1HUXA

Crystal structure of the acidaminococcus fermentans (r)-2-hydroxyglutaryl-coa dehydratase component a
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
SIYTLGIDVGSTASKCIILKDGKEIVAKSLVAVGTGTSGPARSISEVLENAHMKKEDMAFTLATGYGRNSLEGIADKQMSELSCHAMGASFIWPNVHTVIDIGGQDVKVIHVENGTMTNFQMNDKCAAGTGRFLDVMANILEVKVSDLAELGAKSTKRVAISSTCTVFAESEVISQLSKGTDKIDIIAGIHRSVASRVIGLANRVGIVKDVVMTGGVAQNYGVRGALEEGLGVEIKTSPLAQYNGALGAALYAYKKAAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Metal binding protein
source organism Acidaminococcus fermentans
publication title Crystal structure of the Acidaminococcus fermentans 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase component A.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACTIVATOR OF (R)-2-HYDROXYGLUTARYL-COA DEHYDRATASE
total genus 76
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2001-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1huxA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1huxA01
5BPLA 4H5RA 4JHDB 5AQVA 2W40A 3WQUA 1NGGA 3D2EB 2IVOA 3S41A 4JNEA 4BGBA 5JLFA 3FZHA 4H5WA 1XUPO 4I6MB 4PL8A 3WUHA 2ASPA 1BWFO 2V52B 3HTVA 3C7NB 3O6WA 4B9QA 2E20A 2FLOA 3SJHA 3CETA 4CI6A 5AQGA 2HF4A 5AQKA 3ZX0A 3ULEB 4RCHA 4QS9A 4FWKA 3BF3A 3IUCA 1E4GT 3VERA 4JD2A 1TUUA 2FF6A 4HWIA 3O08A 2E2OA 1YXQA 3H6EA 1R59O 4K41A 3LDOA 2FSKA 1T6DA 4DHYA 3MN9A 4M63C 4ISEA 5AQTA 4A61A 4BRCA 1GLEG 3AY9A 1Z6RA 1QHAA 2FSJA 5AQOA 1HKBA 3C0BA 1YVNA 4PKGA 3F9MA 4H5VA 2QWOA 3GL1A 2GEMA 2IIRA 3WT0A 2D1KA 3I8BA 2J4RA 1QQMA 1J6ZA 3LM9A 1KAZA 2E2PA 1RFQA 5AQJA 2V7YA 1SQKA 2UYTA 1TUYA 4H0XB 3VF4A 4CBXA 4IO8A 1ATNA 3EO3A 3WXLA 4XH4A 2P9NB 3M6GA 3O8MA 4C23A 4BC2A 1NGDA 5BN9A 4YDUC 3QBXA 4H5TA 2ZGYA 3CHWA 3VEWA 5AQNA 2QWQA 1JCEA 3B8AX 1P8ZA 2CH6A 5BREA 1GLAG 3VF2A 4CZHA 5B8HA 1NGEA 3P4IA 4KBOA 4BVPA 3H3NO 3FZLA 4M7XA 3H3OB 3WEEA 2ASOA 5ELZA 2FSNA 4CZMA 4L3QA 3DAWA 3QICA 1Q18A 1QZ6A 3VEOA 4EHTA 1DKGD 3FR0A 3W0LA 3ZEUA 3ZX3A 3O5BA 4EHUA 3H45C 4GY2B 5FPEA 4BR5A 5LJWA 3CJCA 4MLHA 4FWNA 3UKUA 3W3DA 4BRDA 1QQOA 2E1ZA 1KXPA 3HM8A 3CQYA 3SMSA 3MN6A 5F0XA 5AQIA 2BTFA 1MWMA 3FLCO 4BR7A 3UKRA 2ZGZA 4B1UB 1HKGA 2P9IA 3VESA 1C0FA 1MDUB 2YJEA 4BC3A 3TPQA 2P9SA 4ISFA 1U2VA 5E26A 1ZC6A 3HI0A 4JD2B 3LDPA 2ITMA 3LDLA 4NB4A 4PKHA 4CZKA 2AA4A 2GWKA 4BRNA 1NGHA 3HSCA 2QM1A 4FOIA 2Q36A 2KHOA 4BRHA 3D7EO 1K8KA 4GNIA 4BRQA 3LDNA 2GELA 1NGFA 4WQ5C 4WYBA 5AQZA 5FPNA 2FXUA 4EFHA 5JLHA 1GLBG 3UB5A 1ESVA 3TU5A 3JXUA 2GWJA 4CBUA 2F9WA 3A5LC 2CGJA 4A2AA 4BRKA 4PL7A 4FL9A 2D0OA 1X9JA 1GLLO 3R8EA 1HLUA 4J8FA 2EWSA 4K43A 1QQNA 1BG3A 4CZGA 4FWSA 5AFUA 1SAZA 2CGKA 2Q2RA 5AZJA 5JMVA 3CERA 4CZJA 5KQDA 3A5NC 3QMLA 1BO5O 3L0QA 1S3XA 1Z05A 3L6QA 4FWQA 3VENA 2PBDA 2QWLA 3VF6A 1NM1A 5EVZA 3GDQA 1G99A 5KPZA 3IMXA 3ZX2A 1XC3A 3G25A 5ADXA 2Q97A 4CBWA 3A8YA 3WEEB 3ZETA 2QWNA 3LL3A 3RSEA 1U6ZA 1T6CA 3VEZA 3DWLA 3VEVA 4B1WB 1BDGA 4BGAA 3OHRA 3ZEUB 2D0PA 3FFKB 3D2FA 1ATSA 2F9TA 3ATVA 2HMPA 4FSVA 1YUWA 3UKUB 5F2RA 1GLJO 4AM7A 4IJAA 5AQUA 4WQ4A 4BRAA 3M3ZA 3ID8A 3VETA 4CZFA 4JAXA 4XH1A 1GLDG 5AQRA 4CJ7A 2E2QA 3UKRB 3LDQA 4CD1A 1X3MA 3A5MC 3EKUA 2P9IB 5FPDA 1BU6O 5AQFA 4A62A 2NLXA 2V51B 2YHYA 2P9LA 1HKCA 2P9SB 3U4LA 1U2VB 1KAYA 5LJVA 2P9KA 3A5OC 3GBTA 4NO7A 4H0OA 5BR9A 5BPNA 2A6AA 1X3NA 2DPNA 5KQ8A 1K8KB 3BP8A 2ZF5O 3QBWA 2W41A 3MMVA 2A3ZA 3QFUA 5EOYA 3VEYA 1JCGA 1BOTO 3DXMA 3GE1A 1JCFA 2IVNA 3BEXA 3CJ9A 4BRPA 3O1WA 1BA1A 4DB3A 1NLVA 4EIAA 4K42A 4BRMA 4BR0A 4RWTA 3CJBA 2QWPA 1C0GA 2ZWHA 4BRFA 3EN9A 1NWKA 1V4TA 3IDHA 3BUZB 4B1ZA 4FWRA 4H0TB 5BRFA 5BN8A 5AZJB 2YCHA 4BR4A 3H1VX 5AFUH 4PKIA 4FPBA 3H1QA 4JN4A 4ISGA 4B1XB 4IXCA 4CZLA 1IJJA 2YJFA 5E84A 1BA0A 3UE5A 3CJ1A 4RTFD 5AQMA 3GG4A 1SZ2A 4Z94A 3MK6A 5AQLA 4H0YB 2V7ZA 1NGIA 3MN7A 2A5XA 4MO4A 5BPMA 5KPTA 5ADXH 3ZETB 5AZIA 2GUPA 2VWBA 4Y0WA 4CD3A 3RSEB 1RGIA 3AAQA 1NGJA 3GOIA 3U8XA 4FO0A 3SMPA 3D2FB 3ATUA 3WXKA 2E1YA 4O5FA 4E1JA 2I7PA 4H0PA 4IWVA 3SK3A 1LOTB 3EL2A 4BRIA 3VGKA 4IJNA 4BVOA 1YAGA 1BUPA 4EAHD 1CZAN 2I7NA 2H3GX 1D4XA 3SLCA 3WQTA 2A42A 5EX5A 5AQSA 3KZBA 4IZ9A 1MWKA 3VOVA 4B1VA 2P9LB 5BRHA 3CQXA 2Q31A 1DEJA 4H03B 3R9PA 4K25A 2P9PA 1H1VA 2QXLA 1WUAA 2P9KB 4FWPA 4YDUA 5AQHA 3M1FA 4CZEA 3JS6A 3MDQA 4BREA 3O1BA 3BF1A 4BC5A 4XH5A 4BG9A 1HX1A 1HPMA 5JICA 4HTLA 1TYQA 4BR9A 4QS8A 3O80A 2YHXA 2FF3B 4AM6A 3O4WA 4M7YA 3ENOA 1ZXOA 2P9UA 1NGAA 3QB0A 3DXMB 3VPZA 3CJAA 3DXKA 1EQYA 3H46O 2CH5A 4DQ8A 3FGUA 5TKYA 4JHDA 5AQXA 2ASMA 2NRHA 3D2EA 4BC4A 4BRLA 4QS7A 4BG8A 5I9EB 2A41A 2Q0RA 2HOEA 3LM2A 4I6MA 5AQWA 1MA9B 1V4SA 3CJ7A 4FOEA 2QW9A 3I33A 3C7NA 4DCHA 1HJOA 2D4WA 3DJCA 3FZKA 3R6MA 5CE3A 4FWMA 4MO5A 4O8KA 2VCPA 3IFRA 3EKSA 1ZBSA 1S22A 3ULEA 2A40A 5F1XA 2CGLA 2NZTA 4BROA 4LC9B 3VGLA 1QZ5A 3HZ6A 1LCUA 1NBWA 2PAVA 5AZIB 4H5NA 1DGKN 1ATRA 5AR0A 1NMDA 4H0VB 2OANA 1KAXA 4WQ5A 5AQQA 3U9ZA 4BRGA 1NGBA 1OKJA 2YI1A 5AQPA 3J8AA 1E4FT 1RDWX 2QWMA 1IG8A 3HBTA 1T44A 2YHWA 4XEIA 4A2BA 4CZIA 5AQYA 1GLFO 4WQ4C 2WUSA 3AAPA 2GTDA 4FPAA 5EXWA 2Q0UA 3U9DA 1NGCA 2BUPA 2E8AA 1Y64A 2Q1NA 3MCPA 1XQSC 3WXJA 2E2NA 2P9NA 3EZWA 3FZMA 1WOQA 3VGMA 3FZFA 4MLEA 2P9PB 2AP1A 3KVGA 4BR2A 5KPRA 3KHYA 3VEXA 4BQZA 1HUXA 4B1YB 3QFPA 4FWOA 3WXIA 2E88A 1TYQB 4F9OA 3L4IA 3QDKA 3MN5A 5LY3A 3FE1A 2VYPA 3A0IX 1GLCG 2QWRA 3CIPA 2HF3A 4FWLA 2P9UB 3ENHA 5EY4A 5FPMA 2IVPA 5BRDA 3AARA 4BQLA 3DXKB 3CI5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WNGA 3QNOA 4W5QA 4JHDB 3TTFA 4I7FA 3P31A 2E6LA 3D2EB 1TL3A 2JWLA 2XY8A 1GOAA 4JNEA 4BGBA 5JLFA 3WUHA 3P38A 1BWFO 1M90O 3C7NB 4FJKA 3KIOA 3TTCA 3CETA 1RDUA 1D8YA 5HOOA 3BF3A 3IUCA 2G8FA 1E4GT 3BY5A 3ZT0A 3V1OA 4DG1A 4CHOA 1YXQA 3H6EA 3O9TA 3B6PA 3LDOA 1XNQK 2FSKA 1T6DA 1VQ7N 3BZKA 1ITGA 1KC8O 1GLEG 4IFYA 4GW6A 1Z6RA 3LAMA 4R79A 2FSJA 3C0BA 1YVNA 3J7ZO 3F9MA 3CQ8A 2GEMA 5IWAK 2J4RA 1IO2A 2R7YA 1K9MO 1NK5A 2E2PA 5AQJA 1W0HA 3DRRA 4GMJB 5J2NA 4RW7A 4C8OA 4XH4A 3M6GA 3KWIA 1L3TA 4CJLA 3O8MA 4M3ZA 4DSKA 4DFMA 4BC2A 1J54A 1NGDA 4FJHA 4KI4A 3CG7A 4IFVA 3QEVA 1E3MA 1KVAA 5AQNA 3B8AX 1P8ZA 2CH6A 1GLAG 3K5OA 4KAZA 3DRSA 4K8ZA 3DLEA 4KBOA 3KD1E 2E6MA 5ELZA 4KI6A 2QI2A 1UOCA 3DAWA 3QICA 1VQ8N 2P51A 4Z4IA 3VEOA 2G8WA 3W0LA 3NMUA 4KREA 2NRVA 3O5BA 4EHUA 1SUQA 1U47A 2JWKA 2NRXA 1BGXT 3TSPA 4MLHA 3TAEA 3AVAA 1KXPA 1RT3A 3AA3A 1WLJA 1W7AA 4BR7A 4J2EA 1A5WA 2ZGZA 2ZM6K 3RRHA 3SQ2A 4JI8K 5SWMA 2P9SA 4C8NA 3VMFB 1VQPN 1ZC6A 4Z4HA 1Z26A 1IBLK 3E9LA 4JD2B 3LALA 3LDPA 4PHTX 3D0PA 4AHUA 3V9SA 3F5TA 2GWKA 4BRNA 4DU3A 1NU0A 2Q36A 3OYFA 3KLGA 1K8KA 4BRQA 3VA0A 3DLBA 5AQZA 2HHTA 2GV9A 3V9ZA 2JGUA 3CC4N 2HNYA 4HUEA 4B3SK 2HMIA 3A5LC 1KFSA 2QEXN 3PV8A 4CEOA 4N5SA 2D0OA 5FLXO 3OYEA 4GKKK 1VQLN 3ZYYX 2BANA 1QQNA 1VQNN 2CGKA 1BCMA 4CZJA 3L0QA 1NK8A 4FWQA 4RW6A 1XMQK 1I39A 2G8VA 4X62K 2QWLA 4ZTFA 2G8IA 3VF6A 3VQEA 3J81O 4FJ9A 5GAGP 3CD6N 3GDQA 1G99A 4B9SA 3ZX2A 1YJNN 3V81A 4DFKA 2Q97A 4C8LA 4CBWA 3A8YA 3THVA 4JKEA 2XY6A 3OBYA 1U6ZA 4DR4K 1T6CA 1S9EA 2FC0A 3VEVA 4DU1A 2D0PA 3QO9A 5HLFA 2IDOA 3ATVA 2HMPA 1DTTA 2FBXA 2KZMA 1KTQA 3UKUB 3NGYA 3OYJA 1GLJO 2IC3A 1JKHA 3T19A 3VETA 4FLWA 4CJEA 4JAXA 1YI2N 4CIEA 1GLDG 3K5MA 3K5LA 3CCVN 2E2QA 3UKRB 3JAMO 4CD1A 4LF5K 1X3MA 5FPDA 3EKUA 3RMDA 2QKBA 4A62A 3EEQA 2P9LA 5I3UA 2X6SA 3U4LA 1HNWK 4NCAA 2HHHK 1EETA 4NO7A 3SUPA 2OZMA 4CJQA 3I0SA 1DLOA 4IDKA 4CE9A 2DPNA 4MFBA 4O0JA 4BWJA 4DTJA 4DTPA 3C94A 1C1CA 3E9OA 2ATQA 3KTQA 3QFUA 4W5TA 1BOTO 3GE1A 4CCHA 3O1WA 4K42A 1VQ5N 1XNRK 2ZWHA 4FZYA 3IDHA 2ZQBA 4CF1A 2YNFA 3L3VA 4X66K 5BRFA 1BI4B 5GAEP 1F21A 4FPBA 3H1QA 1B9DA 3CCRN 4IXCA 1IJJA 4JKGB 3HVRA 2Z1GA 5E84A 1BA0A 1SS6A 2YV0X 4YOXA 1HNZK 1KRPA 5DK5A 1KD1O 3VQPA 4LH5A 3VQ8A 3MN7A 3SPZA 3NAEA 2VG6A 2VQFK 3PUFA 5AZIA 3VA3A 3RSEB 3TAGA 1XMOK 2YHBA 3T1YK 3THYB 5C2FA 1NGJA 4O0IA 4FLZA 1D5AA 1FJGK 4FO0A 5C10A 3WXKA 4FW2A 3ZT3A 2OA8A 2E1YA 1OH5A 1K73O 4K0KK 3AVNA 2X74A 4AHRA 2NRRA 4BRIA 1NOZA 5LMNK 5HRSA 3ZT2A 1U04A 3TWHA 4WFBL 2BE2A 1G15A 5E41A 4DKWA 1KFDA 1BUPA 2P1JA 5LL6Z 4ILGB 2H3GX 1K8AO 4B9NA 3DOKA 4IZ9A 5BRHA 1DEJA 3R9PA 1T8EA 1H1VA 2P9KB 1S6QA 3LZIA 3MXMA 4DQQA 3SI6A 4O55A 3JS6A 3CCJN 1ASVA 4XH5A 4BG9A 4DTUA 1Q8IA 5JICA 5KI6A 3L2UA 2YHXA 3THXB 2FF3B 3AVLA 3O9UA 1KVBA 1J53A 4DFJA 1NGAA 3DXMB 3VPZA 4CEDA 2UUBK 1NJYA 3TARA 2CH5A 3M8SA 5TKYA 4DS4A 4CFAA 4QS7A 4C8KA 3CM5A 2F96A 1RT5A 3LM2A 1MA9B 4JI7K 3CJ7A 2QW9A 3QINA 1HJOA 3DJCA 3FZKA 2VCPA 1FXXA 4JKCA 3V9XA 4LFCK 2A40A 4M3TA 1WSIA 3H08A 2HNDA 2PAVA 4M3RA 1DGKN 4H0VB 3PX4A 4ID1A 3MXJA 2YKMA 4WQ5A 1ZBIA 3LWMA 4CJVA 3U3GA 1E4FT 4YOWA 1NK6A 4RW8A 5TKWA 3T7ZA 4XEIA 3VQQA 4CZIA 4KRFA 3VQAA 1VK0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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