1DGKN

Mutant monomer of recombinant human hexokinase type i with glucose and adp in the active site
Total Genus 343
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
343
sequence length
898
structure length
898
Chain Sequence
DDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGVEGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDRAIDAYSLNPGKQLFEKMVSGMYLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLGVEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLTKDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGANFRVLLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structures of mutant monomeric hexokinase I reveal multiple ADP binding sites and conformational changes relevant to allosteric regulation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEXOKINASE TYPE I
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 343
structure length 898
sequence length 898
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 1999-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
N PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1dgkN03
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1dgkN01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1dgkN02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1dgkN04
3MDQA 3VEYA 5I9EB 3AAPA 2A42A 3EL2A 2I7NA 1U6ZA 5FPNA 2GTDA 2PAVA 2QM1A 2Q2RA 3H46O 5BR9A 3DWLA 3A0IX 4M7YA 3R8EA 4BRFA 1TUYA 4H5NA 5BPMA 5FPEA 4B1YB 1ATNA 1DGKN 3L6QA 2P9SA 3GBTA 1Y64A 4Y0WA 5KPTA 4JHDA 2P9UB 3FZHA 1BO5O 2IIRA 1T6DA 3A8YA 3IDHA 1BDGA 2QWQA 1CZAN 4M63C 5JLHA 3IMXA 1HLUA 1NM1A 1WOQA 5AQMA 4CJ7A 5E26A 4FWLA 5ADXA 4QS9A 2IVOA 5KQ8A 2FSJA 3VENA 4BRHA 5FPDA 3MN9A 3VGMA 5AZIB 3U4LA 3HM8A 2F9TA 4BGBA 1R59O 1S22A 1JCGA 4CZHA 3DJCA 1DKGD 5AQZA 5JICA 2OANA 2D0OA 3EKUA 3ZETB 3TPQA 4BVOA 1BWFO 2E2PA 5KPZA 3L4IA 3WUHA 4O5FA 1JCFA 3C0BA 2QXLA 3W3DA 5AQHA 4BRPA 1YVNA 1NGBA 2E88A 4K43A 3JS6A 5AQNA 4A61A 2P9IB 5AQIA 1NGIA 5EX5A 2FSNA 4K41A 4FL9A 3JXUA 4FWQA 1T44A 2CGKA 3QDKA 4H0TB 3SK3A 4EHUA 4H0VB 3P4IA 2P9UA 3ZX2A 4CZKA 3QFUA 1IJJA 4WYBA 3SMSA 3VESA 3DXKB 3LDQA 5AQQA 1NWKA 3MN5A 2QWLA 4PKHA 3FZFA 3LDOA 5AFUA 3VF4A 5AQSA 1H1VA 2GEMA 4XH1A 4MLHA 5AZIA 2CH5A 3QMLA 3U8XA 2NLXA 1YXQA 3R9PA 5BRHA 4BC4A 3I33A 3O4WA 3DAWA 4AM6A 3A5MC 2ASOA 3FZLA 3ZETA 3WEEB 4H5RA 5BN9A 3D7EO 2YHWA 5AQLA 1KAXA 2F9WA 1RDWX 3CJ9A 4B1ZA 3VEZA 4BG9A 1C0FA 3DXMB 2A3ZA 3VOVA 3VEXA 4XH4A 4BR9A 4BRIA 1X9JA 1ATSA 2E2QA 3HTVA 3AY9A 3H6EA 1NBWA 3M3ZA 4BC3A 5BREA 3HBTA 3B8AX 2FF3B 4PL7A 2P9NB 2FXUA 2QWNA 1BA0A 2HMPA 2ZGZA 4FWRA 3ENOA 1SQKA 3SJHA 1HKGA 1YAGA 1U2VB 3EN9A 3M1FA 4C23A 3GE1A 3VF2A 3GDQA 1ZXOA 2A41A 3QFPA 2V51B 5AQYA 3DXKA 2Q0UA 5AQWA 3LM9A 4BVPA 4H0YB 3SMPA 4WQ4C 4GY2B 4FOEA 3BUZB 5EXWA 3SLCA 1GLEG 3L0QA 4QS8A 3U9DA 4Z94A 3BF3A 1SAZA 3VETA 2E1ZA 4CZEA 2ZWHA 3M6GA 1HJOA 3KVGA 4BRAA 3ZEUA 5AQTA 1BA1A 1NMDA 4K42A 2ASPA 4BR0A 4DCHA 3O1WA 2HF3A 3WEEA 4B1VA 2HOEA 4M7XA 3GL1A 4QS7A 3ID8A 3VGKA 4DHYA 4CZGA 1NGAA 1NGCA 3CJAA 3DXMA 3EZWA 5F0XA 5ELZA 3MCPA 3D2EA 1ATRA 1WUAA 1RGIA 2IVPA 4A2AA 3I8BA 4CZJA 2P9NA 1QQNA 1GLLO 4H5VA 4CZFA 1QHAA 3FZKA 5AQGA 2H3GX 4O8KA 4BRDA 3WT0A 1U2VA 3UKRA 2GUPA 4J8FA 2VYPA 2HF4A 1J6ZA 2QWPA 4HWIA 5EOYA 1TUUA 3WXKA 2GWJA 3O8MA 4BQZA 4K25A 3MN6A 1GLCG 3FFKB 4MO5A 3WXIA 2QW9A 4B1WB 1K8KB 2V7YA 4PKIA 3IUCA 5BPNA 3BEXA 2ZF5O 1BUPA 1NGJA 5AR0A 2VCPA 3FZMA 5AQVA 4CBUA 4ISGA 4WQ5C 4B1XB 5CE3A 1JCEA 5LJWA 1G99A 3CQYA 4MO4A 1BU6O 2E1YA 3W0LA 1X3MA 4H0XB 5JMVA 4H5TA 3GOIA 3RSEB 4NB4A 2I7PA 2P9KA 3R6MA 3CHWA 2ASMA 2W41A 1BOTO 5BN8A 4BROA 4WQ4A 5E84A 1IG8A 2A5XA 4BG8A 4H0PA 4L3QA 4PKGA 3S41A 2D1KA 3BF1A 4XEIA 4AM7A 4BRNA 1GLJO 3AAQA 3CJCA 2P9LB 4CI6A 3QBWA 1XUPO 2CGJA 3FLCO 2J4RA 1LOTB 4FWMA 1KAZA 2DPNA 2UYTA 3ZEUB 5FPMA 4RWTA 5AQJA 4ISFA 5AQOA 5KQDA 1V4SA 2CH6A 3ULEA 4HTLA 4JD2B 3EKSA 3A5LC 3HSCA 4FOIA 3HI0A 1NGEA 2GELA 2E20A 3CJ1A 4EFHA 4BRCA 5EY4A 4IO8A 2BUPA 2IVNA 1NGDA 1GLDG 2AP1A 5F2RA 3IFRA 4DB3A 1MWKA 3D2EB 3WQTA 3UKUB 3H1VX 5AFUH 3AARA 5AZJB 3EO3A 3UE5A 4EIAA 3GG4A 1XQSC 4YDUC 4E1JA 3F9MA 1K8KA 2FSKA 5B8HA 1YUWA 4XH5A 3VPZA 1RFQA 3D2FA 4FO0A 4FPBA 1NLVA 3J8AA 3CERA 3UKRB 3TU5A 3VEOA 4FWKA 4BRMA 5AQFA 3RSEA 4F9OA 3MN7A 4CZMA 1P8ZA 2P9PB 1MA9B 2V52B 3CJ7A 3U9ZA 4IZ9A 2NZTA 1DEJA 3G25A 4IJNA 3C7NA 2P9LA 2W40A 1LCUA 3VEVA 4CD3A 1HUXA 4WQ5A 3VEWA 4CD1A 4IJAA 5AQRA 3OHRA 3BP8A 2QWOA 4JD2A 1BG3A 4IWVA 1X3NA 2P9KB 1C0GA 3FE1A 2V7ZA 4I6MB 3LDLA 3FGUA 4EHTA 1GLFO 3QICA 4FPAA 4FWOA 2YCHA 4CZLA 2Q0RA 3LDNA 1E4GT 3O08A 3UKUA 4BR7A 5AZJA 4BQLA 1TYQA 1ZC6A 3CIPA 4RCHA 3VF6A 2YHYA 3ZX3A 3ULEB 3VERA 5BRFA 3ZX0A 5LY3A 5BPLA 3O1BA 3KZBA 2YI1A 4CBWA 5BRDA 3CQXA 2Q31A 3CI5A 2P9PA 2Q1NA 1Z6RA 2QWMA 5ADXH 5LJVA 1XC3A 2A6AA 4EAHD 2YJEA 4YDUA 4BGAA 2D4WA 2Q36A 3WXJA 3D2FB 1QQMA 1NGFA 1KXPA 4BC5A 4BREA 1EQYA 4B1UB 4BC2A 2A40A 2FF6A 1MDUB 4JNEA 1HPMA 2KHOA 4PL8A 1OKJA 2FLOA 1QZ6A 2D0PA 4GNIA 4KBOA 2WUSA 1NGHA 3QB0A 1V4TA 1ZBSA 3ENHA 4I6MA 4CZIA 2E2NA 1T6CA 4FWNA 2BTFA 3H45C 4A2BA 4BR4A 1HKBA 3C7NB 3LM2A 3MMVA 3WQUA 4CBXA 5AQKA 2EWSA 1HX1A 2NRHA 4H5WA 4BRGA 1GLBG 3O5BA 5AQPA 3QBXA 4A62A 4BRLA 2ITMA 1S3XA 3H3OB 2PBDA 1D4XA 1MWMA 3FR0A 2Q97A 3HZ6A 4RTFD 3O80A 4BRKA 3LL3A 2YHXA 2YJFA 3CJBA 1QZ5A 5TKYA 2E8AA 4LC9B 3ATVA 5AQUA 1GLAG 2ZGYA 4H03B 4IXCA 2P9SB 2QWRA 4JHDB 3KHYA 1TYQB 1Z05A 5F1XA 4JN4A 4BRQA 4FWPA 5EVZA 3A5NC 3H3NO 4NO7A 4FWSA 1Q18A 4FSVA 3LDPA 4DQ8A 3ATUA 5AQXA 5JLFA 2GWKA 4BR2A 4ISEA 2E2OA 4JAXA 5KPRA 3UB5A 3MK6A 3O6WA 1HKCA 1E4FT 1KAYA 1ESVA 3H1QA 3A5OC 1NGGA 4MLEA 2AA4A 2VWBA 3VGLA 1QQOA 4B9QA 3WXLA 3CETA 4H0OA 1SZ2A 2P9IA 4BR5A 2CGLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4E7KA 5CYMA 3AAPA 2A42A 1U4BA 3EL2A 2I7NA 3AVIA 2DFFA 1N8RO 2KZMA 5FPNA 3VQBA 2O4GA 3DWLA 1XMQK 5FRMA 3I56N 3SI6A 4OX9K 2QTDA 3V9WA 3R8EA 4UQGA 1RDBA 4DTSA 2YV0X 1VSLA 4BRFA 1TUYA 3O4QA 3DRRA 4A5AA 5FPEA 3QETA 3KLHA 1DGKN 5EU7A 3H08A 1NKCA 1U04A 5KPTA 2P9SA 3GBTA 4FW1A 4JHDA 3VQDA 3R1XA 5KGXA 1CLQA 2P9UB 1EETA 4F4KA 1T6DA 1BDGA 1CZAN 1HLUA 1WOQA 1P90A 3HPHA 3L2VA 4O0IA 3UIQA 4GMJB 3P39A 3HM8A 3CFPA 3SUOA 3DJCA 1W9HA 3TSQA 5KRSA 1WSHA 5JICA 1WN7A 3ZETB 5LMUK 1S1TA 4WCEL 1BWFO 3VQEA 2E2PA 2YKNA 4FM0A 1VSMA 4BRPA 1YVNA 4BDPA 4OLAA 1IBLK 1VQKN 1BIUA 2D0CA 4CJ3A 1TKTA 4Y1DA 4A61A 2P9IB 5AQIA 4DUZK 4RG8A 1TK0A 4FL9A 3MWTA 1S1UA 4FWQA 5JVGL 4H0VB 3PY8A 2O8EA 4AQYK 2PZSA 4HVJA 3ZX2A 2BANA 3DXKB 2WC9A 1HNIA 4PQUA 4PKHA 4ILJA 5AFUA 2W6KA 2RN2A 1H1VA 4CERA 4B9TA 4HHTA 5AZIA 4RW4A 3CPWM 2UUBK 5JVHL 2DFEA 3C95A 2NLXA 1JLCA 3P31A 1XMOK 4FK4A 3O4WA 1A5XA 3DAWA 3A5MC 4CJEA 4F3TA 4IFYA 4FJNA 1RDAA 3AVGA 1S1WA 3D7EO 3PO5A 1RDWX 2HNYA 3N4QA 5TKWA 1C0FA 2KKZA 4BG9A 2A3ZA 3VOVA 4DV6K 3QEVA 1J54A 1X9JA 5D3GA 4JKFA 3ID6A 1N32K 3H6EA 3AV9A 4G9ZA 3QLHA 5HL7L 3M8SA 1WSJA 1QQCA 1ZBFA 3K57A 1VQON 3EN9A 4ID1A 4C23A 2A41A 1RBUA 4BVPA 5CR4A 4GY2B 4FOEA 4CGDA 1YTUA 2DFHA 3MWPA 3PSIA 1NMNA 4Z94A 1RT5A 3WNEA 4C8MA 4E1MA 4CK3A 1NJZA 2D5RA 4ILGB 4BR0A 4DCHA 4FZXC 2ASPA 1JLGA 3K58A 1M1KO 3O1WA 4B1VA 2HOEA 1WSIA 1JLQA 3GL1A 4QS7A 4FK0A 3VGKA 3M8RA 3OYCA 3PUFA 4CZGA 3DXMA 1T8EA 4JI3K 3MX2A 3DOLA 4FLUA 4BDYA 3D2EA 1WUAA 3E9LA 1QQNA 4YNQA 1GLLO 4H5VA 1TL1A 2QKBA 2H3GX 4RW7A 3U6FA 1U2VA 3KD5E 2G8VA 3ZLJA 3TAQA 3M5RA 2QWPA 1TUUA 2HVIA 2KTQA 1KVCA 4IG0A 4PKIA 3SPYA 4CEAA 1VQ6N 2VCPA 3FZMA 3O9RA 4BDZA 1A5WA 3HPOA 1NJWA 4ISGA 4WQ5C 4B1XB 4M3ZA 1G99A 3CQYA 1N33K 1BU6O 2E1YA 5KI6A 1QVGM 5JMVA 5GINA 3RSEB 3TWHA 4NB4A 1QVFM 5HRRA 2P9KA 1EKEA 3V81A 2ASMA 3SQ4A 4WQ4A 1HYVA 4U7BA 4FJXA 1IG8A 2A5XA 4HUFA 4L3QA 4PKGA 5KRTA 3BF1A 3LAMA 4XEIA 2X74A 3PX0A 3AAQA 4OPKA 1OH6A 3D45A 3QBWA 3C94A 3AO4A 1TKDA 1M90O 1RBTA 3TAMA 1VQMN 1V4SA 3CCEN 3ULEA 3DMJA 2HMIA 4CCHA 3C6HA 3A5LC 3HSCA 4FOIA 3IS9A 5DM6L 4JI8K 3OYBA 1NGEA 3MXJA 3CJ1A 5EY4A 3CFOA 2BUPA 4KHQA 2XO7A 4F2SA 3CCVN 3C6TA 3D2EB 3H1VX 1CXQA 2PFUA 2D0BA 1K8KA 3K2PA 2HHTA 2P51A 1JXBA 4LF7K 3VQ9A 2UXCK 3NDKA 4Z4EA 4CF0A 2HNZA 4JI2K 1P8ZA 1VQLN 4ZHRA 3CJ7A 3O4NA 1JXEA 5AJ3K 4E3SA 4IDHA 4OGCA 4O5BA 1LAVA 4KH6A 2P9LA 3VEWA 2UUCK 1KSPA 4CD1A 4DF4A 3LPTA 1BHLA 1X3NA 2P9KB 3FE1A 4B3TK 3FGUA 4EHTA 2OPSA 3CC2N 2GUIA 4IOCL 3CCSN 5CY4A 2YCHA 1RILA 3LDNA 1QSLA 5AZJA 3KKRA 3KLEA 1TYQA 3C6UA 4FLYA 3CM6A 1EO1A 2YHYA 3IG1A 3ULEB 3U3YA 3PLAA 3T69A 3VERA 2X78A 4DS5A 3EZ5A 1L3VA 5BPLA 1SV5A 2NUBA 4CF1A 3KLGA 4W5NA 3OYJA 4CBWA 4NCAA 5BRDA 4V19S 1QE1A 3K59A 2B5JA 4NYNA 2F4VK 4CIFA 3OYGA 3SV3A 4DG1A 3TTCA 2XY8A 2P5OA 3OYFA 1XC3A 4OPJA 2YJEA 3HSTB 3L2UA 3QEWA 3JAMO 1QSSA 4LF8K 4YOXA 1ZBLA 4BREA 3WXMB 4N41A 4RW8A 4CHZA 4B1UB 2UUAK 2A40A 2FF6A 3QO9A 2A1SA 4CHQA 2O8FB 3CPEA 2KHOA 4EZ6A 4KB1A 1QZ6A 4GNIA 4KBOA 1ZBSA 4JKAA 3ENHA 1F21A 4FZYA 3H45C 3NAEA 4A2BA 3S3OA 4BR4A 3LM2A 3MMVA 4AH9A 3PX6A 4CBXA 5AQKA 1HX1A 5JS1A 4CGFA 5M1NA 2W42A 3H3OB 3S3MA 3FR0A 4I9QA 2Q97A 4OJRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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