1LAWA

Stabilization of escherichia coli ribonuclease hi by cavity-filling mutations within a hydrophobic core
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYIRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Stabilization of Escherichia coli ribonuclease HI by cavity-filling mutations within a hydrophobic core.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RIBONUCLEASE H
molecule tags Hydrolase
source organism Escherichia coli
total genus 50
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1lawA00
4O44A 3K5NA 2ATQA 1RT1A 3CFOA 4KTWA 4DTSA 1G15A 2G8IA 4FJ5A 2KFZA 3U3GA 4OPKA 3PV8A 1RTDA 1U04A 3AVJA 5I3UA 3VQ6A 1RDCA 3JSMA 1NK9A 3MEEA 4F3OA 4PWDA 3AA4A 4YFUA 4FLXA 1KLMA 3U6FA 2X6NA 5KRSA 1D5AA 4CECA 1IH7A 4R5PA 4OGEA 3SNNA 4FK2A 3V4IA 1BGXT 1Q9YA 1EETA 4OJRA 1C1AA 1ASVA 4E7LA 4OVLA 3SUQA 3KK1A 2XHBA 2NUBA 3WNFA 1HQUA 1XC9A 1NJZA 4FZZA 1WSHA 1A5WA 1RNHA 1XWLA 3KLIA 3VQBA 2E4LA 4RW6A 3CM6A 4AH9A 4B9MA 4ID5A 5HP1A 4FJMA 1QHTA 4PUOA 3OYIA 4W5TA 2YKNA 3OS2A 1HYZA 1SKSA 1KVBA 3CYMA 3KJVA 4DLGA 1FK9A 1QTMA 1ZBIA 2OPQA 4B8CA 1GOCA 1J9AA 1IKVA 4Q0BA 2BDPA 3T1AA 4OLBA 4DQQA 5J2QA 3TAPA 1EXQA 3L8BA 3I0RA 4B9SA 3NHGA 2HVHA 1REVA 4NCBA 3AVAA 4AILC 4LH5A 1BIUA 1RBRA 4CEOA 3AVCA 5EU7A 5C25A 2P1JA 3DYAA 4M3TA 3B6PA 4KPYA 1U45A 3DOKA 3LP2A 2PZSA 1S1VA 5K14A 3OYNA 1WSGA 1RT4A 1RTIA 1KTQA 4FJLA 4KV8A 4LD0A 4RW4A 3KK2A 3PX4A 1TKXA 3RMBA 4O4GA 2O4GA 4CF8A 3SQ4A 2PY5A 4DG1A 4N76A 2ZQBA 1JXEA 3TAEA 4M41A 4IDKA 2HB5A 3NGZA 3V9XA 3DLHA 3DLEA 3AVHA 1U4BA 4CJQA 3V9UA 4FJ8A 2YV0X 2F8TA 1LW2A 1DTTA 5SZTA 4W5OA 3V1OA 4DSEA 1ASWA 4ELUA 3ZSXA 4BWJA 4J2EA 1J53A 1X1PA 2B4JA 3PUFA 4E1NA 2BGGA 1NKEA 3AO1A 3OYFA 1ZBLA 3KD1E 1RBVA 1BHLA 1FKOA 1W9HA 2D5RA 3NF9A 4KFBA 3AO5A 3MXIA 2QK9A 4CIFA 4C8KA 4DWIA 3K2PA 5KGWA 2X6SA 1BQNA 4E7IA 1SUQA 3NH0A 4M45A 1LV5A 1C0MA 4KHWA 1HJRA 2E6MA 4KB1A 2E6LA 2XY8A 1RDDA 1RT7A 1S1XA 4CHYA 3LAMA 4CF0A 3M8SA 2I5JA 4KHYA 1JLQA 4FJKA 1A5VA 2RF2A 2IGIA 3O3HA 4Q5VA 3T3FA 1U48A 1UAXA 2FBVA 3AO4A 3D45A 2Y1JA 4RW9A 2JLEA 3KKRA 5KRTA 4O0IA 2HHUA 4I2PA 4E7JA 3AVNA 5KGXA 1QSYA 1Z25A 4F3TA 1NJYA 1GOBA 3AVGA 3LPTA 3ISNC 3LWMA 3QESA 3I8DA 4Z4HA 1VRTA 3NGYA 4W5QA 4CEDA 3S3NA 2YNGA 4ZTFA 1QQCA 4O55A 5FRMA 3CFRA 3DLGA 3HK2A 1BIZA 1ITGA 3SZ2A 2P5OA 5DMRA 1WAFA 1VSKA 3RWUA 4TSXA 4NYNA 3HSTB 4CJFA 4B3OA 3KLHA 4H4OA 3OYAA 3OYJA 4EP4A 5J2MA 3QNOA 4FLVA 1TK8A 4BDPA 3VQ5A 4EZ9A 4WE1A 1ZBFA 4ICLA 4ZHRA 4NCGA 4C8OA 4B9NA 4CJLA 2HHXA 1CLQA 4CHNA 1BQMA 1S9EA 1SKWA 3DOLA 4KHQA 4EZ6A 3IRXA 4CK1A 1UA1A 3KD5E 2LSNA 4CHOA 5E41A 3NGIA 3LDSA 3JYTA 4FLYA 1YVUA 3QEPA 1BI4B 3EYZA 1WN7A 4OLAA 3QEVA 3HVRA 2A1SA 4CF1A 3F73A 4DFKA 1UWBA 4CEBA 4CGGA 4B8AB 1RT2A 1HNVA 1TVRA 3CFPA 1XHXA 1KVAA 2WONA 1WSEA 3V1RA 3CQ8A 4AHVA 2KFNA 1SKRA 1IG9A 1B9FA 1IKXA 3ZSQA 2PYLA 4GW6A 1LAWA 1S6PA 2KZMA 1HQEA 1XHZA 3HJFA 1LW0A 4FW2A 4XIUA 4HTUA 1BCOA 3DLRA 4DU1A 2HHSA 1JLGA 1VSHA 3DMJA 2HNZA 4E3SA 4PY5A 4PA1A 3RMCA 4CJTA 2Z1GA 1TAQA 1C1CA 3V6DA 3P1GA 4FJHA 2OZMA 2D0AA 3C94A 3VQCA 4FXDA 1B9DA 1RT3A 4E1MA 1TAUA 4CFCA 4W5RA 1U47A 4J2AA 1UA0A 4BACA 3ZT4A 3NFAA 1VSIA 3TANA 2G8HA 4M3RA 1K6YA 3VQAA 3M8QA 4FYDA 3C95A 2OZSA 3V9WA 1A5XA 1UOCA 4LSNA 3LPUA 3VN5A 4CHPA 2QXFA 4FJGA 3TI0A 3OJUA 3V1QA 4BE0A 2OYQA 1SV5A 2QKBA 2HHVA 5FRNA 4OPJA 1L3UA 1KRPA 4CJ3A 3OYGA 2X74A 1TKDA 4W5NA 4CGHA 3V81A 1ZBUA 3QIOA 4CJEA 1TKZA 2Z1IA 4FW1A 4O0JA 3KLFA 3SCXA 1QSSA 2AJQA 4B9LA 1WSFA 3WNGA 1DLOA 4AHUA 3L2RA 1RTJA 4CJUA 2W42A 1WAJA 1NJXA 3ZSZA 3T19A 4ELTA 1LAVA 5J2NA 1D9DA 2RPIA 3AO3A 3V9ZA 1YTAA 1SL1A 2VWJA 4FM1A 3MEDA 5DK5A 5HRSA 1KFDA 1D9FA 3SUOA 4BE2A 1JXBA 3VQEA 1I3AA 2OPSA 3SV4A 4JRQA 4DQSA 4KAZA 3HP9A 3KKSA 4CJSA 3LWLA 3KLEA 3NAEA 4HUGA 3QIPA 4M3XA 3ZSYA 4M3YA 2B6AA 2HHQA 4OKKA 1NOZA 3L3VA 1J5OA 4HCCA 2B5JA 1JLAA 4DTRA 3U3YA 2HVIA 3AA3A 3K58A 3OYCA 1N6QA 4H4MA 4KI4A 4CEEA 5JS1A 4CGDA 1KFSA 4LY7A 4DTJA 3RR7A 4CCHA 4CEQA 1WLJA 2YNFA 5C24A 3OY9A 3NDKA 2FBTA 4DU3A 1QE1A 5I42A 2IOCA 3EZ5A 3SPYA 3TABA 3ZCMA 3K5OA 1DTQA 1L3VA 2DY4A 1F21A 3UIQA 4K8XA 2OA8A 4GVMA 3SYZA 4DLEA 1T05A 1NKBA 4F8RA 4FZXC 5CYQA 3TAGA 3BDPA 3ZT3A 4OKJA 3V9SA 1C6VA 1WSIA 3DRSA 3HL8A 3NE6A 4DTOA 4FLUA 2F8SA 5J1EA 4N56A 3I0SA 4Y1CA 4B08A 1NK6A 2G8VA 1JLCA 1W0HA 4FK4A 3DM2A 4IKFA 1VSFA 3VQ8A 2RKIA 2Z1HA 4CEZA 1RCHA 3LALA 1KLNA 1Z26A 3NF8A 4GMJB 2XY6A 4CFDA 3ALYA 1NKCA 1NK4A 4LSLA 4HCBA 4AHCA 2KQ2A 2IAJA 2GV9A 4EP5A 2QKKA 4F2RA 4IFYA 4AHSA 4FJ7A 5D3GA 2HW3A 4M3WA 2IC3A 1VK0A 3ITHA 4DFPA 2HHTA 3SPZA 3NBPA 1JLFA 4IG3A 1S6QA 3QLHA 3OYHA 4NCAA 4CGIA 4E7HA 3TWHA 1TK5A 3O3GA 3F9KA 3QEXA 3HP6A 4FK0A 4DS5A 3RMDA 2HNDA 3AA2A 4E0DA 1JKHA 2G8WA 4BE1A 3SQ2A 3SUNA 4KHSA 1Q8IA 4BDZA 1VSMA 3OJSA 4DSIA 1JLEA 5T7BA 3M8PA 4OGCA 4DSJA 4KTQA 4KO0A 3L2VA 3LZIA 3PY8A 4BDYA 1LWFA 4DTXA 4FVMA 1T7PA 5C42A 4RG8A 3NF6A 4HHTA 3LANA 3TR8A 3H08A 1RDAA 1VRUA 2YKMA 3MECA 4DMNA 4F4KA 4DSFA 1VSEA 3ZSVA 3NCIA 4CEFA 2YHBA 3IG1A 5HRNA 3MEGA 1TK0A 2XY7A 4ZTJA 4FJJA 2ZE2A 5HRPA 1S1TA 3C6TA 1S9GA 4CJKA 1FXXA 3HYFA 4CFAA 3HVTA 4CEAA 4CK3A 3IAYA 3HPGA 2YHAA 3DRPA 1ZYQA 3RR8A 5SWMA 2Z1JA 5CY4A 1I39A 3WNEA 3ZSRA 4CESA 1RBUA 4I2QA 4N47A 2F96A 4C8LA 4IBNA 3WNHA 1GOAA 4PQUA 4AHTA 2R7YA 2DFEA 3PX0A 2ITGA 3OYLA 3BGRA 3OYEA 3K5MA 1BI4A 4FLZA 1X9WA 3THVA 1O1WA 1IKYA 4ID1A 2GUIA 3AVIA 2Y1IA 4NYFA 1N5YA 1HYSA 3KLGA 5HLFA 1HPZA 3PO5A 1TL3A 1CXUA 3LP0A 1TV6A 4HUEA 2G8KA 4CJRA 3E01A 3QETA 4KREA 4QCLA 4FLWA 4DTUA 3QERA 1EP4A 2FC0A 3SI6A 4CHZA 4FCYA 1X9MA 1T8EA 5HBMA 3S3MA 5FDLA 4I7FA 4L8RB 1KSPA 4DQIA 4CGFA 1TKTA 4B9VA 5JS2A 2FBXA 1C0TA 1RBTA 4ELVA 4M3ZA 4DU4A 1ASUA 4K8ZA 3TARA 3SQ0A 4Z4IA 2VG7A 3AVMA 3CG7A 3FFIA 3ZT0A 4CJWA 3HXMA 3K5LA 3TAQA 4CFBA 3D0PA 4M42A 4CERA 4QOZB 1BL3A 3S3OA 4J2BA 4KTZA 3VQQA 4IFVA 4I9LA 3OYMA 3S9HA 5J2PA 2X78A 3L2WA 2OPRA 1U49A 1NK7A 4DQRA 2XRIA 3NF7A 2KZZA 4C8NA 3PO4A 3TAMA 5FROA 3HT3A 4Z0UA 1C1BA 1RBSA 1RT6A 1S5JA 2HNYA 1B92A 2IS3A 3HPHA 1C0UA 3DRRA 1RT5A 3AVBA 4OKEA 3KK3A 2VWKA 3QEIA 3DLKA 4CJPA 3QO9A 3EY1A 4DTNA 2OPPA 1HYVA 1RTHA 3AVLA 4KKOA 3LAKA 4HUFA 1Q9XA 4E19A 3G10A 3O4NA 3PX6A 3RTVA 3SJJA 1NK5A 4CF2A 4CF9A 4FJXA 4FJIA 1JLBA 1NOYA 2PYJA 4E89A 3DI6A 2EHGA 4CJVA 1WNSA 3MAQA 2G8FA 1EKEA 4KB0A 1VSDA 1JL2A 1VSLA 3OYDA 4H8KA 1FKPA 2ZD1A 4O5BA 3O3FA 2P5GA 3HO1A 3VQ4A 3HM9A 3OS0A 4FJNA 2GBZA 4Y1DA 4AHRA 3M8RA 4JS5A 4DTPA 1KCFA 2Q3SA 3KIOA 4Z4CA 1L3TA 5CZ2A 4M3UA 5KI6A 3P5JA 3AVFA 2YNIA 1CZ9A 1WSJA 4YNQA 2HMIA 4DF8A 1YT3A 2RN2A 4QAGA 4HVJA 4B9UA 3L3UA 2KW4A 2ETJA 2WOMA 5CYMA 2EX3A 3VA0A 4DFJA 1D8YA 4DSLA 2FBYA 3VQDA 1LWEA 3NH1A 1IO2A 3OS1A 5CZ1A 4KHUA 1HNIA 1S1WA 2YNHA 3RMAA 2D0CA 3LP3A 3ULDA 2G8UA 2KTQA 3QNNA 1LWCA 1JL1A 3SQ1A 2A1RA 3DLBA 4JS4A 1NK0A 1Y97A 1XI1A 3NH2A 3ZSOA 4FJ9A 1CXQA 3VQ9A 4DF4A 3O4QA 3CM5A 4CE9A 5HRRA 4DSKA 4I9QA 3OYBA 2HHWA 3TAFA 1NJWA 1ZBHA 2BANA 4CIGA 1YTUA 3AV9A 4Z4GA 1MU2A 4CK2A 2O4IA 4DFMA 1J54A 4MFBA 2DFFA 4JLHA 4JRPA 4RW8A 2DTUA 2XO7A 1NK8A 3B6OA 3AA5X 3ASMA 3VQ7A 1QSLA 4FM2A 2XY5A 4DQPA 3C6UA 4N41A 3ZT2A 3LZJA 3IS9A 4KHNA 1HRHA 3VQPA 4CJ5A 2D0BA 3VA3A 1VSJA 2BE2A 1RDBA 4C8MA 2P51A 1RILA 4Z4EA 4E7KA 1IKWA 2DFHA 3RRHA 4BWMA 2JGUA 1SL0A 4DTMA 4G1QA 3MXJA 1BCMA 4FLTA 3ZSWA 1EX4A 1R0AA 1T03A 1QS4A 2VG5A 3L2QA 4B9TA 3OVNA 4J2DA 3SUPA 4UQGA 3OYKA 4CIEA 1X9SA 4KRFA 1L5UA 3A2FA 3MXMA 1L3SA 2IDOA 4KI6A 2VG6A 4N5SA 4LH4A 5HROA 4F2SA 1HMVA 3QEWA 4FM0A 3P83D 3K57A 1CZBA 4RW7A 5KTQA 4Z4FA 1TGOA 4CGJA 1S1UA 3QINA 3RRGA 4CHQA 3SV3A 4IG0A 3K59A 1KVCA 3LP1A 4MQ3A 1BISA 4CJ4A 1TL1A 4FZYA 3AVKA 4DS4A 1SL2A 3ZT1A 3L2UA 3AO2A 3HPOA 3KTQA 3G0ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BRMA 2KFZA 1G15A 3P31A 2GEMA 4L3QA 2ZF5O 3PV8A 3OTOK 2I7PA 4IOXA 3AVJA 5I3UA 3UKUB 4DUYK 4F3OA 3AA4A 4FLXA 1KLMA 1K9MO 4JKEA 5KRSA 4FK2A 4OJRA 5HL7L 1IV0A 4FWKA 4YOYA 2XHBA 1NGIA 1HQUA 1XC9A 3VQBA 1RNHA 3KLIA 4FWQA 3JAMO 1HUXA 4H0PA 4B9MA 3CM6A 4AH9A 4FJMA 2DPNA 4PUOA 3Q7BA 3OS2A 1KAZA 3U9DA 1SKSA 4DLGA 2OPQA 5EOYA 4OLBA 3TAPA 4FWRA 3CI5A 3U9ZA 4WQ5C 4AILC 3J7ZO 5C25A 1VQ7N 5AQGA 3DOKA 3VPZA 2ASMA 4YDUA 1W97L 1YITN 4FJLA 3CQYA 1MWKA 3FR0A 5KPRA 1TKXA 2Q97A 4CZJA 2GX9A 4CF8A 2UXDK 4DG1A 4N76A 1JXEA 2NRVA 3DLEA 2UU9K 5SZTA 1ESVA 1ASWA 4G9ZA 3WEEB 3THWA 2B4JA 2BGGA 2P9NA 2F9WA 4BRQA 3KD1E 1BHLA 1FKOA 1W9HA 2QK9A 4DWIA 4JKFA 2E2NA 1SUQA 1U2VA 1C0MA 1HJRA 1VQ5N 1RDDA 3M8SA 4FWPA 2FSNA 3VGMA 2RF2A 5AQOA 3O3HA 3UE5A 1Q86O 3T3FA 1UAXA 3AO4A 2O8FB 2WTUA 5KRTA 4YY3K 1I94K 2QWOA 3E9LA 1Z25A 3MMVA 1GOBA 3AVGA 3ISNC 2D1KA 4W5QA 4BGBA 4LF5K 4IOAL 1BIZA 3SZ2A 1VSKA 1WBDA 3GG4A 4NYNA 4JI6K 2D0OA 1ATNA 5J2MA 1YJNN 1TK8A 4BDPA 1SQKA 4FPBA 4NCGA 4C8OA 4CJLA 1CLQA 1BQMA 1GLDG 2HBLA 3IRXA 2ZJRL 4CHOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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