5LY3A

P. calidifontis crenactin in complex with arcadin-2 c-terminal peptide
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
427
structure length
427
Chain Sequence
ISDAYRLKYTFGVDFGTSYVKYGPITLNEPKMVQTRGLFLRDLPESVKMRIPPDVLARGLVVGDEEVRKYLSSVRDVQRNLKYPLKDGVARRDDEEAWRVLKELARYTLAQFPVSDPEFAGWLVAVALSALAPDYMYKAIFDIYDELASEFKIYAVTILPQPLAVAIAENAVNCVIVEGGHGNIQVAPISFALIREGLVALNRGGAEANAITREILKDIGYSDIAREEYAVEVVKRAVGLVPRRLKEAIRAAKSDPDRFVTKVRLSPVVEVEIPREYAWTRFLIGEIVFDPNHEEIKSYIEQSRLRIENAVIGDVTLYGEMDVASAIITSLRNVSVEIQERVASQIILSGGAFSWRVPPGMEDVAADSVTRVKIALEEKSPALASKVEVRLVSEPQYSVWRGAVIYGYALPLSLEWSDTTREGWRFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Actin/actin family protein
publication title Crenactin forms actin-like double helical filaments regulated by arcadin-2.
pubmed doi rcsb
source organism Pyrobaculum calidifontis
molecule tags Structural protein
total genus 139
structure length 427
sequence length 427
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ly3A01
3.30.420.570 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ly3A02
1HKCA 4BRAA 3A5MC 3B8AX 4H5WA 1HLUA 4BVPA 2Q1NA 3VEYA 3JS6A 2CGKA 5TKYA 4AM6A 1RGIA 5AQKA 1HJOA 4NB4A 2GWKA 4JN4A 4JD2B 4K25A 5KPZA 2VWBA 4BC4A 4BRKA 5B8HA 3WT0A 3CJ9A 4RCHA 1TUUA 5KQDA 4L3QA 3DXMB 3VGKA 1BU6O 1YVNA 4IO8A 3SMSA 3EKUA 4IZ9A 1BG3A 4CI6A 1NGFA 3ID8A 2QXLA 4A62A 1ATNA 2A3ZA 4B1VA 3VF2A 4IWVA 3O1WA 5EVZA 3RSEA 3FLCO 4B9QA 3O1BA 2HMPA 1QQOA 5FPEA 3H1QA 1BO5O 3ZX2A 5AQJA 3VEZA 2F9WA 1U2VA 4M63C 3LDPA 2GELA 1BA0A 3BP8A 4FWQA 2E2NA 2YHXA 4F9OA 1GLFO 3MK6A 2P9IB 3QBWA 5BN8A 1QZ6A 3GE1A 4BRQA 5FPNA 1NBWA 4C23A 5CE3A 2P9NB 3ULEB 3QMLA 4BRCA 1X3MA 2P9SB 1TYQB 4BRNA 1DKGD 1ZXOA 4B1YB 3H3OB 4BRFA 5LJVA 3I33A 2CH6A 3VESA 3KZBA 3ZX3A 3TPQA 4M7YA 4BQZA 3KVGA 5AZJA 1JCEA 4FWMA 1CZAN 5E84A 1LOTB 4BG8A 3AAPA 5AZIA 2FLOA 2CH5A 4KBOA 4BR4A 1NMDA 3WXLA 1S22A 2HOEA 1S3XA 3ATUA 3R8EA 3HI0A 3CI5A 4K41A 1H1VA 2CGLA 1GLBG 4BVOA 3FZFA 1KXPA 4DB3A 4QS7A 2Q2RA 2Q31A 4JHDB 1GLDG 3CJ7A 5EX5A 4CZFA 2QWLA 4JNEA 3CJBA 4BR5A 2QWPA 2EWSA 4MLEA 1JCGA 4CBUA 2AP1A 1E4FT 3UKUB 4FO0A 2E8AA 4EIAA 2D1KA 3SJHA 1MWKA 4DCHA 3FZLA 4CZMA 2NRHA 3WUHA 4BR7A 2AA4A 2QWQA 3JXUA 2UYTA 2Q36A 1HUXA 4BR0A 2H3GX 3C7NA 4FWKA 3EZWA 3R6MA 2F9TA 4BGBA 4Z94A 5BRFA 1V4TA 2FSNA 3HBTA 5AR0A 3HSCA 4J8FA 4FSVA 3MCPA 3IDHA 3SK3A 5JLFA 4FOIA 2V7YA 1TUYA 4XH4A 5ADXA 5AQWA 4EAHD 3GDQA 4YDUA 3O5BA 1YAGA 5F1XA 4FL9A 4JAXA 5AQNA 1NLVA 3IMXA 1DEJA 4IJNA 4A61A 3MN9A 4E1JA 3UE5A 3VOVA 2IVNA 2A41A 3EKSA 1BUPA 5AQIA 4WQ4C 4B1WB 3W3DA 3GG4A 1T6CA 4CZJA 1QQNA 4H0OA 5KQ8A 4WQ5A 3M1FA 2A5XA 1GLLO 3P4IA 1BA1A 2A6AA 5BREA 2ZGZA 3WQUA 2A42A 1NGDA 4H0XB 4O8KA 4FWNA 4I6MA 4K42A 5E26A 3CQYA 5FPMA 3M6GA 5ADXH 2GEMA 5LJWA 3QBXA 3IFRA 3D2FA 1LCUA 2E20A 3DAWA 3O8MA 3WXJA 5EXWA 3DXKB 3ZETA 3IUCA 4ISFA 4H5TA 4FWOA 4AM7A 2P9LB 1NGIA 4WQ5C 4ISEA 5AQLA 5AQVA 1WOQA 5AZJB 3FZMA 5EOYA 4H5VA 3WQTA 3U4LA 4DHYA 1NGAA 2D0PA 3UB5A 3L4IA 2Q0RA 3R9PA 1NGJA 3AARA 2VCPA 4BC3A 4CD1A 2J4RA 4PKHA 1Z05A 2FXUA 5F2RA 5KPRA 1NGEA 3AY9A 3DJCA 2YI1A 3VF6A 2KHOA 2GUPA 4FWRA 1U6ZA 3CIPA 4H0PA 5EY4A 2YHYA 1EQYA 1QHAA 2P9PB 5BR9A 2Q0UA 3O4WA 3LDOA 3VENA 4EFHA 1K8KA 1YXQA 3A5NC 3L6QA 3J8AA 5KPTA 1Q18A 2P9UB 4GY2B 1IG8A 1MDUB 2ASOA 1HPMA 3HTVA 3VETA 4JD2A 2E88A 3MMVA 1XUPO 3QFUA 1OKJA 4ISGA 4QS8A 1HX1A 2I7PA 3M3ZA 5AQZA 5BRDA 3LDNA 2V7ZA 3SLCA 3H46O 3SMPA 3VEOA 3VEVA 3VF4A 4H0VB 1G99A 4FWLA 2ITMA 4BC5A 4CBWA 2IVPA 4B1XB 1ATSA 3TU5A 2P9KB 4A2AA 3EO3A 1GLCG 3ZEUB 4BC2A 2YCHA 2ASMA 3QICA 4H5NA 5JICA 4M7XA 1J6ZA 2HF4A 2FSKA 3GOIA 3S41A 5I9EB 5F0XA 3CQXA 4BRHA 1E4GT 3FZKA 1T6DA 4H0TB 4QS9A 1DGKN 3FE1A 3GL1A 4I6MB 4FPBA 4IJAA 2Q97A 4LC9B 4BRDA 4H0YB 4EHTA 3O08A 2ZF5O 3D2FB 1BWFO 5BN9A 2W41A 4CJ7A 3LM9A 1X3NA 2E1ZA 5AQUA 4A2BA 5AQSA 3VPZA 3ENHA 3CJ1A 2E1YA 3WEEA 2PBDA 3FR0A 3LM2A 3RSEB 4BREA 4CBXA 3I8BA 4BGAA 2W40A 5AQFA 2PAVA 1U2VB 5BRHA 3AAQA 1NWKA 4MLHA 4CZHA 1ZBSA 5AQHA 4JHDA 2HF3A 5AQQA 2IVOA 3O80A 1GLEG 2D0OA 4HTLA 1NGHA 3FFKB 2NZTA 2VYPA 2QW9A 2FF6A 3EL2A 2D4WA 4YDUC 3UKUA 3D2EA 2V51B 3CJCA 3QFPA 3A5LC 3C0BA 5ELZA 3HZ6A 4CD3A 4B1UB 2A40A 2NLXA 4BRGA 4GNIA 1RDWX 1IJJA 4BRIA 4BRLA 1NM1A 1MA9B 3EN9A 1RFQA 5BPMA 4CZEA 4BRMA 2E2PA 5AZIB 1HKGA 4BQLA 1ATRA 1WUAA 1NGGA 4FWSA 5FPDA 1NGBA 3UKRA 3A8YA 4CZGA 4BG9A 3BF3A 1ESVA 1QZ5A 4PKGA 4BRPA 5AFUA 1SQKA 4IXCA 1XQSC 5JMVA 1SAZA 1V4SA 3BUZB 3G25A 3DWLA 3VEXA 3LDLA 3W0LA 2I7NA 3H1VX 2FSJA 1KAYA 1C0FA 3F9MA 2P9PA 5AQMA 2DPNA 4FPAA 1C0GA 3LDQA 2YHWA 3U8XA 1R59O 2YJFA 1GLJO 3A0IX 3VGMA 4CZLA 3C7NB 3A5OC 4PL8A 4CZKA 3D7EO 1XC3A 4XEIA 1D4XA 3BEXA 5JLHA 1X9JA 2YJEA 5AQYA 2QWNA 3DXMA 3ZX0A 5LY3A 3MN6A 4PL7A 1YUWA 4BR2A 4RTFD 5AFUH 1KAZA 2ASPA 1NGCA 3DXKA 3CJAA 1KAXA 4NO7A 3L0QA 4Y0WA 5AQGA 2P9LA 3FZHA 2OANA 5BPLA 1QQMA 3LL3A 3WEEB 2IIRA 3BF1A 3CHWA 2E2QA 3U9DA 2P9IA 2QWMA 1Y64A 3VEWA 3KHYA 2QWRA 2GTDA 5BPNA 2P9NA 4XH1A 3ULEA 4PKIA 3ENOA 4BROA 3HM8A 3H3NO 2P9SA 5AQRA 1TYQA 5AQXA 2QM1A 2QWOA 3QDKA 1JCFA 2FF3B 2V52B 3D2EB 3MDQA 3WXKA 3VERA 4WYBA 2ZWHA 2P9UA 4DQ8A 4EHUA 4MO4A 4H5RA 1T44A 4XH5A 3VGLA 3ZETB 1HKBA 4RWTA 5AQPA 3U9ZA 1ZC6A 3CERA 4WQ4A 3H6EA 5AQOA 3OHRA 3QB0A 3O6WA 3CETA 2CGJA 3GBTA 3ATVA 1BDGA 1SZ2A 4H03B 4K43A 3WXIA 3MN7A 2WUSA 2BUPA 1BOTO 3UKRB 2GWJA 4O5FA 4BR9A 2P9KA 5AQTA 3MN5A 4FWPA 2E2OA 4FOEA 3ZEUA 4CZIA 4MO5A 3H45C 3FGUA 1P8ZA 1MWMA 1GLAG 2ZGYA 4HWIA 1K8KB 4B1ZA 2BTFA 1Z6RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GVMA 3A5MC 3B8AX 4BVPA 3VEYA 5C0YA 3ZSXA 4FZZA 2X74A 1HJOA 4NB4A 4CERA 2ZJQL 2UU9K 1IBLK 5B8HA 3WT0A 3CJ9A 4LSNA 3L2WA 4M3XA 4IO8A 4CHZA 2PY5A 3SMSA 3PO4A 2VG6A 4IZ9A 4CEFA 5M1PA 2QXLA 3TAEA 2OTJN 4JK7A 1TK0A 1ATNA 3VF2A 1VSFA 4JK9A 4JKDA 4B9QA 1L5UA 4IDKA 4JKHA 1O13A 1BL3A 3WNGA 3ZX2A 3OBWA 5AQJA 1UAXA 4FWQA 1GLFO 4A59A 2P9IB 4JS5A 1SKRA 2O8BA 1QZ6A 3GE1A 4C23A 2G8VA 3MEGA 3HPHA 2OA8A 1NKEA 2P9SB 4B1YB 4U7BA 4O55A 4A5AA 5MLCQ 1QSLA 4B9NA 4FJIA 4M7YA 4BQZA 1VHXA 2ATQA 4OGEA 1VSDA 5E84A 4W5QA 1JLFA 3S3MA 1X9MA 3OYDA 3L2QA 3M8RA 2NRTA 2W6KA 3O3GA 4JKBA 2HOEA 3ZSQA 3ATUA 3CCSN 1FXXA 3CI5A 3QLHA 3LP3A 3O4NA 3OYLA 4BVOA 2O8EB 3HRGA 2Q31A 4JHDB 3AO4A 4CZFA 3CJ7A 4FK2A 4MFBA 4JNEA 1NNEA 3CJBA 2QWPA 1JCGA 4CBUA 4JKCA 1E4FT 4CK3A 2JGUA 1S9EA 4JI7K 1W7AA 4CEEA 4I2PA 2NRHA 4FJJA 1EKEA 4LFCK 1JXEA 4BACA 1L3SA 1BISA 1XHXA 1HJRA 3CG7A 1VQON 4DV4K 5LMNK 5GIPA 3QO9A 5AR0A 3AVFA 1X9SA 5LL6Z 4DTRA 4Q0BA 3IDHA 3ZSOA 1WLJA 2HHTA 4ID5A 1L3UA 1OVQA 4KO0A 5AQNA 3CQ8A 4IJNA 5D3GA 2IDOA 5KI6A 4E7JA 1BUPA 4B1WB 3W3DA 2HHVA 4B9SA 4NXNK 3IKMA 3C95A 3ZSZA 4FM1A 2A5XA 5H1SQ 1FK9A 1GLLO 3SAFA 1Q9XA 2A6AA 3L2VA 1JLAA 3RRHA 2A42A 4H0XB 4CHNA 4O8KA 3RVCA 3CQYA 3HT3A 2WOMA 3V6DA 2PZSA 4N5SA 3LPUA 3AA3A 3WXJA 5HP1A 3DLHA 3DXKB 4JEPA 5JS1A 3THXB 5AQLA 1NGIA 4M41A 5AQVA 1IBMK 3WNHA 4KTZA 3V9SA 4IOAL 3UB5A 3L4IA 5M1QA 1HYVA 4DF8A 3R9PA 2XY7A 4CD1A 3VN5A 1IKXA 2JWLA 3T19A 3M8QA 4FYDA 4O0JA 2FXUA 5F2RA 3CMAN 1NGEA 1BHLA 1TL3A 1VQ5N 3I56N 1U6ZA 4H0PA 3WNEA 4BDPA 1QHAA 3OYNA 3RMDA 3LDOA 4FJNA 1ITGA 3J80O 1IKYA 4KH4A 4CJ5A 1RT5A 3A5NC 4OX9K 4CJEA 3VQDA 3J8AA 1WSEA 1KRPA 1MU2A 3NHGA 2GUIA 4LF9K 3FFIA 2Y1JA 2HW3A 1XUPO 3AA5X 1FJGK 3LDNA 3VEOA 3VF4A 4E3SA 5C12A 4IFYA 4FWLA 4JLHA 1M90O 3TARA 3SBTA 3SQ4A 1GLCG 4CJPA 2ZJRL 1DT9A 3NH2A 4CK1A 2YCHA 4H5NA 4BE0A 4DF4A 4DU1A 3MX2A 5JICA 4M7XA 2DFEA 2FSKA 4B3SK 5F0XA 3CQXA 3EE9A 3FZKA 4Z4EA 1UA1A 4KB1A 5CYMA 3GL1A 4I6MB 3SQ0A 4FPBA 3EEQA 4LC9B 2B5JA 4BRDA 4H0YB 3O08A 4CW7B 3HVRA 5BN9A 4ELTA 4N56A 4PY5A 3CC2N 2E1ZA 2B6AA 1N36K 4RW9A 4B3RK 3WEEA 5FROA 1VQMN 1RT1A 3AVLA 3E9PA 5C42A 2QKBA 2F8SA 3OVNA 2W40A 4DTJA 4DWIA 4PA1A 5C10A 5HROA 2PAVA 4FJXA 5BRHA 1VSJA 1J9AA 3VQ9A 3MXIA 4CK2A 1NWKA 4NCGA 1S1WA 1ZBSA 4DU3A 5AQQA 2HF3A 3J7YP 1C6VA 3LALA 3FFKB 2NZTA 2NNWA 2QW9A 3SPZA 3VQ7A 1Q86O 5CR4A 5BR8K 3A5LC 3M8SA 4DFPA 3C0BA 3TAPA 3OW2M 1WAJA 1HNZK 3R3LA 3VQBA 2OCEA 1JLBA 4BRGA 3AA4A 3R1XA 3AVKA 4AHSA 4FJHA 1MA9B 2QI2A 1B92A 4MDBA 3J81O 3SAGA 5AZIB 1HKGA 3HL8A 1IG9A 1ILYA 4B08A 3HPGA 4X64K 2YX6A 4NCBA 1NGBA 2NRVA 1J53A 4G1QA 1HMVA 4A5BA 3ZSYA 5AFUA 5E41A 1U49A 3KKRA 3SZ2A 2E6MA 3DWLA 3VEXA 3W0LA 2ETJA 3OYBA 2P9PA 3KLIA 1I94K 1C0GA 3LDQA 3U8XA 4OLBA 3A0IX 4UY8O 4DKWA 3C7NB 3A5OC 5KRTA 3TWHA 4PL8A 4CZKA 4YHHK 3SNNA 3V1OA 1RNHA 3TI0A 5JLHA 1NJZA 2PYJA 2YJEA 3AO3A 3BZCA 3DXMA 5CY4A 3KD5E 4F4KA 4BR2A 2KW4A 1ZYQA 3PX4A 1NGCA 1WN7A 4NO7A 4Y0WA 2P9LA 3FZHA 1SL1A 3QERA 2QK9A 4DUYK 4M3UA 2OZSA 4DV5K 3OYCA 3CHWA 1LWCA 3P38A 4DSLA 3SAHA 3SUQA 1U45A 2E2QA 3RWUA 3NF7A 3U9DA 2QXFA 3KLHA 1TV6A 3VEWA 3CYMA 3TANA 1RBTA 4LF8K 3KHYA 3D0PA 1BI4B 2P9NA 3G4SN 2FBVA 2VG5A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3N4P A;  3OA9 A;  3NVM A;  1CLQ A;  3VQ4 A;  4WE1 A;  3CF5 L;  4B9V A;  3MWT A;  4CED A;  3VQP A;  1HNI A;  3SJJ A;  3AA2 A;  3AVG A;  4B8A B;  4C8L A;  2E5L K;  3LPT A;  3ULE A;  4CFB A;  4HHT A;  3MEC A;  3H3N O;  4FJL A;  1OH7 A;  1TYQ A;  1VSL A;  1JCF A;  4KHP K;  3ZSW A;  1D5A A;  3QIN A;  1C1B A;  3VER A;  4FCY A;  4QOZ B;  4F3O A;  1Z26 A;  3VGL A;  3NF9 A;  1YJW N;  3SUN A;  5JS2 A;  1ZC6 A;  4WQ4 A;  4LH5 A;  2YHB A;  3VTH A;  1W9H A;  3OHR A;  4IOX A;  3QB0 A;  3O6W A;  1NOY A;  1KQS M;  3DMJ A;  1B9F A;  4E0D A;  1BDG A;  4K43 A;  3WXI A;  3MN7 A;  5JVG L;  1LW0 A;  1T3V A;  1N34 K;  2EX3 A;  1BOT O;  4HUG A;  3UKR B;  4O4G A;  4O5F A;  1NK7 A;  2P9K A;  4X62 K;  3AVB A;  2VG7 A;  4FOE A;  3ZEU A;  1VQK N;  4CJS A;  4CZI A;  3FGU A;  1MWM A;  2O8F A;  4WFN L;  4B9T A;  2FC0 A;  2ZGY A;  4HWI A;  1K8K B;  3K5L A;  4KHW A;  5C15 A;  4W5N A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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