 1ZBLA 3LPTA 4B9LA 3PSFA 4JI7K 3VQEA 5BN8A 3LM9A 5AQRA 4JLHA 1MU2A 1ILYA 3IRXA 4JI1K 1VK0A 5TKWA 3O1WA 2CH5A 2HF4A 2OPPA 3DXKB 3SZ2A 4ELTA 1RT3A 1QS4A 4OKKA 2BUPA 3AAQA 4A5BA 1XHZA 1OH8A 3WQUA 4DSIA 3WUHA 3OYNA 4ISGA 1S72N 1HNZK 3TR8A 3ENHA 2G8WA 3DLLL 1GLFO 3CMEN 4AILC 3Q7BA 3OBWA 5C0YA 2XY5A 3G10A 4YOYA 1HYVA 1HRHA 1BA1A 2JWLA 1Z25A 3HT3A 1J9AA 2A1RA 4DFKA 3S3NA 2YKMA 3F5TA 4JI0K 1Y64A 3UE5A 5BRDA 3DRPA 3D45A 4J2DA 3UKRB 2E2NA 4CZGA 4EHTA 3ATUA 4FWSA 2P9UA 5AZJB 2IC3A 3QB0A 3ZSXA 3SAHA 5SWMA 1P8ZA 5M1OA 4OVLA 4CFAA 3OYLA 5M1KA 2PY5A 4FJMA 3KJVA 3AVLA 4E7LA 2P1JA 1YVNA 4CJQA 1WSEA 5EVZA 3DLKA 4BRNA 1Z6RA 3H1VX 3JYTA 1KXPA 5AQZA 3K9KA 3JS6A 1RTHA 3ULEB 3K9JA 3U3GA 5DK5A 3LL3A 2GV9A 3ITHA 3VEOA 1KVAA 3HPGA 4CEEA 4IZ9A 2G8IA 1YT3A 5ADXA 4DS5A 3VEZA 3ZEUA 3KLIA 5CY4A 5LL6Z 3THWA 1BDGA 4DTPA 1BCMA 4GNIA 4PKIA 3CCVN 2G8FA 3EZWA 1XI1A 4JYAK 3MMVA 1S6QA 3QFUA 2ITGA 3OBYA 4B3OA 4EP5A 3L2WA 2NRXA 1KCFA 1NJXA 4DU3A 3CG7A 3QESA 4BRQA 3SI6A 3VESA 3TAEA 1EX4A 2HOEA 1J6ZA 4OLBA 2AP1A 1HKCA 3WEEA 5AQIA 3W0LA 4CJUA 3NHGA 3VQ7A 4E7KA 1J5EK 1XMQK 2HBJA 2Z1GA 2W42A 5C25A 4BECA 1QVGM 3RTVA 4E7IA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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