The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
34
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sequence length |
122
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structure length |
122
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Chain Sequence |
TPASRYITDMTIEELSRDWFMLMPKQKVEGPLCIRIDQAIMDKNIMLKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSFPGHTIEDVKNAIGVLIGGLEYNDNTVRVSKTLQRFAWGS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Non-structural protein 1
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| publication title |
X-ray structures of NS1 effector domain mutants.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Influenza a virus
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| molecule tags |
Viral protein
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| total genus |
34
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| structure length |
122
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| sequence length |
122
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-12-01 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2GX9 A; 3P31 A; 3M5R A; 3O9U A; 2RHK A; 3D6R A; 4OPA A; 3O9T A; 3P39 A; 3O9R A; 3P38 A; 3RVC A; 2KKZ A; 4OPH A; 3O9Q A; 3O9S A; 3KWI A; 3KWG A; 3L4Q A; 3F5T A; 3EE9 A; 3OA9 A; 3EE8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2D0P A; 3CI5 A; 5IT9 O; 4FWM A; 5AQX A; 2OZM A; 2KW4 A; 4FW1 A; 3CHW A; 3CER A; 3U6F A; 3QEX A; 4H5W A; 4CF2 A; 5J2M A; 3DJC A; 2HF4 A; 3RMD A; 2VQE K; 2YHX A; 4BRE A; 3O9R A; 5M1K A; 4LF7 K; 3W3D A; 4CD1 A; 3OY9 A; 4RWT A; 1HPM A; 3VQB A; 1RDD A; 4KAZ A; 2YHB A; 4FJJ A; 4RW9 A; 3CME N; 2DFH A; 3GE1 A; 2NRZ A; 4JI1 K; 1XMO K; 3RSE B; 4CGD A; 1N5Y A; 1ITG A; 3ZCM A; 1T05 A; 1B9F A; 4F2S A; 4H0V B; 4FVM A; 1NGI A; 3AO1 A; 3H1V X; 2Z1G A; 3ZSO A; 3OJS A; 3M1F A; 1NJX A; 1S1X A; 3N4P A; 4CZE A; 1M1K O; 2PYJ A; 4L8R B; 4DU1 A; 2Q3S A; 4BRN A; 3MN5 A; 3IG1 A; 3VQC A; 4BE0 A; 3T1A A; 5FPN A; 2P9U B; 2QTD A; 3CQY A; 2UUB K; 3LAK A; 5AQG A; 1KVA A; 2GTD A; 2Y1J A; 1VQ9 N; 5C42 A; 3RSE A; 2HHH K; 4H5R A; 3HP9 A; 4CEF A; 1JCE A; 3K0S A; 5LY3 A; 4V19 S; 1DEJ A; 1RBT A; 3CCJ N; 1QVG M; 3OBW A; 3VET A; 1NG9 A; 2OPQ A; 3TAP A; 1DGK N; 4H5T A; 4FCY A; 1YJN N; 4CBX A; 2ZJR L; 3UE5 A; 4E7K A; 4O0I A; 3SBG A; 3KLH A; 1VQ6 N; 3TAB A; 2P9U A; 1IV0 A; 4KI4 A; 2HOE A; 4CW7 B; 1VQO N; 1NKE A; 1ZXO A; 4FJH A; 4DV2 K; 1HX1 A; 4CFD A; 2YNF A; 3PSI A; 4M45 A; 2FC0 A; 1HLU A; 1VSE A; 3PIO L; 1NGB A; 3CD6 N; 3SUO A; 3T19 A; 3PIP L; 3QEV A; 2FBV A; 4RCH A; 3AVL A; 3JYT A; 2YI1 A; 3VEX A; 4R5P A; 4H8K A; 4U7B A; 5AFU A; 1RDW X; 4FVU A; 1DLO A; 1S9G A; 1Y64 A; 3D2E B; 3LDN A; 4BC2 A; 2VGM A; 4PHT X; 2BAN A; 3CFO A; 3AVJ A; 1WSH A; 5AQY A; 5M1N A; 4FJ9 A; 1RBV A; 1ESV A; 1YVU A; 3SQ4 A; 1IBM K; 4OO1 J; 1IBL K; 5EXW A; 4DWI A; 4C8N A; 1KLM A; 1BOT O; 5AQH A; 1NK4 A; 2B4J A; 4EAH D; 5GIP A; 2HF3 A; 4FL9 A; 4YOV A; 3SQ1 A; 4DFJ A; 5AQW A; 3D2E A; 5HRO A; 2EWS A; 2KLA A; 1YT3 A; 1ZC6 A; 4H0P A; 4IEI A; 2P5O A; 1VQN N; 1HUX A; 1IJJ A; 1H1V A; 5C12 A; 3AVI A; 2X78 A; 3P5J A; 3SBT A; 3THV A; 1WNS A; 3JS6 A; 3D2F B; 3QIP A; 3R3L A; 3RRH A; 4FPA A; 1OKJ A; 2Q0R A; 4DR5 K; 3QIO A; 4KRF A; 3P4I A; 3MWP A; 1RT1 A; 4MFB A; 4NB4 A; 3AVH A; 4BQL A; 4CEO A; 2OCE A; 4RW4 A; 2CGJ A; 3HP6 A; 1J54 A; 4Q0B A; 2Z1I A; 1OH7 A; 1BL3 A; 1TUU A; 3D2F A; 3O9T A; 3Q7C A; 1OH8 A; 4JRP A; 3L4I A; 3O9S A; 1WSJ A; 2KZZ A; 5KI6 A; 1SKR A; 4M3Y A; 1MDU B; 3NF6 A; 3VQ8 A; 4W5N A; 4KHP K; 2E88 A; 2HVI A; 2YCH A; 2G8W A; 3PY8 A; 3RMC A; 1JL2 A; 5AQT A; 2YHA A; 1HKG A; 3MWT A; 1HJO A; 4KTZ A; 4FWO A; 3NGZ A; 2GBZ A; 3LP3 A; 3NH2 A; 4AH9 A; 4B9V A; 5HRP A; 5LMN K; 4K41 A; 5HBM A; 3BDP A; 2OPS A; 3MMV A; 4BC4 A; 4IFE A; 4MDA A; 4ICL A; 1S3X A; 4BRA A; 3LWM A; 2KQ2 A; 1N32 K; 2AJQ A; 1T8E A; 3AVM A; 4E0D A; 4G9Z A; 3D6R A; 4DG1 A; 4BDP A; 4YOX A; 1X1P A; 1WSI A; 3EYZ A; 1E3M A; 4AM6 A; 3WUH A; 5LJW A; 1NJZ A; 1DTT A; 4TSX A; 5EVZ A; 3EY1 A; 3PO5 A; 1DKG D; 2BGG A; 2GUI A; 1BUP A; 4JK7 A; 4DU4 A; 1YTA A; 1YXQ A; 3AA5 X; 3F9M A; 4LSN A; 3MXM A; 2VG5 A; 5F0X A; 2P9L A; 1VQL N; 1D8Y A; 2HND A; 3KKS A; 3L2R A; 5AQR A; 1BDG A; 4FZY A; 1E4F T; 5GAG P; 3HM9 A; 1GOC A; 3OVN A; 4ID1 A; 5EOY A; 5J2P A; 1T6C A; 3O3F A; 4DV7 K; 3K9J A; 4O0J A; 1NK7 A; 4IXC A; 1XWL A; 1TKD A; 1NK8 A; 1VK0 A; 4I9L A; 4BE2 A; 3NGI A; 3L0Q A; 3FFK B; 3TU5 A; 3NAE A; 3T1Y K; 1L3U A; 4JI6 K; 5KPZ A; 1S22 A; 3CFR A; 3G71 N; 3RVC A; 4CHZ A; 3P83 D; 4MO4 A; 2OAN A; 4W5T A; 3O9Q A; 5AQQ A; 3DLE A; 3LPU A; 3CCM N; 3EKU A; 2OPR A; 4Z0U A; 4WFB L; 4JI3 K; 3A5L C; 3FFI A; 2IOC A; 3ZT2 A; 4FJK A; 2G8H A; 4F3T A; 1NGF A; 3WXK A; 4NCA A; 3CCS N; 2E8A A; 2QKK A; 3EZW A; 3QBW A; 1IKY A; 4CJT A; 4IO9 L; 4ILH A; 1Q82 O; 2D0A A; 3LWL A; 1BQM A; 3OTO K; 4DSI A; 1Q18 A; 4AHU A; 4M3R A; 4FM0 A; 4H4M A; 3I56 N; 3P31 A; 1NGG A; 3TAQ A; 4ELT A; 2YNG A; 1C0F A; 4JHD B; 3AVF A; 1YF5 L; 3J8A A; 3CFP A; 1C1B A; 1QHA A; 1TK0 A; 4FJX A; 2HHT A; 3DLK A; 3T1H K; 3LP0 A; 2KKZ A; 3SYZ A; 2QI2 A; 1G99 A; 3EKS A; 3HI0 A; 4QCL A; 3WXL A; 4X65 K; 5FRM A; 1EO1 A; 1N36 K; 1KCF A; 2GEM A; 3H08 A; 5AQF A; 2CGK A; 3VN5 A; 5D3G A; 4JI5 K; 4JHD A; 2A41 A; 4E7J A; 3MN7 A; 3AO4 A; 4W5R A; 4YDU A; 1KAZ A; 4E7I A; 4NLB A; 3VEO A; 3WXM B; 3TAE A; 1D4X A; 2FBY A; 4OPH A; 1YIJ N; 5AQU A; 3LM9 A; 1TAU A; 2EHG A; 1TV6 A; 4A5B A; 4LH5 A; 1NM1 A; 1K9M O; 4JS4 A; 2VWJ A; 3SV3 A; 4O5B A; 3CC7 N; 2WBN A; 3CC2 N; 5KPT A; 2Z1J A; 1LW0 A; 4EHU A; 3AA4 A; 4BGA A; 5J2N A; 2WTU A; 3OBY A; 3HT3 A; 5F2R A; 3HRG A; 2KFZ A; 4FSV A; 4EZ6 A; 3SNN A; 2NRT A; 1BU6 O; 2WC9 A; 3A5N C; 3C6H A; 1QQM A; 3CET A; 4YNQ A; 4B9L A; 4DTN A; 1C0M A; 2V52 B; 3CJ9 A; 1YAG A; 4CK3 A; 4FJL A; 1VSF A; 3CC4 N; 3M5R A; 5GAH P; 4MQ3 A; 4M3X A; 3MEG A; 4FZX C; 4B9U A; 1SQK A; 3THX A; 1LV5 A; 3LPT A; 4B3S K; 1RDA A; 3ZSW A; 5A2Q O; 3MX5 A; 2KTQ A; 3IMX A; 5GIO A; 2HW3 A; 5C2F A; 4KB1 A; 4BRQ A; 4KHS A; 3VA3 A; 1CZA N; 2O8D B; 3SAH A; 2X74 A; 1XNQ K; 4IZ9 A; 2QEX N; 1NGD A; 3I55 N; 1KQS M; 1VSH A; 3V81 A; 3FZL A; 3CPW M; 4B9Q A; 1J5E K; 3DI6 A; 4PKI A; 2QWP A; 2FBX A; 2JGU A; 4AHV A; 2D5R A; 1K8A O; 3KKR A; 4JI4 K; 2O8D A; 4IFV A; 3V4I A; 5TKW A; 4BC3 A; 3TSQ A; 2A40 A; 2HST A; 3CJ1 A; 1EP4 A; 1RT7 A; 2Q97 A; 4KH6 A; 4OGC A; 3A8Y A; 3HSC A; 3DLB A; 5LMU K; 1X9W A; 3WXI A; 4DU3 A; 3VTH A; 4CZJ A; 2HHQ A; 3U3Y A; 4K42 A; 4H03 B; 3R1X A; 1FXX A; 5BN8 A; 4YFU A; 2FXU A; 4M41 A; 3FZH A; 4NXM K; 3AO2 A; 2VYP A; 3OYB A; 3OYN A; 1ZYQ A; 4KH4 A; 4OKJ A; 3QEP A; 1RT2 A; 4A59 A; 3MCA B; 2V7Z A; 2ZJP L; 4B9S A; 3VQ6 A; 2CGL A; 4CK2 A; 1HR0 K; 1I94 K; 5AQK A; 5JS2 A; 1TK5 A; 1JLQ A; 3L2W A; 2XY6 A; 1FJG K; 3Q7B A; 3KZB A; 1QS4 A; 3EN9 A; 3VEV A; 4Z4F A; 4FWQ A; 5C2D A; 2CH6 A; 3OYK A; 2QM1 A; 3IUC A; 4JKF A; 4OGE A; 4J2E A; 1XHX A; 4W5O A; 3MK6 A; 2HVH A; 3A5O C; 3WNF A; 3BP8 A; 3AY9 A; 5I9E B; 3VF4 A; 4M3T A; 4R79 A; 4HUG A; 3DLH A; 3C6U A; 3MXJ A; 1HQU A; 4M7Y A; 4Y0W A; 4JI8 K; 4ISG A; 1BHL A; 3SAG A; 5IWA K; 1QQN A; 1ASW A; 1GLJ O; 1IG9 A; 1WB9 A; 1C6V A; 1FKO A; 3G10 A; 3RR8 A; 5DM7 L; 1JLA A; 5C0Y A; 1RDU A; 5I3U A; 4GMJ B; 3M3Z A; 4IG0 A; 2ASO A; 3NVK A; 4QS8 A; 4AHS A; 2QW9 A; 3CJC A; 1YIT N; 3KD1 E; 3KK2 A; 2GWJ A; 3O1B A; 1ZBL A; 4B1Z A; 2GX9 A; 4FW2 A; 4CJ7 A; 1KVB A; 4CJL A; 4DUY K; 3G25 A; 4K25 A; 2D0O A; 2RHK A; 2A1S A; 4CJ5 A; 3VEW A; 3RMB A; 3VER A; 4CJF A; 3OJU A; 4B3M K; 5AQS A; 5J1E A; 1IH7 A; 3K9K A; 5DMR A; 5AQJ A; 2D1K A; 1HNV A; 4FLY A; 3V9Z A; 2IGI A; 3OYL A; 1XMQ K; 4FLT A; 4BR7 A; 1Y97 A; 4C1N K; 1L3T A; 4FK4 A; 3O4Q A; 2HHU A; 1VRT A; 4FZZ A; 3V9S A; 1RT5 A; 4JAX A; 4CGI A; 4N76 A; 3RR7 A; 1BCM A; 1NK0 A; 2BH1 A; 4BR9 A; 5I42 A; 4DQQ A; 3WQT A; 2YHY A; 4EP4 A; 4DTP A; 4K43 A; 2FLO A; 1EXQ A; 1IKV A; 4OKK A; 1A5W A; 2IDO A; 1VSM A; 4CJ4 A; 4GKJ K; 4IOA L; 4FM2 A; 3EZ5 A; 4BDY A; 4DQI A; 3VPZ A; 2HMI A; 3M8P A; 4JLH A; 1C0G A; 1KAX A; 2VG6 A; 4EFH A; 4IJN A; 5E41 A; 2O4G A; 1K73 O; 4BRL A; 3KWI A; 3MEC A; 4F2R A; 1QQC A; 3HZ6 A; 3M8S A; 5M1P A; 1BIU A; 4YY3 K; 1GLC G; 1C0T A; 3WNG A; 3SJH A; 4DHY A; 1VQ4 N; 2RN2 A; 4K8Z A; 2YNI A; 4JV5 K; 2OYQ A; 1LAW A; 1HKC A; 4F9O A; 4DLE A; 4YOR A; 1U48 A; 2F8T A; 3VQ4 A; 3VQE A; 1NJI O; 5J2Q A; 4J8F A; 3D45 A; 1QSY A; 2IAJ A; 1VQ5 N; 4CEA A; 3RRG A; 5BRF A; 4CZG A; 2ZQB A; 4HTL A; 1FKP A; 3ENB A; 3R8E A; 1W9H A; 3NH1 A; 2LSN A; 4NYN A; 3AVA A; 3P1G A; 4NCB A; 2IVN A; 5H1S Q; 3D0P A; 4KHU A; 4KV8 A; 3VEY A; 1WUA A; 1NOY A; 1T6D A; 2PZS A; 1BQN A; 3ZT4 A; 4DTO A; 5AQN A; 5GAE P; 1YVN A; 3L4Q A; 4FWN A; 4EZ9 A; 4CGH A; 1VQK N; 3L2Q A; 4FK0 A; 3J7A P; 3DOK A; 4NLC A; 2I7P A; 3O4N A; 3WT0 A; 3HTV A; 3VMF B; 2YJE A; 3OYA A; 1RBU A; 1TKX A; 1NU0 A; 3LZJ A; 3QLH A; 2VGN A; 3GOI A; 3FZM A; 3H46 O; 3CQX A; 4BVP A; 4IOC L; 3K2P A; 3S41 A; 1FK9 A; 1WAF A; 3LP1 A; 1NGE A; 4BR4 A; 3ZEU B; 3ZX0 A; 4JYA K; 3CQ8 A; 1RCH A; 3EO3 A; 4CBW A; 4J2A A; 4YDU C; 4A5A A; 1SKW A; 3M6G A; 3DRS A; 1BO5 O; 3CF5 L; 3ENO A; 3HBT A; 3QBX A; 1SL0 A; 1VRU A; 4CEB A; 4DSL A; 2F96 A; 4DS4 A; 4FWR A; 2XY7 A; 5TKY A; 3JXU A; 1TKZ A; 3CJ7 A; 3B6O A; 4JK8 A; 2W41 A; 4IBN A; 3ZEU A; 1HNX K; 3KVG A; 5HLF A; 4A61 A; 4CD3 A; 4GKK K; 4Z94 A; 3VES A; 4JK9 A; 2AP1 A; 1K8K B; 3PUF A; 4JN4 A; 3VQA A; 2ZM6 K; 1NGC A; 1N34 K; 2CH5 A; 3DRP A; 1FW6 A; 3AO3 A; 4DSF A; 4FJG A; 3FE1 A; 1HJR A; 2WUS A; 1WN7 A; 3TAR A; 3AVG A; 3O1W A; 4KH5 A; 2B5J A; 3TR8 A; 5BRD A; 4JKG B; 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2Q0U A; 4BQZ A; 2ZWH A; 1KVC A; 3AGR A; 3SQ2 A; 3PX0 A; 4O5F A; 4CJ3 A; 3AVC A; 4B1Y B; 4CJR A; 4IKF A; 2P9S B; 2FF3 B; 3CJB A; 3PSF A; 1Z05 A; 3VA0 A; 1D9D A; 1S6P A; 4YOY A; 1MU2 A; 4CES A; 1NOZ A; 4XH5 A; 3R6M A; 3C65 A; 4M3W A; 2HNZ A; 3J7Y P; 3UIQ A; 1NK9 A; 1YTU A; 1J5O A; 3LAM A; 4HCB A; 1MWM A; 2YHW A; 4BG9 A; 2W40 A; 2DFE A; 3K5O A; 1NKC A; 2P9S A; 1RT3 A; 1ATS A; 1S1W A; 2GV9 A; 4DV3 K; 4X64 K; 1REV A; 1I3A A; 4C8O A; 3AAP A; 2QK9 A; 1NKB A; 1T03 A; 2DTU A; 3HOS A; 4XH4 A; 4OJR A; 5K14 A; 3TSU A; 4KB0 A; 3H3N O; 1SKS A; 1UAX A; 2W42 A; 4FJ7 A; 5FPD A; 3CCQ N; 2A6A A; 4JKD A; 2UUC K; 3LM2 A; 3OYF A; 1GLE G; 4JI7 K; 4DB3 A; 5BN9 A; 2PAV A; 1KAY A; 3LDP A; 2HMP A; 4IDK A; 4CHQ A; 3AVN A; 2F7T A; 4PKG A; 4AHC A; 4WF9 L; 5FLX O; 4CIF A; 1C1A A; 2A1R A; 4JEP A; 1Z26 A; 4C1N I; 5BRH A; 3GG4 A; 3OYM A; 4CEQ A; 4IFY A; 4FWK A; 4JRQ A; 3SK3 A; 2OA8 A; 4ILJ A; 4OVL A; 3C95 A; 3DRR A; 2I5J A; 3I0R A; 3LL3 A; 5EU7 A; 4DTJ A; 2YV0 X; 2XO7 A; 4OPJ A; 3O80 A; 4BG8 A; 4HTU A; 4O4G A; 4Y1D A; 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