1HKBA

Crystal structure of recombinant human brain hexokinase type i complexed with glucose and glucose-6-phosphate
Total Genus 334
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
334
sequence length
899
structure length
899
Chain Sequence
DDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGVEGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLGVEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLTKDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The mechanism of regulation of hexokinase: new insights from the crystal structure of recombinant human brain hexokinase complexed with glucose and glucose-6-phosphate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords D-GLUCOSE 6-PHOSPHOTRANSFERASE
molecule tags Phosphotransferase
source organism Homo sapiens
total genus 334
structure length 899
sequence length 899
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 1997-12-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hkbA03
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hkbA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1hkbA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1hkbA04
2NRHA 4FL9A 1GLEG 3GDQA 3QBWA 1DKGD 2V52B 1GLAG 3HZ6A 2FSNA 3EKSA 2A42A 2BUPA 4Z94A 5EOYA 2AA4A 4C23A 4BR7A 4NO7A 4BVOA 2W41A 1SAZA 2ZGZA 4PKIA 2E1ZA 2PBDA 4B9QA 4FSVA 3CJ9A 3O8MA 1HKGA 4IJNA 5AQHA 2QM1A 3L4IA 4K42A 1YVNA 2AP1A 2FXUA 4JN4A 2QW9A 4MLEA 3SJHA 3ENOA 3ULEA 2UYTA 3ZX0A 4BR9A 2FF6A 2FSJA 4FWMA 4IWVA 1T6CA 4IXCA 1YUWA 3C7NB 4I6MB 4KBOA 2Q97A 2ZF5O 3AAPA 4AM6A 3QICA 2Q31A 4JNEA 1BG3A 5AQZA 1S22A 3LDQA 5KPRA 1V4SA 3FFKB 3AAQA 5LJVA 2HF4A 4FPAA 4BRMA 2A41A 3A5OC 4WQ5C 5BREA 4BQLA 1ZBSA 4M63C 5KQDA 5AQPA 1TYQA 3M3ZA 4B1UB 4H5VA 3LL3A 1ZXOA 5AQYA 2ASOA 3ZEUB 4FPBA 3TU5A 1LCUA 4CZKA 1KXPA 3WXJA 4BRCA 1RGIA 3LDLA 3ATUA 3U9DA 1X3NA 3H3OB 1NGHA 3VF2A 2I7PA 2V7ZA 5JLHA 4CZEA 4GNIA 4IZ9A 4JAXA 3EZWA 4JD2B 2P9PB 5AQQA 3IMXA 3R6MA 3VF4A 5KPZA 4ISGA 3S41A 3A0IX 1XQSC 1ESVA 4XH5A 5AQTA 1QZ6A 1RDWX 4CD1A 5BPLA 3D2EB 4EIAA 1JCGA 1WOQA 3F9MA 4RWTA 2YHYA 4H0PA 2NZTA 5FPEA 2ZWHA 3MN7A 2QWLA 1K8KB 3IUCA 4M7YA 1SZ2A 4H0TB 5AZJB 4CJ7A 4A61A 3O6WA 5F1XA 1MWKA 3L0QA 2EWSA 2YI1A 1NGDA 3VEVA 1S3XA 2E2QA 2YHWA 1Q18A 4BROA 2Q0RA 2E20A 5EXWA 5BPMA 3DXMB 1JCFA 4GY2B 2P9KB 5AQXA 2IVOA 4BRDA 2DPNA 5AQRA 3B8AX 2Q0UA 2E2OA 1NGGA 1QQNA 2YCHA 2CGJA 3OHRA 5F2RA 2IVNA 5AQKA 2D1KA 4H0XB 4BRHA 2V7YA 3C7NA 5AQLA 1BOTO 4CZFA 2H3GX 4QS9A 1QQOA 2A3ZA 1ATNA 3HTVA 4H03B 3WXIA 4BGBA 2GELA 5KPTA 3MCPA 3D7EO 1HX1A 4PL7A 1TUYA 4PL8A 3GOIA 2QWNA 5AQGA 2E1YA 2W40A 3UB5A 3ZETB 5KQ8A 1E4FT 1BDGA 1U2VB 3I33A 4BC5A 3O80A 3EO3A 3EKUA 2GUPA 5LJWA 3MN6A 4RTFD 3JS6A 1NLVA 4BGAA 3VERA 3R9PA 2CGLA 3LM9A 1IG8A 4FWSA 4BC4A 3ZEUA 3CERA 1GLFO 2QWMA 4FWNA 2YJEA 3DXKB 3KHYA 3UE5A 3U8XA 5BR9A 3W0LA 5FPMA 5JLFA 4BREA 1GLDG 4JHDB 4B1XB 2P9LB 3VGMA 1YAGA 1NGEA 2FSKA 4YDUA 4B1WB 2GTDA 3ZX3A 3UKUB 2V51B 3MMVA 4JD2A 2P9PA 5AQUA 4Y0WA 3I8BA 5BPNA 3BUZB 1QHAA 3GG4A 4HTLA 4DCHA 2QWRA 3UKRB 3D2EA 3EL2A 1KAZA 4J8FA 4BRKA 4BRGA 2NLXA 1NGJA 2P9NB 3VETA 5AZIB 2E2NA 5AFUH 2HMPA 4B1VA 4H5NA 3VEZA 1K8KA 1D4XA 5AZJA 3O1BA 2ITMA 4CBUA 1TUUA 3A5NC 2I7NA 5AQNA 3WQUA 1C0FA 1WUAA 3VENA 3O4WA 5FPDA 1R59O 4A62A 3L6QA 4BRIA 4IJAA 5ADXH 1GLLO 1NWKA 3DXMA 1ATRA 4MO5A 3KVGA 2ASMA 2P9KA 3ID8A 1SQKA 3MN9A 2A6AA 5E26A 1BUPA 1NMDA 4FWRA 1BU6O 3VPZA 1BA0A 4BRQA 5BRFA 4WQ4A 1C0GA 3MK6A 4HWIA 3AY9A 4LC9B 1NGIA 4B1YB 1G99A 3WEEB 1BA1A 2Q1NA 1HLUA 1QZ5A 3MN5A 4K43A 5LY3A 3G25A 1HKCA 3FLCO 4BRNA 2J4RA 3FR0A 5ELZA 4M7XA 3FZFA 5AQWA 3ZETA 2VYPA 3QMLA 1NM1A 4FWOA 3VEXA 3WUHA 1J6ZA 2QXLA 1U2VA 2YJFA 3HSCA 4H5WA 3SK3A 2QWPA 3WQTA 4ISEA 5AQIA 2IIRA 4DB3A 2E88A 4CZMA 4DQ8A 1QQMA 3VEYA 5FPNA 1NGCA 5AQVA 2HF3A 4CZJA 1BO5O 4YDUC 5AR0A 3WXKA 2ZGYA 1HUXA 3FZMA 4A2AA 4XEIA 4BR5A 3DXKA 2BTFA 4H0OA 1YXQA 1MA9B 3GBTA 4IO8A 3TPQA 3VEOA 4CBWA 3QFUA 3CJBA 2A40A 4JHDA 3RSEB 1KAYA 2P9LA 1XUPO 1V4TA 5E84A 2P9IB 3DJCA 3U9ZA 4XH1A 3CI5A 2E2PA 4EHTA 2GEMA 5AQFA 3UKUA 4CZIA 4FWLA 4E1JA 5EX5A 2FF3B 2QWQA 4FOIA 4QS8A 3W3DA 3BP8A 1Y64A 3MDQA 4NB4A 4XH4A 2P9UB 5B8HA 5AFUA 3FZLA 3UKRA 3BF1A 3D2FB 1LOTB 1NBWA 2P9SB 1ATSA 4MO4A 3LDOA 1U6ZA 3CQXA 2P9NA 5AZIA 4H5TA 1BWFO 1HKBA 4CD3A 3CIPA 4PKHA 1T44A 5JMVA 3H45C 4DHYA 4L3QA 4AM7A 3ZX2A 4CZLA 5ADXA 3IFRA 2YHXA 3FZKA 3LM2A 1Z6RA 4H5RA 2E8AA 2GWJA 4EHUA 5I9EB 1T6DA 4BQZA 3KZBA 4WQ4C 3DWLA 3WXLA 4O8KA 3EN9A 4FWKA 2A5XA 2OANA 2Q2RA 2CH5A 3O08A 4EAHD 4FWPA 3VEWA 3FGUA 1X3MA 1MDUB 4BR4A 3CQYA 3M1FA 3O5BA 3VF6A 5CE3A 3H1VX 2PAVA 5F0XA 1HJOA 2IVPA 2CH6A 1E4GT 2F9WA 3CJ1A 3FZHA 3JXUA 4BG9A 3SMSA 1MWMA 1XC3A 3A5LC 4BR0A 3HM8A 3M6GA 3WEEA 1NGFA 2GWKA 3ULEB 3HI0A 3ATVA 4A2BA 1Z05A 3H6EA 3WT0A 2VCPA 1ZC6A 3SLCA 3FE1A 3VESA 3IDHA 3CJCA 1EQYA 4QS7A 3A5MC 1DGKN 5BN9A 1DEJA 3H3NO 1HPMA 3H1QA 4BRPA 3J8AA 3C0BA 5BRHA 3HBTA 5BN8A 3LDPA 2QWOA 4FO0A 3QFPA 4WYBA 5JICA 1GLBG 4EFHA 1OKJA 2FLOA 1P8ZA 3U4LA 2HOEA 2ASPA 4F9OA 4H0YB 3SMPA 4CZGA 1IJJA 3O1WA 5AQSA 4BC2A 3P4IA 2F9TA 1X9JA 4BR2A 3VOVA 3LDNA 1TYQB 5EY4A 3VGLA 1JCEA 4PKGA 3RSEA 3CJ7A 3BEXA 3ENHA 2D0PA 4MLHA 1RFQA 1NGBA 2P9IA 2VWBA 3CJAA 2Q36A 4ISFA 4K25A 4O5FA 1KAXA 4WQ5A 2D0OA 3QBXA 4RCHA 3QB0A 4BRFA 3BF3A 5EVZA 1GLCG 3AARA 4BC3A 4H0VB 3DAWA 4BRAA 5BRDA 2D4WA 1GLJO 3H46O 2P9UA 3R8EA 3CETA 3D2FA 1H1VA 2KHOA 2P9SA 2WUSA 4BG8A 1NGAA 2CGKA 3A8YA 3GL1A 5AQJA 4BVPA 4FOEA 4K41A 3VGKA 4CI6A 3CHWA 4BRLA 5AQOA 4B1ZA 4FWQA 5TKYA 1CZAN 4CZHA 5AQMA 4I6MA 3QDKA 4CBXA 3GE1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3JYTA 2QA4N 4CFDA 3GDQA 1J53A 3E01A 3NH0A 3EKSA 3PIPL 3RVCA 4LSNA 4JKEA 3MEEA 3I56N 3O8MA 1NK8A 3LP1A 1FK9A 4PWDA 3CG7A 1YVNA 3V1RA 3TI0A 3TAFA 4OPAA 1GOAA 4FWMA 3V81A 4FLYA 4IXCA 4DR2K 2G8VA 5DK5A 4IFYA 4M3WA 3AAPA 3LZIA 3D0PA 3T3FA 3ZT4A 4DQQA 1NJYA 1LW2A 5LJVA 3TWHA 1NNEA 2A41A 1B9DA 3QNOA 4WQ5C 3AVGA 4YFUA 4BE0A 1C0MA 4M63C 4DV1K 4DR6K 5AQPA 3M3ZA 5E41A 4CJQA 1ZXOA 2ASOA 3DLGA 4FPBA 3TU5A 3TAPA 4CZKA 4BRCA 3PO5A 4LFCK 4DUZK 1W9HA 1ZBFA 3L4QA 1NGHA 4B9SA 5CZ1A 1ZBHA 3NH1A 4PUOA 4GNIA 4IZ9A 3EZWA 3IMXA 3R6MA 2E6LA 3VF4A 2QXFA 2FBTA 2HBKA 3S41A 3P83D 4JI0K 1XQSC 2IGIA 1BQMA 1FW6A 4CEDA 5BPLA 4BE1A 1JCGA 3G6EN 3F9MA 4EP4A 4RWTA 4IO9L 3SYZA 4H8KA 4CFCA 3MN7A 3RWUA 1O13A 4H0TB 4CJ7A 3V9ZA 1MWKA 4BDYA 1CXQA 2E20A 4LY7A 5TKWA 3V1OA 3SZ2A 5JS2A 4FZZA 1D9DA 4GY2B 3HOTA 2IVOA 5MLCQ 5FDLA 1RDDA 3SAFA 3P39A 3B8AX 5FROA 3KLGA 4RW9A 3NF6A 1EP4A 3KKSA 1JLCA 3AO1A 3PX0A 3RMAA 3THWB 2D1KA 3IS9A 1IO2A 1X9WA 4BRHA 4HCCA 3C6AA 4FLWA 4QS9A 4KI6A 1ATNA 3V1QA 4W5OA 3HP6A 5C12A 3CYMA 4R5PA 4PL8A 2QWNA 5AQGA 3CCLN 2W40A 2YNIA 1E4FT 1IKWA 2P1JA 2GUPA 1W2BM 3VA3A 2A1RA 4BGAA 3LM9A 2NNWA 3S9HA 4FWNA 4F3OA 3DXKB 4CVNE 3DLRA 1DTTA 3UE5A 4CESA 3PLAA 5BR9A 5JLFA 4LFAK 4BREA 3NAEA 2Z1IA 1RCHA 4FM0A 2XHBA 1VRUA 1L3UA 3UKUB 2V51B 3WXMB 4PHTX 1XHXA 1C1CA 3I8BA 4LF5K 1RT5A 4Z4FA 4DR1K 3AVAA 1TK8A 4JKAA 3D2EA 3EL2A 2E4LA 2GV9A 3CFPA 3KLFA 2P9NB 3VETA 4KHPK 2E2NA 5AFUH 4B9LA 4KI4A 4EZ6A 1REVA 1BHLA 1K8KA 1KFDA 4CBUA 5CR4A 3G0ZA 1TVRA 4CJWA 5CYQA 4BRIA 4Z4EA 2OA8A 4I2QA 4B3TK 3JAMO 1R0AA 4CEBA 4NYFA 4GV9A 1NMDA 4FWRA 1BU6O 1HYVA 2QK9A 4GKJK 3ASMA 4BRQA 1VQPN 1EO1A 3AO5A 1VQMN 3WEEB 2Q1NA 1HLUA 3J80O 4JI6K 4IOCL 3CPEA 3KKRA 2VG7A 2PZSA 3FR0A 4M7XA 3L2RA 1EETA 2WBNA 3FZFA 4DV3K 4DU1A 1LAVA 4JI7K 4JKGA 3IG1A 3QMLA 1NM1A 3VA0A 1S1XA 4ICLA 3I0SA 1J6ZA 3HSCA 5J2PA 4BACA 3MWPA 3NFAA 1WAJA 5AQIA 4DV6K 2IIRA 4DSJA 4DQ8A 1XC9A 4I9QA 3HPHA 2P5OA 2OCEA 3VEYA 4DTUA 3O9RA 1XMQK 2ZGYA 1HUXA 2B6AA 3HSTB 4A2AA 1XHZA 4XEIA 5GAHP 1IV0A 4WE1A 4IO8A 1L3TA 1SKSA 4KV8A 5D3GA 3QEPA 3RSEB 1KAYA 3CCVN 5GIPA 3DJCA 3U9ZA 4YY3K 3K9JA 1ASWA 3RTVA 4JK7A 2GEMA 1EX4A 3HRGA 4KFBA 4HHTA 2QWQA 1S1TA 4CF1A 1LWCA 4CGDA 1JL2A 4U7BA 3MDQA 4OO1J 3L8BA 5AFUA 3UKRA 3BF1A 3L3UA 1LOTB 3EYZA 3CQ8A 4F4KA 1IH7A 4DTNA 1U6ZA 5AZIA 3QETA 3G4SN 1HKBA 4AHUA 1T44A 4LF4K 5JMVA 5HRNA 3H45C 1JLGA 2IAJA 4OGEA 3ZX2A 3TSUA 3IFRA 4CJVA 4FLTA 3OS2A 5AJ3K 2EHGA 3FZKA 1JL1A 1IG9A 3EE9A 4H5RA 2GWJA 4EHUA 3LP0A 3DWLA 1SL0A 4CJPA 4RG8A 3TSQA 3K58A 1RT2A 3VEWA 3FGUA 1DLOA 3OYLA 1MDUB 3CQYA 1NJWA 2D0BA 2VGNA 4JKHA 3LZJA 4ID5A 2PAVA 4JV5K 1NJIO 1RBSA 5F0XA 1HJOA 4DSFA 2IVPA 5CHIA 4DQSA 3DOKA 3O9QA 4Q5VA 2WC9A 3NBPA 1MWMA 3HM8A 3M6GA 1RT7A 3HI0A 3ZT0A 1HR0K 3PO4A 4YHHK 3FE1A 3VESA 1WN7A 3SNNA 4RW4A 4QS7A 4JKFA 4R79A 3V6DA 3N4PA 4B9VA 1HPMA 3K5MA 1JLQA 3J8AA 4CIGA 3F73A 3CMEN 5KTQA 5BN8A 3KD1E 2QWOA 3PX6A 3M5RA 1GLBG 4EFHA 2B5JA 4Q0BA 5DM7L 5AQSA 4BC2A 1YJNN 1IKYA 3VOVA 3LDNA 4G1QA 5EY4A 4DTXA 2G8FA 3CJ7A 3U6FA 2KFNA 1RFQA 1NGBA 4B8AB 3VQ9A 2D0OA 4RCHA 2RF2A 2ZM6K 1GLCG 2VGMA 3CCEN 4BRAA 5BRDA 2D0CA 3R8EA 4LH4A 4RW7A 3KWGA 3V9WA 1ZYQA 4OLBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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