3WUHA

Qri7 and amp complex
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
376
structure length
344
Chain Sequence
KGYKVLAIETSCDDTCVSVLDRFSKSAAPNVLANLKDTLDKAHIHHQARIGPLTERALIESNAREGIDLICVTRGPGMPGSLSGGLDFAKGLAVAWNKPLIGVHHMLGHLLIPRMGTNGKVPQFPFVSLLVSGGHTTFVLSRAIDDHEILCDTIDIAVGDSLDKCGRELGFKGTMIAREMEKFINQDINDQDFALKLEMPRNMLSFSFSAFITALRTNLTKLGKTPEREIRSIAYQVQESVFDHIINKLKHVLKSQPEKFKNVREFVCSGGVSSNQRLRTKLETELFNFYYPPMDLCSDNSIMIGWAGIEIWESLRLVSDLDICPIRQWPLNDLLSVDGWRTDQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Saccharomyces cerevisiae mitochondrial Qri7 in complex with AMP
pubmed doi rcsb
molecule keywords tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferase, mitochondria
molecule tags Metal binding protein
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 103
structure length 344
sequence length 376
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.234: N(6)-L-threonylcarbamoyladenine synthase.
pdb deposition date 2014-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00814 Peptidase_M22 Glycoprotease family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3wuhA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3wuhA01
4XH4A 4BREA 3QBXA 2IVOA 3A5MC 3KZBA 3H3NO 1YXQA 3IFRA 5BN9A 4A61A 4EAHD 1T44A 4WQ5A 1HLUA 1U2VA 3J8AA 4EFHA 3WUHA 1NGHA 4BC3A 5AQWA 3VEZA 4RWTA 3UB5A 3CQYA 5AFUH 2PBDA 4BR5A 2ZF5O 3G25A 5AQRA 3WXIA 3FZLA 3GDQA 1J6ZA 1LOTB 3A5LC 2FSNA 5AQTA 1XC3A 4PKIA 3SMSA 2OANA 4BRNA 5JLFA 2ZGZA 1XUPO 3D7EO 3ZX3A 1BG3A 4QS7A 4DCHA 1R59O 3VGMA 4BRFA 5AQXA 2W41A 1NGDA 2A42A 2DPNA 4CZLA 3VF4A 3QB0A 1NGIA 1V4SA 4EIAA 1SQKA 2Q0RA 3LDOA 1Z6RA 3FZMA 3L4IA 1ATRA 3CETA 5AZJB 5ADXH 4CZJA 1MWMA 4PKHA 4BROA 3VGLA 2P9LB 5AQVA 3BP8A 3ID8A 1DGKN 4B1XB 5E84A 5BRHA 4EHUA 5F2RA 1T6CA 1MA9B 3QBWA 3QFPA 2IIRA 3U4LA 2E1ZA 1HPMA 5AZIB 1TYQA 4MO5A 1QQMA 5AQHA 1K8KB 4Z94A 3FE1A 3CI5A 3AY9A 2AA4A 2ZWHA 2FSJA 4FWQA 4I6MA 3CIPA 4QS8A 3O1BA 4XEIA 3UE5A 1NMDA 1H1VA 4FWLA 4CJ7A 4JHDA 3HBTA 1ESVA 1NGCA 4A62A 3OHRA 1JCFA 3TPQA 2Q0UA 3ZETA 4WQ4C 2YCHA 4F9OA 5BPLA 4IXCA 2IVPA 2P9LA 4FPBA 1QQNA 3DXMA 4IZ9A 5AQSA 1WUAA 1Y64A 4LC9B 2P9UB 4BR7A 2GUPA 4Y0WA 4BRPA 3H1QA 5LJWA 3C7NB 3CJ1A 4MLEA 4IWVA 3MN7A 2NRHA 3EKSA 1GLDG 1TUYA 2FLOA 4FOEA 3LDPA 1X9JA 2QWOA 3CJAA 3MN5A 1HUXA 2V7YA 5B8HA 3GBTA 1HKBA 3ZEUA 2E88A 3O80A 4M63C 3CJ7A 2V51B 3ZX2A 5AQZA 3WXJA 3U8XA 2YJEA 3LL3A 4H5TA 5AZJA 3AARA 5AQPA 3VF2A 3VETA 3MMVA 3SK3A 3P4IA 5CE3A 3FZFA 5JMVA 1RFQA 2Q36A 3FR0A 3I33A 3R9PA 1YUWA 1BUPA 1E4FT 3H6EA 4FOIA 4K41A 4NB4A 3FGUA 2P9UA 1GLBG 5LJVA 2A5XA 3VPZA 1SZ2A 4WYBA 4FWMA 3C7NA 4O5FA 5AQKA 5EY4A 3LDNA 5FPEA 4B1WB 5BPNA 1KXPA 3DJCA 4CBWA 1MWKA 1GLCG 4BRKA 2CGLA 4CZEA 4H03B 3SMPA 4CZGA 4ISGA 3VGKA 2QWQA 1BOTO 5AQGA 3VEXA 3UKUA 3TU5A 1YAGA 3O08A 4BVPA 1NM1A 1TYQB 1KAYA 3WT0A 2P9KA 3SJHA 3VEVA 4BRCA 4BR2A 4H0XB 4CZMA 2NLXA 1DKGD 4JAXA 3BF3A 1BWFO 1BA0A 1DEJA 1HKCA 3EO3A 5LY3A 4FWRA 2UYTA 3CJBA 3IMXA 4H5RA 4FWSA 3O5BA 4FWKA 4I6MB 4MLHA 1NGAA 5EXWA 5BRFA 4BRQA 1GLJO 4JHDB 4PKGA 2VWBA 1OKJA 2QWRA 3JXUA 3BF1A 3EL2A 4KBOA 4NO7A 3ZETB 5BRDA 3MDQA 2GEMA 2HMPA 2GELA 5AFUA 2FSKA 3VF6A 5BREA 1HX1A 3DXMB 4BC4A 2D4WA 3ULEA 4HTLA 3VOVA 1QQOA 1S22A 2ASOA 4J8FA 4A2AA 2P9NB 4YDUA 2FF3B 4FPAA 4BRMA 3DWLA 1RDWX 4WQ5C 1Q18A 2NZTA 1BO5O 3FZHA 4K25A 4JN4A 4K42A 4BC5A 4BGAA 2VCPA 3B8AX 4H5WA 4IJNA 4H5NA 3ZEUB 2CH6A 4CZFA 2YHWA 3CHWA 3O8MA 3GOIA 4M7YA 5AR0A 4PL8A 3QMLA 3CERA 5F0XA 2Q97A 4DHYA 4H0PA 2AP1A 1BU6O 4HWIA 1JCEA 4CZIA 1NLVA 4BR4A 2I7NA 1NGEA 3HZ6A 3QFUA 2GTDA 4GY2B 4H0OA 1ZXOA 5FPDA 4H0YB 2P9NA 2I7PA 3U9DA 4PL7A 1HJOA 3WQTA 2GWKA 2HF4A 3ATUA 3VERA 5AQUA 1X3MA 3EN9A 3VEYA 2E2PA 4DQ8A 4FL9A 3VEWA 2A41A 4XH5A 3MN9A 5JICA 4BRHA 1D4XA 3F9MA 5TKYA 3BEXA 1XQSC 3M1FA 3IUCA 3UKUB 1NGBA 2QWNA 2QW9A 1MDUB 3HM8A 5AQYA 1KAXA 3R8EA 2YHXA 1NBWA 1YVNA 2P9KB 3L6QA 4BRGA 4JD2A 2CGJA 3WEEB 1IJJA 1NGJA 3GE1A 5AQNA 3M3ZA 3A5OC 5KPTA 2P9IA 3H3OB 2VYPA 3SLCA 4FWOA 1NGFA 3VESA 3A8YA 2V52B 4BR0A 1KAZA 2E8AA 4RTFD 5FPNA 4CBUA 3RSEB 2Q2RA 4BG8A 4BC2A 4EHTA 2QWPA 2GWJA 2ASPA 2P9PA 3D2EA 4CD1A 4B9QA 4B1YB 5AQMA 2Q31A 3ULEB 2YJFA 4FSVA 4RCHA 3LDLA 2CH5A 3CJCA 4XH1A 1GLEG 2QWLA 3ATVA 2CGKA 3WEEA 3DAWA 5AQOA 3DXKA 2A40A 1CZAN 1GLFO 2D0PA 1S3XA 2PAVA 4GNIA 2QWMA 3D2FA 4L3QA 5AQJA 1ATSA 3W3DA 4BQLA 4C23A 3RSEA 4ISFA 4JNEA 4BQZA 2E2NA 3HI0A 3QDKA 3S41A 4WQ4A 5AQIA 1U6ZA 4MO4A 4H0TB 3GL1A 5KPRA 3FLCO 1G99A 3EZWA 1JCGA 2ITMA 1C0FA 1BA1A 2P9SA 2E2QA 4A2BA 2KHOA 3JS6A 4QS9A 4BG9A 3VEOA 5AQQA 3LDQA 4K43A 3WXKA 3CJ9A 4BRAA 4DB3A 1TUUA 2Q1NA 1NGGA 2FF6A 4ISEA 4BR9A 3MN6A 1C0GA 1ZBSA 3WQUA 3KVGA 4BRLA 1IG8A 2H3GX 2W40A 2YI1A 3IDHA 2BTFA 4BRDA 5EX5A 3O4WA 1E4GT 1RGIA 5ADXA 5AQFA 4B1VA 4E1JA 2J4RA 3MK6A 4IJAA 4CZKA 4JD2B 4B1ZA 1GLLO 4BGBA 3ENHA 3O1WA 3WXLA 2P9IB 3UKRB 4M7XA 1WOQA 2FXUA 1EQYA 5KQ8A 2D0OA 2IVNA 2QM1A 5AQLA 4BRIA 5BN8A 2WUSA 3ENOA 3AAPA 2ASMA 2YHYA 5BPMA 4FWPA 2BUPA 3R6MA 4CBXA 1BDGA 5ELZA 4AM6A 2F9TA 2QXLA 5E26A 2E1YA 2E2OA 2P9PB 2F9WA 3FFKB 2EWSA 3D2EB 3L0QA 1QZ5A 1Z05A 2HF3A 3H45C 3A0IX 4H0VB 5KQDA 3U9ZA 3BUZB 3VENA 4B1UB 2A3ZA 1GLAG 5KPZA 3FZKA 4FWNA 3H1VX 5JLHA 2ZGYA 3M6GA 4YDUC 5AZIA 3HTVA 1ZC6A 1U2VB 4AM7A 3QICA 3AAQA 3DXKB 1SAZA 4O8KA 5F1XA 1K8KA 2A6AA 3EKUA 1QHAA 2D1KA 3UKRA 4CI6A 1LCUA 3D2FB 1QZ6A 3HSCA 2E20A 1V4TA 5BR9A 5I9EB 1ATNA 3LM9A 5EVZA 3CQXA 5EOYA 3I8BA 3A5NC 4FO0A 4H5VA 1P8ZA 3LM2A 3H46O 3GG4A 2HOEA 3O6WA 4CD3A 2V7ZA 1X3NA 3W0LA 5FPMA 1T6DA 3KHYA 3MCPA 1HKGA 4BVOA 2P9SB 4CZHA 1NWKA 3C0BA 4IO8A 3ZX0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IFEA 4XH4A 4BREA 3QBXA 5KGXA 1VQPN 1WAFA 2HBJA 4CJUA 5JVGL 4B08A 3IFRA 3KLGA 4EAHD 3O3FA 2Y1IA 1T44A 4JKCA 4WQ5A 1U2VA 4EFHA 4EZ6A 4LF4K 3QEVA 1NKCA 3WUHA 3VEZA 4RWTA 1VQ8N 1VQLN 4CGJA 3MXJA 3UB5A 4OVLA 4YFUA 3OYGA 3CCQN 1EP4A 1LOTB 3ZT2A 2FSNA 5AQTA 4FJXA 1XC3A 4PKIA 3DI6A 1BI4A 1UWBA 4ZTFA 2X6NA 4HUGA 4CHYA 4E7HA 1RBSA 2DPNA 1U45A 1TKXA 1IO2A 2D0BA 3OJUA 1C0TA 4DTJA 3LP2A 5M1QA 4EIAA 3RMCA 4KH6A 3FZMA 1TKTA 1ATRA 4GVEA 1Q82O 5AZJB 1FK9A 5ADXH 4CZJA 1HYZA 4B9MA 2P9LB 4IOCL 3ID8A 4ELTA 4B1XB 5E84A 4KHWA 3A2FA 4Z4IA 4PHTX 1VQNN 1HPMA 3F2KA 2FBVA 3BZCA 3AO3A 3SCXA 3CXCM 3SBGA 1VQON 4MO5A 3LP3A 1RILA 3OJSA 4M3YA 3CI5A 1A5XA 5GAEP 2AA4A 2IC3A 3U3GA 4CW7B 2FSJA 4B3OA 2X78A 4RW8A 3LAMA 4QS8A 3TSQA 2YNGA 4XEIA 3MAQA 3SPYA 4CJ7A 1DT9A 1VSMA 3NH1A 1HNWK 1UA0A 3TAMA 3PSIA 4DTSA 5HRSA 3V81A 1N34K 2GUIA 4C8NA 1IKVA 1CXUA 4DQQA 3JSMA 2IVPA 3MX2A 2P9LA 2O8EA 5KRSA 2F8SA 5BR8K 1HQEA 5CYMA 4BR7A 2UUCK 4JI0K 5LJWA 2Z1HA 4WFNL 3O3HA 2NRHA 5M1PA 4H4OA 1TUYA 4FOEA 1OH7A 1SUQA 2D0CA 2Z1JA 3CJAA 2V7YA 1Q9YA 3VQ4A 1HKBA 3ZEUA 3V4IA 2HNYA 3CJ7A 1G15A 3OS1A 2OYQA 4K8ZA 3U8XA 4CEQA 3S3MA 4H5TA 2HHTA 5AQPA 3SK3A 4CEOA 1U49A 1VQ7N 1HNZK 2IS3A 1NJXA 4JI7K 3TSUA 4FK0A 3CQ8A 4KHPK 1WBDA 1E4FT 4CFCA 1KVAA 3PX4A 1RT6A 4DFMA 1GLBG 1SZ2A 4FWMA 3J7ZO 5EY4A 1Q9XA 3WXMB 4B1WB 1NNEA 3PIPL 2O8BA 4M3UA 1RTJA 1J5EK 4BDPA 4CZGA 1NK0A 4BE2A 4ISGA 3IAYA 2QWQA 3SNNA 3UKUA 3AA2A 4BVPA 3ZT4A 1NM1A 4FVMA 3WT0A 4IEEA 4CF8A 3F73A 3TR8A 1QVFM 1T8EA 2VGNA 2NLXA 5FRNA 1BA0A 1HKCA 1YT3A 3TAFA 2UYTA 4IOXA 3QIPA 4CESA 3T69A 4FWKA 5GINA 5BRFA 1YVUA 3MEEA 4BRQA 4KH5A 1HPZA 4JHDB 2RHKA 5DK5A 5C24A 3ZETB 3VMFB 2GELA 5AFUA 2FSKA 4M3TA 4DG1A 3DXMB 4FW2A 2QEXN 4CFDA 3ULEA 1QQOA 2ASOA 4I2PA 4DV3K 3THVA 1RDBA 4IG3A 3JYTA 4NYFA 2FF3B 4FPAA 4I9LA 4BRMA 4YY3K 4OPAA 4X64K 3PX0A 3DLHA 3C6AA 2R7YA 4CECA 5HP1A 3E1YA 5DM7L 1WSGA 5HRNA 2YV0X 1NJYA 3B8AX 1JKHA 3DMJA 4CZFA 2XY8A 2KW4A 5GIOA 3OYNA 4DV4K 1F21A 4DTUA 5AR0A 4PL8A 3QMLA 1JLQA 3CERA 1BL3A 3NH2A 3VTHA 1RT3A 1VQ5N 2I7NA 1B9FA 4U7BA 5J2NA 1NGEA 4JKGA 3CMAN 3H08A 1JLGA 1IKWA 4NLBA 4H0OA 3OYHA 3PV8A 1FXXA 2NRTA 2NRWA 1HJOA 1X9SA 2GWKA 1KLNA 4KTZA 1X3MA 3VEYA 2E2PA 3OYMA 4C8OA 2PY5A 2A41A 1ZBIA 3TSPA 4DTNA 3HT3A 4KKOA 4DS5A 3L6QA 2X74A 4BRGA 1TK0A 1OVQA 4GKKK 4HCBA 3HP9A 3A5OC 5SZTA 2P9IA 3SUPA 1NJIO 4LF8K 3VQCA 1NKEA 4IFVA 1FKPA 4FWOA 1VSLA 3A8YA 4CEAA 3RSEB 4BG8A 4BC2A 2OTLN 1QTMA 2QWPA 4H8KA 3V1QA 3HPGA 1RTHA 3TAGA 4KHNA 4B1YB 2P1JA 5FDLA 4E89A 3L2UA 4FJ5A 1RBTA 3K5NA 1CZBA 1HYVA 1QSSA 1NJWA 2CH5A 2IAJA 4XH1A 1L3SA 1S9EA 4DR2K 3WNEA 1O1WA 2NNWA 1YHQN 3T3FA 4DQSA 3BGRA 2PAVA 4DQPA 4B8AB 3NAEA 1QS4A 4G1QA 3RSEA 4ZHRA 4JNEA 3QDKA 4BWJA 4Q5VA 3CYMA 1U6ZA 4YOWA 4B3MK 1T3VA 3E01A 1CZ9A 1JCGA 3DLLL 1BA1A 2P9SA 1KFSA 2A1SA 3VQ5A 3G10A 4BG9A 4CF1A 3VEOA 4B3RK 2HHSA 1IBLK 3TABA 4DB3A 1TUUA 3P39A 4IG0A 4CIFA 2FF6A 3SV4A 4DLGA 1IG8A 3JAMO 1IBKK 2FBXA 3IDHA 2BTFA 2JGUA 2ZJPL 3U3YA 5EX5A 3O4WA 4K8XA 1M90O 3SQ1A 4IJAA 5KGWA 1GLLO 4OKKA 4BGBA 3AVKA 1WOQA 2HVHA 2Z1GA 4MDBA 3NE6A 1DLOA 2QXFA 2O8FA 2YHYA 5CYQA 4E19A 2B5JA 3K2PA 2NRXA 5ELZA 1N5YA 3IS9A 5E26A 1VRUA 2P9PB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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