3HBTA

The structure of native g-actin
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin
publication title The structure of native G-actin
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein
total genus 113
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hbtA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hbtA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3hbtA03
2E1ZA 2QWOA 1T44A 3GBTA 5LJWA 3AAPA 5BPMA 5AQHA 3VEZA 5AFUH 1ATNA 3SLCA 1QHAA 3S41A 3A8YA 1MWMA 2QW9A 3MCPA 2P9UB 5KPZA 2A41A 1NGFA 1NGEA 3QDKA 4CZHA 5AQTA 3U4LA 2P9PB 5FPDA 4BR7A 2P9SA 1IG8A 2E2NA 3B8AX 3H46O 2P9NA 1E4GT 4MO4A 3CI5A 3WXLA 5JMVA 1BDGA 3J8AA 4CZIA 5AQRA 1NWKA 4O8KA 4JHDA 2I7PA 3WQUA 4NB4A 3C0BA 3ATUA 3DXMB 1LCUA 2W41A 4A62A 5BRDA 4WQ5A 3H3NO 4KBOA 4BC5A 4H5NA 3BUZB 3U9DA 1NGIA 3HSCA 3FZMA 4XEIA 4BRIA 3MN6A 2Q36A 3MN9A 2YJFA 3WUHA 3QFUA 4BRAA 3ZX3A 4H0OA 3M3ZA 5FPNA 1NM1A 3CJBA 3LDNA 1D4XA 4B1UB 4CZLA 5AZIB 5LY3A 3FZLA 1R59O 4BR5A 3A5MC 4IXCA 4BRGA 2E8AA 4JD2B 4AM7A 2V7ZA 3L4IA 2GWKA 5AQLA 3UB5A 4BRMA 3DAWA 4CJ7A 1QQMA 2QWNA 2VYPA 5TKYA 3O80A 3WEEB 3VEOA 2CGJA 1NGCA 3ZX0A 3A5NC 4B1WB 5KQDA 3IMXA 5B8HA 4B1ZA 1WUAA 2YJEA 1NLVA 2BTFA 4JD2A 2A5XA 3U9ZA 1XQSC 1BO5O 4FOIA 2NLXA 1S3XA 3UKUB 3VGLA 4HWIA 4LC9B 2QM1A 1ESVA 1XUPO 2YCHA 4K41A 2V7YA 4RCHA 3WEEA 1SZ2A 2CH6A 3R8EA 1YXQA 4A2AA 4BR4A 2UYTA 3CHWA 3O4WA 4BRPA 4IZ9A 3CJCA 2A6AA 4BG8A 4BVOA 4DCHA 1NGHA 3L0QA 4BRFA 4BRNA 3D2FB 4CZJA 1GLFO 3EZWA 3VF2A 3ENOA 1C0FA 2WUSA 5CE3A 2P9KB 3GG4A 3C7NB 1ATRA 3UKUA 2ZGYA 3G25A 4AM6A 1K8KB 4JAXA 3ULEB 1TYQB 1BWFO 5BR9A 2ZGZA 3CERA 3CETA 1H1VA 2J4RA 1BA1A 1YVNA 3IUCA 4A2BA 4E1JA 2FF6A 2FSNA 1NGGA 3H1VX 5EVZA 4MLHA 1SQKA 3GDQA 1GLDG 3D2FA 5EY4A 3ZETB 2A40A 2E20A 1C0GA 2I7NA 3DWLA 3C7NA 4K42A 4B1YB 1XC3A 3ULEA 4BREA 4BR0A 4IWVA 4M7YA 5EX5A 1YAGA 3ID8A 2A42A 5AQNA 3UE5A 2IVPA 2HMPA 2FSKA 3CJ7A 4RTFD 3R6MA 4BRLA 2PBDA 3A5OC 4MLEA 3LDPA 3QICA 3ZETA 3KZBA 2DPNA 3MDQA 5BN8A 2W40A 2A3ZA 3OHRA 4BRQA 5BREA 2E2PA 3HM8A 4BRCA 2P9LA 3CIPA 3D7EO 3M6GA 2QWMA 1IJJA 5E26A 3VGMA 1BUPA 5AQUA 2BUPA 1BA0A 2P9UA 1MWKA 3M1FA 2NRHA 2YHYA 4GNIA 3O5BA 3LDQA 2P9PA 3CJAA 1Z6RA 1DGKN 3VESA 3VEXA 1CZAN 3VPZA 3EKUA 1GLBG 5AQFA 4BVPA 2VWBA 1MA9B 3A5LC 4HTLA 1NGBA 2HF4A 2YHXA 3MK6A 3W0LA 4BC3A 3BP8A 3DXMA 5EOYA 3HBTA 3FR0A 2P9IB 4WYBA 1JCFA 2ZWHA 4H5WA 4K25A 4CZEA 1TUYA 3QB0A 1KAXA 1Y64A 2F9WA 3UKRB 2Q2RA 2Q31A 3FZFA 1NBWA 4EFHA 4Y0WA 1KXPA 5AQMA 4JNEA 5JLFA 2GUPA 5AFUA 3BF3A 4H0YB 3EL2A 1HKBA 1X9JA 4PKGA 2P9IA 2YHWA 4DHYA 5AZIA 3KHYA 4FWSA 5AQJA 4H0XB 3ZEUB 3H6EA 4BROA 2NZTA 3UKRA 3DJCA 4CD1A 4K43A 4H0PA 4WQ4C 3HTVA 3CJ9A 1KAYA 5BPNA 4DB3A 4FWRA 1HKGA 3VERA 3SMPA 3FLCO 4FPAA 4J8FA 3LM2A 4YDUC 1NMDA 3QBXA 3ATVA 3GE1A 4H03B 2Q1NA 1HX1A 5ADXH 3D2EB 2GELA 5AQGA 1GLAG 4C23A 1J6ZA 4BRKA 3WT0A 5AQVA 4PL8A 1HPMA 4EHTA 1OKJA 5FPEA 1GLLO 5AQIA 5JICA 5BN9A 1GLJO 2Q97A 1V4SA 5AQOA 4H5VA 3D2EA 2CH5A 4CZMA 3L6QA 2D4WA 2P9KA 3LDLA 1RFQA 1KAZA 2F9TA 2GTDA 2PAVA 4JN4A 5KPRA 3VOVA 1K8KA 4WQ5C 5AQYA 5LJVA 3DXKB 1TYQA 4B1VA 4BRHA 3QFPA 4FSVA 3IDHA 1MDUB 2H3GX 1QQOA 4FL9A 4BG9A 4XH1A 4PL7A 4GY2B 4CZGA 2E2OA 2IVNA 5AQZA 1HUXA 3EKSA 3JXUA 1X3MA 4FO0A 3O6WA 2P9SB 4YDUA 3ZX2A 3EN9A 1Z05A 5F0XA 3VEWA 4DQ8A 1JCGA 2FLOA 4O5FA 4BQLA 3WXIA 2VCPA 3DXKA 2YI1A 5AQSA 2ASOA 2FXUA 1X3NA 4FWNA 3O8MA 4FOEA 5KPTA 3FFKB 3LL3A 4FWKA 4ISGA 4L3QA 5ADXA 4EAHD 4BQZA 4Z94A 3A0IX 4B9QA 2E2QA 4CZFA 4FWPA 4BC2A 3O08A 4IJAA 4QS7A 3VEVA 3QBWA 3KVGA 2IVOA 2OANA 4EHUA 3CJ1A 3LDOA 2HOEA 2QWRA 1G99A 4MO5A 3SMSA 4I6MB 3MN5A 2QXLA 3P4IA 4BR2A 4M7XA 5F1XA 2GWJA 4QS9A 4FWQA 4EIAA 4M63C 5BRHA 4CBXA 5I9EB 2ZF5O 4XH5A 2KHOA 3MMVA 3W3DA 5BPLA 3H45C 5AZJB 3VGKA 5F2RA 3WXKA 2CGLA 1GLEG 3H3OB 4CZKA 4H0VB 3WXJA 1BG3A 1HJOA 3CQYA 3AAQA 1BU6O 4CBWA 1YUWA 1ZXOA 3FZKA 3IFRA 4PKIA 3U8XA 4I6MA 1WOQA 3WQTA 2QWQA 2ITMA 2Q0RA 3AY9A 2V51B 1RDWX 1P8ZA 5JLHA 4BRDA 5AZJA 3LM9A 4IJNA 4FPBA 4NO7A 4A61A 1DKGD 1ZBSA 2E1YA 2Q0UA 4RWTA 4BC4A 2D0OA 2ASMA 5FPMA 3TU5A 1QQNA 2E88A 3HI0A 2ASPA 3FE1A 2QWPA 3VEYA 3JS6A 4QS8A 1TUUA 2FSJA 3VENA 3O1BA 2FF3B 3I8BA 4FWLA 3H1QA 3SK3A 3AARA 5AR0A 4ISEA 3GL1A 4BGBA 1S22A 4CBUA 3ZEUA 4FWMA 2AP1A 3VF6A 1ATSA 1HLUA 3FGUA 3MN7A 3HZ6A 1QZ5A 5AQKA 2QWLA 3RSEB 1JCEA 2D1KA 2AA4A 1LOTB 3GOIA 4ISFA 1E4FT 1RGIA 5ELZA 1BOTO 1DEJA 1QZ6A 2GEMA 5E84A 3VETA 1T6CA 3I33A 1HKCA 5KQ8A 3CQXA 4XH4A 3VF4A 2D0PA 4PKHA 1T6DA 4H5TA 4FWOA 4BR9A 4H0TB 4B1XB 1U2VB 3FZHA 2EWSA 3RSEA 3ENHA 3QMLA 2IIRA 4IO8A 5EXWA 4H5RA 1SAZA 1EQYA 1NGAA 3F9MA 1Q18A 2CGKA 1U6ZA 1NGJA 1V4TA 4CI6A 1GLCG 4WQ4A 1ZC6A 4CD3A 1NGDA 4F9OA 3EO3A 3BF1A 5AQXA 2HF3A 5AQPA 5AQQA 3R9PA 3O1WA 2V52B 4BGAA 2P9NB 5AQWA 1U2VA 5BRFA 3TPQA 3BEXA 3SJHA 2P9LB 4JHDB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3V9WA 1NK9A 2QWOA 1T44A 4OJRA 5BPMA 1N5YA 3OYFA 1QHAA 4IFVA 1RNHA 5KPZA 1NGFA 3QDKA 3G71N 3K5MA 3U4LA 2G8IA 2P9SA 4KO0A 3B8AX 3CI5A 1EKEA 4CIGA 1IKYA 1VSIA 2QKBA 5HRNA 1K73O 5BRDA 2X74A 4WQ5A 4KBOA 4BC5A 1UAXA 5FRNA 5KRSA 1KD1O 3K5OA 3VQ6A 3CFRA 4XEIA 4JKBA 4BRIA 4DR4K 2HNZA 3MN6A 3O9TA 5FROA 4KHQA 3NH1A 3ZX3A 5C0YA 5FPNA 3S9HA 4OPAA 4B1UB 3HVRA 2F8TA 5LY3A 1R59O 4BR5A 3R1XA 4CIEA 1HPZA 1NOYA 4CF9A 4AM7A 2V7ZA 4W5RA 2F4VK 3OBWA 3L4IA 1HYSA 4KREA 3DAWA 4CJ7A 2EX3A 5I42A 1L3UA 4F2SA 1IKXA 3VEOA 5GAHP 3OYBA 2VGMA 1S1WA 4IFYA 1FXXA 3A5NC 1VQ8N 5B8HA 3RVCA 4B1ZA 1WUAA 4CEZA 4DR5K 1T8EA 3U9ZA 1BO5O 4DR7K 4BE1A 4KPYA 3EZ5A 1TK5A 1U4BA 4CK2A 3LWMA 2GV9A 4EZ6A 4DQIA 1NKBA 4RCHA 1S5JA 3IS9A 4IDKA 1RTHA 3TSUA 4YHHK 2E4LA 1VSJA 4RW8A 4W5QA 5T7BA 2HHTA 1NGHA 2OZSA 3SQ0A 4CZJA 1GLFO 1RT4A 2WUSA 4CHOA 2P9KB 3D0PA 1BCMA 4AM6A 2YX6A 3QESA 3CETA 1NU0A 3ZLJA 2NRWA 2GX9A 3ALYA 4CEEA 4FZYA 4JV5K 2FSNA 3DMJA 2KFZA 5EVZA 3EE9A 4JKDA 5EY4A 3ZETB 1I39A 3LANA 3ZSRA 1IH7A 3JYTA 2IC3A 5KGXA 1KQSM 1XC3A 1F21A 1RDUA 4M7YA 2Z1HA 5AQNA 2HMPA 3R6MA 4BRLA 4CVNE 4MFBA 3SUQA 3LDPA 4KHWA 3ZETA 5CHIA 5BN8A 4PY5A 5BREA 3HP6A 4JRPA 1BCOA 1BIUA 4GKJK 3VGMA 1WBDA 5FRMA 3NCIA 1MWKA 4G1QA 4HCBA 3DI6A 3S3NA 3T1AA 1N33K 1QTMA 3VEXA 4BDPA 3EYZA 1GLBG 3F73A 5AQFA 4FZZA 3HM9A 1DTQA 2HF4A 2YHXA 4B3OA 4BC3A 3O9UA 4A59A 5M1QA 1RBTA 1KFDA 3HBTA 2ZQBA 1I3AA 2P9IB 1FW6A 1JCFA 2ZWHA 4H5WA 1NK4A 1TUYA 2Y1JA 1Y64A 2Q31A 1KRPA 5C10A 4Y0WA 4WF9L 5AQMA 2W6KA 3OYIA 5AFUA 3BF3A 4H0YB 4IFEA 1BIZA 1HKBA 3EL2A 1WAJA 4LSNA 3AVBA 3JAMO 4M3WA 4ID1A 2P9IA 1TKZA 4CHQA 5AZIA 3KHYA 4F3TA 4FWSA 5DM6L 4PHTX 2P5OA 4CJKA 2NRZA 3H6EA 2NZTA 3C95A 3B6PA 3M8SA 1VQPN 3VQCA 4DB3A 3NF7A 4MQ3A 3CCMN 3L4QA 4FK4A 4B9LA 3LM2A 3WXMB 1NMDA 3QBXA 3S5TA 2G8VA 1HX1A 3NH0A 3SAFA 1N34K 3TAPA 3CCVN 4FW2A 5AQGA 1EXQA 1GLAG 1SL0A 1LW2A 4E7HA 4I7FA 2YNHA 4AHUA 4BRKA 2QKKA 4B8CA 5AQVA 4B9VA 4EHTA 3SQ1A 2E5LK 3J7ZO 3G4SN 5FPEA 3VTHA 4QAGA 1IKWA 4DTNA 1ZBUA 1ZBFA 3TTCA 3ZSVA 4CECA 2KZZA 4LF6K 3CCEN 3L6QA 2C1GA 1LWEA 4CF0A 3OYLA 4FJGA 1KAZA 2GTDA 2HHUA 4KKOA 1K8KA 1MDUB 1C0TA 1KVBA 2KW4A 4XH1A 4GY2B 4KAZA 5AQZA 1HUXA 3EKSA 3JXUA 3PIPL 1X3MA 4CHYA 2OZMA 1W97L 2QK9A 1ZBLA 2PYLA 3OYNA 2OA8A 1S6QA 1JCGA 2FLOA 4BQLA 3H08A 2VCPA 4HUFA 3P1GA 4DSKA 1X3NA 5KPTA 4ISGA 4ILHA 1BL3A 4YFUA 3T1HK 3CCJN 3L3UA 2I5JA 4HTUA 2DFEA 4CEDA 3HPHA 2UUAK 4CHNA 4IJAA 5J1EA 2OANA 3R3LA 3OS0A 3CJ1A 1VRTA 4ILJA 4FJJA 4N56A 1G99A 1XMQK 4I6MB 4CCHA 2QXLA 1FJGK 3P4IA 2XY8A 5HL7L 4B9SA 4EIAA 3ASMA 4M63C 4O4GA 1TAQA 3VQEA 1SKSA 1N36K 4G9ZA 3AO1A 3L3VA 3VQBA 4AHCA 3WXJA 1BG3A 4C1NK 1WB9A 1BU6O 1YUWA 2HBMA 3O9RA 2VG6A 3NBPA 4PKIA 4I6MA 3MXMA 1WOQA 1G15A 3MEDA 1RBSA 2O8BB 1D5AA 2RN2A 2KFNA 1EWQA 4BRDA 3QIPA 5GINA 1DKGD 1ZBSA 2E1YA 4R79A 2Q0UA 5C25A 1MU2A 4AQYK 4E7IA 1WSEA 3NE6A 1RDAA 1K8AO 2O8BA 3SK3A 3AARA 3GL1A 4JI6K 1RTDA 3ZEUA 4MDBA 1HLUA 1WSFA 3HZ6A 1QZ5A 2X6NA 3IKMA 1UA1A 3RSEB 2AA4A 1LOTB 4ISFA 1FK9A 1YJ9N 3CM5A 1QZ6A 2GEMA 1OH6A 1HKCA 4OPJA 3I0RA 4ZTJA 2AJQA 4BR9A 4H0TB 1ITGA 4B1XB 1C1CA 1Z25A 3RSEA 2YNFA 3QMLA 4IO8A 1YIJN 1W7AA 3AO5A 3F9MA 1NJZA 4LF5K 4KHNA 1U6ZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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