4A5BA

Crystal structure of the c258s/c268s variant of toxoplasma gondii nucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 (ntpdase1)
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
595
structure length
592
Chain Sequence
b'DADTEKRINVGKTHLQTLRNLETRCHDSLQALVVIDAGSSSTRTNVFLAKTRSCPNKGRSIDPDSIQLIREGKRFTGLRVVLEEWLDTYAGKDWESRPVDARLLFQYVPQMHEGAKKLMQLLEEDTVAILDSQLNEEQKVQVKALGIPVMLCSTAGVRDFHEWYRDALFVLLRHLINNPSPAHGYKFFTNPFWTRPITGAEEGLFAFITLNHLSRRLGEDPARSMIDEYGVKHSRNDLAGVVEVGGASAQIVFPLQEGTVLPSSVRAVNLQRERLLPERYPSADVVSVSFMQLGMASSAGLFLKELCSNDEFLQGGICSNPCLFKGFQQSCSAGEVEVRPDGSASVNEDVRKNRLKPLATYCSVHNPEISFKVTNEMQCRENSIDPTKPLAERMKIENCSIIEGTGNFDKCVSQVESILVAPKLPLPANIEAASSGFESVDQVFRFASSTAPMFITGREMLASIDTLKDHRLLRSDFSGDVEELAEAAREFCSSEVIIRTDGPVIQLPGEQKLNSLNFDLCKTMALTVSLLRHMAAGENQPSFIKWEKSIAGPDGKPLADLGWQVGVILHHVLFTEEWGRTAYEAGYSHNLE'
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural Insight Into Activation Mechanism of Toxoplasma Gondii Nucleoside Triphosphate Diphosphohydrolases by Disulfide Reduction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NUCLEOSIDE-TRIPHOSPHATASE 2
source organism Toxoplasma gondii
molecule tags Hydrolase
total genus 196
structure length 592
sequence length 595
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.1.15: Nucleoside-triphosphate phosphatase.
pdb deposition date 2011-10-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.530 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4a5bA01
3.30.420.540 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4a5bA02
4A59A 4JEPA 4KH5A 4KH4A 4KH6A 4A57A 4A5BA 4A5AA 3AGRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1TAQA 1N34K 5JVGL 4B3OA 4CK1A 1KQSM 5KRSA 2P5GA 1OVYA 3CFPA 1JLQA 4JKCA 4RW7A 2PAVA 1RCHA 2X6NA 2QWPA 4DSEA 1BIZA 1KAZA 1TKTA 2HHSA 4DG1A 3HL8A 3WQUA 4DTNA 2V52B 3OS2A 1DEJA 4DTMA 1JL2A 1MWKA 3Q7BA 5C25A 4CJLA 4K8ZA 2V51B 3HPGA 1Z25A 1DGKN 2I7PA 3V9ZA 4F3OA 4IBNA 3VGKA 2D0BA 3AVHA 3CJAA 1J6ZA 4PKHA 4KBOA 4FJMA 1ATNA 1V4TA 3PO5A 2GBZA 2RF2A 2UXDK 4KFBA 1JLGA 3AVFA 3TI0A 1NKEA 4CW7B 4B9LA 1BO5O 3OYFA 2QWRA 2YNIA 1VQ8N 4NYNA 2QWNA 5SWMA 3VQPA 3TR8A 2F8TA 2KZMA 2BTFA 5GAEP 3R6MA 4CD1A 4DS4A 3QEXA 3ZX3A 3TARA 3ZSXA 2KLAA 1C6VA 1WOQA 3THWA 5CY4A 4M3WA 1EXQA 4U67L 4K43A 1RTHA 4KKOA 4YNQA 3A5OC 2W6LA 4MDBA 1BUPA 3U9DA 5BR8K 3NH1A 3HI0A 1KSPA 4A2BA 3F2KA 1J54A 1N32K 4HUFA 1QQOA 3C95A 1RTDA 4C8OA 3VQQA 5KPZA 4J2AA 4FYDA 1ZBHA 4G9ZA 2B4JA 1ZBIA 5J2QA 5AZJA 3PSFA 1IG9A 1U49A 5C12A 3O9QA 4FPAA 3OYEA 3VQ4A 1HUXA 4H0XB 3GE1A 4YOVA 4H5NA 4H03B 5ADXA 4I6MB 5KQ8A 1T7PA 3AO1A 2O8EB 3OHRA 3CCUN 5SZTA 2IDOA 2FF6A 4LY7A 3QDKA 2B6AA 4DR7K 4H0TB 4WE1A 1VHXA 3NH0A 3QETA 4CIFA 3D2EA 2XO7A 2PZSA 2E2NA 3ENBA 1FKOA 3M8QA 1LWEA 2NZTA 4JAXA 1Q8IA 1T03A 4JKEA 1NJZA 4FJ7A 2O8BA 4JN4A 1U4BA 4AHTA 4R5PA 1NM1A 4RW8A 3H45C 5I42A 4B3MK 4MLEA 4DSKA 3SI6A 1IBKK 4CBWA 2RKIA 3AO2A 4WQ4C 4NCBA 3VTHA 4FL9A 1NK7A 2UU9K 5C15A 1B9DA 2RPIA 2YJEA 4B3SK 4Z4IA 2VWBA 2A5XA 4YHHK 4MFBA 3A5MC 3NF9A 4CHOA 3CFRA 5DK5A 2X74A 3DI6A 4BDYA 4FJXA 1ITGA 4DTPA 1B9FA 4HVJA 3QEVA 1X9WA 4BRCA 5JS1A 4N47A 4J2EA 1FXXA 4FWOA 3ZSRA 3E9OA 4CZHA 3M3ZA 2E6MA 2FSJA 3I0SA 4ILGB 4KHYA 3D0PA 1HKGA 3J80O 1S72N 4GKKK 4DQ8A 3VEVA 2HHTA 3DWLA 5BR9A 1HQEA 2KQ2A 2FBYA 1VSLA 4CF9A 3KWIA 4CFBA 4K8XA 2W6KA 1HYZA 5AQVA 1D9DA 1NK8A 3CMEN 1Q81O 4O44A 5BRFA 1NOYA 4BR9A 3DLKA 3ZSZA 1RTIA 4BGAA 5F0XA 3J7ZO 3RTVA 3J8AA 5AQUA 3T1HK 5ELZA 3QLHA 3QB0A 3DJCA 1UWBA 4FCYA 1C0FA 5B8HA 4Y1DA 4DFMA 3VQBA 2NRZA 4C8KA 3SUQA 3SK3A 3ATUA 4NXNK 3QFPA 2QTDA 4QS9A 4PY5A 4IDHA 3OA9A 3NBPA 4BG9A 1VSHA 1U04A 3O9TA 4Y1CA 4C8NA 4B9QA 2FXUA 1SS6A 1GLCG 2V7ZA 3QICA 4LF6K 3M8RA 3VGLA 4JKAA 3OVNA 2YHBA 4FK0A 4KRFA 3ULEB 1I39A 3A2FA 3QO9A 3U8XA 4DU1A 3AVJA 5H1SQ 1YVUA 2UUAK 3FZHA 4JI5K 1BA0A 4PKGA 1QSSA 1RDBA 3AAPA 2E2QA 1N36K 3TAPA 4DWIA 3IMXA 2HNZA 4MDAA 4JI2K 2QKBA 1W9HA 3F9MA 2XY5A 1K6YA 5BN9A 1NK9A 2A41A 4O8UA 2UUCK 4CD3A 2HF4A 4AF1A 1W2BM 5CZ2A 3SUOA 2HMPA 1P90A 3OYBA 1HRHA 3PX6A 5C24A 2QXLA 5EOYA 2HSTA 4YDUA 3NDKA 4CEBA 4AHSA 4EP5A 4FLVA 3MCPA 5EXWA 3CCJN 3PV8A 2Z1IA 1J5OA 1BISA 4CJWA 2QM1A 4DTXA 2ASMA 5EU7A 2OTJN 1FK9A 3TU5A 4KHSA 4JI1K 1N33K 3ZT4A 1NJIO 3V9SA 4FLYA 4BVOA 1CZ9A 4DV1K 2ZE2A 1OH5A 3OBWA 1QVFM 4OLAA 3A5NC 3TSUA 5EY4A 4JKFA 4K25A 4KH5A 1KLNA 4CGJA 3O6WA 3PSIA 1EWQA 3ATVA 2W40A 1SKSA 2UUBK 3TTCA 1IKVA 1VSIA 3MN9A 3FGUA 3RR8A 4EAHD 4XEIA 3ALYA 2BGGA 3OYGA 3DRSA 2YKNA 5AQFA 1XI1A 3CPWM 4CGDA 3CC4N 2VWKA 4I6MA 3R3LA 1XMOK 4CZGA 4B08A 2O8EA 1RBRA 3GDQA 4EHTA 4R79A 4KHUA 1BG3A 3OW2M 2XHBA 5J1EA 4C1NI 3S3NA 4NB4A 5DM7L 1KVCA 3FLCO 3U3GA 3CD6N 1NMNA 1K8KB 1KC8O 3Q7CA 1WAJA 2E6LA 1WBBA 1G15A 3CJBA 4JD2A 5TKWA 5KRTA 4M63C 4FJIA 4I7FA 4BG8A 4BRPA 2FBTA 4ISGA 1Z26A 2OCEA 1YT3A 4JV5K 1OH8A 4FXDA 3LDPA 1WSJA 3CQ8A 1T6DA 1WNSA 3PUFA 3L4IA 4DLGA 4ZTJA 4E1JA 2I5JA 4RW6A 3W3DA 4RW9A 1A5WA 2E4LA 1NNEA 1V4SA 4CFAA 3QEPA 3CYMA 3K5LA 4JEPA 4IG0A 5HROA 3KLEA 5HRSA 3CG7A 5IT9O 3SQ2A 2A42A 3HVRA 1Q9XA 1NK6A 3QBXA 3VEXA 1MDUB 2YCHA 3DLEA 3IS9A 3P83D 4CGHA 1VSKA 1NLVA 2GUIA 3IDHA 1QHTA 4GVEA 5AQYA 4PWDA 4LFBK 5KGWA 1M90O 2NUBA 1TUYA 1RBVA 1T3VA 3DOLA 3KD1E 3M8PA 4CF1A 3CCMN 2HNYA 3K2PA 4PL7A 1ZBSA 3WNHA 2KTQA 3AO4A 3ID8A 4CJFA 3CI5A 1VSDA 3K5MA 2G8HA 3OYHA 4W5NA 4CJUA 3M6GA 3JXUA 4C1NK 3DXKB 1KLMA 2DFEA 4X64K 4CJEA 1RT2A 3O9UA 4M45A 4CCHA 1Z05A 1K9MO 2HVHA 3AA5X 4O4GA 2B5JA 5FPDA 2XRIA 4AH9A 4EZ6A 3LAKA 4IFVA 2E2OA 2ZQBA 1NGEA 5CYQA 1WSGA 3SJJA 1KFSA 1HYVA 4H5VA 2QA4N 4BWMA 3T19A 2VQEK 3UKRB 4BGBA 4DUZK 3PX0A 1S1WA 3LDLA 4H5TA 1XHZA 4JHDB 3HSCA 2Y1JA 5FRMA 4OGCA 3THYB 4FWMA 4NLCA 3BF3A 3PX4A 3H3OB 4LSNA 4OPHA 5C2DA 4XIUA 1IBLK 4DUYK 3T69A 4BQLA 4CJPA 2J4RA 3CQYA 2RN2A 4CI6A 3LZIA 3BGRA 3QESA 3DOKA 3VQEA 4ICLA 3ULEA 3P38A 1XMQK 1QS4A 5CZ1A 4K0KK 3SV3A 4OPKA 4E7HA 3AVIA 4Z94A 4C8LA 3EY1A 4CJ7A 4CBUA 4JRPA 4J2DA 1I94K 1GOCA 2D5RA 1T44A 1QSYA 5AQOA 1Q18A 1YTUA 1GLLO 1RNHA 3SYZA 1ZYQA 3AGRA 3KIOA 4FJLA 3MXMA 2HVIA 4CHYA 2G8KA 4FJNA 3AY9A 4NYFA 2ITGA 3LL3A 3AVAA 3KVGA 2G8UA 1K8AO 2HHHK 1RILA 4GNIA 2LSNA 4Z0UA 5F2RA 4K42A 3AGKA 5KI6A 1SKWA 1RT3A 3ZSQA 3AA3A 2RE2A 2ZJRL 1JJ2M 2G8FA 1Y97A 3TPQA 3OS0A 5EVZA 2WOMA 4FJ9A 2G8VA 3VMFB 5GADP 1NK5A 1VQPN 4DS5A 3VQ9A 2GEMA 3RMBA 1TKXA 2P9NB 2ZWHA 4FSVA 4V19S 5DMRA 2NRRA 4B9TA 3MAQA 4TSXA 3O1WA 1YHQN 1T6CA 2P9SB 2VQFK 4AHVA 2XY6A 3KLFA 4YOWA 3OYAA 4JKBA 4CJSA 4FW1A 1YJNN 1TK8A 4EHUA 3TANA 3VETA 3OYMA 3EE9A 4FM0A 4QS7A 4DV7K 4B9NA 2XY7A 4OPJA 1OKJA 1S6PA 3C7NB 3MEEA 2I7NA 5M1NA 4JS5A 3TSPA 1S22A 1NJWA 4DTUA 1RDWX 2BE2A 1TK0A 4CEAA 1TK5A 5C0YA 1QTMA 2QK9A 5FROA 4ISEA 4BRQA 3HRGA 2ATQA 3ISNC 3T3FA 5M1OA 3L2RA 3S41A 4BR7A 4FJ5A 2PYJA 1K8KA 1WAFA 4JKHA 3VERA 4ISFA 5HRRA 3JAMO 4FLZA 4KI6A 1IO2A 3FFIA 3B6PA 4GY2B 1ZBFA 3NMUA 1HKCA 4JK8A 3EO3A 2HHUA 3O8MA 2GUPA 2VCPA 4CIGA 4DFPA 3CIPA 3A0IX 5LMNK 2QW9A 2O8FB 4X62K 1C1CA 1DTTA 3VENA 5JLHA 1JCEA 3R9PA 3I0RA 3SPZA 4DSFA 3HZ6A 4CK3A 1S5JA 1WSFA 3L0QA 3KTQA 3RSEB 4M42A 3CJ1A 2ZM6K 4FLUA 4FWQA 4AM6A 3KK3A 2P9UB 4RCHA 5D3GA 2WTUA 1HKBA 4OO1J 1NGFA 3DLLL 1U47A 2ZJPL 4PUOA 3BDPA 1GOBA 1QVGM 1NGIA 5AQSA 3KLIA 2Y1IA 3LP1A 5AFUH 3VOVA 1JLAA 4BDZA 5DM6L 4NXMK 1EKEA 3OJSA 3SZ2A 4G1QA 1KCFA 3G10A 4CJVA 3D45A 3KLHA 4KH6A 3H1QA 4CERA 2GWKA 3L3UA 3ZT1A 4KHPK 1B92A 1Q9YA 2WONA 4OLBA 3QINA 3MWPA 3TTDA 2AA4A 1IH7A 4I2QA 4F4KA 4BE0A 1N5YA 2F9TA 3V9UA 4J2BA 4X66K 3T1AA 4CZMA 5A2QO 4FWNA 4ID1A 2JWLA 4KTQA 3DLBA 2E88A 1HNIA 5HOOA 4Z4GA 4QAGA 3HJFA 4HCCA 2DFHA 4DHYA 2NRWA 4B9VA 3F5TA 1RFQA 4UY8O 4JHDA 1LCUA 4LC9B 3LM2A 3THYA 3M8SA 4BRNA 3S3MA 3ULDA 3AVLA 2Q36A 4E7IA 3DYAA 1HNXK 1YJWN 1IKWA 2KZZA 3L4QA 3LWLA 4CJKA 2HHQA 2XY8A 2E8AA 3AVMA 1L3UA 2Q1NA 1HNWK 4PL8A 3HM8A 4E7KA 3WNGA 1S1TA 4UQGA 2OA8A 4JKGA 5C10A 5BPNA 4Q0BA 2W41A 2A6AA 3S3OA 3JSMA 1KTQA 2QI2A 3K58A 3KK7A 3CFOA 3QMLA 2QWLA 4X65K 2JLEA 4JS4A 1CZBA 4IOXA 3SLCA 3V4IA 4FVMA 3ASMA 4ID5A 1XC3A 3VQ7A 4M3YA 4FWLA 3U4LA 4KREA 4PQUA 5FLXO 1JXEA 2D0PA 5AQTA 3SPYA 4HUEA 1S9EA 4IJNA 1TKZA 5JLFA 4FZYA 2GELA 2V7YA 2O8DA 4L3QA 4BRHA 3ZEUA 1VSEA 1DT9A 1ZXOA 4E7LA 1QQMA 2X6SA 3CPEA 5BPMA 4F3TA 3ZSOA 1N6QA 1KVAA 3O9RA 3SAGA 4YDUC 1XUPO 2NRVA 3V9WA 3HBTA 4W5QA 1LAVA 2UXCK 3RRGA 3THXB 3GG4A 2P9NA 3EKSA 4AQYK 3V1QA 3DXMA 3GL1A 5J2NA 5CR4A 3I55N 3LM9A 2P9SA 3D6RA 2HBLA 3P39A 3VEYA 1G99A 1VQ7N 2YNGA 1YIJN 4DF8A 3LAMA 1SZ2A 4NLBA 3CJ7A 4YFUA 3O3FA 1J9AA 2P9IB 1L5UA 3C7NA 1HPZA 3RMCA 1NOZA 4DU3A 4M3RA 3QEWA 1NGGA 3OY9A 1RT6A 4LH5A 1RT1A 3G0ZA 1VQ6N 3K59A 2F96A 4FJGA 3OYDA 2HBJA 2Q3SA 5HBMA 3AV9A 5AQIA 2E20A 1U48A 3THVA 2OPQA 4DQSA 3UKUB 4IOCL 1W0HA 4GKJK 3CCLN 1EQYA 3HYFA 4HCBA 5AQPA 1HJOA 1YITN 1GLJO 2KW4A 4CJRA 4JK7A 1TAUA 1LW2A 2DPNA 4H5WA 1RDUA 4E1MA 3C94A 3D7EO 4K41A 3CM6A 3U3YA 3T7ZA 5LJVA 1UA0A 2NRHA 2GTDA 4FWPA 3L8BA 1KAYA 1XWLA 4DTSA 3WXMB 4DV5K 2GV9A 3FE1A 3RSEA 1VRTA 1EP4A 4Z4FA 4XH4A 2VG7A 4DV3K 3WEEB 4IO9L 2P9UA 2HHVA 4I9QA 1VQLN 1YXQA 3NGYA 2CH6A 2PYLA 1SL2A 1S1XA 4C8MA 3C6UA 3OBYA 3SAHA 1BDGA 3AARA 3AVCA 4CESA 3H1VX 4HWIA 4CJQA 3GOIA 4QOZB 3IRXA 3L2WA 2HNDA 4CJ5A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4A59 A;  4JEP A;  4KH5 A;  4KH4 A;  4KH6 A;  4A57 A;  4A5B A;  4A5A A;  3AGR A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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