3WUHA

Qri7 and amp complex
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
376
structure length
344
Chain Sequence
KGYKVLAIETSCDDTCVSVLDRFSKSAAPNVLANLKDTLDKAHIHHQARIGPLTERALIESNAREGIDLICVTRGPGMPGSLSGGLDFAKGLAVAWNKPLIGVHHMLGHLLIPRMGTNGKVPQFPFVSLLVSGGHTTFVLSRAIDDHEILCDTIDIAVGDSLDKCGRELGFKGTMIAREMEKFINQDINDQDFALKLEMPRNMLSFSFSAFITALRTNLTKLGKTPEREIRSIAYQVQESVFDHIINKLKHVLKSQPEKFKNVREFVCSGGVSSNQRLRTKLETELFNFYYPPMDLCSDNSIMIGWAGIEIWESLRLVSDLDICPIRQWPLNDLLSVDGWRTDQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferase, mitochondria
publication title Structure of Saccharomyces cerevisiae mitochondrial Qri7 in complex with AMP
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Metal binding protein
total genus 103
structure length 344
sequence length 376
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.234: N(6)-L-threonylcarbamoyladenine synthase.
pdb deposition date 2014-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00814 Peptidase_M22 Glycoprotease family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3wuhA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3wuhA01
2HMPA 3UKRA 3CHWA 3EO3A 3IUCA 1Q18A 3MN7A 4H0PA 2D0OA 4E1JA 4H0OA 1J6ZA 2P9PA 5LY3A 4H0VB 3SJHA 5BRHA 2W40A 1X3MA 3TU5A 1NBWA 5KPRA 3D2FB 5AQUA 3AARA 1ATNA 1ZBSA 3CJ9A 4H0YB 3S41A 4DHYA 4CI6A 5AQLA 4JD2A 2GUPA 1GLJO 1GLCG 2P9IB 2IVPA 3BEXA 3VERA 3TPQA 2Q31A 3ID8A 3SMPA 2J4RA 4XH4A 3HTVA 1HKBA 4BROA 3QFUA 4M63C 4I6MA 3VGLA 4MLHA 4BGAA 4CD1A 1V4TA 4B1ZA 5EXWA 1NGFA 4WQ4A 4FL9A 1K8KA 1SZ2A 5AQSA 4WYBA 4BRHA 2HOEA 1P8ZA 4A2BA 2NZTA 4O5FA 1BDGA 5BN8A 1DEJA 4CZMA 5F0XA 3VF6A 4IXCA 4QS7A 2A3ZA 2AA4A 2Q0RA 1E4FT 1V4SA 1R59O 5KQDA 4GNIA 3HI0A 2FSNA 3J8AA 3BF1A 4FWLA 2E2OA 5JLHA 4FPAA 4H0TB 2QXLA 3VGKA 3U8XA 1JCEA 3LDQA 3WEEA 2IIRA 3MN9A 2CGJA 4F9OA 5TKYA 3W3DA 1GLLO 1ZC6A 2D1KA 3W0LA 4BRDA 3BUZB 5AQRA 4NB4A 3UKUA 5AQGA 4BRFA 1HLUA 4EFHA 4BRNA 4CZKA 1X3NA 3OHRA 1LCUA 1HPMA 2E2QA 5AQMA 5AZJA 4DCHA 5E84A 4C23A 2E1YA 3SK3A 4IWVA 1GLBG 1NLVA 2ITMA 5BRDA 2Q1NA 3F9MA 2W41A 2QWMA 4CZEA 1QQNA 4BREA 4EIAA 3L6QA 4MO5A 3LM9A 4JAXA 3ZETA 2E88A 3H46O 5AQNA 1HX1A 3KHYA 3H3NO 3QDKA 3HZ6A 1YAGA 1GLAG 1NGBA 3EZWA 3O8MA 4BRMA 3LDNA 4QS8A 5EVZA 5BREA 3UB5A 1QQMA 4Y0WA 3WXKA 4HTLA 2P9NA 3O1BA 3H1QA 1BA1A 3EL2A 3GE1A 3CERA 3VOVA 2CGKA 4ISEA 5AQFA 5BRFA 1WOQA 1IG8A 3A8YA 4FO0A 4K25A 1GLDG 3WT0A 3M3ZA 3L0QA 2V51B 3C0BA 4CZHA 5BPLA 3ULEA 3ZX0A 4DB3A 4IJAA 3R8EA 4BRGA 3DXKB 4BC5A 2NLXA 5LJVA 4CD3A 4BRPA 1QZ5A 2P9LB 2A40A 5AQHA 1SQKA 2UYTA 4BRQA 4H5TA 3D2FA 3G25A 1QQOA 2QM1A 5JMVA 4RTFD 4BG8A 3D2EA 2P9IA 3WQTA 3FLCO 1YXQA 3QFPA 5AQQA 4BRKA 5AQWA 2ASMA 3BF3A 2P9UA 2Q2RA 4FPBA 2YJFA 5CE3A 3SLCA 3ZEUB 4B9QA 1NGCA 4DQ8A 2CH5A 4CJ7A 4B1VA 4BC4A 3MN5A 2V52B 4FWNA 4FOIA 4FSVA 1BOTO 1U2VB 2NRHA 2ZGYA 3H1VX 3AAQA 3AAPA 3B8AX 3UKRB 5AQPA 2YCHA 5FPEA 4RWTA 3C7NB 4CZIA 4M7YA 1CZAN 3FGUA 2HF3A 3GL1A 4FOEA 5AZIA 2P9SA 4CZFA 2YHXA 4BVOA 4CBXA 2GELA 3FE1A 2GEMA 5AFUH 4CBWA 3JXUA 3LDLA 4JD2B 1TUYA 2BUPA 2GWKA 2YHYA 3KZBA 4JHDA 4YDUC 3RSEA 3UE5A 3A0IX 3EKSA 3VEWA 3CJAA 1ATRA 1TYQA 2WUSA 2VWBA 3CI5A 1T6DA 1YVNA 3FFKB 1MWKA 2FSKA 3QICA 4AM7A 1RFQA 3FZHA 3P4IA 1JCGA 1X9JA 5AQIA 3HBTA 3ATUA 1YUWA 1IJJA 1E4GT 3VEOA 3WUHA 1U6ZA 1K8KB 4XH1A 3O6WA 4BR0A 2QWLA 5E26A 3R6MA 1NGJA 2E1ZA 1C0FA 3A5OC 3BP8A 5AQTA 2QWRA 1NM1A 5AFUA 1EQYA 3CQYA 2GTDA 1Z05A 2V7YA 4B1UB 2P9KA 1QHAA 4L3QA 2I7PA 5AQVA 5AQYA 3EN9A 4PKIA 2QW9A 1RGIA 1NGDA 5BR9A 4A61A 3KVGA 4K43A 2F9WA 3CETA 4KBOA 4ISFA 2A41A 3O80A 4MLEA 4FWSA 3FZMA 2QWOA 3H3OB 2D0PA 2E20A 3UKUB 2KHOA 1ATSA 2FXUA 1NGIA 2YHWA 5AQKA 3U9DA 2DPNA 2ASOA 1BU6O 4O8KA 5KQ8A 4WQ4C 3FZFA 4BR9A 5I9EB 5AQOA 2PBDA 3ENHA 1HKGA 4H0XB 3CJBA 4PKGA 5AZJB 4FWKA 3WQUA 3WXJA 3LDPA 3IDHA 3VENA 4K42A 3WXIA 1ZXOA 3DXMA 3M1FA 1RDWX 1H1VA 1KAYA 3DXKA 1BO5O 2E2PA 3MCPA 5AQZA 5F1XA 2I7NA 1NGGA 3ATVA 3QMLA 2E2NA 5EOYA 3ZETB 4BRCA 5KPZA 2Q0UA 3DWLA 4H5RA 3ZX2A 1DGKN 1WUAA 3VGMA 1XQSC 2A42A 2FLOA 5JICA 4IO8A 3H6EA 3O1WA 1GLFO 5FPNA 2P9NB 4A62A 4EHUA 4AM6A 5BPNA 2EWSA 4PKHA 2QWNA 4BR5A 5KPTA 3GOIA 4M7XA 2QWPA 3ZEUA 5BPMA 3A5MC 3U9ZA 1TUUA 5ADXA 5FPDA 4BQLA 1OKJA 1KXPA 1BG3A 3MMVA 4QS9A 5BN9A 2ZF5O 4IZ9A 3MK6A 4PL8A 1BWFO 3C7NA 2ZGZA 4BRLA 2V7ZA 4CZLA 3VEVA 5AR0A 4IJNA 4FWPA 1NGEA 2A5XA 4Z94A 2D4WA 3ULEB 4BR4A 3GG4A 3H45C 2P9PB 3ZX3A 3L4IA 4BRIA 1HJOA 4BC2A 3D2EB 2GWJA 4BC3A 4BQZA 3DJCA 3A5LC 3JS6A 3FZKA 1C0GA 4B1XB 4JNEA 1NMDA 1NGHA 2P9UB 4J8FA 4EAHD 5EY4A 2VYPA 1HKCA 4BR2A 2AP1A 2IVOA 5AQJA 3CJ7A 4H5NA 2ASPA 3LM2A 2HF4A 4I6MB 3VEXA 1LOTB 3HM8A 3A5NC 4BG9A 2YJEA 1GLEG 4WQ5C 2YI1A 5AZIB 4MO4A 3O08A 2IVNA 3VPZA 3HSCA 2P9SB 5F2RA 1T6CA 3EKUA 1Y64A 2FF3B 4FWQA 4FWMA 4BRAA 1JCFA 3D7EO 3VETA 2QWQA 2FF6A 3RSEB 4JHDB 4LC9B 5B8HA 2OANA 1S3XA 3CJCA 3DAWA 1TYQB 1QZ6A 4HWIA 2VCPA 5AQXA 4BR7A 1XUPO 4H5VA 3WEEB 3QBWA 3LDOA 4CZJA 4H5WA 4XEIA 1T44A 3U4LA 5LJWA 2Q97A 1ESVA 3FR0A 3I33A 5EX5A 4BGBA 5JLFA 2BTFA 1KAXA 4CZGA 4RCHA 2CH6A 1MWMA 4B1YB 4H03B 3M6GA 4FWOA 3CJ1A 1G99A 3VEZA 4PL7A 1XC3A 4ISGA 3VF4A 1BUPA 3O5BA 1Z6RA 4NO7A 4BVPA 5ELZA 4EHTA 3CIPA 4A2AA 2P9KB 1NGAA 5FPMA 3FZLA 5ADXH 1BA0A 2E8AA 3QB0A 4XH5A 1MA9B 3QBXA 2P9LA 2FSJA 2Q36A 2CGLA 3AY9A 4GY2B 4B1WB 3ENOA 1DKGD 3VEYA 3WXLA 4FWRA 4K41A 3SMSA 3IFRA 2F9TA 3MDQA 2H3GX 3GDQA 1MDUB 2PAVA 4YDUA 3I8BA 3GBTA 3CQXA 1S22A 3VF2A 3O4WA 1HUXA 3DXMB 4CBUA 3R9PA 2ZWHA 3LL3A 1SAZA 3IMXA 1D4XA 1NWKA 1U2VA 3MN6A 3VESA 2A6AA 1KAZA 4WQ5A 4JN4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3UKRA 4A5AA 3V4IA 3EO3A 3ZSZA 3VQDA 2O8BA 4CGIA 4H0PA 4O0IA 1W2BM 1J6ZA 1YTAA 2D0AA 1YI2N 2IC3A 2YNFA 3TU5A 2BH1A 4OVLA 1TK8A 5KPRA 1L3SA 3CFPA 3CC7N 4Z4EA 1HQEA 3S41A 4DHYA 4DQIA 3KK3A 3CPWM 3ID6A 1JLCA 1E3MA 2O8FB 1L3VA 1GLCG 3BEXA 4YORA 1DT9A 4NLCA 1Q9XA 3S3MA 4DUYK 4FJMA 1RT3A 4DTXA 3HTVA 3TANA 5SZTA 3VGLA 4FLVA 4I6MA 5I3UA 4BGAA 4CD1A 1V4TA 4KREA 4BDYA 1EWRA 4BWMA 2WOMA 4FL9A 1K8KA 5BN8A 1DEJA 3QEVA 1RBSA 4B9UA 2A3ZA 2Q0RA 1E4FT 4GNIA 2FSNA 2VQEK 1DLOA 3HP9A 4FPAA 5HRSA 4H0TB 4AILC 2LSNA 3OJSA 3AVGA 3WXMB 3WEEA 4C1NI 1WAFA 4F9OA 3TAFA 4Q5VA 4OGCA 5AQRA 2KQ2A 3NCIA 4ELTA 5AQGA 3AVAA 2VG6A 3QLHA 4JLHA 3SV4A 2E5LK 3J81O 2PZSA 2E2QA 5AQMA 4DCHA 3LAMA 4KHUA 4DR2K 3DOKA 1NK6A 2G8HA 3B6PA 1GLBG 4HUFA 2ITMA 3QEXA 1RDUA 4A5BA 1OH8A 4X65K 2BDPA 5FDLA 1LV5A 1BI4B 1QQNA 4GKKK 1KFDA 3T7ZA 3L6QA 4JAXA 3SPYA 5AQNA 4EP4A 1HX1A 2B5JA 3ZSXA 4E1NA 1NJXA 2G8VA 3RR7A 1Q9YA 3LWMA 1YAGA 3JAMO 2W42A 1IG9A 1I39A 4JI1K 3UB5A 4Y0WA 3NH2A 1Q7YO 4I9LA 2P9NA 1QS4A 1CLQA 3GE1A 4ISEA 1WOQA 5LL6Z 1K6YA 4MDAA 5DM6L 4K8ZA 1B9DA 3WT0A 4XIUA 2V51B 3C0BA 4CHPA 4LF4K 5BPLA 1QTMA 4IDKA 4LSLA 4DB3A 1YHQN 1DTTA 2IAJA 1J54A 4CECA 2YHAA 3QIPA 4CJEA 4BRPA 2P9LB 4CEEA 2UYTA 3LDSA 2QM1A 4JKGB 1BIZA 1TL1A 1Z26A 3NGYA 5BR8K 4G9ZA 3KLIA 4RG8A 3SUOA 1VK0A 2Q2RA 4DSJA 4FPBA 2ZQBA 3PSIA 3SLCA 4CEAA 1NGCA 4DTJA 2CH5A 4CJ7A 3TI0A 1D9DA 2FC0A 4BC4A 4FLTA 3MWPA 3HK2A 3AGKA 2QKKA 1U2VB 4N47A 3H1VX 4B8AB 3AAQA 2YCHA 3NVMA 3O9SA 3GL1A 4FOEA 3TWHA 2P9SA 4CZFA 3HYFA 1LWEA 4DQSA 3JXUA 4W5RA 2XRIA 3TABA 3LDLA 3CMEN 4PA1A 2BUPA 2YHYA 4YDUC 4NYNA 3UE5A 4DFJA 2QEXN 2ZM6K 1QVGM 2D0BA 4DTMA 3FFKB 4PY5A 1RFQA 1Y97A 3P4IA 4M3XA 2G8FA 5KI6A 1Q86O 3HBTA 1KFSA 3OYLA 4CE9A 3RRHA 4JRQA 3CC4N 2QWLA 1TVRA 3CMAN 4OO1J 1YF5L 1U04A 3O9UA 5H1SQ 1OH7A 2QWRA 5AFUA 2V7YA 2HHTA 3J80O 1TGOA 3EN9A 2QW9A 1NGDA 3DLGA 5BR9A 5T7BA 3KVGA 1YT3A 3CETA 3CG7A 4ISFA 3PSFA 3P38A 3CCRN 2ZJRL 4N5SA 3KD1E 3UKUB 1ZBIA 1ATSA 4BDZA 1KTQA 3T19A 3HPHA 3C95A 4WQ4C 4X66K 2A1SA 2W6LA 1RTHA 3FZFA 3T1HK 1EO1A 1LW0A 3O4NA 1YITN 4KHNA 3ENHA 3WQUA 4X64K 4NCBA 3MEDA 5M1PA 1TAUA 1SUQA 3IDHA 2E6LA 4IO9L 1ZXOA 1RDWX 5CZ2A 1KAYA 4E7LA 2E2PA 1ASUA 2G8KA 4CJFA 4OKJA 5AQZA 2HHUA 1RBTA 3E9OA 3P1GA 2E2NA 3PY8A 1NKEA 1VSMA 3QNOA 4FK2A 1RDAA 3DWLA 2VG5A 3THWA 3TAMA 2F4VK 1J53A 1RDDA 4WCEL 3IG1A 4HUEA 4IO8A 1ITGA 1S1TA 3E01A 1VQ8N 4O55A 1RTIA 3AO1A 3DMJA 1OH5A 1L5UA 3LALA 4ELUA 2D0CA 4BR5A 3ZT4A 4B9LA 1C1AA 3KLEA 2RHKA 3A5MC 3U9ZA 1TUUA 4KHSA 4NXNK 4BQLA 4CJSA 1N36K 3MMVA 4QS9A 4B3RK 1ASWA 3LP2A 4FJLA 2ZF5O 3MK6A 2ZGZA 3CQ8A 4BRLA 2A1RA 3V6DA 3EYZA 5AR0A 1JKHA 4LF6K 4NXMK 2F8SA 4DR5K 3WNFA 3NH1A 3IKMA 2P9PB 3KKRA 4BRIA 3AO5A 3MCAB 3R1XA 4BQZA 2JWLA 3A5LC 3JS6A 4AHVA 4ILGB 3BZKA 1C0GA 4JNEA 3CCJN 1NMDA 3EE9A 4GW6A 1NKBA 4J8FA 1VQKN 2VYPA 3SNNA 1HKCA 4BR2A 2X74A 3SQ1A 4CFCA 5KRSA 2ASPA 2DTUA 3NVKA 5IWAK 4WFBL 1K8AO 2XHBA 3OYNA 3HM8A 3A5NC 1NNEA 3OYJA 4AHTA 1S1XA 1Q82O 1GLEG 4MO4A 1UA1A 3SYZA 4FWQA 4BRAA 2GUIA 1YIJN 3DI6A 1JCFA 4HTUA 3D7EO 3K9KA 2FF6A 3RSEB 4JHDB 4FVMA 4Q0BA 3DAWA 5C12A 3NF8A 1S72N 4DV2K 3LPUA 3QBWA 4E7HA 1KLNA 1RDBA 4CJPA 3DLEA 3N4PA 4XEIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2NNW A;  4HWI A;  4OLA A;  3WEE B;  4BY9 C;  4LH5 A;  4FM1 A;  4V19 S;  4CZJ A;  4H5W A;  2IOC A;  4KHW A;  2P5O A;  2YKM A;  5FLX O;  1ESV A;  3I33 A;  3KIO A;  3VA3 A;  2BTF A;  4CZG A;  2UXB K;  4H4M A;  3R3L A;  1BCM A;  4B1Y B;  4KI4 A;  3M6G A;  4M3Y A;  1A5X A;  4F2S A;  4YOW A;  1XC3 A;  1LWC A;  3VF4 A;  4NO7 A;  4EHT A;  1RCH A;  1IKV A;  3SV3 A;  2WTU A;  1HNV A;  2OPR A;  3SAH A;  3SPZ A;  3FZL A;  4OPH A;  2NRT A;  4B9V A;  1BA0 A;  3AVC A;  2E8A A;  2O8E B;  4XH5 A;  4O5B A;  2CGL A;  1KSP A;  4FJJ A;  4GY2 B;  5M1N A;  3KK2 A;  4B1W B;  1XMQ K;  2BE2 A;  4HHT A;  3VEY A;  3WXL A;  1W97 L;  1OH6 A;  3SMS A;  3IFR A;  2QI2 A;  4O4G A;  1ZBH A;  2VGM A;  2NRZ A;  2PAV A;  4C8N A;  4YOT A;  1GOA A;  2KFZ A;  3TAQ A;  4N41 A;  3SUP A;  3IMX A;  4CW7 B;  1NU0 A;  1NWK A;  3K0S A;  3VES A;  2HHH K;  3AO3 A;  1Q8I A;  4QAG A;  5M1Q A;  4JN4 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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