5LY3A

P. calidifontis crenactin in complex with arcadin-2 c-terminal peptide
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
427
structure length
427
Chain Sequence
ISDAYRLKYTFGVDFGTSYVKYGPITLNEPKMVQTRGLFLRDLPESVKMRIPPDVLARGLVVGDEEVRKYLSSVRDVQRNLKYPLKDGVARRDDEEAWRVLKELARYTLAQFPVSDPEFAGWLVAVALSALAPDYMYKAIFDIYDELASEFKIYAVTILPQPLAVAIAENAVNCVIVEGGHGNIQVAPISFALIREGLVALNRGGAEANAITREILKDIGYSDIAREEYAVEVVKRAVGLVPRRLKEAIRAAKSDPDRFVTKVRLSPVVEVEIPREYAWTRFLIGEIVFDPNHEEIKSYIEQSRLRIENAVIGDVTLYGEMDVASAIITSLRNVSVEIQERVASQIILSGGAFSWRVPPGMEDVAADSVTRVKIALEEKSPALASKVEVRLVSEPQYSVWRGAVIYGYALPLSLEWSDTTREGWRFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin/actin family protein
publication title Crenactin forms actin-like double helical filaments regulated by arcadin-2.
pubmed doi rcsb
source organism Pyrobaculum calidifontis
total genus 139
structure length 427
sequence length 427
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ly3A01
3.30.420.570 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ly3A02
3QBWA 4BRIA 1S3XA 1TUUA 2WUSA 3CETA 3H45C 4WQ5A 3L6QA 3D2FB 1LCUA 2A40A 3M3ZA 4CBWA 3G25A 4FPAA 5ADXH 1DGKN 4CBXA 4BROA 4CBUA 3ULEA 2HF3A 3BF3A 3GE1A 3UKUA 1E4GT 1J6ZA 1NGBA 2GELA 2Q31A 5KQDA 3SMPA 3VGLA 4BRLA 4CD1A 3I8BA 4WQ4A 4FL9A 5AQLA 5EY4A 2Q0UA 4B9QA 2NLXA 4CZMA 1GLCG 1HX1A 3FZFA 4BR4A 1KAXA 4FOEA 3MN6A 1MDUB 5AQSA 1DKGD 5AQMA 1Z6RA 2CGLA 3VF2A 5BR9A 4BVOA 1S22A 4PKIA 3O80A 4Y0WA 5JMVA 3ZX0A 5AQHA 3IDHA 2ZF5O 3KVGA 1ATNA 4FPBA 3WXLA 2A3ZA 2QWOA 2ZGYA 1BU6O 1TUYA 3LM2A 1XUPO 3CI5A 3DAWA 1NGIA 3U9DA 5EOYA 3D7EO 4J8FA 4FWMA 2ZGZA 2NRHA 3VETA 4ISGA 5B8HA 4IJAA 1WOQA 3KHYA 3AY9A 5BRHA 2CGKA 3CJ9A 2W41A 4MLHA 3VF6A 3WEEB 3IFRA 4DQ8A 5JLFA 1HKBA 3A5NC 4RTFD 2F9TA 2FSKA 2QWMA 3FFKB 4C23A 3DXMB 3C7NA 3MN5A 3AARA 5AQYA 1QZ5A 1C0GA 3CJAA 1MA9B 2P9UB 5I9EB 1KAZA 1XC3A 4H03B 2V7ZA 2Q36A 4M7XA 3GBTA 3F9MA 3H6EA 4LC9B 3O8MA 3DXKA 2QWQA 3LL3A 5E26A 1U6ZA 1X9JA 4FWSA 5KPZA 4CZJA 2CH5A 2YHWA 4H0VB 3IMXA 1XQSC 3FLCO 3FZKA 2A6AA 4CD3A 4H0TB 3ENOA 1NGFA 2A5XA 3FR0A 5AFUH 3R9PA 1TYQB 3CQXA 4BG8A 4QS9A 4XH1A 3U8XA 3HM8A 2GEMA 2P9SB 2GWJA 2UYTA 1KAYA 3BUZB 4CZFA 3SMSA 3O08A 4BR2A 3A0IX 4I6MB 3EKSA 4BQZA 3GDQA 4H0PA 3MCPA 3SJHA 3U4LA 2V52B 3JS6A 4B1YB 1SQKA 3MN7A 4BR0A 4BVPA 4JN4A 3CQYA 3HI0A 5KPTA 3A5OC 3H1VX 1GLJO 5AQXA 3OHRA 1K8KB 1H1VA 1E4FT 4EHTA 5AZJA 5KQ8A 2P9PA 2FSNA 2PAVA 3O1WA 4O5FA 2OANA 1NM1A 3VENA 1EQYA 1IG8A 2E2NA 3BF1A 3CJ1A 4BRKA 5EX5A 1GLFO 3UB5A 4H5RA 1ATRA 3RSEB 1U2VB 4HWIA 4MLEA 4A2BA 2YHYA 5LY3A 2AA4A 3MMVA 4FOIA 1IJJA 2QWLA 4BRGA 5BRFA 1NBWA 3LDQA 2D0OA 3D2EB 4IO8A 4K41A 4PKGA 5AQIA 3A8YA 2A42A 4JAXA 3ENHA 1R59O 1D4XA 3A5MC 4JHDA 2V7YA 5AQTA 3J8AA 3QICA 3VOVA 3HTVA 1BUPA 1JCFA 2Q0RA 1HJOA 4F9OA 2E88A 3D2FA 5AQFA 1RGIA 4BREA 3W3DA 1YAGA 5EXWA 5ELZA 1GLEG 3DJCA 4AM7A 4QS7A 4JD2B 2E1YA 4K43A 2W40A 2KHOA 3C0BA 1QHAA 3FE1A 2FXUA 2P9NB 1NMDA 3BEXA 2HF4A 4H5WA 2IVNA 5AQPA 5LJVA 2FF3B 4XH5A 3H3OB 4CZEA 3R6MA 3UKRB 2FF6A 1RDWX 3U9ZA 3VGMA 5F1XA 3LDPA 1HPMA 4B1XB 4BRHA 5AZIB 4BRMA 3ZETB 4BC4A 3CIPA 1JCGA 2EWSA 3W0LA 3QFUA 4H5VA 1GLDG 5BN8A 2P9KB 3EKUA 4H5TA 2DPNA 1NGJA 2FLOA 3P4IA 4CZGA 4WQ4C 1G99A 4QS8A 2VWBA 4XEIA 1WUAA 3MK6A 5LJWA 1BG3A 4CJ7A 1QQNA 2P9LB 4PKHA 4MO4A 3LDOA 4BQLA 4EFHA 5F0XA 3H1QA 2J4RA 5JICA 2GUPA 1BWFO 3WEEA 4CZIA 4NB4A 1T44A 2P9IB 1YVNA 1HUXA 3JXUA 3QBXA 2CGJA 4H0YB 3ZX2A 3DXMA 5ADXA 2E8AA 4BRFA 2ASOA 1NGGA 3VGKA 2P9UA 3EZWA 3L4IA 4CZHA 5BRDA 1OKJA 1GLBG 2BUPA 4NO7A 1YXQA 2E2OA 3WUHA 1ZC6A 2I7NA 4IZ9A 3TU5A 1BA0A 4BRDA 1MWMA 5E84A 1NGEA 4E1JA 4BRAA 3A5LC 4BG9A 3WXJA 5BPNA 4FWPA 3ZEUB 1BO5O 4BR5A 1P8ZA 3MDQA 5BN9A 4KBOA 4K25A 3UE5A 3O6WA 3QFPA 1TYQA 3AAQA 1Z05A 5AQJA 4BRQA 1YUWA 1HKCA 1X3MA 2P9SA 3LDNA 3ULEB 3SK3A 5EVZA 4YDUC 3UKUB 3ZX3A 1Q18A 1HKGA 4ISFA 4Z94A 4I6MA 2I7PA 1BOTO 2D4WA 5AQGA 1ATSA 2PBDA 4B1WB 1C0FA 1SZ2A 2GWKA 3O5BA 5JLHA 5FPEA 5AQUA 4JNEA 4AM6A 4FO0A 4XH4A 1K8KA 5BPMA 1QQOA 3GL1A 1NGDA 1NWKA 5CE3A 3SLCA 4FWKA 4FSVA 2BTFA 5AQWA 4BC3A 5FPDA 1X3NA 4BC2A 2QWNA 3BP8A 1T6CA 4B1VA 2HOEA 3VEYA 2D1KA 4M7YA 3VESA 3RSEA 3VEOA 1U2VA 2ASMA 2YJEA 4BRNA 4PL7A 3H3NO 4FWQA 4IWVA 3L0QA 1KXPA 4A61A 3VF4A 3D2EA 1JCEA 3CJ7A 1ZBSA 3TPQA 2E2PA 2E20A 3EL2A 3CHWA 3GOIA 4BC5A 4WQ5C 4BR9A 4FWLA 1BDGA 2IIRA 3M1FA 3H46O 4IXCA 4BGBA 4EHUA 4O8KA 2V51B 4B1ZA 4B1UB 3I33A 3FZHA 1LOTB 2QWRA 5AQQA 2D0PA 4A2AA 2QW9A 2YHXA 3M6GA 5AFUA 4CZKA 1NGHA 1T6DA 3C7NB 4HTLA 4ISEA 4JD2A 4RWTA 5FPNA 5AR0A 2P9NA 2H3GX 2FSJA 2VCPA 2QXLA 3WT0A 5TKYA 2AP1A 3UKRA 3ID8A 1MWKA 3DXKB 3MN9A 4WYBA 1HLUA 4MO5A 4FWRA 3AAPA 3QDKA 1GLAG 4BRPA 1BA1A 5AZIA 3WXKA 5KPRA 3ZETA 1Y64A 4EAHD 2QM1A 3VPZA 3IUCA 3ATVA 5AQZA 2YCHA 4K42A 3R8EA 3VEVA 5F2RA 2YJFA 3VEWA 4EIAA 2P9KA 3DWLA 3WQUA 3O4WA 3GG4A 4CI6A 3EN9A 1QZ6A 4DCHA 3WQTA 2F9WA 3CJCA 2Q97A 3FGUA 5AQNA 2IVPA 4FWOA 3VEZA 3EO3A 1V4SA 3WXIA 4A62A 1NGAA 2P9LA 4YDUA 1NLVA 3LM9A 4BGAA 3O1BA 5BPLA 5FPMA 2IVOA 3ATUA 5AQKA 2E2QA 1SAZA 4L3QA 3HZ6A 1GLLO 3FZLA 3LDLA 4RCHA 1RFQA 4DHYA 1ESVA 2P9IA 4BRCA 2VYPA 3B8AX 5AQOA 2YI1A 4H0OA 5AQVA 1CZAN 2HMPA 4H5NA 5AZJB 2P9PB 3VEXA 1ZXOA 4CZLA 4PL8A 2Q2RA 1NGCA 2GTDA 4M63C 5AQRA 2ZWHA 3HSCA 2CH6A 3HBTA 4GY2B 4FWNA 2QWPA 4BR7A 3CJBA 3S41A 3CERA 3VERA 4H0XB 2E1ZA 1V4TA 2ASPA 3KZBA 5BREA 4DB3A 1QQMA 1DEJA 3FZMA 2A41A 2ITMA 4GNIA 4IJNA 3QMLA 4JHDB 2NZTA 3QB0A 3ZEUA 2Q1NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1S3XA 1FW6A 4CGIA 3L6QA 3SQ2A 4JI7K 2A40A 1JLCA 1KFDA 3MECA 3G10A 1DGKN 2OCEA 5DMRA 5CY4A 4JEPA 3ULEA 1Q9XA 3JYTA 3TABA 1NK8A 3RMBA 2EHGA 1SKRA 5FRNA 1NGBA 2GELA 2Q31A 3AVIA 1VSIA 4DQPA 4FL9A 4K8XA 2Q0UA 3CF5L 4NXNK 1KAXA 4FOEA 2A1SA 1MDUB 3VQ4A 2HHUA 4N41A 4DKWA 1DKGD 3EY1A 1S9GA 3DLLL 4Z4CA 3ZSWA 2FBTA 1S22A 1X9MA 5JMVA 3HK2A 3PIOL 4Y1CA 1VQ9N 3WXLA 2BDPA 2QWOA 1GOAA 1BU6O 1TUYA 3CI5A 4JKHA 4E3SA 1XMQK 4CHPA 3D7EO 1TGOA 4DTXA 3QIOA 2YHAA 3CJ9A 4MLHA 5CHIA 4DMNA 5FROA 1YHQN 2YHBA 3A5NC 1BIUA 4MDAA 4FVUA 1NJXA 3CCLN 4C23A 4B3SK 4Z4FA 1A5WA 3DXMB 3FFIA 2HMIA 4C8MA 3TAFA 2D0CA 2P9UB 2QXFA 4KHSA 4GV6A 3I55N 2WTUA 1HPZA 3H6EA 4LC9B 3VQBA 1IKVA 2O8CB 3V9SA 4CGJA 1X9JA 4FWSA 4NCGA 4H0VB 1XQSC 3FLCO 1NGFA 1KC8O 4B9MA 2IS3A 3OS0A 1BI4A 2RPIA 2GEMA 2P9SB 4UY8O 2XRIA 1KAYA 1NOZA 5JVHL 4DV6K 1LWEA 5C24A 3O08A 2O4GA 3A0IX 4BR2A 3THYA 4DTPA 3EKSA 1GOBA 1RBTA 3SNNA 4FZYA 1HMVA 3JS6A 4RG8A 3MN7A 4IFYA 3TAPA 2O4IA 1E4FT 4KREA 2P9PA 1VQLN 2PAVA 4I9LA 2OANA 1NM1A 3OJSA 1EQYA 2E2NA 3CJ1A 3U3GA 4X66K 3UB5A 4H5RA 1OH7A 1VQKN 4HWIA 4MLEA 5LL6Z 3MX2A 4Z4GA 1ASWA 1IKYA 1X9WA 1NBWA 3THXA 3RVCA 1NJIO 1QSSA 4CF2A 3WNFA 4KH4A 2I5JA 3OYAA 4IG0A 2G8WA 1D4XA 2VQFK 3HTVA 3F9KA 1JCFA 1LWFA 2Q0RA 4F9OA 1RT1A 4BREA 5FLXO 1SV5A 2WBNA 4AM7A 3K0SA 4FJGA 1KFSA 3QNNA 3FE1A 2RF2A 3Q7CA 4DV1K 5LJVA 4O5BA 3PY8A 4CE9A 5GADP 1VSFA 3U9ZA 3VGMA 4GV3A 3DOLA 1RNHA 1EXQA 1HPMA 3PUFA 4B1XB 1ZBIA 3NVKA 2E5LK 5AZIB 4GMJB 3ZETB 3CG7A 1JCGA 4JYAK 5CZ2A 4QOZB 2VGNA 4H5TA 4LD0A 2HNZA 3P4IA 2HBLA 4FM1A 3HPHA 4ZTJA 3OYLA 3WNEA 3MK6A 1HQUA 5LJWA 1BG3A 4CF8A 4WFNL 2ETJA 3G0ZA 3CPWM 1FKOA 4CJLA 3ZSQA 4AF1A 4DS5A 1RT7A 4AHCA 1U47A 1MU2A 4E89A 4DTUA 3QEXA 1HUXA 4C8OA 4KB0A 2YV0X 1N5YA 1VSHA 3M8SA 4H4MA 1NGGA 1S1VA 4JKAA 3L4IA 3CFRA 2OTJN 2ZJPL 3OYEA 5FRMA 1GLBG 2DY4A 1S9EA 2BUPA 3O9UA 1ZC6A 2P5OA 1W2BM 4YNQA 1UWBA 3VTIA 4AHSA 4GW6A 3V6DA 5IWAK 3WNGA 3ZEUB 2O8EB 1TVRA 3HPGA 3MDQA 3ASMA 2O8BB 4KBOA 3CM5A 1N32K 4DTMA 3C6HA 4JV5K 4IG3A 4CIGA 3OW2M 1HKCA 1EO1A 2KZMA 3SK3A 1YIJN 2PY5A 2QKBA 4ISFA 2VWJA 4V19S 3CCUN 3QEIA 1BOTO 2D4WA 5AQGA 3AVMA 1TK5A 1N8RO 4B1WB 1ZBUA 4AM6A 3MCAB 4M41A 3VTHA 3OYHA 4B3RK 4J2BA 1JLAA 3SLCA 1NK9A 4FWKA 4BC2A 4JK8A 4E7LA 3VEYA 3VESA 2D1KA 4M7YA 1JLQA 1W97L 3CD6N 4BRNA 3H3NO 3J7YP 3O4QA 3KIOA 3L0QA 1NK0A 3VF4A 2WOMA 3D2EA 4E7JA 3V81A 1NNEA 2E2PA 2RE2A 3CHWA 3GOIA 4BC5A 1RDAA 3MEEA 3R3LA 4BR9A 1CXUA 3QERA 1BDGA 2IIRA 4YOXA 3M1FA 4EHUA 2UUAK 3DLHA 1Q81O 3I33A 5GAHP 4FJ7A 3CCJN 3DOKA 2E6LA 4OGCA 3O9RA 4A2AA 2YHXA 4Q5VA 4CJFA 3ZSRA 1NGHA 4M42A 1RDUA 5FPNA 5KI6A 1Q8IA 4CEAA 3ID8A 4F2SA 1MWKA 4EP5A 3QEVA 3KK1A 3QO9A 1GLAG 1FK9A 4FM2A 2RKIA 1SL2A 5K14A 1HQEA 4FK4A 4M3YA 3QLHA 4JK7A 1RTJA 3J7AP 3VQ9A 3IUCA 4DR6K 2IGIA 3VEWA 3VQCA 2P9KA 3DWLA 4HVJA 3DLGA 1QZ6A 4DCHA 4DQQA 3VQ5A 1CXQA 3CJCA 3CQ8A 3FGUA 3AVBA 4FWOA 4Q0BA 3VEZA 3K58A 4LSLA 4A62A 1NGAA 3SI6A 1NLVA 4DSIA 4BGAA 1KCFA 2A1RA 1WSJA 3ATUA 1SAZA 4L3QA 1GLLO 4BE2A 4B9SA 1WSEA 1QVFM 2KFNA 1ESVA 2P9IA 2VYPA 5AQOA 2NUBA 3B8AX 1WN7A 1J5EK 1NGCA 3M5RA 5AQRA 3DLKA 4W5TA 3T69A 4KKOA 3G71N 4BR7A 4DLEA 1V4TA 3I0SA 4KPYA 1NU0A 3C6TA 4DSLA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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