1MWMA

Parm from plasmid r1 adp form
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
320
structure length
316
Chain Sequence
MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords ParM
publication title F-actin-like filaments formed by plasmid segregation protein ParM
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 98
structure length 316
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mwmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mwmA01
1R59O 4JD2A 3L0QA 3O6WA 3O8MA 1BA0A 4CZHA 1QQOA 3VGKA 3QBWA 2E2PA 3WXIA 3CJ7A 3AAQA 3EZWA 1YUWA 1H1VA 3L6QA 1BG3A 2A40A 1SAZA 1XQSC 3LM9A 5KQDA 4YDUA 2P9UA 4IJAA 2IVPA 2E2NA 3ENHA 3VETA 4BVPA 2GEMA 1E4FT 3FZLA 3VESA 1U2VA 3CIPA 4H5TA 2NZTA 4K41A 2QWLA 1ZXOA 2D0PA 1GLCG 3AARA 3FE1A 4BC2A 3FZFA 4K42A 5BRDA 3UKUB 3R6MA 5AFUA 4CZMA 3D7EO 4ISGA 3ZETA 5AQXA 1Y64A 3O1WA 5F2RA 1NLVA 5LJWA 5EOYA 2YHXA 3QB0A 3MN5A 4MO4A 3ZEUB 5B8HA 2P9NB 4FWMA 3CJBA 4H0YB 3ULEA 3H6EA 4XH1A 2KHOA 4FWKA 2I7PA 4H5VA 3UKUA 4FWNA 3VPZA 2FXUA 3VEVA 1ATNA 1CZAN 3QBXA 4K25A 1S3XA 5AZIB 4IJNA 3P4IA 3EO3A 1HJOA 3ZEUA 4BRAA 4CJ7A 2P9NA 4IO8A 3CQXA 2QWQA 2FLOA 3KZBA 2ASOA 5BN8A 4BC3A 4BRPA 2NLXA 2QWPA 3H46O 2CGKA 3WT0A 3DWLA 1DEJA 5AZIA 4I6MB 1QZ6A 4BRLA 4QS8A 1DGKN 4JHDA 1MDUB 3DXKB 3CJAA 1QZ5A 4DQ8A 2GWKA 3CJCA 3M6GA 4FOIA 1NGHA 2V52B 4WQ4A 1KAYA 4HTLA 4BQLA 2P9KA 1DKGD 4O8KA 4MO5A 1LCUA 3MN7A 4CZIA 5AQTA 1TYQB 3C0BA 5AQJA 1Z05A 4I6MA 1T44A 3H1QA 2I7NA 3SMPA 4CZLA 5KPZA 2NRHA 3U9DA 3VF6A 4BR0A 5LY3A 3EN9A 3DXKA 1XC3A 3VEYA 2QWNA 1C0GA 1J6ZA 5EY4A 3VF4A 3UKRB 5LJVA 2D0OA 4AM6A 5E26A 3DXMA 3H1VX 3L4IA 1TYQA 4CZGA 3D2EA 2BUPA 2DPNA 2OANA 4FWQA 5ADXH 3TU5A 2QWRA 1C0FA 1NGIA 3O08A 3UKRA 4FOEA 1NGBA 4H5NA 4B1UB 1HKBA 2WUSA 1YVNA 3SJHA 3M3ZA 1NMDA 2P9LA 4IZ9A 3AY9A 4BR4A 5BRFA 1MA9B 3TPQA 1BWFO 3JXUA 3R8EA 4JNEA 4PKGA 1E4GT 4B1ZA 4CZKA 1X3MA 3H3NO 5BN9A 4BRGA 3GL1A 3LM2A 2F9TA 5AQLA 5AQVA 4FWLA 3O5BA 4BRHA 4BVOA 1NGDA 1NGGA 4NO7A 5JICA 2IVOA 2Q36A 5ELZA 4CZJA 4H0OA 1HUXA 4A62A 3HBTA 3ZX0A 1HLUA 3MN6A 5KPTA 3SLCA 3A0IX 1BU6O 4BC5A 4ISFA 4BQZA 4BR5A 1QHAA 1YXQA 2V51B 1U6ZA 2VYPA 2YJEA 3BF3A 5JLHA 4CZFA 3CJ1A 2QXLA 3SMSA 1GLBG 5AFUH 4C23A 3UB5A 5AQHA 2P9PB 5AQIA 3HM8A 5AQGA 3VEZA 1SQKA 1JCFA 4H5RA 1S22A 2YCHA 3CI5A 3LDNA 1QQNA 2J4RA 4FPAA 2GTDA 3A8YA 2V7ZA 2Q0UA 5AQPA 3BF1A 2YI1A 4H0XB 1GLEG 4F9OA 4BRQA 4PL7A 5I9EB 3SK3A 4DHYA 2HOEA 2E8AA 1SZ2A 3I33A 4CBXA 3CETA 1RFQA 2H3GX 1T6CA 5KPRA 3CJ9A 1NGEA 3R9PA 3VF2A 2BTFA 4FWSA 4JAXA 4CZEA 3FR0A 4MLEA 4PKHA 4XEIA 3A5MC 3IFRA 5TKYA 3QFPA 1BOTO 3HZ6A 4EIAA 2CGLA 3MCPA 3ATVA 3HTVA 3UE5A 3FLCO 1BO5O 4KBOA 4XH5A 4B9QA 1JCGA 5EXWA 4BG8A 4DB3A 2CH6A 3J8AA 4BR9A 2ZF5O 1G99A 4Y0WA 3FZKA 4B1XB 1QQMA 3A5NC 5AQYA 4A2BA 2FSJA 5AQWA 1TUYA 4AM7A 2A3ZA 4BR2A 3H45C 4CBUA 1D4XA 4GY2B 3BUZB 3HI0A 3C7NB 3KVGA 2CH5A 4DCHA 3U4LA 2QM1A 1YAGA 4QS9A 5EX5A 1GLFO 5AZJB 4BR7A 1MWMA 4FWPA 3D2FB 3VOVA 3M1FA 2A5XA 1HKCA 2W40A 3HSCA 4H0TB 1KAXA 2P9IB 3I8BA 1NGCA 3C7NA 2E20A 4BC4A 1NM1A 4H03B 4RTFD 3OHRA 4CI6A 2AA4A 2HF3A 2E88A 1ESVA 1ZC6A 4A2AA 4B1VA 2Q31A 1JCEA 5AZJA 3RSEB 4RCHA 3FZMA 3LDLA 2FSNA 1ZBSA 5BPMA 2PAVA 4WQ4C 3VERA 4CBWA 3GG4A 2Q0RA 3EKSA 4H5WA 5FPNA 3LDOA 2IVNA 4BRIA 4QS7A 4B1WB 3ZX2A 3VENA 1NBWA 5AQUA 4WQ5C 3U9ZA 2E2QA 3RSEA 3WQUA 4HWIA 3ID8A 3F9MA 2CGJA 3QFUA 5F0XA 5AQKA 4H0VB 3AAPA 4JN4A 3EKUA 4JD2B 2YHWA 2E1ZA 5JMVA 1HX1A 4PL8A 2AP1A 3GOIA 2UYTA 4FSVA 4XH4A 5KQ8A 3QDKA 4M63C 4IWVA 5AQMA 3VEOA 5BPLA 1ATRA 4BRDA 3MN9A 5E84A 4CD3A 1BA1A 1X3NA 2P9UB 3G25A 1NGJA 2HMPA 2YJFA 3VGMA 1EQYA 5AR0A 1GLJO 1U2VB 4FO0A 2F9WA 1RGIA 5BRHA 1NWKA 3DJCA 4EHTA 4MLHA 4FPBA 4EHUA 3IMXA 4BRKA 2FF6A 2GUPA 3LL3A 2Q1NA 3CHWA 2QW9A 1TUUA 2ZGZA 4LC9B 3ZETB 1LOTB 3A5OC 2P9PA 2IIRA 1GLLO 3LDQA 3FZHA 4YDUC 2Q2RA 4CD1A 3ULEB 1MWKA 2ASMA 1OKJA 5JLFA 4EAHD 1BUPA 4NB4A 1WUAA 3ATUA 1KXPA 3VGLA 3KHYA 3O1BA 3WQTA 1ATSA 5BPNA 2GELA 2ZWHA 1P8ZA 5AQRA 3O80A 2P9SB 2E1YA 3H3OB 3QMLA 5EVZA 4M7XA 2EWSA 2Q97A 3GDQA 4BRFA 3JS6A 2PBDA 3B8AX 1V4SA 1X9JA 5F1XA 5AQSA 3VEWA 3QICA 5CE3A 4GNIA 2ITMA 1NGAA 4BRCA 4JHDB 1K8KB 3BP8A 5AQNA 2P9SA 4BREA 2VWBA 2HF4A 2VCPA 3ENOA 4K43A 4PKIA 2A6AA 2P9KB 4EFHA 1RDWX 3ZX3A 1WOQA 5BREA 4E1JA 1HPMA 4FWRA 1K8KA 3A5LC 5AQOA 4FWOA 2E2OA 5FPMA 1GLDG 3MMVA 1Z6RA 3S41A 4FL9A 3BEXA 4BRMA 3VEXA 3DXMB 1BDGA 4WQ5A 1NGFA 2ZGYA 3D2FA 3GBTA 4L3QA 3W0LA 3D2EB 4A61A 4BG9A 5FPEA 2QWMA 3EL2A 2A42A 3FGUA 3FFKB 4IXCA 4WYBA 1XUPO 3CQYA 1Q18A 2P9IA 4ISEA 3WEEB 4B1YB 1KAZA 4BRNA 2W41A 2ASPA 2GWJA 4BGBA 1T6DA 5AQQA 2P9LB 3CERA 3W3DA 3LDPA 3WXJA 2A41A 2D4WA 3U8XA 4Z94A 2YHYA 5BR9A 2V7YA 4J8FA 2D1KA 5AQFA 2FSKA 4BGAA 3WUHA 4M7YA 2FF3B 3WXLA 4BROA 4RWTA 4O5FA 1HKGA 1V4TA 3WEEA 4H0PA 1IG8A 3MDQA 5ADXA 2QWOA 3GE1A 5FPDA 3IDHA 3WXKA 3O4WA 1GLAG 1IJJA 3IUCA 5AQZA 3MK6A 3DAWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3P31A 1JL2A 1RBVA 3PO5A 4CZHA 4I2QA 4V19S 2AJQA 4CJSA 3WXIA 3P38A 3CJ7A 3AAQA 3EZWA 1H1VA 3KWIA 3CFRA 2A40A 4DFMA 1SAZA 4N5SA 4JKCA 3HSTB 2Z1HA 2B4JA 4JRQA 2IVPA 3ENHA 3SBTA 4BVPA 3CD6N 3RRHA 2GEMA 5JS2A 3TTDA 3VQPA 5J2QA 3VESA 3D0PA 4K41A 3G71N 3MX2A 5BR8K 2XHBA 3O9TA 4DFKA 4F4KA 2D0PA 1GLCG 3FE1A 5M1QA 3CCQN 2OZSA 3FZFA 5BRDA 1RTJA 3QO9A 3PX4A 5JS1A 1TVRA 5AFUA 1LV5A 5IWAK 5JVHL 3D7EO 4ISGA 4YHHK 4YOWA 1OVQA 5AQXA 4JKFA 1W2BM 4CK2A 3QERA 5EOYA 1ZBLA 2F7TA 3ZEUB 1DLOA 4XH1A 2OPQA 2IAJA 3UKUA 3M8RA 1SS6A 1VSKA 4FK0A 1ATNA 1CZAN 3QBXA 3SAHA 4K25A 1S3XA 3HP9A 3N4QA 2GUIA 3P4IA 4LSNA 4JI3K 3HOTA 3QINA 4JKHA 4N41A 2P9NA 1ITGA 4LF4K 3ZSWA 4M3WA 3RMDA 1N6QA 3CQXA 2QWQA 4AHSA 4CJKA 1JLCA 3OJUA 1R0AA 3SUNA 1SV5A 3WT0A 3DWLA 3ZT1A 3NHGA 4RW7A 4M3YA 3ZSRA 3MWPA 2DY4A 3CJAA 1QZ5A 4JRPA 4DTRA 3G10A 4DTSA 1NGHA 4FYDA 4A5BA 2P9KA 1DKGD 4O8KA 4DMNA 1O1WA 3NBPA 5AQTA 3C0BA 2YKMA 1T44A 3SMPA 2ZJPL 3CPWM 2NRHA 3S3OA 4KHPK 3U9DA 5HRPA 3EN9A 3DXKA 3O3FA 1WBDA 1XC3A 4FCYA 5EY4A 1VRUA 1XNRK 3CF5L 2XY5A 3C6AA 4AM6A 1DTTA 5KI6A 1TYQA 2HHQA 4CZGA 2VQFK 4CEQA 4NXMK 1VQ7N 4HHTA 3HPGA 2QWRA 1HJRA 3AO1A 5FROA 1C0FA 4FOEA 1NGBA 4H5NA 4O0IA 3M3ZA 1YF5L 3CCEN 1NMDA 2P9LA 5A2QO 5BRFA 1MA9B 4DR4K 4FJHA 1NG9A 1X3MA 1D9DA 2UUCK 5FLXO 3GL1A 2D0AA 4OKKA 1NKCA 3ASMA 4CGDA 3DLKA 4RW9A 4CZJA 4AQYK 1T03A 4H0OA 4A62A 3O4QA 1IBMK 3OYEA 3L8BA 1BGXT 3A0IX 1BU6O 3MXJA 4B9MA 4E1NA 3L2UA 3MXIA 4ISFA 4BR5A 3WNFA 1QHAA 3IG1A 4ELVA 4ICLA 2YNGA 5JLHA 3CJ1A 4DQQA 1TAQA 1QE1A 1GLBG 3J81O 3LWMA 3L3UA 3KLIA 5AFUH 4C23A 4Q0BA 3MXMA 1TL3A 5AQHA 3ISNC 3EZ5A 1YJWN 3BZKA 4CJ5A 4H5RA 4IEEA 3TAMA 3TR8A 1D5AA 4DR7K 5AQPA 4CCHA 4DSIA 4H0XB 4F9OA 3OYKA 3SK3A 1UWBA 4KTQA 1SZ2A 4OGCA 2BTFA 2BDPA 4H4OA 1UA0A 4FZYA 3CXCM 2O8EA 5TKYA 4GV9A 1NK8A 4EIAA 1ZBUA 3AGKA 2CGLA 1QQCA 1I94K 1HPZA 3TARA 3ATVA 3HTVA 4F2RA 4BG8A 4DB3A 2B5JA 4BR9A 1G99A 2VGMA 4B1XB 3T1YK 4R5PA 5AQYA 2FSJA 1TUYA 4CF2A 4AM7A 4Q5VA 2A3ZA 5GAGP 1BI4B 3U3GA 3G6EN 4ID5A 1VQ8N 3BUZB 2HHTA 3NGYA 4FZXC 3LANA 3F2KA 4QS9A 5CZ1A 3O9UA 1TAUA 3VA0A 4DU1A 1JLAA 3K59A 5HRSA 3AO4A 4OJRA 3DLGA 3ENBA 4H0TB 1KAXA 1NGCA 2E5LK 5GAHP 4M3XA 4CJTA 3V9WA 3TSPA 4DS5A 2HF3A 4YY3K 1ESVA 1YTAA 3MEDA 4ID1A 4Z4IA 4B1VA 4DUYK 5AZJA 4RCHA 5KRSA 4FZZA 2E6LA 4CGIA 1VSLA 4JK9A 4CFCA 1BQMA 1EO1A 4CBWA 4DTJA 5I3UA 4H5WA 3LDOA 4B1WB 3ZX2A 1IKVA 2YV0X 3ZSXA 5AQUA 4WQ5C 3QEXA 2ZJQL 1BCOA 2X6NA 2ZQBA 4W5QA 3K58A 5C12A 3RSEA 1SKRA 4CJUA 3JYTA 2JWLA 4K8XA 4M45A 4E1MA 2YNHA 4QOZB 3AVIA 1LAWA 4PL8A 1U04A 2NRWA 3QDKA 4M63C 2XY6A 4FJMA 3SQ1A 3MN9A 3LAKA 3HXMA 4CD3A 5E41A 4FJLA 3KTQA 1A5WA 3U6FA 3PUFA 4CFAA 4OPKA 3SUQA 3QLHA 3LPTA 2HMPA 5H1SQ 4CGHA 5I42A 4IKFA 4C1NI 1NWKA 3DJCA 2F8SA 1REVA 3IMXA 4BRKA 2ZJRL 3RRGA 3CHWA 4LFCK 3SBGA 3KKRA 3VQCA 4CIFA 4FVMA 5C0YA 3SCXA 4AHRA 3LDSA 3KD5E 3LWLA 4FJIA 3SI6A 2Q2RA 2WONA 2OPPA 5SZTA 4GV6A 3O3GA 5HLFA 2NRRA 4YFUA 4C8MA 1VQLN 3J80O 3C94A 4AHUA 4GV3A 4NYNA 4DR1K 1LAVA 4EZ6A 2EX3A 5DM6L 3LP1A 2WC9A 4FM0A 1M1KO 3NAEA 1WBBA 1K8KB 1D8YA 4BREA 1SL1A 1W0HA 3VTHA 4M3TA 4OPHA 3E9LA 4K43A 3RMCA 2P9KB 4CEEA 4EFHA 2Y1IA 4DLGA 3LALA 1WOQA 4B9LA 4OO1J 4E1JA 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5M1OA 4FJGA 1XHZA 2XRIA 1LWCA 3NDKA 4E7HA 1HMVA 2XY8A 3SQ0A 1NJIO 1HJOA 4CJ7A 3CMEN 1NK5A 4U67L 1E3MA 2FLOA 1Q9XA 1S9EA 4NCGA 5HP1A 3T3FA 5BN8A 2O8BA 4CGJA 1YJ9N 1TK5A 2NLXA 2O8FA 1L5UA 5HL7L 4CESA 1DEJA 5AZIA 2Z1GA 1QZ6A 3CQ8A 4BRLA 4H4MA 1W9HA 3SYZA 4B3TK 4I9LA 1HYZA 4X65K 2GWKA 3VQ7A 4JKEA 3CC2N 4WQ4A 1KAYA 4FJKA 4HTLA 4BQLA 1RT4A 3MN7A 4M3ZA 4DTXA 4I6MA 3HOSA 2G8VA 5KPZA 4WFAL 5LY3A 3VEYA 4DFJA 2RE2A 5CYQA 4DLEA 2ZD1A 3V9ZA 2KZZA 2WTUA 3UKRB 5LJVA 5SWMA 3ZSOA 5GIOA 4BDZA 4Z4FA 3H1VX 4H8KA 3L4IA 1VK0A 2BANA 2VWJA 2BUPA 3T1HK 3K5OA 2OANA 1U45A 4KAZA 3TU5A 1ZBHA 2BH1A 4OVLA 4KTZA 4UY8O 4TSXA 3AA2A 4B1UB 3CCSN 2HBMA 1RTHA 1YVNA 4IZ9A 4KB0A 3AY9A 4K8ZA 3R8EA 4PKGA 1E4GT 5BN9A 4BRGA 2UUBK 5AQVA 5AQLA 4IG0A 1S1UA 4FWLA 1NGGA 4NO7A 1RBRA 4GKKK 1TKZA 5ELZA 5GADP 2DFHA 3CMAN 5HOOA 3ZSYA 3ZX0A 3NGZA 5KPTA 3QEPA 3HK2A 4FLZA 3V9UA 4BC5A 3C6UA 4GKJK 1W7AA 3DYAA 4CECA 4DTOA 1YXQA 3NH0A 2V51B 3E9PA 1U6ZA 4B3SK 5C42A 1SUQA 3M8PA 3PY8A 1LWFA 1ZYQA 3SMSA 3I55N 2F4VK 3DRRA 3UIQA 5AQGA 4FW2A 4MDAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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