2EWSA

Crystal structure of s.aureus pantothenate kinase
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
267
structure length
260
Chain Sequence
MKVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIIPGDLTAANFGHVLHHLDADFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Prokaryotic Type II and Type III Pantothenate Kinases: The Same Monomer Fold Creates Dimers with Distinct Catalytic Properties.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Pantothenate kinase
molecule tags Transferase
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
total genus 95
structure length 260
sequence length 267
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2005-11-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ewsA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ewsA01
4BRDA 2F9WA 3D2EB 4H5WA 4WQ4C 2F9TA 2P9LA 4BG9A 1V4TA 2QWOA 1Z05A 3BUZB 3UKUA 4JN4A 1E4GT 4J8FA 1RFQA 4DQ8A 1KAXA 4XH4A 3S41A 1T6DA 4ISFA 1MWKA 4CZJA 1LOTB 2E2QA 1R59O 3ZX0A 3CETA 4YDUC 4K43A 4BRNA 4K42A 4QS9A 1XC3A 2IIRA 4BQLA 3VEXA 2E20A 5AQWA 4M7YA 5BPMA 5KPTA 3FFKB 1RDWX 4BR2A 2P9UB 4ISEA 1QQOA 4QS8A 3SJHA 4CI6A 1YVNA 2QWPA 3BF3A 3CIPA 3UB5A 2W41A 4E1JA 3U9DA 2ZGZA 3O8MA 2YHWA 5CE3A 2GEMA 2ASMA 3B8AX 3MN7A 2FSJA 3MDQA 4K25A 4B1VA 5LY3A 5AFUA 2DPNA 1BUPA 4CZHA 3EO3A 1ATNA 4JNEA 2KHOA 4JAXA 4BR9A 2P9NB 3GDQA 4A61A 1EQYA 3IDHA 3L4IA 5EX5A 3M6GA 4WYBA 5AQFA 3O5BA 1NGDA 1X9JA 3FE1A 4BRCA 2VWBA 1MDUB 4BC3A 2QWNA 5AQMA 3DJCA 5KQDA 3W0LA 3HI0A 3L0QA 4EHTA 1WUAA 5AZIA 5B8HA 4XEIA 3UE5A 3FZLA 2A6AA 2E2PA 3IUCA 5BN9A 2NZTA 1X3MA 3QICA 3FZHA 4WQ5C 2VYPA 3A5NC 3JXUA 4DCHA 3LDLA 2A42A 1U6ZA 5E84A 3GL1A 2E2NA 4CJ7A 3MCPA 3DXKB 2CGKA 5AQNA 3U9ZA 3D7EO 4BRKA 4CD3A 3O08A 2QWLA 3CJBA 3KHYA 4CBXA 4FWKA 2GELA 2IVNA 5AQGA 4IO8A 2P9KA 4BR7A 3WQUA 5LJVA 1NLVA 3AY9A 4BGAA 4XH1A 3C0BA 5KPZA 3WEEB 2EWSA 2NLXA 2WUSA 1JCGA 3FLCO 2QXLA 1QQMA 1SZ2A 4BRPA 2ASOA 5FPEA 4FWSA 1P8ZA 3VGKA 3CQYA 3FR0A 3SMPA 5BPNA 1NGGA 5AZIB 1IJJA 1MWMA 4CZMA 3HZ6A 3LDOA 4CZGA 3ZEUB 4PKIA 4C23A 3M3ZA 3VEWA 1XUPO 3FZKA 3O80A 3M1FA 3WT0A 3CJ7A 4DHYA 1SQKA 1KXPA 4CZEA 4CZLA 3WUHA 4BROA 1NGHA 2H3GX 4CZIA 4BREA 1V4SA 1C0FA 1TUYA 3KZBA 1WOQA 5AQTA 3VF2A 3VENA 3ID8A 4WQ4A 1H1VA 4BRIA 5AZJB 3IFRA 5I9EB 4B1UB 2I7NA 1G99A 3F9MA 3CJAA 1NGEA 2P9IA 1U2VA 1YAGA 2ASPA 1T44A 2GWJA 3EKSA 5F0XA 2YJFA 3DXMB 4PL7A 3ZX3A 3H6EA 4M63C 4BG8A 2P9SA 4YDUA 3GG4A 1SAZA 3QBXA 4BVOA 3H3NO 3A5LC 3WXKA 4JD2B 3TU5A 2UYTA 3VOVA 1NGCA 3LDPA 4FWQA 2Q1NA 2OANA 5BN8A 1KAZA 1HX1A 3CJ9A 4AM6A 2ZGYA 5EXWA 1GLBG 3ZETA 5AQIA 4M7XA 4RTFD 4B1XB 4GNIA 3RSEA 1NWKA 2CH6A 4BVPA 2P9LB 3I8BA 1JCFA 2E2OA 1Q18A 2QWMA 5ADXH 3LDNA 2D4WA 1Y64A 3CERA 1NBWA 1BU6O 4EAHD 3GE1A 2ITMA 3SMSA 3UKUB 1Z6RA 2IVPA 2D1KA 3H46O 5F2RA 3HM8A 2QW9A 4IZ9A 4BC5A 1HLUA 3UKRA 4HTLA 4H0VB 4BRLA 5EOYA 3VF6A 1CZAN 5LJWA 5AFUH 1LCUA 4BC4A 1HKCA 1BG3A 4QS7A 4FPAA 4FOEA 3A5OC 5ELZA 2YI1A 3WXLA 2D0PA 3H1VX 1GLCG 1K8KA 4BR0A 3VERA 2FXUA 4BR5A 4FWNA 3AAPA 3R8EA 1TYQA 3QFPA 4WQ5A 3D2FA 4H0TB 1KAYA 1NMDA 3QFUA 1GLLO 2V7YA 4FO0A 3H1QA 4H5TA 3ULEA 3QBWA 3BF1A 4BRMA 3HBTA 5JMVA 3LM9A 3VF4A 2A41A 2V51B 2CH5A 4IJAA 1QZ6A 2AP1A 2PAVA 4H5NA 4H0XB 3UKRB 4H5RA 3EZWA 5AQLA 5E26A 1GLEG 3MK6A 2E1YA 3EKUA 3W3DA 2AA4A 3D2EA 3CI5A 4HWIA 1QQNA 3U8XA 4B9QA 2GWKA 5AQKA 5AQJA 5BPLA 5AQQA 3VEOA 4Z94A 2A40A 5JLHA 5JICA 4CBUA 1OKJA 3FGUA 3ZX2A 1BA1A 4RCHA 4AM7A 3AARA 3WXIA 1K8KB 1ESVA 4FPBA 1TUUA 1IG8A 3R6MA 5AQOA 4FOIA 3SLCA 5AQPA 3D2FB 2J4RA 4EFHA 1HKGA 1NGAA 5FPNA 1D4XA 4H5VA 4Y0WA 3H45C 4L3QA 1GLDG 4BRQA 3O4WA 4XH5A 4I6MA 4EHUA 4ISGA 2NRHA 2I7PA 2GUPA 2P9KB 4CZKA 1RGIA 5KPRA 2P9UA 3R9PA 1HUXA 5BRFA 1BDGA 2E1ZA 4MO4A 3U4LA 1HPMA 1X3NA 3P4IA 4H0PA 2Q0RA 2P9PA 2D0OA 3G25A 4IJNA 2HF3A 2W40A 4BC2A 4IXCA 4RWTA 2FF6A 2ZF5O 4A2BA 4BRHA 2Q2RA 3QB0A 5AQVA 1NGFA 4FWLA 4LC9B 3LM2A 2P9NA 3QDKA 5AQSA 1BOTO 4BRFA 3HSCA 3ATUA 1HJOA 2A3ZA 3LDQA 3CHWA 2Q0UA 4BRAA 2BUPA 2HF4A 1MA9B 4B1YB 5AQYA 3ENHA 4I6MB 1GLJO 2YJEA 3I33A 3EN9A 3MN5A 5BR9A 3ENOA 3VEZA 2FSKA 4F9OA 3A8YA 5ADXA 1NGIA 1J6ZA 1BWFO 3HTVA 4H0OA 1ZBSA 3KVGA 2FF3B 3FZFA 4FWOA 2P9IB 3DAWA 3AAQA 1U2VB 3MN9A 4JHDA 1ATSA 3O6WA 5BRHA 3DXKA 5EVZA 5AQZA 2P9PB 3IMXA 4EIAA 5BREA 3MN6A 3VPZA 2P9SB 4A2AA 1QZ5A 2QM1A 4KBOA 2FLOA 5TKYA 3GOIA 2HOEA 4BQZA 5BRDA 3VGLA 1S22A 4MLEA 1DKGD 3QMLA 1GLFO 3SK3A 3CJCA 2CGJA 4NO7A 3WEEA 4FWPA 3VEYA 1NGJA 3ZETB 4BGBA 1XQSC 5EY4A 3RSEB 3VESA 2E88A 3WXJA 2YCHA 1DEJA 3BEXA 1S3XA 3ATVA 2ZWHA 1NM1A 3VEVA 4CBWA 2BTFA 4DB3A 2GTDA 4H03B 1ZXOA 3C7NA 2Q36A 3ZEUA 4B1WB 3BP8A 1GLAG 3LL3A 3VGMA 2QWQA 3JS6A 4PKHA 4JHDB 1BA0A 3MMVA 2HMPA 2Q31A 3H3OB 1DGKN 4GY2B 5AQRA 1E4FT 1T6CA 4NB4A 5AQHA 3CJ1A 2Q97A 5AQUA 2E8AA 4PL8A 1BO5O 3EL2A 1C0GA 3GBTA 3J8AA 3A5MC 1NGBA 4MO5A 4IWVA 5F1XA 1JCEA 1YXQA 5AZJA 4FWMA 2FSNA 5JLFA 2IVOA 4O8KA 1QHAA 2CGLA 4H0YB 4CD1A 5KQ8A 1ZC6A 3VETA 5FPDA 2PBDA 4BR4A 3WQTA 1TYQB 2YHYA 4B1ZA 4K41A 1HKBA 4A62A 4O5FA 3A0IX 2V52B 2A5XA 2YHXA 2VCPA 3O1WA 3DXMA 5FPMA 1YUWA 4FSVA 3ULEB 2QWRA 3OHRA 1ATRA 4MLHA 5AQXA 3CQXA 5AR0A 4FL9A 4CZFA 4FWRA 3C7NB 3TPQA 3O1BA 3DWLA 3L6QA 4JD2A 4PKGA 3FZMA 4BRGA 2V7ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WNGA 2HW3A 1QSLA 2F9WA 4WQ4C 3PSIA 4QCLA 1YVUA 4Z0UA 3IRXA 4CHYA 1YITN 3E9OA 1KLNA 2QWOA 4IFEA 5C42A 2W6KA 4DQRA 4NYNA 1HNZK 1RFQA 3RR7A 4GVMA 2KQ2A 4CJPA 4JI6K 1LOTB 4A5BA 4IG0A 3ZX0A 4MQ3A 3QNOA 1RTDA 3KLHA 3OJUA 3E66A 4I9QA 4F3TA 1VRTA 4IBNA 1RDWX 4WF9L 2P9UB 4ISEA 3J7ZO 2PY5A 2QWPA 1ZBHA 2YKNA 2D0BA 2W41A 1U49A 4E1JA 1ITGA 1GOBA 4KHSA 2HBKA 3HVRA 4WFNL 4CFAA 4JNEA 1ATNA 1KLMA 4JAXA 2P9NB 3GDQA 4KKOA 2G8UA 1EQYA 2IS3A 3K58A 1NGDA 4HUGA 1QSYA 2VWBA 4AH9A 4E7LA 4LH4A 1L3TA 4LY7A 3PO5A 2KFZA 3PX4A 4E0DA 4IEEA 3TWHA 4GKKK 1IKXA 3W0LA 1WSGA 1RT2A 2GBZA 1WUAA 1VSMA 3VTIA 5B8HA 4XEIA 4B9VA 4LFBK 2VGMA 1X3MA 4F2RA 1BIZA 4WQ5C 3A5NC 4DCHA 2A42A 5E84A 2HBMA 3MCPA 3NFAA 5C24A 3MX5A 3RRGA 5AQNA 3U9ZA 3RVCA 1BI4B 4BRKA 3T19A 3KHYA 3OYLA 4M3ZA 2IVNA 5GIOA 4BDPA 2WOMA 5LJVA 1UOCA 4Q5VA 4K8ZA 3VQPA 3WEEB 2EWSA 4IOCL 3E9LA 4OPAA 1KD1O 2KKZA 4F3OA 1EKEA 1SZ2A 1IKYA 3SMPA 2UXBK 3ISNC 1MWMA 4CZMA 3CCRN 4I9LA 3OYDA 4PKIA 3DMJA 4C23A 3M8QA 4DR6K 4M3RA 3I0SA 3VEWA 1A5WA 3RMCA 3OYGA 1NMNA 1XUPO 1LAWA 3FZKA 3M1FA 2XY5A 1SQKA 1KXPA 1XWLA 2DY4A 2NRWA 4CZLA 4AHTA 2H3GX 4KHWA 1OH5A 3VENA 4CJWA 4E19A 1RT5A 1H1VA 4WQ4A 1YI2N 4CGGA 5I9EB 4BE0A 4FK4A 2NRTA 3HPGA 1EWRA 2UUCK 4B3OA 3OS2A 4B9TA 4TSXA 4B3RK 4YOVA 3EKSA 2RN2A 2YJFA 3ZX3A 5JVGL 4JRQA 1L3VA 2P9SA 4DQQA 1UA0A 4MDBA 4FVMA 2ZM6K 2PYLA 5HL7L 1S9EA 2UYTA 5A2QO 3NH0A 3LDPA 4A59A 2KLAA 4PHTX 1KAZA 3SUNA 1KSPA 4G9ZA 3ZETA 3ZSWA 4B1XB 4GNIA 3OYIA 1WSIA 3C6TA 2E2OA 4O0JA 4OPKA 2DFHA 2DFFA 1JKHA 2ITMA 2IVPA 3ZSYA 4K0KK 2XY8A 3AVKA 3SPZA 3UKRA 1S5JA 3EE8A 4HTLA 5JVHL 3NGIA 4OJRA 1CZAN 3DLLL 2VQEK 3HYFA 4CJTA 1M1KO 1S72N 5ELZA 4FOEA 3LAKA 3K5OA 3H1VX 3THWB 1GLCG 3LWLA 2FXUA 4ELTA 1TYQA 4WQ5A 2ZE2A 4CF2A 4KHNA 1JLBA 1KAYA 1NMDA 2V7YA 4H5TA 4OPHA 1OVQA 3NGZA 4M45A 5SWMA 4DFMA 4JV5K 3BF1A 1VQLN 1XHZA 3LM9A 4CGDA 3C94A 4J2EA 3DRSA 2YNHA 2O8DA 2AP1A 3MECA 3NE6A 4GV3A 3OS1A 3U3GA 3CMEN 3K9JA 3MK6A 3EKUA 3QEVA 3D2EA 4HWIA 2G8FA 5AQQA 1DTQA 3VEOA 2A40A 5JLHA 5LMNK 2HNZA 1ZYQA 1EETA 3ZX2A 1BA1A 1RDAA 2HNYA 3WXIA 4FPBA 3OYJA 1TUUA 1IG8A 2X78A 2F7TA 4FM1A 5AQPA 3SYZA 3D2FB 3MWTA 1I3AA 4EFHA 4OVLA 1SKSA 1HKGA 2D5RA 3OYEA 1BCMA 2XHBA 2HBLA 3E9PA 4DV0K 2E5LK 1D9FA 1SKWA 1VSLA 2GUIA 1GLDG 4BRQA 1C1AA 1I39A 5FRNA 2NRHA 3QEXA 2EX3A 4CZKA 1RGIA 5J2PA 4CIFA 2A1SA 4C8KA 3AV9A 1HUXA 1N33K 4DU1A 4M3TA 1WNSA 3J7YP 2KTQA 4HTUA 3L8BA 3V9XA 1TK8A 4A2BA 2PYJA 3HO1A 3OTOK 2Q2RA 1QHTA 4FCYA 3CF5L 4LC9B 3TSPA 3F73A 2NRVA 1BOTO 3HSCA 3ATUA 3PSFA 5GAGP 3HJFA 3K5LA 3V1OA 3LDQA 4BRAA 3WNEA 4CF0A 4I6MB 4KHPK 3MN5A 3M8PA 3AVJA 3VEZA 3ZLJA 5ADXA 3A8YA 1NGIA 1J6ZA 3RMDA 2RHKA 1YJNN 4JK7A 4CJSA 4JI7K 3O6WA 4FW1A 4ID1A 2RPIA 4BE1A 1JL2A 1FJGK 4MDAA 2P9SB 4A2AA 2QM1A 4DTUA 4KB1A 1RDDA 2ZJPL 3DLKA 4BQZA 3TTCA 1S22A 3IG1A 3KLFA 4N76A 4M3UA 2IOCA 3KWIA 4NO7A 3O3HA 4FWPA 4JEPA 3NMUA 1NGJA 3ZETB 4C1NK 3HOSA 2D0AA 5SZTA 2YCHA 1RDUA 5J2NA 1S3XA 3NH1A 2RF2A 4CHOA 2B5JA 4H03B 3CPEA 4A5AA 1B9DA 3WXMB 3BP8A 3OVNA 1BA0A 1NNEA 1VSFA 2HMPA 4ICLA 1DGKN 5AQRA 3EZ5A 3V81A 1ZBFA 3CJ1A 5C0YA 4PL8A 4GV6A 1VSDA 1NK6A 1YXQA 2VWJA 5HROA 3OYCA 2IVOA 4O8KA 2PZSA 2CGLA 1ZC6A 1C1CA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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