2EWSA

Crystal structure of s.aureus pantothenate kinase
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
267
structure length
260
Chain Sequence
MKVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIIPGDLTAANFGHVLHHLDADFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Prokaryotic Type II and Type III Pantothenate Kinases: The Same Monomer Fold Creates Dimers with Distinct Catalytic Properties.
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
molecule tags Transferase
molecule keywords Pantothenate kinase
total genus 95
structure length 260
sequence length 267
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2005-11-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ewsA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ewsA01
2AA4A 5AZIA 4BRAA 1IJJA 3A0IX 3H1VX 1WUAA 1BA1A 3DAWA 2FXUA 2IVNA 1MA9B 1KAYA 4WQ4A 3LDLA 2GEMA 4H5VA 5BPLA 2E88A 4FPBA 2ASOA 3DXMA 3WT0A 4XH4A 1X3MA 3CI5A 3RSEA 4CI6A 4BREA 1XUPO 2ZGYA 1SAZA 3C0BA 5BPNA 4BRDA 5AQOA 1J6ZA 4BQLA 3HI0A 5FPDA 4FWPA 3J8AA 5AQQA 2QW9A 3VEOA 4C23A 1NGBA 2Q2RA 1ZC6A 4NO7A 5JICA 3WQTA 2D4WA 2QWLA 3VETA 4BC5A 3ULEA 4JHDB 4I6MA 1DGKN 4PKHA 2YJEA 1NMDA 3ENOA 1DKGD 4BRLA 3M6GA 4WYBA 5BREA 1KXPA 3H3NO 5E84A 2VCPA 3H6EA 4H0TB 5F2RA 2NLXA 4BRCA 5FPMA 3FZKA 4FL9A 1C0GA 3LDQA 3MDQA 3H46O 3CHWA 4B9QA 5AQYA 3KZBA 4IXCA 4DCHA 3FZMA 3ULEB 1OKJA 5KPRA 4CBWA 4BROA 4BR9A 3LM9A 3KHYA 5AQWA 1H1VA 4XEIA 2QM1A 5LJWA 4ISGA 3CQXA 3R6MA 3MN6A 4FWLA 3QB0A 3KVGA 4LC9B 2Q1NA 3MN9A 2ASMA 3U4LA 4B1WB 2E2NA 2UYTA 3I33A 1QQOA 3AAPA 1GLCG 4ISEA 3W3DA 4BC3A 1QHAA 4JHDA 3VF2A 1BO5O 2BTFA 4GY2B 3ID8A 4H5NA 5AQTA 3C7NA 5CE3A 3UE5A 1GLBG 2IVPA 4H0PA 3LL3A 4ISFA 2P9SA 2FLOA 3VERA 1Y64A 3IFRA 4H0XB 2P9IA 4YDUC 1T44A 1QQMA 2A41A 3DXKA 4KBOA 3JS6A 3L0QA 3D7EO 3CJ1A 1QZ6A 4MLHA 4BR4A 4JAXA 3HTVA 4H0YB 1S22A 3QICA 5AQIA 1HKCA 4F9OA 4AM6A 4K43A 1JCEA 1CZAN 3U9ZA 2W41A 2HOEA 2P9UB 3MMVA 4BRIA 5AR0A 4WQ5C 3VOVA 3JXUA 5TKYA 1NGJA 2H3GX 1GLAG 4FOEA 3VGLA 4PL8A 4BGBA 3GOIA 3MCPA 1GLLO 2GWKA 3CJ9A 3GBTA 4PKIA 3O8MA 5KPZA 2FSNA 2I7NA 2W40A 5ADXA 4CZGA 2WUSA 1Q18A 4CBXA 3ENHA 2GWJA 4H5TA 4IO8A 2IVOA 4FWRA 1NGFA 4IWVA 1YXQA 3ZETB 2FF3B 4QS8A 3VEZA 3ZX0A 4EHUA 1SQKA 3BP8A 1GLJO 4BRQA 4A62A 3U8XA 2F9WA 3O80A 1SZ2A 3WQUA 1G99A 2ITMA 1DEJA 1LCUA 3DWLA 3ZEUB 4B1UB 4DHYA 1V4TA 3ATVA 3GG4A 4BVOA 4L3QA 3D2EB 1ZBSA 5AQRA 4BC4A 5AZJA 3VEWA 3ZX2A 4BRKA 1NGIA 2IIRA 3FE1A 1HPMA 4BRFA 3QFPA 3B8AX 4IZ9A 2YJFA 3O1BA 2DPNA 1E4FT 1U2VA 2P9PB 2P9LB 3ZEUA 4BR0A 3S41A 1NGAA 5AQNA 4BRPA 1WOQA 4HWIA 1E4GT 4AM7A 2I7PA 5JLFA 3WXLA 5AZJB 2OANA 3FZLA 2E2QA 2QWRA 1K8KB 5BRDA 4FO0A 2P9NA 4EFHA 2CGLA 3C7NB 3AY9A 4CBUA 2HF4A 1GLDG 3CJAA 1NM1A 4RWTA 1BDGA 3R8EA 4EHTA 2P9IB 2P9KA 3TPQA 5BRHA 5EVZA 1NGGA 3UKUB 4PKGA 1V4SA 4EIAA 1QZ5A 1HJOA 2FSJA 3QFUA 4CJ7A 4MLEA 4BRNA 2GUPA 2Q31A 1X9JA 2ZWHA 3CQYA 3LDPA 3LDNA 5BPMA 3EN9A 2CGKA 1TUYA 3LDOA 4J8FA 2A5XA 4MO4A 4BC2A 3M3ZA 1XC3A 5BN9A 3SJHA 3I8BA 2QWQA 4JD2B 4E1JA 2Q0RA 3H45C 2YHYA 4H0OA 1NGHA 1Z05A 3VF6A 3MK6A 3FGUA 5ADXH 5LY3A 3BUZB 2V7YA 1X3NA 2E2OA 2YI1A 1RFQA 1Z6RA 3SLCA 3SMPA 4B1ZA 3UB5A 4BRHA 4RTFD 5E26A 3D2FA 3WUHA 2EWSA 3VGKA 2A3ZA 4K42A 3UKRA 4IJNA 4A61A 3VEVA 5KQDA 5AQZA 1YVNA 4DQ8A 4PL7A 2E8AA 1MWKA 5FPNA 5AQLA 3H1QA 1HX1A 4CD3A 2FSKA 4BRGA 2NRHA 2VWBA 1XQSC 3SK3A 2PAVA 2KHOA 1HUXA 1BUPA 3O1WA 4JN4A 2E1YA 2ZGZA 2CGJA 3BF1A 3D2FB 4BR7A 5AQGA 2V52B 3WXKA 4QS7A 2HMPA 2D0OA 3CIPA 2BUPA 3CJCA 1IG8A 3AAQA 3AARA 3WEEB 1RDWX 3CJBA 2QXLA 3FR0A 4EAHD 4H0VB 1NWKA 3WXJA 2CH5A 1TYQA 3IDHA 1ESVA 4M63C 4CZHA 3DXMB 5KQ8A 2HF3A 1K8KA 4O8KA 5AQKA 2P9NB 2QWPA 4CZFA 1ATRA 1RGIA 3HBTA 2QWMA 4A2AA 2J4RA 3CJ7A 2YHXA 3WEEA 2V7ZA 2P9KB 2YCHA 5F0XA 3A8YA 4WQ5A 3UKUA 4CD1A 1S3XA 3BF3A 3HZ6A 4M7XA 4NB4A 5I9EB 4WQ4C 3G25A 4FWMA 3CETA 5AQUA 3DJCA 3ZETA 5EX5A 2YHWA 3GL1A 4BGAA 4H5RA 3FZHA 3BEXA 5KPTA 2PBDA 4FWQA 4O5FA 1T6CA 4BG9A 2GTDA 5AQHA 3ATUA 3RSEB 5BN8A 5BR9A 5AQXA 3A5NC 1LOTB 1QQNA 1NLVA 3FZFA 1ATSA 1BA0A 1TYQB 3VEXA 4CZEA 1BWFO 2P9SB 3H3OB 1P8ZA 3MN7A 3MN5A 4RCHA 5BRFA 2V51B 3L6QA 3VEYA 2QWNA 2A40A 3M1FA 3VENA 3R9PA 3TU5A 3EKUA 3QBWA 4YDUA 3W0LA 2F9TA 4XH5A 5B8HA 4MO5A 5LJVA 3A5OC 2D1KA 3O08A 3FFKB 1YUWA 3F9MA 5AFUA 1HKBA 4QS9A 2P9UA 3GE1A 1HKGA 3EKSA 3GDQA 4IJAA 5AQSA 1BOTO 5AZIB 4K25A 4BR2A 1C0FA 1TUUA 3VF4A 3ZX3A 3HSCA 3VPZA 3DXKB 1JCGA 4XH1A 2NZTA 3SMSA 2D0PA 5F1XA 4M7YA 4BQZA 5AFUH 4H5WA 4BG8A 2E2PA 1NGEA 2ASPA 1ATNA 1U6ZA 4FWKA 4A2BA 1HLUA 5AQFA 1GLFO 4BR5A 4CZMA 3QMLA 2E1ZA 4B1YB 4GNIA 4DB3A 4K41A 3IUCA 3O4WA 3VESA 4FOIA 1NGDA 3A5MC 3L4IA 3O5BA 4HTLA 3WXIA 3UKRB 2Q0UA 2Q36A 5AQMA 4B1XB 3FLCO 3U9DA 4CZIA 1JCFA 2E20A 3HM8A 2P9LA 2VYPA 4CZKA 3OHRA 1U2VB 4FPAA 2FF6A 4I6MB 5EY4A 1R59O 5ELZA 3A5LC 4CZLA 4JNEA 3EZWA 5JLHA 5AQJA 3LM2A 5AQPA 1ZXOA 4B1VA 2QWOA 5JMVA 3QDKA 2GELA 1T6DA 2A6AA 3EO3A 4FSVA 1MWMA 4CZJA 1NBWA 1YAGA 3IMXA 2CH6A 4Z94A 4FWNA 2Q97A 5FPEA 2ZF5O 5EXWA 2A42A 3O6WA 3D2EA 3EL2A 3VGMA 3P4IA 1MDUB 1BG3A 3QBXA 4FWSA 1BU6O 1GLEG 5AQVA 5EOYA 2P9PA 4JD2A 3CERA 4BRMA 1KAZA 1NGCA 2AP1A 4H03B 1KAXA 4BVPA 1EQYA 1D4XA 4Y0WA 4FWOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O8BA 4YFUA 3J7AP 1WSIA 4AH9A 1U4BA 2BGGA 4DV0K 1WUAA 1BA1A 4IKFA 4DV6K 2IVNA 4M41A 4WQ4A 3LDLA 2GEMA 4KHWA 3Q7BA 1SKRA 4KPYA 4PQUA 4XH4A 1X3MA 1XHXA 3JSMA 4CEFA 1XUPO 2ZD1A 2ZM6K 3C0BA 5BPNA 4BRDA 5J2QA 5M1OA 3M5RA 4Z4FA 1NKCA 3CPEA 3HI0A 4BQLA 3C95A 1M1KO 5AQQA 2HHHK 3HOTA 3T69A 3ZSOA 3VEOA 2XRIA 1VQON 2G8WA 1ZC6A 1VQPN 4HHTA 1KC8O 2D4WA 3V9ZA 1M90O 3OYDA 1KSPA 4YHHK 1DGKN 3LWMA 4G9ZA 4QCLA 3P5JA 1NOYA 4ID5A 3SQ1A 4BRLA 3F73A 1EETA 1UOCA 5E84A 4ELUA 1XMOK 4JRPA 1EWRA 4BRCA 4W5QA 1L3VA 3LANA 2ZQBA 4DQSA 2W6KA 1S1WA 1RBVA 3KZBA 4IXCA 4DCHA 4E7IA 2QA4N 1Z25A 3LM9A 3KHYA 1WAJA 4CF1A 4XEIA 1BCOA 3V1OA 5LJWA 3CQXA 3OS1A 3MN6A 4JS5A 3QB0A 2ATQA 3HXMA 3NF8A 1CZ9A 2ASMA 2FC0A 3U4LA 4B1WB 1SS6A 2E2NA 3VQBA 3CC4N 2OA8A 1U49A 2GBZA 3W3DA 4FJ7A 4JHDA 4WFAL 3PX0A 3VF2A 4BE1A 4TSXA 4JKHA 4AILC 5CYMA 1NMNA 4M3TA 3OYCA 3LP3A 3THYB 4H5NA 1Z26A 4A59A 3KTQA 1GLBG 2JWLA 5BR8K 2FLOA 3AA4A 3VERA 1KQSM 3RVCA 1HYZA 3CCEN 1RBUA 3PIOL 1Q86O 1A5VA 1B92A 3J80O 4BR4A 3QICA 1S5JA 4Y1CA 4KV8A 5AQIA 1JL2A 5GADP 4NYNA 4F9OA 4KHQA 1JCEA 1CZAN 2W41A 3P1GA 2ZJRL 2P9UB 2QXFA 4FJHA 3BGRA 2IAJA 4F8RA 4JKAA 2G8IA 3JXUA 1NGJA 1NJXA 4FOEA 1RT2A 1UAXA 3RRGA 4BGBA 3MCPA 1GLLO 3GBTA 4FVMA 5KPZA 4KH6A 4JK7A 1DTQA 5ADXA 4QAGA 1LV5A 1BGXT 1X1PA 1BIZA 1RT4A 1YIJN 1NK5A 3E01A 1NGFA 1KFSA 3ZETB 3SAGA 4QS8A 5CHIA 4EHUA 3ALYA 4M3UA 1NKEA 1LWCA 3L2UA 1U04A 1G99A 3VTHA 1L3TA 1DEJA 1HQEA 1LCUA 3ZEUB 4DHYA 4L8RB 1V4TA 4IG0A 1WSJA 3OYIA 4LH4A 1ASUA 4DG1A 5AQRA 4BC4A 3AVNA 1X9WA 3VEWA 3V1RA 4I2PA 4Z0UA 2DFFA 4FLWA 2YJFA 1E4FT 4FJLA 4PUOA 3ZEUA 3SV4A 3AO4A 4XIUA 4ZTJA 4DU4A 2O8CA 1KVAA 2PFUA 1HRHA 4YY3K 3ZSZA 2O8BB 4BDZA 1TK0A 2OANA 3AA3A 5BRDA 2HHVA 3IG1A 2NNWA 2P9NA 2O8EB 1RILA 2PY5A 3QERA 4FJJA 3LWLA 3K2PA 5J2MA 3WNGA 4EHTA 5BRHA 2F8SA 4E7LA 1V4SA 2FSJA 1YT3A 4CECA 4MQ3A 1Q9XA 2GUPA 1EKEA 2Q31A 1X9JA 2X74A 3LDPA 4C8KA 3VQ8A 4HCBA 3MCAB 3WNHA 1IG9A 3SJHA 3R3LA 2YHYA 1J53A 4B3TK 5LY3A 2NRZA 3SLCA 4DV4K 4Z4GA 3JAMO 1WBBA 4BRHA 4RTFD 3E9OA 5SWMA 3WUHA 3VGKA 4IFVA 4A61A 4EZ9A 4B8AB 5HRRA 1BISA 1Q8IA 3ULDA 5KQDA 1Q7YO 4PL7A 4DV3K 5AQLA 3H1QA 1KTQA 4BRGA 2NRHA 4FJIA 2VWBA 1NK9A 3SK3A 3DLGA 3PIPL 1BUPA 3QO9A 4JN4A 3TSQA 4CW7B 4YOYA 2CGJA 3D2FB 4B9TA 4CFBA 4Z4IA 1SL1A 4W5RA 4IOCL 2EX3A 3C94A 2RN2A 1IG8A 3AAQA 5GAGP 1NG9A 4FYDA 1VSHA 3AARA 2UXCK 1HNIA 3CJBA 4BDYA 1R0AA 4FK2A 2CH5A 3LAKA 3KWIA 3IDHA 2E6LA 1NK0A 1NOZA 4CZHA 3DXMB 1Q81O 2HF3A 4O8KA 5AQKA 4DSFA 2P9NB 4GW6A 2UUAK 3AVLA 5C12A 3NVKA 5KGWA 4A2AA 3PY8A 3WEEA 2Z1IA 4JRQA 2NUBA 1ASWA 2FBYA 3BY5A 3SBTA 4M7XA 5IT9O 1C1AA 4ICLA 3CETA 3VQEA 5GAHP 3RWUA 1A5WA 4BGAA 1P90A 4CHZA 1OH8A 1SUQA 2PBDA 4E19A 1T6CA 2ITGA 3SUNA 5C42A 1TGOA 4YOTA 3CFOA 5AQHA 3RSEB 5BR9A 4EP5A 1VQNN 1LOTB 4FZYA 3FZFA 4CEQA 3AVHA 1BA0A 4FLXA 4IBNA 1BWFO 1RT6A 4NYFA 3NHGA 4DWIA 4DFKA 3LP1A 2ZJQL 2A1RA 2A40A 4KO0A 1RBSA 4DSEA 1VRUA 3OYJA 3KD5E 3SQ0A 4DSIA 4Z4CA 4XH5A 3HSTB 5LJVA 3SAHA 4FLTA 3SJJA 3QEIA 2RKIA 1YUWA 3FFKB 4DTXA 2P9UA 3HPGA 4B3MK 3DOKA 3GE1A 1HKGA 4CJTA 3MXMA 4IJAA 4LFCK 2Q3SA 4K25A 4BY9C 4F2RA 3HSCA 3VPZA 2X6SA 3DXKB 2P5GA 3TTFA 4CFDA 2D0PA 3K5LA 1RBTA 4U67L 3CQ8A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2AA4 A;  5AZI A;  4BRA A;  1IJJ A;  3A0I X;  3H1V X;  1WUA A;  1BA1 A;  3DAW A;  2FXU A;  2IVN A;  1MA9 B;  1KAY A;  4WQ4 A;  3LDL A;  2GEM A;  4H5V A;  5BPL A;  2E88 A;  4FPB A;  2ASO A;  3DXM A;  3WT0 A;  4XH4 A;  1X3M A;  3CI5 A;  3RSE A;  4CI6 A;  4BRE A;  1XUP O;  2ZGY A;  1SAZ A;  3C0B A;  5BPN A;  4BRD A;  5AQO A;  1J6Z A;  4BQL A;  3HI0 A;  5FPD A;  4FWP A;  3J8A A;  5AQQ A;  2QW9 A;  3VEO A;  4C23 A;  1NGB A;  2Q2R A;  1ZC6 A;  4NO7 A;  5JIC A;  3WQT A;  2D4W A;  2QWL A;  3VET A;  4BC5 A;  3ULE A;  4JHD B;  4I6M A;  1DGK N;  4PKH A;  2YJE A;  1NMD A;  3ENO A;  1DKG D;  4BRL A;  3M6G A;  4WYB A;  5BRE A;  1KXP A;  3H3N O;  5E84 A;  2VCP A;  3H6E A;  4H0T B;  5F2R A;  2NLX A;  4BRC A;  5FPM A;  3FZK A;  4FL9 A;  1C0G A;  3LDQ A;  3MDQ A;  3H46 O;  3CHW A;  4B9Q A;  5AQY A;  3KZB A;  4IXC A;  4DCH A;  3FZM A;  3ULE B;  1OKJ A;  5KPR A;  4CBW A;  4BRO A;  4BR9 A;  3LM9 A;  3KHY A;  5AQW A;  1H1V A;  4XEI A;  2QM1 A;  5LJW A;  4ISG A;  3CQX A;  3R6M A;  3MN6 A;  4FWL A;  3QB0 A;  3KVG A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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