1HUXA

Crystal structure of the acidaminococcus fermentans (r)-2-hydroxyglutaryl-coa dehydratase component a
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
SIYTLGIDVGSTASKCIILKDGKEIVAKSLVAVGTGTSGPARSISEVLENAHMKKEDMAFTLATGYGRNSLEGIADKQMSELSCHAMGASFIWPNVHTVIDIGGQDVKVIHVENGTMTNFQMNDKCAAGTGRFLDVMANILEVKVSDLAELGAKSTKRVAISSTCTVFAESEVISQLSKGTDKIDIIAGIHRSVASRVIGLANRVGIVKDVVMTGGVAQNYGVRGALEEGLGVEIKTSPLAQYNGALGAALYAYKKAAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Metal binding protein
molecule keywords ACTIVATOR OF (R)-2-HYDROXYGLUTARYL-COA DEHYDRATASE
publication title Crystal structure of the Acidaminococcus fermentans 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase component A.
pubmed doi rcsb
source organism Acidaminococcus fermentans
total genus 76
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2001-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1huxA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1huxA01
2QWNA 3GDQA 1HX1A 4JHDA 3SMSA 3UKRB 4JAXA 5ADXH 1YVNA 2VCPA 2HF3A 1GLBG 1HLUA 1XUPO 1XC3A 4BG8A 3HZ6A 1HKGA 1MA9B 3O5BA 5AZIA 4CBXA 2P9KA 2V52B 3CHWA 3WXLA 4BRPA 3VGKA 1MDUB 5F2RA 3R9PA 3WQUA 4H5RA 3ENOA 4M7XA 3VERA 1HUXA 1NGIA 4BQLA 2KHOA 2D0OA 5LJWA 2IVPA 4FPBA 3ATUA 1X3MA 3VPZA 2Q0RA 3RSEB 3LDNA 3QB0A 1IG8A 4M63C 1K8KB 3O8MA 2QW9A 5BRFA 2D4WA 2Q2RA 1U2VB 1NLVA 1ZC6A 3ZETA 2E88A 3HI0A 4LC9B 4WYBA 4Y0WA 4EIAA 3LDPA 3WXJA 5I9EB 5AQLA 2Q97A 1MWMA 4A62A 4FWMA 4BRMA 3D2FB 1TYQA 3MN5A 4AM7A 1KAZA 5AFUA 4B9QA 3BEXA 3I33A 4BRQA 4FWRA 3UKUB 4CZFA 3CI5A 4BQZA 1YAGA 4BRNA 1BU6O 3BP8A 1LCUA 2QWOA 3BF3A 3HSCA 1KAYA 4BRIA 3C7NB 4H0OA 5AQTA 3VESA 4HWIA 3AAQA 5FPDA 1BA1A 5JMVA 4MLEA 4HTLA 3ULEA 3H6EA 5F0XA 1S22A 2FSNA 3A5MC 3JS6A 3CQXA 2QWPA 3GBTA 1QHAA 3U8XA 4BRLA 4BREA 3FFKB 1CZAN 3F9MA 3EKUA 1NGDA 3GG4A 5E26A 3G25A 3VENA 2CGLA 2GELA 4BVPA 1YUWA 1ATRA 5FPEA 4CZLA 2V7YA 2ZWHA 4H0TB 3KZBA 4JN4A 3CERA 4JNEA 2A42A 1QZ6A 3O1WA 1NBWA 2ASOA 2BTFA 3S41A 4IJNA 3VF4A 4CD3A 5AR0A 1DGKN 2P9PA 4FOEA 3WXIA 5AQYA 4C23A 1KXPA 3B8AX 1JCFA 2YCHA 3VEZA 3VEXA 2YHWA 4WQ5C 4BR9A 2CH5A 1JCGA 3L0QA 3LM9A 3WT0A 2IIRA 1X3NA 3W3DA 1SQKA 3L4IA 2P9UB 1RDWX 3DWLA 5F1XA 2E2NA 1Q18A 1SAZA 3QDKA 4XH5A 4WQ4A 1GLCG 4FL9A 5BN9A 3VETA 3GE1A 3O08A 1DEJA 5AFUH 3MN9A 1HJOA 2EWSA 3LM2A 3EKSA 5AQMA 1Z6RA 4BROA 4A2BA 3GOIA 5EOYA 3FLCO 1J6ZA 3CETA 1T6CA 4M7YA 4FWNA 1GLLO 5BPNA 3VEOA 4A2AA 5BRHA 3O80A 4A61A 2E20A 2CGJA 1QQNA 1BA0A 3FZKA 4JHDB 5AQGA 5AQWA 2BUPA 5AQVA 1NGEA 5AQKA 4FWSA 3HBTA 3MDQA 2YJFA 1WUAA 5TKYA 4EAHD 4YDUA 3MMVA 4B1VA 5AQNA 3KHYA 4CZMA 1NM1A 1BG3A 5AZIB 3WUHA 2P9KB 5B8HA 1GLJO 3SMPA 3AY9A 5BPMA 3D2EA 3QBWA 4H0XB 4RWTA 2HMPA 3O6WA 1ZBSA 3BUZB 3KVGA 3R8EA 5BRDA 4FPAA 3CJAA 4QS8A 5AQRA 2VYPA 4H0YB 2QWRA 3O1BA 1IJJA 4BRAA 2P9SA 1S3XA 2W41A 4PKHA 4BC5A 3DXMA 3IUCA 3DXKA 2V51B 3AAPA 4IO8A 3VGMA 2GEMA 4H5WA 1HPMA 1K8KA 4JD2A 4BC4A 3CJ7A 1HKCA 4FO0A 4BRCA 1MWKA 5KPTA 3ZETB 5LY3A 3QFPA 4KBOA 4NO7A 3EN9A 1V4TA 5AQZA 2ZGYA 3DJCA 3A5NC 1TYQB 3U9ZA 4CI6A 3VF6A 4CZHA 2YHYA 1Z05A 4IWVA 1E4FT 3ZX3A 5AQXA 3H45C 3BF1A 4H0VB 4B1WB 1C0FA 3EO3A 4CZGA 2A41A 4F9OA 4BRDA 1V4SA 1BDGA 4XEIA 3UE5A 1QQMA 2Q31A 3ULEB 1BUPA 3HTVA 4FWPA 4NB4A 5AZJB 3CJ1A 3QBXA 3VOVA 3TPQA 2NLXA 1GLAG 3FZMA 1EQYA 5BREA 1GLDG 2YI1A 5CE3A 1RFQA 2Q1NA 1G99A 2QWQA 3A5LC 3J8AA 4CJ7A 4B1ZA 1NGBA 5AQIA 1JCEA 2FF3B 2OANA 5AQFA 3M1FA 4XH4A 4PKGA 4DQ8A 2E2QA 3MK6A 1T6DA 2DPNA 3LDOA 1GLFO 1BOTO 2CH6A 4FWOA 2GUPA 5KPRA 2UYTA 3IFRA 4GNIA 4QS7A 4CZKA 3ATVA 3R6MA 4MO5A 2QM1A 2A3ZA 4K43A 3H1QA 4BRHA 2P9LA 5ELZA 2P9PB 3VEWA 4FWLA 4QS9A 5EXWA 1NGJA 4I6MA 4MLHA 4O8KA 3U4LA 3WXKA 2E2PA 2P9IA 4BGBA 3VEVA 3WQTA 1OKJA 2AA4A 5EVZA 2FLOA 2P9NA 4PKIA 5KQ8A 3ZEUA 1D4XA 3WEEA 2GTDA 2GWJA 3FE1A 1LOTB 4BC3A 4BRKA 3FZLA 1T44A 2FSJA 2Q36A 3M6GA 4BC2A 2GWKA 3SJHA 4H5TA 3UKRA 2PAVA 4DCHA 4EHUA 2QXLA 2NRHA 3FR0A 1X9JA 3QICA 3U9DA 3IDHA 2IVOA 2WUSA 4PL8A 3QMLA 4BR0A 4CZJA 3H46O 2PBDA 4DB3A 4RTFD 3VGLA 1P8ZA 1QZ5A 3ZX2A 2FXUA 4CBWA 3VEYA 4BRFA 4BRGA 3D2EB 2I7NA 2I7PA 2VWBA 3W0LA 4B1XB 1KAXA 3RSEA 4K25A 2H3GX 5BPLA 3MCPA 2QWLA 4H5VA 2CGKA 1U2VA 2P9SB 2Q0UA 3AARA 3GL1A 4K41A 4L3QA 3DXMB 3DXKB 1NMDA 2F9TA 1U6ZA 1XQSC 3P4IA 1SZ2A 5AQPA 4JD2B 1BWFO 1DKGD 3D2FA 5EX5A 4E1JA 4WQ5A 2V7ZA 5JLHA 2W40A 4WQ4C 3UKUA 4BR7A 3MN7A 2A5XA 3FZHA 5AQHA 4H5NA 5AQQA 4B1YB 3H1VX 5EY4A 3ZX0A 5FPMA 2ZF5O 3C7NA 3EZWA 1NGHA 2FSKA 2ITMA 2ZGZA 1GLEG 4O5FA 1Y64A 2F9WA 2YJEA 5AQUA 4BG9A 4EHTA 1QQOA 1NWKA 3FZFA 4ISEA 3DAWA 4EFHA 4PL7A 5BN8A 1ATSA 5ADXA 5JICA 1ESVA 4Z94A 5LJVA 5AQSA 3I8BA 4GY2B 3ENHA 2E8AA 1ZXOA 3HM8A 5AZJA 4CD1A 1WOQA 4FSVA 4H0PA 4YDUC 5KQDA 4ISGA 2E2OA 3VF2A 4MO4A 3IMXA 2D1KA 3A5OC 5KPZA 4B1UB 1TUUA 4BR5A 3A0IX 1HKBA 3H3OB 2D0PA 4ISFA 1NGAA 2ASPA 3D7EO 3ID8A 1TUYA 3FGUA 1C0GA 3A8YA 4FOIA 4DHYA 3JXUA 3O4WA 2E1ZA 3M3ZA 4AM6A 4K42A 4BVOA 1NGFA 3CIPA 3LDLA 4IZ9A 4H03B 2HF4A 2A6AA 5FPNA 1RGIA 3QFUA 4BGAA 4IJAA 4FWKA 4XH1A 5E84A 3UB5A 2P9LB 2QWMA 1ATNA 2P9UA 2J4RA 3L6QA 1R59O 4BR2A 5AQJA 4CZEA 3LDQA 2IVNA 4I6MB 3CQYA 3H3NO 4J8FA 3EL2A 3SLCA 4CBUA 2P9IB 1E4GT 3CJ9A 2AP1A 2FF6A 3LL3A 4RCHA 2ASMA 2P9NB 3CJCA 4FWQA 3ZEUB 4CZIA 2E1YA 3MN6A 3C0BA 3WEEB 1BO5O 2HOEA 3TU5A 3SK3A 3OHRA 2A40A 1NGCA 3CJBA 2NZTA 1H1VA 2YHXA 1NGGA 4IXCA 5JLFA 1YXQA 5AQOA 4BR4A 5BR9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3GDQA 2DFFA 5ADXH 4JAXA 1YVNA 4DQRA 4IG3A 4B9SA 4W5OA 2HHQA 3VQBA 1XC3A 1EETA 2JWLA 4BG8A 2I5JA 1NMNA 4CJWA 4Z4EA 3DLLL 3CHWA 3QIPA 4BRPA 4WFAL 1D9FA 1MDUB 2AJQA 3KLHA 3LZJA 4FJLA 3QNNA 2B6AA 4KV8A 3CXCM 3NDKA 3SJJA 1VSLA 4NXMK 1SKWA 4C1NI 4FLXA 2R7YA 1FKOA 4FLZA 2D0OA 3AA5X 3ATUA 3TTDA 1X3MA 2OPPA 4CW7B 2X6SA 3CC2N 2Q0RA 3RSEB 4KKOA 2D0AA 1XWLA 4HVJA 5BRFA 5HL7L 2D4WA 2Q2RA 1U2VB 3U6FA 1ZC6A 3MXJA 3ZETA 2E88A 3DRRA 4Y0WA 4WYBA 5C42A 5I9EB 5AQLA 2Q97A 1XI1A 3ZSWA 4BRMA 2OCEA 2O8DB 1NK4A 1DLOA 2LSNA 4BRQA 4FZZA 3CI5A 2EHGA 1MU2A 1BU6O 1ZYQA 3BP8A 3NH1A 1LCUA 3AGRA 1KAYA 4BRIA 4KI6A 4LD0A 2IOCA 5AQTA 1XMOK 4PY5A 4LF9K 5FPDA 3HOTA 3T1YK 1BA1A 4HTLA 3J7ZO 3TI0A 3KK7A 5F0XA 1KD1O 1S22A 5KRTA 3JS6A 3CQXA 2QWPA 3MX2A 4O0IA 2KQ2A 2YHAA 3GBTA 3QIOA 2XY6A 5J1EA 3AO2A 1K9MO 1CZAN 1HYVA 4JI4K 3EKUA 3O4NA 4M3YA 1NGDA 3GG4A 3OYHA 4CJVA 1SL2A 4QAGA 3THWA 1D8YA 4A59A 4CZLA 5CZ1A 4BE1A 1TKXA 2V7YA 2ZWHA 4OLBA 3LP1A 3CERA 4JV5K 2FBTA 5M1KA 3RMBA 2P51A 4MDBA 4IJNA 1W0HA 4FOEA 1YITN 3V1QA 3VEZA 4LF5K 1VQMN 4WQ5C 1JCGA 5C2DA 1JLCA 2IIRA 1RDWX 4O8UA 2Z1GA 4XH5A 1SL1A 4WQ4A 1GLCG 3F9KA 4KREA 2BE2A 1B9FA 1DEJA 2HBMA 5HLFA 3EKSA 4FVMA 5AQMA 2OZMA 1QS4A 3H08A 1K73O 3GOIA 2HVIA 4IBNA 5FRMA 3FLCO 4HUGA 1NK5A 3R1XA 4IFVA 4DV3K 5M1OA 3VEOA 3HJFA 3O80A 4A61A 2PYJA 3CFRA 1N5YA 1BL3A 4R79A 1U45A 3RMDA 4KH6A 2Q3SA 2BUPA 1RNHA 5MLCQ 1NGEA 4DQSA 4FJKA 4YNQA 4WCEL 1WUAA 3VQAA 3VQCA 4B1VA 4LSLA 4CZMA 4KHQA 5AZIB 5B8HA 1EP4A 1J5OA 1LAWA 5BPMA 3D2EA 3QBWA 4H0XB 4N76A 1ZBSA 3KVGA 3AVJA 5BRDA 4FPAA 4OGEA 4QS8A 5AQRA 4FJ5A 3E9PA 4BRAA 1IBLK 1S3XA 2W41A 4PKHA 2VG6A 3TAFA 3DXKA 3AAPA 4IO8A 5CZ2A 2D0CA 3VGMA 4DFKA 4GKKK 2GEMA 2HBKA 3OYLA 4FLVA 3CMEN 1K6YA 4RW4A 3CJ7A 3ITHA 3L2VA 4DV7K 3PSIA 4KI4A 4KBOA 2ETJA 4NO7A 4LY7A 2NRVA 3U3YA 3K5LA 1ZBLA 1TAUA 3CFPA 3D0PA 3RMCA 3VF6A 4CZHA 2F4VK 2HB5A 3CCEN 4B1WB 1VQ8N 2QA4N 4F3OA 2A41A 4BRDA 1RBRA 4FLTA 3LZIA 4YFUA 1BUPA 3HTVA 4NB4A 1YHQN 3QBXA 2G8VA 2XO7A 4DTPA 1OVYA 3QNOA 5CYQA 4CEOA 2ZQBA 1EQYA 3BY5A 4OJRA 3K5OA 4JS4A 1P90A 2WC9A 4FJHA 5CE3A 1S5JA 1RBUA 2KLAA 4B1ZA 5AQIA 4NXNK 4XH4A 4DR2K 1JLEA 1WSFA 3AV9A 4HUEA 3EEQA 3MK6A 2DFHA 1OH6A 3EZ5A 2QXFA 4ILJA 4C8MA 4I9LA 3R6MA 3H1QA 1EWQA 2G8WA 1C0UA 3KD5E 2KZMA 4FW1A 1YJ9N 3SUPA 4QS9A 1KCFA 1NGJA 4O8KA 5IT9O 5C15A 3O3HA 4BE0A 4Q5VA 2HHSA 2P9IA 5SZTA 3RMAA 5J2PA 1NJYA 2OTLN 4ILGB 1QVFM 3QEVA 5GIOA 4PKIA 5KGWA 3HYFA 3DI6A 3OS2A 4FJGA 3FE1A 4YOUA 4CGGA 1KSPA 4HTUA 3LP0A 4U7BA 4BC3A 5M1QA 1LW2A 3MXIA 1RCHA 3NVMA 1T44A 1TAQA 4BC2A 3T1AA 3TAQA 3SJHA 4H5TA 4HCCA 4C8OA 4FZXC 2D0BA 5C2FA 3SUOA 2NRHA 4DV1K 4NCAA 4DU1A 3QICA 4A5BA 4AHSA 4KTQA 1LWFA 3RR7A 5BR8K 1JXEA 3QMLA 4Y1DA 1HYSA 4NLCA 1ITGA 3VGLA 3HVRA 1QZ5A 4CBWA 3VEYA 4KTZA 3PX4A 1CLQA 4DQPA 2I7NA 4PUOA 3OYDA 2VWBA 4IFYA 4JRPA 3RSEA 3EY1A 3G4SN 4C8KA 4JI5K 4X62K 2CGKA 1U2VA 4I9QA 4NCBA 2W6LA 1NJWA 2BDPA 4B3MK 3ZSZA 5GAGP 2F9TA 4JD2B 4YOVA 2O8DA 5JLHA 2V7ZA 4BR7A 5AQHA 4JKFA 5FPMA 4DFPA 2ZF5O 3ASMA 4CF0A 1NGHA 2ITMA 4BY9C 1Y64A 2F9WA 4EHTA 4LFAK 4DSEA 3WNHA 1M90O 3FZFA 2G8IA 4ISEA 1VQ5N 3C6UA 3DAWA 3O9SA 5BN8A 3SAHA 3SV4A 1OH5A 4DSJA 4Z94A 5D3GA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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