2F7TA

Crystal structure of the catalytic domain of mos1 mariner transposase
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
227
structure length
204
Chain Sequence
WVPHELNERQMERRKNTCEILLSRYKRKSFLHRIVTGDEKWIFFVNPKKTMLCVWWDQSGVIYYELLKPGETVNAARYQQQLINLNRALQRKRPEYQKRQHRVIFLHDNAPSHTARAVRDTLETLNWEVLPHAAYSPDLAPSDYHLFASMGHALAEQRFDSYESVKKWLDEWFAAKDDEFYWRGIHKLPERWEKCVASDGKYFE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Mechanism of Mos1 transposition: insights from structural analysis
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila mauritiana
molecule tags Dna binding protein
molecule keywords Mos1 transposase
total genus 72
structure length 204
sequence length 227
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01359 Transposase_1 Transposase (partial DDE domain)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.470 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2f7tA00
3K9JA 4MDBA 5CR4A 4U7BA 4MDAA 3HOTA 3HOSA 4R79A 3K9KA 2F7TA 3F2KA 5HOOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4N56A 1KVBA 3W3DA 2E2PA 5FPNA 3O9RA 3GOIA 2P9SB 3F9MA 4KTQA 4DTSA 4JKGA 4DR2K 3V9WA 1ILYA 3RTVA 2HHSA 4YY3K 1XUPO 3NVKA 2P9IA 1W7AA 3AVBA 4Z4IA 1KLNA 4B9VA 3C65A 4PUOA 1YITN 5BRDA 4NXMK 4JLHA 1J9AA 2RF2A 1KSPA 3OJSA 2KHOA 3GBTA 4HTUA 3H1QA 1GLAG 2I7PA 1IG9A 1BO5O 3DLEA 3KK2A 2QA4N 3E9LA 3CC2N 1QHAA 4BR0A 4DSFA 3ZX3A 4KTZA 5E84A 4DQRA 1KFDA 3WXMB 2ITMA 2W40A 4FM2A 5J2MA 2PY5A 1QVFM 4K43A 2P9LB 2H3GX 4H5RA 1WUAA 5ADXH 5J2NA 1FXXA 3AGRA 3SV3A 1BA1A 4PHTX 1WAFA 5BPMA 2IDOA 2G8FA 1Q8IA 3VQ9A 4DR6K 3PSFA 4DV1K 5C2FA 2VQEK 3M8QA 3FZLA 4G1QA 4B8CA 3C6TA 3C6AA 3T19A 4EAHD 2QK9A 4A62A 1QSSA 3AO3A 4FM0A 3IRXA 1NGAA 4KH6A 4CBWA 1VQNN 2E88A 3M6GA 1SAZA 1IKWA 1X3NA 1TKZA 5AQPA 3OYGA 4YNQA 1BWFO 4BC2A 2F4VK 2FBXA 4CZIA 5BREA 4IDKA 4C8MA 1VSIA 4C8NA 3DJCA 2UUAK 3F2KA 3MXIA 4GY2B 3G0ZA 3LM9A 3UIQA 2QEXN 3LDSA 2IS3A 1BHLA 1C0MA 2Q1NA 3AA4A 2UUBK 1TL1A 3D2FB 3HPHA 3D2FA 4FJHA 2GV9A 4CJ5A 1ESVA 4FOIA 1BIZA 1HQUA 4NO7A 4FM1A 1YAGA 5CR4A 1KTQA 2HVHA 3OYFA 1EO1A 1WSGA 1QQMA 3M5RA 2G8KA 4Z4FA 1IKXA 3CIPA 1HYVA 1WNSA 1BI4B 4CF1A 1U2VB 4GMJB 4BWJA 4LY7A 2VCPA 3VQQA 4KTWA 3MN9A 3RRGA 4JAXA 4WF9L 5ELZA 3OJUA 3B6OA 2KLAA 3LDQA 3KLEA 4A5BA 1VQ8N 1VQON 3SMPA 2XHBA 3NF9A 2Q31A 3O5BA 3QFUA 5KPZA 1RT4A 1H1VA 2VYPA 3NCIA 2HSTA 1SKWA 4DWIA 2DPNA 4FVMA 4BGAA 2VG5A 1LV5A 4FPAA 3FFKB 4HCBA 2HW3A 2DTUA 4CJWA 2V52B 3EY1A 1DTQA 1XNQK 5F2RA 3AVAA 3UB5A 3QEPA 2B5JA 1K8KA 3NH2A 3CXCM 4O0IA 1Q81O 1RTDA 4B9TA 3K5OA 3S3OA 3EE8A 4O4GA 3SPYA 1X9MA 1SL1A 3PUFA 1Z26A 3U3GA 1DGKN 2HHUA 3OYJA 4M3UA 2NRHA 5AQQA 2VG7A 3LP2A 2Z1JA 2JWLA 2RN2A 4BRCA 3QBXA 2WBNA 3V9SA 3QMLA 3BZCA 1NMDA 5AQIA 3UKUB 5JMVA 4JKGB 1BDGA 3V6DA 5AJ3K 4IFEA 4B1VA 1V4TA 1ZBIA 1QZ6A 1S9GA 4CFAA 3CHWA 4CZEA 5AQTA 1WSHA 2QWOA 3DLRA 3ENHA 1XC9A 3AA5X 3CM5A 4RG8A 4AF1A 4QS7A 2EWSA 5FPMA 1HJOA 2A1RA 4JS5A 2NLXA 3OY9A 4C8OA 3SQ0A 4FSVA 4EZ6A 1LWEA 2YNFA 4CEBA 3CCUN 4FZXC 4CJLA 4CJTA 5BPLA 1SL0A 2E20A 1W0HA 1VK0A 2F9WA 4B08A 5E41A 1JLFA 4OLBA 4CGIA 1REVA 5AQYA 3TU5A 3H08A 2YNGA 2YX6A 2PFUA 4CEEA 4MDAA 4E7JA 4F2SA 2D0PA 5MLCQ 4B3TK 2E2NA 2X78A 3CETA 4EP5A 3C94A 4JI7K 4OO1J 4FZYA 4DQQA 5D3GA 3O4WA 4O8KA 3SQ1A 1JLGA 2NRZA 3A5LC 3AAQA 3SUOA 1U47A 5CZ2A 1U4BA 1HNWK 1C0FA 2R7YA 2E8AA 1X3MA 4LC9B 4BRLA 3V4IA 4B3MK 4OPKA 4DLGA 4YORA 2Q2RA 5DM7L 2G8IA 1TGOA 1IH7A 4CEDA 3MN5A 4AHUA 4LH5A 4B9QA 5EY4A 1BOTO 1FKPA 3VF6A 3VQ8A 3SLCA 3G10A 4JI5K 1DEJA 2ITGA 2YJEA 3KK3A 4CGDA 1Q86O 1M90O 3RRHA 4QOZB 4HUEA 1JLAA 3FZMA 2FLOA 4GNIA 2WTUA 3L4QA 3MN7A 1J53A 3MEDA 4JK8A 3NAEA 4DTOA 3HM8A 1T44A 3KHYA 1VQKN 2YCHA 2PAVA 1E4GT 4B9UA 1VQLN 3CCSN 1S1WA 4OPJA 2Z1IA 2VWJA 2OPPA 3VGKA 4CJPA 3ULEA 2P5GA 1I3AA 3WUHA 1NKEA 2PYLA 3T7ZA 2FSNA 4HUGA 3B8AX 5KQDA 4IEIA 1C0UA 3DOLA 3MCAB 3CJBA 4JK7A 2GELA 3THWB 5KRTA 3QNOA 1YVNA 2HHXA 1HPMA 3QBWA 2VGNA 3CCVN 3V1OA 2IGIA 1SKRA 3IMXA 1T6DA 3LAMA 3PLAA 3TR8A 3WNGA 3VQBA 5HRSA 3RMBA 4CF8A 3P1GA 1GLCG 1NK9A 3TI0A 4CHQA 2FF6A 4RCHA 1IKYA 1J6ZA 1X9SA 3MWPA 3AV9A 3NF7A 3CJ1A 4I9LA 1Z25A 3CFRA 1RT7A 1LW0A 1ASUA 4C23A 1NGFA 3LALA 3PIOL 3ZSXA 3LANA 2W42A 1BA0A 1DTTA 3I0RA 1J54A 3FFIA 3DOKA 3OYKA 2E1YA 1SV5A 2CH6A 1NWKA 2IVNA 4DQPA 1C6VA 2HHHK 1WOQA 4QCLA 1HJRA 5JVHL 3M8RA 1YJNN 1VSMA 4V19S 3SBGA 1TKDA 5KTQA 5FROA 2YNHA 1FKOA 3ULEB 4X65K 4OGCA 3SCXA 5AQFA 1ZXOA 3VQAA 3JAMO 4CZGA 2YHXA 4M63C 1NJIO 5HROA 4CIEA 3S3MA 3PV8A 3VEVA 2NRXA 1VQ6N 4I7FA 3SUNA 1U04A 2I5JA 4YOVA 1XI1A 1ASVA 3ID8A 4FJMA 3EE9A 2D0BA 4CHOA 1WAJA 3O4NA 4FJLA 1RBRA 1OKJA 1NMNA 5BN9A 3IAYA 3THXB 3T3FA 3VQPA 5JLFA 4BDYA 4DF4A 4B1ZA 3PO4A 3O9UA 3VPZA 3SJHA 3U3YA 4Y1CA 3HVRA 3UE5A 4E7LA 5AQNA 3TAPA 4OLAA 4CF2A 1IO2A 2EX3A 3G4SN 5BR8K 2QWRA 3TAEA 2UXCK 3ZX0A 2ZJRL 1D8YA 4LSLA 3AO5A 2GWJA 3SQ4A 3TAQA 3OA9A 4CGJA 2KKZA 3DAWA 4JKAA 1DKGD 3CJ9A 4F4KA 4C1NI 4CI6A 4DQIA 3HT3A 4DG1A 4F8RA 5AQOA 3TAMA 4H0XB 3I8DA 3AVIA 4DTNA 3DM2A 1XWLA 4ISEA 3WEEB 4FOEA 3EO3A 1J5OA 4PL7A 5GAHP 3LDPA 4CFDA 4FWQA 1NK6A 2KZZA 4NLBA 2E2OA 2XRIA 4JD2B 3MXJA 2OTJN 3CG7A 4NCGA 3KLHA 2E2QA 4DFKA 1A5XA 2EHGA 1OH7A 5C0YA 5AZIA 2YKNA 1HNIA 4CFBA 4DR4K 4CD1A 4LD0A 3WXJA 3O3GA 2A6AA 1D9DA 2BTFA 4JD2A 1TYQB 2O8CB 3V9XA 3D7EO 2QI2A 3SI6A 4IO9L 1QVGM 1VHXA 3BF1A 3C7NB 1EWQA 4BE0A 2IIRA 4IDHA 2F7TA 3QERA 3GG4A 3OTOK 2X6NA 5M1KA 2A3ZA 2YJFA 1HKCA 3UKUA 4CGFA 3ZSWA 3JYTA 2VG6A 1CZ9A 3P38A 5AZIB 2P9NA 2OCEA 2B4JA 4PKGA 1VRTA 1QQNA 3A0IX 3QEIA 4N5SA 4DFPA 4DTPA 1CXQA 3GL1A 4M42A 4OGEA 3HPOA 4ILGB 4CZLA 3CC4N 1D9FA 2HF4A 1C0TA 3BP8A 4KO0A 3HP6A 4DS4A 4Z4EA 1L3UA 2UUCK 4OJRA 5C12A 4FJ5A 3QO9A 4A2BA 5BN8A 1IBMK 3U4LA 3THXA 1LCUA 3OS0A 1IBKK 1SZ2A 4LSNA 4KH4A 1D5AA 4B1UB 1N8RO 4DTJA 1W97L 3SYZA 3HP9A 1NGIA 1N33K 2O4GA 2QWQA 4JI0K 4Y0WA 1BQNA 3H45C 3V1RA 3ATVA 2OANA 1NGDA 2HNDA 1TKTA 3CCEN 3OYEA 3EKSA 2GWKA 3SAHA 3CI5A 5GIOA 4FWOA 1RT6A 3SUQA 3ZSQA 5LMNK 4CZMA 2ZE2A 4LFCK 5TKYA 3QICA 4BVPA 3TAGA 4BROA 1VSJA 1XNRK 2P9LA 2QWNA 2YV0X 4RW6A 4BG9A 4DTRA 2BGGA 2D5RA 4I2QA 1BU6O 1KVCA 3ZSVA 3SUPA 3G25A 1DLOA 4E1JA 4XH1A 3WT0A 1QTMA 3L3UA 4H5NA 4RW7A 4KPYA 4H4OA 3A2FA 2A1SA 4O5BA 2O8BB 1HYSA 4X66K 3L2UA 4NYFA 4M3RA 3TSPA 2RKIA 4IJAA 1GLBG 1RDDA 4O5FA 3CPWM 4F2RA 3M8PA 4E89A 1B92A 2HVIA 3B6PA 3ZCMA 5KRSA 4AHRA 1HKGA 4BWMA 3WQTA 1K8AO 3A8YA 4UY8O 4DV6K 4CGGA 4FLYA 3O9TA 5CE3A 2DFFA 3W0LA 1ATSA 2I7NA 4J2EA 1KCFA 2FBYA 1TV6A 3FZFA 4Y1DA 4L3QA 1NGCA 1NK0A 1T7PA 4DUYK 5LMUK 4K8XA 3LDOA 3ZT1A 3Q7BA 4DHYA 4Z4HA 3BY5A 3HTVA 3THYA 3LWMA 3KIOA 4WCEL 5JICA 4FW1A 4FWKA 4QS9A 5JVGL 3K9JA 1VQPN 2B6AA 2OZSA 4CF0A 5AQLA 3V81A 3G6EN 1S72N 2Z1GA 4O44A 4DF8A 5FDLA 3VQ4A 2HB5A 1G15A 5FLXO 5T7BA 2OPQA 4A2AA 3CJ7A 1NKCA 4CK2A 1RT5A 3IKMA 2HMPA 2KFNA 3HVTA 1BIUA 5GAEP 2NRTA 4AH9A 1IG8A 3AVKA 3H46O 3P4IA 3TPQA 1TK5A 4IJNA 1T05A 3VENA 2VQFK 2HF3A 1L5UA 3HK2A 3QB0A 3OYCA 1HLUA 3UKRA 2E6LA 3CQXA 4O55A 1RDBA 3AVCA 1TVRA 3OYLA 2ETJA 4FK2A 3J7AP 1VSLA 1U6ZA 5AQXA 1Q18A 4FWLA 4DR1K 4M3WA 1HX1A 2A42A 1KAYA 2RHKA 1RDCA 4DFJA 2A40A 3C7NA 3DRPA 4BVOA 4XEIA 2BANA 3V9UA 3CCMN 3FR0A 4FXDA 3I56N 2O4IA 4B1WB 1N5YA 1Q7YO 3PO5A 3WNHA 3RMCA 1NJWA 5CZ1A 4JI2K 4JS4A 3O8MA 1U48A 3VN5A 3P31A 2PYJA 4W5QA 1L3TA 3HO1A 5AZJA 2FSJA 3MK6A 3VF2A 3O9QA 1BG3A 3HPGA 3OYDA 3RR8A 4CHNA 3O08A 4JKBA 4DU3A 3QEXA 2WONA 2ZD1A 1TK0A 1RT1A 1B9FA 2FBTA 3L4IA 4FLWA 4CIGA 3L8BA 4DSLA 1JXEA 2P9NB 3SV4A 2P9PB 3AVGA 3ALYA 3CCRN 1XHZA 1XQSC 3L2QA 4M3YA 5AZJB 2W6KA 2E5LK 2AJQA 3IS9A 3VQDA 3ULDA 2G8HA 2QKKA 4GVMA 1RBTA 1C0GA 1HPZA 3PIPL 2XY7A 2UU9K 4KB0A 1S1TA 1TUUA 3DMJA 3HZ6A 2V51B 4JI6K 3N4PA 4YHHK 3J80O 4KHQA 3K2PA 4WFNL 1NK7A 1HYZA 3NH0A 3PX4A 4FLVA 3VOVA 1S1VA 5M1OA 3O80A 3NF8A 4X62K 2ZWHA 2D0OA 3WXLA 4KI6A 4JRPA 3MWTA 4CK1A 2HHTA 1Y64A 4FWSA 3MX2A 4CIFA 4AHTA 1MWKA 1XMQK 4BDZA 3E66A 3VQ5A 1YJ9N 1JLQA 4DB3A 1HR0K 2ZJPL 5CYQA 4HWIA 4PA1A 1K8KB 4Z4GA 1UA0A 4CZFA 1I39A 2YI1A 4DTMA 3ZYYX 3HBTA 3KJVA 2V7ZA 1HMVA 4CJSA 1ASWA 3T69A 3QINA 3L2RA 5E26A 1VQ9N 4BC4A 4XH4A 4H03B 2D4WA 3THYB 1JL2A 4A57A 5AQGA 4FCYA 1FK9A 3MXMA 3IDHA 4DTUA 3BUZB 4HUFA 4RW8A 3C6HA 2P9UA 3QDKA 1ITGA 1VQ4N 4JKDA 1JLBA 1E4FT 3ZT4A 4F3OA 2AA4A 2YHWA 2ZGZA 4LF6K 1I94K 3K5MA 3GE1A 4FJ7A 3A5OC 4BREA 2JGUA 4CHPA 5BRHA 4BRAA 2P1JA 4YOYA 4N47A 4IFYA 2OA8A 3TWHA 3OYHA 3O6WA 2G8WA 3QETA 1LWFA 2OZMA 1K6YA 4PKIA 1S1UA 4JHDB 1HUXA 5FPDA 1YT3A 3KD5E 3K0SA 2ZM6K 1CZAN 4ICLA 3ZSZA 2NNWA 5LJWA 1WB9A 4I9QA 4JYAK 3PY8A 4LFBK 3L3VA 1VSKA 2GEMA 3KLGA 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 3K9J A;  4MDB A;  5CR4 A;  4U7B A;  4MDA A;  3HOT A;  3HOS A;  4R79 A;  3K9K A;  2F7T A;  3F2K A;  5HOO A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4N56 A;  1KVB A;  3W3D A;  2E2P A;  5FPN A;  3O9R A;  3GOI A;  2P9S B;  3F9M A;  4KTQ A;  4DTS A;  4JKG A;  4DR2 K;  3V9W A;  1ILY A;  3RTV A;  2HHS A;  4YY3 K;  1XUP O;  3NVK A;  2P9I A;  1W7A A;  3AVB A;  4Z4I A;  1KLN A;  4B9V A;  3C65 A;  4PUO A;  1YIT N;  5BRD A;  4NXM K;  4JLH A;  1J9A A;  2RF2 A;  1KSP A;  3OJS A;  2KHO A;  3GBT A;  4HTU A;  3H1Q A;  1GLA G;  2I7P A;  1IG9 A;  1BO5 O;  3DLE A;  3KK2 A;  2QA4 N;  3E9L A;  3CC2 N;  1QHA A;  4BR0 A;  4DSF A;  3ZX3 A;  4KTZ A;  5E84 A;  4DQR A;  1KFD A;  3WXM B;  2ITM A;  2W40 A;  4FM2 A;  5J2M A;  2PY5 A;  1QVF M;  4K43 A;  2P9L B;  2H3G X;  4H5R A;  1WUA A;  5ADX H;  5J2N A;  1FXX A;  3AGR A;  3SV3 A;  1BA1 A;  4PHT X;  1WAF A;  5BPM A;  2IDO A;  2G8F A;  1Q8I A;  3VQ9 A;  4DR6 K;  3PSF A;  4DV1 K;  5C2F A;  2VQE K;  3M8Q A;  3FZL A;  4G1Q A;  4B8C A;  3C6T A;  3C6A A;  3T19 A;  4EAH D;  2QK9 A;  4A62 A;  1QSS A;  3AO3 A;  4FM0 A;  3IRX A;  1NGA A;  4KH6 A;  4CBW A;  1VQN N;  2E88 A;  3M6G A;  1SAZ A;  1IKW A;  1X3N A;  1TKZ A;  5AQP A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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