1MWMA

Parm from plasmid r1 adp form
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
320
structure length
316
Chain Sequence
MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ParM
publication title F-actin-like filaments formed by plasmid segregation protein ParM
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Structural protein
total genus 98
structure length 316
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mwmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mwmA01
3DXMA 4JHDA 1NGJA 3KZBA 4FWRA 2QXLA 3U4LA 2V7ZA 4EHTA 2GEMA 1TUUA 1QZ5A 2IVNA 1MDUB 2P9LB 5AQIA 1G99A 4BR5A 1BG3A 2A6AA 4XH5A 4K43A 3UE5A 4FWOA 3OHRA 2HMPA 4BR2A 2A40A 1LCUA 4B1WB 5F1XA 4A62A 3I33A 3QDKA 3ZX2A 1T6CA 5TKYA 3WEEB 2KHOA 2PBDA 3O5BA 2FSNA 3MN6A 4FWPA 3A5NC 3MN9A 2GELA 2H3GX 2P9SA 4NB4A 2NZTA 5KPTA 3D2EA 4FPAA 1T6DA 4BRKA 3FGUA 4QS7A 4EIAA 2NLXA 4AM7A 1TYQA 1E4FT 1C0GA 3VEVA 1IG8A 2I7PA 3M3ZA 3WUHA 2AP1A 1YAGA 4CZFA 4Z94A 3L6QA 1BO5O 3H6EA 4JNEA 4BGBA 3CJCA 3IUCA 2F9WA 4O8KA 4MO4A 1HKGA 5LJVA 4BQLA 5AQTA 3G25A 4M63C 3RSEB 4BC4A 2YHWA 4B1XB 3ULEB 1K8KA 1YXQA 3QB0A 4H0XB 1ATRA 1NLVA 3O8MA 4CZKA 1HLUA 3DWLA 1LOTB 3CHWA 4FWQA 4C23A 1RGIA 4PL8A 1ATSA 5F2RA 4B1YB 3VETA 4FWLA 4M7YA 2QWOA 3QICA 5AZIA 3DXMB 4JHDB 4BRNA 4CD1A 3LDQA 5BRFA 4BRGA 1BA1A 3SJHA 3FE1A 4DQ8A 4WQ4A 5AQKA 3CIPA 3A5MC 5FPDA 2IVPA 2YJFA 1V4SA 1QHAA 2CGKA 2V7YA 4BVPA 3HM8A 1X9JA 3GE1A 4BR4A 3H46O 4QS9A 4AM6A 1NGIA 3AY9A 2P9IA 5AZJB 2FXUA 1T44A 5AQJA 1GLCG 4A2AA 3L0QA 3LDNA 5CE3A 3ENOA 2P9SB 1BWFO 2YI1A 4RCHA 5AQXA 3D2EB 5AFUA 1NGFA 3LM2A 4H5NA 4K42A 2AA4A 3VF4A 4JAXA 2CGJA 4MO5A 3BUZB 2E8AA 5AQVA 1TYQB 1E4GT 3MDQA 3VGLA 4CBWA 4CZMA 1GLJO 1ATNA 5EXWA 4BG8A 5BPNA 5AQOA 1NBWA 3CJAA 5JMVA 4BRLA 3ZEUA 5B8HA 5AQGA 3FFKB 2QWPA 3CJ9A 3WT0A 4CZGA 3IDHA 3J8AA 4GY2B 3MK6A 4K25A 5E26A 1GLBG 1K8KB 2ZGYA 3TPQA 2Q1NA 1HX1A 2Q31A 2E20A 4IWVA 4L3QA 3VGMA 2BTFA 3CETA 4XH4A 5EVZA 3S41A 1WOQA 3VEZA 4FWSA 2P9NB 1DGKN 2VYPA 4PKGA 3L4IA 5BRDA 5BPLA 1V4TA 3F9MA 4BRQA 1D4XA 4B1VA 4K41A 5AZIB 3W3DA 1HKBA 3WQTA 2J4RA 3VENA 2IIRA 5AQSA 1RDWX 5KPZA 4I6MA 1EQYA 2F9TA 1KAXA 5KQ8A 3HI0A 3LDLA 2D0PA 4FPBA 4BVOA 1XC3A 3IFRA 2W40A 1BOTO 3QMLA 3VEYA 3WXLA 5ADXA 4WYBA 4H5RA 2ZF5O 2P9IB 3DXKA 5FPMA 4HTLA 2QM1A 5EY4A 4HWIA 4E1JA 3SMPA 4CZEA 3DAWA 2E2OA 2FF6A 4BRCA 4H0PA 3ATVA 3WQUA 2Q97A 3B8AX 1RFQA 2A5XA 2PAVA 2D4WA 1YVNA 4GNIA 1DEJA 3VF6A 3LM9A 3FZHA 3R6MA 3GDQA 3WXIA 2W41A 3I8BA 3WXKA 5BREA 3D2FB 4JN4A 3A5LC 3MCPA 4A61A 4BR9A 4RTFD 5AQWA 3FZMA 2VCPA 3LDOA 2QW9A 1ZBSA 4BROA 3ZEUB 3H3NO 4FOEA 4M7XA 4ISGA 5AQFA 3FLCO 2WUSA 3KHYA 5AQRA 4MLEA 3A5OC 3BF3A 5AQYA 2HF3A 1SAZA 4BRHA 1MWMA 4BRIA 2V52B 3QFUA 3GL1A 4FO0A 2FLOA 1NGGA 2P9UA 3FZLA 1X3NA 1GLAG 2GTDA 5JICA 1HUXA 2E1ZA 3A8YA 5EOYA 3MN7A 2QWQA 3ZETA 1WUAA 2UYTA 3QFPA 5F0XA 2BUPA 4BRDA 1YUWA 3H1VX 3VEOA 3VOVA 4BREA 5AQLA 4I6MB 3BP8A 3O6WA 4H03B 3HSCA 3C7NA 1NGEA 3JXUA 1SQKA 3R8EA 5I9EB 4JD2A 3DXKB 2A41A 1H1VA 3QBWA 5AFUH 4WQ4C 2CGLA 5AQMA 2ZWHA 4IJAA 3VESA 4BC3A 2OANA 2ZGZA 1NMDA 3U9DA 1QQOA 2A42A 4IO8A 1NWKA 3KVGA 4CD3A 2QWLA 3JS6A 1GLEG 4DCHA 4BR7A 1MWKA 1NM1A 3ZX3A 4KBOA 4DHYA 3H3OB 3A0IX 4QS8A 2A3ZA 2GUPA 4CI6A 3EKUA 3VPZA 5FPEA 1Z6RA 4BRFA 4H5VA 4H0OA 1HJOA 2YCHA 4CZHA 1NGAA 1C0FA 4IXCA 1X3MA 1Y64A 1BU6O 3HBTA 2QWMA 3EO3A 1S22A 4H0TB 2D0OA 3UKRA 3CQXA 2P9UB 3MN5A 3M6GA 2I7NA 2CH6A 2E2PA 3O1WA 1U6ZA 1U2VA 4IJNA 1S3XA 2V51B 3EZWA 3QBXA 2GWKA 3CJBA 4PL7A 3ID8A 3ZETB 5BPMA 5JLFA 4BQZA 3DJCA 3ATUA 1XQSC 2YHYA 1BDGA 2Q0RA 2Q36A 4CZLA 3ZX0A 1P8ZA 1BUPA 4H0YB 5E84A 4BGAA 1JCFA 4J8FA 3AAPA 2P9KA 3EKSA 3C7NB 2P9PA 3TU5A 5ADXH 3HZ6A 4ISFA 3R9PA 3WXJA 2VWBA 3GBTA 4FL9A 4H0VB 1SZ2A 4JD2B 5AQQA 1JCGA 5AQNA 5AZJA 3ENHA 3UKUA 4H5WA 3VEWA 2FSJA 4F9OA 3SLCA 2QWRA 4BG9A 1ZXOA 4ISEA 4LC9B 4BRPA 2ASPA 4CZIA 4BRMA 3CI5A 3C0BA 3UB5A 5AQPA 4RWTA 2ITMA 2FSKA 4MLHA 2YHXA 5AR0A 1GLLO 1OKJA 3GOIA 4B1ZA 3U8XA 4CBXA 3W0LA 1NGDA 5AQUA 3O08A 1KXPA 3CJ1A 1NGHA 3LDPA 5BRHA 2HF4A 3BF1A 4XEIA 1DKGD 2GWJA 2DPNA 5BR9A 3HTVA 1CZAN 4EAHD 4BC5A 2E2QA 3D7EO 4NO7A 3UKRB 4FWKA 4FWNA 2YJEA 1Q18A 2P9NA 3CJ7A 2HOEA 1HPMA 2P9LA 1Z05A 1U2VB 4IZ9A 4PKHA 3H1QA 5AQHA 3O1BA 5LJWA 2ASMA 3AAQA 3H45C 3M1FA 1IJJA 4WQ5A 3CQYA 1J6ZA 2E88A 2IVOA 1NGCA 4BC2A 5FPNA 1XUPO 3O80A 1R59O 5BN8A 3FR0A 3SK3A 2P9KB 3O4WA 4YDUA 2P9PB 3WEEA 1TUYA 2NRHA 4PKIA 3VF2A 1JCEA 2D1KA 3LL3A 2Q2RA 3VGKA 4CJ7A 4EHUA 2CH5A 1KAZA 3EN9A 1QQNA 2QWNA 3UKUB 3AARA 3IMXA 3BEXA 1QQMA 1ZC6A 1HKCA 1MA9B 4BR0A 2E1YA 4H5TA 3EL2A 2FF3B 3FZKA 4WQ5C 2ASOA 4BRAA 1KAYA 4CBUA 4XH1A 3CERA 3P4IA 2Q0UA 4Y0WA 3MMVA 4YDUC 5JLHA 4FOIA 4B1UB 5LY3A 3U9ZA 2EWSA 4O5FA 1QZ6A 3D2FA 3RSEA 5BN9A 4FWMA 5KQDA 3ULEA 3VEXA 3GG4A 1BA0A 4B9QA 4EFHA 3FZFA 3VERA 3SMSA 1ESVA 4DB3A 5ELZA 5EX5A 1NGBA 2E2NA 1GLFO 5AQZA 1GLDG 4FSVA 5KPRA 4CZJA 4A2BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DXMA 1NGJA 3KZBA 3OS2A 2QXLA 3U4LA 1RDCA 3S9HA 4CF0A 1QZ5A 2P9LB 4IFVA 5AQIA 1L3TA 2A6AA 4K43A 1NJYA 3K5OA 3UE5A 3OHRA 2HMPA 4FLWA 2A40A 3EZ5A 1YTAA 4GKJK 1EKEA 5F1XA 4CECA 1JLEA 4PQUA 2UUAK 1K6YA 3TSQA 1VQLN 1LW2A 3K9KA 2PBDA 5J2QA 3LZIA 3TTDA 3A5NC 3VQCA 1ASWA 2NZTA 1WSFA 3THWA 5J2MA 4BRKA 3FGUA 2W42A 5I3UA 3C6UA 1TYQA 2O8CA 1HJRA 2E6LA 1UWBA 4DUYK 2HNDA 4PWDA 4GV9A 1NG9A 4Z94A 1M1KO 2G8WA 4FLYA 1BO5O 3OY9A 1KVBA 2EHGA 4DLGA 1YVUA 4JI1K 4MO4A 3LDSA 4BC4A 3PIOL 4OPAA 1T03A 1GOAA 3KLEA 3ULDA 1RTIA 3CHWA 1NK0A 1EX4A 1ZBFA 1EWRA 3CCJN 4DUZK 1ATSA 5F2RA 4DV1K 3VETA 2PFUA 2Z1JA 5AZIA 3V9ZA 4J2BA 3JSMA 4DV6K 5HL7L 3QINA 1BA1A 1JLFA 3DLEA 4WQ4A 1U04A 3TSPA 3AVKA 3IRXA 2CGKA 3D45A 1IBLK 3H46O 4GMJB 3VMFB 4LF5K 4CJSA 1CZ9A 1BCMA 1KD1O 2UUBK 4FLTA 1GLCG 4CEQA 4A2AA 1U47A 2P9SB 4XIUA 4RCHA 4H8KA 5AFUA 4DS4A 4OPKA 4HUFA 2ATQA 1ASUA 3OS0A 1HNIA 3QIPA 4JAXA 3MCAB 4KHPK 1IKWA 1SKWA 3VGLA 2RKIA 1BGXT 2Q3SA 4IDHA 4B08A 1ATNA 1L3SA 1VQ9N 3OBWA 1TAUA 4BG8A 5HP1A 3TANA 4ZTJA 3ZSYA 4HUGA 3I55N 1NBWA 3D6RA 3CJAA 5JMVA 4BRLA 4NLCA 5B8HA 2O8BB 3MECA 4CZGA 3TPQA 2F7TA 4M3RA 3CETA 3S41A 3VEZA 1DGKN 4WFBL 4LD0A 1V4TA 5M1QA 4Z4FA 4B1VA 4B3MK 4K41A 3W3DA 4K8ZA 1S5JA 3WQTA 3VENA 5GADP 5AQSA 1RDWX 4I9LA 4FJ8A 5IWAK 4I6MA 2F9TA 2P5GA 4DTNA 4B9NA 2HB5A 2RPIA 2VQFK 4DTJA 3PLAA 4BVOA 2Z1IA 3PSIA 4B9SA 4JRPA 1BOTO 3WXLA 2HHQA 3KLIA 4CGFA 1T7PA 2KFNA 4WYBA 2P9IB 1FJGK 2QM1A 4CF9A 4RG8A 4M3TA 4DR4K 2NNWA 2VG6A 3DAWA 4JK7A 3VQ4A 4GKKK 1P90A 3L2QA 3ATVA 3WQUA 1HMVA 3KKSA 3VTIA 2A5XA 4E3SA 2PAVA 5JS2A 4MDBA 1IKXA 1YVNA 1S6QA 3PX6A 3FZHA 3WXIA 4C1NI 2HBMA 3I8BA 5BREA 4A61A 4BR9A 3SJJA 5DK5A 4KH5A 4CK3A 3SPZA 1ZBSA 3H3NO 4JI6K 5AQFA 4FJNA 3HYFA 4Z4CA 2B5JA 2WUSA 3KHYA 1SAZA 2P9UA 4DSEA 1X3NA 1GLAG 3OYJA 3AA2A 2QWQA 1WSIA 4C8KA 3VQ5A 4E1NA 5F0XA 3QETA 3NBPA 1N34K 1RBUA 3BP8A 4YNQA 4KHSA 1IO2A 3HSCA 3C7NA 1Q9YA 2OPPA 3BGRA 5A2QO 4ZTFA 3OJSA 3DXKB 4A59A 3L2RA 4GW6A 5EU7A 5AFUH 2CGLA 5AQMA 3QEPA 3AO4A 1BQNA 2ZWHA 4B9VA 2OANA 3U9DA 3HPHA 1NJZA 2A42A 4FZZA 4JV5K 1Q8IA 4LF8K 1MWKA 3SPYA 1A5VA 1WBDA 1NM1A 4DHYA 3H3OB 1TKTA 1Q7YO 3NGYA 4FJHA 4CI6A 3VPZA 1C1CA 4EZ9A 4H5VA 3ZLJA 1W97L 2YCHA 4CZHA 1LWFA 2OPQA 1C0FA 4IXCA 1Y64A 4CHOA 3IS9A 3V1RA 4B3TK 2D0OA 2PY5A 1RT5A 1WAFA 3MN5A 3T1YK 1TK5A 3NHGA 3M6GA 2E2PA 1S1XA 2JWKA 1U6ZA 3NF6A 1S3XA 1SUQA 2GWKA 4FJIA 5BPMA 5JLFA 5GAEP 4BQZA 4M3ZA 3ZYYX 1JJ2M 3ATUA 3QEVA 2Q0RA 4B3RK 4KREA 1OVYA 1BUPA 4JKGA 5E84A 1KFSA 3AAPA 1RILA 2X78A 4OKKA 4Q5VA 3AVHA 4DR1K 2X74A 2B6AA 1KLMA 3R9PA 4I7FA 3WXJA 2VWBA 4F3OA 2ITGA 4DTMA 5GAHP 3THXB 1JCGA 3UKUA 4GV3A 2FSJA 4F9OA 4CF1A 2ASPA 2KLAA 4CEFA 4BRMA 4H4OA 4F4KA 2G8VA 3U3YA 2QXFA 4JS4A 4FJ7A 4DG1A 2ITMA 1VRTA 1QSYA 2QKBA 3NF7A 1RNHA 3GOIA 3L2VA 3OYMA 3O08A 1J9AA 4O5BA 1VK0A 3P39A 2YNHA 1NJIO 5BRHA 3OYKA 3ZSRA 3BF1A 3THVA 2FBXA 5JS1A 3VN5A 3OYLA 4LF9K 4FM1A 4ELUA 5BR9A 3DLKA 1HNVA 2XY7A 3T69A 4EAHD 4CHQA 3UKRB 4H4MA 5LMNK 3SQ4A 4DSJA 1OH8A 2OPRA 2HOEA 3J7AP 2OCEA 1T05A 3H1QA 5T7BA 3OYIA 2P1JA 4FK4A 4Z4IA 1SKSA 3LP2A 3C95A 3CQYA 4RW6A 2ETJA 4U67L 2VGNA 4BC2A 2HNYA 3O4WA 1EXQA 4CJWA 3G6EN 4CF2A 3LPTA 1JCEA 3LL3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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