1BO5O

Crystal structure of the complex between escherichia coli glycerol kinase and the allosteric regulator fructose 1,6-bisphosphate.
Total Genus 174
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
174
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
EKKYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIGGKGGTRIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of a complex of Escherichia coli glycerol kinase and an allosteric effector fructose 1,6-bisphosphate.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Escherichia coli
molecule keywords PROTEIN (GLYCEROL KINASE)
total genus 174
structure length 498
sequence length 498
chains with identical sequence Z
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1998-08-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1bo5O02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1bo5O01
1KXPA 2V52B 3H46O 1BG3A 3ATUA 3SLCA 1JCGA 3SMSA 2AA4A 5AQWA 5I9EB 2FLOA 4FO0A 4BR5A 1GLFO 5AFUH 1QQOA 5AQVA 3CJBA 3WUHA 4IO8A 5JMVA 5E84A 3FE1A 2P9NA 4CD1A 3QFPA 4KBOA 5KPTA 1DGKN 1GLLO 2P9KA 2ZGYA 3VEVA 1NM1A 2QWOA 3A0IX 3QBXA 2FF6A 4BR9A 2A3ZA 1HJOA 4M7XA 3DAWA 3VEYA 2E2OA 3VEZA 1EQYA 4BC3A 4A62A 1TYQA 1HPMA 3L4IA 4CZMA 1NGCA 2J4RA 2PAVA 1MDUB 3R8EA 3C7NB 3ENOA 4BRDA 1C0FA 3H1VX 1XQSC 2CGJA 2GTDA 5AQGA 1J6ZA 4BR4A 3FFKB 4IWVA 3JS6A 4CZGA 5EXWA 4B1VA 4QS9A 2HF3A 3MK6A 3WXKA 2V51B 4QS7A 1JCEA 5TKYA 4CZFA 2GWJA 3EKUA 1GLDG 1BA0A 3CHWA 3ID8A 5AQFA 3FZKA 4JD2A 3HTVA 4CZEA 3B8AX 4YDUC 2P9PA 4MLEA 2E1ZA 4CZIA 5ADXH 3GG4A 1P8ZA 2FSNA 3QFUA 4MLHA 4BRMA 1YVNA 3SMPA 5ELZA 4EHUA 5BPNA 5AZIA 3VEXA 1GLCG 5F0XA 2Q0RA 2CGKA 3CIPA 4B1YB 4BC5A 1NBWA 4FWOA 1HKCA 3IDHA 4BR0A 2YI1A 4Y0WA 3WQTA 4B1UB 1HLUA 3F9MA 3VGMA 3UE5A 2QWRA 4H5RA 2NRHA 1YAGA 3A8YA 4BROA 4EIAA 1MWMA 3GE1A 3DXMB 3FR0A 4H5TA 3QBWA 5B8HA 4CBXA 3CJCA 3GBTA 4B1XB 4C23A 4H03B 1WUAA 3KHYA 3D2EB 1E4GT 3AARA 3TU5A 3ZETA 3EL2A 2BUPA 3CI5A 4RWTA 4XH1A 3CQXA 4XH5A 1K8KA 1ATRA 4IXCA 4A2AA 4LC9B 3ULEA 5AQHA 4CZKA 3O6WA 2Q1NA 2P9IA 2P9UB 4B1ZA 1BOTO 3WEEB 2IVOA 3A5MC 3VF4A 2YJFA 3MN7A 4BRFA 4H0VB 5LJVA 1NGHA 3LDPA 4PKHA 4RTFD 4BG8A 3UKUB 1HUXA 3P4IA 5EVZA 4BVOA 2FSKA 4FPAA 4BC4A 2E8AA 2QWQA 3VESA 1NGEA 2Q97A 4JNEA 3VERA 2BTFA 5AZJA 5EY4A 1S22A 3DXKA 1D4XA 3GL1A 3IMXA 4K42A 4FSVA 3O80A 4FWQA 5KPZA 4CZJA 3H45C 1NGFA 3UB5A 3VEOA 2P9LA 4H0TB 2IVPA 2P9SB 4M7YA 5AQXA 4WYBA 3U8XA 2QWNA 1NGDA 4JHDB 3KVGA 4WQ5C 4B1WB 4AM7A 3EKSA 3H6EA 2HMPA 2FF3B 4BRIA 4AM6A 2HOEA 3HBTA 3RSEA 5KQ8A 5BN8A 1OKJA 1HX1A 3HZ6A 5FPNA 2YHXA 2V7ZA 5AQYA 5E26A 4WQ4C 1Z6RA 4I6MB 1NGAA 5AQQA 3IUCA 3FZFA 3KZBA 5BPMA 4K43A 3ZEUB 2WUSA 2W40A 2IIRA 5AQIA 2VYPA 2PBDA 3U9ZA 4CZHA 3D2FB 2F9WA 3LDOA 3H1QA 1NGBA 3C0BA 4XH4A 3CJ7A 1IJJA 3D7EO 4MO5A 1T6CA 1MWKA 4A61A 3J8AA 5LJWA 5KPRA 2QW9A 3LDQA 3HSCA 4FL9A 4BRQA 1ZBSA 5BN9A 4FWNA 4J8FA 5FPMA 5FPEA 1S3XA 4H5NA 1QQNA 4IJAA 5AQRA 2F9TA 4PKGA 5AQMA 3U9DA 1QQMA 4BC2A 5CE3A 1KAZA 5JLFA 3C7NA 1ATSA 5F1XA 1NGGA 2Q36A 3VGKA 4DCHA 1BU6O 2CGLA 1ATNA 1RGIA 4YDUA 2ASMA 3I8BA 4K25A 4E1JA 1TUUA 3AAQA 3SJHA 2QWPA 3VOVA 4A2BA 5AR0A 4DB3A 4GY2B 2VWBA 5JLHA 3WXIA 1V4TA 2CH5A 3UKRB 3ATVA 2D4WA 4O8KA 3SK3A 2I7NA 5AQTA 1ZXOA 2ZWHA 3DWLA 4JAXA 4PL8A 3MN6A 4CZLA 2ITMA 3I33A 5AQOA 1Q18A 4NO7A 1DKGD 3WT0A 4CJ7A 3FZLA 1U6ZA 4IZ9A 1C0GA 2E20A 4JN4A 5KQDA 3BP8A 3G25A 1LOTB 1GLBG 3QDKA 2A42A 1NGIA 1IG8A 2A41A 3A5OC 2AP1A 1CZAN 5AQJA 1WOQA 3DXMA 1BO5O 2ASOA 3ENHA 2E2NA 2YCHA 2IVNA 4FPBA 3CJAA 1E4FT 4EFHA 3D2EA 2GUPA 5AQPA 4Z94A 3ZX3A 3U4LA 1BA1A 5BRFA 2Q2RA 4ISEA 3O4WA 2D1KA 2E88A 3BF1A 2YJEA 1SAZA 2KHOA 2OANA 4FOIA 4BRKA 2P9NB 5AQNA 4ISFA 4BGBA 1MA9B 2P9UA 2P9KB 4PKIA 3VF6A 3WEEA 3L6QA 1QZ6A 4CI6A 2QWLA 3M6GA 3R9PA 4BQLA 4PL7A 4IJNA 3BEXA 3MN9A 3UKUA 2H3GX 4EAHD 3W0LA 3S41A 1NWKA 3IFRA 3EZWA 4H0PA 3H3NO 1TYQB 1X3MA 3WQUA 3O1BA 3TPQA 3GDQA 1BDGA 3LL3A 3BF3A 4BR2A 3HI0A 1DEJA 2GELA 1GLJO 3CERA 1GLAG 5AFUA 3GOIA 3H3OB 3LM2A 5AQZA 1NLVA 2A5XA 4BRHA 4WQ5A 1X9JA 4H5WA 3O1WA 3ZX2A 3O08A 4XEIA 3AAPA 3DJCA 3M3ZA 5BRDA 2P9SA 1YUWA 4BQZA 4DHYA 3FLCO 3M1FA 3WXLA 1X3NA 4JD2B 5EX5A 4WQ4A 2P9PB 1R59O 4JHDA 2FSJA 4FWRA 1Y64A 1NGJA 3CETA 1QHAA 4HTLA 5AZIB 3FGUA 3O5BA 1LCUA 2D0OA 5F2RA 4FWPA 3A5LC 4H0OA 4BGAA 3LDLA 1GLEG 2GWKA 2A40A 3WXJA 5AQSA 3ZX0A 4I6MA 4NB4A 4H0XB 2ASPA 4M63C 4H5VA 3ZEUA 3QB0A 1ESVA 4FWSA 4BRAA 3QMLA 2QWMA 4H0YB 3D2FA 2Q0UA 1U2VB 3CJ1A 3VF2A 2A6AA 5EOYA 5AQKA 2Q31A 2W41A 3VGLA 3VEWA 4DQ8A 1TUYA 2NLXA 3CQYA 5ADXA 5AQUA 2VCPA 3ZETB 1RDWX 2EWSA 1K8KB 4BR7A 1V4SA 2HF4A 1RFQA 2YHYA 4FOEA 4CBWA 3OHRA 3ULEB 4F9OA 1SQKA 2P9IB 3AY9A 3L0QA 2ZGZA 4B9QA 1T6DA 2NZTA 4BRLA 5AQLA 2QM1A 3MCPA 1YXQA 3VPZA 1QZ5A 3A5NC 1H1VA 1XUPO 5BR9A 4QS8A 4FWLA 1U2VA 1HKBA 3CJ9A 3JXUA 4BREA 4L3QA 3LDNA 1Z05A 3MN5A 2D0PA 2E2PA 2UYTA 1T44A 2GEMA 5AZJB 4BRNA 2E2QA 1G99A 3QICA 3MDQA 3UKRA 5BREA 4K41A 3LM9A 3FZMA 5JICA 3DXKB 5BRHA 4EHTA 2YHWA 4BG9A 1NMDA 2P9LB 1BWFO 1KAXA 4CBUA 5BPLA 4RCHA 3VENA 4BRGA 4HWIA 1KAYA 3VETA 3W3DA 3BUZB 1ZC6A 1XC3A 5LY3A 4FWKA 4ISGA 3HM8A 5FPDA 4FWMA 3EO3A 3FZHA 3O8MA 4MO4A 4BRPA 2FXUA 3EN9A 2I7PA 4GNIA 4CD3A 1HKGA 3RSEB 2CH6A 2V7YA 1JCFA 2DPNA 3MMVA 1BUPA 4O5FA 4BRCA 3R6MA 2E1YA 4BVPA 1SZ2A 2QXLA 2ZF5O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5KTQA 1KXPA 2V52B 3ATUA 3TSQA 2NRVA 1JCGA 2HBJA 2VGMA 1NOZA 5I9EB 5C12A 5AFUH 1QQOA 5FLXO 2YKNA 4IFYA 4FLUA 3WUHA 3OYCA 2UUCK 5JMVA 5E84A 4CF8A 5KRTA 1JLEA 1UOCA 1NM1A 3V1OA 2QI2A 5DK5A 4V19S 1Z25A 3L3UA 4M7XA 4KI6A 5FRMA 3AVIA 3VEZA 3HJFA 1GOBA 1VSKA 1CLQA 4CZMA 2PAVA 3R8EA 3C7NB 3ENOA 1HMVA 3AO5A 1C0FA 2ATQA 3TARA 4W5OA 3H1VX 1XQSC 5AQGA 2GTDA 3NGIA 2ZJQL 4IWVA 4E3SA 4AHRA 4B1VA 1RDCA 3RR7A 4FJJA 4IEIA 2QXFA 4CW7B 2GWJA 3TAQA 3U3GA 4LFAK 3HTVA 4JRPA 3B8AX 4JKAA 1VSHA 2P9PA 3CMEN 4I2PA 3WNEA 4XIUA 4LF8K 4DTXA 4EHUA 4CJ3A 1XHZA 4DSLA 4FM0A 4NLCA 5FRNA 4EZ6A 1NBWA 1HKCA 1JL2A 4BR0A 4CFDA 3C94A 2YI1A 3WQTA 1WSJA 2OPQA 4CJTA 4FXDA 4FVUA 4GW6A 3M8QA 1MWMA 4B9TA 3HPGA 4DU1A 3FR0A 4H5TA 5B8HA 3VQ5A 1ZBLA 4KHPK 3AO4A 3V9XA 4B1XB 3BY5A 4H03B 3PO4A 3D2EB 1DT9A 4JI0K 1YJWN 3CI5A 4XH1A 3CFPA 4XH5A 3OYLA 4IKFA 4A2AA 3TR8A 3O6WA 2E6MA 1KRPA 1F21A 3K5MA 4A5AA 1YIJN 1NNEA 3MN7A 4BRFA 5LJVA 1NGHA 3KLFA 1VQLN 3PLAA 3TAFA 2E5LK 1Q82O 3SQ4A 5EVZA 2FSKA 3KKSA 1J5EK 2HW3A 3NVKA 1KCFA 2IAJA 1YHQN 2E8AA 1NGEA 1E3MA 2Q97A 1SUQA 3VERA 5GAHP 1NU0A 1S1UA 2HMIA 3DXKA 3GL1A 4K42A 1OH5A 1HQEA 3TSPA 4CZJA 3P31A 3QNOA 2P9SB 4M7YA 2QWNA 3AO1A 1KLMA 3CC2N 4UQGA 3V9WA 4LF5K 1YJNN 1IKWA 1RILA 4AM7A 3H6EA 3K2PA 3CCSN 3G0ZA 3VQBA 2HOEA 3HBTA 2XY6A 4F8RA 1HX1A 4EP4A 3L3VA 2YHXA 1K8AO 2P5OA 2X78A 4DLEA 4C8OA 4IOCL 1HQUA 3BZCA 4F2RA 2VYPA 4NCGA 4CVNE 4DSFA 2KW4A 1IKYA 4GV6A 3C0BA 1KC8O 3ZSXA 3CJ7A 1IJJA 3TANA 4B3SK 2XRIA 1T6CA 3J8AA 5LJWA 3LDQA 3KTQA 4FL9A 2B5JA 4AHUA 4DTOA 2YNGA 4YOUA 1VQ4N 4OLAA 5FPEA 2G8IA 2NRRA 1RBVA 5AQRA 3OJSA 2F9TA 3VQ6A 5AQMA 3DRPA 4B9SA 4BC2A 4JI4K 3AVAA 1NK8A 4Z4HA 5A2QO 2BE2A 1RTJA 1S6QA 3SZ2A 1NGGA 2Q36A 4Z0UA 1IKVA 3ZT1A 4IOXA 4M3RA 2YHBA 1RGIA 4E1JA 2ASMA 5JS1A 4A2BA 2IS3A 4GY2B 2Q3SA 3UKRB 3OYKA 4R5PA 3DYAA 3SK3A 1A5VA 4CIFA 4FLYA 3AGRA 2F4VK 5D3GA 3E9LA 2ITMA 3F5TA 4FJIA 4NO7A 3CCVN 3M5RA 4BACA 1IBLK 3FZLA 4IZ9A 2P51A 1C0GA 2EX3A 3BP8A 4WF9L 3CCRN 4JKGA 1EO1A 3O9UA 3LWLA 2O4IA 1GLBG 3QEPA 2OZSA 1YITN 1SV5A 4DU4A 2VWJA 1WOQA 3ENHA 1KFDA 4ILGB 2ZQBA 4CJPA 4EFHA 1C1AA 4FM2A 1BCMA 3ZX3A 3U4LA 1FXXA 2HHUA 2Q2RA 4ISEA 1JXBA 2D1KA 3O4WA 4CHQA 3AA4A 5KRSA 2YJEA 3KK1A 4FOIA 3TSUA 4DLGA 2R7YA 4N47A 4ISFA 5DM6L 3LDSA 4FLWA 3J7AP 3VF6A 3WEEA 3L6QA 4B9MA 2BDPA 1U45A 1RT4A 2IOCA 3MXIA 4BWJA 4PL7A 3AVFA 1N36K 3UKUA 2GV9A 3S41A 1NWKA 1RT5A 1HRHA 3JYTA 1WBDA 4X62K 1KVAA 5HRPA 1ASUA 2DY4A 1BDGA 1VQ6N 4Z4CA 4BR2A 3HI0A 2GELA 3CERA 3SPZA 5AQZA 3MXJA 1SKRA 2GUIA 4OKJA 3O1WA 1OVYA 5GIPA 4BQZA 4DHYA 3M1FA 1VSDA 2P9PB 1R59O 3NH1A 4FWRA 3MEEA 3HYFA 2VG5A 4E19A 4BDZA 1QHAA 2F8SA 3O5BA 4OPJA 2D0OA 4G1QA 4H0OA 4DV7K 4BGAA 3LDLA 3U6FA 2QK9A 4NYFA 3WXJA 5AQSA 3ZSRA 3ZX0A 3TTFA 1CZ9A 5CZ1A 4NB4A 4H0XB 4FJHA 3O3FA 4RG8A 4W5NA 1QSSA 2X74A 3P5JA 3QB0A 4PQUA 4HVJA 1ESVA 2KKZA 4YY3K 2BANA 3QMLA 5M1QA 4WFNL 1W2BM 2EHGA 1O13A 3I0SA 4CERA 1U2VB 5E41A 2XHBA 2A6AA 5EOYA 5AQKA 5H1SQ 3LPUA 3E9OA 1TUYA 3OYDA 4JEPA 4HHTA 1HNZK 1WN7A 2VCPA 4K0KK 2HHHK 3LP0A 1RDWX 3O4NA 1FK9A 4CBWA 4F9OA 4CESA 1HNVA 3D45A 1T6DA 2NZTA 1U47A 4FJNA 4CGDA 2HBLA 2I5JA 1H1VA 1WLJA 1XUPO 5BR9A 3CJ9A 4BREA 3OYGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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