1C0FA

Crystal structure of dictyostelium caatp-actin in complex with gelsolin segment 1
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
368
structure length
367
Chain Sequence
DGEDVQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEAEMQTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords GELSOLIN SEGMENT 1
publication title Structural basis for the higher Ca(2+)-activation of the regulated actin-activated myosin ATPase observed with Dictyostelium/Tetrahymena actin chimeras
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Contractile protein
total genus 124
structure length 367
sequence length 368
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1c0fA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1c0fA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1c0fA03
3ZX0A 3DAWA 5JLFA 5AQRA 5BREA 3ZEUA 1Z6RA 5AQWA 3O4WA 4NO7A 1YUWA 2W40A 1X9JA 3H3OB 3WXKA 3CETA 3VPZA 3FZHA 3G25A 3R8EA 2IVNA 3ZEUB 1T6CA 2ITMA 5BN8A 1E4GT 2FF6A 2P9UA 5AZJA 5AQLA 3EO3A 1KAYA 4BR4A 3EL2A 4EIAA 2P9UB 2QWOA 5AZJB 1XC3A 2P9LA 4BVOA 2E2NA 5E84A 1NGHA 3RSEA 2FXUA 1GLBG 1KAZA 4WQ4C 3P4IA 3HBTA 4XH1A 1NLVA 4FWQA 3C7NA 1S3XA 2V7YA 3RSEB 4L3QA 5CE3A 3L6QA 3ZETB 4Y0WA 2GTDA 3W3DA 3CJ7A 4H0PA 4BC3A 5AQGA 1OKJA 3C7NB 1U2VA 3ATUA 4CZMA 3L4IA 3AY9A 3R6MA 3UKUA 4WQ4A 5AQYA 4H5WA 4I6MA 3JS6A 3MN9A 2UYTA 1GLEG 3VETA 5LJVA 1U2VB 3W0LA 2BTFA 3UKUB 3O1WA 5AFUH 3IDHA 4H0OA 5AQZA 3O6WA 4I6MB 5FPDA 4A61A 2HF4A 2ZWHA 3O5BA 2GWJA 3MN5A 3VESA 3QFPA 3F9MA 4FL9A 2I7NA 1NGBA 1BA1A 2H3GX 2Q2RA 3CJ1A 4KBOA 1BWFO 2E1ZA 3FGUA 2ZF5O 5JICA 2P9PA 4PL8A 1JCGA 4H5TA 3IMXA 2E1YA 3MMVA 2QWLA 2YJFA 4ISGA 5AZIB 3QFUA 2P9PB 4EAHD 1BA0A 4RWTA 2A40A 2CGKA 3FZKA 5EXWA 2P9SA 4H5VA 4H0XB 1V4TA 1QQMA 4AM7A 1Y64A 4XH4A 4FWKA 2Q0RA 3H45C 3QMLA 2P9SB 3B8AX 4BG9A 3WUHA 1MWKA 1SQKA 4FO0A 2CGLA 2FF3B 3LDNA 4FPAA 5AQFA 5BRDA 5KQDA 3BEXA 4BRQA 3D2EA 2E88A 4XH5A 3ULEA 5FPEA 4FWSA 4AM6A 1XQSC 2ZGYA 4BQLA 4MLEA 3A0IX 3WXLA 3BF3A 1Z05A 4FWMA 2F9TA 3D2EB 3FZFA 1CZAN 4BR0A 2A6AA 3EN9A 3VGLA 4M63C 3WQUA 1ZC6A 4HWIA 4DB3A 5LY3A 4FSVA 4CD1A 3IUCA 3U9DA 1YVNA 4GY2B 1GLCG 3FR0A 4JHDA 3VGMA 1NGJA 4CD3A 2GUPA 3VOVA 1GLAG 2ASOA 3TPQA 1H1VA 1NM1A 3O1BA 2W41A 1MDUB 5AQHA 1X3NA 5AQNA 2FSKA 4JHDB 3CHWA 5AQJA 2GWKA 1RFQA 3CIPA 1HPMA 4NB4A 3DJCA 3BF1A 3VEYA 4BGBA 2A42A 3M1FA 2A5XA 4WQ5C 1Q18A 2J4RA 4CZIA 2FSJA 5AQXA 3SLCA 1DKGD 4PL7A 5AQTA 3SMPA 4BRAA 2VCPA 3WXIA 1ZBSA 5AQVA 4BROA 1NGCA 3R9PA 1HUXA 1DEJA 4BG8A 5AQKA 4WQ5A 3QICA 2ASPA 1X3MA 4WYBA 4FWRA 3KHYA 2V52B 2YI1A 3D7EO 2A3ZA 5E26A 5JMVA 4BRHA 2Q36A 4J8FA 4QS8A 3VF4A 5KPRA 4IO8A 1T44A 2HMPA 4XEIA 4BC5A 4FOIA 5AQMA 3AAQA 1BG3A 3VGKA 2NZTA 2ZGZA 5AQPA 2A41A 1NWKA 1P8ZA 4H5NA 5KPZA 1T6DA 3CJAA 1NGEA 1DGKN 1U6ZA 3QBXA 4YDUA 1TYQA 4BGAA 2Q1NA 4M7XA 3HSCA 3KZBA 4JNEA 4E1JA 1NGFA 4BRNA 2QM1A 4HTLA 1TYQB 1J6ZA 2QWNA 2CH6A 2OANA 3CQYA 1C0GA 5AZIA 4BR5A 4B1YB 3LDQA 4K42A 1LOTB 3VEVA 3M3ZA 2Q97A 4B1UB 5JLHA 3LDOA 5BPLA 3MN7A 4K43A 3VERA 2F9WA 3LM2A 1ATSA 4O8KA 4B1WB 3VF2A 2HOEA 3LM9A 1V4SA 4QS7A 3ENOA 4H03B 5KPTA 1MWMA 1RDWX 1HJOA 3HZ6A 3A8YA 3H1QA 3IFRA 1LCUA 1TUYA 1XUPO 3MDQA 2GEMA 2QXLA 4M7YA 4PKIA 2P9IA 4CI6A 4RCHA 3A5MC 4FWPA 4JN4A 4FWOA 4FOEA 5F2RA 4CBUA 2YCHA 3LL3A 1IG8A 1WOQA 3VEXA 2BUPA 2P9IB 2E2OA 4CZKA 2QWQA 3BUZB 3L0QA 4BRGA 5FPMA 3UKRB 3KVGA 4K25A 2P9KA 4BREA 3LDLA 4EHTA 2QWMA 1NMDA 5BRHA 1YAGA 3VEWA 1HLUA 1ZXOA 3EZWA 4LC9B 4FWNA 1ATRA 4BRDA 5ELZA 2P9KB 4IJNA 2E8AA 3CJBA 4CJ7A 3VENA 3SK3A 3DXMB 4CZEA 3A5LC 1HKCA 3D2FA 2CGJA 2WUSA 4BRLA 2E20A 2QWPA 5EY4A 2E2PA 1JCFA 4MLHA 4MO5A 3H1VX 3CJCA 3D2FB 3O8MA 2D0OA 1KAXA 4A2AA 4BVPA 1BU6O 5ADXA 4CZGA 3WT0A 4BRPA 3HI0A 2I7PA 4ISEA 3UB5A 5F0XA 4B1ZA 4BC4A 4FPBA 4H0TB 5FPNA 4BRIA 5TKYA 4GNIA 3HM8A 3AAPA 2DPNA 3MN6A 4JD2A 3FFKB 2IVOA 3GG4A 4B1VA 4JAXA 1HKGA 1NGIA 1C0FA 4B1XB 3CJ9A 5BPNA 1NGAA 5BR9A 1IJJA 2E2QA 3GOIA 4IXCA 1EQYA 2HF3A 3JXUA 2AA4A 3FZLA 4JD2B 1QZ6A 4DCHA 3TU5A 3H3NO 3H6EA 3FLCO 3A5NC 3WXJA 4EHUA 3O80A 4YDUC 5AQQA 5BN9A 2YJEA 5KQ8A 4PKHA 1WUAA 4O5FA 3GDQA 1KXPA 1NGDA 3BP8A 3CI5A 1GLLO 1GLFO 2D0PA 2NRHA 3QBWA 3SMSA 2YHWA 2P9LB 4BRKA 5F1XA 2YHYA 1JCEA 1SZ2A 1BOTO 4QS9A 3EKSA 5EVZA 3GL1A 5AQSA 2KHOA 1QHAA 1SAZA 3ATVA 1GLJO 1K8KA 2CH5A 3U4LA 4FWLA 2Q0UA 4EFHA 4F9OA 5B8HA 5LJWA 1MA9B 3DXKA 4PKGA 5BPMA 1G99A 1QQOA 1HX1A 1K8KB 4K41A 2FLOA 2QWRA 4BRFA 1NBWA 4BR2A 3QDKA 4A62A 2D1KA 3DXKB 4DQ8A 2V7ZA 1BO5O 2YHXA 1ESVA 1GLDG 3OHRA 3U9ZA 4BRMA 4CZJA 3CERA 3QB0A 3WQTA 4BC2A 3VEOA 3S41A 3A5OC 2FSNA 5AFUA 4IWVA 1R59O 4H5RA 2P9NA 1QQNA 3FE1A 1TUUA 4MO4A 3H46O 5BRFA 5EOYA 3J8AA 3SJHA 4CZFA 3ZX3A 4Z94A 5AQUA 2EWSA 2P9NB 4ISFA 3GE1A 3HTVA 5AR0A 2QW9A 2IVPA 4RTFD 4IZ9A 4CBWA 2VYPA 3C0BA 4DHYA 3LDPA 3EKUA 2GELA 5AQOA 1BDGA 3UKRA 3WEEA 4IJAA 3VEZA 4A2BA 2ASMA 3I33A 3GBTA 4H0VB 3M6GA 1RGIA 1HKBA 3U8XA 2VWBA 2AP1A 4B9QA 1ATNA 1NGGA 2IIRA 5EX5A 3WEEB 2V51B 4BRCA 4C23A 1YXQA 3DXMA 4CZLA 4BR9A 4H0YB 3AARA 3MCPA 3UE5A 1BUPA 5AQIA 3VF6A 2NLXA 3ID8A 1D4XA 2PBDA 2PAVA 3DWLA 3ZETA 1E4FT 3FZMA 3CQXA 5ADXH 3ULEB 1QZ5A 3ZX2A 3O08A 4BR7A 4CZHA 5I9EB 1S22A 2D4WA 4BQZA 3MK6A 3ENHA 2Q31A 4CBXA 3I8BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O9SA 3SQ2A 4E7KA 3I56N 3DAWA 1Z6RA 4LH4A 3O4WA 2QKBA 2W40A 3QERA 2ZQBA 1NK5A 2HVHA 3G25A 2IVNA 4YOVA 2KZMA 2ITMA 3ZSOA 1RTDA 1S9GA 3OYGA 4IOCL 3ENBA 3E9LA 4DUZK 3OYAA 5AZJB 4BVOA 3KLGA 3ZT1A 5E84A 3RSEA 1GLBG 1KAZA 4WQ4C 1S3XA 5CE3A 2F8TA 1SKWA 4Z4GA 3RR8A 2A1SA 2DY4A 1OKJA 3UIQA 4DR1K 4I7FA 3O4QA 5AQYA 2FBYA 5LJVA 1U2VB 2BTFA 3B6OA 3CPWM 5AQZA 4RW6A 3L2RA 4A61A 3O5BA 2ZWHA 3MN5A 4BDZA 1TAQA 5GIPA 3F9MA 4LF9K 2FBTA 1BCMA 2H3GX 2IGIA 3CJ1A 1NK7A 4JI6K 4FCYA 2P9PA 4DS4A 4FZYA 4JKHA 1K73O 2E1YA 4KI6A 4OLAA 4LF6K 2QWLA 2YJFA 4EAHD 1NJZA 3HP9A 4KH4A 1I3AA 4J2EA 4KHYA 5EXWA 3HO1A 1E3MA 3V6DA 2P9SA 1EXQA 1Y64A 4XH4A 2QEXN 2UXCK 2Q0RA 1HNZK 3E9OA 2GBZA 3P5JA 3VQ4A 1MWKA 1SQKA 3ZT2A 2CGLA 2FBVA 4WFBL 3PO5A 4BRQA 1S1UA 1VAZA 3D2EA 1HNVA 5FPEA 4FWSA 3O9RA 3ZSWA 4AM6A 5HRPA 1UA0A 1X9WA 3ALYA 2QKKA 3A0IX 1N32K 1R0AA 1Z05A 4KRFA 4DU1A 1RILA 3ULDA 2B5JA 1EWQA 3SPZA 1G15A 2KZZA 4GY2B 4KREA 3FR0A 3CPEA 1NGJA 2F8SA 3ASMA 1NM1A 1VQNN 3I55N 4CF8A 1VSEA 3M8RA 4F2SA 4JHDB 4L8RB 3CHWA 2I5JA 1IKVA 4N76A 3THYA 2GWKA 3F2KA 2A5XA 2HNZA 1Q18A 2J4RA 4CZIA 1QHTA 1Q9YA 4Z4FA 5AQXA 1WBBA 2HHTA 3SLCA 1EX4A 3MCAB 4BWJA 4FYDA 4DSIA 3SMPA 2IS3A 2VCPA 1IV0A 3R1XA 3NGZA 4B8CA 2O8BB 3K5OA 1KVCA 3SI6A 4BROA 4NLCA 2P5GA 1C1BA 3P1GA 1O1WA 4BG8A 1QS4A 2B4JA 3SYZA 1NK4A 3QICA 4CFCA 5GAGP 4DV6K 2HHXA 2V52B 1FKPA 2A3ZA 4XJXA 4FOIA 3AVLA 3TSPA 2NZTA 1VQON 3PX6A 1IBMK 2A41A 1T6DA 4G9ZA 3CJAA 3NF6A 3U3GA 1NGEA 1DGKN 1J5EK 1TYQA 4LY7A 5KRTA 4OGEA 3DI6A 3AVKA 4JNEA 1REVA 3NFAA 3NF8A 4FLVA 4ID1A 3QNNA 2Q97A 2OPPA 3ISNC 4K43A 2F9WA 3LM2A 3VQBA 5TKWA 3HPOA 3ENOA 1VQ8N 5KPTA 3NBPA 3QEXA 3QETA 1HJOA 2LSNA 4DTNA 1WSIA 2HHVA 1SKRA 1LCUA 4E1MA 2QK9A 4DR6K 4UY8O 1YT3A 3KD1E 3BZCA 4PKIA 3A5MC 4FWPA 5JS2A 1S6QA 2HNDA 4FWOA 3RMCA 3TANA 3QO9A 3LL3A 3NE6A 1ZBLA 3D0PA 4CZKA 2HBJA 3ZSRA 2R7YA 4PWDA 5BR8K 1IBLK 3HYFA 1U04A 4EHTA 2QWMA 5BRHA 2XHBA 4GVEA 4ZTJA 3LWMA 3C6HA 3KLEA 2OZSA 1HLUA 1ATRA 2XO7A 1KD1O 4C8NA 4RW9A 1JJ2M 3T1HK 2VWKA 3CJBA 4DR2K 3NMUA 4CF1A 5M1FA 2YV0X 3DXMB 3AO1A 1VQ4N 2E2PA 1JCFA 4X65K 5C25A 4M3ZA 1WSGA 1NJXA 3T1AA 1BIUA 4Z4HA 1BU6O 4R79A 3NH0A 3HI0A 4ISEA 3UB5A 5F0XA 1VRTA 4B1ZA 4YNQA 4E72A 3SBTA 3SV4A 2ITGA 5FPNA 4BRIA 5TKYA 2G8IA 2DPNA 3LALA 3FFKB 4JAXA 1UWBA 1C0FA 5BPNA 1IJJA 4IXCA 3GOIA 4B9SA 4DLEA 2C1IA 4JD2B 4R5PA 4PUOA 4NYFA 4ILJA 4YY3K 3H6EA 4AILC 3A5NC 3TAQA 3LAKA 3OS1A 3P31A 2JWKA 3MXMA 5AQQA 3OYEA 1K8AO 3TTFA 2HMIA 1NKCA 4DS5A 1KSPA 4CJEA 3DYAA 3GDQA 4CESA 1KXPA 3AO3A 4CHYA 3CC4N 3WNEA 1S6PA 4NXNK 1GLFO 3A2FA 3QBWA 1Y97A 1JCEA 1SKSA 1BOTO 3SQ1A 4OPHA 2JLEA 2KHOA 2P1JA 3E66A 4DQQA 4KHNA 3TARA 1K8KA 3VA3A 1NOZA 4F9OA 2HBMA 3HSTB 4CJSA 4PKGA 1ZYQA 1G99A 3TTDA 1QQOA 2UXBK 1NBWA 1YF5L 4DTXA 4BR2A 3ZT3A 2VQFK 2OCEA 4A62A 4A59A 2Y1IA 3OTOK 3M8QA 3LWLA 4YOUA 4KPYA 4LD0A 3PSIA 3QEVA 3U9ZA 4YOWA 1N5YA 4DSLA 3VEOA 4J2BA 2FSNA 5MLCQ 1NK6A 5M1OA 4LF8K 5D3GA 4W5QA 2NNWA 5BRFA 3H46O 3J8AA 4CVNE 3RMDA 1WSFA 3THWB 2P9NB 3GE1A 3HTVA 4RTFD 3KWIA 3V9UA 4IZ9A 4DHYA 4PA1A 5I3UA 4ID5A 2Y1JA 4ILHA 4GW6A 2UU9K 5GAEP 3WEEA 4A2BA 2ASMA 3GBTA 4H0VB 4QAGA 2RN2A 2VWBA 1JKHA 1LW2A 1IO2A 4B9QA 1U45A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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