2FF6A

Crystal structure of gelsolin domain 1:ciboulot domain 2 hybrid in complex with actin
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
370
structure length
360
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Gelsolin
publication title The Structural Basis of Actin Interaction with Multiple WH2/beta-Thymosin Motif-Containing Proteins
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein/contractile protein
total genus 122
structure length 360
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff6A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2ff6A03
2ZWHA 2NZTA 3FLCO 1S3XA 2GEMA 3AY9A 3VF6A 3VEZA 3UKUB 3GBTA 3LDOA 4ISFA 4IJAA 1MWKA 4BVPA 5FPDA 3FR0A 3F9MA 2E8AA 3CJ9A 5E26A 2CGLA 1V4TA 4M63C 5AQGA 1R59O 5JMVA 5AZIA 3W3DA 4BRHA 2PBDA 3LDLA 4FPAA 4BR4A 1QQMA 3FZMA 4CZMA 4EIAA 4KBOA 3KVGA 1ESVA 3VGMA 2YHWA 5JICA 2HMPA 1X3NA 2FSKA 1NWKA 4WQ4A 3CETA 4H0OA 5FPMA 4EAHD 2E20A 2A41A 4WQ4C 3UE5A 1SQKA 4NB4A 5AZIB 5AQMA 5AZJA 1GLFO 1NMDA 3JXUA 2FLOA 4BQZA 3LDNA 3M6GA 4IO8A 2YJEA 2F9TA 1HUXA 5EX5A 3ZEUA 4H03B 4JNEA 1NGEA 5JLFA 4H5RA 2D0PA 3FZFA 4B1UB 3DXKA 1T6CA 1XUPO 3QBWA 4LC9B 3VENA 4JD2A 5KQDA 5AFUA 4FWOA 4BGAA 4AM7A 3O4WA 4PKGA 3CJAA 1NM1A 3EKSA 2CGJA 3D2EA 4FPBA 1BDGA 1JCEA 4H0YB 2D0OA 4CBXA 5EY4A 5AQHA 5AQXA 3C7NA 1BA0A 4BR2A 4ISEA 1GLDG 3EZWA 3GL1A 3U8XA 3JS6A 1HKCA 2ZGZA 3VERA 3ZEUB 2HF4A 5KPTA 1TYQA 1K8KA 3DXKB 3LDPA 4JHDA 4FWMA 1YAGA 1XQSC 4MO4A 3BF3A 3C0BA 3D2EB 1NGHA 1ATNA 2FXUA 3FZLA 3MDQA 1EQYA 1CZAN 4BVOA 1Z05A 4QS8A 5AQLA 2VWBA 4K43A 2P9UA 2QWOA 4NO7A 3UB5A 3C7NB 5AQPA 4O5FA 1G99A 3A5LC 3DWLA 4BGBA 4FOIA 2GELA 3ULEA 3CJBA 4WYBA 3H3OB 1TUUA 1TYQB 3VESA 3MN9A 2P9KA 3L4IA 3SMPA 1Z6RA 1K8KB 4JHDB 3O6WA 1GLJO 1DGKN 4J8FA 1C0FA 1HX1A 1HKGA 3FGUA 3MN7A 1Q18A 3VEVA 4I6MA 2Q2RA 4QS7A 4F9OA 4A2BA 4BRGA 3O1BA 3O8MA 4PKHA 2P9UB 5E84A 4BR0A 5TKYA 4DB3A 1J6ZA 1LOTB 5EXWA 3U9DA 5BRFA 2P9SA 3CJCA 3ULEB 4PL7A 3WT0A 1DKGD 1X3MA 2P9KB 4FL9A 4CZGA 2QM1A 4BRQA 5LJWA 4BROA 3A0IX 2HOEA 3VF4A 1E4FT 3FZHA 4I6MB 1E4GT 5F1XA 3CIPA 2P9PA 5CE3A 2E2NA 4XH4A 1NGAA 4DCHA 5BN9A 3O08A 1ATSA 2KHOA 2BTFA 4B1VA 2Q0UA 1YXQA 3A5NC 4IJNA 1GLAG 2I7PA 1GLCG 1V4SA 2P9SB 3GOIA 2FF3B 1NGBA 2QWQA 5BPLA 4EHUA 2ASMA 4RCHA 3HSCA 2BUPA 1BA1A 2Q36A 2AA4A 5BREA 4BRIA 2P9NA 3EO3A 2Q31A 3WXJA 2NRHA 2P9PB 3SLCA 4DQ8A 4K41A 4CI6A 2W40A 3P4IA 1QHAA 4BRPA 1KAYA 3EN9A 4CD1A 2CH5A 3H1QA 1HJOA 2ASOA 1QQNA 1C0GA 3MCPA 1KXPA 4XEIA 5AQOA 4BR5A 3HM8A 2I7NA 2E2PA 5AQJA 2NLXA 2P9NB 1IJJA 4FOEA 2GWJA 2Q0RA 1P8ZA 5BR9A 1LCUA 5AR0A 5JLHA 3BUZB 4H5TA 4H5NA 2WUSA 4BC2A 5F0XA 1IG8A 2UYTA 4GNIA 5AZJB 5AQFA 2QWRA 2IVPA 3J8AA 4A2AA 5AQRA 3EL2A 4BRAA 3U9ZA 3G25A 5BN8A 2QWMA 3CJ7A 3VGLA 2DPNA 3WQUA 3CHWA 3H46O 3L6QA 2E2QA 3O1WA 1WOQA 5BPNA 4WQ5A 1HKBA 4B1ZA 4L3QA 1NGDA 4JD2B 3CJ1A 3ZX0A 4WQ5C 2QW9A 4BRCA 1U2VA 2QWLA 5BRHA 4DHYA 3ZX2A 2YJFA 3AAQA 3S41A 2V51B 1QZ5A 1KAZA 2D4WA 3BEXA 4BR9A 3ATUA 3B8AX 4PKIA 5LJVA 1ATRA 3I33A 1HPMA 1HLUA 4BRMA 2FF6A 2EWSA 4IXCA 4CJ7A 3ATVA 3HZ6A 3ZETA 5AQNA 4BRFA 2PAVA 3UKRA 4BRNA 4FWKA 3MN6A 2W41A 1BO5O 1TUYA 1U2VB 4YDUC 3CERA 4BC5A 4RWTA 3QDKA 4H5VA 3MN5A 4FSVA 5FPNA 4A61A 4CZLA 3AARA 5AQVA 2GWKA 5EOYA 4RTFD 1DEJA 3KZBA 4FWQA 1RDWX 4JAXA 3WXKA 4FWNA 3SMSA 4CBUA 1KAXA 1MA9B 3ZETB 5EVZA 3UKRB 1SZ2A 1BU6O 2IVNA 3LM9A 4H0PA 3R9PA 1QQOA 3FZKA 4JN4A 3L0QA 1YVNA 5ADXA 4AM6A 5KPRA 4GY2B 3WUHA 3SK3A 3CQXA 2A40A 2CGKA 3A8YA 5AQZA 3EKUA 5KQ8A 4BRLA 3R8EA 4M7YA 3AAPA 2E88A 3SJHA 4IWVA 4EFHA 3DJCA 4CBWA 5ADXH 3VEWA 4O8KA 4PL8A 2V7ZA 4MLEA 1NLVA 3A5OC 1ZBSA 2A6AA 5AQUA 1MWMA 4BG9A 1NGCA 3IFRA 4CZKA 4ISGA 3VEXA 4BG8A 4CZJA 4FO0A 2ZGYA 4CD3A 2CH6A 2VYPA 2FSJA 2GTDA 3VOVA 5AQSA 2E1ZA 3BP8A 4BR7A 3IMXA 2E2OA 2IIRA 3GG4A 3W0LA 3D7EO 3VPZA 2GUPA 1GLEG 3LM2A 4CZFA 2YCHA 1SAZA 1JCFA 5B8HA 3ENHA 1ZC6A 1X9JA 2ITMA 5BRDA 3WQTA 2A5XA 1JCGA 3VETA 2Q1NA 3LL3A 3GDQA 3ZX3A 4BREA 3FE1A 3WEEA 3HBTA 4B1XB 3QB0A 1BUPA 2YHXA 3D2FA 4K42A 3VEYA 5LY3A 3QFPA 4H5WA 4XH5A 3HI0A 1BG3A 3U4LA 3H45C 1NGJA 1OKJA 4CZHA 3CI5A 1U6ZA 4BC4A 3RSEA 4H0XB 4BC3A 3LDQA 3GE1A 4XH1A 2E1YA 2ASPA 4BRKA 5AQWA 3M1FA 3IUCA 3QMLA 4M7XA 3WXLA 4H0VB 3BF1A 4FWLA 3QBXA 1BOTO 4HWIA 2F9WA 4FWPA 3WEEB 4Y0WA 4B1WB 2Q97A 5ELZA 3D2FB 5FPEA 1WUAA 5AFUH 2QXLA 3DXMA 3KHYA 5AQQA 4BRDA 3H1VX 2VCPA 1MDUB 3R6MA 1GLLO 2YHYA 1NGGA 3O80A 3RSEB 2IVOA 1RGIA 2H3GX 3ENOA 2FSNA 2QWNA 3TU5A 3VEOA 3HTVA 2P9LA 4B1YB 2A3ZA 1S22A 3A5MC 4YDUA 1NGFA 4CZEA 4E1JA 4EHTA 4K25A 3TPQA 3M3ZA 5AQKA 1XC3A 3CQYA 5I9EB 1YUWA 3DAWA 1ZXOA 4IZ9A 2P9IA 3O5BA 3VF2A 3VGKA 4FWSA 2HF3A 2QWPA 4CZIA 4Z94A 2ZF5O 2AP1A 3DXMB 3MMVA 2J4RA 1H1VA 3FFKB 4QS9A 5KPZA 1T44A 5BPMA 5AQTA 4HTLA 3H3NO 3ID8A 2P9LB 2V7YA 4FWRA 1BWFO 4B9QA 4C23A 2D1KA 4H0TB 2OANA 3H6EA 3IDHA 1NGIA 3UKUA 5F2RA 3MK6A 2P9IB 2YI1A 4BQLA 3QICA 1D4XA 3OHRA 1RFQA 3I8BA 4A62A 4MO5A 1GLBG 2A42A 5AQYA 1T6DA 2V52B 3QFUA 1Y64A 1NBWA 1QZ6A 3WXIA 5AQIA 4MLHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3FLCO 1GOAA 4KO0A 4CF9A 4DSJA 4FM2A 3SPYA 3WNGA 2DFEA 2OA8A 4A5BA 4DSIA 4JKBA 3QLHA 2W6LA 3I0RA 1VQ6N 3E66A 5FPDA 3FR0A 3F9MA 5HROA 2CGLA 4OKKA 5AQGA 1R59O 4B3SK 4LFCK 4JK8A 4ICLA 3LDSA 3EY1A 3W3DA 4BRHA 4JKEA 4M42A 2PBDA 2OTLN 4DQPA 1WSGA 4FPAA 4BR4A 5J2NA 1QQMA 3FZMA 3OJSA 3VQ9A 2NRRA 3IG1A 4EIAA 4JI3K 3KVGA 3OTOK 3VGMA 3KKRA 2YHWA 1LAWA 2FSKA 1NWKA 4CEQA 2OPSA 3LP1A 3CETA 3CC4N 4CJ5A 4WQ4C 3UE5A 4NB4A 1BQNA 1YITN 4E7IA 1NMDA 4IO8A 3SZ2A 4HCCA 4K8ZA 5EX5A 5JLFA 4H5RA 3ZT2A 1VHXA 3L3VA 4AHTA 3DXKA 1XUPO 4LC9B 1TVRA 3O4WA 4DR4K 4V19S 3EKSA 4QAGA 4B3RK 1FJGK 3D2EA 1HYVA 2BH1A 1WNSA 1WAFA 4CF1A 1WBDA 4FM0A 3RRGA 4HUEA 1GLDG 3V1RA 2Z1GA 1QSLA 1HKCA 2O8FA 1JL2A 2HF4A 3KKSA 4DV4K 4CJTA 3SCXA 1W9HA 3LDPA 4F3OA 3K0SA 4LF4K 4RW7A 3KK3A 5KGXA 1LWCA 5SZTA 2VGMA 3C0BA 3FZLA 3RTVA 1X1PA 4M3WA 2QTDA 3SQ0A 3QINA 1FW6A 1RT1A 4K43A 1YF5L 3K5OA 3QIOA 3C7NB 5AQPA 5J2MA 3LAMA 4BGBA 1G99A 3KWIA 3EZ5A 4DG1A 3U6FA 1LWEA 1N5YA 2P9KA 2FBXA 4FLYA 3O6WA 1M1KO 4DV3K 4EP4A 4GV9A 4F9OA 4A2BA 3U3YA 3D45A 1IKWA 3MXIA 2OTJN 3VA0A 4B3MK 4OLAA 1UA0A 2P9UB 3NH2A 5TKYA 1IBLK 4IOXA 5EXWA 1J53A 1TV6A 3NF6A 4PL7A 5GAEP 2HNZA 2W6KA 3J81O 3KD5E 2P1JA 2QM1A 3A0IX 3VF4A 3V81A 4CFAA 1E4FT 3FZHA 1U4BA 1KLMA 2ATQA 4JI1K 4DSFA 1HNIA 3D6RA 4CEFA 5CE3A 1XI1A 2QEXN 1A5VA 1NGAA 2NRTA 1ATSA 2D0AA 2KHOA 2E6MA 4J2BA 4B1VA 1CXUA 1NK6A 2HHIA 4IBNA 3OBWA 2GV9A 1WBBA 4RCHA 3HSCA 2HHVA 3K9KA 2OZSA 2Q36A 2AA4A 4E7HA 4BRIA 3QERA 2P9NA 3EO3A 1T7PA 4KHNA 2IC3A 2B4JA 3CM6A 2Q31A 1NK5A 1RT6A 4CJQA 3K58A 3ULDA 1NJXA 2P9PB 4DQ8A 3VQ7A 4K41A 3KLEA 2XY7A 2W40A 3UIQA 4BRPA 1VQKN 3J7YP 4E19A 3MCPA 5AQOA 2PYJA 3O9QA 4JKCA 1WSJA 1IBKK 2HNYA 3SJJA 1WSIA 3MAQA 1P8ZA 3MX2A 5AR0A 1TKTA 2YKNA 2NNWA 5JLHA 1QE1A 1WAJA 2B5JA 2O8DB 1QHTA 2WUSA 4DQQA 2KLAA 3AVJA 4CJ4A 5CZ2A 5FLXO 3JYTA 1HYZA 5AZJB 4PQUA 4KTQA 4BRAA 4I9QA 2W00A 3RR7A 1U47A 4FW2A 1RDDA 2DPNA 3NVMA 3CHWA 3LWMA 2D5RA 2A1RA 5BPNA 1HJRA 2WC9A 4JD2B 1RBUA 1XMQK 1K8AO 1S1XA 1Q8IA 2O8BA 4DHYA 3VQBA 4QCLA 4N76A 2FBVA 3S41A 2JWKA 4BR9A 2WBNA 4PKIA 1ATRA 3I33A 3OA9A 3J80O 4OJRA 2EWSA 1RBSA 4IXCA 2WFBA 4ID1A 4O0IA 4M3YA 3LP0A 3ZETA 4AHUA 3VQDA 3EYZA 4JKAA 2KFZA 3AVKA 3T7ZA 5GAHP 3K2PA 3MN5A 3NGYA 4IO9L 1MU2A 4DR7K 1VQON 1S6QA 3DM2A 3TSUA 1BIZA 4CJUA 2ZJQL 4FLZA 4FWQA 3OYGA 3G10A 4UQGA 3QO9A 2YHAA 3FFIA 4C1NI 4CJRA 4E72A 5C2DA 4Z4HA 4H0PA 2E4LA 3DRSA 1REVA 1QQOA 5M1NA 4DU1A 4JK9A 1SL2A 3SAFA 1YVNA 4E7KA 5ADXA 3T3FA 4AM6A 5KPRA 4DTMA 3CQXA 1BGXT 3A8YA 5AQZA 1XNRK 4ILHA 1QSSA 4LH4A 3TAFA 2YNGA 3AAPA 3SJHA 1B9FA 4B9TA 3VEWA 1LW2A 4O8KA 4BE0A 4FW1A 3KK7A 3PX6A 1ZYQA 3AVGA 4MLEA 4BY9C 3AVFA 4JI6K 1LW0A 3A5OC 4F2RA 2KKZA 3THXA 5HBMA 3BGRA 3A2FA 3DYAA 1NGCA 3IFRA 4CZKA 4G1QA 4CZJA 4IOCL 5LMNK 4KTWA 4DQRA 1K9MO 4OPAA 3THWB 4BR7A 4CJ3A 3AA4A 3CCVN 2QKBA 4BWJA 3L2VA 1GLEG 4CZFA 3OYEA 5I42A 3ZT4A 4BE2A 4KHYA 1X9JA 3OYIA 2RE2A 1L3SA 4NXMK 1TGOA 2A5XA 4DU3A 1ZBLA 1HQEA 3NDKA 4DV2K 3THYA 3LALA 3FE1A 3MECA 3T69A 1BQMA 3SAGA 3OYHA 4OVLA 5LY3A 2Z1JA 1I3AA 2W42A 2UUAK 4CZHA 1N32K 5C24A 3GE1A 3O9RA 2E1YA 1WN7A 5AQWA 1S5JA 4CK1A 2F8SA 4CHNA 3QMLA 4FJHA 3WXLA 4O55A 4X62K 1BOTO 4Y0WA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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