2FF6A

Crystal structure of gelsolin domain 1:ciboulot domain 2 hybrid in complex with actin
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
370
structure length
360
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Structural Basis of Actin Interaction with Multiple WH2/beta-Thymosin Motif-Containing Proteins
pubmed doi rcsb
molecule keywords Gelsolin
molecule tags Structural protein/contractile protein
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 360
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff6A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2ff6A03
3S41A 5AQPA 1E4GT 4BR5A 2D0PA 3VEVA 4FWOA 3C7NB 3M1FA 2HMPA 4K43A 2W41A 4YDUC 5B8HA 4EFHA 3VEXA 3CJCA 4BR2A 1BU6O 3CJAA 4H5VA 3HBTA 3GOIA 1BDGA 2P9NB 3A8YA 3H46O 1V4TA 3UKUB 3B8AX 4LC9B 4BC5A 1YXQA 2FXUA 3H3OB 4H03B 3KVGA 2FLOA 5BREA 1XUPO 4CD1A 4RTFD 5EXWA 3GBTA 4QS7A 3O1BA 3DWLA 3A5MC 4CZHA 3QDKA 5LJVA 3IDHA 3VETA 3FE1A 3GL1A 1Z05A 4H0VB 4CZKA 3CIPA 3AY9A 3FFKB 3WXJA 1TUUA 4DCHA 2E1YA 3LM2A 5LY3A 4ISGA 4JD2B 2P9UA 5ELZA 1D4XA 5AQKA 1NGEA 5AQJA 3WEEA 1E4FT 4BREA 1HKBA 1NGBA 4WYBA 1GLCG 3D7EO 3D2FB 2Q2RA 2F9WA 2A42A 4BRHA 3EN9A 1TUYA 1QQOA 2FSKA 3VGMA 5JMVA 5AFUH 5BRHA 3L4IA 3FZHA 2P9LA 4ISEA 4H0XB 3AAQA 4B1YB 4CZGA 2AA4A 3CERA 3U9ZA 4F9OA 2OANA 3DXMA 1BUPA 3LDLA 2A6AA 1NMDA 2P9SA 3I33A 4BGAA 5AFUA 1ATNA 1H1VA 1GLLO 2FSNA 2P9IA 3WXIA 3ZETB 2A3ZA 4BROA 4CZMA 5E26A 4M7XA 5KPTA 4XEIA 1X3MA 2DPNA 5BRFA 4BRIA 4FWLA 4I6MB 3H45C 2E1ZA 1ZBSA 1LCUA 2GWJA 2I7PA 4FPBA 4CZFA 5JLFA 2NZTA 2ZGZA 5AQVA 4AM6A 4K41A 3JXUA 3D2EB 3U8XA 3ID8A 1HX1A 3VESA 3QBXA 3ENHA 4CBXA 4BR4A 3HI0A 4WQ5A 2IVOA 3H1QA 3H6EA 3ULEA 5BPMA 1Q18A 4FPAA 2KHOA 3ZX3A 2YI1A 2W40A 5AQSA 4NB4A 5JLHA 1OKJA 5CE3A 4A61A 2ZF5O 2BUPA 3BUZB 5AQXA 3RSEB 5AQIA 2QM1A 2P9SB 2QWMA 1SZ2A 2P9PA 4XH5A 4Y0WA 3DAWA 4BC2A 1XC3A 3DXKA 3HZ6A 1YAGA 3HTVA 4MLEA 2GEMA 3LDPA 3EZWA 3QICA 4BR0A 1ESVA 5AQOA 3M3ZA 2YJEA 1GLAG 3UKRA 1K8KB 4L3QA 4FWKA 4C23A 4GY2B 4CZJA 3BF3A 3EL2A 3FZFA 3VEWA 2D1KA 3ZEUA 1IG8A 3SLCA 1YUWA 2Q97A 3WT0A 1YVNA 4FWQA 4BC3A 4PKHA 3HM8A 3ULEB 5F0XA 2ASPA 4H5NA 2J4RA 2CH5A 4BRCA 3P4IA 2VCPA 4O8KA 1X3NA 3ENOA 5AQTA 1T44A 3VF6A 5AZIA 3WQUA 1U6ZA 4H5RA 4BQLA 1DEJA 5EX5A 3SMPA 4JHDA 3R6MA 1NWKA 2P9PB 4J8FA 5AQZA 3IMXA 2UYTA 3EKSA 2F9TA 4PL7A 1SQKA 2Q36A 4H0YB 4CJ7A 4PKGA 2YCHA 5AQFA 3TU5A 2HF3A 3W0LA 1GLBG 3U9DA 1JCFA 4DQ8A 3L0QA 5AQYA 3U4LA 2E2OA 5AQWA 5AZJA 1ZC6A 2QWNA 3O08A 3O80A 5FPNA 4B1WB 3QMLA 1NGAA 2Q1NA 4BRLA 3JS6A 1MDUB 4IJNA 4BVOA 2QWOA 1EQYA 3DJCA 5LJWA 2Q0UA 2P9KA 1MWMA 3MMVA 4BR9A 2VYPA 4BC4A 5BR9A 2IIRA 3IUCA 3O4WA 4CZEA 2I7NA 5FPDA 3CJ1A 1DGKN 4JHDB 2YHWA 2GUPA 3A5OC 2CGLA 4HTLA 1MWKA 5AQMA 1NM1A 4A62A 4CZIA 1C0GA 3GDQA 2FF3B 2E8AA 4KBOA 5JICA 1HKGA 4QS8A 2H3GX 1JCGA 5KPZA 2P9UB 4IWVA 3MN7A 3VF2A 5ADXH 5BRDA 4BRDA 4IJAA 1Y64A 4AM7A 3WEEB 1GLEG 2GWKA 5KPRA 2E88A 2VWBA 3WXLA 2ASMA 4CD3A 2V52B 2Q31A 5ADXA 4HWIA 3KHYA 3ZX2A 4PKIA 3VEZA 1WOQA 1DKGD 3SMSA 3ATUA 4M7YA 3M6GA 1Z6RA 3IFRA 4WQ4A 2V51B 5F1XA 2P9KB 3C7NA 4RWTA 4H0TB 2FSJA 1JCEA 1XQSC 2P9LB 3F9MA 5AQRA 3VERA 4A2BA 5I9EB 3DXMB 1QZ5A 3O5BA 1TYQA 3FR0A 4WQ5C 2P9IB 3CI5A 2QWPA 3VEYA 3R8EA 2PBDA 1ATRA 4H0PA 3CJ9A 3H3NO 2A40A 3FZKA 4WQ4C 3GE1A 2QWRA 2FF6A 1BA0A 3HSCA 4IXCA 3MDQA 2IVNA 1GLFO 5BPNA 3LDOA 1BO5O 4GNIA 4A2AA 4EIAA 3MN5A 1NBWA 4CZLA 4BG9A 1NGGA 4K25A 2D4WA 4DB3A 2E2PA 1SAZA 4DHYA 1KXPA 4MO5A 5EOYA 2QWQA 4IZ9A 1R59O 4PL8A 4RCHA 3WXKA 2CGJA 1QQNA 3ZX0A 1X9JA 1RFQA 2YHXA 1NLVA 4XH4A 4JD2A 2NRHA 1HKCA 1NGJA 2Q0RA 3LM9A 2WUSA 3FZMA 4BRFA 2GTDA 3O1WA 4FWMA 1BG3A 5AR0A 3KZBA 3BEXA 1BWFO 2GELA 3CJBA 1TYQB 1HUXA 3D2FA 3UB5A 1CZAN 3O6WA 4FO0A 5BN9A 1RGIA 1QHAA 3DXKB 1ATSA 2HOEA 2QWLA 2PAVA 4O5FA 3H1VX 2E2NA 1LOTB 2D0OA 3UKRB 3AARA 3CETA 4JNEA 4BQZA 2HF4A 1QZ6A 3VOVA 1NGFA 1HPMA 3ZETA 3ATVA 5TKYA 3ZEUB 4BRQA 4B1XB 3R9PA 2E20A 4JN4A 2EWSA 4EHUA 4B1ZA 3VENA 3A5NC 4K42A 4B1VA 3MCPA 1KAZA 4I6MA 3AAPA 3MK6A 4H5WA 4FWSA 4FWRA 4JAXA 4B9QA 4BVPA 2A5XA 1G99A 5AQHA 5AQGA 3TPQA 3UE5A 4BGBA 1RDWX 1WUAA 2V7YA 4H0OA 3SK3A 1U2VA 3D2EA 4FL9A 5AZIB 3SJHA 3CQXA 4BRKA 1QQMA 2A41A 4EAHD 1BOTO 1V4SA 3EKUA 1HLUA 3QB0A 3CQYA 2ITMA 2YHYA 2ZWHA 4BG8A 2ZGYA 2IVPA 3EO3A 2NLXA 5EY4A 5BPLA 2ASOA 5FPMA 1KAYA 5AQNA 4BRNA 5BN8A 3C0BA 3QFPA 1S22A 3L6QA 5KQDA 3BP8A 4EHTA 1ZXOA 2YJFA 3I8BA 5AQLA 4FWPA 1C0FA 3RSEA 4NO7A 2CGKA 3CJ7A 4CBWA 3VEOA 5AZJB 3FGUA 3VGKA 1HJOA 3VF4A 4FSVA 5KQ8A 2V7ZA 1J6ZA 4H5TA 1GLJO 1P8ZA 3FLCO 4B1UB 1IJJA 3G25A 1NGCA 3OHRA 1S3XA 3BF1A 1K8KA 3LDQA 5FPEA 1NGDA 4XH1A 1T6DA 1U2VB 1MA9B 5AQUA 5EVZA 5F2RA 4FWNA 3J8AA 4Z94A 1T6CA 2P9NA 5AQQA 3MN9A 3UKUA 3VGLA 4BRPA 2QXLA 4ISFA 5E84A 4CBUA 3W3DA 4IO8A 2QW9A 3A5LC 3MN6A 4E1JA 3WQTA 3LDNA 1KAXA 3CHWA 4BRMA 3WUHA 4FOIA 2E2QA 3QBWA 4FOEA 3O8MA 4QS9A 3GG4A 1BA1A 4YDUA 3VPZA 4BR7A 1NGHA 1GLDG 3A0IX 2AP1A 3LL3A 3QFUA 4M63C 4MLHA 4MO4A 4CI6A 1NGIA 4BRAA 2BTFA 2CH6A 3FZLA 4BRGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3S41A 2D0PA 3HPGA 1KVBA 5C10A 5B8HA 5HL7L 4IBNA 3LWLA 4CHZA 4BR2A 1HQEA 3GOIA 1BDGA 3LWMA 3M8QA 1YXQA 2FXUA 3DLBA 3SUNA 1EWRA 3AVKA 4RTFD 4E7HA 4QS7A 3SJJA 3O1BA 2UXDK 1VSJA 1YTUA 3QDKA 3L2UA 2UUBK 3L8BA 2XY5A 3N4QA 4FW1A 3GL1A 4CHQA 1VQ4N 2OTJN 3AY9A 3HJFA 1N6QA 2E1YA 1NK0A 4JD2B 2P9UA 1D4XA 3KLFA 3AA5X 4X62K 4PWDA 1NGEA 1E4FT 1HKBA 3PO4A 4IG0A 4WYBA 1Q9YA 3D7EO 3CMAN 3SAGA 2F9WA 2A42A 4BRHA 4M3WA 4Z4GA 1NJYA 3QIPA 3QEWA 3OYDA 2FSKA 4JK8A 4DQSA 5AFUH 4RW8A 1Q86O 4ISEA 4H0XB 2HBJA 4DQPA 4F3OA 2KLAA 2NNWA 2Z1GA 1NMDA 4BGAA 1LW2A 1Q7YO 3WXIA 2A3ZA 4BROA 1HMVA 4XEIA 3I0SA 5BRFA 3J7ZO 2E1ZA 3K58A 1RBSA 1ZBUA 2I7PA 2QKKA 4N76A 2B6AA 4FPBA 5JLFA 2PYJA 4XJXA 5AQVA 1HNWK 3EE8A 4K41A 1Q8IA 4LFCK 4GW6A 3ID8A 4BWJA 3RMCA 1ZBFA 1L5UA 3QBXA 3ENHA 1KTQA 4O4GA 4CW7B 2Z1JA 3JSMA 4B9UA 4M3ZA 2IVOA 3E01A 3H1QA 3ULEA 4A5AA 5BPMA 4FPAA 1IO2A 2KHOA 2YI1A 2W40A 2WTUA 2OPSA 2HNYA 4FJ5A 2BUPA 3HPHA 4EZ9A 2YNFA 2WFBA 4FJHA 4BC2A 4CEEA 1Y97A 1YAGA 3HTVA 4W5RA 4CEDA 2OCEA 4TSXA 1S1XA 3M3ZA 1J53A 4YNQA 1K8KB 4KTQA 4L3QA 1SL2A 1QSLA 3ZSOA 3OYJA 3FZFA 2KQ2A 1Z26A 2ZQBA 2KW4A 3MXIA 3RMBA 1RBRA 4J2BA 2YNHA 4BC3A 3HM8A 3ULEB 1CXUA 2ASPA 3K5NA 3VQ4A 4FJGA 1HQUA 4PA1A 2C1GA 4CF0A 3VF6A 1WSGA 1IBKK 4KI6A 1U6ZA 3LP3A 2WOMA 4H5RA 3HK2A 4I9LA 5EX5A 3VQBA 4JHDA 3K9KA 4JKEA 3ZT1A 3HP6A 1NKCA 3VMFB 3QNOA 2HMIA 2F9TA 3QESA 1Q81O 2Q36A 4H0YB 3C6TA 4KI4A 4CJQA 2YCHA 2RN2A 5AQFA 3W0LA 1NU0A 1S1TA 1QSSA 4B9LA 3VQQA 4LY7A 3DLHA 1EO1A 2VG7A 2HHWA 4A59A 3KIOA 3QMLA 1U45A 2Q1NA 1J5EK 4AHRA 3A2FA 3JS6A 1MDUB 1EQYA 3DJCA 3NF9A 3SNNA 1MWMA 3O9UA 2DFEA 4IEIA 4BR9A 2VYPA 4BC4A 2IIRA 4CZEA 2I7NA 3F9KA 3A5OC 4JHDB 3OYLA 4Z4FA 2WONA 3L2QA 4CJTA 3EY1A 4FZYA 1RT6A 3OJUA 3G0ZA 2EX3A 1EXQA 1JXBA 5KPZA 4C8KA 2UXBK 3TSQA 3MN7A 3VF2A 4DF4A 4PY5A 4AM7A 4AQYK 3AVIA 3QETA 3LP2A 5ADXA 1JLEA 2AJQA 2C1IA 3CC7N 4DKWA 4Y1DA 3OYEA 4M7YA 3NH2A 3TAQA 3KK3A 3C6AA 2F4VK 4E89A 3VQ6A 4KHYA 3K5MA 2P9IB 3VEYA 2QWPA 3HRGA 1RBUA 3OBYA 4YOYA 1KFDA 3H3NO 2X78A 5C15A 3FZKA 4CEFA 3GE1A 3LALA 3VN5A 3NDKA 4RG8A 3S9HA 2IVNA 4B9VA 3ZSZA 3HL8A 4CZLA 5A2QO 3CM5A 2D4WA 1X9SA 4DHYA 2E2PA 3Q7BA 4IZ9A 3BY5A 2VG5A 4NCBA 4CJWA 1QQNA 1VQPN 1ZBLA 3DYAA 1QVGM 3K9JA 4W5NA 1HKCA 1WSEA 4B8CA 2GTDA 4DG1A 1B9DA 3CJBA 4HVJA 2O8DA 4B8AB 1HUXA 1NK4A 4W5TA 2FBVA 5FRMA 1JLFA 4O0JA 1RGIA 5BN9A 3DXKB 5CZ1A 4KREA 1KLNA 3PUFA 2HOEA 1U4BA 2HHTA 3OJSA 4DR6K 4BACA 3HP9A 4O5FA 3S3OA 5M1NA 3J7YP 4BE0A 3ITHA 4BDYA 1P90A 3VOVA 1BQMA 3ZETA 4DV6K 3SQ0A 3VQEA 2EWSA 4EHUA 3QERA 3L3UA 5JS2A 3MK6A 1J9AA 4LH4A 4J2DA 4JAXA 4H4OA 3TPQA 1RDWX 2V7YA 3E66A 1U2VA 4C8LA 3CQXA 3CYGA 2O8BB 1V4SA 4OO1J 3EKUA 3CQ8A 4IEEA 2YHYA 4BG8A 2WBNA 4JKGB 3EO3A 1C1AA 5BPLA 4JI3K 5HLFA 3VQAA 3C0BA 4WFAL 3L6QA 5KQDA 3EEQA 4IOAL 5AQLA 1DTQA 3PLAA 2CGKA 3CJ7A 3OYAA 4DR7K 2DTUA 3FGUA 3VGKA 5KQ8A 2V7ZA 4R79A 5GIPA 3HVRA 4QAGA 3D0PA 3HO1A 1SKWA 3J80O 2HBMA 1IJJA 3M5RA 4FLWA 3NH0A 4LSNA 1S3XA 3THVA 5FPEA 4OX9K 1KVAA 1WBBA 1T6DA 1U2VB 5EVZA 4JI5K 2X74A 3O3HA 4Z94A 1D9DA 2P9NA 3U3YA 5AQQA 1XMOK 3MN9A 3UKUA 3VGLA 2HW3A 3DRPA 3W3DA 3PV8A 1ASWA 3WQTA 1VSHA 4BRMA 3WUHA 2YHAA 1QE1A 3V1QA 1TKDA 2PY5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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