3FLCO

Crystal structure of the his-tagged h232r mutant of glycerol kinase from enterococcus casseliflavus with glycerol
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
497
structure length
495
Chain Sequence
EKNYVMAIDQGTTSSRAIIFDRNGKKIGSSQKEFPQYFPKSGWVEHNANEIWNSVQSVIAGAFIESGIRPEAIAGIGITNQRETTVVWDKTTGQPIANAIVWQSRQSSPIADQLKVDGHTEMIHEKTGLVIDAYFSATKVRWLLDNIEGAQEKADNGELLFGTIDSWLVWKLTDGQVHVTDYSNASRTMLYNIHKLEWDQEILDLLNIPSSMLPEVKSNSEVYGHTRSYRFYGSEVPIAGMAGDQQAALFGQMAFEKGMIKNTYGTGAFIVMNTGEEPQLDNDLLTTIGYGINGKVYYALEGSIFVAGSAIQWLRDGLRMIETSPQSEELAAKAKGDNEVYVVPAFTGLGAYWDSEARGAVFGLTRGTTKEDFVRATLQAVAYQSKDVIDTMKKDSGIDIPLLKVDGGAAKNDLLMQFQADILDIDVQRAANLETTALGAAYLAGLAVGFWKDLDELKSMAEEGQMFTPEMPAEERDNLYEGWKQAVAATQTFKF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Glycerol kinase
publication title Structural Characterizations of Glycerol Kinase: Unraveling Phosphorylation-Induced Long-Range Activation
pubmed doi rcsb
source organism Enterococcus casseliflavus
total genus 184
structure length 495
sequence length 497
chains with identical sequence X
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2008-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3flcO02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3flcO01
3OHRA 3AY9A 4FWRA 5KQ8A 2P9NB 1EQYA 1TUUA 5KPRA 4NO7A 4EHTA 4BR7A 3SK3A 3D2FB 2Q36A 2NRHA 5AQJA 1C0GA 4EHUA 4AM7A 1QQMA 4A2AA 2E20A 5KQDA 4WQ4C 3MN6A 2E88A 3CJ9A 3CQXA 4BREA 3AAPA 2UYTA 1NGJA 1H1VA 1QQOA 4FPBA 4BRAA 3CI5A 3DXMB 5EOYA 3WXJA 3A5MC 5AQKA 1SZ2A 3CJBA 4BG8A 4GY2B 2GTDA 3VOVA 4B1WB 2CGKA 4Y0WA 5AQHA 5LY3A 4IWVA 5FPNA 3VERA 2HMPA 3A8YA 4H0TB 5FPMA 1YAGA 1NGFA 3EZWA 3M6GA 1NGAA 2GWJA 4CZMA 2P9SA 3BF3A 4BGBA 4WQ5A 3VF2A 2J4RA 2GUPA 2OANA 2QWPA 3ZX2A 4RTFD 4BVPA 3H6EA 4PL8A 4BR5A 5F0XA 1R59O 1T6DA 3P4IA 3VEXA 2IVPA 2DPNA 1NGHA 4DCHA 1YXQA 3C0BA 1NLVA 4LC9B 3CJCA 1NM1A 3LM2A 3O5BA 4YDUA 2VWBA 2KHOA 1GLEG 5AQIA 3C7NA 4BR9A 3WUHA 4EFHA 1Z05A 4JAXA 3MN5A 2QM1A 5AQOA 4CZFA 4BR2A 2A3ZA 2D0OA 2ITMA 1X3MA 2AA4A 4O8KA 4BRHA 4IO8A 4ISGA 1JCFA 2P9LA 3B8AX 3ZX0A 4PL7A 4H5VA 3GL1A 4FOEA 3ULEB 4BRMA 3GDQA 3R9PA 1ESVA 3WT0A 1TYQA 2A6AA 4H0YB 3UE5A 5BRDA 1K8KA 1KAYA 5AZJA 4B1VA 4RWTA 1GLJO 4CZKA 2E2QA 2P9IA 2Q0RA 1SAZA 3KZBA 3QFUA 3UKRA 1LCUA 5I9EB 4BR0A 2HF3A 3H1VX 3IUCA 4K42A 1X9JA 3LL3A 3H45C 2QW9A 4EAHD 2YCHA 5ADXH 4A2BA 4I6MA 3LDOA 5B8HA 4CZEA 3QMLA 4M7YA 2FXUA 3FE1A 4Z94A 1Q18A 1XC3A 3GE1A 1HLUA 1MWKA 3IFRA 3O1WA 4H5TA 3WQUA 3ENHA 1HKBA 4BQLA 4E1JA 5JLFA 3MN7A 2ASOA 2P9UA 3LM9A 4MLHA 3O08A 4BRQA 3R8EA 1ZC6A 4IJNA 3WEEB 4FSVA 3UB5A 4CZHA 2P9PB 4DQ8A 4JD2A 4XEIA 2FF3B 3FZFA 4CJ7A 1QZ6A 3RSEB 4MO4A 4FPAA 3D2EB 1NWKA 3SLCA 2W40A 3ID8A 4JNEA 4KBOA 5KPZA 5AZIB 3ZEUB 1KXPA 3HM8A 1JCEA 3GOIA 4FWLA 5FPDA 3I33A 4H0OA 5AQSA 4YDUC 5AFUH 3FGUA 1WUAA 4JN4A 3DWLA 5AQPA 1MA9B 4QS8A 1NGGA 2PAVA 4BRPA 4BRKA 1U2VB 3HI0A 3MDQA 5BN9A 2CGLA 2HF4A 1RFQA 1IJJA 3SJHA 2Q0UA 4FL9A 5BRHA 2WUSA 3ZETB 1DEJA 4MLEA 3MK6A 2YJFA 3EO3A 1GLBG 2FLOA 3EN9A 3EKSA 3DJCA 4H0PA 1C0FA 4O5FA 1ATNA 3HZ6A 5EXWA 3FZKA 4FWSA 1HKCA 4H03B 5FPEA 3ATVA 3LDLA 4HTLA 1V4TA 2CH5A 1WOQA 3W0LA 4CI6A 3KHYA 3VEWA 5AQFA 1XUPO 1OKJA 2AP1A 1RGIA 5AQYA 3VEZA 4PKIA 3A5OC 2E2NA 2W41A 4BROA 4H0XB 1KAXA 5EY4A 3VEOA 3HBTA 3U4LA 1P8ZA 3WXLA 1MDUB 5ELZA 1BA1A 5F2RA 3ATUA 3M3ZA 2ZGYA 4XH1A 2P9SB 3VENA 1T6CA 1NBWA 3DXKA 2FSJA 3IDHA 3CQYA 3VPZA 4CD3A 1LOTB 1V4SA 2GEMA 3CJ7A 3O8MA 4NB4A 3GBTA 2YHXA 4BRIA 3U9DA 4EIAA 5BPMA 3L6QA 3VEYA 1YUWA 2ZF5O 1NGBA 2A41A 3HTVA 5AQTA 5E84A 3VGLA 2V7ZA 3BUZB 2YJEA 4FWPA 2YHWA 1BUPA 3C7NB 1Y64A 3VF4A 4J8FA 4BRGA 3EKUA 4CBWA 4B1YB 4BRDA 1NGCA 2IVNA 2QWQA 4DHYA 2QXLA 1NGIA 2ZWHA 4PKGA 2D0PA 2VCPA 2P9LB 2CH6A 4IZ9A 4CZGA 1G99A 4FWMA 2V52B 3WXKA 5AQZA 4ISEA 3SMSA 5AR0A 1TYQB 5AQQA 3FZMA 2QWNA 5AQXA 5AQNA 3BEXA 5JICA 2P9IB 3UKUB 2Q1NA 2P9KB 4CZJA 3JS6A 1BO5O 1D4XA 3LDPA 2E2OA 3FFKB 4M7XA 4BR4A 3QDKA 1YVNA 1GLFO 2Q31A 4H5WA 5BPNA 4I6MB 1ZXOA 4IXCA 3VESA 4AM6A 2NLXA 4BGAA 4BVOA 2F9TA 1DGKN 4B1ZA 2E1YA 3H46O 4A62A 2FF6A 2H3GX 2VYPA 1NGDA 1QZ5A 4WQ5C 3BF1A 4B9QA 3VGMA 5BRFA 3QICA 3A5NC 4DB3A 2P9PA 2P9UB 3DAWA 3O4WA 3F9MA 4C23A 5BR9A 1CZAN 3H3OB 3L4IA 3IMXA 4JHDB 4ISFA 1J6ZA 1GLAG 2EWSA 2P9NA 5BREA 3S41A 4XH4A 2E2PA 1ATSA 4JD2B 3TU5A 3WQTA 1HUXA 3ZEUA 3D2FA 4FWOA 3VETA 2CGJA 2F9WA 4WYBA 5EX5A 1U2VA 3O1BA 1HJOA 1DKGD 3H3NO 2GELA 3AAQA 3ZX3A 5EVZA 3VGKA 4BC4A 5LJWA 4CZLA 1ATRA 3O80A 3DXMA 2QWMA 3M1FA 3ZETA 4B1XB 1Z6RA 3J8AA 3MN9A 2Q97A 5BPLA 5BN8A 4H5NA 3TPQA 2D1KA 2PBDA 3QBXA 4BRNA 1BWFO 4BC2A 1SQKA 4BC5A 4FWKA 2A40A 1HKGA 3VF6A 2V7YA 4CBUA 5AQRA 3HSCA 3QB0A 2A5XA 1ZBSA 2E1ZA 3VEVA 3R6MA 4IJAA 2QWOA 4CZIA 5ADXA 1BA0A 1HX1A 1BOTO 1IG8A 3CETA 5AQLA 1E4GT 2ASMA 4CD1A 3WXIA 2I7PA 4BRLA 2IVOA 2V51B 4FWNA 5AQUA 3U9ZA 3AARA 4QS7A 3G25A 2NZTA 3FZHA 3ENOA 4HWIA 4H0VB 1T44A 2HOEA 3DXKB 3W3DA 1NMDA 2D4WA 3A0IX 2E8AA 1TUYA 1U6ZA 4H5RA 2IIRA 3ULEA 4MO5A 3H1QA 4M63C 4BQZA 4WQ4A 4A61A 1JCGA 5JLHA 5KPTA 4F9OA 3A5LC 4BRCA 3CERA 3CHWA 3O6WA 4PKHA 3QFPA 1QHAA 1MWMA 4FOIA 5E26A 5AQMA 3GG4A 3MMVA 5AFUA 3BP8A 4GNIA 1K8KB 5AZJB 2QWLA 4B1UB 1GLCG 3FZLA 3QBWA 4BG9A 5LJVA 3LDQA 3UKRB 5AQWA 1NGEA 4BC3A 4CBXA 5JMVA 1X3NA 3UKUA 3EL2A 2P9KA 3LDNA 2QWRA 2YI1A 1E4FT 4XH5A 1GLDG 4BRFA 3CJAA 3FR0A 5TKYA 3KVGA 3CJ1A 3I8BA 5F1XA 4K25A 1RDWX 3U8XA 4FO0A 2BTFA 3WEEA 3L0QA 5CE3A 4K43A 4QS9A 3SMPA 1BDGA 4L3QA 1S22A 3JXUA 4K41A 3RSEA 2ASPA 3CIPA 3D2EA 4RCHA 2FSKA 3FLCO 2ZGZA 1KAZA 5AQVA 4FWQA 3D7EO 4JHDA 1BG3A 1S3XA 5AZIA 1GLLO 1XQSC 2GWKA 2I7NA 2Q2RA 1HPMA 1QQNA 2A42A 2BUPA 2FSNA 1BU6O 3MCPA 5AQGA 2YHYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XWLA 3HP6A 3I56N 4FWRA 5KQ8A 3V1RA 3I0SA 3TAQA 2G8KA 2Q36A 4EHUA 1QQMA 4A2AA 2BE2A 1QE1A 3AVHA 3O4QA 3THYA 1NOYA 1X1PA 4OVLA 4JI2K 2W6KA 5FROA 1VQMN 1EWRA 4FPBA 1WN7A 2OTJN 3T3FA 3OS1A 2W6LA 1LWEA 4E7JA 3CCVN 4M41A 3DLGA 3OVNA 4CHZA 5J1EA 1S1VA 2NRRA 3RTVA 3M8PA 1RBUA 4H0TB 3L2RA 1NGFA 2KFNA 3M6GA 2GWJA 4DTMA 1R0AA 4FLZA 5C0YA 4LD0A 4A5AA 2J4RA 4BVPA 2HNZA 3H6EA 4YORA 1BQNA 1OVQA 2HHVA 1R59O 1T6DA 2Z1HA 1RT5A 3VEXA 2HVHA 2DPNA 3OYDA 5KRSA 4CEDA 3AVLA 3ZSZA 4J2DA 3C0BA 4LC9B 2O8FB 3J7ZO 2HVIA 4DLGA 4O5BA 4BR9A 2G8HA 3O3GA 1OH8A 1VQNN 4CFAA 2F96A 3QESA 2YKMA 1X3MA 2AA4A 3OA9A 4BRHA 4IO8A 4YOXA 3MXMA 1JCFA 4DTJA 1HYZA 3TANA 4H5VA 2AJQA 4ICLA 4F8RA 4BRMA 4F3OA 3ZT2A 3UE5A 3AA2A 1K8KA 3J7AP 2JWLA 4RWTA 5HRRA 3VQPA 4CZKA 3DLKA 1EXQA 2YKNA 5FRMA 4YOVA 4HCBA 1NOZA 3LAKA 2P5OA 4EAHD 2QW9A 5C12A 2PYLA 1HNWK 1ZBIA 5ADXH 1VQPN 3LDOA 4BE1A 4ELUA 2WONA 1X9MA 1G15A 4DSJA 2FXUA 3FE1A 4FW2A 3CPEA 1Q18A 3K5NA 3QEIA 4E19A 3HM9A 3O1WA 4JKGA 1RBTA 4O0JA 4NYFA 4OLAA 3ENHA 4E1JA 3AGRA 4DTXA 4MLHA 3ENBA 3VA3A 3R8EA 1ZC6A 4IJNA 3V4IA 4J2EA 3WEEB 4KH6A 3ZSRA 4A59A 4JKDA 1WSGA 2P9PB 1F21A 3ZSYA 3SBGA 4XEIA 1OH7A 2FF3B 2FBXA 4I2PA 1QZ6A 3RSEB 4CJ7A 3L2UA 4MO4A 3THXA 3D2EB 3SLCA 5GAHP 1VSHA 3D0PA 3TAPA 2W40A 1RTJA 3HO1A 4B9SA 2O8BA 5KPZA 4DTNA 4DV6K 4CHYA 5AZIB 3ZEUB 1ZBLA 1JCEA 1D9DA 3I33A 4H0OA 4KTQA 1Q7YO 4JN4A 3DWLA 4BRPA 1NGGA 4DQIA 4BRKA 1U2VB 3MWPA 2Z1GA 2CGLA 1T03A 1BI4B 4CF1A 3HOTA 3T1YK 2VWJA 3LPUA 1RT2A 4DG1A 1WLJA 2HHSA 4MFBA 1XNQK 4MLEA 1VAZA 2YJFA 3EO3A 2HHQA 2FLOA 3EN9A 5C2FA 3EKSA 3DJCA 4FCYA 4KHQA 4LFBK 1S9EA 3PX0A 3VQ8A 3NGIA 3ATVA 5HBMA 4C8LA 4E0DA 3CD6N 3S3OA 4U7BA 4QCLA 4DSIA 4CGIA 3PV8A 1OKJA 3JYTA 4JKAA 2HNDA 3QEVA 3TAGA 3VEZA 1KVAA 4PHTX 3AV9A 3MX2A 4PKIA 2UXCK 3F9KA 1VSJA 3HBTA 1KVBA 3VQ5A 3WXLA 4JRPA 1BA1A 1RTIA 3BZKA 5M1NA 3ATUA 3G0ZA 2ZGYA 3VENA 1T6CA 1BGXT 2FBTA 3DXKA 3CQYA 4FW1A 3A2FA 4LSLA 1LOTB 1V4SA 3O8MA 3GBTA 3L6QA 1YUWA 3H08A 2A41A 5AQTA 3KJVA 3RWUA 1VHXA 3BUZB 4FJNA 4FWPA 2YHWA 1BUPA 3C7NB 3ZSWA 1ASVA 1A5VA 3VF4A 4DFMA 4J8FA 2NRXA 3HP9A 4FK0A 4B9MA 2HBKA 1XMOK 1L3UA 4DR4K 4MDAA 1NGIA 2ZWHA 4KH5A 4PKGA 2D0PA 4NCGA 2VCPA 4CZGA 1WSIA 1NU0A 5CYMA 1G99A 4FWMA 4M3RA 3CCLN 2IOCA 5AR0A 3FZMA 5AQXA 4FJ5A 4FK2A 4O44A 3K2PA 5CHIA 3HRGA 2X78A 2KZZA 1VK0A 3G6EN 1TVRA 4CJFA 3OW2M 4H5WA 1A5XA 4IOXA 4ELVA 5GADP 1ZXOA 4HHTA 4B1ZA 2NRZA 4WFBL 1NGDA 3BF1A 4B9QA 5TKWA 4FLVA 3R1XA 4DB3A 5KI6A 5M1PA 4N47A 1CZAN 1WSJA 3DLEA 4KAZA 4JHDB 3AVNA 4BDYA 2EWSA 3O3FA 5BREA 3LDSA 2E4LA 4JD2B 3TU5A 1HUXA 3V9UA 3N4QA 2Y1IA 3LZIA 1S1WA 3CG7A 3VETA 4GV3A 5M1KA 3NH0A 2G8FA 1YF5L 4YOYA 5C24A 3H3NO 3M8RA 1S5JA 2JGUA 2KQ2A 5LJWA 3SQ2A 3OS2A 4A5BA 4AHTA 3ZT0A 5FLXO 1N34K 1Z6RA 4FM1A 2Q97A 5BPLA 5BN8A 3I8DA 3L2VA 4RW6A 5C10A 4WE1A 2PBDA 3QBXA 4PA1A 3KLEA 5HOOA 3U3GA 5I42A 1BWFO 4MDBA 4CHPA 1SL0A 2A40A 3KLFA 3AA3A 3Q7CA 3HSCA 3U6FA 3SZ2A 4CJWA 3CF5L 3VEVA 3HJFA 4CCHA 3PIOL 2UU9K 4NXNK 4CZIA 1FK9A 2ZM6K 1VSDA 1HX1A 3E9OA 4CD1A 1LAVA 1NMNA 4BRLA 5FRNA 4FWNA 4AHCA 3U9ZA 4BWJA 3FZHA 2OZMA 4H0VB 3W3DA 1NMDA 2E6MA 3RRHA 3D6RA 1TUYA 1TL3A 1U6ZA 4H5RA 3ULEA 4BQZA 1YVUA 4M63C 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2O8D B;  4CFD A;  4I6M B;  2HMI A;  4AM6 A;  1KTQ A;  4AHR A;  4BGA A;  5IWA K;  3S3N A;  3H46 O;  3CPW M;  4I9L A;  2VYP A;  4DR7 K;  3ZSQ A;  3VGM A;  4UY8 O;  3QIC A;  1Q8I A;  3O4W A;  3I0R A;  3F2K A;  3P39 A;  5BR9 A;  4CK3 A;  1SL1 A;  4CJ5 A;  3NGZ A;  3AVF A;  1NKE A;  1J6Z A;  1GLA G;  2P9N A;  3S41 A;  4GKK K;  4Y1C A;  4XH4 A;  2WFB A;  5M1Q A;  3V9S A;  1NJW A;  5C15 A;  2CGJ A;  3LPT A;  3OYJ A;  2F9W A;  3AGK A;  4N41 A;  1TV6 A;  4FZX C;  2GEL A;  2BGG A;  1T8E A;  4CZL A;  1ATR A;  5HRP A;  3O80 A;  2BH1 A;  4L8R B;  4CJE A;  3M1F A;  3ZET A;  5DM6 L;  1YIT N;  3J8A A;  4CK2 A;  4IDK A;  4B3T K;  3SV4 A;  1CZ9 A;  4FLW A;  3K59 A;  2XRI A;  1LWC A;  1RDC A;  1LW2 A;  4C8N A;  1SQK A;  4BC5 A;  3QO9 A;  4E89 A;  1HNV A;  3MCA B;  2E5L K;  4DU4 A;  3DRP A;  1FW6 A;  4G1Q A;  1ZBS A;  4X64 K;  2YNI A;  1S1T A;  1JL2 A;  3P31 A;  1VQL N;  1C6V A;  4NLC A;  3HOS A;  2IGI A;  5AQL A;  1NJY A;  2ASM A;  2I7P A;  2QTD A;  2V51 B;  5AQU A;  5C42 A;  3OYM A;  3OJS A;  1QTM A;  3G25 A;  3ENO A;  3N4P A;  2HOE A;  3FFI A;  3A0I X;  3OYN A;  2YHA A;  4NCA A;  5JLH A;  4MO5 A;  1NK9 A;  4KKO A;  1SS6 A;  1JCG A;  3K0S A;  5KPT A;  2UUB K;  3A5L C;  1IBL K;  2OPP A;  1ASU A;  1OH6 A;  4KI6 A;  4E3S A;  3K5O A;  3P5J A;  2RE2 A;  4DS5 A;  3MMV A;  4BDZ A;  3CCE N;  4DUY K;  4B9U A;  5AZJ B;  2QWL A;  4KTZ A;  4FZY A;  2UXD K;  3CYM A;  1GLC G;  5LJV A;  3UKR B;  4FYD A;  5J2P A;  5AQW A;  1NGE A;  3UKU A;  1GOA A;  3EL2 A;  3VQ4 A;  3LDN A;  1WB9 A;  2QWR A;  4OPK A;  3AA4 A;  4GVE A;  3ZSX A;  2VG5 A;  4JI6 K;  3SPZ A;  3CJ1 A;  3ZT1 A;  3ZLJ A;  3I8B A;  4K25 A;  4DF8 A;  2BTF A;  1TL1 A;  3O3H A;  2XY5 A;  4CEA A;  1FKO A;  3SMP A;  1HQE A;  1BDG A;  1S22 A;  2IAJ A;  3KK2 A;  2ASP A;  3CME N;  3KWG A;  1VQO N;  1JLF A;  3T7Z A;  3L2W A;  1Q81 O;  1IG9 A;  1KAZ A;  4FWQ A;  3D7E O;  4DMN A;  1S3X A;  4DV3 K;  2Q2R A;  5AQG A;  4FJM A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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