The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
34
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sequence length |
122
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structure length |
122
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Chain Sequence |
TPASRYITDMTIEELSRDWFMLMPKQKVEGPLCIRIDQAIMDKNIMLKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSFPGHTIEDVKNAIGVLIGGLEYNDNTVRVSKTLQRFAWGS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Viral protein
|
| molecule keywords |
Non-structural protein 1
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| publication title |
X-ray structures of NS1 effector domain mutants.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Influenza a virus
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| total genus |
34
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| structure length |
122
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| sequence length |
122
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-12-01 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2GX9 A; 3O9U A; 3D6R A; 3EE8 A; 3KWI A; 3F5T A; 3KWG A; 3OA9 A; 3RVC A; 3EE9 A; 3P39 A; 3M5R A; 3O9S A; 3P31 A; 3O9T A; 2RHK A; 3L4Q A; 3O9Q A; 4OPA A; 3P38 A; 2KKZ A; 3O9R A; 4OPH A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4CGF A; 1Y97 A; 5H1S Q; 2O8C A; 1YUW A; 3CIP A; 3OBW A; 2R7Y A; 3LP1 A; 3MMV A; 1XHZ A; 4DV5 K; 2HVH A; 4FJJ A; 2NRR A; 2F7T A; 2P9P A; 1QSL A; 1BU6 O; 1RBR A; 5JLH A; 3L6Q A; 2W6L A; 2DPN A; 1QVG M; 2AA4 A; 3OTO K; 3FZH A; 1WSI A; 3ALY A; 4DTR A; 4IJA A; 3CET A; 2FSN A; 4DSL A; 1NOY A; 4HHT A; 1YTA A; 2UUA K; 3A0I X; 3DXK A; 3THY A; 4KTZ A; 4FWM A; 1TKT A; 3SUQ A; 4FOI A; 4HCB A; 2VYP A; 3KLF A; 3CCM N; 1GLL O; 3I33 A; 5M1Q A; 3C6H A; 4YNQ A; 3MED A; 3U6F A; 1A5V A; 4E7I A; 4OLB A; 4B9S A; 3CPE A; 4H4M A; 3JS6 A; 4YOX A; 1KLN A; 3HPO A; 3QB0 A; 1L3T A; 3EN9 A; 4FWR A; 3H6E A; 3AVM A; 1U2V B; 4CF2 A; 3LM9 A; 1GOC A; 2FBT A; 3B6P A; 2CGL A; 3V9W A; 1Z6R A; 1YTU A; 1CXU A; 2QEX N; 1RDC A; 5AQL A; 4JKF A; 5JVH L; 4H03 B; 2HHQ A; 4K43 A; 5KGW A; 2QXF A; 5C2F A; 1K8K B; 1CZB A; 1NJI O; 4BR5 A; 4JHD A; 4C1N I; 4PY5 A; 4GMJ B; 1IV0 A; 2QKB A; 5BPN A; 3TTF A; 4M3Y A; 4IJN A; 4FWO A; 4BRQ A; 3V1Q A; 1QVF M; 5AQN A; 4E3S A; 4H0V B; 2ASM A; 3TTD A; 3OYL A; 4FM2 A; 1YXQ A; 1RIL A; 3QFU A; 4KH6 A; 3BF3 A; 5SZT A; 3ISN C; 3Q7B A; 3ZSR A; 3QEX A; 3TAR A; 1C0M A; 3RTV A; 4QOZ B; 3VQ9 A; 4JI5 K; 1X3M A; 1D9D A; 4IEI A; 2DY4 A; 3O9R A; 4BC4 A; 3VA3 A; 1IH7 A; 3FZF A; 1NJZ A; 1WSE A; 2ZWH A; 4JD2 A; 1YI2 N; 5CHI A; 3RR8 A; 1TL3 A; 4FLY A; 3FLC O; 4HWI A; 4C8O A; 3CC2 N; 5AQT A; 3S9H A; 1BCO A; 3TSQ A; 1RBT A; 3CHW A; 1TAQ A; 3K5M A; 2BTF A; 3G10 A; 2F9T A; 1FJG K; 3M5R A; 4W5N A; 2BAN A; 2Q2R A; 5KRT A; 3O08 A; 4DR1 K; 2QWP A; 4DWI A; 4F3O A; 2HVI A; 4XH4 A; 2XHB A; 4DUZ K; 1I94 K; 4AHC A; 2HBJ A; 3VQ7 A; 4QS8 A; 2P9N A; 4FLU A; 1DEJ A; 4GV3 A; 4CGI A; 4O5F A; 2A5X A; 2WUS A; 1XC9 A; 4CJL A; 4CJ4 A; 2OZS A; 4M3W A; 3VTI A; 2PFU A; 4JNE A; 4CZJ A; 4CEE A; 3HRG A; 3PO4 A; 2B5J A; 4B8A B; 3CQX A; 5AQU A; 3U8X A; 4I2Q A; 3DMJ A; 2GX9 A; 5F0X A; 1BO5 O; 3E01 A; 5BN8 A; 3SZ2 A; 3OHR A; 1X9S A; 4JV5 K; 4BRC A; 3MEC A; 1U49 A; 4FL9 A; 3LZI A; 3K0S A; 4B9Q A; 1VSD A; 3VQP A; 5LY3 A; 5AQX A; 3KHY A; 2D0O A; 4HUG A; 5C24 A; 2X6N A; 1IJJ A; 2OPS A; 3MN6 A; 3O4Q A; 2KQ2 A; 1GLB G; 4BQL A; 4NCB A; 1TL1 A; 1HYZ A; 5A2Q O; 4CER A; 2QK9 A; 5B8H A; 2NRH A; 5KPR A; 4DFP A; 1SL2 A; 3J7Y P; 3T69 A; 4PKH A; 4YY3 K; 3CF5 L; 3O6W A; 4O5B A; 2P9L A; 4CEC A; 1UA1 A; 2E8A A; 1N36 K; 5SWM A; 1JXE A; 5HBM A; 2IVO A; 4BRF A; 3P4I A; 4BVP A; 3TAG A; 4B3R K; 1RT6 A; 3VOV A; 1QQO A; 3Q7C A; 4AH9 A; 5MLC Q; 3T3F A; 5J2Q A; 1W2B M; 1J53 A; 2NZT A; 4AM7 A; 3QIC A; 4KTW A; 1IKV A; 5E41 A; 2D0P A; 3CM6 A; 1S3X A; 3OVN A; 1IKW A; 2E2Q A; 3HM9 A; 4GKJ K; 2O8D A; 4Z4G A; 3O3F A; 4BE1 A; 1VSF A; 3N4P A; 5EVZ A; 1K8A O; 3LDS A; 3R1X A; 4NLC A; 3QIN A; 2RF2 A; 1GOA A; 5DMR A; 4KHS A; 2JGU A; 4B1Y B; 5KPZ A; 4M3Z A; 4JS4 A; 3KZB A; 3IFR A; 4DQQ A; 1QTM A; 2OA8 A; 3K2P A; 3J7A P; 3D2E A; 1S1W A; 3SNN A; 3LAL A; 3D45 A; 3WXI A; 1XWL A; 3MCP A; 4H0O A; 5IT9 O; 1NK9 A; 3ENB A; 4ISF A; 2FBX A; 5AQQ A; 4JKG B; 2CH5 A; 3O9Q A; 4H0Y B; 1RT3 A; 4JYA K; 1RDU A; 3K57 A; 3ZET A; 3O1B A; 1T6D A; 3C6U A; 2P9I B; 3THX B; 3FFK B; 1RCH A; 3VQ6 A; 5LJW A; 1Q8I A; 4CK2 A; 3SUP A; 5AQW A; 2YKM A; 3VEN A; 4FLV A; 3CCL N; 1D9F A; 3ZT4 A; 3PIP L; 1EO1 A; 4DTP A; 3L3V A; 5C10 A; 3ZSQ A; 4DFM A; 4LFC K; 1YIT N; 2HND A; 3CMA N; 2HNZ A; 4LF5 K; 5JS1 A; 4KH5 A; 2G8K A; 5J2M A; 2Z1H A; 2XY5 A; 3EZ5 A; 4DV3 K; 5BRD A; 3M8P A; 3I55 N; 5KQ8 A; 3CME N; 1LCU A; 4K41 A; 3O4N A; 5EY4 A; 3LAM A; 1OH8 A; 1HNI A; 4CJW A; 3TSU A; 1RT7 A; 1TKX A; 5AR0 A; 3SQ1 A; 3NVK A; 4DLG A; 3WUH A; 2WTU A; 1BWF O; 1UA0 A; 1IG9 A; 2HB5 A; 3QDK A; 3UKR A; 4CD3 A; 4JAX A; 1RDW X; 3THW B; 4X64 K; 3F2K A; 4IFE A; 2JLE A; 4O44 A; 3CER A; 3SQ2 A; 3L0Q A; 3KTQ A; 3L2U A; 4G1Q A; 4Y0W A; 3NF6 A; 3HOT A; 2OCE A; 3OYD A; 1N8R O; 2FSK A; 5I3U A; 3FFI A; 5GAG P; 4OPK A; 1NK4 A; 1XC3 A; 4BQZ A; 3OA9 A; 3CQ8 A; 2BH1 A; 5BRE A; 4FJX A; 4U7B A; 1VQM N; 4CHP A; 3I0R A; 4CBW A; 4CJK A; 2XY7 A; 4CZE A; 4F9O A; 2ZE2 A; 4J2E A; 3BZC A; 4OPH A; 2UU9 K; 1TUY A; 3GBT A; 4OPJ A; 4M45 A; 3A5L C; 2RPI A; 3AA3 A; 1NK8 A; 4CHN A; 3K5L A; 4CZG A; 2O8E B; 3PV8 A; 3HK2 A; 1ZYQ A; 1ATS A; 4CBU A; 1BIU A; 3IDH A; 2NRT A; 4FJ5 A; 5LJV A; 3VER A; 1JL2 A; 5JLF A; 1JCE A; 5HRO A; 4DTS A; 2ZGY A; 5DK5 A; 4AHU A; 3ULE B; 4YOR A; 3VES A; 3JXU A; 4FWS A; 3D6R A; 3H1V X; 1K9M O; 4YHH K; 4M7X A; 2PBD A; 3A8Y A; 4AHV A; 2EX3 A; 4B1W B; 2CGJ A; 2E2P A; 3G0Z A; 1O13 A; 2DFF A; 3T1Y K; 3EEQ A; 1S1V A; 1U2V A; 5AQR A; 2ZQB A; 4JRP A; 4Z4F A; 1IG8 A; 5C12 A; 4DU3 A; 1L3S A; 4IOC L; 2AP1 A; 3R3L A; 1H1V A; 4M7Y A; 1RT2 A; 4AHT A; 3KKR A; 3AVC A; 2HHV A; 3SAH A; 5AZI B; 1K8K A; 5AFU A; 3J81 O; 2OPP A; 4FLT A; 2BE2 A; 4MQ3 A; 2E2O A; 1SS6 A; 4R5P A; 3ZT1 A; 4OVL A; 4BY9 C; 4FZY A; 3LPT A; 4JN4 A; 5AQZ A; 2RHK A; 3CFO A; 4LSN A; 2F96 A; 5EXW A; 4DMN A; 4M42 A; 4WQ5 A; 4CIG A; 3MN7 A; 4BRP A; 5HL7 L; 4FPB A; 3HPG A; 1W0H A; 2Y1J A; 3LM2 A; 3SBG A; 1KTQ A; 4KV8 A; 2VWJ A; 2HHH K; 3CJ7 A; 3U4L A; 3ITH A; 4CJ7 A; 1VQ7 N; 4CGJ A; 1KRP A; 1BL3 A; 1LW0 A; 1KAY A; 1BHL A; 1T7P A; 4KI6 A; 2EHG A; 3CCJ N; 3VA0 A; 2KFN A; 3DWL A; 3CPW M; 3M8S A; 1SKW A; 3NGI A; 1HNZ K; 5J1E A; 4KRE A; 1KVC A; 4DS4 A; 3QEP A; 3BP8 A; 4H8K A; 3WNG A; 3TAN A; 4DU1 A; 2GEM A; 2B4J A; 4IFY A; 4B1Z A; 3F73 A; 4N47 A; 3UKU B; 4CF0 A; 4FJK A; 3SJH A; 3SLC A; 1T6C A; 4NXN K; 4QAG A; 3LAK A; 4BGB A; 4DTN A; 4JI8 K; 4Z94 A; 1VQ4 N; 1D5A A; 3CCQ N; 1MWM A; 3ZX3 A; 1GLD G; 3GDQ A; 3QET A; 4H5N A; 4BVO A; 4BWM A; 3WXJ A; 1KFD A; 3C95 A; 2IGI A; 2OAN A; 1G15 A; 1P8Z A; 4I2P A; 1SUQ A; 4MO4 A; 1UWB A; 1IKX A; 3V9X A; 3R6M A; 3DLG A; 4FPA A; 3V9Z A; 1SKS A; 1HR0 K; 4B9N A; 1HPZ A; 4M63 C; 2HF3 A; 3J80 O; 3CD6 N; 1BA0 A; 1XMQ K; 4H5V A; 4LF4 K; 3E66 A; 1RT4 A; 5CZ1 A; 5GAD P; 3P38 A; 2WC9 A; 3BDP A; 1Y64 A; 1J6Z A; 4CF8 A; 2P51 A; 1HNX K; 2X74 A; 3K9J A; 3KK1 A; 1VQL N; 3OYJ A; 4CJV A; 1JXB A; 3EY1 A; 3S3M A; 3L4I A; 2D0A A; 2IDO A; 4KB1 A; 3ZYY X; 1FXX A; 4BC3 A; 1SL0 A; 4DSI A; 4DFJ A; 1XQS C; 4GVE A; 1BUP A; 4HTL A; 3HL8 A; 3FE1 A; 4BRO A; 4MFB A; 3M3Z A; 1OVY A; 3IS9 A; 3KK2 A; 1NJW A; 2G8V A; 3MX2 A; 3VPZ A; 1X9M A; 4IDK A; 4DKW A; 3RRH A; 1NK7 A; 4LSL A; 4FZX C; 3EKU A; 3SV4 A; 1DLO A; 1QQN A; 3AVA A; 1YF5 L; 4G9Z A; 3OYI A; 4DTU A; 5HOO A; 3LZJ A; 3IG1 A; 5CE3 A; 5C25 A; 3KD1 E; 2KLA A; 4MDB A; 5IWA K; 1NK6 A; 3G71 N; 1J5O A; 4UY8 O; 3LAN A; 3ZSZ A; 1JLC A; 4RW6 A; 1L3V A; 2G8F A; 4NYF A; 2XY6 A; 3HT3 A; 3DRR A; 4CCH A; 3V1O A; 1QSY A; 2A6A A; 2GUP A; 4BWJ A; 4FJ9 A; 3NBP A; 1T03 A; 2Z1J A; 2B6A A; 3V9S A; 1O1W A; 3H46 O; 4KHQ A; 1MU2 A; 1KAZ A; 3KLI A; 3ATU A; 3U9Z A; 4FYD A; 1KAX A; 4HVJ A; 2FXU A; 3P5J A; 2O4G A; 5LMN K; 1HKB A; 4ICL A; 2W41 A; 3GOI A; 1ZXO A; 5JIC A; 1YVU A; 3QEI A; 1TK5 A; 3T19 A; 3OYG A; 1IO2 A; 1RNH A; 3U9D A; 3KKS A; 3RMC A; 2X78 A; 2JWK A; 2YNF A; 3O4W A; 4GKK K; 1HPM A; 1VSL A; 3O5B A; 4IFV A; 3TSP A; 3WT0 A; 4DTM A; 3TAQ A; 3IAY A; 5HRP A; 1K6Y A; 1Z26 A; 4LY7 A; 1RBU A; 1NU0 A; 4JI4 K; 2YX6 A; 1T8E A; 3E9O A; 2Q3S A; 4FO0 A; 2P9I A; 4W5T A; 3THX A; 4OKJ A; 1WNS A; 3IMX A; 4K8Z A; 3LDL A; 4IBN A; 2ZJP L; 4RW8 A; 5JMV A; 4C8K A; 2UXC K; 2QM1 A; 2QXL A; 4BG9 A; 4MO5 A; 2IAJ A; 3SQ4 A; 1E4G T; 1BOT O; 4WFN L; 5JVG L; 1X3N A; 4B3M K; 2NUB A; 3HTV A; 4ELU A; 1B9F A; 2BGG A; 2ZGZ A; 4B3O A; 1F21 A; 4C8L A; 1FK9 A; 4H4O A; 4YOU A; 4CGD A; 3L2R A; 4BC2 A; 4JI7 K; 2IS3 A; 3D0P A; 3TR8 A; 4F4K A; 2ETJ A; 1NGI A; 4FM0 A; 2HHS A; 3ZSY A; 4A5A A; 3THW A; 2V7Z A; 3J7Z O; 3KLH A; 4CF9 A; 2FC0 A; 3DAW A; 2HST A; 4ZTJ A; 3ZLJ A; 4DF8 A; 1WB9 A; 4M3T A; 2HOE A; 3UB5 A; 2O8B B; 1BG3 A; 2OPQ A; 2VG5 A; 1Q81 O; 3H08 A; 5AQP A; 1EKE A; 2QI2 A; 4YFU A; 2GV9 A; 4BG8 A; 4A59 A; 3TAF A; 3DXM B; 4K0K K; 3SPZ A; 3LL3 A; 1WBB A; 4FCY A; 2E6L A; 3PO5 A; 4QS9 A; 1B9D A; 1EXQ A; 2Q31 A; 3NDK A; 1QZ5 A; 4CEO A; 3DLH A; 1DTT A; 2ASO A; 3MN9 A; 1U48 A; 3I56 N; 4DCH A; 1GLF O; 3CJC A; 3P83 D; 4E1N A; 3TAB A; 1S9E A; 2DFE A; 2QWQ A; 3KLE A; 4DR5 K; 4W5R A; 3VQ5 A; 1ZBF A; 4CJU A; 2KFZ A; 3FZM A; 3T1H K; 4KKO A; 4YDU A; 4ILJ A; 2O8E A; 3ZT2 A; 4KHW A; 4LD0 A; 5AQM A; 4BRD A; 3HYF A; 3F5T A; 3NCI A; 2YHX A; 2IOC A; 5GIN A; 1U45 A; 5GIP A; 1HJO A; 4NYN A; 1YAG A; 1JLE A; 1GLC G; 4DR6 K; 4E19 A; 1TYQ B; 4EAH D; 3OBY A; 3DI6 A; 1W7A A; 1C1C A; 3ULE A; 3G6E N; 1L3U A; 3PX4 A; 1ZBI A; 4GNI A; 3VN5 A; 4BR7 A; 2BDP A; 4EIA A; 3VTH A; 3DLR A; 3JYT A; 3SAF A; 1Q9X A; 2HBM A; 4AF1 A; 3DYA A; 3C65 A; 4C8N A; 3K59 A; 1VK0 A; 3NF8 A; 2IVP A; 1A5W A; 4J2B A; 4Z4H A; 3ATV A; 3C0B A; 3OYE A; 1YJN N; 4DR7 K; 3RRG A; 4IG3 A; 1Q18 A; 1X9W A; 5AZJ B; 5ADX A; 1RTI A; 1ZC6 A; 4OKK A; 3RR7 A; 4HCC A; 2G8I A; 4L3Q A; 5AQG A; 4QS7 A; 4CJS A; 4BE2 A; 4CVN E; 3PX0 A; 4E1M A; 3DJC A; 3CC4 N; 1C0T A; 5FRM A; 4JI6 K; 1BI4 A; 1SAZ A; 3F9M A; 4QCL A; 1LWF A; 2P9S B; 1QQC A; 3SV3 A; 1BDG A; 4LF8 K; 4V19 S; 2Q1N A; 3OS0 A; 3WXM B; 4LF6 K; 3IKM A; 1C1B A; 3AGR A; 5AQK A; 1RT5 A; 4MDA A; 4BRN A; 2F8S A; 2PY5 A; 2OPR A; 2G8U A; 4FWN A; 3VMF B; 3KWG A; 3NHG A; 1ZBL A; 5BR8 K; 3E1Y A; 2QWO A; 4F2S A; 4FWQ A; 2V51 B; 5FLX O; 1JLQ A; 4PL7 A; 5KQD A; 3NH2 A; 4AIL C; 3QEV A; 3DLK A; 1NGE A; 4NCA A; 2GEL A; 3A5O C; 2HBL A; 2FBY A; 3TAM A; 3L4Q A; 4DB3 A; 1IBL K; 4LF7 K; 2P9P B; 1VQ9 N; 3UKU A; 2D5R A; 3SCX A; 1J54 A; 1VQK N; 4FJH A; 4YDU C; 3SUN A; 4X65 K; 2GBZ A; 1WAJ A; 4KB0 A; 1M90 O; 3ENO A; 4GV6 A; 3T7Z A; 1LOT B; 4CD1 A; 4OJR A; 4B3S K; 4YOY A; 2Z1G A; 4CFB A; 4DQI A; 3HZ6 A; 4C8M A; 4WE1 A; 4KAZ A; 1NNE A; 1C0G A; 4BDZ A; 1SZ2 A; 2UXD K; 2NRV A; 2GUI A; 3AO4 A; 3VQD A; 2HBK A; 3CCV N; 3BZK A; 2HNY A; 4I7F A; 4KHU A; 1VQO N; 1IKY A; 3QBW A; 4PKG A; 3ZSX A; 3NAE A; 4CJF A; 5ADX H; 4N5S A; 4E0D A; 3LP2 A; 3BEX A; 4OGE A; 4B1X B; 3VEO A; 1GLJ O; 2E20 A; 3V6D A; 3KIO A; 1QZ6 A; 2QWR A; 2ZJQ L; 3WXL A; 5AQO A; 3ZX0 A; 2Q97 A; 5HLF A; 4WYB A; 4CEF A; 1YIJ N; 3QML A; 4B9M A; 4PL8 A; 4CFC A; 1L5U A; 2YNG A; 4CI6 A; 1N34 K; 1KCF A; 1ILY A; 1TKZ A; 2ZD1 A; 3MEE A; 3MK6 A; 3U3G A; 4CW7 B; 1ITG A; 3ZX2 A; 2VQF K; 4WCE L; 1JKH A; 1JLG A; 1VSM A; 4DF4 A; 2H3G X; 1WLJ A; 3CJ1 A; 4DR2 K; 2UXB K; 5JS2 A; 1SV5 A; 3LDP A; 3VF4 A; 2XY8 A; 4JKA A; 3SMP A; 4CHQ A; 1WSJ A; 1HNW K; 1CXQ A; 4AHS A; 3HXM A; 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