3WXKA

Crystal structure of trypanosoma brucei gambiense glycerol kinase in complex with glycerol
Total Genus 188
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
188
sequence length
513
structure length
513
Chain Sequence
b'FTMKYVGSIDQGTTSTRFIIFDERQRPVSVHQVPHTQHTPHPGWLEHDPMEIFRSACKCMSVAIAKLRQKDASFRKIEAIGITNQRETTVAWDRVTKEPLCYAPVWNDLRTYDITKKVTAELGGGDSMFASKITGLPVSTYFAAFKMRWMLENVPAVADACRRGTLCFGTIDTWLMYKLSGGKAFVTDVTNASRTFLMDLRTRKWSPELCEKLKIPMETLPEIRSNSELFGYVETDECGVAAALNERTPIMGSIGDQQSALFGNMCFEKGEAKNTYGTGCFLLMNVGEEARFSKHGLLSTVGFQVGRDGPCYYALEGAIACAGATVEWMRRNMNLFSHITECEKLARSVPGTQGIVFVPAFSGLLAPYWDPSARGTIVGMTLKTTRAHVIRAALQAIALQLNDVVGSMKRDAGLNLSSLRVDGGLSKNGLLMEIQASLLGVDILVPSMHETTALGAALCAGLAAGVWTSLEEVKAVSRRENSWKTVSPSGSAMEREAMIAEWREALKRTKWAK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glycerol kinase
publication title Molecular basis for the reverse reaction of African human trypanosomes glycerol kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma brucei gambiense
molecule tags Transferase
total genus 188
structure length 513
sequence length 513
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2014-08-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3wxkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3wxkA01
1SZ2A 3MK6A 4H0PA 2VCPA 1BUPA 4IJNA 4A2AA 5BRDA 2A5XA 5BRHA 3ZX0A 4IO8A 3QBXA 3VGLA 1K8KA 1U2VB 3LDQA 3UKUA 3VEZA 4JN4A 5KPZA 2YJEA 2F9WA 1GLJO 5AQSA 3EKUA 4A2BA 4B1UB 2ZGZA 1HPMA 2CGKA 3A5OC 3H46O 2YCHA 5AQXA 3O8MA 3H45C 4A62A 4QS8A 1YAGA 3VESA 2E1YA 3SLCA 1X3MA 1DGKN 3WEEB 4BR4A 3AAQA 3I33A 4BRCA 4EHUA 4O5FA 4BR0A 2D4WA 4L3QA 5AQLA 1ATSA 2P9IA 2A6AA 4IZ9A 3ATUA 3O6WA 1KAZA 4FWQA 1DKGD 5F1XA 3H3OB 1NGGA 4H03B 2GUPA 4YDUC 2V7ZA 1MA9B 1JCGA 2Q97A 2QXLA 2VYPA 1P8ZA 1XC3A 1IJJA 2QWNA 1YUWA 4BRKA 2ITMA 5LY3A 2VWBA 5AQYA 5KQDA 1YVNA 4CI6A 3TPQA 1T44A 4WQ5A 3VETA 5FPDA 2P9KB 1WUAA 1V4SA 3CQYA 3IDHA 1BG3A 1NGBA 2I7PA 4AM7A 1ZC6A 4BRQA 4PKHA 2GWJA 3UKRA 1BWFO 2FLOA 4MLEA 4BC2A 3FZLA 3MN7A 5AZIA 2NRHA 3FLCO 3QICA 3WXLA 3ULEA 1NMDA 1ZBSA 1GLFO 4XH4A 1HLUA 3VEYA 3ZX2A 3QDKA 3KZBA 1NLVA 2AA4A 5BPNA 1HX1A 4CZHA 2E2PA 4RTFD 1E4GT 2P9SB 2FXUA 2V7YA 4BR9A 4WYBA 4BR7A 1ATNA 4KBOA 3U8XA 2P9PB 1TYQB 4BROA 4CZEA 3HSCA 1QZ5A 3LDNA 4H5VA 4BC5A 4DCHA 2AP1A 1QHAA 2IIRA 3EKSA 1C0GA 3VGMA 3VOVA 3FZHA 3R8EA 3SMSA 5E26A 1SQKA 2A3ZA 1NGJA 5AQVA 4H0OA 2Q1NA 4NO7A 2GTDA 5F0XA 5AQIA 4FSVA 4BG9A 3R6MA 2QM1A 4JD2A 4QS7A 1GLAG 3QBWA 4LC9B 5EY4A 3KVGA 3CETA 4GY2B 4IWVA 5AQGA 3JS6A 1YXQA 4BC4A 1NGAA 5AR0A 5FPEA 4FWKA 3LDPA 1NGHA 1KAXA 3LDLA 2V52B 4HTLA 1QZ6A 3QFPA 5AQJA 1BDGA 2QWPA 1Y64A 2QW9A 4Z94A 2FSJA 1NGEA 3GBTA 4JHDB 4XH1A 3H3NO 3IMXA 5AQUA 5AZJA 5LJWA 3RSEA 3ZEUA 1E4FT 3FZFA 2E2OA 3H6EA 5E84A 3D2FB 3OHRA 5BN8A 1TUUA 4MLHA 2EWSA 1HKGA 4I6MB 5AQWA 4BREA 4BRIA 3LL3A 4BG8A 4BGAA 5ADXH 3C0BA 3A5MC 2Q31A 4BQLA 1JCFA 2DPNA 2YI1A 3J8AA 3SJHA 4F9OA 4YDUA 4EHTA 3ATVA 4CZIA 1V4TA 4XH5A 4CD1A 1NWKA 4FWNA 1S3XA 4H0TB 5EVZA 3AARA 1T6DA 2QWRA 2Q36A 3VENA 4BR2A 3MN5A 3VEVA 2BUPA 1U2VA 4JAXA 4WQ4C 4ISGA 3L6QA 5CE3A 2E1ZA 3QFUA 3CI5A 1T6CA 5FPMA 2ZF5O 3CJBA 3QB0A 4EAHD 4XEIA 4CZKA 2P9LB 5AQTA 2NZTA 2D0PA 1QQOA 3R9PA 4A61A 1Z6RA 3ZETB 3W0LA 2OANA 3WEEA 1HKBA 2P9NA 4QS9A 3U9ZA 1BA0A 4IJAA 1XQSC 4FWSA 3HM8A 1Q18A 3M6GA 2HMPA 3BP8A 2QWOA 3S41A 4BRNA 4RWTA 2YHYA 1LOTB 2E2QA 3FR0A 1WOQA 3DXMB 3GDQA 4EFHA 5AQOA 5AZIB 3CERA 4BRDA 5BR9A 4FO0A 2Q0UA 5AQZA 4MO4A 3FE1A 3BEXA 4BQZA 5AFUH 3VEXA 4ISEA 3WT0A 2W40A 2F9TA 3MN9A 5AQNA 3VEWA 3CJ1A 2H3GX 5AQHA 2P9KA 3MDQA 4H5TA 5AQMA 4CZLA 1H1VA 3SK3A 3GOIA 2PAVA 4CJ7A 2Q2RA 4FL9A 1GLLO 3P4IA 4JNEA 4DHYA 3C7NB 3VGKA 2PBDA 4B1XB 1NGFA 3WQUA 2E8AA 2CH6A 3MMVA 4K43A 1OKJA 3DXKB 4BRAA 1GLEG 4E1JA 2IVOA 1J6ZA 1BU6O 3U9DA 2P9UB 4H0XB 4B1ZA 3F9MA 1NGDA 3O08A 4BRMA 1NGIA 2D1KA 2FSKA 2P9SA 3D2EA 3CJCA 4BVPA 5B8HA 2HF3A 2HOEA 3LM9A 5JLHA 2P9PA 1TYQA 2YHWA 4BR5A 4DB3A 3QMLA 5ELZA 1X3NA 4ISFA 1D4XA 3TU5A 5BPLA 4K42A 1HKCA 4K41A 3WQTA 4CD3A 1EQYA 3UE5A 1DEJA 1KXPA 3VF4A 2KHOA 4FWPA 2A42A 4DQ8A 4AM6A 2Q0RA 3IUCA 3H1QA 4CZGA 3D7EO 3L4IA 1ATRA 3I8BA 4B1WB 4O8KA 2ASPA 5EXWA 4FPBA 4CZJA 3RSEB 4CZMA 3ZEUB 5BPMA 2BTFA 5KQ8A 3WXKA 5BREA 2A41A 3O80A 4WQ4A 2FSNA 1BA1A 1K8KB 3BF3A 2FF6A 4MO5A 3UKUB 5KPRA 3AAPA 4H5RA 4BRHA 2QWQA 4M63C 1MWMA 1RGIA 3HTVA 4CZFA 3CIPA 3VERA 2E2NA 2ASMA 3VPZA 2CGLA 3DAWA 2NLXA 1TUYA 2GWKA 4JHDA 3CJ9A 5AQFA 2IVPA 3D2FA 3CJ7A 2WUSA 1Z05A 1BOTO 5AQKA 2V51B 4I6MA 4PL8A 2QWMA 4BVOA 1ZXOA 4H0VB 4M7YA 2P9IB 3UB5A 5F2RA 3FZKA 4PKIA 4BRFA 3HZ6A 1NBWA 4FWMA 4CBWA 4EIAA 4FPAA 4PKGA 3A5LC 3CHWA 3DWLA 3EZWA 1CZAN 1NGCA 1RFQA 3JXUA 3FFKB 3CQXA 1R59O 2P9NB 5EX5A 2GELA 4Y0WA 4C23A 3FGUA 4BGBA 1RDWX 3IFRA 3H1VX 3VEOA 2CGJA 3A0IX 1S22A 3SMPA 5BRFA 3A5NC 2W41A 3BUZB 3L0QA 4H0YB 4H5WA 2HF4A 2P9LA 3EO3A 3UKRB 5JMVA 4CBUA 2FF3B 3EL2A 3W3DA 5ADXA 2QWLA 1QQNA 3ZETA 3ULEB 3ID8A 3O1BA 2D0OA 3LM2A 4FWLA 3HI0A 3GL1A 1ESVA 4B1VA 4H5NA 3WXJA 4BRPA 1NM1A 3DXMA 1GLCG 3M3ZA 5AQQA 1HUXA 2IVNA 1JCEA 1C0FA 1KAYA 1GLDG 4K25A 4IXCA 3O1WA 4B9QA 2GEMA 1SAZA 3G25A 1U6ZA 2ASOA 1G99A 2I7NA 5FPNA 2A40A 3EN9A 3AY9A 4PL7A 4WQ5C 3ENHA 2E88A 5JLFA 3D2EB 3KHYA 3WXIA 1MWKA 3ZX3A 2E20A 3FZMA 4BC3A 3WUHA 1MDUB 4JD2B 4M7XA 2ZWHA 3C7NA 3MCPA 4RCHA 2J4RA 3B8AX 5AQRA 3GE1A 5BN9A 2YHXA 3DXKA 5TKYA 4FWOA 4GNIA 4J8FA 2P9UA 4FWRA 1XUPO 1X9JA 3U4LA 3MN6A 4BRGA 4B1YB 4BRLA 3LDOA 5I9EB 3GG4A 5EOYA 2YJFA 5AFUA 3VF2A 4FOEA 1QQMA 3O5BA 5AZJB 1GLBG 1IG8A 1HJOA 4HWIA 3VF6A 3DJCA 2ZGYA 3O4WA 3ENOA 1BO5O 3A8YA 4FOIA 3M1FA 3CJAA 5AQPA 5KPTA 2CH5A 5JICA 4NB4A 4CBXA 3BF1A 3HBTA 2UYTA 1LCUA 5LJVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DQRA 2NRTA 5J2NA 4KO0A 4JV5K 5CZ2A 1MU2A 5BRDA 1XMQK 5BRHA 4B3RK 3OYCA 3LDQA 3UKUA 5M1KA 2YHAA 1TVRA 3EE8A 3VEZA 1IBLK 4YNQA 3PO4A 1T05A 4V19S 1Q7YO 4JI5K 4EP5A 4B1UB 1HPMA 2CGKA 3J81O 3O8MA 4CJRA 4FJHA 3H45C 3S3NA 4QS8A 1CZBA 4Z0UA 5J2MA 2OTLN 3AVFA 1HQUA 2RKIA 1KLNA 2E6LA 1DGKN 4KI6A 3OYGA 3I33A 4BRCA 4U67L 1JLFA 3AA3A 4O5FA 3QETA 5E41A 4K8ZA 1ATSA 2X6SA 4B8AB 4IDHA 1LV5A 4EZ6A 1DKGD 3L4QA 2O8CA 4CGFA 1QVGM 1MA9B 1SKWA 3ZSQA 2WONA 1OH8A 3K2PA 3ZSRA 1WN7A 5AQYA 5C2FA 3NGZA 4DQPA 5C12A 4CJPA 4E0DA 4Q0BA 4OLBA 3SUOA 1T44A 1B9DA 1DTQA 4KHPK 1WUAA 5IWAK 4M3RA 4RW7A 1V4SA 2QKBA 3IDHA 1BG3A 5IT9O 4PHTX 3DLKA 3KWGA 4PKHA 3UKRA 1NJYA 2NRVA 3SV3A 3ZYYX 2NRHA 1VQ9N 1S1XA 1OH7A 3ZX2A 3DOKA 4OLAA 1NLVA 3TAPA 2E2PA 4DF8A 1E4GT 2FXUA 3HYFA 5HLFA 4BR7A 4BWJA 5J2QA 1C0TA 3CXCM 3LDNA 4DCHA 1QTMA 3EKSA 5CYQA 3M8QA 3R8EA 2ATQA 2B6AA 3SMSA 2FBTA 2NUBA 1EWQA 1EKEA 1B9FA 1SQKA 4K0KK 5AQVA 3KKRA 4CGDA 1LAWA 2VG6A 1J5EK 1RT6A 4NO7A 3DOLA 4FSVA 3OYBA 1FW6A 1TKZA 3CM6A 3R6MA 2VWJA 4QS7A 4IOCL 3PO5A 4IFYA 3PSFA 4B9UA 4JI0K 4LFCK 4DFKA 4O8UA 1YXQA 5FPEA 2A1SA 4FWKA 4ILGB 3LDPA 1NGHA 1KAXA 4CEBA 5AQJA 1BDGA 2QW9A 4Z94A 1TKTA 3THXB 3H3NO 3IMXA 3J80O 4J2AA 3RSEA 3PV8A 3ZEUA 4AH9A 1E4FT 3FZFA 4OO1J 1EP4A 3D2FB 3MECA 5BN8A 2VG5A 2VGNA 3TSPA 2B4JA 4FVUA 1YT3A 5AQWA 4BREA 4BRIA 4E19A 1RDDA 2BANA 3E1YA 4DLGA 4JKHA 2F96A 4X65K 4DTMA 4J2BA 3SYZA 2DPNA 4F9OA 4EHTA 2HHXA 1V4TA 4GMJB 1S3XA 4H0TB 3VENA 1ZBFA 2QWRA 4CJVA 3AVLA 1RT5A 5JVHL 4DFJA 1FKPA 4CGJA 2NRXA 5HRSA 3L6QA 2E1ZA 4YOXA 3CI5A 1SS6A 1KRPA 3B6OA 2KW4A 4I9LA 2NZTA 4C8OA 2PYJA 3W0LA 4F2SA 2OANA 4Z4IA 1BIUA 4J2DA 2E6MA 4IJAA 2G8VA 4FWSA 3HM8A 2HMPA 2QWOA 1EWRA 2YHYA 1LOTB 3FR0A 1WOQA 4HCCA 1QSYA 5I42A 4NYFA 3TARA 3OVNA 4DV5K 4YY3K 3FE1A 4CERA 3T69A 5AQNA 3AVBA 3MDQA 4H5TA 1XHXA 4CZLA 3SK3A 4JK9A 2KLAA 4FJ9A 3CFOA 3C7NB 1IBMK 1O13A 4B1XB 1NGFA 4JK8A 2E8AA 3MMVA 3DRSA 1GLEG 4YOTA 1YITN 4IOAL 1BU6O 3V4IA 1DLOA 4DTXA 2KFNA 2O8BB 2HBLA 3NH2A 4B1ZA 4BDPA 3F9MA 3O08A 4DR2K 2D1KA 2FSKA 5HRRA 4E1MA 4FM0A 4C8KA 3ZT0A 4JYAK 2HOEA 5JLHA 1VSHA 4CEDA 4CJWA 2JGUA 2OCEA 2PY5A 1JLBA 3TU5A 3DYAA 4K42A 3T1YK 1DEJA 1VQON 3RVCA 3ZSOA 2KHOA 2QI2A 4CZGA 4JI8K 3I8BA 4B1WB 4CF9A 5MLCQ 4W5TA 4FPBA 4CZJA 1VSLA 3HP9A 5BPMA 4ID1A 2RF2A 2BTFA 3U6FA 3THYB 5CYMA 1S1WA 3L3VA 1VRTA 4AF1A 5KQ8A 1K8KB 4MO5A 2FF6A 1VQ4N 1VQKN 5KPRA 4GW6A 1BGXT 3NAEA 4M63C 3CIPA 4KTQA 1NOZA 4KH4A 4UQGA 3JYTA 4M3XA 2ASMA 1WBBA 3THXA 3CJ9A 4F3TA 1RT4A 3VQ7A 3D2FA 1Z05A 2HHSA 5AQKA 2QWMA 2W42A 1D9FA 3AA2A 1ZXOA 4H0VB 2P9IB 4OPAA 2X6NA 1GOCA 2D0CA 1ASUA 4CBWA 4DR5K 1U47A 2HW3A 4FPAA 3O3GA 4LFBK 4PKGA 4OKKA 4H4OA 1CZAN 3NF6A 3D6RA 4Y0WA 3FGUA 5HRNA 3IFRA 3H1VX 3CCEN 4OPJA 5JS1A 4M45A 1CLQA 4H5WA 4JRQA 3LWLA 3HL8A 3K58A 3KK2A 3EYZA 4FLZA 3W3DA 4DS4A 2HNZA 3U3YA 1R0AA 3O1BA 4CFDA 3L8BA 2FC0A 3HI0A 1ESVA 4HVJA 4DR1K 2D0AA 1K6YA 4BRPA 1WNSA 1GLCG 3CMAN 4DS5A 3NHGA 1KCFA 2P5OA 2IVNA 3M8SA 2KFZA 1JCEA 3ZCMA 1RNHA 1WAJA 3OYFA 1JL1A 3K9JA 1U6ZA 1ZBLA 1BQMA 3V81A 3AY9A 4N76A 1YHQN 3ENHA 3HRGA 3ZX3A 3WXIA 4CHNA 4BC3A 3WUHA 4JD2B 1T03A 3S9HA 3OYLA 3MCPA 3C7NA 3KLHA 5HBMA 5JS2A 1KSPA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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