1C0FA

Crystal structure of dictyostelium caatp-actin in complex with gelsolin segment 1
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
368
structure length
367
Chain Sequence
DGEDVQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEAEMQTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords GELSOLIN SEGMENT 1
publication title Structural basis for the higher Ca(2+)-activation of the regulated actin-activated myosin ATPase observed with Dictyostelium/Tetrahymena actin chimeras
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 124
structure length 367
sequence length 368
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1c0fA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1c0fA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1c0fA03
1HJOA 1QQNA 2ASPA 4CZKA 4H5RA 3CJBA 2V52B 1QZ5A 4BGAA 4CBWA 4CJ7A 4HWIA 4JNEA 3GL1A 4F9OA 4IZ9A 1LCUA 5ELZA 5AQNA 4BR0A 1HKCA 2HF4A 1R59O 3VEWA 4PKIA 3ULEB 3FZLA 5LJVA 5JMVA 5ADXH 4BRQA 1JCGA 3EL2A 1Z6RA 4ISGA 4J8FA 5AQPA 1DEJA 2E2PA 1ATRA 5AQLA 3O08A 4JD2A 2FLOA 2I7NA 4BRMA 1HKGA 3FZHA 1XC3A 4WQ4C 4A2BA 2CGLA 3UE5A 1GLCG 3WEEA 3GE1A 4BVPA 3W0LA 5AQJA 1NGEA 4BRPA 3O1WA 4BC4A 4BR4A 3EKUA 2Q0UA 5AQMA 3RSEA 3UKRA 1QZ6A 2VWBA 4MLHA 3CETA 2P9PB 1SQKA 2GWKA 3AAPA 1U6ZA 2Q36A 3A5LC 5AZJA 1GLEG 3FR0A 3KVGA 3UB5A 4A2AA 3OHRA 3GOIA 4CI6A 1X3NA 3R6MA 4Y0WA 3U9ZA 3UKUB 5LY3A 5B8HA 3EO3A 3CJ9A 3SK3A 1V4SA 3O8MA 4BRIA 1IJJA 4PL8A 1U2VB 2W40A 4MO4A 2A3ZA 3DWLA 3LDPA 1QQMA 4H0TB 5AQOA 4BQZA 3L0QA 2FXUA 5AQHA 5EY4A 2D0OA 3LM9A 3AY9A 3D2FB 4CZGA 5BREA 1C0FA 3CQYA 4JN4A 1QHAA 4JD2B 5FPDA 1GLFO 4RTFD 3VESA 3P4IA 2P9NB 4BROA 1DKGD 2ZF5O 5F0XA 3A5MC 4BR9A 2FSJA 4CZHA 4RCHA 4PKHA 4WYBA 3QFPA 3O6WA 5AQQA 3F9MA 3H1QA 2E2QA 2F9TA 3C7NB 4BRCA 3VGMA 2A6AA 2QWRA 3FE1A 5F1XA 3A8YA 1GLJO 1S22A 3WQUA 2BUPA 3UKRB 4BRKA 5AQTA 4MO5A 2E20A 4AM6A 1H1VA 2A40A 2Q1NA 4FSVA 4C23A 3O80A 3WXIA 2IVPA 5BN9A 1TYQB 4A61A 2E8AA 1YAGA 4FL9A 1XUPO 1NMDA 1HX1A 3ENOA 5ADXA 5AZJB 3QB0A 5AQYA 4H0PA 3GDQA 2CGKA 5BRFA 1HKBA 3ZX2A 1BU6O 4BRHA 4O8KA 3S41A 2V7YA 3IUCA 1T6CA 3VGKA 1ATNA 2PBDA 4MLEA 1MDUB 3UKUA 4Z94A 3H3NO 4FWMA 5E26A 3U9DA 4BRNA 2QXLA 2IVOA 2FF3B 3O4WA 4IJAA 3U8XA 5AQGA 1BA1A 1NGCA 2PAVA 1U2VA 2HOEA 1RDWX 3O5BA 4BC5A 1GLBG 4FWRA 1YXQA 1KAZA 1NGJA 1E4FT 2UYTA 4ISFA 4BR5A 4FOIA 5BRDA 1JCEA 3D2FA 5AQXA 3HM8A 4GNIA 4JHDB 4K41A 4QS9A 1QQOA 4GY2B 2P9NA 4EAHD 5AQFA 3D2EB 1S3XA 2J4RA 3WXJA 1YUWA 2ASOA 3MN7A 2CGJA 2P9KB 2YI1A 2ZGZA 3H1VX 5JLHA 5JLFA 4KBOA 2E2OA 4QS8A 4WQ5A 3IFRA 3GG4A 3LL3A 3C7NA 2F9WA 2ITMA 4EHUA 3LM2A 3JXUA 4CBUA 4FWSA 3LDQA 3SLCA 3HI0A 4NB4A 2HMPA 5JICA 1HPMA 1Y64A 4BREA 2GELA 3EN9A 1TUUA 4JAXA 3VENA 3WXLA 1TYQA 2QWOA 3FFKB 3VEZA 1EQYA 4B1UB 3VF4A 4B1ZA 2NLXA 5I9EB 1Z05A 3ZX3A 4B1VA 5AQIA 1NGFA 2A5XA 1BDGA 5EVZA 3FZKA 1HLUA 2Q31A 3CJ1A 3R9PA 4XH4A 1LOTB 2E2NA 2VCPA 4CZEA 4AM7A 5CE3A 1TUYA 5FPMA 2NRHA 4CZFA 4FPBA 3VEYA 4YDUA 3HZ6A 1ZBSA 3LDLA 5BPMA 1K8KA 3BEXA 1MWKA 3MN5A 4BG9A 3A5NC 3CI5A 4BRLA 1D4XA 3ENHA 4FPAA 1BG3A 2FF6A 2QWPA 3A0IX 3ATUA 1NGAA 2QM1A 1C0GA 1RFQA 3WUHA 3M3ZA 2ZGYA 5AQZA 3DXMA 5AQKA 3CIPA 2IIRA 2A42A 3VEOA 4FWKA 4JHDA 5TKYA 2GWJA 2P9LB 5BR9A 2DPNA 3CJCA 4XH5A 3D2EA 4BR7A 3J8AA 3H46O 1BO5O 4M7YA 4XEIA 5KPZA 1ZC6A 3MCPA 3M6GA 3LDNA 2P9KA 4IWVA 4LC9B 2YJFA 3H6EA 3TU5A 2I7PA 2GTDA 5AQWA 2KHOA 4BRFA 1ATSA 2D1KA 1KAXA 2BTFA 3KHYA 3H45C 4NO7A 2YHXA 3IDHA 3L6QA 3BF3A 3QICA 3QFUA 1NWKA 4K43A 5F2RA 1HUXA 4A62A 1SZ2A 1E4GT 2P9SB 3SJHA 1ZXOA 1NM1A 4CD1A 1XQSC 4H0XB 4RWTA 4EIAA 3QMLA 1BOTO 4EHTA 2YJEA 4B1XB 3LDOA 4FWLA 2OANA 3TPQA 3G25A 3EZWA 1J6ZA 4XH1A 2GEMA 4CBXA 4EFHA 1T6DA 5AFUH 3VEXA 1K8KB 2ASMA 3C0BA 3O1BA 5LJWA 4QS7A 4FWNA 1MA9B 2VYPA 4BC2A 1NGHA 3FGUA 4BRDA 4H5TA 4WQ5C 2E1ZA 1GLDG 3DXMB 4BR2A 4DB3A 3ZX0A 4BC3A 2V7ZA 1GLAG 3ATVA 2Q2RA 4BVOA 4CZLA 3B8AX 3VEVA 2AA4A 1GLLO 3CHWA 2QWLA 2H3GX 4BGBA 2P9LA 3CERA 5KQ8A 3HTVA 5EOYA 1G99A 3QDKA 1CZAN 3DJCA 3H3OB 3R8EA 4FWPA 3FZFA 4H03B 3CQXA 1ESVA 4O5FA 4I6MA 4FOEA 4BRGA 5AR0A 4E1JA 4H5VA 5EXWA 1OKJA 2W41A 3DAWA 5BPLA 2V51B 3A5OC 1DGKN 1X3MA 3VETA 1JCFA 3VOVA 2Q0RA 3HBTA 3MK6A 1NBWA 4YDUC 3VERA 3VGLA 2P9SA 3ZETA 4FO0A 4K25A 4B1YB 3BF1A 4L3QA 2ZWHA 2P9IB 3CJAA 3GBTA 3MMVA 4WQ4A 2AP1A 1BUPA 3W3DA 4M63C 1NGIA 2A41A 2YHWA 2EWSA 5BPNA 2FSKA 5AQUA 1YVNA 3DXKA 1X9JA 3MN6A 4FWQA 4H5WA 1KXPA 4DCHA 1V4TA 5AZIA 3IMXA 4DHYA 2P9UA 3VF2A 2IVNA 4H0VB 4IXCA 3ZEUA 1WOQA 2QW9A 3FLCO 2E88A 4IJNA 1P8ZA 4FWOA 3I33A 3QBXA 2HF3A 3D7EO 2NZTA 3BUZB 3QBWA 3HSCA 2QWNA 1T44A 3MDQA 3WT0A 4B1WB 3ID8A 2E1YA 3VF6A 1Q18A 4I6MB 3JS6A 3AARA 3ULEA 3I8BA 3WXKA 1IG8A 1NLVA 2QWQA 5AQRA 5AFUA 4ISEA 3L4IA 4PKGA 2YHYA 4CZJA 1BA0A 2CH5A 4IO8A 4BQLA 4K42A 3WEEB 2WUSA 4H0OA 2CH6A 4CD3A 5KPRA 1MWMA 2D4WA 4B9QA 3ZETB 1RGIA 3EKSA 4PL7A 1SAZA 2GUPA 3MN9A 5FPEA 5FPNA 5E84A 1NGGA 4H0YB 3RSEB 2YCHA 5KPTA 3M1FA 5KQDA 4BRAA 3KZBA 1KAYA 5BN8A 2QWMA 3CJ7A 1WUAA 2P9IA 2FSNA 5BRHA 3FZMA 3DXKB 1NGBA 3VPZA 5AZIB 1BWFO 1NGDA 5AQSA 3SMPA 4CZIA 2P9UB 2P9PA 4M7XA 4BG8A 3BP8A 4HTLA 2Q97A 2D0PA 4H5NA 5EX5A 3ZEUB 3U4LA 4CZMA 4DQ8A 3SMSA 3WQTA 3AAQA 5AQVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3J7YP 4C8LA 4CZKA 4DSFA 3D0PA 2ZD1A 4CJ7A 1JKHA 4JNEA 4F9OA 4LH5A 4IZ9A 4WCEL 5AQNA 4BR0A 1VQLN 4PKIA 3FZLA 4B9TA 4FZXC 5JMVA 3EL2A 1Z6RA 1A5XA 2W6LA 2O4GA 3S9HA 2E2PA 1ATRA 2FLOA 2I7NA 2XRIA 4IOXA 3PX4A 2QK9A 3H08A 3P83D 4F8RA 3BY5A 2HHIA 5A2QO 2CGLA 3CG7A 1GLCG 3T69A 4CJRA 3VQEA 3IAYA 2O8CA 1G15A 1VQMN 4BWMA 1J9AA 1KSPA 4BC4A 5HL7L 3BDPA 4CK1A 1OH8A 2QXFA 5M1OA 4CEDA 4DQRA 4LF9K 3WXMB 2VGMA 5FRNA 3THXB 1SUQA 3EY1A 3CC7N 4HCBA 4K8ZA 3AV9A 2Q36A 4MDAA 3HM9A 5AZJA 4WFNL 1C0TA 1YJ9N 4J2EA 3U9ZA 3EO3A 3RMDA 2KQ2A 4BDZA 3P38A 2VG7A 3O8MA 4BRIA 5C42A 3C95A 4OX9K 3NFAA 3CPEA 2HMIA 4ELUA 1QQMA 4H0TB 2XY6A 3VQAA 3V4IA 4E1NA 5EY4A 3AY9A 4CZGA 1C0FA 4JN4A 3S3NA 1TKZA 5FPDA 3LP1A 3NMUA 4RTFD 3VESA 3OYFA 4BROA 1DKGD 1QSSA 2ZF5O 4YOTA 1ZBUA 1EETA 2P1JA 3EEQA 1JLFA 2W42A 4DSLA 2E2QA 2F9TA 4YHHK 5HRPA 5F1XA 4OKJA 1TKTA 3WQUA 1WSHA 4DLEA 2VG6A 1VSLA 4KHQA 3FFIA 2QA4N 1H1VA 1OH5A 5C2DA 4FSVA 4C23A 3O80A 4Q0BA 4A57A 5CZ2A 2IS3A 4K0KK 4LF5K 2RF2A 3AVGA 4H0PA 3GDQA 3THXA 2GX9A 1HKBA 4N5SA 2OTJN 1BU6O 2VWKA 4BRHA 3CMEN 3S41A 3K5LA 3AVBA 4C8MA 4FLZA 3DRPA 3NVMA 2HVIA 2IVOA 1NGCA 3O5BA 1RDBA 4BC5A 4DQIA 4KI4A 1J5OA 3PV8A 5KRTA 2UYTA 3QNNA 4BR5A 5BRDA 3OBYA 4H8KA 5AQXA 1XC9A 4RG8A 4DTRA 1NMNA 4E3SA 4FJKA 4CHPA 2J4RA 5C0YA 2ZGZA 2YI1A 5JLHA 3O3HA 4Z0UA 2E2OA 3L2UA 4QS8A 4FZYA 4KH5A 4WQ5A 4LFAK 3UIQA 5HLFA 1BIZA 4DSIA 1HNWK 3M8RA 4M42A 3I55N 2F9WA 5LMNK 1B9DA 3JXUA 3N4PA 4CBUA 4FWSA 2ETJA 3VTHA 2YNIA 3HI0A 2HMPA 1VQ6N 1Y64A 4BREA 2NRVA 3MWTA 4ILJA 4JAXA 3TTDA 3ZT2A 4IFVA 2QWOA 4CF0A 4JRQA 4CEBA 4KPYA 1NG9A 4B1ZA 5I9EB 4B1VA 3DI6A 4CJKA 1SV5A 4DV7K 1F21A 2Q31A 1LOTB 1XI1A 2WONA 4CZEA 1RT3A 4AM7A 5CE3A 2OCEA 2OYQA 2NRHA 4B08A 4OJRA 3VEYA 1NJYA 4ZTFA 4QOZB 3CCUN 3AVCA 3CM6A 4YOWA 4BG9A 2HSTA 3CI5A 3QIPA 3DM2A 1BG3A 3TSQA 2QWPA 3ATUA 3TAGA 4I2PA 5AQZA 2ZGYA 3V1OA 3SBGA 4CJSA 3G71N 2KFNA 2P9LB 4LF7K 3J8AA 4XEIA 5KPZA 5T7BA 1ZC6A 4IWVA 3M6GA 4OKEA 3E9LA 2GTDA 2OZSA 1RCHA 1JLGA 3M8QA 1FJGK 4DV3K 3EZ5A 2D1KA 1KAXA 4F2RA 4JKEA 4NO7A 2UXBK 3IDHA 1TL3A 1TAQA 4MFBA 3BF3A 3DRSA 4OPAA 3QICA 3THWB 4K43A 3O3GA 1S9EA 3AVMA 4CD1A 3SI6A 4EIAA 2NRTA 2YJEA 4W5NA 3EZWA 2QEXN 4NCAA 4AH9A 1K8KB 4ID1A 2ASMA 2NRWA 2VYPA 4QCLA 1VQ4N 1VK0A 3K5OA 3I8DA 2E1ZA 2XY5A 1GLDG 3DXMB 3ZX0A 1RT2A 2AA4A 1SL0A 4WE1A 1D5AA 3AO2A 2P9LA 3CERA 4LY7A 5KQ8A 3CMAN 1BQNA 3KJVA 1CZAN 3H3OB 4FWPA 3FZFA 1JJ2M 2D0BA 4FOEA 3AO3A 1K9MO 1OKJA 4BWJA 1X9SA 3CYGA 1TKDA 5BPLA 4FCYA 2V51B 2ZJPL 3DMJA 1JCFA 2ZJRL 3N4QA 3HBTA 3KLEA 3THWA 1RBSA 3ZLJA 3VGLA 1VSHA 4G9ZA 3NDKA 3DLRA 2OPPA 3AVKA 1KLNA 2VG5A 3HVRA 2XY8A 2EX3A 1TKXA 4JI5K 3HRGA 3CJAA 3EYZA 3W3DA 1NGIA 2VQEK 3NF8A 4CJLA 4KO0A 5DK5A 1YVNA 5AQUA 4FWQA 1KXPA 4BE7B 3E9PA 4DHYA 3IMXA 3P31A 1J5EK 3QLHA 3KKRA 4IXCA 4AF1A 3FLCO 3ASMA 1JLEA 3NBPA 3QBXA 3D7EO 3OJSA 4Z4GA 2RE2A 3ZSVA 4EP4A 2W6KA 3QIOA 1N33K 3SQ4A 5HROA 3SAHA 4JI0K 1D9FA 3HO1A 5KI6A 3ID8A 2E1YA 1IKYA 1Q18A 3DYAA 4CGGA 4JKHA 4HVJA 1P90A 3O4NA 3I8BA 3QEWA 4J2AA 1BA0A 3TAMA 1C0MA 1KQSM 1T05A 3O9UA 3WEEB 4HUGA 4Z4IA 4H0OA 2CH6A 4CD3A 5KPRA 1SAZA 4E7LA 5KRSA 3T1HK 3B6PA 5KPTA 2E4LA 3M1FA 4LH4A 2C1IA 1HYSA 1KAYA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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