2FF6A

Crystal structure of gelsolin domain 1:ciboulot domain 2 hybrid in complex with actin
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
370
structure length
360
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein/contractile protein
molecule keywords Gelsolin
publication title The Structural Basis of Actin Interaction with Multiple WH2/beta-Thymosin Motif-Containing Proteins
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 360
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff6A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2ff6A03
1JCFA 4GNIA 3TU5A 3CI5A 3UKRB 3FGUA 3VGLA 4MLHA 4JD2A 3MMVA 1MWMA 3GDQA 4FWQA 2DPNA 1LCUA 4JD2B 3SMPA 2GWKA 3QMLA 4BQLA 4DQ8A 3AY9A 5BPNA 3BUZB 2YHXA 1YXQA 4BRPA 3DJCA 3OHRA 4MLEA 1U6ZA 2HMPA 3VF2A 1HJOA 3MN5A 2E88A 2QWOA 3W0LA 3WEEA 4FWNA 5F1XA 4RCHA 3WEEB 3ZX2A 4QS8A 2A3ZA 4BRLA 5F0XA 5EVZA 3CQYA 1IG8A 3ATUA 3QBWA 2YJFA 3CIPA 1X3NA 3U9ZA 2NZTA 1BO5O 1IJJA 5E26A 5BRFA 2GWJA 2KHOA 5LJVA 1GLFO 1RGIA 2GEMA 3LM2A 4FPAA 2F9TA 5AR0A 2FXUA 4M63C 5LY3A 5ELZA 3MDQA 1NGIA 2WUSA 3HTVA 5AQLA 1NGGA 2QM1A 3VGKA 3WXJA 3FZMA 4BR0A 3L6QA 3SLCA 1T44A 2QXLA 3VENA 5AZIA 3SJHA 2P9KA 5AQHA 2YJEA 1GLLO 3BP8A 1ZXOA 2A5XA 5AQIA 3FZFA 5AZIB 5EXWA 4BGBA 2P9KB 3VEXA 2W40A 4FSVA 4AM6A 1X3MA 5JLHA 2I7PA 4O8KA 4A61A 4RWTA 2H3GX 3GOIA 1X9JA 2P9SA 4GY2B 2ITMA 4BRKA 2BUPA 3GE1A 4HWIA 2P9SB 4IJNA 2ZGYA 5AQUA 2VCPA 3M1FA 3H46O 4A2BA 4FWPA 2D1KA 4JNEA 3MN6A 3U4LA 3GG4A 3I33A 3ID8A 4FWLA 1RFQA 1GLDG 1D4XA 3UKUA 3LL3A 1XUPO 1NGDA 2IVPA 2QW9A 4JHDA 4CD3A 1J6ZA 4K41A 4BVPA 4C23A 3VPZA 3UKUB 1ATRA 3QICA 3U9DA 4JHDB 4BRNA 4PKIA 3CERA 4PKHA 4J8FA 1BU6O 3MN9A 2QWQA 4H0TB 4ISEA 5ADXA 1TYQA 3QFUA 5LJWA 1DEJA 1E4FT 1NGCA 1DGKN 4CZMA 3IMXA 2J4RA 1TYQB 3JXUA 3FR0A 3WQUA 2CGKA 4FOEA 4MO4A 3MCPA 1WOQA 5ADXH 1BWFO 3SK3A 4WQ4A 4FWSA 3FZHA 2Q2RA 2YI1A 3LDOA 3VEZA 4B1YB 4FWOA 3HI0A 2QWRA 4H5VA 4BRFA 1V4TA 1GLEG 1HX1A 1BA1A 5FPMA 4DHYA 3G25A 4K43A 4BRQA 3VESA 3VF4A 2VWBA 5AQKA 1GLCG 2UYTA 1WUAA 2A41A 4M7XA 3DAWA 4LC9B 5EY4A 3FZKA 1RDWX 4XH4A 1KAZA 4BR2A 4BRAA 2PAVA 3O08A 4B1WB 3W3DA 1HUXA 4B1VA 2IVOA 3S41A 2HF4A 2IIRA 3I8BA 1YUWA 3F9MA 5B8HA 3O8MA 3AAQA 2Q31A 3H1VX 1ATNA 3LDPA 1OKJA 3H45C 4H0XB 5KPZA 3AAPA 4BR4A 3HBTA 4CZLA 3C7NA 5AQRA 2Q1NA 2CH6A 2CH5A 3EO3A 3C7NB 4AM7A 3RSEB 3D2FA 1JCGA 2ASMA 2OANA 3D2FB 1E4GT 3M3ZA 1BUPA 3VEYA 3A8YA 1EQYA 4IZ9A 2E1ZA 2QWNA 3ZETA 2VYPA 2A40A 3P4IA 3FLCO 2FSNA 3WUHA 3O1WA 3ZX3A 4A2AA 2ASOA 3ZETB 3H1QA 4BQZA 2FF6A 2ZF5O 1CZAN 1H1VA 1SAZA 3MK6A 4PKGA 4WQ4C 4E1JA 3HZ6A 1ZC6A 5E84A 3UE5A 5AFUA 2E1YA 3R8EA 4BGAA 3TPQA 2P9UA 3VEWA 1C0GA 1MWKA 1ZBSA 2AP1A 1KXPA 2HOEA 3IFRA 2P9UB 1MDUB 4MO5A 5AQPA 3QB0A 1ATSA 2NRHA 4FWKA 5AFUH 3CHWA 5CE3A 3H3NO 2W41A 2YHYA 3L4IA 5BN8A 2Q97A 2ZGZA 3EZWA 4FO0A 1K8KB 3AARA 1HPMA 5BRDA 5TKYA 1NM1A 4K25A 1U2VA 5JLFA 2V7ZA 1HKBA 1NGBA 3CJCA 1U2VB 3WT0A 3O5BA 4NO7A 4H5NA 5EOYA 3VGMA 2FF3B 3D2EA 3ATVA 1NWKA 2GELA 3CQXA 4B9QA 3D2EB 4EAHD 1QQOA 1JCEA 4BRDA 3R6MA 4B1XB 4FPBA 5FPNA 1QZ6A 3EL2A 4H0OA 1QZ5A 3WXKA 4HTLA 4YDUA 2Q0RA 4IXCA 4QS7A 5AQTA 1ESVA 3MN7A 3M6GA 2E2NA 3ENHA 2I7NA 5AQVA 5KPRA 3KZBA 3A5MC 4BRIA 4DCHA 5AQYA 1GLAG 5AQXA 4NB4A 3CETA 3ENOA 4H5TA 4H5WA 5AQFA 3SMSA 4XEIA 4IO8A 4H03B 5AZJA 5KPTA 4BVOA 1Q18A 4K42A 4CI6A 2PBDA 5AZJB 4ISGA 4F9OA 2NLXA 3HSCA 2FSKA 2EWSA 2IVNA 3BEXA 4BRHA 4CZHA 1TUYA 3EKSA 2V52B 4BREA 3CJ1A 4BC3A 5AQQA 4B1ZA 3L0QA 3B8AX 5AQMA 3FZLA 3IDHA 1G99A 4QS9A 5KQ8A 3GL1A 2V7YA 3VF6A 1MA9B 2AA4A 1TUUA 4CBWA 2E2QA 4DB3A 2V51B 1XQSC 5AQSA 5BREA 2QWMA 1NGFA 4CZEA 2P9IA 4CZKA 3VEVA 4BR5A 4H5RA 4CBXA 3DXKA 2ASPA 3WXIA 1GLBG 1HKGA 2P9IB 4CZIA 4WQ5A 3DXKB 1C0FA 2QWLA 4FL9A 4H0PA 1KAXA 1BG3A 3VERA 3R9PA 3RSEA 3HM8A 2F9WA 2D4WA 1QHAA 3O6WA 4ISFA 4O5FA 5EX5A 1T6CA 4CBUA 1BA0A 1BOTO 4Y0WA 4M7YA 3A5OC 3H3OB 4YDUC 4H0VB 4FOIA 3FE1A 4WYBA 1QQMA 3U8XA 3EKUA 4EIAA 3KVGA 3BF3A 4BC4A 3D7EO 2E8AA 5F2RA 3O1BA 4BRCA 4CD1A 3ZEUA 4FWMA 3C0BA 1V4SA 1Z6RA 4RTFD 4EHTA 1NGHA 3DWLA 3ZEUB 3A5LC 4JN4A 4PL8A 5I9EB 5BPLA 1NMDA 1T6DA 4BROA 2ZWHA 3LDQA 3QBXA 3VEOA 2CGJA 2E2PA 2A42A 3EN9A 1NGJA 3KHYA 4XH1A 3J8AA 5AQNA 3VOVA 2BTFA 2P9NA 5FPDA 4EHUA 4Z94A 4EFHA 3CJBA 4A62A 1K8KA 4IWVA 4BG8A 3O4WA 2Q36A 4IJAA 2P9NB 3QFPA 1BDGA 4BC5A 1R59O 1P8ZA 2QWPA 5BN9A 4BC2A 1YVNA 3ZX0A 4B1UB 4BRGA 5BRHA 1KAYA 5AQZA 4CZGA 1S3XA 3LM9A 1NGEA 3H6EA 3VETA 5FPEA 4I6MA 1SZ2A 1XC3A 2D0PA 3CJ9A 3O80A 4XH5A 2YCHA 3LDNA 3QDKA 4I6MB 4WQ5C 4BG9A 3WXLA 4PL7A 5JMVA 2E2OA 1GLJO 1SQKA 2CGLA 1Z05A 4CZFA 2P9PA 1LOTB 2YHWA 4H0YB 5BPMA 4KBOA 4BRMA 5AQOA 5AQGA 2P9LA 3IUCA 2P9PB 3A5NC 3LDLA 3WQTA 1S22A 3JS6A 5JICA 4L3QA 2Q0UA 2P9LB 3CJ7A 2FLOA 3ULEA 2E20A 1NGAA 4JAXA 3DXMA 3BF1A 4CJ7A 2HF3A 3ULEB 2FSJA 1QQNA 1DKGD 3DXMB 2D0OA 4BR9A 5AQJA 2A6AA 4CZJA 2GTDA 2GUPA 1HLUA 1YAGA 1NBWA 3CJAA 4FWRA 4BR7A 5KQDA 5AQWA 1HKCA 3UB5A 3UKRA 1NLVA 3GBTA 5BR9A 3A0IX 3FFKB 1Y64A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JCFA 3UKRB 3CI5A 4CJSA 3P38A 4AHVA 3DLKA 1MWMA 1HQEA 3F5TA 3AVCA 4DQ8A 2GWKA 3OBYA 3BUZB 3DJCA 1S6PA 4DR4K 1EX4A 4BY9C 3VF2A 1ZBIA 3W0LA 4B3OA 1U47A 3ZT1A 2F8TA 4DR6K 4U67L 2Z1GA 5F1XA 3ZX2A 5EVZA 1OH7A 3CQYA 5M1OA 3VQ5A 1U4BA 4JK9A 1BI4B 3ATUA 4CHOA 4HCBA 2YJFA 3CIPA 1RT2A 5CR4A 3QO9A 3NAEA 1KVBA 2QXFA 5E26A 5BRFA 1HYVA 3HRGA 4DV5K 3SQ1A 5I42A 3VMFB 2F9TA 3CG7A 1X9SA 2FXUA 4M63C 1VQNN 1OVQA 3MECA 3MDQA 1NK7A 3KK2A 2NRTA 1QE1A 2WUSA 3HTVA 1NGGA 1XI1A 3AO4A 3C6AA 4FM0A 3TAEA 2KZMA 4CVNE 2A5XA 1ZXOA 3C95A 3D45A 5FRNA 2P51A 4I9QA 3AVGA 4J2BA 1HNWK 4CJPA 4AM6A 3EE8A 3JAMO 3NVMA 4AF1A 2P9SA 4BRKA 2XO7A 4KHUA 3GE1A 5GINA 2HSTA 4O55A 4FWPA 3LAMA 1X1PA 2BDPA 4E0DA 3GG4A 2O8BB 3M8QA 5SZTA 1RFQA 3SI6A 3NGYA 4CD3A 1WBDA 2IVPA 3CD6N 5M1QA 4IOCL 3OTOK 5GADP 3VPZA 3UKUB 4DQRA 3ZSWA 3HK2A 3DI6A 4BRNA 2E6LA 3BZKA 4O4GA 4PKIA 4ZHRA 3OS0A 3KKSA 3O9UA 4ISEA 2EX3A 4DF8A 4DV4K 4CEOA 1OH6A 4FJ8A 2O8EA 1DGKN 4CZMA 1TYQB 3DYAA 2HNDA 4JS5A 4CF2A 2ZJRL 1WOQA 3J7AP 5ADXH 1VSJA 5LL6Z 3SK3A 3RMDA 2QA4N 4M45A 2RKIA 2FBYA 1A5VA 4FWSA 1JL1A 1RBTA 4CW7B 4CJWA 4OGCA 4CE9A 2DY4A 1DLOA 4IG0A 4BRFA 4UY8O 5HP1A 1C0MA 1GLEG 1HX1A 1BA1A 4CJVA 4JS4A 3G25A 3CCSN 3OS1A 3AVHA 2XY7A 2VWBA 3DM2A 2YHBA 4JK7A 3PX4A 2O8FB 1WUAA 3TAMA 2HHIA 4LC9B 3NMUA 4XH4A 4ID5A 1KAZA 4HUEA 3O08A 4B1WB 4GKJK 3W3DA 3V4IA 3G6EN 1JLFA 1HUXA 2IVOA 3NF7A 2HF4A 2JGUA 4KAZA 4DR3K 2YNFA 1YUWA 1HYZA 2Q31A 2D0AA 3CXCM 2KQ2A 3AAPA 4OKEA 1NOZA 4YOTA 4CZLA 3C7NA 4LF5K 4AM7A 5E41A 2OYQA 1E4GT 2Q3SA 5SWMA 3VEYA 3A8YA 3RVCA 3ZETA 3P4IA 3PO4A 2FSNA 2ASOA 4E7LA 4KPYA 1T05A 4I2QA 1NK0A 1CZAN 4TSXA 3HZ6A 1VQ4N 1ZC6A 3F9KA 5E84A 1ZBHA 3HVTA 2E1YA 4FJLA 4UQGA 2E4LA 2P9UA 1XHXA 4WCEL 4ID1A 2HHXA 3QB0A 4FWKA 2X6NA 5CE3A 4B9SA 4GVMA 5BN8A 3EZWA 1K8KB 3AARA 1W97L 4O0JA 2V7ZA 3C6UA 3OYAA 4H5NA 4DR5K 3CPWM 2G8FA 1NWKA 2Y1JA 2GELA 2ETJA 3CQXA 4B9QA 3D2EB 1JCEA 4DS5A 3R6MA 4O5BA 4FPBA 5FPNA 2XRIA 1IBMK 3WXKA 3O3FA 1WSJA 4HTLA 1VSIA 4YDUA 4CHPA 3OYLA 1TK0A 1ESVA 3HOTA 3SUOA 4B8CA 3RMAA 4OLAA 3HXMA 3KK7A 2P5OA 3AA5X 3LP2A 5C25A 1C1AA 4N76A 2PYLA 4H03B 4N47A 2QEXN 5AZJA 1VSEA 1Q8IA 3OYHA 4PY5A 2R7YA 4CI6A 2PBDA 4MFBA 1Q86O 2EWSA 3O9SA 4AHCA 3S3NA 4JKFA 3LWLA 4YOVA 3IS9A 2Z1JA 3EKSA 2FBXA 3CJ1A 3TWHA 4Z4FA 1B92A 1XWLA 1VQ5N 3KK3A 1B9FA 4CERA 4GMJB 4LSNA 3IDHA 4Z4GA 5KQ8A 1WB9A 3GL1A 4KH5A 1MA9B 4Q5VA 1TUUA 4CBWA 1S6QA 3LWMA 4KV8A 2QWMA 3E1YA 5KRSA 3PO5A 1REVA 4CZKA 3AO1A 3VEVA 2YX6A 3KJVA 4M3TA 5KGWA 3ZSRA 1HKGA 4DTRA 5JENA 4PUOA 3DXKB 1C0FA 3MXMA 3I0RA 1JLBA 2O8DB 3RSEA 4JRQA 1IBKK 1NK6A 5EX5A 4HTUA 4DSJA 2YNHA 1TKZA 3A5OC 4KB1A 4FJNA 3FE1A 4CGIA 1LW2A 1NOYA 4HUGA 4RG8A 4HVJA 4K8XA 1NKBA 3KWIA 1NMNA 3EKUA 3BF3A 4BC4A 3PLAA 5F2RA 3O1BA 3ZEUA 3IG1A 1V4SA 4EHTA 4DSFA 4E1MA 5I9EB 2NRWA 1YITN 4BROA 3VQ8A 3LDQA 3QBXA 5M1FA 1RCHA 2HHVA 3QINA 5C10A 3KK1A 1HRHA 1N5YA 4DSLA 4EHUA 4IWVA 4KFBA 3O4WA 4IJAA 2P9NB 3ZT0A 4B9LA 1BDGA 4KREA 3THWB 4FJJA 3VQ6A 4BC2A 3KIOA 4I9LA 3HL8A 4CJ4A 4B1UB 3CYMA 5AQZA 3L2RA 1N32K 4B3MK 4JI0K 3CYGA 3LM9A 1TKXA 4KI4A 1RBVA 3VN5A 3VQ7A 2ZM6K 2JWKA 3O80A 1HYSA 4ICLA 2YCHA 1EWQA 4I6MB 3K2PA 2OPPA 5JMVA 2E2OA 2KTQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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