1GLBG

Structure of the regulatory complex of escherichia coli iiiglc with glycerol kinase
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
496
structure length
489
Chain Sequence
KYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the regulatory complex of Escherichia coli IIIGlc with glycerol kinase.
pubmed rcsb
molecule keywords GLUCOSE-SPECIFIC PROTEIN IIIGlc
molecule tags Phosphotransferase
source organism Escherichia coli
total genus 155
structure length 489
sequence length 496
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1992-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
G PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
G PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1glbG02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1glbG01
3O4WA 2W40A 1ZBSA 2QWMA 1BDGA 4H0OA 3WEEA 2GEMA 5AQRA 2ITMA 1GLFO 5KPZA 1ATRA 4CJ7A 2IVPA 3WXIA 3EN9A 3QBXA 4JD2B 2P9NB 3SMSA 1K8KB 4CI6A 2P9NA 3MDQA 2P9UA 2VYPA 2V7ZA 4IJNA 3I8BA 3ENHA 4BC5A 2E2PA 4H0XB 3CETA 3U9DA 3ZX2A 4BRGA 3GE1A 2KHOA 2FXUA 4M7YA 2E8AA 1NGAA 3CERA 4BG8A 4RWTA 4FWLA 3FFKB 1Q18A 4YDUA 5LJWA 4J8FA 3H46O 3CIPA 3QMLA 5AQVA 2YCHA 2QWPA 3QFPA 4MLEA 2VWBA 4JHDB 4WQ5C 3IFRA 4QS9A 5KPTA 3A5MC 3VEWA 3CJ7A 5AQQA 2Q97A 2YJFA 3J8AA 1IJJA 1T44A 3BF3A 3GBTA 4H5VA 1RDWX 4BR2A 3CJ9A 3EL2A 5TKYA 3M6GA 4EHUA 5B8HA 3ENOA 2HF3A 4B1ZA 5AQWA 5AFUH 1XQSC 5AQMA 4KBOA 4B1XB 1NGEA 2A41A 3VF6A 2YHXA 4CZEA 3OHRA 2GWJA 3B8AX 4BR4A 5EY4A 4BQLA 2ZF5O 5AQZA 3O8MA 1JCGA 1YVNA 3LDNA 3FGUA 5EX5A 1YUWA 3BF1A 2QWOA 4PKGA 4PKIA 4CZHA 4BGAA 3BUZB 4E1JA 3G25A 2IVNA 4MO4A 3VGMA 3VOVA 4WYBA 5BPMA 2CGKA 1YAGA 3H6EA 5AQUA 4B1UB 5AQFA 4EAHD 4H0VB 3QDKA 5AQGA 4BR9A 4I6MA 3EKUA 1NLVA 3M3ZA 5AFUA 3FR0A 3KHYA 4BVOA 3P4IA 3EKSA 3DXKA 1X3NA 1MA9B 4BC2A 2GELA 3RSEA 3C0BA 4H03B 2YI1A 1DGKN 2Q36A 2A5XA 4FOIA 5KQDA 1HJOA 3L6QA 4IO8A 1BA1A 4XEIA 4XH1A 5BRDA 4IWVA 5F2RA 3FZFA 3VGKA 4NB4A 1NGGA 5FPNA 3UE5A 3QB0A 1Y64A 4QS8A 2E20A 2P9KB 1MWMA 1QHAA 1SAZA 1HX1A 1C0FA 2P9KA 3O6WA 3ZX3A 4CBUA 3U9ZA 4FWQA 1JCEA 2E1ZA 4BRKA 2P9SA 2EWSA 4DQ8A 4FWOA 2I7PA 1V4SA 4PL7A 3H1QA 4CZJA 5FPDA 3CI5A 3WEEB 3MCPA 3HTVA 3MN5A 3SMPA 1NMDA 3MN7A 4ISEA 4CD3A 1CZAN 4BRCA 5F0XA 1S3XA 4HWIA 3ID8A 4M7XA 4BREA 1GLLO 2P9UB 3LDQA 4BRMA 3WUHA 4FO0A 4BRIA 1ZXOA 2PAVA 3C7NA 4PL8A 1C0GA 5BRFA 2ZGYA 2ASOA 1BA0A 2FF3B 2A40A 1QQMA 1OKJA 2P9IA 4O5FA 1HLUA 2AA4A 4RTFD 4WQ5A 4GY2B 2CH5A 3ZX0A 3D2EB 2Q2RA 3D2EA 2GUPA 3L0QA 4CZKA 5BREA 3VEZA 4A2AA 2QXLA 3LM2A 1GLJO 4MLHA 4FWNA 4BC4A 3W3DA 1XUPO 3JS6A 2A3ZA 5AQOA 1Z6RA 3FZHA 4XH5A 3VEYA 3ULEA 3O08A 3H1VX 3FLCO 3CQYA 3U4LA 4A61A 4BC3A 4BQZA 5AQPA 1HKCA 2OANA 1XC3A 3MN6A 3GOIA 1U2VA 2P9LB 5KPRA 2YJEA 2FSJA 3FZLA 2P9LA 4B1YB 4LC9B 5BPLA 2Q0RA 2NZTA 3BP8A 3LM9A 4BRQA 3AARA 3O5BA 2VCPA 5JMVA 1QZ6A 4QS7A 1KAXA 1JCFA 3U8XA 2CGLA 4FOEA 5FPMA 2H3GX 4K25A 4H5RA 2A42A 4BRAA 2D0OA 4BR7A 5F1XA 2J4RA 5CE3A 2V7YA 5AZIB 4BRFA 5BRHA 3M1FA 1BG3A 5AZIA 1BWFO 2ASPA 3DXMA 3WT0A 3MMVA 5AQNA 3O1BA 3ZETA 5KQ8A 1DKGD 3CJAA 5I9EB 1BUPA 2Q31A 3A0IX 3AAPA 3LL3A 5JICA 3JXUA 3F9MA 4I6MB 3FE1A 2AP1A 2HMPA 2NLXA 3LDPA 4WQ4C 3DAWA 3DJCA 1NGJA 1BOTO 1GLBG 5LJVA 3DXKB 1KAYA 4RCHA 4BRNA 3RSEB 1T6DA 3HI0A 4NO7A 4H0TB 2NRHA 2P9PA 3MK6A 3QBWA 4GNIA 2YHYA 4XH4A 1ESVA 1BU6O 2QWQA 2BUPA 4BR5A 4EHTA 3IMXA 2IIRA 1TYQA 3WXLA 5AQLA 5EOYA 5BN8A 1X9JA 3LDLA 3HBTA 3VEXA 3W0LA 4EFHA 4FSVA 5AQSA 2P9SB 5AQJA 1D4XA 3H3OB 2QW9A 1GLAG 4FWKA 5AQIA 1TUUA 3DWLA 2GTDA 4H5WA 5JLHA 4MO5A 3VETA 1HKBA 4K42A 1E4FT 4JAXA 2PBDA 3UKRA 1BO5O 3O1WA 1P8ZA 1RFQA 3O80A 5EXWA 3FZKA 5ADXH 3I33A 1NWKA 3D2FA 3C7NB 2GWKA 5ELZA 3TU5A 1LOTB 1ZC6A 2P9IB 3AY9A 2E2NA 1NGIA 1H1VA 1V4TA 2V52B 4H0PA 3SLCA 2E88A 4BRPA 1RGIA 4DHYA 1MWKA 5AQTA 4BROA 3S41A 3HSCA 4Y0WA 3ZEUB 3ZEUA 3EZWA 1ATSA 4JD2A 1K8KA 1GLCG 4IXCA 3ATUA 3FZMA 2D1KA 3ULEB 2E1YA 2ZGZA 4ISGA 4CZLA 5LY3A 1EQYA 1X3MA 2CGJA 1NGDA 4F9OA 2HOEA 1HPMA 1NGBA 1LCUA 5BPNA 5ADXA 2E2QA 1U2VB 3A5OC 3VGLA 2D4WA 5FPEA 3AAQA 2FSNA 1KAZA 2D0PA 4DB3A 3VESA 1HUXA 3VF4A 4CBXA 4BR0A 3UKUB 2Q0UA 3GG4A 3D7EO 3UKUA 4JHDA 3H3NO 4B1VA 3WQUA 4CBWA 3BEXA 4B9QA 5BR9A 3SK3A 1NM1A 5EVZA 4BRLA 4YDUC 4CZFA 2DPNA 3WQTA 2CH6A 3CJCA 3CHWA 2QM1A 1J6ZA 2HF4A 2V51B 2I7NA 4PKHA 5AZJB 2QWNA 3WXKA 4WQ4A 5AZJA 1R59O 3DXMB 3KZBA 3ZETB 4Z94A 4CZGA 4AM7A 3CJ1A 2FLOA 5JLFA 5AR0A 2WUSA 4DCHA 5AQHA 3VENA 4FWSA 1E4GT 3GDQA 2F9WA 3VPZA 3WXJA 3EO3A 2A6AA 1NGFA 4B1WB 3A5LC 1TUYA 3HZ6A 2BTFA 4FL9A 3IUCA 3VERA 4FWMA 2Q1NA 4JNEA 4K43A 4L3QA 4BGBA 3SJHA 4O8KA 1ATNA 2FSKA 1G99A 4AM6A 4BG9A 2YHWA 3IDHA 1HKGA 1Z05A 3HM8A 2P9PB 4FWPA 2E2OA 2IVOA 4HTLA 4IZ9A 5E26A 1YXQA 1GLDG 3R9PA 1QZ5A 2QWRA 1DEJA 4BVPA 2QWLA 4H5NA 4K41A 4CD1A 1S22A 1NGCA 4A62A 5BN9A 4BRDA 1QQNA 1TYQB 1WUAA 3R8EA 3VEVA 4CZMA 4BRHA 3GL1A 3VEOA 3CJBA 4IJAA 3TPQA 4CZIA 3L4IA 1QQOA 1KXPA 4FWRA 3QFUA 1WOQA 1IG8A 1SQKA 1U6ZA 2UYTA 3H45C 3QICA 3CQXA 4EIAA 4JN4A 4H0YB 1NGHA 3UKRB 3LDOA 5AQKA 4FPAA 5E84A 4A2BA 3ATVA 3KVGA 3MN9A 3VF2A 4C23A 1GLEG 2F9TA 3UB5A 3A8YA 2FF6A 2W41A 1T6CA 4M63C 3D2FB 4ISFA 4H5TA 3R6MA 1MDUB 4FPBA 1NBWA 3A5NC 2ASMA 5AQXA 5AQYA 2ZWHA 1SZ2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FDLA 1ZBSA 2WFBA 2O4GA 4KHYA 1GLFO 1ATRA 4CJ7A 4BY9C 4KB1A 1DLOA 4M3ZA 3HVRA 2P9NB 4CI6A 2VYPA 3ZSOA 4LF4K 3I8BA 1UA0A 5GADP 2OPSA 2AJQA 1X1PA 4B9TA 2E2PA 3L8BA 3P1GA 5M1PA 3DLGA 3T1AA 4Z4EA 4BG8A 4DSLA 1RBUA 4DG1A 1Q18A 1NOYA 2JWLA 4DV3K 4DSKA 2HVIA 2VWBA 4E19A 3IFRA 1WBBA 1NK8A 2GUIA 2P51A 1IJJA 3BF3A 2P5OA 1IH7A 4BR2A 2ZJRL 5TKYA 4EHUA 1TAQA 2HF3A 4B1ZA 3ISNC 1BCOA 2BDPA 3TAQA 1NGEA 2A41A 4I2QA 4LH4A 4M3WA 3SAHA 1BQNA 4CF1A 4BQLA 4LD0A 4KREA 1YVNA 3LDNA 4RW9A 4O5BA 1RDCA 1LV5A 3ZLJA 1KTQA 1JLGA 2OCEA 2VG5A 3I0SA 3BF1A 3PIOL 4PKIA 4BGAA 4E89A 3BUZB 4E1JA 4MO4A 3ZSVA 4EAHD 5MLCQ 4OLBA 3LP0A 2RHKA 3EKUA 5C24A 4CJ3A 4DQRA 3P4IA 3LDSA 1ILYA 1X3NA 1NK9A 3C0BA 4CK1A 1DGKN 4JLHA 2HHHK 1W0HA 3K5NA 2Y1IA 4YORA 3PY8A 1NMNA 1A5XA 4NXMK 4XH1A 1B92A 1NKCA 1KQSM 5J1EA 3NH0A 5F2RA 4H4OA 4NB4A 1GOBA 1NGGA 3K2PA 1Y64A 3M8QA 3VQQA 4CEZA 2E20A 4F3OA 1SAZA 2HW3A 3NE6A 4B3MK 1C0FA 3O9UA 3DM2A 1N34K 4KHUA 2VQFK 2HHQA 2RF2A 4PA1A 3OYHA 1IG9A 4OGCA 4FWQA 5KRSA 4FJ8A 5K14A 4BRKA 3MWPA 4AHRA 3HPGA 3MCPA 3HTVA 3CM5A 2G8IA 1Y97A 3SMPA 1NMDA 3MN7A 4N56A 1C1CA 3QERA 4DR4K 4M7XA 3PSIA 1GLLO 1HQEA 3OJSA 5C42A 3OYDA 2PAVA 4PL8A 1C0GA 4KHWA 4PQUA 4I7FA 5AJ3K 4DU4A 3RMAA 3KJVA 5DM7L 3HXMA 3DLLL 2AA4A 2WTUA 4E0DA 4IG0A 3D2EA 3ZSWA 4IOCL 4CZKA 5BREA 4B9NA 4IKFA 1VSLA 4FWNA 4JK7A 4FK0A 1N32K 3W3DA 3JS6A 1JLAA 4PHTX 1L3SA 1KVAA 3FLCO 3IG1A 4DQPA 1RCHA 3CQYA 4E7KA 4BQZA 5AQPA 1HKCA 1M90O 2B6AA 4DV6K 2P9LB 3T1YK 3IS9A 4W5OA 4DSFA 1HYSA 4DSIA 3BP8A 3LM9A 4BRQA 3WNEA 1XNQK 2I5JA 2VCPA 1J9AA 5IWAK 4CGDA 4W5TA 4GV3A 4Z4FA 4BDPA 2CGLA 4FOEA 1O1WA 4K25A 1HNIA 4H8KA 3O3GA 5F1XA 2FBYA 4ILGB 3K5OA 3D0PA 4ID5A 5BRHA 3Q7CA 4CK3A 5AZIA 4B3RK 3DXMA 5AQNA 4CEQA 4JS5A 4B9VA 2UXBK 3KWIA 1DTTA 4CEBA 4LF5K 4I6MB 2AP1A 2NLXA 4WQ4C 3M8RA 3DAWA 3DJCA 3F5TA 1T03A 1XMQK 2F8TA 4OPHA 4B9MA 4PWDA 1YVUA 4FVUA 4DR7K 1WSFA 3HI0A 4DTJA 4CGIA 1RT7A 2WBNA 3HO1A 3CD6N 3QBWA 2IAJA 4GNIA 3JYTA 1K73O 5LMNK 1NJWA 2BUPA 4BR5A 3PX6A 1RT2A 4CHOA 1HRHA 4BE0A 1TYQA 3OW2M 1CXUA 5AQLA 4FM2A 2YNGA 3AVGA 2NRZA 1X9SA 1LWCA 3HBTA 5IT9O 4FSVA 1F21A 2VWKA 4DTSA 2P9SB 3THXA 5DM6L 1S9GA 2G8FA 2YKNA 4K42A 1E4FT 1RDDA 3UKRA 1B9FA 1NNEA 5M1OA 4CJRA 3BY5A 1VQ6N 1LWFA 2RPIA 3I33A 3MCAB 2OPRA 4DU3A 5GIOA 5ELZA 4JEPA 2O4IA 1KVBA 2P9IB 1EO1A 1OH8A 1H1VA 2V52B 3OYJA 3DYAA 1X9WA 1C6VA 5AQTA 1HQUA 2KZMA 2P5GA 4Y0WA 4KH5A 2NRXA 4FW1A 4AHUA 4M3YA 3EEQA 3E66A 4C1NK 2YHAA 1I3AA 4LSLA 4FJNA 3QNOA 2ZJQL 3EY1A 2E1YA 5EU7A 4U67L 4E1MA 4ISGA 3HOTA 3THWB 4F9OA 2HOEA 1HPMA 1NGBA 2A1RA 4Z4IA 1U2VB 3A5OC 5FPEA 1KFDA 2IOCA 4OPJA 3AAQA 3V4IA 4JV5K 2FSNA 4DB3A 1SL1A 1K8AO 4N41A 3VF4A 4CBXA 4NCAA 4IO9L 3OYMA 3GG4A 3F2KA 4KTQA 3DRRA 4B1VA 3WQUA 4B9QA 2E6LA 1VSMA 3HK2A 3HP6A 4KAZA 1BI4A 4CZFA 5HLFA 3C95A 1EWRA 3CHWA 1RTHA 5I42A 2HB5A 2V51B 4M3XA 2I7NA 4LH5A 4BE2A 4WQ4A 5AZJA 1QSYA 3KZBA 3ZETB 3OS0A 3OYGA 3SUOA 4CZGA 2EX3A 3H08A 5AR0A 3E1YA 5GIPA 5AQHA 3GDQA 3VPZA 5CR4A 1YJNN 4JI5K 3CCMN 2A6AA 3ZSYA 4GV6A 2PFUA 3A5LC 3G4SN 3M5RA 3VERA 1BCMA 4FWMA 1ATNA 4FZXC 4O4GA 1G99A 4AM6A 2YHWA 4NLCA 3U3YA 1WSIA 3HM8A 4BWMA 2E2OA 5M1KA 5E26A 4KKOA 4KH4A 1T3VA 1GLDG 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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