3HBTA

The structure of native g-actin
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
publication title The structure of native G-actin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin
total genus 113
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hbtA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hbtA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3hbtA03
4A2AA 2GWJA 2GTDA 3TPQA 1MA9B 5LY3A 4LC9B 4Y0WA 5E26A 2CH6A 3D2EB 1HKCA 4BRQA 4EFHA 1SZ2A 2E1ZA 4FOEA 1TUUA 3DWLA 3RSEB 4FWKA 4J8FA 1JCFA 1MDUB 5AQHA 3IUCA 5JLHA 2FSNA 3BEXA 3SMSA 3LDOA 2A42A 3VGMA 3FE1A 2VCPA 2I7PA 2YHWA 3AAPA 5BPLA 2HF3A 1KAYA 5ELZA 5AQJA 3BF3A 5AQTA 4B1WB 4IXCA 4BQZA 4FWRA 3UKRB 1TUYA 3QFPA 4CZKA 2YJFA 1IJJA 4GNIA 5EVZA 1GLAG 4CZLA 5FPDA 3CETA 1IG8A 3ID8A 2GUPA 3VEXA 4C23A 3H46O 5AQXA 2QWRA 4BR4A 4XH4A 3P4IA 4IO8A 3CI5A 1JCEA 3QICA 3ZEUB 2YHYA 3R8EA 4H0TB 4K25A 3GL1A 3VF6A 1NGJA 3LDQA 2Q36A 5AQQA 3QFUA 2QW9A 2OANA 3VEWA 4K43A 3UB5A 2AP1A 4BRFA 3C7NA 1LOTB 1NWKA 2FF6A 4CZGA 3O4WA 3ZETB 3KVGA 3L4IA 4EIAA 4JD2A 2ZWHA 2YCHA 3O6WA 5E84A 3TU5A 3FZLA 3ATUA 5AQMA 3ZX2A 4B1UB 1RGIA 1NGHA 4FWMA 2P9UA 4O8KA 3VF4A 1YXQA 2QM1A 2CGLA 4EHUA 5BREA 5CE3A 3D7EO 2Q0UA 4CZMA 2VWBA 3LDLA 1YVNA 3R9PA 4BVOA 4BR9A 1NGIA 3VEVA 4A2BA 1QHAA 1NMDA 3IFRA 3BUZB 3O08A 4CZIA 4BREA 3H6EA 3FZHA 3M1FA 2Q1NA 3SK3A 3WXJA 4E1JA 4M63C 1GLBG 3O1WA 3QDKA 3KHYA 3MN7A 3WEEB 2FSJA 3CQYA 1QZ5A 4CZFA 3UKUB 4BG8A 4WQ4C 3WXKA 4HWIA 5BRHA 5AQNA 3GE1A 2P9SB 2QWLA 4BQLA 1JCGA 3MMVA 4H03B 4PL7A 5FPMA 2PAVA 4NO7A 1T44A 3A5OC 1EQYA 2QWNA 4XH5A 3CJ7A 3M6GA 5F2RA 2E2NA 2E88A 3CERA 1K8KA 1HPMA 1Q18A 1HJOA 4DB3A 4ISGA 2D0PA 4XH1A 3AY9A 3ULEA 3SLCA 2F9WA 1NGGA 1HX1A 4H5WA 4BR5A 5AQVA 2A3ZA 3BF1A 3MN6A 2QWPA 3A5MC 5BN8A 4CI6A 4MLHA 2FSKA 3L0QA 4B1ZA 4F9OA 1HLUA 2ASMA 4K42A 5LJVA 3U9ZA 3LM2A 4A62A 4B1YB 3C7NB 3UE5A 5AZJA 4BRLA 4MO4A 1CZAN 1BOTO 3WEEA 2FF3B 3D2FA 2F9TA 1HKGA 4JD2B 4FOIA 4FSVA 3UKUA 4PKHA 3JS6A 1LCUA 2P9SA 1TYQB 4WQ5C 2P9UB 3L6QA 4QS7A 1NGBA 1YAGA 1QQNA 3GBTA 2H3GX 4IJNA 4PL8A 3VETA 4AM6A 1ATRA 1OKJA 4H0OA 1G99A 3F9MA 1KXPA 3A8YA 2ASPA 1HKBA 2ZF5O 4BRGA 1BA1A 2NZTA 5AQLA 2FLOA 4ISFA 2BUPA 1NGDA 1NGFA 4CZJA 2ZGYA 3A5LC 4I6MA 2VYPA 4H0PA 3VEYA 5BRDA 1NGEA 3DXKB 3FFKB 2PBDA 2V52B 1T6DA 2YI1A 3MDQA 1X3NA 2E1YA 3WQUA 4FWQA 4BC4A 3EO3A 4CZHA 2E8AA 4IJAA 4Z94A 4PKGA 4CBUA 2W40A 2HF4A 1K8KB 3MCPA 1XUPO 3C0BA 3CJCA 2IVNA 4DQ8A 3WQTA 3ATVA 4QS8A 4JNEA 3ULEB 2P9LB 3MN5A 1MWKA 1TYQA 2A6AA 2P9PA 4IZ9A 3AARA 3VGKA 5BPMA 4XEIA 4HTLA 4RTFD 4KBOA 3VGLA 4JN4A 1U2VB 2IVOA 1WUAA 1C0GA 1ZC6A 4FWSA 3MK6A 3S41A 1WOQA 5AQGA 4BG9A 2V51B 3CJ9A 4B1VA 5AQFA 4NB4A 1XQSC 2YHXA 3SMPA 1P8ZA 3CHWA 3QBXA 3QBWA 3OHRA 4QS9A 3IMXA 1QQOA 2Q2RA 4JHDA 5FPNA 5AZJB 3D2FB 4H5VA 2NLXA 2E2OA 3U8XA 1MWMA 1C0FA 3GDQA 4WQ4A 4BRNA 3WXLA 3JXUA 4FWNA 1ESVA 2A5XA 1YUWA 3LDNA 3SJHA 3IDHA 4B9QA 3U4LA 1ATSA 3VF2A 3BP8A 4BR7A 3DXKA 1BDGA 4IWVA 5AQYA 1KAXA 2WUSA 1T6CA 4BGAA 4MLEA 4BRAA 2HOEA 2AA4A 5EOYA 1SQKA 4BR2A 2DPNA 4BRHA 2D4WA 5AQZA 1H1VA 3FR0A 2UYTA 1DEJA 3FZFA 1Z05A 3LL3A 3KZBA 4H5NA 2P9LA 1Z6RA 2E2PA 3WT0A 5B8HA 5AFUA 4I6MB 5LJWA 3I8BA 1KAZA 2KHOA 1U2VA 5I9EB 4BC3A 4RCHA 3HTVA 4CJ7A 3B8AX 1S3XA 4WYBA 1ATNA 3CJ1A 5KPRA 4BGBA 5AFUH 1ZXOA 3WUHA 2J4RA 1SAZA 3EL2A 3GG4A 4EHTA 4GY2B 5JICA 2Q0RA 4H0YB 4YDUC 4L3QA 2Q31A 3CJAA 2FXUA 5AQSA 2ZGZA 4DCHA 3DAWA 3O80A 4H0VB 2P9PB 4M7YA 3VEZA 5FPEA 1S22A 4WQ5A 2CGJA 4H0XB 3WXIA 3H45C 3W3DA 4ISEA 5F0XA 5AQOA 3VESA 3J8AA 2GEMA 4EAHD 3DXMA 5AZIB 2V7YA 3U9DA 4CZEA 2A41A 5F1XA 4JHDB 1ZBSA 2P9NA 3LM9A 2W41A 1V4SA 5KPTA 2P9KB 4CBXA 4BC2A 4FWLA 5BN9A 5KPZA 3VERA 3HI0A 3ENOA 1BG3A 1GLLO 2IVPA 4FWPA 3DJCA 1J6ZA 4BROA 2P9IA 3QMLA 5EY4A 5AQRA 4FWOA 4H5RA 4BVPA 1RFQA 1GLCG 3EN9A 2GWKA 2BTFA 1BA0A 4RWTA 4MO5A 1NM1A 3FZMA 3I33A 3ZX3A 5BR9A 5AQPA 5AQWA 3O1BA 2HMPA 1E4FT 1Y64A 3G25A 1RDWX 4BRMA 4M7XA 1X3MA 3MN9A 3EKUA 4BRPA 2D1KA 1NGAA 5JMVA 2E20A 3VENA 2A40A 3GOIA 3R6MA 1BU6O 3D2EA 1NBWA 4FPBA 3ENHA 3H1QA 4CBWA 4AM7A 4PKIA 5AZIA 3RSEA 3FGUA 5AQUA 3O5BA 3VOVA 2E2QA 1QQMA 5KQDA 2CH5A 2ASOA 3W0LA 1QZ6A 2GELA 2P9KA 3LDPA 4BRIA 5KQ8A 2ITMA 5AR0A 2QWMA 4K41A 1DGKN 1X9JA 1GLFO 3VPZA 4BR0A 1GLDG 2Q97A 1BWFO 1HUXA 3VEOA 3FZKA 3ZX0A 1U6ZA 3UKRA 4O5FA 4CD1A 4FO0A 1V4TA 1E4GT 5EX5A 4CD3A 1D4XA 1DKGD 3AAQA 1NLVA 2CGKA 3DXMB 3EZWA 3QB0A 1XC3A 3HSCA 4JAXA 2P9NB 4A61A 3HZ6A 5BRFA 2QXLA 3ZEUA 4BRDA 1GLEG 3H3NO 3CQXA 5EXWA 4DHYA 1NGCA 5ADXA 1BO5O 1BUPA 5JLFA 2QWOA 2I7NA 2P9IB 3O8MA 5BPNA 5TKYA 3A5NC 4B1XB 2D0OA 3H3OB 1R59O 3H1VX 3FLCO 3CIPA 3ZETA 4BRKA 5AQKA 4FPAA 2EWSA 4H5TA 2IIRA 2YJEA 5ADXH 4BC5A 2QWQA 1GLJO 2V7ZA 3HBTA 5AQIA 4BRCA 3CJBA 3M3ZA 3A0IX 4YDUA 3EKSA 3HM8A 2NRHA 4FL9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3K5LA 4CJEA 1KCFA 2GTDA 3TPQA 5LY3A 4I2PA 4Y0WA 3N4PA 2PYLA 3OYIA 4EFHA 1I94K 1ILYA 5HRSA 3RSEB 1B9DA 1YI2N 2VGMA 2DTUA 3E9LA 4KHWA 2G8WA 2NRZA 4X62K 3SBTA 2I5JA 3LDOA 3VGMA 3E1YA 3VQAA 5ELZA 3VQ6A 1T8EA 3CCUN 4RW6A 4B1WB 1TV6A 4N5SA 3AVFA 2YJFA 4GNIA 5EVZA 1GLAG 1IG8A 1BQMA 2A1SA 2GUPA 4IEIA 4CHPA 4FM2A 1WBBA 2QWRA 3CFPA 3WNGA 3CI5A 4WFBL 5M1FA 3QICA 3ZEUB 4JS4A 1NK8A 4K25A 4JV5K 4FLXA 3SZ2A 3ASMA 3HVTA 2Q36A 2Q3SA 1L3VA 1RDDA 2OANA 3VEWA 1DT9A 4CGIA 1LOTB 3KLGA 1NWKA 3TSPA 4FJJA 4LF9K 4EIAA 2YCHA 5E84A 3N4QA 4FZZA 1WSEA 1U47A 3ZX2A 1NGHA 1NG9A 4CECA 1YXQA 4U67L 2CGLA 1QVGM 4BVOA 5CYMA 3VEVA 4M3TA 3KLHA 5HL7L 1NMDA 2HBMA 4EZ9A 4E0DA 4CF0A 3FZHA 1RT3A 3I56N 3EY1A 1NJIO 3MN7A 3CFOA 4AHRA 2FSJA 4CZFA 4HVJA 4BG8A 4O44A 1IBKK 3GE1A 1JXBA 3V9SA 4BECA 4E89A 4W5RA 4PL7A 5FPMA 2PAVA 2YKNA 4NO7A 1T44A 4H4MA 5JS1A 1JLCA 1EQYA 3CJ7A 1M1KO 4J2BA 4DWIA 3SQ1A 3HSTB 4FYDA 2XY6A 1K8KA 1KVAA 1HPMA 1Q18A 2QKKA 3SQ2A 3AY9A 4DR3K 3ULEA 4CJPA 1NK7A 4AQYK 4F3OA 3L2QA 3SJJA 3SAHA 5C10A 3BF1A 4BE7B 3MN6A 4ELVA 5BN8A 3V1QA 1Q9XA 4NCAA 2X6NA 4JKGA 4F9OA 3T3FA 3TAMA 2QEXN 2ASMA 1W2BM 3VQ7A 3UE5A 5AZJA 1LAWA 3RMCA 1YHQN 3D2FA 3SV3A 2O8CB 4DFJA 3HPGA 4PKHA 3FFIA 4YFUA 3JS6A 3TR8A 4E7IA 4N76A 1TYQB 3NMUA 3DLGA 3RRHA 1EETA 1YAGA 4FM1A 4HUFA 4AM6A 3RWUA 1FKPA 2W00A 4KHNA 3V1RA 1G99A 3F9MA 4B9LA 2DFEA 4KRFA 4JKDA 5CHIA 4F3TA 3K57A 2BUPA 4ZTJA 4BDYA 1C0TA 4DTOA 2JWLA 1HQEA 1KRPA 4B9NA 1HNXK 3VEYA 5MLCQ 3DXKB 1JL2A 3LAMA 3MDQA 2E1YA 4B9TA 4GV9A 1RDAA 3K9JA 1KTQA 4JI5K 4FJLA 4CBUA 3S9HA 1VQ8N 1K8KB 3MCPA 2HHWA 5HROA 1YTAA 3AA4A 3U6FA 3C0BA 4DS5A 1D9FA 4JNEA 3ULEB 4X64K 3MN5A 2F96A 4IZ9A 2A6AA 1L3SA 5BPMA 4DR5K 4FK0A 4RTFD 3C6UA 1EKEA 1IH7A 4JKGB 4JLHA 2OPRA 1ZC6A 3MK6A 1JLFA 4BG9A 4QAGA 4NB4A 4IFEA 2YHXA 1P8ZA 1TL1A 1TGOA 2R7YA 3T1YK 3OHRA 4QS9A 4DTNA 5AZJB 4JI3K 4UQGA 5J1EA 3HK2A 4AHCA 5J2NA 3D2FB 2E2OA 5M1NA 2KTQA 3WXLA 3CFRA 3MEGA 4E19A 1ESVA 3SJHA 3U4LA 4BR7A 1FW6A 4M3UA 1KAXA 1VSIA 3ZT1A 2WUSA 3NF8A 1QS4A 3CYGA 3K58A 3DLHA 1B9FA 2D4WA 3AA3A 3ZT0A 2IS3A 2G8FA 5C24A 4CE9A 3OY9A 5JVGL 4DFMA 1Z05A 3C94A 1OVYA 3KZBA 2P9LA 1Z6RA 3SBGA 4EZ6A 1U04A 4KO0A 4CGGA 5AFUA 4K8ZA 4J2DA 1Q8IA 4FJ7A 3NE6A 3KIOA 3C6HA 2G8HA 3AGRA 3CQ8A 4BC3A 3NVKA 3ZSOA 4WYBA 3CJ1A 4WE1A 5LL6Z 4CF1A 4PA1A 2J4RA 1K6YA 2HHTA 1WSHA 5HLFA 3LALA 4L3QA 1WB9A 2Q31A 1DLOA 4OVLA 2VGNA 4H0VB 3LP0A 3VEZA 4DV4K 4NYFA 4WQ5A 2HHVA 4B3TK 1XMOK 2GEMA 3LANA 4DFPA 2RPIA 4EAHD 4CFDA 3P83D 3HXMA 1SL2A 3U9DA 2HMIA 3BZKA 3V81A 1XI1A 4ID1A 2D0AA 2WONA 1ZBSA 4DU3A 3T19A 4CBXA 4HUEA 4WFAL 3TSQA 5KPZA 1VQON 3J80O 1S9EA 3VERA 1GOBA 4RG8A 1GLLO 1J6ZA 3BZCA 4B9UA 3QMLA 1RDBA 1WAFA 4CJLA 2FBXA 2PYJA 1GLCG 2GWKA 1WAJA 2F8TA 2IGIA 4NLBA 3OYMA 3H08A 3CPWM 3CCMN 3O1BA 3J7ZO 1NJYA 4BWMA 4RW8A 2VQEK 2NRXA 1X3MA 4IDHA 3EKUA 2G8VA 1RBSA 2Y1IA 1NGAA 4O4GA 4OGEA 2A40A 4M3ZA 5GIOA 3D2EA 4ILJA 1NBWA 4CF8A 1SV5A 3E01A 3MWPA 4PKIA 5AZIA 4WCEL 3VOVA 4FW1A 3MWTA 2CH5A 3KLIA 4KB1A 3DLBA 5KRSA 2OYQA 1JLBA 5AR0A 2YNGA 1RDUA 3HVRA 1DGKN 4RW9A 2GV9A 5M1QA 2YNHA 1GLDG 4O5FA 1V4TA 4DV7K 3KWGA 4IG3A 1D4XA 1BCOA 4BDZA 1KFDA 1NLVA 2CGKA 4DLGA 4CJ3A 4LH4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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