1HUXA

Crystal structure of the acidaminococcus fermentans (r)-2-hydroxyglutaryl-coa dehydratase component a
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
SIYTLGIDVGSTASKCIILKDGKEIVAKSLVAVGTGTSGPARSISEVLENAHMKKEDMAFTLATGYGRNSLEGIADKQMSELSCHAMGASFIWPNVHTVIDIGGQDVKVIHVENGTMTNFQMNDKCAAGTGRFLDVMANILEVKVSDLAELGAKSTKRVAISSTCTVFAESEVISQLSKGTDKIDIIAGIHRSVASRVIGLANRVGIVKDVVMTGGVAQNYGVRGALEEGLGVEIKTSPLAQYNGALGAALYAYKKAAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Metal binding protein
molecule keywords ACTIVATOR OF (R)-2-HYDROXYGLUTARYL-COA DEHYDRATASE
publication title Crystal structure of the Acidaminococcus fermentans 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase component A.
pubmed doi rcsb
source organism Acidaminococcus fermentans
total genus 76
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2001-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1huxA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1huxA01
4PL8A 1IG8A 2D1KA 5AQSA 3U4LA 1QHAA 3VEOA 5AQQA 3GG4A 3MN6A 4WQ5A 4XH4A 1GLCG 5E26A 1SQKA 3H1QA 3AAQA 3KVGA 3EKSA 4A2AA 3I33A 5AQXA 3D2EB 5EXWA 3H45C 4EFHA 2QWLA 5AZIA 3VETA 2P9KA 4B1VA 2Q1NA 2QWQA 2YCHA 3W3DA 4BRGA 4CZIA 3FFKB 2NZTA 3CI5A 4H03B 3LDNA 5AQTA 4CZJA 2F9TA 3O8MA 1TYQB 2GEMA 2CH5A 3LDQA 1NGEA 3C7NB 3QDKA 4I6MB 3IMXA 1NGFA 4DQ8A 5BPLA 4BR9A 1RFQA 3DWLA 5TKYA 3WQTA 3ATUA 3U9DA 1X9JA 5KQDA 4XH1A 2P9UB 1JCEA 3BF1A 2UYTA 2GWJA 4MO5A 5LJVA 4JHDA 4XH5A 3CJ1A 5AQHA 1BA1A 2P9LA 3FR0A 4BGAA 4J8FA 1OKJA 3QFPA 4BRMA 3DAWA 3O1WA 3O4WA 4FWPA 4ISFA 3HSCA 4H5VA 4BRLA 4PKIA 4H5NA 4WQ4A 3H1VX 2OANA 3BP8A 2VWBA 4B1YB 2Q36A 4BRPA 3ULEA 3QBXA 4IWVA 4E1JA 3SMPA 1DGKN 2ZGYA 1KAXA 3WEEA 2V7ZA 4B1UB 2IVOA 3QICA 3WXLA 3J8AA 1T6CA 1ATNA 4BC5A 5I9EB 3RSEA 3L0QA 5E84A 5FPEA 1H1VA 1R59O 1WOQA 5AQZA 4H0YB 3IUCA 3KZBA 2E2OA 3H6EA 3ZEUA 3HZ6A 4GY2B 3R6MA 3CJ9A 3SK3A 1V4TA 4FWRA 4RCHA 3CIPA 2QWPA 5JLHA 3FLCO 1NBWA 1IJJA 3WT0A 5BN8A 4PL7A 3VEYA 1WUAA 3WXJA 3U8XA 4BRQA 3MN5A 4AM6A 2QWOA 1NGGA 5BN9A 1XQSC 5LJWA 4BGBA 5BRHA 2HF3A 3CQXA 2E1ZA 1Y64A 3SJHA 1U2VB 3L4IA 3C0BA 4JHDB 5ELZA 1J6ZA 5AQWA 1XC3A 3ZX2A 3ATVA 5BREA 2DPNA 4BRHA 2P9NB 3DXMA 1HPMA 2A42A 1GLLO 3GOIA 1T6DA 3UKUB 2IIRA 1BUPA 4CZHA 3A8YA 5BR9A 3GL1A 1CZAN 3KHYA 3OHRA 4QS7A 1Z6RA 4FWSA 2ITMA 3CQYA 1HX1A 5FPNA 3M6GA 4M7YA 4WYBA 3VEWA 5B8HA 2W40A 1X3NA 2CGLA 2QXLA 3QBWA 3D7EO 4Z94A 1S22A 2ASPA 5ADXH 4MLEA 4RTFD 4BRCA 4NB4A 4BG9A 5KPZA 2EWSA 2GUPA 3FZLA 2CGJA 3CETA 5F1XA 3GE1A 2YJEA 4JD2B 4BRIA 2GTDA 1NLVA 5AQLA 3DXKB 4IJAA 3GDQA 3FZFA 2E8AA 4FWNA 2P9SB 3VEXA 1K8KB 3VGKA 3SLCA 1ESVA 5BPNA 4O8KA 4JN4A 2E2PA 4Y0WA 4L3QA 4CZMA 3MN9A 3ZETB 1MWMA 3VF2A 5AQKA 1SAZA 3VOVA 5AZJA 5EOYA 4BR7A 4BQLA 1HLUA 3LDPA 1BA0A 3IDHA 4FPBA 2FF3B 3A0IX 4CD1A 1BDGA 5LY3A 3A5NC 4FWMA 4CBUA 4EIAA 1QQNA 2PAVA 2ZF5O 4CZGA 2P9PA 1C0GA 2P9IB 3CJBA 4CZFA 2D0PA 2Q0UA 3HTVA 4BR2A 3R9PA 1GLJO 1BG3A 1LCUA 4ISEA 5F0XA 4BVOA 4BC4A 5AQRA 5AQPA 2QW9A 4DHYA 1MWKA 4JAXA 5AQOA 5KPTA 1NGCA 4BRNA 2IVNA 4B9QA 4BR4A 1HKBA 3UKRA 4BREA 4BRFA 3CERA 2F9WA 3D2FA 3CJ7A 2QWRA 2Q2RA 2Q0RA 5AR0A 3BEXA 3AAPA 3O80A 1NM1A 3VPZA 3WXIA 3FE1A 4BR0A 4BRDA 1E4GT 1NWKA 5AFUH 4BVPA 3M1FA 2HOEA 4RWTA 2VCPA 5KPRA 3VENA 3L6QA 1GLEG 2VYPA 4H0OA 3FZKA 5AZIB 2P9KB 3CHWA 2CGKA 1SZ2A 4B1WB 4BROA 4IXCA 5AQVA 2YI1A 1JCFA 4CBWA 3JS6A 2WUSA 4WQ5C 3FZMA 3LM9A 3MDQA 2E2NA 4EHTA 4K41A 4MO4A 1GLDG 2GWKA 1TYQA 4BC2A 1TUYA 3M3ZA 4CZLA 3C7NA 3DJCA 4FL9A 3MK6A 2KHOA 1RDWX 5AZJB 3FGUA 3LDLA 3O6WA 1BWFO 3VESA 1T44A 5KQ8A 2D4WA 4BQZA 1X3MA 2P9UA 2E20A 2FXUA 1ZXOA 4H5TA 2P9LB 3H3OB 4A2BA 4B1XB 4FPAA 5JLFA 5AQUA 4HTLA 3HBTA 2IVPA 5JICA 1QQMA 2Q31A 4K25A 4XEIA 1EQYA 3SMSA 3I8BA 4CZEA 2FSJA 4FWKA 4K43A 4FO0A 2YHYA 2W41A 3R8EA 1BOTO 2V52B 3VEZA 4IZ9A 3WUHA 3U9ZA 1ATSA 2QM1A 3MCPA 2E88A 2BUPA 3O1BA 2NRHA 3ULEB 3TPQA 2ASOA 3A5MC 4FWLA 3UKRB 2A40A 1DKGD 2FF6A 3WEEB 1ATRA 3D2FB 3EKUA 5EX5A 3O5BA 2QWNA 4JNEA 4YDUA 1D4XA 1P8ZA 2CH6A 3IFRA 3O08A 3QFUA 3RSEB 1C0FA 3ID8A 4H0PA 1HKCA 3W0LA 5CE3A 4M63C 4WQ4C 4AM7A 3VF6A 3ZEUB 4CD3A 1QZ6A 2A6AA 5ADXA 5BPMA 3EN9A 1ZC6A 3S41A 4EHUA 2YHWA 3LDOA 3ENOA 1YXQA 1YVNA 2H3GX 4C23A 2FLOA 1KAZA 2PBDA 3FZHA 3VF4A 3WXKA 2HF4A 1QQOA 3G25A 4MLHA 3EZWA 3VGLA 4F9OA 1ZBSA 1RGIA 2AA4A 4EAHD 4A62A 3AARA 5AQMA 5AQNA 5JMVA 4B1ZA 1NGJA 4IJNA 2I7NA 3H46O 3MN7A 4IO8A 1LOTB 2BTFA 5AQJA 5BRFA 3A5OC 4BRAA 4ISGA 4DCHA 2D0OA 2E1YA 3F9MA 4O5FA 4BC3A 1U2VA 2I7PA 3HI0A 2ZWHA 4QS8A 4QS9A 4PKHA 2E2QA 1NGIA 4H0XB 3DXMB 1HUXA 2QWMA 2HMPA 2FSKA 1GLFO 1MA9B 4CBXA 4KBOA 5AQGA 2P9NA 1NGDA 3QB0A 1HJOA 3UKUA 4FWQA 1TUUA 3VGMA 3TU5A 3HM8A 3QMLA 4GNIA 3BUZB 4M7XA 5EVZA 1XUPO 5FPDA 4BR5A 1YAGA 4FOIA 3WQUA 3AY9A 2A41A 3P4IA 4H0TB 1GLBG 1KAYA 2A3ZA 4BRKA 3VERA 1E4FT 3MMVA 3BF3A 3LM2A 1U6ZA 2Q97A 3GBTA 3ZX0A 3D2EA 4NO7A 1G99A 1YUWA 5AQFA 5EY4A 4FOEA 5F2RA 4BG8A 1NGAA 4CJ7A 3H3NO 4H5WA 2ASMA 1BU6O 1S3XA 4JD2A 2YHXA 3DXKA 5AFUA 2P9SA 1K8KA 2ZGZA 2V7YA 4FWOA 4H5RA 4I6MA 5FPMA 3B8AX 3UB5A 3ZETA 1NGBA 3EO3A 2AP1A 3EL2A 4DB3A 3LL3A 1HKGA 4A61A 4PKGA 1NMDA 2V51B 2YJFA 1Z05A 5BRDA 2FSNA 1Q18A 2A5XA 3JXUA 4YDUC 3VEVA 1NGHA 1QZ5A 2NLXA 4HWIA 1DEJA 3ENHA 2P9PB 4FSVA 5AQIA 4LC9B 3A5LC 2GELA 3ZX3A 1MDUB 5AQYA 2P9IA 1V4SA 4K42A 2J4RA 3CJCA 4H0VB 1GLAG 1KXPA 3CJAA 1BO5O 1JCGA 4CI6A 3UE5A 4CZKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2D0BA 3SUNA 1YTAA 4NLBA 4CESA 3GG4A 5FRMA 5C12A 3KWGA 3VQEA 3PSFA 4WQ5A 4XH4A 4JI6K 2O8EA 4BDPA 5E26A 2ZJRL 2XY6A 1SQKA 3Q7BA 1VQ6N 1WSJA 2RHKA 3KVGA 3V9XA 2OZMA 1GOCA 5AQXA 3H45C 3SZ2A 4YOUA 1CLQA 5AZIA 2P9KA 1JLGA 4N47A 2E4LA 2NZTA 3CI5A 4LF8K 1T03A 5AQTA 1ASWA 3JAMO 4CZJA 3K0SA 1Q8IA 4IDHA 1TYQB 1BI4B 1LW2A 4CJTA 1RT7A 1NGEA 2JWLA 1J5OA 1NGFA 4DQ8A 4KV8A 3KLFA 1WLJA 3WQTA 1IBKK 2G8HA 1X9JA 1K73O 2DFHA 2P9UB 2UYTA 4OPKA 1QS4A 4JV5K 2GWJA 4MO5A 4JHDA 4KHNA 3CJ1A 1U4BA 2FBTA 5AQHA 4JS5A 1NK4A 4JI8K 3LAMA 4BGAA 5HRSA 3TTCA 3SAGA 3PY8A 2WONA 3QFPA 4ISFA 4MFBA 1HMVA 4H5VA 4BRLA 4DV0K 3PO5A 2OPQA 3TSQA 4PKIA 4H5NA 3M8SA 3AVGA 4Q0BA 2OANA 4M41A 1VQKN 2G8FA 4CHZA 4BRPA 1RT5A 3QBXA 4IWVA 2PZSA 4E1JA 1KAXA 4OO1J 4E89A 4JKCA 4FW2A 2ETJA 4B1UB 2IVOA 3QICA 3WXLA 2O4IA 3AO4A 1C1AA 1T6CA 1VSEA 1SV5A 5I9EB 3ZSXA 1SKRA 4PHTX 5FPEA 1R59O 4FZYA 2VQEK 5DM6L 4OPJA 2QI2A 4H0YB 4DSKA 4FK0A 1NMNA 2E2OA 4FLTA 4GY2B 3CJ9A 3CXCM 4RCHA 1LWCA 3OJSA 3WT0A 4LFCK 2IOCA 3VQBA 1EETA 1RBRA 3S9HA 4ELVA 3WXJA 3ZT3A 1W0HA 4CGFA 5C42A 1T8EA 2W6KA 1ZBLA 4LH5A 2NRRA 2BE2A 3WNHA 3OA9A 1JL1A 4B9UA 1XQSC 4B9TA 3OJUA 4Z4IA 3SJHA 3V9SA 3KD1E 1NJYA 5ELZA 5AQWA 1XC3A 3K57A 3ATVA 3CCUN 1XMOK 1HRHA 3CMEN 3DXMA 4PUOA 2E6LA 1L3VA 2Z1HA 1T6DA 2IIRA 2EX3A 1LV5A 4FJJA 3GL1A 4LF5K 4CHNA 3OYFA 3KLGA 4WFAL 1Z6RA 3DLGA 2RPIA 1HX1A 4CJEA 4QCLA 5J2PA 1REVA 1MU2A 1KFDA 1RDAA 2W40A 1X3NA 4YOTA 5JS1A 1S22A 5M1NA 1N34K 3CCEN 4Z4CA 2GUPA 2CGJA 1YI2N 3GE1A 5FRNA 4KTWA 4W5RA 4JKBA 4BRIA 3V4IA 3THWA 3TABA 3RMBA 1QHTA 3TAGA 4JI5K 3MEGA 1XI1A 3VEXA 3VQAA 1VSFA 4JN4A 1RILA 4W5OA 3MN9A 1ZBHA 3HYFA 3AA5X 3TR8A 2B5JA 3OYIA 3MECA 3HPOA 5EOYA 4FJLA 5FDLA 1T05A 1YF5L 5KI6A 2O8DB 4BQLA 1HLUA 1BA0A 4LSNA 5LY3A 4FWMA 4J2DA 3SQ1A 3O9SA 2P9IB 4GVEA 1I39A 3KLHA 3HTVA 4BR2A 4DFMA 3R9PA 3U3GA 1NU0A 4BVOA 5AQRA 1MWKA 3HPHA 4FLYA 4DQPA 1NGCA 4BRNA 4IFYA 1OH6A 3SQ4A 3CERA 4IFEA 2F9WA 5J2NA 5AR0A 2O8EB 3TAEA 3BEXA 5M1OA 3MEEA 3V9ZA 1UA0A 3O80A 4I2PA 3WXIA 3C94A 3TTDA 4LY7A 2B6AA 2KFZA 1BCOA 3M1FA 2XRIA 2ZJPL 4O44A 5CYMA 1GLEG 5C10A 5AZIB 2P9KB 1NK6A 3CCJN 4B1WB 4FLZA 4CJ5A 3IS9A 4U7BA 3FZMA 3LM9A 3MDQA 2E2NA 4Y1CA 3V1OA 1GLDG 2HBLA 1IKWA 5AZJB 3M8PA 2YNGA 3AGRA 3VESA 1EWQA 2D4WA 4BQZA 1U49A 1X3MA 1DLOA 2E20A 2FXUA 4F2SA 1NK8A 1FKOA 4A2BA 3T19A 1HNZK 2Q31A 4MQ3A 2IDOA 1UOCA 3AO3A 1C0UA 2OPPA 2VG6A 5DMRA 3J80O 3PX0A 2YV0X 5GINA 2QM1A 4CERA 2NRHA 2RE2A 3HSTB 2P51A 3F73A 4B9SA 3CFRA 4JI7K 3EKUA 4I7FA 5EX5A 5HRPA 2WTUA 1D4XA 1SKSA 3HPGA 2CH6A 4BDYA 3QFUA 4IG3A 3RWUA 3W0LA 2BH1A 4OKJA 2W6LA 1IH7A 3DYAA 2D0AA 5KTQA 4AM7A 1C1BA 4QAGA 5J1EA 4DV6K 5BPMA 4FJIA 1TKDA 4DTOA 1YVNA 4RW7A 4YNQA 3FZHA 2HF4A 1SUQA 4N76A 4KI6A 1NKCA 1QQOA 3G25A 4MLHA 3EZWA 4DU1A 4F9OA 1ZBSA 1DT9A 3WNGA 1RGIA 2AA4A 1YJ9N 4KI4A 3AARA 5AQMA 4FJMA 5BRFA 3HOTA 3MN7A 1LOTB 2BTFA 1ASVA 5TKWA 4DCHA 1QSYA 2E1YA 3P1GA 4O5FA 3S3NA 3Q7CA 4QS8A 4PKHA 3RMAA 1JLCA 3DXMB 3ALYA 3I56N 1C6VA 1S6PA 2HMPA 3LP2A 1GLFO 1MA9B 4CBXA 2P9NA 4CIEA 2QEXN 1HJOA 5I3UA 3NDKA 3MWTA 3LP0A 4M45A 4OPAA 3TU5A 3HM8A 3UIQA 1VRTA 5FPDA 1YAGA 4CECA 3WQUA 3SJJA 2A41A 2FC0A 3CC7N 1GLBG 1KAYA 4CJ4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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