3SJHA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-29) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 18-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp-latrunculin a
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein, protein binding
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 120
structure length 357
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3sjhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3sjhA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3sjhA03
3UKRA 1R59O 3VGLA 4BREA 3TPQA 3UB5A 3FZHA 2V52B 3WT0A 2IVNA 2P9UB 5AQKA 3UE5A 1GLEG 1K8KB 2QWOA 3WEEA 1RFQA 3CJ9A 4CI6A 4PKHA 1OKJA 3A8YA 4GY2B 3H1VX 3FGUA 2Q1NA 5CE3A 4RCHA 5F0XA 3O6WA 1U2VA 5BRHA 1QQNA 4A2BA 2ZGYA 3OHRA 3CIPA 1V4SA 3CERA 4B9QA 1TUUA 5AQJA 1QHAA 3I33A 1BOTO 2QM1A 2QWNA 1P8ZA 4B1VA 4MO5A 4BVOA 4WYBA 4FWLA 4FWOA 4H0VB 3EKUA 3QBXA 3CQXA 5BPNA 1SZ2A 4RWTA 1EQYA 2ASMA 3C0BA 4A2AA 1BUPA 2P9SA 3MDQA 4JD2B 2P9KB 4FSVA 4B1UB 3FZKA 4FWKA 1NGGA 5EVZA 3FZFA 2E2PA 1QZ6A 3BF1A 4FWNA 1NWKA 3C7NB 3UKRB 2ASPA 3LDQA 4CZGA 1GLFO 1NGCA 4BRLA 4GNIA 2VYPA 1ZBSA 3FZMA 4PL8A 2J4RA 4BG8A 5KQ8A 4IO8A 4JN4A 1HKCA 4ISGA 2FF3B 3VENA 3WEEB 2HF3A 4O5FA 1JCFA 1HUXA 5BR9A 2YJEA 2P9LA 1JCEA 3EZWA 3J8AA 1GLLO 4BRPA 1ATRA 3LDLA 5AQRA 4BGBA 1U2VB 2QWRA 3VERA 2QWPA 4H5RA 4H0YB 4PKIA 5ELZA 4BRMA 4EIAA 2Q97A 2A40A 2QXLA 4XH4A 3LDPA 1BG3A 4YDUA 3VGMA 3A5LC 1LCUA 2CH5A 3WQTA 3ZX3A 2ZF5O 1U6ZA 4EAHD 2QWLA 1NGIA 4CZKA 4FWSA 5AQTA 3FE1A 1BA1A 4WQ5A 3VGKA 3D2FA 2DPNA 2P9SB 3VESA 4BC4A 4WQ4C 5LJWA 2YHXA 3B8AX 2NLXA 1NGHA 5AR0A 3VEVA 3MCPA 3CETA 2GTDA 3MMVA 1GLDG 1Y64A 5TKYA 4O8KA 5AQOA 5JMVA 4H0TB 2IIRA 4BGAA 4H03B 3F9MA 3HI0A 2W41A 2HF4A 5BRDA 5LY3A 1ZXOA 2QWMA 3O80A 4MLEA 4BRFA 1V4TA 2P9LB 4BRAA 3S41A 4KBOA 3WUHA 3CJ1A 3QB0A 1NLVA 1C0FA 1G99A 2W40A 3LM2A 4BC2A 3R6MA 3EO3A 3U9DA 2ITMA 3DAWA 4BC5A 2VWBA 2A41A 3LM9A 3QICA 3VOVA 3MN7A 2OANA 4B1WB 4RTFD 4JNEA 4H5TA 3LDOA 3AY9A 4BRQA 2KHOA 3CI5A 3O4WA 3H45C 1QZ5A 2E1ZA 3D2FB 5AZIA 3HBTA 4BVPA 5EY4A 4BQLA 4A62A 5KPTA 4IXCA 4AM6A 5LJVA 3O8MA 4J8FA 1IG8A 1IJJA 2V7YA 4FPAA 1Z05A 3ID8A 2FF6A 3QDKA 1S22A 1JCGA 4DQ8A 4BRDA 3H3NO 3UKUA 1J6ZA 3O1WA 1HKGA 2ZWHA 4LC9B 4BR5A 2E2NA 1YAGA 4H0XB 5AQMA 4B1YB 4H5VA 1ATNA 2GUPA 3RSEA 1X3MA 1Q18A 3HZ6A 3VEXA 3A5MC 1HKBA 5KPZA 5KPRA 1T6DA 2V7ZA 3W3DA 1NGDA 3WXJA 2EWSA 2ASOA 3L4IA 2E1YA 2IVOA 1E4GT 1NGEA 4XEIA 4AM7A 1BA0A 3MK6A 3O08A 5EX5A 2ZGZA 3CQYA 2Q2RA 4CBUA 4BG9A 1D4XA 1HLUA 4FWQA 4XH1A 5AQUA 5AZJA 2E20A 4EHTA 2CGKA 4CZEA 1DGKN 1QQMA 5FPEA 3MN9A 2FSKA 1XC3A 4E1JA 5AZIB 3DXMA 3A5OC 2A42A 1S3XA 1ATSA 4F9OA 4BC3A 1WOQA 4IJAA 1BO5O 2E2OA 3D2EA 4Y0WA 1BWFO 1BDGA 3M1FA 4FOEA 5JLHA 2I7PA 1KXPA 3VEZA 5FPDA 5F1XA 3SMSA 4B1XB 2YCHA 3UKUB 4Z94A 3WXKA 1T44A 3VF6A 2YHYA 3VF4A 4A61A 1RGIA 2PBDA 3ZEUA 1CZAN 1KAZA 2A5XA 3RSEB 2BTFA 3GL1A 4PL7A 4FOIA 4BRGA 3AAQA 2F9TA 5AQGA 4BRKA 5AFUH 2VCPA 3HTVA 1ZC6A 3LDNA 3LL3A 1YXQA 1MA9B 4CJ7A 2GELA 4H0PA 3ATUA 3BEXA 4QS8A 4BR7A 2V51B 4PKGA 3CJBA 4BRHA 3GOIA 5AZJB 3SJHA 1GLBG 3ENHA 1E4FT 3KVGA 4K43A 2A6AA 3CHWA 1MDUB 1WUAA 3QBWA 4HTLA 4BROA 3JS6A 4CBWA 1HJOA 2FLOA 4BQZA 3DJCA 3DXMB 3HSCA 3BUZB 4C23A 3JXUA 4JAXA 2HMPA 3FFKB 3GE1A 2CH6A 3D2EB 1TYQA 1T6CA 3U8XA 1NMDA 3ZETA 3BF3A 3FLCO 2IVPA 4M63C 4CD1A 4BR9A 2E8AA 3HM8A 4YDUC 3DWLA 2YJFA 1HX1A 4B1ZA 4H5WA 4K42A 5AQYA 1DEJA 3DXKA 1YVNA 3QFUA 3ZEUB 3M3ZA 4H5NA 5AQVA 4CZFA 5BRFA 4BRCA 5E84A 1GLAG 2D4WA 5E26A 4HWIA 2E88A 2YHWA 2UYTA 1SAZA 5JLFA 3G25A 4BRNA 1C0GA 2D0OA 3O1BA 1NGFA 3CJCA 3ULEA 2F9WA 5AQLA 4ISFA 4BR2A 1Z6RA 5ADXH 4NO7A 3FR0A 4FWRA 3SMPA 4IJNA 1NGJA 3R8EA 2FSJA 1X3NA 3M6GA 3ATVA 5AQZA 3SLCA 2A3ZA 3EKSA 1QQOA 5AFUA 1NBWA 2P9NA 4FWMA 4BR4A 3KZBA 5BREA 5AQPA 4K41A 1TYQB 5BPLA 3VF2A 3VETA 5I9EB 3ZETB 1MWMA 5AQWA 5F2RA 1X9JA 1H1VA 2NZTA 4CZHA 4MO4A 2D1KA 5AQXA 3GG4A 4QS7A 1NGBA 1GLJO 3GBTA 4L3QA 3DXKB 5EOYA 3VPZA 4DHYA 3L0QA 5KQDA 2QWQA 3ZX0A 3AARA 2Q0RA 4DCHA 3VEWA 3VEOA 3A0IX 5AQIA 2CGJA 1ESVA 4M7YA 5FPMA 2BUPA 2FXUA 3U4LA 5AQQA 3ULEB 4BR0A 4WQ4A 3WQUA 3H6EA 5JICA 1SQKA 2GWKA 4JHDA 3ENOA 2HOEA 2Q0UA 4M7XA 2P9IA 4I6MA 1XQSC 2I7NA 3CJ7A 3SK3A 3EL2A 2E2QA 3H1QA 4CZMA 1MWKA 5FPNA 1HPMA 1GLCG 2P9NB 2YI1A 3FZLA 3O5BA 4CBXA 4MLHA 2AA4A 3MN5A 2WUSA 4CD3A 2P9PA 1NGAA 4FWPA 4CZLA 5AQSA 3L6QA 5ADXA 2GWJA 3R9PA 3I8BA 2FSNA 2GEMA 5B8HA 3H46O 3EN9A 2H3GX 3AAPA 3ZX2A 3BP8A 4DB3A 1KAXA 3CJAA 3P4IA 3WXIA 3U9ZA 3H3OB 4EFHA 1LOTB 2NRHA 3QMLA 2P9UA 4IWVA 4FO0A 3TU5A 3IUCA 5BN9A 1K8KA 3IDHA 5AQHA 1BU6O 3D7EO 4NB4A 3MN6A 2AP1A 3W0LA 1XUPO 4EHUA 4CZJA 5EXWA 2PAVA 3VEYA 5AQNA 4JHDB 5AQFA 4ISEA 3A5NC 3QFPA 3IFRA 1NM1A 2Q36A 2P9IB 1RDWX 4I6MB 1TUYA 2Q31A 2CGLA 4FL9A 4FPBA 4K25A 5BPMA 1YUWA 4WQ5C 3KHYA 3GDQA 1DKGD 2D0PA 4H0OA 4XH5A 2P9PB 2QW9A 4BRIA 4JD2A 4CZIA 2P9KA 3WXLA 4IZ9A 5BN8A 3IMXA 4QS9A 1KAYA 3C7NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3UKRA 1R59O 2V52B 2IVNA 1Y97A 1YVUA 4YOYA 4B3MK 2QWOA 5GIPA 4A59A 3OJUA 1OKJA 5F0XA 3DLBA 5BRHA 2ZGYA 4G9ZA 3CERA 4B9QA 3ZYYX 5JENA 4ZTJA 4DSJA 1QHAA 3I33A 4F4KA 4CK2A 2QM1A 2QWNA 4JRPA 2O8CB 3ZT3A 4FWLA 4PHTX 4H0VB 3NDKA 3EKUA 4C1NI 4LD0A 3CQXA 4R5PA 4A2AA 1JLQA 3G71N 1REVA 5KTQA 2P9SA 3MDQA 2FBTA 4DSKA 4DV1K 4DV4K 3V9ZA 3L2UA 3FZFA 4AF1A 1G15A 2E2PA 4FWNA 3C7NB 3CCJN 3UKRB 4DSIA 4CZGA 4GNIA 3FZMA 2OZSA 4AHSA 2J4RA 1D5AA 4JN4A 2P5OA 2IS3A 3VENA 4CJEA 4JI5K 4CHZA 4CGDA 3SBTA 5BR9A 2YJEA 1JCEA 3EZWA 4BRPA 1GLLO 3IS9A 1ATRA 1VSKA 1EP4A 4CIGA 4CGJA 4H0YB 3MCAB 3CFPA 1IBLK 4EIAA 3TAFA 3OYLA 4B9MA 3B6PA 3DI6A 2KTQA 1LCUA 3V6DA 3VQ5A 2I5JA 4QOZB 3MXJA 4DV6K 4ID5A 3FE1A 1BA1A 1CXUA 4CJSA 1M1KO 1N33K 3AVJA 4CGIA 3D2FA 2P9SB 5MLCQ 4BC4A 2OPSA 2EHGA 1NGHA 5AR0A 3BDPA 3CCEN 1BQNA 2GBZA 1VSFA 4OKJA 1TAQA 2XY6A 1C1AA 2GTDA 3MMVA 3J7AP 1ITGA 5AQOA 5JMVA 4H0TB 2IIRA 3C6TA 3Q7CA 4CK1A 4RW4A 2W41A 3DOKA 1VQ9N 3LZIA 4BRFA 2QEXN 4ILJA 4BRAA 1WBDA 2QKBA 4IDHA 4O44A 3KKRA 5CYMA 1J53A 1G99A 4IO9L 3R6MA 3VQBA 2ATQA 1RTIA 4DUYK 4DU4A 3DAWA 1WSEA 3CD6N 4WFBL 1KTQA 3LM9A 3O3HA 1N34K 2OANA 4B1WB 4JNEA 4CJTA 3CPEA 1S1WA 4BE1A 3OBYA 3V1QA 3O4WA 1YJNN 2E1ZA 3D2FB 1TGOA 5AZIA 4BVPA 3LANA 4A62A 4I2QA 1U4BA 1SS6A 1JLCA 4AM6A 4DS5A 1SL1A 1IJJA 3O3GA 4FPAA 2DTUA 4F3OA 3CCQN 2FF6A 1OH8A 1JCGA 5GAEP 1J6ZA 3MWPA 4CF2A 1W0HA 4CHOA 3SUPA 4B8CA 3L2QA 4FYDA 3AO1A 5KPRA 4DR1K 4WFAL 2ZM6K 1SV5A 1T6DA 4JKHA 2V7ZA 4MDAA 4CJKA 3O9UA 3SV4A 3P38A 2ASOA 3L4IA 2IVOA 1BA0A 3MK6A 4MQ3A 5C2FA 4YFUA 3RMBA 1VSJA 4NXMK 3SQ1A 1HLUA 4FWQA 3CCRN 5J2PA 3AO5A 1JLAA 1RNHA 4CZEA 1RBSA 3T69A 3VQ8A 4QCLA 1XHZA 3L2VA 2O4IA 1WLJA 1E3MA 3MN9A 2FSKA 5AZIB 3DXMA 3A5OC 1S3XA 4BC3A 1BO5O 1BWFO 1BDGA 4IG3A 5JLHA 3QEWA 2I7PA 2BANA 1XNQK 1KXPA 5FPDA 1NK7A 1X1PA 4JYAK 5DM7L 3QEXA 2FBVA 3WXKA 3TAEA 3DRSA 1EKEA 1T44A 4TSXA 2PBDA 1NMNA 3ZEUA 1CZAN 1Q8IA 3AVAA 4C8OA 3AAQA 1CZBA 5AFUH 3HTVA 4LSLA 3OY9A 3LDNA 1YXQA 3WXMB 1MA9B 1LW0A 1HNZK 4E7KA 4H0PA 3HO1A 3E9PA 3VQ6A 4BR7A 2OPPA 3NGZA 3CJBA 1TKXA 1Z25A 3GOIA 3SJHA 3D45A 3KWGA 4KH5A 4DTJA 1MDUB 4HTLA 4H4OA 4BROA 2UXCK 1VQLN 2FLOA 4BQZA 3K5OA 3HYFA 3DXMB 4MDBA 4M41A 3RRGA 4A5BA 5DM6L 4OO1J 3KK3A 1BGXT 3GE1A 4B9SA 4CESA 3HSTB 4C1NK 3V1OA 1B9DA 3A2FA 3ZETA 3FLCO 4M63C 3LDSA 4DMNA 1HX1A 3P1GA 1Q82O 3TAGA 4H5WA 1ZBFA 3DXKA 1YVNA 2F8TA 3ZEUB 4HTUA 4DTMA 1VSIA 4PA1A 4Y1DA 3F2KA 1SUQA 4GVEA 5E26A 2QXFA 4B9LA 4LFBK 2E88A 4CGFA 3SQ4A 3KKSA 3SI6A 1TL3A 3HXMA 4CEAA 4OGEA 4OPAA 1NGFA 2VG7A 3VN5A 1YT3A 3ULEA 4BDPA 2F9WA 1W9HA 1TV6A 5AQLA 4CJUA 4ISFA 3ENBA 4BR2A 5SZTA 3EYZA 5ADXH 3Q7BA 5FLXO 1DT9A 4FK2A 1KSPA 3LALA 1I39A 2KFNA 3SQ2A 4KHWA 5LL6Z 3CMAN 2A3ZA 1UWBA 3NH2A 2O8DA 2A1SA 3LWMA 5FROA 5CR4A 4E7JA 1SL0A 5FDLA 4I9QA 4C8MA 4GV6A 3ZETB 4DR3K 1JXEA 2HHSA 2HNDA 3SPZA 1BI4A 4QS7A 1NGBA 3GBTA 4JS5A 3NVKA 4M3RA 4CCHA 3DXKB 3VPZA 1KFSA 4WF9L 3PO5A 3HM9A 4NCGA 3OYAA 3A0IX 3CCUN 1K9MO 4R79A 4HHTA 1WSIA 4M7YA 5FPMA 2NRVA 3ULEB 3F5TA 4WQ4A 4FZYA 1T03A 2Z1HA 3H6EA 4CFBA 5C25A 5M1FA 1SQKA 4JI6K 3ENOA 4DTOA 1NU0A 4KHUA 3AO4A 4I6MA 3AV9A 4AH9A 1C0UA 4N76A 3EL2A 2O8DB 4CEOA 5FPNA 3PX6A 2IDOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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