1GLDG

Cation promoted association (cpa) of a regulatory and target protein is controlled by phosphorylation
Total Genus 160
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
160
sequence length
496
structure length
489
Chain Sequence
KYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Cation-promoted association of a regulatory and target protein is controlled by protein phosphorylation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUCOSE-SPECIFIC PROTEIN IIIGlc
molecule tags Phosphotransferase
source organism Escherichia coli
total genus 160
structure length 489
sequence length 496
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1994-03-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
G PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
G PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1gldG02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1gldG01
2YHWA 5BN9A 2V51B 1X9JA 5AQWA 3H1VX 3EKSA 1GLEG 2HOEA 2QWNA 3ENHA 5AQNA 3FZFA 4H5NA 2D0PA 2W41A 5EOYA 4BRKA 3OHRA 2A5XA 3A0IX 4ISFA 2CGKA 5AQLA 3AARA 1P8ZA 5BN8A 3O6WA 1C0FA 4AM6A 4GNIA 1BWFO 4B9QA 3GOIA 1TYQB 4ISGA 3VETA 1KAXA 4CZJA 2ZGYA 3ATVA 4JNEA 5AFUH 3S41A 4JN4A 1NMDA 1TUUA 3AAQA 1S22A 5KQ8A 3J8AA 1KAZA 3D7EO 3VEOA 3ZETB 4BG8A 3KVGA 2P9IA 1ATNA 2DPNA 1TUYA 5BPMA 4BR7A 3AY9A 1X3NA 3M3ZA 4B1UB 1NGHA 2V7YA 2Q2RA 5AR0A 2FLOA 3MN5A 3CQXA 1K8KB 5CE3A 1HKCA 5BPNA 4A2BA 4YDUA 1T6DA 2P9LB 2Q1NA 4BR9A 5AQSA 5AQUA 4LC9B 4BROA 5KPTA 1MDUB 3A5MC 2ZGZA 5F0XA 1NGJA 5E84A 4JD2A 1QQMA 3W0LA 1ZXOA 4FWMA 2IVPA 3SMSA 3VF6A 2P9IB 2ASMA 2E2PA 5AQPA 1NGAA 4CZIA 4CZMA 5JLFA 2NRHA 4XH5A 3A5LC 4I6MA 4JHDA 5ELZA 4DB3A 4XH4A 3FZMA 4IJNA 4PKIA 1GLFO 4CD1A 3ZX3A 3EKUA 1NGEA 1WUAA 1Y64A 4PL8A 3M1FA 1DEJA 3WXIA 3GG4A 2QWLA 3IMXA 2YI1A 1J6ZA 4XEIA 4BRDA 3D2FA 4RCHA 4B1VA 1SZ2A 1XC3A 4BRIA 4FOIA 4JD2B 4H0VB 5AQMA 4DHYA 3BF3A 1HJOA 2IVNA 4K41A 4CI6A 3EO3A 2J4RA 3WUHA 4PKHA 3KHYA 5LJWA 1GLAG 3WT0A 3GE1A 4I6MB 4JHDB 2NZTA 4BGAA 2V52B 2F9TA 2A42A 3D2EA 1GLDG 3MDQA 5AQKA 1BDGA 3QFUA 2QW9A 1U2VA 5AZJA 3W3DA 3CI5A 4CZHA 1DKGD 3A8YA 4BC4A 5EXWA 1E4FT 4H0TB 5AQZA 5AQTA 3VEVA 1GLBG 5AZIA 2P9NA 3ZETA 1QQNA 2H3GX 3H1QA 1NGIA 4EIAA 2P9UB 4A61A 4BRPA 2YCHA 3UKUA 1RDWX 3O1WA 2PAVA 3VGLA 1GLLO 4DQ8A 3BP8A 2QWRA 2HMPA 2IIRA 5AQHA 1OKJA 2E1ZA 4BR0A 3D2EB 1E4GT 3A5NC 4MO4A 3R6MA 4FWKA 1K8KA 4FWPA 1U2VB 2YHXA 2QWMA 3WEEA 4A62A 2P9LA 5AZJB 4CBUA 1EQYA 4FOEA 4O5FA 2A6AA 2GELA 4BRLA 3F9MA 3H6EA 3ENOA 1YVNA 1HPMA 3FLCO 3FZKA 2A3ZA 3I33A 3SMPA 3VENA 5AQYA 4BR5A 4FWLA 3H46O 5LJVA 5AZIB 3QFPA 4B1ZA 2ASOA 3LDNA 3MCPA 2P9NB 5EX5A 3O8MA 4WQ5A 4NB4A 3ZX2A 3BUZB 2GTDA 3UKUB 5BR9A 4FWRA 3R8EA 3DWLA 2VYPA 1R59O 4XH1A 5KQDA 1BU6O 1U6ZA 2Q0UA 4PKGA 1YAGA 3UKRA 2GWJA 5F2RA 4BQLA 3U8XA 2D0OA 4BR4A 2P9PA 2ZWHA 3IDHA 1XUPO 4H5VA 3SK3A 2QWQA 3CQYA 3WEEB 4M7YA 1NLVA 3AAPA 3WXJA 3O1BA 1QQOA 4KBOA 4JAXA 4IJAA 4EAHD 4EHTA 5EY4A 2YJEA 5B8HA 1JCGA 3U9ZA 4IO8A 3CJ1A 3VEXA 1BO5O 4FWQA 1BUPA 2GUPA 3FZHA 3QICA 5AQGA 5KPZA 4BRGA 3HBTA 4CZEA 4CZFA 3SLCA 4H0PA 4BGBA 3FZLA 3ZEUA 1DGKN 4H0OA 3UKRB 4BRMA 4MLHA 3EN9A 5JLHA 2P9PB 1ZC6A 3JS6A 5I9EB 1BA1A 2E8AA 3GDQA 1MA9B 2PBDA 2UYTA 3FR0A 3IFRA 1HUXA 2BTFA 3IUCA 3QBWA 4DCHA 2EWSA 1T44A 5TKYA 1GLCG 4FWSA 4BRCA 4BRQA 4H0XB 4YDUC 1JCFA 2P9UA 3DXMA 4WQ4A 5F1XA 4E1JA 3EL2A 5BRFA 4FPAA 3U9DA 1NGDA 3ZEUB 3VGKA 3L6QA 3VERA 2WUSA 2V7ZA 3O5BA 1BG3A 2QWOA 4F9OA 4MLEA 5FPDA 2YJFA 3MK6A 1NGCA 3O08A 4CZGA 1XQSC 3LM2A 1NBWA 2CH5A 3L0QA 4WYBA 3VF4A 4FWOA 5BPLA 4BC2A 4RTFD 5AQVA 3U4LA 1YUWA 4CZLA 1QZ6A 2VWBA 1RFQA 3CHWA 4QS8A 3QMLA 3G25A 3TPQA 1NGFA 5ADXA 4FPBA 2FF6A 2FSNA 4L3QA 3DXMB 2FSJA 4K25A 1ATSA 1LOTB 1IG8A 2KHOA 5AQQA 3CJCA 3A5OC 5BREA 1QHAA 3DAWA 2AA4A 2Q97A 4MO5A 1KXPA 3LDOA 3R9PA 2E1YA 3O80A 4K42A 2D1KA 3M6GA 4FO0A 3VOVA 3DXKA 3H3NO 5AQXA 3C7NB 3VF2A 5BRHA 1IJJA 2OANA 4IZ9A 4BRNA 4EHUA 1GLJO 1HLUA 3GBTA 3MN6A 1MWMA 1C0GA 1RGIA 1S3XA 3RSEA 4BG9A 1QZ5A 1V4SA 4BRAA 4H5WA 1BA0A 3BF1A 3WXKA 4H5TA 3CIPA 2CGLA 3VEZA 2D4WA 2GWKA 2A40A 2HF3A 4QS7A 4J8FA 1ATRA 4FWNA 2IVOA 3LDPA 2I7PA 3C0BA 3P4IA 3TU5A 1CZAN 3HZ6A 3B8AX 4HWIA 4B1WB 5AQFA 3DXKB 3HI0A 2E88A 1D4XA 3HSCA 1T6CA 1YXQA 2BUPA 3WQTA 4RWTA 2FSKA 3LDQA 3QB0A 1LCUA 4Z94A 4CD3A 1NM1A 3H3OB 5E26A 4BC5A 4CBXA 3RSEB 2QM1A 1KAYA 4EFHA 2ITMA 1Q18A 5FPMA 2ASPA 1SQKA 4Y0WA 3LL3A 5AFUA 5LY3A 2VCPA 3CJBA 3LDLA 1HKGA 4BC3A 4PL7A 4NO7A 4B1YB 3MN7A 1SAZA 3WQUA 2YHYA 3I8BA 3JXUA 3VEWA 4FL9A 3DJCA 3ID8A 3SJHA 4BVPA 4ISEA 4QS9A 4WQ5C 5AQJA 4IXCA 3O4WA 4IWVA 4CZKA 4H03B 3BEXA 2A41A 3CJAA 4K43A 4H5RA 1JCEA 4BREA 2AP1A 3QDKA 2P9SA 3FE1A 4CBWA 3CJ7A 3ULEA 1G99A 2P9KA 4GY2B 1WOQA 2Q0RA 3ATUA 1NGBA 1Z6RA 4O8KA 2W40A 3VESA 1H1VA 3CJ9A 1NWKA 2Q31A 4M7XA 2F9WA 3VEYA 2I7NA 5JICA 2ZF5O 1NGGA 1HX1A 2FXUA 1ESVA 5AQOA 4BVOA 2E2NA 3VPZA 3UB5A 5JMVA 2QWPA 2E2QA 3FFKB 3KZBA 2NLXA 3VGMA 4CJ7A 5ADXH 4BRFA 3EZWA 3L4IA 4HTLA 1HKBA 1MWKA 5EVZA 3C7NA 3CETA 3WXLA 2E20A 2CH6A 5FPEA 4M63C 4BRHA 3H45C 4A2AA 2QXLA 3QBXA 3MMVA 5AQRA 4B1XB 2P9SB 3LM9A 3GL1A 3HTVA 4C23A 5KPRA 4BQZA 3ULEB 2GEMA 2P9KB 3UE5A 3MN9A 2CGJA 2Q36A 3CERA 4BR2A 2E2OA 3FGUA 5BRDA 1V4TA 4H0YB 4FSVA 5FPNA 1TYQA 3ZX0A 3D2FB 4AM7A 3HM8A 2FF3B 1Z05A 1BOTO 1X3MA 2HF4A 1ZBSA 4WQ4C 5AQIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NGIA 3CCVN 1J5OA 1QS4A 2G8HA 3SZ2A 4KKOA 4CEZA 5EU7A 4DR4K 1Z25A 5AQNA 4CGGA 4H5NA 4NYNA 5DMRA 3VQ9A 4GV3A 1P8ZA 1C0FA 4AM6A 2Z1HA 4DU1A 4MDBA 4MFBA 1ZBLA 4ISGA 4F2SA 3VETA 4CZJA 2ZGYA 2HVIA 2B4JA 3G0ZA 5JVGL 5AFUH 3S41A 1LAWA 1NMDA 4JN4A 3S3NA 5SZTA 3AAQA 1S22A 4OVLA 5KQ8A 1KAZA 3SI6A 2HBJA 3NH0A 1EETA 4DTXA 4LH4A 3THVA 2E4LA 3K57A 4BR7A 4K8XA 4DFJA 1X3NA 4IG3A 1F21A 3HT3A 4B08A 4DS4A 3C95A 4B9SA 3J7AP 4N56A 4DUYK 1WAFA 4F2RA 1OVQA 1WLJA 5BPNA 1KFDA 1T3VA 4C8KA 2D5RA 3VA0A 3TANA 1TKTA 2P9LB 4GVEA 4CW7B 3KKSA 5KPTA 3WXMB 4OLAA 5I42A 4A59A 1TVRA 2ZGZA 4KTWA 1NKEA 4OO1J 1S1WA 3CCUN 2O8BA 5KRSA 4DFKA 1QQMA 3B6PA 4FJKA 1GOBA 2IVPA 2XY7A 2P9IB 2E2PA 1NGAA 1RT6A 3EE9A 3V9ZA 2NRHA 1NNEA 3AO3A 4XH5A 4F4KA 2IGIA 3A5LC 4KFBA 4I6MA 5ELZA 3SNNA 4DB3A 2FC0A 4E7JA 4IJNA 4B9LA 4YOTA 4DTPA 3M1FA 2ZJPL 1DEJA 1TKZA 1YTAA 3DRSA 1NK0A 2RF2A 4AHTA 1D9FA 3M8QA 3QESA 2IAJA 1J9AA 1SUQA 3PIPL 5CZ2A 1REVA 4DHYA 2D0BA 3J7YP 1RT3A 3TAMA 5HROA 4E7LA 3EO3A 4PKHA 3MXIA 3KHYA 5K14A 1S1XA 3O3GA 4YFUA 1GLDG 3MDQA 3RMCA 3S3MA 3RTVA 1T7PA 4O44A 1JLGA 4FLXA 4JI2K 1UAXA 4CZHA 4B3TK 5C2DA 2O8DA 1E4FT 3K58A 1YTUA 1KVAA 4FVUA 3DI6A 1SL2A 4A61A 2HVHA 3O9TA 3ZT0A 3VGLA 3RRHA 1EKEA 5DK5A 1VQLN 5J2PA 5GAGP 1N34K 3OVNA 4LFAK 3VQDA 4FJGA 3R6MA 3CYMA 4CESA 3CFOA 2QWMA 4DR6K 4H4OA 2VQEK 3CG7A 5CYQA 4IG0A 1L3VA 2P9LA 3H6EA 3K9KA 3FLCO 1QVFM 3CFRA 3SMPA 3VENA 4IOXA 2G8KA 2HNDA 3VQ6A 4B1ZA 3LDNA 3MCPA 3L2QA 5C2FA 4KH5A 3TTCA 3ZX2A 4DSIA 3V9WA 2X6SA 3BUZB 1WSIA 3P31A 3CCSN 4PA1A 1W97L 2VYPA 5KQDA 4FJ7A 2Y1IA 1NK7A 2GWJA 1GOAA 1VQ7N 3QEWA 3U8XA 4Y1DA 2ZWHA 1XUPO 4H5VA 4CEOA 3WEEB 3QINA 4M7YA 4CHPA 1UWBA 4JAXA 4E1NA 1KD1O 4KHQA 3OA9A 5B8HA 1JCGA 3E1YA 3SAFA 3CJ1A 4OJRA 1BUPA 2GUPA 3RWUA 4FCYA 3Q7BA 3KK7A 3NF9A 4BE2A 2QXFA 1BCOA 3SLCA 4KPYA 4IBNA 4DTOA 3UKRB 4MLHA 4CF9A 1S9EA 3AO4A 5JLHA 2HHSA 2OA8A 1ZC6A 5I9EB 1BA1A 4FJNA 1WSJA 3GDQA 1MA9B 3HM9A 1FK9A 5JVHL 4KI6A 4AQYK 4FJIA 1HUXA 1ZBHA 1VSIA 2EWSA 3LAMA 3ZSOA 4HUFA 3G4SN 3KKRA 4I9LA 1NJZA 4E7IA 2ZJRL 3TAFA 1JCFA 3NMUA 3P83D 3DXMA 4IFEA 5FLXO 2YNFA 4FPAA 3T19A 1IH7A 2WUSA 1S9GA 3AVKA 4FLWA 3HYFA 1BG3A 4HVJA 4J2AA 1K73O 3QNOA 5BPLA 3NBPA 4RTFD 3AVCA 4FLZA 5DM6L 2BE2A 3CHWA 4NYFA 4QS8A 2D0CA 3RR8A 4FPBA 2YHAA 2O8EA 1ATSA 3ULDA 1TK5A 5AQQA 3TTDA 4BWJA 4B9UA 2WFBA 4MO5A 1IBLK 1NJYA 3KLFA 4KHPK 3LP2A 1RCHA 1S6QA 5BRHA 3NVKA 1IJJA 1T05A 4IZ9A 4EHUA 3VA3A 5AJ3K 4DR2K 2PZSA 3K5LA 3ID6A 4BG9A 1TV6A 4JKGB 5CZ1A 3DLRA 1QSLA 2XY8A 4H5WA 4C8LA 1JLFA 3WNFA 3V1OA 2D4WA 1YHQN 2A40A 2RN2A 1TK0A 3SQ0A 2I7PA 1XI1A 1U04A 2F8SA 3P4IA 3TU5A 4DV3K 1NMNA 3B8AX 4G1QA 4HWIA 4B1WB 4X62K 3HI0A 3C6TA 1D4XA 4KHYA 4C8OA 5FDLA 4RWTA 1RT4A 3O3HA 3JYTA 4B9TA 2FSKA 3O3FA 4CJEA 1VRUA 2F8TA 5HRSA 3Q7CA 1ZBFA 1BGXT 4GMJB 4CK3A 2WC9A 2ITMA 1CZBA 5M1QA 4Y0WA 3PX4A 3THWB 4O55A 3LDLA 2WTUA 1HKGA 4BC3A 3NF8A 3MN7A 3JXUA 3OJUA 5GAHP 3DJCA 5M1NA 4FK2A 4CEFA 1B9FA 4JS5A 4DTSA 3HP9A 5AQJA 3O4WA 2UXCK 4KRFA 1EX4A 1KFSA 4CEDA 1LWCA 5M1KA 4K43A 1RT7A 1JCEA 3NVMA 4WFNL 4N76A 3FE1A 2OCEA 3CJ7A 5C25A 1G99A 2P9KA 1WOQA 1NGBA 4BWMA 3OS2A 2DFFA 3DLKA 4FZZA 3CJ9A 5JICA 5SWMA 1HX1A 1ESVA 1Q82O 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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