1Q18A

Crystal structure of e.coli glucokinase (glk)
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
TKYALVGDVGGTNARLALCDIASGEISQAKTYSGLDYPSLEAVIRVYLEEHKVEVKDGCIAIACPITGDWVAMTNHTWAFSIAEMKKNLGFSHLEIINDFTAVSMAIPMLKKEHLIQFGGAEPVEGKPIAVYGAGTGLGVAHLVHVDKRWVSLPGEGGHVDFAPNSEEEAIILEILRAEIGHVSAERVLSGPGLVNLYRAIVKADNRLPENLKPKDITERALADSCTDCRRALSLFCVIMGRFGGNLALNLGTFGGVFIAGGIVPRFLEFFKASGFRAAFEDKGRFKEYVHDIPVYLIVHDNPGLLGSGAHLRQTLGHIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of Escherichia coli ATP-dependent glucokinase and its complex with glucose.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Escherichia coli
molecule keywords Glucokinase
total genus 92
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2003-07-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02685 Glucokinase Glucokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1q18A01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1q18A02
2FXUA 2QWMA 4DQ8A 3KVGA 3VGKA 2E1YA 4BRHA 2P9UB 2P9PB 3EZWA 5BR9A 4FWQA 2E88A 4EFHA 3FE1A 4FO0A 3VESA 2HF3A 4Z94A 1Z05A 3BP8A 2ASOA 2FLOA 1SZ2A 4FWRA 4YDUC 3KZBA 5AQWA 4BROA 1ESVA 1NBWA 3S41A 2AP1A 4IXCA 5AFUA 4BRCA 2P9SB 4QS9A 3I8BA 4LC9B 3MK6A 5I9EB 1Y64A 2Q1NA 3R6MA 4BR2A 1GLCG 1EQYA 2QWLA 3W3DA 3D2FB 5ADXA 3F9MA 2NRHA 2ITMA 1GLJO 2VCPA 5AQPA 1WUAA 1OKJA 4H03B 1TUYA 2I7NA 4XEIA 3AARA 5TKYA 1C0FA 5ELZA 1XQSC 4BRLA 1K8KA 2UYTA 3L0QA 3FGUA 2Q97A 4IJAA 4BRIA 5BPNA 3VGMA 3LL3A 3A5OC 2VWBA 5FPNA 3WUHA 4CZMA 2GWJA 1GLDG 5AQNA 2IVNA 3D2EB 2GUPA 4JHDB 5JLHA 3BEXA 2CGJA 4WQ5A 5AQUA 3SLCA 2DPNA 4H5WA 3MN5A 4BRPA 4BRKA 3AAPA 3ZEUB 4DCHA 3U9ZA 3SJHA 1YUWA 4H0VB 1YXQA 3H1QA 4BRDA 4BVOA 3FZKA 3GBTA 3M3ZA 5KPZA 3EN9A 4H5VA 2YJFA 3ULEA 4J8FA 2WUSA 1T44A 2CGKA 4A2AA 1KAYA 4B1YB 3ZETA 4K43A 1U2VB 2CGLA 4BGBA 3WT0A 3CJ7A 4CD3A 1WOQA 4B1VA 4F9OA 4H0PA 3C7NA 4HWIA 3CJ1A 3A5NC 3U8XA 3I33A 3M1FA 3ID8A 2IVPA 4M7YA 4A62A 4WYBA 2IIRA 3O1WA 4B1UB 4BRQA 3H1VX 2QWOA 4CBUA 1R59O 1X9JA 2Q36A 3O8MA 5FPMA 2FSJA 3SK3A 3O08A 3VETA 4BC4A 4RCHA 2AA4A 1RDWX 3U9DA 3W0LA 2P9LB 4A2BA 5KQ8A 2QWNA 4CZFA 3QBXA 1V4TA 1P8ZA 3AAQA 3WXLA 4BR9A 2Q2RA 5FPDA 2OANA 5AZJB 1NGCA 1QZ6A 4NO7A 4JD2A 3LM2A 3CJBA 4CZLA 4K42A 2A6AA 3DXMA 3QDKA 3TPQA 3GOIA 2KHOA 4ISFA 4FWLA 2E2OA 3UE5A 3ATUA 1Z6RA 2P9NB 3MCPA 4H0OA 3FFKB 3MDQA 3WQTA 4M7XA 1GLFO 3UKUA 4XH1A 5AQHA 1GLAG 3QFPA 3A5LC 1LOTB 2HOEA 3FZFA 1NLVA 3EL2A 5LJVA 1SQKA 2E20A 1HX1A 3CQYA 1TYQB 4EHTA 3IDHA 1RFQA 1U6ZA 2GEMA 1BU6O 4QS8A 4O8KA 3VF6A 2CH6A 5AQGA 3LDQA 3CHWA 1BA0A 4WQ5C 4O5FA 3VEVA 3QB0A 5JMVA 1IJJA 4BC2A 4FWMA 5F1XA 3WEEA 4CI6A 4L3QA 3LDOA 4PKHA 3VENA 3C0BA 1D4XA 3CI5A 2GTDA 1MDUB 1XC3A 4Y0WA 3HZ6A 2A5XA 4IWVA 4BR0A 5JICA 2Q0RA 4PL8A 1NM1A 3CETA 2J4RA 3DAWA 4CBXA 1JCFA 2ZF5O 2D1KA 3ENOA 4BR7A 4MLEA 3L6QA 1HPMA 3BUZB 4B9QA 2VYPA 5CE3A 5EOYA 3H45C 4FPAA 4CZGA 2HMPA 1T6CA 2FSKA 4FPBA 2W40A 3O4WA 3RSEB 2P9UA 2H3GX 3P4IA 5B8HA 5AZIB 5EX5A 1NMDA 2P9PA 1HLUA 3AY9A 1DGKN 1YAGA 1QQMA 4FL9A 2P9IB 4BVPA 3EKUA 4CZJA 3CQXA 2E2PA 1QQNA 1ATRA 3GE1A 5E26A 1C0GA 2YJEA 3HM8A 4CD1A 1BG3A 4CJ7A 3EO3A 2QM1A 3WQUA 2P9SA 4ISGA 1SAZA 2E2QA 2GELA 1HUXA 1QHAA 5AQFA 1V4SA 4BRFA 4B1ZA 1XUPO 5BREA 1GLBG 4JD2B 4B1WB 2NLXA 2F9WA 3ATVA 3O1BA 4WQ4A 3FLCO 3QFUA 4I6MA 4BRMA 4MLHA 3VGLA 3DXKB 4H5TA 3BF1A 2P9KB 1E4FT 4H0YB 4IZ9A 4H0XB 5AQLA 3ZX0A 3GDQA 5AFUH 4JN4A 5BN9A 1JCGA 2EWSA 1NGGA 3UB5A 3D2EA 3VEXA 2YHXA 3VEZA 4PL7A 5E84A 1MWMA 5ADXH 2ZGYA 3VF2A 2V7YA 3H3OB 3UKRA 3VEYA 1NGJA 1Q18A 1HKGA 5BN8A 5F0XA 2FF3B 4K41A 3ZEUA 3A8YA 2A42A 3O80A 4JNEA 3TU5A 5AQMA 5BRHA 3ZX3A 3MN7A 3VEOA 4AM6A 2D0OA 3HI0A 1MWKA 1U2VA 1YVNA 1LCUA 1NWKA 3G25A 3JS6A 4FWSA 4EHUA 1J6ZA 4FWPA 2Q31A 3R8EA 1KXPA 3MMVA 4H5NA 2YCHA 3IUCA 1S3XA 3A0IX 2BUPA 3DJCA 5AQRA 2PBDA 2E8AA 2Q0UA 3A5MC 2NZTA 2V52B 2ASMA 1NGHA 3CIPA 1S22A 2A41A 3LM9A 1K8KB 4BG8A 5AQKA 1JCEA 1TUUA 3VPZA 3VEWA 1NGEA 2F9TA 1HKCA 2P9LA 2QWQA 3O5BA 2CH5A 2A40A 4BR5A 2FF6A 4RTFD 2D0PA 5AQQA 4CZEA 3GG4A 4K25A 4NB4A 3VOVA 1X3MA 5AZJA 5BPMA 3QMLA 4IJNA 3VF4A 3H3NO 3BF3A 4BRGA 2P9NA 4WQ4C 3ULEB 5AQYA 1BO5O 4KBOA 1BDGA 1NGFA 3CJAA 3ZETB 5BRDA 3IFRA 2HF4A 3L4IA 3DWLA 2ASPA 3ZX2A 4PKIA 2A3ZA 4BR4A 4BQZA 1TYQA 5LY3A 2IVOA 3C7NB 1RGIA 4PKGA 3D7EO 2QW9A 2YI1A 4FSVA 1ATSA 1GLEG 2BTFA 1NGAA 4GY2B 4BQLA 4BG9A 1ATNA 4I6MB 3SMSA 4XH5A 3QICA 1BOTO 1E4GT 3R9PA 1GLLO 4RWTA 3IMXA 5EVZA 3WXJA 3EKSA 4EAHD 4GNIA 3VERA 3HSCA 3B8AX 3JXUA 5FPEA 4FWNA 1DKGD 2QWPA 4DHYA 5JLFA 3ENHA 4IO8A 2V7ZA 5AQXA 1BUPA 2E2NA 3MN9A 4M63C 3FZHA 1T6DA 1NGDA 1CZAN 2PAVA 3UKRB 4CZKA 3D2FA 4MO5A 3SMPA 4YDUA 1IG8A 5F2RA 2V51B 3H6EA 5AQVA 4CZIA 4FOEA 4H5RA 3GL1A 5KQDA 3DXMB 3KHYA 1X3NA 3CJ9A 3FZLA 2ZWHA 5EXWA 1BA1A 1G99A 3M6GA 4FWKA 4FWOA 4BREA 5AQZA 3UKUB 3FZMA 2E1ZA 1DEJA 3MN6A 5AQSA 2QXLA 3RSEA 5BPLA 4JHDA 5AZIA 5EY4A 4BGAA 2YHYA 2W41A 1KAXA 5AQJA 3WXIA 1KAZA 4HTLA 5LJWA 2P9IA 1QZ5A 1HJOA 3O6WA 4EIAA 4BC5A 4FOIA 2YHWA 3HTVA 3LDPA 2GWKA 2ZGZA 4A61A 4E1JA 3HBTA 1BWFO 3WEEB 4MO4A 1HKBA 3CERA 5AQIA 2I7PA 1H1VA 1ZC6A 4CZHA 4AM7A 3WXKA 2D4WA 2QWRA 5KPTA 4H0TB 4ISEA 5BRFA 1QQOA 3LDNA 4BC3A 4XH4A 4CBWA 1ZXOA 4QS7A 3U4LA 3FR0A 1MA9B 5AR0A 5KPRA 4C23A 2FSNA 3DXKA 3CJCA 4B1XB 4DB3A 2P9KA 1NGIA 3LDLA 5AQTA 1NGBA 4JAXA 3H46O 5AQOA 3QBWA 4BRAA 4BRNA 1ZBSA 3OHRA 3J8AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3G10A 2X78A 3VGKA 3QIPA 3CG7A 2XO7A 1OVYA 4O5BA 4FWQA 2E88A 3OVNA 2PY5A 1VSEA 3VESA 2YNFA 1UOCA 3BP8A 2ASOA 3QETA 3VMFB 3NBPA 4GVEA 5AQWA 3SUPA 4FJJA 4M42A 4CW7B 3M5RA 4OPKA 3TSPA 4BRCA 2P9SB 3I8BA 3MK6A 3TAMA 3R6MA 4A5BA 5HBMA 3SPZA 2IAJA 2ZE2A 4DFPA 3ZCMA 3SQ0A 4CIFA 1N36K 1XC9A 4Z0UA 5GAEP 2ITMA 4RW8A 1GLJO 3KK1A 3ZSQA 1OKJA 1TUYA 3AARA 4DV0K 1YITN 3D45A 1D5AA 4DTSA 1TK5A 3L0QA 5CYQA 1TKXA 4DV5K 3VGMA 1WBDA 3A5OC 5FPNA 3KTQA 3NAEA 1KFSA 1VK0A 4WQ5A 5E41A 4BE1A 3CPWM 4YOYA 3OY9A 1SUQA 3ZEUB 4DCHA 1QHTA 3U9ZA 4FM0A 1E3MA 4JK8A 3K0SA 2YJFA 4J8FA 1T44A 2CGKA 2PZSA 4OGEA 4B1YB 3AGRA 1U2VB 1O13A 1QQCA 2KLAA 4CF0A 1FKOA 3MEDA 1JXEA 3O4QA 3U8XA 2ZJPL 3I33A 3M1FA 3CCUN 1LAVA 2Z1HA 4A62A 2P5OA 5M1PA 3O1WA 4B1UB 5DM7L 3KLEA 1VQLN 4JKDA 3CCJN 4AHCA 5GIOA 3IKMA 3HRGA 1RT5A 1X9JA 4FM1A 1NJIO 5FPMA 4BC4A 1X9SA 2HHSA 4LFBK 5BR8K 2QWNA 1CXQA 4KTZA 3WXLA 1P8ZA 3SJJA 4BWMA 3VA0A 4BR9A 3NGYA 5M1KA 5FPDA 5AZJB 4NO7A 4E89A 5C12A 1NG9A 1KVCA 1IH7A 1C0UA 2HHHK 3TPQA 3P39A 4AHUA 3SCXA 4FXDA 4FJ9A 1NJXA 4DMNA 1NK5A 3WQTA 3DMJA 4L8RB 3IS9A 2XY6A 3AVBA 1RTJA 2HOEA 3FZFA 3VQ7A 3L2UA 1NLVA 1BI4B 3EL2A 5LJVA 5J2QA 1NK4A 3G4SN 1XNRK 3CQYA 4OPAA 1TYQB 4CHPA 2XY5A 4HTUA 2YNIA 3DLRA 3AA3A 4O8KA 4KV8A 2CH6A 3LDQA 5FRNA 3V81A 3T69A 1U49A 1WSJA 4CE9A 5JMVA 4DQRA 4BC2A 5M1QA 4CJRA 5DM6L 4KHPK 5F1XA 4CI6A 3LDOA 4BWJA 3KJVA 1K9MO 3C0BA 1D4XA 1VQ7N 2GTDA 1MDUB 4OLBA 3HZ6A 2A5XA 4XIUA 2UXDK 3U3YA 4PL8A 1NM1A 4M3ZA 1A5VA 2P1JA 1JCFA 2D1KA 2Z1IA 4ID1A 3C6UA 3HM9A 3THWB 3AO2A 4B9QA 4KHQA 4C8KA 5EOYA 4YOTA 4W5TA 3L2QA 4LF6K 1BCMA 2W40A 4DR7K 5JS1A 1EKEA 5EX5A 1NMDA 3AY9A 2OA8A 3C6TA 3CC7N 1YAGA 5C0YA 1HNZK 3KWIA 2XY7A 3SBTA 3ZSXA 3V9ZA 4CZJA 2HSTA 3EKUA 1OH8A 4YFUA 1S1XA 1ATRA 2XY8A 2YKMA 1BG3A 1Q7YO 2RE2A 3OYAA 3PLAA 2QM1A 4KRFA 4GMJB 1ITGA 3SNNA 1UWBA 2GUIA 1RT6A 4H8KA 1S1WA 5BREA 4JD2B 4B1WB 4DF4A 1S1UA 1IV0A 3FLCO 3ZT0A 1JLAA 3BF1A 3CM6A 4H0XB 5AFUH 1RT2A 3L3VA 4CIGA 3OW2M 3HPOA 4M3WA 4DF8A 1JKHA 4AHRA 2WTUA 5E84A 2NRRA 5ADXH 5C25A 4RG8A 4N56A 3WXMB 4OKKA 4J2BA 3H3OB 4E7JA 2PYJA 1VSDA 1L5UA 4OGCA 3OYJA 2QEXN 4O4GA 3KD5E 4KO0A 4R79A 3OYIA 1XWLA 1IBKK 3MN7A 4CFBA 5FRMA 3HI0A 4YORA 4CGIA 3V6DA 3G25A 1XHZA 1NNEA 1SS6A 4EHUA 4GKKK 3LDSA 4FJ5A 4KH6A 2PBDA 2E8AA 2QI2A 4LF9K 2ETJA 4OX9K 1IKWA 5JVHL 1ZBHA 3L4QA 3V1OA 4AHSA 4G1QA 3LM9A 4BG8A 3IAYA 1JCEA 4DV7K 2VG5A 4IDKA 3VEWA 1NGEA 1N8RO 3T7ZA 3ZSWA 2W42A 3M8PA 3CCVN 2CH5A 3R3LA 4BR5A 2WONA 1WB9A 4CZEA 5AQQA 3GG4A 4K25A 1REVA 2HNZA 1ZYQA 5BPMA 1J9AA 3QMLA 1L3VA 2O8CA 2BGGA 5EU7A 3ASMA 1RBVA 1L3SA 3OA9A 2WC9A 4WFAL 2NRZA 3S3MA 3NFAA 5M1OA 4CGDA 3NVKA 5C2FA 2OPRA 4RW7A 2O8DB 1BO5O 1C1CA 1NGFA 5BRDA 1RBTA 4DTOA 3CQ8A 1EX4A 3L4IA 3DWLA 2G8UA 4X66K 5C15A 1HJRA 1B9FA 1DTQA 5LY3A 3C7NB 1YJWN 3MEGA 3D7EO 2YI1A 4FSVA 4DTXA 5AJ3K 2Y1JA 4LF8K 4NCBA 4BQLA 3QICA 1E4GT 2HHXA 4RWTA 4CF1A 5LMNK 3IMXA 3WNFA 3WXJA 2OPQA 1QTMA 1VQ6N 4GNIA 4BE2A 1VSIA 1VQ9N 4CGHA 2QK9A 3B8AX 4CJ3A 4CJ5A 4DHYA 2WBNA 1EP4A 1WSIA 5CY4A 4M63C 4KB1A 5CR4A 4H4OA 1SKSA 4JRQA 1EXQA 3H6EA 5AQVA 4H5RA 4LH4A 3ULDA 3TAEA 2X6SA 4NLBA 1G99A 3F73A 4DKWA 1EO1A 4FWOA 4C8MA 3AVMA 2Z1GA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5EXW A;  1BA1 A;  3M6G A;  4DR2 K;  3ZSY A;  3AO5 A;  3FZM A;  2E1Z A;  3HL8 A;  4FJL A;  4DS4 A;  5C24 A;  4N5S A;  1VSJ A;  5AQS A;  4DSK A;  5GAD P;  4A57 A;  2QXL A;  3RSE A;  4CER A;  5BPL A;  2O8F A;  3ZT1 A;  2YHY A;  1BIU A;  3MEC A;  1KAX A;  5LL6 Z;  3WXI A;  4JI7 K;  1KAZ A;  1F21 A;  2P9I A;  4C8N A;  4FJK A;  4M3Y A;  2ZJR L;  3C6H A;  3ID6 A;  4DTU A;  3ZSO A;  4EIA A;  3QEV A;  4CEQ A;  4KHY A;  2ITG A;  3HTV A;  4JLH A;  3T3F A;  3K58 A;  4E1J A;  4GVM A;  4DQQ A;  1M1K O;  4E7I A;  5HRP A;  4PHT X;  3SUN A;  2HBL A;  3D0P A;  3M8S A;  1JLF A;  2F8S A;  3E9L A;  2NUB A;  2QWR A;  4U7B A;  4BC3 A;  4X64 K;  4QS7 A;  4AF1 A;  3FR0 A;  5AR0 A;  3OBW A;  1C0T A;  3DXK A;  3CMA N;  4JI8 K;  4DB3 A;  2P9K A;  3L2V A;  5AQT A;  3H46 O;  3SAG A;  3PO4 A;  3LWL A;  5I3U A;  4JKF A;  4LF5 K;  2NRX A;  1OH7 A;  3A2F A;  3AO4 A;  3MEE A;  4CF8 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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