2EWSA

Crystal structure of s.aureus pantothenate kinase
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
267
structure length
260
Chain Sequence
MKVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIIPGDLTAANFGHVLHHLDADFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Pantothenate kinase
publication title Prokaryotic Type II and Type III Pantothenate Kinases: The Same Monomer Fold Creates Dimers with Distinct Catalytic Properties.
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
molecule tags Transferase
total genus 95
structure length 260
sequence length 267
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2005-11-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ewsA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ewsA01
1GLEG 3SMSA 3LDQA 4RCHA 5LJVA 5AQRA 4BR9A 2A6AA 1QQOA 4DQ8A 1LCUA 1OKJA 3I33A 1BA1A 1HKGA 2GELA 2FSNA 1U6ZA 3AARA 3SK3A 4H5WA 4FWSA 4XH5A 1KAYA 3A8YA 2ZGZA 1K8KB 1HPMA 3VETA 3VGMA 1V4SA 3F9MA 3WXKA 3ENHA 4CBWA 3KZBA 2QWOA 4BGBA 3L6QA 4M63C 4LC9B 1XUPO 4NB4A 3H1VX 5BRFA 5AQQA 1QQMA 1KAXA 3WQTA 3ZX0A 1Y64A 2P9KB 4EHUA 4A2AA 3ATVA 3D7EO 5AQTA 1GLBG 1V4TA 1BWFO 2Q97A 4M7XA 2FLOA 2P9UA 4JHDA 3EZWA 2HOEA 2P9NB 2YJFA 3ZETA 4CZLA 3CJ1A 4H0YB 4K42A 2V52B 4PL8A 1C0FA 5E84A 1BU6O 3LDPA 5AR0A 4BGAA 1NMDA 4BR5A 1G99A 2UYTA 3VEYA 3VEWA 3WXIA 1X3NA 3FZKA 2Q36A 2W40A 1ZC6A 3AAPA 4B1WB 3VF2A 3SJHA 2YHYA 3EN9A 1R59O 5AZJA 3O6WA 4PKHA 4EIAA 1GLDG 3ZEUA 2ASPA 2PAVA 3BF1A 4BQLA 5JMVA 1D4XA 1JCGA 3QMLA 3WXJA 4BR4A 3FZLA 2BTFA 4BR0A 1GLAG 2VWBA 3CJCA 3QFPA 3H45C 3QB0A 1YXQA 4CJ7A 2FF3B 4FOIA 1HKCA 4IJAA 3A0IX 3VESA 5BR9A 1ATRA 3DXKA 3DXMB 3EL2A 4BRPA 3WUHA 2ZGYA 3VGKA 5TKYA 3QFUA 3DAWA 4FWKA 3I8BA 2NZTA 2ZF5O 3FFKB 5AFUH 3O80A 4WQ4A 3RSEB 1Z6RA 2QWNA 3VF4A 4BRNA 3A5LC 1DKGD 1ATNA 4CBXA 4PKIA 4IXCA 2QWRA 4MO5A 5AFUA 3DWLA 5AQVA 1DEJA 4BVPA 5AQGA 2VYPA 3ATUA 4RTFD 5BPLA 3CERA 3W3DA 4XH4A 1U2VB 2P9PB 3LDLA 5AQPA 2A5XA 3HZ6A 3HI0A 3ULEB 5EOYA 5BRHA 3HBTA 1RGIA 2F9WA 3WT0A 1GLCG 3MN6A 4GNIA 5LY3A 1P8ZA 3AY9A 3EKSA 4H0TB 2GTDA 3W0LA 1K8KA 1S3XA 3CIPA 3GE1A 3U4LA 2J4RA 4QS7A 3GOIA 1NGFA 1NBWA 5AZIB 5JICA 4BRAA 3M3ZA 5F2RA 2P9KA 5LJWA 3FZHA 4H5RA 4H0OA 1RDWX 1RFQA 3WXLA 1MWKA 4Y0WA 4BQZA 3FZMA 2P9NA 1NGIA 3FZFA 3SLCA 2QWQA 3EO3A 2ASMA 1CZAN 2D4WA 2FXUA 3R8EA 3WEEB 1NGGA 3SMPA 2ASOA 2E2PA 4AM7A 3GBTA 3O4WA 4JAXA 2GEMA 2QXLA 1NGDA 5AQYA 5BN9A 5EXWA 1X3MA 3CJ9A 2CH6A 5B8HA 4H03B 4DHYA 3GG4A 3VENA 2D0PA 4FPBA 1LOTB 4DCHA 3C7NB 1NGCA 4FWRA 1NGHA 1YVNA 2P9LB 4H5VA 4B1XB 1T44A 4BR7A 5BRDA 3D2FB 4JNEA 3O1BA 3DXMA 5KQDA 4NO7A 4FSVA 1EQYA 1SQKA 2IVOA 4BROA 3J8AA 3HSCA 3VEOA 3LL3A 5BREA 3RSEA 1HX1A 4RWTA 3O5BA 4WQ4C 1T6DA 2GWKA 1MDUB 2PBDA 5AQXA 3H6EA 1NLVA 3MDQA 5CE3A 4FWOA 1U2VA 2P9PA 2QW9A 3FLCO 3UKRB 3LM9A 3ULEA 4EAHD 2Q0RA 3CHWA 5KQ8A 5EY4A 4A61A 4DB3A 4BRMA 1MA9B 2ZWHA 4BREA 3QBWA 3KVGA 4C23A 4CD3A 3IMXA 5AQOA 4BC5A 1NGEA 2D0OA 4HTLA 1KXPA 2WUSA 3WQUA 2V51B 4IO8A 5AZIA 3VGLA 4BC2A 1IG8A 1Z05A 1QHAA 4IZ9A 4CZHA 1YAGA 1XC3A 1H1VA 2YJEA 3LDOA 4I6MB 3U9ZA 4BRCA 4BRFA 5AQNA 1NWKA 3MN9A 3VOVA 4K25A 3B8AX 1GLLO 3QDKA 4QS9A 3ZX2A 4ISEA 2E1ZA 1Q18A 5ADXH 4IWVA 2P9IB 1SZ2A 5KPZA 4XEIA 2VCPA 1J6ZA 1X9JA 2P9SB 5BPMA 2A3ZA 4CD1A 5AQWA 3MN7A 1BOTO 4BRGA 3OHRA 3A5MC 1C0GA 1MWMA 5ADXA 3EKUA 2DPNA 4H0PA 5EX5A 3WEEA 2E2QA 5EVZA 4CZGA 4JD2B 2QM1A 2IIRA 4EFHA 1TUUA 4MLHA 4ISFA 3MMVA 2ITMA 3UKUB 2FSJA 1HUXA 4WQ5A 3DJCA 3VEVA 4BRLA 3BF3A 2QWLA 2E1YA 4JN4A 4J8FA 2E8AA 2NRHA 1QZ5A 2CH5A 5BN8A 5AQHA 4CZKA 4PL7A 4YDUA 1HJOA 2KHOA 2FF6A 4FWPA 2GUPA 3FR0A 1DGKN 3C7NA 4KBOA 2E20A 2P9LA 3C0BA 3LM2A 3CQYA 3D2FA 1E4GT 3MK6A 2YI1A 1ZBSA 3BEXA 3BUZB 3VF6A 3UB5A 3D2EB 3JXUA 3H3OB 5FPNA 4WYBA 4B1ZA 4CZIA 3L4IA 4K43A 3TPQA 5F0XA 4M7YA 4H0VB 4BC4A 1HLUA 1BO5O 1WUAA 3HM8A 4BRHA 2Q0UA 2FSKA 4A62A 1WOQA 2Q31A 4BR2A 3ENOA 3U9DA 2AP1A 1SAZA 1E4FT 4QS8A 2A42A 2CGKA 3FGUA 1S22A 3P4IA 4MLEA 4B1YB 3CJ7A 4PKGA 2QWMA 1TYQB 3UE5A 3H3NO 5AQSA 3UKRA 4B1VA 5BPNA 4CZFA 2YHXA 3FE1A 2YHWA 1TUYA 2HF4A 2A41A 1T6CA 4B1UB 4BVOA 4HWIA 1QZ6A 3VEXA 1BG3A 3ZX3A 4FO0A 5AQJA 2E2NA 4H5NA 5E26A 4O5FA 3VEZA 3R6MA 4BRIA 2W41A 4BG9A 4Z94A 4IJNA 2Q1NA 3IUCA 5AQIA 5AQKA 1NM1A 3CJBA 4AM6A 2F9TA 3GDQA 4FWQA 3H46O 1ESVA 5AQZA 2V7ZA 5KPRA 4I6MA 1GLFO 3BP8A 4BG8A 1NGAA 4FWLA 3MN5A 2CGLA 3CETA 5AQLA 3AAQA 2NLXA 3M6GA 2GWJA 1JCEA 2P9IA 5JLFA 2BUPA 3M1FA 4CBUA 4MO4A 4FOEA 2P9SA 2P9UB 4ISGA 4JHDB 3HTVA 4H0XB 2D1KA 4CZJA 2H3GX 3JS6A 4FWMA 3ZETB 1KAZA 2CGJA 1HKBA 3VERA 4E1JA 5AQUA 4O8KA 4JD2A 3L0QA 4K41A 5ELZA 5AQFA 3UKUA 3MCPA 1XQSC 2IVNA 4FL9A 4F9OA 3GL1A 4BRQA 3VPZA 4CZMA 4WQ5C 5AZJB 3A5NC 5FPMA 1ZXOA 4BRDA 2I7PA 3ZEUB 1QQNA 4CI6A 3O08A 2OANA 1YUWA 4CZEA 5KPTA 5FPDA 5F1XA 4YDUC 4BC3A 1BUPA 3IDHA 5FPEA 5AQMA 3U8XA 4H5TA 3D2EA 3CJAA 4BRKA 2E88A 1JCFA 4L3QA 1ATSA 2I7NA 3O1WA 4B9QA 5JLHA 3DXKB 2HMPA 3G25A 3O8MA 5I9EB 1GLJO 2YCHA 3KHYA 1NGJA 4FWNA 1IJJA 1BDGA 3LDNA 2AA4A 3QICA 2IVPA 3S41A 3H1QA 3ID8A 3R9PA 2E2OA 3CQXA 4FPAA 1NGBA 2A40A 1TYQA 3IFRA 1BA0A 2HF3A 3CI5A 2V7YA 3QBXA 2QWPA 4A2BA 2EWSA 3TU5A 2Q2RA 4XH1A 4EHTA 3A5OC 4GY2B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CZ2A 3OYKA 2IAJA 3LDQA 5LJVA 2ZJQL 4PQUA 2A6AA 3ULDA 4NXNK 1JLEA 2GELA 4CJFA 3V1OA 4YY3K 2X78A 1U6ZA 3SK3A 1VQ6N 3C65A 2JGUA 3SV3A 3VGMA 3PX4A 3WXKA 3ENHA 4K0KK 3KZBA 3CF5L 2HNYA 1WN7A 5MLCQ 3DMJA 4KH5A 5J2PA 3CFOA 1XC9A 4CHNA 4DFKA 4JKGA 1SL0A 3WQTA 3DYAA 4DMNA 4A2AA 3CM6A 2Q97A 3HOSA 4DTXA 4M7XA 3S9HA 4XIUA 3K5OA 4B08A 2YJFA 4YORA 4CZLA 4MFBA 1TL3A 4BACA 2V52B 3OYGA 1KVCA 2FBYA 1NMDA 1G99A 3WXIA 4DV4K 4PWDA 3M8SA 1A5XA 1X3NA 2E4LA 1YF5L 2Q36A 1SKSA 4DKWA 3HYFA 5CZ1A 3SJHA 2OPPA 3EN9A 1QSLA 3O6WA 3B6PA 4KRFA 1WSGA 4YOVA 3D6RA 4RG8A 3PO4A 3LANA 1GOAA 3WXJA 3FZLA 1QSYA 4CGGA 4IDHA 4CIEA 4LY7A 4KV8A 5HRPA 1HKCA 3A0IX 4V19S 3EL2A 5CY4A 3AVCA 1NU0A 3WUHA 4KB1A 2E6MA 2NZTA 3O80A 4I9QA 3VQEA 1Z6RA 5IWAK 2DY4A 4QAGA 4BRNA 4CJWA 3A5LC 3OYBA 2QWRA 1WSEA 2NRZA 2X6NA 2WC9A 4DQSA 5BPLA 4DTNA 1B9DA 1QHTA 3W3DA 1HR0K 3HO1A 3P39A 4E7JA 3ULEB 3OJSA 5EOYA 2F9WA 2GX9A 3WT0A 1GLCG 3Q7BA 5LY3A 3KLFA 2UXCK 3OYLA 3EKSA 3W0LA 4X65K 4DLGA 3GE1A 2J4RA 3ISNC 3KD5E 4Z4HA 4F3OA 4CEDA 5GIPA 2O4IA 4B9VA 1NBWA 5JICA 4DFJA 2EX3A 1FJGK 2FBTA 5F2RA 3FZHA 4H0OA 3K0SA 1RDWX 3AVLA 3OBYA 4J2BA 2HHUA 4U67L 3ZSXA 5GAEP 3K5MA 3AVIA 1HNZK 2X6SA 3R8EA 3LP1A 3EY1A 3WEEB 3G71N 2Z1GA 3SMPA 2E2PA 3M8PA 4UY8O 1KFSA 4AM7A 4KFBA 4AHVA 5IT9O 4GW6A 1HRHA 4JAXA 3UIQA 2QXLA 2HMIA 1DTQA 3HRGA 4CHQA 4N76A 1YJWN 2A1SA 2BE2A 4DHYA 1IO2A 3HXMA 4CGIA 4IOXA 4FPBA 2WBNA 3C7NB 1NGCA 4CGDA 1NGHA 1K9MO 1B92A 2F96A 4JNEA 4IG0A 3DXMA 4NO7A 5JS1A 2IVOA 3J8AA 4CF0A 3PX0A 1ASWA 1F21A 1RDAA 2NRVA 3NVMA 3VQCA 4FJNA 1WSHA 2KTQA 2PBDA 3HK2A 3ZT0A 1NG9A 4U7BA 3TR8A 2P9PA 1BL3A 2O8FA 2IDOA 3O9SA 3UKRB 2Q0RA 4OKJA 2VGMA 1RCHA 1VQON 2HBLA 4A61A 1YTUA 4BRMA 3THXA 2GUIA 3RVCA 4BC5A 1NGEA 3V9ZA 1YJNN 1Z26A 4MQ3A 5AZIA 3FFIA 4CEZA 2UU9K 3QIPA 1QHAA 1IBMK 1XC3A 4ZTFA 1H1VA 2OCEA 4M3XA 3U9ZA 3DRRA 4BRCA 2XY6A 4DQRA 3VOVA 4K25A 1VSMA 3B8AX 1GLLO 3QDKA 2W42A 1L3TA 3CCQN 3AVAA 3ZX2A 2I5JA 4DTJA 2E1ZA 3SCXA 5ADXH 4IWVA 1IV0A 1T8EA 1SZ2A 2Z1IA 5BPMA 1Q9XA 1MWMA 1RILA 5ADXA 3AVFA 3L4QA 4GKJK 4NXMK 2E2QA 1DLOA 1WSFA 2OTLN 1RTJA 1VHXA 2FSJA 3DJCA 1TAUA 1NK6A 2F8TA 4OGEA 2XY8A 2QWLA 2E1YA 4JN4A 5LL6Z 2IOCA 4ELTA 1OVYA 1QZ5A 2CH5A 3VQ4A 4FJ5A 2KHOA 2GUPA 1IBLK 3HPGA 4NYFA 3M8QA 1LW2A 2P9LA 3MX2A 3C0BA 4WFAL 3VQ9A 2RF2A 3UB5A 4CJ5A 3D2EB 3NVKA 3JXUA 3H3OB 5FPNA 4WYBA 1XI1A 4M7YA 1HLUA 3V9UA 3HM8A 3VQ5A 4CJPA 2Q31A 4DS4A 3ENOA 1S5JA 3U9DA 1QVFM 2VG7A 4GKKK 1RTHA 3DLEA 4MLEA 4B1YB 3AO4A 1TYQB 3UE5A 2HNDA 1T05A 3PSIA 1K73O 4FZYA 1NKCA 3KLHA 2YHWA 3G0ZA 2OYQA 4JV5K 4W5QA 3NGIA 3LDSA 3VEXA 3ZX3A 1VRTA 5K14A 3R6MA 4BRIA 4BG9A 1YVUA 4FJKA 3MEDA 2KLAA 4IJNA 5AQIA 3HP9A 5AQKA 1I3AA 3QINA 3C6HA 3NDKA 4IDKA 4FWQA 3VQPA 5AQZA 2V7ZA 3E9OA 1Q82O 4F8RA 3TSUA 4IG3A 4JI2K 1GLFO 1RDUA 4DV1K 4E19A 4CJ4A 3VN5A 4FWLA 4JKGB 3EE9A 2CGLA 3CETA 3AO2A 3L2WA 3TAPA 1JXBA 3M6GA 4PHTX 3JYTA 4FOEA 3DLRA 4ISGA 1NK7A 3K5NA 4CZJA 5C42A 4CJTA 4DU3A 1Q8IA 5H1SQ 1HKBA 3VERA 2GBZA 3K5LA 4ILHA 5AQUA 4QOZB 2PFUA 1WAFA 4CK3A 4FM0A 3L0QA 2KZZA 3HPHA 1CXUA 3IKMA 3MCPA 3V9SA 3IS9A 1X1PA 4KHYA 1FKOA 4BRQA 3VPZA 3V81A 4BRDA 4PUOA 2OANA 1M1KO 1N5YA 2OPRA 5KPTA 5FPDA 1S9GA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GLE G;  3SMS A;  3LDQ A;  4RCH A;  5LJV A;  5AQR A;  4BR9 A;  2A6A A;  1QQO A;  4DQ8 A;  1LCU A;  1OKJ A;  3I33 A;  1BA1 A;  1HKG A;  2GEL A;  2FSN A;  1U6Z A;  3AAR A;  3SK3 A;  4H5W A;  4FWS A;  4XH5 A;  1KAY A;  3A8Y A;  2ZGZ A;  1K8K B;  1HPM A;  3VET A;  3VGM A;  1V4S A;  3F9M A;  3WXK A;  3ENH A;  4CBW A;  3KZB A;  2QWO A;  4BGB A;  3L6Q A;  4M63 C;  4LC9 B;  1XUP O;  4NB4 A;  3H1V X;  5BRF A;  5AQQ A;  1QQM A;  1KAX A;  3WQT A;  3ZX0 A;  1Y64 A;  2P9K B;  4EHU A;  4A2A A;  3ATV A;  3D7E O;  5AQT A;  1GLB G;  1V4T A;  1BWF O;  2Q97 A;  4M7X A;  2FLO A;  2P9U A;  4JHD A;  3EZW A;  2HOE A;  2P9N B;  2YJF A;  3ZET A;  4CZL A;  3CJ1 A;  4H0Y B;  4K42 A;  2V52 B;  4PL8 A;  1C0F A;  5E84 A;  1BU6 O;  3LDP A;  5AR0 A;  4BGA A;  1NMD A;  4BR5 A;  1G99 A;  2UYT A;  3VEY A;  3VEW A;  3WXI A;  1X3N A;  3FZK A;  2Q36 A;  2W40 A;  1ZC6 A;  3AAP A;  4B1W B;  3VF2 A;  3SJH A;  2YHY A;  3EN9 A;  1R59 O;  5AZJ A;  3O6W A;  4PKH A;  4EIA A;  1GLD G;  3ZEU A;  2ASP A;  2PAV A;  3BF1 A;  4BQL A;  5JMV A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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