1BO5O

Crystal structure of the complex between escherichia coli glycerol kinase and the allosteric regulator fructose 1,6-bisphosphate.
Total Genus 174
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
174
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
EKKYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIGGKGGTRIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of a complex of Escherichia coli glycerol kinase and an allosteric effector fructose 1,6-bisphosphate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (GLYCEROL KINASE)
molecule tags Transferase
source organism Escherichia coli
total genus 174
structure length 498
sequence length 498
chains with identical sequence Z
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1998-08-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1bo5O02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1bo5O01
1T6DA 1ATNA 2CGKA 3M3ZA 4C23A 1Y64A 2GEMA 5AQFA 2D1KA 1S3XA 2P9KB 5AQQA 4CZGA 4EHUA 3FZMA 3AAQA 3CETA 4B1YB 4BRFA 4H5WA 3RSEB 1NGHA 2IVOA 2A5XA 5AQSA 3U9ZA 4B9QA 3VEVA 1MWMA 3CJCA 4ISFA 1QZ6A 3H6EA 3B8AX 4PL7A 4BRLA 4CD1A 1E4FT 1KAYA 3LDLA 3VEYA 5JICA 1GLDG 1QZ5A 3BF3A 1JCGA 2GWJA 2W40A 2QW9A 4CZLA 3S41A 5ADXH 2P9LB 1T6CA 5AZJB 5BREA 5AZIB 3O5BA 1V4TA 4YDUC 5ELZA 2QWQA 2QWLA 1HKBA 3IMXA 3C0BA 2P9NB 5FPDA 2HF4A 2V52B 3BEXA 4BR4A 3EKSA 4KBOA 3OHRA 5F0XA 2CGJA 2I7PA 1SZ2A 1U6ZA 2A42A 4FWPA 3UKRA 3M1FA 1JCFA 2CH6A 5AQGA 1TYQB 3VGLA 1RDWX 2FSNA 1ATRA 3CHWA 2NZTA 5I9EB 5AQIA 1GLEG 2GTDA 3W3DA 3H46O 3TU5A 1NGDA 2E1YA 3EN9A 2IIRA 3A8YA 4O8KA 3O6WA 3WQTA 1JCEA 1DEJA 4JN4A 5AQPA 3LDPA 4BC4A 4LC9B 2NRHA 3J8AA 4BRMA 4H03B 3C7NA 2YHXA 4FO0A 3ZETA 2Q97A 3MCPA 4JHDB 3D2FA 5AFUA 3ZX2A 3MN7A 3IFRA 5AQOA 3WXIA 1TUYA 3O80A 5KPTA 5LY3A 4B1WB 4BGBA 1Z6RA 3IUCA 1QQNA 3WXJA 4HWIA 2BTFA 2E2NA 3D2EA 4GNIA 2ASPA 3H1QA 4JD2B 3GOIA 1NGAA 2E20A 2E2QA 5AQMA 2EWSA 4K43A 3UE5A 3U8XA 2ITMA 4BRGA 4H0PA 4J8FA 3WEEA 2E8AA 1NMDA 2GELA 3VPZA 4EFHA 4B1ZA 1NWKA 4MLHA 5EVZA 4BR7A 2P9UB 1SQKA 1DKGD 3GL1A 4CZIA 4PL8A 5KPZA 2HOEA 4O5FA 5AQUA 2CH5A 3CJ7A 4BREA 2QM1A 4BRKA 2E1ZA 3UKUA 2I7NA 1IG8A 3VGKA 4FWNA 1XQSC 5BPMA 2QWPA 2CGLA 1IJJA 1YAGA 3SLCA 4K25A 3EL2A 1ESVA 3FE1A 3LL3A 2D0OA 5AQZA 4CI6A 1HUXA 4YDUA 4DB3A 1BUPA 4EAHD 3EO3A 3DXMB 4B1XB 1HJOA 3CERA 5TKYA 3HBTA 4BROA 5F1XA 3CIPA 4BR0A 4H0YB 4CZKA 4HTLA 1R59O 5BPLA 3DXKA 2F9WA 2ZF5O 4BRNA 4BQLA 3VEOA 2PBDA 5BN8A 3GE1A 5AQTA 2V7ZA 1GLBG 2NLXA 4IZ9A 3WQUA 2YCHA 1NGBA 4I6MA 5AQXA 5AQLA 5BRFA 3VENA 1NGIA 2A3ZA 4BC3A 2YI1A 5JMVA 4BQZA 4A2BA 5AQJA 3KZBA 2PAVA 3M6GA 4NO7A 4RCHA 1X9JA 4EIAA 3VEWA 2A41A 4QS7A 3MN5A 4BVPA 3ZX0A 3CJ9A 1K8KA 3QBXA 2OANA 1GLFO 1NM1A 1U2VA 3VEZA 2GUPA 4IJAA 2P9PA 2AP1A 3QDKA 4Y0WA 4BVOA 1BO5O 4AM6A 3FZHA 3H45C 3QFUA 2ASOA 3HZ6A 4AM7A 2ASMA 5EX5A 4H0TB 4BRPA 3ULEB 3GBTA 3KVGA 3EKUA 4MO5A 1BG3A 1E4GT 1BA1A 4BGAA 2A40A 2P9KA 3DAWA 3I8BA 1XUPO 4RWTA 2BUPA 2E2PA 4A61A 2FSJA 3P4IA 2P9IB 4EHTA 3I33A 3A5NC 1NGEA 1LOTB 2YHYA 1EQYA 2Q36A 4FWMA 3RSEA 1RFQA 2HF3A 3TPQA 1HKGA 2ZWHA 1DGKN 5F2RA 3LDQA 5EY4A 2ZGYA 4BG8A 3LM9A 1MDUB 3EZWA 3ID8A 3F9MA 1NBWA 3MK6A 3VOVA 2P9SB 3ZEUB 5E84A 2E2OA 2VCPA 1NLVA 1X3NA 1S22A 3GDQA 3FZFA 4FWKA 1BWFO 4Z94A 2AA4A 5LJWA 2V7YA 2Q1NA 2Q31A 1GLCG 2YJFA 1XC3A 3GG4A 2P9LA 3UB5A 5AZJA 5LJVA 5JLHA 4WQ5C 1WOQA 5AZIA 5BR9A 3DWLA 4IWVA 2WUSA 4F9OA 2P9NA 1BDGA 1GLLO 3MN9A 3JXUA 4FWOA 3JS6A 3WT0A 3U4LA 3VEXA 5AQHA 1NGGA 2HMPA 4BRDA 1TYQA 2FF6A 5JLFA 3AY9A 2J4RA 1T44A 3SJHA 5AQNA 3SK3A 3A5MC 1QQOA 1BA0A 2YJEA 3WXLA 3CQYA 1YUWA 5ADXA 4CZEA 3QMLA 1SAZA 3MDQA 2D4WA 3O1WA 3R6MA 4FWQA 4H0XB 3VF2A 4BR5A 4CBXA 4CBWA 5KPRA 4FWRA 4PKGA 4BRCA 3O4WA 1C0FA 3VGMA 3FGUA 4H5VA 3WUHA 4BC5A 1NGJA 4RTFD 3FZLA 4DHYA 4JHDA 3LM2A 3A0IX 5AR0A 4B1UB 2E88A 3FFKB 1G99A 3FLCO 4FSVA 1C0GA 3L4IA 4CZMA 3O08A 1P8ZA 5CE3A 4PKIA 5EOYA 1HX1A 4JD2A 3KHYA 4XEIA 1KXPA 3VF6A 1HLUA 1YXQA 1NGFA 3IDHA 3WXKA 3A5OC 4GY2B 4H5RA 2IVNA 4FWSA 5BPNA 5AQKA 3VETA 4K42A 4FOEA 5AFUH 3UKRB 4H5NA 2DPNA 1QQMA 4FL9A 4H5TA 1GLJO 5BN9A 2P9UA 1LCUA 3H3NO 3H1VX 3FZKA 3CQXA 3CJBA 5AQVA 3VERA 4FPBA 4BC2A 5BRHA 4WQ4C 3D7EO 3CJAA 4BR9A 2A6AA 4XH4A 3W0LA 3O1BA 2H3GX 1QHAA 1TUUA 4E1JA 4IJNA 2QWMA 2UYTA 3ENOA 4NB4A 4WQ5A 3VESA 3C7NB 3ZETB 1OKJA 3D2FB 3DXMA 3CI5A 3QBWA 1GLAG 1X3MA 3MN6A 4BG9A 3BUZB 4CBUA 2FF3B 3ATUA 4XH5A 4FWLA 4JAXA 4H0VB 5FPNA 3D2EB 5AQWA 1ZBSA 1WUAA 1HKCA 3O8MA 1KAZA 5FPMA 1BU6O 2Q0UA 3AAPA 4BRQA 4FOIA 4ISEA 3WEEB 3HSCA 4FPAA 2FSKA 3VF4A 4L3QA 4A2AA 5EXWA 4BRAA 2VWBA 4XH1A 1CZAN 4DCHA 2Q0RA 1NGCA 1MWKA 2IVPA 3ZX3A 3QB0A 2V51B 4IXCA 3R9PA 4CZFA 1RGIA 3LDNA 3UKUB 3HTVA 2VYPA 3LDOA 3U9DA 2QWOA 3QFPA 2FLOA 3ATVA 2Q2RA 3ULEA 4K41A 3QICA 4PKHA 3L6QA 4MO4A 1H1VA 5KQDA 3DJCA 1Q18A 5KQ8A 2P9IA 4BRIA 1ZXOA 3AARA 3ENHA 4ISGA 2W41A 3L0QA 2D0PA 1ATSA 1ZC6A 3BP8A 4H0OA 3A5LC 3SMPA 4CZHA 1Z05A 3DXKB 4DQ8A 3SMSA 4QS9A 2QWRA 2ZGZA 3FR0A 1V4SA 1D4XA 2F9TA 3ZEUA 2P9SA 4IO8A 4JNEA 3CJ1A 1KAXA 4I6MB 1MA9B 5BRDA 3MMVA 5FPEA 1J6ZA 4CJ7A 5E26A 4CD3A 4WQ4A 5AQYA 4CZJA 4B1VA 4M7YA 2YHWA 3G25A 4M7XA 4MLEA 4A62A 1HPMA 3BF1A 1K8KB 4BR2A 2QXLA 2QWNA 2GWKA 1YVNA 1U2VB 2KHOA 1BOTO 2FXUA 3HM8A 2P9PB 5B8HA 3HI0A 4QS8A 3H3OB 4M63C 4WYBA 4BRHA 5AQRA 3R8EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JKDA 3SBGA 3QNOA 1ATNA 2CGKA 4C23A 3RWUA 3VQ6A 3QEWA 5AQQA 3CC2N 1B92A 4ELUA 1NK5A 4YOYA 4YFUA 4CHYA 1ZBFA 1ZBUA 2P5OA 5AQSA 3HPGA 1A5VA 1QHTA 4B9QA 3VEVA 2ZD1A 2Y1JA 3VQQA 3CJCA 1QZ6A 3H6EA 4CJLA 3B8AX 4PL7A 1BI4A 3K57A 4CD1A 1NJWA 1LW0A 3AV9A 3JAMO 5HOOA 3LDLA 3VEYA 1GLDG 1JCGA 2W40A 1WSIA 2QW9A 3S41A 5ADXH 3SQ2A 1CXUA 3WNHA 5ELZA 4DV4K 2QWQA 2QWLA 3IMXA 5FPDA 3OYHA 2HF4A 4KFBA 4B9UA 4J2AA 1F21A 3EKSA 3KLGA 3DRSA 3QNNA 2CH6A 4HHTA 5AQGA 3VGLA 2GBZA 1RDWX 5C12A 3OYMA 2ZE2A 5GIOA 3RMBA 2XHBA 4CJUA 3HM9A 1NGDA 3A8YA 1B9FA 3O6WA 4YOWA 3WQTA 1DEJA 4F4KA 3RVCA 3CG7A 4GVEA 3LDPA 5KTQA 2NRHA 3C7NA 2YHXA 2NRRA 3AO4A 1LWFA 3SI6A 3KIOA 3V9UA 3KD1E 4DWIA 3WXIA 3O80A 1OH6A 2UU9K 2ZM6K 4JRPA 2OTJN 1Z6RA 3WXJA 3MWPA 4HWIA 3K5MA 4E19A 2BTFA 3D2EA 3GOIA 1EKEA 2F7TA 2OPQA 4CHNA 5AQMA 3I55N 3UE5A 2ITMA 4FVMA 3CCLN 2JWKA 4H0PA 4BRGA 1XMOK 4NCAA 4JI6K 3AVMA 4B1ZA 1S1UA 1SQKA 5LMUK 4CZIA 1RTJA 4JEPA 1YJNN 1RT6A 4O5FA 3CMAN 2WOMA 4JKAA 4BREA 1EP4A 3NDKA 3UKUA 1XHZA 3J7AP 5BPMA 1XQSC 1IJJA 4Q5VA 3OA9A 4J2DA 1J5EK 3LP1A 3SLCA 5C25A 4KHSA 3ZSQA 5J2QA 3QERA 4FZXC 1BISA 4BACA 2LSNA 3CERA 3RRHA 3HBTA 4DUYK 5F1XA 3CM6A 1HR0K 4CZKA 1UA0A 3ZYYX 1R59O 3I0SA 3LDSA 4BRNA 1ASUA 2P51A 4LF9K 4NXMK 1S6PA 4UQGA 3WQUA 2YCHA 1IBLK 3QIPA 3E01A 5AQLA 1WNSA 4BC3A 3KZBA 1W9HA 4NO7A 4RCHA 3KK1A 1X9JA 4EIAA 1JKHA 3VEWA 3C65A 3MN5A 3ZX0A 4E7HA 3CJ9A 4CESA 3QBXA 3NVKA 2GUPA 2G8UA 2OZSA 3FZHA 3TAFA 2ASMA 3TI0A 1VSDA 3OJUA 4CJWA 3VQEA 2PZSA 3LP0A 4I2QA 4PWDA 4BRPA 3GBTA 3KVGA 3EKUA 1BG3A 4O55A 1BA1A 3DAWA 4MQ3A 4DSJA 3E66A 2FSJA 2P9IB 2QA4N 3PX6A 3RTVA 4OO1J 1NGEA 2W6LA 2HHTA 3VQ5A 4A5BA 3NCIA 2HF3A 4CJPA 3BGRA 4M3XA 3HPHA 3AVFA 2VGMA 3SPYA 5HP1A 4L8RB 4FXDA 1IV0A 4DR5K 2HSTA 3EZWA 3VOVA 1NBWA 2P9SB 5IT9O 3C95A 2PY5A 1IKXA 4ZTJA 4RW8A 1L3SA 4CJTA 1HJRA 1VQ9N 2A1SA 1OH5A 4AHRA 2NRXA 3L2RA 3AVAA 3GG4A 4ILHA 3OYJA 4DSLA 3T19A 4DV3K 2AJQA 4HTUA 1VQMN 1WBDA 1TL1A 5FRNA 3DWLA 4IWVA 3HP6A 3QEXA 2HHHK 1I39A 4IDHA 1GOBA 1HMVA 1L3UA 3U4LA 3U3GA 4WCEL 1S6QA 3OS0A 4H8KA 2J4RA 5AQNA 4FM1A 3OYAA 2B5JA 3WXLA 1OVYA 5ADXA 3AA4A 5HRSA 4AHCA 1EO1A 3QMLA 5GAHP 1RILA 4FWQA 3E9PA 3VF2A 3CFPA 4FWRA 1BIZA 2UXCK 4PKGA 4DR2K 3VGMA 4WE1A 3WUHA 4BC5A 1NGJA 4RTFD 3FZLA 3SQ0A 4M3YA 4FJJA 5HROA 3FFKB 1RDDA 1G99A 3QEVA 4FSVA 1C0GA 3KK3A 1YT3A 4LSNA 3F9KA 1FXXA 4C8NA 5CE3A 2IC3A 3ENBA 4DFMA 4XEIA 1BQMA 4MFBA 4OKEA 2I5JA 1RT7A 3A5OC 4H5RA 1XNRK 3OY9A 4K42A 5AFUH 1U4BA 4KTZA 5FRMA 3PIOL 4OVLA 4V19S 4HUEA 3CQXA 4CEBA 1X9MA 4FPBA 1JLQA 4DQQA 1NK4A 4KRFA 1NMNA 1HNZK 2UXBK 3O1BA 1NG9A 3KJVA 1TUUA 2DY4A 4OPKA 4DTPA 3B6PA 1N8RO 4KHWA 2KFNA 3D2FB 1VHXA 1SKRA 3QBWA 2HHSA 1VQ8N 2FF3B 3ATUA 3CMEN 1NJYA 3LAMA 2KZZA 1C0UA 2JWLA 4O8UA 2IOCA 1VQ6N 4EP5A 4CJSA 1VSKA 3AA2A 4W5RA 1HKCA 1KAZA 3IRXA 4DV2K 1C0MA 1R0AA 1XNQK 5JVGL 4CHOA 4ISEA 2XY6A 1N36K 3WEEB 4DTRA 3NFAA 5M1NA 3T7ZA 1CZAN 2Q0RA 1T3VA 4CGFA 3RRGA 3ZX3A 1RDBA 2V51B 3QB0A 4IXCA 3R9PA 4E3SA 4PUOA 1VQNN 4CJ4A 1HPZA 3HOSA 3NGYA 3OBWA 4Q0BA 3D45A 4KHPK 4FLUA 2OPRA 3SJJA 3QICA 3V1QA 3AO2A 3M5RA 4LD0A 5KQDA 5KQ8A 2P9IA 3CYMA 4OLAA 3EE8A 1ZXOA 5C24A 3Q7BA 4KI6A 2ZJRL 3AVKA 4KV8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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