1DGKN

Mutant monomer of recombinant human hexokinase type i with glucose and adp in the active site
Total Genus 343
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
343
sequence length
898
structure length
898
Chain Sequence
DDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGVEGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDRAIDAYSLNPGKQLFEKMVSGMYLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLGVEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLTKDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGANFRVLLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structures of mutant monomeric hexokinase I reveal multiple ADP binding sites and conformational changes relevant to allosteric regulation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEXOKINASE TYPE I
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 343
structure length 898
sequence length 898
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 1999-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
N PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1dgkN03
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1dgkN01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1dgkN02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1dgkN04
2F9TA 2E1ZA 2GTDA 3ZX2A 5EOYA 3O1BA 3H3NO 3DXMB 3WUHA 1JCGA 1R59O 3WQTA 3LDPA 3GG4A 3QICA 1NMDA 4H0OA 5LJWA 1NM1A 3MN5A 4IO8A 3A0IX 3QMLA 3D2EA 3VEYA 4PKIA 3DJCA 3U9ZA 1MWMA 5AQWA 4RTFD 1ATSA 3QDKA 3A5NC 4QS9A 2NLXA 4CD3A 2ZWHA 4MLEA 5AR0A 4BRAA 2ASPA 3F9MA 3FR0A 4RCHA 4K41A 4IXCA 2NRHA 2D4WA 5FPDA 4B1YB 4H0VB 4H5RA 3HZ6A 3BF3A 4H5TA 3QFUA 4FWQA 1U6ZA 3HTVA 5EVZA 3UB5A 2QM1A 2W40A 4BRDA 4A61A 1X9JA 4CJ7A 1DEJA 2V51B 2A40A 3BF1A 4BC4A 3ULEA 3D2EB 3MN6A 3BP8A 4QS8A 4JNEA 1OKJA 2V7ZA 2HF3A 4C23A 4BGBA 2QW9A 1QHAA 3ZETA 5AQHA 4CBXA 1GLEG 2OANA 4IJAA 1QQNA 1NBWA 3CJCA 5AQLA 3CETA 4DCHA 5AQTA 1K8KA 4FWNA 4WYBA 1ATNA 1KAXA 4H0YB 2CH5A 3CJ9A 1GLAG 4WQ5C 5F2RA 3IDHA 3W3DA 4A62A 3JXUA 4QS7A 2IVNA 4BQLA 4BREA 5ADXH 4CBUA 3HI0A 4FOIA 4K25A 3VF2A 3QBXA 4BGAA 1G99A 3ULEB 3W0LA 4EHUA 1RGIA 1BDGA 2YI1A 4CZEA 5AQSA 1J6ZA 4H5VA 3CERA 1V4TA 4BR9A 4CZLA 4O5FA 3VEOA 4GY2B 3ZETB 4CZKA 4H0PA 1NGCA 1BU6O 4FPBA 3GOIA 4MO5A 4A2AA 2QWLA 1K8KB 5KQ8A 3WEEA 1HKCA 1IJJA 3U4LA 2E2QA 4MLHA 3CJAA 2EWSA 4ISGA 1XUPO 3IMXA 5FPEA 2AP1A 1CZAN 2VWBA 2D0PA 5BREA 1NWKA 3MCPA 3ENOA 2QWMA 1NGGA 3LDOA 2QWPA 4NO7A 3HSCA 2QWRA 4BG9A 4WQ5A 1GLJO 1KXPA 1NGHA 3AARA 5EY4A 2CH6A 1ZBSA 2GUPA 4BRHA 5BN8A 4MO4A 2FLOA 3ZX0A 3CQYA 4I6MA 4JN4A 2GELA 2I7NA 3U8XA 5AQMA 4BVPA 4E1JA 1GLBG 4RWTA 1DKGD 5EX5A 3WQUA 5KPZA 3AAQA 1X3NA 2Q0RA 5BRHA 3H3OB 3O80A 3I8BA 3FE1A 3D2FA 4FO0A 1GLDG 4GNIA 2P9IB 4BC2A 4B1VA 3A8YA 1S22A 2P9NB 3SLCA 2A3ZA 3L6QA 2YCHA 3DWLA 1QZ5A 1WOQA 3H45C 4AM6A 1TYQA 3ATVA 2H3GX 1BG3A 1NGFA 4JHDA 1SQKA 3A5MC 3ENHA 2HOEA 1QQMA 2F9WA 3MN7A 1V4SA 1BWFO 2IVOA 3VGKA 2VYPA 1RDWX 4XH4A 4BRQA 1NGIA 1D4XA 4FWRA 4J8FA 3SK3A 3EO3A 1HPMA 4I6MB 3VEWA 4DHYA 4CZJA 3CJ7A 1RFQA 5FPMA 3A5LC 4BRCA 5E84A 4BRKA 4IJNA 3ZX3A 1NGBA 3D2FB 2NZTA 3SJHA 2P9LA 2CGLA 3VETA 2ZGYA 3C7NA 3LDNA 3IFRA 1TUUA 4BRMA 1U2VA 2FSNA 3VGMA 4FPAA 1GLCG 2E2NA 3O4WA 2FF3B 3FFKB 4AM7A 4B1ZA 3VERA 5AQNA 3MDQA 4XH1A 3SMSA 4Y0WA 2E1YA 2E20A 4JHDB 4FWLA 5JICA 5TKYA 3WXLA 5BRDA 2PBDA 3P4IA 2YJFA 1ZXOA 5AZJA 5AZIA 3CHWA 2FXUA 3H46O 2FSJA 2V7YA 1LCUA 5AQYA 3VEVA 3VPZA 2PAVA 5ADXA 2YHYA 1KAZA 2YHXA 3JS6A 3MMVA 3O08A 4M7XA 1BUPA 2P9LB 4PL8A 3GDQA 1SZ2A 3C7NB 3QFPA 1T6DA 4BR5A 4FOEA 4BRNA 3C0BA 2Q2RA 3LL3A 2ASOA 1ATRA 4B1WB 5AFUH 4JD2A 3R6MA 5BPNA 5AQIA 5AQKA 3AY9A 2CGJA 4DB3A 3ATUA 1S3XA 1TUYA 5BPMA 4KBOA 2QWNA 3RSEA 5AZJB 5AZIB 2BUPA 3EKUA 3S41A 4M63C 3VEXA 3VF6A 5BPLA 3UE5A 3VF4A 4FSVA 1P8ZA 3FZMA 3A5OC 4IWVA 1Z05A 4H0TB 3L0QA 5AQOA 5FPNA 4BRPA 1E4GT 5KPTA 1GLFO 4CZHA 1MA9B 4JD2B 2BTFA 2YHWA 2WUSA 5BRFA 3VENA 3GBTA 4B1XB 2Q1NA 3GL1A 2W41A 5BN9A 4M7YA 3RSEB 3WXKA 3DAWA 3CJBA 2AA4A 3M1FA 4H0XB 5BR9A 4BR2A 3QBWA 3BEXA 3H1QA 2D1KA 3WEEB 2FF6A 3CQXA 3H1VX 4B1UB 4BC3A 1X3MA 1SAZA 3UKUA 3WT0A 1YXQA 5B8HA 4EIAA 1HUXA 3I33A 2QWQA 1Z6RA 2HMPA 3IUCA 1HJOA 2ZF5O 5F0XA 4H5NA 3WXIA 4FWSA 4HWIA 4BRFA 5F1XA 3EN9A 2QXLA 3KZBA 2GWJA 2V52B 1YVNA 4ISFA 3FZKA 1XQSC 1YAGA 2A5XA 1NGAA 2Q0UA 3G25A 4FWMA 2Q97A 1EQYA 1JCFA 1C0GA 3MN9A 1T6CA 3D7EO 4HTLA 2E88A 4CZGA 4NB4A 3BUZB 4DQ8A 5AQPA 1Y64A 3M3ZA 3M6GA 2P9PA 3ZEUA 3UKUB 4YDUC 3FLCO 4PKHA 3L4IA 3J8AA 4H5WA 4BRIA 1LOTB 2FSKA 1YUWA 1TYQB 1ZC6A 3FGUA 4F9OA 3LDLA 3U9DA 2E2PA 5KQDA 1WUAA 2DPNA 2Q31A 3FZFA 4L3QA 4LC9B 2P9UA 5AQXA 4BROA 1GLLO 2IIRA 3EL2A 4CZMA 5AFUA 1BA0A 4FWOA 5LY3A 2P9KA 2I7PA 5JLHA 3EKSA 2P9PB 3ZEUB 2IVPA 4WQ4C 5AQJA 3VESA 1QZ6A 1QQOA 1U2VB 3OHRA 4BR4A 2YJEA 5KPRA 4CBWA 2E2OA 4CZFA 4PKGA 3O6WA 3UKRA 1DGKN 2GWKA 2HF4A 5AQZA 3QB0A 5AQQA 1NGDA 3LM9A 1KAYA 4XEIA 4YDUA 2A42A 5JLFA 1NGEA 5AQGA 3HBTA 3GE1A 3O5BA 1T44A 4K43A 1NGJA 2P9UB 3R8EA 3KHYA 3LDQA 4O8KA 2GEMA 4A2BA 2P9SA 1MWKA 2J4RA 5AQRA 3FZHA 2KHOA 4K42A 1BOTO 2P9KB 2A41A 2Q36A 3SMPA 3TU5A 5JMVA 3MK6A 2UYTA 4CI6A 4EFHA 1E4FT 3H6EA 3EZWA 3DXKA 3FZLA 1HKGA 3B8AX 5LJVA 5E26A 3WXJA 4EHTA 3UKRB 4FWPA 3O8MA 4BRLA 4CZIA 1BA1A 3ID8A 3VOVA 1HLUA 4BQZA 2CGKA 4BVOA 4WQ4A 5AQUA 4B9QA 4ISEA 4BRGA 5CE3A 3AAPA 2VCPA 3LM2A 4BG8A 2D0OA 4BR7A 1BO5O 4PL7A 3KVGA 3VGLA 3HM8A 1Q18A 1H1VA 4H03B 2P9SB 3CIPA 2ASMA 2P9IA 1C0FA 3CJ1A 3VEZA 3CI5A 2E8AA 1NLVA 3DXMA 1ESVA 2P9NA 4FWKA 1IG8A 1HKBA 2ZGZA 2ITMA 4XH5A 1XC3A 3TPQA 4EAHD 4BC5A 3DXKB 1HX1A 3R9PA 2QWOA 1JCEA 4JAXA 4IZ9A 1MDUB 4BR0A 5ELZA 2A6AA 4Z94A 4CD1A 5AQFA 3O1WA 5I9EB 5AQVA 5EXWA 4FL9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3L2WA 2E1ZA 2GTDA 3ZX2A 4JKHA 4CHOA 1W2BM 5EOYA 3VQ6A 4JK7A 4OPJA 3WUHA 3HSTB 1JCGA 4AHRA 1TK5A 1NJIO 1Q7YO 4IO8A 1MU2A 1ATSA 4CJKA 1VQ8N 3SUNA 4O55A 2VGNA 4KH4A 4DU3A 3KTQA 4ZHRA 2ZJPL 1YTAA 3F9MA 4RCHA 1X9MA 4CCHA 3O9SA 5FPDA 1JLBA 3DRRA 4DU4A 3HZ6A 3BF3A 3VMFB 4E7JA 4M42A 1U47A 4H5TA 5C0YA 4QCLA 4FWQA 3HTVA 3K2PA 2QM1A 4BRDA 3P1GA 1DEJA 4FJ8A 4LF6K 3OYNA 4YOWA 3OTOK 3AVAA 4QS8A 5DM7L 1C6VA 3AVIA 4LF7K 4LSNA 1Z25A 2QW9A 2GUIA 3ZT3A 2KQ2A 1NMNA 4GKKK 3ULDA 3EYZA 4HTUA 1ZBIA 1Q82O 1VQKN 4H0YB 3CJ9A 4WQ5C 1GLAG 3E9PA 3W3DA 3V1RA 1X9WA 4A62A 4K25A 3VF2A 3QBXA 4Z0UA 4O5BA 4DTOA 1S1VA 3W0LA 4EHUA 3PX6A 3QNNA 1D9FA 1X1PA 3CERA 4WFNL 4HUFA 2VG5A 1NKEA 4LSLA 4FJKA 4H0PA 1NGCA 1BU6O 4JKEA 3MWPA 2NNWA 3WNHA 1RNHA 2KW4A 3F9KA 5KQ8A 1OH6A 4B08A 4W5RA 4JS4A 2YX6A 4OKEA 1C1AA 4ISGA 4B3OA 5FPEA 2VWBA 4AQYK 5GINA 3HOSA 3HJFA 1S1XA 3G10A 3SBTA 5C12A 4I9QA 4KTZA 3MCPA 1N6QA 4ELVA 1TAQA 4KHYA 3LDOA 4A57A 4CEFA 3M8RA 2QWRA 3UIQA 4DUYK 4WQ5A 3THWA 4R79A 1RDCA 3AARA 3TTCA 2NRWA 4DQSA 1JKHA 5EY4A 4BRHA 4IOXA 5BN8A 2GELA 3U8XA 2XY6A 4A5BA 4FZZA 3LPUA 3CFOA 4FJJA 4AHSA 4RWTA 3H3OB 2KFZA 3I8BA 4GNIA 2DFFA 4FK4A 3OYFA 3OYKA 2HHWA 4EZ9A 4B1VA 2UUCK 2A3ZA 3L6QA 4FJXA 1WSGA 3DWLA 1WOQA 1UWBA 3H45C 1TYQA 4JHDA 3ENHA 2F9WA 4JKGB 2IVOA 2VYPA 4XH4A 4BRQA 4JS5A 3PX0A 4FYDA 4FWRA 2ZD1A 5SZTA 4I6MB 3VQCA 3BGRA 4DF8A 1VSFA 2VQEK 4JI7K 2NZTA 3VETA 2P9LA 3T3FA 4DV5K 3IFRA 4B9SA 2HB5A 3QEVA 4FPAA 1GLCG 5IWAK 3F73A 2HVIA 1N34K 3AO4A 2DY4A 3RRHA 5J2QA 4Y0WA 2E1YA 2XY8A 4GV6A 2YKMA 4CF8A 4JKCA 3ZT1A 3WXLA 3P4IA 4DTUA 4IG3A 1VRUA 4JK8A 5C2DA 3OA9A 3IS9A 3SNNA 4OPAA 1EWRA 5AQYA 4DV4K 3VPZA 1U48A 1BIUA 3JS6A 4J2DA 4Z4GA 1T6DA 5I42A 4DSEA 5LMNK 4K8ZA 3SPZA 4OJRA 4AHCA 4FJ9A 1TKTA 4JD2A 5AQIA 3RVCA 4IG0A 3AY9A 3PSFA 3AGKA 1YIJN 2BH1A 1HYVA 1VSJA 5BPMA 1WBBA 5AZIB 3S41A 3L2UA 4CF2A 3UE5A 3VF4A 4FSVA 3FZMA 4IBNA 3ZT0A 1RDUA 1M90O 4KHQA 5HRSA 4W5OA 2HSTA 1HRHA 1TL3A 4CHPA 3HM9A 2QEXN 1E4GT 3T1HK 2G8WA 1XHZA 4M3WA 4DV6K 4LF8K 2FBTA 4FLYA 4B1XB 5C25A 4OKKA 3S3MA 1QVGM 3RSEB 4JI8K 1B9DA 1NOZA 1SL0A 3LP0A 2D1KA 3CQXA 4IKFA 4BC3A 3OW2M 4H4OA 2NUBA 3WT0A 4EIAA 3I33A 4KHWA 4M41A 1Z6RA 3MX2A 3CF5L 4H5NA 1RT5A 4AHTA 4HWIA 1S1WA 5F1XA 4M3ZA 1RTIA 3KZBA 5A2QO 4ISFA 4L8RB 1TL1A 2QKBA 2Q97A 1JCFA 3SAGA 3RR8A 2QXFA 3D7EO 4E7HA 1NG9A 2YHAA 2E88A 3M6GA 3OYDA 2PYLA 5GAEP 4X64K 1K9MO 3SZ2A 1OVYA 3L4IA 4ZTFA 3DLRA 4BRIA 2QI2A 2QA4N 1TYQB 3LP2A 3DLHA 4F9OA 4F4KA 4OVLA 2Q31A 3FZFA 4L3QA 2FBXA 1ASVA 3CM5A 2P9UA 4BE2A 3L2QA 2IIRA 3K0SA 3CPEA 4WFAL 3PIPL 2AJQA 2HBMA 3TAMA 1RBTA 4FCYA 5JLHA 4FLUA 1S9GA 2P9PB 1JJ2M 2HHTA 1J9AA 3AV9A 5KPRA 3TAQA 4MQ3A 1KLMA 3UKRA 3JYTA 2P51A 3K9JA 1IBLK 1KAYA 4JEPA 3JSMA 1WSHA 1NGEA 3HBTA 1E3MA 1HJRA 5FDLA 3GE1A 2KZMA 3IAYA 4K43A 1LWCA 3NBPA 4PQUA 5CHIA 3K5NA 2HBJA 1HPZA 2KHOA 3TWHA 4B9VA 1DLOA 1XMOK 2A41A 4DR1K 1G15A 1JLGA 5JMVA 4YHHK 2UYTA 3OYCA 4CEOA 5J2MA 3H6EA 3D0PA 3FZLA 3B8AX 2W6KA 3O8MA 1VQLN 1BA1A 3ID8A 1HLUA 1U49A 1RILA 4BQZA 4DQPA 3HT3A 3F5TA 5AQUA 4B9QA 5CE3A 2X6NA 3KLHA 3LM2A 1NJYA 1CZ9A 3NGYA 4BG8A 4BR7A 4CW7B 4B3MK 3HOTA 3MAQA 3KVGA 1EETA 3HM8A 1H1VA 1KVBA 4DFJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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