3HBTA

The structure of native g-actin
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords Actin
publication title The structure of native G-actin
pubmed doi rcsb
total genus 113
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hbtA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hbtA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3hbtA03
2CH6A 2P9IA 3DXKB 4M63C 4QS9A 4XH5A 2A40A 4FWOA 4CZJA 1HKGA 5BRFA 3FZMA 5FPDA 3ZX0A 4B1UB 4JAXA 3H6EA 3O4WA 4FWQA 3VETA 5KPRA 3MCPA 3VF6A 1G99A 4B1ZA 1S22A 3KVGA 2P9NA 4K42A 1E4GT 2A41A 2Q36A 1GLCG 1GLLO 3EZWA 1MDUB 3FLCO 4CI6A 1QZ5A 3CQXA 5AZJB 1IJJA 3BF1A 3L0QA 4AM7A 4BROA 3WEEA 3SMSA 2HOEA 1T6CA 4DQ8A 3VESA 3FZLA 2QM1A 2V51B 4MO5A 4CZEA 1NBWA 4ISGA 3VGLA 3D7EO 1WUAA 4EIAA 1BDGA 3A5MC 4FPBA 3FZKA 2P9PA 3I8BA 5AQUA 1IG8A 4PKHA 3D2EA 4B1VA 3BP8A 3O5BA 2E2NA 3O1BA 3ULEA 3LL3A 3FZHA 3C7NB 5AQSA 2ZWHA 1GLFO 1GLAG 3WT0A 1GLEG 1NGJA 4BRCA 1DEJA 1C0FA 3MN9A 4ISEA 3AAQA 4IJAA 3DAWA 4H5TA 3HM8A 4H0TB 2P9LA 1ATNA 2Q2RA 2A3ZA 1U2VB 1DKGD 3ENOA 3VEYA 3ZETA 3C0BA 2AP1A 3EN9A 3MK6A 3BEXA 4BRQA 2PAVA 4GY2B 3M1FA 1HKBA 1SAZA 4BR9A 3QICA 4Y0WA 5KQDA 1S3XA 4FWLA 3ZEUA 2E1ZA 1RDWX 5EX5A 2A42A 1ATRA 4FL9A 1NWKA 4PKIA 4WYBA 5AQTA 3FE1A 2Q0UA 1NGFA 4LC9B 1NGDA 1TYQA 1Z6RA 2NRHA 2Q1NA 3FR0A 1BUPA 4QS8A 4PL8A 3DWLA 5BPNA 2NLXA 4JHDB 3O08A 5AQIA 2QWQA 2D1KA 5AR0A 2FLOA 4CZIA 4FWNA 1NGCA 4H03B 1YUWA 1BA1A 3GDQA 1KXPA 4H0XB 3R9PA 3VF2A 2BUPA 2E2OA 2E8AA 3HBTA 4I6MB 2VWBA 5LJVA 3DXMB 4H5VA 3VEOA 5AQRA 4DB3A 4EAHD 1GLJO 2P9SB 5JLHA 5AZIA 1BWFO 2P9UB 5AQJA 3BUZB 5AQVA 3LDPA 3FZFA 3SMPA 3J8AA 1YVNA 3ZX3A 4ISFA 3LM2A 5ELZA 3U9DA 3LDLA 4BRNA 4IZ9A 3RSEA 4IJNA 3CHWA 3A8YA 4CJ7A 2CGLA 4CZHA 5LJWA 1ESVA 1GLDG 4H5WA 4IXCA 4CBUA 4A62A 5AQLA 5EVZA 3CJ7A 3AY9A 4FPAA 2ZGYA 4FWPA 3MN6A 2Q0RA 3D2FA 2QWMA 2VYPA 3LDOA 2ASMA 5BRHA 2I7PA 3JS6A 1Y64A 4A61A 1YXQA 2W41A 3R6MA 5AQPA 1ZC6A 1ZXOA 5AQOA 1BA0A 3SJHA 3H1QA 2AA4A 4BRGA 2Q31A 4B1YB 3UE5A 3IFRA 2P9KB 2YJFA 4PL7A 5JLFA 4A2AA 4QS7A 1HKCA 3ULEB 5AQNA 4H5RA 4BR7A 2YHXA 2VCPA 2YJEA 3UKUB 5TKYA 1HLUA 2YI1A 5AQGA 5AFUH 2J4RA 2GUPA 4BC4A 1KAXA 4H0VB 4BC2A 5KQ8A 3QDKA 2ASPA 3U9ZA 2IVPA 1MWKA 3WQTA 3CI5A 5ADXH 2GTDA 3ZX2A 3LDQA 2CGKA 4HWIA 4FWKA 3CIPA 3DXKA 4EHUA 5FPMA 2HF3A 1TUUA 1Q18A 3G25A 5AQFA 2FXUA 5CE3A 5AQHA 3QMLA 3ZEUB 3W0LA 4A2BA 3H1VX 4CZFA 2E2PA 3MN7A 3VEZA 3BF3A 1NMDA 4IWVA 3A5OC 4CD1A 4MLEA 3H3NO 3KHYA 3QFPA 3ATVA 3WXKA 1T44A 4PKGA 4JD2B 2H3GX 3F9MA 1QQOA 1BOTO 1TUYA 5KPTA 3W3DA 4B9QA 3U4LA 1NGEA 3QBWA 2ASOA 5BPMA 3VEXA 2IIRA 1V4SA 2KHOA 3U8XA 1ATSA 1J6ZA 5AQQA 3CJ9A 4BR0A 4AM6A 1NM1A 3A0IX 4BG9A 3GE1A 4E1JA 2ZGZA 3CETA 3WXJA 5LY3A 4BQZA 5JMVA 4C23A 5AFUA 2OANA 4M7YA 3B8AX 4K25A 1K8KA 2ITMA 4DCHA 1GLBG 5EY4A 3O6WA 3C7NA 2UYTA 5AQYA 3VGKA 5KPZA 3GL1A 2FSJA 4BVPA 4BRIA 3ENHA 3UKRB 2FF3B 4BC5A 4FWSA 4B1WB 5FPNA 1JCFA 2WUSA 4GNIA 3A5NC 1XQSC 4BRMA 5F0XA 4NO7A 1C0GA 3CERA 4BG8A 2P9IB 1RGIA 2E2QA 4IO8A 2A6AA 5AQWA 5AQMA 4BR5A 1KAYA 1X3MA 3EO3A 1NGIA 1EQYA 3HTVA 3L4IA 1E4FT 2PBDA 4CZLA 5BR9A 1LOTB 1XC3A 4DHYA 2P9NB 4FO0A 1XUPO 2IVNA 2F9TA 3WXIA 2HF4A 3H45C 3WEEB 2V7ZA 4WQ4A 3O80A 2A5XA 4BQLA 5EXWA 2E20A 4BC3A 1QQNA 3O8MA 4WQ4C 1SZ2A 3HSCA 3VPZA 3CJ1A 2IVOA 2E1YA 4FWMA 1MWMA 4K43A 5F1XA 1NGBA 2P9PB 4RWTA 3DJCA 1JCGA 1YAGA 3D2EB 2DPNA 3DXMA 1OKJA 5AQZA 2CGJA 3IUCA 2P9SA 4EHTA 2P9UA 3FGUA 4K41A 2BTFA 2F9WA 2D4WA 4WQ5A 4FOIA 1ZBSA 2QXLA 1MA9B 1NLVA 1BG3A 4WQ5C 5BPLA 4O5FA 4J8FA 1KAZA 3WXLA 2P9LB 4BRAA 3SLCA 3GOIA 4XH4A 3ZETB 2FSNA 3LM9A 3VOVA 2YCHA 1DGKN 2QWOA 1HX1A 3M3ZA 2QWPA 3QFUA 5E26A 3SK3A 2D0PA 4Z94A 1H1VA 3WUHA 4H0PA 4O8KA 1V4TA 3GG4A 2Q97A 4XEIA 4BRDA 2V52B 2NZTA 2QW9A 4MO4A 4YDUA 3OHRA 4RTFD 3H3OB 4BRPA 2GWJA 1NGHA 5AQKA 1HPMA 3HI0A 3S41A 1TYQB 2GEMA 5AZJA 2P9KA 3QBXA 4YDUC 5BN9A 1K8KB 3VEVA 4M7XA 1SQKA 3AARA 3P4IA 4BR4A 3VENA 3MMVA 4L3QA 3A5LC 5BN8A 4F9OA 3UKUA 2EWSA 4KBOA 1HUXA 1Z05A 2QWLA 5B8HA 4CZGA 5F2RA 2QWRA 4JNEA 4NB4A 3TU5A 2YHWA 3CQYA 3CJBA 4H0OA 2GWKA 4CBXA 5FPEA 1BO5O 4BREA 4H0YB 2YHYA 1X3NA 3H46O 1P8ZA 2I7NA 5AZIB 1X9JA 4B1XB 3WQUA 3HZ6A 3IMXA 5ADXA 3EKSA 1CZAN 2FSKA 3GBTA 2CH5A 3RSEB 3R8EA 2W40A 3M6GA 1LCUA 3UB5A 4CBWA 5EOYA 2GELA 2ZF5O 4FOEA 4BRKA 3AAPA 2E88A 4CD3A 1QHAA 4BGAA 4JD2A 1U2VA 1R59O 3VGMA 2HMPA 3VF4A 4BR2A 4CZKA 4BRHA 4BVOA 3D2FB 1D4XA 3ATUA 3ID8A 2QWNA 5E84A 4BRFA 1RFQA 1NGGA 5JICA 1U6ZA 1JCEA 3FFKB 5AQXA 2V7YA 1NGAA 3I33A 3EKUA 3O1WA 1T6DA 3TPQA 4BGBA 2D0OA 3LDNA 5I9EB 3IDHA 3VEWA 4CZMA 3L6QA 3VERA 4EFHA 3CJAA 1QQMA 4H5NA 4JHDA 4RCHA 1QZ6A 3CJCA 4XH1A 4BRLA 3KZBA 3QB0A 4HTLA 3MDQA 1HJOA 2FF6A 5BRDA 3MN5A 3UKRA 5BREA 3EL2A 3JXUA 4FWRA 4FSVA 1WOQA 1BU6O 4I6MA 4MLHA 4JN4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2X6SA 1KLNA 4XH5A 4A5BA 3PSFA 4OGCA 1VAZA 4E0DA 2P1JA 1XMOK 4KHUA 3PIOL 3H6EA 3O4WA 3VETA 2YX6A 1VSEA 2VQEK 4WFAL 1G99A 4U67L 4B1ZA 2O8FA 3LP3A 3KVGA 3P31A 4IOXA 1E4GT 4FW2A 1GLCG 4JI6K 1T03A 1IKYA 1NK5A 3BF1A 4AM7A 3J7ZO 4X65K 3FZLA 3TSQA 1VHXA 2V51B 4MQ3A 1NBWA 4ISGA 3VGLA 1QTMA 3SQ1A 3L4QA 3A5MC 3SUNA 1QSLA 1NK0A 3A2FA 4YOWA 1WNSA 5AQUA 4JS4A 2OA8A 3D2EA 4B1VA 4B08A 3RRHA 3CCVN 5DM7L 1XHZA 1X9SA 3FZHA 1LAVA 3C7NB 3CG7A 5AQSA 2UUCK 1SKSA 2IS3A 3BZCA 3LZJA 5C10A 1FXXA 2PZSA 2HHTA 4H5TA 4DV1K 3HM8A 4H0TB 4NXNK 1ATNA 1EO1A 1DKGD 4CF1A 3KJVA 4Z4EA 4OKKA 4CHNA 1EXQA 4BRQA 2DY4A 3QICA 5KQDA 3ZEUA 3QNNA 4FL9A 1NWKA 4WYBA 4F8RA 1BI4B 5HRNA 1NGFA 3QO9A 1NGDA 4LFCK 4CJVA 1Z6RA 4B3MK 4CEQA 4PL8A 3EZ5A 2NLXA 4JKFA 5AQIA 1I3AA 1QVGM 1BA1A 2HSTA 4DQIA 5DMRA 1KXPA 2WONA 3D0PA 3JYTA 4H0XB 1OH8A 2BUPA 3HBTA 2VWBA 3B6OA 5LJVA 3QEXA 5AQRA 4PY5A 2P9SB 5JLHA 1BWFO 3WNEA 4DUZK 4Z4IA 4DV0K 3LDPA 3BDPA 3FZFA 1FK9A 3LP1A 3G0ZA 4ISFA 3LM2A 4BRNA 4IFEA 5H1SQ 4CJ3A 3A8YA 4CZHA 2HHWA 1IO2A 3SAGA 5C24A 2OZMA 1W0HA 3U6FA 3MECA 5AQLA 5EVZA 3CJ7A 4C1NK 4E7KA 3RMBA 4CJEA 1ASWA 4O4GA 2QWMA 1VSFA 1XMQK 4J2AA 4PUOA 1JLEA 3LAKA 1YXQA 3THXB 2VG7A 3CC4N 4CF9A 5AQOA 3H1QA 3K5MA 2AA4A 2Q31A 3CPEA 4B1YB 3IFRA 1T8EA 1EWRA 2YJFA 5JLFA 3HT3A 1CZ9A 4Q5VA 3AO2A 1QSYA 2QA4N 2VCPA 2OTJN 2YHAA 1HLUA 3OYBA 4FJNA 1REVA 2QKKA 1U4BA 2J4RA 5A2QO 2ZJPL 4B9TA 4BC4A 1KAXA 4JLHA 4FVMA 1XI1A 3L2UA 4KREA 3WNFA 3WQTA 3U9ZA 4DUYK 3CI5A 3ID6A 5HRPA 3ZX2A 4DSEA 3LDQA 1W97L 1IBLK 4BE7B 3TTCA 1IH7A 4O55A 2HF3A 4B3SK 3CMAN 3LP0A 2QXFA 1GOAA 4A2BA 3H1VX 3LP2A 4CZFA 3K5LA 4CHYA 4IWVA 1J9AA 3M8PA 3KHYA 1FJGK 3ATVA 3AA3A 3WXKA 2F96A 2Y1JA 3RWUA 4W5RA 1NJIO 2HBKA 1B9FA 4BE0A 1OH6A 3F9MA 1BOTO 3U4LA 1SS6A 3KD5E 4M3WA 3AVHA 2IDOA 3L2QA 1ATSA 1JL2A 1NM1A 4YFUA 3GE1A 4FK4A 4V19S 4BQZA 5JMVA 4KHQA 2UXBK 4IFVA 4GV3A 4KKOA 1RT4A 4K25A 4DCHA 5GIPA 3AVJA 3C7NA 3S3OA 3DLGA 1S1VA 4IOCL 4YOUA 3QESA 1RTDA 4BRIA 4MDBA 4DR6K 3U3YA 3HRGA 1JCFA 1YJWN 1ZBUA 4CF0A 2WUSA 4CFAA 4BRMA 1Q9XA 3CERA 1WBDA 2P9IB 2O8DA 3ZT0A 1NK7A 3O9SA 3SPZA 5AQMA 4DU1A 1K73O 1JXBA 1FKPA 1WSJA 3AA4A 5MLCQ 1EQYA 3CMEN 2PBDA 5BR9A 4CK3A 1LOTB 5FLXO 4DHYA 3MAQA 2VWJA 4CJSA 1WSHA 1QHTA 3KLHA 1BI4A 3PX4A 4N47A 1J53A 1Z26A 2HF4A 3F9KA 3H45C 2V7ZA 4B9UA 4C8NA 2E20A 4BC3A 1L5UA 4F2RA 3C6AA 2HBLA 3CM5A 3CJ1A 3HSCA 4EP5A 2P9PB 3VQ9A 4ILJA 4RWTA 1O1WA 1JCGA 3OBWA 4CK1A 3HVRA 4KB0A 4BE1A 1WN7A 4NYFA 3IUCA 2P9SA 4EHTA 2NRXA 3IKMA 3FGUA 3NE6A 4WQ5A 3AO1A 1JLFA 4FOIA 4HTUA 4DS5A 2JGUA 5HLFA 3V1QA 4B9SA 3ZSWA 1Q8IA 5BPLA 5HL7L 4ILGB 2PFUA 4HVJA 3WXLA 1NK4A 4B9MA 3RMDA 3KWIA 1CXUA 3GOIA 3DMJA 4CGDA 3E01A 2QEXN 1VQ6N 2XY8A 1YJNN 5M1PA 3QEWA 3QFUA 3BZKA 1VQ4N 1R0AA 3WUHA 4KHWA 4YOVA 3GG4A 4XEIA 4CFCA 1A5XA 1TL3A 3OHRA 4YNQA 1L3UA 3S3NA 1VSIA 4OKEA 4JI0K 3VTHA 2OPRA 4L3QA 3A5LC 5BN8A 3OYMA 3V6DA 1Z05A 5JS1A 4DTPA 5KI6A 4H0OA 4M42A 3ZSXA 1XWLA 4N5SA 3PLAA 4CBXA 1VSHA 1BO5O 3DLHA 1EKEA 3NGZA 3ZSOA 1ZBFA 2F4VK 1X3NA 4B1XB 4YY3K 1G15A 3HZ6A 3NCIA 4IEIA 4HUGA 2FSKA 3OY9A 3RVCA 4RW4A 1KCFA 3RSEB 5J2NA 5DK5A 3UB5A 4NLBA 1RDDA 4DR4K 3HL8A 2G8VA 3V9UA 3IAYA 3VGMA 1S1WA 3THWB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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