1C0FA

Crystal structure of dictyostelium caatp-actin in complex with gelsolin segment 1
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
368
structure length
367
Chain Sequence
b'DGEDVQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEAEMQTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords GELSOLIN SEGMENT 1
publication title Structural basis for the higher Ca(2+)-activation of the regulated actin-activated myosin ATPase observed with Dictyostelium/Tetrahymena actin chimeras
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Contractile protein
total genus 124
structure length 367
sequence length 368
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1c0fA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1c0fA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1c0fA03
1QZ6A 5BRDA 1TYQA 3LM2A 2FSNA 4RTFD 1D4XA 4IJNA 1BO5O 1NM1A 1BOTO 3DJCA 3VEOA 4EFHA 2ASOA 2A3ZA 3ZETA 2CGKA 1IJJA 4BR5A 5E26A 2P9IA 4BRNA 1TUYA 3M3ZA 4FWQA 4O5FA 5EXWA 4CZEA 4HTLA 5AQNA 3SLCA 5JMVA 2YHWA 5EOYA 3W0LA 2NLXA 2YJEA 4IWVA 4H0XB 3A8YA 5AQQA 3LDNA 3ENOA 4KBOA 3M1FA 1KAXA 3EO3A 1RDWX 3SMPA 2HF4A 1SQKA 3EKSA 3ID8A 3VETA 5LJWA 3H3OB 4HWIA 2Q97A 5AQUA 3U9DA 3HI0A 3R9PA 2YCHA 4FSVA 3LDPA 2ZWHA 4EIAA 1NGEA 4JD2B 4NO7A 5KPTA 4MO5A 4BR4A 3MN5A 5B8HA 2E8AA 4Y0WA 4FWMA 4BRLA 4CBUA 5ADXA 4BR9A 5JLFA 2Q0RA 4WYBA 4BR7A 2P9LB 1U6ZA 3EKUA 2GWJA 4PKGA 4JAXA 3WQTA 4DCHA 1MA9B 3H1QA 3DWLA 4H03B 4H0TB 4CZMA 4A2AA 3JS6A 4BRCA 1GLEG 3D2FB 3O6WA 1NMDA 3O08A 4XEIA 3UKUA 2IVNA 4CZLA 1QHAA 1LCUA 3VEVA 3GBTA 4WQ5A 3LDQA 3O8MA 1ATSA 2E20A 2VCPA 4JN4A 4BG9A 2P9UA 1NGBA 3H3NO 4B1ZA 3WXIA 3C7NA 1NGDA 1BDGA 4J8FA 2H3GX 2DPNA 3CJ9A 4BR2A 1NBWA 5AQTA 5BREA 1DEJA 2YJFA 4PKHA 3QICA 2Q36A 3VEZA 2W41A 3MCPA 2E2PA 2PBDA 5ELZA 4BRFA 5EVZA 4CZGA 2WUSA 3TU5A 3IUCA 4B9QA 5AZJB 2V7YA 1NGFA 2CH5A 3QBWA 4O8KA 4BREA 4BC5A 4K43A 1T44A 2D1KA 5BR9A 2P9SB 3I33A 5FPEA 3ENHA 4FPBA 1RGIA 3H6EA 3VOVA 2P9NB 1S3XA 4BQZA 3CIPA 1GLJO 2QWRA 1BWFO 2UYTA 3DXMA 1K8KA 4GNIA 1X3MA 2QWLA 4H5RA 4B1YB 3JXUA 3ZX2A 3MN6A 1T6CA 2IVPA 2YI1A 1QQOA 5AQPA 4M63C 4CZFA 3LDLA 1NGAA 3VF6A 4ISFA 3UKRA 4BRQA 3BF3A 3FZKA 1KAZA 2HF3A 3WT0A 3GL1A 2QM1A 1DKGD 4EHUA 4PKIA 2E1ZA 3WXLA 5BPNA 3GOIA 3D2EA 3VGMA 2A40A 1RFQA 4AM7A 1WUAA 5AZIA 3ULEB 2P9PA 5E84A 4CZKA 3O1BA 1IG8A 1J6ZA 2V52B 4BRHA 2FSJA 1ATNA 2P9KA 3DXKA 3IDHA 3CJBA 4H5WA 3EN9A 3S41A 3G25A 4H5TA 2YHYA 4FOIA 4ISEA 2A5XA 2CGLA 3UB5A 2FXUA 4BRDA 1Z6RA 3ATVA 1KAYA 3SMSA 4QS9A 1SAZA 4BRMA 1NLVA 3EZWA 1HPMA 4IO8A 3VENA 5TKYA 2Q31A 3AARA 1YAGA 2KHOA 4BRAA 3VGLA 5FPDA 4H5VA 2HMPA 2BUPA 2E2OA 5AQYA 4WQ4C 4BGAA 4FWSA 3O4WA 2IIRA 3KZBA 2CGJA 1GLFO 2A42A 1R59O 4FWLA 5AQGA 3A5LC 4YDUC 1XUPO 3B8AX 1U2VB 4MLEA 4I6MB 1C0FA 3FLCO 3A5MC 3M6GA 3FE1A 4JHDB 1X3NA 3EL2A 2E2NA 5LJVA 3WUHA 3ZEUB 3IMXA 4IXCA 2AP1A 1XC3A 3QBXA 5AQRA 4DHYA 3CJ7A 2I7PA 3CJ1A 2FF3B 3VEYA 2NRHA 3VEXA 1KXPA 2FF6A 3RSEB 4BVOA 4CZHA 3U8XA 3GDQA 5BPLA 1TUUA 4BR0A 1HJOA 2P9LA 1LOTB 1JCGA 3QMLA 1WOQA 4L3QA 3L4IA 4FL9A 5AQFA 4CBXA 5AQHA 3SJHA 5BRHA 5JICA 3QFPA 1YXQA 4K41A 2I7NA 3O80A 3WEEA 3HZ6A 3D2FA 5KQDA 3R6MA 1BU6O 2ZGZA 3C0BA 3KHYA 3MK6A 4JNEA 4BC3A 4H0VB 3MDQA 2FSKA 4RWTA 3L0QA 2QWQA 4H0PA 3H45C 2ZGYA 5AQLA 4M7YA 2VWBA 4FWPA 5AQIA 5F0XA 3FR0A 3AAPA 2D0OA 1S22A 4WQ5C 2E2QA 3D7EO 2PAVA 3A0IX 1TYQB 4BRGA 4CJ7A 3BF1A 1ATRA 3WXJA 4FPAA 3CJAA 5LY3A 1GLCG 1GLLO 3ZETB 4MLHA 4XH1A 1BUPA 1HUXA 2P9IB 3I8BA 5AZJA 1H1VA 4ISGA 2V51B 1OKJA 3VF2A 2GWKA 1EQYA 3AY9A 3HBTA 5KPZA 1QZ5A 3VEWA 1JCFA 2YHXA 5FPMA 2P9SA 3U9ZA 4RCHA 4FO0A 4H0YB 1E4FT 3O1WA 1E4GT 5AQJA 4F9OA 5KQ8A 4FWNA 4CI6A 3CERA 2J4RA 3WXKA 2D0PA 4BROA 5AQOA 2GEMA 1XQSC 3FZMA 5AQZA 3HTVA 4CD1A 4FWKA 5EY4A 3VERA 1ZXOA 3FZLA 3LM9A 1NGIA 3CQYA 4WQ4A 4AM6A 3H1VX 3VF4A 2QW9A 5JLHA 2GUPA 4YDUA 3U4LA 1BA0A 1HKCA 1ZC6A 2FLOA 2W40A 3H46O 2A6AA 1T6DA 5AQKA 3BEXA 2V7ZA 4M7XA 4BVPA 2A41A 4DB3A 1YVNA 4BRPA 2QWOA 3J8AA 3BP8A 3QB0A 3UKUB 4B1UB 2IVOA 5ADXH 5F2RA 2QWPA 2ZF5O 3MN7A 4QS8A 5AQXA 3ULEA 3BUZB 2ITMA 4EAHD 2OANA 1V4TA 2ASPA 1NGGA 4CBWA 3CJCA 4FOEA 4NB4A 3FZHA 1DGKN 3ZX3A 5AQSA 3CETA 2AA4A 3HM8A 1HLUA 4Z94A 2P9UB 1MWMA 2Q2RA 3OHRA 4MO4A 5EX5A 4A2BA 3C7NB 4IZ9A 5KPRA 2QWNA 3LDOA 2QXLA 3CHWA 2Q1NA 5FPNA 4A61A 3ATUA 2CH6A 4BQLA 1NGHA 2ASMA 4JD2A 4C23A 3FZFA 3GE1A 3A5OC 4BC4A 5BN9A 4GY2B 1SZ2A 2F9TA 2GELA 3W3DA 4B1XB 5AQMA 4CZJA 3MMVA 3WEEB 5AR0A 1Y64A 2HOEA 1NGJA 1C0GA 4H5NA 3VESA 4BRIA 5F1XA 3P4IA 2E88A 5AFUH 5BRFA 5BN8A 2GTDA 4BGBA 1YUWA 1Q18A 4PL8A 1MWKA 1HKBA 4DQ8A 3QFUA 1BA1A 1HKGA 1U2VA 2F9WA 4BC2A 1JCEA 2D4WA 4H0OA 3GG4A 4I6MA 4CD3A 3R8EA 4A62A 4LC9B 1NWKA 1ZBSA 4JHDA 5AQWA 1QQMA 1GLDG 2Q0UA 3MN9A 5AFUA 4K25A 3ZEUA 4PL7A 3F9MA 5BPMA 4IJAA 3DXMB 1GLAG 1K8KB 1CZAN 3QDKA 4QS7A 4E1JA 1Z05A 4K42A 1ESVA 1P8ZA 2BTFA 1V4SA 3L6QA 3RSEA 1MDUB 4B1VA 2QWMA 3UE5A 3O5BA 3WQUA 4FWOA 5CE3A 3FFKB 4FWRA 3UKRB 3VGKA 1BG3A 2EWSA 2NZTA 3TPQA 3LL3A 5AQVA 3HSCA 3IFRA 3ZX0A 3DAWA 3D2EB 3A5NC 3AAQA 4B1WB 5AZIB 2VYPA 2P9PB 1NGCA 3VPZA 4BRKA 2E1YA 1X9JA 3CI5A 1G99A 3CQXA 1HX1A 4BG8A 3FGUA 4XH5A 3DXKB 2P9KB 4XH4A 3KVGA 4CZIA 1GLBG 3SK3A 4EHTA 1QQNA 2P9NA 5I9EB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1TYQA 2OYQA 4G1QA 4KI6A 4CEBA 4GW6A 1NM1A 4B8CA 2ASOA 2XY6A 1NMNA 5E26A 1NJYA 4BRNA 4FZYA 4O5FA 4FWQA 4BE7B 4KREA 3MX2A 4X62K 3DLHA 1RT3A 1YT3A 4CHYA 2YHWA 1TL1A 3HVTA 4OKJA 1NKBA 1ASWA 2NLXA 2D0BA 5AQQA 3KLFA 4ICLA 4DU4A 2VG6A 3VETA 4C1NK 5LJWA 2Q97A 4Z4EA 1NJXA 3L4QA 3R9PA 3U9DA 3NH2A 4FSVA 2ZWHA 4EIAA 1NGEA 4GMJB 2G8VA 5B8HA 3MN5A 4M42A 1VQPN 2E8AA 4Y0WA 4B08A 4H4MA 3ZSYA 5JLFA 3AVNA 2Q0RA 1BCMA 3HJFA 5GIPA 2GBZA 1YF5L 3OTOK 1EX4A 4E7LA 4JAXA 2OPSA 4H03B 3THXA 4BE1A 3HRGA 3DLBA 4M3YA 3D2FB 1NMDA 1JLGA 2NRTA 2HHSA 4IEEA 2D0CA 2YNIA 4JYAK 4DR3K 3ZCMA 4FJLA 4CZLA 3SPZA 2Z1IA 2G8HA 1C0UA 5CZ1A 3SQ0A 1S1UA 1ATSA 4JN4A 4AF1A 3LZIA 1WBDA 1WB9A 3VQBA 2IDOA 5GADP 2HNDA 1NBWA 3KWGA 3K59A 1WAJA 1CZBA 1DEJA 4JK9A 4DTUA 1R0AA 3ZYYX 3KTQA 3AO5A 1NJWA 4KB1A 2E2PA 5ELZA 1ASVA 4BRFA 3QEPA 3TU5A 4B9QA 5AZJB 2V7YA 3F73A 4NCBA 4BREA 3T1AA 2Z1GA 1T44A 3ZLJA 3J7AP 2P9SB 4OLBA 1LWEA 3HO1A 4CEDA 1BI4B 5C2FA 5C2DA 3LALA 4DSKA 1FK9A 3ENHA 1N8RO 4KPYA 3NF7A 3I0SA 3AV9A 3H08A 4CECA 2P9NB 4WF9L 1S3XA 4BQZA 1EETA 1GLJO 2QWRA 4OGEA 1C1CA 2XO7A 1X3MA 4B1YB 3ZX2A 3OYMA 1RTJA 1T6CA 2HVIA 1P90A 2ETJA 1QQOA 3HP9A 5AQPA 2XRIA 3LDLA 3AGKA 2O8FB 4ISFA 4HUFA 1HYSA 1KAZA 2QKBA 4JV5K 3K57A 4I9QA 3VQQA 1NOYA 4JI6K 3WXMB 4CEQA 3THVA 3RR7A 1REVA 3D2EA 1WUAA 4M3XA 4M3UA 5CR4A 2BDPA 4OKEA 4LSLA 5E84A 4CZKA 1S1WA 4DV5K 1NJZA 1IG8A 3B6OA 4I9LA 4DFPA 4BRHA 4YOVA 1Q81O 1ATNA 3DXKA 4M3WA 3IDHA 3CJBA 3L3VA 4NCAA 3EN9A 5T7BA 4KH5A 3BZCA 2YHYA 2HBMA 4ILGB 2C1IA 2GV9A 3CCUN 2O8DB 2YKNA 2HBKA 4L8RB 1NLVA 2ZD1A 2ATQA 4IO8A 3VENA 1KQSM 1K6YA 4JKFA 5C0YA 2YNFA 4FLVA 3RR8A 4BRAA 5FDLA 3R1XA 1WBBA 2BUPA 1FJGK 4BGAA 2IIRA 3S5TA 2CGJA 2FBXA 1R59O 4ELVA 3A5LC 4FW2A 1XUPO 4FJHA 3K5NA 4CJQA 4ZTJA 4B3SK 4PUOA 3AGRA 3CG7A 1B92A 2OCEA 1HPZA 3EL2A 1C1BA 4XIUA 2QK9A 4IXCA 4CHQA 1I94K 3SQ2A 4AHSA 1QSLA 3CM6A 3QBXA 3M8SA 2FF3B 3D6RA 5BPLA 2FF6A 2G8IA 3GDQA 1VQ5N 4YOTA 4OPJA 3CC4N 3CQ8A 3SYZA 3SI6A 4L3QA 3KJVA 4CBXA 3OYLA 4CF0A 1IV0A 4K41A 4FJIA 1ZBHA 3CCMN 3TTDA 2I7NA 3DOKA 3HZ6A 4KFBA 3R6MA 3TTCA 4DR2K 4J2AA 3DLEA 1QSSA 3RMBA 1BU6O 4FLTA 3KHYA 3AVMA 4JNEA 3PV8A 1QVGM 2HHIA 1YJNN 1IO2A 4H0PA 3H45C 4O5BA 5AQIA 3FR0A 2KTQA 1GOCA 2UXCK 4GV9A 1VQ7N 4E0DA 2PAVA 4RW9A 1TYQB 2BE2A 4C8KA 3BF1A 3WXJA 3LPTA 3J80O 1U49A 5M1NA 4I7FA 3OYCA 1JKHA 4MLHA 3PIPL 4N41A 4GKKK 3OVNA 1HUXA 3QNOA 2Z1HA 4ISGA 3NFAA 3OJSA 3T1HK 2QA4N 3VQ9A 5GAEP 4H0YB 5KTQA 1RT1A 3IG1A 3RVCA 3K58A 5HRRA 3CFRA 1E4GT 2Q3SA 3IAYA 2NNWA 4DTJA 3VTHA 3OS2A 4KH4A 4FXDA 2D0PA 2FBYA 4CHZA 3FZMA 4DV2K 3FZLA 2VWJA 2Y1JA 3PX0A 3C6TA 3VF4A 4MDBA 2YKMA 2GUPA 4O55A 1L3UA 2Z1JA 1KFDA 2FLOA 3E9OA 3R3LA 1KSPA 1UA1A 2FC0A 3DM2A 3D45A 4FZXC 2A41A 4DB3A 4FM1A 4FYDA 4M3ZA 4FJNA 2X74A 5IT9O 3TARA 2QWPA 1VQ6N 5AQXA 3ULEA 2ITMA 1V4TA 2ASPA 4CBWA 4CGGA 3CJCA 4NB4A 3ENBA 3FZHA 4EZ6A 4CHPA 4F8RA 3HP6A 3PSIA 1X9MA 2AA4A 4LY7A 1MWMA 2Q2RA 4MFBA 4FK2A 1DTTA 1K8AO 3NBPA 5FPNA 1W7AA 3ATUA 2ASMA 4O8UA 4DSIA 2JGUA 3A5OC 3OYEA 1NG9A 3EZ5A 4QOZB 4GY2B 3V9XA 4CZJA 3QERA 3WEEB 4XJXA 4DR6K 4CJTA 3B6PA 4BRIA 4IG3A 5F1XA 3QIOA 5BRFA 2KQ2A 5M1QA 2HW3A 1VHXA 4HUEA 3SV3A 1Q18A 4DQ8A 4BC2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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