3WUHA

Qri7 and amp complex
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
376
structure length
344
Chain Sequence
KGYKVLAIETSCDDTCVSVLDRFSKSAAPNVLANLKDTLDKAHIHHQARIGPLTERALIESNAREGIDLICVTRGPGMPGSLSGGLDFAKGLAVAWNKPLIGVHHMLGHLLIPRMGTNGKVPQFPFVSLLVSGGHTTFVLSRAIDDHEILCDTIDIAVGDSLDKCGRELGFKGTMIAREMEKFINQDINDQDFALKLEMPRNMLSFSFSAFITALRTNLTKLGKTPEREIRSIAYQVQESVFDHIINKLKHVLKSQPEKFKNVREFVCSGGVSSNQRLRTKLETELFNFYYPPMDLCSDNSIMIGWAGIEIWESLRLVSDLDICPIRQWPLNDLLSVDGWRTDQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Metal binding protein
molecule keywords tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferase, mitochondria
publication title Structure of Saccharomyces cerevisiae mitochondrial Qri7 in complex with AMP
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 103
structure length 344
sequence length 376
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.234: N(6)-L-threonylcarbamoyladenine synthase.
pdb deposition date 2014-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00814 Peptidase_M22 Glycoprotease family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3wuhA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3wuhA01
3CJAA 5JICA 2GWKA 1X3NA 1IG8A 2IIRA 2ZWHA 4CZLA 3VESA 1U2VB 3H1VX 3SMSA 1QHAA 4BRHA 3UE5A 2DPNA 5JLHA 5EVZA 2CH6A 4MLHA 1NWKA 2P9SA 3DXMB 2H3GX 2QM1A 3RSEA 3R6MA 1KAXA 3GL1A 3W3DA 4IZ9A 3UB5A 3U9DA 1X9JA 3AAQA 5BN8A 4FWMA 4GNIA 3WXLA 1ZXOA 3IFRA 2GTDA 2BTFA 3WQUA 3AARA 3VGLA 2NLXA 2CGJA 2I7PA 3L4IA 3ZX0A 1YVNA 4I6MA 5AQFA 5AQHA 4H5WA 5AFUH 3VF6A 5KPRA 5LJWA 2P9NB 4FWNA 4JN4A 4E1JA 3O80A 3UKUB 4CJ7A 3ZEUB 2A6AA 3MMVA 1Q18A 3DWLA 3VEXA 4CBUA 3SK3A 5AQXA 3R8EA 4CZEA 4BROA 3WXKA 4PKHA 2ZGYA 2P9KB 2FSKA 3VENA 1D4XA 4FOEA 4BRGA 3BP8A 2E2PA 2AP1A 2P9IB 4K43A 4HTLA 4BRCA 3EL2A 2IVOA 4NB4A 3SJHA 4MO5A 1HUXA 1S22A 2AA4A 2HF3A 2E8AA 4CI6A 4BC2A 4ISFA 2PAVA 1JCEA 3VERA 1TUYA 5AFUA 3H3NO 3B8AX 2FSNA 4BG8A 3M1FA 3GOIA 5BN9A 5F0XA 1NGFA 3HM8A 3A5OC 4FPAA 3M6GA 3O6WA 1BA0A 2FF6A 3RSEB 3WEEA 3FLCO 1WOQA 3TU5A 3AAPA 3GDQA 4HWIA 4BG9A 2ASMA 3D2FA 4M7XA 3FR0A 4FO0A 3A0IX 4CZIA 4CZMA 1KXPA 3BF1A 1JCGA 1H1VA 3QFPA 4FSVA 1WUAA 5BRDA 1BDGA 3AY9A 3J8AA 5BPNA 5AQRA 4CZHA 3VETA 2IVNA 4I6MB 2QWMA 4ISGA 1NGAA 1IJJA 1SQKA 3G25A 3L6QA 4FWKA 1XUPO 2YHWA 4FWSA 2GEMA 3I8BA 2E1YA 3H6EA 5AQVA 5BRFA 4FWRA 4FWOA 3LM2A 1QZ5A 3U4LA 4BRPA 1C0FA 3H46O 2E2QA 5KPZA 3H1QA 5BREA 1QQMA 4H0YB 4IJNA 1DGKN 4IWVA 2P9PA 4B1XB 2A41A 4BRIA 2VYPA 4FWLA 3QICA 2YHYA 2V7ZA 1RGIA 1TUUA 3A5MC 4ISEA 3CETA 3WT0A 4AM6A 3JXUA 3LDNA 2GUPA 4BVPA 3QB0A 1TYQA 4B1VA 1X3MA 2CGLA 3QMLA 5AQJA 1NGHA 1NGEA 3IUCA 4A2BA 5AQYA 4Z94A 4MO4A 4DB3A 4WQ5C 1XC3A 4YDUA 4EAHD 3ULEB 3VF4A 1HX1A 5EOYA 2P9LA 2Q1NA 3H3OB 3WEEB 2F9TA 1CZAN 4LC9B 4CBXA 4FL9A 1ATSA 3QBWA 5KPTA 3F9MA 4BRDA 3D2FB 4BREA 3VPZA 3WUHA 4NO7A 4BRNA 1HKCA 5CE3A 4BVOA 1Z05A 4DCHA 1J6ZA 1HPMA 4CD3A 2CH5A 2FF3B 3HZ6A 5LY3A 3HSCA 3VEZA 2QXLA 3MN9A 4B1YB 3A5LC 3C0BA 1T6CA 4IJAA 2P9UA 2D0OA 5AQIA 3HBTA 1E4GT 4WYBA 3CJ1A 2HF4A 5BR9A 4L3QA 4K25A 2ZGZA 2FXUA 3FFKB 1QQNA 3CJCA 4FWQA 1NGJA 2YHXA 1GLFO 2D4WA 5AQSA 1JCFA 1BWFO 2ASOA 1HKBA 4BR9A 3U9ZA 5KQ8A 2YJEA 3BF3A 4H5VA 4PL8A 2V51B 5E84A 4BR0A 5BPMA 2Q31A 1LOTB 1GLLO 4FOIA 2V52B 1C0GA 3LDOA 4WQ4C 4JHDA 3UKRA 1QZ6A 3S41A 4BC4A 5TKYA 1GLCG 3BUZB 3KVGA 2ZF5O 1E4FT 4B1UB 1TYQB 1NGBA 1Z6RA 5EY4A 3DJCA 4CD1A 1K8KA 2P9SB 2QWQA 3CQYA 3EZWA 3ATVA 3M3ZA 3EKSA 4IXCA 3O8MA 5AZIA 5F2RA 2P9LB 1DKGD 4O5FA 3C7NA 2E2OA 3W0LA 5I9EB 5E26A 2GELA 3VEYA 3VEWA 5BPLA 4BC3A 5ELZA 1LCUA 1V4TA 3A8YA 3SMPA 4BQLA 1RDWX 4A61A 5EXWA 3QBXA 3DXKA 3CJ7A 2Q0UA 3O08A 5AQUA 1Y64A 2P9UB 2YCHA 2W41A 1GLAG 2VWBA 2QWRA 4XH1A 2Q2RA 4QS7A 2D0PA 5AQZA 3ZX3A 1S3XA 3FZMA 4JD2A 4JAXA 2OANA 4BR5A 3P4IA 1XQSC 5FPEA 1YXQA 3CJ9A 3VOVA 4RWTA 3MDQA 4O8KA 4H5TA 5AQOA 1ZBSA 4A62A 3JS6A 2P9NA 2GWJA 3HTVA 1ATNA 1T44A 3UKUA 4BR4A 4B9QA 2W40A 2E20A 2IVPA 1OKJA 4H5NA 2E2NA 2CGKA 5AZJA 1NGGA 2A5XA 4BC5A 4BRKA 5AQNA 4JHDB 3UKRB 1SZ2A 4BGBA 4XH4A 5LJVA 2D1KA 1NM1A 3U8XA 1SAZA 3VEOA 3WQTA 3FZFA 4A2AA 1K8KB 3MN5A 3LDLA 3KZBA 5EX5A 2YJFA 4BRAA 3LM9A 3GG4A 5AZIB 1ATRA 5BRHA 3C7NB 4EFHA 5AQMA 1NGDA 2EWSA 4DQ8A 4JNEA 3SLCA 2QWLA 2FSJA 1HJOA 1T6DA 4EHUA 4IO8A 5AQPA 1GLBG 2A40A 1BA1A 2PBDA 3OHRA 4QS9A 4BR7A 4FPBA 3R9PA 4J8FA 4C23A 4GY2B 4WQ5A 2ASPA 4PL7A 3CJBA 1YAGA 3D2EA 3DXKB 2E88A 2QWNA 3BEXA 3ATUA 5F1XA 1MWMA 2V7YA 3FE1A 4K41A 3FZHA 4Y0WA 4H0OA 4JD2B 3FZKA 4FWPA 3ZETA 4BRQA 5JMVA 1RFQA 2NRHA 2Q0RA 4XEIA 2YI1A 3L0QA 4BQZA 3CI5A 1ZC6A 5FPMA 2P9PB 2BUPA 4BRMA 4BRFA 4MLEA 2F9WA 3WXJA 3O1BA 5AZJB 2HMPA 2E1ZA 1BG3A 1QQOA 4B1ZA 4CZFA 4QS8A 4AM7A 4B1WB 1MWKA 5JLFA 2UYTA 1BU6O 3CERA 5ADXH 3O5BA 1NMDA 5AQGA 3VF2A 1KAYA 2A42A 3H45C 1MA9B 3EO3A 2NZTA 3MK6A 4H0XB 4H0VB 2HOEA 4H03B 5B8HA 3WXIA 3VGKA 1ESVA 3VGMA 4PKGA 3ENOA 3MN6A 1U2VA 3LDPA 3QDKA 4WQ4A 3O1WA 3EKUA 1MDUB 1EQYA 4EIAA 3TPQA 3DXMA 1BUPA 2KHOA 3CHWA 4H0TB 5KQDA 3ULEA 1GLDG 4EHTA 5FPNA 5AR0A 2A3ZA 3ZX2A 1HLUA 4BRLA 3MCPA 3D2EB 4CZGA 3LL3A 5AQKA 2Q36A 5FPDA 3KHYA 5ADXA 2WUSA 1NGCA 2QWPA 3IDHA 3IMXA 4RTFD 3ENHA 1P8ZA 5AQLA 4H0PA 5AQQA 4BR2A 2QWOA 3D7EO 3ZETB 4K42A 2Q97A 4CZKA 3HI0A 1DEJA 3MN7A 3ZEUA 4CZJA 3FZLA 4H5RA 3QFUA 3DAWA 4RCHA 4XH5A 3CIPA 1GLEG 1KAZA 3A5NC 2FLOA 2QW9A 4M63C 4M7YA 3I33A 2P9KA 4BGAA 1BOTO 3EN9A 5AQTA 2I7NA 1R59O 3GE1A 3LDQA 3CQXA 1NLVA 1G99A 3FGUA 2P9IA 3GBTA 4YDUC 4F9OA 1GLJO 2J4RA 4PKIA 4KBOA 5AQWA 3O4WA 1NGIA 1BO5O 3VEVA 4DHYA 1U6ZA 2VCPA 3ID8A 1HKGA 1NBWA 1YUWA 2ITMA 4CBWA 1V4SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CQ8A 5JICA 1X3NA 3VESA 4JV5K 2DPNA 3QEWA 1NWKA 3DXMB 4M3YA 3TTFA 1CZBA 3RSEA 2QM1A 3NH1A 1RBVA 3K5LA 2RE2A 3ISNC 3L2VA 3SUOA 3GL1A 1VSIA 3W3DA 4IZ9A 3UB5A 3K5MA 4FK4A 4GV6A 5EU7A 4B3OA 2GTDA 5JVHL 2IGIA 3VGLA 4PA1A 3SUNA 2ITGA 1KRPA 3PX4A 4FJKA 3F9KA 4H5WA 3CXCM 4E1JA 3O80A 1WSJA 1SS6A 4CJ7A 2NRXA 3O9UA 1Q9XA 3VEXA 4CBUA 2P5GA 5C15A 4IO9L 3EE9A 4LF4K 3MX5A 3WXKA 4R5PA 3QESA 2XY7A 4BWMA 2FSKA 2RKIA 1JL2A 3KK3A 1O13A 2P9IB 1S1TA 2KW4A 4DR5K 5J1EA 3CC2N 4DLGA 2OA8A 1HUXA 1S22A 4M3ZA 4CI6A 1GOBA 4BC2A 3NGIA 1JCEA 2QTDA 3HP9A 4Z4CA 5FRNA 5AFUA 4OPKA 2F8SA 3B8AX 2BDPA 4FJ5A 3PO5A 5TKWA 2KZZA 1NGFA 1XI1A 3HM8A 3A5OC 3M6GA 2F8TA 1RT1A 3WEEA 1RT4A 3HPGA 3FLCO 5HRPA 3TU5A 3GDQA 1VQMN 4YOWA 4BG9A 3QNOA 1EX4A 1N36K 4CF1A 3VA3A 1YJNN 4OJRA 1VSKA 2Z1HA 1CZ9A 3QFPA 4LSNA 1JLAA 1BDGA 3QERA 2WTUA 2OPSA 3SZ2A 4I6MB 1J9AA 3LWMA 3QO9A 4PHTX 1S72N 4FWSA 1I3AA 1R0AA 1YVUA 3SV3A 4E7JA 2E1YA 3H6EA 3O3GA 5BRFA 3RRGA 4BRPA 2HHWA 2QI2A 2XO7A 1A5VA 4CHYA 1YTAA 3T1YK 4DSLA 5BREA 1QQMA 4FZZA 4H0YB 4IJNA 2P9PA 3NCIA 1C0MA 4FWLA 4DSJA 3MXJA 1LAWA 4ISEA 1K8AO 4AM6A 2NNWA 2XRIA 4QOZB 3KK7A 4B1VA 1SKWA 1NNEA 2CGLA 4JKEA 4KHYA 2IAJA 3ZCMA 4QCLA 1U04A 4A2BA 1UAXA 3HT3A 4MO4A 4U7BA 1HX1A 4DF8A 4LC9B 3TSUA 5C24A 4FL9A 1OH8A 5HROA 4E3SA 3QBWA 4BRDA 3U3GA 4BREA 4JI1K 4CK1A 4Z0UA 4CK2A 1J6ZA 4CD3A 2OPRA 4CJKA 5C0YA 5LY3A 4E19A 2UUBK 1L3VA 2QXLA 4BACA 1BI4B 4DV0K 4FLYA 2X6SA 4IOCL 3V6DA 1E4GT 4WYBA 1VQ6N 2HF4A 4JKBA 3LDSA 3DLHA 2ZGZA 2FXUA 3LALA 4FWQA 1NGJA 1S9GA 2YHXA 2WFBA 5C12A 1LWCA 1BWFO 5DM6L 4DQRA 3SPZA 4KB0A 1HKBA 3J7YP 4KTZA 5KQ8A 4PL8A 5E84A 3ZSRA 2YHBA 1NK4A 2NRZA 1KTQA 4LH5A 4ILHA 4CEDA 2ZF5O 4B9SA 3VA0A 4B3SK 4JK8A 1VQ4N 5EY4A 4C8MA 3E66A 3JSMA 2P9SB 3NE6A 3CQYA 4LF8K 4DLEA 3ENBA 3TAQA 3OS1A 3CPWM 4MDBA 4FM0A 3THYB 3CMEN 3DOLA 4N41A 1TK5A 4CHNA 3ZT2A 5E26A 1IH7A 5BPLA 1TL1A 3WNFA 1V4TA 2HBJA 4FLWA 3V1OA 3HM9A 3VMFB 1RDWX 2UXCK 3T69A 4DUZK 1J5EK 4J2DA 3DI6A 5GINA 3DRSA 3CJ7A 1T05A 3O08A 5AQUA 2QWRA 4DR2K 5T7BA 1CXQA 1TKDA 3I0SA 3OBYA 5AQZA 4KPYA 3KWGA 4JAXA 4BR5A 1XQSC 4DU1A 1YXQA 3CJ9A 3VOVA 4O8KA 4DTXA 1IBMK 5AQOA 1ZBSA 1S6QA 1ZBUA 3JS6A 3OYNA 1T44A 1X1PA 4BR4A 3V1RA 2E20A 2IVPA 4H5NA 4DV4K 3CCLN 1LW2A 2A5XA 4BC5A 3C6AA 5AQNA 3UKRB 4CFBA 4LD0A 5GIPA 4XH4A 1K73O 2B5JA 4CJEA 5LJVA 1RTJA 1ITGA 3VEOA 4YOYA 3V9WA 1WNSA 3OJSA 4A2AA 3A2FA 3CCEN 4Z4FA 3HXMA 3GG4A 3DOKA 1DTTA 4NYFA 5AZIB 2ZJPL 4M3RA 1TKXA 2KQ2A 4EFHA 4DQ8A 1S1UA 1C1BA 2A40A 4BR7A 4DV1K 1VQ9N 1XNQK 1S6PA 4GY2B 1VK0A 4WQ5A 1WB9A 1IV0A 3I55N 4IEEA 4OKJA 2ZM6K 3FFIA 3MX2A 1TGOA 5M1NA 3CCJN 1NKEA 3AO2A 2HB5A 2KFNA 4H4OA 4H0OA 4JD2B 4FWPA 2UU9K 3ZETA 5JMVA 2OTLN 3IAYA 4DS4A 1S5JA 3QEXA 3SQ2A 4BQZA 1HJRA 2NUBA 3CI5A 1ZC6A 5FPMA 1M90O 4H4MA 3C6TA 5KRTA 5AZJB 1N33K 2E1ZA 4EZ9A 4B1ZA 2HSTA 3OYCA 1HNIA 1L3TA 1HYZA 1C0UA 3EYZA 4DMNA 3O5BA 1VSLA 1EETA 1NMDA 3Q7BA 1YHQN 3H45C 4IFEA 1MA9B 3NMUA 3NH0A 3EO3A 4H0VB 4EP4A 5B8HA 4DKWA 4B9MA 3TARA 5DMRA 3MN6A 1U2VA 3LDPA 3QDKA 3O1WA 1EQYA 4EIAA 2DFHA 1EKEA 4BE1A 1ZYQA 4FK2A 3CHWA 4RW7A 3ULEA 1DLOA 2JGUA 4CECA 3ZX2A 3SQ4A 1NK9A 1RTDA 1RTIA 3D2EB 4CZGA 4JS5A 4BE0A 3LL3A 3E1YA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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