5LY3A

P. calidifontis crenactin in complex with arcadin-2 c-terminal peptide
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
427
structure length
427
Chain Sequence
ISDAYRLKYTFGVDFGTSYVKYGPITLNEPKMVQTRGLFLRDLPESVKMRIPPDVLARGLVVGDEEVRKYLSSVRDVQRNLKYPLKDGVARRDDEEAWRVLKELARYTLAQFPVSDPEFAGWLVAVALSALAPDYMYKAIFDIYDELASEFKIYAVTILPQPLAVAIAENAVNCVIVEGGHGNIQVAPISFALIREGLVALNRGGAEANAITREILKDIGYSDIAREEYAVEVVKRAVGLVPRRLKEAIRAAKSDPDRFVTKVRLSPVVEVEIPREYAWTRFLIGEIVFDPNHEEIKSYIEQSRLRIENAVIGDVTLYGEMDVASAIITSLRNVSVEIQERVASQIILSGGAFSWRVPPGMEDVAADSVTRVKIALEEKSPALASKVEVRLVSEPQYSVWRGAVIYGYALPLSLEWSDTTREGWRFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crenactin forms actin-like double helical filaments regulated by arcadin-2.
pubmed doi rcsb
source organism Pyrobaculum calidifontis
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin/actin family protein
total genus 139
structure length 427
sequence length 427
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ly3A01
3.30.420.570 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ly3A02
5FPNA 4B9QA 5BREA 5FPMA 5BN8A 4JNEA 2P9NA 2P9UA 3KZBA 4IJAA 2W41A 4JD2A 1NWKA 3CJBA 3ATUA 5F0XA 2DPNA 2YJFA 1D4XA 3MN7A 1YUWA 1SAZA 4K42A 4MLHA 3VENA 1U2VB 1J6ZA 2E1ZA 3CI5A 1BU6O 4H03B 4ISFA 4BR5A 2F9WA 1BUPA 1C0GA 4H0PA 3J8AA 4BQLA 4Z94A 5AQXA 4BRQA 2P9PB 2Q0UA 3CJ7A 5BN9A 1JCEA 3VOVA 3BP8A 3A5LC 3A8YA 2V7ZA 5AQQA 2V7YA 1T6CA 4BRCA 3HTVA 4I6MA 1U2VA 3BF1A 3MN6A 3CQYA 1Z05A 4RCHA 3LDPA 4H0TB 3VEVA 5F1XA 3EN9A 4JD2B 2P9UB 1HX1A 4XH4A 2P9SA 4H5VA 1BG3A 1MA9B 2NZTA 5AQJA 5AQUA 3MN5A 2A6AA 2YI1A 2V52B 4BGAA 5AQGA 1SQKA 4WYBA 5BRFA 4BRAA 5BPMA 3MCPA 3LM9A 2QWRA 4PKIA 1DGKN 3L4IA 2Q0RA 4WQ5A 3FLCO 5AQOA 3W0LA 4FWOA 3HI0A 3SLCA 3BUZB 4IZ9A 1XQSC 3VPZA 5FPDA 1HKGA 3VF2A 3QBWA 1NGEA 1QQMA 3O6WA 1IJJA 1GLBG 1U6ZA 3ATVA 4IXCA 1ZBSA 2ASPA 4DHYA 1BDGA 5FPEA 5F2RA 2A3ZA 4JN4A 4FWKA 2P9PA 3U9DA 3FR0A 1K8KA 1E4GT 1WUAA 1QQOA 1GLFO 1S3XA 1GLLO 2FSNA 4FOEA 3MK6A 2GEMA 4A62A 4B1YB 5AQHA 5E84A 4BROA 4EHUA 4CBXA 3FZFA 1LOTB 3WXJA 4B1VA 1ATSA 1IG8A 2FSKA 4BGBA 1Q18A 4C23A 1NGDA 3RSEB 4FWMA 2QW9A 4FWLA 4BC3A 3EL2A 4K43A 5EXWA 1NGHA 1SZ2A 1ATRA 5CE3A 3VGMA 4JAXA 3FGUA 3DAWA 4PL8A 2P9KB 2IIRA 3VETA 3SJHA 1TYQB 3O1WA 4K41A 1EQYA 5LJWA 4NB4A 2FF3B 2YHXA 3H1VX 4FSVA 3MN9A 4PKGA 4WQ4A 3HZ6A 1V4SA 3D2EB 3VF6A 2J4RA 2E8AA 1MWKA 1K8KB 3GG4A 1GLAG 3UB5A 2BUPA 3ZEUB 1NGAA 3F9MA 4KBOA 3AAQA 3GOIA 3R9PA 3FZMA 5KPRA 1RGIA 3DXKA 3ZX2A 1HUXA 1BWFO 3IMXA 3DXMB 3R8EA 3P4IA 1V4TA 3GDQA 1Z6RA 4K25A 4LC9B 2P9IB 1JCFA 4ISGA 4ISEA 2ZGYA 2QWPA 4AM7A 4CZHA 3VEYA 1NBWA 3H45C 4QS9A 4M7YA 1KAZA 3ZX0A 5AZJB 2F9TA 3AAPA 4H5NA 1G99A 3CJ1A 5E26A 1QZ5A 3O80A 3QFUA 2GTDA 4CBUA 4MO4A 3MDQA 3FZHA 5AQLA 4FOIA 2YHYA 5AQNA 4BC5A 4BG8A 1NGBA 2H3GX 4F9OA 3U9ZA 3H6EA 3O4WA 4A2BA 4BR0A 3KVGA 2ZWHA 4HWIA 5KQ8A 4O8KA 4FWPA 4I6MB 1NGIA 1HKBA 3QDKA 4FWQA 1MWMA 4FWNA 2OANA 2D1KA 3M3ZA 2I7PA 4FO0A 3VGLA 3SK3A 1DKGD 3A5NC 3KHYA 4GY2B 3WQTA 4M7XA 2A41A 2E88A 1BA1A 4H0OA 3VF4A 4BRDA 5ADXA 3U4LA 2E2QA 3ZX3A 2ZGZA 3U8XA 5AQSA 5BRDA 1MDUB 3I33A 5AR0A 3W3DA 1KXPA 2FSJA 3D7EO 3ZETA 2QM1A 2A42A 1HLUA 4BRLA 4XH5A 1HKCA 1ZC6A 5AQPA 3WEEB 4BRPA 2CGLA 2Q1NA 3C7NB 4IWVA 5AQVA 2Q31A 3LL3A 5AFUA 1GLJO 2QWLA 5AZJA 1YAGA 3ENOA 4B1XB 5KQDA 5AQFA 1ZXOA 1RDWX 5EVZA 3LDOA 4PKHA 2QWNA 3LDLA 3L0QA 4J8FA 4RWTA 3WXLA 3TPQA 4H5TA 3AARA 2A40A 3DXKB 2Q2RA 2GWJA 2CGKA 4YDUA 5LJVA 5AQIA 3HSCA 3D2FA 3FZKA 1DEJA 3S41A 3VEOA 3ZEUA 3DJCA 2A5XA 1ATNA 2FLOA 2QWQA 4BR7A 2IVPA 5AZIB 1RFQA 4EFHA 5EY4A 4AM6A 3EKSA 4EAHD 4H5WA 4FWSA 2VCPA 2W40A 3O5BA 3QICA 4WQ4C 4FPAA 3I8BA 1P8ZA 2IVNA 3ULEA 3DWLA 3UKUB 1TYQA 2GELA 2GUPA 4BRFA 5BPNA 3UKRB 1BO5O 3CERA 2E20A 3QFPA 4EIAA 3QBXA 4L3QA 4CJ7A 2P9KA 4HTLA 3B8AX 4QS8A 3QMLA 3FFKB 3VESA 1BA0A 3WXIA 1NM1A 5I9EB 2ASOA 3GL1A 5AQKA 4DCHA 1NMDA 3LM2A 5B8HA 3LDQA 3QB0A 1CZAN 2PAVA 4E1JA 2D4WA 3BF3A 1E4FT 2FXUA 4M63C 3UKRA 2WUSA 3FE1A 2QWOA 4FL9A 4BVOA 4RTFD 4GNIA 2V51B 3UKUA 5JICA 3FZLA 1NGJA 5ADXH 3MMVA 4CZKA 3VERA 3TU5A 2E2OA 3ID8A 5EOYA 5KPZA 1T44A 4IO8A 5BR9A 1GLCG 1S22A 4A61A 2KHOA 4CBWA 3A0IX 2E2PA 4BQZA 2HF3A 3R6MA 1C0FA 3VGKA 3C0BA 5KPTA 2E1YA 4XEIA 1GLEG 3A5MC 3GBTA 1NGCA 3CQXA 5AQYA 2VYPA 4H0VB 1JCGA 3H3NO 4H0XB 4BRNA 2HOEA 2CH5A 2E2NA 3M6GA 5ELZA 1T6DA 1HJOA 3WEEA 4B1ZA 1R59O 1NGGA 2P9SB 3EKUA 3EO3A 2Q36A 2YCHA 3GE1A 3ZETB 2CH6A 2QXLA 3VEXA 5JMVA 3AY9A 1QHAA 4O5FA 3H46O 4FWRA 2IVOA 4BRMA 4YDUC 2D0PA 1OKJA 1Y64A 5AQZA 3IDHA 2AP1A 3SMPA 4PL7A 1YVNA 2HMPA 3A5OC 4BR2A 4BVPA 5AQTA 4BRHA 2YHWA 1KAYA 5LY3A 4MO5A 4CZLA 3D2EA 2VWBA 3JS6A 3HBTA 5BRHA 2BTFA 3G25A 3WXKA 5JLFA 3WQUA 1NGFA 3JXUA 3O08A 4BREA 3O1BA 3WT0A 4BRKA 1XC3A 1LCUA 1H1VA 2EWSA 2QWMA 4CZMA 1X9JA 1X3MA 2P9NB 2YJEA 3BEXA 1QQNA 3IUCA 4B1WB 2FF6A 4JHDB 2AA4A 4QS7A 3H1QA 1BOTO 5AFUH 4CD3A 4CD1A 4CZEA 3EZWA 4BR4A 3VEWA 2ASMA 1NLVA 4MLEA 3RSEA 3LDNA 3CJAA 3M1FA 4BG9A 4CZJA 4CZIA 5BPLA 2HF4A 2NLXA 1XUPO 3UE5A 3CIPA 2P9IA 3ENHA 2P9LA 3CETA 1TUYA 4H5RA 3ULEB 4A2AA 3DXMA 2ZF5O 1X3NA 1KAXA 3CHWA 4DQ8A 3CJCA 2I7NA 3H3OB 1YXQA 5AZIA 4BRGA 3SMSA 3OHRA 5AQWA 3HM8A 4CZGA 2ITMA 3D2FB 3IFRA 2CGJA 1WOQA 2GWKA 2NRHA 5EX5A 4XH1A 4BR9A 4B1UB 1GLDG 4FPBA 4NO7A 1ESVA 3VEZA 2P9LB 4BC4A 5JLHA 1TUUA 2D0OA 4CI6A 3WUHA 5TKYA 2PBDA 3L6QA 4WQ5C 1HPMA 2Q97A 4EHTA 3O8MA 4Y0WA 2UYTA 4IJNA 1QZ6A 4CZFA 4DB3A 3C7NA 4H0YB 4BC2A 5AQMA 4JHDA 5AQRA 4BRIA 3CJ9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1C0TA 4KV8A 4CEQA 5FPMA 5BN8A 1ZBFA 1KVCA 2P9UA 4IJAA 2P5OA 4JD2A 4WFNL 3H08A 5KGWA 4OGCA 4CJLA 3VENA 1U2VB 2E1ZA 1BU6O 1IO2A 2O8CB 4H0PA 4Z94A 4DV1K 1WBDA 4BRQA 1WNSA 2P9PB 2G8KA 4Q5VA 4PA1A 3K59A 3G6EN 5M1KA 4WF9L 1U4BA 3OYJA 4KTZA 3L3UA 4I6MA 3QETA 3CQYA 1RT7A 4F4KA 4HVJA 3K9KA 3EN9A 3DYAA 3SQ1A 2NZTA 1J54A 3QINA 4E0DA 3MN5A 4FCYA 2G8VA 4FLUA 1KQSM 3MCPA 4GMJB 4PKIA 3DLGA 3I0SA 5I3UA 5AQOA 4B9TA 4BE1A 3HI0A 3SLCA 3SZ2A 3K5OA 3TABA 1SKWA 4AH9A 3SYZA 4E89A 4GW6A 5FPDA 4KH6A 4AHVA 3VF2A 3V4IA 2QTDA 3L8BA 1EWRA 1U6ZA 2VG7A 1A5XA 4MQ3A 3KWIA 1TAQA 2ASPA 1HYVA 1HNZK 3CMEN 4U7BA 2P9PA 3U9DA 4DU1A 4DR6K 3V81A 1C6VA 1GLFO 1LW0A 1S3XA 3U3YA 3RRGA 4A62A 2HBLA 1YJ9N 4JKFA 1RNHA 5AQHA 2P51A 4JKHA 4EHUA 3KJVA 3FZFA 4B1VA 3KD1E 3SAGA 1Q86O 2O8EA 3SAHA 4FWMA 3LANA 1KD1O 4K43A 4FK4A 5EXWA 4DTOA 5CE3A 5HRPA 4Z4CA 3AVHA 4JAXA 2O4IA 3DAWA 2VG5A 4A59A 3AA3A 4KI6A 4CGDA 4H4MA 3VETA 2Z1HA 3SJHA 1KLMA 3DLEA 1C1BA 3NGZA 4PKGA 4DFKA 4DV7K 3HZ6A 3VF6A 3ZT3A 2E6LA 4JKGB 2ETJA 3ZSZA 3TR8A 3UB5A 1RT2A 3ZCMA 1UA0A 3QEWA 3R9PA 3AV9A 4JK7A 1ZYQA 4DTSA 1W7AA 4OPAA 2OA8A 1HMVA 3NDKA 3R8EA 3IAYA 3P4IA 1V4TA 4DSKA 3GDQA 2Y1JA 4K25A 1XNQK 3OS2A 4ISEA 2Z1GA 1K8AO 3NGYA 4DS4A 3H45C 3QERA 2F8SA 1KAZA 3M8PA 5DM7L 1YTUA 2F9TA 3LWLA 4M3RA 1CZ9A 1YJWN 4DR4K 4NYNA 4NCBA 4CBUA 4CJPA 3TSUA 3FZHA 4FJLA 3CF5L 4BC5A 2D5RA 2H3GX 1SS6A 3R3LA 3O4WA 1RTDA 4BR0A 4O8KA 3J7YP 2EX3A 1N33K 2I7PA 1VSEA 1DKGD 3KHYA 4DWIA 1T05A 4H0OA 3VF4A 1VQ6N 4K0KK 4ID5A 1VQ7N 1WN7A 1S72N 3I33A 3AA5X 5AR0A 4FW2A 4IFEA 5E41A 1FKOA 3C95A 3C94A 3KK2A 2FSJA 2BH1A 3N4QA 4W5NA 1C1CA 1HKCA 3P5JA 1RBRA 2CGLA 4CJ4A 3F9KA 3C7NB 5BR8K 2OCEA 3ALYA 2Q31A 2KTQA 5AFUA 1GLJO 5GAHP 5AZJA 2XHBA 3LP0A 1ZXOA 1RDAA 1TV6A 4M41A 3TAGA 1D5AA 3T69A 3D6RA 4JKCA 3WXLA 4IFVA 3TPQA 3WXMB 3ZSXA 2A40A 5FRNA 4F3OA 5AQIA 5MLCQ 3HSCA 2EHGA 3FZKA 3VEOA 2IOCA 2JWKA 2W6LA 1RFQA 4HCBA 4KRFA 2DFFA 4O55A 4AM6A 4EAHD 4DTNA 2VCPA 1KVBA 1SKSA 2NUBA 5EU7A 4LFCK 4J2AA 1BQMA 3QEXA 3RMBA 3DWLA 1VAZA 3V9UA 1VQMN 5BPNA 1BGXT 3UKRB 5M1PA 4JEPA 3QFPA 3TARA 3TAPA 3QBXA 3ZT4A 4L3QA 4CJ7A 4BACA 4IDKA 3O3GA 1NOZA 3AVLA 3VESA 3WXIA 1NM1A 4AQYK 1DTTA 4AHUA 4BE2A 3CPWM 1WLJA 3LDQA 1LWEA 2D4WA 1XHZA 3RTVA 2FXUA 4FZXC 4RTFD 2V51B 5JICA 1JJ2M 1KFDA 4JKEA 3MMVA 2E2OA 3PO5A 4C8OA 1B9DA 4M3WA 2KKZA 1J5EK 3CD6N 1NJXA 4A5AA 1X1PA 3V1OA 5HP1A 5AJ3K 1MU2A 3OA9A 3IRXA 3CCVN 3OYMA 1BCOA 1S5JA 1QSSA 5LMNK 4KO0A 2AJQA 2HF3A 1NK4A 2RKIA 1TKDA 2E1YA 1GLEG 1C0MA 3THXB 4YOYA 2VYPA 3LPTA 3TI0A 2W6KA 3L4QA 3D0PA 5C0YA 4YOWA 3SCXA 1FXXA 1HJOA 3WEEA 1R59O 3TAMA 3EO3A 3BZKA 4JKBA 2CH6A 2PYJA 3S3MA 2WC9A 4B9LA 4DTJA 4FWRA 1IKVA 1L5UA 4BRMA 4YDUC 2DY4A 2D0PA 1OKJA 1IH7A 5AQZA 1TK8A 2HNDA 2AP1A 4FJGA 4AHSA 1YVNA 3TSQA 3A5OC 3RR8A 3J81O 4RW8A 3VTHA 2JGUA 4MO5A 2VGNA 3ULDA 1EKEA 3G25A 4O4GA 2YHAA 3JXUA 3CCUN 4BREA 3HT3A 2XRIA 2OPPA 3O1BA 4B9MA 1XC3A 1LCUA 2QWMA 3L2WA 4CZMA 4DS5A 1X9JA 3KKSA 3CC4N 4W5TA 3VA3A 3HO1A 4PQUA 4JHDB 1I94K 1BOTO 4FJ5A 4CD3A 4JI3K 1YF5L 2ASMA 2NRWA 3VN5A 3LDNA 1RT6A 3CJAA 4RW9A 4JRQA 5BPLA 1XUPO 2Z1JA 1YJNN 1TUYA 3VQAA 3THYA 3C6UA 2OZSA 4A2AA 3DXMA 4B8CA 4FM2A 2RN2A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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