2YI1A

Crystal structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetyl mannosamine 6-phosphate and adp.
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
313
structure length
308
Chain Sequence
GTLSALAVDLGGTNLRVAIVSMKGEIVKKYTQFNPKTYEERINLILQMCVEAAAEAVKLNCRILGVGISTGGRVNPREGIVLHSTKLIQEWNSVDLRTPLSDTLHLPVWVDNDGNCAALAERKFGQGKGLENFVTLITGTGIGGGIIHQHELIHGSSFCAAELGHLVVSLDGPDCSCGSHGCIEAYASGMALQREAKKLHDEDLLLVEGMSAVGALHLIQAAKLGNAKAQSILRTAGTALGLGVVNILHTMNPSLVILSGVLASHYIHIVKDVIRQQALSSVQDVDVVVSDLVDPALLGAASMVLDYT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords BIFUNCTIONAL UDP-N-ACETYLGLUCOSAMINE 2-EPIMERASE/N-ACETYLMAN
publication title Crystal Structures of N-Acetylmannosamine Kinase Provide Insights Into Enzyme Specificity and Inhibition
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 106
structure length 308
sequence length 313
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2011-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yi1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yi1A02
5AQXA 3MK6A 4FWKA 3WQUA 3VEWA 1S22A 4FWQA 1XC3A 4M63C 1E4FT 4BR2A 5AQWA 3ID8A 2A5XA 2CH6A 3ZEUB 2D4WA 4BRMA 3CIPA 2GUPA 3I33A 2I7NA 4CI6A 2E1ZA 5F2RA 4HWIA 3W0LA 3D2FB 4BVPA 1GLJO 3B8AX 3HBTA 4H5TA 4DQ8A 2Q0RA 4FWSA 5BR9A 2ZGYA 1EQYA 3AAPA 3U9ZA 4JD2A 3MN6A 3A5NC 2Q36A 1MA9B 4H0PA 3MMVA 1OKJA 4PKIA 5EXWA 5EX5A 4NB4A 5BPLA 2QWLA 2HMPA 2UYTA 4BRHA 4CZIA 3ATVA 2ZF5O 1HJOA 1TUYA 2WUSA 2P9SA 3SLCA 3FZHA 4A2AA 1T44A 4BRPA 3U9DA 3H3OB 5AQNA 3LDQA 1NMDA 4DHYA 3DAWA 3GL1A 5TKYA 4BR7A 2FF6A 2QWMA 3O4WA 4BVOA 3M6GA 3SMPA 4BRFA 2IVPA 4FOEA 3CETA 2YHXA 1K8KA 4FSVA 4H5VA 2A3ZA 1HLUA 4JHDA 3D7EO 2F9TA 4BG8A 3EKSA 1T6DA 4YDUC 4B1YB 2DPNA 4MLEA 4O5FA 5AFUH 1TYQA 3U4LA 4FPBA 4H03B 3HI0A 4A61A 1V4TA 3I8BA 1HKBA 2E88A 1NLVA 3GBTA 5AQPA 3HZ6A 2PAVA 1IJJA 3DXKA 3MN7A 3EZWA 4FOIA 5ELZA 4BRCA 4RWTA 3FZFA 3ZX3A 5AQLA 4HTLA 3O1WA 2P9IB 2QWRA 2P9UA 3UKUA 4FPAA 3S41A 3FGUA 5AZIA 1NGIA 1YXQA 1U2VA 3MDQA 3CQYA 4ISGA 5F1XA 3J8AA 3WXLA 3CHWA 4FWNA 5BN8A 2QM1A 5FPMA 3VEZA 1SAZA 1HPMA 3H46O 3CJCA 3WXJA 3DJCA 4BRGA 3LM2A 1BUPA 1RFQA 2E1YA 3VGLA 3KZBA 3IUCA 1ESVA 1SQKA 1GLAG 5AQJA 5LJVA 5AQFA 5BRFA 1BO5O 1QZ5A 4WQ4A 2GTDA 2AP1A 5AQQA 3ZX0A 5AQRA 3SMSA 3IFRA 4B1WB 5FPNA 4MLHA 2P9KB 1DKGD 3HSCA 5AQTA 1LOTB 4M7XA 3HM8A 3OHRA 1SZ2A 1BWFO 2QWQA 1D4XA 3WEEB 3O8MA 3VETA 4LC9B 3BF3A 3ULEA 5LY3A 4Z94A 5BRHA 4PL7A 3L4IA 3LDLA 4FL9A 1J6ZA 5BPNA 2HF4A 1X3MA 5CE3A 4IXCA 5AQZA 1LCUA 2D0OA 1C0GA 3VEOA 3CERA 1NWKA 3FZLA 2FLOA 3O1BA 4CZFA 3H6EA 2E2OA 4MO4A 3A5LC 4FWMA 4Y0WA 3ZEUA 4ISFA 1MWKA 1XQSC 3DXMB 5AR0A 3QICA 4EHTA 3D2FA 4FWLA 1GLBG 4BRNA 2YJFA 3CJAA 4DCHA 4H0VB 3FR0A 2YCHA 4FWRA 1XUPO 3H1VX 1YUWA 3AARA 3VESA 3VPZA 4BQLA 3VF2A 1QHAA 4CBXA 4RCHA 4BROA 4CJ7A 1U6ZA 3VOVA 3AY9A 3H1QA 4GNIA 3RSEB 5AFUA 2I7PA 3GE1A 5KPRA 1S3XA 3H3NO 1NGBA 3MN5A 4CZGA 4EIAA 2J4RA 2P9SB 3G25A 3CJ9A 2Q0UA 2Q97A 5LJWA 3A5OC 1WOQA 2OANA 1TUUA 4K43A 1WUAA 1HKGA 2ZWHA 3GDQA 4BRQA 1R59O 2CH5A 3C7NB 3CJ7A 1CZAN 3C0BA 5AZJB 4QS8A 2AA4A 5KQDA 1ZBSA 2BUPA 1Y64A 3VENA 4CZKA 3VF6A 5AQKA 3WT0A 1NGGA 1ATSA 1QQMA 4CZMA 4BC3A 1NGAA 4CZLA 3UKRB 3WXIA 4JN4A 3D2EB 3ZETB 4E1JA 2YHWA 3R6MA 3WUHA 2P9IA 3DXKB 2W40A 2E2NA 3GOIA 3JXUA 5BPMA 3CI5A 5KQ8A 3VF4A 3QBXA 3CJBA 1ATRA 2P9PB 4H5WA 4CZJA 5BRDA 3IMXA 4WQ4C 2P9UB 2E2PA 3UKUB 4WYBA 2E20A 2Q1NA 5AQUA 4BGAA 1ZXOA 1RGIA 4BRKA 3WXKA 2KHOA 4BREA 3FFKB 1HKCA 3O5BA 4BRLA 2FSNA 4CZHA 3ENHA 2FF3B 2PBDA 4A62A 1QQOA 4PL8A 4H0XB 1ATNA 2ZGZA 3QFUA 5JLHA 2VCPA 4H0OA 3VERA 5ADXH 3TPQA 3UE5A 2QWOA 4BGBA 1IG8A 2EWSA 2NLXA 2HF3A 1JCFA 2A40A 4XH5A 4H0YB 3FZKA 4F9OA 2P9LB 5F0XA 4QS7A 4XH1A 4BC4A 2P9KA 5AQYA 3LM9A 2P9NA 1X9JA 1KAZA 3AAQA 4EFHA 4BQZA 2F9WA 4CD1A 4I6MB 4JNEA 2H3GX 2E2QA 4BRDA 4WQ5A 1BOTO 3R9PA 2ASOA 2D1KA 2ASMA 4EHUA 4C23A 2CGJA 2VWBA 4B1VA 4BR9A 3R8EA 1Z6RA 2IIRA 3O80A 1NGHA 3QBWA 5KPTA 1ZC6A 2CGLA 1KAYA 3BUZB 3F9MA 4QS9A 4A2BA 2GWJA 4RTFD 1G99A 4BR4A 1NM1A 3ZX2A 1BG3A 1T6CA 2Q2RA 2ASPA 2QWNA 3DXMA 4GY2B 5AQMA 3IDHA 4IJNA 5AQOA 4B1ZA 3LL3A 2QW9A 2D0PA 3QDKA 4BR5A 2A6AA 3EO3A 4JAXA 4JD2B 2FSKA 3VGKA 2GWKA 3TU5A 1H1VA 4BC2A 3DWLA 4H5NA 4FWPA 3VEXA 2A41A 4IZ9A 2IVOA 4O8KA 4CZEA 5JMVA 3JS6A 3MN9A 3FLCO 4XH4A 3RSEA 2YI1A 4MO5A 1GLLO 1KAXA 3VGMA 1DEJA 3KVGA 1RDWX 1DGKN 2V7YA 3EN9A 1GLDG 5BN9A 2Q31A 3C7NA 1K8KB 1MWMA 1QZ6A 2FXUA 4M7YA 1GLEG 3WQTA 2QXLA 3KHYA 3CQXA 4JHDB 5AZJA 3FE1A 2GELA 4XEIA 3L6QA 5EOYA 3GG4A 3VEVA 3W3DA 1JCEA 4K41A 1NGDA 1TYQB 2HOEA 2QWPA 4NO7A 1YAGA 5AQGA 5E26A 2YHYA 3UKRA 4B1UB 5KPZA 4B1XB 2NRHA 3BEXA 3D2EA 4H0TB 1X3NA 2CGKA 2BTFA 4K42A 5AQSA 3ZETA 1Z05A 3UB5A 3A0IX 1QQNA 1E4GT 1BU6O 3MCPA 1NGFA 1GLCG 2FSJA 4PKHA 4YDUA 4AM6A 1GLFO 5AZIB 3EL2A 2P9PA 3O08A 1U2VB 4CBWA 5ADXA 1P8ZA 1NGCA 5BREA 3EKUA 1BA1A 3SK3A 2A42A 4BG9A 3SJHA 3BP8A 3BF1A 1MDUB 2YJEA 5EVZA 4K25A 2E8AA 4J8FA 4B9QA 3H45C 3ATUA 5FPEA 2NZTA 3LDOA 3QFPA 2IVNA 4CD3A 5I9EB 4DB3A 1HX1A 3L0QA 2V7ZA 4AM7A 4BRAA 1YVNA 4BRIA 3QB0A 4IJAA 1BA0A 2V51B 4WQ5C 1Q18A 3QMLA 4IO8A 4BC5A 5AQHA 3VEYA 3A8YA 1NBWA 3LDPA 1KXPA 4ISEA 2V52B 2GEMA 4L3QA 4IWVA 1HUXA 4PKGA 5E84A 1BDGA 3M3ZA 4FWOA 2P9LA 2W41A 3WEEA 3O6WA 3FZMA 3M1FA 3LDNA 5AQVA 2ITMA 5B8HA 3U8XA 3A5MC 1NGJA 3HTVA 4KBOA 1V4SA 4I6MA 5AQIA 2P9NB 4EAHD 3P4IA 1NGEA 3ULEB 3ENOA 5EY4A 4CBUA 1C0FA 3CJ1A 2VYPA 5FPDA 1JCGA 4BR0A 5JICA 5JLFA 4FO0A 4H5RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AA4A 4KTQA 4C1NK 1RBVA 4AHVA 5C25A 3ID8A 1LWEA 3MECA 5D3GA 4C8NA 4CJTA 1TAQA 1T7PA 2GUPA 2I7NA 5F2RA 4HWIA 4O44A 4CJWA 4H5TA 2Q0RA 5CY4A 3NGYA 1ASWA 4AQYK 1GOAA 4OPKA 5EXWA 3AVAA 3EZ5A 1ITGA 3PIOL 4DUZK 5FRNA 2HHSA 3VTIA 4I2PA 4KH5A 1XNQK 4BRHA 4B9LA 1BI4A 2P9SA 1IBKK 4LH5A 1T44A 4HUEA 3EY1A 1BHLA 4DTXA 3CD6N 4KB0A 4IEIA 3LZIA 1U49A 3DAWA 4CFDA 4H4OA 5CZ1A 2QWMA 3SQ4A 3ID6A 4BRFA 3CETA 4K8XA 3I0SA 2A3ZA 4RW6A 4JHDA 5HBMA 4BG8A 3CCMN 4B1YB 2DPNA 1N34K 4AHSA 2OA8A 4MLEA 3EEQA 3VQCA 1SS6A 4O5FA 1VSDA 3U4LA 1FKOA 4DF4A 1V4TA 2VGMA 4E7JA 1NK5A 2E88A 4NXMK 4AH9A 1IJJA 1KLMA 4FYDA 3EZWA 5ELZA 3LWMA 4KHPK 4CJLA 3AO1A 3O1WA 4E3SA 2HHUA 3AVMA 3QIPA 3UKUA 1NKEA 1JLGA 1E3MA 3SI6A 5AZIA 3LWLA 3T7ZA 3MDQA 1D9FA 5CHIA 3C6UA 4JI6K 3THXB 1VSLA 4JRQA 1RDDA 5FPMA 3S3OA 1SAZA 4RW4A 5BR8K 4IKFA 3NMUA 2F7TA 1U47A 1Q9YA 2XY8A 1QSLA 5M1QA 3BZKA 1FK9A 5KI6A 2WONA 1C1CA 3SAFA 4FM1A 1GLAG 2D0BA 5AQJA 5LJVA 1NMNA 4Q5VA 5BRFA 3OYIA 1LV5A 3F2KA 3UIQA 4JK9A 5AQRA 1HYZA 1UWBA 3SMSA 4KHYA 1M90O 2QKBA 3VQ4A 4B1WB 3I55N 2P9KB 4LY7A 2KZMA 3ZYYX 1D4XA 2OTLN 5CYMA 2XO7A 3O8MA 4JKDA 3ZSOA 4LC9B 5IT9O 3L4IA 1JLQA 2RHKA 2HF4A 5CE3A 1JXEA 2NNWA 5C2FA 2VG7A 3HOSA 3VEOA 4OJRA 3NCIA 2FLOA 1LW0A 2X6SA 4Y0WA 4CF2A 4NLBA 1YVUA 1XQSC 4DTSA 4JV5K 3SV3A 4LH4A 1QS4A 3K0SA 3O4QA 4YHHK 3TARA 4DSIA 3L2UA 2YJFA 5FLXO 3CXCM 3FR0A 1XUPO 3AARA 3VESA 5J2NA 3H08A 3THVA 3CFPA 5CYQA 3ZLJA 2KKZA 1BCOA 1I3AA 2HVHA 1A5VA 1IKXA 1U6ZA 3I56N 3WXMB 4FJ9A 3T1YK 1S1TA 3RSEB 1XHZA 3FFIA 1NGBA 4FCYA 4M3UA 3THYA 4CZGA 1NKBA 3TAGA 3ASMA 4ZHRA 4LFCK 2Q97A 5LJWA 2OANA 1HKGA 3R1XA 4BRQA 4DWIA 1IH7A 3C7NB 1TL1A 1CZAN 4YORA 1SL2A 3L2RA 1OH7A 4CHZA 2HBJA 2YNGA 2BUPA 4CJEA 3E9LA 4MQ3A 1ATSA 1QQMA 3AA2A 3CCJN 1K73O 3AVBA 1NGAA 1DTQA 3UKRB 4CZLA 5HRNA 2KLAA 3WXIA 1J5OA 1NU0A 3ZETB 1KVBA 1L3TA 4CFAA 3B6OA 3KD1E 1TVRA 2W40A 5BPMA 3CI5A 3O9UA 4KHUA 5BRDA 3AGRA 1SKSA 1VSEA 2P9UB 2Y1JA 1KCFA 1XWLA 4WYBA 1MU2A 1SKRA 1HKCA 3LZJA 2WC9A 1ASUA 4CZHA 1S5JA 3ENHA 1HJRA 5JVHL 4PL8A 3SPZA 2O8FA 2ZGZA 5JLHA 2QK9A 2XRIA 3WNFA 4NCBA 5CR4A 4M3XA 4ELVA 2OPSA 2QWOA 3TAEA 2HF3A 4DQRA 4H0YB 1KSPA 4QS7A 4XH1A 4B9UA 2XY5A 3LM9A 1J9AA 2NRVA 1KAZA 3K5MA 2IGIA 2F9WA 4LD0A 3KLFA 4CF8A 4I6MB 1ZBFA 2JGUA 5C42A 3R9PA 4Y1DA 3EE9A 1SL0A 4F3TA 3R8EA 3TAQA 3KTQA 3O80A 1U45A 1NKCA 4QS9A 2GWJA 3K9KA 4PQUA 2IS3A 4HVJA 4M3RA 4IOAL 3K2PA 1NM1A 1WAJA 3ZX2A 5K14A 2ASPA 3K9JA 3QETA 3O9TA 4B1ZA 4CGHA 3QEWA 3LDSA 3Q7BA 1CXUA 4JAXA 1TKTA 1A5WA 4B08A 3DRRA 3VGKA 2I5JA 1VQNN 3QESA 2IAJA 1ASVA 2EHGA 1J53A 3OYBA 3DWLA 4YOYA 1BI4B 3C94A 2A41A 4CJFA 4CJVA 3NVKA 2IVOA 4O8KA 5HP1A 3BDPA 4CZEA 3ENBA 2D0CA 5EU7A 4UY8O 3NFAA 4JKBA 1TV6A 4CEAA 4LF5K 5BN9A 4JHDB 2HHVA 2GELA 3LAKA 4XEIA 5J2MA 3C6HA 3HM9A 2E4LA 1Q7YO 3KJVA 1NGDA 3OYLA 1WSEA 4CEFA 4DSLA 3HPGA 4NO7A 4O8UA 3K5LA 2G8HA 4CJSA 1W7AA 4B1UB 3V9SA 1YI2N 1X3NA 4CEZA 2F8SA 1L5UA 4DFJA 1QQNA 1WSIA 4CJ4A 2B5JA 3MCPA 1NGFA 4DSKA 5HRPA 3RMDA 2G8FA 4I9QA 2Z1JA 4DQQA 5AZIB 2P9PA 3THXA 4GVEA 1P8ZA 1U4BA 3EKUA 5GINA 4A5BA 2X78A 2P5OA 3QEPA 3J7AP 5A2QO 4B9VA 4FJMA 3M5RA 2V7ZA 1NJXA 4CJKA 4AM7A 4PUOA 4CEBA 2ZJPL 1B9DA 1BA0A 2HBKA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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