3KWIA

X-ray structure of ns1 effector domain w187y mutant
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
122
structure length
122
Chain Sequence
TPASRYITDMTIEELSRDWFMLMPKQKVEGPLCIRIDQAIMDKNIMLKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSFPGHTIEDVKNAIGVLIGGLEYNDNTVRVSKTLQRFAWGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Viral protein
source organism Influenza a virus
publication title X-ray structures of NS1 effector domain mutants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Non-structural protein 1
total genus 34
structure length 122
sequence length 122
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.330 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3kwiA00
3O9TA 3O9SA 3KWIA 3F5TA 3P38A 3OA9A 2KKZA 3O9RA 3O9QA 4OPAA 3P31A 3P39A 2RHKA 3D6RA 3EE8A 3M5RA 2GX9A 4OPHA 3EE9A 3RVCA 3KWGA 3O9UA 3L4QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VEOA 4Z94A 1SUQA 2HNYA 4IJNA 4CI6A 1RBVA 4JLHA 3O3FA 3NCIA 2Q2RA 3R3LA 5EXWA 1NM1A 3HSTB 4J2BA 3HK2A 1U04A 2RHKA 3FGUA 4KHUA 4BRFA 3HO1A 1TUUA 3DXKB 1P90A 2VWBA 3OY9A 4FLYA 1DEJA 4FM1A 4JS5A 3H08A 3U6FA 2G8IA 3F5TA 5JVGL 3UKUB 2P9PB 2YHYA 4FK2A 3KZBA 2ZGZA 3NE6A 5EY4A 3SUNA 4M3WA 2NRRA 2P9IB 1NGCA 1M90O 2UUCK 1SKWA 3D6RA 3ZX2A 4CF0A 2QWQA 4NLCA 4C8NA 3EYZA 4CJVA 5MLCQ 3OHRA 4B1XB 1C0GA 5FPDA 1FJGK 2V7YA 2JWKA 1S1TA 4O55A 1W97L 4JKBA 1WB9A 2BTFA 5BPNA 3ID6A 4B3OA 2UXDK 5CZ2A 1S9EA 4RW8A 4CJQA 2IOCA 3TAPA 1XC3A 4FJJA 1VSFA 4OKEA 3J8AA 4AILC 1U47A 1TAQA 4CEEA 1EQYA 2F7TA 1X9JA 3D2EB 1LV5A 1GLEG 1GLAG 3CC7N 3BDPA 4CJRA 1JCEA 4BE2A 3C7NB 2XY6A 4CFDA 4DG1A 4E7LA 2GUIA 2ITGA 3NF6A 5IWAK 1ILYA 4LFCK 3H45C 3DI6A 1EX4A 5C24A 4A2AA 3SZ2A 1FK9A 2FSJA 2FSNA 4CJPA 3V1QA 2OPRA 2HB5A 2YHBA 4DTXA 3DYAA 4FJXA 5BREA 3NH2A 1WSHA 1TK5A 4DTUA 5KPRA 3OYCA 3HI0A 4MLEA 3G6EN 3K9JA 3VQ5A 4NXNK 2HHSA 3OYBA 1Z26A 3H6EA 3LZJA 3T19A 1KVAA 2CGLA 3CXCM 5HP1A 3ULEA 1MWKA 4KHSA 3AVJA 3GG4A 5F0XA 4CJTA 4DSEA 4EFHA 4OKJA 1JLGA 4PL8A 3F73A 2HMPA 3H3NO 1XI1A 1CZAN 1WN7A 2QKBA 5DMRA 3O3HA 3JAMO 2QXLA 4ILJA 4WQ5C 2V7ZA 4ZTJA 1IG9A 2KFZA 3LDNA 2P51A 2ASOA 2NRZA 2A6AA 4JRQA 3DLEA 4K42A 4B3TK 1KAYA 1IKVA 1JJ2M 4CJKA 3EE8A 3PSIA 4DLEA 4OPHA 3HVRA 4RW4A 4Z4GA 1NGBA 2F96A 3BEXA 5CYQA 4DV0K 4PQUA 4KI4A 3KWIA 3HVTA 1SL2A 3SCXA 4KHYA 3V81A 1IH7A 4CZGA 3AA2A 3T1HK 2HHUA 4B1VA 4M3YA 4H4MA 4CGIA 3PV8A 3ATVA 1N34K 4XEIA 4F4KA 5FPNA 3QMLA 3QEXA 3P31A 2UXBK 2NZTA 3MXMA 5HLFA 4CJFA 4DUYK 4F8RA 2PYJA 4CEOA 4A62A 1S1UA 2HBLA 3A2FA 3RR8A 1O1WA 3KK7A 4BDPA 1VSJA 4YOVA 2F4VK 4FZYA 4IOAL 3SAFA 3HXMA 3RRGA 3WXJA 3ENBA 1NWKA 2XY8A 2E5LK 4DU1A 1N33K 3O80A 5BRFA 3NVMA 1RGIA 2XRIA 4DTNA 3QFPA 4CHPA 2ASMA 2A42A 3WXLA 4BQLA 5ADXA 4IEEA 3TTDA 3BZKA 1SKRA 4G9ZA 3KD1E 3AVIA 2A40A 2OPSA 1ZBSA 3CCUN 1RDUA 3RR7A 2EWSA 3S3NA 1U48A 4LF7K 2YKMA 1I3AA 3H1VX 1RDBA 3MAQA 4JKDA 3VQDA 5F1XA 1F21A 4DCHA 2NRXA 1RT1A 3WT0A 5E26A 4FWKA 3HRGA 3F2KA 1BL3A 3JXUA 3TSPA 3SV4A 5TKYA 3OYIA 1IJJA 3AVKA 5GADP 3R9PA 4OX9K 1Q82O 4CJLA 4TSXA 4M3RA 4LF5K 4FJ8A 1I94K 2FF6A 3C6AA 3LPTA 5J2NA 2O8FB 1BI4A 4NB4A 4AF1A 1VSLA 5EX5A 4BWJA 4JKFA 3CF5L 2KLAA 4BC5A 3QICA 4XIUA 1XQSC 5KGXA 1QSYA 1C1CA 1NGAA 4N56A 3N4PA 2X78A 2WC9A 4FK0A 3HM9A 3CHWA 2HHHK 4U7BA 4NCBA 1HYSA 3AA3A 3RSEA 3CCEN 3CCLN 3PIOL 1NG9A 2ATQA 3M6GA 3OYJA 3CERA 4JEPA 5M1KA 4HCCA 3LDPA 1T6DA 2Z1HA 1JL2A 5KQ8A 2IVPA 5EU7A 4HUFA 4FWOA 3TR8A 2QM1A 4OKKA 2P1JA 3WXMB 1YHQN 1E4FT 5AQYA 4N47A 3SYZA 4CBUA 2W6LA 4OGEA 1VQ4N 1S1WA 3OYEA 3ZSXA 2OZMA 3T3FA 3TTCA 3VQ6A 1XMOK 4DS5A 3A5OC 2F8TA 2QWMA 4YORA 4J8FA 1NOZA 3FZLA 3K5MA 4LF9K 4DQQA 2D0BA 3SAHA 3CM6A 3OW2M 2ZD1A 5AQJA 3LANA 1M1KO 1RTJA 4NYFA 3MECA 3CQYA 2VQFK 3S3MA 2RN2A 3AO1A 4OJRA 4H5RA 3OBYA 4FJ7A 3WQUA 3NGYA 1NK5A 2DTUA 2Q0RA 1NKCA 4MDBA 3J7AP 3M1FA 3THVA 2DY4A 3WXIA 1EETA 1VK0A 4ISEA 3HOTA 4DSKA 3CQ8A 3DXMB 3C65A 1HNVA 2HBKA 4L8RB 1NOYA 4KTQA 1XUPO 5GAEP 4EP4A 1T03A 1VQ8N 1GLBG 4AHVA 3BZCA 4BG8A 4CD3A 3L2RA 4DF4A 4DUZK 5J2MA 1TKZA 3IUCA 3NH0A 1RT7A 1WSEA 2VYPA 4IOXA 4CJSA 2IDOA 2UYTA 5AQMA 4CEAA 1YXQA 4E7HA 4PKIA 1SV5A 2OANA 1S3XA 3HP6A 3PY8A 2A3ZA 2FBYA 4FWLA 3U3GA 3THXA 4JD2A 3EO3A 3LL3A 4A59A 1TKDA 4KFBA 4GV6A 3V9XA 1VSIA 3CJ9A 1NK8A 3ZEUB 5M1QA 3PO4A 2E2PA 5AQXA 4CHQA 1U4BA 3QLHA 4CZHA 3AY9A 1S6PA 4FWPA 4CF8A 4DFMA 1HYVA 1BCOA 3ASMA 4CIFA 2E1ZA 4H0TB 1ZBIA 1NKBA 4GKKK 3HSCA 1EP4A 2ZJPL 2WOMA 2G8VA 4EZ6A 1D4XA 3OJUA 4Z4CA 2YV0X 4J2DA 1QQMA 1K8AO 3CFRA 4ISFA 4Q0BA 2A1SA 2O8BA 4FLWA 3M3ZA 4BQZA 2G8UA 3NF7A 4IKFA 4CIEA 1HPZA 4IFYA 1JXBA 2B6AA 1ATNA 4CW7B 3V6DA 3QDKA 1NGHA 3RTVA 3OVNA 4K25A 5BPMA 4DV2K 2OZSA 5HRPA 4IDKA 4MQ3A 1KAXA 4C23A 1UA0A 3QEVA 3ZETA 1HNZK 4CK2A 3FFKB 4UY8O 1HX1A 4M3UA 5AQSA 1HUXA 4LH4A 3LDLA 3WQTA 1UAXA 3K9KA 2JWLA 4IEIA 1A5XA 3C6HA 1C0TA 3V4IA 4CGJA 1LW0A 3TI0A 4YDUA 3VEVA 4C8LA 3AVGA 1C0FA 4BRHA 3M8PA 3UB5A 4CJWA 4CZEA 4KREA 4KI6A 4R5PA 1ITGA 1KFSA 1OH6A 2YI1A 1EWQA 1IBLK 4QOZB 1TL3A 1KCFA 3OYHA 3SNNA 4H0PA 5LJWA 4M45A 4DQPA 4Z4EA 4W5RA 4O8UA 4AM7A 4DSFA 3CPEA 3I56N 2O8CB 5AQHA 4O0JA 3C95A 5BRHA 1CZ9A 1HKBA 3THWA 1BOTO 1KRPA 4FJHA 4DQSA 3VN5A 5JS1A 3VGLA 1YAGA 4E3SA 1X9SA 5HRSA 1RBTA 5LJVA 4FJIA 3VPZA 4Z4HA 2DFFA 1HQUA 2PFUA 4DU3A 4FO0A 1NK6A 2P9NA 1ZBLA 3DLLL 2F8SA 1IBMK 4OLAA 3IKMA 1B9FA 4DSLA 5AZIB 4H03B 3B6OA 3O4WA 4GV3A 2PAVA 3N4QA 4C1NK 1NJZA 3RVCA 4RG8A 1G15A 4CVNE 1NNEA 4B08A 3ZT2A 1KVBA 4HHTA 4BR5A 3J81O 2GELA 3RMAA 4JKGB 4B9SA 4FJLA 3A5NC 2UUAK 4FL9A 3JS6A 3T1YK 3L2VA 1CZBA 1IKWA 2VGNA 2EX3A 1TK8A 3P39A 1BUPA 4CF9A 3AA4A 3CC2N 4BG9A 5HOOA 4LF8K 1NJIO 2Z1JA 4KHWA 1U6ZA 2QXFA 4FLZA 2QEXN 1VQON 4X62K 4DSJA 4FLTA 3ZLJA 3CMEN 3FR0A 2G8KA 2P9SA 4A5AA 5T7BA 4FWSA 4FJ9A 4FWRA 1Q7YO 4I7FA 3ZSWA 4YOWA 4B8CA 3CC4N 3O08A 1K6YA 3I55N 1XHXA 3QEIA 3ZSOA 3K0SA 1KLMA 3S41A 1K8KB 4KTZA 2P9LA 4CFCA 3KIOA 4NCGA 3O8MA 4DV6K 1EWRA 1KAZA 2VQEK 3G4SN 3P38A 4B1ZA 2FBXA 1XWLA 4BRAA 3KLIA 3UKRA 3MK6A 4JK8A 2Z1GA 4ZTFA 1H1VA 4CHNA 4Z4IA 2YNIA 2UUBK 4M41A 3NBPA 1T7PA 4KRFA 3KJVA 2XO7A 1Z6RA 1HLUA 1SS6A 1T05A 4WFNL 1TAUA 3AO3A 1WSIA 4DTJA 3LM2A 2ZWHA 3DMJA 3AARA 1ESVA 1QS4A 2ZF5O 1WNSA 4DTRA 3DM2A 4B9LA 1OH7A 4FJ5A 3D0PA 2FSKA 3CFPA 3T69A 3NMUA 3AGRA 3A5LC 4KH4A 4MO5A 1C6VA 4XH4A 3NF9A 3LDOA 3ZT0A 2OTLN 4LFAK 1HNWK 5JLHA 1RDCA 3QIPA 4ELUA 2YKNA 4PUOA 3ZT3A 3DRSA 3NDKA 2VG5A 2HBJA 4LF6K 2ZQBA 1GOAA 3AVLA 5HBMA 1S1XA 3TABA 3QO9A 4CJ5A 2OCEA 5AZJA 3MWPA 4KBOA 4B9NA 2PYLA 4CHYA 3EZ5A 4A5BA 2R7YA 4H8KA 1RBSA 1Z05A 4I6MB 2O8DB 4IFVA 3DLGA 3O9TA 2QWOA 3AO2A 2HHQA 1RNHA 3IG1A 3K2PA 3I33A 4BRQA 4FCYA 3W0LA 4A57A 4M3XA 4FOEA 2B4JA 1SAZA 1ASWA 3HP9A 5C15A 3TAEA 2YNFA 4FK4A 1OVYA 4V19S 2X74A 4X66K 4DB3A 1YIJN 2W6KA 3EKUA 2YJFA 2G8FA 3TAGA 2OPPA 3THYA 3CCSN 3BUZB 1KXPA 4G1QA 4J2EA 2QK9A 3L2UA 4NXMK 3F9MA 4QS9A 2GWJA 1T3VA 4M3ZA 1X9MA 5AQLA 1U2VA 3AO4A 1BDGA 1TGOA 1TL1A 1GLJO 3MCAB 4J2AA 5E84A 4X64K 2I7PA 3SV3A 2KTQA 1J5OA 3MDQA 1D5AA 4HUGA 5I42A 3VTIA 4JI8K 1ZBFA 3KLGA 2D0CA 4CGGA 3VGMA 5DM7L 1KD1O 2E1YA 4B9VA 4CGDA 4BWMA 3CYMA 1NGGA 3ENOA 3ZEUA 3IS9A 3H1QA 3KKRA 5FDLA 4JKHA 3PO5A 3NF8A 4JNEA 1TYQB 3LP3A 4CGFA 3I0SA 4KPYA 3H46O 4K8XA 1NKEA 3LDSA 3MEEA 2WFBA 5EVZA 3A8YA 4YHHK 3GDQA 4MO4A 3K59A 2Q0UA 1IG8A 5AQPA 5AQTA 3GE1A 1DTQA 3DLBA 4JAXA 2QWLA 5DM6L 3O1BA 4PA1A 2P9KB 3DLKA 4BR9A 3D2FA 3L0QA 1YJNN 1SKSA 1X9WA 3AGKA 3EL2A 3K5NA 1NGEA 3WEEB 1C0UA 3PX6A 2CGJA 4CEDA 3LP1A 4PY5A 3HTVA 1KTQA 1FXXA 1VQPN 1VSHA 2E2NA 5C0YA 1RT4A 2VWJA 4BRGA 3CG7A 4YOTA 4KAZA 1BIUA 1J6ZA 5M1NA 1SQKA 3L3UA 5CZ1A 3Q7CA 4OLBA 5SZTA 1VQNN 1E3MA 3VMFB 2HF4A 1S1VA 4DF8A 3S9HA 2E2QA 2AA4A 4WQ4C 2X6NA 3L3VA 1RBRA 5CHIA 4Q5VA 5LMNK 1S22A 4O44A 1I39A 1B9DA 1IKXA 1ZBHA 1GLCG 4JHDA 2GWKA 4LD0A 1IO2A 5FRNA 3SPYA 3CM5A 1Z25A 5HROA 3CQXA 1GOCA 4I2QA 1HYZA 3FZFA 2FLOA 4HTLA 1P8ZA 3KK1A 1DGKN 4OPKA 1DKGD 2VG7A 3RMBA 3IRXA 1YTUA 3TAFA 4IG0A 2QWPA 3VQ9A 1HMVA 5JICA 5JMVA 4X65K 4AQYK 4CF2A 3W3DA 1GOBA 4H4OA 2KHOA 4ZHRA 4PKGA 4K8ZA 4WE1A 1UA1A 1T8EA 4CK1A 3VQPA 2GUPA 2FF3B 3SQ0A 3C94A 2Q31A 2YJEA 4IZ9A 3QESA 3SMSA 3L2QA 1QSSA 3DJCA 2O8EA 3TAMA 4E7JA 4IG3A 2P9UA 4EP5A 4LC9B 1JL1A 2W41A 1N32K 3LM9A 1QE1A 4DU4A 1JCFA 1YVNA 1RCHA 1NLVA 3CCMN 3CPWM 3DAWA 4M42A 4DV1K 5M1PA 4BR2A 5C10A 1NU0A 3BF3A 3NGIA 1JLQA 3J7YP 2CH6A 2Y1JA 1QVGM 1MA9B 5B8HA 4EIAA 4BC4A 4YOUA 4DHYA 2BH1A 1S9GA 1XC9A 5DK5A 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2VG6A 5CY4A 1LW2A 1D9FA 3EEQA 1NBWA 4H5NA 4FW2A 4EHTA 4FSVA 1U49A 1WUAA 3CIPA 3U9DA 2KZMA 4C8MA 3CJBA 5I9EB 4IXCA 4FXDA 1KSPA 4F3OA 3FZKA 2QI2A 4JV5K 3KKSA 4JRPA 3CFOA 3ZYYX 3HOSA 1RTHA 2W40A 4DFKA 3CJ7A 2PBDA 5KTQA 3VA0A 4IBNA 3VESA 1GLDG 1OH5A 4CZFA 4FVMA 1W9HA 3DLHA 5C25A 3M5RA 4FYDA 2B5JA 3M8QA 3D7EO 3EZWA 1VSKA 1HJRA 4BRPA 5C12A 1S72N 2E6MA 3ZSZA 1HKGA 4C8OA 1BISA 3OA9A 4BRMA 4CFAA 4CGHA 4E1NA 3QINA 3VQ8A 4L3QA 3VEXA 4WF9L 3OYNA 3FZMA 3O5BA 4IOCL 5C2DA 2F9TA 4DV4K 3EE9A 2QTDA 2FXUA 1NK7A 4M7YA 3BF1A 2P5OA 4C8KA 3MCPA 4DR4K 3LAMA 3RSEB 2FBTA 4GMJB 1QHAA 3LP2A 4FPBA 4KH5A 3AVMA 4DLGA 4OO1J 3TPQA 1YI2N 4E0DA 3SMPA 2E8AA 2RKIA 1WBBA 2HHVA 3J80O 3JYTA 5GINA 4JKAA 3UE5A 4DFJA 1V4TA 1TKXA 3O9UA 3MMVA 1N8RO 5M1OA 1XNRK 1YT3A 5KPTA 1Q18A 2V51B 1LCUA 2GV9A 1BCMA 5JLFA 5AQKA 5K14A 2HHWA 4JS4A 2GTDA 3QEWA 3VQAA 4KTWA 2QWRA 3D45A 4CEZA 3HM8A 3Q7BA 1T44A 3G25A 1WLJA 1TUYA 3AVBA 2Q36A 1S5JA 4EAHD 4FLUA 2UXCK 2O8FA 5AQUA 1KLNA 4K43A 4RW9A 4ISGA 3LPUA 3QFUA 3LAKA 3ZSQA 3BGRA 5JVHL 4CJEA 3G0ZA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3O9T A;  3O9S A;  3KWI A;  3F5T A;  3P38 A;  3OA9 A;  2KKZ A;  3O9R A;  3O9Q A;  4OPA A;  3P31 A;  3P39 A;  2RHK A;  3D6R A;  3EE8 A;  3M5R A;  2GX9 A;  4OPH A;  3EE9 A;  3RVC A;  3KWG A;  3O9U A;  3L4Q A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3VEO A;  4Z94 A;  1SUQ A;  2HNY A;  4IJN A;  4CI6 A;  1RBV A;  4JLH A;  3O3F A;  3NCI A;  2Q2R A;  3R3L A;  5EXW A;  1NM1 A;  3HST B;  4J2B A;  3HK2 A;  1U04 A;  2RHK A;  3FGU A;  4KHU A;  4BRF A;  3HO1 A;  1TUU A;  3DXK B;  1P90 A;  2VWB A;  3OY9 A;  4FLY A;  1DEJ A;  4FM1 A;  4JS5 A;  3H08 A;  3U6F A;  2G8I A;  3F5T A;  5JVG L;  3UKU B;  2P9P B;  2YHY A;  4FK2 A;  3KZB A;  2ZGZ A;  3NE6 A;  5EY4 A;  3SUN A;  4M3W A;  2NRR A;  2P9I B;  1NGC A;  1M90 O;  2UUC K;  1SKW A;  3D6R A;  3ZX2 A;  4CF0 A;  2QWQ A;  4NLC A;  4C8N A;  3EYZ A;  4CJV A;  5MLC Q;  3OHR A;  4B1X B;  1C0G A;  5FPD A;  1FJG K;  2V7Y A;  2JWK A;  1S1T A;  4O55 A;  1W97 L;  4JKB A;  1WB9 A;  2BTF A;  5BPN A;  3ID6 A;  4B3O A;  2UXD K;  5CZ2 A;  1S9E A;  4RW8 A;  4CJQ A;  2IOC A;  3TAP A;  1XC3 A;  4FJJ A;  1VSF A;  4OKE A;  3J8A A;  4AIL C;  1U47 A;  1TAQ A;  4CEE A;  1EQY A;  2F7T A;  1X9J A;  3D2E B;  1LV5 A;  1GLE G;  1GLA G;  3CC7 N;  3BDP A;  4CJR A;  1JCE A;  4BE2 A;  3C7N B;  2XY6 A;  4CFD A;  4DG1 A;  4E7L A;  2GUI A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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