1GLBG

Structure of the regulatory complex of escherichia coli iiiglc with glycerol kinase
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
496
structure length
489
Chain Sequence
KYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the regulatory complex of Escherichia coli IIIGlc with glycerol kinase.
pubmed rcsb
molecule keywords GLUCOSE-SPECIFIC PROTEIN IIIGlc
molecule tags Phosphotransferase
source organism Escherichia coli
total genus 155
structure length 489
sequence length 496
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1992-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
G PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
G PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1glbG02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1glbG01
3U9DA 4HWIA 3G25A 1GLLO 3C7NB 3D2FA 1NMDA 4BVOA 2UYTA 4BRKA 4RTFD 1U2VA 2YCHA 3BF3A 3O1WA 1JCGA 2HMPA 1X3MA 3VPZA 3B8AX 3DXKA 3I33A 5BPNA 4CBUA 3JS6A 2AP1A 1GLJO 1HKGA 3GL1A 2KHOA 3QFPA 4H5VA 5AZJB 2P9KA 3O80A 2YHXA 1GLCG 4FO0A 4M63C 2IIRA 3O5BA 2F9TA 1RGIA 3D7EO 2FXUA 3A8YA 5AQTA 4M7YA 2YJFA 4F9OA 4FWRA 4BRCA 1HKCA 4FSVA 4L3QA 1XC3A 1Z6RA 2V52B 2ZF5O 4IJNA 2OANA 3QDKA 3U8XA 5KPRA 5BPLA 5LJWA 2E1ZA 2BUPA 1TUYA 2YJEA 2P9PA 4XH5A 3EN9A 2QXLA 3IMXA 2P9IA 3ZEUA 2A42A 1CZAN 1TUUA 5BPMA 3ULEB 1HUXA 3W3DA 5EOYA 5AQUA 2P9LB 4K41A 2GTDA 2QWQA 1R59O 2P9UA 5EXWA 3RSEA 3U4LA 1BA1A 1SZ2A 3VOVA 2GWKA 3P4IA 4BRDA 1YVNA 5BN9A 2FLOA 2AA4A 1T44A 3CJ7A 4CZMA 4EHTA 3A0IX 1WOQA 4KBOA 4JD2A 2W40A 5AQWA 5AR0A 3VENA 3ZETA 1V4TA 3C7NA 3WUHA 1ZBSA 2QWMA 5ADXA 1HJOA 3H45C 4RCHA 5BREA 4AM7A 3L4IA 4A2BA 4CBWA 2ASMA 5AQFA 4FWQA 4ISGA 3UKUB 2A5XA 3SLCA 1C0FA 3SMSA 2A6AA 3FE1A 5AQZA 4PKGA 4CZLA 5AZJA 2CH6A 2CH5A 4CD3A 1ATSA 3M1FA 1NGHA 3MCPA 1SAZA 3FGUA 3FLCO 5EVZA 1GLDG 5AQIA 3DJCA 4WQ5C 2PAVA 4BQLA 4BC2A 4BROA 3FZHA 3MMVA 4MLHA 5BR9A 2QWOA 3ZX3A 2D1KA 3O6WA 3VGKA 3WEEB 4H0OA 2QWLA 3DXMB 4B1ZA 2E2OA 5AQPA 1NGDA 3ZX0A 1QQOA 1K8KA 3ULEA 4DQ8A 3MN6A 1QZ5A 3JXUA 1NGBA 5KPZA 2Q31A 3D2EB 1ZXOA 3LL3A 1BWFO 2ASOA 3BUZB 4PKIA 3S41A 4MO4A 5BRFA 5EX5A 3VEOA 3IFRA 4JHDB 4CZEA 1DEJA 1MWMA 1H1VA 5FPNA 4H0PA 4MO5A 2Q2RA 2D4WA 3ID8A 4BRLA 3M3ZA 4JAXA 1GLFO 2NZTA 3LDNA 5F1XA 5AZIA 4K43A 5AFUA 3I8BA 1OKJA 2WUSA 5F0XA 3TPQA 3SMPA 4ISFA 4WQ4C 4IXCA 1S3XA 3FZMA 4H03B 4FWPA 3A5LC 3CJ9A 4Y0WA 3QBWA 3HM8A 1DKGD 1D4XA 1IG8A 4PKHA 5AQHA 4O5FA 5AQMA 5FPDA 2D0OA 5B8HA 3VGLA 2PBDA 3L6QA 4XH4A 3VGMA 4B1UB 1T6DA 5CE3A 3ENOA 3EKUA 1NLVA 4A2AA 4BR7A 2VYPA 4EFHA 1BO5O 2VCPA 1IJJA 4BG9A 4FWLA 5AFUH 3LDLA 2FSKA 3R6MA 2HOEA 3KVGA 3O1BA 4BR4A 2ZGZA 4BR9A 1BA0A 1KAXA 2E2NA 4GNIA 2QM1A 1S22A 1XQSC 3MN5A 4JN4A 4QS8A 3WEEA 3C0BA 4BRGA 2CGKA 1X9JA 3DXMA 3H3OB 2E88A 2P9SA 4A61A 4BGAA 5AQLA 3CIPA 2Q97A 4IZ9A 4BRPA 2V51B 5TKYA 3AY9A 5LY3A 1QHAA 2ASPA 1NGFA 2HF4A 4K42A 4FPBA 4H5NA 3MDQA 4LC9B 1T6CA 4XEIA 4CZHA 2P9NB 3H1QA 2E1YA 1LCUA 3GE1A 2DPNA 2H3GX 4PL8A 5AQKA 4BRQA 3HZ6A 3W0LA 2FF6A 5BRDA 3FFKB 4BC5A 4JHDA 3A5MC 3CERA 1NBWA 3QFUA 3GDQA 4BQZA 4M7XA 3MN7A 4AM6A 3A5NC 1HKBA 1GLBG 2I7NA 4I6MB 4QS9A 2Q0RA 3HI0A 3H46O 3IDHA 3O08A 3O8MA 4BG8A 4WQ5A 3WT0A 4CI6A 1ESVA 3LDPA 4CZFA 2YHWA 3D2FB 3A5OC 4O8KA 4CZKA 2FSNA 4CD1A 3CJ1A 4CZGA 1BG3A 2D0PA 4NB4A 3MN9A 3VEYA 1NM1A 3FZLA 3DXKB 1YXQA 1JCFA 5AQYA 1HX1A 1Y64A 2IVOA 2NLXA 5ADXH 5FPMA 3HSCA 4Z94A 2P9KB 4K25A 4BRIA 4GY2B 4B1WB 4EIAA 3BP8A 5AQNA 3KZBA 3QICA 1YUWA 5F2RA 1U6ZA 3EO3A 4FWOA 2YHYA 5AQJA 3VEZA 3WXLA 1E4FT 3WXKA 3VF4A 3CJAA 2A3ZA 1X3NA 3CETA 2P9LA 4BVPA 2HF3A 2YI1A 5ELZA 3SK3A 4WQ4A 1MWKA 4PL7A 2P9PB 5AQQA 2E8AA 4H5TA 3UB5A 3BEXA 2P9IB 3ZEUB 5AQSA 4CZJA 2E20A 4CJ7A 4CZIA 4FWKA 4FPAA 5I9EB 2V7ZA 4B1XB 2P9UB 3MK6A 2A40A 2CGJA 3FZKA 3HTVA 3F9MA 3RSEB 2A41A 5KQDA 1NGIA 3DAWA 1MDUB 3DWLA 4BR5A 3BF1A 4XH1A 1HLUA 2I7PA 4BRNA 4FOIA 3LDOA 5E26A 1NGEA 1EQYA 3ZETB 3H1VX 2GUPA 4IWVA 3UKUA 3SJHA 4FWNA 2CGLA 2E2QA 1Z05A 3VERA 3FZFA 3VEXA 2NRHA 1DGKN 1QZ6A 1G99A 4H0VB 3CQXA 4H5RA 1RFQA 4BRFA 1ATRA 3UKRB 3CJCA 2QWPA 4YDUC 4FOEA 2W41A 3WQUA 2Q0UA 3WXJA 3H6EA 3VEWA 1JCEA 4C23A 2QWRA 3ENHA 3ATUA 3M6GA 1TYQB 5E84A 1LOTB 1BDGA 3GG4A 1QQMA 3VF6A 4IJAA 2GELA 5AQGA 4BREA 4DB3A 3J8AA 1SQKA 4IO8A 3QB0A 3VEVA 2VWBA 3GOIA 4FWSA 2ZGYA 4BRHA 4BRMA 4JNEA 4H0YB 2GEMA 3KHYA 1ATNA 2IVPA 3D2EA 1KAYA 1ZC6A 3LM2A 4BC3A 4MLEA 1E4GT 4QS7A 3EZWA 3CJBA 1K8KB 1GLEG 5AQRA 2F9WA 5BN8A 1YAGA 2FSJA 1NGGA 2Q1NA 3GBTA 3HBTA 1BOTO 2V7YA 5KQ8A 4A62A 4EAHD 4H0XB 5EY4A 5JLFA 4B1VA 2E2PA 3EL2A 4NO7A 1P8ZA 4H5WA 4FL9A 1J6ZA 5AQXA 3IUCA 1U2VB 3LDQA 5AZIB 3WQTA 4BR0A 4BGBA 5BRHA 3VF2A 4DCHA 3AARA 4WYBA 4BC4A 2ZWHA 5JLHA 5AQVA 2QWNA 4BRAA 3UKRA 1MA9B 4ISEA 3CHWA 1NGAA 3ZX2A 3VESA 4EHUA 5KPTA 1NGCA 5LJVA 4BR2A 3QBXA 3UE5A 3L0QA 1NGJA 2BTFA 3AAQA 1C0GA 1TYQA 3TU5A 2FF3B 3H3NO 4H0TB 3WXIA 5FPEA 1XUPO 1WUAA 3ATVA 3EKSA 5JICA 1HPMA 2IVNA 3U9ZA 3CI5A 4DHYA 1KXPA 1QQNA 5AQOA 4HTLA 3O4WA 1V4SA 4CBXA 2P9NA 2ITMA 1GLAG 2P9SB 2Q36A 1RDWX 3R8EA 3OHRA 2QW9A 1Q18A 3FR0A 3R9PA 1BU6O 2GWJA 4B9QA 2J4RA 3QMLA 3LM9A 5JMVA 4RWTA 3VETA 4B1YB 3AAPA 4YDUA 1BUPA 1KAZA 4FWMA 4I6MA 4J8FA 4E1JA 4JD2B 3CQYA 1NWKA 2EWSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DFPA 1VK0A 4HWIA 4FJ5A 3G25A 4FW1A 4G1QA 3SAHA 1GLLO 4CJ3A 2G8KA 2QKKA 3VQBA 1D9FA 4OKJA 2NRXA 1U2VA 1UA0A 3CYMA 3CFOA 4HUGA 2HMPA 3DLGA 3VPZA 5A2QO 3MEEA 2NRTA 3B8AX 4NCGA 4NYFA 2VGNA 3OYKA 1Q9XA 5BPNA 2AP1A 1HKGA 3QFPA 2P9KA 1VAZA 4M42A 3O80A 2IIRA 2F9TA 4DFJA 1JLAA 3RWUA 1CZBA 5AQTA 2FXUA 3A8YA 3CCLN 3P83D 1HNXK 1OH5A 3VQ7A 1WB9A 1HKCA 4FSVA 1XC3A 3NGIA 2V52B 3LANA 2OANA 3U8XA 2B6AA 3C6HA 3DLLL 4YORA 4DMNA 4DFKA 2BUPA 2YJEA 4FZXC 2O8DB 4OKKA 2O4IA 3O3GA 4DU4A 2KZMA 5KRSA 1TUUA 2EHGA 5EOYA 2P9LB 2XO7A 2UXCK 1TAQA 4FLWA 1SV5A 3OS1A 4B9SA 3THVA 3RSEA 3VQCA 3EY1A 1BA1A 3U6FA 1SZ2A 3VOVA 2UXDK 4BRDA 1WSFA 4CHNA 1DLOA 3A0IX 1WOQA 5AQWA 1K9MO 3CCJN 2NRRA 4GMJB 3THWB 1TKXA 3C7NA 3C94A 1RDDA 1RDAA 1HJOA 3H45C 4OPHA 4RCHA 4N47A 1Q8IA 2XHBA 3EEQA 5I3UA 1VQON 1NKCA 3E1YA 4IFEA 1BQNA 4FJ9A 3UKUB 3HJFA 3E66A 3IAYA 1C0FA 3KLHA 2VG6A 2I5JA 5C12A 1ATSA 3M1FA 1NGHA 3MCPA 1T05A 3R1XA 1SAZA 3BY5A 4F3TA 4CFBA 3WNGA 1KVCA 5EVZA 5AQIA 2PAVA 3MMVA 3VQ8A 5BR9A 3VGKA 1VQNN 3L2QA 3DXMB 3SPYA 1NOYA 4DR4K 5AQPA 3F9KA 3M8QA 2OPRA 3ZX0A 5DM6L 1QQOA 5C0YA 3MXJA 4ELTA 4CF0A 5KPZA 2Q31A 4NXMK 2ETJA 3N4PA 1BWFO 1KLMA 4KHUA 3S41A 4MO4A 3ZSZA 5EX5A 3V1QA 3KD5E 3QINA 1S9GA 1H1VA 2PYLA 2D4WA 1WAFA 2IC3A 3M3ZA 3PX0A 4DQIA 3AVKA 5F1XA 3ENBA 3AGKA 2WUSA 4IXCA 1TAUA 2GBZA 1KLNA 3FZMA 4DR5K 2KKZA 2P51A 4N5SA 5KI6A 3QBWA 2QI2A 3G10A 5FPDA 2D0OA 5CE3A 1T6DA 3LP3A 4LF8K 1NJWA 1RTIA 2VCPA 2ZJQL 2OA8A 4BG9A 1S1WA 3CFPA 3S3OA 2PYJA 1KAXA 1WBBA 3VQ5A 2QM1A 4JEPA 1J54A 1XQSC 3NAEA 1N36K 1TL1A 2E88A 2P9SA 4ILJA 4DV2K 1ITGA 3P39A 4BGAA 1JXBA 3AA3A 4IZ9A 4XIUA 2V51B 4CHYA 5CY4A 4HCCA 1T6CA 4CF1A 1BGXT 2FF6A 4DV0K 3HO1A 3K2PA 4E7LA 2ZM6K 3QFUA 4U67L 3GDQA 2X74A 5FDLA 1B92A 1HKBA 3CCEN 2YHBA 2HNZA 4DUYK 1GLBG 1HR0K 1WN7A 2JGUA 1WSEA 4W5QA 3HP6A 2LSNA 4WQ5A 4AHTA 4H4MA 2YHWA 4JKGA 1SL0A 4HTUA 3AVBA 3CJ1A 5KGXA 4C1NI 2IGIA 1NJXA 4I2QA 4NB4A 3MN9A 3VEYA 4OKEA 3OYAA 4W5RA 4DV6K 4OO1J 4Z94A 5GINA 4BRIA 4H8KA 4B1WB 1J9AA 3KZBA 1U6ZA 3K58A 3EO3A 3AA2A 4FXDA 2YHYA 3LAMA 1YJWN 2OPQA 3ISNC 4KHPK 3QERA 3WXKA 3OYBA 3KTQA 3LAKA 2A3ZA 2D0CA 4LD0A 2HF3A 2YI1A 1U47A 4PL7A 2BH1A 4KREA 2KZZA 4H5TA 4CJ5A 4FJGA 3RMCA 1IKWA 4JKDA 4CJKA 4AILC 3ZYYX 4KHNA 1JJ2M 1SL1A 1YTAA 5I9EB 3MAQA 3SQ4A 2V7ZA 4M3UA 4FM2A 2P9UB 1I39A 4DLEA 3FZKA 4HUEA 4B8CA 5KQDA 4DU1A 4EZ6A 4J2EA 3SPZA 1HLUA 1VRTA 1TKTA 1EQYA 2HB5A 1CZ9A 3LALA 3SJHA 1QTMA 2CGLA 1VHXA 1S1XA 3VERA 2UUCK 4Z4HA 2HBKA 4JK7A 2YKMA 1DGKN 1QZ6A 4F4KA 1TGOA 4CJPA 1UOCA 1VSDA 4H0VB 1IG9A 3OYNA 1VQMN 3UKRB 3CJCA 3LWMA 1D9DA 2W41A 3WQUA 1RTHA 2Q0UA 3HP9A 4CFAA 4DR1K 4CK3A 5C2FA 5DK5A 3DLKA 1EWRA 2FBTA 4CEEA 4DSKA 3ATUA 3M6GA 1T7PA 3VQ9A 2NRZA 3VF6A 3LPUA 4IO8A 3TAPA 3GOIA 3OYIA 2QK9A 4OLAA 3KHYA 4CHQA 3F73A 2IVPA 1K8AO 3D2EA 3NVMA 3V1OA 4M3WA 4MLEA 3HL8A 2VWJA 5KTQA 1S1UA 1ASWA 1K8KB 1GLEG 3SBGA 4M45A 2F9WA 1FKPA 1C1AA 5CYQA 1YAGA 4DS4A 3CPEA 4U7BA 5M1KA 1QSLA 2E4LA 4RW8A 4K8XA 4JS4A 1U45A 4FZYA 4JYAK 1EKEA 4KO0A 4FL9A 3IUCA 5AZIB 3E9OA 4BGBA 3AVHA 2WONA 4CGHA 4W5NA 4WYBA 2ZWHA 5JLHA 1HNVA 5AQVA 4O5BA 3KK1A 4OX9K 2B5JA 4KPYA 5J2QA 4Z4CA 3V1RA 4H4OA 1NGAA 3ZX2A 5KPTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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