1HKBA

Crystal structure of recombinant human brain hexokinase type i complexed with glucose and glucose-6-phosphate
Total Genus 334
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
334
sequence length
899
structure length
899
Chain Sequence
DDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGVEGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLGVEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLTKDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The mechanism of regulation of hexokinase: new insights from the crystal structure of recombinant human brain hexokinase complexed with glucose and glucose-6-phosphate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords D-GLUCOSE 6-PHOSPHOTRANSFERASE
molecule tags Phosphotransferase
source organism Homo sapiens
total genus 334
structure length 899
sequence length 899
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 1997-12-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hkbA03
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hkbA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1hkbA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1hkbA04
2W41A 4CD3A 2QWQA 2FSJA 3AY9A 5AZJA 5AQMA 3WXLA 3EZWA 3O4WA 2V7YA 4CBUA 2P9LB 1YAGA 3ZEUB 4B1XB 2CH6A 2QXLA 2Q0RA 2QWRA 5FPMA 4BRPA 4F9OA 3VEWA 3FZFA 4E1JA 3H6EA 3O1WA 5AZJB 3AARA 3C7NA 4WQ4A 5BRFA 3WXKA 4DQ8A 3VEZA 4B1WB 1GLFO 1GLJO 3R8EA 1U2VB 4BRLA 5F1XA 3CETA 1ATSA 1NMDA 5EY4A 4A2BA 4CZKA 4H0YB 3UKRA 1K8KB 1LOTB 3EO3A 1HKCA 3VGMA 3BEXA 3O5BA 1D4XA 3G25A 2GWJA 3JS6A 5AQVA 3HBTA 4XEIA 3KZBA 3O08A 2V7ZA 2P9PA 5AQJA 4BC4A 4Y0WA 5BPLA 2CGJA 3EKSA 3MCPA 4K25A 4FWMA 2QWMA 5FPEA 4BG9A 5AFUH 2VCPA 3IFRA 3ULEA 3H3NO 2YJEA 2F9TA 3MMVA 1MWKA 2F9WA 3LM9A 2AA4A 3U4LA 3MN5A 3VEVA 2ZWHA 3D2EA 4BG8A 5AZIA 3CI5A 3CHWA 4FPAA 4QS7A 4BR0A 3D2FA 3ZX2A 4BGBA 4FWKA 2IVPA 3IDHA 3MN6A 2A41A 1EQYA 1MDUB 2NRHA 2E8AA 4HWIA 1NGGA 2NZTA 4RTFD 2GUPA 4FPBA 4JHDA 3L6QA 1HUXA 3I8BA 2Q36A 1YUWA 4CBXA 3B8AX 1KAYA 2ASPA 3DXMB 3UB5A 3VF2A 4JAXA 2P9KA 5B8HA 1J6ZA 5FPDA 1NGDA 3VETA 3I33A 2QWOA 2YHXA 2HMPA 1SZ2A 2DPNA 2E2NA 2QWLA 2E2OA 1LCUA 3BP8A 3VERA 4H0TB 3U9ZA 4BREA 3GE1A 4IO8A 4XH5A 3RSEA 3HM8A 2P9UA 2AP1A 4FL9A 5AQIA 5KQ8A 1HLUA 3QB0A 3EKUA 4BVOA 3CQXA 3WT0A 4IJNA 3RSEB 1WUAA 5AQUA 2P9SB 4H5RA 3MN7A 1T6DA 1TYQB 1RDWX 3VENA 2KHOA 4H5VA 1ATNA 1G99A 4IJAA 3DXKA 4BRDA 1NGCA 5BRHA 1C0GA 3VF4A 5AQWA 3O80A 1QQMA 2GELA 5AQSA 2P9LA 1Q18A 5AQTA 5JLHA 1HKGA 2Q2RA 5EXWA 3ZEUA 3LDLA 4NO7A 5AQOA 4BR7A 2ZGZA 1GLCG 2A42A 3J8AA 3R6MA 3VESA 1NGBA 2Q31A 1ZC6A 3WEEB 5AQGA 4BRCA 2UYTA 3IMXA 5AQRA 4C23A 4ISFA 2D0PA 2ZF5O 1U2VA 2I7PA 3S41A 5EX5A 4AM6A 2OANA 4EHUA 3UKUB 3AAQA 3BUZB 2IVNA 1K8KA 4FOIA 2P9IB 2BUPA 1OKJA 1XQSC 4K41A 3A5LC 4IWVA 2E1ZA 5E84A 2ASMA 2ITMA 4J8FA 4KBOA 5AQFA 4NB4A 1IG8A 4GY2B 2V52B 4FWSA 1Z6RA 2FF3B 1MWMA 3WQTA 3A5NC 2ASOA 3VEOA 2HOEA 5KPTA 3IUCA 3ZX0A 3GL1A 1ZXOA 1GLBG 3A0IX 3VOVA 4H5NA 1ESVA 4CZMA 3QDKA 3FE1A 4BC5A 4FWLA 4O5FA 3DJCA 2FF6A 3SMSA 4A62A 2P9NA 2A3ZA 1R59O 3LDOA 3MN9A 5LJWA 3VGKA 3ATUA 5AQYA 2GEMA 5BPMA 1T6CA 3O8MA 4FSVA 1XC3A 2GWKA 2WUSA 4I6MB 3TU5A 4MLEA 2A6AA 4BC3A 4CZJA 5BPNA 2YI1A 2P9NB 3KVGA 4H0XB 1BA1A 3DXMA 3FZMA 3FZHA 1MA9B 4PL8A 1NWKA 2YJFA 4M7XA 1QZ6A 3WXJA 3VEYA 1HX1A 1YVNA 4XH1A 4PKHA 1ZBSA 4BR4A 2V51B 1GLEG 2QM1A 4WQ5C 3TPQA 3VPZA 4WYBA 5BN9A 4GNIA 3R9PA 3QFUA 5CE3A 3SK3A 4JD2A 5EOYA 2YHYA 5AQHA 4EFHA 2YCHA 1SAZA 5ELZA 5LY3A 4BR9A 1YXQA 3CJAA 1Y64A 4MO4A 5BREA 4BQZA 3F9MA 3HI0A 1U6ZA 1X3MA 3DAWA 2NLXA 4JD2B 4PKGA 1RFQA 3BF3A 1HKBA 1E4FT 4FOEA 2YHWA 2E20A 2P9SA 3LDNA 3HSCA 4DCHA 2CGKA 1TYQA 4XH4A 4FO0A 4BRFA 3H46O 4HTLA 4B1VA 3ZETA 1NGJA 4RWTA 2FLOA 4BR2A 1KAZA 3M6GA 5KPRA 2EWSA 2E1YA 3A5OC 2QWPA 3CQYA 3WXIA 4BRQA 5KQDA 1IJJA 1C0FA 3M3ZA 3ZETB 3FZKA 3WUHA 4AM7A 2Q1NA 1QHAA 4CZIA 2PBDA 4O8KA 3WEEA 2PAVA 3QBXA 4WQ5A 4RCHA 3ZX3A 3P4IA 2Q0UA 5BR9A 4BROA 4B1YB 3UKUA 3ENOA 1BDGA 4PL7A 5AQLA 2E2QA 4BRNA 2P9IA 1H1VA 3UE5A 4EIAA 5JMVA 5KPZA 3D7EO 4K43A 4ISGA 4MO5A 3GBTA 2GTDA 1S3XA 1WOQA 2D4WA 3LDPA 1QZ5A 4ISEA 3W0LA 3LL3A 5AQNA 3H1VX 4YDUC 1Z05A 4M7YA 5E26A 3FZLA 3AAPA 3GOIA 5BN8A 3FR0A 5LJVA 4L3QA 4BRGA 2BTFA 1BWFO 3O1BA 1KAXA 4CZHA 3GDQA 5F2RA 4CJ7A 5AQZA 5I9EB 1TUYA 5AQKA 1NLVA 1BU6O 3M1FA 2QW9A 4Z94A 4DHYA 4FWNA 4PKIA 1V4TA 1NGAA 3L4IA 3ID8A 4QS8A 5AQQA 4BRIA 4I6MA 4CZGA 1HPMA 3EL2A 4BRHA 3VF6A 4CD1A 2H3GX 2D0OA 1V4SA 4B1ZA 3KHYA 3C7NB 3VGLA 1CZAN 3BF1A 1DGKN 4A61A 1NBWA 3QMLA 1X3NA 4LC9B 4CZEA 5F0XA 3UKRB 3H1QA 1GLAG 3SJHA 2HF4A 4H0PA 1NM1A 3H45C 4YDUA 3EN9A 4B1UB 4BC2A 2P9PB 1SQKA 4FWOA 4MLHA 3CJ9A 5AQXA 4IXCA 3C0BA 5JLFA 1BO5O 1NGHA 1NGIA 2VWBA 3LM2A 2W40A 4BRAA 5BRDA 3A8YA 1BUPA 3ULEB 4BR5A 1BOTO 3FGUA 3GG4A 1RGIA 3FFKB 4BRMA 4JNEA 4BRKA 3D2EB 3CIPA 5TKYA 4BGAA 1DEJA 1NGFA 5AZIB 2J4RA 1GLLO 5AQPA 2HF3A 3H3OB 3D2FB 3SMPA 1ATRA 2QWNA 5ADXH 4QS9A 2FSKA 4EHTA 2IVOA 2CGLA 4BVPA 1BA0A 1JCGA 1JCFA 4JHDB 4BQLA 1QQNA 3CERA 4H5WA 1BG3A 1HJOA 1T44A 1DKGD 5JICA 2D1KA 2P9KB 4CZFA 3U8XA 4H03B 1QQOA 1E4GT 4FWPA 4H0OA 4B9QA 3JXUA 4FWQA 3QBWA 4FWRA 5AFUA 1NGEA 4WQ4C 3CJ7A 4M63C 2A5XA 3W3DA 4K42A 3VEXA 3U9DA 4CI6A 3CJBA 3MK6A 3QICA 5EVZA 4DB3A 4IZ9A 3ATVA 3SLCA 2E88A 4A2AA 2FSNA 2A40A 1JCEA 3LDQA 4JN4A 4EAHD 3WQUA 1TUUA 3A5MC 2CH5A 1X9JA 2P9UB 2FXUA 4H5TA 4CZLA 3CJCA 3QFPA 2ZGYA 1GLDG 3CJ1A 5AR0A 5FPNA 2IIRA 2VYPA 4H0VB 3HZ6A 3ENHA 3MDQA 3L0QA 3DWLA 5ADXA 1XUPO 2I7NA 1P8ZA 4CBWA 3O6WA 3OHRA 2E2PA 2Q97A 3FLCO 3HTVA 1KXPA 1S22A 3DXKB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GV9A 5AQMA 3WXLA 1VAZA 3TARA 1ASVA 3J7AP 4YOWA 3SCXA 2Q0RA 2QWRA 1K9MO 3VEWA 3FZFA 4Z4GA 3H6EA 4CGJA 3O1WA 3AARA 2X6SA 3IAYA 4HVJA 3VEZA 1NKBA 4EZ9A 1YTAA 3A2FA 4DFJA 1D9DA 1NMDA 5EY4A 3KD5E 2O8CB 1VQ8N 4CZKA 2GV9A 4H0YB 1K8KB 1IKXA 1LOTB 3T19A 3EO3A 4FJJA 4BACA 3CYMA 2WOMA 2NRWA 3G25A 4YFUA 1QSSA 2VG6A 4IFYA 2G8WA 4Y0WA 1KFSA 3EKSA 3LP3A 2QWMA 1C1BA 3OBYA 4IOAL 5C2DA 2UUAK 4XIUA 3MMVA 1QQCA 2HHUA 1MWKA 3U4LA 2ZWHA 4UY8O 2WFBA 5DMRA 2HMIA 1YTUA 3K5OA 4FPAA 1G15A 4BR0A 3ZX2A 2ETJA 3MN6A 2QXFA 3M8QA 4CJUA 4CGHA 3OS1A 4KH5A 2NRHA 4HWIA 1NGGA 2D0CA 3OVNA 4FPBA 4KO0A 4JHDA 3L6QA 3T69A 1F21A 1B9DA 3OYAA 4CHNA 3B8AX 4E1MA 3L3UA 4CFAA 1ZBHA 2VG7A 1QVGM 3VF2A 3B6OA 2IC3A 5B8HA 1S1UA 3KWIA 4J2DA 4N47A 4DSFA 4CJ3A 4O5BA 3DOLA 3PX4A 4H0TB 4N41A 3HJFA 2RE2A 3LWLA 4Z4HA 2P9UA 2RF2A 1C0TA 2ZD1A 3RTVA 1EO1A 4IG3A 3WT0A 4LFAK 4GW6A 4GMJB 1OVYA 1T6DA 1RDWX 4H5VA 4NYNA 3HP9A 4NYFA 4C8NA 1KVCA 3RR7A 3T1AA 5BRHA 2VWJA 4NCBA 3LDSA 3O80A 2KFZA 2D0AA 3QETA 3ENBA 4J2BA 3THYB 1Q18A 3VQ4A 2Q2RA 3VQDA 2G8IA 5AQOA 4C8MA 4ELTA 1GLCG 3WNEA 2VGMA 3K5MA 2RPIA 3C6AA 3P31A 4OPHA 5E41A 5IWAK 4JI4K 5AQRA 2HB5A 1NK5A 2OANA 4KFBA 4WCEL 3RMBA 3HK2A 1RILA 3SUQA 2P9IB 4M3ZA 3AA4A 1J5OA 5E84A 4KBOA 4NB4A 1VSHA 1JLBA 2E6LA 1C1AA 2QEXN 2FF3B 3A5NC 3VEOA 5KPTA 3V9XA 3OYBA 5HRPA 3GL1A 5H1SQ 3VOVA 4B8CA 4CJFA 2VG5A 3FE1A 3OYEA 4FWLA 1RT1A 4HUFA 1NJIO 4CK2A 4DV0K 3LDOA 3NF9A 1VQ4N 2GEMA 4FSVA 4CEOA 1XC3A 1HYVA 4FM0A 4I6MB 2HVHA 3TTFA 4MLEA 4BC3A 4KPYA 3PY8A 3NF6A 4NLBA 1HJRA 4DV1K 4F2SA 4EZ6A 3FZMA 3SUOA 4PL8A 1MA9B 4DSLA 2YJFA 4CESA 4FJ8A 1TL1A 4BR4A 1BCOA 1ZBSA 3C95A 1U4BA 4WQ5C 3VPZA 3HVRA 4WYBA 3V1OA 4B9MA 3QFUA 4DG1A 5CE3A 3SK3A 1VSDA 5EOYA 4EFHA 2YCHA 3LP1A 3LAKA 5ELZA 1RT4A 2KW4A 4YNQA 3LZJA 5LY3A 3IS9A 1YF5L 1HYSA 4MO4A 4BQZA 3F9MA 3HI0A 2DFEA 5FRMA 4OPAA 2NLXA 4PKGA 3BF3A 3CD6N 2YHWA 5DM7L 2P9SA 1CLQA 3MAQA 1UWBA 1S1VA 4KB1A 2G8HA 4BRFA 2KKZA 4RWTA 4AHCA 4B9SA 5GADP 3CM5A 3QERA 4GKKK 3DLHA 4CF0A 4KI6A 3SQ4A 3WXIA 3PX0A 5KQDA 3M3ZA 3FZKA 3WUHA 4AM7A 1BL3A 4CJ4A 2B5JA 3D0PA 5FRNA 1NJYA 3HVTA 1BQNA 5LMUK 4CZIA 4LF7K 3WEEA 2NRXA 1FXXA 3EEQA 3ZX3A 1Q82O 4U67L 1KQSM 5HOOA 3O3HA 4B1YB 2UXDK 4CF9A 4GVEA 3LP2A 4BRNA 1SV5A 2I5JA 3D7EO 2WC9A 2IGIA 3GBTA 1VQ6N 3W0LA 5AQNA 4YDUC 4BWMA 5E26A 3NGYA 1ZYQA 4KKOA 3AAPA 3C6UA 2BTFA 4BE1A 4H4MA 1XWLA 2PYLA 4G9ZA 1YJWN 3LAMA 4FK2A 1TUYA 3CFPA 5AQKA 4BDPA 3WXMB 3E01A 3SUPA 1U04A 3VQ7A 4CEAA 1EX4A 4Q5VA 1VSMA 4JLHA 3TAQA 1FKOA 5AQQA 1J53A 1B9FA 1HPMA 1L3UA 3D6RA 4AHUA 2H3GX 3AVAA 4CHYA 1CXQA 4EP5A 3VGLA 1CZAN 1IBKK 2YKNA 2O8FB 4A61A 3QMLA 1NK9A 1X3NA 3ZT4A 2NUBA 3UKRB 4DR4K 3DLEA 2HBMA 4FCYA 4KTWA 1NM1A 5T7BA 3OYCA 3EN9A 3MXJA 5JVHL 1HMVA 1IKVA 5AJ3K 1NK4A 3L2WA 4IXCA 2E6MA 2Y1JA 5D3GA 2W40A 4BRAA 3VQ5A 3A8YA 1BUPA 3C6TA 3ULEB 1RGIA 1DTQA 3AVJA 1D5AA 4JNEA 4E19A 4FYDA 3D2EB 4J2EA 1WAFA 2JLEA 3KKRA 4BGAA 4FK0A 2J4RA 1GLLO 4NLCA 2ZJRL 3O9QA 4JK8A 3THXB 4C1NI 3D45A 3NGZA 5ADXH 4RW9A 1S1WA 4BVPA 4GV3A 3MEDA 1JLCA 1VSIA 1HJOA 3M8PA 3SQ1A 3S3MA 5M1NA 5M1QA 2ITGA 4DFMA 4FWPA 3J7ZO 3QBWA 4FWRA 1N8RO 1Q8IA 3W3DA 2A5XA 4K42A 3I8DA 4CK3A 1EKEA 2E4LA 4M41A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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