1DGKN

Mutant monomer of recombinant human hexokinase type i with glucose and adp in the active site
Total Genus 343
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
343
sequence length
898
structure length
898
Chain Sequence
DDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGVEGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDRAIDAYSLNPGKQLFEKMVSGMYLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLGVEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLTKDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGANFRVLLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structures of mutant monomeric hexokinase I reveal multiple ADP binding sites and conformational changes relevant to allosteric regulation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEXOKINASE TYPE I
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 343
structure length 898
sequence length 898
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 1999-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
N PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1dgkN03
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1dgkN01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1dgkN02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1dgkN04
3FZHA 3QBXA 4H0OA 1TYQB 5AQFA 2QWNA 1NWKA 2FXUA 5BN9A 2E2NA 4J8FA 2CGKA 4CZGA 4LC9B 4CBUA 4H0VB 3CETA 3EN9A 1ESVA 3JXUA 3VF4A 5EX5A 2GWKA 3VGLA 1Z05A 4H5VA 3EKUA 1X3MA 1K8KB 1BA1A 5FPMA 3QBWA 5FPEA 5KPRA 4FWOA 2P9SA 4CZMA 2P9KA 3H1VX 3P4IA 2FSKA 4A2AA 4BC4A 5JICA 5KPTA 3AARA 5E84A 1HKBA 3RSEA 3WXIA 3CERA 2QWPA 3UKUA 2P9UA 4CI6A 3W0LA 2CGJA 3LDLA 4AM7A 5AQJA 5EOYA 2HMPA 3CIPA 3LDQA 3CQYA 4M7YA 5AQOA 1YUWA 2AA4A 5BPNA 2VWBA 1GLFO 1TYQA 5AQYA 3H3NO 1ZC6A 2FLOA 3D2EB 1V4SA 4EHUA 5AQWA 3LM2A 5AQNA 3A8YA 5AQZA 4H0XB 1MDUB 3O1WA 3ZETB 4H0YB 2GUPA 2D1KA 3HI0A 2ZWHA 2BTFA 2YHWA 3VGMA 3O1BA 4PKIA 2FSNA 4FWSA 1NGGA 3R8EA 1Y64A 4EHTA 5E26A 3HTVA 2ZGYA 2E8AA 3GG4A 4HTLA 3WQUA 4GY2B 1KAXA 1GLEG 4DQ8A 3EL2A 1T44A 1NGDA 2I7NA 3U9ZA 1EQYA 4A2BA 2GWJA 4MLHA 1QZ6A 3L0QA 4BC2A 3U8XA 3EO3A 2ZGZA 5FPNA 4L3QA 4BGAA 5KQDA 2QM1A 1RDWX 2GTDA 3H3OB 5BREA 3MK6A 4WQ4A 2IVPA 3D2EA 4BQLA 4EIAA 4H03B 1ZBSA 3ZETA 3IFRA 3BF1A 1S22A 3WXKA 4CD3A 5KPZA 2NRHA 3FFKB 2AP1A 1BWFO 2H3GX 2IIRA 2WUSA 2Q2RA 1J6ZA 3VF6A 3DXMB 3CJ7A 2YHXA 4ISFA 4BR0A 4YDUC 3UE5A 3LDOA 1H1VA 5AZIB 5BN8A 2PAVA 2QWLA 5AQLA 3A5MC 4BRQA 5BRHA 3FE1A 5BRDA 1SZ2A 1BA0A 3FLCO 3D7EO 4BR5A 5CE3A 4FWNA 4CZFA 1GLLO 1T6DA 1YXQA 2F9TA 2QXLA 2YHYA 5AQKA 5AQUA 3VPZA 3O8MA 5JLHA 2CGLA 1ATSA 3VESA 2UYTA 3LDNA 4BVOA 2GEMA 4K43A 3O80A 1D4XA 2P9PA 2V51B 4F9OA 4H0TB 4CZKA 4YDUA 2CH6A 3WXJA 3HZ6A 5ELZA 3QICA 3WQTA 3ATVA 3ZX2A 2QWQA 3G25A 1XUPO 3DXMA 1NGBA 4BROA 3IDHA 4A62A 1WUAA 4BREA 5AZIA 2ASPA 2V52B 3SK3A 4BR4A 1XQSC 1E4FT 2NZTA 3H46O 4FWQA 4C23A 1LCUA 4FSVA 4JN4A 1HKGA 3MDQA 2E2OA 4WQ5C 1QZ5A 2IVNA 2FF3B 4DB3A 4EFHA 3VOVA 3QFUA 1T6CA 4FOIA 4B1WB 5F0XA 4FL9A 4ISGA 4Y0WA 1TUUA 2ASOA 3W3DA 1BDGA 4BRLA 2P9LB 2W41A 3M6GA 3UKRB 5AQVA 5KQ8A 1S3XA 4B9QA 1NGJA 3I8BA 1MWKA 3AAPA 4BRIA 4CJ7A 5AQIA 4EAHD 3CJCA 5BPMA 5FPDA 4DHYA 5EXWA 5LJVA 1NMDA 4WQ5A 4BRFA 3SMSA 1DEJA 3M3ZA 4XH4A 1XC3A 1K8KA 1C0FA 1YAGA 2Q36A 3CHWA 3WT0A 1P8ZA 1NGHA 4FO0A 4CD1A 1QHAA 4JHDB 1KXPA 4NO7A 3VEYA 1YVNA 3U4LA 4PKHA 1IJJA 3H6EA 2YJEA 2YI1A 5BRFA 1NM1A 3VGKA 4FWKA 1U6ZA 1U2VB 4CZJA 4FOEA 3MN9A 2A42A 3UKRA 1QQNA 4FWRA 3VEVA 1GLAG 1MWMA 2Q97A 3D2FB 2DPNA 3QMLA 3WXLA 3ATUA 3BEXA 4K25A 3FZFA 4BR7A 1JCEA 5AQSA 3ENOA 3I33A 5I9EB 1GLCG 4H5WA 1BG3A 4H5TA 1SAZA 3ZX0A 2FF6A 3L6QA 4BRKA 2Q0RA 3VEWA 4QS9A 4E1JA 5ADXA 5AQQA 4BC3A 4JHDA 3ULEB 2D0PA 3TPQA 3DXKB 3R9PA 2E2QA 4MO5A 1TUYA 3KHYA 2OANA 5EY4A 3FGUA 1KAZA 1R59O 2IVOA 3KVGA 4IXCA 5LY3A 5AFUH 4H5NA 5AFUA 4XH5A 4BQZA 1U2VA 3KZBA 1JCFA 1V4TA 4IO8A 5AR0A 1NGFA 3S41A 3UB5A 3SMPA 1X3NA 4BRHA 1DGKN 3SLCA 2GELA 2ITMA 2PBDA 2E88A 4ISEA 1NBWA 4IJAA 1HUXA 5AQHA 4IWVA 1NGAA 3VENA 2A41A 3QDKA 2P9IB 2KHOA 3MN6A 3GL1A 3DJCA 2D4WA 2ASMA 5AQPA 1GLJO 1ZXOA 4BRPA 2P9SB 2YJFA 4IZ9A 2P9KB 5JLFA 1HJOA 2D0OA 2P9NB 5EVZA 1JCGA 4CBXA 2VCPA 2HOEA 4JAXA 4B1UB 1OKJA 3O4WA 3ENHA 4GNIA 4H5RA 4BGBA 3ULEA 1Z6RA 5AQXA 3EZWA 3FZLA 3GE1A 3R6MA 4NB4A 4FWLA 1MA9B 5AQMA 3A5LC 1HKCA 1RGIA 3M1FA 3HM8A 3O6WA 1HLUA 5AQGA 3FZKA 1C0GA 3CJ1A 3CJBA 4CZLA 4BRCA 5LJWA 5JMVA 3HBTA 4FWPA 5F1XA 1BOTO 3F9MA 2P9IA 3MMVA 2HF3A 3DWLA 4PL7A 2BUPA 3CQXA 4DCHA 2P9NA 5AQTA 4QS7A 2NLXA 1X9JA 2VYPA 2YCHA 4BR2A 4M63C 3WEEB 4BC5A 2I7PA 4QS8A 3C7NB 4K42A 4XEIA 4CZEA 5BPLA 2E1ZA 4BG8A 3B8AX 2A3ZA 1G99A 3BUZB 3J8AA 4BRNA 1NGCA 3EKSA 4MO4A 1NGIA 4CZHA 4FWMA 1DKGD 2QWMA 3QFPA 1HPMA 3OHRA 1RFQA 3VF2A 4O5FA 5AZJB 2V7ZA 3LDPA 4WQ4C 4FPAA 5F2RA 3BP8A 3FZMA 3H1QA 4IJNA 4BR9A 3MCPA 2P9LA 3ZEUB 4HWIA 5TKYA 4WYBA 3O08A 3H45C 4BRAA 3U9DA 4B1VA 2Q31A 2E20A 4JD2B 3JS6A 3LL3A 4CBWA 3GBTA 3A5OC 3IUCA 3WEEA 4RCHA 1E4GT 1WOQA 3MN7A 3C7NA 3CI5A 3TU5A 4BRDA 1Q18A 4KBOA 5AQRA 1LOTB 1GLDG 5ADXH 2EWSA 3VEXA 3SJHA 1GLBG 4A61A 1QQOA 1BU6O 2A5XA 4O8KA 3DAWA 3MN5A 1ATNA 1HX1A 3GDQA 4FPBA 2W40A 4B1ZA 2P9PB 4BVPA 4JNEA 4I6MB 4BG9A 4RWTA 5AZJA 3VETA 5B8HA 1KAYA 2QWOA 3VEZA 1BUPA 2J4RA 2Q0UA 2V7YA 3ZEUA 4B1XB 2A6AA 2E1YA 4Z94A 1ATRA 1NLVA 3CJ9A 4JD2A 2FSJA 3WUHA 3AY9A 3HSCA 5BR9A 4AM6A 3D2FA 4H0PA 4PKGA 3ID8A 4XH1A 3FR0A 4PL8A 4M7XA 4RTFD 2QWRA 1CZAN 4BRMA 2Q1NA 2A40A 2QW9A 2E2PA 3BF3A 3IMXA 3VERA 3RSEB 4B1YB 3UKUB 2P9UB 3AAQA 3C0BA 3QB0A 3VEOA 3GOIA 4K41A 3A0IX 3CJAA 3DXKA 2HF4A 3ZX3A 3LM9A 1SQKA 1BO5O 1QQMA 4BRGA 2CH5A 4MLEA 2ZF5O 1NGEA 3A5NC 4I6MA 1IG8A 3L4IA 2F9WA 3O5BA 4CZIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H0OA 5AQFA 1NWKA 4FYDA 2FXUA 5BN9A 5CYQA 3NGYA 3OS0A 3TSUA 4CZGA 3BDPA 2NRXA 4CBUA 5GADP 4B3MK 5CHIA 3CCSN 3JXUA 3V9XA 1VQ4N 3VGLA 3S3MA 4N56A 1K8KB 1WNSA 3LP3A 4LSNA 5KPRA 4DR3K 4CHZA 4OKEA 1NOYA 5DM6L 4A2AA 4BC4A 2OTLN 1RNHA 1S1XA 2JGUA 5E84A 3AA2A 2QWPA 3UKUA 1MU2A 4I9LA 3LDLA 4CIEA 3AVHA 2HMPA 4YY3K 2VG5A 5HRRA 2VWBA 3AVBA 3AO2A 1GLFO 1TYQA 2FBVA 3D2EB 3NF8A 3U3YA 1BIZA 5AQZA 4FCYA 4CFCA 3MX5A 4DSLA 2DTUA 1NK8A 2BTFA 3SBTA 3O1BA 5EU7A 4FWSA 1Q81O 4B9MA 1Y64A 3BY5A 4EHTA 3CQ8A 2E8AA 4HTLA 3VQEA 1NKCA 1KAXA 3OYIA 3U9ZA 3E1YA 4AQYK 4HCBA 1QVFM 4YOUA 1ZYQA 1LWFA 5BREA 4IBNA 4CCHA 4FLTA 3HO1A 3K59A 1CLQA 1NNEA 3BF1A 4CERA 3TSPA 1KD1O 4FJ8A 1BWFO 2WUSA 3VQCA 1ASWA 4KHUA 4HUEA 1H1VA 2O8BB 1WB9A 1N8RO 1ASUA 5GIPA 4BR5A 4Z4IA 1T6DA 2F9TA 1I39A 5AQUA 1ATSA 4Q5VA 5D3GA 4BVOA 5DM7L 2GEMA 4O8UA 3NFAA 1KCFA 3O80A 1VRUA 2V51B 4OKKA 3TTCA 4DU4A 4CZKA 3AGKA 4AILC 1UWBA 3VTIA 1VQ5N 3OBYA 1RDBA 5ELZA 3MCAB 1EWRA 3G25A 3T1AA 3CC4N 1I94K 1FXXA 4BROA 2GUIA 3HPOA 4IG3A 3V1OA 4JKDA 2ASPA 4CF9A 3CMAN 3C6AA 1R0AA 1E4FT 3OYBA 3H46O 3RMCA 4GMJB 3TR8A 4KI4A 3AVLA 4FWQA 4IDKA 3MDQA 3TARA 1QZ5A 1WSIA 1T6CA 4B8AB 5HOOA 4E7KA 2HBJA 4KREA 5F0XA 4YNQA 1TUUA 1BDGA 4QOZB 1BCOA 4BRLA 4JI2K 3VN5A 4L8RB 3UKRB 4RW4A 5KQ8A 1S3XA 2NRWA 4DFPA 3AAPA 4CJ7A 1C1CA 3C65A 4EAHD 5BPMA 1YTUA 5DMRA 4WQ5A 3SQ0A 1DEJA 1NK9A 3TAFA 1K8KA 2O8CB 1B9FA 3CHWA 1P8ZA 4FO0A 3EY1A 4CW7B 1QHAA 3B6OA 4NO7A 3B6PA 3VEYA 2VQFK 1IKWA 5M1NA 5SWMA 3WNHA 2OTJN 3H6EA 1B9DA 2NUBA 3CG7A 5BRFA 3O3FA 4CEDA 3JAMO 5H1SQ 2HHVA 1Q9XA 4IEEA 2QEXN 3N4QA 4W5RA 4OPKA 4HTUA 4DWIA 4OO1J 1QQNA 1T8EA 3RWUA 4JYAK 5JVHL 4YFUA 1YITN 3VEVA 4R5PA 4F4KA 1SL0A 1Y97A 4FXDA 2Q97A 2B4JA 2DPNA 3WXLA 3IS9A 4DQIA 5GAEP 4AHTA 3FZFA 1RT5A 3I33A 5I9EB 4B9UA 3E9PA 1BG3A 3V6DA 3AVFA 4QS9A 5M1PA 4OGCA 1TGOA 2BGGA 4BC3A 4DR5K 3U6FA 4IEIA 4NYFA 3TPQA 5K14A 4CGHA 4MO5A 1ZBLA 3CFRA 1VSEA 5CY4A 5KTQA 1KAZA 5AFUA 4XH5A 4PHTX 1C0TA 2GBZA 3KZBA 3OYGA 3S41A 3UB5A 1NGFA 4GKJK 1YI2N 3SMPA 4YOWA 2OZMA 3F73A 1EO1A 2AJQA 3MX2A 4RW6A 3SUQA 4IWVA 4FJHA 2VWJA 3QDKA 3V1QA 4Z4HA 2D0BA 3MWTA 2D4WA 5AQPA 3KD1E 4YOVA 2P9SB 5JLFA 2P9KB 4KO0A 1HQUA 3RRHA 4CEQA 3ZLJA 3O4WA 1OVYA 3AVCA 3MECA 1T03A 1SL2A 2O8BA 5AQXA 3CM6A 2O8EA 3SUNA 3CFPA 4CGGA 2P5OA 4CFBA 3MXJA 4M41A 3VTHA 2HNYA 1MA9B 4OGEA 2RKIA 3AO1A 5AQGA 3DRPA 4CZLA 3CJBA 2ZQBA 5LJWA 1UA1A 3THWA 1VQLN 2HF3A 4K8XA 3SAFA 2XHBA 1VQ7N 3QLHA 4DCHA 3KLFA 3CCVN 3K5NA 4KPYA 2YCHA 3FFIA 2X6NA 4C8NA 4CGJA 1QSLA 1BI4B 4DQPA 3O9UA 4GW6A 4M3YA 2HNZA 4CZEA 2HBMA 2PFUA 4FW2A 2E1ZA 4CF8A 3B8AX 4DU3A 3NMUA 4RW9A 4BRNA 4MO4A 4C8KA 5C24A 3QFPA 1U49A 1HPMA 3MXIA 2XRIA 2E4LA 5AZJB 4AH9A 4DF4A 4PUOA 4FPAA 5C2FA 1I3AA 3MCPA 4JK8A 5TKYA 5T7BA 1NK4A 4BRAA 3U9DA 1VQ8N 5CR4A 4CESA 2GX9A 4IDHA 2KTQA 1HRHA 4WFAL 3L8BA 1RTHA 4B3TK 1WOQA 4IOCL 3C7NA 2HBLA 2UXDK 1Q18A 1VSMA 4KBOA 5AQRA 1LOTB 4CJEA 4BACA 1C0UA 2HHHK 1WSEA 5ADXH 4A61A 4B9NA 1QQOA 2OYQA 1BU6O 3M8QA 2XY7A 1HNWK 1KVAA 1HX1A 4JKFA 2P9PB 4I6MB 1FKPA 3QEVA 4ZTFA 2YV0X 4C1NI 3PO4A 1NK6A 3M8RA 1NOZA 4E7JA 3VEZA 2ZJQL 3SQ4A 3VQ9A 2Q0UA 3ZEUA 1LV5A 3SJJA 1NLVA 3KIOA 3BZKA 3CJ9A 4JD2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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