3SJHA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-29) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 18-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp-latrunculin a
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein, protein binding
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 120
structure length 357
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3sjhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3sjhA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3sjhA03
1QQNA 3WUHA 2Q36A 3CERA 1WUAA 1P8ZA 5EY4A 4H0VB 2I7PA 3WQTA 1U2VA 1NGHA 3FZHA 3EL2A 5AQVA 1GLFO 3GBTA 2P9SA 1XC3A 3OHRA 3ULEB 2YHXA 4PKIA 1D4XA 3SLCA 4EAHD 1WOQA 3AAPA 4BR2A 2E2OA 4HTLA 5I9EB 2F9WA 2A42A 5F1XA 3VF6A 2PAVA 4BG8A 2P9LA 4BREA 3S41A 1HUXA 5BPLA 4BGAA 2AP1A 2P9IA 4AM7A 2V7ZA 2P9PA 3WXJA 4H0XB 3ULEA 3CJ7A 3O80A 4NB4A 1HX1A 2E1ZA 5E84A 3CJAA 1NGAA 4C23A 4FWKA 3VEOA 1KXPA 1ATRA 3QFUA 2QWLA 1RGIA 3GG4A 5KQDA 4JNEA 4MO5A 5E26A 3FZMA 4Z94A 2ZF5O 4IJNA 3VERA 4H0PA 5ELZA 2GTDA 5AZJB 3BP8A 2GEMA 4MLEA 4BG9A 4A62A 4BRLA 5JICA 1Z6RA 3EKUA 2NLXA 1JCEA 2QWNA 4PL8A 2QWQA 3WT0A 1SQKA 1OKJA 2P9UB 4NO7A 3VEVA 3VETA 4CZEA 1H1VA 3SK3A 5AQJA 2ASMA 1KAXA 5AQYA 2YCHA 4QS7A 1DGKN 2D4WA 4H5TA 3A5LC 3FZLA 2OANA 1CZAN 3I33A 3DWLA 1DEJA 3CQYA 4O5FA 3UKUA 4CD1A 3FLCO 3L4IA 4F9OA 3LDOA 3HZ6A 5FPMA 3AARA 4FWNA 5BPMA 3MN5A 2F9TA 3SMSA 1T6DA 4BC2A 1J6ZA 2FXUA 2IVNA 1LCUA 4H03B 4MO4A 1TUYA 1ATNA 1Q18A 4FWOA 3EN9A 3WEEB 4BRKA 4AM6A 1EQYA 4BR5A 2UYTA 1X3NA 1QHAA 4H5NA 1GLAG 2VWBA 1HKGA 3L0QA 5AQIA 1DKGD 1NMDA 2QWPA 3C0BA 4A2AA 4IO8A 4XEIA 3KZBA 1V4SA 3M1FA 5F0XA 4XH5A 3O5BA 4CBXA 4YDUC 3D2FB 3KVGA 2PBDA 3QDKA 4BRPA 4EHUA 5EVZA 3G25A 3H45C 4B1WB 2IVPA 1NGFA 2QM1A 3ZEUA 2CGLA 4ISFA 4H5RA 1NGGA 5AQHA 3VEYA 5AQQA 2FSJA 3GDQA 3R9PA 4RTFD 4M7XA 5AQGA 3AY9A 2QWRA 4A2BA 5AQZA 2J4RA 3CJBA 4PKGA 3MDQA 5BRHA 2P9KB 3VPZA 5FPEA 1NWKA 3VF4A 1TYQA 1K8KA 3CETA 1QQOA 4GY2B 1MA9B 3ENOA 4DCHA 5BPNA 4K41A 1QQMA 4WQ4A 3A5MC 4B9QA 3TU5A 3ZX0A 4FWSA 4QS9A 1X9JA 4H0YB 3MK6A 1C0FA 4FOIA 4L3QA 3H46O 3FZKA 1RFQA 3FFKB 4FWPA 2Q1NA 3VOVA 2NZTA 1HKBA 3SMPA 4FPAA 2DPNA 2ASOA 3H1QA 1GLBG 2GWJA 1Z05A 1KAYA 4A61A 2QWMA 4H5VA 3JS6A 2V7YA 3O4WA 2A6AA 3DXMB 4JAXA 4JHDB 4WQ5C 4EHTA 2W40A 3VEXA 3HTVA 3I8BA 1S3XA 3HM8A 4IXCA 3BF3A 4BC5A 1MWMA 3C7NA 3BUZB 4M63C 5BR9A 5AFUH 4K25A 3ZEUB 4H0OA 5AQSA 3QFPA 2FF6A 5CE3A 3LM9A 3MMVA 1IJJA 2A40A 3FGUA 1HKCA 3D2FA 3VF2A 4I6MB 2CGKA 4CZHA 3IFRA 1GLEG 2YHYA 3ZETB 3LDQA 3W3DA 1T44A 2HF3A 2FLOA 3GL1A 2E88A 3EO3A 3HBTA 5LY3A 3EZWA 1X3MA 4BRQA 2D1KA 2HF4A 3LDLA 1ESVA 4CZJA 1BU6O 2YJEA 1BOTO 2BTFA 4BRCA 4BR9A 2Q0RA 4DQ8A 3BEXA 3GOIA 4FWRA 5EX5A 1NGBA 3SJHA 1V4TA 1YVNA 2A5XA 2YI1A 2GWKA 1E4GT 3ATVA 3LDPA 1GLDG 3U4LA 3RSEB 4B1VA 3EKSA 1ZXOA 2P9IB 1NLVA 3FE1A 4B1ZA 2HOEA 4DHYA 1TUUA 1BUPA 3QMLA 4WQ5A 2Q2RA 5KPZA 2P9LB 5BRFA 2AA4A 3R8EA 4BRDA 5LJVA 4BRAA 3D2EB 5AQLA 3ID8A 1YUWA 5AQKA 5AQXA 4CJ7A 2P9UA 3QBWA 5EXWA 4QS8A 2WUSA 3GE1A 3A8YA 3IUCA 2P9SB 3KHYA 1LOTB 3JXUA 3MN6A 5KPRA 2D0PA 3UKRB 5BREA 1U2VB 5FPNA 3MN7A 4Y0WA 2E2NA 4DB3A 3O08A 3O1BA 3U9DA 3P4IA 1SAZA 4CZMA 3VENA 3A5OC 4BGBA 4BRHA 3WXKA 5KPTA 1BWFO 4RCHA 1XQSC 4K43A 1S22A 4FO0A 3J8AA 1MDUB 1T6CA 3A5NC 1U6ZA 4H5WA 2ASPA 2HMPA 4PKHA 5BRDA 2VYPA 3UKRA 1YXQA 4BRIA 3ZETA 3A0IX 2D0OA 1ATSA 1C0GA 4BVOA 2P9PB 4CBUA 4I6MA 5AQFA 3H3NO 2E2QA 3ZX2A 3D2EA 4ISGA 3WXIA 3O6WA 2E1YA 2FSKA 4XH4A 4JD2A 1BA1A 5AQOA 3U8XA 2E8AA 3C7NB 2BUPA 2QWOA 2YHWA 4FSVA 3U9ZA 3DXKA 4IWVA 1RDWX 1BO5O 2VCPA 4JHDA 3UE5A 1QZ6A 3HI0A 1BDGA 3CHWA 1MWKA 1YAGA 4B1UB 4BRFA 2IVOA 3RSEA 2A41A 3DAWA 3CIPA 3IDHA 4CZIA 4FPBA 1NGIA 3IMXA 3M6GA 1GLJO 2EWSA 5AZIA 1JCGA 2V51B 3QICA 4K42A 5LJWA 2P9NB 4CBWA 4MLHA 1HLUA 1G99A 5EOYA 3H1VX 3O1WA 3VGMA 4CZLA 3M3ZA 5KQ8A 3VGKA 2KHOA 2GUPA 5AQRA 3FR0A 5JLFA 1NGEA 2H3GX 5ADXH 5AQMA 1NBWA 3LL3A 2YJFA 4BRGA 2Q0UA 2ITMA 2FF3B 5TKYA 3VEWA 4BC3A 3WXLA 4B1XB 4BR7A 3R6MA 1TYQB 3VEZA 2P9KA 4FOEA 4WYBA 2GELA 4H0TB 1XUPO 2E20A 5JLHA 4WQ4C 3MN9A 4BRNA 2QW9A 3CQXA 2W41A 3W0LA 5F2RA 5FPDA 4CZKA 5AQTA 2Q31A 4FWLA 1Y64A 3ZX3A 4PL7A 3DXMA 3O8MA 4FWQA 1QZ5A 4KBOA 2NRHA 4E1JA 2ZGZA 3AAQA 4HWIA 1JCFA 1R59O 3ATUA 3VGLA 3D7EO 4BRMA 4BQZA 1KAZA 3CJ1A 3ENHA 4M7YA 1GLCG 5AQUA 4BC4A 1ZBSA 3HSCA 4B1YB 1NGDA 3BF1A 3WQUA 3LM2A 3B8AX 5BN9A 1ZC6A 4LC9B 5AZIB 4IZ9A 4XH1A 4CZGA 3CJ9A 3H6EA 2E2PA 3QBXA 4GNIA 1K8KB 4O8KA 1BA0A 5ADXA 1NM1A 4BQLA 1GLLO 1BG3A 4YDUA 2FSNA 3UKUB 4CI6A 4BR4A 5AR0A 3F9MA 3DXKB 1IG8A 3VESA 4BVPA 4EIAA 3DJCA 2CH5A 5AQPA 2CH6A 4CZFA 3FZFA 4ISEA 4BROA 4JD2B 2QXLA 4FWMA 5AFUA 2V52B 2ZWHA 1E4FT 4BR0A 5B8HA 1HPMA 2ZGYA 1NGJA 5AQNA 5AQWA 3QB0A 4CD3A 4RWTA 5JMVA 3L6QA 4JN4A 3MCPA 4FL9A 5BN8A 2Q97A 1SZ2A 3TPQA 2I7NA 2IIRA 4EFHA 3CJCA 3UB5A 5AZJA 1NGCA 4J8FA 3CI5A 4IJAA 2A3ZA 1HJOA 3LDNA 3H3OB 2P9NA 3WEEA 2CGJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GKKK 5JVGL 3FZHA 4E1NA 4C8LA 3EL2A 4CERA 3QEIA 3GBTA 3QINA 4J2EA 3SZ2A 1HNVA 2YV0X 1JLFA 2ZJPL 1IBLK 3RWUA 1RBVA 4HTLA 3HPOA 3F5TA 5F1XA 3I55N 2ZM6K 4BREA 2HBLA 5BPLA 1NJIO 1WSHA 4BGAA 2AP1A 4YOTA 4IOCL 2OTLN 1VQMN 3L4QA 4IDHA 3ULEA 1NKCA 3DLHA 1C1CA 4BE1A 4DLEA 4F8RA 4BE0A 2NUBA 4KH6A 2ZD1A 4G9ZA 3LANA 1HYSA 1KSPA 5C2DA 1KXPA 1DT9A 1LWEA 2QWLA 3CC4N 3AVKA 4WF9L 1YJNN 4B8CA 4CGDA 4DR1K 3CCLN 4F4KA 3O9UA 3VERA 4H0PA 1T03A 4FZXC 3BP8A 4BG9A 3THYA 4E0DA 1BHLA 4JK7A 4LD0A 1L5UA 4CE9A 4XJXA 4W5RA 3O9TA 4PL8A 4LF7K 2P9UB 1IH7A 1CZ9A 1VSMA 1Z26A 3VETA 1W0HA 4X66K 1H1VA 5AQJA 3T7ZA 3QETA 3RMBA 4JI2K 1A5VA 1HQUA 2PFUA 1WAFA 4AQYK 3NVMA 3AA3A 3FZLA 3CPWM 1CZAN 4I2PA 4FW2A 4AHSA 4CD1A 3VQCA 4FJNA 2W00A 5FPMA 4E89A 1CXUA 3AARA 5BPMA 1S1WA 4KREA 4YOXA 4BWMA 3AA5X 1T6DA 5C24A 1J6ZA 1QE1A 1VQPN 2HHWA 1TL3A 4OO1J 1VQNN 4H03B 1TUYA 4E7KA 4BRKA 4CEFA 1VQ9N 2PZSA 5FLXO 2JWLA 1EX4A 4FK2A 2X78A 4ILHA 1X3NA 1QHAA 3G0ZA 1RTDA 1GLAG 4KHUA 5FRMA 2VWBA 2ZJQL 3TTCA 4I9QA 5HL7L 1N32K 3C0BA 2HMIA 4A2AA 1NKEA 4IO8A 4XEIA 4XH5A 3OBYA 3NF7A 4RW9A 4CHOA 4W5NA 1P90A 1NGFA 1W9HA 4ISFA 4M3UA 4H5RA 1NGGA 5AQQA 4O55A 3JAMO 2YNGA 2O8BA 4RTFD 4M7XA 1YTAA 2UXBK 3AY9A 3O9SA 4IFYA 4FJLA 2RHKA 4EZ9A 3I0SA 2J4RA 3CJBA 3EY1A 3DM2A 1GOAA 1UAXA 3CETA 4FJKA 1QQOA 1MA9B 4OKEA 4WQ4A 1IKXA 1YTUA 1J54A 4WFAL 3SQ2A 2ZJRL 4M3ZA 1VQ7N 2PYLA 4FLVA 3AVNA 4MFBA 4DUZK 3L2VA 1QSLA 3WXMB 5D3GA 1IKVA 4OPJA 4QCLA 4DQPA 2D0CA 2QWMA 3JS6A 2V7YA 3O4WA 4CGJA 4IOAL 4C8MA 3VEXA 1S3XA 3HM8A 4IXCA 4CFCA 1VSKA 5AJ3K 3C7NA 3LWMA 1J9AA 3K5NA 4IO9L 5AQSA 2G8HA 5C10A 3QFPA 1ITGA 3MMVA 4FJ5A 3FGUA 4YOVA 4I6MB 4PUOA 2CGKA 4CZHA 3U3GA 3IFRA 4ELVA 1GLEG 1HNWK 3AO1A 4J2AA 4O44A 2HF3A 3GL1A 1OVQA 3EO3A 3OJUA 2HHHK 3J7AP 4I9LA 5LY3A 3EZWA 1X9MA 3KWIA 4BRQA 1WSFA 4KTZA 4N5SA 3J7ZO 1BOTO 2BTFA 2YNIA 3T19A 3RRHA 3N4QA 4RG8A 5JENA 1IBKK 5HRSA 3CFRA 2X6NA 1XC9A 4GMJB 3OYIA 3D6RA 4CJTA 3NH1A 1I39A 3OYMA 3LDPA 4KTWA 4ELTA 4FJXA 4B1VA 2Y1JA 4AHCA 1BI4A 1C1AA 4B1ZA 1NLVA 3HSTB 4FM0A 3QMLA 4KB0A 1C0MA 3R1XA 2F8TA 5KPZA 1WSGA 2HHIA 2AA4A 3RVCA 2RE2A 2WFBA 3TSPA 3ID8A 3RR7A 4Q0BA 5AQKA 2Z1HA 2NRWA 4X62K 3P83D 2C1GA 4ELUA 2KW4A 1UOCA 2UUBK 3JXUA 3DLRA 4DR5K 2D0PA 3UKRB 1JLGA 1HNXK 5FPNA 3MN7A 1JLQA 3LP0A 4YORA 3O1BA 3RMAA 2R7YA 1SAZA 4CK2A 4CJEA 4DR3K 4DKWA 1BWFO 4RCHA 1XQSC 4FJIA 1S22A 4FXDA 4B8AB 3A5NC 4FJ7A 2YKNA 2VYPA 3UKRA 4AHRA 1B92A 5DMRA 3CD6N 2BDPA 3NH0A 4DR4K 2W6KA 3ZETA 3A0IX 3CCQN 1ATSA 4CBUA 2P9PB 4DTUA 1VSEA 2D0BA 3ZX2A 3TARA 3UIQA 4DLGA 2P51A 3AVCA 4LF8K 3U8XA 2D5RA 4MDAA 3SBGA 1IKYA 2BUPA 4FSVA 2VCPA 4CHZA 4CW7B 4M3XA 3KTQA 1YAGA 2OZMA 4FZYA 1MU2A 2KZMA 4AHUA 4K0KK 3HVRA 4DWIA 3ID6A 4CZIA 3IDHA 1I3AA 1REVA 1KCFA 2NRXA 3IMXA 3KKRA 1NG9A 3HL8A 4JKCA 4Z4HA 3HXMA 3QICA 3K5MA 4FCYA 3H1VX 3O1WA 4BDZA 4J2BA 5KQ8A 2KHOA 3SNNA 3CMAN 1XNQK 3V1RA 4CF9A 1ASWA 3SQ4A 2YJFA 3T1HK 2Q0UA 3R3LA 5K14A 4FLYA 1NJXA 3WXLA 4ILGB 4B1XB 4BR7A 1TYQB 3ZYYX 3VEZA 2P9KA 3NCIA 4WYBA 2GELA 4IBNA 3PX0A 3MN9A 4KI6A 3E9OA 2W41A 3W0LA 3TAFA 5AQTA 3RTVA 1Y64A 3O8MA 1QZ5A 1LAVA 2NRHA 2ZGZA 3NBPA 1JCFA 1YVUA 4ID5A 4HUFA 3O3HA 3LP2A 3NF9A 3U3YA 4CIEA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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