3HBTA

The structure of native g-actin
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The structure of native G-actin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin
molecule tags Contractile protein
total genus 113
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hbtA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hbtA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3hbtA03
3A5OC 3A5LC 5AQWA 3RSEB 3EZWA 4ISFA 5AQPA 5BR9A 1E4GT 2FLOA 3WXLA 2E20A 4FL9A 3R9PA 4CZEA 1SZ2A 5KPTA 3HSCA 4FWOA 3EN9A 4J8FA 4BRQA 2VYPA 4CZIA 2QWRA 2VCPA 5JMVA 3W0LA 3A0IX 1U6ZA 3ZX0A 3GOIA 1XUPO 3FFKB 4H5WA 1NBWA 1RDWX 5AQFA 4K41A 2AA4A 4H0TB 4RTFD 3MN6A 1JCEA 3UKUB 4B9QA 1MA9B 3BP8A 3WEEB 1BDGA 2P9PB 2YJFA 3SK3A 1BOTO 4K25A 4K43A 3W3DA 4O5FA 2IIRA 4WQ4C 5AQRA 3F9MA 3SMPA 3DXKA 4H5VA 2H3GX 5AQZA 1C0FA 4BRLA 1NWKA 2I7NA 4GY2B 3VF6A 3CERA 3QDKA 5I9EB 3MK6A 5AQTA 1MDUB 4BQZA 2YHWA 4H5RA 5AFUH 4CD1A 2V51B 5BRDA 4FWMA 2WUSA 2P9NB 2QWNA 3D2FA 3LL3A 5KPRA 2E2OA 3VESA 2HF4A 1DKGD 4FWQA 1HUXA 3IFRA 3OHRA 3AAQA 3VGMA 3MN9A 3CQXA 1H1VA 4CZHA 1T44A 3H45C 4FOIA 1HKBA 4EHTA 5BPNA 4M63C 5AQVA 1XC3A 4ISGA 2E2NA 3LDPA 5EVZA 4I6MB 4BVPA 5AQJA 3D2EA 4BC4A 2YI1A 5ADXH 5BPLA 3CJCA 3UKUA 5BN8A 4IWVA 3WEEA 5EY4A 2E1YA 2P9PA 1WOQA 4H03B 4QS7A 3A5NC 5AZIB 4A2AA 3QMLA 5FPNA 4B1ZA 2CH6A 4CZLA 2GUPA 3IUCA 4FWSA 2GWJA 2NRHA 2QWMA 3CIPA 3L4IA 3WXKA 4FWKA 3HTVA 4HWIA 2GEMA 3CJ1A 2QWQA 4H5NA 4DHYA 1HJOA 5JLHA 2FF3B 4JNEA 3M3ZA 3WXIA 3HBTA 3M1FA 3TPQA 4JAXA 3GDQA 4HTLA 4E1JA 2Q1NA 1GLLO 4CBXA 1TUYA 2P9IB 4DQ8A 1BA1A 1BO5O 2IVOA 1HKGA 3U8XA 2V52B 4QS8A 4BC5A 2FSKA 2P9NA 2YHXA 3EKUA 3JS6A 3LDQA 4FWNA 1NGFA 3VEZA 2E2PA 4MO4A 4B1WB 2P9SB 4IXCA 1YXQA 4H0OA 2I7PA 3ENOA 4QS9A 3O6WA 4BRMA 3ZX3A 3VEVA 4C23A 2BUPA 2QWPA 3D7EO 3QBWA 1NGIA 2NZTA 1KAXA 2PAVA 3MN5A 4I6MA 4WYBA 1S3XA 4CZKA 4JHDB 2YHYA 4WQ4A 4XH5A 3SJHA 4BG9A 2CH5A 3QB0A 3O1WA 4ISEA 4K42A 5AZIA 3BF1A 4IJAA 4WQ5C 1GLBG 4BQLA 5AZJB 1QHAA 2E1ZA 5AFUA 4B1XB 4BVOA 3GL1A 2A42A 2AP1A 3A5MC 4NB4A 2VWBA 1HKCA 3LM2A 2P9UB 4MLEA 3BEXA 2QM1A 4XH1A 3KVGA 4AM7A 1ATRA 3KZBA 4GNIA 2A6AA 3P4IA 5AQHA 1X3MA 3QBXA 2UYTA 2D0PA 2P9IA 1GLEG 4BC3A 3H3NO 3KHYA 4A61A 3LDOA 2Q36A 3DWLA 3DXMB 5E84A 5FPEA 2Q0UA 1NGCA 3VEXA 3R6MA 1ATSA 5LJVA 1QZ5A 3QFPA 2A41A 3VGKA 2P9SA 5ADXA 3FZLA 3FLCO 3ID8A 3VGLA 3ULEB 4M7YA 3FZHA 3WQTA 2YJEA 3M6GA 4BREA 4FWPA 2DPNA 4M7XA 3AY9A 5BPMA 4JHDA 5BREA 2FXUA 3RSEA 2PBDA 4MO5A 1KXPA 3CJBA 5AQYA 4BRNA 3D2FB 4BRCA 2W41A 3O08A 3WT0A 4JD2B 5E26A 2QXLA 3UKRB 4PL7A 3J8AA 5TKYA 1KAYA 3I33A 4NO7A 3I8BA 5AZJA 3WUHA 5JLFA 3UE5A 3R8EA 3TU5A 2YCHA 2A5XA 2D0OA 4FOEA 3O8MA 2OANA 1MWMA 1YAGA 2P9UA 4H5TA 1P8ZA 2D4WA 4BGBA 3GBTA 1ESVA 5F2RA 4BR4A 3CQYA 2GELA 3FE1A 2ASMA 4BC2A 5B8HA 1YVNA 4PKIA 2P9KB 5AQQA 4H0PA 4BRFA 1NLVA 3MMVA 4FWLA 3LDNA 1BU6O 4O8KA 5ELZA 1K8KA 5AQKA 2F9TA 1QQNA 1SQKA 3S41A 4H0YB 1U2VB 4FO0A 1TYQB 1NM1A 1GLCG 1Y64A 3C7NB 3HM8A 2FSJA 3ULEA 1Z6RA 3BUZB 1V4SA 1GLDG 3IDHA 3U9DA 1C0GA 4WQ5A 3GE1A 1NGEA 4BR7A 4H0VB 3SLCA 1CZAN 4JD2A 3UKRA 4CJ7A 2A40A 3HZ6A 1YUWA 1KAZA 2Q2RA 1D4XA 1LCUA 2V7YA 1XQSC 1QZ6A 5F0XA 1NGGA 1GLAG 1HPMA 1ATNA 5KPZA 1BWFO 3DAWA 1E4FT 3ATUA 3ATVA 4XEIA 4EIAA 2KHOA 4EFHA 4PKHA 4RWTA 1DGKN 2ZF5O 4AM6A 1MWKA 2HOEA 2ITMA 5LJWA 3B8AX 1EQYA 1NGHA 1NGAA 5AQGA 4CZMA 4IZ9A 5JICA 1R59O 3EKSA 3LM9A 2GWKA 5AQSA 3DJCA 1Z05A 2E88A 3FZFA 4IJNA 3L6QA 2FF6A 4DB3A 2ZWHA 2D1KA 2QWLA 4BR5A 5AQOA 2P9KA 4PKGA 5LY3A 4CZFA 4B1YB 5AQUA 5CE3A 3LDLA 5AQIA 4CD3A 4BROA 2ASPA 3FZMA 4FPAA 1U2VA 4IO8A 1TYQA 4YDUA 3C7NA 1JCGA 3VF2A 1S22A 4JN4A 2ASOA 3VF4A 3CJ7A 1QQMA 4B1VA 3D2EB 3O80A 5EOYA 3H1VX 1QQOA 3QFUA 3MCPA 1HLUA 5AQXA 3H46O 4FWRA 3IMXA 3VEOA 4XH4A 2P9LB 4CBWA 1GLFO 1T6DA 3JXUA 4B1UB 3H3OB 5F1XA 5BRFA 5EXWA 1LOTB 5AR0A 4YDUC 4CI6A 4EAHD 3C0BA 1G99A 2Q31A 3GG4A 3MN7A 3O5BA 1BG3A 4RCHA 3U9ZA 3O4WA 2QW9A 1GLJO 1NGDA 3UB5A 2CGLA 2J4RA 1SAZA 5BN9A 4L3QA 3VEYA 4BRDA 4Y0WA 5AQMA 3ZEUB 3ZX2A 3G25A 3CJAA 4F9OA 4FSVA 3MDQA 1TUUA 4H0XB 3BF3A 3ZETB 3U4LA 2ZGYA 4BRGA 3AAPA 2ZGZA 3QICA 2FSNA 3FZKA 2HMPA 4FPBA 3DXMA 1K8KB 1J6ZA 3H1QA 4BGAA 5AQNA 1X9JA 1RGIA 3L0QA 2CGKA 2GTDA 1ZC6A 1IJJA 4BR2A 1BA0A 2EWSA 4PL8A 3VENA 4EHUA 5KQDA 1T6CA 3VETA 3HI0A 5EX5A 1Q18A 1HX1A 4BRAA 2IVNA 4DCHA 4BRKA 2A3ZA 2BTFA 5BRHA 3AARA 2F9WA 2P9LA 2Q97A 3FGUA 3WQUA 2E2QA 3H6EA 3SMSA 3ENHA 3CJ9A 1NGBA 3CHWA 4BRHA 4KBOA 2W40A 3FR0A 4BR0A 4BR9A 2HF3A 4A62A 4BRIA 1IG8A 2NLXA 3O1BA 3VEWA 4MLHA 1NGJA 3DXKB 5AQLA 2IVPA 4BG8A 4Z94A 3VOVA 3VPZA 4CZGA 1OKJA 4LC9B 5KQ8A 5FPDA 2QWOA 3ZEUA 5FPMA 4BRPA 1NMDA 1BUPA 4CZJA 3A8YA 4A2BA 3ZETA 2CGJA 1RFQA 4CBUA 1WUAA 1X3NA 1ZBSA 3CI5A 3CETA 1ZXOA 1DEJA 3WXJA 2Q0RA 3VERA 1V4TA 1JCFA 2E8AA 3EO3A 2V7ZA 3EL2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3A5LC 2O4GA 3EZWA 5BR9A 1IKXA 4GKKK 2VGMA 2FLOA 4CZEA 3R9PA 4CJUA 3KWGA 4TSXA 5C25A 3N4PA 4CZIA 3QLHA 4Y1DA 1HPZA 3KLIA 4E7HA 4CERA 3MWTA 4NYNA 3ZSXA 5JMVA 3S3OA 4B9LA 3ZX0A 4YOWA 3FFKB 2O8CA 1JL2A 2XY8A 3SAGA 4CESA 4H0TB 4KPYA 4QOZB 2E5LK 1WAJA 3UKUB 5KRSA 3CG7A 1MA9B 1C6VA 2YJFA 3DRSA 4V19S 2O8FA 4RW9A 4CJ5A 1NJYA 1ZBFA 1HNXK 5FRNA 2IIRA 2ZJPL 2G8IA 5CYMA 4DSIA 1VQ6N 4O55A 4KI6A 1KLMA 1C0FA 5CZ1A 3K59A 3VF6A 3CERA 4EZ6A 3L3VA 3D0PA 1VSFA 2YV0X 5AQTA 1MDUB 2GX9A 3SUNA 2YHWA 4H5RA 4FLVA 4CD1A 2V51B 5BRDA 4FWMA 2WUSA 2Q3SA 5C15A 4B9NA 5KGWA 1MU2A 4C8LA 1XI1A 4BDPA 1HUXA 4W5OA 1K8AO 4FOIA 4DMNA 4EHTA 3OYFA 3HP9A 1XC3A 5EVZA 4I6MB 4BVPA 3CYGA 3V81A 2A1RA 3D2EA 1TL3A 1FK9A 2YI1A 2IS3A 5BN8A 4A5AA 2OPQA 5GAEP 4Y1CA 1N34K 2QKBA 3WEEA 2P9PA 2OA8A 3AGKA 1YVUA 3HOSA 4Q0BA 5FROA 3TR8A 3HOTA 4K8XA 2GWJA 2KZZA 1RBVA 2NRHA 1Q9XA 4E0DA 4CFDA 3O9QA 1HNIA 4M3RA 2GEMA 3CJ1A 5JLHA 4JNEA 4BE0A 3M1FA 4DUZK 1WBBA 4HTLA 2VG6A 2P9IB 1JXEA 3CFPA 1RBRA 4AHUA 5M1FA 3V1OA 3SUPA 5JS1A 5KTQA 4FXDA 2P9NA 3EKUA 3JS6A 4FWNA 5T7BA 3OVNA 3VEZA 4B1WB 2P9SB 4F3OA 2I7PA 3ID6A 4QS9A 1TK0A 4BRMA 1NGIA 2NZTA 1KAXA 1QTMA 3MCAB 4O0IA 1IBKK 3MN5A 4CJPA 1QQCA 3K9JA 1S3XA 4CZKA 4FJXA 4JHDB 3AVGA 2YHYA 2HNYA 4WQ4A 3NGIA 1CXQA 4BG9A 3CXCM 1U4BA 2CH5A 2Z1JA 2KW4A 5AZIA 3VQ4A 3ZSQA 4IJAA 1L3SA 4BQLA 3OW2M 5AZJB 3PIPL 2B6AA 2X6SA 1QHAA 4DSLA 3GL1A 2A42A 4LF7K 1SL0A 5IT9O 4YOUA 4W5RA 1TL1A 2C1IA 2QM1A 4JI0K 1KC8O 3KVGA 4AM7A 1ATRA 1M90O 3PSIA 3P4IA 4BC3A 4NYFA 3ZT4A 4Z4EA 4A61A 1NKEA 3TAQA 4KHYA 3DXMB 3DWLA 2Q0UA 1RBSA 3T19A 3TAGA 2OPSA 1ITGA 2A41A 3PX4A 1ILYA 4DLGA 2O8DB 1RT2A 3BZCA 3VGLA 4DTOA 3LP1A 4B3MK 3CM6A 1SKRA 3M6GA 4BREA 4DR4K 4ILJA 4NXNK 2FXUA 1L3TA 2QK9A 4BRNA 2Z1HA 4KHNA 3IG1A 3DLHA 3K5MA 1JJ2M 3VQ6A 3AVNA 3CCRN 3I8BA 1XHZA 3WUHA 4IFYA 4F2RA 2A5XA 4ZHRA 4C8MA 4KHPK 3QESA 4UQGA 3OYAA 4H5TA 3SPYA 1VSMA 3VQ5A 5F2RA 3V9WA 3CQYA 2GELA 5HP1A 1YVNA 4BRFA 4FWLA 1NOZA 4JI6K 1QQNA 3S41A 1U2VB 4FO0A 4CK3A 1NM1A 3S5TA 1JLAA 3VQQA 4EP5A 2F7TA 3BUZB 4KTWA 4YOYA 3VQ8A 4CJ4A 3AGRA 4CFBA 3ZYYX 3V9XA 5J2PA 3OYHA 4LH4A 4JKHA 4CHZA 4DTPA 2NNWA 4OKEA 1U47A 1JKHA 4DFMA 3UKRA 1KFDA 1D4XA 4IG0A 4FW1A 3QEIA 3M8SA 3AVAA 1XQSC 5GAGP 5HL7L 1HPMA 3DMJA 3WNEA 2YNFA 3ATVA 1L3UA 4EIAA 3I8DA 4DQQA 4OX9K 2HHWA 3O4NA 5CZ2A 1MWKA 4CJ3A 2FBTA 1A5VA 4IZ9A 3UIQA 5SZTA 5M1KA 2NRTA 5AQSA 3JAMO 2XO7A 4JS4A 3FZFA 4IJNA 3L6QA 4CF9A 4BR5A 3JSMA 1WSJA 5LY3A 4PKGA 4CGDA 4JK8A 4QCLA 1RBUA 1ZBUA 1I39A 3LDLA 4UY8O 4FLXA 3KLEA 1RILA 2ASPA 4E1NA 4RW8A 1DLOA 3CMAN 1YHQN 3C7NA 5LL6Z 3PX6A 3PV8A 1VSEA 4X66K 3VF4A 1BL3A 4C1NI 3DLBA 1HQUA 3TSUA 1BHLA 3PO4A 4DTRA 3DOLA 1HQEA 1QQOA 1HLUA 3AVJA 4DU1A 4CGHA 4CJEA 1WSHA 2WOMA 3IMXA 2QI2A 1T6DA 4B1UB 3H3OB 4AF1A 4IG3A 3C0BA 3TANA 1FKOA 4U67L 4NCAA 4CJRA 3HT3A 4J2BA 2Q31A 3MN7A 4LH5A 5GAHP 1IH7A 3U3GA 2Y1IA 3AVLA 1RDAA 4BWMA 2OCEA 2YKMA 4YHHK 4NCGA 4JKEA 4FJHA 1RTIA 3PIOL 1X9SA 1RTHA 4L3QA 1B9FA 4BRDA 3TI0A 5HROA 3G25A 4B8AB 4FSVA 4H0XB 3BF3A 3OS0A 2ZGYA 3K2PA 3F73A 3RR7A 1T3VA 4DSKA 2F4VK 2ZJQL 1RT5A 3DXMA 5M1PA 3L0QA 3ZT3A 1ZC6A 1JLGA 1BA0A 2ZD1A 3VQ7A 1C0UA 3C94A 4BRAA 4KHSA 1YIJN 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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