1J9AA

Oligoribonuclease
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
184
structure length
184
Chain Sequence
SHMSFDKQNLIWIDLEMTGLDPEKERIIEIATIVTDKNLNILAEGPVLAVHQSDELLNKMNDWCQKTHSENGLIERIKASKLTERAAELQTLDFLKKWVPKGASPICGNSIAQDKRFLVKYMPDLADYFHYRHLDVSTLKELAARWKPEILEGFKKENTHLALDDIRESIKELAYYREHFMKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
publication title The Crystal Structure of Haemophilus Influenzae HI1715, an Oligoribonuclease
rcsb
molecule keywords OLIGORIBONUCLEASE
total genus 61
structure length 184
sequence length 184
ec nomenclature ec 3.1.-.-:
pdb deposition date 2001-05-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1j9aA00
5K14A 3MXMA 4Z4GA 1WSJA 4DSIA 4C8NA 1FKOA 1HRHA 1UWBA 3HPOA 4DTRA 3M8SA 2YNHA 4KO0A 2DFHA 3LZIA 1KFDA 4GMJB 4IKFA 4W5OA 4FJXA 1CLQA 4AHVA 4B9TA 1RNHA 5I3UA 2IOCA 3SJJA 1QHTA 2D0CA 2JGUA 2LSNA 3NF9A 4I2QA 4FLVA 1KRPA 3V1QA 3DLBA 4CHQA 4PQUA 4OLAA 4H8KA 1KVBA 4AHSA 4CJFA 1ITGA 4F4KA 3VQAA 1RDBA 4CK2A 4FJGA 2WOMA 2XY6A 4KRFA 3CG7A 1A5VA 4CEZA 4OLBA 3ZSXA 4LH4A 1RT2A 2Z1GA 4RG8A 4W5QA 5J2PA 3CM6A 1KTQA 3OYLA 1XI1A 3HP9A 3UIQA 2OA8A 3ZSZA 1I3AA 2F96A 3SZ2A 1BL3A 3AVLA 3K5OA 3LDSA 3OYIA 3VQEA 1LV5A 3NHGA 1J5OA 2X78A 4LY7A 1QQCA 4CJWA 2KQ2A 3DYAA 2RKIA 4CIGA 3MECA 3T1AA 2D0AA 4AH9A 5J1EA 3HP6A 1SKWA 4KAZA 3KLFA 2YV0X 4FJKA 3AA3A 3CQ8A 1JLAA 2P1JA 2QXFA 3OYFA 4OGCA 4GVMA 4C8MA 4CEOA 3DI6A 3QEVA 4DQPA 1VSDA 4R5PA 3VQ5A 1A5WA 4HCCA 4FM0A 2DTUA 2ATQA 3NDKA 4DQIA 4RW9A 3O4QA 5SZTA 3LWMA 1TV6A 1BISA 4FW1A 4HHTA 4NCBA 1CXUA 1YVUA 1TAUA 3DLKA 2PYJA 4KKOA 3MAQA 4DSJA 4DLEA 5T7BA 4ZTFA 3VQPA 3NE6A 4H4MA 3DLGA 3NF7A 4BE0A 3WNFA 3WNGA 3KK3A 3HPHA 4IG0A 3ZT1A 5FRMA 2KZMA 1NKBA 3OJUA 4NYFA 2NUBA 3F9KA 4ZHRA 1S9GA 4IFYA 2G8FA 3SQ0A 4BWJA 4JRPA 3KLEA 4LD0A 3PUFA 4KTQA 4N56A 5DK5A 2IGIA 3AVBA 4IDKA 2VG6A 4CEBA 3OYAA 4HUEA 4FLYA 1BQNA 4LSNA 2P5OA 4ICLA 2XRIA 3OYEA 2JLEA 1J9AA 4BACA 4KFBA 4CEAA 2B5JA 3SCXA 3OYNA 3OYMA 1NK0A 3QEXA 2ZE2A 3LAMA 1C1AA 3O3FA 4EZ9A 2OYQA 3RMCA 3KK1A 4J2AA 4HUFA 1HPZA 1K6YA 1C0UA 3DLEA 3IRXA 3M8QA 3RMDA 1VK0A 3NH1A 3U3YA 3PX6A 1TKTA 3V6DA 1HYZA 4IG3A 4CJKA 4DU3A 1JL2A 1F21A 1RBSA 5CYMA 3LZJA 3HSTB 3K57A 4KHWA 4QAGA 3DOKA 4OVLA 2VWJA 3ZSOA 4E7HA 5DMRA 4N47A 4DSKA 1QSSA 1VSIA 4FM2A 3MEDA 4DTJA 4JLHA 4Z0UA 1D8YA 4B9NA 1HYSA 1A5XA 1JXEA 5KRTA 2OZMA 1BIZA 1CXQA 3CM5A 4DQRA 3SQ1A 4KPYA 3RTVA 3HXMA 4AHTA 1Z25A 1BGXT 3C6TA 4DU4A 1RTJA 5FROA 4CJTA 4CHYA 1EX4A 4DF4A 3TAPA 4B9VA 4EZ6A 4M3XA 3LP2A 1X9SA 3K59A 4DFMA 1C1CA 4CGHA 2YNGA 4FJJA 1JLBA 4K8XA 3LP1A 3TAMA 3ZT3A 4CEDA 4PA1A 5HRNA 1S1TA 1HMVA 1HQUA 3VQ8A 1JLQA 3V9UA 1VSJA 4OJRA 2G8IA 1W0HA 5CY4A 1LW0A 1D9DA 3OYBA 3HYFA 3AVMA 1TL3A 1TK8A 4C8OA 1B9FA 1IKVA 2E6LA 1L3UA 2YNFA 4W5RA 3TANA 4FLTA 4DF8A 3VQBA 3EZ5A 4DTPA 4PWDA 4DTNA 3D45A 3OYGA 2KTQA 4M45A 3RMBA 1W9HA 3U3GA 1IKXA 3THVA 4AHCA 1NK7A 1WNSA 5KGXA 4CJSA 4CJVA 1VSKA 3NBPA 2VG7A 4CF1A 1RT7A 2R7YA 1SL0A 4CFAA 2Z1IA 4I9LA 3WNEA 1TL1A 4M3WA 5FRNA 3RMAA 4F2SA 3OYCA 1IO2A 3NFAA 4FZZA 1YT3A 1LWCA 3QEIA 4MFBA 4J2BA 3KKRA 2I5JA 4OKKA 1RBVA 1Q9YA 4NYNA 4O0JA 3OYJA 4OKJA 4CJPA 3G10A 1X9MA 1HQEA 1UAXA 2A1RA 1JXBA 1RTDA 1QSYA 3LAKA 1CZBA 3SUOA 1LWEA 1NOZA 2OZSA 2FBVA 1IKYA 2EHGA 1B9DA 1VRTA 4KB0A 1RT6A 4CEFA 3HK2A 1T05A 1TK5A 2OPQA 3LALA 5HBMA 3LPTA 1HJRA 3SUPA 3SPYA 4B9UA 3ZSWA 4FK2A 2W42A 1B92A 3WNHA 4CECA 3QLHA 3TABA 1NOYA 3A2FA 4ID1A 3OYHA 1L3VA 4F8RA 4N76A 3K5MA 3IS9A 1VSEA 4FJMA 4Q0BA 2OPSA 2IAJA 1NK6A 3O3GA 3TAGA 4J2EA 1JL1A 4EP5A 3PX0A 4O0IA 3K5LA 1T03A 2DFEA 1YTAA 3AVAA 1WAJA 1NJYA 3V4IA 4ID5A 4DSEA 3T3FA 2BGGA 3HJFA 1BI4B 5HRRA 3TR8A 4CFCA 3M8RA 3DLHA 4CF2A 4OKEA 4CE9A 2O4GA 2ZD1A 4FZXC 4N41A 2ETJA 3L3VA 1NK5A 1QSLA 2B4JA 3JSMA 1S1UA 5C42A 4CIFA 4QOZB 3RRHA 3KK2A 1NJWA 2HHTA 3M8PA 1HYVA 1REVA 1XHXA 3CFPA 4DWIA 3RR7A 1SL1A 1RDAA 4CGJA 1L3SA 4BE1A 3SUNA 4CIEA 3V9WA 1WSIA 2A1SA 4BDZA 3ZSRA 3ZSYA 4AHRA 4F2RA 4I7FA 2G8HA 1C0TA 1RBUA 4FJIA 4E7JA 4CGGA 3QIOA 1XHZA 1VSHA 3MEEA 1ZBFA 3CFOA 3HVRA 4CHNA 2OPPA 3OS1A 3SV4A 3TAQA 3L2UA 4KI6A 5D3GA 1TAQA 1T7PA 2B6AA 2YKMA 4CHPA 3DRRA 3HPGA 3ZT0A 2HNZA 1U48A 3AA2A 3KLGA 3KTQA 4KHNA 2HHUA 3KD1E 1J54A 1MU2A 1GOAA 4CF0A 3ASMA 3TAFA 4ELUA 4B9SA 1LW2A 3K2PA 3SYZA 4I2PA 3AA5X 2F8SA 4CERA 1NJZA 1KFSA 3VQ7A 3QERA 3TI0A 2IDOA 2GBZA 3G0ZA 4AHUA 4CGDA 1ASWA 4CGIA 4ZTJA 4DS4A 3ITHA 4HTUA 2QK9A 3OJSA 1EP4A 4HCBA 2YHAA 4Z4HA 4Z4IA 3QO9A 4KREA 4E19A 4FZYA 2HNDA 2RF2A 4RW6A 4IFVA 5J2QA 4LH5A 4KHUA 1IG9A 1BI4A 4O44A 2IS3A 4H4OA 1C6VA 1IKWA 5EU7A 2DY4A 3ZT4A 5CZ1A 3PY8A 4Z4EA 3OY9A 2HVHA 4FJLA 3VQQA 2HHWA 1DTQA 2HNYA 3AVCA 2GV9A 3AVHA 4EP4A 2FBYA 3KJVA 4CFDA 4DLGA 2QKKA 1RBRA 4PY5A 2OPRA 1SUQA 2Q3SA 4CJ5A 5SWMA 1TVRA 2EX3A 1RBTA 4DFKA 3C95A 1KCFA 3HT3A 4WE1A 1QTMA 4FJ5A 3KKSA 4AILC 4CFBA 4CJEA 3QNNA 3AO3A 4E1MA 4JRQA 3AVIA 3OVNA 1ZBLA 3ZSVA 4I9QA 3SUQA 3DOLA 2IC3A 1S1WA 3AA4A 3IG1A 3SNNA 4OGEA 4M3TA 1C0MA 1RILA 3EY1A 1LAWA 4KTZA 3P5JA 1TKDA 4FLXA 3S3MA 3SI6A 3ZCMA 5JS1A 1RDDA 4ELVA 3DRSA 2FBTA 1VSFA 4CEEA 4FJ9A 3C6UA 4CJUA 4B9LA 4Z4FA 5JS2A 3SQ4A 4KTWA 1KLNA 3OS0A 1WSGA 3L3UA 3SPZA 4DTOA 4RW8A 4CHZA 3U6FA 4CF8A 5KI6A 3QESA 3KLIA 4DFJA 1LAVA 4NCGA 4M3RA 1WSEA 3NGIA 2XHBA 4B8AB 2HMIA 4RW7A 3HO1A 3AO4A 4E3SA 2VWKA 4CGFA 3L2RA 4FJ7A 1S9EA 2X6SA 3ISNC 3V9XA 3PO5A 4KI4A 3E01A 4LSLA 4CJQA 4FLWA 4C8KA 4B9MA 4DQSA 3SV3A 1C1BA 3TWHA 5KGWA 2RN2A 4BDPA 4QCLA 1S1XA 4DSLA 3MXJA 1ZBHA 4F3TA 3V9ZA 1ASUA 2G8KA 3NCIA 1SV5A 3S9HA 3BDPA 3QNOA 3PO4A 2Z1HA 3P1GA 3AVKA 5C24A 2BDPA 4RW4A 4FLUA 3QEPA 4UQGA 3O4NA 1KSPA 4YFUA 4Z4CA 4B8CA 2G8VA 3CFRA 1NK4A 4KHQA 2KW4A 1Q8IA 3H08A 4OPKA 3OS2A 4E0DA 1N6QA 3DLRA 4M41A 3MEGA 2F8TA 1T8EA 3VA3A 1DTTA 4NCAA 4BWMA 2QKBA 4FXDA 2XO7A 3FFIA 1S6PA 4DTMA 1JLEA 2E4LA 4JS5A 4DU1A 1SL2A 1N5YA 2E6MA 1Y97A 3AO5A 1BCOA 4FCYA 4OPJA 1U49A 3RRGA 4TSXA 3V1RA 5HLFA 4HUGA 2FC0A 1FKPA 2XY5A 3S3NA 3OYDA 2PY5A 4DG1A 3K5NA 2HHSA 3LPUA 2ZQBA 3AVGA 4FK4A 2XY7A 4CESA 4O4GA 3T19A 2XY8A 1QE1A 2GUIA 3VQCA 1KLMA 1BHLA 2ITGA 3V1OA 1WSHA 4L8RB 5FDLA 1VRUA 2FBXA 4G1QA 1D9FA 3O3HA 5CYQA 1L3TA 4E89A 5HRPA 4BE2A 3AVNA 3L2QA 5HRSA 4J2DA 4FJ8A 3VQ6A 1RT1A 1WN7A 1Z26A 4CK1A 2O4IA 5E41A 4O55A 3I0RA 1WLJA 1S6QA 5KTQA 4E7LA 4M42A 4E7IA 3IAYA 3I0SA 4CCHA 1RT4A 3CYMA 3JYTA 3HVTA 1X1PA 4W5TA 4FLZA 4JS4A 3V9SA 4FVMA 4DTUA 4Y1CA 2Y1IA 3B6OA 3AVJA 3LWLA 4N5SA 4FJNA 3QEWA 4M3YA 1SKRA 5HROA 1JLCA 1UA1A 4FYDA 4DSFA 1XC9A 1DLOA 1FK9A 3AO2A 4DFPA 1D5AA 1FXXA 1WAFA 4HVJA 3NAEA 2BANA 2YNIA 4BDYA 1EETA 3TAEA 2PZSA 2HHVA 2G8UA 2Y1JA 5J2MA 2VG5A 2HW3A 3NGYA 4Q5VA 3OYKA 4FM1A 1RT5A 1I39A 2D5RA 3C94A 1GOBA 3LP0A 1BIUA 2X6NA 3NF8A 3NH0A 4E7KA 1U47A 4M3UA 3VQ9A 4DMNA 3KIOA 3L2WA 3EYZA 4DQQA 2PYLA 4O5BA 1RTHA 4FJHA 1EXQA 3TARA 4CEQA 3RWUA 3D0PA 4KB1A 3NGZA 1TKZA 2Z1JA 3VN5A 4CJRA 4CJLA 1HNVA 1RT3A 3K58A 2D0BA 3ZSQA 3MXIA 4B08A 5CZ2A 1EKEA 4FW2A 1NKEA 1YTUA 1ZBUA 3PV8A 3AO1A 3HM9A 1Q9XA 1RCHA 4XIUA 1KVAA 3SQ2A 1ZYQA 3DRPA 2G8WA 1BCMA 2P51A 4MQ3A 1WSFA 4DTXA 2AJQA 1NJXA 4W5NA 4K8ZA 3HL8A 1U45A 3ULDA 1TK0A 3VQ4A 1GOCA 3AVFA 3AV9A 1J53A 1JLFA 4CJ4A 3V81A 2KZZA 4IBNA 2P5GA 3B6PA 1JLGA 2YKNA 4CJ3A 1ZBIA 2KFNA 1TGOA 3QIPA 2BE2A 2YHBA 1BQMA 4DTSA 1IH7A 1VSLA 3VA0A 4KHYA 1L5UA 1SKSA 2HVIA 3I8DA 4C8LA 3VQDA 3KD5E 1XWLA 2X74A 2KFZA 3NH2A 3F73A 2DFFA 4F3OA 1NKCA 1UOCA 3ALYA 3LANA 4CF9A 4B3OA 3PX4A 1JKHA 1O1WA 3BGRA 1S5JA 4PUOA 5I42A 1TKXA 1KVCA 4CHOA 5C25A 5HP1A 1NK8A 1QS4A 5KRSA 1U04A 4GW6A 1UA0A 4E1NA 1HNIA 4Y1DA 3ZT2A 4M3ZA 1G15A 3NF6A 2RPIA 1CZ9A 1X9WA 3QETA 1R0AA 1NK9A 4CK3A 1U4BA 3S3OA 1RTIA 3DM2A 2HB5A 4KV8A 4KHSA 4DS5A 2HHXA 4YNQA 1VSMA 3QINA 1S1VA 3P83D 1RDCA 2WONA 3RR8A 3DMJA 4FK0A 3LP3A 1LWFA 3KLHA 3L8BA 1ASVA 4ELTA 2HHQA 5J2NA 3L2VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WSJA 4DSIA 4C8NA 4DTRA 1BO5O 3LZIA 1GLCG 1CLQA 4AHVA 4BRKA 2W40A 1T6CA 4B9TA 1RNHA 5I3UA 3FR0A 4GNIA 1KRPA 4AHSA 4CJFA 4F4KA 3VQAA 1HX1A 1QZ6A 2YX6A 1RT2A 5J2PA 3ZSZA 3H3OB 1I3AA 3CCRN 1BL3A 3AVLA 3SZ2A 5AQOA 3WXKA 3LDSA 4DKWA 3MX2A 1NNEA 2X78A 4LFCK 1QQCA 2V51B 3DYAA 5C2DA 4CIGA 3T1AA 3D2FA 4AH9A 5J1EA 3KLFA 3I8BA 1JLAA 2YCHA 3OYFA 3EE8A 3TSUA 4R5PA 3VQ5A 1A5WA 4HCCA 4DQIA 5SZTA 3VF4A 2PYJA 4YOTA 3LL3A 4DSJA 4DLEA 5T7BA 2PBDA 4FWRA 5BREA 3TU5A 3ZT1A 5AQYA 1NKBA 3VTHA 3F9KA 1U2VB 1BUPA 4JKGB 4IFYA 2E1ZA 3SQ0A 4LF5K 3K9JA 4JRPA 3KLEA 3ATUA 4N56A 3AVBA 5AQGA 4CEBA 4FLYA 3O1WA 5B8HA 3CJBA 2JLEA 3SCXA 3OYNA 3RSEA 3QEXA 3Q7CA 2Q0UA 3C6HA 2OYQA 4J2AA 3I33A 4PKGA 3HI0A 1C0UA 3LM9A 3DLEA 3IRXA 3EO3A 4QS7A 1HNWK 2ASOA 3PX6A 5AFUA 2VQEK 1F21A 5CYMA 3HSTB 4KHWA 2VWJA 3ZSOA 4E7HA 3MEDA 4JLHA 1HYSA 5KRTA 1BIZA 3CM5A 4DQRA 3CD6N 3RTVA 2J4RA 4AHTA 1KC8O 1HJOA 4YHHK 3C6TA 4DF4A 4EZ6A 4M3XA 3ZYYX 3SAGA 4CGHA 2W6KA 3LP1A 4CEDA 1TUUA 1JLQA 3F9MA 4BVOA 4C8OA 5CY4A 4BQZA 4G9ZA 3IFRA 2YNFA 1RGIA 4IJAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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