3SJHA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-29) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 18-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp-latrunculin a
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein, protein binding
total genus 120
structure length 357
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3sjhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3sjhA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3sjhA03
3KHYA 3D2FA 3QB0A 4O5FA 4H03B 4JNEA 3VEZA 1QZ5A 3L6QA 4M7XA 5KPTA 3O1BA 3OHRA 3WXIA 4BC2A 2ZGZA 1TYQA 1XC3A 5ADXA 1K8KB 4FWNA 1JCGA 3C7NA 4BC5A 3HBTA 3HSCA 3AAPA 2P9IB 2P9UB 1HKCA 2P9KA 3ENHA 5BPMA 5I9EB 1NGFA 4FOIA 5AQIA 1BO5O 1DGKN 3ZX3A 4FSVA 1BU6O 3CQXA 3HZ6A 4RTFD 4BRCA 1YXQA 3CETA 5AQPA 2P9NB 1U6ZA 3VGKA 4FL9A 4KBOA 3RSEB 2V52B 4XH4A 1IG8A 2A41A 3SMPA 3HI0A 2ASPA 5AQUA 2IVPA 3CJ1A 2FSKA 4BR2A 4JD2B 1QHAA 4C23A 4CZHA 5BR9A 1BUPA 2QWLA 5AQYA 1RDWX 1RFQA 1DEJA 5ELZA 4E1JA 3R9PA 1BA0A 5BPLA 4BGBA 1BWFO 2E2QA 1NMDA 3A5LC 4YDUC 4FO0A 5JLFA 3DXMA 3S41A 4HTLA 1HX1A 2CGJA 2HMPA 3A0IX 3ULEB 3EN9A 5LJVA 4A62A 2GTDA 4FPAA 5AQQA 5AQZA 3O4WA 1Z6RA 3EL2A 3MK6A 5BRDA 2HF4A 3L4IA 2E8AA 2Q97A 3AY9A 4FOEA 4JHDB 5EVZA 4BR0A 3VEVA 2A5XA 3VETA 4PKGA 5AFUA 3FZLA 3EZWA 4GNIA 4I6MA 1HKBA 1H1VA 1ZBSA 5BPNA 3AARA 1C0GA 1BA1A 1GLLO 3JXUA 5F2RA 3MMVA 5BN9A 4BC4A 1HJOA 4FWOA 3WEEB 2IVOA 5EOYA 2CGKA 4LC9B 2D4WA 4WQ4C 4ISFA 3MN6A 3UKUB 1WUAA 3U9ZA 1YAGA 3FGUA 3LDLA 3D2EA 5AR0A 2E1YA 3GOIA 1MA9B 1ZC6A 4H5WA 5FPMA 3JS6A 4BRMA 2FSNA 4QS9A 3VPZA 2QWRA 3A5NC 3UKRA 1NGAA 1QQOA 3R8EA 3EKUA 1YVNA 2CGLA 2F9WA 4RCHA 3U9DA 3W3DA 2PBDA 2DPNA 4EHTA 4BR5A 3FZFA 1ATRA 1EQYA 4BG9A 4GY2B 2P9IA 2P9UA 3H3OB 3WUHA 3GL1A 1NGGA 4PL7A 2NRHA 3IMXA 4WQ5C 1GLJO 3P4IA 4H5RA 4CZLA 1KXPA 5BRFA 5JLHA 2Q1NA 2P9SB 1YUWA 2OANA 2IIRA 2IVNA 2Q2RA 3C0BA 4ISEA 4A61A 4BR4A 3MCPA 4H0TB 1TUYA 4BQLA 3QICA 1XUPO 1X3MA 3ZX0A 4XH5A 4K43A 5AQFA 2P9NA 3TPQA 3RSEA 2D0OA 4BRDA 3O80A 3U8XA 5BN8A 2V7ZA 1HPMA 4BVPA 3I33A 1J6ZA 4H0YB 3J8AA 2I7PA 3O1WA 3O5BA 3VF2A 3LDOA 1D4XA 3G25A 2FSJA 3D7EO 3CIPA 3A8YA 3QFPA 3VERA 2VCPA 2A6AA 4BRPA 1SAZA 3SLCA 4H0PA 3DWLA 4IWVA 3ZETB 5KQDA 3CI5A 2W41A 3CJ9A 4JAXA 3ULEA 2F9TA 3GBTA 4CJ7A 4IO8A 3QFUA 5AQKA 2KHOA 2Q31A 4EFHA 1KAXA 4XH1A 5E26A 1NGEA 3MDQA 3ENOA 5B8HA 4BRNA 2P9PB 2GEMA 4JHDA 4FWRA 2BUPA 3LM2A 1WOQA 4H5NA 3BF3A 4EAHD 5FPNA 3B8AX 3CHWA 1Q18A 5BRHA 2P9LB 2NZTA 1X9JA 5AQSA 4AM7A 2A42A 4K42A 3QMLA 4HWIA 3WEEA 2E1ZA 5AQHA 2FXUA 5FPDA 4H0VB 5AQGA 4J8FA 4K41A 3UKUA 4MLHA 5ADXH 1G99A 4BRKA 3VEYA 4IJNA 4BREA 1R59O 1TYQB 4BRQA 1GLDG 4CZEA 3F9MA 2FF3B 1GLFO 2BTFA 4FPBA 3H1VX 3M1FA 1ZXOA 4O8KA 2A40A 2QWOA 3GG4A 5EXWA 1JCFA 1HLUA 3IDHA 4BR9A 4CD3A 3MN7A 2VYPA 5AQRA 1RGIA 1DKGD 1E4GT 3VF6A 3ZX2A 2YHYA 3VENA 5EY4A 2CH6A 3H1QA 1V4TA 3MN9A 3UE5A 4CZGA 2V7YA 2NLXA 4YDUA 5AQMA 4BGAA 3CJCA 3H46O 3CJAA 3DXKB 2P9SA 2GWKA 4DQ8A 3MN5A 4H0XB 4BRAA 1LOTB 1QZ6A 3TU5A 4FWMA 4H5TA 5TKYA 2H3GX 1NM1A 5AZIB 3H6EA 4B1YB 1GLEG 1MWKA 3VGMA 3A5MC 3W0LA 1S3XA 4IXCA 2YCHA 3ATUA 4QS8A 2YI1A 1MWMA 1K8KA 3U4LA 3FZMA 1OKJA 3GE1A 3O6WA 4B1ZA 1NBWA 2E20A 5AQNA 1GLBG 2Q0RA 4BROA 3BUZB 3EO3A 3SMSA 3BF1A 3CJ7A 5AQVA 1HKGA 2FF6A 1T44A 1LCUA 4WQ4A 4B9QA 4BRLA 4XEIA 4M63C 3ZETA 3DAWA 1QQNA 4EHUA 4BVOA 1ATNA 1E4FT 2WUSA 3O08A 4WYBA 3WT0A 1GLAG 2E2PA 2P9PA 4PKIA 1SQKA 3CERA 2QWNA 3QBWA 5AZJB 2ASOA 4JD2A 4F9OA 1KAYA 5AQLA 1S22A 4CBWA 2AA4A 2GWJA 5AQOA 2D1KA 3LDQA 4B1VA 3ZEUB 4L3QA 4B1UB 2P9LA 4DCHA 4WQ5A 1BG3A 2HF3A 3UKRB 4H0OA 4Y0WA 3WXLA 3IUCA 3LDNA 3LDPA 5E84A 3H45C 3AAQA 3WXJA 2AP1A 3FZKA 1NWKA 2ZGYA 3FFKB 3FZHA 3QDKA 2GELA 3ID8A 2Q36A 5AQXA 4Z94A 3VEWA 5LJWA 1MDUB 2ASMA 1NGCA 1T6CA 4BG8A 4CZJA 4DB3A 4CZFA 2PAVA 1U2VB 2QXLA 1T6DA 3WQTA 4NB4A 2J4RA 3LM9A 4FWKA 5F0XA 2YHXA 4MO4A 3D2FB 1TUUA 2Q0UA 1HUXA 2QWMA 3QBXA 2W40A 3DXKA 2V51B 4NO7A 4BRHA 2YJEA 4QS7A 3H3NO 4B1XB 4IJAA 1ATSA 3FR0A 3C7NB 3A5OC 5LY3A 3SJHA 2D0PA 5AZIA 2E88A 2QM1A 1XQSC 4A2BA 5CE3A 5KQ8A 4EIAA 2HOEA 2P9KB 3CQYA 4H5VA 1P8ZA 3WXKA 4CZMA 1NGBA 5KPRA 3IFRA 5FPEA 1BOTO 4CBXA 2ITMA 1X3NA 3M6GA 1Y64A 3O8MA 4B1WB 4IZ9A 3KVGA 4K25A 5F1XA 2I7NA 4CZKA 1SZ2A 2VWBA 1NGHA 3I8BA 2QWQA 2CH5A 3VOVA 3KZBA 2YHWA 2QWPA 4PL8A 4ISGA 4FWSA 4BC3A 3VESA 1CZAN 3EKSA 2E2OA 4BRFA 3FE1A 1NGJA 1GLCG 2FLOA 3FLCO 4BRGA 3UB5A 3DXMB 2GUPA 3DJCA 5AQTA 3VEOA 5AZJA 4CD1A 4AM6A 4M7YA 4FWPA 1NLVA 3HM8A 3SK3A 4MLEA 2ZF5O 4BRIA 5KPZA 2UYTA 5JMVA 1NGIA 5BREA 3ZEUA 3BEXA 4MO5A 3VGLA 1KAZA 4CBUA 1C0FA 2EWSA 5AFUH 1BDGA 2QW9A 3GDQA 4RWTA 5AQWA 3R6MA 2A3ZA 3BP8A 4A2AA 4DHYA 1ESVA 4I6MB 4BR7A 4CZIA 4CI6A 1IJJA 1JCEA 4FWLA 4FWQA 3ATVA 3VEXA 3HTVA 4JN4A 1Z05A 3VF4A 1V4SA 3L0QA 3WQUA 5EX5A 3M3ZA 1QQMA 1U2VA 2ZWHA 3LL3A 4BQZA 3D2EB 5AQJA 5JICA 4PKHA 2E2NA 2YJFA 1NGDA 3CJBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KV8A 4ILJA 3D2FA 1OH8A 4H03B 1RT1A 3CFPA 3VEZA 1QZ5A 3L6QA 5M1QA 4M3RA 5KTQA 3J81O 4DTUA 3LP1A 5HRRA 4BC2A 4FWNA 4CGJA 3P1GA 3HBTA 2YHBA 3HSCA 2GBZA 3OYEA 5C0YA 2YKMA 5BPMA 2YNFA 1BO5O 5FRNA 4FSVA 1TKDA 1BU6O 4WE1A 1TL3A 4BRCA 3D0PA 4CECA 1N36K 2O8DB 3TAPA 4IG3A 4I9QA 2V52B 1IG8A 2UUAK 2ASPA 2UUBK 2IVPA 2FSKA 4HUEA 4FK4A 4QAGA 2BH1A 2D0BA 1NMNA 1RDWX 4E1JA 4IEIA 3AVGA 3TABA 3A5LC 4FO0A 3HJFA 3MAQA 3AGRA 4RW4A 3S3NA 2NRXA 3I56N 3ULEB 1HNVA 4WFAL 1T8EA 4FM0A 5AQZA 1OH5A 1Z6RA 4DV5K 1O13A 4GKJK 2VG5A 4YOUA 2JGUA 4DSEA 3AY9A 5A2QO 3L8BA 2WOMA 3NVMA 4BR0A 1DTQA 1IKWA 5AFUA 1TK8A 4GNIA 3EZWA 4I6MA 5KRTA 4Q0BA 4DQIA 2OPRA 4KHSA 1H1VA 4CERA 1Q8IA 1TL1A 4KTQA 3AARA 1C0GA 2QXFA 3JXUA 2IOCA 4B9MA 3O4NA 5BN9A 2Z1JA 3RRGA 1YTUA 3F2KA 4M41A 3VQDA 4CGHA 2CGKA 4B9NA 3UKUB 3U9ZA 3T1HK 2XY6A 3BDPA 4H5WA 3O9QA 1IBLK 4AHUA 4GW6A 4AQYK 1WSJA 2QWRA 3A5NC 4IG0A 5HBMA 4JI6K 3RMAA 4IEEA 1YHQN 3EKUA 3TTDA 4FYDA 4NCBA 3U9DA 5GAHP 4EHTA 5CYMA 1ATRA 5DMRA 4GY2B 3H3OB 3GL1A 4PL7A 2NRHA 2HHWA 5C2FA 4CJ3A 4F3TA 5JLHA 2Q1NA 2OA8A 2Q2RA 4A61A 4BR4A 4DQRA 4A5AA 1TUYA 4BQLA 3HRGA 4XH5A 1XC9A 2O8DA 4W5QA 3O80A 3U8XA 1HPMA 3THVA 1KFDA 3MCAB 3DM2A 1B92A 1D4XA 3HO1A 2P5OA 4O0JA 2FSJA 4CJVA 4OKKA 2YHAA 3SV3A 2UXBK 4X62K 4K8XA 1JL1A 4I7FA 4C8NA 3PX6A 3NGZA 1QSSA 4IWVA 1KVBA 3QNOA 3VQAA 2A1SA 3ULEA 4DU1A 1HR0K 5AQKA 4EFHA 1QSLA 5JVGL 3LALA 4W5OA 5B8HA 4DV6K 3AO1A 3HVRA 1TK5A 2ETJA 1C0MA 1XNRK 1IKVA 4H5NA 3BF3A 3LP0A 3R3LA 4EAHD 4DFKA 5FPNA 1BGXT 3ZT0A 4L8RB 1RTIA 2KZMA 5J2PA 4DR6K 3F73A 4BE7B 5AQSA 4CJPA 1KTQA 4DQQA 2G8HA 4H0VB 4CK3A 4JS5A 3UKUA 4MLHA 2RF2A 2W6KA 3VEYA 4NLBA 3L2UA 4DR2K 1JLAA 1VQ7N 4DTRA 2QWOA 1BCOA 1HLUA 3IDHA 4BR9A 1S1VA 3MN7A 3NAEA 3TR8A 4DFJA 3QERA 3ZSWA 2XHBA 1RTHA 1DKGD 3VF6A 2YHYA 3VENA 4CJLA 3SPZA 3H1QA 2NRWA 4DTNA 1SS6A 4CZGA 4BWMA 2Z1IA 5AQMA 3CMEN 3CJAA 3RR8A 4TSXA 2HBMA 4DQ8A 4BRAA 1NK4A 1QZ6A 3THYB 2H3GX 3LAMA 5H1SQ 1MWKA 2VWJA 3WNGA 2G8IA 3W0LA 2HHXA 5CR4A 1CZ9A 4FJ9A 4IXCA 4UY8O 1SL2A 1RT7A 1X1PA 3PSIA 4BECA 3OYMA 3WNHA 3G10A 3ZYYX 2NNWA 3B6PA 2PFUA 3FZMA 4E7HA 2WBNA 3NHGA 2FBXA 4BROA 4C8KA 4OVLA 1J54A 2FF6A 1T44A 2XY7A 1TAUA 4OGCA 4WQ4A 3AA2A 4DU4A 1HRHA 4LSLA 4M63C 4O55A 3DAWA 1YJWN 3ZSYA 3NF7A 1IKXA 4N5SA 3G6EN 4KB0A 3WT0A 4LF8K 3DI6A 2OZSA 2UU9K 4LH5A 4PKIA 5GIPA 3CERA 2G8WA 4F9OA 4FJIA 3THXB 1D5AA 2FC0A 3ZEUB 4M3ZA 4CFAA 3P31A 4DCHA 4KB1A 1RBRA 4YOYA 1TKTA 3QETA 1YF5L 4KTZA 3SBGA 3PIOL 3L2RA 1DTTA 1I39A 3FZKA 2ZGYA 3FZHA 3WXJA 4AILC 3OS2A 1TKXA 4N56A 4JI7K 4DSFA 5FLXO 4DG1A 4Z94A 5LJWA 1MDUB 4Z4GA 4CGFA 2XRIA 3C6UA 4RW6A 4CZJA 4DB3A 2PAVA 2YV0X 2QXLA 4ILHA 4ID5A 2J4RA 4FWKA 5F0XA 4JK8A 1Y97A 4JI5K 3QBXA 3T7ZA 1UAXA 4JKFA 4BRHA 1HNZK 1WAFA 3MECA 2Q3SA 3C7NB 4O8UA 4LSNA 3SJHA 3RMCA 2HOEA 4CK1A 4DV4K 1NJYA 4FJ8A 2G8FA 3CQYA 4ZHRA 4CZMA 5KPRA 3E9LA 1X9MA 1YIJN 1KQSM 1VRUA 4CBXA 1VQ8N 3M6GA 5CY4A 5M1OA 4KHYA 2ZM6K 2I7NA 3NCIA 2AJQA 4BEBA 2GV9A 4B8CA 1U4BA 2VWBA 3CD6N 3OYDA 1WSGA 3KZBA 2YHWA 4DTPA 2VQFK 4ISGA 1EWRA 2XY8A 2Y1JA 4XJXA 3AVCA 2HNDA 1WBBA 4JK9A 3RTVA 1BISA 1NGJA 5IT9O 3S3OA 2PYLA 4BWJA 3DXMB 5BR8K 3V81A 5J2QA 1O1WA 3HXMA 4CD1A 1C6VA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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