The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
34
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sequence length |
122
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structure length |
122
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Chain Sequence |
TPASRYITDMTIEELSRDWFMLMPKQKVEGPLCIRIDQAIMDKNIMLKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSFPGHTIEDVKNAIGVLIGGLEYNDNTVRVSKTLQRFAWGS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Viral protein
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| source organism |
Influenza a virus
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| publication title |
X-ray structures of NS1 effector domain mutants.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Non-structural protein 1
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| total genus |
34
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| structure length |
122
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| sequence length |
122
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-12-01 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3O9T A; 3O9S A; 3KWI A; 3F5T A; 3P38 A; 3OA9 A; 2KKZ A; 3O9R A; 3O9Q A; 4OPA A; 3P31 A; 3P39 A; 2RHK A; 3D6R A; 3EE8 A; 3M5R A; 2GX9 A; 4OPH A; 3EE9 A; 3RVC A; 3KWG A; 3O9U A; 3L4Q A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3VEO A; 4Z94 A; 1SUQ A; 2HNY A; 4IJN A; 4CI6 A; 1RBV A; 4JLH A; 3O3F A; 3NCI A; 2Q2R A; 3R3L A; 5EXW A; 1NM1 A; 3HST B; 4J2B A; 3HK2 A; 1U04 A; 2RHK A; 3FGU A; 4KHU A; 4BRF A; 3HO1 A; 1TUU A; 3DXK B; 1P90 A; 2VWB A; 3OY9 A; 4FLY A; 1DEJ A; 4FM1 A; 4JS5 A; 3H08 A; 3U6F A; 2G8I A; 3F5T A; 5JVG L; 3UKU B; 2P9P B; 2YHY A; 4FK2 A; 3KZB A; 2ZGZ A; 3NE6 A; 5EY4 A; 3SUN A; 4M3W A; 2NRR A; 2P9I B; 1NGC A; 1M90 O; 2UUC K; 1SKW A; 3D6R A; 3ZX2 A; 4CF0 A; 2QWQ A; 4NLC A; 4C8N A; 3EYZ A; 4CJV A; 5MLC Q; 3OHR A; 4B1X B; 1C0G A; 5FPD A; 1FJG K; 2V7Y A; 2JWK A; 1S1T A; 4O55 A; 1W97 L; 4JKB A; 1WB9 A; 2BTF A; 5BPN A; 3ID6 A; 4B3O A; 2UXD K; 5CZ2 A; 1S9E A; 4RW8 A; 4CJQ A; 2IOC A; 3TAP A; 1XC3 A; 4FJJ A; 1VSF A; 4OKE A; 3J8A A; 4AIL C; 1U47 A; 1TAQ A; 4CEE A; 1EQY A; 2F7T A; 1X9J A; 3D2E B; 1LV5 A; 1GLE G; 1GLA G; 3CC7 N; 3BDP A; 4CJR A; 1JCE A; 4BE2 A; 3C7N B; 2XY6 A; 4CFD A; 4DG1 A; 4E7L A; 2GUI A; 2ITG A; 3NF6 A; 5IWA K; 1ILY A; 4LFC K; 3H45 C; 3DI6 A; 1EX4 A; 5C24 A; 4A2A A; 3SZ2 A; 1FK9 A; 2FSJ A; 2FSN A; 4CJP A; 3V1Q A; 2OPR A; 2HB5 A; 2YHB A; 4DTX A; 3DYA A; 4FJX A; 5BRE A; 3NH2 A; 1WSH A; 1TK5 A; 4DTU A; 5KPR A; 3OYC A; 3HI0 A; 4MLE A; 3G6E N; 3K9J A; 3VQ5 A; 4NXN K; 2HHS A; 3OYB A; 1Z26 A; 3H6E A; 3LZJ A; 3T19 A; 1KVA A; 2CGL A; 3CXC M; 5HP1 A; 3ULE A; 1MWK A; 4KHS A; 3AVJ A; 3GG4 A; 5F0X A; 4CJT A; 4DSE A; 4EFH A; 4OKJ A; 1JLG A; 4PL8 A; 3F73 A; 2HMP A; 3H3N O; 1XI1 A; 1CZA N; 1WN7 A; 2QKB A; 5DMR A; 3O3H A; 3JAM O; 2QXL A; 4ILJ A; 4WQ5 C; 2V7Z A; 4ZTJ A; 1IG9 A; 2KFZ A; 3LDN A; 2P51 A; 2ASO A; 2NRZ A; 2A6A A; 4JRQ A; 3DLE A; 4K42 A; 4B3T K; 1KAY A; 1IKV A; 1JJ2 M; 4CJK A; 3EE8 A; 3PSI A; 4DLE A; 4OPH A; 3HVR A; 4RW4 A; 4Z4G A; 1NGB A; 2F96 A; 3BEX A; 5CYQ A; 4DV0 K; 4PQU A; 4KI4 A; 3KWI A; 3HVT A; 1SL2 A; 3SCX A; 4KHY A; 3V81 A; 1IH7 A; 4CZG A; 3AA2 A; 3T1H K; 2HHU A; 4B1V A; 4M3Y A; 4H4M A; 4CGI A; 3PV8 A; 3ATV A; 1N34 K; 4XEI A; 4F4K A; 5FPN A; 3QML A; 3QEX A; 3P31 A; 2UXB K; 2NZT A; 3MXM A; 5HLF A; 4CJF A; 4DUY K; 4F8R A; 2PYJ A; 4CEO A; 4A62 A; 1S1U A; 2HBL A; 3A2F A; 3RR8 A; 1O1W A; 3KK7 A; 4BDP A; 1VSJ A; 4YOV A; 2F4V K; 4FZY A; 4IOA L; 3SAF A; 3HXM A; 3RRG A; 3WXJ A; 3ENB A; 1NWK A; 2XY8 A; 2E5L K; 4DU1 A; 1N33 K; 3O80 A; 5BRF A; 3NVM A; 1RGI A; 2XRI A; 4DTN A; 3QFP A; 4CHP A; 2ASM A; 2A42 A; 3WXL A; 4BQL A; 5ADX A; 4IEE A; 3TTD A; 3BZK A; 1SKR A; 4G9Z A; 3KD1 E; 3AVI A; 2A40 A; 2OPS A; 1ZBS A; 3CCU N; 1RDU A; 3RR7 A; 2EWS A; 3S3N A; 1U48 A; 4LF7 K; 2YKM A; 1I3A A; 3H1V X; 1RDB A; 3MAQ A; 4JKD A; 3VQD A; 5F1X A; 1F21 A; 4DCH A; 2NRX A; 1RT1 A; 3WT0 A; 5E26 A; 4FWK A; 3HRG A; 3F2K A; 1BL3 A; 3JXU A; 3TSP A; 3SV4 A; 5TKY A; 3OYI A; 1IJJ A; 3AVK A; 5GAD P; 3R9P A; 4OX9 K; 1Q82 O; 4CJL A; 4TSX A; 4M3R A; 4LF5 K; 4FJ8 A; 1I94 K; 2FF6 A; 3C6A A; 3LPT A; 5J2N A; 2O8F B; 1BI4 A; 4NB4 A; 4AF1 A; 1VSL A; 5EX5 A; 4BWJ A; 4JKF A; 3CF5 L; 2KLA A; 4BC5 A; 3QIC A; 4XIU A; 1XQS C; 5KGX A; 1QSY A; 1C1C A; 1NGA A; 4N56 A; 3N4P A; 2X78 A; 2WC9 A; 4FK0 A; 3HM9 A; 3CHW A; 2HHH K; 4U7B A; 4NCB A; 1HYS A; 3AA3 A; 3RSE A; 3CCE N; 3CCL N; 3PIO L; 1NG9 A; 2ATQ A; 3M6G A; 3OYJ A; 3CER A; 4JEP A; 5M1K A; 4HCC A; 3LDP A; 1T6D A; 2Z1H A; 1JL2 A; 5KQ8 A; 2IVP A; 5EU7 A; 4HUF A; 4FWO A; 3TR8 A; 2QM1 A; 4OKK A; 2P1J A; 3WXM B; 1YHQ N; 1E4F T; 5AQY A; 4N47 A; 3SYZ A; 4CBU A; 2W6L A; 4OGE A; 1VQ4 N; 1S1W A; 3OYE A; 3ZSX A; 2OZM A; 3T3F A; 3TTC A; 3VQ6 A; 1XMO K; 4DS5 A; 3A5O C; 2F8T A; 2QWM A; 4YOR A; 4J8F A; 1NOZ A; 3FZL A; 3K5M A; 4LF9 K; 4DQQ A; 2D0B A; 3SAH A; 3CM6 A; 3OW2 M; 2ZD1 A; 5AQJ A; 3LAN A; 1M1K O; 1RTJ A; 4NYF A; 3MEC A; 3CQY A; 2VQF K; 3S3M A; 2RN2 A; 3AO1 A; 4OJR A; 4H5R A; 3OBY A; 4FJ7 A; 3WQU A; 3NGY A; 1NK5 A; 2DTU A; 2Q0R A; 1NKC A; 4MDB A; 3J7A P; 3M1F A; 3THV A; 2DY4 A; 3WXI A; 1EET A; 1VK0 A; 4ISE A; 3HOT A; 4DSK A; 3CQ8 A; 3DXM B; 3C65 A; 1HNV A; 2HBK A; 4L8R B; 1NOY A; 4KTQ A; 1XUP O; 5GAE P; 4EP4 A; 1T03 A; 1VQ8 N; 1GLB G; 4AHV A; 3BZC A; 4BG8 A; 4CD3 A; 3L2R A; 4DF4 A; 4DUZ K; 5J2M A; 1TKZ A; 3IUC A; 3NH0 A; 1RT7 A; 1WSE A; 2VYP A; 4IOX A; 4CJS A; 2IDO A; 2UYT A; 5AQM A; 4CEA A; 1YXQ A; 4E7H A; 4PKI A; 1SV5 A; 2OAN A; 1S3X A; 3HP6 A; 3PY8 A; 2A3Z A; 2FBY A; 4FWL A; 3U3G A; 3THX A; 4JD2 A; 3EO3 A; 3LL3 A; 4A59 A; 1TKD A; 4KFB A; 4GV6 A; 3V9X A; 1VSI A; 3CJ9 A; 1NK8 A; 3ZEU B; 5M1Q A; 3PO4 A; 2E2P A; 5AQX A; 4CHQ A; 1U4B A; 3QLH A; 4CZH A; 3AY9 A; 1S6P A; 4FWP A; 4CF8 A; 4DFM A; 1HYV A; 1BCO A; 3ASM A; 4CIF A; 2E1Z A; 4H0T B; 1ZBI A; 1NKB A; 4GKK K; 3HSC A; 1EP4 A; 2ZJP L; 2WOM A; 2G8V A; 4EZ6 A; 1D4X A; 3OJU A; 4Z4C A; 2YV0 X; 4J2D A; 1QQM A; 1K8A O; 3CFR A; 4ISF A; 4Q0B A; 2A1S A; 2O8B A; 4FLW A; 3M3Z A; 4BQZ A; 2G8U A; 3NF7 A; 4IKF A; 4CIE A; 1HPZ A; 4IFY A; 1JXB A; 2B6A A; 1ATN A; 4CW7 B; 3V6D A; 3QDK A; 1NGH A; 3RTV A; 3OVN A; 4K25 A; 5BPM A; 4DV2 K; 2OZS A; 5HRP A; 4IDK A; 4MQ3 A; 1KAX A; 4C23 A; 1UA0 A; 3QEV A; 3ZET A; 1HNZ K; 4CK2 A; 3FFK B; 4UY8 O; 1HX1 A; 4M3U A; 5AQS A; 1HUX A; 4LH4 A; 3LDL A; 3WQT A; 1UAX A; 3K9K A; 2JWL A; 4IEI A; 1A5X A; 3C6H A; 1C0T A; 3V4I A; 4CGJ A; 1LW0 A; 3TI0 A; 4YDU A; 3VEV A; 4C8L A; 3AVG A; 1C0F A; 4BRH A; 3M8P A; 3UB5 A; 4CJW A; 4CZE A; 4KRE A; 4KI6 A; 4R5P A; 1ITG A; 1KFS A; 1OH6 A; 2YI1 A; 1EWQ A; 1IBL K; 4QOZ B; 1TL3 A; 1KCF A; 3OYH A; 3SNN A; 4H0P A; 5LJW A; 4M45 A; 4DQP A; 4Z4E A; 4W5R A; 4O8U A; 4AM7 A; 4DSF A; 3CPE A; 3I56 N; 2O8C B; 5AQH A; 4O0J A; 3C95 A; 5BRH A; 1CZ9 A; 1HKB A; 3THW A; 1BOT O; 1KRP A; 4FJH A; 4DQS A; 3VN5 A; 5JS1 A; 3VGL A; 1YAG A; 4E3S A; 1X9S A; 5HRS A; 1RBT A; 5LJV A; 4FJI A; 3VPZ A; 4Z4H A; 2DFF A; 1HQU A; 2PFU A; 4DU3 A; 4FO0 A; 1NK6 A; 2P9N A; 1ZBL A; 3DLL L; 2F8S A; 1IBM K; 4OLA A; 3IKM A; 1B9F A; 4DSL A; 5AZI B; 4H03 B; 3B6O A; 3O4W A; 4GV3 A; 2PAV A; 3N4Q A; 4C1N K; 1NJZ A; 3RVC A; 4RG8 A; 1G15 A; 4CVN E; 1NNE A; 4B08 A; 3ZT2 A; 1KVB A; 4HHT A; 4BR5 A; 3J81 O; 2GEL A; 3RMA A; 4JKG B; 4B9S A; 4FJL A; 3A5N C; 2UUA K; 4FL9 A; 3JS6 A; 3T1Y K; 3L2V A; 1CZB A; 1IKW A; 2VGN A; 2EX3 A; 1TK8 A; 3P39 A; 1BUP A; 4CF9 A; 3AA4 A; 3CC2 N; 4BG9 A; 5HOO A; 4LF8 K; 1NJI O; 2Z1J A; 4KHW A; 1U6Z A; 2QXF A; 4FLZ A; 2QEX N; 1VQO N; 4X62 K; 4DSJ A; 4FLT A; 3ZLJ A; 3CME N; 3FR0 A; 2G8K A; 2P9S A; 4A5A A; 5T7B A; 4FWS A; 4FJ9 A; 4FWR A; 1Q7Y O; 4I7F A; 3ZSW A; 4YOW A; 4B8C A; 3CC4 N; 3O08 A; 1K6Y A; 3I55 N; 1XHX A; 3QEI A; 3ZSO A; 3K0S A; 1KLM A; 3S41 A; 1K8K B; 4KTZ A; 2P9L A; 4CFC A; 3KIO A; 4NCG A; 3O8M A; 4DV6 K; 1EWR A; 1KAZ A; 2VQE K; 3G4S N; 3P38 A; 4B1Z A; 2FBX A; 1XWL A; 4BRA A; 3KLI A; 3UKR A; 3MK6 A; 4JK8 A; 2Z1G A; 4ZTF A; 1H1V A; 4CHN A; 4Z4I A; 2YNI A; 2UUB K; 4M41 A; 3NBP A; 1T7P A; 4KRF A; 3KJV A; 2XO7 A; 1Z6R A; 1HLU A; 1SS6 A; 1T05 A; 4WFN L; 1TAU A; 3AO3 A; 1WSI A; 4DTJ A; 3LM2 A; 2ZWH A; 3DMJ A; 3AAR A; 1ESV A; 1QS4 A; 2ZF5 O; 1WNS A; 4DTR A; 3DM2 A; 4B9L A; 1OH7 A; 4FJ5 A; 3D0P A; 2FSK A; 3CFP A; 3T69 A; 3NMU A; 3AGR A; 3A5L C; 4KH4 A; 4MO5 A; 1C6V A; 4XH4 A; 3NF9 A; 3LDO A; 3ZT0 A; 2OTL N; 4LFA K; 1HNW K; 5JLH A; 1RDC A; 3QIP A; 4ELU A; 2YKN A; 4PUO A; 3ZT3 A; 3DRS A; 3NDK A; 2VG5 A; 2HBJ A; 4LF6 K; 2ZQB A; 1GOA A; 3AVL A; 5HBM A; 1S1X A; 3TAB A; 3QO9 A; 4CJ5 A; 2OCE A; 5AZJ A; 3MWP A; 4KBO A; 4B9N A; 2PYL A; 4CHY A; 3EZ5 A; 4A5B A; 2R7Y A; 4H8K A; 1RBS A; 1Z05 A; 4I6M B; 2O8D B; 4IFV A; 3DLG A; 3O9T A; 2QWO A; 3AO2 A; 2HHQ A; 1RNH A; 3IG1 A; 3K2P A; 3I33 A; 4BRQ A; 4FCY A; 3W0L A; 4A57 A; 4M3X A; 4FOE A; 2B4J A; 1SAZ A; 1ASW A; 3HP9 A; 5C15 A; 3TAE A; 2YNF A; 4FK4 A; 1OVY A; 4V19 S; 2X74 A; 4X66 K; 4DB3 A; 1YIJ N; 2W6K A; 3EKU A; 2YJF A; 2G8F A; 3TAG A; 2OPP A; 3THY A; 3CCS N; 3BUZ B; 1KXP A; 4G1Q A; 4J2E A; 2QK9 A; 3L2U A; 4NXM K; 3F9M A; 4QS9 A; 2GWJ A; 1T3V A; 4M3Z A; 1X9M A; 5AQL A; 1U2V A; 3AO4 A; 1BDG A; 1TGO A; 1TL1 A; 1GLJ O; 3MCA B; 4J2A A; 5E84 A; 4X64 K; 2I7P A; 3SV3 A; 2KTQ A; 1J5O A; 3MDQ A; 1D5A A; 4HUG A; 5I42 A; 3VTI A; 4JI8 K; 1ZBF A; 3KLG A; 2D0C A; 4CGG A; 3VGM A; 5DM7 L; 1KD1 O; 2E1Y A; 4B9V A; 4CGD A; 4BWM A; 3CYM A; 1NGG A; 3ENO A; 3ZEU A; 3IS9 A; 3H1Q A; 3KKR A; 5FDL A; 4JKH A; 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1HMV A; 5JIC A; 5JMV A; 4X65 K; 4AQY K; 4CF2 A; 3W3D A; 1GOB A; 4H4O A; 2KHO A; 4ZHR A; 4PKG A; 4K8Z A; 4WE1 A; 1UA1 A; 1T8E A; 4CK1 A; 3VQP A; 2GUP A; 2FF3 B; 3SQ0 A; 3C94 A; 2Q31 A; 2YJE A; 4IZ9 A; 3QES A; 3SMS A; 3L2Q A; 1QSS A; 3DJC A; 2O8E A; 3TAM A; 4E7J A; 4IG3 A; 2P9U A; 4EP5 A; 4LC9 B; 1JL1 A; 2W41 A; 1N32 K; 3LM9 A; 1QE1 A; 4DU4 A; 1JCF A; 1YVN A; 1RCH A; 1NLV A; 3CCM N; 3CPW M; 3DAW A; 4M42 A; 4DV1 K; 5M1P A; 4BR2 A; 5C10 A; 1NU0 A; 3BF3 A; 3NGI A; 1JLQ A; 3J7Y P; 2CH6 A; 2Y1J A; 1QVG M; 1MA9 B; 5B8H A; 4EIA A; 4BC4 A; 4YOU A; 4DHY A; 2BH1 A; 1S9G A; 1XC9 A; 5DK5 A; 1REV A; 3ULD A; 3HJF A; 5CE3 A; 4FLV A; 2NLX A; 3DWL A; 1SL1 A; 5D3G A; 2XHB A; 4FLX A; 2RE2 A; 4CEB A; 1XNQ K; 3MXJ A; 1DTT A; 4O5B A; 4RW7 A; 1SL0 A; 4YFU A; 3S3O A; 3VEZ A; 1UWB A; 3E9L A; 5FRO A; 3CCJ N; 2KZZ A; 5AFU A; 4E19 A; 3P5J A; 1N6Q A; 3FLC O; 4RWT A; 3SQ2 A; 3SQ1 A; 2JGU A; 3DXK A; 3SBT A; 3QNN A; 1MDU B; 3R6M A; 2YNH A; 3QET A; 5C2F A; 2DFH A; 3UKU A; 2P9P A; 3OBW A; 1X3M A; 1ZC6 A; 1WOQ A; 4B9Q A; 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