1MWMA

Parm from plasmid r1 adp form
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
320
structure length
316
Chain Sequence
MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural protein
molecule keywords ParM
publication title F-actin-like filaments formed by plasmid segregation protein ParM
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 98
structure length 316
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mwmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mwmA01
5AZJB 3CQYA 4MLEA 4H0VB 5E26A 2V7YA 4CI6A 3LDPA 1XC3A 2P9SA 2ZWHA 4WQ4A 5AR0A 4B1UB 1RGIA 3F9MA 3TU5A 3RSEB 1JCEA 1YAGA 5BRFA 3FZKA 3FE1A 2V52B 4BQZA 5AQJA 1MDUB 2QM1A 4BROA 5JLFA 5LY3A 4H5TA 3QFPA 2V51B 3W0LA 4BVPA 3KHYA 3SJHA 1HPMA 3I33A 3CJ7A 2QW9A 1HKCA 2YI1A 4FWKA 5AQGA 5FPEA 3S41A 3H1VX 4H5VA 2P9PB 4E1JA 5AQIA 2E88A 2GWJA 2E1ZA 4FL9A 1GLBG 1S22A 2I7PA 1KXPA 3D2FB 1SQKA 4JD2A 2FLOA 2PAVA 3VPZA 3VOVA 1QHAA 2HF3A 1OKJA 3HBTA 3G25A 3A5LC 4B1XB 3IDHA 5KPRA 4Y0WA 3LM9A 5AQNA 2J4RA 4CZGA 2P9LB 3DXMB 3ZEUB 3VEYA 5F2RA 3D7EO 1Z6RA 1KAXA 2DPNA 3EN9A 3ZX2A 4K41A 3VEWA 1GLDG 3FLCO 3MK6A 2YJEA 2A3ZA 4BG8A 2E8AA 5AQXA 4JAXA 3O08A 3O8MA 2VYPA 2WUSA 4FO0A 5AQFA 3CERA 5BPMA 1NWKA 3L0QA 3QBWA 4YDUA 3A5NC 5AQRA 2YHXA 1U6ZA 4IXCA 3FZMA 3KZBA 4BRGA 5AQSA 3MDQA 4FPBA 1BA0A 4K43A 2GWKA 2E2PA 3U4LA 3CJ1A 4WYBA 4RWTA 1HKBA 4B1YB 4FWSA 2HOEA 5LJWA 4L3QA 5JICA 5BRDA 3ULEB 1QQOA 3MN5A 1GLCG 1WUAA 1NGDA 4BRMA 4PL7A 4RTFD 4BRAA 2P9KB 3FFKB 3AY9A 3GDQA 4O5FA 4PKHA 2ASMA 3O6WA 1ATNA 4H03B 1HUXA 1C0FA 1E4FT 1JCFA 4Z94A 4A61A 3IUCA 3DXKA 3FZHA 3UKRA 2Q97A 2QWQA 5EVZA 3GE1A 3VEVA 1EQYA 2W41A 4CBUA 1DKGD 5FPDA 5KQDA 2E1YA 3CI5A 3ATUA 1BOTO 1NGEA 1X9JA 2E2OA 4PKIA 1BWFO 3A5MC 1K8KB 4ISGA 5AQQA 2KHOA 1DGKN 3GL1A 1DEJA 4FWRA 2FXUA 2E2QA 3ENOA 4JHDA 4MO5A 5KQ8A 4H0OA 5AFUH 4LC9B 4M63C 4C23A 5ELZA 1LOTB 1CZAN 2E20A 5AQZA 2VCPA 3VEZA 4FWMA 1NGFA 4B9QA 1MA9B 4ISEA 3U9DA 4JD2B 3QMLA 5AQHA 4BRIA 1QZ5A 1NGGA 4IO8A 2P9IA 5AQPA 2AA4A 3VGLA 3UKUB 2FF3B 1HJOA 4CZFA 4BC2A 2CGLA 3IFRA 4BRHA 3BF1A 2ASOA 4MLHA 4CZIA 3C7NB 1QQNA 4H0PA 3IMXA 2F9WA 2E2NA 2F9TA 4BRNA 4BR2A 4EHUA 2BUPA 3DWLA 5AZIB 5E84A 3WUHA 2D4WA 2V7ZA 5FPMA 5AQOA 1YXQA 4JN4A 3VGMA 1TYQB 4M7XA 4CJ7A 3HTVA 3R8EA 3J8AA 2QWMA 3D2EA 3VETA 3QB0A 2YHWA 4I6MA 4FPAA 2P9NA 2QWNA 3GOIA 1KAYA 5AQTA 5KPZA 1BDGA 4CZMA 2D0OA 4A2BA 4CZHA 2IVNA 2QWOA 4B1VA 5AZJA 2ITMA 3B8AX 3FGUA 4AM7A 3CJAA 3WEEA 1T6DA 3L4IA 3EKUA 2W40A 3LDQA 2I7NA 3ZETB 1V4TA 4BVOA 2QWRA 3VESA 4FOEA 4F9OA 4RCHA 3BF3A 3LDLA 4BGAA 4H5WA 3MN9A 4BRFA 3FZLA 3SK3A 3HI0A 2NLXA 3H1QA 3O1BA 4BRCA 3H46O 1KAZA 3DXKB 5EX5A 2FSKA 2EWSA 1XUPO 1E4GT 1GLJO 3BP8A 1ATSA 1MWMA 3UE5A 4H5NA 3MN6A 3HSCA 4H0XB 1SAZA 2HMPA 2Q31A 3KVGA 4HWIA 1HLUA 2GELA 4AM6A 5I9EB 1RDWX 2P9UB 2QXLA 4GNIA 3VF4A 3GBTA 5AQWA 4B1ZA 1S3XA 4JHDB 2FSJA 4IJNA 1NGHA 4WQ5C 3QBXA 4KBOA 3HM8A 5BRHA 3WXKA 4CD1A 2ZF5O 4HTLA 5F1XA 3H3NO 2P9LA 3CETA 3ZEUA 3MN7A 2P9SB 5FPNA 3UB5A 4BRPA 3BUZB 3DAWA 4BR0A 3O4WA 4ISFA 3CHWA 5LJVA 4CZEA 2YJFA 2IVOA 1NGCA 5AFUA 1ESVA 2PBDA 4MO4A 4BRQA 1IJJA 4QS8A 1Q18A 1BUPA 4FWPA 3OHRA 3R6MA 4XH1A 5EXWA 3EKSA 3A5OC 3O80A 4BG9A 2CGKA 4XH4A 3A8YA 3LDNA 3CJ9A 1T6CA 3AAPA 2FF6A 4EHTA 1GLFO 4DHYA 4A62A 3I8BA 2IIRA 5BR9A 1BA1A 5KPTA 1HKGA 3MMVA 3H45C 1H1VA 3D2EB 1ZXOA 2A40A 4M7YA 4DCHA 4I6MB 4FOIA 2IVPA 3R9PA 5BREA 1U2VA 2Q2RA 2D1KA 2P9KA 2Q36A 3C0BA 3EO3A 4EAHD 3O5BA 5AQLA 3SLCA 4CZLA 1YVNA 1NGAA 5AQUA 3ZX0A 5ADXH 3LDOA 2CGJA 3VGKA 1GLLO 3JS6A 1QQMA 3EZWA 3LM2A 3WEEB 1X3NA 3ENHA 4FWNA 2YHYA 5B8HA 3L6QA 3FZFA 3QDKA 1BU6O 4B1WB 1X3MA 1TUYA 3FR0A 4QS7A 4IJAA 3M1FA 1YUWA 2ZGZA 4H5RA 1IG8A 3WXLA 4JNEA 1HX1A 5AQYA 1K8KA 3WT0A 3CJCA 3WQTA 3JXUA 1JCGA 4IZ9A 4FWLA 3DJCA 1NGBA 1ZBSA 3H6EA 2ZGYA 4WQ5A 1RFQA 1T44A 4BC3A 4BQLA 4DB3A 1BG3A 1D4XA 3M6GA 2OANA 3W3DA 4CD3A 4BGBA 1GLAG 2BTFA 3AAQA 1WOQA 3VF6A 3BEXA 3WQUA 4EIAA 1NLVA 5CE3A 3RSEA 1XQSC 3SMPA 1C0GA 5AQVA 4NO7A 3UKUA 4CZKA 2CH6A 3ID8A 2A5XA 4WQ4C 4CBXA 2FSNA 5BN9A 2H3GX 3HZ6A 4GY2B 3CQXA 3AARA 3EL2A 4K42A 3UKRB 3C7NA 4XEIA 3M3ZA 3CJBA 1NMDA 5EY4A 2Q1NA 1SZ2A 1BO5O 5AZIA 1Z05A 4FWQA 2UYTA 2CH5A 3VEOA 2GTDA 3VENA 1TYQA 4IWVA 2P9PA 1NBWA 1QZ6A 3D2FA 4A2AA 1NM1A 1TUUA 3P4IA 1Y64A 2D0PA 4QS9A 4BC4A 3U8XA 2A6AA 3A0IX 3WXIA 4EFHA 3VERA 5BPLA 5AQKA 4CZJA 4DQ8A 4O8KA 4BC5A 3DXMA 3SMSA 3GG4A 4K25A 5BPNA 4BR5A 5BN8A 2HF4A 2Q0RA 1V4SA 2P9IB 2AP1A 4XH5A 1U2VB 4BR9A 2NZTA 4NB4A 4H0TB 3ZETA 4PKGA 1R59O 4PL8A 3LL3A 3QFUA 2Q0UA 2A42A 3VEXA 4BRKA 1J6ZA 3WXJA 4BREA 2VWBA 1ATRA 4YDUC 2A41A 3ATVA 1ZC6A 2ASPA 5AQMA 3CIPA 4H0YB 2QWPA 5EOYA 4BR4A 1P8ZA 4BRDA 3ULEA 3VF2A 2NRHA 2P9UA 1LCUA 3ZX3A 4BRLA 2GUPA 3H3OB 5ADXA 4FSVA 3QICA 2P9NB 4CBWA 5F0XA 1MWKA 5JLHA 5JMVA 4FWOA 1GLEG 4BR7A 3MCPA 4J8FA 1G99A 1NGIA 1NGJA 5TKYA 2GEMA 2QWLA 2YCHA 3O1WA 3TPQA 3U9ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NK8A 2PFUA 2V7YA 4DF4A 4W5OA 4YOUA 1U48A 1HYSA 3MX2A 3T7ZA 3HM9A 5AR0A 4PWDA 3TU5A 1OH6A 3RSEB 4CJ4A 4K0KK 1JKHA 5C0YA 3FZKA 2V52B 2Z1GA 3TABA 3V9UA 1MDUB 5JLFA 3VQDA 1VSMA 5LY3A 4YNQA 4H5TA 3CF5L 3MXMA 3UIQA 2ZJRL 1HPMA 5CYQA 1Y97A 2HBLA 4CJTA 4GV9A 1QTMA 3KKSA 1WAJA 1JXEA 3I8DA 4FL9A 3O3FA 2GX9A 4JD2A 1SQKA 4N47A 4CE9A 3VPZA 2NRRA 1IBLK 1W9HA 4CFCA 3KLGA 2RF2A 1F21A 5KRTA 4MFBA 4B1XB 5CZ1A 2QTDA 4DV0K 2KZMA 1JLFA 3LM9A 4FZXC 2J4RA 3HVTA 2P9LB 3ZEUB 3LP2A 3VEYA 1JLAA 3D7EO 5F2RA 1NNEA 4X65K 1L3SA 1KAXA 5J2MA 5FLXO 2Z1JA 3RRHA 3FLCO 2YNHA 5AQXA 4RW9A 2VYPA 2WUSA 4GKJK 3CERA 1NWKA 1RT7A 4AHRA 4FJNA 2HNZA 2RKIA 3QBWA 2HHXA 3AVHA 1NJIO 1J53A 4IXCA 4DTOA 3FZMA 1JLGA 1T03A 4LH4A 3F2KA 4FPBA 3I55N 2ZQBA 3K5LA 3CJ1A 4CEFA 4RWTA 4B1YB 2OA8A 4FWSA 3SV4A 5LJWA 4E7LA 1IKXA 5JICA 3VQ8A 1KVCA 3MN5A 3ZSYA 1J5EK 4BRMA 2E6LA 3C95A 4BRAA 4B8AB 5KTQA 3HXMA 1T3VA 4CF2A 3AY9A 3LDSA 3GDQA 4PKHA 4B3OA 2ASMA 3WNFA 1XWLA 1ILYA 2PYJA 3PX0A 1JCFA 4OVLA 4A61A 4CGFA 3UKRA 1T8EA 4I7FA 5EVZA 1CZ9A 1QS4A 4CBUA 3KK7A 1RTHA 1REVA 5KQDA 3ZT1A 3DLKA 1BCMA 3NF9A 2HVHA 2E2OA 3L2VA 4ISGA 2KHOA 1DGKN 2GUIA 4HUGA 2IS3A 1DEJA 4NYFA 4CHZA 1C0TA 3JAMO 5C15A 5AFUH 2VQFK 4DU3A 5ELZA 2E20A 5LMNK 1J54A 2DFEA 3HRGA 2HHSA 4B9QA 5JVHL 1M90O 4JD2B 1X9WA 4GKKK 3MEEA 2KW4A 5AQHA 3WXMB 1BIUA 2AA4A 3UKUB 3OYJA 1JJ2M 2ZJPL 2E6MA 4DLEA 2O8CB 1VSDA 1W2BM 3EY1A 4CIEA 4CW7B 3OBWA 3P5JA 1VQ4N 3C7NB 1QQNA 4H0PA 4DTXA 3OS0A 4N41A 4BR2A 1U04A 3ISNC 2BUPA 3IKMA 5AZIB 3VMFB 4IBNA 4BE0A 5E84A 1KQSM 4DTPA 2D4WA 5FPMA 2G8WA 3OJUA 1I94K 4CF0A 3V9SA 2VG6A 3TAFA 2RPIA 4I6MA 2P9NA 1WBBA 2AJQA 4DSKA 1J9AA 3VQBA 1X9SA 4CZMA 2D0OA 2HHUA 1LW2A 4IFEA 4AM7A 4NCAA 1T6DA 2I7NA 1RDBA 4DS4A 4CESA 3SAFA 1N8RO 1IH7A 4FOEA 4DU4A 1NJXA 3FZLA 3H1QA 3PIPL 4KI4A 2WFBA 2EWSA 4W5QA 1XUPO 4M3ZA 3PV8A 2QEXN 1S72N 1JLBA 1ATSA 1TKXA 4UQGA 1KTQA 3HSCA 4YY3K 2VG7A 2GELA 4M3YA 1WSGA 4AM6A 1RDWX 3QIPA 4IDKA 3BDPA 1S3XA 4CJLA 3V9ZA 1Q9XA 4IJNA 4Y1DA 1HYZA 4WQ5C 3RMBA 3QBXA 3PX4A 3HM8A 1KRPA 4L8RB 5AJ3K 3H3NO 4CIGA 4EZ9A 4E89A 1TKZA 3MN7A 3HSTB 4FLXA 4KH4A 4CJVA 1N5YA 4BR0A 4F3TA 4ISFA 3U6FA 3M5RA 3MX5A 2XHBA 4N76A 2YJFA 3K9JA 1RILA 4BDPA 1KCFA 1ESVA 1Q18A 3SJJA 4BACA 4FWPA 3R6MA 3CCJN 5SWMA 4FJGA 3E9OA 4CFBA 2CGKA 2ZD1A 3J7ZO 1SL0A 2RE2A 3SQ0A 1BA1A 3E01A 3MMVA 3H45C 4M7YA 4I6MB 4FOIA 2F8SA 1B92A 1NG9A 2HW3A 2NRXA 4FM2A 4EAHD 1ZBIA 4OLBA 1KLMA 2IC3A 5AQLA 3L8BA 4WF9L 1SUQA 4JS4A 4J2AA 4A5BA 2RN2A 1RBTA 5GAEP 3O9SA 5JS2A 3JS6A 5E41A 3LM2A 3ENHA 4FWNA 4Z0UA 2YHYA 5B8HA 3L6QA 3QDKA 1BU6O 4B1WB 3Q7BA 1X3MA 3KD5E 4B9LA 2F8TA 2P1JA 4DV2K 4CERA 3E66A 3KLFA 4H5RA 3WXLA 3PSIA 4O44A 3CJCA 3MECA 4JKHA 1JCGA 4IZ9A 4FWLA 3G0ZA 1O1WA 4DTJA 1NGBA 3CFPA 2VGMA 2BANA 4O8UA 3AO4A 1RFQA 3K58A 1SKSA 1BG3A 1D4XA 1GOAA 3V1QA 1L5UA 4CD3A 4B8CA 2DTUA 4IG0A 3WQUA 3QNOA 1VQ7N 1NLVA 5CE3A 3O3HA 1C0GA 2O8EB 1W0HA 1JL2A 2JGUA 1TL1A 1NJWA 4CZKA 2CH6A 1WBDA 3ID8A 3BZKA 4CBXA 2H3GX 3HZ6A 4XEIA 1G15A 3TARA 4LF9K 2XY5A 1Z05A 4DMNA 4FWQA 2A1SA 4YORA 2CH5A 3ZSOA 3R1XA 1TYQA 4CVNE 2P9PA 4KTZA 3RVCA 1JLCA 1TUUA 2HBJA 4QS9A 4E7JA 5HRSA 3A0IX 3WXIA 4EFHA 4CZJA 3ZT3A 4DQ8A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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