1HUXA

Crystal structure of the acidaminococcus fermentans (r)-2-hydroxyglutaryl-coa dehydratase component a
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
b'SIYTLGIDVGSTASKCIILKDGKEIVAKSLVAVGTGTSGPARSISEVLENAHMKKEDMAFTLATGYGRNSLEGIADKQMSELSCHAMGASFIWPNVHTVIDIGGQDVKVIHVENGTMTNFQMNDKCAAGTGRFLDVMANILEVKVSDLAELGAKSTKRVAISSTCTVFAESEVISQLSKGTDKIDIIAGIHRSVASRVIGLANRVGIVKDVVMTGGVAQNYGVRGALEEGLGVEIKTSPLAQYNGALGAALYAYKKAAK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIVATOR OF (R)-2-HYDROXYGLUTARYL-COA DEHYDRATASE
publication title Crystal structure of the Acidaminococcus fermentans 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase component A.
pubmed doi rcsb
source organism Acidaminococcus fermentans
molecule tags Metal binding protein
total genus 76
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2001-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1huxA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1huxA01
1BWFO 1V4TA 3CJ1A 3CETA 3EL2A 3GBTA 2ITMA 2YCHA 4RCHA 3QFUA 1MWKA 2GUPA 4Z94A 5AZIA 1QQMA 4I6MB 4BC4A 3EN9A 1BA1A 4WYBA 5AQPA 3VGMA 3MN7A 5LY3A 1U2VB 5AQIA 4FWLA 3H6EA 4FPAA 4BRDA 3GL1A 2P9KA 5FPDA 2D4WA 5AQMA 1HLUA 3IMXA 4CD1A 1V4SA 1WUAA 5AQVA 3VF2A 3I33A 1OKJA 2P9IA 2Q31A 5AQUA 5AQWA 3R6MA 3O08A 3U9DA 2ASPA 3FLCO 4JHDB 4BRIA 4BC3A 3VEZA 4K25A 3U8XA 3ATVA 3CHWA 4WQ5C 4M7XA 4CZLA 2IIRA 2W41A 3SMSA 2ASMA 3AY9A 4H0TB 4CZEA 3MK6A 4BVPA 1NMDA 4NB4A 1SQKA 1C0GA 2ZF5O 3C7NA 1MWMA 3SMPA 2Q2RA 3LDOA 3VOVA 1HKGA 4CD3A 3MMVA 2E20A 3IUCA 2HMPA 4FSVA 1ATRA 4JN4A 4FWNA 3FFKB 1T44A 3BF3A 4IJNA 3RSEA 1NGJA 5BRFA 3ENHA 3VEXA 5AQXA 1YUWA 4BQZA 3VENA 3FZLA 1GLDG 4QS9A 1RDWX 3B8AX 2P9IB 2CH6A 4CBWA 1S22A 5AQKA 3CIPA 3BP8A 1HX1A 2FF6A 3H3NO 4H0OA 3IFRA 1JCEA 5AZJB 2YHWA 4IO8A 4PKHA 2E2NA 4QS8A 3O80A 1YXQA 3DWLA 1LOTB 3GG4A 4FWRA 3DAWA 2D1KA 5KQ8A 3BUZB 4H0YB 1ATSA 4NO7A 2J4RA 5B8HA 1GLFO 4A61A 1QQOA 3WT0A 3WXJA 1QZ5A 3C7NB 4AM7A 3ZX3A 1NWKA 2CGLA 2ASOA 3GE1A 5AQLA 3CERA 3TPQA 4YDUA 4AM6A 3UKRB 2E1YA 3ZX0A 4A62A 2KHOA 3F9MA 5BN8A 3S41A 2P9UB 1X3NA 3H3OB 4CZMA 3TU5A 4BRCA 4YDUC 5ADXH 5AQOA 3O8MA 1HKCA 3M3ZA 1NGIA 4B1WB 2E2QA 4JNEA 5AQQA 2IVNA 3OHRA 4JD2B 2QM1A 3DXKA 5F2RA 4BC2A 1WOQA 4XEIA 3ZX2A 4CBXA 1E4GT 3LM2A 2WUSA 2BUPA 4B1YB 2QWRA 4BR4A 2QW9A 4K42A 3VGLA 1KXPA 1HUXA 2Q1NA 4FWPA 4MO5A 3HTVA 3ZEUA 4EHTA 5LJVA 3LDNA 3UB5A 3ZETB 4BR2A 2A6AA 4DHYA 5BRDA 4FWQA 2ZWHA 3WEEB 2A5XA 3UE5A 4IJAA 4FOEA 4H03B 2VYPA 4BR0A 3CJ9A 3HZ6A 4QS7A 4B1VA 3VEWA 4CZGA 4JAXA 4HTLA 4GNIA 1GLAG 4FL9A 2CGKA 3SLCA 2HOEA 2E1ZA 3A5NC 4A2AA 2QWQA 2W40A 2E88A 3DXKB 3MDQA 3J8AA 3DJCA 1T6DA 4ISEA 1TUYA 1NGCA 2V7YA 1H1VA 5KPZA 2GWKA 4IWVA 3VPZA 4IZ9A 2HF3A 3P4IA 3ULEA 4BRNA 3A0IX 4WQ5A 4F9OA 4DQ8A 4XH1A 2V7ZA 5FPEA 3I8BA 3ZEUB 1Z05A 2P9SA 4FOIA 4FWOA 5AQTA 4CZJA 3D2FA 5AQYA 4H0XB 5AQSA 5AZIB 2V52B 2FSKA 4BREA 5LJWA 1YVNA 3FE1A 2DPNA 1Z6RA 4BRKA 3SK3A 4IXCA 1LCUA 1XC3A 4O5FA 2QWMA 4H0PA 3L4IA 1NBWA 5F0XA 3LDQA 5AQNA 3D7EO 1QHAA 3O1WA 1GLCG 1NGBA 2P9KB 3ID8A 4ISFA 4EFHA 3VEOA 5AQFA 5CE3A 4WQ4C 1JCFA 2P9LA 4BRFA 4EHUA 3BF1A 3H1VX 5JLFA 2P9PA 3ULEB 4K41A 4BR5A 3QBXA 1NGEA 4EAHD 3JS6A 2GWJA 1SAZA 4H5VA 2P9SB 4FWKA 1Y64A 3U9ZA 3VESA 1NGGA 2AP1A 4H5WA 2QWNA 4B1UB 4BQLA 3D2FB 4XH5A 1TYQA 1BUPA 3KZBA 5E26A 4FPBA 1ATNA 4M63C 4A2BA 4CZIA 1C0FA 1KAZA 4FO0A 4DCHA 4H5NA 5AQJA 3JXUA 3H1QA 1GLEG 5KPRA 2OANA 4BRAA 1HJOA 1TUUA 2FSJA 2NZTA 5JLHA 3AARA 3LDLA 3RSEB 3A5LC 1JCGA 1S3XA 2YI1A 5EOYA 4GY2B 3VERA 3H45C 4CJ7A 4MLEA 4L3QA 5AQHA 2P9LB 3DXMA 1Q18A 3G25A 4BRQA 4BGAA 4BC5A 3CI5A 4B1XB 4FWSA 4XH4A 4FWMA 3WXLA 3O1BA 4CI6A 1KAXA 2QWPA 3WXKA 2PAVA 4BRLA 4PKGA 3D2EA 3HBTA 1CZAN 5BPMA 2GELA 1TYQB 2FF3B 5BN9A 1R59O 2I7PA 3W3DA 3WUHA 2UYTA 4MLHA 1X9JA 1GLLO 3GDQA 1BA0A 3U4LA 1K8KA 1U2VA 2QXLA 3R9PA 3QFPA 5ELZA 3W0LA 5AQZA 4PL8A 4RTFD 1IG8A 3HSCA 3EKUA 2F9TA 2ZGZA 3VGKA 2YHXA 1BO5O 2EWSA 1SZ2A 3O4WA 4C23A 2AA4A 2YHYA 2D0OA 4H5RA 2V51B 5I9EB 3L6QA 3EZWA 1BU6O 4J8FA 1X3MA 1BG3A 3ATUA 3UKUA 1DEJA 2P9NA 4Y0WA 1E4FT 2I7NA 5AR0A 4B1ZA 4BRGA 2BTFA 3A8YA 5AFUA 3VF6A 4LC9B 2FSNA 3D2EB 3QDKA 1DKGD 2FXUA 1RFQA 3HI0A 3EKSA 2CH5A 2NLXA 3VETA 4CBUA 4BRPA 1K8KB 3VF4A 4BG8A 5JMVA 2PBDA 4PKIA 2Q36A 5E84A 3WXIA 4BGBA 1KAYA 4CZFA 3H46O 3QB0A 1GLJO 2E8AA 1MDUB 2H3GX 4RWTA 5AZJA 3UKUB 2P9NB 3CJBA 3CQXA 4WQ4A 3O6WA 1T6CA 1HKBA 1QQNA 4HWIA 3SJHA 5BR9A 5BPNA 1HPMA 2A42A 3FZHA 3MN5A 4CZHA 3A5MC 1G99A 2A40A 3C0BA 1BDGA 2A3ZA 2QWLA 1NM1A 2VCPA 3FZKA 2Q0RA 4BRMA 2F9WA 1XQSC 2D0PA 3KVGA 3WQTA 4BVOA 1ZXOA 4BR7A 3IDHA 1ZBSA 3UKRA 4BG9A 1U6ZA 3VEVA 2QWOA 5EX5A 4K43A 5BREA 2P9UA 4EIAA 4PL7A 3HM8A 5EY4A 3L0QA 1QZ6A 3A5OC 2E2PA 4H5TA 4DB3A 5JICA 2A41A 3CJAA 5AQGA 3BEXA 2IVPA 3CJCA 1NGFA 4ISGA 3ENOA 2VWBA 4E1JA 5FPMA 4JD2A 3FGUA 5EXWA 4BR9A 1NGAA 4CZKA 5EVZA 2IVOA 1MA9B 1P8ZA 4KBOA 3EO3A 1ZC6A 3KHYA 1NGHA 4O8KA 2P9PB 4H0VB 1D4XA 1EQYA 2CGJA 2GTDA 3QICA 3R8EA 3FZFA 4B9QA 5BPLA 5F1XA 3CJ7A 3ZETA 5KPTA 1NLVA 5TKYA 3LM9A 1YAGA 2YJEA 1RGIA 2E2OA 5KQDA 1IJJA 4M7YA 2Q0UA 3GOIA 3WEEA 3QBWA 3VEYA 1XUPO 4MO4A 4BROA 5BRHA 2ZGYA 3MCPA 4I6MA 3O5BA 2HF4A 2YJFA 3CQYA 3LL3A 3QMLA 5AQRA 1J6ZA 3M1FA 3MN9A 1BOTO 3M6GA 3FZMA 2Q97A 2FLOA 5ADXA 1GLBG 3WQUA 1DGKN 3FR0A 3AAQA 5FPNA 1NGDA 2NRHA 3DXMB 4JHDA 3AAPA 4BRHA 3MN6A 3LDPA 1ESVA 5AFUH 2GEMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BWFO 3OA9A 1J54A 4X66K 2XY6A 2F8SA 1SL2A 3THVA 1SUQA 2YCHA 4LSNA 3AO5A 4NLBA 3SQ0A 4DWIA 2DY4A 1BA1A 1VSFA 3E66A 2RKIA 4FJ7A 3MN7A 1ZBIA 3E9LA 5JVGL 2IC3A 2HBLA 1Q9YA 3GL1A 4KB1A 1S5JA 5AQMA 1IBKK 4BACA 1TKZA 5AQVA 2QEXN 4FK0A 2Q31A 5AQUA 4FJMA 5AQWA 4BE1A 1J5EK 4ZTJA 4K25A 4WE1A 3ATVA 3M8PA 4WQ5C 4CZLA 4CHPA 3DMJA 3C6HA 2ASMA 3K9KA 4H0TB 4CZEA 4BVPA 1NMDA 2UUBK 4FLZA 2KZMA 4ELTA 2YNHA 2Q2RA 3VOVA 4JEPA 1YJWN 1CXUA 5CY4A 4CD3A 1MU2A 1ATRA 3J80O 4DTSA 3ZT0A 4IO9L 3VQCA 1B9DA 3V9ZA 3L2WA 1GLDG 3QIPA 4B9VA 3WXMB 1EWQA 1ILYA 5AQKA 4OLBA 1HX1A 5GIOA 2YHWA 3OYJA 2PZSA 4N76A 1YXQA 3GG4A 2XY5A 3OYGA 3O4QA 1WSJA 2W6LA 4FLYA 4CHQA 1GLFO 2NRWA 3M8QA 3WT0A 4CGHA 2OA8A 3MWPA 3H08A 1VAZA 3GE1A 3VQ9A 3P39A 4AM6A 3NH1A 4OVLA 4A62A 1W7AA 2KHOA 3F9MA 3OYIA 4Z4CA 1X3NA 4R79A 3TU5A 4H8KA 3I0RA 4DV4K 2Y1JA 3VQ6A 1TL1A 1WSEA 1NK4A 3KWGA 3OHRA 1JL1A 3RMDA 2QM1A 4CJWA 3DXKA 4XEIA 3LM2A 1HNIA 3IS9A 1S1WA 2QWRA 3AGRA 3VGLA 5FROA 3O3FA 3ZEUA 1RILA 4CEOA 3HOTA 3CC7N 4CGJA 3ZETB 5HRRA 3L2UA 3LWLA 3KK3A 2A6AA 4DHYA 4AHCA 4O5BA 2O8BB 4IJAA 1WAFA 4TSXA 3TAMA 4CJLA 4YOWA 4DF4A 1BISA 1F21A 2DFFA 4CZGA 4HTLA 4FLUA 3K5MA 2HOEA 3E9PA 3WNGA 2QWQA 2NRXA 4DR6K 4A5BA 3VQEA 1YF5L 2NNWA 3J8AA 4RW9A 4PY5A 1TUYA 4CGIA 4BDPA 4IWVA 4CJ4A 4DQRA 2O8DB 2UXBK 3J7AP 3RVCA 4QAGA 2P9SA 1B92A 4C1NI 3CC2N 1DLOA 1UWBA 3AA5X 4DSJA 3SPZA 2G8IA 2GV9A 4DU4A 4B3RK 3AVGA 2NRZA 3K59A 4IXCA 5C2FA 2F7TA 5F0XA 4FLXA 3O1WA 3E01A 5DMRA 3V9WA 1WSFA 4ISFA 2UXCK 1WBDA 2YX6A 4EFHA 1C0UA 1LAVA 3DRSA 3OS1A 2JWKA 1JCFA 2P9LA 3H1VX 1SKSA 2KFZA 3ULEB 3AA3A 3QBXA 4WFAL 4Q0BA 1KC8O 5IT9O 4JKAA 4CEZA 4C8MA 4K0KK 4PA1A 5GAEP 1EETA 3L3UA 1YJNN 4B1UB 4FXDA 3VA0A 3D2FB 4FLWA 1BUPA 3KZBA 4FPBA 1ATNA 4DV3K 4EZ9A 4A2BA 2OYQA 1WNSA 3LDSA 3LP1A 3O9UA 3DOKA 3RTVA 3BDPA 1N32K 2YKNA 2HMIA 3OYHA 1U48A 4DUYK 1HJOA 1TUUA 4GVEA 1DTQA 3AARA 4O44A 3A5LC 1JCGA 4DQQA 4KPYA 1DTTA 2VGNA 2FBTA 3DXMA 1LWEA 5J2NA 1Q18A 1VQ7N 3NGYA 3O3HA 4BC5A 3LPUA 4FWMA 1VSKA 4CEEA 3WXKA 1QHTA 4B9UA 4MFBA 4BRLA 3SYZA 3HBTA 4FLVA 2XO7A 1TYQB 3W3DA 2X6NA 2UYTA 3VQDA 4IDHA 3GDQA 1BA0A 1I3AA 3U4LA 4A59A 1U2VA 3KKRA 1O13A 4NYFA 4M3TA 1HNZK 4FK2A 2F9TA 1DT9A 2YHXA 4AHTA 1KQSM 1SZ2A 2QXFA 3DLBA 3G71N 4H5RA 3ZT3A 1C1CA 3EZWA 3AVFA 4M3ZA 4LF9K 4FJHA 3ATUA 1DEJA 1FK9A 2P9NA 4B9SA 1J9AA 1E4FT 2I7NA 4OGEA 1FXXA 5M1QA 4BRGA 2OCEA 3A8YA 4E7HA 4FJGA 2YHAA 5AFUA 3ZCMA 1RFQA 3IG1A 3HI0A 5CZ2A 2KQ2A 4E7IA 4KREA 4DSEA 4RW4A 3AVKA 4BDYA 3CCRN 4N41A 4BG8A 2XHBA 2Q36A 4AHRA 3DM2A 2B5JA 2D0BA 3LAKA 4DLGA 3RMCA 4CJFA 1QTMA 1YTUA 4W5NA 1ZBUA 4FJXA 4RWTA 5CHIA 2Y1IA 1N6QA 4Z4IA 5AZJA 3HSTB 2WTUA 1T6CA 4B9LA 1TVRA 4CJRA 2JGUA 3KLEA 4DUZK 4B3SK 4FZZA 4B3MK 4JI4K 4CZHA 4QOZB 1A5VA 2A40A 1BDGA 1TL3A 2KLAA 1ZBFA 1A5XA 1QE1A 4M3WA 1U45A 1YI2N 3WQTA 4OKJA 1ZBSA 2BGGA 3L2VA 4BG9A 3CCLN 1U6ZA 5BREA 3O4NA 5GAGP 3C6TA 5HBMA 4CJTA 5EY4A 2PY5A 4CHOA 3A5OC 3DLKA 3ZSZA 2NRRA 3BEXA 3CJCA 3KK2A 1NK9A 3CFOA 4C8NA 3CFRA 2HHXA 2IVOA 1P90A 1OVYA 1CZ9A 4OKEA 4BDZA 3O9SA 5FRMA 4EP4A 1IKXA 1NGHA 2RF2A 4H0VB 2CGJA 4E7LA 3VQPA 3DLEA 1L5UA 3LM9A 2VQEK 2YJEA 1RGIA 2E2OA 5LMNK 4GV6A 1IJJA 4E3SA 3GOIA 1A5WA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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