5LY3A

P. calidifontis crenactin in complex with arcadin-2 c-terminal peptide
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
427
structure length
427
Chain Sequence
b'ISDAYRLKYTFGVDFGTSYVKYGPITLNEPKMVQTRGLFLRDLPESVKMRIPPDVLARGLVVGDEEVRKYLSSVRDVQRNLKYPLKDGVARRDDEEAWRVLKELARYTLAQFPVSDPEFAGWLVAVALSALAPDYMYKAIFDIYDELASEFKIYAVTILPQPLAVAIAENAVNCVIVEGGHGNIQVAPISFALIREGLVALNRGGAEANAITREILKDIGYSDIAREEYAVEVVKRAVGLVPRRLKEAIRAAKSDPDRFVTKVRLSPVVEVEIPREYAWTRFLIGEIVFDPNHEEIKSYIEQSRLRIENAVIGDVTLYGEMDVASAIITSLRNVSVEIQERVASQIILSGGAFSWRVPPGMEDVAADSVTRVKIALEEKSPALASKVEVRLVSEPQYSVWRGAVIYGYALPLSLEWSDTTREGWRFP'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Actin/actin family protein
publication title Crenactin forms actin-like double helical filaments regulated by arcadin-2.
pubmed doi rcsb
source organism Pyrobaculum calidifontis
molecule tags Structural protein
total genus 139
structure length 427
sequence length 427
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ly3A01
3.30.420.570 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ly3A02
3VPZA 3WXJA 3H6EA 4J8FA 1ATNA 4WYBA 1KAXA 3LM9A 3VESA 1ATSA 3A5OC 4O5FA 3SLCA 3L6QA 5I9EB 4IWVA 3VENA 5FPEA 2IVPA 4PKHA 3VEZA 3QBXA 4NO7A 1GLJO 1G99A 1GLFO 3GBTA 3H3NO 4XH5A 4K42A 3RSEA 1BWFO 5AZJB 5F0XA 4H5NA 1U2VA 2QWPA 1MWKA 5AQZA 5BREA 4YDUC 2VYPA 4WQ4C 4A62A 4BRDA 4FWQA 4I6MB 4BC5A 4A61A 4BRGA 3U9DA 5BPNA 5AQQA 1YUWA 3JS6A 4BRIA 3OHRA 4IJAA 3BUZB 3BF1A 4BRAA 2E1ZA 1DEJA 1HKBA 4BROA 3CQXA 2P9LA 2YHYA 4IJNA 4DB3A 3DWLA 4H5VA 2BUPA 5AQPA 4BRCA 5ADXH 3M1FA 3CJ1A 2P9PB 5EVZA 4FWOA 3A5LC 1V4SA 4K43A 1BDGA 4K41A 1NM1A 2FXUA 3FR0A 2PBDA 4PKGA 4FWPA 2P9NA 3MN7A 2EWSA 4B1YB 3R6MA 4QS9A 4JAXA 3ENHA 4CI6A 1X9JA 2YI1A 3MK6A 1WOQA 5AFUH 1QQMA 3C7NB 4M7YA 1YXQA 1JCFA 4JD2A 2HMPA 3WQUA 1S22A 5JICA 2QXLA 3U4LA 1QQNA 2YHWA 1C0FA 3IUCA 5AQRA 3L4IA 1BO5O 1LOTB 2ZWHA 1V4TA 3S41A 3JXUA 4WQ5A 2D4WA 4A2BA 3L0QA 1X3NA 3VEVA 2A5XA 2KHOA 2AP1A 1TUUA 1SAZA 2E8AA 3QFUA 3EO3A 3VERA 3DXMA 1IG8A 1GLAG 2P9KB 4LC9B 3O08A 3VOVA 1KAYA 3WXIA 2P9SA 2P9UA 2D0OA 4FPAA 2F9WA 3AARA 3QDKA 1BG3A 1NGEA 3DJCA 1NGJA 4PKIA 1OKJA 3A8YA 4IO8A 4H0YB 1NBWA 5AZIB 4AM6A 5LJVA 4CZEA 4BQZA 3EKUA 2J4RA 3H3OB 3HZ6A 3VEXA 3MCPA 2P9IA 1HKGA 4BR7A 2FF6A 2E2PA 3ULEA 3VETA 3UKUA 1WUAA 4B1XB 2IVOA 3I33A 4MO4A 4EIAA 4FOIA 4PL8A 3GE1A 5E26A 3LDLA 3MMVA 3ZEUB 2W40A 4XEIA 4B1WB 2BTFA 2WUSA 2D1KA 4H0TB 3M3ZA 1C0GA 4M7XA 4BGBA 4ISFA 3QB0A 3FGUA 3VEYA 2Q1NA 3D2EA 4Y0WA 3TPQA 1KXPA 4BRPA 1JCGA 2E2QA 3UKRB 3WXKA 1E4FT 3BEXA 4EAHD 5AQMA 5JLFA 2VWBA 3DXKB 4CZHA 3H1QA 1NGBA 1Z6RA 5AQOA 3LDPA 2AA4A 2GELA 4BRQA 2ZGYA 4HTLA 3ID8A 3SJHA 3ZETB 3W3DA 5JLHA 2YJFA 3WEEA 3O5BA 3FE1A 4BVOA 2QWLA 4BRHA 3I8BA 1MWMA 4JHDA 4DCHA 3SMSA 5AQFA 2A40A 2YCHA 4BRNA 3ZX0A 1ZC6A 5FPNA 2CH6A 3QMLA 1TYQB 2HOEA 3A5NC 2I7PA 3HBTA 4FWMA 3WUHA 5AQLA 5BR9A 4RCHA 5AQSA 3VGKA 4EHUA 1J6ZA 4B1ZA 4O8KA 1NGDA 3HI0A 3R9PA 3GL1A 2YJEA 3LDNA 1NWKA 2HF4A 1NGFA 3IFRA 4BREA 5AQUA 4FWSA 2Q31A 1S3XA 1SZ2A 5AR0A 3MN9A 2CGLA 2A3ZA 1T44A 4BRKA 3TU5A 5AQNA 5AQGA 1RFQA 1GLEG 5KQDA 1IJJA 3G25A 2FLOA 3CI5A 1T6DA 1Y64A 2ASMA 3FZMA 3CIPA 5TKYA 1NGIA 2ZF5O 3R8EA 1XC3A 4FOEA 1U6ZA 1ATRA 3GDQA 3CERA 4BRLA 4GY2B 2CGJA 3CHWA 3RSEB 4BQLA 3H45C 1R59O 2NLXA 1U2VB 2GUPA 3KHYA 4IXCA 3GG4A 3IMXA 4M63C 5AQIA 3O1BA 5AZJA 3LDQA 3CQYA 4BGAA 4YDUA 2F9TA 4WQ4A 3O6WA 4ISEA 1BOTO 1K8KB 1XQSC 1QHAA 2QWOA 4XH1A 4BC3A 5BPLA 3U9ZA 4CJ7A 4I6MA 3O4WA 4BRFA 4K25A 3F9MA 2FSKA 5FPDA 5KPZA 1P8ZA 1T6CA 2P9LB 2E2OA 2UYTA 5LJWA 3MN5A 2QM1A 3HSCA 1TUYA 2ITMA 3LM2A 4BR5A 4MO5A 3J8AA 2E1YA 3C0BA 3HM8A 2ZGZA 2V51B 3GOIA 2P9PA 4C23A 4CBUA 1HUXA 3LL3A 5AQYA 2E2NA 2P9NB 4A2AA 4GNIA 3EZWA 2GEMA 4NB4A 3FZFA 2GWKA 4HWIA 5F2RA 3U8XA 3QFPA 4CZMA 2IIRA 2PAVA 3WXLA 4L3QA 1NMDA 3ATVA 5BRDA 1GLBG 4JD2B 4FL9A 4BC2A 2CH5A 3AAQA 4BR9A 4PL7A 5CE3A 3FFKB 4EHTA 2H3GX 3SMPA 3C7NA 4BR4A 2QWMA 1DGKN 1RDWX 4Z94A 3EL2A 1NGCA 4CZKA 2IVNA 3IDHA 4DQ8A 1ZXOA 2A42A 3M6GA 5ADXA 1BUPA 2Q97A 2E20A 4WQ5C 5KQ8A 4CD1A 2HF3A 2FF3B 2D0PA 3MN6A 2Q0UA 3DXMB 4H5TA 1CZAN 2ASOA 1GLDG 2I7NA 3D2FB 1SQKA 3CJBA 4IZ9A 2CGKA 2P9SB 3BP8A 2P9UB 1NGAA 4H0XB 5AQXA 2V52B 3CJ9A 4BC4A 4FPBA 1E4GT 2P9KA 4CBXA 4B1UB 3O8MA 3ZX2A 3A5MC 1ZBSA 4BR0A 3LDOA 5AFUA 4KBOA 3VGMA 5EX5A 2E88A 4H0PA 1K8KA 1KAZA 1XUPO 3FZHA 2VCPA 4H5WA 3EN9A 2NZTA 2FSJA 4CZFA 1QQOA 3HTVA 4BG8A 3WQTA 1MDUB 5AZIA 1JCEA 3CETA 1Z05A 3VGLA 5BN8A 2P9IB 1HJOA 1RGIA 3MDQA 1NGGA 4B1VA 3ULEB 5EXWA 4MLEA 3UKUB 5FPMA 3AY9A 2Q0RA 4CZGA 3P4IA 3VF6A 3BF3A 5AQJA 4BVPA 5AQTA 5LY3A 3O80A 1NGHA 2QWQA 2QWNA 1ESVA 2NRHA 2OANA 5KPRA 4JN4A 3FZLA 3H1VX 2DPNA 4XH4A 1HLUA 5E84A 3ZEUA 4CZLA 3KVGA 5BRHA 3D2EB 4CZIA 5AQVA 4QS8A 3H46O 1HKCA 4FWNA 4RTFD 1GLLO 1HX1A 3AAPA 4MLHA 4FWLA 3VF2A 5B8HA 3UKRA 4BG9A 4H5RA 4BRMA 5JMVA 4FSVA 1QZ5A 4EFHA 5AQHA 5F1XA 2FSNA 4CZJA 1BA0A 3DXKA 4H03B 4B9QA 1BU6O 2V7ZA 3UE5A 3FZKA 5KPTA 2QW9A 3ATUA 4FWKA 5EOYA 3W0LA 1NLVA 3KZBA 4F9OA 3WEEB 3VF4A 3D7EO 2GWJA 1BA1A 1D4XA 2A41A 3O1WA 4H0VB 4AM7A 3ZETA 2V7YA 3A0IX 1DKGD 4ISGA 3D2FA 4JHDB 4E1JA 5BN9A 4CD3A 1GLCG 1QZ6A 3ZX3A 3QICA 5BPMA 5BRFA 3SK3A 4FWRA 4H0OA 3EKSA 3VEWA 2W41A 4FO0A 1Q18A 3CJ7A 3WT0A 2Q36A 1H1VA 1TYQA 3ENOA 3B8AX 1EQYA 4QS7A 4BR2A 2ASPA 1LCUA 2GTDA 2Q2RA 5ELZA 3DAWA 3CJCA 3CJAA 1YAGA 5AQWA 3VEOA 4CBWA 2A6AA 4RWTA 3QBWA 1MA9B 5EY4A 3UB5A 2QWRA 5AQKA 1YVNA 4DHYA 1X3MA 3FLCO 1HPMA 2YHXA 4JNEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2UUCK 3VPZA 3WXJA 4Z4HA 4J8FA 3SQ2A 1ATNA 1WBDA 4N47A 5T7BA 1U4BA 2HHTA 1HNIA 3B6OA 4GVMA 1RILA 5KRSA 2WC9A 3V1QA 3HT3A 4B9UA 4LF9K 4M41A 3DLLL 3TANA 4R5PA 2X6NA 4J2DA 3RMAA 3AGKA 3KLHA 4O44A 4YDUC 5TKWA 2VYPA 3AVCA 4FWQA 2QKKA 4I6MB 1FJGK 1K73O 3U9DA 4KHYA 5BPNA 1B9FA 5HBMA 1XNRK 4BRIA 3K2PA 4IJAA 1FW6A 4PY5A 3CCRN 1WAJA 4CJKA 4H5VA 3SCXA 1W7AA 3CJ1A 4CJEA 3S9HA 2VWKA 1NM1A 2FXUA 5MLCQ 3OW2M 2PY5A 4KHNA 3O9QA 3AO3A 3S3OA 2P9NA 3MN7A 1N6QA 2EWSA 1OVQA 1JLQA 3QETA 4DF8A 3PY8A 3TR8A 2P51A 3R6MA 3PSFA 4JI6K 1QQMA 2VQFK 1RBRA 5M1KA 2OYQA 2HMPA 1JL2A 4LH5A 3WQUA 4JS5A 2UXDK 1RBUA 2QXLA 3U4LA 1C0FA 3CCQN 4Z4FA 1BO5O 4MQ3A 4LH4A 4OPHA 3J7ZO 2ZWHA 3S41A 1I39A 4ILGB 3ID6A 1NJYA 3VEVA 2KHOA 5SZTA 1TUUA 3HO1A 3FFIA 3KLGA 2P9SA 2P9UA 1S1TA 2D0OA 2W6KA 4N5SA 2OZSA 3OTOK 1BG3A 2ETJA 3TTDA 3KWGA 1OKJA 1TK0A 3A8YA 3LWMA 1JLAA 5AZIB 5A2QO 1VQ7N 1VSEA 1D9DA 4FJ9A 4BQZA 3MXIA 1ZBFA 4FXDA 1DTQA 4M3YA 3H3OB 3KTQA 1U04A 1HNWK 3ULEA 4CJUA 2P5GA 4FJKA 3I33A 4PL8A 2JGUA 1BIUA 3V81A 4NYNA 3MMVA 3ZEUB 3VA0A 3DLGA 2KW4A 2NRRA 2D1KA 2WUSA 3M3ZA 4H0TB 3SBTA 4DR7K 2O8FA 4BGBA 1BISA 4Y0WA 3TPQA 5IT9O 4OVLA 3ZSOA 4LY7A 3OYIA 3OYBA 4EAHD 4U7BA 3HP9A 2VWBA 3IAYA 1Z6RA 3VQBA 3OYKA 4YY3K 3LDPA 1JL1A 2GELA 2X78A 4JKEA 1QSYA 4HTLA 4CJPA 4FZXC 3BGRA 3DMJA 3SJHA 1BQNA 3CM5A 3O5BA 3JSMA 4Z4GA 4BVOA 3I55N 4W5NA 3KIOA 1U47A 5C25A 4BRHA 3I8BA 4A5AA 4RW9A 2OPPA 2YCHA 3VQDA 4BRNA 4KHSA 2GUIA 3QMLA 4CJSA 2HNDA 4MDAA 3V9UA 2I7PA 5BR9A 5DM7L 1TKZA 4RCHA 1FXXA 5AQSA 3VGKA 2KKZA 3SUPA 1J6ZA 4ID5A 1LW2A 1QVGM 2YJEA 2HF4A 3ZCMA 1IBMK 3OYLA 4NCBA 4F3OA 4XIUA 2P5OA 3CCMN 3RR8A 2XHBA 4E7IA 2Z1IA 1T7PA 3ZYYX 3TU5A 3F2KA 1RFQA 1GLEG 5KQDA 2FBYA 5GIPA 4DUZK 4OGCA 2Y1JA 3QEIA 2WTUA 3DOLA 1Q8IA 1T6DA 1Y64A 1M1KO 1NGIA 2VGMA 1XC3A 3VMFB 1UAXA 1ATRA 3GDQA 3CERA 1OH7A 4WF9L 1S6QA 1REVA 4DTPA 1R59O 3OY9A 1KC8O 2YNGA 3ZT1A 3THWA 3GG4A 5FROA 4M63C 3O1BA 1J5EK 4MDBA 5JVGL 4LF6K 5C24A 4E1MA 2F9TA 1TL1A 4DV6K 1LV5A 3O6WA 1K8KB 1QHAA 3K0SA 1VRUA 4IFYA 4HUGA 1D8YA 4PUOA 4CJ7A 5M1FA 3B6PA 5C10A 1VQMN 4YHHK 4F2SA 3NFAA 1T6CA 2P9LB 4KB1A 3TTCA 3OJSA 1O13A 4KRFA 4DR3K 1FKOA 5FLXO 3CM6A 1NOZA 3J8AA 1Q9XA 4KH6A 4CHOA 4JI0K 2UUBK 1L3UA 3C0BA 4FM2A 4CEFA 1E3MA 2O8CB 4C23A 3I0RA 2E6LA 2WFBA 4A2AA 4FK0A 4NB4A 3C95A 3U8XA 3D6RA 4CJTA 2PAVA 3CFOA 3HXMA 3T7ZA 4L3QA 1ZBUA 5HRRA 5BRDA 4E3SA 3L4QA 4UQGA 4BC2A 2CH5A 5KGWA 3O3HA 2G8HA 4OGEA 2OCEA 3FFKB 4PL7A 4DV3K 3HPGA 2NUBA 4UY8O 2H3GX 3SMPA 4JEPA 4BR4A 4RW6A 1RDWX 4JK9A 3HVTA 1NGCA 4CZKA 3IDHA 1ZXOA 1JLBA 1CZ9A 4W5TA 4WQ5C 3MN6A 3DXMB 2ASOA 4LD0A 4B8CA 3VQPA 4JI1K 3TI0A 4DMNA 4LF5K 2XY7A 1NKEA 4H0XB 2G8FA 3QIPA 3MWPA 1SL0A 4CBXA 4RW7A 3AVKA 3NH2A 4H0PA 1K8KA 1XUPO 1TGOA 3RMBA 3FZHA 4GMJB 3OYGA 4IO9L 4E1NA 1EWRA 1WAFA 3WNEA 4BG8A 3WQTA 3SV3A 3T3FA 1HJOA 1RGIA 3MWTA 1X9SA 4MLEA 4B8AB 4B08A 4DSEA 1ILYA 4GW6A 3PIPL 3OYCA 4JI4K 3L3UA 3O80A 3M8RA 3J81O 2QWNA 1FK9A 5J2PA 1L3SA 3TTFA 1OH6A 4XH4A 4H4OA 3AA4A 4BWMA 4CZLA 3KVGA 3NGIA 1VQ6N 2FC0A 4CGHA 3NE6A 2YKNA 1A5VA 4MLHA 1HX1A 2O8BB 4FWLA 5E41A 3TAEA 4H5RA 1J54A 3AVJA 1QZ5A 1KFSA 4B3TK 3LAKA 4FLVA 2FSNA 4E7JA 4AHUA 1QQCA 4CZJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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