2EWSA

Crystal structure of s.aureus pantothenate kinase
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
267
structure length
260
Chain Sequence
MKVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIIPGDLTAANFGHVLHHLDADFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Prokaryotic Type II and Type III Pantothenate Kinases: The Same Monomer Fold Creates Dimers with Distinct Catalytic Properties.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Pantothenate kinase
molecule tags Transferase
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
total genus 95
structure length 260
sequence length 267
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2005-11-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ewsA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ewsA01
2E2PA 3MDQA 4BRLA 3H46O 1HJOA 5AQXA 3LM9A 4JAXA 3D2EA 1YVNA 5FPMA 1GLFO 4FWSA 4XH1A 2OANA 4O5FA 2QWRA 2V7YA 3DJCA 4WQ4C 3P4IA 1Z6RA 3CJ9A 3WXIA 2D4WA 2HMPA 5EX5A 3VEWA 5AZJB 4A2BA 3LDOA 4EHTA 3ENOA 2QWMA 3L6QA 2VCPA 4CZIA 3S41A 2P9IB 5BRDA 4JD2A 3O4WA 2ASMA 2J4RA 2P9SA 1QZ5A 4DHYA 3FZMA 3VESA 4BC4A 1QZ6A 1NGJA 4HTLA 4JNEA 3CQYA 3WXLA 4WQ5A 4WQ4A 1NBWA 4BRDA 2ZGYA 1JCGA 2P9LB 4K25A 4B1ZA 1ATNA 3A5LC 3DAWA 5F1XA 4AM6A 4MLHA 4IXCA 4BC5A 3H1VX 3O6WA 1BWFO 2QW9A 4B1UB 2H3GX 2Q1NA 5EOYA 3HM8A 2YHYA 2VWBA 3FZFA 1TUYA 3VEOA 1KAZA 3H45C 1NLVA 3EN9A 4EFHA 1BG3A 2ZF5O 3UB5A 3WQUA 1NGGA 3OHRA 4FPAA 2FLOA 2E2QA 4BR5A 4BG8A 2IVOA 2PBDA 4BREA 5AZJA 4PL8A 1ZBSA 4BVOA 1XQSC 4JHDB 4BR4A 5KPTA 3O1WA 4BC2A 4WYBA 3FZLA 1BDGA 5AQOA 1NWKA 4FO0A 3MK6A 3U8XA 2NRHA 1X3NA 2F9WA 5AQZA 5F2RA 2P9IA 5AQTA 3SMPA 4KBOA 4IJAA 3KVGA 1GLJO 2HF4A 4BR7A 1GLLO 2P9NB 3D7EO 3ZX0A 2A40A 3ZETB 5BPLA 2ZWHA 3UKUA 1BA0A 1WUAA 2P9LA 4CZGA 4H0TB 3FE1A 3RSEB 3CJ1A 5AQNA 3ZEUB 5KQ8A 5AQPA 2P9PB 4FWKA 3ENHA 4PKGA 1R59O 4K43A 4JN4A 4H5WA 1NGHA 4RWTA 4BR9A 2A5XA 1H1VA 3LDLA 3VGKA 1S3XA 4RTFD 1C0FA 1HX1A 4JHDA 3VETA 4QS7A 1DKGD 1JCFA 2E8AA 1NGEA 3HBTA 2E1ZA 4MLEA 3DXKB 3ZX3A 1BA1A 2V52B 5I9EB 3CJCA 4K41A 3H3OB 3QFUA 1GLDG 3R6MA 3TPQA 3VENA 3QB0A 2A6AA 2IIRA 2E2NA 2E88A 2AP1A 1Q18A 4CI6A 3IFRA 1BO5O 2D0OA 1MDUB 3CQXA 3ZETA 4DCHA 3CJAA 4FOIA 5EXWA 4BRPA 2FF6A 3RSEA 4B1VA 4FWNA 3ZEUA 3AARA 3A5MC 2P9PA 4QS8A 4H0YB 3M6GA 3M3ZA 4ISEA 1SAZA 3SMSA 4IO8A 2QM1A 5KPRA 1SZ2A 1ATRA 4A2AA 4H5TA 1RGIA 5AQFA 1BU6O 4BRAA 4BRGA 1LCUA 2YJEA 3R9PA 4BQLA 2GELA 4B1YB 1KAYA 2QXLA 3SLCA 3B8AX 2QWOA 2Q97A 4A62A 1IJJA 5AQIA 5E26A 3DXKA 3M1FA 2CGLA 5FPDA 2WUSA 1LOTB 3C0BA 1DEJA 3BP8A 4CZMA 4H5NA 1C0GA 3O1BA 3GG4A 4F9OA 2P9UB 5F0XA 2BTFA 3EZWA 3VEXA 2BUPA 1HKCA 3MMVA 4LC9B 3W3DA 4CZKA 2P9KB 4BVPA 4YDUC 4CJ7A 5BR9A 3LL3A 1CZAN 4H5VA 3FZKA 3G25A 2I7PA 5AZIB 3WXJA 4M7YA 5CE3A 2GTDA 4CBUA 2VYPA 1HKBA 5AQVA 4H0OA 4BQZA 2QWPA 1YAGA 5AQGA 3MN7A 3VPZA 5BREA 4HWIA 4BRKA 3EKSA 3WEEB 3EO3A 3WXKA 5AR0A 2PAVA 4H03B 3VERA 4BRMA 5BRHA 3SK3A 5AQKA 2A41A 4H0PA 4YDUA 1RDWX 3QBWA 5BPNA 3KHYA 4IJNA 3U9DA 3I8BA 2YHXA 3L4IA 1J6ZA 5B8HA 3GDQA 3H1QA 2Q36A 4B1WB 4CZLA 1HUXA 1OKJA 3A0IX 3GBTA 2QWNA 3AAQA 2NZTA 4H0XB 3F9MA 4CZJA 2P9KA 4H0VB 4DQ8A 1E4GT 4FL9A 4FWQA 2EWSA 2NLXA 4H5RA 4EHUA 4MO5A 2ASPA 3AY9A 3O80A 3UKRB 4Z94A 5AZIA 1MA9B 3VOVA 5AQUA 4FSVA 4IWVA 1ESVA 2HF3A 3HSCA 3EL2A 4ISGA 3D2EB 5EVZA 4M7XA 3VF2A 2DPNA 1HPMA 4XEIA 1GLEG 3QICA 3VF6A 2CGKA 2I7NA 1ZXOA 4BRFA 5FPEA 2E20A 3IUCA 3LDQA 4B9QA 4BGAA 4L3QA 5AQQA 5LJWA 2P9NA 3LDNA 3WEEA 2GWJA 3FR0A 3DXMB 5E84A 1SQKA 4ISFA 1TUUA 3QBXA 1KAXA 3HI0A 3H3NO 3A5OC 2FSNA 1NGDA 3CERA 1QQOA 1HKGA 3MN9A 3C7NB 1GLCG 4FWMA 2E2OA 2IVPA 4J8FA 2FXUA 4Y0WA 2QWQA 4NB4A 4BRNA 3WT0A 3QFPA 5JLHA 3MN5A 1MWKA 1U6ZA 4FOEA 4A61A 3BF1A 3UKRA 1Y64A 4FPBA 4MO4A 1EQYA 4I6MB 2YCHA 3J8AA 3A5NC 1U2VB 2AA4A 3WUHA 2QWLA 2FSJA 2HOEA 1QQNA 3L0QA 2FSKA 3QDKA 5TKYA 1K8KB 5JICA 1X3MA 4BRQA 3HZ6A 3FLCO 1QHAA 1BUPA 4BRIA 3FFKB 4WQ5C 3KZBA 4BRCA 2YHWA 3UE5A 3A8YA 3BEXA 3GE1A 3ULEB 2V7ZA 1ZC6A 2GWKA 5ADXA 3FGUA 3DXMA 5AQMA 3VF4A 4BRHA 3BF3A 3GOIA 4GNIA 1ATSA 4IZ9A 3O08A 1S22A 4E1JA 5ADXH 5EY4A 3VGLA 3ATUA 3LM2A 1G99A 3C7NA 3VEZA 1NMDA 1NGIA 1V4TA 4CZHA 3W0LA 4XH4A 2D1KA 1YXQA 1YUWA 4B1XB 4C23A 3UKUB 3R8EA 2W40A 3I33A 3H6EA 2FF3B 1TYQB 1T6DA 3SJHA 4I6MA 1T6CA 3MN6A 2YJFA 5BRFA 1NM1A 1U2VA 4QS9A 3JS6A 4CBWA 2A42A 1Z05A 2Q31A 3U4LA 1K8KA 3IMXA 5KQDA 4CZEA 4BR0A 4FWLA 5AQYA 2CGJA 5FPNA 4EAHD 1MWMA 3CHWA 4DB3A 2Q0RA 1E4FT 4RCHA 3ULEA 3VEVA 4AM7A 2V51B 4CZFA 5AFUA 3AAPA 1NGAA 4O8KA 1NGCA 2F9TA 2ZGZA 5KPZA 3ID8A 1KXPA 5AQHA 2P9UA 3IDHA 4BC3A 5AQRA 4BROA 3WQTA 5AFUH 3O8MA 4EIAA 3CI5A 4BG9A 1V4SA 1X9JA 4PKHA 2IVNA 5BN8A 4PKIA 5AQSA 5BN9A 3TU5A 5AQLA 5LY3A 2CH5A 1JCEA 3VEYA 2YI1A 3D2FB 1HLUA 5AQWA 2E1YA 5AQJA 2W41A 4NO7A 1TYQA 1GLAG 1NGBA 3GL1A 4GY2B 4BR2A 2D0PA 3O5BA 3DWLA 3FZHA 2ASOA 2Q2RA 4BGBA 3CJ7A 5JMVA 5LJVA 3U9ZA 2A3ZA 1T44A 3HTVA 1BOTO 2CH6A 3CIPA 4CBXA 1DGKN 3CJBA 4FWOA 3ZX2A 3JXUA 1GLBG 2ITMA 4PL7A 3QMLA 4CD1A 4M63C 2GEMA 1WOQA 4K42A 3BUZB 5BPMA 1QQMA 1IG8A 3CETA 4JD2B 2P9SB 3VGMA 3EKUA 1XC3A 5ELZA 2Q0UA 5JLFA 1D4XA 4CD3A 3MCPA 3LDPA 4FWPA 1P8ZA 2GUPA 1NGFA 1RFQA 1XUPO 4XH5A 2KHOA 2UYTA 4FWRA 3ATVA 3D2FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2E2PA 2O8DA 1HJOA 4JAXA 4Z4GA 2BGGA 3OBWA 2A1RA 1Z25A 4OPHA 1S1UA 3TTFA 4B3RK 1Q7YO 4FWSA 4XH1A 5M1KA 2D0CA 4E1MA 3AVGA 2YV0X 2V7YA 3VQEA 3NGZA 4X66K 4CFBA 1GOAA 3K9JA 2HMPA 5AZJB 4EP4A 3SQ0A 3QNNA 3AVJA 5IWAK 4Y1DA 4DTSA 2ZJPL 3B6OA 3L6QA 3QNOA 1KVBA 4JD2A 1X9MA 4WFNL 3V9WA 3KWIA 3VESA 1E3MA 1JLEA 3NGYA 4FLYA 2ZJQL 5CY4A 3PV8A 1VQ4N 3CQYA 2ZGYA 3K5MA 2IC3A 5F1XA 5HROA 4DU4A 4B3OA 4OLBA 2XRIA 3O6WA 2H3GX 2B4JA 2KTQA 3VEOA 4X62K 1KAZA 3H45C 4YFUA 4EFHA 1BG3A 3R3LA 3J80O 3V9UA 1JLCA 4BG8A 2QKBA 4BREA 1KC8O 4JHDB 4ZTJA 5KPTA 3F9KA 1BDGA 5AQOA 4H8KA 5J2PA 2RHKA 1NWKA 4KPYA 3C6UA 5AQZA 5AQTA 4KHWA 3P83D 4JK8A 4KBOA 3KVGA 4B9VA 3VQ6A 3MECA 2PFUA 3CM6A 4N41A 3AVAA 3J7AP 3M8SA 3O4NA 4ELTA 4ELVA 3DRSA 5E41A 3SZ2A 4LF9K 1HPZA 3FE1A 3LPUA 4HUFA 3VQ4A 4HCBA 3ENHA 1XMOK 1R59O 3T69A 4HUGA 2PYLA 3ITHA 3VGKA 4RTFD 4R79A 1Q9XA 4WE1A 3NHGA 4LF5K 1O13A 1JCFA 1VK0A 2E1ZA 3TAEA 4B9MA 2RPIA 4DSIA 4E0DA 2V52B 4K41A 3ZSQA 3QFUA 1GLDG 2HHVA 3TPQA 3QB0A 3L2RA 2A6AA 2JGUA 1QSSA 4FJLA 2O8BB 2E88A 4CI6A 5M1FA 3CQXA 4FZZA 1VQKN 3IS9A 3TAPA 4FJMA 3SCXA 4JI3K 4BRPA 4BY9C 1IG9A 2ZD1A 4FWNA 3ZEUA 4RG8A 5CHIA 4AF1A 2P9PA 3D45A 4LF7K 3PIOL 2XY7A 4DV3K 1SAZA 4CEEA 1VSMA 4IO8A 3E9PA 3MXMA 4DSEA 4LF4K 1SKSA 4IEEA 3T1YK 1YIJN 4BRAA 3V9SA 3R9PA 2YJEA 2FBXA 4BQLA 1N32K 3VA0A 1KAYA 4DTNA 2QXLA 3CF5L 4DG1A 1JL1A 2Q97A 4A62A 1IJJA 4CF8A 2DTUA 3JAMO 3K59A 3DOLA 4CJVA 1WNSA 3CCJN 3SYZA 4J2AA 4H4MA 1LOTB 4LFBK 1W97L 1BISA 1IKXA 2KKZA 4HVJA 1IBMK 1K6YA 1UAXA 2P9UB 4FXDA 4N56A 3I8DA 3EZWA 4IFYA 4LC9B 2YNGA 2X74A 4BVPA 3PO5A 1HYZA 3AO3A 1FXXA 5AZIB 3LZIA 3WXJA 3TARA 1J5OA 3OS2A 3RMBA 1CZ9A 4U7BA 4A5BA 4H0OA 4BQZA 1JLGA 4IFEA 3VPZA 3KIOA 1C0UA 2VQEK 3WEEB 3EO3A 3WXKA 2PAVA 5BRHA 2A41A 3V1QA 4FLWA 4DFKA 2JWKA 4W5NA 5BPNA 1XC9A 2ZE2A 1ILYA 4IJNA 3I8BA 2YHXA 3L4IA 5B8HA 1VSKA 2Q36A 2YNIA 4CZLA 3A0IX 2QWNA 2NZTA 1J9AA 4CZJA 2P9KA 4FL9A 3C6AA 2NLXA 4M3XA 4CJTA 4NCAA 1B92A 4CGIA 4KFBA 2HF3A 1S1WA 2D0BA 2NNWA 4I2QA 4JI0K 4CJ5A 3CCMN 2EX3A 4M7XA 5GINA 3QETA 3EZ5A 1N33K 3VF6A 2BE2A 4BRFA 1ZXOA 4FK2A 3KLFA 2HNZA 2E20A 2HSTA 3DOKA 3LDQA 3M5RA 2KFNA 4BGAA 4L3QA 1RT2A 3LDNA 4JEPA 4DR5K 1KLNA 3TSQA 3LP0A 1SQKA 1QS4A 4UY8O 1KAXA 3K5NA 4X64K 2HBLA 3H3NO 2FSNA 4RW7A 2WTUA 1QQOA 1HKGA 3ZT0A 3O9RA 1RBSA 3TAGA 3ZT2A 4FW1A 4NB4A 1T03A 1RBUA 3TANA 2QTDA 4FOEA 2G8HA 1ASWA 4A61A 3A2FA 3I55N 4N47A 3FFIA 3N4QA 3QESA 3OYGA 3A5NC 3WUHA 2AJQA 3L0QA 4DTRA 2FSKA 5TKYA 1VSEA 4CHQA 1NK6A 3MEDA 4BRQA 3HSTB 5FRMA 1KTQA 3FFKB 2G8IA 3KZBA 3RR8A 3BEXA 3CD6N 5ADXA 5MLCQ 1HNVA 1U4BA 5KRSA 3CFOA 5HRRA 3S9HA 3DLHA 3GOIA 3AA5X 4E1JA 1EXQA 2HHUA 3MWPA 4BE1A 4CEDA 3C7NA 1BI4A 1VRUA 1NMDA 3E01A 2OPRA 2YKMA 1V4TA 1NKCA 1D9FA 2HBJA 4XH4A 4G9ZA 4FYDA 4DQRA 4F8RA 1X9WA 3I33A 2IAJA 3NF8A 3Q7BA 2OA8A 1T6DA 3SJHA 4PQUA 2P1JA 3I56N 4QS9A 3JS6A 1N36K 3HJFA 3MX2A 2A42A 5KQDA 3PX6A 4CZEA 4BR0A 1YTAA 5FPNA 1MWMA 4AHTA 3QERA 2Q0RA 4RCHA 4Z0UA 3ULEA 4ICLA 3VEVA 1WSGA 4CZFA 1NGAA 2QXFA 4O8KA 4CJUA 3VQ5A 3ID8A 3IDHA 4F3TA 1RILA 1A5XA 4BROA 3WQTA 3PO4A 3OA9A 1JLBA 3AVLA 2IVNA 5BN8A 4TSXA 4ELUA 1NK8A 4ILHA 1C1CA 3KLGA 2E6MA 4GV6A 5LY3A 4DQPA 1W0HA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4PKH A;  4Z4H A;  4PKI A;  5AQS A;  4AHV A;  3RTV A;  1WBD A;  1QVF M;  2HHT A;  3DLE A;  1IO2 A;  1JKH A;  4LH5 A;  3NFA A;  4IOA L;  1S6P A;  5AQL A;  2HB5 A;  2CH5 A;  2GUI A;  3VEY A;  2YI1 A;  2G8F A;  4JI8 K;  3D2F B;  4CJ4 A;  3CC4 N;  4PHT X;  3ZT3 A;  5J2M A;  3ZSR A;  3V9Z A;  1TYQ A;  1ZYQ A;  3GL1 A;  1NGB A;  5C25 A;  4FJH A;  4CFC A;  3AVC A;  1F21 A;  4DKW A;  3FZH A;  1RDU A;  2Q2R A;  4BGB A;  3HPO A;  3U9Z A;  4KHN A;  4LFC K;  2HMI A;  3CIP A;  4DTU A;  1U47 A;  1U04 A;  5KRT A;  1J54 A;  1GLB G;  1GOB A;  2ITM A;  1N8R O;  2GEM A;  2OPQ A;  1WOQ A;  4K42 A;  2F96 A;  3P31 A;  3CPE A;  3V9X A;  3DM2 A;  1IBK K;  2P9S B;  5ELZ A;  3N4P A;  1UOC A;  3KK7 A;  4DV5 K;  1D4X A;  4DS4 A;  3MCP A;  4CJK A;  1D9D A;  1K8A O;  1L3U A;  3CCL N;  3E66 A;  3V4I A;  1NGF A;  1XUP O;  4M45 A;  4BDY A;  2WBN A;  3NE6 A;  1SKW A;  1P90 A;  3IG1 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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