5LY3A

P. calidifontis crenactin in complex with arcadin-2 c-terminal peptide
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
427
structure length
427
Chain Sequence
ISDAYRLKYTFGVDFGTSYVKYGPITLNEPKMVQTRGLFLRDLPESVKMRIPPDVLARGLVVGDEEVRKYLSSVRDVQRNLKYPLKDGVARRDDEEAWRVLKELARYTLAQFPVSDPEFAGWLVAVALSALAPDYMYKAIFDIYDELASEFKIYAVTILPQPLAVAIAENAVNCVIVEGGHGNIQVAPISFALIREGLVALNRGGAEANAITREILKDIGYSDIAREEYAVEVVKRAVGLVPRRLKEAIRAAKSDPDRFVTKVRLSPVVEVEIPREYAWTRFLIGEIVFDPNHEEIKSYIEQSRLRIENAVIGDVTLYGEMDVASAIITSLRNVSVEIQERVASQIILSGGAFSWRVPPGMEDVAADSVTRVKIALEEKSPALASKVEVRLVSEPQYSVWRGAVIYGYALPLSLEWSDTTREGWRFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Actin/actin family protein
publication title Crenactin forms actin-like double helical filaments regulated by arcadin-2.
pubmed doi rcsb
source organism Pyrobaculum calidifontis
molecule tags Structural protein
total genus 139
structure length 427
sequence length 427
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ly3A01
3.30.420.570 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ly3A02
4O8KA 3CJAA 4BG9A 3C7NB 1NGFA 4FL9A 3DJCA 3IMXA 3UB5A 3H3NO 4M7YA 3UKUB 4FPBA 5LJWA 2CGKA 1JCEA 1BU6O 4FWOA 2P9KB 1T6DA 4QS7A 2P9LA 4K25A 3CETA 3GOIA 1NGGA 2E2QA 3HM8A 4LC9B 1U2VB 4RTFD 2P9IA 4A62A 4DB3A 1MA9B 4RWTA 1YUWA 2QWMA 1IJJA 2Q1NA 3WQUA 1XUPO 2YJFA 4IO8A 5AFUA 1XQSC 1E4GT 2GTDA 2V7YA 3CJ1A 3LM2A 3R9PA 4B9QA 1XC3A 5ELZA 3BF3A 3P4IA 5AZIB 3IUCA 3KVGA 3AAQA 5BRFA 3ULEA 3CIPA 3TPQA 3H45C 5EX5A 1JCFA 2EWSA 2VCPA 4EIAA 1ZXOA 3A5MC 4YDUA 2P9UA 5KPZA 1GLCG 3CHWA 4EFHA 1KAXA 3BP8A 4JD2B 4YDUC 5AQRA 3HZ6A 3UKRA 2A5XA 3FZHA 3ID8A 3D2EA 4JHDA 1IG8A 2A42A 3U4LA 5KPTA 3U8XA 5EXWA 2QWLA 3VEWA 5EVZA 3VGKA 4FPAA 1X3NA 3KZBA 1RFQA 2E2NA 2E1ZA 3UE5A 5AQLA 1TYQB 2YI1A 2A41A 3O8MA 2D0OA 3QB0A 4MLEA 4EAHD 1BG3A 5AQGA 5LY3A 3MN5A 5LJVA 2D1KA 3MN9A 3QBXA 1SZ2A 3A8YA 3ZEUB 1BA1A 2BUPA 2NLXA 4H0XB 4BREA 2YCHA 4FWSA 3O4WA 4CZJA 2Q0RA 3O6WA 2YHYA 3DAWA 1TUUA 3ZX2A 4XH4A 4BR0A 4BC3A 1NGBA 3VEZA 5AQNA 3B8AX 4GY2B 4CJ7A 3VGLA 2P9NA 1GLFO 4CZEA 2P9IB 5JICA 2H3GX 3BUZB 3FZLA 3G25A 4H03B 3CJBA 3M6GA 2GWJA 2VYPA 5AQTA 3VEOA 3WXIA 4H0YB 4JNEA 1ATNA 3FFKB 1NM1A 3ATUA 3QFUA 2KHOA 4FWLA 4BRFA 4CZFA 5BPMA 2PBDA 3O5BA 3ULEB 1MWKA 5FPMA 4CD3A 4FOIA 4GNIA 4DCHA 2D0PA 5F1XA 1J6ZA 1BA0A 3FZMA 2CGJA 2P9UB 4H0PA 3ZX0A 4O5FA 3HBTA 4FWQA 2GUPA 4WQ4C 3J8AA 4H0TB 1HLUA 3UKRB 4JHDB 2IIRA 3D2EB 3VOVA 3U9ZA 3WEEA 3D2FA 3AY9A 4BRDA 4DQ8A 3WUHA 5KPRA 3H6EA 4WQ5A 3DXKA 1RDWX 1X3MA 3FZFA 1YAGA 1WUAA 4ISFA 4B1XB 3EKUA 3R6MA 2FSKA 4WQ5C 3RSEA 2HF3A 3VERA 3SLCA 3SMPA 1S3XA 1NLVA 4BVPA 3QMLA 3ATVA 3JXUA 1WOQA 3DXMA 4IZ9A 3VEVA 1QZ5A 4BC5A 1CZAN 3BEXA 4FWNA 4C23A 3VEXA 3O08A 1D4XA 2QM1A 3SK3A 5AQIA 4XH1A 3WXLA 5E26A 5F0XA 4CZLA 2QXLA 4I6MB 5AQHA 1X9JA 3I33A 4B1UB 3A0IX 2W41A 5AQOA 2FXUA 1HUXA 2UYTA 3HTVA 1G99A 1Y64A 4BRGA 3GL1A 3LL3A 2P9NB 4IWVA 3S41A 4PKIA 2A6AA 1YVNA 3FR0A 4BQLA 4RCHA 2P9SA 1H1VA 2Q36A 3GDQA 2QW9A 5KQ8A 1E4FT 3BF1A 3AAPA 2GEMA 1MDUB 1NGHA 4A61A 4BRHA 5AQYA 5JMVA 3L6QA 4A2AA 2HF4A 4BRKA 3O80A 4PKGA 1GLDG 4CZKA 4K41A 2P9PA 4PKHA 3ENOA 4IJNA 5BN9A 3U9DA 3HSCA 2YHWA 3SMSA 5BRDA 2V52B 5BRHA 3SJHA 1BWFO 4QS9A 1HJOA 2FF6A 4BC2A 4CD1A 1NGJA 3WEEB 3WQTA 2HMPA 4IJAA 2ASPA 1QQMA 2FSJA 3D2FB 3VENA 2ZWHA 5F2RA 4BRCA 2IVPA 3GE1A 4FO0A 1HKBA 2HOEA 2QWPA 4HWIA 2IVNA 5AQWA 3W3DA 3RSEB 4H5WA 1S22A 4K43A 2Q97A 3C7NA 3DXMB 3LDLA 4B1VA 5JLHA 2D4WA 1Q18A 4ISEA 5AQQA 2P9LB 2I7NA 3A5NC 3MN6A 2ITMA 3UKUA 1DEJA 5AQMA 5ADXA 1SQKA 4BR7A 3VETA 2P9KA 4IXCA 3IFRA 4AM7A 1EQYA 4PL8A 3JS6A 2QWOA 2F9TA 2ZGZA 4H0OA 1OKJA 4FOEA 4WYBA 5AQZA 1SAZA 1U2VA 2PAVA 4FWKA 4B1ZA 5FPNA 4H5TA 4EHTA 4KBOA 5B8HA 5EY4A 1C0GA 1QQOA 3CJ7A 5AQUA 5BR9A 4BVOA 2CH5A 3W0LA 3A5LC 2P9SB 1QHAA 3EO3A 3MN7A 3QFPA 1GLEG 1KAZA 4JAXA 3CQXA 1ATSA 5AZIA 5FPEA 4H0VB 2E8AA 2Q0UA 4FSVA 4WQ4A 5ADXH 4PL7A 3H46O 4A2BA 1HKCA 1DGKN 3ZETA 2A3ZA 4ISGA 3L4IA 1NGDA 1QQNA 3VEYA 2ASOA 4M7XA 1V4SA 3VF2A 3VF6A 3O1BA 4BRIA 2YJEA 3CI5A 3H1VX 5JLFA 1NMDA 3LDOA 4XH5A 4CBWA 2W40A 2AA4A 4HTLA 5TKYA 1Z05A 1GLBG 4BRMA 4CBUA 1C0FA 4BR9A 2Q2RA 1KXPA 2FSNA 3ZX3A 3CJCA 3ZEUA 1ZC6A 4BQZA 2GWKA 3MK6A 2FLOA 2E2OA 3MCPA 3WXJA 4BGBA 2BTFA 1NGIA 5KQDA 4BC4A 4FWMA 5AQVA 4BRAA 3LDQA 2WUSA 2CGLA 2V51B 4F9OA 1LOTB 4CZGA 1HKGA 3CQYA 1LCUA 3MDQA 5BREA 3L0QA 2CH6A 3MMVA 4BR2A 4QS8A 5AQPA 2VWBA 3KHYA 4H5VA 3FLCO 2AP1A 3HI0A 1V4TA 5E84A 3D7EO 3WT0A 3I8BA 1YXQA 2ZGYA 5EOYA 5AZJA 4L3QA 5AQSA 3VPZA 3M1FA 1P8ZA 2DPNA 3LM9A 3R8EA 5FPDA 1KAYA 4CZHA 5AR0A 4XEIA 1K8KA 4B1YB 4BRQA 4BR5A 5CE3A 4MO4A 4AM6A 1QZ6A 3H1QA 4BR4A 2YHXA 3ZETB 1U6ZA 4H5NA 2NRHA 4BRLA 3DXKB 3H3OB 4NO7A 1ZBSA 4K42A 4H5RA 3DWLA 3EZWA 3FE1A 2ZF5O 1TUYA 5BPNA 1BUPA 4BRPA 2GELA 3QICA 4FWPA 5AFUH 1GLJO 2E1YA 4Y0WA 4CBXA 1BOTO 2E20A 3ENHA 1NGCA 3OHRA 4CZIA 1BDGA 1BO5O 3IDHA 2J4RA 1NGAA 3GBTA 2I7PA 3FZKA 3QBWA 2A40A 5AQXA 3AARA 4BG8A 4I6MA 3LDNA 4CI6A 2E2PA 4J8FA 1DKGD 2FF3B 2F9WA 3GG4A 5AQFA 2IVOA 3QDKA 1GLLO 1NGEA 2NZTA 3EL2A 1NWKA 3VGMA 3TU5A 4EHUA 3CJ9A 3VESA 1JCGA 5AQJA 1MWMA 2E88A 2QWQA 4JN4A 2QWNA 1ATRA 2ASMA 5AZJB 3EKSA 5BPLA 4MLHA 3FGUA 2OANA 2P9PB 3VF4A 1T6CA 4BROA 4DHYA 1K8KB 2V7ZA 4FWRA 3A5OC 3C0BA 4JD2A 3LDPA 5I9EB 3EN9A 3M3ZA 4M63C 1Z6RA 1HPMA 2QWRA 4E1JA 4B1WB 5BN8A 5AQKA 1R59O 1NBWA 3WXKA 1GLAG 1T44A 2Q31A 3O1WA 4Z94A 4NB4A 4CZMA 1TYQA 4BGAA 1RGIA 4BRNA 3CERA 4MO5A 1ESVA 3F9MA 1HX1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RBTA 4O8KA 4BWMA 4FK2A 4FL9A 3KD1E 2B6AA 3ZSWA 4KHSA 4M7YA 1GOCA 4RW4A 4FPBA 5J2MA 1YT3A 1K9MO 3ZT2A 2PYJA 1QTMA 4CJPA 1OH7A 4K25A 3HM8A 3OY9A 1U2VB 4JI1K 4IG0A 4E0DA 2BANA 4FJJA 4M3RA 3VQQA 1ZBLA 2Q1NA 4CFAA 4CHYA 4E1NA 2YJFA 1XHZA 1KSPA 1RTJA 5AFUA 3OS2A 1ZYQA 1E4GT 1LWEA 3KK7A 3CJ1A 3R9PA 4L8RB 1EO1A 1XC3A 1VQ5N 4JKBA 3IUCA 1LAWA 5M1FA 1NK7A 3CIPA 3TPQA 1BI4B 4U7BA 2O8CB 1C6VA 3DYAA 1F21A 3CCLN 1DT9A 2P9UA 5KPZA 4IKFA 4FZYA 3CHWA 3OTOK 4EFHA 3HO1A 3FZHA 1IG8A 2A42A 5KPTA 2QWLA 4FCYA 2QXFA 3VQEA 3KZBA 5AQLA 2YI1A 3O8MA 4CVNE 5GIOA 1BG3A 3MN5A 5LJVA 2UXDK 3LALA 4G9ZA 1L3TA 1VSKA 4H0XB 5AJ3K 2YCHA 4FWSA 4JS4A 4HHTA 3MXJA 2YHYA 3TARA 3OYBA 4XH4A 3TTCA 4BC3A 4DTNA 1T3VA 5J2PA 1VQON 4GY2B 3O3HA 3QNNA 1MU2A 2F8SA 5DM7L 1M90O 1GLFO 3C6HA 5DK5A 2VYPA 4JKFA 3KKRA 4J2BA 5H1SQ 4JNEA 2E6MA 4EP5A 3QFUA 4CZFA 5T7BA 2P5OA 4KHWA 5C25A 1RDCA 2HNDA 4DCHA 3K2PA 1BA0A 3AVLA 4UY8O 2IC3A 3ZT0A 2WBNA 3CFPA 3DLHA 3VA0A 3UKRB 1HLUA 1RDBA 3U9ZA 4JK8A 3P38A 4GVMA 1YIJN 3AY9A 4BRDA 4CJQA 1X3MA 1YAGA 1ASUA 2I5JA 4B1XB 3SUQA 4H4MA 3HT3A 3V6DA 2GV9A 2HF3A 3SLCA 3TAPA 4F8RA 1N36K 3C6AA 2OPQA 1QZ5A 2Z1IA 3VEXA 4LFCK 2VG5A 2QM1A 3OA9A 4I2QA 3VN5A 2JWLA 4CZLA 1BGXT 3NCIA 4R79A 3LPTA 2FXUA 3HTVA 4CGDA 3GL1A 3LL3A 4IWVA 3S41A 4PKIA 4FJMA 2A6AA 3S9HA 1YVNA 5GINA 1WAJA 4BQLA 4RCHA 2Q36A 3WXMB 1NK6A 2F8TA 1RCHA 4ILHA 4IEIA 4LSLA 1MDUB 3PIOL 2HF4A 3K9JA 3O80A 4DV2K 4BDYA 4IFYA 3AVNA 4DU1A 4JKGB 1D9DA 4LF4K 3ZSQA 4DR5K 5BN9A 2G8UA 4RG8A 1SKRA 2RE2A 3ITHA 3Q7BA 4YOYA 2KFNA 3Q7CA 4QS9A 1DTQA 1U4BA 2QKKA 1NGJA 2Z1JA 2HMPA 3WQTA 1JLFA 1L5UA 3E1YA 3D2FB 3NH0A 5SWMA 2NRWA 4BRCA 2IVPA 3GE1A 2EHGA 4ZTJA 1VQ9N 5M1PA 4CF0A 5HRPA 5I42A 1M1KO 1C1BA 3W3DA 2E5LK 1VSLA 4K43A 2UUAK 1YJNN 4ILJA 1RNHA 4CGHA 3DXMB 3OYLA 4DV0K 2D4WA 1WSGA 3CMAN 3O9QA 3S3NA 4BR7A 4PL8A 3JS6A 2IDOA 1W2BM 5AQZA 4FOEA 4WFBL 3ZSOA 1U2VA 3K59A 4DQIA 4FWKA 2ZJQL 2FBTA 3AVHA 1RILA 2YKNA 1KC8O 4DV5K 3D0PA 3NE6A 1N8RO 5C2FA 3SUOA 5BR9A 1NJZA 2ZM6K 3MN7A 1KVCA 3O3FA 2OCEA 2O8DA 1GLEG 3BZKA 3BGRA 1NKCA 3CQXA 1ATSA 3V1QA 2Q0UA 2HBKA 3THYB 1RT4A 4YOWA 1U49A 1BI4A 4A2BA 1HPZA 1BCOA 1HKCA 3F9KA 3NGZA 2HVIA 2O8CA 4ISGA 3SUNA 1NGDA 1QQNA 3VEYA 2ASOA 1A5WA 1UAXA 2BDPA 2BGGA 3EE9A 3MEDA 4O8UA 5GADP 4O0IA 3CI5A 3H1VX 4IOXA 4DQPA 4DR1K 2P5GA 3CCEN 3LDOA 2O8EA 3ALYA 2W40A 4AHUA 2W6KA 5TKYA 1WBBA 4WE1A 3U6FA 4YNQA 4DFKA 1VSMA 3I0RA 2G8HA 1C0FA 3VQ7A 2PFUA 4BR9A 1BIZA 3MEEA 1KXPA 3MXMA 1ZC6A 4BQZA 3LZIA 2RKIA 1S6PA 3WXJA 2E2OA 2OZSA 4F4KA 1NGIA 1OH5A 1ASVA 2OTLN 4DQQA 3TAMA 1NK9A 3AVFA 4BRAA 4FZZA 3LDQA 2WUSA 1XI1A 2CGLA 4OPHA 2V51B 3HPHA 4F9OA 1Y97A 3CQYA 4KHUA 2CH6A 4JK7A 3CG7A 4QS8A 1VQMN 1EXQA 3KHYA 4H5VA 2AP1A 1VRUA 2VGNA 5E84A 5GIPA 1OVQA 3E9LA 4X65K 2ZGYA 4W5NA 5EOYA 1A5VA 2X6SA 3LP1A 1QSSA 3VPZA 2VGMA 2O8BB 3M1FA 5FLXO 4DV1K 2HW3A 2DPNA 3LM9A 3R8EA 4QAGA 3VTHA 1K8KA 4BRQA 4BR5A 3M8SA 4MO4A 4AM6A 4CFBA 1KVAA 1QZ6A 3ZETB 4DV4K 2NRHA 4HTUA 4ELTA 4Z4GA 4BRLA 3SV3A 2HBMA 4CIGA 1ZBSA 4DR2K 4Z4FA 2Z1HA 3EZWA 3FE1A 2ZF5O 1TUYA 5BPNA 4BRPA 3AVBA 2E1YA 4CBXA 1BOTO 1NKBA 2NRZA 3OHRA 1OH6A 2NRVA 1BDGA 1BO5O 1J53A 4YHHK 2QTDA 3DLGA 2QA4N 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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