The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
34
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sequence length |
122
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structure length |
122
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Chain Sequence |
TPASRYITDMTIEELSRDWFMLMPKQKVEGPLCIRIDQAIMDKNIMLKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSFPGHTIEDVKNAIGVLIGGLEYNDNTVRVSKTLQRFAWGS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
X-ray structures of NS1 effector domain mutants.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Influenza a virus
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| molecule tags |
Viral protein
|
| molecule keywords |
Non-structural protein 1
|
| total genus |
34
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| structure length |
122
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| sequence length |
122
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-12-01 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2RHK A; 3P31 A; 3O9U A; 3M5R A; 2GX9 A; 3O9Q A; 3O9T A; 4OPA A; 2KKZ A; 3D6R A; 3L4Q A; 3O9R A; 3KWG A; 3RVC A; 3P39 A; 3P38 A; 3OA9 A; 3F5T A; 3O9S A; 3EE8 A; 4OPH A; 3EE9 A; 3KWI A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3C6A A; 2KFZ A; 1I39 A; 3AA5 X; 3QBX A; 1C6V A; 1XUP O; 1IG8 A; 3K58 A; 1L3V A; 1KVA A; 3H3N O; 3VQP A; 3ZLJ A; 1RBT A; 3CQY A; 1KLN A; 4TSX A; 5FDL A; 3QER A; 3A5N C; 2IGI A; 2V51 B; 2KTQ A; 4GY2 B; 2HMI A; 4JD2 B; 4DFM A; 5GIP A; 4CIF A; 1QSS A; 1YJN N; 2O8F B; 1D5A A; 3LDN A; 1HPZ A; 5KI6 A; 3F9K A; 1C0G A; 1YI2 N; 1W2B M; 4BAC A; 5EU7 A; 3V81 A; 1VQK N; 2KHO A; 3TI0 A; 3AAR A; 1BCM A; 3EEQ A; 5J2M A; 2QWN A; 4DR3 K; 1BDG A; 2ASM A; 1RNH A; 4IG0 A; 3ZX2 A; 4I2P A; 4NYN A; 4JS5 A; 1HNX K; 4DTR A; 3V1Q A; 1DLO A; 3W0L A; 2E6L A; 3V9W A; 3HPH A; 4ILH A; 1LW0 A; 4DFJ A; 3NF6 A; 3TSP A; 5M1Q A; 2HF3 A; 4CJ5 A; 3PX4 A; 2OPP A; 4CJS A; 4FL9 A; 3T1Y K; 3SK3 A; 2Z1I A; 3SUP A; 2V52 B; 5AQX A; 2XY8 A; 3CIP A; 1N5Y A; 5AZJ A; 4WQ5 A; 3MWP A; 4BG8 A; 1EX4 A; 4FJ8 A; 1SL0 A; 3H45 C; 1VSL A; 3A0I X; 3N4Q A; 3ID6 A; 1KCF A; 3KTQ A; 1RDD A; 4KHY A; 1U45 A; 3BEX A; 1TKX A; 3E66 A; 1FXX A; 3P5J A; 3ZSW A; 3HPG A; 3M8Q A; 3OYI A; 3KK7 A; 1R59 O; 1NNE A; 3O1W A; 1KFD A; 1GOC A; 1X3M A; 2YNI A; 2ATQ A; 3NE6 A; 3R9P A; 3SUN A; 4X65 K; 3OJU A; 4DSJ A; 4FSV A; 5LMN K; 2VGM A; 3C94 A; 3MCA B; 3TTD A; 1IO2 A; 4HVJ A; 3HJF A; 2HHQ A; 3HM9 A; 2YJE A; 3NH2 A; 3QEP A; 4CES A; 5I42 A; 3AVJ A; 3LP3 A; 5JVH L; 4FLX A; 1NJY A; 1ITG A; 3V9S A; 5MLC Q; 2P9L A; 2OPQ A; 2OAN A; 3EZW A; 1MWM A; 1S1W A; 1SKR A; 3RTV A; 4F9O A; 4KI6 A; 5DMR A; 4ZTJ A; 4KTQ A; 3I56 N; 3QB0 A; 4FPA A; 1MA9 B; 3D6R A; 1LW2 A; 4NXN K; 2FBT A; 1S22 A; 4R5P A; 2FSN A; 3AAQ A; 4H5T A; 1U48 A; 3NCI A; 5AQJ A; 1VAZ A; 4JYA K; 3THY A; 1HMV A; 5KTQ A; 3HP6 A; 1LOT B; 5AQN A; 3IAY A; 3P83 D; 4L3Q A; 3CC4 N; 4DF4 A; 1U49 A; 1CZB A; 3VF4 A; 2YHX A; 3PO4 A; 4RW9 A; 2KQ2 A; 2QWP A; 1Z26 A; 1VRT A; 1U6Z A; 2ZM6 K; 4DV2 K; 3L2Q A; 4M63 C; 2HHT A; 2Q31 A; 4FM2 A; 1Q81 O; 3J80 O; 1H1V A; 3ZT1 A; 2GEL A; 1GLA G; 2FBV A; 3THW B; 4MDA A; 3RWU A; 3SPY A; 1QHT A; 4M7Y A; 3S3N A; 2D1K A; 5HRO A; 2FC0 A; 3AA4 A; 1ATR A; 5KRS A; 2VQF K; 3CFR A; 3BY5 A; 4K41 A; 2O8F A; 2PZS A; 1WNS A; 3TTF A; 4GVM A; 4BRL A; 4K8X A; 5SWM A; 1U2V A; 3ZEU A; 1HKC A; 3K2P A; 5GAH P; 2DFH A; 3I33 A; 4HTU A; 4WFN L; 1VQ8 N; 3NGI A; 1L3T A; 2EHG A; 4KTZ A; 3CJA A; 4RTF D; 2W42 A; 3K9K A; 4DR6 K; 3VPZ A; 4HUE A; 3MAQ A; 3MN5 A; 3WNG A; 4K8Z A; 3KLG A; 4G1Q A; 5C2D A; 3L3V A; 4JNE A; 4DG1 A; 2WON A; 2IVO A; 1NKE A; 2O8C B; 1VSE A; 3HZ6 A; 2GUI A; 3NHG A; 1HYZ A; 3MXJ A; 4CJQ A; 1NMN A; 4K0K K; 3VOV A; 1WN7 A; 4KTW A; 2KZZ A; 4EZ9 A; 1E4G T; 5KPT A; 2G8I A; 2HHU A; 5HL7 L; 3DRR A; 2QTD A; 4BC3 A; 3BZK A; 3TAF A; 2P9P A; 3K0S A; 3IS9 A; 3AVG A; 1NU0 A; 2UXB K; 4JI6 K; 2E2Q A; 1UA0 A; 2ZE2 A; 4K42 A; 4EZ6 A; 1X9S A; 3AO3 A; 3VEZ A; 4LH5 A; 1EQY A; 4FWP A; 5AZI A; 2CH5 A; 1RDW X; 3G10 A; 1RFQ A; 5KPZ A; 4OLB A; 5FRM A; 1NWK A; 4Y1D A; 3DMJ A; 3OYN A; 4FW2 A; 2G8W A; 3L2W A; 1CZA N; 2D4W A; 3EKS A; 3WNE A; 3H6E A; 1S9E A; 1W97 L; 2NRT A; 4IEE A; 2HBL A; 4O44 A; 2YCH A; 1RT1 A; 3QIC A; 3VQQ A; 1EWR A; 2RF2 A; 1RDU A; 1JCG A; 2GX9 A; 1I3A A; 4B1X B; 3UKR B; 4FJL A; 1DGK N; 2FSJ A; 3OYK A; 4HTL A; 2PY5 A; 3OS1 A; 2Q0R A; 4FJM A; 2WOM A; 4B9S A; 1CXU A; 4FCY A; 4FJG A; 3D2F A; 4DMN A; 4QOZ B; 1BU6 O; 4M3Z A; 2P9I A; 1VK0 A; 1QE1 A; 4FJN A; 2O8E A; 1TUY A; 3FE1 A; 3LAM A; 2XY5 A; 4J8F A; 4A62 A; 4CK3 A; 1BA0 A; 1JXB A; 1TYQ B; 4Q5V A; 1Q18 A; 1QZ6 A; 4BR5 A; 1BIZ A; 2OZM A; 1HX1 A; 1QQN A; 5BRD A; 3VTI A; 1NK7 A; 1C1B A; 4CJ3 A; 4CIG A; 4DTJ A; 3F9M A; 4O5B A; 2BGG A; 2VYP A; 1ESV A; 4RW4 A; 4IFY A; 5BPL A; 1HR0 K; 3U4L A; 1XI1 A; 2HBM A; 4IOA L; 3UKU B; 3TSQ A; 2P5O A; 2NRZ A; 3O9U A; 3MN6 A; 4CFB A; 4CK1 A; 1NK9 A; 4DLE A; 1LV5 A; 3PSF A; 3HI0 A; 4E0D A; 5LL6 Z; 4CJ4 A; 4W5R A; 1NKC A; 3T1H K; 1XWL A; 1EET A; 2PBD A; 1Q9Y A; 1BA1 A; 5F1X A; 2P9P B; 5GIN A; 3ZX0 A; 4ID1 A; 2VGN A; 3HBT A; 2OCE A; 3CJ1 A; 2E20 A; 3RRH A; 4JHD A; 4BWJ A; 4X66 K; 1RTI A; 3RMC A; 4GKJ K; 5AQQ A; 4XH5 A; 2EX3 A; 3T69 A; 3SQ0 A; 1R0A A; 1GOB A; 3A5L C; 3CJ7 A; 2D0C A; 2F96 A; 1DTQ A; 4CGI A; 1K8A O; 3SQ1 A; 4DTP A; 2DY4 A; 4AHT A; 3DLK A; 4KHU A; 4CBU A; 5CR4 A; 4H4M A; 4B9Q A; 1NG9 A; 1SKS A; 3DXK A; 4WF9 L; 3FLC O; 4HCC A; 1YTA A; 2HF4 A; 3CYM A; 3K5N A; 1MU2 A; 1IG9 A; 1Y64 A; 5AQI A; 1HNZ K; 4KFB A; 1YAG A; 1U2V B; 3M5R A; 1UAX A; 1WBD A; 1LWC A; 3U3Y A; 2QWM A; 2YKM A; 3O4N A; 2P9S B; 2WFB A; 3D2E B; 3RSE B; 3U6F A; 2VWB A; 3CJB A; 1Z25 A; 4E1M A; 1A5V A; 1O1W A; 2P9U B; 4YOR A; 4FWN A; 3OYF A; 4KB0 A; 3O5B A; 3MXM A; 5A2Q O; 4MLE A; 3HM8 A; 4K43 A; 4FLV A; 1B9F A; 3QIO A; 2O8E B; 2ZGZ A; 2YV0 X; 1A5W A; 1RBV A; 1QQC A; 3V9X A; 3SQ2 A; 4W5T A; 1XQS C; 4N41 A; 5HRR A; 1BQN A; 4UQG A; 3CF5 L; 1J6Z A; 4CGF A; 4Z4E A; 4YOW A; 3UKR A; 4J2D A; 4CZH A; 1L3U A; 5KQD A; 2YJF A; 4CFD A; 4JI3 K; 2E88 A; 1NGH A; 4XIU A; 2W6K A; 2FXU A; 4O0J A; 5BR9 A; 3F73 A; 3ZSZ A; 1ASW A; 3PSI A; 4R79 A; 3CI5 A; 3D2E A; 3G4S N; 1KFS A; 3HL8 A; 3VMF B; 1RDA A; 3AO4 A; 4GV9 A; 4CZL A; 1GOA A; 3R1X A; 1XMO K; 2Q0U A; 1D4X A; 3KLE A; 1LCU A; 4B9T A; 4OVL A; 3DLB A; 4KI4 A; 4B1W B; 1VQM N; 4YOT A; 4CGD A; 4WFB L; 3OBW A; 1IBK K; 3T3F A; 4LFB K; 4B1Y B; 3OYG A; 3THX A; 1SL2 A; 1LAV A; 3RMD A; 3M1F A; 4O5F A; 3VGM A; 4DU4 A; 4E7J A; 4J2E A; 4I9Q A; 1RT5 A; 3NGZ A; 4AF1 A; 2HHS A; 3BUZ B; 2QK9 A; 3W3D A; 4B9L A; 3CCR N; 4E7K A; 3WEE B; 4J2A A; 2X6S A; 1Q86 O; 1N32 K; 3MCP A; 4CEE A; 5AQV A; 3J7Y P; 3C95 A; 1JCE A; 3O9R A; 4O55 A; 1JLE A; 1XMQ K; 4E7L A; 2IC3 A; 2HVI A; 3NH1 A; 1HNI A; 1HUX A; 1VSJ A; 5EXW A; 3OYM A; 4BG9 A; 3DXM B; 2BUP A; 4JLH A; 3VN5 A; 2GV9 A; 1RTJ A; 1HRH A; 4DSL A; 2P9K B; 1I94 K; 1VHX A; 3G6E N; 4B8C A; 3K9J A; 2ASO A; 4PKI A; 5AQF A; 3BF3 A; 1TYQ A; 4BC2 A; 3WQU A; 4W5O A; 2V7Z A; 1WAF A; 3KLF A; 3IMX A; 3KHY A; 3UB5 A; 1HNV A; 1QQO A; 3N4P A; 4CFA A; 4A59 A; 4CEO A; 3PIP L; 5EOY A; 3JAM O; 4N76 A; 4JK8 A; 1QSL A; 3EN9 A; 3GG4 A; 3CME N; 1YIT N; 1BWF O; 4C23 A; 3RMB A; 4KH5 A; 4E89 A; 3MK6 A; 3CFO A; 3ZSQ A; 3MMV A; 4FWM A; 3VGK A; 3LP0 A; 5JMV A; 5AQL A; 2P9K A; 1SS6 A; 2NRX A; 3ENO A; 4LF6 K; 2RPI A; 4CW7 B; 4KHN A; 5ADX H; 2G8U A; 1IKV A; 3GOI A; 3VQC A; 2RKI A; 3G0Z A; 1EO1 A; 3AO5 A; 1GLF O; 1ZBL A; 4BRK A; 1BQM A; 4JKG B; 4F8R A; 1WUA A; 3E1Y A; 3OA9 A; 1Q7Y O; 2F9T A; 4HUG A; 3JS6 A; 4A2B A; 3TAG A; 4IFV A; 4DU1 A; 1S9G A; 3NGY A; 5AQU A; 1SUQ A; 3OYH A; 3VQB A; 4YNQ A; 1BO5 O; 3BZC A; 5HRS A; 4EHT A; 1KRP A; 4H0V B; 3NMU A; 4DR1 K; 3V9Z A; 3L6Q A; 4FLY A; 4Q0B A; 3L8B A; 3WEE A; 3ZET A; 4JK7 A; 3DYA A; 1FW6 A; 2HMP A; 3S9H A; 2OTL N; 3WQT A; 1EP4 A; 5IWA K; 2JWL A; 3KK3 A; 1U04 A; 2YHA A; 4CHZ A; 2BDP A; 4Z4G A; 2NRW A; 4NXM K; 4BRP A; 4B1Z A; 4WQ4 C; 1J9A A; 3CFP A; 3K5M A; 1V4T A; 3H1Q A; 4JHD B; 4ELU A; 1V4S A; 3PY8 A; 3ENB A; 5AQR A; 1D8Y A; 3PIO L; 3KVG A; 1NGF A; 2I7N A; 4FJ7 A; 4U67 L; 5KPR A; 1KLM A; 4GV3 A; 1ASU A; 1KVB A; 1NGJ A; 4FW1 A; 3EY1 A; 4BDP A; 4CJP A; 1L3S A; 4EP5 A; 3RMA A; 3OYL A; 2O8B A; 3LDP A; 1GLC G; 1WSI A; 4EP4 A; 4JKC A; 1GLD G; 3I8B A; 4DQ8 A; 3LPU A; 1GLB G; 2NNW A; 4DFP A; 2E2N A; 4BE2 A; 2JLE A; 2OPR A; 4Z94 A; 4MDB A; 1NK0 A; 3AA3 A; 4CJU A; 4BR2 A; 4JKE A; 3THW A; 4LF7 K; 1CZ9 A; 4YOV A; 1ZBU A; 4DR4 K; 4DV7 K; 5CE3 A; 4H0O A; 3NF8 A; 3CQX A; 1QSY A; 4DTN A; 4DTM A; 1WSG A; 4FLU A; 4OO1 J; 3SAH A; 2P9I B; 1Z05 A; 4IG3 A; 1TVR A; 1RT6 A; 4H4O A; 3HVR A; 2HNZ A; 2Q3S A; 2ZD1 A; 3ITH A; 4PA1 A; 2QM1 A; 3J8A A; 1BI4 B; 2P9U A; 1J54 A; 4DUZ K; 1XHZ A; 3AVF A; 2KLA A; 3RSE A; 1BUP A; 4KRF A; 3IRX A; 2NLX A; 4CHQ A; 4KKO A; 4PL8 A; 4JI8 K; 4OPK A; 3WXL A; 3DLG A; 2RN2 A; 1LAW A; 4ISF A; 4BY9 C; 4FVM A; 1B92 A; 1MDU B; 2KKZ A; 2F8S A; 1DT9 A; 4JD2 A; 1NGB A; 2UUA K; 4FZX C; 3LP2 A; 3O3G A; 3LPT A; 3OYC A; 3QFU A; 2D0A A; 2W6L A; 2O4G A; 1FJG K; 2GBZ A; 3QEV A; 1WLJ A; 2P9L B; 3AVI A; 4RCH A; 2UUC K; 4FWK A; 5BPM A; 1G15 A; 3P31 A; 3QEI A; 1DEJ A; 1NLV A; 2UXD K; 4C8L A; 1YIJ N; 3CM5 A; 4FOI A; 5BRF A; 3VQD A; 2Z1J A; 3T1A A; 3K5O A; 2KFN A; 1YTU A; 3TTC A; 2ZQB A; 1RGI A; 3VEX A; 4L8R B; 1N6Q A; 3MX2 A; 3L4Q A; 2YKN A; 4AHS A; 1VQ9 N; 1X3N A; 4DSF A; 2ZJP L; 3LM9 A; 1JKH A; 5CZ1 A; 5T7B A; 5GAD P; 3DOK A; 2VG5 A; 3C65 A; 4KPY A; 4FVU A; 1YXQ A; 1F21 A; 4H0X B; 4YDU C; 2HB5 A; 3DRP A; 4JN4 A; 1K8K B; 3SV3 A; 5J1E A; 4OKK A; 4CJL A; 4BRC A; 1KXP A; 1T3V A; 4FK0 A; 4OLA A; 4AHC A; 3J7Z O; 1YT3 A; 2D0B A; 1ZXO A; 3CJC A; 4FZZ A; 3C6U A; 4WYB A; 3MED A; 3L4I A; 3TWH A; 1S72 N; 3ATV A; 3VEO A; 5FRN A; 4WCE L; 1RT7 A; 5KGW A; 4IOC L; 4BRF A; 1RBR A; 3AY9 A; 1E3M A; 1IJJ A; 2AJQ A; 5CY4 A; 3ZEU B; 3EYZ A; 2P5G A; 4BR7 A; 3CPW M; 4LF8 K; 4YDU A; 1UWB A; 5IT9 O; 4DTO A; 3TAB A; 1JLB A; 1T44 A; 4CZJ A; 3BF1 A; 5C0Y A; 3OYB A; 3ZSO A; 4CHN A; 4CZK A; 3ENH A; 1NGA A; 1WAJ A; 4CED A; 5HRN A; 1KAY A; 1S6P A; 4BR4 A; 4KHW A; 3UE5 A; 2HW3 A; 4Z4H A; 5ELZ A; 1RT4 A; 1XNR K; 4KHS A; 3IG1 A; 1REV A; 2F8T A; 1QVF M; 3VF6 A; 4BQL A; 2P51 A; 3LDS A; 1KQS M; 1T03 A; 4DQI A; 1VQP N; 3GL1 A; 1S1T A; 1N8R O; 3HRG A; 2KZM A; 4AH9 A; 4CZI A; 5F2R A; 5AQH A; 1TGO A; 3V4I A; 2FBX A; 1VSM A; 2O4I A; 4O4G A; 1BG3 A; 4FK2 A; 1VRU A; 3ZT4 A; 3OVN A; 1QTM A; 1YJW N; 2HBJ A; 4MQ3 A; 3ZX3 A; 2UUB K; 4BGA A; 3TAN A; 5C42 A; 4E1J A; 4M42 A; 3THV A; 1NJZ A; 1XC9 A; 1NOY A; 4F3T A; 1C0U A; 3BP8 A; 4FWO A; 4DCH A; 3TAP A; 3TAQ A; 4I7F A; 5CHI A; 5AQW A; 1KD1 O; 1WSH A; 3E9P A; 1ASV A; 2PAV A; 4WFA L; 2HVH A; 3AGR A; 5C12 A; 1VSK A; 3DI6 A; 4X64 K; 5AQY A; 4CZM A; 5AFU H; 2E1Y A; 1HYV A; 2G8K A; 3ISN C; 3O80 A; 4CVN E; 4E1N A; 3MN7 A; 3JYT A; 3S3O A; 2DFE A; 3ZSX A; 4BR0 A; 1JCF A; 5HOO A; 4B3M K; 3CM6 A; 3O4Q A; 4CHO A; 4DWI A; 3QEX A; 4B3O A; 5KQ8 A; 3VA0 A; 4Z4I A; 3LZI A; 1E4F T; 3LZJ A; 1YJ9 N; 3RR7 A; 1S1V A; 1RDC A; 4CE9 A; 4CEA A; 4EIA A; 5DK5 A; 4CJV A; 4M45 A; 2Q36 A; 1IKW A; 3NFA A; 2G8V A; 3CHW A; 3SJH A; 4JKG A; 4BE0 A; 4C8K A; 2QKK A; 3OJS A; 3L2U A; 3OYA A; 4F2R A; 4BWM A; 1HJO A; 3FZL A; 1J53 A; 4IOX A; 4XH4 A; 4M3T A; 3ASM A; 4QS8 A; 1HKB A; 3MN9 A; 1FKP A; 5AFU A; 3FFI A; 4KO0 A; 5BR8 K; 3O4W A; 5FPM A; 2ITG A; 3SNN A; 4JKA A; 4LSL A; 1D9F A; 4DKW A; 2F7T A; 3CET A; 3LM2 A; 4DLG A; 3U3G A; 3AA2 A; 1B9D A; 4BRN A; 4CF1 A; 2A40 A; 4YFU A; 4CK2 A; 4DB3 A; 4PQU A; 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