1HKCA

Recombinant human hexokinase type i complexed with glucose and phosphate
Total Genus 350
100200300400500600700800050100150200250300350
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
350
sequence length
899
structure length
899
Chain Sequence
DDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGVEGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLGVEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLTKDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTHYDRLVNEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRTE
100200300400500600700800800600400200
050100150200250300350Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Phosphotransferase
source organism Homo sapiens
publication title Regulation of hexokinase I: crystal structure of recombinant human brain hexokinase complexed with glucose and phosphate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords D-GLUCOSE 6-PHOSPHOTRANSFERASE
total genus 350
structure length 899
sequence length 899
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 1998-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hkcA03
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hkcA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1hkcA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1hkcA04
2HMPA 3UKRB 3O08A 4JNEA 1ESVA 3JS6A 2A3ZA 4FOIA 3HM8A 1CZAN 3AAQA 3M1FA 3ATUA 2A6AA 1Q18A 4BRGA 2P9PB 2IIRA 3H1QA 4CZGA 1NGGA 2KHOA 1NGBA 4NO7A 2YHXA 5AZJB 1U2VA 3WT0A 1NMDA 3EN9A 3VPZA 3CJ9A 4RCHA 3R9PA 2P9LB 2D4WA 3EL2A 4J8FA 4CZMA 3GE1A 2FXUA 4BRKA 2ASOA 3SMSA 4CJ7A 1V4TA 5FPNA 3QB0A 4K25A 3IDHA 4H03B 4JD2A 2BUPA 4CI6A 3H3OB 4CZEA 1TUYA 2E2QA 5E26A 2GELA 2A40A 2GUPA 4BRLA 4MLEA 1BOTO 2E20A 1NGCA 3QDKA 4K43A 5BREA 3G25A 3ID8A 3RSEA 1K8KB 5BR9A 4RWTA 3LL3A 5AQRA 2QWPA 4CZJA 3WQUA 5BPLA 2YHYA 3A5MC 3FGUA 2A42A 4GNIA 4JN4A 2P9IA 4FWRA 1BO5O 1DEJA 3QICA 4BRHA 2YI1A 4FPBA 4O5FA 3WXLA 2E1ZA 4IJAA 3GL1A 2NRHA 4KBOA 1Z6RA 2AP1A 2P9KA 5AQKA 5F1XA 4BRPA 1G99A 1HKGA 2VYPA 3LDQA 1NGIA 5BN9A 3FR0A 4I6MA 2CH6A 1X9JA 4QS8A 2HOEA 2Q0UA 4A2AA 3MN5A 3BF3A 4JAXA 4BR5A 2P9NA 4FSVA 4WQ4A 3D2FA 2Q97A 1RDWX 4B1YB 4B9QA 2QWMA 1S3XA 4AM7A 2D1KA 3ENHA 3ZETB 1C0GA 2FF3B 4BGBA 2Q36A 1E4FT 4JHDA 3VETA 3QBXA 1QQMA 2E2PA 3C7NA 3A5OC 3AY9A 3KZBA 3WXJA 2YJEA 3LDNA 4FOEA 1NGDA 5FPMA 5AQWA 5EX5A 3U9ZA 3VGLA 5KPTA 3UKUB 3FFKB 3DXKA 1GLLO 1NLVA 5BPNA 2BTFA 3VERA 4IXCA 1MDUB 1NBWA 1ATRA 4H5NA 3LM9A 1BDGA 3ZX3A 3FZHA 3FZMA 2YHWA 2V52B 4DB3A 2D0PA 1BWFO 1BU6O 1U6ZA 2V7YA 5LJWA 3VGMA 5KQ8A 3ZEUA 2P9PA 4BVOA 3CI5A 1T6CA 3ULEB 4BRQA 5EXWA 1LOTB 2IVPA 3VEWA 3MK6A 5AZJA 3VF6A 4BRAA 1Y64A 3WEEB 2FSNA 5KPRA 1HKCA 3CERA 4EHUA 1KAZA 4A2BA 3MN7A 2P9LA 4XEIA 5JMVA 1T6DA 3A5NC 3EO3A 3CJCA 5BRDA 4EIAA 2CGJA 2VCPA 3HSCA 4ISGA 1NGHA 4H0YB 4BC2A 3GOIA 3O1BA 3ZX0A 3VOVA 2YJFA 3B8AX 1HLUA 3KVGA 4BG9A 1C0FA 3P4IA 4MO4A 1KXPA 1X3NA 5AQHA 2AA4A 3MMVA 1K8KA 4CZLA 1HX1A 3QFUA 3O6WA 5AQIA 3FZFA 3FLCO 3I8BA 1ZXOA 5AQQA 1J6ZA 4FWNA 3L0QA 3HTVA 1LCUA 5ADXH 1BA1A 1NWKA 5BPMA 1WUAA 1DGKN 1JCFA 1QHAA 4BC4A 1WOQA 3TPQA 3UB5A 4H5RA 3DJCA 1SAZA 5FPEA 4CZIA 4FWMA 4A62A 3CJ7A 4NB4A 3R6MA 1IJJA 1KAXA 3A5LC 1XC3A 5AFUH 3ENOA 4RTFD 4A61A 4H0TB 1ATSA 3JXUA 2P9UB 1V4SA 2A41A 3VESA 4DCHA 2QM1A 3VF4A 2QWOA 3VENA 1NM1A 4H5TA 5AQVA 2WUSA 3U9DA 4ISFA 3BF1A 5KQDA 3QMLA 2P9SA 3ZETA 4MLHA 4WQ5C 3W0LA 3U8XA 2QWLA 3IFRA 4H5WA 3CIPA 1NGJA 1BA0A 3GBTA 2DPNA 4BR4A 2FLOA 1BUPA 5ADXA 1QZ5A 1GLFO 4H0PA 3TU5A 2I7PA 4C23A 3UKUA 3M3ZA 4H0VB 4XH4A 4FWQA 3LM2A 3F9MA 4XH1A 4PL7A 3O8MA 4WQ5A 1GLDG 3RSEB 2FF6A 2QWRA 1YUWA 5AQJA 5AFUA 3SJHA 1YVNA 2OANA 1NGEA 2IVNA 4H5VA 1ZBSA 2J4RA 5E84A 5BRHA 2V51B 4BVPA 2D0OA 1E4GT 2QXLA 3SK3A 1R59O 1TYQA 3ULEA 2W40A 1NGAA 4LC9B 4IZ9A 2H3GX 5TKYA 3VEVA 3WEEA 4QS9A 1QQOA 3C0BA 4FL9A 5B8HA 5BRFA 5ELZA 3UKRA 3MN9A 2NLXA 3EKSA 4BROA 5AQUA 4CZHA 4IO8A 3CJ1A 2GWJA 3D2EB 4Z94A 5F0XA 3HBTA 3VEXA 5AZIB 4CBXA 1IG8A 4BQLA 5EVZA 5AQNA 2P9NB 4BRIA 4WYBA 5AQLA 1GLEG 5F2RA 4L3QA 4MO5A 1TUUA 4BR7A 1RGIA 4BRNA 4CBUA 3AARA 4YDUC 3AAPA 5JICA 4Y0WA 4F9OA 4JHDB 2W41A 4BG8A 1KAYA 4B1VA 3LDPA 5I9EB 4B1UB 5AQYA 5AQMA 2PBDA 3O1WA 3DAWA 4HWIA 1XUPO 5JLHA 5EOYA 4CZKA 4HTLA 3L6QA 5AQGA 1BG3A 1JCGA 3L4IA 5AQXA 3H45C 4B1WB 2ZGZA 2F9TA 3MCPA 2ZF5O 3DWLA 2CGLA 1S22A 4PKGA 5AQSA 3O4WA 3EZWA 4FWOA 1P8ZA 1XQSC 3WUHA 1NGFA 3H3NO 1JCEA 2CH5A 4PL8A 3DXMB 2IVOA 3WXKA 1DKGD 4AM6A 1X3MA 1T44A 1D4XA 4H0OA 3VEYA 1QQNA 3ZEUB 4CZFA 4H0XB 4BRMA 3O80A 1HPMA 4ISEA 1YAGA 1GLCG 3QBWA 3IMXA 1MWKA 2P9UA 4O8KA 3OHRA 1MA9B 3CJAA 5AQFA 3VGKA 1SZ2A 5LJVA 3CHWA 3U4LA 4FO0A 3FZKA 4PKIA 3LDLA 4EAHD 3LDOA 1GLBG 4CD1A 4DHYA 1ATNA 5JLFA 3O5BA 2FSKA 2I7NA 3CETA 4K42A 2CGKA 4FPAA 4K41A 2PAVA 4XH5A 4FWKA 3VEZA 3CJBA 3FZLA 4QS7A 1U2VB 2QWQA 4M7YA 3WXIA 4BR0A 4B1ZA 1ZC6A 4BRDA 4BRFA 3KHYA 4BC5A 4BGAA 2ZGYA 4BR2A 2Q2RA 2UYTA 3MDQA 2QW9A 1RFQA 5CE3A 3WQTA 2EWSA 3H46O 3VF2A 4JD2B 1OKJA 3HZ6A 2VWBA 4M63C 2ASPA 3SMPA 2ZWHA 3SLCA 5EY4A 5BN8A 4BRCA 3D7EO 2E8AA 4IWVA 1QZ6A 4IJNA 4WQ4C 3ZX2A 2GWKA 2FSJA 3BEXA 2V7ZA 4BR9A 4GY2B 3GDQA 3CQXA 5AQOA 4BREA 2GTDA 2HF3A 2Q0RA 3D2EA 3FE1A 4CD3A 3J8AA 3BP8A 3EKUA 5AZIA 2P9IB 4EFHA 3HI0A 1YXQA 5AQTA 2QWNA 3IUCA 3S41A 1HKBA 2E1YA 3CQYA 1Z05A 1GLJO 2P9KB 2A5XA 2P9SB 3M6GA 4BQZA 4M7XA 3R8EA 4B1XB 1MWMA 5KPZA 4EHTA 2Q1NA 4I6MB 2YCHA 2NZTA 4PKHA 2GEMA 3BUZB 2Q31A 2ITMA 2E2NA 3D2FB 1EQYA 3GG4A 1HUXA 3W3DA 5FPDA 3VEOA 1SQKA 3MN6A 3H1VX 2F9WA 5AQPA 1H1VA 2E2OA 3C7NB 5LY3A 2ASMA 2E88A 3DXMA 4FWPA 4CBWA 3ATVA 5AQZA 3QFPA 1HJOA 3I33A 4BC3A 1GLAG 4E1JA 3DXKB 4FWSA 1TYQB 4YDUA 4FWLA 3UE5A 4DQ8A 2HF4A 5AR0A 3A0IX 3A8YA 3H6EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DKWA 3HP9A 3O4QA 3AGKA 3L4QA 3L2QA 1FXXA 2A3ZA 3HM8A 4KB1A 1TL1A 3M1FA 4X64K 2PFUA 1Q18A 4DFMA 5I42A 4M3XA 3H1QA 4CZGA 2KHOA 1NGBA 4NO7A 2YHXA 2DFEA 4GVEA 1NK0A 3J7YP 1K8AO 3RR7A 1VAZA 1RBTA 3B6OA 3SAGA 2OTLN 1WSIA 4RCHA 3R9PA 5K14A 4DLGA 1IBLK 1VQNN 1JLGA 2D0BA 1SKSA 4FK0A 3V9UA 4CJ7A 4DSKA 5C15A 4K25A 2JLEA 4JD2A 4H03B 3H3OB 4FLTA 3LDSA 5FRMA 1B92A 2E2QA 5E26A 2A40A 2ZE2A 1KLMA 4BE1A 1G15A 1NGCA 4CEOA 4KHSA 3LL3A 4DQIA 4RW8A 4CZJA 5BPLA 4CJWA 4JS4A 3FGUA 4JN4A 3AVLA 4JS5A 1VQ9N 1DEJA 3QICA 1TL3A 4O5FA 3OYGA 4KTZA 2QXFA 2E1ZA 4IJAA 4MDAA 1J5OA 1WBBA 1KVBA 1L3VA 3LDQA 5GADP 3EEQA 1W97L 5DM7L 5BN9A 4CEQA 2O4GA 3OYJA 4BR5A 3V81A 4B9QA 4ELUA 5D3GA 1F21A 4IEEA 4AM7A 3DLRA 1S9GA 3MAQA 2FF3B 3AA5X 2G8HA 4JHDA 1C1AA 4A5AA 1QQMA 2E2PA 3RMAA 1K73O 4KHNA 2O8EB 4N56A 4AHTA 3AY9A 5M1FA 2E4LA 3WXMB 4FOEA 1K9MO 3L2WA 4JI4K 3KKRA 4YFUA 3TTCA 1TKZA 5KPTA 4QCLA 2W6KA 5J2QA 4IOCL 3VERA 1RNHA 4QAGA 1RT4A 3LAMA 4IXCA 3BY5A 2GX9A 1HNIA 3LM9A 3PO4A 3MXIA 4U67L 1BDGA 4I2QA 2V52B 3THYA 1T8EA 4DB3A 3QNNA 2DY4A 5IT9O 3SUPA 3VGMA 5KQ8A 4CHZA 1Y97A 1RT5A 4JKHA 3DLEA 1Y64A 5KPRA 1HKCA 4N5SA 4KTWA 3L3UA 4JKDA 1N34K 3MN7A 2P9LA 4B3RK 3CMAN 3KWIA 4DTPA 4I2PA 3A5NC 4JV5K 5BRDA 1S6PA 3CFOA 1KCFA 2CGJA 3LP3A 1QHTA 3JAMO 2OCEA 1B9FA 2YJFA 3CYMA 4E7JA 1RT7A 2OA8A 1ILYA 3O4NA 4LSLA 4C8KA 1KQSM 3BGRA 4DV2K 1BHLA 3KD1E 1Q82O 1S1XA 1J6ZA 4DSJA 1LCUA 1BA1A 1NWKA 1QHAA 4BC4A 3HM9A 1LAVA 3NH2A 1EWQA 4IFVA 5HRPA 4FWMA 3L8BA 4JK9A 4F4KA 1XC3A 3K58A 1K6YA 3HOSA 1KSPA 4H0TB 3V9SA 3JXUA 2A41A 3DI6A 1HYSA 3VF4A 3ZSOA 1QVGM 3M8RA 4OKKA 3BF1A 3OYAA 4DQQA 1BCMA 2KW4A 2JGUA 4C8NA 3S3OA 2QWLA 1FKOA 3CIPA 4RW9A 4DS5A 1YT3A 2Z1GA 1VQMN 3VMFB 1GLFO 1TKTA 3LZIA 3C95A 3UKUA 1GOBA 3QEPA 3M3ZA 1UAXA 1TK8A 3TAGA 4PL7A 3CD6N 4JKGB 1GLDG 1ZBFA 1J5EK 4FVMA 1TV6A 1WSJA 2YHAA 3SJHA 1YVNA 4CIGA 1NGEA 2RPIA 4JKCA 4CJUA 5E84A 5BRHA 2V51B 4G9ZA 3OS0A 2D0OA 1TKXA 3SK3A 1TYQA 1SKWA 3ULEA 2HW3A 4IZ9A 4YOXA 3K2PA 5TKYA 3WEEA 3OTOK 3G0ZA 3WNHA 1HR0K 3SNNA 4Z0UA 3ZCMA 4BROA 4FJHA 4E89A 2B6AA 4IO8A 4JRQA 4Z94A 3SPYA 3VEXA 5AZIB 4JK7A 3PSIA 1XHXA 2O8DB 2P9NB 3ZSXA 3V4IA 2HHWA 4KHYA 5F2RA 2G8UA 3K0SA 3PLAA 2KTQA 1ZBIA 2W41A 1KAYA 3MCAB 3TSQA 1HQEA 3LDPA 4B1UB 5AQYA 4M3YA 4CVNE 2RN2A 5KRSA 3HPHA 3BZKA 5KGXA 1XNRK 1SKRA 5EOYA 3VQBA 4LF5K 3L6QA 3VTHA 5AQGA 1BG3A 3MXMA 4CK3A 1EXQA 2ZGZA 4FLYA 1NMNA 3DWLA 4PKGA 2RKIA 1P8ZA 4CFBA 3H3NO 1VQ5N 2O8FB 1JCEA 1JJ2M 3DRRA 1N33K 5J1EA 4AM6A 4JKEA 4CGJA 2ZJPL 2F8TA 3ZEUB 3VEYA 1D9FA 5T7BA 1D8YA 2QI2A 3TI0A 1N36K 1GLCG 1A5XA 2UXDK 3QBWA 3QLHA 2P9UA 4O8KA 2F96A 4CFAA 5AQFA 4FJLA 3VGKA 3TR8A 4M45A 3O9TA 3AA4A 1N5YA 3V9WA 4H4OA 4DQPA 1A5WA 2I7NA 3E9LA 3VEZA 3FZLA 3VQQA 4JI8K 4KHPK 2QWQA 1EP4A 4OJRA 1NG9A 4DR1K 1JKHA 4M7YA 5M1OA 3M5RA 4KKOA 1QE1A 4BGAA 1ASVA 3QEWA 4AILC 4M3UA 3C6UA 1RTIA 1WSHA 3WQTA 1Q8IA 3RMCA 2YNFA 4A5BA 2EWSA 4JD2B 2O8EA 4M63C 3LZJA 4C8MA 3HVRA 1HJRA 1JL1A 3F2KA 3EY1A 1RT3A 1T3VA 1UOCA 4IWVA 5JVHL 3TAMA 4CGDA 2Y1IA 1BL3A 3KK3A 3K5NA 4WFBL 2FSJA 4WFNL 4KTQA 2EX3A 5AQOA 3GDQA 3WNFA 5C2DA 4B08A 3CCQN 3FE1A 1VSMA 1ASWA 1VQ6N 3KK1A 1QVFM 1A5VA 3E1YA 3SV4A 4CE9A 3G10A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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