1MWMA

Parm from plasmid r1 adp form
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
320
structure length
316
Chain Sequence
MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ParM
publication title F-actin-like filaments formed by plasmid segregation protein ParM
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Structural protein
total genus 98
structure length 316
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mwmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mwmA01
5AQWA 3U9DA 1NGDA 1XQSC 3FR0A 1QHAA 4BR9A 1TUYA 3A5OC 3CERA 3EZWA 3FFKB 1LCUA 3VESA 1T6CA 3QBWA 1NGAA 4JHDB 3D7EO 3SK3A 1RDWX 3VF2A 2E2OA 1QQMA 3H46O 1IG8A 2GUPA 1RFQA 4IXCA 1KAZA 5EVZA 4PL8A 4H5VA 1U2VA 4FWRA 3HZ6A 3LM9A 1E4GT 5KPZA 4WQ5C 1GLCG 5AQKA 4ISFA 1HX1A 3O4WA 3H6EA 5AQRA 3O6WA 4JD2A 2P9UA 1V4SA 3WQUA 1DEJA 2A40A 1JCGA 2AP1A 1JCEA 3R6MA 2F9TA 2P9LB 4H0VB 4BQLA 1YAGA 4EHUA 3C0BA 3VENA 1ESVA 1X3MA 5KQ8A 4JHDA 4H5NA 4F9OA 3GG4A 2P9KA 4BR5A 2E88A 4FWNA 4BRNA 2A3ZA 2P9PA 3VGKA 2AA4A 3CJCA 1HJOA 2Q36A 1QQNA 5FPMA 2D0PA 2QWRA 3MDQA 3BF3A 2HF4A 3O1WA 2YI1A 2Q0RA 4BRLA 3MMVA 1ATRA 4WQ5A 2ZGYA 1NGIA 1Z6RA 3FZLA 4HWIA 3UKRA 2GELA 3QICA 4FL9A 4E1JA 3CJ1A 2NLXA 5AFUA 3WT0A 2D0OA 3CJ9A 2CGKA 2YCHA 3IDHA 1BDGA 3L6QA 5AQQA 2PBDA 3CIPA 3LDOA 4CZGA 5F0XA 1KAXA 4QS7A 4FWMA 4RWTA 1S22A 3HTVA 5AQIA 1QQOA 2W40A 1V4TA 5F2RA 3A0IX 1P8ZA 3WXJA 5BR9A 3A5NC 1MWMA 2V7YA 1YVNA 4WYBA 4H0XB 4ISEA 2ASMA 5KQDA 4I6MB 4BR2A 5ADXH 3AAPA 2HMPA 3B8AX 2YHXA 5EXWA 3EN9A 3S41A 3FZKA 4JAXA 4BRCA 3VETA 5AQMA 5AZIA 4O8KA 2FSJA 3ULEB 3EL2A 1G99A 3BF1A 2P9SA 5AQUA 4A62A 2Q31A 1MDUB 5BPLA 3UB5A 3D2EB 5E26A 4CD1A 3QB0A 4B1VA 1LOTB 3ZETB 1CZAN 4CJ7A 3A5MC 5BRHA 1NGCA 3MCPA 4H0YB 4A2AA 2A6AA 3A5LC 3DXMB 2P9NB 3H3OB 3O8MA 2UYTA 2ZGZA 5BREA 4FPAA 1ATSA 4GY2B 4I6MA 3CHWA 4YDUC 3HM8A 5AZJB 3QDKA 5EOYA 2GEMA 3KVGA 2BUPA 2DPNA 3W3DA 1SAZA 3CJAA 1ATNA 3ID8A 3VGLA 3M1FA 1NGFA 2E2NA 4BC4A 3UKUA 3H45C 2V52B 2A5XA 2A42A 4KBOA 4MO5A 3LM2A 3VEWA 3M6GA 3D2FB 4A2BA 4EAHD 2E1ZA 3G25A 3C7NB 1BG3A 4H5WA 4WQ4C 2QWLA 5LJWA 3F9MA 4O5FA 1DGKN 3VGMA 1BA0A 4LC9B 2IVOA 1HKBA 3EKSA 4B1XB 2QWPA 4NO7A 4QS8A 5TKYA 5EX5A 4H0PA 3MN7A 4PKGA 5AQLA 5JLHA 1TUUA 3O5BA 3VOVA 3WXKA 3U4LA 1GLEG 1XUPO 3VEVA 1C0FA 3GDQA 2Q2RA 4BC3A 1NM1A 4BVPA 1NWKA 4FOIA 4CZJA 4BC5A 4BG9A 3A8YA 3LDNA 4AM7A 4CBXA 4FWPA 5BN9A 3D2FA 3VERA 4DCHA 4DQ8A 5AQPA 2IVPA 1Z05A 3C7NA 2QWNA 5FPDA 4DHYA 3IUCA 4WQ4A 2E2PA 4FSVA 5AQSA 4FWOA 4FOEA 1BUPA 3DWLA 2QWOA 4JN4A 1YUWA 2D4WA 1HKGA 2E2QA 4CZFA 1GLAG 3FGUA 2FLOA 3H1VX 1MWKA 2E20A 3MN6A 4XH1A 4Z94A 3HSCA 3ATVA 2FSKA 3CQYA 2YHWA 3P4IA 2P9LA 3TU5A 3KZBA 1KXPA 2QXLA 3DXKB 3L0QA 3WXIA 4BR0A 3I33A 3ATUA 1TYQB 4PKHA 3RSEB 3FZHA 3ZEUB 1T44A 3BUZB 4XH4A 5EY4A 3DJCA 1BA1A 5BPMA 4MLEA 4BVOA 4Y0WA 5AQTA 2ZF5O 2CGLA 4GNIA 3J8AA 2D1KA 4CZLA 4BR7A 2GWKA 4BRDA 4CD3A 2Q97A 4BRQA 2WUSA 1SZ2A 3CQXA 5JICA 5AQZA 4IZ9A 4J8FA 4XH5A 2GWJA 4CZKA 1H1VA 1HKCA 4A61A 2FF6A 4BGBA 2ITMA 5JLFA 4L3QA 1TYQA 4QS9A 5AQOA 5AR0A 3BEXA 4K25A 3RSEA 3SMSA 4CBUA 1GLJO 5LY3A 3FZMA 1BU6O 1X9JA 1GLLO 3DAWA 5CE3A 4B1YB 2P9IB 2Q0UA 3ZX0A 2HOEA 5AFUH 5AQJA 4BROA 4B1WB 4PL7A 3ZX3A 3AARA 3VEXA 1J6ZA 1HPMA 4IJAA 4ISGA 4BRPA 1DKGD 3IFRA 4BRMA 2I7NA 3ENHA 2YJFA 1NMDA 1XC3A 4AM6A 3OHRA 4EIAA 5LJVA 3AAQA 3KHYA 5AQGA 3CETA 3ULEA 3L4IA 3QFPA 4C23A 4H0TB 3CJ7A 5AQVA 1E4FT 4CBWA 2QW9A 4MO4A 1RGIA 3TPQA 5F1XA 3JXUA 3U8XA 5AQNA 3D2EA 2BTFA 3R8EA 2ASOA 3VEZA 1QZ6A 1NGJA 4H5RA 1WOQA 3SMPA 3VF4A 3ZETA 3GE1A 3U9ZA 1U2VB 2J4RA 2P9IA 1GLFO 1NGHA 5BRDA 2YHYA 4B9QA 1X3NA 3DXMA 2P9NA 3W0LA 4NB4A 5JMVA 2GTDA 3GL1A 4JD2B 4DB3A 2P9UB 5KPRA 5AZJA 3WEEB 4H5TA 3I8BA 4BREA 3VEYA 3ZX2A 2V7ZA 4YDUA 3H1QA 4IJNA 2IVNA 4K41A 3WUHA 3BP8A 2ASPA 1Y64A 2NZTA 2CH6A 2I7PA 2P9KB 4FWLA 2VWBA 4CI6A 2P9PB 1HLUA 3FE1A 3MN5A 4B1UB 3AY9A 2W41A 1BWFO 1QZ5A 2E1YA 2PAVA 3WQTA 3UE5A 4K43A 4HTLA 2NRHA 5ELZA 3FZFA 1WUAA 2V51B 3UKRB 1MA9B 3LDQA 1NGEA 5BPNA 3WEEA 2KHOA 4BQZA 4BRAA 3WXLA 5FPNA 1SQKA 2VCPA 3H3NO 3JS6A 4FWQA 3MN9A 3ENOA 3VPZA 4PKIA 4H03B 1D4XA 1JCFA 4BG8A 4JNEA 3R9PA 1T6DA 5ADXA 1GLBG 1KAYA 1HUXA 3LDPA 4M7YA 3HBTA 4FWSA 4RTFD 2A41A 3FLCO 2IIRA 4IO8A 2ZWHA 2FF3B 2FXUA 4M63C 3SLCA 4CZMA 4BRGA 4FWKA 1ZC6A 3M3ZA 1OKJA 4B1ZA 3QBXA 3O1BA 4EFHA 3HI0A 2YJEA 4IWVA 1C0GA 4BGAA 1R59O 5FPEA 2VYPA 5AZIB 4H0OA 1YXQA 1K8KB 5AQXA 4CZIA 4RCHA 4EHTA 2QWQA 2P9SB 4M7XA 2FSNA 4XEIA 4BRHA 1ZXOA 3LDLA 1EQYA 3IMXA 3CJBA 3CI5A 2OANA 4MLHA 3DXKA 4K42A 1IJJA 4BRFA 5AQHA 3ZEUA 1GLDG 3O80A 2EWSA 2F9WA 5I9EB 2E8AA 1NBWA 2CGJA 3QFUA 1S3XA 3QMLA 1BOTO 5B8HA 1Q18A 5KPTA 3SJHA 1U6ZA 1NLVA 3VF6A 5E84A 3GOIA 2HF3A 1K8KA 3UKUB 4BR4A 4BRKA 5BN8A 2Q1NA 2QWMA 4FO0A 3LL3A 4BC2A 3EO3A 1BO5O 3MK6A 1NGGA 1NGBA 3EKUA 2QM1A 5BRFA 5AQFA 4CZHA 4FPBA 3GBTA 3O08A 5AQYA 2H3GX 4BRIA 3VEOA 4CZEA 2CH5A 1ZBSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AQWA 4FZZA 3FR0A 1REVA 4M3ZA 4QOZB 4DFPA 3EZWA 1W7AA 4NCGA 2O8EB 4RW4A 5M1OA 4BE0A 1IH7A 2E2OA 3V9WA 2WONA 3H46O 4HUEA 1JLEA 2B4JA 4Z4EA 3IRXA 4A59A 3HZ6A 3D45A 1RTHA 3SPZA 2QEXN 4CEZA 2YNHA 2O8BB 1NOZA 4G9ZA 4QCLA 1BL3A 3O4WA 4GV9A 4ZTFA 1ZYQA 3PX6A 2PFUA 4CGFA 3L2RA 3R6MA 1TKDA 3MEEA 2YNGA 2HB5A 4KI4A 2O8EA 1ESVA 5KQ8A 4B9UA 4F9OA 3ZT1A 4DR6K 4OLBA 1T8EA 4BR5A 2E88A 4BRNA 2P9PA 1HJOA 4JS4A 4DSKA 3MXJA 4J2DA 2UXCK 1Y97A 4YHHK 3O1WA 2HF4A 3DOKA 4X64K 1WSFA 2Q0RA 3T1YK 3HPHA 1ATRA 4FZXC 1Z6RA 2GELA 3TTDA 2KTQA 2NRZA 3CJ1A 5AFUA 4CHNA 2D0OA 2CGKA 2YCHA 1BDGA 1BIUA 2Z1HA 4IFVA 4CJPA 4RWTA 2BANA 1YHQN 3HTVA 4JK7A 2IS3A 3TAQA 2UUAK 2W40A 3A0IX 4KHWA 3O9TA 3QEIA 4CIFA 1MWMA 2V7YA 1YVNA 4WYBA 3THWA 4ISEA 1YTAA 2ASMA 3P31A 4I2PA 3TTFA 1HYVA 5KQDA 4UY8O 1ZBUA 5EXWA 3EN9A 3S41A 5GIPA 3J7YP 2FSJA 1WAJA 4M45A 2XRIA 2Q31A 3ZSYA 3UB5A 5E26A 4FYDA 3QB0A 1JLCA 2HNYA 3DLLL 3VQEA 3ZT2A 1BISA 4DSEA 1VSDA 3MCPA 4H0YB 4A2AA 2P9NB 3H3OB 3QETA 2UYTA 4CJ3A 3QNOA 4I9LA 4LF5K 3HM8A 2GEMA 1RT3A 2BUPA 3CJAA 3TAEA 1ATNA 3E9OA 3SQ2A 4LFAK 4YOUA 5CHIA 3CQ8A 1JLBA 2NRRA 3F73A 1VSMA 4EAHD 3TANA 4B3SK 3VQ5A 2E1ZA 3G25A 4WQ4C 3IG1A 4IG3A 5LJWA 4B3MK 4O5FA 4E89A 1FKPA 4XIUA 1BA0A 4LC9B 2QWPA 4NO7A 4GVMA 4OX9K 5J2QA 1YITN 3OYAA 2ITGA 5LMUK 3C65A 3NGYA 5JLHA 4LF6K 3UIQA 4CJ4A 4FLWA 3WXKA 3CCVN 4OO1J 3VEVA 1CLQA 1U4BA 3HL8A 1KTQA 1RDDA 5C25A 1WNSA 4FOIA 4HHTA 2PZSA 4CGIA 4DFKA 1VQ7N 4FWPA 5AQPA 4UQGA 1LAWA 4DQSA 3SV4A 4FJ5A 1OH7A 1RT5A 4FSVA 4HUGA 3L8BA 1OVQA 4YOWA 1N8RO 3QESA 4CGHA 3E9PA 3AA2A 1NKCA 3AVAA 3FGUA 1QVGM 3HOTA 3PSFA 1MWKA 1C1CA 4CK2A 4CESA 1RBTA 2FSKA 4CJ5A 2JWLA 2OPQA 3KZBA 2JGUA 1X9WA 1KXPA 4WCEL 3I33A 3ULDA 4FW1A 1BI4A 3ATUA 4PKHA 3U3YA 3ITHA 4CK1A 4E7JA 4XH4A 2YV0X 3WNFA 5D3GA 1BA1A 4MLEA 3LPUA 4BVOA 5AQTA 3HXMA 2R7YA 4GNIA 4JKFA 3TAPA 4W5RA 1YTUA 4Q0BA 4IFEA 5H1SQ 4FLVA 3SZ2A 3OYDA 4JLHA 5AQZA 4J8FA 4DTXA 4DTNA 3C6HA 5JLFA 3RR7A 4L3QA 3QINA 5AQOA 4EZ6A 3HVTA 4CBUA 2HBMA 3BY5A 3K58A 5LY3A 2UUCK 4LSNA 4JV5K 3DAWA 5CE3A 1RBVA 4E0DA 1LV5A 3N4PA 4B1WB 4PL7A 5KI6A 2RPIA 3CFOA 5I42A 4CJEA 1T05A 4RW7A 4BRPA 3IFRA 1GOCA 3T1AA 2YNFA 1NMDA 1SS6A 1XC3A 4U67L 3NDKA 4FJNA 5KRTA 4CHYA 1BCOA 4FCYA 3DI6A 3KHYA 3D6RA 3SAGA 4J2BA 3L4IA 1G15A 4H0TB 4CBWA 1Q82O 3ZLJA 3SQ0A 4CEEA 4N76A 1WOQA 4GKKK 4GV6A 4MFBA 2J4RA 1JJ2M 2P51A 1GLFO 1NGHA 5BRDA 4B9SA 1VSLA 3DXMA 5I3UA 3W0LA 3OY9A 1FKOA 4H5TA 2VQFK 4BREA 2V7ZA 4YDUA 1UA0A 3CM6A 3DLGA 4FW2A 1VQPN 3BP8A 1EWRA 1Y64A 2NZTA 1IG9A 4W5OA 2I7PA 3MXMA 2VGNA 2E4LA 1WSHA 4CEAA 5AJ3K 1HLUA 4YORA 1NKBA 4B1UB 3HT3A 3L4QA 1BWFO 1QZ5A 3WQTA 4DSJA 3UE5A 5CYQA 3VQQA 4DUYK 1W2BM 1WUAA 2V51B 4Y1DA 1MA9B 2OYQA 3CC7N 5BPNA 5GINA 3IS9A 3PUFA 2VCPA 4FWQA 4CF9A 4E1NA 3L2WA 4DS4A 1VSFA 2KLAA 1HNIA 2HMIA 3AO1A 4BG8A 3KKSA 3ZT0A 3R9PA 1T6DA 3CCLN 2F8SA 1HRHA 4WFNL 1K9MO 4RTFD 1JL2A 1CZBA 1NMNA 3FLCO 3RR8A 2HHHK 3KK1A 3AGRA 1XMOK 2FXUA 2O4IA 3SLCA 2AJQA 2OPRA 4FWKA 2BGGA 3OYIA 3M3ZA 3SAFA 2PYLA 3C6TA 4BE1A 1ZBIA 3HI0A 2RKIA 3LP0A 4BWJA 1TK5A 4ILHA 1ASVA 3I8DA 3OJUA 4H0OA 1K8KB 5AQXA 3MEGA 5M1KA 4FLYA 3K5MA 1HR0K 4XEIA 4BRHA 3ZCMA 1ZXOA 4CK3A 3CCMN 3K5OA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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