3FLCO

Crystal structure of the his-tagged h232r mutant of glycerol kinase from enterococcus casseliflavus with glycerol
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
497
structure length
495
Chain Sequence
EKNYVMAIDQGTTSSRAIIFDRNGKKIGSSQKEFPQYFPKSGWVEHNANEIWNSVQSVIAGAFIESGIRPEAIAGIGITNQRETTVVWDKTTGQPIANAIVWQSRQSSPIADQLKVDGHTEMIHEKTGLVIDAYFSATKVRWLLDNIEGAQEKADNGELLFGTIDSWLVWKLTDGQVHVTDYSNASRTMLYNIHKLEWDQEILDLLNIPSSMLPEVKSNSEVYGHTRSYRFYGSEVPIAGMAGDQQAALFGQMAFEKGMIKNTYGTGAFIVMNTGEEPQLDNDLLTTIGYGINGKVYYALEGSIFVAGSAIQWLRDGLRMIETSPQSEELAAKAKGDNEVYVVPAFTGLGAYWDSEARGAVFGLTRGTTKEDFVRATLQAVAYQSKDVIDTMKKDSGIDIPLLKVDGGAAKNDLLMQFQADILDIDVQRAANLETTALGAAYLAGLAVGFWKDLDELKSMAEEGQMFTPEMPAEERDNLYEGWKQAVAATQTFKF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural Characterizations of Glycerol Kinase: Unraveling Phosphorylation-Induced Long-Range Activation
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glycerol kinase
molecule tags Transferase
source organism Enterococcus casseliflavus
total genus 184
structure length 495
sequence length 497
chains with identical sequence X
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2008-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3flcO02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3flcO01
3EKSA 4I6MB 4CBUA 1QZ5A 4MO5A 4AM7A 3ZX3A 5AQQA 5LJWA 4IJAA 4EAHD 4JD2A 1T6DA 4DCHA 5ADXA 3FGUA 4H5NA 4YDUC 4CJ7A 5KQ8A 5AQTA 1HUXA 1U2VB 5EOYA 5JLHA 3WT0A 1T44A 2FF3B 2VYPA 4ISFA 4FSVA 4H0PA 1S22A 3ATVA 4BRPA 4O8KA 1KAXA 1D4XA 3M3ZA 2ASMA 5AQGA 3SMPA 1TUYA 2GWKA 5AQWA 1H1VA 1Z05A 4M7YA 1ZBSA 3O4WA 3D2EA 3H3OB 1NGFA 2DPNA 5BPMA 2FF6A 5AQZA 5KPRA 4EIAA 3EKUA 3W3DA 1RDWX 4FL9A 2W41A 4NO7A 3JXUA 2D4WA 3QBWA 4PKGA 4FWOA 4BG8A 1NGJA 3BUZB 1Q18A 1TYQA 1QZ6A 3VEYA 3MDQA 4MLEA 3RSEB 4AM6A 2Q0RA 1NGHA 3A5NC 2E8AA 4H0VB 1JCGA 2YI1A 5BRFA 4BC3A 3U4LA 1MDUB 2P9NA 3OHRA 3MCPA 4HWIA 4IO8A 4QS8A 2ZGYA 2CGKA 3FE1A 2ASPA 3GL1A 4PL8A 4BRMA 3GOIA 3AARA 1ATSA 5LJVA 3DWLA 3MK6A 1NGEA 1ZXOA 3R8EA 3UKRB 3MN9A 5FPEA 1NMDA 2YCHA 1KAYA 4RCHA 3UB5A 4BRDA 3U9ZA 4BC4A 3KVGA 4FOEA 3A5OC 4JNEA 4IWVA 5FPDA 4H5VA 3QDKA 1XC3A 4CBXA 1MA9B 3CJ7A 3VF2A 3BEXA 2ZGZA 4HTLA 2E20A 1CZAN 3HTVA 1KXPA 2AP1A 3EO3A 3CJCA 2WUSA 3CI5A 3TU5A 3S41A 2CGLA 3O1WA 3H1QA 3EN9A 3SMSA 4EHTA 2NRHA 4FPBA 4BRQA 5F2RA 4JAXA 4M63C 3H6EA 2Q31A 3ATUA 5BPNA 4B1YB 3DXMA 2P9SB 3LDOA 4B9QA 4E1JA 2IVPA 3WEEA 4CZIA 1LCUA 5ELZA 3ID8A 2A3ZA 4CZFA 1C0FA 2NZTA 4DB3A 5KPZA 2QWRA 3WQUA 4BQZA 1MWKA 4B1ZA 4GNIA 1RGIA 3CJ1A 3SJHA 3QB0A 3SLCA 5LY3A 2GEMA 3CJ9A 3HBTA 4NB4A 1BA1A 1JCEA 5AFUH 1YVNA 2GWJA 3A8YA 1GLDG 5JLFA 3O6WA 4B1XB 4BR7A 3DAWA 3ENOA 4CZJA 2P9IA 4B1UB 3I8BA 3D2FB 5TKYA 3ULEB 3ZEUA 1ATNA 1P8ZA 2D0OA 2P9LA 4LC9B 3UE5A 1XQSC 3IUCA 5AQMA 2P9PB 2V52B 4BR0A 2E88A 5KQDA 3FZMA 4BVOA 2H3GX 3FZKA 5AQLA 4JD2B 4BRLA 4H0OA 3WXJA 2BUPA 2FXUA 4CBWA 3VGMA 2UYTA 2FSJA 5AQRA 3VEOA 3B8AX 3ZX0A 1IG8A 2E2NA 4BR9A 2AA4A 3O08A 5AZIB 4L3QA 2V7ZA 4XEIA 1DEJA 1OKJA 3JS6A 4FWKA 1ATRA 5AZJB 1NGIA 1BG3A 1K8KA 1HPMA 4B1VA 3D2EB 3UKUB 4BQLA 4J8FA 3IFRA 4MO4A 1NWKA 1DGKN 1V4SA 2D0PA 2GUPA 3QFUA 3VGLA 3WUHA 2YJFA 4CD1A 2E1YA 2Q36A 3KZBA 4PKIA 4H0YB 5JICA 1GLAG 3CIPA 4H5TA 4H03B 3VEVA 2IVNA 2YHYA 1U6ZA 3C7NA 5AQSA 3VOVA 4IXCA 3LDQA 1BWFO 1TYQB 3O8MA 5BRDA 3VEWA 2HF4A 3CERA 4H0XB 4BGBA 1HKGA 2OANA 1QQNA 1Y64A 3LM9A 2P9UB 1J6ZA 4IZ9A 4WQ4A 1NM1A 5EVZA 1YAGA 3R6MA 5F1XA 3DXKA 2P9NB 5AQJA 5EY4A 1BDGA 1SQKA 4Y0WA 3H46O 3QBXA 2A6AA 4JN4A 3L4IA 2EWSA 1NGGA 4K42A 2CGJA 4FWMA 1WUAA 5EX5A 3HSCA 1NGCA 4CZMA 5AFUA 4FO0A 2P9KA 5E84A 3D7EO 2ZF5O 1MWMA 3FZHA 3WXIA 4DHYA 1QQMA 4JHDA 3LDNA 4FPAA 3MN7A 4RWTA 4FWRA 2J4RA 3ZETA 2I7PA 3LL3A 4H0TB 1XUPO 1SZ2A 3HZ6A 2GELA 3QFPA 4YDUA 3IDHA 3CQYA 3VGKA 4BRCA 5JMVA 3LDPA 2W40A 2Q97A 2GTDA 3FLCO 4F9OA 4PL7A 1IJJA 1T6CA 2E2QA 2QW9A 4BRGA 2I7NA 1TUUA 4CZKA 3MN5A 5AQXA 1GLJO 3EL2A 2FSNA 4K43A 4XH5A 4XH1A 4FOIA 1HLUA 2QWMA 1G99A 3DXMB 1YUWA 3VEXA 3VENA 1WOQA 3HM8A 4M7XA 1GLCG 3CQXA 4PKHA 3GBTA 5BR9A 4WQ5A 1BA0A 1RFQA 2V51B 2QWQA 1KAZA 3EZWA 4ISGA 2F9WA 4WQ4C 5B8HA 3C0BA 3ENHA 5AQYA 4WYBA 3LM2A 4CZLA 5BRHA 4I6MA 3VF4A 4BR5A 3VETA 5AQVA 3U9DA 2F9TA 2QWLA 5AQPA 2P9IB 3L6QA 4BC5A 1E4GT 3CJAA 2QWOA 3A5MC 1GLFO 3ZEUB 2PBDA 4A2BA 3AY9A 3O80A 1U2VA 4BRFA 4BRKA 3VPZA 3VERA 1NGAA 2FLOA 3LDLA 2YHXA 5AQIA 1GLBG 2QWNA 3SK3A 3ZX2A 4FWQA 1NGDA 3CETA 4BRNA 4C23A 3U8XA 5BREA 1BUPA 3A0IX 1R59O 1BO5O 4FWSA 4A62A 4EFHA 2Q0UA 2D1KA 4BR2A 3GDQA 4H5WA 5AZIA 4QS7A 5AQHA 3AAPA 1DKGD 5AQFA 5AZJA 4B1WB 3M1FA 3IMXA 5EXWA 4CZHA 2HOEA 3FFKB 2V7YA 4BGAA 3UKUA 3MN6A 5FPMA 5BPLA 4XH4A 3RSEA 3O5BA 2HMPA 1K8KB 1BU6O 5AQOA 5BN8A 2QWPA 4BRHA 3TPQA 2ITMA 4QS9A 3HI0A 4O5FA 2A42A 4WQ5C 4EHUA 2E2PA 1X3MA 3W0LA 2PAVA 4FWPA 2IIRA 4K25A 1E4FT 3C7NB 3WXLA 3UKRA 5ADXH 2A40A 1HJOA 2P9UA 3CHWA 1EQYA 4FWLA 2BTFA 1QHAA 3H3NO 3FZLA 5E26A 3BF1A 1Z6RA 1HX1A 4BRAA 2YJEA 3DXKB 3VF6A 2A5XA 4MLHA 3P4IA 4RTFD 3WXKA 5AR0A 3H45C 3QMLA 1V4TA 2KHOA 3BF3A 4CZGA 4BG9A 3G25A 4H5RA 3F9MA 3O1BA 1NGBA 2ZWHA 2QXLA 5CE3A 1ZC6A 1QQOA 3J8AA 4BREA 5F0XA 2E2OA 1JCFA 2P9KB 4JHDB 3GG4A 5I9EB 4CI6A 1HKBA 1C0GA 3A5LC 3L0QA 1S3XA 1X3NA 4ISEA 3ZETB 3GE1A 2IVOA 4CD3A 1SAZA 4BR4A 3M6GA 3VESA 4BVPA 4DQ8A 2P9SA 4KBOA 1NBWA 3DJCA 1BOTO 1HKCA 5AQKA 2NLXA 3I33A 5AQUA 3WEEB 3VEZA 3MMVA 1GLLO 2Q1NA 4A61A 5FPNA 1YXQA 2ASOA 3BP8A 4FWNA 1NLVA 3R9PA 2YHWA 2VWBA 4CZEA 2A41A 4K41A 2Q2RA 3CJBA 5BN9A 1GLEG 4Z94A 2FSKA 4BROA 4GY2B 2CH6A 2HF3A 5KPTA 2E1ZA 2VCPA 1X9JA 3D2FA 3H1VX 3ULEA 2CH5A 3KHYA 3FR0A 3QICA 3AAQA 3WQTA 1LOTB 3FZFA 5AQNA 1ESVA 4IJNA 2P9PA 4BRIA 2P9LB 4A2AA 4BC2A 2QM1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VQ7A 3KK1A 3TAEA 1QZ5A 4AM7A 2OA8A 4ILJA 5AQQA 2X6NA 2RPIA 1NOYA 2O4IA 2OZMA 2A1SA 4W5NA 5JLHA 3WT0A 3RMAA 2HB5A 4FSVA 2IC3A 1S22A 4H0PA 3OYBA 1D4XA 2UXBK 3CCMN 3SMPA 4I2PA 3SQ1A 5KTQA 4FJ8A 3JYTA 4FLZA 1Z05A 3Q7CA 3D2EA 3H3OB 2OTLN 4CK1A 1HR0K 2DPNA 2FF6A 1L3VA 3THVA 5D3GA 4F4KA 2W41A 5A2QO 4NO7A 3AGRA 1K8AO 1HYVA 3QBWA 4DV4K 4CJEA 1EP4A 1EX4A 5DM6L 4O8UA 2KFZA 3VEYA 3M8QA 4CIGA 5GADP 1FJGK 3NAEA 1E3MA 4N56A 1VK0A 4AM6A 3OY9A 1U47A 4XIUA 2NUBA 1NGHA 3HT3A 3V9SA 2PYLA 2E8AA 3PSIA 2FBXA 4BC3A 3U4LA 3QIOA 4HWIA 1K6YA 2ZGYA 5C2DA 4HTUA 4BDZA 1ATSA 5LJVA 3PLAA 4GV6A 3MK6A 1NGEA 5J2PA 1ZXOA 3UKRB 4E7JA 3N4PA 3AA2A 3UB5A 1RT7A 1LWFA 3KVGA 3LP3A 2YHBA 1VRUA 4H5VA 3QDKA 4DU1A 2XO7A 5HRNA 1K9MO 2HHSA 1RNHA 3BEXA 1YTAA 2E20A 4LSNA 1D8YA 4IEIA 3CI5A 5M1FA 4JI1K 1VSJA 3O3GA 1RT2A 3QNNA 4FW2A 4B8CA 1CZBA 1TKDA 1BCMA 2G8UA 1ZBIA 4BRQA 1BQNA 4JAXA 2Q31A 4DFMA 4DFJA 3V6DA 4CZIA 3FFIA 4OKEA 4CESA 3OYGA 1NJYA 2HBKA 4CJTA 3NHGA 1CLQA 1MWKA 3DMJA 4CJ5A 3OYLA 3CFRA 4YOTA 3CJ9A 2JWKA 1WAJA 1SV5A 3H08A 5AFUH 3A8YA 1DTQA 3QO9A 3LP1A 1R0AA 4OJRA 3O6WA 4RG8A 4FZYA 3O9UA 4CZJA 4KHSA 2FBVA 1ATNA 4JKBA 3JSMA 1SKSA 3U3YA 1I3AA 3OS2A 3CF5L 2O4GA 4PWDA 1U45A 4X64K 3FZMA 4BVOA 1U04A 3NGYA 1N6QA 3F2KA 4CFCA 4M3XA 3I0RA 4AQYK 1JJ2M 4BRLA 4H0OA 3K5NA 4CJQA 3ULDA 4IOXA 1RT3A 2BUPA 1WSJA 4CGFA 3EYZA 2HVIA 1K73O 2E2NA 3SZ2A 1XC9A 2V7ZA 1OKJA 1WLJA 3JS6A 2E6LA 4FWKA 4FJLA 1VSKA 5AZJB 3AGKA 1HPMA 4B1VA 3MWPA 4CJ4A 2B4JA 4C8LA 3UKUB 4BQLA 3HPOA 1Y97A 1V4SA 3LP0A 3O9TA 4AHRA 5H1SQ 3RMBA 2E1YA 2Q36A 3RMDA 1TGOA 4H0YB 3ZT4A 4H5TA 1NK7A 1WNSA 4H03B 4CGJA 1CZ9A 3OBYA 3SPYA 5M1QA 2RN2A 4Z4IA 2W6KA 2WTUA 2A1RA 3AV9A 3IS9A 5F1XA 3V9ZA 3DXKA 3WNGA 3NF6A 5GAHP 4O0IA 4DU4A 3NVMA 4MQ3A 1UA1A 1TK0A 3QBXA 4JN4A 2WOMA 4FWMA 1QTMA 2XY8A 1KVBA 2OPPA 4H8KA 3D7EO 2ZF5O 1YJWN 3CFPA 1N5YA 1HNZK 3LDNA 3TAGA 4FWRA 3LL3A 1XUPO 2GELA 4YDUA 1QQCA 2VG6A 1M1KO 4YOYA 2W40A 4KI6A 2Q97A 2QK9A 1IJJA 4CJSA 1EWRA 1RBRA 5AQXA 4LH4A 4DV6K 2FSNA 4K43A 3IAYA 4LF7K 1VQ6N 3QETA 3AVAA 3K5MA 3QEXA 3DXMB 3T1HK 1YUWA 4ILGB 2G8IA 1RT4A 4M7XA 4PHTX 1GLCG 3TTDA 1JLGA 1BA0A 1RFQA 3P39A 4G1QA 4KHUA 2G8VA 2OYQA 2QWQA 1KAZA 1RDBA 3EZWA 3VQAA 2F9WA 1X9WA 3AVJA 3ZSVA 4FK4A 4CZLA 1XHZA 2NRVA 3VF4A 1ZBFA 2KLAA 1FW6A 3HXMA 4CEZA 4JRQA 1D9DA 5JVGL 4F3OA 1E4GT 1GLFO 2OPQA 3MX2A 2ZJRL 3AVNA 3LZJA 4FLVA 2ZD1A 3AY9A 3MEGA 1T8EA 1NGAA 3OYIA 4DQRA 2BE2A 2HNDA 3ZX2A 4FWQA 4CFDA 1NGDA 4CERA 5BREA 4WFAL 4ZHRA 4CFBA 3HRGA 1QE1A 3DI6A 3TARA 1YTUA 1NKBA 1J5OA 1XHXA 3M8PA 4LD0A 2D1KA 4LY7A 3T69A 3AAPA 1OH8A 1KCFA 2F8SA 5EXWA 2Z1HA 1YI2N 4CCHA 1S6PA 2V7YA 3FFKB 2O8CA 5SZTA 3PY8A 4Y1DA 4CEEA 4XH4A 4CJFA 1OVYA 1TKZA 4KI4A 1TV6A 3QEVA 1L5UA 1JXEA 3L2UA 3ZSZA 2A42A 4F8RA 3MX5A 2HBJA 4K25A 1E4FT 3C7NB 4CK2A 2P9UA 3HPGA 4KHQA 3V1RA 1QHAA 3OYMA 1U4BA 3T1YK 1NKEA 3TSUA 4YOWA 4KV8A 3BF1A 3P83D 1Z6RA 1EKEA 2W42A 1JL1A 3SPZA 4MLHA 4RW6A 4E7LA 4CHPA 4CZGA 3G25A 4H5RA 1S9EA 4HUEA 1IG9A 1NGBA 3VQPA 3ZT0A 4JKGB 2F96A 1S1VA 2LSNA 4R5PA 1YJ9N 4JHDB 2XY7A 5DM7L 4NXMK 2EX3A 1C0GA 1RTHA 3A5LC 3L0QA 3ZETB 3R3LA 1BIUA 3GE1A 2IVOA 1JLBA 1ITGA 5C42A 1W7AA 3ALYA 2KW4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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