1C0FA

Crystal structure of dictyostelium caatp-actin in complex with gelsolin segment 1
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
368
structure length
367
Chain Sequence
b'DGEDVQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEAEMQTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the higher Ca(2+)-activation of the regulated actin-activated myosin ATPase observed with Dictyostelium/Tetrahymena actin chimeras
pubmed doi rcsb
molecule keywords GELSOLIN SEGMENT 1
source organism Homo sapiens
molecule tags Contractile protein
total genus 124
structure length 367
sequence length 368
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1c0fA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1c0fA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1c0fA03
4NB4A 5FPNA 1U2VA 5EOYA 3OHRA 3LM2A 3DXKA 1DEJA 3C7NA 2QWMA 4FOEA 2P9UA 3FE1A 3VGKA 2YHWA 2P9NB 4PKIA 4CD3A 1YAGA 4J8FA 3KVGA 4M63C 5AQJA 3AARA 5AQMA 1MWKA 3GDQA 4C23A 4Z94A 4K42A 3VETA 3ZEUB 2E2QA 3EL2A 5EY4A 3KZBA 3F9MA 4FPAA 3R9PA 1BWFO 1E4GT 2A5XA 2UYTA 1X3NA 5I9EB 2BUPA 4M7XA 1V4SA 4GNIA 1KAXA 3O6WA 5AQOA 5BPMA 2IVPA 2GTDA 4JAXA 1QQOA 2YJEA 5JICA 4HTLA 4JHDA 4BR2A 1GLBG 2VYPA 3H46O 1ZXOA 4BR7A 3MMVA 5AZJB 1K8KB 3KHYA 5BN8A 1MDUB 3ENHA 3O1BA 5AQHA 3FZKA 4CZHA 3EO3A 4DQ8A 5AQPA 4BRGA 1HPMA 1GLJO 3MN9A 5AQYA 4BC2A 1T6CA 4CBWA 4HWIA 1U6ZA 2P9SA 5JLHA 2P9LB 3H3OB 3A8YA 4CZIA 2GUPA 3O8MA 1TYQA 3IFRA 1RDWX 4BRMA 4BC4A 4EFHA 5BRDA 3H3NO 1BDGA 4I6MB 1JCGA 1JCFA 1MWMA 5AFUA 3VGMA 1ZC6A 2H3GX 3FZFA 3WEEA 2E1ZA 4MO4A 4CBUA 3QBWA 4FWRA 3ULEB 2Q0UA 1C0GA 3CJAA 4FSVA 4H0XB 4BG9A 4BG8A 4AM7A 4FWSA 3WXKA 1RFQA 4BC5A 2HMPA 1NBWA 1QHAA 4FL9A 5E84A 2F9WA 2V52B 2P9IA 3TU5A 4CI6A 3S41A 3LDQA 3EKSA 2E2PA 3JXUA 3VEXA 1S22A 3RSEA 2ZGYA 5FPEA 3A5MC 4DCHA 2FSNA 2QWNA 3DXMA 4IJNA 4K43A 1JCEA 3A5NC 1ZBSA 4FWLA 3QDKA 1T44A 5F1XA 4CZKA 1NGIA 2QWPA 5AQKA 1QQMA 2AA4A 1GLDG 1Q18A 2P9KB 3DJCA 1LOTB 3QB0A 3CERA 3CETA 5AZIA 5EVZA 3VEZA 1QZ5A 1Z05A 4PKGA 3WQTA 3FFKB 5AQVA 4H0VB 2IVNA 1NGCA 4H0PA 5EX5A 5KQ8A 2AP1A 3H6EA 2QXLA 1V4TA 4ISEA 1XUPO 3U4LA 4B1YB 5LJVA 2IIRA 1HUXA 2FSKA 1Y64A 4CZFA 1J6ZA 4AM6A 1NLVA 3W0LA 3DXKB 4B1XB 3C7NB 2CGJA 2P9UB 2YCHA 3QBXA 4K41A 2CGLA 2IVOA 2V7YA 4H5NA 5F2RA 3FZMA 3VESA 4A2AA 3UE5A 3QMLA 3M1FA 3UKRA 2ASOA 2Q2RA 3LDPA 5AR0A 3G25A 1MA9B 1NGAA 3VEVA 1X3MA 5BR9A 3EZWA 2Q31A 3R6MA 4O8KA 1NGBA 1G99A 1BA1A 4IWVA 2NLXA 4JHDB 3MN7A 4A2BA 2A6AA 5AQNA 3W3DA 3SMSA 4CD1A 2A42A 1SQKA 1NMDA 3H45C 4BR0A 3FGUA 1BOTO 4EAHD 5KPTA 4CZJA 1QQNA 2A40A 2P9NA 2J4RA 2KHOA 2W40A 1NWKA 2V51B 2P9SB 1T6DA 2CH5A 5AQSA 2YJFA 1TYQB 4BR5A 3M3ZA 4XH4A 4BRFA 3JS6A 2FXUA 5AQXA 3UKUB 1NGDA 3I8BA 4MLEA 3TPQA 4BQZA 2A3ZA 3H1QA 2PAVA 3WEEB 2FLOA 4EIAA 1NGHA 3IDHA 5AQTA 5AQRA 3BF1A 3ZX2A 4M7YA 4PL8A 2VCPA 3U8XA 2BTFA 4B1UB 5FPDA 4WQ5C 2E20A 5AZJA 4ISFA 4H0TB 3CI5A 3A5OC 4EHTA 5TKYA 4JNEA 4BRDA 2P9IB 2FF3B 5KPRA 2D0PA 1GLFO 1YVNA 4JN4A 3C0BA 3LL3A 4BRNA 2WUSA 1YUWA 3VGLA 2P9LA 1KAYA 4H5WA 2D1KA 1GLEG 3DXMB 4H5VA 4GY2B 4JD2A 3CQXA 4B1VA 2QWOA 2QM1A 5AQUA 3B8AX 3CJCA 2QWRA 2E88A 1BG3A 1ATSA 4CZMA 5AZIB 1XC3A 2GELA 1NGFA 4BRLA 3CJBA 5AQZA 1HX1A 4A61A 2FSJA 3CJ1A 4H0YB 2YI1A 3SJHA 1XQSC 5F0XA 3QFUA 3BEXA 2HF4A 2I7PA 4CZLA 5B8HA 4WQ4C 3HBTA 5LY3A 3HTVA 2NZTA 3I33A 4PKHA 2D0OA 5EXWA 4PL7A 1WOQA 1IJJA 3LDLA 3WT0A 4DHYA 4BVPA 4RTFD 2P9PB 3L6QA 4FO0A 2OANA 1U2VB 3A5LC 1NGGA 3ZETA 3D2FA 4RCHA 4ISGA 4BGBA 1HLUA 3O08A 3ID8A 3R8EA 3P4IA 3WXJA 3AAPA 3WQUA 3UKRB 1ATNA 4KBOA 3ENOA 4YDUC 3VERA 5KQDA 1GLCG 4BRKA 2E1YA 1SAZA 4H5RA 5JLFA 4EHUA 4CZEA 5BRFA 4FWPA 3QICA 1S3XA 2ITMA 4RWTA 3ATUA 3D2EA 1ESVA 2V7ZA 2PBDA 3VOVA 4XH5A 1C0FA 1DGKN 2HOEA 1KXPA 4IO8A 3VENA 1BU6O 3CJ7A 3VF2A 1IG8A 1HKCA 2ZF5O 4CBXA 3FZHA 2GEMA 3FLCO 4L3QA 3SK3A 4BREA 3IUCA 5BREA 4BRCA 1E4FT 4XH1A 3CQYA 3GL1A 4H0OA 5AQLA 3L4IA 3GE1A 1H1VA 1YXQA 3D7EO 2D4WA 4BRQA 1NGEA 3UB5A 4DB3A 2QWQA 3VPZA 5LJWA 3DAWA 5BN9A 4BRPA 5ADXH 2A41A 4FWMA 3ATVA 4K25A 4FOIA 1R59O 1KAZA 3HI0A 3GOIA 2ZWHA 3VEWA 4B9QA 1D4XA 3ZEUA 2YHXA 4B1ZA 4B1WB 4BQLA 3O1WA 2YHYA 2W41A 4QS8A 3CHWA 4NO7A 3WXLA 5AQQA 4MO5A 3MK6A 3O4WA 1TUYA 1HJOA 3HZ6A 2CGKA 1TUUA 2VWBA 3ZX3A 3BUZB 2Q1NA 3AAQA 3MN5A 4FPBA 4IXCA 4FWKA 5AQFA 3AY9A 3WXIA 4A62A 4BC3A 3GG4A 1OKJA 3BF3A 1K8KA 5AQWA 4WYBA 4WQ5A 1LCUA 3BP8A 3EKUA 3J8AA 2Q0RA 4O5FA 5BPLA 3VEOA 3HM8A 2I7NA 4JD2B 5E26A 3RSEB 3MCPA 3WUHA 1DKGD 3MN6A 1WUAA 3UKUA 2E8AA 4E1JA 3M6GA 5ELZA 4XEIA 5AQIA 4LC9B 5JMVA 1HKGA 3HSCA 4I6MA 3A0IX 1BO5O 3H1VX 2QWLA 3LM9A 3CJ9A 2DPNA 4FWOA 2HF3A 3L0QA 3LDOA 3ULEA 3VEYA 2QW9A 3EN9A 5AFUH 5FPMA 4CJ7A 2Q97A 4BVOA 4FWQA 1NM1A 1HKBA 1BA0A 1SZ2A 3MDQA 3FZLA 2CH6A 3CIPA 2E2OA 2E2NA 2FF6A 4BRHA 1QZ6A 3QFPA 4WQ4A 4QS7A 4BRIA 4BRAA 5CE3A 1EQYA 4H5TA 4BR9A 4IJAA 2NRHA 5BPNA 3ZETB 3D2FB 2GWJA 1BUPA 3LDNA 1X9JA 1RGIA 2F9TA 1GLAG 3U9DA 2P9KA 2Q36A 4QS9A 4F9OA 4FWNA 4MLHA 3SLCA 3ZX0A 1Z6RA 2GWKA 3IMXA 1P8ZA 3D2EB 3O80A 3VF4A 4CZGA 3SMPA 3O5BA 4H03B 4IZ9A 4YDUA 1CZAN 1GLLO 5AQGA 4BR4A 1ATRA 3U9ZA 4Y0WA 4BROA 3DWLA 2ASMA 2ZGZA 5BRHA 3GBTA 3FR0A 1NGJA 3VF6A 4BGAA 5KPZA 5ADXA 2ASPA 2P9PA 2EWSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CGGA 4HUFA 3SUQA 4WFBL 1VSDA 5EOYA 1DEJA 1P90A 4C8LA 2P9UA 3LAMA 2YHWA 2P9NB 1EP4A 2I5JA 4PKIA 4J8FA 3KVGA 1EWQA 3O9RA 5K14A 4J2AA 4K42A 2RF2A 4HVJA 2P5GA 2B5JA 1RTIA 1WSIA 3DI6A 1RTJA 1Q8IA 1BCOA 2QTDA 1RBVA 4JLHA 3O9QA 4M3ZA 1S1UA 3QETA 1RBUA 2HNYA 2NRTA 1QQOA 1S1VA 5GIOA 4FLWA 3VQAA 2VYPA 3H46O 5M1FA 4ZTJA 1NK7A 1U49A 1NK5A 4N56A 3O1BA 5AQHA 3EO3A 4DQ8A 5AQPA 1HPMA 3T7ZA 1GLJO 4BC2A 3AA3A 1T6CA 5HP1A 4HWIA 3O8MA 4JK9A 1TYQA 3IFRA 3OYBA 4J2BA 1CXQA 4LFAK 5BRDA 1X9WA 3SYZA 3H3NO 1MWMA 3ZSWA 1LAVA 3NBPA 4GW6A 2B4JA 1VSMA 4CBUA 3OYFA 3TANA 3NF6A 4BG9A 3CC7N 4BG8A 4AM7A 3WXKA 3SUPA 4JK8A 1QHAA 4MQ3A 4FJLA 1QVGM 5JENA 2V52B 2P9IA 4DSEA 3K9JA 4JKBA 1NU0A 4EP5A 3KLHA 2ZGYA 4PY5A 5C2FA 2QWNA 3DXMA 4K43A 4B9MA 1ITGA 3A5NC 1ZBSA 1T44A 4CZKA 1NGIA 3K57A 1QQMA 1DT9A 1Q18A 1BIUA 3TAPA 3DJCA 1LOTB 5HBMA 3CPEA 3VEZA 4J2EA 4NCBA 1QZ5A 4CW7B 2DFFA 3SBTA 3K59A 4H0PA 5EX5A 3KKSA 1M90O 3HOSA 1J5EK 4B9SA 3OS1A 3H6EA 2QXLA 3WNGA 1HQUA 3KKRA 1NKEA 1EWRA 2D0BA 4CEFA 1JXEA 1LAWA 4FZXC 1HUXA 3AO5A 4DU3A 3U6FA 3C7NB 3DLEA 3TSPA 3PIPL 5FLXO 3DLKA 3AO4A 2CGJA 4LSNA 4KTZA 2V7YA 3C6TA 3NF7A 4A59A 3VESA 4JI6K 4N76A 3N4PA 2ASOA 1N32K 3LDPA 3V81A 2KZZA 3G6EN 5BR9A 4FJ8A 5HOOA 4DQRA 4H4MA 4O8KA 1NGBA 1NK0A 4EP4A 2OCEA 2NLXA 4GKJK 3PV8A 3MN7A 4CERA 4B08A 4KPYA 5AQNA 3S9HA 2O8FA 1N34K 3P31A 1X9SA 1NJIO 3FGUA 5KPTA 3R3LA 2F7TA 1B9FA 2J4RA 3PSFA 1T05A 2VWKA 5GIPA 3LZJA 1TV6A 1X1PA 4BR5A 3G71N 2G8UA 4BRFA 3O9TA 4NLCA 1S1XA 1NGDA 3I8BA 2YKNA 3K5OA 3TPQA 4BQZA 4NYNA 3KIOA 3RR8A 4DWIA 1SL1A 4EIAA 1NGHA 3IDHA 5AQRA 4CEAA 3HP9A 4B1UB 4WQ5C 5AZJA 5IWAK 2X6SA 4CJKA 4H0TB 2B6AA 3VQ6A 1FJGK 4FCYA 4YOUA 1IV0A 1T7PA 3PO4A 4JI8K 5KGWA 1KAYA 4H5WA 4OKEA 1N33K 1D8YA 4DTSA 4GY2B 2X74A 3P39A 3CQXA 4DSKA 2QM1A 5AQUA 4JI3K 1RDUA 3CJCA 1WNSA 2E88A 3P38A 1ATSA 4FJXA 1NGFA 4E19A 2HVHA 4A61A 4AHVA 4CFCA 3NHGA 5DMRA 3T1HK 3RMBA 4K8XA 1ZBUA 2YI1A 3HM9A 1XQSC 2VWJA 4B9TA 1NJWA 4OKKA 4QAGA 4CZLA 4ELTA 1E3MA 1RDAA 4JRPA 2JLEA 1NJYA 1NK9A 1OVYA 4PKHA 4KB1A 3WT0A 4DHYA 1S9GA 4OVLA 3OJSA 3K5LA 4BVPA 2HSTA 2NUBA 4CEOA 4UQGA 2W42A 3LP0A 1IBMK 3ZETA 3ISNC 3R8EA 4GMJB 3MXMA 5C10A 3LP1A 3V9UA 2HNZA 3UKRB 2WTUA 4CHZA 3ENOA 4YDUC 5DM7L 3FFIA 4NCGA 1VSKA 1SAZA 4LH4A 1QSSA 4FWPA 2ITMA 4RWTA 4FK0A 3E66A 3D2EA 4RW4A 2V7ZA 4CEDA 5JVHL 3VOVA 1NJZA 1C0FA 2O4IA 3T1AA 1NNEA 3VENA 4KHUA 4G1QA 5FROA 3LANA 3V9ZA 1HKCA 3DOKA 4CBXA 3V9WA 4M3WA 3FZHA 4FVMA 3O3FA 1CZBA 4BREA 5AQLA 1RT4A 3L4IA 1D5AA 1C1CA 1RTHA 2D4WA 4W5QA 1NGEA 3VQEA 4H4OA 3VQ7A 2XHBA 3SQ1A 2OA8A 2W6KA 5MLCQ 5JVGL 1UAXA 3J81O 4CF0A 4FOIA 1D9DA 4CGDA 3S5TA 2ZWHA 4B9QA 3PX0A 3T3FA 1VRUA 4B1WB 4BQLA 4ZHRA 5HLFA 4FLXA 4CHQA 3CYMA 2HHSA 3CPWM 3OYDA 1HJOA 4JKEA 3HZ6A 4A57A 3PO5A 1TUUA 4JI0K 2VWBA 3ZSQA 1TKTA 3QLHA 4IEEA 3BUZB 4KB0A 5AQFA 5J1EA 4DTPA 4CEZA 4DSLA 3NF8A 4WQ5A 1LW0A 3EKUA 3P5JA 1Q82O 3F9KA 4EZ9A 2Y1IA 3RTVA 1QE1A 2O8EA 2I7NA 4JKAA 1YJWN 3SZ2A 3MN6A 3MEEA 2HBLA 4DFPA 3LP2A 5T7BA 4DLEA 4KHPK 3QEWA 3HSCA 3KK1A 3H1VX 2QWLA 4LFBK 1UA0A 1N5YA 3LM9A 4WF9L 1K9MO 2HF3A 1TKZA 1CLQA 3LDOA 3ULEA 3VEYA 2EHGA 4X65K 3V6DA 4CJ7A 3HP6A 2Q97A 5EU7A 1VSIA 1HKBA 1BA0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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