1LAWA

Stabilization of escherichia coli ribonuclease hi by cavity-filling mutations within a hydrophobic core
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYIRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Stabilization of Escherichia coli ribonuclease HI by cavity-filling mutations within a hydrophobic core.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RIBONUCLEASE H
molecule tags Hydrolase
source organism Escherichia coli
total genus 50
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1lawA00
3D0PA 3V9XA 3S3MA 4FJGA 4KHWA 3MXIA 5HRRA 3CG7A 4CFDA 4KB0A 1RDAA 4Y1DA 4J2DA 4DWIA 3QNOA 3LWMA 4IG0A 3S9HA 3FFIA 1D9DA 1ZBIA 1HJRA 1L3UA 4E1MA 1WAJA 3LZJA 3SZ2A 4KHYA 5K14A 2G8VA 3LALA 4E7LA 3OYBA 1YVUA 1WSIA 1RT2A 3S3NA 3QEIA 1EXQA 5HRSA 4DSFA 2X74A 2HB5A 3QLHA 3CFOA 1HQEA 3DLRA 3WNEA 5C25A 3NH1A 1C1AA 4MQ3A 3HVRA 4E7IA 1RTIA 4DTPA 1NK8A 3MXJA 1RBSA 1EX4A 4KHNA 4DS5A 3ZT2A 1FK9A 1WSGA 4FJHA 1SL0A 4M3WA 2F8TA 3LP2A 4CF0A 4IFYA 4H4OA 1JLCA 4FLZA 2DFHA 2XHBA 3NF9A 4HUFA 4NCGA 4FLVA 3KK2A 3K5MA 5SWMA 4KTZA 5J2NA 4BWMA 4LD0A 1UWBA 1WAFA 3LDSA 4DQRA 5J1EA 1GOAA 1C1BA 3K58A 4HTUA 4BDPA 1KLMA 1HMVA 1RT6A 2YNFA 1RCHA 4DSJA 4F8RA 1S6QA 4ID1A 4M41A 4HHTA 2Z1JA 4KTWA 4B9UA 3NH2A 3M8SA 4L8RB 4O4GA 2IGIA 3WNFA 2IC3A 3AVIA 4B8CA 3ZCMA 4CJSA 4OPJA 1UA1A 1N5YA 3L3UA 4CJPA 1ASVA 3PO4A 5FRNA 1EP4A 3HP6A 4IKFA 4J2EA 4FZZA 4AILC 3NHGA 4AHSA 4ICLA 4Q5VA 1TK0A 5CYMA 1JLBA 5CZ2A 1SL2A 3SUPA 2G8HA 1T7PA 4M3UA 4FLXA 4DQIA 4PA1A 3LWLA 1L3VA 3VN5A 1QSSA 4H4MA 2P51A 3L8BA 3AO1A 3AVLA 4W5OA 1W0HA 4CGJA 3OYIA 2KZMA 2D0BA 3PY8A 1ZBHA 1REVA 3L2RA 4Z0UA 1IH7A 3O3FA 5HBMA 4CJUA 4W5QA 4F2SA 1MU2A 4CEZA 3KD5E 1SV5A 2ETJA 2D0CA 4Z4CA 2X78A 1LAVA 4CEAA 3LPTA 4CGHA 1NKBA 3HO1A 3ITHA 1NK9A 4K8ZA 3WNGA 4N76A 4KHSA 1FKOA 4CIFA 3VQ7A 4Z4FA 2G8WA 4FJ5A 3DLHA 3JSMA 5EU7A 1BCOA 1JXBA 4DTOA 4B9SA 1RT5A 3QEVA 3NF8A 3ZT0A 3ZSVA 3QEPA 4ELTA 4O0IA 4OJRA 3JYTA 3QEWA 1DLOA 4CF8A 4CIEA 1X9SA 4NYNA 1S1WA 3MAQA 2OYQA 1RT1A 3NFAA 3M8RA 3F73A 1BIUA 4CFAA 4IDKA 2KFZA 1XHZA 1IG9A 1BL3A 1KRPA 5I3UA 2FC0A 3C6UA 2OPSA 3THVA 4IG3A 4CJ3A 3E01A 4M42A 2Z1HA 3ZSQA 4DG1A 3HJFA 3TANA 4AHVA 4KHUA 2OZSA 4DTJA 3SCXA 1NK4A 5J2PA 3SUOA 3U6FA 1N6QA 1EETA 4FLYA 4FJJA 3L2VA 3TAMA 1D8YA 2ATQA 3NBPA 1RILA 1SKRA 1VSMA 4F4KA 4M3RA 3B6OA 2PY5A 3C6TA 2HNDA 2IAJA 3TWHA 4CGGA 2YNIA 2FBVA 3DOKA 3OJSA 4DTNA 4DTSA 3AO4A 3ALYA 1B9FA 3PX4A 4HCBA 3CYMA 3VQ9A 4HVJA 4HUEA 4CJFA 4ZTFA 3V9ZA 2BDPA 2XO7A 1F21A 4DTUA 4C8MA 2YKMA 3AVNA 4Z4GA 5FDLA 3AVCA 3U3GA 2D0AA 1BISA 1A5XA 1ASUA 3OVNA 3SQ2A 4Q0BA 3ZSRA 5SZTA 4I2QA 1X9WA 1WSEA 4FYDA 4CJWA 4CJLA 4DLEA 4Z4HA 3HL8A 1C1CA 1VSDA 4ZTJA 2E6LA 3OYLA 1A5VA 1WN7A 1C0MA 1RBUA 3NE6A 4FVMA 4QCLA 3PV8A 4W5RA 2B5JA 3MEGA 3KLEA 2A1RA 3AVAA 2IOCA 3VA3A 1Q9XA 2A1SA 3CQ8A 4CK1A 4FLUA 2HHVA 1BQNA 1U4BA 4JRPA 4DQQA 4CHOA 3L2QA 1U49A 3VQBA 4E7KA 4CEEA 4YNQA 2Y1IA 2WONA 1L5UA 1NOZA 1RNHA 3T19A 1IKXA 2RPIA 4DSIA 1Z25A 3NH0A 1IKYA 1RDDA 2Z1IA 2D5RA 5HP1A 2OPQA 3VQDA 1KVCA 1UA0A 5KTQA 5FRMA 3OJUA 1UAXA 4CHQA 3EY1A 1S1XA 2VG7A 2XY8A 2GV9A 4CERA 1QTMA 4KI6A 4PUOA 3U3YA 1SL1A 1A5WA 1J54A 2HHQA 2X6SA 2PZSA 1L3TA 4KREA 5HLFA 1XWLA 1O1WA 3QIPA 4CFCA 4BE2A 3TARA 4CJTA 1X1PA 4N47A 3K5OA 2BE2A 3ZSXA 1TKDA 2P5GA 3A2FA 1W9HA 1VSFA 3V9SA 1S1TA 3AVBA 4CEDA 4CHNA 3RRGA 4M3YA 1WSHA 1ITGA 1HRHA 1BGXT 4AHRA 1TKXA 4KHQA 3B6PA 3HSTB 4KO0A 4CJ5A 4E3SA 4BE0A 4FW2A 4M3XA 2KTQA 4C8LA 1HYSA 4JRQA 1RT7A 3ISNC 1JL1A 1S1VA 3MXMA 4ELUA 2GBZA 1CXQA 3DOLA 3RRHA 4KKOA 1VSJA 3VQ8A 2ITGA 3OYAA 4CHYA 5HROA 4CJQA 4DU3A 3SQ1A 3ASMA 4J2AA 2RN2A 4OKJA 4IBNA 3NGZA 3ZSOA 4FJ7A 1U48A 3VQ5A 4CJ4A 3OYKA 4DU1A 2QXFA 4ZHRA 4H8KA 1KFDA 2YV0X 4TSXA 5KRTA 3QIOA 3I8DA 3PX0A 3RMDA 3AO5A 4B3OA 4F2RA 1DTTA 3SYZA 1NK6A 4CF9A 4FK0A 1RTJA 4CHZA 3RTVA 1JL2A 4AHUA 1JLGA 1TGOA 3EYZA 2HNYA 3HM9A 2EX3A 3TAQA 1U45A 1QHTA 2RKIA 1IKWA 1TL1A 1BQMA 1WLJA 2DFFA 2E4LA 4CEFA 4CJRA 3RMCA 1ZYQA 1TK5A 2G8IA 3NF7A 1TK8A 4CIGA 1VRTA 2W42A 3K59A 4FCYA 4FJ8A 2DY4A 1GOBA 2LSNA 3O4QA 3LZIA 3QERA 4E19A 4CK3A 5KRSA 4AH9A 2Y1JA 3OYCA 1KFSA 1EKEA 1VSIA 4O5BA 3OS1A 2FBTA 1TAQA 1NKEA 1TVRA 2QKKA 1LWFA 3K5NA 3V9WA 4DF4A 1LWCA 1TKZA 4DSEA 4RW6A 1XHXA 3DLGA 4CHPA 4DFMA 4FJNA 1YTAA 4RW4A 2RF2A 3TAEA 4FK4A 4OKEA 1T05A 5JS1A 1BCMA 3SJJA 3BGRA 3AVMA 3M8QA 5JS2A 3LP3A 4W5TA 1KVBA 4CCHA 2BANA 2HVHA 3WNHA 1NJXA 3AA3A 3NDKA 4DQPA 2Z1GA 4RW8A 2ZD1A 4B9VA 1RBTA 4B9NA 4F3TA 1BI4A 1C0TA 4E0DA 4FJMA 1CZBA 4W5NA 4BWJA 1VSEA 4UQGA 4KAZA 4NYFA 2P5OA 4HCCA 4CGFA 1B9DA 3AVFA 3HT3A 4FM0A 1QE1A 1X9MA 3O3GA 1KSPA 1J9AA 3OYHA 4DTMA 4B9MA 3AVHA 3VQAA 4CGDA 1NK5A 2YNHA 2G8KA 1HNIA 3DLBA 1IKVA 1G15A 5J2QA 2Q3SA 4FJIA 3HPOA 4FXDA 4OGEA 4PQUA 3SUNA 4OLAA 3SI6A 2BGGA 1GOCA 3KIOA 4RW9A 4JS4A 3RMBA 4DFJA 1S5JA 3ULDA 4B8AB 3V6DA 4RW7A 4MFBA 4FM1A 3SNNA 3LP0A 4OKKA 4KTQA 1VSKA 3DRPA 5C42A 4C8KA 4CJVA 4C8OA 3OYMA 4CFBA 2B4JA 3SV3A 3LAMA 3VA0A 1S9EA 5J2MA 4EP4A 3AVGA 4OPKA 1ZBLA 4DQSA 2XY6A 4CEOA 3SPYA 1R0AA 3LPUA 1ASWA 1RDCA 2IS3A 2YHAA 1NK0A 1JKHA 1LW0A 1HYVA 2ZE2A 3QNNA 4DTXA 3TAGA 1L3SA 4FZYA 3OYFA 1VRUA 4DTRA 4F3OA 1KLNA 3OYDA 3KJVA 4FM2A 4M3ZA 3V4IA 3V9UA 3C95A 3M8PA 4E7JA 1QQCA 1Q9YA 5CZ1A 3QESA 3VQEA 1CLQA 2XRIA 3ZT3A 1NJWA 1SKSA 1J5OA 2HHXA 3RWUA 4CECA 2OPRA 1WNSA 3DYAA 3SQ0A 1UOCA 3OS0A 1FXXA 3ZT4A 4J2BA 2DTUA 4KRFA 2FBYA 3L2WA 2X6NA 4Z4EA 3HK2A 3C94A 3CFPA 3V1OA 3K5LA 1TKTA 4CF1A 1NOYA 3ZSWA 3AA2A 4CEBA 1C6VA 4O55A 3S3OA 4OGCA 3VQ4A 3DRSA 3HXMA 4FJ9A 2G8FA 4B9LA 1RTHA 1YT3A 3P5JA 4CJEA 3KK3A 1RTDA 3I0SA 1QSLA 3DI6A 3DLKA 3OYJA 3H08A 4B9TA 3AV9A 4O0JA 2XY7A 4FJKA 4LSLA 4CEQA 4KV8A 3G0ZA 4DU4A 4DFKA 3LAKA 3DRRA 2OZMA 4FW1A 3G10A 4DSKA 4PWDA 4CJKA 3KD1E 4E1NA 3UIQA 4JS5A 1I39A 2VG5A 4I2PA 3HVTA 2O4IA 3V1QA 3IS9A 3OS2A 3MECA 1HPZA 2PYLA 2I5JA 1RT3A 3KLHA 1KTQA 3NAEA 4FLWA 1B92A 2VWKA 1DTQA 4KPYA 3MEEA 2OA8A 3T1AA 2EHGA 1HQUA 5CYQA 5KGXA 4YFUA 3AVJA 2WOMA 3LP1A 3LANA 1LV5A 5D3GA 2DFEA 2F8SA 3TR8A 2O4GA 2VG6A 4DS4A 4XIUA 4DF8A 1RDBA 3K57A 3RR7A 3PX6A 1U47A 4WE1A 2QK9A 2XY5A 3QETA 1Z26A 2FBXA 4BE1A 3AA4A 4DLGA 3QO9A 5T7BA 5I42A 3HP9A 5FROA 4FZXC 4LY7A 1QS4A 5DMRA 3OYGA 2KZZA 2QKBA 1J53A 4BDZA 4BACA 1S1UA 4AHCA 4OVLA 1FKPA 1JLQA 3ZSYA 1VK0A 5HRNA 1ZBFA 3VQQA 1RBVA 4B08A 3DMJA 1LWEA 3IRXA 1QSYA 1TAUA 1I3AA 4IFVA 3AVKA 4GW6A 3TAFA 2IDOA 3KK1A 2GUIA 1Q8IA 2G8UA 1WSJA 4QOZB 4N5SA 1T8EA 3P1GA 1HYZA 4GMJB 1VSHA 3O3HA 2ZQBA 3TAPA 1LAWA 3HYFA 3KLIA 3DLEA 4AHTA 4FLTA 4LH5A 5DK5A 4CF2A 4QAGA 4JLHA 4KI4A 3PUFA 4C8NA 4CE9A 1YTUA 3EZ5A 4RG8A 2B6AA 3I0RA 3KKSA 3KTQA 3MEDA 3IAYA 3DM2A 2HHSA 1IO2A 3V81A 1TV6A 2YKNA 4N41A 1BHLA 3D45A 3P83D 1XI1A 1XC9A 2AJQA 4LH4A 3ZT1A 1S6PA 4KFBA 1T03A 4ELVA 5KI6A 1VSLA 4E89A 2P1JA 3CFRA 3L3VA 1ZBUA 2R7YA 2HHWA 1KVAA 3O4NA 3HPHA 2JLEA 3QEXA 1D5AA 3F9KA 4NCAA 2HHTA 3OY9A 2KQ2A 3AA5X 3SUQA 3RR8A 4BDYA 4OLBA 4DFPA 4KB1A 3KKRA 2E6MA 3L2UA 3VQCA 3SPZA 4M3TA 1NJYA 3CM5A 4CK2A 4Y1CA 3CM6A 1K6YA 1NK7A 4I9QA 2OPPA 2VWJA 4PY5A 1LW2A 2YNGA 2KFNA 3OYNA 3OYEA 1NJZA 1JLFA 3T3FA 2JGUA 4M45A 4HUGA 3QINA 1SKWA 4FJXA 4DSLA 1D9FA 3AO2A 5CY4A 2HHUA 5C24A 3AO3A 1HNVA 1JXEA 1Y97A 4DMNA 4G1QA 5E41A 3NGIA 5KGWA 4R5PA 2HVIA 1BI4B 2HW3A 3RMAA 4NCBA 3VQPA 1BIZA 2PYJA 4I7FA 3PO5A 1RBRA 4EZ9A 1U04A 1TL3A 4O44A 3SQ4A 2KW4A 1CXUA 4N56A 4CESA 1JLEA 1CZ9A 1RT4A 4ID5A 2NUBA 4FJLA 3VQ6A 3IG1A 3NGYA 3KLGA 3KLFA 4EP5A 3BDPA 1WSFA 2HNZA 1JLAA 3HPGA 4K8XA 4Z4IA 4CGIA 3K2PA 2HMIA 4E7HA 4GVMA 4EZ6A 3V1RA 5HRPA 3NCIA 3TABA 4I9LA 3ZSZA 3TI0A 1S9GA 1NKCA 2YHBA 4LSNA 2F96A 1KCFA 1SUQA 3SV4A 4FK2A 1C0UA 3NF6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SAZA 3V9XA 4CZKA 4CFDA 4KB0A 2Q97A 4J2DA 3QNOA 1MDUB 3LWMA 4IG0A 3CCSN 4JKFA 3EE9A 4AF1A 5K14A 3K9KA 1WBBA 4E7LA 1YVUA 4DR4K 3SAGA 4DSFA 3QLHA 1HQEA 3NH1A 2QA4N 3LL3A 4BC2A 2UUAK 1K8KB 4JI7K 1EX4A 4MDBA 4DS5A 1FK9A 3O08A 4CF0A 4FLZA 1JLCA 3LM2A 1X3MA 4HUFA 3I33A 4FLVA 3KK2A 5SWMA 3QBXA 3P39A 3O9SA 4DQRA 5J1EA 5KQ8A 4DSJA 3BP8A 1S6QA 4HHTA 2DPNA 2Z1JA 4B8CA 2IC3A 1EWQA 3E1YA 3ZCMA 1BU6O 1IBKK 4IOAL 4WQ4A 3VERA 3MK6A 2HHHK 1TK0A 1VQ6N 1IJJA 1JLBA 5CZ2A 3SUPA 2G8HA 5LMNK 5AQIA 4PA1A 3LWLA 3SK3A 4H4MA 3L8BA 3AVLA 2D0BA 1ZBHA 3CCRN 1IH7A 4X62K 4JI1K 3TTDA 4W5QA 3ZETA 2ETJA 3C6HA 4IOCL 2O8DB 5HOOA 1NKBA 3ITHA 1WOQA 4K8ZA 3VQ7A 4Z4FA 3LDPA 2G8WA 5FPDA 3EKUA 4PKHA 3JSMA 4B9SA 4JK7A 4O0IA 1DLOA 4CIEA 4YOVA 4NYNA 1S1WA 4BG8A 2KFZA 3NVMA 5AQLA 1IG9A 1BL3A 5I3UA 3THVA 2V52B 3E01A 2Z1HA 4M42A 4DG1A 2QWLA 2OZSA 4DTJA 1NK4A 1DT9A 4FJJA 4H03B 4JKBA 2WTUA 3IFRA 1RILA 4B3RK 1HLUA 2PY5A 3E9PA 3C6TA 2ZWHA 4X66K 2HNDA 4CGGA 3DOKA 2FBVA 3ALYA 3VQ9A 4JD2A 4HUEA 4CJFA 1NJIO 1E3MA 1NU0A 4ISFA 4JN4A 1ATSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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