1NGJ | Genus

Total Genus 123

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	123
sequence length	382
structure length	382
Chain Sequence	KGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule keywords	HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
publication title	Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment. pubmed rcsb
source organism	Bos taurus
molecule tags	Hydrolase(acting on acid anhydrides)
total genus	123
structure length	382
sequence length	382
ec nomenclature	ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date	1994-05-17

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.30.30	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Defensin A-like	Defensin A-like	1ngjA02
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngjA01
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngjA03
3.90.640.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Actin; Chain A, domain 4	Actin; Chain A, domain 4	1ngjA04

3DWLA 4B9QA 4CI6A 3H1QA 2P9IB 1K8KA 4B1VA 3DXMB 5F1XA 2I7NA 4I6MB 5AQKA 5AQTA 4BRGA 4H0VB 3QB0A 3BF1A 3LDQA 4B1WB 5EY4A 3MN7A 1SAZA 3UE5A 3U9ZA 1V4SA 4MLHA 2E20A 4EHUA 3LDOA 2ASPA 4MLEA 3U8XA 2E88A 2F9TA 1Z6RA 1P8ZA 1H1VA 4IWVA 1WOQA 1G99A 2GELA 3ZETA 4M7YA 1TUUA 4B1YB 4JN4A 4BRHA 4JHDA 3ULEA 1NMDA 4CZEA 2VYPA 2YJFA 3TPQA 2HF3A 2P9IA 5AFUH 2E8AA 4AM6A 3QBWA 3A5NC 2CGKA 1X3NA 4C23A 1XUPO 3KVGA 2CH5A 4I6MA 3SLCA 1JCGA 1NGAA 1BA1A 2FSNA 5AQMA 4BRLA 3L4IA 4RCHA 4PL7A 4Z94A 2P9NB 3QFPA 4H5TA 5AQFA 5E84A 4BR4A 1BWFO 3FFKB 3A5MC 5AZIA 4FO0A 3FZFA 1ZC6A 3SK3A 5AZJA 3VETA 5BR9A 5KPRA 1U6ZA 4BG9A 3A5LC 2CH6A 3IFRA 1JCEA 1S22A 1S3XA 1U2VB 3HI0A 5EOYA 4A2BA 4BVOA 1KAXA 2IVOA 3FE1A 3EN9A 1MWMA 4PKGA 3O5BA 5AQSA 5ADXA 3OHRA 4FOEA 3IDHA 2D4WA 3H3OB 1D4XA 1WUAA 3VF2A 4XH4A 3VEVA 1QHAA 2I7PA 4H0YB 5EXWA 2GUPA 4K41A 1X3MA 4LC9B 1NGGA 3EKSA 1MDUB 1QQNA 4H0TB 2QWNA 3DXKB 3BF3A 1DGKN 1DEJA 4ISGA 4MO4A 2Q0RA 4A62A 3AAQA 2ASOA 4PL8A 1NGCA 3CJAA 4FPAA 4Y0WA 3B8AX 4XEIA 1NGBA 3MN5A 3WQUA 4BQLA 3MDQA 1NLVA 5AQRA 3O1WA 4B1ZA 5BRHA 3D2FA 3QFUA 3MN6A 4FWPA 2W41A 3A5OC 3BP8A 4BC2A 3CJBA 2H3GX 5ELZA 5AQZA 3TU5A 3L6QA 4H03B 4H0PA 3L0QA 3CJCA 3D2EA 3GDQA 3ZX3A 5FPEA 5AQWA 4FWNA 4HWIA 4FOIA 2P9PA 2NRHA 3H6EA 4M7XA 4CJ7A 3H3NO 2AA4A 3FZKA 4WQ4C 3O1BA 4H5VA 1HLUA 5KPTA 1YXQA 2HOEA 4IZ9A 3C0BA 2FF3B 3G25A 2A41A 3MN9A 1RDWX 4FWQA 4EAHD 3HTVA 2E2NA 2QXLA 5BN8A 3HBTA 4CZFA 4FWLA 4ISEA 3EL2A 3EZWA 3VGKA 1QZ5A 3H45C 1MWKA 2Q31A 3UKRB 3ZEUB 4A61A 2Q36A 2Q1NA 5I9EB 4FSVA 3ZX2A 1SQKA 1KAYA 2QM1A 3P4IA 3HM8A 2E2QA 5FPDA 4BRAA 3VGMA 4PKHA 5CE3A 1JCFA 2FSKA 3O8MA 2FXUA 1Q18A 2E2PA 3WEEB 5EVZA 4WQ5C 3VEXA 1C0FA 3VF4A 1NM1A 3HZ6A 4MO5A 1NBWA 4ISFA 2UYTA 3QBXA 4BRMA 5KQDA 1T44A 4FWRA 2YI1A 3O6WA 2D1KA 5AQQA 2P9UB 5TKYA 3VERA 2ZGZA 5LJVA 5KQ8A 3QMLA 1Y64A 3VEYA 4DB3A 1BG3A 3O08A 5AQXA 1KAZA 3DXMA 3W3DA 5BPLA 1HX1A 4NO7A 3M3ZA 4BROA 2V52B 3GG4A 4CZHA 2FF6A 3O4WA 2Q97A 4BRQA 3ZEUA 3FR0A 4B1UB 3VOVA 2A5XA 1GLLO 5BRFA 1NGEA 2V7ZA 5F0XA 4BRCA 3MCPA 3GL1A 3H1VX 3VEZA 5AQJA 1V4TA 5EX5A 2CGJA 3ENOA 3LDPA 3UKUB 4BR5A 1BOTO 3CJ7A 4JD2B 3WEEA 4CZMA 3ATUA 5AQNA 3ID8A 3EO3A 2ZWHA 1GLFO 5AFUA 3VGLA 3S41A 3CI5A 2A3ZA 2Q2RA 1NGIA 1GLDG 2F9WA 2P9UA 1NGFA 3CJ1A 4H0OA 1BU6O 3CQYA 4HTLA 1E4GT 2GWKA 3CIPA 3ENHA 1C0GA 4BC5A 4CBXA 4GNIA 1R59O 2P9NA 1X9JA 2YHXA 2HMPA 1NGJA 4IXCA 4JAXA 3AARA 3BUZB 1GLCG 1J6ZA 4BREA 4H0XB 2QWLA 1K8KB 4K42A 5AQIA 3VEWA 1T6DA 5AR0A 1U2VA 4BC3A 5JMVA 2QWQA 2E2OA 4JD2A 3FZMA 3QICA 3EKUA 5JICA 4CBUA 5BPNA 2E1YA 3BEXA 2YJEA 3KHYA 4CD3A 4YDUA 1QQMA 3VENA 1YUWA 1ZBSA 5AQOA 3M1FA 3MK6A 2P9SB 5JLFA 4FWSA 4BG8A 5B8HA 4BR9A 4DQ8A 4BRKA 2A42A 1E4FT 3DXKA 4CZGA 2BTFA 3J8AA 3O80A 2QW9A 4EIAA 4FWKA 2QWMA 2Q0UA 4E1JA 1Z05A 1LOTB 3GOIA 3CHWA 2BUPA 4CZJA 4DHYA 3FZLA 3CETA 4GY2B 4H5RA 5FPMA 3R8EA 4CZIA 3WT0A 2FLOA 2KHOA 4AM7A 5FPNA 2D0OA 4IO8A 2ZGYA 3R9PA 5AQYA 1GLBG 3ZX0A 4K43A 3IUCA 4CZLA 3JS6A 4YDUC 5BPMA 5F2RA 1IJJA 3GE1A 4CZKA 3D7EO 5AQPA 4FWOA 3DJCA 3AY9A 4PKIA 5BRDA 1EQYA 1HUXA 5AZIB 4EHTA 1ATRA 2A6AA 5AZJB 2CGLA 2YHWA 3SJHA 2ASMA 5JLHA 2VCPA 3H46O 5AQGA 5E26A 2P9SA 1T6CA 2YHYA 3UB5A 1TUYA 2VWBA 4J8FA 1ATNA 3LDNA 3HSCA 1YVNA 2EWSA 1BDGA 1MA9B 2PAVA 4H5NA 2E1ZA 2HF4A 2P9KB 4QS8A 3QDKA 5BN9A 1BA0A 4A2AA 3WXJA 4BVPA 4FWMA 2NLXA 3R6MA 1QZ6A 3UKRA 4IJAA 4BGAA 4L3QA 4O5FA 1OKJA 3LM2A 4BRDA 5ADXH 2YCHA 3WUHA 4JNEA 3WXLA 1TYQB 2J4RA 1XQSC 3FGUA 4EFHA 3LL3A 2OANA 2AP1A 1HPMA 4IJNA 2QWOA 4RWTA 4K25A 3W0LA 4BRIA 3RSEB 3D2FB 2P9LB 3U4LA 2ITMA 4BRPA 4RTFD 3LDLA 1NGDA 5AQLA 4QS9A 4H5WA 4CBWA 3VESA 1ATSA 4NB4A 3A0IX 1DKGD 5LY3A 4BRFA 3D2EB 2V51B 4BQZA 3DAWA 4BR2A 3LM9A 4FL9A 3AAPA 1LCUA 4CD1A 3VF6A 1HJOA 3VEOA 2P9PB 2FSJA 1BO5O 3CJ9A 2P9KA 3A8YA 3C7NB 1RFQA 2WUSA 3F9MA 5LJWA 3U9DA 3VPZA 5AQHA 2A40A 5AQUA 2IVNA 1BUPA 3ATVA 1TYQA 4WQ4A 3FZHA 4F9OA 2GEMA 3CERA 3UKUA 1ZXOA 1XC3A 2GTDA 4BR0A 2GWJA 3CQXA 3WXIA 5AQVA 3JXUA 5KPZA 1NWKA 1GLEG 3RSEA 4QS7A 3I33A 1QQOA 2P9LA 1YAGA 3KZBA 1GLJO 2DPNA 4WYBA 3I8BA 2IIRA 2IVPA 1KXPA 2V7YA 4XH1A 2W40A 4BC4A 2QWPA 3WXKA 1SZ2A 2NZTA 4FPBA 4BR7A 4O8KA 3M6GA 4BGBA 1ESVA 4B1XB 1IG8A 3MMVA 4KBOA 4M63C 3SMPA 3IMXA 1HKBA 1HKCA 1RGIA 2PBDA 2ZF5O 4XH5A 1GLAG 3SMSA 5BREA 1HKGA 3ZETB 3FLCO 4BRNA 3C7NA 2D0PA 4DCHA 1CZAN 3WQTA 3GBTA 4JHDB 3ULEB 2QWRA 1NGHA 4WQ5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

4B9QA 3CYGA 3HT3A 3P5JA 1NRBA 2P9IB 4A5BA 2HHVA 4B1VA 3CCRN 4FZYA 3ZT0A 2I7NA 2FBTA 3NE6A 4FK0A 1FKPA 4H0VB 1ZBFA 2YNHA 3I0SA 2G8HA 3AGKA 3RVCA 3OS2A 3MN7A 2MZ0A 3PIPL 1SAZA 3L56A 4J2BA 2Y1IA 4CEAA 3U9ZA 1B9DA 3QEIA 5CY4A 2KZZA 1K9MO 4EHUA 3LDOA 4MLEA 1JKZA 2NY8X 3U8XA 1NNEA 5TKWA 1Z6RA 1H1VA 3MWPA 4IWVA 3I56N 1ICAA 2GELA 3ZETA 3KOYA 1BHLA 4B1YB 4BRHA 3HPHA 4JHDA 4PA1A 3QIPA 1GOCA 1VQPN 4CJ4A 1XMOK 4KTZA 1X3NA 4NCGA 3T1AA 2LN8A 4I6MA 1NGAA 5AQMA 4FW2A 4ILHA 2LT8A 4DLGA 3HP6A 1FH3A 4JKFA 4BDPA 2KKZA 4Z94A 3QFPA 4B3SK 2ETJA 3AO1A 1EKEA 4FO0A 1BCOA 3FZFA 3DI6A 1NG9A 4AH9A 1VQLN 3VETA 2ATQA 3LPUA 4BG9A 2I5JA 1JCEA 3KLEA 4AILC 2OPPA 3HI0A 4H4OA 3S3MA 3OBYA 1KAXA 1W9HA 1CHZA 3RR8A 4QAGA 2XY5A 5ADXA 4NLBA 1KLNA 1RTDA 1IKYA 4XH4A 3VEVA 2Z1GA 1X3MA 3D6RA 4DFMA 4ZTJA 3P1GA 1NGGA 1MDUB 1QQNA 3DXKB 4CFBA 4Y1DA 4E72A 4Z0UA 3QEVA 4KYPA 2Q0RA 4A62A 3CJAA 4XEIA 3TSUA 3MN5A 3WQUA 4BQLA 4CJ5A 5D3GA 1RT6A 2VY6A 4BE2A 1BL3A 2NNWA 1JXCA 2O8FA 2X74A 3ZT1A 4LD0A 3I8DA 4BACA 2ATBA 2YNGA 3BP8A 4B9NA 4H03B 3EE8A 5A2QO 3D2EA 3GDQA 4NXNK 5FRMA 3HVRA 1LAVA 4KH6A 1HNXK 4LF9K 3K57A 4FWNA 1J9AA 4HWIA 5EU7A 2RN2A 1S1XA 4DSJA 3O1BA 1HLUA 1FJGK 3DLRA 5J2MA 4K0KK 3J81O 1ZBLA 2A41A 4JKCA 1X9WA 4YNQA 1KCFA 2QXLA 5BN8A 4DR1K 1U4BA 2O8CA 4KI6A 3QNNA 2KFZA 5HRNA 1SL0A 3DLKA 5I9EB 4FSVA 4E89A 3QERA 1RT5A 1SQKA 4FJLA 2QM1A 2ITGA 5C42A 3HM8A 3C6TA 1C1BA 4LF4K 3AVHA 4DF8A 2E2FA 3MXMA 1TGOA 4O0JA 4HHFA 4I2PA 3OYJA 3PUFA 2OTLN 4WQ5C 1K6YA 1XWLA 1VQNN 1I3AA 4F3OA 4ISFA 2UYTA 3QBXA 1B3CA 4DUZK 1T05A 4W5OA 2BANA 4BE1A 1VRTA 1RT1A 2LJMA 2WONA 3O6WA 4JRPA 1RDUA 4FJ8A 4CW7B 2F8SA 3SAGA 1NJIO 1L3TA 1Y64A 2QXFA 4DB3A 2HBLA 1BG3A 2RE2A 5BPLA 4FM0A 5E41A 4BROA 3GG4A 4KH5A 2FF6A 4FJKA 3O9SA 2Q97A 2JWKA 4BRQA 4B1UB 3HOSA 3CQ8A 5H1SQ 2G2KA 2A5XA 2VQFK 4RW4A 1IKWA 4OKJA 1NGEA 3CFOA 4U67L 3EY1A 3GL1A 3T69A 1UA0A 1V4TA 1VQ9N 3LDPA 3QINA 2KBJA 4OPKA 3THWA 3CJ7A 4JD2B 3P83D 3DLEA 1SN4A 2KGQA 1KC8O 4CJLA 3QETA 4DQPA 1GLFO 5AFUA 1IV0A 1S1TA 1TKTA 4B3OA 1LQQA 4JLHA 3PX6A 1XMQK 4Z4HA 4M3YA 1NGFA 1KFSA 1E4GT 3AVCA 4O4GA 4CIFA 3SAFA 3V1RA 3S5TA 1DJTA 3ENHA 1C0GA 3V9WA 3DLBA 3M5RA 4CBXA 1JJ2M 3PY8A 1YTUA 1R59O 1B92A 4JK7A 3T1YK 2R7YA 2YHXA 4CVNE 4JAXA 3AARA 3BUZB 1J6ZA 4BREA 3O9TA 4M3TA 3QEXA 4JKHA 4JKAA 1VSIA 2O8BB 1K8KB 4K42A 4LF7K 4BDYA 5AR0A 3RR7A 5KGWA 3L3UA 3RRHA 1U47A 1O13A 3AA5X 2HBKA 3KK3A 3C6UA 1T7BA 3IS9A 1NK9A 3EKUA 4IFEA 4CBUA 4CQKA 1C0TA 2E1YA 3DMJA 5M1KA 4KTWA 2OPRA 3E66A 3C6HA 3F5TA 4RW8A 3M1FA 3C6AA 2D0CA 1P0AA 4GVEA 1TAQA 4DQ8A 1SEGA 1LWEA 4AEIA 4BRKA 4CK1A 2KBHA 2A42A 3DXKA 4CZGA 2BTFA 3G0ZA 1EETA 3HPGA 3J8AA 1LOTB 3DRSA 3GOIA 3V4IA 4CZJA 4DHYA 4GY2B 1KD1O 1KQSM 3R8EA 3AVNA 3SV4A 4DTOA 5GINA 3PSIA 3AA3A 1N32K 3ZX0A 4CZLA 2VWJA 4N47A 1EXQA 5FRNA 1IJJA 1T03A 3I0RA 2IAJA 3D7EO 5AQPA 4F2RA 2P5OA 4PKIA 4R5PA 2RPIA 4CJKA 1EQYA 3LPTA 4LFAK 4YORA 5AZIB 5AZJB 5M1FA 2FC0A 4DSLA 4DV3K 3ID6A 1NU0A 1C1CA 1IG9A 5C2DA 3UB5A 2VWBA 2NY9X 3LDNA 4NXMK 1BDGA 5HBMA 2JGUA 1Q86O 3F73A 2HB5A 4FVMA 3WXJA 5M1PA 4DV7K 1RBSA 4E0DA 1I39A 4ICLA 3TTCA 4DV6K 1OKJA 3OBWA 4E7JA 1I2VA 4CF1A 1XQSC 1XRSB 1EP4A 1NJXA 4PWDA 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2GX9A 4NYFA 4RG8A 3HPOA 1D5AA 4OKKA 2E8AA 3LZJA 3O3FA 3OY9A 2CGKA 4C23A 4LF6K 4CK2A 3SLCA 4BRLA 4CK3A 5HRRA 2Q3SA 2OPQA 4CHPA 1BRZA 4H5TA 4BR4A 4KV8A 4DS5A 3A5MC 2KJAA 5AZIA 2O8FB 3QO9A 1ZC6A 5AZJA 1U45A 4DTMA 5KPRA 1U6ZA 3CXCM 3IFRA 3OYLA 5M1QA 1U2VB 5EOYA 3ZCMA 3CYMA 4UJ0A 4DR5K 4CJWA 2HHUA 3VMFB 3V9ZA 3FE1A 4HUFA 5BR8K 3BZKA 3IDHA 4M3UA 3THVA 3V9XA 4H0YB 2GUPA 4YFUA 5I42A 5M1NA 3EKSA 1PE4A 3L2RA 1CXUA 3BF3A 5T7BA 1LV5A 4LSLA 5HOOA 1IBMK 1U48A 2O8CB 1S6PA 4O5BA 3B8AX 3K9KA 4FK4A 2WOMA 1NLVA 3L8BA 5AQRA 5KTQA 3O1WA 3AVLA 2YHAA 3QFUA 2UUCK 1FK9A 2Z1IA 3A5OC 4BC2A 1EWRA 3KK1A 5ELZA 3AVBA 4KHNA 1M90O 2EX3A 5AQWA 3Q7CA 1HYSA 2PYLA 1KVAA 2NRTA 2NRHA 3H6EA 4CJ7A 3ZT2A 2MN5A 3LZIA 2ZJQL 4Z4EA 2UXCK 5C0YA 4H5VA 4KO0A 2A1SA 1LWFA 2HOEA 1TVRA 1RNHA 2P51A 1J53A 1QS4A 4CJFA 2D0AA 1D8YA 4KHWA 1WSEA 4BY9C 1VK0A 1ITGA 1DLOA 4ISEA 3LP3A 1QZ5A 1MWKA 3UKRB 1Q9XA 1A5VA 4J2AA 3HM9A 3ISNC 2NUBA 2JDQD 1TI5A 1KAYA 1T8EA 1R0AA 4N5SA 3CCLN 3PV8A 4DR6K 4NYNA 4BRAA 5FPDA 2HHWA 4WFBL 4GKJK 1WBBA 2EHGA 4FJMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4B9Q A;  3CYG A;  3HT3 A;  3P5J A;  1NRB A;  2P9I B;  4A5B A;  2HHV A;  4B1V A;  3CCR N;  4FZY A;  3ZT0 A;  2I7N A;  2FBT A;  3NE6 A;  4FK0 A;  1FKP A;  4H0V B;  1ZBF A;  2YNH A;  3I0S A;  2G8H A;  3AGK A;  3RVC A;  3OS2 A;  3MN7 A;  2MZ0 A;  3PIP L;  1SAZ A;  3L56 A;  4J2B A;  2Y1I A;  4CEA A;  3U9Z A;  1B9D A;  3QEI A;  5CY4 A;  2KZZ A;  1K9M O;  4EHU A;  3LDO A;  4MLE A;  1JKZ A;  2NY8 X;  3U8X A;  1NNE A;  5TKW A;  1Z6R A;  1H1V A;  3MWP A;  4IWV A;  3I56 N;  1ICA A;  2GEL A;  3ZET A;  3KOY A;  1BHL A;  4B1Y B;  4BRH A;  3HPH A;  4JHD A;  4PA1 A;  3QIP A;  1GOC A;  1VQP N;  4CJ4 A;  1XMO K;  4KTZ A;  1X3N A;  4NCG A;  3T1A A;  2LN8 A;  4I6M A;  1NGA A;  5AQM A;  4FW2 A;  4ILH A;  2LT8 A;  4DLG A;  3HP6 A;  1FH3 A;  4JKF A;  4BDP A;  2KKZ A;  4Z94 A;  3QFP A;  4B3S K;  2ETJ A;  3AO1 A;  1EKE A;  4FO0 A;  1BCO A;  3FZF A;  3DI6 A;  1NG9 A;  4AH9 A;  1VQL N;  3VET A;  2ATQ A;  3LPU A;  4BG9 A;  2I5J A;  1JCE A;  3KLE A;  4AIL C;  2OPP A;  3HI0 A;  4H4O A;  3S3M A;  3OBY A;  1KAX A;  1W9H A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1NGJA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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