1C0FA

Crystal structure of dictyostelium caatp-actin in complex with gelsolin segment 1
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
368
structure length
367
Chain Sequence
DGEDVQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEAEMQTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the higher Ca(2+)-activation of the regulated actin-activated myosin ATPase observed with Dictyostelium/Tetrahymena actin chimeras
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Contractile protein
molecule keywords GELSOLIN SEGMENT 1
total genus 124
structure length 367
sequence length 368
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1c0fA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1c0fA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1c0fA03
2P9KB 5AQOA 4BR2A 4YDUA 5AZJA 4JNEA 3CJ9A 2A41A 3QICA 4PKHA 2WUSA 2QWRA 4EIAA 3UE5A 2A42A 4FPAA 4M63C 1G99A 1RFQA 5FPEA 4K41A 1MWMA 2GUPA 5EY4A 3IFRA 4YDUC 3H1QA 1NLVA 3VF6A 2ZGZA 3GG4A 3SJHA 4BR9A 1X9JA 3CQXA 1OKJA 1QQMA 3VEXA 1ESVA 3RSEA 3VETA 2CGLA 4BRMA 1QHAA 1E4FT 5LJVA 1NGHA 5AFUA 5EOYA 3FZFA 2QW9A 3IMXA 3ZETA 4BG8A 4HWIA 1NGJA 3HBTA 1T44A 2QWOA 3CIPA 5TKYA 2IVNA 2YJFA 3M6GA 5AQUA 3ULEA 1HKGA 1SQKA 3A5LC 3CERA 3DXMA 4IZ9A 3MN9A 4CI6A 4FO0A 2GELA 2E20A 5BRHA 2P9UB 5BRDA 3H3NO 2ASPA 4H5RA 5JLFA 3LDOA 2I7NA 3O8MA 3QB0A 1JCFA 1HPMA 2P9UA 4H5NA 3CJ7A 3MMVA 4BRFA 1SAZA 2V7ZA 1QQNA 3U9ZA 1HJOA 3AY9A 2YHYA 3VOVA 3IUCA 3MN7A 4PKGA 3FGUA 1BWFO 4F9OA 4BRGA 3ZETB 4BRKA 4A2AA 4B1WB 3MN6A 4IWVA 4CD3A 1NGDA 2FSKA 4KBOA 3HSCA 3C0BA 1J6ZA 4H0YB 4MLEA 1BA0A 3VENA 2ASOA 2E8AA 3FZKA 3LM2A 1X3MA 4CZFA 5LY3A 2P9IB 2QXLA 2F9WA 1K8KA 3ID8A 3WXJA 3BF3A 1GLFO 1JCEA 1JCGA 1NGFA 3WXLA 3A0IX 4PL7A 3I8BA 3D2FB 3EKUA 2KHOA 3O4WA 3U4LA 3HM8A 2D4WA 3L4IA 5AQMA 3VEVA 3LDLA 3O1WA 3C7NB 4H5WA 4BC5A 4BRNA 1K8KB 4BR0A 3CETA 4FSVA 5I9EB 4MLHA 2J4RA 1TUUA 4BGAA 4CZJA 5EXWA 2E2OA 2ZGYA 2D0OA 3EN9A 4IXCA 3VEYA 4H0PA 2CGJA 4JD2A 4CBUA 4CZKA 1E4GT 1S3XA 2ZWHA 4BRPA 1EQYA 5AQWA 1ZXOA 4EAHD 2QWQA 1U6ZA 4FWNA 4K25A 1ZBSA 3FR0A 2P9NA 2AP1A 4MO4A 3O80A 1BG3A 1IG8A 1NM1A 4A62A 3O08A 2FF6A 2Q36A 1DEJA 3HTVA 4BVPA 2QWLA 2FSNA 5F1XA 4WQ5A 5EX5A 3I33A 3VEWA 1QZ6A 3WQTA 4CZLA 1HKBA 4PL8A 2ASMA 3QBXA 5JLHA 4BC3A 3UKUA 3R8EA 3ATVA 2Q31A 5AFUH 2D1KA 4WQ4A 4Z94A 2BUPA 2BTFA 4A61A 4H0OA 3BEXA 2V52B 3C7NA 5AQFA 3R6MA 5AQNA 4QS8A 1DKGD 1YUWA 3JXUA 1QQOA 3A5MC 1BU6O 1NBWA 3OHRA 1WUAA 3WEEB 1HKCA 4NO7A 3IDHA 3FZHA 3VESA 4WQ4C 2A6AA 2P9IA 2CGKA 2I7PA 4XEIA 1GLAG 4B1VA 5AQIA 2GWJA 3GE1A 4O8KA 3U8XA 3O6WA 4J8FA 2Q97A 2HOEA 3DXKA 2YHWA 2HMPA 1SZ2A 5BN8A 5FPDA 3DWLA 2QWNA 3W0LA 2QM1A 3QFUA 4O5FA 2YCHA 5KQ8A 2V7YA 1MDUB 4DQ8A 2W40A 1V4TA 2H3GX 3CQYA 3CJ1A 2P9SB 4RTFD 3F9MA 3ENOA 1KAZA 3WUHA 2D0PA 3LM9A 3LL3A 4EHUA 2P9SA 1BUPA 4BRIA 1NGBA 4L3QA 4M7YA 5AQYA 4FWLA 4I6MA 3BUZB 2CH5A 2P9PB 4FWSA 5LJWA 1ATRA 1D4XA 4BC4A 3UB5A 4FWQA 5AQTA 5ADXH 3DXMB 5BR9A 1U2VA 3FZMA 5AQJA 3SLCA 4FWKA 4BROA 3QMLA 3H6EA 4RCHA 3D2EA 2IIRA 5BREA 5AQKA 4CZGA 3EL2A 2NLXA 3H46O 4RWTA 1NGAA 4WQ5C 3TU5A 3ZEUA 3MK6A 2PAVA 5AQZA 4NB4A 3D2FA 5E84A 3A5NC 3VGMA 3M3ZA 4IO8A 3M1FA 4BR5A 4CZHA 3MCPA 2P9LB 3H1VX 4H5VA 3VF4A 1ATNA 4BREA 1XQSC 1IJJA 5AQPA 4QS9A 3VEOA 1LOTB 3SK3A 3UKRA 5FPNA 2EWSA 1BA1A 2FF3B 5BPMA 2FXUA 3S41A 3KVGA 1RGIA 1BOTO 2QWMA 2UYTA 3O1BA 3EZWA 3VGLA 1KAYA 3UKUB 4B1ZA 5AZIB 2IVOA 3FFKB 1U2VB 2OANA 4B1YB 2E2NA 3KHYA 4XH1A 4QS7A 4MO5A 4XH5A 3L6QA 3BF1A 4H0XB 3R9PA 5AQGA 1GLLO 5FPMA 3P4IA 3EKSA 1Z6RA 1X3NA 2FLOA 4H03B 5ELZA 2VCPA 3HZ6A 2E88A 4HTLA 3L0QA 3MN5A 4AM6A 4AM7A 4BGBA 2E2PA 4ISEA 3FZLA 3H3OB 5AQHA 4C23A 4EHTA 2F9TA 4B9QA 1WOQA 2VYPA 3WXKA 5AZIA 4H0VB 4BRAA 1C0GA 5F2RA 2NZTA 1YXQA 3FE1A 3BP8A 3MDQA 4JD2B 3LDQA 3QBWA 3UKRB 3CJCA 1HLUA 2Q0RA 5JICA 2A40A 4DCHA 3W3DA 3ZX0A 5BN9A 3GOIA 5BRFA 1HX1A 1DGKN 1GLCG 4CJ7A 1ZC6A 2GWKA 3WEEA 1R59O 1NWKA 4CZMA 4JHDA 5ADXA 4JHDB 4PKIA 1HUXA 4IJAA 3GL1A 4CBWA 4BR7A 1NGIA 5BPLA 1Q18A 3VEZA 4B1UB 5F0XA 1NGGA 3GBTA 4K43A 2HF4A 1LCUA 4FOIA 1GLDG 3D2EB 1NGEA 3J8AA 4XH4A 3JS6A 2PBDA 3QDKA 1Z05A 3WXIA 2E2QA 3G25A 4BRHA 3TPQA 2E1ZA 3KZBA 2DPNA 2V51B 3AAQA 2W41A 3AARA 1QZ5A 3WQUA 4DB3A 2IVPA 3CJAA 4FWPA 1XUPO 4Y0WA 1MA9B 3SMPA 1YVNA 5KPRA 4CZEA 1H1VA 4BC2A 3CHWA 1GLBG 2YI1A 3SMSA 2YHXA 4CZIA 5KQDA 4H0TB 3O5BA 3ULEB 4JN4A 3CI5A 4FWOA 4M7XA 2CH6A 4BRDA 5AQSA 3VPZA 4WYBA 1KAXA 1Y64A 4DHYA 3VGKA 1V4SA 1BDGA 3A5OC 4FWMA 1NMDA 3B8AX 3RSEB 5KPTA 2VWBA 4ISFA 1RDWX 2E1YA 4JAXA 3WT0A 4K42A 4BRQA 3DXKB 2HF3A 4CD1A 4EFHA 3CJBA 3ENHA 5AQRA 4BQLA 2P9LA 3HI0A 3VERA 5BPNA 4ISGA 3A8YA 3VF2A 3FLCO 1KXPA 2AA4A 3ZX3A 3D7EO 4E1JA 2GTDA 1C0FA 3H45C 2GEMA 4H5TA 2ITMA 1T6DA 3GDQA 4CBXA 4FWRA 5AQVA 3ATUA 5JMVA 4BQZA 1MWKA 3QFPA 1TYQB 3ZEUB 4GNIA 2ZF5O 3AAPA 4FPBA 2Q2RA 3DAWA 4BRLA 2NRHA 3U9DA 1P8ZA 4GY2B 2FSJA 1TUYA 4B1XB 2A5XA 2YJEA 3ZX2A 1T6CA 2P9KA 1NGCA 5AQLA 5AZJB 1XC3A 4FOEA 4BVOA 5AQXA 1GLEG 3LDNA 3EO3A 1ATSA 1YAGA 2P9PA 3DJCA 2QWPA 2A3ZA 4I6MB 4FL9A 2P9NB 5E26A 3LDPA 5AR0A 1GLJO 2Q0UA 4LC9B 4BR4A 1BO5O 1S22A 4IJNA 4BRCA 5AQQA 5CE3A 4BG9A 2Q1NA 1TYQA 5B8HA 1CZAN 5EVZA 4A2BA 5KPZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2P9KB 4BR2A 4YDUA 1T03A 4BY9C 1XMQK 3QICA 1UA0A 3HOTA 3UE5A 3TAEA 3PLAA 3CC7N 1C0TA 3HJFA 1MU2A 2XY8A 4G9ZA 3MWTA 3JYTA 4M3XA 3CM5A 3SYZA 1ZBLA 4H8KA 4YNQA 1KQSM 3H1QA 1BQMA 4CHZA 2R7YA 3CQXA 4JI8K 4CEZA 4PA1A 2CGLA 3AO3A 3AVBA 4R5PA 1NGHA 3D45A 2EX3A 1VK0A 3DOLA 3FZFA 5FROA 3ZETA 4HWIA 1ASWA 3V9ZA 2QWOA 4CGHA 5TKYA 3BDPA 2IVNA 2YJFA 3SV4A 4ZTFA 4B9NA 2DTUA 1VQPN 2GELA 2E20A 5BRHA 2P51A 2P9UB 3CM6A 3ULDA 2G8FA 1A5XA 1VSJA 3HM9A 4NCBA 3WNEA 4YHHK 4B3MK 5M1NA 3LDOA 1D5AA 1RT7A 3QB0A 1KLMA 3MMVA 4BRFA 4FJMA 4L8RB 1L5UA 3VQ8A 4CGFA 1ZBFA 5HRRA 2G8VA 4CHYA 1R0AA 3ZSOA 4BDZA 4WE1A 5CZ2A 4JYAK 4M3RA 4A2AA 2UUCK 4B1WB 5KGWA 3MN6A 4FJKA 4CJKA 1NGDA 2ETJA 2FSKA 1C0UA 4H0YB 4JKDA 1JLQA 2E8AA 3LM2A 1X3MA 4Z4FA 4A59A 1YF5L 2QXLA 4C8MA 2G8KA 3ID8A 1DT9A 1GLFO 1TKDA 4PL7A 3NCIA 3KKSA 4CF0A 2FC0A 4DSEA 1N6QA 2D4WA 3HP6A 4EZ9A 3C7NB 3CETA 4FSVA 2A1RA 4KTQA 1RT3A 4MLHA 3AO4A 4BGAA 4JI1K 5CYMA 3CFRA 3RMAA 4OKKA 5EXWA 2B4JA 2D0OA 1UWBA 3EN9A 4IXCA 2CGJA 4JD2A 3F73A 3AO1A 1E4GT 5AQWA 1XHXA 1U6ZA 4K25A 1ZBSA 3FR0A 3TSUA 3V6DA 3SPYA 4EP4A 3DLGA 2C1GA 3T1HK 1S1WA 4JI0K 1OH5A 4ELTA 3NH2A 1VAZA 2X6NA 3S5TA 2O8EA 1O13A 2QEXN 2FF6A 1DEJA 3O3FA 5F1XA 5EX5A 3OYJA 3BGRA 1RTHA 4DR1K 3ZT2A 2ASMA 4FJHA 3DYAA 3R8EA 2D1KA 1S6QA 2RF2A 1W9HA 3CCVN 3C7NA 4O8UA 5AQFA 3V9UA 1WAJA 3JXUA 1VHXA 4FLYA 1NBWA 1WUAA 1W7AA 4NO7A 3IDHA 4CHQA 3VESA 3EYZA 4FJ7A 2PYLA 4NLBA 1VSKA 2I7PA 1GLAG 3MEGA 5AQIA 3GE1A 3EZ5A 3U3YA 1ITGA 4MDBA 4F3OA 2HMPA 5BN8A 5FPDA 4IG3A 1YI2N 2QWNA 2QM1A 3QFUA 3L3VA 5KQ8A 1MDUB 2W40A 4KV8A 3SQ2A 3DM2A 4JS5A 4F4KA 4DTUA 3ENOA 1KAZA 2D0PA 3LL3A 4DWIA 3RRHA 4AHTA 3J7ZO 3AA3A 2D0AA 4DV3K 3DLBA 5AQYA 4M3TA 4AHRA 2QKKA 1BGXT 3BUZB 2KW4A 4BC4A 2WFBA 4CJ5A 1CZBA 2EHGA 3FZMA 4CK1A 1YITN 3QMLA 4RCHA 3SQ1A 2G8IA 3QEPA 3SAFA 4FJXA 3HVTA 4B3TK 3TAGA 4WF9L 2WONA 1I3AA 3O9TA 3TSQA 4EP5A 1GOAA 3QNNA 5M1KA 3MK6A 2PAVA 1EWQA 4W5OA 4BEBA 4NB4A 5E84A 3NF8A 3VGMA 4IO8A 1HQUA 3ZCMA 1Q8IA 1W2BM 3MCPA 4W5TA 4H5VA 4FJGA 3LAMA 3MX5A 3CF5L 1XQSC 5E41A 2BDPA 4JKFA 1NU0A 4H4OA 1BA1A 4ILJA 5M1OA 3V1RA 1TV6A 1RGIA 3I55N 1BOTO 3O1BA 4IFYA 1N33K 4CGJA 4DTPA 3LAKA 3J80O 4IFVA 2PFUA 2RHKA 1KAYA 5AJ3K 2XHBA 4E72A 2IVOA 4C8OA 4CFCA 2E2NA 1SL2A 4BWJA 3AVGA 4XH1A 4HVJA 4XH5A 3R9PA 3P4IA 4M42A 1BISA 1KTQA 2HHSA 4RW6A 1RT6A 3OJUA 1WBDA 3L0QA 3VA3A 3MWPA 1REVA 2AJQA 1QSSA 5HOOA 4CEQA 3WXKA 3VQ7A 2O4GA 5SZTA 5SWMA 1VQ8N 1C0GA 4JI3K 5F2RA 3ZYYX 2G8WA 3MDQA 4FZZA 2GV9A 4JD2B 2KZMA 3NH1A 3RMBA 3NAEA 4I2QA 1NK4A 5JICA 4RW4A 5IWAK 4DSIA 3W3DA 4DU4A 4FYDA 5BN9A 3ENBA 2D0BA 1ZC6A 4DR7K 3WEEA 2D5RA 3KLIA 4ID1A 1NWKA 4NXNK 2NNWA 1HUXA 4IJAA 1SL1A 1VRTA 5LMUK 4E7LA 5BPLA 3NVMA 1Q18A 2KFNA 5GADP 1LCUA 2JWKA 1GLDG 3D2EB 1NGEA 3S3MA 4XH4A 3KTQA 3JS6A 4KPYA 4CEEA 3R1XA 1YJWN 1NK7A 1Z05A 5GAEP 5T7BA 3HP9A 3TPQA 2WBNA 1EP4A 4G1QA 2O8CA 1RT1A 4Q5VA 1TL1A 4CEFA 3WQUA 1E3MA 4H4MA 4HUGA 4Y0WA 4CE9A 3CHWA 4BE7B 4CERA 1IBLK 2DFFA 4DS5A 3EE8A 4H0TB 1VSIA 3ULEB 4JN4A 4LF9K 4I9QA 5AQSA 3VPZA 4WYBA 4PQUA 3KJVA 4FM1A 2HHIA 1BDGA 3A5OC 1NMDA 2RN2A 3QEVA 4DQQA 4CD1A 1NJZA 2X74A 1EETA 1RDUA 5AQRA 2P9LA 3HI0A 3NVKA 3VF2A 5J2NA 3VQ5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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