2YI1A

Crystal structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetyl mannosamine 6-phosphate and adp.
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
313
structure length
308
Chain Sequence
GTLSALAVDLGGTNLRVAIVSMKGEIVKKYTQFNPKTYEERINLILQMCVEAAAEAVKLNCRILGVGISTGGRVNPREGIVLHSTKLIQEWNSVDLRTPLSDTLHLPVWVDNDGNCAALAERKFGQGKGLENFVTLITGTGIGGGIIHQHELIHGSSFCAAELGHLVVSLDGPDCSCGSHGCIEAYASGMALQREAKKLHDEDLLLVEGMSAVGALHLIQAAKLGNAKAQSILRTAGTALGLGVVNILHTMNPSLVILSGVLASHYIHIVKDVIRQQALSSVQDVDVVVSDLVDPALLGAASMVLDYT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structures of N-Acetylmannosamine Kinase Provide Insights Into Enzyme Specificity and Inhibition
pubmed doi rcsb
molecule keywords BIFUNCTIONAL UDP-N-ACETYLGLUCOSAMINE 2-EPIMERASE/N-ACETYLMAN
total genus 106
structure length 308
sequence length 313
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2011-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yi1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yi1A02
1Z05A 4XH5A 4H5TA 3VESA 3A0IX 4K43A 3DXKB 2UYTA 2QW9A 2I7NA 3WXJA 4BRIA 1BOTO 3D2FB 1K8KA 1DEJA 4ISGA 3VPZA 3W0LA 2NLXA 2VCPA 1S22A 4BRCA 2IVNA 4H0VB 5BRFA 1BO5O 5KQDA 5JLFA 3EKUA 3BUZB 3FZLA 2YHXA 4QS8A 5TKYA 5BPNA 1GLAG 2ZWHA 1MDUB 5EVZA 3VF4A 4BRGA 1R59O 3L6QA 4DHYA 3LM2A 3HBTA 2YI1A 2P9LA 3C7NB 3GDQA 5FPNA 3ULEA 4WQ4C 4CD1A 4BR2A 1YXQA 2QWPA 1DKGD 3H3NO 4BGAA 2Q1NA 1XQSC 2QWNA 4J8FA 4B1XB 5F2RA 3VEXA 3H6EA 1G99A 3ID8A 3H45C 1QZ5A 4ISFA 4B9QA 1BA1A 2P9KB 2Q0RA 2W40A 1QQNA 5AQYA 2NRHA 4PL8A 4O8KA 5FPDA 1HKBA 2V7YA 2GWKA 2FSKA 5BRDA 3CETA 3SLCA 4BR5A 3ENHA 5LJVA 2D0OA 1NLVA 4B1WB 4FWNA 4BVOA 2WUSA 3U8XA 4MLHA 3UE5A 1Q18A 4F9OA 1NGEA 1T44A 4MO5A 5CE3A 4EAHD 4M7YA 3ZEUA 4E1JA 4L3QA 1GLCG 2A6AA 3B8AX 4IJNA 3SMSA 4BQZA 4C23A 2FXUA 1BU6O 2E1YA 4BRQA 3HI0A 4JD2B 3CJCA 2OANA 1Y64A 3WQTA 3SJHA 4XH1A 4FWRA 1QZ6A 2E2QA 2VYPA 4NB4A 4FWPA 3H1QA 1KAYA 3ZETB 3F9MA 4IZ9A 3VETA 3CJAA 2D0PA 5FPMA 4HWIA 2ASMA 3WQUA 5BPLA 1GLFO 4GY2B 1GLDG 2E20A 2QWRA 4BR9A 4CZIA 4B1VA 3DXMB 3UKRB 4GNIA 4CD3A 2H3GX 3LL3A 2EWSA 2PAVA 3CJ9A 1NWKA 1T6DA 4BG9A 1HX1A 1TYQB 2V7ZA 3LDNA 3QFUA 3S41A 4BRAA 1J6ZA 4JHDA 4FWLA 5AZJA 2P9NB 2BTFA 2D1KA 4JNEA 2IVPA 3BF1A 3R6MA 5AQJA 3GE1A 4KBOA 2E2OA 1MWKA 4FSVA 5LJWA 2IVOA 2P9PB 4CBXA 5E84A 3WEEA 3WXKA 4BC2A 4DB3A 4PKGA 5AQLA 4DCHA 2YJFA 3FGUA 4BVPA 1YVNA 2FSNA 4CBWA 3QBXA 5KPRA 3O08A 3P4IA 2AP1A 4PL7A 3D2EB 3C7NA 5AQFA 1NM1A 4H5WA 3R9PA 3ZX0A 3CERA 5F0XA 1NGHA 3A8YA 5BREA 2V51B 4BQLA 5BN8A 3KZBA 3A5LC 5EOYA 3L0QA 5AQRA 3FLCO 4H0TB 5AQSA 3VGLA 1T6CA 3WUHA 3IDHA 4FO0A 5AQGA 2ZF5O 3RSEA 2HOEA 2P9SA 3KVGA 1NGGA 4NO7A 4I6MB 1NGBA 4BROA 3HSCA 3LM9A 4MLEA 4CZEA 1NMDA 1HUXA 3FZMA 3CJ1A 3O8MA 3H1VX 1X9JA 3UKUB 3EKSA 4AM6A 4IJAA 5AQVA 3GOIA 2CGLA 2GELA 1ZBSA 2QWMA 3SMPA 3L4IA 1NBWA 3HZ6A 1Z6RA 4AM7A 2V52B 5AQNA 3VEWA 5EY4A 3M3ZA 4B1ZA 2Q0UA 3G25A 3ATUA 5AQXA 5EXWA 4B1UB 4Z94A 3HM8A 2YCHA 3O4WA 1OKJA 1U6ZA 2GWJA 2P9UA 1BA0A 3AAQA 2E1ZA 5AQQA 3CQYA 5BPMA 2J4RA 2FSJA 5AQOA 1X3MA 3MN5A 1LCUA 1K8KB 3CIPA 3VGMA 1SAZA 3EZWA 1BDGA 5AR0A 4JN4A 1HJOA 3IMXA 2IIRA 1MWMA 3M6GA 5FPEA 4BR4A 5JICA 1WUAA 1V4TA 2QWLA 5JLHA 3BP8A 3R8EA 4BRPA 2W41A 1GLLO 2ZGYA 4H0PA 4BR7A 4A2BA 2P9LB 4IXCA 1GLJO 4BRKA 4WQ5A 4BRNA 1BWFO 1HKGA 2PBDA 1WOQA 5E26A 2QXLA 1RFQA 2QWOA 3BF3A 4H0YB 4FPAA 4BREA 1KAZA 3MN9A 3U4LA 5AZIA 2GTDA 1U2VA 3LDLA 4CZJA 2P9PA 4BRLA 1H1VA 3TPQA 2D4WA 1ZXOA 4CZMA 2Q2RA 2A5XA 1ATRA 3MMVA 5JMVA 2P9IA 3CJBA 1JCEA 2FLOA 3CQXA 2Q31A 4H0OA 3DWLA 2AA4A 2GUPA 4QS9A 4CZLA 4QS7A 3QBWA 3DXKA 2ASPA 1NGAA 1V4SA 3EL2A 4BC4A 2Q36A 3C0BA 2E8AA 3D2FA 3IUCA 4CZFA 4BC3A 2Q97A 4K25A 3ZEUB 4FWMA 4FL9A 4RCHA 4BG8A 4RWTA 5ELZA 2E2NA 2YHWA 4WQ5C 3DJCA 5AFUH 1SQKA 4EHTA 4I6MA 3UB5A 4WYBA 5AQMA 3A5OC 4EHUA 3VEVA 1GLBG 4A2AA 1HPMA 1ZC6A 3CI5A 3VERA 2QM1A 2A3ZA 3O1BA 3EO3A 3O1WA 4CJ7A 1ATNA 3A5NC 4BRMA 1C0FA 1KXPA 4HTLA 1MA9B 1NGCA 5AQHA 3AARA 3WXLA 2VWBA 3AAPA 3ATVA 3LDPA 3VGKA 3WT0A 5B8HA 2E88A 4FWSA 2HF3A 3VF2A 3ZX2A 1NGFA 4EIAA 4CBUA 1ESVA 2P9KA 3VF6A 1NGDA 3MDQA 5AQZA 3U9ZA 3VEYA 3FE1A 2A42A 4BRFA 4H5RA 2YJEA 3GBTA 4JHDB 2YHYA 3AY9A 2FF3B 5AZJB 3U9DA 3VOVA 4O5FA 5KQ8A 1YAGA 4BRHA 5AFUA 5LY3A 2I7PA 2QWQA 2FF6A 3QMLA 4XH4A 1RGIA 2CH6A 2F9TA 4H0XB 2A41A 3WEEB 1HLUA 1X3NA 3LDQA 5AQPA 3GG4A 1ATSA 3FFKB 3CHWA 3IFRA 3W3DA 4CZHA 1GLEG 5AQIA 4JD2A 1BUPA 2NZTA 1TUUA 2HMPA 4IWVA 3GL1A 5KPTA 1XC3A 1DGKN 1E4FT 3FZKA 3ZETA 1RDWX 3O6WA 1QQOA 2F9WA 4DQ8A 1KAXA 3VEOA 1NGIA 5AQUA 1JCGA 4A62A 3FR0A 3BEXA 4EFHA 2KHOA 3OHRA 3RSEB 3I33A 1SZ2A 2P9SB 3WXIA 4XEIA 4BR0A 3DXMA 3UKRA 5BR9A 4PKHA 3O80A 3SK3A 2DPNA 1NGJA 4MO4A 2GEMA 4FOEA 4K42A 1TYQA 3FZFA 3ULEB 1QHAA 1TUYA 4A61A 4YDUA 1HKCA 2BUPA 3FZHA 2P9NA 3QFPA 4FOIA 1IG8A 4FWOA 3EN9A 1YUWA 4CZKA 1CZAN 5BN9A 3JS6A 4FPBA 4IO8A 1XUPO 2P9UB 4Y0WA 4BRDA 3QB0A 2E2PA 3D7EO 3ENOA 3D2EA 5ADXH 1EQYA 4BGBA 3MK6A 4BC5A 3HTVA 3VENA 3TU5A 2CGKA 4H5VA 3VEZA 4RTFD 1P8ZA 2ITMA 3ZX3A 1E4GT 4CI6A 5BRHA 1BG3A 2HF4A 3A5MC 4K41A 4CZGA 2ZGZA 3LDOA 3H46O 2A40A 3M1FA 3I8BA 3QDKA 4FWKA 4YDUC 5KPZA 5AQKA 3JXUA 5I9EB 3QICA 5EX5A 4PKIA 5AQWA 4M63C 3UKUA 1QQMA 3MCPA 4FWQA 3DAWA 1LOTB 3MN6A 4H5NA 4ISEA 1S3XA 1C0GA 4H03B 1D4XA 3H3OB 4B1YB 1JCFA 2CH5A 5AZIB 1U2VB 4LC9B 4WQ4A 3O5BA 1IJJA 2CGJA 3CJ7A 3KHYA 2ASOA 5F1XA 3MN7A 4M7XA 5ADXA 2P9IB 5AQTA 3J8AA 4JAXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H5TA 1NK6A 3HPOA 1YHQN 3JYTA 2VCPA 2EX3A 1RDAA 1YVUA 2YHXA 4QS8A 5TKYA 3KD1E 1GLAG 3VF4A 2XY7A 1R59O 3CCVN 1L3UA 3CM6A 4DHYA 2YI1A 3MXJA 3MEDA 3L4QA 4CD1A 1YXQA 2QWPA 3VA3A 4E7JA 2OYQA 5HRSA 4FJHA 2Q1NA 3C6HA 3TTDA 4JKGA 4Z4CA 3AGRA 4DU4A 1G99A 5FLXO 3K5MA 3O3FA 4B9VA 5HRRA 2NRHA 4PL8A 1VSLA 2V7YA 2GWKA 2FSKA 3EZ5A 5CYMA 1VQ8N 3U8XA 3UE5A 3WNFA 4CF9A 3OYIA 4FXDA 1T44A 5CE3A 3O9UA 1CZBA 2WONA 1S9EA 2OPRA 4C23A 2FXUA 3NFAA 4PHTX 1HYSA 2OANA 3OYGA 4FLZA 4JKBA 3OYMA 1I94K 4XH1A 3O4NA 1TV6A 3KKSA 2NRTA 3KD5E 4JK7A 4IZ9A 3SQ1A 3CJAA 5FPMA 3WNHA 2ASMA 3QIPA 1DLOA 4GY2B 1SUQA 3K2PA 3N4QA 1GOCA 3CG7A 3DXMB 1EP4A 1REVA 2EWSA 2PAVA 4KHYA 2F4VK 2ZJPL 4DU1A 4NYNA 4BG9A 1QTMA 2UXDK 3S41A 4BRAA 3KJVA 1IV0A 4OPAA 1HYZA 2ITGA 4IFEA 4NCBA 1JXEA 3R6MA 1SKWA 5J2PA 4PA1A 5FRMA 4EP5A 2FBXA 3OJUA 3QESA 4CBXA 4C8KA 3QEVA 4E7IA 4DB3A 3MAQA 4HUEA 3KTQA 4CBWA 2FSNA 5KPRA 3QBXA 4CIEA 3HO1A 3P4IA 2AP1A 4PL7A 2VGMA 2KZZA 4E7LA 4OGCA 4FCYA 3RR8A 4AHCA 4JI4K 1WAJA 2OPPA 2Z1HA 3KZBA 3A5LC 3L0QA 5AQRA 1NJXA 1KC8O 2OZMA 4E1NA 4H0TB 4FLXA 4DTXA 3VGLA 1T6CA 1RTIA 1RT6A 3L2VA 5HOOA 4M3WA 2HOEA 3NHGA 2HNYA 4FJLA 3CJ1A 1Q86O 1RTHA 1X9JA 4LF8K 4IJAA 2GELA 1ZBSA 3QETA 4OGEA 4DQRA 3IAYA 4BWJA 1R0AA 3HK2A 2YNHA 5C10A 4AM7A 4CEOA 5AQNA 3LZJA 3VEWA 3CCUN 3G25A 2YV0X 5EXWA 4Z94A 3HM8A 3O4WA 2D0BA 2RKIA 1BCMA 4QOZB 3BY5A 1CXUA 4O4GA 5GIOA 4UY8O 2J4RA 1Z25A 2UUAK 1S9GA 2FSJA 1BIUA 4YOTA 3CIPA 3EZWA 1BDGA 3DLHA 4FVUA 5AR0A 3HYFA 3IMXA 3I56N 3M6GA 5CY4A 4EP4A 4DU3A 1RBVA 5FPEA 5M1OA 5TKWA 3ZSWA 4NXNK 3TSQA 4CJ5A 4H8KA 3VQPA 3CQ8A 1SV5A 4FM2A 3VTHA 3AO1A 5K14A 4BDZA 2W41A 3CMEN 4Z4GA 3CYMA 4BR7A 4A2BA 4WF9L 2HHVA 2PBDA 3THXA 4CHPA 1JL1A 4M3TA 4KH5A 4FJJA 3TR8A 4H0YB 3MN9A 3U4LA 4ZTFA 2ETJA 5HROA 1WB9A 4DMNA 4GVMA 1ZXOA 2YHBA 4CGGA 5JVGL 4IEEA 3L2UA 1ATRA 5JMVA 4F8RA 2OPQA 2P9IA 4LFCK 3CQXA 1ZBHA 4HUGA 4DFMA 3QNOA 4H0OA 5EU7A 1JLBA 4CZLA 4QS7A 3QBWA 3VQ4A 3SQ0A 4CEAA 1MU2A 1U4BA 3DYAA 4CZFA 4Q0BA 4K25A 1OH7A 1IH7A 4KHUA 4CJLA 4J2DA 4WQ5C 3DJCA 1VQNN 4A5AA 3ZT1A 1HPMA 1ZC6A 4B8AB 2OCEA 3L2RA 3KKRA 4CJ7A 1BI4B 1KXPA 2VWKA 3HP6A 5C25A 2D0CA 3K59A 1KVBA 3UIQA 3LDPA 3AAPA 2BE2A 3ATVA 1S1XA 3AVIA 4FWSA 4RW7A 1X9SA 3VF2A 2IDOA 1Q8IA 1VSJA 4QCLA 3VQ9A 1N6QA 3MDQA 3U9ZA 4CJQA 3FE1A 4BRFA 3GBTA 4GV6A 5AZJB 1NMNA 4GV9A 4OJRA 4O5FA 4HVJA 2VQFK 2FBTA 3L3VA 3CM5A 4BRHA 5LY3A 1KLMA 2FC0A 4XH4A 5IWAK 2CH6A 2UUCK 5CHIA 3SI6A 1O1WA 1UA0A 3P5JA 3GG4A 1RT7A 4FJGA 2HW3A 4GV3A 3KLIA 4B08A 3TSUA 4CZHA 1SKSA 4W5OA 4JD2A 4CEBA 2HNDA 4CIFA 3AVNA 3QEWA 1T03A 4C8OA 1XC3A 1DGKN 4CJ4A 3QO9A 2KLAA 3O6WA 2F9WA 1KAXA 1KFSA 3BEXA 4MFBA 3RSEB 3I33A 2JWKA 4DR2K 4M3UA 1OH8A 2IGIA 1L3SA 3SK3A 1NGJA 4KB1A 4CVNE 3P1GA 3O9SA 4FOEA 1TYQA 3EYZA 3V9WA 1WSGA 3QFPA 4FOIA 1W2BM 1NKEA 4CJSA 3MWPA 1LV5A 4JYAK 1YUWA 5I3UA 5M1QA 4CFDA 2P1JA 4DV6K 1CZAN 3VQCA 1QSLA 4OKJA 3NVKA 4N76A 4L8RB 3CF5L 3P39A 4W5QA 3OTOK 1XUPO 4Y0WA 2O8BB 4A57A 3QB0A 2E2PA 3D2EA 3A2FA 1VQ6N 5ADXH 1EQYA 3MK6A 3VENA 3CFOA 4H5VA 5E41A 3I55N 1E4GT 3PLAA 1BG3A 4CZGA 2ZGZA 4LF9K 3ZSRA 2A40A 4DR5K 1TL3A 4BDPA 4FWKA 1JLEA 4NLBA 1QVFM 3JXUA 2ATQA 2IAJA 4J2EA 5EX5A 2DFEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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