The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
34
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sequence length |
122
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structure length |
122
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Chain Sequence |
b'TPASRYITDMTIEELSRDWFMLMPKQKVEGPLCIRIDQAIMDKNIMLKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSFPGHTIEDVKNAIGVLIGGLEYNDNTVRVSKTLQRFAWGS'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Non-structural protein 1
|
| publication title |
X-ray structures of NS1 effector domain mutants.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Influenza a virus
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| molecule tags |
Viral protein
|
| total genus |
34
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| structure length |
122
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| sequence length |
122
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-12-01 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3P39 A; 3D6R A; 3KWG A; 3O9Q A; 3P38 A; 2KKZ A; 2RHK A; 3L4Q A; 3O9R A; 2GX9 A; 3O9S A; 3M5R A; 3O9U A; 3KWI A; 4OPH A; 3P31 A; 4OPA A; 3OA9 A; 3F5T A; 3EE8 A; 3RVC A; 3EE9 A; 3O9T A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3KK3 A; 2OZM A; 4B3M K; 3AA3 A; 4X64 K; 5ADX H; 1VQO N; 3OS0 A; 2WON A; 3FR0 A; 5F1X A; 3KTQ A; 3QIN A; 3E9L A; 4H0V B; 3WNE A; 1M1K O; 2BDP A; 1G15 A; 4O5B A; 4PHT X; 4KHN A; 3OYH A; 4BRA A; 4W5Q A; 2B5J A; 1GLL O; 4BRQ A; 4BE1 A; 1U48 A; 4RW7 A; 2Q2R A; 1HKG A; 5CY4 A; 1YAG A; 2ZGY A; 4EHU A; 1CZB A; 2O8D B; 1FKO A; 4O5F A; 5C25 A; 4LH5 A; 1VAZ A; 4BVP A; 2ZJQ L; 3LWM A; 4BRK A; 5TKW A; 2HOE A; 1Q18 A; 3A5M C; 5LMU K; 4CBW A; 3AVI A; 3EKS A; 5E26 A; 4EIA A; 3O4N A; 4XH1 A; 1QZ5 A; 1HKC A; 4CK3 A; 1W2B M; 5M1Q A; 2Y1I A; 4IOA L; 1LCU A; 3THV A; 2F4V K; 4N76 A; 4BR7 A; 2IOC A; 4YY3 K; 4JS5 A; 2HVH A; 2YKM A; 4FWQ A; 1GLA G; 4BRP A; 1K8A O; 1YIJ N; 2E20 A; 1L3S A; 1OVQ A; 4IO8 A; 4DV2 K; 3A5L C; 4EZ6 A; 1NG9 A; 3MN7 A; 4KHQ A; 1K8K B; 3C65 A; 1TVR A; 3P38 A; 1IV0 A; 5M1N A; 3U3Y A; 2IVN A; 3MN5 A; 4YDU C; 1S1W A; 4CJW A; 3TWH A; 4DTX A; 1RBT A; 3I8B A; 3K2P A; 2OPP A; 4B1Z A; 1NJZ A; 1QE1 A; 3OA9 A; 4EZ9 A; 4BDZ A; 1BIS A; 2HBM A; 4CZH A; 2WC9 A; 5EY4 A; 2D1K A; 3KVG A; 3ZT4 A; 4CGD A; 1ZC6 A; 1TK8 A; 4OO1 J; 2VGM A; 4GVM A; 3LAM A; 2OPS A; 3JSM A; 1QZ6 A; 3AGK A; 4B1Y B; 3QIC A; 4O0I A; 4E3S A; 3HM8 A; 3CXC M; 2F8S A; 2W42 A; 4FPB A; 4DFP A; 5HRS A; 1U04 A; 5EVZ A; 3ULD A; 1U49 A; 1X3N A; 1KD1 O; 1BQM A; 2ZQB A; 4Z4I A; 1BCO A; 2F9T A; 4MO4 A; 3J7A P; 4JKH A; 4LC9 B; 1RT5 A; 4BR4 A; 4B1W B; 5E84 A; 3IS9 A; 3CJB A; 1BUP A; 4KI4 A; 4RTF D; 3MX5 A; 2F9W A; 1XMO K; 4LSL A; 4DV6 K; 3BY5 A; 4BRG A; 2NRR A; 4KHS A; 1YTU A; 1RT2 A; 3SAH A; 4FWS A; 3LL3 A; 3DRR A; 2NRT A; 2GEL A; 5KQD A; 5C15 A; 3RR7 A; 3LZI A; 4Q0B A; 4CFD A; 3LM2 A; 3QEV A; 1BQN A; 4K8X A; 4CHZ A; 3O9T A; 2QKK A; 1NGE A; 3AVK A; 4AF1 A; 3RSE A; 4BC5 A; 4F2R A; 3D45 A; 5I3U A; 4YOW A; 3OYA A; 3MAQ A; 1F21 A; 1TK0 A; 3NVK A; 3WEE A; 2LSN A; 3DLR A; 3NF7 A; 3CJC A; 4RW9 A; 3SCX A; 4OPA A; 3N4P A; 3DYA A; 2P9K A; 4CHP A; 1QTM A; 1D9D A; 2RF2 A; 1KVB A; 2WTU A; 2O8F B; 3FGU A; 1S1U A; 3CPW M; 4KHP K; 1EQY A; 1D4X A; 1NGA A; 1C0T A; 4RW4 A; 3SUP A; 1S1T A; 3MEG A; 3DLE A; 4BRE A; 1WLJ A; 3VMF B; 3CQX A; 1Q86 O; 4OLB A; 4CJV A; 4DR6 K; 5M1K A; 2VYP A; 4CIG A; 3PIO L; 1NGB A; 2DY4 A; 4CGI A; 4JD2 B; 4DSF A; 4C8M A; 2BUP A; 4FWR A; 2B4J A; 3PSI A; 1ZBL A; 2E8A A; 2YHX A; 1IBK K; 3CME N; 3M8R A; 3HI0 A; 3TAM A; 3QEX A; 3AV9 A; 2A5X A; 2E2Q A; 4BC3 A; 1DKG D; 3O4Q A; 4FJX A; 4DTP A; 3KWI A; 3TAN A; 5JMV A; 3AO4 A; 1ESV A; 4XEI A; 2FC0 A; 4FCY A; 1D8Y A; 4CHY A; 1NKE A; 4CJ4 A; 4FK4 A; 1JXB A; 2B6A A; 4JEP A; 4H5W A; 4DFJ A; 5AQW A; 2P1J A; 4DLE A; 3D7E O; 3MK6 A; 3TSU A; 3I56 N; 4YOR A; 3TU5 A; 4FM0 A; 1MU2 A; 3FFK B; 2YJE A; 5J2N A; 3HOT A; 2P5O A; 1C1A A; 3UKU A; 2P9U A; 3ZT2 A; 2F8T A; 3FZK A; 2RKI A; 3K9K A; 1W9H A; 1WSE A; 4FJM A; 2HVI A; 1YVU A; 1YTA A; 2CH5 A; 2FSK A; 4CE9 A; 5J2Q A; 3AVM A; 2YKN A; 1P8Z A; 5AFU A; 5FLX O; 3IFR A; 1NKB A; 3VGK A; 3ENB A; 3Q7B A; 2QWM A; 3PUF A; 1D5A A; 1C0G A; 1TKX A; 5JS1 A; 2NRW A; 3C95 A; 4ID5 A; 3HST B; 2P9P A; 2YHW A; 5BPM A; 2WBN A; 3O6W A; 3CER A; 3ID8 A; 3FE1 A; 3IUC A; 2OYQ A; 4QCL A; 4KO0 A; 4W5R A; 4FL9 A; 4BAC A; 5CZ2 A; 5KTQ A; 3PO5 A; 3VEZ A; 1HNI A; 5AQP A; 2P9S A; 4CES A; 4H0P A; 2E2P A; 3OYE A; 1RDD A; 2NLX A; 3TAR A; 1E3M A; 1WB9 A; 2IVO A; 4PL8 A; 5AQS A; 5HRR A; 3VQQ A; 3CCJ N; 2G8U A; 3A5O C; 3WXL A; 1R0A A; 2V51 B; 3VN5 A; 3ALY A; 4B9S A; 5AQX A; 1RTD A; 4DLG A; 3ZSO A; 4WQ5 C; 5KRS A; 1ATN A; 3GG4 A; 2FBY A; 1JLC A; 4J2E A; 3I0S A; 4B1X B; 3AA4 A; 1EKE A; 1VQ5 N; 4JN4 A; 2DTU A; 4KH6 A; 1WAF A; 3QFP A; 2O8D A; 3EL2 A; 1VQ7 N; 4I2P A; 3LDN A; 4O55 A; 4JI3 K; 4DU4 A; 3TSQ A; 3ZYY X; 4B3T K; 3UIQ A; 1U45 A; 4DV5 K; 1RDA A; 3WQT A; 1RGI A; 4N56 A; 3V9Z A; 5C12 A; 4J2A A; 1MWK A; 3EZ5 A; 4HCB A; 3VQB A; 4J2B A; 1BA1 A; 3NE6 A; 4PL7 A; 2ASO A; 4NXM K; 3WNG A; 3NBP A; 1LWF A; 2VWB A; 5SZT A; 3OBW A; 4K42 A; 2Y1J A; 3CFR A; 1NM1 A; 4B3O A; 3T7Z A; 4CIE A; 5CYQ A; 3DLK A; 3LP3 A; 3I0R A; 1ATR A; 4H5R A; 1KQS M; 1WAJ A; 3ZSZ A; 4UQG A; 1TAQ A; 5T7B A; 2W40 A; 1S1X A; 3FZF A; 2RHK A; 3O3G A; 1C0F A; 2QWR A; 3ZT1 A; 3NF8 A; 2IS3 A; 5AQI A; 3RR8 A; 1N6Q A; 4CGG A; 3AVG A; 3C6U A; 1NK6 A; 4BRC A; 4C23 A; 1C0U A; 3PX0 A; 5F2R A; 5LJW A; 2PAV A; 4DTM A; 1HPM A; 4CGJ A; 1HQE A; 1GLB G; 2HB5 A; 1NKC A; 5AQO A; 3UB5 A; 5AQV A; 3HT3 A; 4CEQ A; 5AQF A; 4H8K A; 3K5L A; 5KPT A; 2YI1 A; 1M90 O; 3HZ6 A; 5JLF A; 1LAV A; 1UA1 A; 5SWM A; 1NK7 A; 2HST A; 3M3Z A; 4G1Q A; 2V7Y A; 4H5V A; 4E19 A; 1IH7 A; 1YIT N; 3VQD A; 1KFD A; 2HHT A; 4NYF A; 4IEE A; 3ZSX A; 4IKF A; 2QWL A; 3MX2 A; 5GIP A; 2YHY A; 2X6S A; 3RSE B; 1Q9X A; 1UWB A; 1NGG A; 4AHS A; 3DOL A; 5LL6 Z; 4DR3 K; 1LAW A; 1X1P A; 4B9V A; 1HKB A; 1BHL A; 4H5N A; 1S6P A; 1ZBF A; 3DAW A; 2EWS A; 3WEE B; 3ZT0 A; 5A2Q O; 3NH1 A; 5KRT A; 4DTO A; 4KPY A; 2J4R A; 1ASW A; 1GLE G; 3AVN A; 5CR4 A; 1X9W A; 4DG1 A; 2P9K B; 3M5R A; 1FKP A; 2HHU A; 4C1N K; 5FPN A; 2Q97 A; 4U7B A; 4LSN A; 1NOZ A; 4KHU A; 1GOC A; 3PY8 A; 3OHR A; 2G8K A; 1OH8 A; 4JKB A; 3WXI A; 2NUB A; 3ZSR A; 2NRX A; 5HL7 L; 3S41 A; 1RTI A; 3QML A; 3SYZ A; 2Z1J A; 3P4I A; 3V9U A; 5C24 A; 1S5J A; 4BY9 C; 2XY6 A; 4JKD A; 4E7J A; 3DXM A; 1H1V A; 3CIP A; 4DQ8 A; 2HMI A; 1B9D A; 1NLV A; 4OVL A; 1WUA A; 2QM1 A; 3L3U A; 1MWM A; 2G8W A; 3D2E A; 4F2S A; 3VA3 A; 2QXL A; 4WQ4 C; 1JCG A; 1VSI A; 1QQO A; 4ZHR A; 3BP8 A; 4DTU A; 1W7A A; 3NF9 A; 4W5N A; 2VWK A; 3CET A; 3O8M A; 3QBX A; 4CK1 A; 4C8L A; 4FJI A; 4NB4 A; 4JKF A; 3SUN A; 1YJW N; 3FFI A; 5AQN A; 3BGR A; 3EEQ A; 4CK2 A; 3VGM A; 3K58 A; 3H45 C; 1CZ9 A; 4CHO A; 1RDU A; 1Q82 O; 3UKU B; 1IO2 A; 4CJR A; 1VSE A; 2P9U B; 5FRO A; 4MO5 A; 3LPU A; 3NMU A; 3OYI A; 1BU6 O; 2X74 A; 4BRL A; 1HYS A; 3B8A X; 2NRH A; 5I42 A; 5CYM A; 1S22 A; 4GW6 A; 2XY7 A; 1N34 K; 3SUO A; 3H1V X; 4CJL A; 5BRF A; 2WUS A; 1VQP N; 1OH7 A; 4DSE A; 4DV0 K; 2QKB A; 5ADX A; 1KAZ A; 3AGR A; 3L2U A; 3DJC A; 2V52 B; 3TAP A; 3MEC A; 2NRV A; 3WNF A; 4OKK A; 5CHI A; 5I9E B; 4AHR A; 4YOY A; 5EXW A; 4IOC L; 3U8X A; 2P9P B; 3G6E N; 3E66 A; 4AM7 A; 3IRX A; 3NF6 A; 3RMC A; 3WXM B; 4CJU A; 3SV3 A; 4DR5 K; 2DFE A; 2P9S B; 2E2O A; 3IDH A; 3OYD A; 3TAF A; 4EP4 A; 1EX4 A; 5AZI A; 4DS4 A; 4I6M A; 1SUQ A; 2HF3 A; 3U9Z A; 4C1N I; 2VCP A; 3R1X A; 3SAG A; 1HJO A; 2ZJR L; 3KK1 A; 1RCH A; 3QLH A; 3UKR A; 2YX6 A; 2GUP A; 3HPO A; 1HNX K; 4LF7 K; 3HK2 A; 3VET A; 4CED A; 1JLB A; 2ZE2 A; 3OW2 M; 3CC4 N; 3OYM A; 3LPT A; 1VQ9 N; 2RN2 A; 1NK4 A; 1TV6 A; 1SL0 A; 3E01 A; 3DXK A; 3KLI A; 4R5P A; 1B9F A; 4GKK K; 5ELZ A; 4ILH A; 4V19 S; 3SLC A; 2JWK A; 2GWJ A; 2VWJ A; 3VOV A; 1SKR A; 4BWM A; 4CW7 B; 3LDQ A; 3K9J A; 3VTI A; 1E4G T; 1G99 A; 1O1W A; 4IFE A; 4F3T A; 3KKR A; 3AAR A; 4E7I A; 5AR0 A; 4CJT A; 1IG9 A; 4EP5 A; 1XMQ K; 1IBL K; 3F2K A; 2Q0U A; 4FO0 A; 4CEE A; 4DV4 K; 2GWK A; 3OYJ A; 2WFB A; 1VSL A; 2OCE A; 4M3X A; 3R6M A; 4FWK A; 5AQU A; 3V1R A; 1P90 A; 1NMD A; 1DGK N; 5C42 A; 4RW8 A; 3G71 N; 2EHG A; 1S3X A; 2W41 A; 3E9O A; 4FW1 A; 1GLJ O; 4QS7 A; 1KAX A; 1RBV A; 3OS2 A; 1JXE A; 1GOB A; 1VHX A; 3HL8 A; 4FJ5 A; 4IZ9 A; 4LF5 K; 3KK7 A; 1CXQ A; 2CGJ A; 2Z1G A; 4WCE L; 4DQP A; 1LW2 A; 1RT1 A; 3HRG A; 5FPD A; 3HJF A; 1GLD G; 4DQS A; 1NGD A; 4AHC A; 2GTD A; 3MED A; 3KK2 A; 2D0B A; 3VQE A; 2ZGZ A; 4FJ8 A; 4FK2 A; 4W5T A; 3O9U A; 4KB0 A; 4FLV A; 3DLH A; 1IKY A; 3P31 A; 3CJ9 A; 1L3T A; 3NAE A; 4QOZ B; 4BC2 A; 3HTV A; 4BDY A; 4DSK A; 1QQM A; 4DV3 K; 1FXX A; 4FLT A; 3BZC A; 4NLC A; 3T3F A; 5LMN K; 1NK9 A; 3NH0 A; 4HUF A; 5MLC Q; 2PYL A; 2A3Z A; 2YCH A; 3C0B A; 1KFS A; 4JKC A; 4BRM A; 1KLM A; 3RMB A; 4OGC A; 3ASM A; 4AHT A; 2O4G A; 3IG1 A; 3VQC A; 5AZJ A; 1WSG A; 4TSX A; 4RW6 A; 1QSY A; 1HNV A; 1S1V A; 3VQA A; 3WNH A; 4UY8 O; 4EAH D; 5DM6 L; 1VQ6 N; 2Q0R A; 1JCE A; 3CM5 A; 5TKY A; 4NLB A; 4JI6 K; 1DLO A; 4DV7 K; 4CFA A; 1WSI A; 5BRH A; 3OYK A; 1VSF A; 5EOY A; 4GV9 A; 4OKE A; 1W97 L; 3D0P A; 4QAG A; 2DFH A; 1NU0 A; 4Z4C A; 3QET A; 4J2D A; 3N4Q A; 3M8P A; 4X66 K; 3DWL A; 5B8H A; 2D5R A; 5EX5 A; 4JRP A; 1VSD A; 3EE9 A; 4DCH A; 4Y0W A; 4WF9 L; 1BI4 B; 3QFU A; 1XC3 A; 4CF8 A; 3SQ4 A; 2NRZ A; 2D4W A; 4FOI A; 4QS9 A; 4DSJ A; 3DXM B; 3OYL A; 1U47 A; 3ID6 A; 1UAX A; 3K5M A; 5JS2 A; 1JL2 A; 4YOX A; 4CVN E; 5J2P A; 5BRE A; 3S3M A; 4FWP A; 3SAF A; 2VQF K; 3D2E B; 1NJW A; 1S9E A; 3ZET A; 1EO1 A; 1JCF A; 2D0P A; 3OYB A; 3OJU A; 4DR2 K; 4B9L A; 3ZLJ A; 3HP6 A; 1RBU A; 1XNQ K; 3FZL A; 3EN9 A; 2KKZ A; 3NVM A; 3JAM O; 3LDS A; 4ZTJ A; 3L4Q A; 4DWI A; 3T19 A; 3CCL N; 5BPN A; 3TR8 A; 1N33 K; 1NJX A; 1HUX A; 1NGJ A; 3R3L A; 5AQK A; 5C0Y A; 3MCA B; 4FYD A; 4H4M A; 3GE1 A; 2A6A A; 4AH9 A; 2H3G X; 2FXU A; 1J53 A; 3LDL A; 1HJR A; 3LM9 A; 4OX9 K; 4DUZ K; 3CF5 L; 1B92 A; 3L0Q A; 4CF1 A; 4DHY A; 3MWT A; 4WFB L; 3TAG A; 4JS4 A; 5BPL A; 5HRN A; 3M1F A; 4CJQ A; 1A5V A; 4CZE A; 1ZBH A; 2QI2 A; 1QVG M; 5DMR A; 4X65 K; 4GNI A; 4AQY K; 2GV9 A; 1XUP O; 1BDG A; 3J81 O; 4NYN A; 3VQ4 A; 1N5Y A; 1WSH A; 3P39 A; 4XH4 A; 3J80 O; 3M8Q A; 3JYT A; 4B1U B; 4CD3 A; 4FLZ A; 2Z1I A; 4CEB A; 2OZS A; 1RT3 A; 3OYC A; 3V9S A; 3L2Q A; 4DKW A; 3C6A A; 4KTQ A; 4CFC A; 1OH6 A; 4K43 A; 3A2F A; 5AZI B; 3W0L A; 3ZX3 A; 5JLH A; 4I6M B; 4BRN A; 3CPE A; 2YNH A; 1L3V A; 1LV5 A; 2KTQ A; 3G10 A; 1RT4 A; 1BA0 A; 4B3R K; 3PO4 A; 1C1B A; 3UKR B; 2FBV A; 3THX A; 4BVO A; 2O8C A; 3V9W A; 4DB3 A; 4GY2 B; 3P83 D; 4AHV A; 4Z4G A; 5FPE A; 4E1M A; 3DXK B; 3QB0 A; 3H46 O; 1T3V A; 4JYA K; 4C8O A; 2OAN A; 1X9S A; 1KRP A; 4F9O A; 4B8C A; 3HOS A; 3MEE A; 1WSJ A; 3CC7 N; 3U3G A; 1A5W A; 3TI0 A; 4A62 A; 1N8R O; 2ZWH A; 1R59 O; 3JS6 A; 4Z4F A; 4KTZ A; 1NOY A; 1TL3 A; 4IOX A; 3ZSW A; 3CJ7 A; 4KV8 A; 4BE0 A; 4PA1 A; 3CG7 A; 4O8U A; 4FXD A; 3PV8 A; 4CZG A; 4H0Y B; 5CE3 A; 1J54 A; 2GEM A; 3LAL A; 3MDQ A; 4BGB A; 3AO3 A; 1LWC A; 1TKZ A; 1JJ2 M; 3RMA A; 1RBR A; 3ENH A; 3G0Z A; 1NGH A; 1K73 O; 1T6D A; 4MLE A; 1NWK A; 2YV0 X; 4KHW A; 3H6E A; 1YI2 N; 3ZCM A; 1SS6 A; 3AVF A; 2A1R A; 3WXK A; 3OTO K; 2ZJP L; 3VPZ A; 1RFQ A; 2ASM A; 2PYJ A; 3OS1 A; 1V4T A; 1WBB A; 4CF0 A; 2OPR A; 4FWL A; 4LF6 K; 1J5O A; 3WUH A; 3ZSV A; 2KZM A; 2YJF A; 1NGI A; 3M8S A; 3TAE A; 2I5J A; 3ZSY A; 4R79 A; 3MXM A; 4HUG A; 3LAK A; 5GAE P; 4B08 A; 2YHB A; 4DMN A; 3H1Q A; 1LWE A; 3D6R A; 1RNH A; 4BC4 A; 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