5LY3A

P. calidifontis crenactin in complex with arcadin-2 c-terminal peptide
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
427
structure length
427
Chain Sequence
ISDAYRLKYTFGVDFGTSYVKYGPITLNEPKMVQTRGLFLRDLPESVKMRIPPDVLARGLVVGDEEVRKYLSSVRDVQRNLKYPLKDGVARRDDEEAWRVLKELARYTLAQFPVSDPEFAGWLVAVALSALAPDYMYKAIFDIYDELASEFKIYAVTILPQPLAVAIAENAVNCVIVEGGHGNIQVAPISFALIREGLVALNRGGAEANAITREILKDIGYSDIAREEYAVEVVKRAVGLVPRRLKEAIRAAKSDPDRFVTKVRLSPVVEVEIPREYAWTRFLIGEIVFDPNHEEIKSYIEQSRLRIENAVIGDVTLYGEMDVASAIITSLRNVSVEIQERVASQIILSGGAFSWRVPPGMEDVAADSVTRVKIALEEKSPALASKVEVRLVSEPQYSVWRGAVIYGYALPLSLEWSDTTREGWRFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crenactin forms actin-like double helical filaments regulated by arcadin-2.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
source organism Pyrobaculum calidifontis
molecule keywords Actin/actin family protein
total genus 139
structure length 427
sequence length 427
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ly3A01
3.30.420.570 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ly3A02
2YJFA 4FOEA 2Q31A 3OHRA 1K8KA 5AQVA 5AZJB 3G25A 5AQLA 3WXKA 4XH5A 1R59O 1NM1A 4BRMA 2GWJA 5KPZA 1QQOA 2ITMA 1JCFA 4RCHA 3LL3A 5AQWA 4BRNA 4BRAA 1NGBA 4DQ8A 1HKBA 2V51B 2ASPA 3A5NC 5CE3A 4BRGA 1ESVA 5E26A 1GLAG 3A8YA 1C0FA 3GOIA 5KQDA 1GLFO 2Q36A 1MA9B 3ZEUA 4B1ZA 1YUWA 3O8MA 3C7NA 5B8HA 2P9PA 3FZKA 3VENA 3U9ZA 4CJ7A 3UKUA 4CBUA 5EVZA 5AQYA 1WOQA 4H0OA 2GWKA 5AQNA 5FPMA 4WQ5A 3D2EB 4HTLA 1BU6O 2A40A 4B1VA 3CQYA 1TYQB 1X3NA 4H5NA 3TU5A 4BRLA 3I33A 5AQMA 4BR2A 1KAYA 1DGKN 3WEEB 4L3QA 3FGUA 5BRDA 4ISFA 4QS9A 3UKRA 4JHDB 1KAXA 1ZXOA 3QDKA 2I7NA 3I8BA 4NB4A 5EY4A 3BEXA 4QS8A 4MO4A 2NZTA 1IJJA 4AM7A 4CZFA 3RSEB 3GDQA 5AQJA 5AQSA 4H0YB 4H5RA 1NGAA 4JN4A 4PKIA 2ZF5O 3FE1A 4WQ4C 4BG8A 2P9LA 2A41A 4PL7A 3QICA 2AP1A 1MDUB 5BN9A 1CZAN 2IVOA 4FPBA 2AA4A 3VGKA 1U2VB 2YHYA 4BR5A 3MDQA 5LJWA 3AARA 2DPNA 3IMXA 5EX5A 2E2QA 3M1FA 1S22A 1NGEA 3IUCA 4H5VA 3BUZB 5AQOA 2GELA 1IG8A 3H45C 3R8EA 3O5BA 3SMSA 4FO0A 1U6ZA 1DKGD 2A5XA 3QBXA 2IVPA 3LDQA 3WT0A 2H3GX 4BC4A 3F9MA 2E1ZA 3VPZA 5E84A 1GLEG 2P9NB 1NMDA 2I7PA 2V52B 3HSCA 1QZ6A 1GLBG 2D4WA 1BA1A 2YHXA 1SQKA 2P9SA 3QBWA 4H0PA 5AQRA 2UYTA 3UB5A 3O80A 3S41A 1NGCA 3CJCA 2VYPA 3ENOA 3D2FA 3L4IA 1BO5O 4MLHA 5JMVA 4CBXA 1HKCA 3WXJA 2BTFA 2V7YA 3GE1A 5EOYA 3U9DA 4PKHA 4O8KA 3W0LA 3WQUA 3M6GA 3JXUA 2FSNA 1QQNA 4H5TA 4FL9A 3CJ7A 1YVNA 2PAVA 1BUPA 2P9KB 4DHYA 2GTDA 3MN6A 3VEOA 4CZKA 1NGJA 4BRFA 3U4LA 3O4WA 3FFKB 3UE5A 2HOEA 3WXLA 3DXMB 2CGKA 3EZWA 5AZIA 4NO7A 3DJCA 4BR7A 1NGGA 5AQIA 3HTVA 4A62A 3DXKB 3ZEUB 4YDUA 4BRPA 3CETA 5BRHA 2OANA 2FXUA 2QM1A 4M7XA 3ATUA 4FWOA 4M7YA 4IZ9A 3MN5A 1HX1A 4WQ5C 3CJBA 4CZLA 1T6DA 3MCPA 4PKGA 2VCPA 5JLFA 4DB3A 1Z6RA 4AM6A 2FF3B 3JS6A 4BC3A 2NLXA 2P9IB 3HZ6A 2Q1NA 4BRIA 5AQKA 1GLCG 2QWOA 4A61A 3R6MA 4BG9A 4BGBA 2PBDA 2V7ZA 5AQTA 4H5WA 4A2BA 1BWFO 4IWVA 1QHAA 3VEVA 3ENHA 3QB0A 3MMVA 1HLUA 2YJEA 2D0OA 5AQUA 3CJ1A 4FWMA 1SZ2A 2ASOA 2NRHA 2Q0RA 3J8AA 3QFUA 5AR0A 2VWBA 5KPRA 3EO3A 2E8AA 4B1YB 3CJ9A 4WYBA 2ASMA 3BF1A 4GY2B 3KVGA 4GNIA 1T6CA 3HBTA 4K41A 1Z05A 3D2EA 4J8FA 1XUPO 2YHWA 3ZETB 2P9LB 1TYQA 2E88A 1V4TA 4I6MA 1HJOA 1XC3A 1ATSA 5KQ8A 1Y64A 5BRFA 4MO5A 5KPTA 4K42A 2CGLA 3ZX2A 3WEEA 5ADXH 3A5OC 4FWPA 5JICA 1T44A 4BREA 2QWQA 4M63C 2P9UB 3HM8A 5AQFA 4KBOA 4B9QA 4JHDA 4CZEA 4EIAA 3HI0A 5BPMA 1MWKA 1D4XA 1XQSC 3CJAA 3O1WA 3WQTA 3RSEA 5FPDA 3A5MC 4MLEA 3H1VX 4C23A 1RDWX 4JD2B 2FLOA 3IDHA 4BRKA 2F9WA 3IFRA 3VETA 4BVOA 4EFHA 2HF3A 3VEXA 3FR0A 4EAHD 5JLHA 4BGAA 1BA0A 3GG4A 1U2VA 1OKJA 1GLLO 2QWRA 1JCEA 1KXPA 4F9OA 3D2FB 3DWLA 5AFUH 1NGHA 4BQZA 1Q18A 3KZBA 3TPQA 5FPEA 3CI5A 1BOTO 2IIRA 4ISGA 3C0BA 1BG3A 4BRCA 4RTFD 3SLCA 5BPNA 1S3XA 3H3NO 2W41A 2QWMA 1K8KB 2W40A 4IO8A 3R9PA 2P9NA 3VF4A 3FZFA 5LJVA 3LDNA 3H3OB 4H0VB 2QW9A 3KHYA 3O1BA 3VERA 1HPMA 1SAZA 4FWQA 2CH6A 1X9JA 2A42A 3MN7A 3VEZA 4BROA 2E2OA 3B8AX 1WUAA 5BN8A 3ULEA 4LC9B 2HF4A 3D7EO 5BREA 4YDUC 3L0QA 2QWNA 4CBWA 2CH5A 1TUYA 3BF3A 3M3ZA 4FSVA 1P8ZA 4H0TB 3H1QA 5BPLA 2E2PA 3C7NB 2P9PB 3SMPA 4CD3A 3MK6A 3SK3A 2FF6A 3EN9A 2P9KA 3A5LC 4BRDA 3BP8A 4FWKA 4CZIA 3FLCO 3UKUB 1C0GA 5AZJA 4DCHA 5ADXA 1J6ZA 4BRHA 2YCHA 4BQLA 4FWNA 3VF2A 3DXMA 3LDLA 1EQYA 2E20A 3FZHA 1GLJO 4A2AA 4CZJA 3LDOA 1YXQA 3QFPA 5AQXA 1NWKA 1H1VA 3DXKA 3P4IA 3VEWA 3ZX0A 2YI1A 1ZBSA 5AQZA 5AQHA 2QWLA 4QS7A 3UKRB 3WUHA 2ZWHA 4FWLA 4B1XB 5AQQA 2QXLA 3H6EA 2Q97A 1KAZA 5AFUA 5I9EB 3VGMA 4RWTA 4ISEA 3VF6A 1LOTB 4B1WB 3H46O 4BVPA 4I6MB 4HWIA 3GL1A 2P9IA 1NLVA 3DAWA 5F1XA 3WXIA 1MWMA 4BR0A 2E2NA 1RGIA 5LY3A 3AY9A 1E4GT 3CERA 1X3MA 1ATNA 2GEMA 3CHWA 1V4SA 1ATRA 4O5FA 4Z94A 5ELZA 1JCGA 3EL2A 5F2RA 3O6WA 2EWSA 1GLDG 2F9TA 2A3ZA 3LM2A 4FWSA 3CIPA 1QZ5A 2E1YA 2FSJA 3ID8A 3FZLA 3VEYA 5F0XA 1E4FT 5EXWA 1RFQA 1HKGA 3EKUA 3ZX3A 3ZETA 2HMPA 4B1UB 1QQMA 5AQGA 4K43A 3LM9A 1NGDA 3AAQA 4FWRA 1BDGA 4FOIA 1TUUA 4WQ4A 3MN9A 2P9SB 3VGLA 4CZHA 4CD1A 2QWPA 2P9UA 4PL8A 2ZGZA 2D0PA 1NGFA 1HUXA 2BUPA 4IJAA 3W3DA 4Y0WA 3AAPA 4IJNA 1NBWA 3CQXA 4CZMA 2KHOA 2Q0UA 3LDPA 2FSKA 2J4RA 4XH4A 2Q2RA 3O08A 5BR9A 4JNEA 4EHTA 4BR4A 4K25A 4JD2A 3L6QA 1G99A 4BR9A 3EKSA 2D1KA 4BRQA 3FZMA 2IVNA 2GUPA 5FPNA 3VOVA 1DEJA 1ZC6A 4H0XB 4XEIA 4XH1A 3SJHA 2CGJA 3QMLA 3ATVA 2WUSA 2A6AA 4IXCA 1LCUA 1YAGA 4BC5A 3A0IX 3ULEB 4BC2A 1NGIA 3GBTA 5AZIB 5TKYA 4JAXA 3U8XA 4FPAA 4EHUA 2ZGYA 4CZGA 3VESA 5AQPA 4H03B 4CI6A 4E1JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FOEA 1C0TA 2GUIA 1XC9A 1JJ2M 1Y97A 4KTQA 4C8LA 1WAJA 3SUPA 1LWCA 1JLEA 1R59O 3MEDA 4FW2A 2GWJA 5I3UA 3CF5L 4GV3A 2OPPA 3SCXA 4I2QA 4B3MK 5AQWA 4YOYA 1GOAA 2V51B 2ASPA 5E26A 4OPKA 4DV7K 3A8YA 4A57A 4CHQA 3GOIA 2Q36A 3NVMA 3ZEUA 3RR8A 4DTNA 1JLCA 3C7NA 4W5RA 3FZKA 3VENA 4LFAK 1HRHA 3U9ZA 3ZSWA 1C1AA 4ILHA 5EVZA 5H1SQ 2YNFA 3V1RA 3EE8A 4WQ5A 2EX3A 3I55N 3J7ZO 4CFDA 4CJ3A 3CQYA 1T8EA 4YHHK 1OH6A 3NH1A 3OYBA 2UUBK 3WEEB 3L4QA 3FGUA 4CHPA 3OYHA 4ISFA 4QS9A 1VQON 1TK8A 3PIOL 4B9LA 4B9TA 1ZXOA 3ZCMA 4OO1J 1HPZA 3BEXA 4DV5K 4KHQA 1EO1A 2NZTA 5SZTA 4DV2K 4U7BA 1P90A 5AQJA 5JS2A 4H0YB 4H5RA 4JN4A 3I0SA 3FE1A 1D5AA 1HNVA 1IKWA 4PL7A 4CJLA 2A1RA 2IVOA 3SBTA 3QLHA 1R0AA 3MDQA 3E01A 3AARA 4AF1A 4DTUA 4H5VA 5HLFA 4KHPK 1IG8A 1WN7A 4FVMA 3H45C 4FO0A 1D9DA 2IVPA 5HOOA 3WT0A 4B9SA 4E7HA 1XMOK 4KH5A 3TTFA 4JKGA 1NMDA 2V52B 3E9LA 1BI4A 2UXBK 3S3OA 5KI6A 3QBWA 5AQRA 3L2WA 3O80A 3L4IA 5JMVA 4JYAK 5JS1A 4IEEA 2V7YA 1Q7YO 3JXUA 3TANA 4CF9A 4H5TA 1ZBLA 3CJ7A 4DTMA 1KD1O 1BUPA 2P9KB 3NFAA 4IO9L 3AVIA 3DI6A 1A5XA 4HVJA 4E3SA 3PSFA 1IV0A 3D6RA 4BRFA 4F8RA 5GAGP 3WXLA 1RILA 2FC0A 4RW7A 4BR7A 3SV4A 1NGGA 3HP6A 1YJNN 4FJKA 4KAZA 4IFYA 1EETA 3IKMA 4M41A 4BRPA 5BRHA 2FXUA 3CPWM 4FWOA 4JI2K 1CLQA 4DSKA 2IC3A 3EEQA 4J2EA 2HB5A 4FCYA 2ZJQL 1T6DA 3MCPA 3E66A 3LAMA 4DB3A 2WC9A 4KHSA 3JS6A 2NLXA 4R5PA 2Q1NA 3NF7A 2QWOA 4KREA 4DFMA 3ZSRA 1BWFO 3QB0A 3MMVA 1HLUA 4F3OA 1SL1A 3CJ1A 4FWMA 1SZ2A 3J8AA 3QFUA 5KPRA 3EO3A 3KLFA 1SL2A 4CK3A 3CYMA 4JI4K 3AA2A 1NJXA 4B1YB 3CJ9A 2O8CA 4C8OA 1OH7A 4GNIA 4K41A 2E88A 1DTQA 1XC3A 5KQ8A 3AA3A 5BRFA 1HYVA 1KFDA 3HRGA 3WEEA 4M42A 4FWPA 5CZ2A 5JICA 3V9ZA 4KI4A 2X74A 4BREA 2E4LA 3JYTA 4EP5A 4DQQA 4EIAA 1BQMA 1MWKA 2VGNA 2UXCK 1JKHA 2O8FA 1QSLA 1VQ4N 4AHSA 3QEXA 4H4OA 3HL8A 3L8BA 4C23A 3H1VX 4GW6A 1VQ5N 1RDWX 2FLOA 4BRKA 3VQ9A 4EAHD 4W5QA 2QTDA 1Q82O 1VRUA 1N6QA 4CGIA 3SQ2A 1GLLO 2QWRA 3DWLA 5AFUH 1KVBA 1KRPA 2VGMA 5FPEA 3NVKA 1BOTO 3D0PA 2WFBA 4FJIA 1RTDA 1ASUA 1I39A 4W5NA 4RW4A 3O9TA 2IS3A 3H3NO 3OBYA 1K8KB 4IO8A 1TKDA 1FKPA 2P1JA 4MQ3A 4YOWA 3O1BA 3VERA 3ZT4A 1SAZA 2CH6A 3MN7A 3VEZA 3B8AX 3MWPA 4RG8A 5BN8A 4IDHA 3F73A 3PX4A 4JLHA 4EZ9A 4Z4FA 4YDUC 4LY7A 4JKAA 1TUYA 4FSVA 3DRRA 5HRNA 2E2PA 4CD3A 3MK6A 3SK3A 2FF6A 3SQ0A 2P9KA 3A5LC 4JV5K 3BP8A 5C25A 5AZJA 1QS4A 1TGOA 4FK4A 4LF7K 4FWNA 3VF2A 1KLMA 4OGEA 3P1GA 1SS6A 4CIEA 2YNIA 2E20A 1DTTA 5MLCQ 4I9LA 4FLTA 1N33K 4UQGA 3QFPA 4IOCL 4GMJB 1K9MO 5C2FA 1L3SA 4HUGA 1FXXA 1ZBSA 3TWHA 4OJRA 3U3YA 3KK3A 4B1XB 3OYKA 3OS1A 4LFBK 5CY4A 3EYZA 3M5RA 1IKYA 3P5JA 3VGMA 3CCQN 4ISEA 1NJIO 3VF6A 3OW2M 4E7KA 3H46O 4BVPA 4I6MB 4HWIA 4CFBA 3WXIA 3RRHA 3VQ7A 4M3RA 3AV9A 2E2NA 1RGIA 2AJQA 5LY3A 4ILJA 3CHWA 1Q8IA 4O5FA 4JKDA 4Z94A 5ELZA 3RR7A 1JCGA 4JS5A 2B5JA 4DF8A 2EWSA 3TI0A 4FJJA 3O9QA 4FWSA 3AGRA 2BE2A 2FSJA 2OPSA 2JWLA 4M3WA 3OBWA 3CCMN 4KHUA 4O5BA 3CPEA 1YTAA 4KB1A 4JRPA 1HNWK 3G0ZA 3ISNC 4KI6A 4DV1K 2P5GA 4JI8K 1HNIA 1HUXA 3W3DA 3N4PA 1D9FA 1DLOA 3RVCA 4GV6A 3T1YK 3O08A 4EHTA 4BR4A 1JLFA 3SQ1A 3CM6A 4DS5A 1KFSA 4JK9A 4YORA 1NKEA 4BRQA 3FZMA 3S3NA 4JKCA 1I3AA 4FJGA 1KTQA 4CEOA 4YOXA 3QMLA 2W6LA 3ZT2A 1YAGA 1S72N 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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