1MWMA

Parm from plasmid r1 adp form
Total Genus 98

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
320
structure length
316
Chain Sequence
MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
S1 (2-7)TIV1 (8-11)AH3 (116-126)S2 (11-17)3H5 (307-309)TI1 (18-21)S3 (23-29)S16 (301-302)AH1 (76-88)O1 (33-35)S4 (32-33)S6 (54-57)TIV2 (39-42)EMPTYS5 (47-49)TIV3 (49-52)TIV4 (50-53)O2 (58-60)3H1 (70-74)S7 (95-102)S11 (139-147)AH2 (104-107)S9 (113-114)S8 (108-109)TII2 (182-185)TI2 (109-112)TI4 (172-175)AH4 (148-159)S13 (176-182)AH8 (242-268)TI3 (161-164)S12 (165-171)TIV5 (183-186)S14 (188-194)AH5 (199-209)O3 (213-215)3H2 (216-218)AH6 (219-228)TI6 (280-283)AH9 (286-294)S15 (275-279)3H3 (283-285)3H4 (298-300)TIV6 (304-307)AH10 (310-319)TII1 (132-135)AH7 (232-238)TI5 (228-231)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Structural protein
source organism Escherichia coli
publication title F-actin-like filaments formed by plasmid segregation protein ParM
pubmed doi rcsb
molecule keywords ParM
total genus 98
structure length 316
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mwmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mwmA01
3WXIA 2YHYA 2NZTA 2KHOA 2GWKA 3ID8A 3ATVA 1BDGA 3BUZB 5AFUA 3FLCO 1WOQA 3J8AA 2IVOA 1BOTO 3FE1A 2A3ZA 4ISEA 1X3MA 3WT0A 3RSEA 2ITMA 4BR7A 5KQ8A 5JICA 1DEJA 1NGEA 3VETA 3A0IX 4BR2A 4B1YB 3AAPA 2Q0UA 5AR0A 5EXWA 5KPZA 4FPAA 5LJVA 3JS6A 1YVNA 2P9PA 3HM8A 1KAXA 3CJCA 1D4XA 3TPQA 3WQUA 3U8XA 2F9WA 2YHXA 3ZEUA 1YAGA 4CZJA 1X9JA 2VYPA 1RFQA 3IDHA 5BN8A 4H5TA 2GELA 1NWKA 3IMXA 4HTLA 4XH4A 2E2QA 3LDLA 3LL3A 3R6MA 2E2NA 2BUPA 2A40A 1C0GA 5FPDA 4H0YB 4M7YA 4BVPA 4H0PA 3VEVA 4BC5A 2ZGZA 5AZJB 3ULEB 4YDUC 4DCHA 2ZGYA 4BROA 2HF4A 5TKYA 4IXCA 4JN4A 5E26A 3BF3A 5EOYA 2D0OA 1HPMA 3ZETA 5BPLA 5BRHA 4H5WA 2BTFA 1H1VA 5ADXH 3CJ1A 5AZIB 3MN7A 3I33A 4IZ9A 5BPMA 1IG8A 4FWPA 3SMSA 1K8KB 3AARA 3A5LC 1GLLO 1T6DA 4FWQA 4BRQA 3FZFA 4FSVA 3H3NO 3TU5A 3CQXA 1TUYA 1GLEG 1Y64A 3HI0A 3O08A 2GEMA 2QWOA 1QQMA 3MCPA 4PL7A 1CZAN 4I6MB 3EO3A 1EQYA 2P9IB 3DAWA 3DWLA 5KPRA 2W40A 2H3GX 4BRCA 3IFRA 4IJAA 4EHTA 2E8AA 5LY3A 1BWFO 2FSKA 5AQPA 5EX5A 4DHYA 3CQYA 4L3QA 1KAZA 2A6AA 3ENOA 4BC4A 4B1ZA 4NB4A 1YXQA 3H1VX 4BRNA 4CZMA 2P9SB 3A5MC 4CBUA 5BR9A 2ASOA 5AQJA 4F9OA 3R9PA 1Z6RA 1MDUB 1ZXOA 3WUHA 3D7EO 3AY9A 5BRFA 5AQSA 3O1WA 4QS9A 5AQHA 4CZKA 3R8EA 1ESVA 3D2FB 2QM1A 4JHDB 2DPNA 4BGBA 1KAYA 3VERA 4WYBA 1NGJA 4B1XB 3AAQA 4BR9A 3P4IA 4HWIA 4EFHA 2FSJA 5AZIA 1GLBG 5AFUH 2P9UB 3LDQA 3MN5A 4JD2B 1NM1A 3M3ZA 1E4GT 1QHAA 4FWRA 4O5FA 3MN9A 1YUWA 3BEXA 1K8KA 2W41A 1S3XA 2FSNA 1HKBA 2F9TA 4H5NA 3SMPA 4CZEA 2QWNA 3O80A 4AM6A 3ATUA 3CETA 1GLFO 2P9LA 3O6WA 4IJNA 5AQKA 3MN6A 2QWPA 5KQDA 3MK6A 1NGAA 1X3NA 4I6MA 2P9IA 4B1UB 4CI6A 2FF3B 4K43A 3CHWA 5AQUA 1Q18A 4E1JA 3EL2A 1KXPA 3FZKA 4CBXA 3UKUB 1DGKN 1NGDA 1XUPO 1HKGA 1NGFA 4DB3A 3O5BA 3KHYA 2V7YA 4BRDA 4H0VB 3WEEB 4BQZA 5LJWA 3M1FA 2E20A 1MWMA 5AQMA 5F1XA 3C0BA 5AQIA 4XH1A 3H3OB 5AQXA 4A61A 4BRGA 5BRDA 5AQWA 2Q2RA 3ZX3A 4K42A 2IVNA 2A5XA 1LOTB 3W0LA 3A5NC 2V7ZA 2AP1A 3GOIA 3VEXA 3B8AX 3QICA 4FOEA 2D4WA 4RTFD 2ASPA 2YJEA 4JHDA 4GNIA 1QQOA 5AQTA 1NMDA 3VF6A 1GLCG 2J4RA 2P9UA 3GBTA 4JD2A 3O8MA 4FWOA 4BRAA 3MMVA 4BG8A 4ISGA 3KZBA 2CGJA 1ZC6A 4AM7A 5BN9A 1P8ZA 1BU6O 4PL8A 4BC2A 3H45C 4BREA 3IUCA 3UKRB 3WXKA 1LCUA 2D0PA 4WQ5C 2WUSA 4Y0WA 1TUUA 3O4WA 2GWJA 3QBWA 2PAVA 1NGIA 2FF6A 1GLJO 3CI5A 1ZBSA 4FL9A 2E2OA 4PKGA 2V51B 2OANA 1HX1A 1XC3A 1DKGD 4QS8A 4FWKA 3QFPA 3UKUA 3SLCA 1BA1A 1S22A 4BGAA 4EHUA 1NGGA 1SQKA 2FXUA 4FOIA 1BG3A 5F0XA 3H6EA 3VEZA 1NLVA 1BO5O 1NBWA 3UE5A 3WEEA 4CZIA 4H0OA 4H0XB 3ZEUB 3KVGA 3VF4A 1TYQB 3ULEA 5AZJA 2CGKA 5AQGA 1U2VB 3VPZA 4PKIA 2HMPA 3ZX2A 1GLAG 1C0FA 4FPBA 2Q36A 4IWVA 4B9QA 3CJBA 3WXJA 1V4SA 3GL1A 5F2RA 5EVZA 1JCGA 2P9NB 4MLHA 2QWQA 3D2EB 3EKUA 3ENHA 3BF1A 3FZMA 4A62A 3MDQA 3UB5A 3EZWA 2NRHA 3DXMB 4J8FA 2V52B 1NGBA 1HLUA 2I7PA 4BR5A 4CZLA 3QMLA 2IIRA 4BQLA 5B8HA 3HBTA 3FZHA 2HF3A 3SJHA 2IVPA 5AQYA 4BVOA 2ZWHA 1R59O 4A2AA 3C7NB 4CBWA 4XEIA 1SAZA 2Q0RA 5AQZA 4CZFA 2E88A 3LDNA 4C23A 3UKRA 2I7NA 4FWSA 3VGKA 4YDUA 3QDKA 3HZ6A 4BR0A 3I8BA 2QWLA 5I9EB 4H5RA 1JCFA 4KBOA 4WQ4C 3VGLA 4H0TB 4FO0A 4BRMA 2P9KB 2UYTA 4RCHA 1QZ6A 1HJOA 3QBXA 4QS7A 2CH5A 3DJCA 5AQNA 3U4LA 3ZX0A 2QW9A 4DQ8A 4BRPA 4PKHA 5AQVA 1QQNA 4M7XA 2P9SA 1SZ2A 4EAHD 2YI1A 3CERA 1RDWX 2QXLA 1U6ZA 1MA9B 5ELZA 5E84A 1RGIA 3VEYA 4JAXA 1TYQA 3LDPA 4ISFA 3H1QA 4MLEA 5FPMA 3H46O 1U2VA 4CJ7A 1J6ZA 5AQRA 4BRFA 3FZLA 3D2FA 3L4IA 2VWBA 3DXKB 2A41A 3QFUA 3CJ9A 2PBDA 4K25A 4BRLA 4FWMA 2QWRA 3L6QA 3LM9A 3U9ZA 2P9NA 4WQ5A 4CZHA 2YHWA 3D2EA 1T6CA 4Z94A 1XQSC 4LC9B 2YCHA 3W3DA 1IJJA 1HUXA 5FPNA 1ATRA 3FGUA 3GDQA 3DXMA 1MWKA 1T44A 2Q1NA 3S41A 2GTDA 5AQQA 4CD3A 5FPEA 1BUPA 4MO4A 2A42A 2ASMA 3VGMA 4O8KA 5ADXA 1OKJA 3VESA 3GE1A 4BRHA 3BP8A 3C7NA 2ZF5O 3A8YA 3OHRA 4MO5A 3RSEB 3VOVA 1V4TA 2FLOA 2AA4A 3HTVA 2P9LB 4BR4A 4BRIA 1ATSA 2EWSA 1BA0A 2VCPA 2CGLA 3O1BA 3WQTA 3CJAA 3JXUA 1NGHA 5EY4A 5JMVA 2Q31A 5AQFA 2P9KA 3F9MA 2P9PB 3A5OC 4FWNA 5AQLA 3GG4A 4BRKA 3CJ7A 3FR0A 5CE3A 1Z05A 3FFKB 1E4FT 4B1VA 3VENA 1GLDG 3SK3A 3U9DA 5BREA 5BPNA 3WXLA 4CZGA 4B1WB 3LM2A 4IO8A 4M63C 4GY2B 5JLHA 4JNEA 2E1YA 3G25A 4RWTA 3VF2A 1WUAA 4A2BA 4NO7A 4CD1A 4H5VA 1G99A 2HOEA 1JCEA 1NGCA 4H03B 4BG9A 1HKCA 1ATNA 3HSCA 3QB0A 2E1ZA 3DXKA 2D1KA 3VEOA 2CH6A 4EIAA 3CIPA 4K41A 3ZETB 4XH5A 5JLFA 2E2PA 2NLXA 3VEWA 4BC3A 4FWLA 4WQ4A 2Q97A 5AQOA 1QZ5A 3L0QA 3M6GA 2GUPA 5KPTA 3EKSA 3LDOA 3EN9A 2QWMA 2YJFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WXIA 3RMDA 1YTAA 1QHTA 3DOKA 2GWKA 3THYB 1U47A 4JK7A 3NGZA 2VG5A 3FLCO 5C15A 1WOQA 3SPYA 1BGXT 1KVCA 2IVOA 3FE1A 5GAHP 2A3ZA 3SYZA 4CK1A 2HVIA 2HB5A 1X3MA 1L3SA 3RSEA 4O5BA 2O8DB 3AVAA 4BR2A 4KH4A 4Y1CA 1JLBA 3OS2A 4ILGB 2IS3A 3SUPA 4CEAA 5LL6Z 3VQPA 1X9WA 1VSDA 3HM8A 3CCVN 3AVIA 4YOYA 3QEXA 3ZEUA 4E7IA 1X9JA 2VYPA 1RFQA 1N5YA 2OPSA 3MEDA 3LDLA 1YTUA 2E2NA 3M8RA 2A40A 1C0GA 1VAZA 5FPDA 4FK2A 1UA0A 3EE9A 2OPRA 2ZGYA 3T1AA 3L3VA 3BF3A 1HR0K 4KHSA 3NMUA 1HPMA 4EZ9A 2XO7A 3NE6A 3K0SA 5H1SQ 4JK9A 4WE1A 5ADXH 3MN7A 4CHQA 3I33A 3TWHA 5BPMA 4FWPA 1K8KB 3A5LC 1GLLO 3HOSA 2OYQA 1T6DA 4ZTFA 4BRQA 4FJXA 2F7TA 3H3NO 1TUYA 1RT4A 4RW9A 1Y64A 3NCIA 1RDDA 1SV5A 2O8DA 3L2WA 4JEPA 5KPRA 4M3UA 2HBKA 1NJXA 4YOXA 2RHKA 3BZCA 4C8MA 1A5VA 3QIPA 3ZSVA 3QEVA 1KQSM 3G6EN 1TKXA 2UUBK 4B9MA 2HVHA 2A6AA 3L2RA 3QIOA 3I56N 4HUGA 4NB4A 1YXQA 4JI4K 4CBUA 2ASOA 4F9OA 4DMNA 3AA4A 1VQLN 3RR8A 4CGDA 5AQSA 1BHLA 3O1WA 1M90O 4Z4EA 3MXJA 4CZKA 3R8EA 1WBDA 1W9HA 2QM1A 4JHDB 2DPNA 4B3RK 3VERA 4BE1A 3AAQA 3LDQA 3NBPA 1MU2A 3M3ZA 1QHAA 1HNVA 1YUWA 5HRPA 1FKPA 1K8KA 1S3XA 4CJSA 2F9TA 3U6FA 3TSUA 3O80A 4AM6A 1HYZA 3MXIA 4IOAL 1Y97A 3HPGA 2G8FA 1IG9A 3O6WA 4IJNA 3AA5X 2R7YA 5KTQA 4AHSA 1WLJA 1C0MA 1L3VA 2BDPA 4GKKK 3IG1A 4CI6A 1IO2A 2FF3B 3HXMA 4IFEA 3K57A 4OKEA 3CHWA 5AQUA 4CGFA 4OVLA 4E1JA 3FZKA 1C0TA 4FLXA 5C42A 3HVRA 4DTOA 4OPAA 4BRDA 4JKDA 4BQZA 3WEEB 2HHWA 4KAZA 2E20A 4O4GA 2QEXN 1KLNA 3IS9A 3C0BA 3AVJA 3H3OB 3NH1A 2F4VK 4DSIA 4KB1A 2Q2RA 4K42A 3DRPA 1S1VA 4CJEA 4UQGA 3W0LA 1S6PA 1QSYA 3GOIA 1RT2A 1RT6A 2D4WA 3TSQA 4JHDA 1CXQA 4K8XA 3SAGA 1QQOA 4KHUA 3VF6A 1YIJN 3V9SA 1YT3A 3MMVA 2JGUA 4X66K 1DTQA 1KLMA 4JKEA 3O9RA 4LH5A 3D0PA 3SUNA 1HNZK 3H45C 4W5RA 2GUIA 4FLVA 4CIEA 1VQ4N 2OPQA 3E9OA 1TUUA 3ID6A 4QOZB 2OTJN 1A5WA 2GWJA 4IG0A 1SKRA 1GOCA 1LW2A 1D9FA 1NGIA 4FW2A 3CFRA 5HROA 2E2OA 4Z4HA 1HX1A 4QS8A 4JI8K 1S22A 5T7BA 5JVGL 4N5SA 1VSFA 3K5LA 4TSXA 3CC7N 4CJ4A 4FOIA 1HRHA 4PHTX 2DFFA 1BO5O 1NBWA 4CHYA 1TAUA 5IT9O 3WEEA 2QTDA 3TTCA 3KVGA 4RG8A 3L8BA 1WAJA 4CIFA 3VF4A 1TYQB 5MLCQ 3ULEA 5AZJA 4M42A 3CCUN 3JSMA 1NK9A 4IWVA 1C0FA 2E4LA 2VQEK 3WXJA 1V4SA 4CJFA 3P5JA 1O13A 1X1PA 3AVFA 1NMNA 4MLHA 2G8VA 4HCBA 1G15A 1S6QA 3EKUA 3ENHA 4CEEA 4A62A 4CW7B 5FDLA 4H4MA 2BE2A 4YOTA 4BR5A 3CC4N 4CIGA 1BISA 3QMLA 5B8HA 3HBTA 3FZHA 2UU9K 4GVMA 3SUQA 2OZMA 4A2AA 1SAZA 3ZT3A 1Q86O 3LDNA 1GOBA 2I7NA 4CEQA 5DM6L 1Q81O 1RT7A 4BR0A 3T1YK 2QWLA 2FBYA 1X9SA 1JCFA 4IDKA 4F2RA 4BRMA 2P9KB 2UYTA 4E89A 1HJOA 3WNEA 5AQNA 4FJ9A 2OA8A 4B8CA 1GOAA 3J80O 1NOYA 1JJ2M 1HNWK 4DG1A 4DQ8A 1EWQA 3CD6N 5AQVA 2P9SA 2YI1A 3CERA 1RDWX 1UA1A 1XMOK 2QXLA 1MA9B 2P51A 3EY1A 1FW6A 1TYQA 4ISFA 3H1QA 4MLEA 3Q7BA 3QNOA 4NCAA 5AQRA 4N47A 1XI1A 4FLTA 3VQ6A 1RNHA 4K25A 4BRLA 3L6QA 3O4NA 4CFDA 3MAQA 1JL2A 2GBZA 4J2EA 1NOZA 1ASWA 1K6YA 1IJJA 5FPNA 3ASMA 3FGUA 3TTDA 3DRSA 1MWKA 3NGIA 5FPEA 1RILA 1RBUA 4FJ7A 4O8KA 4ZHRA 4ILJA 4NXMK 3C6HA 5ADXA 3P31A 4FLUA 1OKJA 1EXQA 1TK0A 4FJ5A 2DFEA 2O4GA 1Q7YO 1I3AA 3AVGA 3CMAN 4BR4A 2AA4A 4BRIA 2P5OA 1ATSA 2EWSA 2G8WA 1XHZA 3DM2A 1NGHA 4DR5K 3O9QA 5JS1A 2DY4A 1S5JA 2P9KA 2P9PB 4IOCL 4Z4CA 3GG4A 2G8IA 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3ENOA 4F3TA 2F8SA 4DQIA 3ITHA 4CZMA 3T69A 4DFJA 3A5MC 3SCXA 2UXCK 5BR9A 2ZE2A 3R9PA 2HHXA 4CEFA 3QESA 1Z6RA 4CE9A 1WAFA 3WUHA 2OZSA 2O8FA 1VQ9N 3PIPL 3BDPA 1JL1A 4B8AB 3D2FB 5JVHL 4O0IA 4JI5K 1TK8A 2X78A 4BGBA 4YNQA 4DR3K 4BWMA 2BGGA 3P4IA 4IOXA 2KFZA 4FZZA 2FSJA 1GLBG 5AFUH 2P9UB 4KTZA 1NM1A 3KWIA 1IBLK 2LSNA 3MN9A 5A2QO 3HK2A 4QCLA 3BEXA 2XY8A 1HKBA 3AO4A 4H5NA 3OVNA 1RDUA 2P9LA 2GX9A 3S9HA 2HNYA 4KV8A 1K9MO 1HNIA 1OH8A 3MK6A 3WNGA 1ZBLA 1NGAA 4C8NA 1X3NA 2P9IA 4B1UB 1J5EK 1IH7A 1D5AA 4K43A 4ZTJA 5TKWA 1N6QA 3D45A 1ZBFA 1NK8A 3LPUA 3EL2A 1KXPA 5C10A 3ZYYX 3I8DA 1VQ8N 1XUPO 3ZT0A 1RTDA 3THWA 4NCGA 3O5BA 1HJRA 3KHYA 1C0UA 2V7YA 1MWMA 5F1XA 5FRMA 2YX6A 5AQIA 3ZT4A 1B9DA 3MCAB 2RKIA 1TVRA 5AQWA 4FJJA 2A5XA 1LOTB 2XRIA 3A5NC 4IG3A 2V7ZA 3E1YA 4Y1DA 3VEXA 3CCQN 1L3UA 4FOEA 4CJUA 4ELUA 2ASPA 3V9UA 3QINA 4OX9K 2YJEA 1BQMA 3V9ZA 1SKSA 4B3MK 3B6PA 3IAYA 5AQTA 4JS5A 2J4RA 4NYFA 3KK3A 2P9UA 3I0RA 3O3HA 4DV7K 3TAQA 3AA2A 2W42A 3THYA 1REVA 4BG8A 4ISGA 1ZC6A 4DR4K 3AVBA 2Y1JA 3RTVA 1LCUA 3AVMA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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