3FLCO

Crystal structure of the his-tagged h232r mutant of glycerol kinase from enterococcus casseliflavus with glycerol
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
497
structure length
495
Chain Sequence
EKNYVMAIDQGTTSSRAIIFDRNGKKIGSSQKEFPQYFPKSGWVEHNANEIWNSVQSVIAGAFIESGIRPEAIAGIGITNQRETTVVWDKTTGQPIANAIVWQSRQSSPIADQLKVDGHTEMIHEKTGLVIDAYFSATKVRWLLDNIEGAQEKADNGELLFGTIDSWLVWKLTDGQVHVTDYSNASRTMLYNIHKLEWDQEILDLLNIPSSMLPEVKSNSEVYGHTRSYRFYGSEVPIAGMAGDQQAALFGQMAFEKGMIKNTYGTGAFIVMNTGEEPQLDNDLLTTIGYGINGKVYYALEGSIFVAGSAIQWLRDGLRMIETSPQSEELAAKAKGDNEVYVVPAFTGLGAYWDSEARGAVFGLTRGTTKEDFVRATLQAVAYQSKDVIDTMKKDSGIDIPLLKVDGGAAKNDLLMQFQADILDIDVQRAANLETTALGAAYLAGLAVGFWKDLDELKSMAEEGQMFTPEMPAEERDNLYEGWKQAVAATQTFKF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glycerol kinase
publication title Structural Characterizations of Glycerol Kinase: Unraveling Phosphorylation-Induced Long-Range Activation
pubmed doi rcsb
source organism Enterococcus casseliflavus
molecule tags Transferase
total genus 184
structure length 495
sequence length 497
chains with identical sequence X
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2008-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3flcO02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3flcO01
3D7EO 1GLAG 1HKGA 1E4FT 5ADXH 1QHAA 4JD2A 1MWKA 2HOEA 2UYTA 1HPMA 2QWNA 2A40A 3KZBA 4BGBA 1T6DA 4JNEA 4B1UB 3HI0A 2E88A 3VOVA 4K41A 2WUSA 3UKUB 3AAQA 3LDPA 3BUZB 4IXCA 4YDUC 4EHTA 4CBWA 3AARA 4H0PA 5TKYA 2P9SB 1HJOA 5KPZA 3ZETA 3SMSA 5JLFA 2ITMA 2EWSA 4CZLA 3FZLA 5EOYA 4YDUA 4H0VB 5F2RA 5EX5A 4FWSA 4B1ZA 4BRLA 3H45C 3VPZA 2PAVA 3C7NB 5BPNA 3TU5A 5BPMA 3CQYA 1P8ZA 3H1QA 5AQMA 1NGIA 3FLCO 4BC5A 2V7ZA 1NGGA 3EO3A 3CIPA 5FPEA 2CGKA 4H0YB 1MWMA 1SQKA 1T6CA 4FSVA 4BRKA 1LCUA 4EIAA 2A41A 3G25A 2E1ZA 2GTDA 3AY9A 3JXUA 1TUYA 2YHXA 2CGLA 3ENOA 1C0GA 1KAYA 2IVPA 3SJHA 1DGKN 2VCPA 1HX1A 3LL3A 2A6AA 3RSEA 1BDGA 4BRCA 3M3ZA 3ZX3A 3WXLA 5JICA 4XH5A 3MN9A 1GLFO 4F9OA 4H5TA 3SMPA 2A3ZA 3ULEA 3I33A 5AQHA 5AFUA 1NGDA 4I6MA 5AQJA 4H5NA 5AQOA 3VF6A 1XQSC 3M1FA 3LDNA 5AQSA 2QWOA 4FWOA 1YXQA 3D2EB 1R59O 3FR0A 5EY4A 3BP8A 3H6EA 1ATSA 3CETA 1NM1A 5FPNA 4ISFA 1GLJO 2Q0UA 3FE1A 3UB5A 3AAPA 3IFRA 5AZJB 3LM2A 1LOTB 4FWRA 2P9IB 4H5WA 3UKRB 3A8YA 2E2QA 3EZWA 4FPBA 3M6GA 3ATUA 2YI1A 1QQMA 5BRFA 1QZ5A 3H3NO 5LY3A 1KAZA 4BR9A 2P9KA 3VERA 5BN8A 2P9PB 4IO8A 4BRIA 2QM1A 3A5NC 2Q97A 4M7XA 4DQ8A 1ZBSA 4BRAA 4GY2B 4BVPA 5AFUH 1CZAN 1OKJA 3EKSA 3U4LA 3A0IX 4DHYA 1GLDG 2GEMA 3WT0A 3DXMB 4NO7A 4WYBA 4BQZA 4CZKA 5EVZA 4BRGA 5KQDA 2P9UA 2GELA 3CJ1A 1NMDA 3C0BA 2FXUA 1GLBG 1K8KB 2FSJA 4PKHA 4JN4A 1QQNA 3DXKB 1GLCG 1YAGA 3IDHA 1U2VA 1BOTO 1RFQA 5ELZA 4PKIA 1E4GT 5JLHA 2CH5A 3BF1A 4A2AA 3D2FB 3VETA 4CZIA 3WXJA 3QBWA 4H0XB 1RDWX 3LDQA 2D1KA 4BC3A 3ZEUB 4CJ7A 4BREA 3R8EA 4DCHA 4QS9A 3WEEA 3QFUA 5EXWA 1BUPA 1ESVA 2QWMA 3HSCA 4JHDA 1ZXOA 4J8FA 3FZHA 4FWPA 4CBXA 4M63C 1JCFA 5KPRA 2ZGYA 1X3NA 4RTFD 3ENHA 3QDKA 2P9NA 3GE1A 4PL8A 4C23A 5AQPA 3VEVA 3H1VX 3VGLA 3MN7A 4HTLA 2ZGZA 3U9ZA 4FPAA 1D4XA 4B1XB 2YCHA 4XH1A 4B1WB 4AM7A 5B8HA 2A42A 5AQUA 1SZ2A 4K25A 3F9MA 3WXIA 1DKGD 4FWLA 3FFKB 1Y64A 3WQTA 2BTFA 2P9LA 3D2EA 1HKBA 2I7NA 1C0FA 3MK6A 2D0OA 5AQRA 1ATRA 1TYQA 4JD2B 2VYPA 4QS7A 4BRDA 3O4WA 3EKUA 5I9EB 3CI5A 2QWLA 3ATVA 2ASPA 3UKRA 1G99A 2BUPA 4BRFA 3WQUA 4BR4A 4NB4A 1NGCA 2H3GX 2GWKA 1NGFA 3CJBA 3MMVA 1NGAA 1Z6RA 2ASOA 3IUCA 1NGEA 3ZETB 2OANA 5AZIA 1NGJA 3VEZA 1H1VA 3W3DA 5LJWA 5LJVA 1NGBA 4IZ9A 3QMLA 1NLVA 1Z05A 4DB3A 3WUHA 3O1BA 2E1YA 5AQYA 3GG4A 4L3QA 3W0LA 4BC2A 3VGKA 3HM8A 1X9JA 3S41A 2V52B 1NGHA 1ZC6A 1BA1A 4FWKA 5AQVA 3A5LC 1KAXA 3LDLA 4PKGA 4HWIA 3UE5A 3L6QA 1WUAA 4XEIA 1J6ZA 2E2NA 2HMPA 3QICA 4RWTA 5E26A 4CZFA 3FZFA 2QXLA 5FPDA 3RSEB 3EN9A 3H3OB 2Q1NA 1XUPO 4FOIA 1NWKA 2D0PA 4GNIA 4K43A 3VEXA 2FSKA 1MA9B 3MDQA 3UKUA 5BPLA 3CJAA 5KQ8A 4B9QA 5F0XA 4AM6A 3H46O 3GL1A 3HTVA 2P9SA 2V51B 3ULEB 5BRHA 3VGMA 3DWLA 2NRHA 2YJEA 4KBOA 1T44A 3FZMA 3P4IA 1MDUB 4BG8A 2NLXA 3B8AX 3IMXA 4ISGA 3O80A 5CE3A 2Q31A 4CZHA 3FZKA 2V7YA 2CH6A 3C7NA 3WXKA 3O5BA 4K42A 3MCPA 3MN5A 1IJJA 2E2OA 2GUPA 1YVNA 2YHWA 3CHWA 4QS8A 1KXPA 4O5FA 3LM9A 3A5MC 4B1YB 1ATNA 1U6ZA 3BEXA 2P9KB 1S22A 4H03B 1V4TA 2HF3A 2F9TA 3O1WA 4MO5A 1GLEG 1JCEA 2ZF5O 2YJFA 3QB0A 2ASMA 5AQWA 1QQOA 2GWJA 2FSNA 2W40A 2YHYA 1BU6O 4ISEA 2F9WA 2NZTA 2QWQA 3I8BA 4EAHD 4CD3A 3VENA 2P9UB 2VWBA 4BRHA 4EFHA 1SAZA 3VEOA 2E8AA 2W41A 2QWPA 5AQGA 1WOQA 2IVNA 1U2VB 4A2BA 2CGJA 3JS6A 3A5OC 1DEJA 3U9DA 5JMVA 2Q0RA 2IVOA 4JAXA 1HUXA 1X3MA 3O6WA 5AZJA 2E2PA 4CD1A 4CZMA 5AQZA 4BRQA 2P9IA 4FOEA 4H5RA 3VEYA 5AQQA 2IIRA 4CI6A 4H0OA 4BG9A 3SK3A 3WEEB 3MN6A 3LDOA 3VEWA 5KPTA 4JHDB 3VESA 3CJCA 4H5VA 5AQKA 4BROA 4O8KA 3FGUA 3ID8A 1QZ6A 1NBWA 2A5XA 2P9PA 2Q36A 4IJNA 4BR2A 2I7PA 3CJ7A 5AQIA 3SLCA 3CERA 5FPMA 4A61A 4BVOA 4CZJA 1JCGA 3O08A 4BC4A 3BF3A 3GDQA 1TUUA 2P9NB 4EHUA 4FL9A 1XC3A 3GOIA 4BGAA 4BRMA 3QFPA 4BRPA 3DXMA 1BWFO 1YUWA 5AR0A 4CBUA 2QWRA 1K8KA 5AQLA 1BA0A 3DXKA 4H0TB 5BN9A 2QW9A 3ZX2A 3TPQA 2ZWHA 2P9LB 1HLUA 3O8MA 4RCHA 3R6MA 2KHOA 4LC9B 2PBDA 1BO5O 3D2FA 1TYQB 2FF6A 3HZ6A 1IG8A 3R9PA 1S3XA 3GBTA 4Z94A 1V4SA 2AA4A 3EL2A 1EQYA 3ZEUA 4A62A 4FWNA 4MLHA 2J4RA 3OHRA 4FWQA 3VF4A 4WQ4C 3CJ9A 4BR0A 1RGIA 3KHYA 3VF2A 5BR9A 4WQ5C 5ADXA 2DPNA 2HF4A 5AQNA 3L0QA 3U8XA 1BG3A 2FF3B 3CQXA 4I6MB 1GLLO 5AZIB 4CZGA 5F1XA 5BREA 4BR7A 4MO4A 4FO0A 4WQ4A 4XH4A 4IJAA 3KVGA 4FWMA 4MLEA 5AQTA 5E84A 4BQLA 4WQ5A 4Y0WA 2E20A 4E1JA 5BRDA 2Q2RA 1HKCA 2AP1A 4BR5A 4M7YA 5AQXA 4CZEA 3DJCA 3DAWA 3QBXA 2D4WA 3J8AA 4BRNA 4B1VA 4IWVA 5AQFA 1Q18A 3ZX0A 3HBTA 4PL7A 2FLOA 3L4IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4TSXA 1GLAG 1NJIO 1HKGA 3D45A 4E1NA 2UYTA 2QWNA 3ITHA 4JNEA 1RT7A 3OYIA 4B1UB 2OPPA 3HI0A 4M3UA 3AAQA 4LFBK 3CC7N 4KHQA 4EHTA 4H0PA 3HPGA 5HL7L 5KPZA 5JLFA 3O3FA 5M1QA 4YDUA 4H0VB 5F2RA 1VSJA 4Z4FA 3SV4A 1VQKN 1FW6A 3DOKA 2RF2A 3KWIA 3MEEA 3NE6A 2PAVA 4M41A 5BPNA 4B3SK 3FLCO 4O4GA 1NGGA 5FPEA 4DLEA 1VQLN 4H0YB 1SQKA 3F9KA 4FSVA 3OBYA 1LCUA 4EIAA 2G8KA 4KFBA 4KHWA 2HB5A 2GTDA 3AO4A 3VQDA 3G4SN 1TUYA 2CGLA 3MXJA 3EZ5A 1A5WA 2VCPA 1CLQA 3I0SA 2WBNA 3RSEA 1BQMA 1WSIA 3P5JA 4CHOA 4XH5A 4HUEA 4H5TA 4DV3K 4CGDA 3OYAA 4KHUA 3ULEA 3O9UA 3BDPA 3V1QA 4DSIA 1HR0K 4DSLA 2AJQA 4DSFA 1S1XA 4WFAL 1R59O 1ITGA 4HUGA 4MFBA 3BP8A 3H6EA 3CPEA 4B9NA 1NM1A 3UB5A 2IOCA 5DM7L 1VSLA 4HUFA 3LM2A 2DTUA 4H5WA 3DLKA 3D6RA 1M90O 1WLJA 1T7PA 3U3GA 4B8AB 3HOSA 3ATUA 4MDAA 1QQMA 1TK0A 5BRFA 1Q81O 3VQCA 4YOUA 1J53A 1TKTA 2ZD1A 1XMQK 4MDBA 2P9PB 4IO8A 4CHYA 3AA2A 5HROA 1SL2A 4OJRA 1YIJN 1CZAN 1SKWA 3U4LA 4JRPA 4CHPA 3HP6A 3DXMB 3OYHA 4BRGA 4B9SA 3R3LA 2W6LA 4JI2K 1XHXA 5C10A 1QQNA 4OPJA 3CD6N 3IDHA 1U48A 5ELZA 2HBLA 2CH5A 3BF1A 3D2FB 3EE9A 3QBWA 1IG9A 4DSJA 3ZEUB 2O4IA 4DCHA 3K57A 3WEEA 1HYSA 1TL1A 4DS4A 3HSCA 4FLXA 3THXB 1ZXOA 1CZ9A 1NKCA 3AVKA 4LSNA 1BI4B 1C1CA 2HNZA 3E1YA 3OS2A 4YOYA 4ILHA 1QS4A 4M63C 5FLXO 3TANA 1JCFA 2ZGYA 4M3TA 1X3NA 1XNQK 1WAJA 3NDKA 5C0YA 4O44A 2P9NA 3GE1A 2OZSA 3NAEA 3MN7A 4HTLA 4KI6A 2ZGZA 3S3NA 3AVMA 2KFZA 4FK4A 4AM7A 1XC9A 4BY9C 1RTJA 1SZ2A 3WXIA 3CC2N 3FFKB 3WQTA 2KKZA 5HRPA 2P9LA 2X74A 4J2AA 1HKBA 2I7NA 1L3TA 4FJ9A 1O1WA 2KQ2A 1JLFA 1RDUA 2XY6A 2VYPA 3O4WA 1OVYA 3EKUA 5A2QO 2QWLA 2KZMA 4DTJA 4DU1A 4B9TA 2EHGA 2BUPA 2KLAA 3G10A 4DTSA 3ZSWA 5D3GA 1VQON 2ZJQL 2PZSA 5TKWA 4HHTA 1X9WA 3AA3A 3NF8A 3CJBA 1NGAA 3CCSN 1NGEA 3T3FA 2HHWA 3VEZA 1QQCA 2HHQA 2ZJPL 4GW6A 4CFDA 4WCEL 3K59A 5LJVA 1NGBA 4IZ9A 4EP5A 3L2VA 1SL0A 1NMNA 3CM5A 1Z05A 1HPZA 3O1BA 4AHSA 3KK2A 2E1YA 3V9SA 3J7AP 1KTQA 3OYLA 3DLGA 5AQYA 1BGXT 3E9LA 4OPKA 3W0LA 4F4KA 3C6HA 1JXEA 3S41A 3ZCMA 2PYJA 2V52B 1NGHA 1BA1A 3VQQA 3LP3A 1YI2N 1KAXA 3LDLA 1VSIA 4PKGA 4LFAK 1KC8O 4XEIA 4Q5VA 1YT3A 3SZ2A 1YJ9N 5E26A 4CZFA 4AQYK 2QXLA 5M1OA 3VEXA 4LF6K 1NWKA 1MA9B 3MDQA 2ZE2A 5BPLA 5KQ8A 5F0XA 3OJUA 2W6KA 1EKEA 5CYMA 3L2WA 3GL1A 1ZYQA 2P9SA 2FBTA 1GOAA 4PA1A 1UWBA 4YHHK 3IS9A 4KBOA 5IT9O 2A1RA 3HVRA 3EYZA 3FZMA 1MDUB 4BG8A 4OO1J 4CZHA 1VQ6N 3QLHA 2V7YA 4CEZA 2PYLA 5GIPA 3WXKA 4X64K 3O5BA 4LF9K 2E2OA 4NYFA 4CJWA 3K0SA 1YJNN 1R0AA 4NXNK 2GUPA 3OYDA 3SAFA 2VWJA 1HQUA 4E7JA 3FFIA 1KXPA 1JLEA 4O5FA 4QS8A 1ATNA 3ALYA 5CR4A 4H03B 2F9TA 4N5SA 3QERA 4PY5A 4CJTA 4Z4GA 2ASMA 2GWJA 3KD1E 1MU2A 2YHYA 3VQ6A 2NZTA 2QK9A 4U67L 1WSFA 1LW2A 2VWBA 4AHRA 4OGCA 1C0MA 3C6AA 1C0UA 2E8AA 2VG7A 2IVNA 1U2VB 4OGEA 2CGJA 1N36K 2GX9A 4AH9A 3K9KA 1HUXA 3O6WA 5AZJA 1REVA 5AQZA 3DM2A 1VSHA 4FOEA 3DMJA 2IIRA 3E66A 2Q3SA 3MN6A 4BWMA 2BE2A 3VEWA 4X65K 3IKMA 3KWGA 4E7LA 3PIPL 4JHDB 3VESA 5AQKA 4BROA 3UIQA 3BZKA 2WOMA 1OH6A 3I56N 1B9FA 3CJ7A 1M1KO 5FRNA 3CERA 3U6FA 3RRHA 1S72N 1JCGA 3MEGA 3O08A 4DG1A 1TUUA 4F8RA 1K73O 4DLGA 4CEAA 2DFEA 3GOIA 1NKBA 3O9SA 1KFSA 3SYZA 4JKBA 4CBUA 1NOZA 5AQLA 1X1PA 2Z1JA 4A57A 1F21A 3CCUN 3ZX2A 3TPQA 2ZWHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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