3WXKA

Crystal structure of trypanosoma brucei gambiense glycerol kinase in complex with glycerol
Total Genus 188
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
188
sequence length
513
structure length
513
Chain Sequence
FTMKYVGSIDQGTTSTRFIIFDERQRPVSVHQVPHTQHTPHPGWLEHDPMEIFRSACKCMSVAIAKLRQKDASFRKIEAIGITNQRETTVAWDRVTKEPLCYAPVWNDLRTYDITKKVTAELGGGDSMFASKITGLPVSTYFAAFKMRWMLENVPAVADACRRGTLCFGTIDTWLMYKLSGGKAFVTDVTNASRTFLMDLRTRKWSPELCEKLKIPMETLPEIRSNSELFGYVETDECGVAAALNERTPIMGSIGDQQSALFGNMCFEKGEAKNTYGTGCFLLMNVGEEARFSKHGLLSTVGFQVGRDGPCYYALEGAIACAGATVEWMRRNMNLFSHITECEKLARSVPGTQGIVFVPAFSGLLAPYWDPSARGTIVGMTLKTTRAHVIRAALQAIALQLNDVVGSMKRDAGLNLSSLRVDGGLSKNGLLMEIQASLLGVDILVPSMHETTALGAALCAGLAAGVWTSLEEVKAVSRRENSWKTVSPSGSAMEREAMIAEWREALKRTKWAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glycerol kinase
publication title Molecular basis for the reverse reaction of African human trypanosomes glycerol kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma brucei gambiense
molecule tags Transferase
total genus 188
structure length 513
sequence length 513
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2014-08-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3wxkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3wxkA01
4AM7A 1D4XA 2QWRA 3WEEB 5LJVA 5F2RA 4CZHA 5FPEA 1WOQA 4A61A 2QWMA 5AQUA 4BR4A 1NMDA 4BC5A 2V51B 2D1KA 4RCHA 4BC4A 2WUSA 4H5VA 1T44A 1Z05A 3KVGA 3HZ6A 3U4LA 4I6MB 3UKUA 3VESA 4B1WB 4BGBA 4H5TA 1U2VB 3WXJA 2GTDA 2E1YA 3ZETA 5AQGA 4CZJA 3L4IA 3M1FA 4YDUA 2P9PA 4BROA 3KZBA 3C7NB 2A6AA 2ASPA 3O80A 3WXLA 2IIRA 4CI6A 3FZMA 5EOYA 4BG8A 2Q1NA 3S41A 3VEYA 3VEOA 3VF2A 1QZ6A 4EHTA 3QFUA 4K43A 3ID8A 4NB4A 1HKGA 1TUYA 2E88A 3ENHA 3VF4A 3MN7A 4WYBA 1GLCG 3DAWA 2HOEA 2HF3A 3QICA 3H3OB 4ISEA 3D2FA 3O1WA 1NBWA 2NZTA 2CH6A 2Q97A 3LDOA 5AQWA 4B1ZA 5AQZA 3GDQA 5AQKA 1GLAG 1KAYA 3BEXA 3HM8A 5KPTA 2D4WA 3ENOA 3ZX0A 2HF4A 4CD1A 2H3GX 2V7YA 3WEEA 4A2AA 2NLXA 4FPAA 2E1ZA 3CI5A 1NGHA 3QFPA 5I9EB 3EO3A 1YAGA 4FWOA 4PKIA 2VWBA 2AP1A 3D2EB 4BC2A 5AQPA 3J8AA 2FF6A 3GE1A 3M6GA 1QHAA 3A8YA 4FWPA 4I6MA 5KPZA 1U2VA 1SZ2A 2FLOA 4BQLA 5BPLA 4BRGA 3OHRA 5AQIA 1RGIA 3MN9A 1U6ZA 3EKUA 3VGKA 4O8KA 3CETA 4FO0A 5LY3A 2A40A 3C7NA 2A3ZA 1NGAA 1MWKA 3EL2A 5AQHA 4AM6A 3CQYA 5JLFA 2A5XA 1BUPA 3CIPA 5AQVA 2W41A 2FXUA 4CZKA 4CBXA 4RWTA 1NGDA 1NGEA 4BG9A 1NGBA 3A5NC 5BN9A 3ATVA 3FE1A 4MO5A 4QS9A 3WUHA 4CZIA 4CZEA 4F9OA 3I8BA 2P9KB 4JHDA 3UE5A 3QBXA 4FWNA 5AQNA 4BC3A 4BR7A 2CGKA 1JCEA 2CGLA 5CE3A 2Q0RA 4C23A 3D7EO 2YJFA 1ZC6A 4XH1A 5F0XA 2QXLA 3G25A 4H0OA 4CD3A 5AQYA 2ZWHA 3AY9A 3LM9A 2FSKA 5AQLA 5JLHA 1TUUA 4K25A 2E2PA 2PAVA 1QQOA 4WQ4A 3TPQA 1HKCA 3A0IX 3RSEB 3M3ZA 2AA4A 5FPDA 3VETA 4M7XA 1ATSA 4IXCA 3FGUA 5AQMA 1MA9B 2FSNA 2GWKA 4H0VB 2F9TA 5FPMA 1J6ZA 2Q2RA 1OKJA 1JCGA 3LDPA 2CH5A 1X9JA 1G99A 1KAZA 5EXWA 4Z94A 3W0LA 2Q36A 1H1VA 5AFUH 2YHWA 3D2EA 5AQSA 2E2OA 3H45C 3L6QA 2GUPA 2BUPA 3GBTA 3SMPA 3CJ1A 4FWMA 3VEXA 3R6MA 5E84A 4EAHD 5BRDA 2P9NB 1HX1A 2QWOA 4BRNA 4QS7A 3UKRB 4BR2A 5BR9A 2V52B 4BRDA 3H6EA 4FL9A 2Q31A 3U9ZA 4WQ5C 5E26A 3CJCA 3DXMB 2P9KA 2QWNA 3BP8A 4DB3A 3F9MA 4EHUA 3O4WA 4BVOA 1E4GT 1GLBG 4EIAA 5ADXA 2UYTA 4BQZA 2KHOA 1S3XA 2GWJA 3RSEA 4BGAA 1IG8A 2D0PA 2V7ZA 4M7YA 4CBUA 1GLDG 5AQOA 3VPZA 4FWSA 1TYQB 3FZLA 4O5FA 2P9LB 1CZAN 2W40A 3HTVA 2FSJA 2DPNA 3VEZA 4CJ7A 5EX5A 4BR9A 2I7NA 4MLHA 4K42A 3R9PA 2E2QA 3AAQA 1K8KB 1V4SA 4JNEA 5F1XA 3ZEUA 5LJWA 3FFKB 3IFRA 4BRPA 1KXPA 2YHYA 2P9IB 3SLCA 4B1XB 1NM1A 5AZIB 1ATRA 3QBWA 4CBWA 1MWMA 4BRHA 1YVNA 3FR0A 2YI1A 3UKRA 3LM2A 4JD2B 2ZF5O 4FWKA 3HSCA 3CJBA 1ATNA 3LDNA 4EFHA 4FOIA 3R8EA 1GLJO 3VF6A 2ZGYA 4GY2B 3DXMA 4HTLA 4ISFA 3LDQA 5TKYA 4NO7A 3SK3A 2HMPA 3WXKA 1P8ZA 3FZFA 4BVPA 3I33A 5B8HA 3O1BA 3MMVA 4KBOA 4XH4A 3AARA 5AZJB 5BREA 1HKBA 1Q18A 5ELZA 1JCFA 1NGCA 2GELA 2QM1A 5AFUA 4CZFA 3WQUA 3BUZB 2I7PA 2YJEA 1TYQA 3SJHA 4BRLA 4BRIA 2P9LA 2VYPA 4M63C 3VERA 3VENA 3UKUB 4FWRA 4K41A 1MDUB 4XEIA 3HBTA 3EN9A 4FOEA 1X3MA 1Y64A 5KQ8A 1K8KA 2P9PB 2QWQA 3MK6A 4DHYA 1ZBSA 1IJJA 3MN6A 4QS8A 3VGMA 4BRCA 4LC9B 4H0PA 1YXQA 4B1YB 2PBDA 2CGJA 4YDUC 3QMLA 5AZIA 4BRFA 2BTFA 4Y0WA 2GEMA 4H0YB 3VGLA 3CQXA 3WQTA 4H5RA 4PL7A 4BRAA 2OANA 1QQMA 4PKHA 3DWLA 4JN4A 4JD2A 3O8MA 3KHYA 4RTFD 3WXIA 4H03B 3D2FB 3SMSA 3WT0A 1S22A 5AQXA 3H3NO 1XC3A 2A42A 4A2BA 2ITMA 2QWLA 5EVZA 1HPMA 4DQ8A 3HI0A 1WUAA 1BA0A 3GL1A 4BRKA 1RDWX 2VCPA 5AZJA 3FZHA 1KAXA 4CZGA 5JMVA 3VEWA 1NGFA 5EY4A 1RFQA 3CHWA 2P9UB 5BRHA 1XQSC 1GLFO 5FPNA 2ASMA 3MN5A 3CJAA 3MCPA 5AQFA 1SQKA 1Z6RA 1ZXOA 1R59O 3GOIA 1C0FA 2P9SB 4MLEA 3A5LC 3BF1A 3P4IA 1GLLO 4PKGA 3IDHA 1DEJA 1BWFO 3FLCO 1T6CA 4A62A 5BN8A 5AQJA 1V4TA 1NWKA 1DKGD 3IUCA 4JHDB 3ULEB 1X3NA 4BR5A 4CZMA 5BRFA 2NRHA 4HWIA 2E8AA 5AR0A 3AAPA 3DXKB 3VOVA 1BG3A 3O08A 4JAXA 1HUXA 1NLVA 3C0BA 1E4FT 3A5OC 2P9NA 3MDQA 4WQ5A 3B8AX 5KQDA 2QW9A 4XH5A 4BRQA 1LCUA 3JS6A 4H5NA 3L0QA 2FF3B 3H1QA 5BPMA 3ATUA 4WQ4C 2ASOA 3FZKA 1BU6O 3JXUA 2IVNA 5ADXH 1EQYA 1C0GA 5AQRA 3GG4A 4DCHA 5KPRA 4IWVA 5BPNA 2ZGZA 1BA1A 2P9UA 2IVPA 1QQNA 3O5BA 3ZEUB 3QB0A 1BOTO 3CJ7A 3U8XA 1GLEG 1HLUA 2IVOA 1NGJA 3CJ9A 3W3DA 1NGIA 5JICA 3A5MC 2P9SA 3U9DA 3VEVA 3IMXA 5AQTA 3TU5A 4H5WA 4IO8A 2YHXA 2A41A 4IJAA 1DGKN 2QWPA 1ESVA 4GNIA 1T6DA 4H0XB 2J4RA 3ZETB 3H1VX 3QDKA 3CERA 1BO5O 3EKSA 2YCHA 3LL3A 4PL8A 1BDGA 4IJNA 1LOTB 2F9WA 3LDLA 3ULEA 4BR0A 4B9QA 4L3QA 4B1UB 2P9IA 3UB5A 2E2NA 4FWLA 4FSVA 3DXKA 3ZX3A 4ISGA 4IZ9A 2E20A 4BRMA 1QZ5A 1YUWA 4H0TB 3ZX2A 4J8FA 4CZLA 2EWSA 3O6WA 4MO4A 3DJCA 4FWQA 5AQQA 4E1JA 1SAZA 1XUPO 4FPBA 4BREA 2Q0UA 3EZWA 2D0OA 4B1VA 3BF3A 1HJOA 1NGGA 3H46O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JI3K 4AM7A 1NK0A 3WEEB 5FPEA 2KLAA 4JKGA 3L2RA 1VQ6N 2W42A 3PX0A 3LALA 4CHOA 2QWMA 5AQUA 4BR4A 3AVMA 4CHPA 3LPTA 1JXEA 2X6SA 3VESA 3D6RA 3SAGA 4W5OA 4FJHA 1U2VB 3WXJA 2GTDA 2VGNA 1YT3A 1SKSA 4BWJA 3OYKA 4CZJA 2ZJQL 3ZSWA 4CGGA 3WXLA 2ASPA 2HBMA 1EWRA 4CI6A 1XNQK 3B6OA 4OPKA 3KD1E 2Q1NA 3K0SA 4JI8K 1WSGA 1EO1A 4ILJA 3VF2A 4EHTA 3QFUA 3BGRA 4ICLA 5GADP 4NB4A 1F21A 1HKGA 1SL1A 3LANA 1Q9XA 1VSEA 1CLQA 4I9LA 1GLCG 4DV3K 2HF3A 2O8EB 1WN7A 4RG8A 3BZCA 3OYNA 1HRHA 3CG7A 1M90O 4Z0UA 1GLAG 3EEQA 4IFVA 2Q3SA 5J2QA 4KB0A 4I7FA 2P1JA 4JS4A 2H3GX 4FPAA 3QESA 4CCHA 5CY4A 1NGHA 2NRWA 1TVRA 3O3GA 1YAGA 4Z4HA 3QEIA 2AP1A 3D2EB 3M6GA 3A8YA 4FWPA 5GIPA 5KPZA 4BQLA 4B8AB 4YOTA 2A1SA 4BRGA 1NJWA 3OHRA 3Q7BA 4DR1K 2FBVA 4FK0A 4DQPA 1IBLK 3EL2A 3RR8A 1HR0K 1VHXA 1BUPA 5CYMA 3J7ZO 4K8ZA 2Z1GA 1NGBA 1KSPA 3LZJA 4CZEA 4MO5A 4CZIA 4F9OA 3UE5A 2F4VK 1Z25A 4M3TA 4BC3A 3I55N 3AA2A 2CGLA 4E7HA 1NG9A 1SKWA 2YKNA 1ZC6A 5HRNA 1Z26A 4ID5A 5FDLA 4CD3A 3AY9A 1T8EA 2HSTA 1TUUA 1NJIO 4WCEL 4RW4A 3E9OA 4CW7B 4E3SA 5J1EA 3RSEB 3M3ZA 1YHQN 1KD1O 2HVHA 4KH5A 3CFPA 1U48A 3NF9A 5C25A 3CCRN 2Q2RA 2PYLA 1W0HA 1QTMA 4OLAA 3L3VA 1ASUA 5EXWA 4DTJA 5KGWA 2UUBK 5AQSA 4KHUA 2X78A 5I3UA 4UQGA 1JJ2M 3ZSYA 4FWMA 4JI7K 3U6FA 5E84A 2QWOA 3DLHA 3RRHA 1Q7YO 1S6PA 4BR2A 3TAPA 4BRDA 4B8CA 4KHQA 3H6EA 4FL9A 1B9DA 5E26A 3CJCA 3DXMB 4JKCA 1DTQA 3G4SN 3KWIA 3A2FA 3OS1A 1C1CA 4BVOA 3O9UA 4DSFA 4AHTA 5T7BA 3PIOL 4B3SK 4LSNA 2Y1IA 1IG8A 4CBUA 4PY5A 4IEEA 1LW0A 3HTVA 1S6QA 2DPNA 3G71N 1OH7A 3AGRA 4KHPK 4K42A 3ZSVA 2JGUA 5F1XA 1QVGM 4IOXA 5LJWA 3AO3A 1EX4A 3FFKB 3IFRA 4E1MA 3TAGA 2OPSA 3J81O 2BDPA 1C0UA 3V9UA 1NJZA 3QBWA 4CGHA 3O3HA 3PV8A 4FLYA 2HNYA 4TSXA 2QI2A 3KLEA 1RBVA 2UUAK 4E7JA 4N56A 1ZBHA 1XWLA 2E6LA 4JI0K 1HYZA 3WNGA 1ATNA 3ZT1A 2F96A 4HHTA 3P1GA 4HTLA 4ISFA 1QQCA 2DTUA 3F5TA 4Q0BA 3WXKA 3THWA 3FZFA 1FK9A 3E01A 4BVPA 3O1BA 1N33K 3QO9A 4KBOA 4BDZA 4DG1A 2NRZA 4NXMK 3VA0A 1JCFA 1NGCA 1TKZA 2QM1A 4W5TA 4KHYA 3S3NA 1TYQA 4BRLA 4HUEA 4BRIA 2VYPA 4FLTA 3QLHA 1L3UA 5C12A 4DFPA 4Z4GA 2HNDA 1HQEA 3MX2A 4KTWA 5KQ8A 3MK6A 4C8NA 3D45A 1ZBSA 3MN6A 3C6AA 3V1RA 4W5QA 2IOCA 3LAKA 2RKIA 1RT6A 3LWMA 2FBTA 2Z1HA 4YDUC 2W6KA 4WF9L 3SUNA 4E0DA 4KKOA 4JKAA 4H5RA 4PL7A 5HBMA 4OKJA 5HRPA 4FJIA 3JAMO 4JN4A 4JD2A 4EZ9A 4CERA 3SMSA 1HJRA 3O9SA 3HL8A 1JLBA 1QVFM 1XC3A 2NUBA 1RBSA 1HPZA 1HPMA 1RBRA 4DQ8A 5FRMA 2P5OA 1RDWX 1KLNA 2GUIA 4GV9A 4JKHA 3E66A 1CZBA 2EX3A 4KH4A 4NLCA 3THYA 2QTDA 3AO2A 4CEEA 2P9UB 4KTZA 3NVKA 3OYGA 1GLFO 4AHCA 4E19A 1VQ4N 2RF2A 5AJ3K 3CM5A 4KH6A 3DM2A 5C15A 3O9TA 4K8XA 3HJFA 1BWFO 3VMFB 5H1SQ 3VTHA 3ULEB 1X3NA 5BRFA 5DM6L 4GKJK 1KVBA 4HWIA 3SYZA 3VQ9A 2OA8A 3OS2A 4BDYA 2E8AA 3EY1A 3AAPA 3DXKB 4JI2K 3VOVA 3O08A 1TKDA 4JRPA 2G8IA 3N4PA 3PX4A 1ZBIA 3B8AX 4XH5A 1LCUA 2FBYA 4GVMA 2YV0X 2XY5A 1HMVA 1SS6A 2ASOA 5DK5A 3DLLL 5AQRA 2O8FA 3GG4A 4DCHA 5KPRA 1TK0A 4FK4A 1LW2A 3OYMA 3KK2A 3F73A 3ZEUB 3O5BA 3TR8A 1CXQA 1BOTO 3CJ7A 4X65K 4CF8A 2ZM6K 3C6TA 2IVOA 3ZT0A 1U4BA 3NBPA 1IKXA 3AVJA 5HRRA 4XIUA 4DV2K 2XY8A 3CMAN 2VGMA 2A41A 4GNIA 1A5XA 2KFZA 1REVA 2HVIA 4BY9C 4L8RB 3H08A 3K9JA 1NK9A 3CERA 4PL8A 4YOUA 2YCHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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