1GLJO

Escherichia coli glycerol kinase mutant with bound atp analog showing substantial domain motion
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
498
structure length
494
Chain Sequence
EKKYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSWTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIGTRIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structures of Escherichia coli glycerol kinase variant S58-->W in complex with nonhydrolyzable ATP analogues reveal a putative active conformation of the enzyme as a result of domain motion.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLYCEROL KINASE
molecule tags Phosphotransferase
source organism Escherichia coli
total genus 165
structure length 494
sequence length 498
chains with identical sequence Y
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1998-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1gljO02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1gljO01
4CJ7A 2YI1A 4FWPA 5EVZA 1X9JA 3FZMA 4H5VA 4Y0WA 1HPMA 1NGAA 1BUPA 3CHWA 2YHWA 3M1FA 1YAGA 4BC2A 1ATSA 3VEOA 2QWMA 4JD2A 1X3MA 3GDQA 3ZX3A 2IVPA 4H0OA 3VERA 1U6ZA 2Q97A 3UKUB 3AAQA 3LDOA 2E20A 3HM8A 2ITMA 4DB3A 5AQGA 4CZKA 1HLUA 2NZTA 4BRLA 3BUZB 1SZ2A 3H45C 4ISEA 3L0QA 1GLBG 3VGKA 4B1VA 4EHTA 4FWSA 3WXLA 1KAYA 4BVPA 4CZFA 1RDWX 3LDLA 3BF1A 3QMLA 5KPRA 4H0PA 1HKCA 5AQNA 3ZETB 3M6GA 4XEIA 4CD3A 3CJCA 3ENHA 3VGMA 5JLHA 2J4RA 1V4SA 3LDPA 3UKUA 4FO0A 3CETA 3L4IA 4BG9A 3D2FB 4H5RA 3VESA 3A5LC 5KQDA 2BTFA 1WOQA 4FOIA 3DXMB 5FPNA 5EY4A 1YXQA 2E8AA 1NLVA 1JCFA 2V7YA 3AY9A 4DHYA 3LM2A 1T6CA 1D4XA 4PL7A 2ASOA 1IJJA 3WQUA 3ZETA 1YUWA 3VPZA 3WXJA 3O1WA 2OANA 1SQKA 1C0FA 4CZLA 3EL2A 3CJ9A 1Y64A 3VEXA 3A8YA 2VYPA 4JNEA 5F1XA 2D0OA 1C0GA 4CBUA 5B8HA 3VF4A 1ZBSA 4YDUC 4FWQA 2V51B 3WEEB 3U8XA 4IO8A 4CBXA 1NGBA 1T44A 2P9UB 4BR2A 3KHYA 3M3ZA 3R6MA 2FSKA 3EKUA 4H0VB 5AQSA 4B1WB 2V52B 3HBTA 3D2EB 2WUSA 5BRDA 3GOIA 1ATRA 4A62A 4B9QA 3CQYA 5AFUA 2VCPA 3ATUA 1U2VA 2ZF5O 3WEEA 4L3QA 1MWMA 4CI6A 3ULEA 1NGFA 3HSCA 5AQHA 2D4WA 1JCEA 3GL1A 3AAPA 4I6MA 2YHYA 4H0TB 1P8ZA 5BR9A 4IJAA 1KXPA 1GLAG 3SJHA 1WUAA 2P9NB 5AQIA 3QFPA 5AQVA 5ADXH 4M63C 2ASMA 3ATVA 3DWLA 4KBOA 5AQMA 5AZJB 4CZEA 3EN9A 2ZGYA 4O8KA 4BQZA 3ZX0A 3ENOA 4FWKA 3CI5A 1NGGA 2EWSA 2F9TA 2QWOA 4BRMA 1XQSC 3VEVA 1KAXA 2P9SB 1HUXA 4FSVA 2Q36A 3A0IX 5AQOA 1ZC6A 5LY3A 1QQNA 3D7EO 3QB0A 4BRQA 4QS8A 1GLCG 2E2PA 4JAXA 2QM1A 5AQFA 1QZ6A 2P9NA 4LC9B 1GLFO 3H1VX 5AZJA 2E2NA 3SMPA 2CGKA 5EXWA 3EKSA 2HOEA 3H1QA 4WYBA 4QS7A 4E1JA 5KPZA 5FPEA 3H6EA 3A5NC 1NGDA 1DEJA 4J8FA 3H3NO 5FPMA 3CIPA 3O80A 2GUPA 1K8KB 4FWLA 4XH1A 2Q31A 4DCHA 1XUPO 3ZX2A 4BRKA 1ATNA 4A2AA 1QQOA 3UE5A 2CH6A 1BG3A 3WQTA 3HZ6A 3FZLA 4CZHA 2AP1A 3BP8A 2FSJA 3VETA 3VF2A 2A3ZA 2D1KA 3ZEUB 2CGJA 4K25A 1QHAA 1HKBA 3CJ7A 4YDUA 4FOEA 1BWFO 3HI0A 1TUUA 4BG8A 5E26A 1KAZA 2IVOA 3UKRB 1GLEG 3RSEB 4QS9A 4Z94A 3O08A 2A41A 1NM1A 4FWOA 5AQLA 1S3XA 2P9LB 1BO5O 1IG8A 1LOTB 1HKGA 3H46O 3CJ1A 3VOVA 3EZWA 3EO3A 5AQJA 2I7PA 2QWPA 4FWNA 3D2FA 2H3GX 3HTVA 3JXUA 5F2RA 3LM9A 3R8EA 3DXMA 2QWNA 2W41A 4EAHD 3FE1A 2IVNA 3VEYA 1TUYA 3L6QA 2GWKA 4DQ8A 3FFKB 3O5BA 3TU5A 1XC3A 1NBWA 5AQYA 4F9OA 5ELZA 4EHUA 5AQQA 4BC5A 4CZGA 3FLCO 2P9LA 4CBWA 4HTLA 4WQ4A 5BN8A 2FF3B 3VEWA 3CJAA 4IWVA 4BC3A 4GNIA 4WQ5C 2YHXA 3H3OB 2E88A 1EQYA 2VWBA 3MCPA 3AARA 3UB5A 4IXCA 2E2QA 4ISFA 4FL9A 1NGHA 5E84A 3W0LA 3A5MC 5BPMA 2P9UA 2FSNA 2F9WA 3P4IA 3BF3A 2A40A 5AQUA 4MLEA 5AFUH 5LJVA 3GG4A 2DPNA 3SLCA 5AQPA 2GTDA 1NMDA 3DXKB 3F9MA 4CZIA 3QFUA 1DGKN 4H0XB 3U9ZA 3D2EA 2KHOA 4WQ4C 5EOYA 2P9KB 3OHRA 2D0PA 2FLOA 4BR5A 1BA1A 5BPLA 1MDUB 2NRHA 2ASPA 3QDKA 3R9PA 4FWMA 4BRCA 1QZ5A 1QQMA 3WUHA 5BPNA 4BROA 4GY2B 4H5WA 4C23A 2AA4A 3JS6A 4H0YB 1LCUA 4B1UB 4BRPA 4PKGA 5AZIB 5I9EB 2QWLA 4AM7A 3FZFA 3S41A 4PL8A 3O6WA 5AQZA 3KVGA 2HF3A 3BEXA 1S22A 5AQKA 4H5TA 3A5OC 4B1ZA 3TPQA 3G25A 1ZXOA 4H03B 4JD2B 2NLXA 3C7NB 3SK3A 3WXKA 3LDQA 4MLHA 3FZKA 5FPDA 2QW9A 4FWRA 2CGLA 5BRHA 3VGLA 3B8AX 4BR9A 4BQLA 5AZIA 4NO7A 1OKJA 2GWJA 2P9SA 2HMPA 3MN5A 4PKIA 3MMVA 3QICA 4CZJA 2GEMA 5AR0A 3CQXA 4ISGA 1NGIA 3FZHA 4CZMA 3C7NA 3ID8A 4XH4A 1SAZA 3U4LA 3MN6A 3CERA 5AQXA 3LL3A 3WXIA 1V4TA 1DKGD 5BN9A 2P9IB 5AQTA 1NWKA 3QBXA 4FPBA 5AQRA 3O1BA 1CZAN 5EX5A 4IZ9A 4AM6A 5BREA 1GLLO 5KQ8A 1J6ZA 2QWQA 5AQWA 1K8KA 1E4FT 2CH5A 2Q0RA 2ZGZA 2QXLA 3IMXA 3GE1A 2YJFA 1G99A 2I7NA 3W3DA 3IUCA 3FGUA 2UYTA 4BVOA 2A5XA 1GLJO 4BRNA 4WQ5A 1YVNA 1R59O 2ZWHA 3ZEUA 1MWKA 1MA9B 2P9IA 1RGIA 3MN7A 1BDGA 3WT0A 2FXUA 5F0XA 4BGBA 2A6AA 2PBDA 4BRIA 4BR4A 4CD1A 3MN9A 5BRFA 3I8BA 3UKRA 3VEZA 3RSEA 1NGEA 4JHDB 2W40A 3MK6A 3LDNA 1T6DA 3O8MA 2P9PB 4BGAA 3VF6A 3FR0A 1HJOA 3CJBA 4JN4A 1JCGA 4BRHA 3C0BA 4A61A 4PKHA 4BR7A 3J8AA 4BC4A 4BRFA 1ESVA 5CE3A 3KZBA 5LJWA 1TYQB 2YJEA 1U2VB 1BOTO 4NB4A 2E1YA 5TKYA 1BA0A 4B1YB 3IDHA 4BR0A 4K41A 3ULEB 4K43A 3SMSA 4A2BA 1BU6O 4JHDA 3U9DA 4BRAA 3MDQA 4RWTA 1Z05A 1GLDG 2P9PA 4I6MB 3VENA 1NGJA 1Z6RA 3QBWA 4K42A 4B1XB 4H5NA 3DAWA 1TYQA 4IJNA 1HX1A 1Q18A 4BRDA 2HF4A 2E2OA 4RTFD 2Q2RA 2GELA 1X3NA 4BREA 5KPTA 4HWIA 2FF6A 4M7XA 5ADXA 3O4WA 4FPAA 4EFHA 2A42A 2IIRA 3I33A 3DJCA 3DXKA 4O5FA 2Q0UA 2V7ZA 2Q1NA 4MO4A 5JMVA 4MO5A 4RCHA 4BRGA 2YCHA 1RFQA 4EIAA 2PAVA 5JICA 2P9KA 4XH5A 1E4GT 2BUPA 4M7YA 1H1VA 3GBTA 5JLFA 2QWRA 1NGCA 3IFRA 2E1ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CJ7A 4DR7K 5EVZA 3TR8A 1X9JA 4C8OA 4CEAA 2HHXA 1HPMA 4FK0A 3CHWA 4BC2A 1QVFM 1ATSA 3NHGA 4DS5A 2WC9A 1HQEA 4H4MA 4I2PA 2Q97A 3P1GA 2X6NA 3LDOA 2ITMA 4KH4A 4DB3A 5AQGA 4ILHA 3VQAA 4ISEA 1O13A 1EWRA 4GV6A 4CF8A 1VQ8N 3WXLA 1KAYA 5CYQA 3I55N 3BF1A 1VQPN 4F8RA 1WSJA 3M6GA 3ENHA 4E1MA 3VGMA 5JLHA 3SUOA 3F9KA 3LDPA 1VSIA 3UKUA 1C1BA 4ICLA 3VN5A 3SQ1A 4WFBL 1IBLK 3THVA 3KLEA 1QTMA 1WOQA 3HVTA 4CGHA 1YXQA 4KREA 1VHXA 3IS9A 4DHYA 3QEIA 3OY9A 3HXMA 4PL7A 1NU0A 5FLXO 2ASOA 1KTQA 3KLFA 2KFZA 4BDZA 4FW1A 1NOYA 3EL2A 5HLFA 4JNEA 4M45A 3ULDA 3VF4A 4IG3A 2V51B 1RT1A 3ZSXA 1NJIO 4CJPA 3OJUA 4CBXA 2G8HA 1T44A 4FK2A 3KHYA 1LWCA 3ISNC 3EKUA 4WF9L 4B1WB 4DMNA 2Z1HA 3OYCA 4B8AB 3HBTA 4PHTX 4GMJB 1VQKN 1IV0A 1KFDA 3VMFB 4DU1A 3CQYA 3SAHA 3CCUN 1YTUA 4K8XA 4LFBK 1XMQK 1VQ9N 1MWMA 1M1KO 4FM1A 1JLGA 4O8UA 3L2RA 3HSCA 1L3VA 1XHZA 4JV5K 4IJAA 1KXPA 3VQQA 1S1XA 1OVYA 1WUAA 2JGUA 2HHVA 1VSJA 1X1PA 5AQVA 5AQMA 2DY4A 2ZGYA 1EP4A 1VSLA 3SNNA 3DOKA 3ZX0A 3ENOA 4DTJA 2D5RA 1TKTA 2EWSA 2F9TA 4BRMA 3U6FA 3CD6N 1OH8A 1KQSM 4CHPA 1IKYA 4IFEA 3E66A 1ZC6A 3N4PA 3D7EO 1XC9A 4FJIA 4LF8K 4YOUA 3NGYA 3DRSA 1FW6A 3ZSRA 1XNQK 4WYBA 3H1QA 5C25A 1HNXK 4QS7A 5FPEA 1NGDA 4J8FA 1RILA 1YIJN 5FPMA 4M3TA 3CIPA 3O80A 3PSIA 2E6MA 4XH1A 2Q31A 1KFSA 3ZX2A 1VSHA 1VQ7N 1J53A 1NNEA 3HK2A 3UIQA 4CJWA 1UWBA 4A2AA 1QQOA 3EYZA 1A5WA 3BP8A 3WNEA 3RMBA 4Z4IA 3RMDA 1QE1A 3T69A 4DTXA 1D9FA 4E7IA 4OPHA 2A3ZA 1UA0A 4CFCA 1NG9A 4FJ7A 4CJFA 3THXB 3L4QA 4YDUA 1FJGK 3G71N 3UKRB 5E26A 1KAZA 2IVOA 2R7YA 1VQNN 3O08A 1D8YA 2KZMA 1BGXT 1NM1A 2E4LA 4DFPA 5AQLA 2O8BA 1S3XA 4HUEA 3NF6A 1BO5O 1LOTB 3HJFA 4KHSA 1NK6A 3CCEN 2YNFA 3EO3A 2I7PA 3OA9A 4DTNA 3JXUA 2BDPA 1QQCA 1W2BM 2NNWA 3DXMA 3LANA 1VQON 3OYGA 4DV4K 2W41A 4MDBA 3K2PA 3VEYA 1BCOA 1K9MO 1J5EK 4JK8A 1JLFA 4DU3A 3PO5A 3TU5A 4E0DA 3OTOK 4F9OA 4EHUA 1LAWA 4BC5A 4CZGA 4WQ4A 4CHZA 3CJAA 3KKRA 4KTWA 2YHXA 3C6AA 4FZZA 2Y1JA 2HHUA 3KD5E 2E2QA 3OW2M 2GBZA 3ZSQA 5E84A 5J2MA 4KAZA 2P9UA 2FSNA 2F9WA 1NK9A 3BF3A 4KRFA 5FDLA 4MLEA 1J5OA 3F9MA 3QFUA 1DGKN 1U49A 4H0XB 3U9ZA 3D2EA 4WQ4C 3OYDA 3OYJA 2VQEK 3ZT2A 5M1FA 1EXQA 1HQUA 3OHRA 4BR5A 1ZBFA 2KLAA 4FWMA 4BRCA 3WUHA 5BPNA 4GY2B 3Q7BA 3ZT3A 1N33K 1ZBIA 4WCEL 1LCUA 4BRPA 3VQ4A 3FZFA 4CIEA 3S41A 2QTDA 4LF5K 1R0AA 4Z0UA 4H5TA 3SBGA 3A5OC 4B1ZA 3G25A 4JD2B 4IG0A 3LDQA 4CECA 5FPDA 4DR1K 1P90A 3O4QA 4FCYA 3N4QA 2W42A 2CGLA 1VQ6N 3RRGA 4BR9A 4J2AA 3L2UA 3QO9A 4NO7A 3ZT0A 1OKJA 3ZSOA 2P9SA 1HYSA 2O8CB 5LL6Z 4PKIA 5GIPA 1VSKA 3QEWA 1NGIA 4R5PA 4PY5A 2NRRA 3ID8A 4XH4A 4Z4GA 5HRSA 1S1TA 3M5RA 1W97L 1HR0K 2F4VK 1RBVA 3O3FA 3KK2A 3CPEA 4DSJA 1J54A 4FZYA 3O1BA 5BR8K 4GV3A 1WN7A 4JEPA 4ZTFA 5AQWA 3HP6A 1HNZK 1J9AA 5HRRA 2O8FA 2WONA 2I7NA 1VQLN 3CC4N 4BVOA 2A5XA 4YFUA 1GLJO 1S1VA 4BRNA 4HHTA 4FW2A 4CJ4A 3HOSA 4CW7B 1MWKA 4F2RA 1RGIA 1BDGA 3V9SA 5F0XA 4BGBA 2A6AA 2WOMA 4JK9A 4KB0A 4BR4A 3ALYA 3SI6A 3MN9A 1EX4A 4CEZA 1YF5L 3K9JA 1LWEA 1T6DA 4CEQA 3PV8A 2BANA 1KVCA 3RVCA 4DSKA 3VQDA 4A61A 4U67L 1KLMA 3DLRA 3J8AA 2F8TA 1TVRA 3V1QA 1ESVA 5CE3A 3KZBA 4NLBA 1U47A 5LJWA 1ZYQA 2YJEA 1X9SA 1IG9A 2YV0X 3DLBA 3KLGA 2HBLA 2YKMA 3G4SN 4I2QA 4JS4A 2HHWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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