3FLCO

Crystal structure of the his-tagged h232r mutant of glycerol kinase from enterococcus casseliflavus with glycerol
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
497
structure length
495
Chain Sequence
EKNYVMAIDQGTTSSRAIIFDRNGKKIGSSQKEFPQYFPKSGWVEHNANEIWNSVQSVIAGAFIESGIRPEAIAGIGITNQRETTVVWDKTTGQPIANAIVWQSRQSSPIADQLKVDGHTEMIHEKTGLVIDAYFSATKVRWLLDNIEGAQEKADNGELLFGTIDSWLVWKLTDGQVHVTDYSNASRTMLYNIHKLEWDQEILDLLNIPSSMLPEVKSNSEVYGHTRSYRFYGSEVPIAGMAGDQQAALFGQMAFEKGMIKNTYGTGAFIVMNTGEEPQLDNDLLTTIGYGINGKVYYALEGSIFVAGSAIQWLRDGLRMIETSPQSEELAAKAKGDNEVYVVPAFTGLGAYWDSEARGAVFGLTRGTTKEDFVRATLQAVAYQSKDVIDTMKKDSGIDIPLLKVDGGAAKNDLLMQFQADILDIDVQRAANLETTALGAAYLAGLAVGFWKDLDELKSMAEEGQMFTPEMPAEERDNLYEGWKQAVAATQTFKF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glycerol kinase
publication title Structural Characterizations of Glycerol Kinase: Unraveling Phosphorylation-Induced Long-Range Activation
pubmed doi rcsb
source organism Enterococcus casseliflavus
molecule tags Transferase
total genus 184
structure length 495
sequence length 497
chains with identical sequence X
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2008-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3flcO02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3flcO01
1OKJA 3BEXA 3CERA 3AY9A 5BPMA 3VPZA 4BG9A 4ISGA 2NLXA 2V7YA 4B1XB 4BC5A 3L6QA 3WXKA 2ITMA 1ZXOA 3ENOA 3IFRA 2OANA 4JHDA 3CJ9A 1NM1A 4CBXA 1BWFO 2D1KA 1ATNA 2QWPA 1JCEA 1ATSA 3MN5A 4EHUA 3ULEB 2I7PA 3SLCA 1GLLO 3JS6A 3EO3A 2PBDA 2IVPA 4BRKA 2FSNA 4A2BA 4BRLA 5AR0A 4BGAA 4CD1A 3LDQA 4WQ4C 4MLEA 4BRPA 1ESVA 3QBXA 4GNIA 2ZWHA 4H5NA 3DXKB 1KAXA 4WQ5A 4BRAA 2V52B 1GLFO 2I7NA 3SJHA 3CJ1A 2YHWA 2W41A 3LM9A 5AQGA 1K8KB 2Q0RA 2A3ZA 4H0YB 4XH5A 2ASPA 2YI1A 2DPNA 4H03B 3CHWA 5EY4A 1X3NA 3ZEUA 3HI0A 3VESA 1Y64A 1QHAA 2E20A 1U2VA 3WXIA 5AZJA 3FR0A 3I33A 5B8HA 3VF6A 3H3NO 1NGCA 4JN4A 2A6AA 4EHTA 2A41A 3KVGA 3TPQA 2PAVA 2WUSA 4PL7A 2CH5A 1XC3A 3BP8A 4FPAA 4ISFA 4BRDA 3VF2A 3EZWA 1WOQA 2J4RA 4JD2A 3QMLA 4BC4A 1G99A 4MO4A 4PKHA 1S3XA 1NGEA 3VEZA 3G25A 3VEYA 3D2FB 4BR9A 1HUXA 4K41A 5AQFA 1QQMA 5EX5A 5AQHA 3O6WA 4B1UB 3VENA 4NB4A 4CZEA 3J8AA 5EXWA 1JCFA 4BC3A 3D7EO 1HPMA 3FZMA 4JAXA 1RDWX 4BGBA 4AM6A 4BROA 3LDPA 2FF3B 1E4FT 4L3QA 4BQLA 3WUHA 1QQOA 3GG4A 4RTFD 4CZIA 4BG8A 2Q1NA 2BTFA 2P9SB 3MMVA 3UB5A 1J6ZA 3FZFA 5FPMA 5BPNA 1LCUA 1C0GA 1TUUA 3UKRA 4HWIA 3GE1A 1RFQA 3GL1A 3RSEA 1C0FA 5AZIA 3R8EA 1MDUB 3VEWA 1E4GT 3W3DA 4MO5A 5EOYA 3BF3A 3F9MA 3BUZB 2VCPA 1U6ZA 1TYQA 2E2OA 1GLCG 3GBTA 2YHXA 3C7NB 3H1VX 5AQQA 3L4IA 5KQ8A 2CGJA 3IDHA 4O8KA 2FSKA 2Q2RA 3CJ7A 5FPEA 3HM8A 4IO8A 1X9JA 2E2QA 1IJJA 2D4WA 5BREA 3M6GA 4IXCA 3UE5A 5ELZA 3IUCA 5AQLA 3LM2A 4BR5A 4CJ7A 1RGIA 4MLHA 5AQTA 4M7XA 1NGDA 2FXUA 2P9KB 1CZAN 3CIPA 1NLVA 4E1JA 3ENHA 3O1BA 3VEXA 3MN9A 3A8YA 3CJCA 4BRQA 1BUPA 2Q0UA 3AAQA 2P9UA 4CBWA 2P9PB 4FO0A 4B9QA 4BR0A 4CBUA 2YHYA 1BOTO 2VWBA 3U8XA 1QQNA 5AFUH 3L0QA 3WEEB 2FLOA 3UKUB 4BRGA 5AQMA 5AQRA 1T6DA 2QWOA 3QB0A 3ZX3A 4K43A 1DGKN 1Q18A 1HJOA 1S22A 4BR7A 3FZHA 2E1ZA 2GEMA 1V4TA 5JICA 5LY3A 3LDOA 2IVOA 1NGGA 1NWKA 4QS7A 1HX1A 1YAGA 2GTDA 2QXLA 2A5XA 1P8ZA 4C23A 4CZFA 3VERA 5KQDA 4FWPA 2YCHA 3KHYA 1HKBA 3DXKA 4YDUC 3LDLA 4H0OA 4BRFA 3CQYA 2E88A 1GLJO 4RCHA 5EVZA 4FWNA 1K8KA 4QS9A 4H0PA 1U2VB 4H0VB 1X3MA 3ZX0A 4KBOA 5KPRA 3CJBA 2E8AA 5AQXA 5AQWA 4H5WA 1MWKA 3DJCA 1JCGA 4FSVA 2YJEA 2D0PA 2AA4A 4LC9B 4A62A 4H5VA 4BR2A 4QS8A 3QDKA 4H5RA 4IJAA 4DHYA 3H6EA 1KAYA 3B8AX 1D4XA 4BRMA 5AQNA 4FOIA 4I6MB 5BRDA 1HKGA 2EWSA 4ISEA 1ZC6A 3AARA 3ATVA 5BN9A 3MN6A 4FL9A 4B1ZA 4XH1A 5AQOA 5CE3A 2Q97A 2HOEA 4PL8A 5FPDA 4B1WB 4CI6A 1ZBSA 1V4SA 1KXPA 1BDGA 4EFHA 5AQUA 1H1VA 2V51B 1TUYA 4A61A 1YVNA 3H45C 3S41A 2P9NA 2W40A 3D2FA 5ADXA 5JMVA 1GLEG 3KZBA 4BC2A 3CETA 5BPLA 2D0OA 4FOEA 4WQ5C 2E2NA 1BA1A 2P9IB 4K25A 3A5MC 3A5LC 3DXMB 2A40A 3EKUA 3EN9A 4M7YA 1YUWA 2P9SA 5JLHA 1NGJA 3D2EB 5AZIB 5I9EB 1IG8A 1NGAA 2CGLA 3FZLA 3O5BA 5E26A 1BO5O 1XUPO 2NRHA 4WQ4A 2P9LB 4BRIA 3ZETB 4Y0WA 3WXJA 2BUPA 5LJVA 3H3OB 2ASOA 4IJNA 4EAHD 3QICA 5F2RA 4BVOA 4J8FA 3OHRA 4FWMA 5AQVA 5F1XA 3R9PA 3O80A 3SMPA 1NMDA 4CZLA 3C7NA 3ID8A 3FZKA 1NGBA 3IMXA 4FWQA 4K42A 4CZGA 2Q36A 2QWLA 4EIAA 4BRNA 4BVPA 3O8MA 3M3ZA 3WXLA 2QWRA 2IVNA 1NBWA 2F9WA 1HKCA 3A5OC 4IZ9A 4XEIA 2FSJA 2FF6A 4JHDB 4PKGA 3GOIA 5KPTA 1MWMA 2P9KA 3R6MA 3FE1A 3VEOA 3EKSA 1Z6RA 3MDQA 4FWKA 4FWRA 4BR4A 1SAZA 3GDQA 4CZHA 4A2AA 4WYBA 4BREA 5AQSA 2P9PA 4CZKA 4FPBA 2VYPA 3SMSA 3DAWA 3ULEA 1QZ5A 1YXQA 3WQTA 3VGKA 3WEEA 1GLBG 3LDNA 1GLAG 5AQPA 4GY2B 3UKUA 3DWLA 1SZ2A 4HTLA 4M63C 5E84A 2NZTA 5ADXH 2V7ZA 4CD3A 1KAZA 2CGKA 2GUPA 3QFUA 3FGUA 4AM7A 4XH4A 2UYTA 2GWJA 1DKGD 3HSCA 2GELA 3CI5A 3ZEUB 4FWOA 1QZ6A 4BRHA 1WUAA 4FWSA 3CJAA 3LL3A 5AZJB 2A42A 3ATUA 5JLFA 1T44A 4FWLA 5F0XA 3P4IA 5AQIA 3HZ6A 1NGIA 4DCHA 2IIRA 5BN8A 3BF1A 1DEJA 3VF4A 4JD2B 4CZMA 1LOTB 4NO7A 4Z94A 4DQ8A 3MN7A 3FLCO 3O08A 3HBTA 1BU6O 2ZGZA 1BG3A 3WQUA 2CH6A 3SK3A 4I6MA 3H1QA 4F9OA 5AFUA 2ZF5O 3C0BA 3WT0A 3VETA 2P9NB 2QM1A 1R59O 2QWMA 4BRCA 4JNEA 1Z05A 1HLUA 5KPZA 2HF4A 3UKRB 1BA0A 2AP1A 1GLDG 4H0TB 4BQZA 2HF3A 2F9TA 4PKIA 3H46O 3RSEB 1SQKA 3AAPA 4IWVA 5BRFA 4RWTA 5LJWA 2KHOA 3W0LA 2P9IA 2QWNA 2QW9A 5AQKA 3VOVA 1TYQB 2YJFA 3ZX2A 1XQSC 2E2PA 2E1YA 3DXMA 1NGFA 3M1FA 3O4WA 3FFKB 5TKYA 1T6CA 4B1VA 3D2EA 3CQXA 3VGMA 3HTVA 1MA9B 3A5NC 5FPNA 3U4LA 4B1YB 3MCPA 5AQYA 5BRHA 1ATRA 2P9LA 2ZGYA 3A0IX 3ZETA 2H3GX 4CZJA 4O5FA 3JXUA 4YDUA 3VGLA 4DB3A 2ASMA 5AQJA 4H5TA 4H0XB 3TU5A 1EQYA 3VEVA 3O1WA 3U9DA 2QWQA 3MK6A 5BR9A 2GWKA 2P9UB 2Q31A 5AQZA 3EL2A 1NGHA 2HMPA 3U9ZA 3QFPA 3QBWA 3I8BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IFYA 4RW6A 3K5MA 3QIPA 3ISNC 1S6QA 1UWBA 3ZYYX 4NCGA 4LF4K 4B1XB 3HYFA 1N6QA 1EKEA 4GW6A 5HOOA 2P5OA 1ATNA 1M90O 3CPWM 1ATSA 4CF1A 3NHGA 3EO3A 1QVFM 2F7TA 4B9SA 1I3AA 2FSNA 4Y1DA 1VSLA 1ZBHA 5AR0A 4BGAA 4CD1A 2WONA 5CZ1A 2B5JA 3LALA 4BRAA 5KRTA 2G8IA 3TSPA 2V52B 3SJHA 1Y97A 2GV9A 4IOXA 5AQGA 4CFAA 2YI1A 4IDKA 1IBLK 4J2AA 3CHWA 3ZEUA 3HI0A 4DR1K 4JEPA 1QHAA 3E1YA 4IG3A 4C8MA 3WXIA 4FLYA 4MQ3A 4W5QA 3I33A 4AHSA 5B8HA 5C12A 3H3NO 1NGCA 4JN4A 3LPTA 3QEPA 4FJ8A 4OJRA 1HQEA 1SL2A 4CJPA 3BP8A 4KH6A 3C6AA 2BE2A 4KREA 3EZWA 3VTHA 4JD2A 4DTSA 4JI8K 4N41A 3QMLA 4BC4A 2UUCK 3TTFA 3THXB 3RMDA 3K2PA 3VEZA 5M1KA 3VEYA 1HUXA 4B3MK 5AQFA 1KQSM 4AHRA 2A1RA 5AQHA 4B1UB 2Z1GA 3VMFB 1A5XA 4NB4A 4LFAK 2W42A 3V9XA 3MAQA 4AM6A 3MXIA 3LDPA 4DWIA 3WUHA 3VQCA 3SNNA 4KHNA 3SAFA 2BTFA 3MMVA 5BPNA 3NMUA 1LCUA 1KRPA 1C0GA 3WNHA 1N32K 3DLHA 3CCSN 4HWIA 4JI0K 2FC0A 1HRHA 3O3FA 1C0FA 3VEWA 4QCLA 1E4GT 3NGYA 1RT4A 5IWAK 3BF3A 4FLTA 2VCPA 3ULDA 3JYTA 4EZ9A 1GLCG 3IAYA 4CIFA 1SL1A 2XO7A 3HVTA 4DR6K 1HPZA 4O8KA 2FSKA 2Q2RA 4UY8O 2QK9A 1REVA 1CZ9A 2UUAK 3Q7CA 1D9DA 4IXCA 3IUCA 5AQLA 4BR5A 2VG7A 3AO1A 4MLHA 4DV0K 4CF2A 3C6HA 1NGDA 2OPSA 3O1BA 3VEXA 1S1TA 3J80O 4L8RB 4B9UA 3L2VA 2Q0UA 1RTDA 2YNGA 3NE6A 4M3UA 2IDOA 3O9QA 4B9QA 4BR0A 1KD1O 4DSEA 4DQPA 2YHYA 3OA9A 1SS6A 2IOCA 4I2PA 2HNZA 3TABA 1T03A 3AVGA 3HVRA 3CCVN 3UKUB 1T6DA 3PSFA 2QWOA 3J81O 1VSEA 1NJWA 3V81A 1NMNA 4B9TA 1Q18A 3S3NA 3E01A 2UXCK 1FK9A 2HBJA 3PX6A 1V4TA 5JICA 3TAGA 4FZYA 3LDOA 1KVCA 4QS7A 3AVIA 2QXLA 2A5XA 2XY7A 3ZSYA 5CYQA 4FLZA 4FWPA 4YDUC 4H0OA 1BI4B 4JKEA 3B6OA 3CQYA 2E88A 3WNFA 4C1NI 1JXEA 4QS9A 4I2QA 4B9VA 4KBOA 3CJBA 5AQXA 1WNSA 1JCGA 2YJEA 4QS8A 4DHYA 5C0YA 1ZBUA 1TKDA 3K5OA 4E7LA 1BCOA 5KGXA 4QAGA 4KRFA 1NK5A 4H8KA 2OPPA 3TSQA 1ITGA 2NRXA 3AARA 4C8OA 1WBDA 4ID1A 3THWB 5AQOA 2Q97A 3V1QA 4NCAA 4B1WB 1F21A 1V4SA 4B3TK 2DFEA 2YNHA 3NF7A 2PZSA 1RBTA 4DFKA 3H45C 3KK1A 4CJVA 5JMVA 3CETA 2HSTA 4FXDA 3MEGA 2P9IB 4DQIA 3SJJA 2ZD1A 2HBKA 4DR5K 2A40A 3EKUA 3EN9A 5HRRA 2XY6A 1YUWA 3G6EN 1NGJA 3THYB 4CFCA 4Z4FA 4CJ3A 4OGCA 3PSIA 1VK0A 3OW2M 3WXJA 5HRPA 4YNQA 4BVOA 4FWMA 3SCXA 1OVQA 1S9GA 3O80A 4JKDA 4DTXA 3ID8A 1WLJA 3EE9A 1NGBA 4K42A 4CZGA 4HTUA 2EHGA 2KQ2A 1YI2N 3M3ZA 1Q7YO 1W2BM 2Z1IA 2QWRA 4IOCL 4LF9K 3MEDA 1A5VA 1VRTA 4IZ9A 5GINA 4FJMA 1S9EA 4XEIA 4RW9A 3GOIA 3CCRN 4CEOA 2HHVA 3LP0A 1S1UA 4FWKA 3VQDA 4A2AA 2X6NA 4BREA 5AQSA 2P9PA 4O44A 3HOTA 3HOSA 1ASWA 4F8RA 4M3ZA 3CD6N 2O8EA 2RKIA 3V9SA 3LDNA 4DTOA 3DWLA 5E84A 2Y1IA 3QO9A 2V7ZA 3KLFA 4CW7B 1NK6A 3NF8A 4V19S 1VQMN 3FGUA 2GWJA 4JK8A 4F2RA 1DKGD 1BL3A 3HSCA 2ZJRL 1HNWK 3DRPA 4NYNA 3MEEA 3ZEUB 4FWOA 4KHSA 1QZ6A 4BRHA 3SZ2A 1C0TA 3LL3A 4DU3A 4CHPA 2QI2A 4XIUA 3ATUA 5JLFA 3QNNA 4FWLA 4A57A 3RMCA 4FW2A 3DLBA 1NGIA 1EP4A 2YX6A 1RBSA 3VF4A 4JD2B 5MLCQ 4OKJA 1RTJA 3O08A 1RT6A 2B6AA 3THXA 3HPHA 4JI1K 3SK3A 4CJQA 4Q5VA 3PO4A 5LMNK 1RT7A 3H1QA 2ZF5O 1UOCA 4C8KA 3WT0A 3U3GA 3KWGA 5M1PA 3P83D 4BE0A 3V4IA 2VWKA 2PY5A 5KPZA 2IC3A 3CCMN 3CCQN 1OH6A 2HF4A 2AP1A 1GLDG 3SUNA 1RT1A 2F9TA 2X78A 1SQKA 3AVLA 4DLEA 3KTQA 3CC7N 4CECA 3C6UA 1I94K 3W0LA 3M8SA 1RBVA 1NKCA 1SV5A 1XQSC 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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