2BUPA

T13g mutant of the atpase fragment of bovine hsc70
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGGTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The hydroxyl of threonine 13 of the bovine 70-kDa heat shock cognate protein is essential for transducing the ATP-induced conformational change.
pubmed doi rcsb
molecule tags Chaperone
source organism Bos taurus
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
total genus 122
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-09-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2bupA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2bupA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2bupA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2bupA04
1X3MA 3VEWA 4E1JA 3QBWA 4IZ9A 4B1VA 1G99A 4WQ5C 3WXKA 3CQYA 4XEIA 1RDWX 2FSJA 4L3QA 4WQ5A 5EOYA 4CZIA 3HZ6A 2I7PA 3WXJA 2VCPA 3MN6A 2ZWHA 2PAVA 2V51B 3C7NB 4MLHA 3CIPA 1NM1A 1D4XA 3OHRA 3BP8A 2F9TA 4CJ7A 1IG8A 5BRDA 1YVNA 2D4WA 3MCPA 4CZJA 5AZJA 1LCUA 3MN9A 4PKHA 3O1BA 3RSEA 1HUXA 1NBWA 3JS6A 5AQQA 3U9DA 1EQYA 3M3ZA 2P9LB 3BF3A 3ZX0A 4B1ZA 2P9SB 5LY3A 3MDQA 3O80A 4FPAA 3WUHA 1ATSA 4XH4A 4B1WB 2ZGYA 1HPMA 4B1UB 3FZHA 4FWNA 3EN9A 5AQKA 1JCEA 5AQNA 1E4GT 1BG3A 3KHYA 4CI6A 3QFPA 1BWFO 3ZEUB 3L4IA 4BR9A 3F9MA 2UYTA 5AQPA 3EZWA 3HM8A 1GLEG 4M7YA 3C7NA 4DQ8A 4PL8A 3LM2A 4GY2B 4BC4A 2EWSA 3IMXA 2DPNA 2QW9A 3O8MA 4JN4A 3LM9A 1Q18A 4JHDB 3U4LA 1QZ6A 5JLHA 5EX5A 1QQMA 4GNIA 2P9LA 1NGDA 3GBTA 2P9SA 2V7ZA 4FWMA 3FZLA 3H3OB 1Z05A 4QS8A 2FSNA 3DXKB 4JAXA 2HOEA 5ADXH 3W3DA 2P9PB 3ZEUA 5JLFA 1C0FA 5BRHA 2J4RA 3GL1A 5BRFA 3CQXA 3VETA 1YUWA 1GLAG 4O8KA 1MA9B 5BR9A 1TUYA 1ZC6A 4BR4A 5F1XA 1JCGA 3SJHA 2IVOA 3DWLA 3HTVA 4FWQA 4A61A 2W40A 4BRQA 1JCFA 4DB3A 4JHDA 5AQLA 5AQSA 3VEZA 3O08A 3CJAA 3LL3A 2OANA 4YDUC 3LDQA 3JXUA 4YDUA 4CZMA 5AQGA 4IWVA 4O5FA 2HMPA 2E1ZA 3A5OC 3H1VX 2YI1A 3DXKA 1WUAA 5ELZA 4RWTA 2P9PA 3U9ZA 4BREA 3O5BA 1T6DA 1SZ2A 1QZ5A 2GEMA 3VERA 1KXPA 1P8ZA 4NB4A 1QHAA 3WEEB 4H5TA 2GWKA 2A6AA 3GOIA 3SK3A 3SMSA 1T6CA 4BRKA 3QMLA 3UE5A 2P9UB 4EAHD 4AM7A 2HF4A 3G25A 4FWRA 2NLXA 3D7EO 1YXQA 4FSVA 1ESVA 3QFUA 2QM1A 4BRIA 4BGAA 5E84A 1BUPA 1YAGA 3J8AA 2CGJA 3VF2A 3P4IA 1GLLO 2GWJA 5AQYA 5I9EB 1K8KB 3FGUA 4EIAA 4M63C 1MWKA 4H5VA 2Q97A 4B1YB 4CD3A 4FWOA 4RTFD 4ISEA 4PKGA 1HKBA 5EY4A 3WEEA 3CJBA 3VGMA 3EL2A 2I7NA 4M7XA 2PBDA 4H5NA 3U8XA 4BR2A 2YJFA 1IJJA 2P9UA 3SLCA 3CETA 3TU5A 5F0XA 4IO8A 1QQOA 2A41A 1SAZA 4FO0A 2FF6A 4K42A 4CBWA 4BC2A 2Q31A 3A5NC 3DAWA 2E2NA 5B8HA 4H0OA 4K41A 2QXLA 1MDUB 1WOQA 5AFUA 4FWKA 2GELA 1DKGD 3MN7A 1K8KA 3HBTA 4BQLA 3AY9A 2GUPA 1ZXOA 5FPMA 4MO4A 3FZFA 3ZX3A 2BUPA 3LDOA 3O4WA 1XQSC 2YJEA 3ATVA 3A8YA 1NGAA 3L0QA 5AQJA 4CBUA 1Y64A 4WQ4C 4CZGA 3MN5A 3WQUA 3VENA 3A5LC 3D2EB 5FPEA 2W41A 2YHXA 2QWMA 3H3NO 3IUCA 3ENHA 4BRPA 2V52B 2V7YA 5TKYA 4AM6A 2P9IB 4PKIA 5JICA 3QDKA 2E8AA 2QWLA 1NGIA 3GG4A 3SMPA 2BTFA 3L6QA 4QS7A 4BRFA 2E2PA 3VEVA 1OKJA 3WXLA 1BA0A 4BVPA 3AARA 3LDNA 1R59O 4H03B 2E1YA 4BC3A 5AQXA 4BR5A 1T44A 1KAYA 2YHYA 4BRAA 2P9NB 1U2VB 4BQZA 5JMVA 4F9OA 4WYBA 1H1VA 3BUZB 2CH5A 3CJ9A 3AAPA 2YCHA 1TYQB 3GDQA 5AQHA 3D2EA 5AQMA 4HWIA 1J6ZA 1KAZA 3UKRB 2NRHA 3BF1A 4RCHA 4FL9A 3H6EA 2A40A 5KQ8A 1NGFA 5AZIB 2CGKA 2P9IA 4BG9A 1KAXA 1S22A 3DJCA 1U6ZA 2VYPA 5AQIA 3FFKB 3CI5A 2FXUA 4B1XB 3FE1A 2E20A 2AP1A 4FPBA 1GLFO 2QWOA 3ID8A 4K25A 5EXWA 3LDPA 1XC3A 3H45C 4IJAA 2P9NA 1U2VA 1GLDG 5AQUA 1HJOA 3EKUA 1NGGA 4CZHA 4JD2B 4J8FA 1CZAN 2ASMA 2ASPA 3H46O 4A62A 4QS9A 2AA4A 3UKRA 1NGBA 2Q0RA 4XH1A 1X9JA 5AZIA 3WQTA 1BOTO 3VESA 4NO7A 3ZETB 4H0YB 3IFRA 3HSCA 3H1QA 4BR7A 4H0VB 1MWMA 5FPNA 4B9QA 4BGBA 4JNEA 2QWNA 3WT0A 2QWPA 5AQZA 3VEYA 4DCHA 2H3GX 4IXCA 4FOIA 3FZMA 3CJCA 4BC5A 4BRLA 5LJVA 1V4TA 5AQTA 2ITMA 1BU6O 4BRNA 4FOEA 2GTDA 3O1WA 4HTLA 3FZKA 1BO5O 4JD2A 4MO5A 3CJ7A 5KPZA 2IVNA 5FPDA 1GLJO 4EFHA 4Y0WA 2Q36A 5AQWA 1ZBSA 1S3XA 2FLOA 4KBOA 2A42A 3VGKA 5EVZA 1X3NA 3TPQA 3ZETA 2YHWA 3MMVA 5CE3A 1HKGA 4CZLA 3DXMB 2VWBA 3MK6A 3KZBA 3S41A 4H0PA 3EKSA 3I8BA 2E2OA 3UB5A 3UKUB 3R8EA 1ATRA 5AQRA 2E2QA 4ISFA 5BN8A 3M6GA 5BPLA 2HF3A 4H0TB 5AFUH 4FWLA 3ENOA 4A2BA 3W0LA 1XUPO 3C0BA 4CD1A 2D0PA 2ASOA 3AAQA 3QB0A 4WQ4A 4BR0A 5F2RA 1NGJA 3IDHA 5BPMA 1E4FT 3EO3A 3QICA 1SQKA 2A3ZA 5AQOA 1NLVA 2CGLA 4FWSA 4Z94A 3ATUA 2P9KB 4ISGA 4H5RA 3I33A 2ZF5O 3B8AX 4BRMA 4I6MB 3DXMA 3ULEB 2A5XA 3UKUA 3VF4A 4FWPA 2Q0UA 5ADXA 1V4SA 2ZGZA 3R6MA 1BA1A 4LC9B 2NZTA 4BRHA 5KPTA 2WUSA 4BVOA 2IVPA 4IJNA 2Q2RA 3A5MC 3VOVA 2KHOA 3WXIA 1DGKN 1HLUA 4DHYA 1TUUA 4CBXA 1ATNA 1NWKA 1RGIA 1RFQA 3VPZA 4A2AA 3CHWA 3FLCO 3GE1A 2FF3B 1NGHA 1C0GA 2P9KA 3R9PA 3CERA 5AQFA 1HX1A 4CZKA 4BG8A 4K43A 1DEJA 4CZFA 4CZEA 3ZX2A 1GLBG 4I6MA 1QQNA 1LOTB 3ULEA 3VEXA 4MLEA 3VGLA 5AQVA 4PL7A 2D1KA 3D2FB 4H0XB 3O6WA 2FSKA 2CH6A 1HKCA 1NGEA 4EHTA 2E88A 4XH5A 5LJWA 3FR0A 1BDGA 4H5WA 1TYQA 4C23A 3BEXA 2Q1NA 2IIRA 3HI0A 4EHUA 2QWRA 3QBXA 5AR0A 1Z6RA 3KVGA 5KQDA 2F9WA 3VEOA 1GLCG 5E26A 5BPNA 5BN9A 4BRGA 4BRDA 4BROA 3VF6A 3A0IX 3LDLA 3M1FA 1NGCA 2QWQA 5KPRA 5AZJB 4BRCA 3RSEB 2D0OA 1NMDA 5BREA 3D2FA 3CJ1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2F8TA 1X3MA 4AEIA 1RBVA 4IZ9A 4B1VA 3J7AP 1VNAA 2YNIA 1G99A 4GVEA 3WXKA 5E41A 4L3QA 1E3MA 3HZ6A 3WXJA 3AGKA 4CK3A 1TI5A 3C7NB 2V51B 3CIPA 4LY7A 4MLHA 1NM1A 4KHNA 1EP4A 4W5TA 1YVNA 2D4WA 3VA0A 4IOAL 3MCPA 4PA1A 4CZJA 3MXMA 1LCUA 1JXEA 3O1BA 3RSEA 1I6FA 1RBTA 5C12A 2HBJA 1EQYA 4Z4CA 4FLZA 1UOCA 4C8KA 4FPAA 1BQNA 4XH4A 3FZHA 1Q86O 1RT6A 5AQKA 1JCEA 1LWFA 1HNZK 1BG3A 3NVMA 3SAGA 3KHYA 2OPPA 1WSFA 3HM9A 4OX9K 3AA5X 2UYTA 4IOXA 5AQPA 3EZWA 3HM8A 4DQ8A 3M8RA 1YT3A 2KJAA 4BC4A 1T03A 4JYAK 2EWSA 3IMXA 2DPNA 1HYSA 4JS5A 4O5BA 3HVTA 3CC4N 1Q18A 2N69A 5GAHP 2HHTA 1VSEA 1C6VA 4MDAA 4FCYA 3CFRA 1S72N 5CR4A 3OYIA 3QEXA 1NGDA 3FZLA 3O3HA 4JI1K 3OVNA 4KREA 5JLFA 1C0FA 3CPWM 1U48A 4W5RA 1AYJA 1ZFUA 4FZZA 3CQXA 4ILGB 1GLAG 5C0YA 5BR9A 4A5AA 2E6LA 5F1XA 3SJHA 3HTVA 3K2PA 3DLHA 3E01A 2W40A 4W5QA 4BRQA 1O13A 4IDKA 3VEZA 4RW7A 1VQNN 4YDUC 4X66K 4DG1A 4DMNA 4MFBA 1VQ4N 4IWVA 4J2BA 5CYQA 2E1ZA 4WFAL 3C65A 4JKGB 3O3FA 3OJUA 4B9LA 2WC9A 1GPSA 1T6DA 2XY6A 4HUGA 3P1GA 1JLGA 4JI0K 3SZ2A 2D0AA 3VERA 3SPZA 1YTUA 1XMQK 3NH2A 5KRSA 3V81A 4IEEA 1YITN 4JI2K 4Z4FA 4H5TA 2GWKA 5HRNA 2F8SA 2A6AA 3DMJA 3QMLA 5CYMA 3QESA 3KHWA 4JI8K 3CC2N 1RTDA 4AM7A 2HF4A 4ILHA 4FWRA 3D7EO 3NGYA 1YXQA 3NAEA 4M3XA 3ZT2A 2O8DB 4BGAA 2KQ2A 3P4IA 3KKSA 5AQYA 3VN5A 5CZ1A 2JWLA 3DLGA 2N66A 2Q97A 3CG7A 3CM5A 1VQKN 5KI6A 4DFKA 1DJTA 2A7TA 5TKWA 3WEEA 3CJBA 3VGMA 3L2VA 5KK4A 2HMIA 3EL2A 3E66A 3KIOA 4HCBA 2O8EB 4M7XA 2PBDA 1QSYA 4CK1A 3U8XA 2HBMA 2GL1A 1U4BA 3CETA 2OTLN 2PFUA 1QQOA 2NY8X 3I0RA 2XY7A 1SAZA 4FO0A 5HRSA 4K42A 1D9FA 5CY0A 4V1DC 3PY8A 1NJWA 1RCHA 4LH5A 3AO4A 2NY9X 4BECA 2VQEK 4FWKA 2GELA 3DOKA 3DLBA 1K8KA 3ZSWA 3AY9A 2GMOA 2GUPA 2IS3A 1J53A 1ZXOA 4M45A 3FZFA 2OYQA 2BUPA 1JZBA 3DRPA 5HLFA 4WE1A 4CBUA 4E72A 5AQJA 4LF6K 2EHGA 3V9SA 4I2QA 4HHTA 1VRTA 3A5LC 4JKEA 3D2EB 2G8UA 4KYPA 1EETA 3H3NO 4YY3K 3IUCA 3KC6A 1CXQA 3WNEA 4BRPA 2V52B 2V7YA 1VQMN 4PKIA 5JICA 4KI4A 3OYBA 1SKWA 3GG4A 1LAWA 3AVNA 3SMPA 2BTFA 2GV9A 1OKJA 1XHXA 2QK9A 1S6QA 2DTUA 1X9SA 1LQIA 3SUQA 2OPRA 3NF9A 3KOWA 1I2VA 3MEGA 3EZ5A 1T44A 4UJ0A 2YHYA 3KP1A 1U2VB 2PYJA 1EXQA 4KPYA 3VQPA 3RMBA 3CJ9A 3AAPA 1VQLN 4LF5K 3G71N 3QO9A 1KAZA 1VQ8N 4B3RK 2Y1IA 4O4GA 3H6EA 2A40A 3SCXA 3T1AA 5AZIB 1K73O 4BG9A 1KAXA 1S22A 4KH6A 2A1RA 1RT5A 5AQIA 4EP5A 3QEPA 4AHUA 3LAKA 2FXUA 1L5UA 2ZJQL 2HHIA 4ELVA 3LALA 1GLFO 1JLBA 3P5JA 4IEIA 1LW2A 1W97L 4YOWA 4JS4A 2EX3A 3LWLA 2N2QA 2JDQD 4FW2A 4K8XA 3L4QA 1NGGA 4IOCL 1WSEA 2OZSA 2HW3A 2ASMA 3V1QA 3ZSVA 5DM6L 1JJ2M 3UKRA 3D0PA 1NGBA 1IKYA 3EY1A 5LL6Z 4ILJA 1X9JA 3WQTA 5K14A 3VQEA 1CN2A 1O1WA 2VG5A 3MXIA 3H1QA 4BR7A 4HUFA 3MEEA 1MWMA 4AHTA 4AF1A 4BGBA 4JNEA 1BCGA 4FLTA 4DR2K 3SI6A 1V4TA 1JZAA 4BRNA 4N76A 4NLBA 1VSLA 1QS4A 4RG8A 1BO5O 3E9LA 3CJ7A 5KPZA 3PO5A 1YHQN 3PIPL 4EZ9A 3U3GA 4LF9K 4KBOA 2A42A 1S6PA 4JKBA 2UU9K 2MZ0A 4M41A 3TPQA 3B6PA 3VQQA 3ZETA 3THXB 3CYMA 2AJQA 5GADP 3MMVA 1J5OA 3AV9A 4E7LA 3F5TA 3KZBA 3S41A 3I55N 4H0PA 3EKSA 3I8BA 3KD5E 1BCMA 5D3GA 5AQRA 2E2QA 1VHXA 5BPLA 4H0TB 5AFUH 2KBHA 4CJQA 1SL1A 4BR0A 2UUAK 3T69A 3QICA 5AQOA 1NLVA 3NGZA 2ATBA 4FWSA 2P9KB 4KHWA 5AJ3K 4CJVA 1Q81O 3F73A 4IKFA 3KOXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2F8T A;  1X3M A;  4AEI A;  1RBV A;  4IZ9 A;  4B1V A;  3J7A P;  1VNA A;  2YNI A;  1G99 A;  4GVE A;  3WXK A;  5E41 A;  4L3Q A;  1E3M A;  3HZ6 A;  3WXJ A;  3AGK A;  4CK3 A;  1TI5 A;  3C7N B;  2V51 B;  3CIP A;  4LY7 A;  4MLH A;  1NM1 A;  4KHN A;  1EP4 A;  4W5T A;  1YVN A;  2D4W A;  3VA0 A;  4IOA L;  3MCP A;  4PA1 A;  4CZJ A;  3MXM A;  1LCU A;  1JXE A;  3O1B A;  3RSE A;  1I6F A;  1RBT A;  5C12 A;  2HBJ A;  1EQY A;  4Z4C A;  4FLZ A;  1UOC A;  4C8K A;  4FPA A;  1BQN A;  4XH4 A;  3FZH A;  1Q86 O;  1RT6 A;  5AQK A;  1JCE A;  1LWF A;  1HNZ K;  1BG3 A;  3NVM A;  3SAG A;  3KHY A;  2OPP A;  1WSF A;  3HM9 A;  4OX9 K;  3AA5 X;  2UYT A;  4IOX A;  5AQP A;  3EZW A;  3HM8 A;  4DQ8 A;  3M8R A;  1YT3 A;  2KJA A;  4BC4 A;  1T03 A;  4JYA K;  2EWS A;  3IMX A;  2DPN A;  1HYS A;  4JS5 A;  4O5B A;  3HVT A;  3CC4 N;  1Q18 A;  2N69 A;  5GAH P;  2HHT A;  1VSE A;  1C6V A;  4MDA A;  4FCY A;  3CFR A;  1S72 N;  5CR4 A;  3OYI A;  3QEX A;  1NGD A;  3FZL A;  3O3H A;  4JI1 K;  3OVN A;  4KRE A;  5JLF A;  1C0F A;  3CPW M;  1U48 A; 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