The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
34
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sequence length |
122
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structure length |
122
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Chain Sequence |
TPASRYITDMTIEELSRDWFMLMPKQKVEGPLCIRIDQAIMDKNIMLKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSFPGHTIEDVKNAIGVLIGGLEYNDNTVRVSKTLQRFAWGS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
X-ray structures of NS1 effector domain mutants.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Influenza a virus
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| molecule tags |
Viral protein
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| molecule keywords |
Non-structural protein 1
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| total genus |
34
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| structure length |
122
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| sequence length |
122
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-12-01 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3L4Q A; 3O9S A; 2GX9 A; 3P38 A; 3D6R A; 3M5R A; 4OPH A; 2RHK A; 3EE9 A; 4OPA A; 3O9Q A; 3EE8 A; 3O9R A; 3O9U A; 3P31 A; 3KWG A; 3KWI A; 2KKZ A; 3O9T A; 3RVC A; 3P39 A; 3OA9 A; 3F5T A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4J2E A; 4WCE L; 4CW7 B; 5CYM A; 3DXM A; 2P9L A; 2ASP A; 4LH5 A; 3L2U A; 3D6R A; 4PL8 A; 1J5E K; 3NH0 A; 1VK0 A; 1LCU A; 3WT0 A; 3SYZ A; 1OVQ A; 4I9Q A; 1LWF A; 3KWG A; 3A5M C; 4E0D A; 3CC4 N; 4Z4I A; 3UE5 A; 2AP1 A; 4XH1 A; 2XY5 A; 1Q18 A; 1U48 A; 4HUG A; 1C1C A; 3I55 N; 3D45 A; 1YXQ A; 2NRZ A; 2BTF A; 4DSI A; 3CER A; 1XMO K; 1IBM K; 4IJN A; 4CJV A; 5HRR A; 1N6Q A; 4FJL A; 3QIC A; 3G0Z A; 3IS9 A; 4AM7 A; 4DFJ A; 2FXU A; 1N5Y A; 2ZJQ L; 3CJB A; 3A5O C; 2HVI A; 5KGW A; 1WAJ A; 3E9O A; 3CD6 N; 4E7K A; 2WC9 A; 4CZM A; 2E2P A; 1LV5 A; 2LSN A; 1KVB A; 4DU1 A; 4OVL A; 1A5V A; 1JCF A; 4E7I A; 4ISF A; 5AQY A; 3HP6 A; 4DTM A; 4BRA A; 4W5T A; 2G8K A; 2G8W A; 3V4I A; 3FFI A; 4BGA A; 4BRK A; 4CZF A; 1BL3 A; 2VG5 A; 4DV0 K; 1XHZ A; 1VQM N; 1WLJ A; 4LFC K; 1MDU B; 4M3W A; 4CEQ A; 3SAH A; 4DV5 K; 5AZI B; 4WF9 L; 3DLB A; 3QFP A; 3SAF A; 3OYI A; 2FSN A; 1S1U A; 3WEE A; 3ZT4 A; 1QSS A; 2Q36 A; 3M8R A; 4FJ9 A; 2B4J A; 4CZG A; 3VEO A; 5GIO A; 3CQY A; 1NGF A; 3T7Z A; 1ZBL A; 1NJZ A; 3EE8 A; 1XC3 A; 3J8A A; 5M1O A; 3VQD A; 2W42 A; 3ENB A; 4FPA A; 4EIA A; 3ZSX A; 1SKW A; 3OYK A; 1VQN N; 3P83 D; 4NB4 A; 2WON A; 1T03 A; 4H5W A; 3THX A; 3AV9 A; 2YKN A; 3CG7 A; 4JS5 A; 3RMC A; 3SJH A; 4DQS A; 4OPK A; 1BQN A; 1VSF A; 1I94 K; 1BG3 A; 3VQ4 A; 4CJ4 A; 2D4W A; 3L2Q A; 4KPY A; 3OTO K; 4CJE A; 1Q81 O; 4PKH A; 2JWL A; 4CEE A; 3K5O A; 4PKG A; 3CCM N; 3VEN A; 4MQ3 A; 3RSE B; 1FKO A; 4X64 K; 5AZJ B; 1N33 K; 4Y0W A; 1ZBS A; 5FPD A; 1WN7 A; 2O8C A; 4I7F A; 4BGB A; 4BWJ A; 2FBY A; 3NMU A; 2HBM A; 1J54 A; 2HHH K; 4JI7 K; 2NRR A; 4QS9 A; 4BRQ A; 1TV6 A; 4WQ5 A; 4QCL A; 1IJJ A; 2FLO A; 1WAF A; 4KAZ A; 1SV5 A; 4H0Y B; 2Q0U A; 4YY3 K; 5J2N A; 1L3U A; 3QFU A; 3ZSY A; 3V9X A; 2HMP A; 3O4N A; 2X78 A; 1KAY A; 3CIP A; 3VQQ A; 3OY9 A; 1VSI A; 4DV3 K; 1NJW A; 3LP2 A; 3A5L C; 1L3S A; 4M45 A; 2WUS A; 2HHU A; 4DTU A; 2KW4 A; 5AQT A; 1E4G T; 4F3T A; 1D5A A; 3AVB A; 3D7E O; 4PY5 A; 4FO0 A; 3H1V X; 4KBO A; 4JYA K; 3LP1 A; 3I33 A; 2JGU A; 3HTV A; 3DXK A; 2YHW A; 4GV9 A; 1RDC A; 1X9J A; 2V51 B; 4LFB K; 5EOY A; 4F2R A; 1GLB G; 4JK8 A; 2KLA A; 3HPG A; 3PV8 A; 3HSC A; 2YHB A; 5EXW A; 1YTA A; 4FK0 A; 4Q0B A; 1RBV A; 4Z4H A; 4V19 S; 3J7A P; 4N47 A; 4DR3 K; 5HLF A; 5TKY A; 2OTL N; 1QZ6 A; 2A40 A; 2QWQ A; 4M7X A; 2A6A A; 1IH7 A; 2HHS A; 2ZJP L; 3LAK A; 3EKU A; 5LMU K; 1SL1 A; 2IVO A; 1OVY A; 4HWI A; 4JRP A; 5C24 A; 3PIO L; 3B8A X; 4FM0 A; 3NE6 A; 2CGK A; 3EYZ A; 3OYC A; 2HOE A; 3AGK A; 2P1J A; 4CI6 A; 1ZXO A; 4W5O A; 3CC2 N; 3L4I A; 4CEC A; 5LMN K; 3P1G A; 4CHN A; 4IKF A; 4I2Q A; 5CZ1 A; 1GLJ O; 3EY1 A; 1SAZ A; 1SS6 A; 1RTJ A; 4DFP A; 5BPM A; 3P38 A; 3CM6 A; 5I9E B; 4KH4 A; 1K8K A; 4CK1 A; 3O3H A; 4RW4 A; 3THY A; 4E7J A; 3FZK A; 4KI6 A; 3MWP A; 2CH6 A; 1S6P A; 4NXN K; 5JLH A; 3AVH A; 3LAL A; 4Z0U A; 3WXI A; 4IEE A; 4CK2 A; 1RDD A; 3VQE A; 5C25 A; 3A8Y A; 4CZK A; 4DR4 K; 5BPL A; 4B3S K; 4MLE A; 4BRG A; 1KRP A; 4IDH A; 5C12 A; 4BRE A; 2ZJR L; 1QQO A; 2ITM A; 4JD2 B; 2OAN A; 3ASM A; 4MFB A; 5TKW A; 3B6O A; 2P9S A; 4B1Y B; 3K9J A; 3RR7 A; 1Z25 A; 4I2P A; 5AQK A; 4IO9 L; 3CFR A; 3KK1 A; 4Z4G A; 2P5O A; 3MEE A; 2VQF K; 2OPR A; 1QS4 A; 2E6M A; 1FKP A; 2F96 A; 3H1Q A; 3QNN A; 4DR1 K; 5HP1 A; 1RT1 A; 3T1A A; 1IKV A; 1TGO A; 2X6S A; 2YNI A; 4CZI A; 4DF8 A; 5F0X A; 3T1H K; 1W2B M; 1V4S A; 1Z6R A; 3QBX A; 3I0S A; 1RT7 A; 4QAG A; 5KPT A; 4YOW A; 4Y1D A; 2KFZ A; 2E20 A; 3I8D A; 3QEW A; 1HKG A; 4CEZ A; 3SPZ A; 4DS4 A; 2O4I A; 3AO5 A; 3MX5 A; 5BN8 A; 4CBU A; 3R6M A; 4E3S A; 1NKC A; 1VSJ A; 2B5J A; 3OS2 A; 4CED A; 1RCH A; 2WOM A; 5AQS A; 4AHS A; 3QEI A; 3CME N; 3TSQ A; 3AA4 A; 3AVC A; 3V9Z A; 4B9U A; 1T6D A; 1VSH A; 4G1Q A; 3ZSQ A; 3PLA A; 3P31 A; 1UWB A; 1E3M A; 3TU5 A; 1TKX A; 5KQD A; 4BRF A; 1V4T A; 5BN9 A; 5EY4 A; 1U45 A; 4JK9 A; 3L2R A; 3VQC A; 4CGJ A; 4IFE A; 3C65 A; 4FCY A; 3HRG A; 3C7N A; 5CYQ A; 4OKK A; 1GLA G; 4YDU A; 4CGD A; 4R5P A; 4I9L A; 4H5T A; 3QEX A; 2UXB K; 1WNS A; 3HBT A; 1KVA A; 1X9W A; 2F9T A; 4ILJ A; 1DTT A; 4DF4 A; 1RIL A; 5AQZ A; 4IFV A; 5HL7 L; 4A57 A; 1SL0 A; 4F4K A; 1N32 K; 2YHX A; 4JV5 K; 1GLE G; 4CER A; 4AF1 A; 1BO5 O; 4DSE A; 1EET A; 4FZX C; 1NG9 A; 1HPZ A; 4GV3 A; 3KD1 E; 2BUP A; 1VQ9 N; 1GOB A; 3KJV A; 1NGB A; 5GIN A; 2GTD A; 1VQ5 N; 3ZLJ A; 2PY5 A; 1LWE A; 1ILY A; 4FWS A; 1VQP N; 5AFU A; 2IAJ A; 5BRH A; 1N8R O; 4BRP A; 4PQU A; 2OZS A; 5DM7 L; 2WBN A; 3HI0 A; 4FWQ A; 4RG8 A; 3JSM A; 2Q3S A; 4K8X A; 3TSP A; 1S9E A; 4CZH A; 3LM9 A; 3DOK A; 4DV2 K; 3PX4 A; 4PWD A; 2P9K A; 5HRP A; 3NF9 A; 2V7Y A; 1KQS M; 4O8K A; 4B9L A; 4JI2 K; 4C8M A; 4NCA A; 4BRC A; 3VN5 A; 4DS5 A; 3UKR B; 3U9Z A; 3OA9 A; 4FJJ A; 3LZJ A; 2P9K B; 1VQ6 N; 1TYQ B; 3DMJ A; 1NMN A; 2KTQ A; 4WQ5 C; 3TAE A; 4DTS A; 4DCH A; 1NGE A; 4FJG A; 1IV0 A; 2ASM A; 1KLN A; 4WFB L; 2UXC K; 1NMD A; 2HB5 A; 4JKC A; 5AJ3 K; 4KTQ A; 2VWB A; 3BUZ B; 4AQY K; 4NLB A; 4WYB A; 5C42 A; 4A61 A; 3K5N A; 4CJT A; 4FZZ A; 4KKO A; 3ULE B; 1KXP A; 1R0A A; 4L3Q A; 2FBV A; 2ZE2 A; 5FRO A; 1CXQ A; 2OYQ A; 3DLG A; 5FPN A; 3HPO A; 3R8E A; 1BWF O; 4EAH D; 1NGC A; 1JLA A; 4KRF A; 1WSE A; 4FPB A; 4CJW A; 3UKR A; 1ZC6 A; 3ISN C; 3TAQ A; 1N34 K; 3VGK A; 4AHR A; 4KRE A; 4M41 A; 4CZL A; 3EZW A; 4JNE A; 2EX3 A; 4FJM A; 4JI8 K; 2VGM A; 3SLC A; 4Y1C A; 3THV A; 3ATV A; 3LM2 A; 3Q7C A; 3KZB A; 1VSD A; 3MN9 A; 4W5N A; 3O8M A; 2Y1J A; 2OPS A; 1HYV A; 1VSK A; 1HR0 K; 5C10 A; 1CZ9 A; 2GWK A; 5AQU A; 2HF4 A; 2YNG A; 2E88 A; 3L8B A; 2Q31 A; 4LH4 A; 3MN7 A; 4JKA A; 3QB0 A; 2UUB K; 3CF5 L; 3J81 O; 2FSJ A; 4FK2 A; 4E89 A; 3V1O A; 3QDK A; 3WUH A; 1BHL A; 3ZET B; 5AFU H; 3LPU A; 2HNY A; 4CZE A; 3E9P A; 3W3D A; 2IS3 A; 2O8E B; 3VES A; 4FXD A; 4B9V A; 3WXM B; 3M8S A; 1Y64 A; 3V9S A; 2G8U A; 3ZSR A; 1LW0 A; 2D0O A; 3AVK A; 2HHX A; 5AQR A; 4OO1 J; 1ZBU A; 2OZM A; 5CR4 A; 3SAG A; 3Q7B A; 3F9M A; 1OH7 A; 1BA0 A; 3SI6 A; 3AVN A; 1WBD A; 4JKG A; 4CE9 A; 4TSX A; 3DYA A; 3MAQ A; 1B9D A; 2RE2 A; 3FZL A; 1X3N A; 4FJ5 A; 3O9T A; 3LWL A; 4FK4 A; 4FYD A; 5LL6 Z; 1RNH A; 3HPH A; 3HJF A; 4C1N K; 1T05 A; 2HBK A; 1YIJ N; 4JK7 A; 1TAU A; 2NNW A; 4C23 A; 1I39 A; 1HX1 A; 4FOE A; 4DR7 K; 3WXK A; 5AQM A; 1C0G A; 3RRG A; 3OYH A; 5A2Q O; 5KI6 A; 1BCM A; 4CHO A; 4KHU A; 1ATR A; 1YJN N; 2ZGY A; 4IZ9 A; 4MDA A; 1IG9 A; 4Z4E A; 1U47 A; 3K57 A; 2YKM A; 4C8K A; 3VQ5 A; 4RWT A; 3V1Q A; 1EXQ A; 4OPJ A; 1GLD G; 3KKR A; 4CBW A; 2A3Z A; 1BIZ A; 4B9Q A; 4CEB A; 4CCH A; 1XUP O; 3O9U A; 2EWS A; 2PFU A; 2A5X A; 1A5X A; 3GL1 A; 1Q9X A; 4GMJ B; 2IIR A; 4XH5 A; 4H4M A; 3KD5 E; 3RWU A; 1HNZ K; 2P9I A; 4BY9 C; 4JI6 K; 4LF5 K; 3LDQ A; 1X9S A; 4E7L A; 2CGL A; 1BA1 A; 3H45 C; 4GY2 B; 3DRS A; 3CCV N; 5C2D A; 3I56 N; 2QWM A; 4DR2 K; 3DOL A; 2W6L A; 4H0P A; 3IRX A; 1TK0 A; 2BDP A; 4MO5 A; 5I3U A; 4QS8 A; 3ZT3 A; 3ZET A; 4I6M B; 2YI1 A; 2NRH A; 2A1S A; 3CCQ N; 2PYJ A; 3K2P A; 3LDP A; 4FM1 A; 1NGI A; 3AAR A; 2ATQ A; 1RGI A; 2PZS A; 4EHU A; 4M3X A; 3O1B A; 1BCO A; 3G25 A; 4Z94 A; 4YOU A; 3I0R A; 2QI2 A; 3SK3 A; 1FJG K; 4DUZ K; 1Z05 A; 1NWK A; 2RN2 A; 2F8S A; 1WOQ A; 3FZM A; 1BUP A; 2X6N A; 4H5N A; 4A62 A; 1YIT N; 3FZH A; 4OLA A; 4JEP A; 4BVP A; 1NGH A; 4CZJ A; 4IG0 A; 3CCR N; 4KTZ A; 4LF4 K; 4YOT A; 3A0I X; 3VTH A; 2PBD A; 1RTH A; 3HP9 A; 1VSE A; 4K42 A; 4FWN A; 3OS1 A; 1BDG A; 3E9L A; 1JLG A; 3TSU A; 3C94 A; 3LDO A; 3U6F A; 3O1W A; 4ELV A; 5CY4 A; 3JS6 A; 3KTQ A; 1NBW A; 4CGI A; 3RMD A; 4B9M A; 1QHA A; 4GW6 A; 3P39 A; 1QZ5 A; 3FR0 A; 4LY7 A; 2GV9 A; 1W97 L; 4E1J A; 2G8V A; 4DV7 K; 4BE1 A; 4GKK K; 1DEJ A; 3NCI A; 1VQO N; 2YNH A; 3MWT A; 4CGH A; 4HUF A; 2YV0 X; 3LPT A; 4WFA L; 1IBK K; 1ITG A; 2BH1 A; 3HST B; 3GDQ A; 5K14 A; 4BR0 A; 4BRM A; 3VMF B; 4DKW A; 1YI2 N; 4FL9 A; 3CJC A; 3N4Q A; 3CQ8 A; 3NBP A; 3VPZ A; 1HNW K; 3LDN A; 2DTU A; 5GAH P; 3ZSV A; 2ZF5 O; 4AHT A; 4CF9 A; 5JVH L; 4CJL A; 3NF8 A; 5BR8 K; 4ILG B; 3TAG A; 4A2A A; 4BWM A; 2Y1I A; 4KH5 A; 2FBX A; 4BC5 A; 4O8U A; 4A5B A; 1NJX A; 1S3X A; 4IEI A; 3KKS A; 1GOC A; 4DQ8 A; 4CIE A; 5GAE P; 2RKI A; 4LC9 B; 5IWA K; 3HOS A; 4B1Z A; 1WSG A; 3RTV A; 3DWL A; 4PKI A; 4HTL A; 4M3T A; 2HNZ A; 3AVA A; 1LW2 A; 2DFH A; 4CF1 A; 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4OKJ A; 2JLE A; 4BR7 A; 2QWN A; 4JAX A; 3QNO A; 3CHW A; 4FLU A; 4PL7 A; 3PX6 A; 1VAZ A; 4KHS A; 4CEF A; 3VF6 A; 2OPQ A; 1HNI A; 3CI5 A; 4O4G A; 3QBW A; 1LAV A; 4K25 A; 4N41 A; 3BEX A; 3S9H A; 2D0P A; 3IG1 A; 3DLH A; 4IDK A; 2O8F A; 4JN4 A; 1CXU A; 1YJW N; 3SCX A; 4YOX A; 1S1V A; 4LSL A; 4FJX A; 4DLG A; 1NKB A; 1RTD A; 3TAR A; 3C6H A; 1TYQ A; 5SZT A; 2P9L B; 4ISG A; 2NUB A; 4M63 C; 3C0B A; 4G9Z A; 2O8B B; 3V6D A; 4CHZ A; 1NOY A; 3T19 A; 4DU4 A; 4H5V A; 2IDO A; 5JVG L; 3ZT2 A; 1NK7 A; 3CCL N; 2QXL A; 1KCF A; 3O3G A; 4HCC A; 4AHC A; 4CFC A; 1YAG A; 3AAP A; 4KV8 A; 1YF5 L; 5BRE A; 3A5N C; 2KZM A; 3OYG A; 3C6T A; 3AO4 A; 4M42 A; 1NGG A; 3V81 A; 1RFQ A; 4JKF A; 4EZ6 A; 4YHH K; 2NRV A; 1YVN A; 4FLY A; 3OJU A; 1XC9 A; 3OJS A; 1TKD A; 2VG6 A; 4AHU A; 1JCE A; 3LAM A; 4AH9 A; 1MWK A; 1BGX T; 4M3Z A; 3CCE N; 2XO7 A; 1NJI O; 5E41 A; 3GOI A; 1KFD A; 2JWK A; 3R1X A; 1QE1 A; 1P90 A; 4PHT X; 1YUW A; 5MLC Q; 3CQX A; 1HYS A; 1Z26 A; 5CZ2 A; 3H08 A; 3SPY A; 1B92 A; 1TUY A; 3H3O B; 3L4Q A; 4KHQ A; 4B08 A; 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