The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
34
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sequence length |
122
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structure length |
122
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Chain Sequence |
TPASRYITDMTIEELSRDWFMLMPKQKVEGPLCIRIDQAIMDKNIMLKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSFPGHTIEDVKNAIGVLIGGLEYNDNTVRVSKTLQRFAWGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Non-structural protein 1
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| publication title |
X-ray structures of NS1 effector domain mutants.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Influenza a virus
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| molecule tags |
Viral protein
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| total genus |
34
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| structure length |
122
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| sequence length |
122
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-12-01 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3KWG A; 3M5R A; 4OPH A; 3OA9 A; 2KKZ A; 2RHK A; 3O9U A; 3P31 A; 4OPA A; 3P39 A; 3RVC A; 2GX9 A; 3F5T A; 3L4Q A; 3EE9 A; 3O9S A; 3O9T A; 3D6R A; 3P38 A; 3KWI A; 3EE8 A; 3O9R A; 3O9Q A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2P9P B; 4X62 K; 4O8K A; 4C23 A; 4BWM A; 3A5L C; 3FZF A; 3S3N A; 3DLH A; 3CCQ N; 2FC0 A; 4DTJ A; 2YJE A; 1M90 O; 4CFC A; 1WLJ A; 1QTM A; 4YOX A; 5AQR A; 4KHN A; 4FLW A; 1ILY A; 1UOC A; 5IWA K; 1ZBH A; 3KTQ A; 1VQP N; 1LWE A; 4JRQ A; 4IZ9 A; 5FRN A; 1JLQ A; 2A40 A; 3DLK A; 4RCH A; 3SUP A; 4ZTJ A; 3P38 A; 1S6P A; 1LW2 A; 3L2V A; 2AJQ A; 1TKZ A; 3JAM O; 2PY5 A; 1KSP A; 3SQ4 A; 3V1O A; 4G9Z A; 2Q0R A; 2IVN A; 4ISE A; 1C0M A; 4GMJ B; 1UA0 A; 3N4Q A; 2P9I B; 4DTS A; 3WXM B; 3KLI A; 1VSK A; 5AZJ A; 5I3U A; 3OS0 A; 1NLV A; 3LZJ A; 1G15 A; 1X3N A; 3IFR A; 3O3F A; 2V51 B; 4WQ5 A; 3VPZ A; 3NH0 A; 1RDB A; 3QEW A; 4FL9 A; 5CYQ A; 1RGI A; 5DMR A; 4E7K A; 1HYS A; 5C10 A; 3AV9 A; 4RG8 A; 3F9M A; 4A5A A; 1XUP O; 3QO9 A; 2UYT A; 1Z05 A; 2W41 A; 4CER A; 3J81 O; 3EEQ A; 1QHA A; 5HLF A; 2P5G A; 4HTU A; 3EKU A; 4CFA A; 4NCB A; 4BVO A; 1WSG A; 3DMJ A; 3AVN A; 5E84 A; 5H1S Q; 3OYB A; 2D5R A; 1IBK K; 1RTI A; 3WNE A; 5JVH L; 5KRT A; 3VA0 A; 4DQQ A; 2QWR A; 4FOE A; 3VQE A; 4JI7 K; 3NVM A; 3GL1 A; 5AZJ B; 4BE2 A; 2ZM6 K; 3PIO L; 2R7Y A; 1X9J A; 1WSF A; 2P9S B; 5KI6 A; 3FFK B; 2O8B A; 1XHX A; 1BOT O; 1S1T A; 5AFU H; 5AQF A; 1TAU A; 2GEM A; 4H5V A; 4CEA A; 1OH5 A; 2VQF K; 3VGM A; 4KI6 A; 1BDG A; 3MDQ A; 4ILJ A; 1HQU A; 2VYP A; 5CYM A; 3AVH A; 2BDP A; 4RW4 A; 3CC4 N; 1HNZ K; 3C7N A; 3QEI A; 5EU7 A; 1NGI A; 2Z1G A; 4CJQ A; 3QES A; 2O8C A; 1Y64 A; 3IUC A; 4M3U A; 3D2F A; 1Q86 O; 4EHT A; 1D9D A; 4UQG A; 1YT3 A; 4H0Y B; 2PYL A; 4ZTF A; 5AQP A; 4WFA L; 5HL7 L; 4IFY A; 1Z26 A; 5AQW A; 2ZF5 O; 4BRD A; 4B3O A; 1KFS A; 3VA3 A; 4LSL A; 2IDO A; 3LWM A; 3CJC A; 3NAE A; 3K57 A; 2P51 A; 1VSJ A; 3MCP A; 4LFA K; 4GVM A; 3M8P A; 1FKO A; 1ATN A; 2WBN A; 5M1O A; 3VTI A; 4R79 A; 5AQZ A; 1W9H A; 4HUE A; 4NYF A; 1X9M A; 4ID1 A; 1S72 N; 2HHV A; 2P5O A; 4QS7 A; 5AQX A; 3VF6 A; 5FDL A; 1KC8 O; 2JLE A; 5M1N A; 1DLO A; 3AVG A; 4JK9 A; 1QSS A; 4GKJ K; 2OPP A; 3SV3 A; 3RRG A; 1S1V A; 3UB5 A; 4KHW A; 3DXK A; 3EY1 A; 3LL3 A; 3H46 O; 1OVQ A; 2F96 A; 1WAF A; 4CZM A; 2QEX N; 3FZK A; 2XHB A; 4KTW A; 4OGC A; 4EP5 A; 3THX A; 3PO4 A; 4NXN K; 1NGH A; 2PZS A; 2DY4 A; 1YIT N; 3AGK A; 3OYM A; 2QKK A; 1J9A A; 2X6S A; 4X64 K; 5B8H A; 1BUP A; 4FJ8 A; 4K42 A; 3OBY A; 5M1K A; 1KAZ A; 1BQM A; 5AQK A; 2IVP A; 4BRQ A; 4DU3 A; 1D4X A; 4GW6 A; 2P9L A; 4DV7 K; 3VEW A; 1X1P A; 3AO1 A; 1NK7 A; 4G1Q A; 3PUF A; 4A5B A; 1RT3 A; 2GWJ A; 3O4Q A; 4C8N A; 4YOY A; 5J2M A; 3BEX A; 2O4I A; 3UE5 A; 1U04 A; 4HUF A; 3CER A; 1NOY A; 2CH5 A; 1J54 A; 4GNI A; 1BIZ A; 4FW2 A; 2IAJ A; 1ASU A; 4Y1D A; 3OYE A; 3VET A; 2EHG A; 3O4W A; 3DXK B; 3ZX3 A; 5I9E B; 4ILG B; 4BR4 A; 3V9Z A; 3SUN A; 4GKK K; 5C25 A; 4CF1 A; 1ASW A; 4O44 A; 3THX B; 4F3T A; 5CE3 A; 3EZ5 A; 1DTQ A; 1S1X A; 4DTP A; 1KVA A; 1WN7 A; 3R6M A; 1U6Z A; 4CBU A; 2IVO A; 3VF4 A; 1BHL A; 1A5V A; 4KHQ A; 4FVM A; 4KV8 A; 1T6C A; 3KK7 A; 4CK3 A; 1IG8 A; 2PAV A; 3RMA A; 4FJG A; 3TPQ A; 5EOY A; 4QAG A; 4FWK A; 3CI5 A; 4FK4 A; 1VSI A; 3CFO A; 2YI1 A; 3L4I A; 1N36 K; 3HP6 A; 3NF9 A; 4O5B A; 3VMF B; 5AQT A; 3T1Y K; 1QQC A; 4M7Y A; 2PYJ A; 4M3R A; 5A2Q O; 2XY8 A; 4MLH A; 4J2D A; 2QM1 A; 5AFU A; 2HHT A; 2YJF A; 3AVA A; 5BRH A; 2I5J A; 1HRH A; 1JL2 A; 5KPZ A; 1KLN A; 4KPY A; 3C6U A; 5DM7 L; 1R0A A; 3VQ4 A; 3SAG A; 1FK9 A; 2E2O A; 5HP1 A; 4Z4C A; 4I9Q A; 4FLU A; 3FZH A; 4FYD A; 3ZEU A; 1KAX A; 3RMB A; 3G25 A; 2F8S A; 4O0I A; 2NRV A; 2HHS A; 3VQ6 A; 1N6Q A; 2ITM A; 4C1N K; 3K5O A; 2KFZ A; 1BQN A; 3HM9 A; 1K9M O; 3ZSO A; 1TYQ A; 4NO7 A; 3DRR A; 5BN9 A; 3ZCM A; 1NJX A; 4M3T A; 4A59 A; 1KVC A; 5HRS A; 2YHW A; 3TAE A; 3UKR A; 1WAJ A; 4C1N I; 2JWK A; 5EVZ A; 2WC9 A; 1B9D A; 1UAX A; 3QER A; 4Q0B A; 4DMN A; 1S5J A; 4OPK A; 1YIJ N; 1N33 K; 3ASM A; 5C0Y A; 1JLF A; 3GE1 A; 3TAF A; 1LV5 A; 1T44 A; 3F2K A; 4H5T A; 4EFH A; 1UWB A; 4CD3 A; 3IRX A; 3ZEU B; 5GAD P; 3NGZ A; 2W6K A; 1VSE A; 2Q1N A; 1U45 A; 1FXX A; 4JHD A; 1VSF A; 3G71 N; 4IBN A; 4QS9 A; 1ESV A; 1SS6 A; 4FM1 A; 2DFE A; 2KHO A; 2XY5 A; 3AA2 A; 2YNI A; 4H8K A; 3I56 N; 1CZ9 A; 1IV0 A; 2OYQ A; 1JLE A; 1EX4 A; 3WQT A; 1DT9 A; 4K8Z A; 3PSF A; 3I8D A; 3S3O A; 3CMA N; 4IXC A; 4H5R A; 4CJW A; 2YNH A; 5C15 A; 3THW A; 5LMU K; 4M3W A; 1Z6R A; 2BAN A; 1L3T A; 1YTA A; 1OVY A; 3D2E A; 3OYG A; 4HHT A; 3OW2 M; 3NMU A; 4BC5 A; 3R8E A; 2A42 A; 3RTV A; 3LPT A; 2OCE A; 3J7Y P; 3L2Q A; 3OA9 A; 2NRX A; 3ZYY X; 2DTU A; 1QS4 A; 3LM9 A; 4QOZ B; 1YVN A; 4FWQ A; 1VK0 A; 4LF7 K; 3J8A A; 1VAZ A; 2O8D A; 2KZZ A; 3KIO A; 4CF2 A; 4C8O A; 5BRD A; 4CGJ A; 3CQX A; 3ZT3 A; 2F9T A; 4H0P A; 3K5L A; 4FOI A; 4JHD B; 3RR7 A; 2HOE A; 3AAR A; 4BR7 A; 4J2E A; 3SBT A; 3AVB A; 4N41 A; 3VEZ A; 2F7T A; 4F9O A; 4KBO A; 1QZ5 A; 1GLF O; 4IFV A; 3OS2 A; 1CZA N; 2OTL N; 4M45 A; 2HBJ A; 3AA5 X; 4B08 A; 2HVI A; 4H0V B; 3QLH A; 4FLT A; 1TAQ A; 4I2Q A; 3D2E B; 1ZBI A; 3ZSZ A; 5JVG L; 4CJU A; 3E9O A; 4IOX A; 3SJJ A; 3HZ6 A; 2NLX A; 1IKY A; 4IG3 A; 3HK2 A; 5CHI A; 2OZM A; 1SKR A; 2Q2R A; 2B4J A; 1IBM K; 4CGH A; 4K43 A; 4LC9 B; 1RTD A; 4IJA A; 3OYJ A; 4B8C A; 3IG1 A; 1VQ6 N; 2O8F A; 1X9W A; 3OY9 A; 4DTU A; 4JI8 K; 4NLB A; 4OPJ A; 4Z4H A; 5AQI A; 3SAF A; 5AQS A; 1BCM A; 3OYI A; 3TTD A; 4A62 A; 3CJ9 A; 1NK8 A; 4BC2 A; 1NG9 A; 3GG4 A; 4EHU A; 4XH5 A; 2P9N A; 3PO5 A; 2A1R A; 4O5F A; 1S1U A; 1HPM A; 4FJJ A; 4LF6 K; 2YNG A; 4CBX A; 3MEG A; 4DTR A; 4JV5 K; 5JIC A; 3TAN A; 5SZT A; 4KAZ A; 1MU2 A; 5HRN A; 4B3S K; 1WSJ A; 4J2B A; 1SAZ A; 5ADX H; 2FSK A; 5CZ2 A; 3M8S A; 1FKP A; 5M1F A; 1NGA A; 3OVN A; 4KRF A; 4E1N A; 1LCU A; 3T69 A; 3SUO A; 2VCP A; 5TKY A; 4DF4 A; 3CCU N; 4AQY K; 3V6D A; 2NRH A; 5J2P A; 4ELV A; 4DQ8 A; 5BR9 A; 4JN4 A; 1FJG K; 1W7A A; 4MDB A; 1XQS C; 4FM0 A; 4E7I A; 1E4F T; 2ZGZ A; 5E26 A; 2RHK A; 4ZHR A; 2QWO A; 3P39 A; 4DV5 K; 1U47 A; 3RVC A; 2V7Y A; 1JLC A; 1YVU A; 3NBP A; 3MED A; 3MXJ A; 3OYD A; 2E8A A; 3CC7 N; 1W0H A; 4LF5 K; 4O4G A; 4PHT X; 3O9R A; 3HVR A; 1ZC6 A; 4CED A; 1K73 O; 2Q31 A; 3VEN A; 4XIU A; 2AP1 A; 3B6O A; 1OH6 A; 1EET A; 3CJ7 A; 4DQP A; 5M1Q A; 3H45 C; 4CHO A; 4DKW A; 1BI4 B; 4A2A A; 2D0A A; 4JKH A; 3THY B; 3L6Q A; 4M3X A; 4Z4E A; 1YJ9 N; 1YJN N; 4CI6 A; 1ITG A; 4FJX A; 1CLQ A; 5E41 A; 1N32 K; 1N34 K; 2JGU A; 3VQC A; 2F9W A; 3CCS N; 2Q97 A; 4BRG A; 3ULE A; 5KRS A; 1TUY A; 1EQY A; 4YY3 K; 3DRS A; 4BR5 A; 3GDQ A; 1T7P A; 1RBR A; 1U2V B; 4O55 A; 1DKG D; 4OX9 K; 4JKA A; 2D4W A; 4YOW A; 3KJV A; 4H03 B; 2HBM A; 1Y97 A; 1I3A A; 2E6L A; 1T6D A; 4V19 S; 4DR7 K; 1LAW A; 1WB9 A; 1UA1 A; 4KTZ A; 2DFH A; 3U3G A; 3M1F A; 3AO4 A; 3O9T A; 4FLX A; 2GWK A; 4H4M A; 3ZET A; 5IT9 O; 4CEZ A; 2BUP A; 2NNW A; 3UKU B; 2QXF A; 2E88 A; 2G8H A; 3QFP A; 1MWM A; 5FPM A; 4K0K K; 2D0B A; 3CIP A; 3SBG A; 3S9H A; 5I42 A; 2G8W A; 4JI1 K; 1XC3 A; 3TAB A; 1GLC G; 1M1K O; 1EXQ A; 4F2R A; 5BRE A; 4WQ4 C; 4DTN A; 3ZSR A; 1RT6 A; 1NM1 A; 3AVC A; 1TGO A; 4ISF A; 3HI0 A; 3VGK A; 2F8T A; 2ZJP L; 4B1W B; 4DQS A; 2ZJQ L; 5M1P A; 4KH5 A; 1ZBF A; 4JKD A; 4FPA A; 5HBM A; 3KWG A; 2Z1I A; 3ITH A; 2HMI A; 1OH7 A; 3ZSQ A; 3MXI A; 2NRT A; 4JKE A; 3O5B A; 3KK1 A; 4CEF A; 4OKE A; 4FZZ A; 3S41 A; 4CJL A; 2AA4 A; 3HPH A; 3NH1 A; 2EX3 A; 4WQ4 A; 5AQG A; 1T03 A; 4IOC L; 1L3V A; 4FXD A; 3ZET B; 3LAN A; 3WEE A; 3CYM A; 3JS6 A; 3TAG A; 3P1G A; 2WOM A; 3TTF A; 3IDH A; 1S1W A; 4BE0 A; 4DWI A; 2ZGY A; 2YCH A; 1NJY A; 4RTF D; 4DTO A; 4K41 A; 3SV4 A; 3OTO K; 1KCF A; 3D45 A; 4EAH D; 3M6G A; 2HHW A; 3NGY A; 5ADX A; 3HP9 A; 3DLL L; 2VWJ A; 4DSI A; 4AF1 A; 4DR4 K; 3QB0 A; 3U4L A; 2VWB A; 3LP2 A; 3WUH A; 4U67 L; 3NFA A; 3JYT A; 1NK6 A; 1C1A A; 4DTM A; 1YI2 N; 4LY7 A; 5T7B A; 1J6Z A; 4FSV A; 1RDD A; 3DOL A; 4CJV A; 1KFD A; 2O4G A; 4DR1 K; 4CZL A; 4CGG A; 2Y1J A; 1HNV A; 2P9U A; 3MWT A; 2QWP A; 3TR8 A; 4QCL A; 4MO4 A; 5KGW A; 2P9K A; 2D0C A; 4PL8 A; 1HNI A; 5GAH P; 4FJN A; 4O0J A; 2E2N A; 3WEE B; 2CGL A; 5GAG P; 4IKF A; 1WOQ A; 4IJN A; 1LWC A; 1NU0 A; 4JKG A; 5C12 A; 3HO1 A; 4CFD A; 4DFJ A; 3CET A; 5FRO A; 1YTU A; 1IH7 A; 3H6E A; 1YUW A; 3B6P A; 1CXU A; 2GTD A; 1WNS A; 3V9U A; 4FZX C; 1JCF A; 3VER A; 2OTJ N; 2O8B B; 3C65 A; 5JLH A; 3CCM N; 3FR0 A; 4KHY A; 2ETJ A; 3A5M C; 3U8X A; 4EZ9 A; 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1O13 A; 1C1B A; 3WXK A; 3NF7 A; 5LJV A; 2P1J A; 2P9L B; 3MEE A; 3MEC A; 3EL2 A; 1XC9 A; 4KI4 A; 4YNQ A; 2GEL A; 1T3V A; 5JS2 A; 4KO0 A; 4CF9 A; 3O3H A; 1GLE G; 1G99 A; 1W97 L; 3DXM B; 3LP0 A; 3ZSX A; 4BGB A; 1RIL A; 3P5J A; 4W5T A; 2VG7 A; 3AA3 A; 3CHW A; 4FCY A; 1VQ5 N; 3TSP A; 5C42 A; 4GV6 A; 4JKF A; 4PQU A; 2ASP A; 3HPO A; 3L8B A; 4N5S A; 1JLG A; 2YX6 A; 2YKM A; 3ALY A; 1DEJ A; 3O9S A; 4CF8 A; 1QVG M; 4GV9 A; 4BRE A; 5AQL A; 1EO1 A; 1KQS M; 4IO8 A; 3FFI A; 2BTF A; 4CGF A; 4LF8 K; 4CZG A; 4Z4I A; 4Z4F A; 2Y1I A; 4BE1 A; 4CK1 A; 1EWQ A; 1BWF O; 1TL3 A; 4M3Z A; 2VG5 A; 4YOT A; 4IG0 A; 2QWN A; 1GOC A; 4XH1 A; 1U4B A; 1HQE A; 3H1V X; 4M63 C; 5TKW A; 2XY7 A; 1U49 A; 1NGB A; 3J7A P; 1BA0 A; 1V4T A; 4DR3 K; 1YAG A; 4IDK A; 5ELZ A; 3I0R A; 4ILH A; 3LDQ A; 4FWR A; 5F0X A; 4HCB A; 5AQU A; 3AO3 A; 3KZB A; 1VQ7 N; 5LJW A; 3HOT A; 4N47 A; 1QSL A; 3DI6 A; 1NK5 A; 1NJI O; 4OLB A; 3L2R A; 4CZI A; 3ZT0 A; 3OBW A; 3M8Q A; 1Q9Y A; 4DSK A; 3M3Z A; 3SI6 A; 3K59 A; 2XY6 A; 5LMN K; 4H5N A; 4B1Y B; 1SL2 A; 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