2FF6A

Crystal structure of gelsolin domain 1:ciboulot domain 2 hybrid in complex with actin
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
370
structure length
360
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Gelsolin
publication title The Structural Basis of Actin Interaction with Multiple WH2/beta-Thymosin Motif-Containing Proteins
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein/contractile protein
total genus 122
structure length 360
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff6A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2ff6A03
4FWMA 4H5RA 2CGLA 1XUPO 2IVOA 5AQHA 3R8EA 5KPRA 2A6AA 3ULEA 3VOVA 4EHUA 3VGLA 3QFUA 1TYQA 1DKGD 2P9UB 3ZEUA 3IMXA 1OKJA 2QM1A 3HM8A 3VENA 3KZBA 3QICA 3QMLA 2P9LA 3H6EA 5AQFA 5FPEA 3LDLA 1GLJO 3QBWA 2E2PA 2YJFA 4CBXA 4B1UB 4JNEA 4PL7A 3ZX2A 3QBXA 3RSEB 4CZIA 3GDQA 4IXCA 4BC4A 4CZMA 3WEEA 3LDNA 1HX1A 4BR9A 3ZETB 1NMDA 1IG8A 4FWPA 3WQUA 3M3ZA 2P9SA 4BRGA 1NWKA 4B1YB 4H5WA 2Q31A 3AAPA 4H03B 4XH5A 4BREA 4FWLA 4M7YA 4CBUA 1QZ6A 3VETA 3JXUA 3FZMA 3FZFA 4H0OA 2GWKA 2QW9A 3H3OB 1JCGA 4BC3A 4WQ4A 1X3MA 3GBTA 1NGCA 2V7ZA 3VGMA 3EKUA 3EN9A 1LCUA 2Q2RA 5E84A 1Z6RA 3IFRA 1KXPA 2E2NA 3LL3A 2P9NA 2YCHA 3R6MA 5AQNA 1ESVA 3ENHA 4WQ5A 4NB4A 1RDWX 5I9EB 1ATSA 2QWQA 2HMPA 4CD1A 4JD2A 2GUPA 1MA9B 4H0YB 3M6GA 5LJVA 3ZX0A 4DB3A 5JMVA 3WXKA 4BQZA 3EKSA 5CE3A 3ULEB 4CZFA 3VESA 3L6QA 4QS8A 2FSKA 1TYQB 2Q36A 3ZEUB 3ID8A 5AQRA 1BWFO 3W3DA 1QZ5A 4FWOA 1Z05A 2VYPA 2P9LB 1YVNA 3HTVA 2E2OA 2Q0UA 4WYBA 1BDGA 2ASMA 2IVPA 4BGBA 4LC9B 4BR7A 3D2FA 2AP1A 4BRPA 1ZC6A 4FWKA 3WEEB 3FE1A 3HZ6A 4FWQA 4BVPA 4BR0A 2IVNA 3D2EA 2AA4A 1K8KA 2P9KA 1NGIA 2P9SB 3J8AA 4EFHA 2V7YA 3P4IA 5LJWA 2W40A 5ELZA 4JAXA 3O4WA 3BEXA 3EZWA 1EQYA 1NLVA 2P9PA 1MWMA 2ASOA 2HF3A 3FZKA 2IIRA 1V4TA 2QWLA 3WXJA 3SK3A 2QWPA 2OANA 4IJNA 4B1VA 2YJEA 5AQLA 4JN4A 3GOIA 1HLUA 3I8BA 3C7NA 3OHRA 1GLCG 5BRHA 4FO0A 2HOEA 1U2VA 3CIPA 3KVGA 3AAQA 1DEJA 4FWNA 4JHDA 4B9QA 2P9NB 2Q0RA 1RGIA 4A2BA 2FXUA 1HKBA 3UB5A 3LM9A 4FSVA 4XH4A 1E4FT 1GLAG 4JD2B 5JLFA 4MLEA 1NGJA 3MN9A 1RFQA 5AQMA 3HBTA 1YUWA 2E20A 2KHOA 4IO8A 4CI6A 1DGKN 5BN8A 3O1WA 4YDUC 4BRAA 4H5TA 4BRHA 5KPZA 1R59O 1NGAA 4ISEA 5AFUH 3FZLA 5BR9A 2EWSA 3G25A 3H45C 3D2FB 3VEVA 2Q1NA 4BC5A 4PKGA 1BG3A 2YHXA 2W41A 3VERA 3D2EB 4CBWA 1K8KB 2P9KB 3MCPA 1XQSC 1Y64A 1BA1A 4A2AA 1QQNA 4O5FA 2H3GX 4E1JA 3CHWA 3IUCA 2P9PB 3MMVA 4CZHA 3I33A 4H5NA 2F9TA 1NBWA 1GLBG 2QWNA 4BRNA 3DAWA 5F2RA 1YAGA 2A42A 4FWRA 1NGHA 3CETA 2ITMA 3UKRA 4CZEA 5ADXH 1GLFO 2A41A 5AQVA 3WXLA 2D0OA 3FR0A 4BVOA 5FPDA 3AARA 3KHYA 4DHYA 3C7NB 3QFPA 5AQTA 3BF1A 1J6ZA 2E8AA 1KAXA 4BRDA 4FPAA 4IWVA 4HWIA 4B1XB 1QQMA 3H1VX 3SMPA 1U2VB 3QDKA 4JHDB 4BC2A 3O80A 2A5XA 2UYTA 3A5LC 2HF4A 4B1ZA 3LM2A 2NRHA 3CJBA 1HKCA 2ZGZA 2PAVA 5EY4A 1T6DA 4BR4A 5EVZA 4CZLA 4XEIA 3LDPA 4XH1A 3A5OC 1TUUA 4FPBA 2J4RA 2DPNA 5BPLA 2FSNA 5TKYA 1S3XA 2YI1A 3AY9A 5EOYA 4BRMA 3C0BA 3CI5A 3FZHA 4A62A 3CQXA 3EL2A 4DCHA 3FFKB 1JCEA 4BRQA 1G99A 1E4GT 5AQYA 3BUZB 4PL8A 3A5MC 2E88A 4CD3A 5AQZA 2FF6A 3ATVA 2BTFA 5KPTA 4J8FA 4MLHA 5BREA 3FLCO 2YHWA 4PKHA 3FGUA 1KAZA 1JCFA 2YHYA 4BG9A 3H46O 3DXKA 5AQGA 3UKRB 4K42A 4EIAA 4Y0WA 1WOQA 1ZBSA 5E26A 3U9DA 1YXQA 1U6ZA 4H5VA 3VEWA 3VF4A 3ENOA 4KBOA 2E1ZA 3BF3A 3VF6A 5AZJA 3O6WA 3VEXA 5F1XA 2A3ZA 1MWKA 2QWRA 5LY3A 5B8HA 2FF3B 2P9IA 3EO3A 2V51B 3SLCA 4BRLA 1NGDA 4GNIA 1QQOA 5AR0A 4BQLA 3A5NC 1BU6O 4CZGA 4NO7A 4H0XB 4AM7A 3L0QA 5EX5A 4Z94A 3VPZA 2ZGYA 5AFUA 1BOTO 3A8YA 3VEZA 3W0LA 3UE5A 5FPMA 1SZ2A 4MO4A 4FOIA 4EAHD 2E1YA 2GTDA 4QS9A 4YDUA 4AM6A 1ATRA 5BPNA 2VWBA 4GY2B 5AQSA 2V52B 5JLHA 3GL1A 5AQPA 5AZIA 3VEOA 1IJJA 4I6MA 3MK6A 3S41A 4BRFA 4CJ7A 5JICA 3LDOA 1LOTB 3BP8A 2E2QA 3HI0A 5KQDA 3DXKB 3DXMA 3CJ7A 1S22A 3IDHA 5BPMA 5AQJA 2CH6A 4FOEA 4MO5A 4H0PA 4ISFA 3CJAA 2A40A 5AQWA 1T6CA 5AQOA 5AZJB 1C0FA 1HJOA 2I7PA 3MN7A 2P9IB 4BRIA 2I7NA 3R9PA 4RCHA 4A61A 1GLLO 1ZXOA 3DJCA 5EXWA 3A0IX 2FSJA 4FL9A 3VEYA 1NGGA 3WT0A 2GWJA 1MDUB 1NM1A 3JS6A 1ATNA 3TPQA 3U8XA 4QS7A 3D7EO 4WQ4C 4CZJA 1P8ZA 2QXLA 4BG8A 3ATUA 4K41A 1NGBA 2ZWHA 1X9JA 4WQ5C 1HPMA 1GLDG 1TUYA 3O08A 5AQUA 4K43A 3GE1A 3DWLA 4HTLA 1HUXA 5AQQA 5F0XA 3O1BA 1CZAN 2CGKA 5FPNA 1BO5O 5AZIB 4I6MB 1QHAA 4RTFD 4M7XA 5AQIA 3ZX3A 5AQKA 5AQXA 3U9ZA 3SJHA 3UKUA 1BUPA 4PKIA 4EHTA 3WXIA 2Q97A 2ASPA 2WUSA 3DXMB 4IJAA 1WUAA 4IZ9A 4DQ8A 1V4SA 3M1FA 2CH5A 2P9UA 2PBDA 4BR2A 2D4WA 3CERA 4BGAA 5BRFA 3CJCA 3MN6A 3VF2A 2D1KA 2FLOA 3O5BA 3RSEA 1D4XA 3F9MA 3TU5A 2F9WA 1X3NA 1NGEA 3CQYA 3ZETA 2GELA 4FWSA 1T44A 3U4LA 1HKGA 3MN5A 5BN9A 3SMSA 2CGJA 5KQ8A 2BUPA 1GLEG 3MDQA 4H0VB 3H3NO 3CJ9A 4F9OA 2ZF5O 1H1VA 4BRKA 2NZTA 4H0TB 4M63C 1SQKA 3O8MA 2QWOA 4BR5A 2GEMA 3VGKA 3CJ1A 3WQTA 1XC3A 1NGFA 4CZKA 3QB0A 4K25A 4ISGA 1C0GA 4B1WB 3HSCA 5BRDA 4RWTA 5ADXA 1SAZA 3H1QA 4O8KA 3WUHA 3B8AX 2D0PA 4BROA 3L4IA 2NLXA 2VCPA 1BA0A 4BRCA 1Q18A 1KAYA 3UKUB 3GG4A 2QWMA 3LDQA 4C23A 4L3QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SQ0A 4FWMA 4H5RA 4IDHA 2CGLA 4JKEA 1IO2A 1A5XA 2RE2A 5KPRA 4DFPA 3AVGA 1IKYA 3VGLA 1TYQA 1DKGD 2P9UB 1OKJA 3HM8A 3SBTA 4FCYA 3L2QA 3QMLA 3HOSA 5AQFA 3H6EA 3TAMA 4JI1K 5KGXA 2YJFA 3QBXA 3K0SA 4DSLA 1YHQN 4BC4A 2QK9A 3ZETB 4FWPA 3V9UA 3S3NA 3WQUA 3M3ZA 1FW6A 5SWMA 2YNFA 4BRGA 3PSIA 4FM2A 4FK0A 4RW9A 4B1YB 5JS1A 1JL1A 1ASWA 4BREA 2O8CA 4YOYA 4FWLA 4M7YA 4CBUA 1QZ6A 4JI8K 3VETA 4DU3A 3O4QA 4H0OA 4U7BA 1RNHA 4DTOA 4Y1CA 3AO1A 4BC3A 1X3MA 3OYDA 1NGCA 2ZE2A 1WSHA 2BE2A 3NGIA 3MXIA 1Z6RA 4GVEA 1KXPA 3EE8A 2P9NA 4G1QA 3R6MA 4FJJA 1ZBFA 4CIFA 5AQNA 3S3MA 3LWLA 4JK7A 3THXA 4CD1A 1KC8O 3THYB 1MA9B 3AVHA 3ZX0A 4DB3A 3WXKA 2KZZA 3EKSA 4CZFA 1LV5A 2IGIA 3VESA 4GV9A 4QS8A 1VQ5N 3RRHA 5AQRA 5HBMA 4AILC 3W3DA 4FWOA 3EE9A 2VYPA 1SL2A 3OYAA 3VMFB 4LC9B 3D2FA 1KVBA 4FM0A 1NK9A 1KLNA 4FWKA 2QXFA 2IVNA 3D2EA 1K8KA 4PY5A 2D5RA 3Q7BA 3J8AA 4KHQA 4JI2K 3CMEN 4FZYA 2V7YA 2DTUA 5ELZA 3THVA 3O4WA 3EZWA 1EQYA 2KFNA 1MWMA 1L3UA 1V4TA 3WXJA 3C6HA 3SK3A 4CJ4A 3PX4A 3TAQA 3T7ZA 4BE1A 4DLEA 1HLUA 3AO4A 4LY7A 1Q82O 2O4GA 3AVFA 5C2FA 3SUOA 2B6AA 2KLAA 2HW3A 3RR8A 4FW2A 4KTZA 4CEDA 4NCBA 4GW6A 4ID5A 4C8OA 4FSVA 2PZSA 2QEXN 5HLFA 2HNZA 1RT6A 4C8MA 5JLFA 3DLLL 2NRZA 4FJGA 3CXCM 3HBTA 1RT7A 3VQPA 3AVCA 4IO8A 3HPOA 4O5BA 2I5JA 2DFHA 4I2PA 4F2RA 2YHAA 5KPZA 5BR9A 1NGAA 4BDYA 4DFKA 1RTJA 4UQGA 4JKGA 3H45C 3DMJA 4DR2K 4E72A 1SL0A 2Q1NA 4OLBA 4NLCA 1RILA 1JLGA 3MCPA 1XQSC 2IS3A 4M41A 2HHUA 2HHXA 3CHWA 2P9PB 4CZHA 2OZSA 3I33A 4KHWA 3V81A 1IKVA 1GLBG 4E7LA 5F2RA 4R79A 4KRFA 2A42A 4CZEA 3UKRA 2RF2A 4QOZB 5CR4A 2G8HA 2EHGA 1VQON 5KI6A 1KLMA 3TAGA 4FJNA 4HWIA 4B1XB 3DOLA 3M5RA 4Q5VA 4JHDB 1L3SA 3L2WA 3I55N 3AVNA 2HF4A 4DTNA 3ID6A 5KTQA 3CJBA 4CFAA 4E7KA 4BR4A 5CY4A 5A2QO 3RTVA 4CK3A 1VQ6N 3PO4A 4FPBA 2DPNA 5BPLA 4DR5K 3KK2A 1F21A 4KHNA 4CK2A 4LF5K 3CCRN 4FXDA 3RVCA 3CI5A 1CXUA 3FZHA 4A62A 4WFAL 4FJMA 4DCHA 3NCIA 2X6SA 1G99A 5AQYA 1T05A 3A5MC 3VA3A 4Q0BA 2KZMA 4ELTA 1QSYA 3CC2N 1U45A 3ATVA 5KPTA 3SNNA 1TKDA 3MXMA 2HB5A 4OO1J 3FFIA 3U3GA 3DXKA 3HK2A 4CF9A 1DTTA 1S1TA 5AQGA 3NMUA 4DQQA 4B3TK 5T7BA 1YJ9N 3IKMA 1ZBSA 5GADP 3CD6N 3VEWA 3VF4A 1Q81O 3SYZA 1NMNA 1ASVA 2HSTA 3KD5E 1YIJN 3O6WA 5DM6L 3VEXA 5LY3A 3HL8A 3CCEN 1NKCA 1TAQA 1VQ9N 4KHSA 1RCHA 5AJ3K 3HVRA 3SPZA 3SLCA 3DLEA 2O8EB 5AR0A 5M1PA 1YVUA 5GINA 4OPJA 1FKPA 2NRWA 3R3LA 4A5AA 4AM7A 5C15A 5AFUA 3CCUN 4MDBA 2O8BA 4FJ5A 1BOTO 5C0YA 2ATQA 4B9UA 3G0ZA 3W0LA 1HNXK 5FPMA 4NXNK 1QQCA 2IAJA 1A5VA 4OPAA 3SUNA 3ENBA 4TSXA 3TTFA 4JI4K 3KIOA 2YHBA 4DR1K 3LP2A 1S1VA 3TAEA 2G8WA 1BQMA 1NOYA 5JLHA 3GL1A 4BRFA 3TTCA 3S41A 4CJFA 4JI7K 2RN2A 1RBSA 3SZ2A 4DTUA 1W7AA 4JI0K 4PA1A 1S72N 4OVLA 1ZYQA 3SI6A 4OKJA 5JVHL 4O4GA 2CH6A 1VAZA 1UA0A 4EZ6A 4MO5A 3CJAA 4DTXA 1T6CA 3J80O 3TTDA 3B6OA 3QLHA 1LAVA 1HNVA 3AVAA 4RCHA 3PLAA 3TARA 3I8DA 3DLHA 5EXWA 1XWLA 2FSJA 4WF9L 4OKKA 3NF8A 5E41A 1JLQA 3CPWM 4M3RA 1T3VA 4CHPA 3RMBA 4RW6A 1D9FA 3D7EO 4CZJA 4B3RK 3VQ4A 1XNQK 1REVA 1Z25A 1HNWK 1NGBA 1X9JA 4AQYK 1HPMA 1BISA 2OYQA 1IKWA 3O08A 1C1CA 4K43A 5AQUA 3KK1A 4IEIA 2E4LA 5AZIB 1QHAA 3ZX3A 3ULDA 1XHXA 4CE9A 3U9ZA 3DRRA 1BUPA 1CLQA 4EHTA 3HYFA 3WNHA 3DXMB 1G15A 1X1PA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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