1HUXA

Crystal structure of the acidaminococcus fermentans (r)-2-hydroxyglutaryl-coa dehydratase component a
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
SIYTLGIDVGSTASKCIILKDGKEIVAKSLVAVGTGTSGPARSISEVLENAHMKKEDMAFTLATGYGRNSLEGIADKQMSELSCHAMGASFIWPNVHTVIDIGGQDVKVIHVENGTMTNFQMNDKCAAGTGRFLDVMANILEVKVSDLAELGAKSTKRVAISSTCTVFAESEVISQLSKGTDKIDIIAGIHRSVASRVIGLANRVGIVKDVVMTGGVAQNYGVRGALEEGLGVEIKTSPLAQYNGALGAALYAYKKAAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIVATOR OF (R)-2-HYDROXYGLUTARYL-COA DEHYDRATASE
publication title Crystal structure of the Acidaminococcus fermentans 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase component A.
pubmed doi rcsb
source organism Acidaminococcus fermentans
molecule tags Metal binding protein
total genus 76
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2001-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1huxA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1huxA01
3CJCA 4FWKA 2D1KA 4PKGA 3CETA 2ZGZA 1K8KB 2ITMA 1WOQA 1LOTB 2QXLA 4PL8A 3U9ZA 5AQQA 4BRIA 1BWFO 3W0LA 3ID8A 2IVNA 5BRFA 4BG9A 5E26A 3IDHA 4BQLA 4CZKA 5AQFA 3MCPA 4FWOA 2FLOA 1GLLO 3LDLA 3SJHA 3UB5A 2A3ZA 1T6DA 1S3XA 3RSEA 4FWPA 1KAXA 5AQGA 1Q18A 1NGCA 5EY4A 2I7NA 2P9SB 3GG4A 5BN8A 4NB4A 1T6CA 4XEIA 4B1XB 1ATSA 4BRDA 3VEYA 1NGGA 2E20A 4IZ9A 4BVPA 1NGIA 4BR2A 4EAHD 2QWNA 2IVOA 4H0VB 5LJWA 4Y0WA 1RGIA 2QWPA 3DJCA 3G25A 3VEWA 1X3MA 5AQIA 1D4XA 3CERA 3BUZB 3D2EB 4CBUA 3WEEB 3VOVA 5AQPA 4L3QA 2CGKA 4EFHA 2YI1A 2YHYA 3VGMA 4WQ4C 5FPEA 3KZBA 1Z05A 4HWIA 2CH5A 2GELA 4BVOA 3JS6A 4K25A 4M7XA 3VEVA 4FO0A 5AQMA 3MN7A 4AM6A 3A0IX 1ZXOA 1DKGD 4CZMA 3ULEB 4BRPA 2ZWHA 4A61A 5BREA 4IJNA 3FZMA 4BR0A 2H3GX 1YVNA 3R9PA 4MO5A 3MN5A 4FSVA 3A8YA 2P9NA 2V52B 3C0BA 1NGAA 4H0TB 5BRHA 1BDGA 3MN9A 4CZHA 4O5FA 3ATVA 4FPAA 1SZ2A 2P9UB 4EHTA 1MDUB 2A41A 5FPDA 4WYBA 4LC9B 1X9JA 4B9QA 2E1ZA 4QS8A 1YUWA 1JCEA 4XH5A 4E1JA 4BC5A 4EIAA 3D7EO 3FZLA 3L6QA 3O1BA 3A5NC 1SAZA 2CH6A 3QDKA 1ZBSA 3C7NA 1NLVA 5EX5A 5AQSA 4BR7A 4CD3A 1NGJA 4CD1A 1DGKN 1HKGA 2QM1A 1V4SA 4ISFA 5KPRA 4Z94A 4H5NA 5AQOA 1TYQA 2FF3B 4WQ4A 3FZHA 1GLBG 3UKUA 1JCGA 2PBDA 2FF6A 4H5TA 4AM7A 2CGJA 1QQNA 4JHDA 4M63C 3QBWA 3DWLA 3QMLA 2D4WA 1ZC6A 4CZEA 4JD2B 3FE1A 3TU5A 4KBOA 1GLCG 3D2FA 2W40A 2QWOA 3B8AX 3H1QA 3VEXA 2E1YA 4I6MA 4BRQA 3O4WA 3VF6A 3DXKB 4FWLA 3U4LA 4MLHA 4O8KA 5AZJB 2ASPA 3O08A 3LDPA 2A5XA 1E4GT 3ZETA 3J8AA 2EWSA 3LDQA 5AQRA 3QFPA 3VGKA 4CZJA 2YHWA 2ASMA 5ADXH 3SK3A 4NO7A 3R8EA 1GLJO 4FWQA 3O8MA 4F9OA 3GL1A 4BC3A 4BRGA 3QBXA 2P9IA 5ELZA 4A62A 5B8HA 4FOEA 1HKBA 4H0OA 1BUPA 3HM8A 3VETA 1ATRA 4PKHA 1NGBA 2A40A 3FGUA 5AQWA 2E88A 1BG3A 2DPNA 4FPBA 2QWRA 1LCUA 3TPQA 4M7YA 4GNIA 3EKUA 3IUCA 3U8XA 1HUXA 3CJ7A 5LJVA 2D0PA 3D2FB 4CBWA 1KAYA 2Q1NA 4MLEA 1HLUA 1QQOA 2QWQA 3O5BA 4CZGA 4I6MB 1HX1A 5F0XA 5AFUA 1NMDA 4H0XB 1IG8A 5LY3A 3UKRA 2P9KA 3DXMA 2VYPA 3OHRA 1U2VA 3SMPA 4H5RA 4B1WB 2GTDA 2YCHA 1NGEA 2D0OA 1QHAA 2YJEA 3ZX3A 2P9PA 2F9TA 1S22A 2IVPA 5KQ8A 4H5VA 3RSEB 4XH4A 1Y64A 2F9WA 2AP1A 2E2PA 4IXCA 2HF3A 1HJOA 1IJJA 4DCHA 1MWMA 3IMXA 2WUSA 4BRMA 1ESVA 3ZX2A 4BRKA 1HPMA 3VEOA 2Q31A 3CJAA 2A42A 4DQ8A 2BUPA 3H46O 1RDWX 1XUPO 2UYTA 2V7YA 3CJ1A 5KPTA 5BR9A 3GBTA 4IWVA 1BA0A 4BRCA 2GWJA 2NLXA 1NBWA 2NRHA 5FPMA 3ZEUA 1GLDG 3H1VX 4ISEA 5AQYA 4CZIA 1CZAN 3CJ9A 3M6GA 5AQXA 2P9LA 4WQ5C 4BC2A 5BPLA 4B1VA 4JNEA 4FWRA 5TKYA 3WQUA 3A5MC 1K8KA 3S41A 1BA1A 1EQYA 3GE1A 3H45C 4IJAA 1BU6O 1NM1A 4BRNA 1U2VB 4PKIA 2QWLA 4DHYA 3QICA 3VF2A 1NGDA 4FOIA 3LM2A 3GDQA 5AR0A 3LDNA 1NGFA 2YHXA 4FWNA 1QZ5A 3WXIA 2P9NB 4H5WA 1C0FA 5JLHA 1Z6RA 1NWKA 5EOYA 1GLEG 3M1FA 4BROA 3O1WA 3I8BA 5AQVA 3CQXA 1MWKA 4RTFD 3CI5A 4XH1A 4H0YB 3VERA 3VF4A 4BR4A 5BPNA 5F1XA 2Q0RA 2GUPA 3GOIA 2Q2RA 4YDUC 3D2EA 3C7NB 3HTVA 3I33A 5AQZA 3WEEA 3M3ZA 4BRHA 1RFQA 3EL2A 2I7PA 3ZEUB 3CHWA 2ASOA 2P9LB 5AQJA 4H03B 2E2QA 5EXWA 1QZ6A 5FPNA 4A2AA 1TYQB 2GWKA 5CE3A 3MMVA 3W3DA 5KQDA 4WQ5A 3KHYA 3VGLA 3H3NO 3ENHA 3UKUB 3CJBA 4K42A 5BPMA 3LL3A 4J8FA 4K43A 5AQNA 5AQKA 3ULEA 2YJFA 3EZWA 1GLAG 1MA9B 1KAZA 3L0QA 4JHDB 1NGHA 4DB3A 1HKCA 1YXQA 2IIRA 2FXUA 4BGBA 2E8AA 2HF4A 3BEXA 3CIPA 5KPZA 4JN4A 5BN9A 4BRAA 3ATUA 2AA4A 3A5LC 3SMSA 3VEZA 3HZ6A 1JCFA 1T44A 2P9UA 1OKJA 3A5OC 3BF1A 1YAGA 3HI0A 3WXJA 3FR0A 4H0PA 3LDOA 2GEMA 4CZLA 4K41A 5AZIA 2OANA 1X3NA 1DEJA 1C0GA 2BTFA 1V4TA 3O6WA 3ZETB 3H3OB 1ATNA 3KVGA 3WXKA 2KHOA 4HTLA 4BG8A 4A2BA 2VWBA 2VCPA 3DAWA 4B1UB 2Q36A 1E4FT 4QS9A 3SLCA 4YDUA 3FLCO 4PL7A 1U6ZA 1XQSC 3VESA 2ZGYA 5JICA 1J6ZA 2FSJA 2J4RA 5AQUA 5AQLA 3AARA 1TUUA 2P9IB 3QFUA 3WT0A 4BRFA 3CQYA 3U9DA 4RWTA 1P8ZA 1XC3A 4BQZA 3P4IA 5ADXA 3IFRA 2FSKA 3AY9A 3HBTA 3L4IA 5I9EB 4JD2A 4B1ZA 4CI6A 3H6EA 3VPZA 1GLFO 2E2NA 2Q97A 4CBXA 3ZX0A 3LM9A 1KXPA 2W41A 4B1YB 4CZFA 4BGAA 3UE5A 3JXUA 4JAXA 3HSCA 2Q0UA 3DXKA 3FZKA 3WXLA 3BF3A 5AZIB 4QS7A 5AZJA 1H1VA 5JMVA 3UKRB 3FFKB 2P9KB 3DXMB 3AAQA 2V51B 3EN9A 4C23A 4RCHA 2V7ZA 1WUAA 4BREA 1G99A 3WQTA 2P9PB 2FSNA 3AAPA 4FL9A 2QWMA 3EKSA 4BR9A 4CJ7A 4BRLA 5BRDA 2PAVA 2ZF5O 5JLFA 2P9SA 3BP8A 1BO5O 3O80A 3MN6A 3ENOA 3QB0A 4GY2B 3WUHA 1R59O 4IO8A 4ISGA 3FZFA 3VENA 4BC4A 5F2RA 1SQKA 4EHUA 4BR5A 5E84A 5AQTA 2A6AA 2CGLA 2NZTA 4MO4A 2HOEA 5EVZA 2QW9A 1BOTO 2HMPA 5AFUH 3MK6A 1TUYA 4FWSA 4FWMA 1QQMA 5AQHA 3R6MA 3F9MA 2E2OA 3EO3A 3MDQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QESA 1FXXA 4N56A 3QLHA 3TSPA 1NG9A 4DTNA 1K8KB 1NKCA 2ITMA 5C24A 1UWBA 1BWFO 2F7TA 1ASWA 4CZKA 4XIUA 5AQFA 1VQPN 2JWLA 2YHBA 3SJHA 3NAEA 4FLWA 4K8XA 4JV5K 2O8EB 4CHOA 3RSEA 4FWPA 1C1BA 2DFEA 2X6NA 1Q18A 2P9SB 3G6EN 1RTJA 1VSIA 5BN8A 3KK2A 4CEBA 3SJJA 4V19S 4JRPA 4B1XB 3CCLN 4CCHA 2IOCA 2O8CB 3DLEA 2XY6A 1TK5A 4FM2A 1NGIA 2HMIA 4FJGA 1RGIA 3DJCA 3G25A 2ETJA 3JAMO 4YFUA 4CFDA 3KK7A 1VSEA 2HBLA 3BY5A 3NHGA 4L3QA 2CGKA 4HHTA 2G8VA 5D3GA 1HNZK 1TAQA 1EX4A 3E9PA 3HPHA 3CMEN 4J2AA 2O8DB 3CFOA 1TVRA 1Z05A 2CH5A 4K25A 1BQNA 5C2DA 3VEVA 2KFNA 3VQAA 1SL1A 3EYZA 5AQMA 1DLOA 1S1TA 1B9FA 1DKGD 3ULEB 1KD1O 3ZT2A 2H3GX 1YVNA 1XC9A 3KLFA 3MXIA 2P9NA 4H0TB 5BRHA 1RTDA 4IDKA 3MN9A 4CEQA 3WNHA 4ILGB 2P5OA 4M3UA 2HHUA 4O5FA 4KRFA 4W5OA 2PZSA 1SZ2A 1ASVA 3ID6A 3OYFA 1B92A 4IKFA 1TGOA 3DLKA 3E01A 4WYBA 1VSJA 4F3OA 1JCEA 5CHIA 4E1JA 3L2RA 3PO5A 2YKMA 3L6QA 3O1BA 3QDKA 1NLVA 3ALYA 4GMJB 5JS1A 1DGKN 4DF4A 5KGWA 4ELVA 3KKSA 4NXMK 1QSYA 4ISFA 1SL2A 3CC2N 4Z94A 4YOWA 4H5NA 1XWLA 1WBBA 1QQCA 1JCGA 2PBDA 2ITGA 3QMLA 1TL1A 3FE1A 3U6FA 3TU5A 3M8QA 4CK1A 3V1RA 1GLCG 3LP2A 2W40A 1BHLA 4FLVA 1JLFA 4BRQA 3DXKB 1F21A 1J54A 1RTIA 5M1NA 4FLYA 1U04A 1YT3A 3ZETA 1RT7A 1XNRK 3J8AA 2EWSA 2G8FA 2YHWA 4G1QA 2ASMA 1L3TA 1EO1A 4OGEA 1IBMK 3PY8A 1GOAA 4FWQA 4F9OA 3GL1A 1EETA 4E1NA 4CEFA 4LF9K 1JJ2M 1QSSA 1WN7A 3AA5X 4H0OA 2XY7A 3KD1E 3HM8A 2W6LA 3SUQA 3WNGA 1NGBA 3M8RA 1QTMA 4B3TK 4FPBA 2QWRA 4JK8A 5C2FA 5C15A 4OLBA 2VGNA 3P5JA 4DV3K 2PY5A 5LJVA 4I7FA 1K6YA 4HUFA 4DTXA 4CBWA 3CMAN 1KAYA 1HLUA 4MDBA 1HX1A 3OVNA 3J80O 4JKGA 4AILC 4H0XB 2PFUA 5LY3A 3O9RA 3UKRA 5K14A 3VQEA 4E89A 3OHRA 3SMPA 2YCHA 1ZBFA 1QHAA 3ZX3A 2D5RA 4DQSA 2IVPA 4UY8O 4H5VA 3RSEB 2YNFA 3V4IA 2AP1A 1W2BM 4KH4A 4IXCA 4LF5K 4LF8K 1IJJA 1SL0A 4DCHA 1TK8A 4O5BA 2EHGA 4G9ZA 4BRMA 1ESVA 3AVAA 2YV0X 2Q31A 4KKOA 1LV5A 4CF8A 4KHNA 3H46O 3TR8A 3T1YK 1RDWX 2UYTA 2V7YA 3CJ1A 1OVQA 3OYAA 1CLQA 1BA0A 5TKWA 1HYSA 4CW7B 4DMNA 3CCQN 1GLDG 4E7JA 1KLNA 2P9LA 3TSUA 1EKEA 5BPLA 3HM9A 3WXMB 4JNEA 3D6RA 4DU1A 2YKNA 3GE1A 4I9LA 4FK4A 4CJVA 1HYZA 3VF2A 3GDQA 4F2SA 4IFEA 3WXIA 3D0PA 4LY7A 2P9NB 4DSFA 4H5WA 2HBKA 1EWQA 5EOYA 1A5XA 4Z0UA 3TTCA 4RG8A 2FBTA 5MLCQ 1MWKA 4OPKA 1T3VA 2W6KA 5JVHL 4FJMA 3VERA 4BR4A 5BPNA 5F1XA 4DFMA 2B5JA 2Q0RA 3LANA 4DUZK 4BWJA 2GUPA 1DT9A 2NRTA 3S3OA 3LZJA 4QAGA 1TL3A 4JI4K 3QNNA 3CCRN 2HBMA 4BRHA 3OYDA 3V9UA 2F8TA 4CGDA 3ZEUB 3RRGA 1RT3A 3M8SA 3RWUA 4N41A 1SKRA 1QZ6A 3TSQA 2QKKA 4B08A 4DSLA 3HXMA 1IG9A 1BISA 3VQDA 4RW9A 5IT9O 1BGXT 3HVTA 4DV0K 3SQ0A 3J7ZO 4BGBA 2E8AA 2HF4A 4CIEA 4JI3K 4Q5VA 1IKVA 4BRAA 3A5LC 1JCFA 3HYFA 4ID5A 2P9UA 3BF1A 1QE1A 4H0PA 2GEMA 2KW4A 4B9NA 4E7KA 1YTAA 1XHXA 4HUGA 2BTFA 3D45A 2HNYA 3ZETB 3H3OB 2KHOA 4IG0A 4LFBK 3RVCA 3RMCA 4B1UB 2Q36A 4QS9A 4PL7A 5JICA 2FSJA 1RT1A 4RW8A 4EZ9A 3SPZA 3VTHA 4BRFA 3CQYA 1P8ZA 1XC3A 1WAJA 2I5JA 3CM6A 4BQZA 3AA2A 3LWMA 4BE2A 4FJNA 3IG1A 3ZT0A 4M3YA 3HBTA 3L4IA 3MWPA 2Q3SA 1Q9YA 1SKSA 2KKZA 2E2NA 4CBXA 2Q97A 4YNQA 1KXPA 1UA0A 4F8RA 4BGAA 1S1VA 1N34K 3JXUA 3I56N 3DMJA 2Q0UA 1JLGA 4MFBA 2QA4N 3V1OA 3BF3A 5AZIB 4A59A 3VQ8A 4KI4A 1K73O 1H1VA 3J7AP 5JMVA 3UKRB 1YVUA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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