4PL7A

Structure of komagataella pastoris actin-thymosin beta4 hybrid
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
425
structure length
382
Chain Sequence
VAALVIDNGSGMCKAGYAGDDAPHTVFPSVVGSFVGDEAQSKRGILTLRYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRLAPEEHPVLLTEAPMNPKSNREKMTQIMFETFNVPAFYVSIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHVVPIYAGFSLPHAILRIDLAGRDLTDYLMKILSERGYTFSTSAEREIVRDIKEKLCYVALDFDQELQTSSQSSSIEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFHPSVLGLEASGIDQTTYNSIMKCDVDVRKELYSNIVMSGGTTMFPGIAERMQKELTALAPSSMKVKISAPPERKYSVWIGGSILASLGTFQQMWISKQEYDESDMAEIEKFDKSKLKKTETQEKNPLPSKETIEQEKQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Actin,Thymosin beta-4
publication title Structural basis of thymosin-beta 4/profilin exchange leading to actin filament polymerization.
pubmed doi rcsb
source organism Komagataella pastoris
molecule tags Structural protein, contractile protein
total genus 126
structure length 382
sequence length 425
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01290 Thymosin Thymosin beta-4 family
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4pl7A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4pl7A01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4pl7A03
2NLXA 1LCUA 2ZF5O 2P9KA 3H6EA 5AQOA 2P9SA 2FXUA 2D1KA 3H1VX 3VF4A 1KAXA 3TPQA 1HKCA 2GWKA 5JICA 2P9PA 4CZGA 4BR2A 3WT0A 1KAZA 4DHYA 4CZLA 4BRPA 2V51B 4FWQA 4C23A 4CZKA 5BN8A 2E1ZA 4CZEA 3WXKA 2GTDA 3WEEB 1SAZA 3FR0A 4FWPA 3FGUA 1NGDA 2P9UA 3MN5A 1NGJA 1TUYA 1Y64A 2Q0UA 5FPNA 1WUAA 5AQFA 5JLHA 1X3NA 4H0OA 4H0YB 4K25A 3VEZA 3VPZA 4H5RA 1V4SA 3WEEA 3VEOA 3O1WA 5EY4A 3WUHA 4H5TA 4YDUC 3G25A 4CBXA 4BRLA 3VETA 3C7NB 3GDQA 1ZC6A 1X9JA 2PAVA 4IWVA 4XH1A 3IFRA 2I7PA 1NGEA 5AQLA 4BRMA 4CJ7A 3QBWA 3GE1A 1HKGA 5AQGA 4BGAA 2H3GX 1BWFO 3GBTA 1C0FA 4BQLA 1T6CA 1GLCG 3QFPA 5BRHA 1DGKN 2HF4A 3VESA 1JCGA 2A3ZA 4FWMA 4CD1A 3U9ZA 2QWOA 3HBTA 2D0PA 1IJJA 5AQRA 1HX1A 2P9NB 3O8MA 1V4TA 1ATSA 4B1XB 5B8HA 3R6MA 4B1ZA 2VWBA 4B1UB 2YHWA 4M7XA 4FOIA 1Z6RA 1OKJA 5BPNA 1SQKA 2E2QA 2UYTA 3U4LA 3LL3A 3VGLA 3W0LA 3BEXA 3FZLA 2FSKA 1NGIA 5E84A 4JAXA 2A40A 5AZJB 2HOEA 4JD2B 5F0XA 4GNIA 3WQUA 1HUXA 2GWJA 3KVGA 1U2VB 1J6ZA 3F9MA 1YUWA 4MLEA 1NWKA 4L3QA 4K43A 4EFHA 5AZJA 3M3ZA 3O4WA 5AQWA 4BRAA 3DXKA 4FWRA 4Y0WA 5FPEA 3SJHA 3ZETB 4H0VB 1NM1A 4J8FA 3R8EA 4H5VA 3B8AX 2Q31A 1QQMA 2AP1A 3WQTA 3H3NO 3EKUA 1RFQA 2E2PA 2CH5A 1WOQA 3RSEB 4CZIA 4QS8A 3VGMA 5AQMA 4BQZA 4B1WB 3ZETA 1S3XA 4I6MB 4O5FA 4BRGA 3VEXA 4CZJA 3ZEUB 1XC3A 2EWSA 4IJAA 1S22A 3JXUA 3O5BA 1GLLO 1NGGA 3LDOA 4MO5A 4DCHA 3C0BA 1T44A 4BC2A 1GLBG 3RSEA 4CBWA 2E2OA 2FSNA 3CJ7A 4H0TB 4H0XB 1ATRA 3KHYA 3WXJA 3FE1A 2Q97A 2QWQA 4FOEA 3CIPA 3ZEUA 1DEJA 3H3OB 3H45C 1BO5O 1D4XA 4F9OA 3ZX3A 3DXMB 3J8AA 5AZIB 4XH5A 4BRHA 5EXWA 1KAYA 3CJBA 5EOYA 5AQNA 4PKGA 4BR4A 1QQNA 2P9IB 4BGBA 2V52B 3CHWA 5E26A 2QWPA 4BVPA 3DXMA 4DQ8A 5AZIA 5TKYA 4Z94A 1R59O 3BUZB 2QWRA 3U9DA 2P9LB 4AM6A 2PBDA 5KPTA 3MK6A 1RDWX 4NO7A 1BUPA 1HPMA 5F2RA 4FWSA 2NZTA 1NLVA 4MLHA 4RWTA 1QZ6A 3TU5A 4WQ4A 2A5XA 4DB3A 2P9LA 3CJCA 1GLFO 4ISGA 5AQKA 1BA0A 3C7NA 3LM2A 3A8YA 5FPDA 3FZHA 3ATVA 4PL8A 3MCPA 2QWNA 4BC4A 3I33A 3UB5A 3MMVA 4BRDA 3A0IX 3GG4A 5BPLA 5F1XA 3VEVA 3VERA 1GLDG 3H46O 5AQIA 1U6ZA 2CGLA 2F9WA 4FWKA 4KBOA 2V7ZA 4WYBA 3CJAA 1YVNA 3SK3A 3A5LC 4IXCA 3UKRB 4WQ4C 5AQPA 3U8XA 5FPMA 3VF2A 5ADXH 1MA9B 3QICA 5LJWA 2QW9A 4A62A 5AQQA 3CQYA 3SMPA 1BOTO 2P9NA 4CD3A 1HJOA 4AM7A 3VEWA 2W41A 1IG8A 3AY9A 2CGJA 4CZMA 5BR9A 4EHUA 5BRFA 5AR0A 3UKRA 2Q2RA 3MN9A 3VENA 4FL9A 3HI0A 4RTFD 4BVOA 1T6DA 1ZXOA 2FF6A 2QWMA 4PL7A 4FSVA 3CQXA 1CZAN 2V7YA 2AA4A 1MWKA 3LDQA 3JS6A 3LDLA 4EHTA 1ESVA 4B1VA 2FLOA 1MDUB 4JD2A 1GLJO 3L0QA 4JHDB 4H5WA 3A5OC 2Q36A 1U2VA 5KQDA 3SMSA 5CE3A 3VF6A 2A42A 5AQSA 3VEYA 2FSJA 1Q18A 4FO0A 3OHRA 3M6GA 1E4GT 4MO4A 5EX5A 3QB0A 2WUSA 5AQTA 3S41A 2QM1A 4BRFA 2HF3A 4H5NA 3BP8A 4WQ5A 2GEMA 4IO8A 3BF1A 4ISFA 3DAWA 3P4IA 3H1QA 4EAHD 3WXIA 1SZ2A 2VYPA 5LJVA 1ATNA 1EQYA 2D4WA 3CERA 4H03B 2IVOA 2P9KB 2E88A 2P9SB 5BPMA 3HTVA 4JNEA 2E1YA 4I6MA 3BF3A 3AAPA 4A2BA 1TYQB 3CETA 2F9TA 2OANA 2P9PB 3QMLA 3FLCO 3AAQA 2GELA 2IVNA 3MN7A 4PKHA 1NMDA 3SLCA 4HTLA 3VOVA 1JCEA 3EN9A 1NGHA 1P8ZA 4FPBA 5I9EB 1NBWA 4BROA 3MDQA 5AQJA 4IJNA 4WQ5C 2QWLA 3ZX2A 3LDNA 1GLAG 2NRHA 1BU6O 4CI6A 5KQ8A 1X3MA 5AQZA 4EIAA 3M1FA 1TYQA 2YHYA 2E8AA 2P9UB 4YDUA 3IDHA 3WXLA 1NGFA 1QQOA 3FFKB 3O80A 3UE5A 2BTFA 4K41A 2GUPA 5AFUH 5AQVA 3VGKA 4BRNA 1G99A 1GLEG 4M7YA 4BR7A 3QFUA 2ZWHA 4BRIA 2Q1NA 4ISEA 3KZBA 3LM9A 2P9IA 4BG8A 4HWIA 1MWMA 3O08A 5JMVA 2CH6A 3FZMA 4CZFA 3D7EO 5ELZA 4CBUA 4FWOA 3EKSA 4B1YB 4BG9A 4E1JA 3I8BA 1JCFA 3LDPA 1QHAA 5EVZA 5ADXA 2Q0RA 4NB4A 1KXPA 2A6AA 3HZ6A 4CZHA 2ASMA 2W40A 4BC3A 5BN9A 4BR0A 3FZFA 1DKGD 3ENHA 2A41A 3QDKA 1XQSC 1BG3A 3ENOA 4A61A 4B9QA 3EZWA 3GOIA 1LOTB 5AQYA 2ITMA 4PKIA 3ULEB 3ID8A 4FPAA 3ATUA 2YI1A 2YJFA 2QXLA 4FWNA 4BRQA 3FZKA 1Z05A 3CJ9A 4BRKA 3IMXA 3IUCA 3ULEA 1C0GA 4XEIA 2DPNA 4RCHA 1NGBA 2YCHA 1RGIA 4A2AA 4QS7A 2J4RA 5BREA 2E2NA 1BDGA 3DWLA 5AQHA 2BUPA 1HLUA 3A5NC 2D0OA 4LC9B 3O1BA 2IIRA 3UKUB 1NGCA 1H1VA 4BRCA 2FF3B 2I7NA 1NGAA 2ASPA 2YJEA 5JLFA 4IZ9A 3CJ1A 3DXKB 1HKBA 4FWLA 2ZGZA 4K42A 4BR9A 2VCPA 4QS9A 4O8KA 1YXQA 2IVPA 3R9PA 3CI5A 2E20A 3UKUA 3W3DA 3D2EB 3AARA 3HSCA 2CGKA 4JHDA 3QBXA 3L4IA 4H0PA 1K8KB 3A5MC 3D2FB 3EO3A 3EL2A 4BC5A 4M63C 4BR5A 5KPZA 3ZX0A 3D2EA 1XUPO 5AQUA 3HM8A 2YHXA 1QZ5A 1YAGA 3MN6A 5LY3A 3GL1A 4JN4A 4GY2B 5AFUA 5AQXA 3DJCA 1K8KA 3D2FA 5BRDA 2ZGYA 3O6WA 2KHOA 2HMPA 1BA1A 4XH4A 5KPRA 1E4FT 1ZBSA 3L6QA 2ASOA 1TUUA 4BREA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZF5O 3MXJA 4RW8A 3C6UA 2D1KA 2Z1JA 3THXA 4OPAA 4OPHA 1VSLA 1EO1A 1KAZA 2DTUA 3AVNA 4BRPA 4FWQA 4OX9K 4OKEA 4CZKA 3OYEA 3WXKA 2GV9A 3K5NA 1XHZA 1HRHA 2FBYA 4GVEA 4JRQA 1XHXA 4LH4A 2VGMA 3AO4A 5BR8K 5FPNA 5GINA 1WUAA 5JLHA 4ILJA 5M1FA 4IFYA 1Q86O 4JI8K 3VEZA 4BWJA 2PZSA 1V4SA 5JVGL 3VEOA 5M1PA 4FLVA 4H5TA 3THWB 4ZTJA 1NJIO 3OYJA 4DG1A 1RBVA 5GAHP 1NJYA 5AQLA 3QESA 4OKJA 1LWFA 3QBWA 2HHQA 5AQGA 4DTRA 5HRPA 3SUOA 4ICLA 2G8FA 3WNGA 3THWA 4CEQA 4B9LA 3K5MA 4CF0A 1QE1A 1DGKN 2HF4A 3CCEN 1J54A 4M3YA 2QKKA 3OYBA 4DV1K 4CJWA 4V19S 4IOCL 3O8MA 2JWLA 3RMDA 1IBMK 1ATSA 1BL3A 3OYKA 2YNFA 4DTXA 5BPNA 1SQKA 2UYTA 3U4LA 3LL3A 4Y1CA 1NJZA 4YOTA 1TKXA 3ASMA 4IG3A 4DQIA 3CYMA 4M42A 3AVCA 2HOEA 5E41A 1NJXA 1S1WA 1VQNN 2PYJA 4B3MK 1HUXA 3F73A 1L3TA 2HBKA 4OLBA 4O8UA 1LV5A 3CCRN 5FRNA 4DR2K 1VSFA 3M3ZA 1QVFM 4E7HA 5AQWA 3V9SA 4DFJA 4CHNA 5FPEA 3ZETB 5TKWA 3B8AX 5CZ2A 3MCAB 1QQMA 2AP1A 3WQTA 3H3NO 3EKUA 2KLAA 1Q82O 5C2DA 3FFIA 2CH5A 1BIUA 4IEEA 3RSEB 2I5JA 3IS9A 4MQ3A 3WXMB 1WAJA 4CZIA 1VSEA 3ZETA 4I6MB 4BRGA 4IJAA 3JXUA 5CHIA 4KH5A 3LP1A 3C0BA 2D0AA 3RSEA 4CBWA 3H08A 3HXMA 1EWQA 3FE1A 3LP2A 3OS1A 3H3OB 4F9OA 5HBMA 3EZ5A 3DXMB 3J8AA 4XH5A 2QI2A 1L3VA 1FK9A 5EXWA 3AO1A 3CMAN 1NJWA 2DFHA 4FJXA 1EX4A 3NBPA 4FCYA 4FLUA 4DU1A 3TARA 4FJKA 3KLHA 3TAPA 2QWPA 4Z4GA 3DXMA 3HOSA 4DQ8A 4M3ZA 1S6QA 1R59O 3BUZB 4AM6A 1YI2N 4E1NA 2PBDA 4CGFA 4NLBA 3MK6A 1RDWX 4NO7A 3T1YK 3ZT0A 3CMEN 4WQ4A 1NK4A 4UQGA 1R0AA 2E4LA 3MEGA 5FDLA 4PQUA 1OVYA 2KFZA 1U04A 4UY8O 5AQKA 2OZSA 2YNGA 1BA0A 3CF5L 3NF6A 4YOUA 4PL8A 4FJ7A 2IOCA 1D8YA 1KVBA 2QWNA 1RDAA 3OYMA 1HPZA 3KLEA 5C42A 2F9WA 3NCIA 4KBOA 4WYBA 3TABA 1YVNA 3PUFA 3KJVA 4WQ4C 5AQPA 2HSTA 3TTCA 3U8XA 5GIOA 3CQYA 3DRPA 3SMPA 1RT3A 4C8KA 1HJOA 4C1NI 3PY8A 5J2NA 2W41A 2ZE2A 2CGJA 4DSIA 2HHWA 5AR0A 2Q2RA 3ZT1A 3PSFA 4BVOA 4E7IA 1IBLK 2QWMA 5KRTA 4FSVA 4R5PA 4I2PA 5CYMA 3ZT3A 2UUAK 4G1QA 3CPEA 1NKEA 2KQ2A 2WTUA 3LDQA 3JS6A 4JV5K 3TAFA 4FXDA 2HNYA 1BQMA 2FC0A 4OGCA 4M3XA 2NRRA 4C8OA 4JD2A 3NGYA 3CCLN 3J80O 2OCEA 1D9FA 1GLJO 1C1AA 2VG7A 3VTHA 1Q18A 3K0SA 3L3UA 3O9UA 1U47A 1N6QA 3CM6A 3S41A 4CHPA 5AJ3K 5HRSA 2F4VK 4ELVA 3DAWA 3G4SN 4DF4A 4WE1A 3TAEA 2VYPA 1EQYA 2D4WA 3HO1A 3VQ8A 2IVOA 3I8DA 1VRTA 2P9SB 2E1YA 5C15A 2P9PB 1X9WA 3VOVA 3EN9A 3S5TA 5I9EB 2G8WA 5AQJA 4NXNK 4JKFA 4K0KK 1CLQA 2HHVA 4N56A 2E8AA 2G8VA 5HP1A 2P9UB 3IDHA 4M3WA 1QQOA 4LF8K 1VSMA 3KKRA 1Q9XA 3O80A 3RMAA 2GUPA 4E19A 5LMUK 3ZYYX 3AVIA 3K9KA 1ZBHA 4BRIA 2Q1NA 4DR1K 1SKRA 3KZBA 3AVKA 3LM9A 2P9IA 3U3YA 3HK2A 4W5QA 5SWMA 1BGXT 4LSLA 4O44A 3M8RA 5T7BA 2UU9K 4LF6K 3LDPA 3OYLA 1QHAA 3ZLJA 4CJQA 1W0HA 1XNRK 2EHGA 3HZ6A 1VQ6N 4RW4A 3G71N 4CHZA 1FW6A 5MLCQ 3FZFA 1N33K 3ENHA 2A41A 4CIEA 3OJSA 5JS2A 4YHHK 1BG3A 4A61A 2O4GA 1YTAA 4Z4CA 1LOTB 1VQ7N 3AVBA 1TKZA 3AVAA 4DSLA 4JKCA 4PKIA 3OYFA 3ID8A 3L2WA 4FPAA 2C1GA 3BGRA 4FWNA 3CD6N 2HHHK 4BRQA 1ASWA 4Q0BA 4IDHA 4DSEA 1WBDA 1VK0A 4JI2K 3IRXA 4Y1DA 4OLAA 1SS6A 2OA8A 2VWJA 2DPNA 4RCHA 1HQUA 3NGZA 3ALYA 4A2AA 1RT4A 3VQAA 1JLBA 2WFBA 1IKVA 5AQHA 4LH5A 4J2EA 5LL6Z 3SCXA 3CFRA 5HL7L 1W2BM 4AHVA 3E9PA 2YJEA 5J2PA 5DMRA 4FWLA 2P51A 4BR9A 3SQ0A 5C24A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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