1HUXA

Crystal structure of the acidaminococcus fermentans (r)-2-hydroxyglutaryl-coa dehydratase component a
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
SIYTLGIDVGSTASKCIILKDGKEIVAKSLVAVGTGTSGPARSISEVLENAHMKKEDMAFTLATGYGRNSLEGIADKQMSELSCHAMGASFIWPNVHTVIDIGGQDVKVIHVENGTMTNFQMNDKCAAGTGRFLDVMANILEVKVSDLAELGAKSTKRVAISSTCTVFAESEVISQLSKGTDKIDIIAGIHRSVASRVIGLANRVGIVKDVVMTGGVAQNYGVRGALEEGLGVEIKTSPLAQYNGALGAALYAYKKAAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords ACTIVATOR OF (R)-2-HYDROXYGLUTARYL-COA DEHYDRATASE
publication title Crystal structure of the Acidaminococcus fermentans 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase component A.
pubmed doi rcsb
source organism Acidaminococcus fermentans
molecule tags Metal binding protein
total genus 76
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2001-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1huxA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1huxA01
3A5LC 1NGJA 1S3XA 3ZEUA 4EAHD 1NGBA 1XUPO 2QM1A 4ISGA 5AFUA 3HM8A 2BUPA 3A5MC 1RFQA 4BRPA 1RDWX 4CZHA 1Q18A 3FZMA 2W41A 4K42A 3IUCA 4L3QA 2QWNA 5BPMA 4A62A 3H1QA 3S41A 3HTVA 2YJFA 4CZLA 1NBWA 3C7NA 3JS6A 2A6AA 3VPZA 1ATRA 1WUAA 1QZ5A 2GTDA 5JICA 4H5WA 3L0QA 3MK6A 5ADXA 1CZAN 4QS9A 3O80A 2P9UA 4K25A 5AQFA 5AQIA 4H5NA 2P9LA 5AQGA 3VGMA 2Q36A 3VESA 1ZBSA 4BG9A 4I6MB 3WQUA 5B8HA 3LM9A 2A3ZA 4H5TA 1IG8A 4QS7A 4BRHA 5EOYA 4B1VA 4K43A 3H6EA 2QW9A 4HWIA 4BRMA 1E4GT 4FWSA 2J4RA 4BRAA 3WEEA 1T6DA 1HJOA 1SQKA 1GLDG 1HX1A 4O8KA 3QBXA 4XEIA 4FWMA 1SZ2A 1HKCA 2FSKA 4H03B 2GELA 5AZJB 3VF4A 4FPBA 3D7EO 2P9PA 3LDNA 2YHWA 3KZBA 3WXIA 2W40A 4LC9B 3VETA 4F9OA 2I7NA 4PL7A 4JN4A 1BA1A 2CGJA 2V7ZA 3O5BA 2QWPA 5AQLA 5AR0A 1X3NA 1MWMA 5FPEA 5F0XA 3W0LA 2FSJA 4BRIA 2P9KA 1U2VA 3CIPA 4BQLA 1NGEA 5BN9A 3O1WA 1X3MA 1JCEA 3J8AA 5AQXA 3QFPA 1XC3A 5AZIB 5ADXH 2UYTA 1GLEG 3H3NO 1NGHA 3DXKB 4JAXA 4MO4A 4CZMA 3CERA 2ZF5O 4H0OA 3GOIA 3L6QA 1JCFA 1QHAA 4BRFA 1X9JA 4EFHA 5LY3A 4AM6A 4PKGA 2DPNA 4JHDB 4FL9A 4BQZA 3U9ZA 3JXUA 2E1YA 1NWKA 2P9IB 2QWQA 2YJEA 1BUPA 4RTFD 4M63C 5AQHA 1V4SA 1MDUB 2WUSA 2HMPA 3UE5A 2BTFA 3O1BA 3A5OC 3CJ7A 2QWOA 3KHYA 3F9MA 3D2EB 1GLLO 4H5RA 5KPZA 1BWFO 2A41A 5AQZA 3R8EA 4CZGA 3FLCO 3H46O 4FO0A 3A5NC 1J6ZA 4BRLA 3TU5A 3BF1A 4CZEA 2CH5A 3M3ZA 1ZC6A 4J8FA 3QMLA 2D1KA 4BR0A 2E8AA 1G99A 4CD3A 4BVOA 4WQ4C 3ATUA 4IXCA 4BRDA 1T6CA 4FOIA 3CJBA 4IJNA 1K8KB 4EIAA 3WXKA 4H5VA 4NO7A 3VGLA 1TYQB 4CI6A 3VF6A 4FWRA 2IVOA 5BN8A 4I6MA 4IO8A 3ZX2A 1XQSC 3VGKA 5KQ8A 2AA4A 2E88A 1BG3A 4PKIA 3D2FB 2QWRA 4WQ5A 3A8YA 4IZ9A 1NGCA 3M1FA 2FF6A 1DGKN 3WT0A 4BR9A 2P9NB 4BG8A 1NMDA 3MN6A 3GE1A 2YCHA 3ENOA 3L4IA 3R6MA 4HTLA 2ASMA 3G25A 4CJ7A 1EQYA 2CGLA 2AP1A 2V51B 5AZJA 3FE1A 1NGIA 3LDQA 4C23A 2IVPA 1E4FT 3GDQA 1QQMA 2E2QA 3MMVA 4FSVA 4B1ZA 4EHTA 4MLHA 4WQ4A 1SAZA 5KPTA 1GLCG 3EKSA 4FPAA 1Z6RA 4QS8A 5AQKA 1KAXA 1H1VA 1KXPA 1TUUA 1ATNA 4M7XA 4A2AA 3SLCA 5AZIA 3QDKA 1IJJA 3AAQA 4RWTA 3WUHA 3VERA 3DXKA 3AARA 1D4XA 1QQNA 3DXMB 1WOQA 3ID8A 3LDPA 3R9PA 4BRGA 3ULEB 5AQJA 3VEXA 3M6GA 2GWJA 4JHDA 3O08A 5F1XA 2FF3B 4CBXA 2YI1A 2P9SB 1LOTB 2ITMA 3EKUA 4PKHA 4DHYA 4BRKA 3O6WA 1R59O 3CJ9A 4BR4A 3RSEA 1JCGA 3HBTA 3KVGA 1C0GA 5BRFA 2QXLA 3WXLA 3I33A 3ZETB 4BGAA 1NGGA 1BO5O 3D2EA 3MN5A 2FXUA 3W3DA 1T44A 4B9QA 4CBWA 4ISFA 4BREA 3IDHA 1DEJA 3GG4A 2Q31A 3OHRA 5AQTA 4FWNA 3U9DA 4PL8A 4H0VB 4H0PA 1RGIA 2HOEA 4FWOA 4O5FA 3TPQA 1HPMA 3C0BA 1YAGA 1K8KA 5AQVA 2CGKA 5F2RA 1TYQA 1U6ZA 4WQ5C 2I7PA 3FZHA 3IFRA 3O4WA 1MA9B 4ISEA 1ZXOA 5BPLA 3QB0A 5AQOA 3EN9A 3D2FA 2NRHA 2ZWHA 3EZWA 5FPNA 5JLHA 2E2OA 2GEMA 3BEXA 4A2BA 1NM1A 3O8MA 4JD2B 1BDGA 4CZIA 2HF4A 1YXQA 2GUPA 1C0FA 3FZLA 4IWVA 2VWBA 5FPDA 1ATSA 2Q2RA 2FLOA 1BU6O 1YVNA 4DQ8A 1ESVA 1TUYA 3MCPA 3UKRB 3HI0A 1Z05A 5AQRA 3VEWA 4BR7A 5LJVA 2A5XA 4BC2A 4CZFA 4BROA 3FZFA 3SK3A 3UB5A 3H3OB 3A0IX 3U8XA 4DB3A 4IJAA 3ATVA 3BUZB 5E26A 3DXMA 2HF3A 4YDUC 3CHWA 4RCHA 5LJWA 5EX5A 3ULEA 2D0PA 1NLVA 4BRQA 3WXJA 4BVPA 4CBUA 5AQWA 3HZ6A 3MN7A 3HSCA 4GNIA 4XH1A 2E2NA 3DJCA 3FGUA 3SMSA 3VEVA 2P9SA 5E84A 4B1WB 3VOVA 4E1JA 3BF3A 4BC3A 5KQDA 1DKGD 2VCPA 5EY4A 3ZETA 1S22A 1V4TA 3CI5A 3LL3A 5FPMA 3LM2A 1KAZA 2CH6A 1NGFA 4JNEA 3ZX3A 2Q97A 4A61A 3UKUB 5JMVA 4K41A 2ASPA 4NB4A 4CD1A 3FFKB 1BOTO 2KHOA 4GY2B 3ZEUB 2PBDA 3ENHA 3MN9A 4Y0WA 1LCUA 3B8AX 4FWQA 3H45C 2H3GX 2PAVA 5ELZA 4CZKA 4EHUA 5BRHA 4YDUA 1BA0A 3QFUA 5TKYA 2YHYA 2QWLA 4KBOA 2P9IA 2VYPA 3VF2A 3SJHA 4Z94A 5CE3A 2E2PA 2D4WA 1Y64A 3C7NB 2EWSA 2E1ZA 2E20A 1YUWA 5AQNA 4MO5A 4B1XB 5BREA 4B1YB 1HLUA 5AFUH 1P8ZA 3CETA 4H0YB 3U4LA 4BRCA 4FWPA 5AQUA 5JLFA 2P9UB 2F9TA 5BPNA 4JD2A 4AM7A 2P9LB 2F9WA 3VEZA 1KAYA 4BC5A 2IIRA 3GL1A 3I8BA 3WQTA 2QWMA 3GBTA 2ASOA 1GLFO 5I9EB 5AQQA 5BR9A 1QQOA 1MWKA 3CJ1A 4BR2A 1GLAG 2Q0UA 4DCHA 3QICA 3VENA 3H1VX 3EL2A 1HKGA 2Q0RA 2YHXA 4FWLA 3WEEB 3UKRA 1GLBG 5AQMA 2GWKA 4CZJA 2IVNA 4MLEA 2ZGYA 2V52B 2FSNA 3EO3A 5BRDA 3SMPA 3CQYA 3FZKA 4BRNA 2P9NA 4WYBA 3AY9A 3P4IA 2P9PB 1HKBA 3CQXA 4BC4A 3BP8A 5AQYA 3MDQA 1QZ6A 1HUXA 3QBWA 3VEYA 5KPRA 3RSEB 3CJAA 1NGAA 2OANA 5EVZA 4H0XB 5EXWA 2V7YA 3LDOA 4BGBA 2P9KB 3DAWA 2NLXA 1U2VB 4XH4A 5AQSA 5AQPA 3DWLA 1OKJA 3ZX0A 1NGDA 4FOEA 3VEOA 3CJCA 4FWKA 3AAPA 2A42A 2NZTA 4XH5A 2A40A 3LDLA 4M7YA 2ZGZA 4H0TB 3FR0A 3UKUA 1GLJO 4BR5A 3IMXA 4B1UB 2Q1NA 2D0OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DFHA 3ZEUA 1XMQK 1UOCA 4ISGA 4OPAA 3O9QA 3A5MC 4DU3A 4BRPA 4YHHK 3TR8A 3NCIA 3VQ6A 5C42A 1QS4A 1VQ7N 4CJEA 4K42A 2ZJPL 3C6UA 2QWNA 3H1QA 2HHWA 3HTVA 3SQ0A 4E7IA 1FW6A 3OYAA 1QZ5A 2GTDA 4LH4A 4M3XA 4JK8A 5HROA 1CZAN 4QS9A 2P9UA 5HBMA 4K25A 4ZTJA 4OPJA 4I9QA 2NRTA 3OYDA 1ZBSA 1HYSA 2FBVA 3KK1A 4TSXA 2XRIA 1CLQA 3WQUA 5B8HA 3LM9A 4DSIA 5J2NA 4IOCL 4BE0A 4K43A 1X9MA 2QW9A 4CJKA 1E4GT 4NCBA 4OKEA 4CGGA 3SUOA 5HRPA 1S1TA 1HJOA 1W0HA 1SQKA 3E9PA 4O8KA 3QBXA 2HHXA 3VMFB 4WFAL 1SZ2A 2FSKA 4H03B 5AZJB 4J2AA 3VF4A 4J2EA 1C6VA 3DRSA 1Q8IA 5A2QO 5FDLA 3KZBA 3THWB 3SQ2A 4F9OA 1TAUA 4B8CA 1BA1A 4Z4GA 4FJXA 3NF7A 1MWMA 5FPEA 1NOZA 2IDOA 3UIQA 3W0LA 4BRIA 1EWRA 1JL2A 3CIPA 3TSUA 2XY5A 5BN9A 1FK9A 1OH8A 2UYTA 1VAZA 3TSQA 3CERA 3L6QA 3KKRA 1QHAA 4DTSA 4JI6K 1KQSM 4BRFA 1X9JA 2HMIA 1XNQK 3VQDA 4FL9A 4V19S 4DR2K 1EX4A 2E1YA 1VQPN 1NWKA 1ASUA 2QWQA 3EE9A 4DF8A 4CK1A 3OYHA 2YHBA 5J2PA 2UXBK 2HMPA 2HBLA 3CJ7A 2NRVA 2HBMA 3AO4A 5JS2A 4ILGB 3KHYA 3VQAA 3RVCA 3D2EB 1VSIA 4CW7B 3FLCO 3H46O 3HM9A 3NH2A 1J6ZA 4DTUA 4CF1A 4JK7A 3M3ZA 3PUFA 2O4GA 4C8OA 3L2RA 4A5AA 5KRSA 3CCMN 1G99A 5M1FA 4CD3A 3IG1A 4IXCA 1TKXA 1K8KB 2O8DA 3KK3A 1YITN 3VGLA 1HQUA 4N41A 5BN8A 1XQSC 4FJ9A 3OYGA 3A8YA 4DR5K 2EX3A 1BISA 2UXCK 3WT0A 4F3TA 4BG8A 3CCEN 3H08A 1D9DA 4IDKA 2BGGA 1WBDA 4MFBA 2CGLA 2V51B 5AZJA 1NGIA 3LDQA 1TL3A 1CZBA 3RTVA 1G15A 3CG7A 1L3VA 1HJRA 3THWA 4E7LA 1VQ5N 4FSVA 4DTPA 1SAZA 4J2BA 5DMRA 4FPAA 3MXMA 4IOXA 3QEWA 1TUUA 4M3ZA 4NLCA 4YOXA 1XWLA 4ZTFA 4CJUA 4KI6A 3DXMB 1WOQA 1U4BA 4RW9A 3V81A 5KI6A 1RDDA 1HNIA 4W5OA 3M6GA 4WFNL 4DV0K 2QK9A 1KSPA 3O08A 5F1XA 3EKUA 4B08A 4W5TA 4HUGA 4DHYA 4AQYK 4KFBA 2D0BA 3NGZA 4CF8A 2G8IA 1JXEA 1NGGA 3D2EA 3EE8A 1KVAA 1HYVA 3W3DA 4B9QA 4W5RA 3MWTA 5FRNA 3NMUA 4FLYA 4AH9A 3TAFA 1RBVA 2WONA 4KB0A 1Q82O 2HHHK 5I3UA 4CHNA 4Z4IA 3NVMA 5HRSA 3GG4A 3PO4A 2OYQA 2Q31A 2KZZA 4DR3K 3U9DA 3ZLJA 1WSIA 4ID1A 3HSTB 5M1PA 4O5FA 3TPQA 3AVFA 1BIUA 1HPMA 3C0BA 1YAGA 1K8KA 4MDBA 4DFKA 3RMDA 2ZJQL 4DQQA 3IFRA 1JJ2M 1MA9B 4JKGA 1YVUA 3EZWA 5JLHA 2PZSA 3C94A 3CFRA 1DT9A 1KLNA 4A2BA 2BH1A 5CYQA 2G8WA 3DMJA 1NK0A 3NHGA 4DV7K 1RDAA 2NUBA 1LWEA 1VSLA 3SUNA 1C0FA 2FBYA 4IWVA 5FPDA 1EWQA 2Q2RA 1NK4A 3THYB 1QE1A 4CK3A 4F8RA 3DYAA 1ESVA 2DTUA 3OYMA 4G1QA 5AQRA 1BHLA 4BR7A 3NF6A 4W5QA 3ATVA 3BUZB 5SWMA 3DXMA 1NJIO 2HF3A 4YDUC 4LF9K 3CHWA 4Q5VA 1YJNN 1LV5A 3SV4A 1NJYA 2Z1JA 4BVPA 4CBUA 1VK0A 3MN7A 3HSCA 4XH1A 2E2NA 1RTIA 3DLGA 3DJCA 3VEVA 3KD1E 4WF9L 2FC0A 1LWCA 4B1WB 4DTOA 1K6YA 1RBSA 5KQDA 2ATQA 2YKMA 4LH5A 2FBTA 3LL3A 3LM2A 4E7KA 3CMEN 5JMVA 5GAEP 3TTDA 3PIOL 3FFKB 2KHOA 2KFZA 2PBDA 1IH7A 4EP5A 4C8KA 3HK2A 4CJ3A 4FK4A 4CZKA 4EHUA 4YDUA 3QFUA 3TANA 2P9IA 1N5YA 2OTLN 4LSLA 4CECA 3E01A 3THXB 1DLOA 4CHQA 1VRUA 2NRXA 1N8RO 3AA4A 2E20A 4KHUA 1VSHA 3EY1A 3R3LA 4B1YB 1WN7A 1VSMA 3PIPL 4CGFA 1K9MO 2OTJN 4FWPA 3QIPA 5BPNA 3VA0A 3DM2A 4AM7A 3LAKA 3VQPA 3ZT3A 3J81O 2UUCK 1HNZK 3K5MA 2HVHA 3GL1A 4CEQA 3ZT1A 1XHXA 3OVNA 4M45A 3THYA 4CJVA 3HL8A 5AQQA 5BR9A 4JRPA 2UUAK 3TAEA 2Q0UA 4CJRA 3CCUN 1RILA 3CCVN 2YHXA 3B6PA 2VGMA 1SKRA 4O55A 3D0PA 3EO3A 3CM5A 3CQYA 4Y1DA 3F73A 4CF2A 4WYBA 2P9PB 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3TABA 2WFBA 3OS2A 3NGYA 3DXKB 3KLHA 1HMVA 4CIEA 2OPQA 2X74A 4H0OA 3GOIA 1YJWN 2X6SA 1JCFA 1E3MA 5HRRA 4EFHA 4LSNA 2BE2A 4CF0A 1T03A 2DPNA 1VSKA 4BY9C 4HUFA 3U9ZA 1OH6A 3QESA 1S1VA 4M63C 3CFOA 1MDUB 1KVCA 3UE5A 2BTFA 2F96A 5CR4A 3OS0A 4W5NA 3VA3A 1UAXA 5KPZA 4FLVA 5AQZA 3R8EA 1RT3A 2OCEA 3G0ZA 3SCXA 3BF1A 4CZEA 4DQPA 4CJPA 2E8AA 3DRPA 2W6LA 1XMOK 4FYDA 4FJNA 1T6CA 4FOIA 4EIAA 3WXKA 2P5OA 3VQEA 4BDPA 4FWRA 1BCMA 3LP2A 4M3UA 4IOAL 3OYKA 3VGKA 2E88A 3AO1A 3AO5A 4PKIA 3D2FB 2QWRA 4WQ5A 3G10A 4IZ9A 3O4QA 1S5JA 3HJFA 1DGKN 1IBKK 4NLBA 1NMDA 1M90O 3L4IA 4R5PA 2ASMA 3G25A 4CJ7A 3QNNA 4A5BA 3FE1A 3LP1A 2XY6A 4C23A 1SV5A 3MEEA 1E4FT 2GV9A 1QQMA 3ZSZA 3VTIA 3B6OA 4B1ZA 3MWPA 3AVBA 4OGEA 5IWAK 1I3AA 1GLCG 2B5JA 3EKSA 5AQKA 3M8SA 3LZJA 3CM6A 4OVLA 4OKKA 3ZSXA 4MDAA 1H1VA 1ATNA 1LW2A 3CQ8A 3K2PA 3OYFA 1IJJA 3AAQA 3SAGA 4RWTA 4FLWA 4NXMK 3DXKA 3AARA 4F4KA 1QQNA 1OVYA 3OYBA 2F8TA 4E3SA 3VEXA 1P90A 2WC9A 1RT5A 1WSJA 2YI1A 4PKHA 4FW2A 1KLMA 5CZ1A 4AHUA 2OPPA 3SQ1A 2O8BB 3O6WA 4CEFA 5J1EA 4BR4A 3RMAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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