1Q18A

Crystal structure of e.coli glucokinase (glk)
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
TKYALVGDVGGTNARLALCDIASGEISQAKTYSGLDYPSLEAVIRVYLEEHKVEVKDGCIAIACPITGDWVAMTNHTWAFSIAEMKKNLGFSHLEIINDFTAVSMAIPMLKKEHLIQFGGAEPVEGKPIAVYGAGTGLGVAHLVHVDKRWVSLPGEGGHVDFAPNSEEEAIILEILRAEIGHVSAERVLSGPGLVNLYRAIVKADNRLPENLKPKDITERALADSCTDCRRALSLFCVIMGRFGGNLALNLGTFGGVFIAGGIVPRFLEFFKASGFRAAFEDKGRFKEYVHDIPVYLIVHDNPGLLGSGAHLRQTLGHIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Escherichia coli
publication title Crystal structures of Escherichia coli ATP-dependent glucokinase and its complex with glucose.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
total genus 92
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2003-07-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02685 Glucokinase Glucokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1q18A01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1q18A02
4H0YB 4CZKA 2FSNA 3DXKB 1HX1A 4IO8A 5AQUA 5KQ8A 2GEMA 4BRCA 2H3GX 4BVPA 2CGJA 3O4WA 4QS8A 1RGIA 3M1FA 3R9PA 5AQKA 4BC5A 4O5FA 5F1XA 1NMDA 1SAZA 3IFRA 3RSEA 4CZEA 5TKYA 4EFHA 3S41A 4FWOA 4FSVA 4NB4A 1MWMA 2Q0UA 4H5RA 4H0VB 4PKIA 2IVPA 1NGGA 3GOIA 1BA1A 3CETA 3CJBA 3ZEUB 4DHYA 2VCPA 2ASPA 1NGDA 3VPZA 4H5TA 1U6ZA 4Y0WA 4FOEA 3VGMA 2V52B 2ZGZA 3U9ZA 1T6CA 2P9IA 2V51B 2ZWHA 3VF4A 3UKUA 4A2AA 1C0GA 4CZIA 2P9PA 1BUPA 2QWQA 5BREA 1Z6RA 1BWFO 2CGLA 4JHDA 4L3QA 1ATRA 1YUWA 3O80A 2QXLA 5F0XA 3UB5A 1EQYA 4QS9A 5AQPA 3U9DA 4BR0A 3WEEA 2FLOA 2ZGYA 2E88A 5AFUH 4BR7A 1TUYA 3H6EA 3MN6A 5AQVA 5AQZA 5AQJA 4I6MB 3VEOA 2P9LB 3CQXA 5AZIB 1HUXA 3C7NB 4GNIA 2NZTA 3ULEA 3U4LA 3A5LC 3JXUA 4XH5A 5FPMA 1KAYA 1HKBA 1YXQA 4FWLA 5JLHA 2F9WA 3VGKA 2QWRA 1SQKA 2GWJA 2Q36A 3OHRA 5AR0A 3F9MA 3FFKB 4DB3A 4WQ5A 3SK3A 2NRHA 3A5MC 4FWSA 4M63C 3VEZA 4AM6A 1H1VA 4BRLA 4H5VA 3O1WA 5FPDA 4H0PA 3WQTA 4EHUA 1NGJA 3TPQA 2A41A 4K41A 3DXKA 2P9SB 4H03B 4JD2A 3H3NO 4CD3A 1X9JA 2WUSA 3LL3A 3WUHA 1GLDG 4H0TB 3L6QA 4B1WB 2QWOA 5FPEA 1S22A 5E84A 4FWRA 2AP1A 4F9OA 3CJ1A 4BQLA 5B8HA 4XEIA 4WYBA 3ZEUA 4IWVA 3CJCA 3EO3A 2YHYA 3CI5A 5AZJB 3G25A 1WUAA 4MO4A 2GTDA 2E2QA 3CIPA 5EY4A 4JN4A 3QDKA 2E20A 3WXKA 1JCGA 2E1YA 4PKHA 1QZ6A 1Q18A 2Q97A 2W40A 3LM2A 3M3ZA 3A8YA 2NLXA 4BREA 5ADXH 4ISFA 4M7XA 4BRNA 4DQ8A 3GL1A 3BEXA 2CH5A 3J8AA 5AQNA 4PL7A 1RFQA 5AQMA 3A5OC 3R6MA 3MN9A 4B1XB 1HKGA 2GELA 4A62A 4CZJA 1XUPO 3QFPA 1D4XA 3WT0A 2OANA 2YI1A 3C0BA 3C7NA 2EWSA 2IIRA 1MA9B 3W0LA 4BC4A 4KBOA 1ZC6A 5ELZA 3CQYA 5LJWA 3HTVA 3KHYA 3CHWA 5E26A 4CZLA 5AQSA 5AQLA 4BR2A 3VEYA 3EZWA 4WQ5C 2FF6A 4CI6A 2BUPA 3VEXA 1ATNA 2ITMA 5BRHA 3MMVA 2FF3B 3H1VX 1LOTB 1TUUA 2A40A 3ZX3A 1JCFA 5EXWA 2P9KB 4BRKA 5BR9A 3GDQA 4BR5A 2CH6A 3QICA 4BRPA 4ISGA 4B1VA 1V4SA 3D2EB 5F2RA 4A61A 3WQUA 3FZMA 4O8KA 4YDUA 4EIAA 4CD1A 4C23A 3MK6A 3AARA 2P9SA 1T44A 5AQHA 3TU5A 4BGBA 4E1JA 5BRDA 5BPLA 1J6ZA 1YAGA 3VENA 1E4GT 1NGIA 1DKGD 4IXCA 4K25A 3VF6A 2D0OA 1CZAN 2I7PA 3GG4A 4H5NA 1BOTO 1GLBG 4BC2A 3W3DA 4B1UB 1SZ2A 4Z94A 3LM9A 3FE1A 4BROA 3FZHA 3LDQA 1KAZA 3AY9A 1ATSA 4FWMA 1K8KB 3QMLA 3ATUA 2I7NA 4FO0A 5I9EB 2ASOA 2QWPA 4BRIA 3VETA 1OKJA 5AZJA 1HJOA 4BRHA 1HLUA 3HZ6A 1U2VB 1GLLO 2HOEA 3A5NC 3UKRB 2ZF5O 4MO5A 1C0FA 1GLJO 1ZXOA 5AQWA 3R8EA 5CE3A 3VEWA 4EAHD 3ID8A 4IJNA 4PL8A 2DPNA 3U8XA 2Q1NA 1X3NA 3JS6A 4BC3A 1Y64A 5BN9A 4B1ZA 1S3XA 1BO5O 2W41A 3GE1A 3DWLA 1DGKN 3L0QA 4J8FA 5AQGA 3KVGA 2P9IB 1X3MA 1DEJA 3UKUB 4H0XB 5KQDA 3MDQA 2IVOA 4QS7A 1MWKA 3MN7A 3ATVA 4JHDB 3I8BA 3M6GA 3O1BA 5KPRA 2HF4A 3FGUA 3L4IA 3VF2A 4RWTA 3WEEB 3D2FB 1QQMA 3WXJA 4MLHA 2UYTA 1QHAA 1JCEA 4CBWA 1T6DA 3P4IA 3H45C 2YHWA 2D0PA 3FZKA 2PAVA 3IMXA 5JLFA 3IDHA 2P9KA 1KXPA 1IJJA 5AQYA 3ULEB 4BG9A 3SLCA 4CZMA 5AQTA 4CZFA 2V7ZA 4BRFA 2BTFA 3VESA 1BDGA 3D2EA 4YDUC 2QWLA 4BGAA 3ZETB 3HBTA 3H1QA 4B1YB 4XH1A 4BG8A 3VEVA 1QQNA 4HTLA 3A0IX 1P8ZA 4I6MA 2HMPA 2P9LA 2QW9A 2F9TA 2Q2RA 5JMVA 5AZIA 2YJFA 4FWNA 3SMPA 4K42A 4FOIA 3FLCO 3BUZB 1K8KA 3B8AX 4JD2B 5KPZA 5AFUA 2P9NB 3EL2A 4ISEA 4BRGA 4CZHA 2J4RA 2FXUA 2Q31A 2YJEA 3DXMB 2QM1A 3IUCA 4NO7A 3QBWA 1U2VA 1TYQB 2D4WA 4K43A 3UKRA 5BPMA 1BU6O 2A5XA 4BQZA 4RCHA 2YHXA 3BF3A 5EOYA 4BRDA 3CERA 5BRFA 4DCHA 5AQQA 2QWNA 3QB0A 4RTFD 2CGKA 1KAXA 2KHOA 3O5BA 3LDOA 5KPTA 2D1KA 3WXLA 5AQIA 3D7EO 2GWKA 3MCPA 2P9UB 1V4TA 4LC9B 3BF1A 1GLCG 1R59O 1XC3A 3I33A 5FPNA 4MLEA 2IVNA 1YVNA 1WOQA 1GLFO 1HPMA 5BPNA 1MDUB 3AAQA 3D2FA 3SJHA 1GLAG 4BRAA 2E2OA 1IG8A 1NGHA 1Z05A 5BN8A 2E2PA 4FL9A 3LDNA 4FWPA 1NBWA 2HF3A 4H5WA 4FWQA 5EX5A 3SMSA 3ZX0A 1HKCA 2A42A 2Q0RA 1NWKA 5AQXA 4B9QA 5LJVA 3EKUA 3RSEB 3VOVA 2QWMA 2GUPA 4WQ4C 2A6AA 2FSJA 1ESVA 3H3OB 5EVZA 1NGFA 3GBTA 1RDWX 2E8AA 1BA0A 3DAWA 4EHTA 1NLVA 1QQOA 4CBUA 3HSCA 3ZETA 3FZFA 2VYPA 3HM8A 2PBDA 4M7YA 1NGCA 3EN9A 3DJCA 4FPAA 4XH4A 3KZBA 1ZBSA 1G99A 2E1ZA 3EKSA 4BR4A 2P9PB 4FPBA 3UE5A 2VWBA 1QZ5A 1NM1A 5ADXA 5LY3A 3WXIA 1LCUA 3HI0A 5AQOA 3CJ7A 2P9NA 4CZGA 3FZLA 4H0OA 2E2NA 4AM7A 4BRMA 1NGAA 3CJ9A 3DXMA 3VERA 3ZX2A 1TYQA 4IJAA 4WQ4A 4BR9A 4JNEA 3QFUA 3O08A 4PKGA 3FR0A 1XQSC 3QBXA 4BRQA 4CJ7A 2ASMA 1NGBA 5JICA 1GLEG 3LDLA 2YCHA 5AQRA 4HWIA 4CBXA 5AQFA 3CJAA 2AA4A 4BVOA 1NGEA 4GY2B 4A2BA 1E4FT 1BG3A 4FWKA 3VGLA 2V7YA 4JAXA 3LDPA 2A3ZA 3ENHA 3O8MA 3O6WA 2P9UA 3BP8A 3ENOA 4IZ9A 2FSKA 3MN5A 3AAPA 3H46O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1E3MA 3EE9A 1DTQA 2O8FA 1VRUA 1BI4A 4B3TK 4BC5A 4O5FA 1UWBA 5F1XA 1SAZA 4FSVA 4M3XA 3T1YK 5KGXA 4DQRA 2Q0UA 4H5RA 4PKIA 4HCCA 1RT6A 1Q81O 1VQ7N 3TSUA 1BA1A 3KWIA 4DS4A 3LALA 5I3UA 4W5OA 4FOEA 3AVCA 1Q8IA 2ZJQL 2ZGZA 4G9ZA 1HPZA 1QSLA 2HNDA 3AVHA 2QWQA 3ZLJA 5CY4A 2O4IA 4L3QA 3IAYA 4ELUA 3F5TA 2QXLA 4GV6A 3UB5A 3ITHA 4QS9A 3F73A 4PQUA 2YV0X 2ZGYA 1TUYA 3V9SA 4JEPA 3MN6A 3T7ZA 4C1NK 3BDPA 1TAUA 2JWKA 1WBDA 3VEOA 2P5GA 2RKIA 2P9LB 4HUFA 5H1SQ 4K0KK 4ILHA 1HNWK 3TSPA 4FWLA 4JKGB 3VGKA 4JI8K 1YT3A 2Q36A 5AR0A 3F9MA 4WQ5A 2JLEA 3CG7A 3P39A 4NLCA 3V9UA 4JRPA 4FJLA 4WFAL 4AM6A 5J2MA 3OYHA 4BRLA 3DMJA 3V6DA 3O1WA 4ID1A 1RDCA 4FM2A 4EHUA 4KFBA 3KTQA 1UA0A 4OX9K 3DLRA 1KC8O 1C6VA 3DXKA 2UU9K 1NK9A 3TTFA 4Q5VA 2HVHA 4M3TA 4WFBL 1X9JA 3LL3A 4CF9A 2HHXA 2E4LA 3K5LA 1C0MA 3QIOA 4H0TB 2QWOA 3F9KA 1OH7A 3OYEA 4DWIA 4NYNA 1KD1O 1S22A 3MWPA 3I0RA 1TKTA 4XEIA 2KFNA 3LWMA 4CGJA 1UAXA 3B6OA 4U67L 2ZJRL 3EEQA 3SAFA 2G8KA 3QDKA 1U45A 4CCHA 1JCGA 3PUFA 2E6LA 4Z4HA 4PKHA 3A8YA 5GIOA 4O55A 3E9PA 3ZSYA 4M3ZA 3TAGA 5AQMA 1Q86O 3R6MA 3MN9A 4JKCA 3CYMA 2XO7A 1GOBA 4A62A 3QFPA 3OYMA 4ZTFA 1D4XA 3C6TA 1RTDA 1RT7A 4DSKA 1XI1A 3G6EN 1VQPN 3FFIA 1S6QA 4CF2A 5ELZA 4CK3A 3CQYA 5LJWA 3S3MA 2Y1JA 5AQSA 5AQLA 3EZWA 4KTWA 1RCHA 3K9KA 4B8CA 3LP1A 4DQSA 3KLFA 1X9SA 1LOTB 2A40A 2YHBA 2LSNA 3C94A 5LL6Z 4CFCA 3V81A 3GDQA 4FJGA 4KHWA 2CH6A 4IOAL 2BDPA 3HL8A 3SUOA 5F2RA 4YDUA 1WB9A 2YNFA 4C23A 2P9SA 1T44A 5BRDA 3KD1E 2A1SA 1YAGA 4JK9A 1DKGD 3D6RA 4JK8A 3THVA 2D0OA 1KFDA 1U48A 4KTQA 2OTLN 4K8ZA 1FKPA 4NLBA 4L8RB 1HJRA 4BROA 3FZHA 2NRRA 4BE2A 3I8DA 4DLEA 1ATSA 3QESA 3SQ4A 5GAHP 4FO0A 1BHLA 3VQDA 1SL1A 5M1KA 4FLUA 4HVJA 1T8EA 3MEGA 5AZJA 3MEEA 3NAEA 1HJOA 1EKEA 4BRHA 1U2VB 1GLLO 2HOEA 4BACA 2FBTA 3ISNC 1HYVA 4KTZA 1ZXOA 1NK6A 3R8EA 3SI6A 4K8XA 3SQ0A 3VEWA 2OTJN 3DYAA 4EAHD 3ID8A 3AO3A 4IJNA 2HHWA 2DPNA 3U8XA 2Q1NA 3JS6A 1VQNN 4AF1A 4B1ZA 2W41A 3RR7A 4KHNA 2P9IB 1J54A 1X3MA 1U4BA 4KO0A 3UKUB 2X6NA 4H0XB 5KQDA 3QEPA 3MDQA 4W5NA 4FJNA 3HP9A 4LY7A 2HF4A 3AGKA 4DSLA 3D2FB 3Q7CA 4MLHA 4CBWA 3P4IA 4FVUA 1IKVA 3H45C 4IFEA 4LSLA 3DOLA 5HRRA 2PAVA 2ETJA 1S72N 2P9KA 3KIOA 1KXPA 4DSIA 5DM7L 3K5OA 3NH1A 4CZFA 2V7ZA 2FC0A 3RMBA 1LAWA 1RDDA 4FJHA 3D2EA 1NU0A 3TI0A 2QWLA 1NJZA 1U04A 1IKWA 5C10A 3HBTA 1VQKN 4DFJA 4NYFA 4B3RK 1RILA 3VEVA 1QQNA 3A0IX 4DSFA 2HNYA 2P9LA 4AILC 2Q2RA 4Z4CA 3ZSZA 4WCEL 1C1BA 3VA0A 4FOIA 2YNIA 3SBTA 3BUZB 1RBTA 5AFUA 5TKWA 4RW4A 4BRGA 3QNOA 2FXUA 3KK7A 3L8BA 3B6PA 4DR7K 3CCVN 3DXMB 3IUCA 1SL0A 4I9QA 1RDBA 5BPMA 2QTDA 4JI5K 4N41A 4F4KA 3CCLN 4BRDA 3CERA 4RTFD 1REVA 4DQQA 3G10A 4R5PA 1JXBA 1KCFA 4ELTA 3OYAA 3CCSN 4FZZA 1GOCA 4CHNA 4B08A 1GLCG 4F2SA 1VQ4N 3I33A 3O9QA 3DRPA 4KKOA 3PX4A 3J7ZO 3OTOK 4CJRA 1YVNA 4YFUA 4CGGA 5KRTA 3L3VA 1RTIA 4A57A 2O8FB 3AVNA 2Z1GA 3H08A 5BN8A 2E2PA 4FWPA 3LDNA 1T05A 1NNEA 2HHQA 2Q0RA 1NWKA 3KWGA 2QWMA 1NMNA 2YKMA 4WQ4C 3NF9A 2A6AA 2FSJA 1ESVA 3H3OB 3DLEA 5M1PA 1RDWX 4ZTJA 1NLVA 4DQIA 3HSCA 3ZETA 3FZFA 1RBVA 3ASMA 3R3LA 5HP1A 1NGCA 3DJCA 4E7JA 4FLZA 4XH4A 3VQAA 1ZBSA 1JLBA 5LMUK 2IC3A 1SKWA 1IH7A 3KK2A 3AVFA 1NJXA 3THWA 3HP6A 5ADXA 4CJUA 3WXIA 3ZT3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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