1RBRA

Structural study of mutants of escherichia coli ribonuclease hi with enhanced thermostability
Total Genus 50

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEPCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
2040608010012014014012010080604020
01020304050Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
AH4 (128-142)S1 (5-13)TIV1 (15-18)S3 (31-42)TI3 (148-151)AH1 (44-58)TII1 (98-101)S4 (64-69)AH2 (72-88)TI'1 (88-91)EMPTYTI1 (92-95)AH3 (101-112)TI2 (122-125)S2 (18-28)S5 (115-120)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
source organism Escherichia coli
publication title Structural study of mutants of Escherichia coli ribonuclease HI with enhanced thermostability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RIBONUCLEASE H
total genus 50
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1rbrA00
4CIFA 1JLFA 1EX4A 3NF7A 3WNEA 1RTHA 3S3OA 1J54A 4CERA 3V9UA 3VQCA 3ZT1A 4KHNA 1S1TA 3C94A 2EHGA 1ITGA 4FW2A 3LP1A 1LAWA 2A1SA 4CJWA 3LP2A 1HYZA 4LSNA 3S9HA 1HRHA 1TKXA 3ZSOA 4F3OA 4FK4A 4DTPA 1BIZA 1WSFA 4B8CA 3VA3A 1VRTA 3ALYA 3KK3A 1HJRA 3BDPA 2B5JA 2X6NA 4DMNA 3SPYA 2G8VA 5KGWA 3QLHA 1IKWA 2HHQA 1RT7A 3AVKA 4IDKA 1C1BA 5HRRA 3LZJA 1CZ9A 4M42A 4RW4A 3DLKA 1VSEA 1BQNA 4CJEA 2IGIA 1T03A 4TSXA 3KLFA 3C95A 2PYJA 1S1WA 4AHSA 3OS2A 1K6YA 3SUPA 4MFBA 2PZSA 1HQUA 4CEAA 3NAEA 1U47A 4OGEA 3AA3A 4CGJA 1WLJA 3LDSA 2FBXA 3DI6A 4DU1A 1NJWA 3KLGA 1HYVA 1LWEA 1JLGA 4MQ3A 4CJ4A 4IFVA 1D9DA 3D45A 1TK0A 4HHTA 4C8KA 4I9QA 4CJUA 3OYGA 4CJKA 2QKBA 4QCLA 4DQPA 4DTJA 3NDKA 3OYCA 3V6DA 2Z1HA 4B9NA 1X9MA 4DSEA 3M8QA 4CJSA 4W5QA 1TK5A 3SI6A 1RT2A 1NKCA 4O5BA 3LZIA 4CHPA 1IKYA 1IKVA 4Y1DA 1Q9XA 3KIOA 2PYLA 3DLBA 5D3GA 3P5JA 3DLGA 4KTWA 3VQ6A 3QEPA 1NKEA 4CECA 3VQ7A 3LANA 3E01A 4KAZA 1D5AA 3KKRA 4QAGA 3ZCMA 4FJXA 3OYLA 3SQ4A 4FJJA 1IO2A 1G15A 4PA1A 4Z4EA 3QEVA 4J2DA 3AVJA 2QKKA 4EP5A 3ZT3A 1BCOA 2HW3A 1BHLA 4OLBA 5FRNA 4E19A 3OYBA 3AVBA 1T7PA 2HHTA 5KTQA 1Z25A 3ZT4A 3CQ8A 4HUEA 3EZ5A 3ZSVA 4EP4A 4KKOA 1U49A 4B9UA 3DYAA 3NHGA 4DTXA 4M3RA 1WNSA 4H4MA 3WNHA 3DRRA 3M8RA 1U04A 2Y1IA 4KV8A 1BISA 2HMIA 1NJXA 4B9LA 1WSJA 3LP3A 3OYNA 3HT3A 4E7KA 1TKDA 4DSIA 3LP0A 3L2UA 4DLGA 3SUNA 1YTUA 2F8SA 4NCGA 1KTQA 4ID5A 1RT3A 1QTMA 4FJIA 3RMDA 1NK9A 4CGIA 3RRGA 4IG0A 2F8TA 3L3UA 3V1QA 1LW0A 2ATQA 1JKHA 3HYFA 4RW6A 2BE2A 3QINA 3U3GA 4JRQA 1L3UA 2VG5A 2YNGA 1BGXT 4IFYA 3G10A 4BDZA 3DLEA 3IRXA 4RW7A 5EU7A 4N56A 3VA0A 1ZYQA 3HSTB 3OJUA 4KI6A 3SNNA 3S3NA 2ZD1A 1JXEA 1RBTA 3SCXA 2G8UA 1DTQA 4LD0A 3VQ9A 4EZ6A 4BDPA 3OVNA 3RWUA 1KVAA 2BGGA 4GW6A 4K8ZA 3CFRA 1VSMA 3SUOA 2IOCA 4UQGA 2KFZA 1KFSA 4PUOA 1RILA 4FZXC 1VSJA 4Y1CA 3L2WA 4RG8A 2XRIA 4ID1A 4I9LA 2XO7A 1N6QA 4M3ZA 4QOZB 3HJFA 4BE0A 1C1AA 2FBYA 2G8WA 2HNDA 3RMBA 1KCFA 2ZE2A 2O4GA 2E6LA 3HO1A 1J5OA 2JLEA 3ISNC 5DMRA 1TK8A 4FM0A 2WOMA 4DTUA 1C6VA 3QEIA 4CHYA 2Y1JA 3RMAA 4F8RA 3SPZA 2P51A 1RT4A 3OYAA 3TAPA 2FC0A 1TKZA 1UOCA 4ZTFA 1QE1A 3QIPA 1LWFA 3OYJA 4M3YA 3TABA 1XHZA 1KSPA 4DSKA 1BL3A 4CK3A 4O0JA 5HROA 1WAJA 3DLRA 4FJLA 1NK7A 4HCBA 3K5OA 3MEDA 2QK9A 1BQMA 4B9TA 2D0AA 2OZMA 4L8RB 1YTAA 1UWBA 2DTUA 2KW4A 1ZBLA 3KKSA 4KPYA 3A2FA 2DY4A 4FVMA 3NF9A 2YNIA 2IS3A 3AVIA 4O4GA 3KLEA 1UA0A 5K14A 5C42A 3TARA 3L2QA 1EXQA 4M3WA 1QSLA 4CJTA 4KREA 1RDBA 2G8FA 3K57A 4KB0A 1B9FA 2OPPA 3VQBA 3HVTA 3NH1A 4DFKA 4FJKA 1LAVA 4DFJA 3DRSA 5HRNA 3KLHA 5CZ2A 4DWIA 3OS1A 2E6MA 4E7IA 2RN2A 1ASVA 4BE2A 1LW2A 2O4IA 3NH0A 1RTIA 1O1WA 2D0CA 3OJSA 3NFAA 5I42A 2YNFA 2OYQA 3DM2A 4PY5A 3AVLA 2X78A 1I3AA 1TGOA 1VSIA 1MU2A 5HP1A 4OVLA 4FLVA 4ZHRA 3RMCA 1FKOA 3VQDA 4Z4CA 3SYZA 3CM5A 4CJVA 2RKIA 2YKNA 3NF6A 3JSMA 4DQRA 2AJQA 4NYFA 1JLAA 4JLHA 4LH4A 3MXMA 1I39A 1WSGA 2IAJA 3RR8A 1S1VA 4B08A 2YHBA 3U6FA 2P5OA 2ZQBA 4C8LA 3HM9A 4KI4A 4KTZA 3SQ2A 1Q9YA 2WONA 4DFPA 4PQUA 4E3SA 1KLNA 4C8NA 1T8EA 3NH2A 3TAEA 1ZBUA 1Q8IA 2B6AA 4JS5A 1SL0A 4CE9A 2PY5A 4CJ5A 1TV6A 1HYSA 2Z1GA 1B92A 1JLQA 4DQSA 3RRHA 1S6PA 3L2RA 4E89A 3M8SA 3SV3A 5DK5A 4CJ3A 5KI6A 1L3SA 2IDOA 1R0AA 3PX4A 4KTQA 2KFNA 3OY9A 1NK8A 4BACA 2HHXA 5CZ1A 3AA4A 4DSLA 1EKEA 1YVUA 3LALA 3ZT0A 1C0MA 4YNQA 4CFBA 1W0HA 5C25A 5HLFA 1LWCA 4HTUA 4JRPA 2XY7A 2G8KA 4AHVA 1VSHA 1ASWA 3DOLA 2VWKA 4E1NA 3NGZA 3PV8A 4FJMA 3TI0A 4E0DA 2B4JA 2YNHA 4CGHA 4OPKA 2HNZA 2X74A 1VSFA 3QETA 4FYDA 3AA2A 5T7BA 3OS0A 1FK9A 4FCYA 3DLHA 1L3VA 3RR7A 4FJ7A 3LWLA 4CF8A 3HPHA 3K5LA 5KRTA 1S5JA 2GUIA 1KLMA 4E7LA 3QESA 4KHWA 1KRPA 1ASUA 4BWMA 1XWLA 1SUQA 3OYFA 5J2PA 1A5VA 3AO5A 3LAMA 4CGFA 4KO0A 4CEQA 1HPZA 2VG6A 3TAMA 3V9ZA 2KQ2A 1S1UA 3VQPA 3PY8A 1TKTA 1VSLA 2RPIA 4KFBA 4DS5A 2BDPA 3KTQA 4DQIA 4M3TA 3ZSYA 1BCMA 4W5OA 3V9XA 1D8YA 4IKFA 1SL1A 3F9KA 3L8BA 1WSEA 4J2BA 4CGGA 3HPOA 2A1RA 4CEZA 4OPJA 4K8XA 2EX3A 2YHAA 3VQAA 4GMJB 2XY5A 2D5RA 1REVA 4F2RA 3LPUA 1S9EA 2FBVA 4OKEA 4FM1A 4DFMA 1XI1A 1CLQA 3B6PA 4AHTA 4FJHA 1NJZA 3AV9A 1JLBA 3MXIA 4CJFA 4I2PA 3OYIA 4FLWA 3NGIA 4DS4A 2JGUA 4FJGA 2W42A 4FLZA 3SV4A 3AVGA 4RW9A 4DTNA 4OKKA 3SZ2A 3PUFA 1B9DA 1C0UA 1RNHA 3CFPA 1HNVA 4DU3A 4CCHA 1SV5A 1VSKA 1BI4A 3LPTA 5JS2A 2X6SA 3RTVA 3VN5A 3PO4A 2OPRA 1D9FA 4OKJA 2F96A 5FDLA 4CF9A 1KVCA 3AO1A 1NKBA 4I2QA 4FJ5A 3OYMA 1L3TA 5J2NA 4CHNA 3L3VA 3JYTA 4DTMA 1JLEA 1VRUA 3K59A 3I0RA 3V1OA 1SKWA 4FK0A 1J9AA 3EYZA 4CHQA 3THVA 1GOBA 3WNFA 4E7JA 1CXUA 2NUBA 1U4BA 5C24A 2HHUA 4O44A 3HL8A 3HVRA 1DLOA 1JL2A 2OPQA 1NK4A 3ASMA 1RTJA 2DFHA 4ELVA 5HBMA 1IH7A 1FXXA 3TAQA 1FKPA 3DMJA 1HMVA 3O3GA 1RBUA 4DLEA 4CEEA 4GVMA 3DOKA 3ZSWA 4KB1A 3TANA 4KHQA 3V81A 1RBRA 1KVBA 3VQ5A 1IKXA 1WN7A 4CESA 1RBSA 1U48A 4CF1A 1RDDA 4O55A 1JLCA 4CJLA 3P1GA 2KZMA 2QXFA 3ITHA 4B9VA 4RW8A 1JL1A 2VG7A 3AO2A 1DTTA 3I0SA 4BWJA 4CFDA 3K5MA 2DFEA 4CEDA 4CFCA 2GV9A 2LSNA 4CK1A 4LY7A 1ZBFA 1TL3A 4H4OA 3UIQA 4J2EA 4NCBA 1F21A 5I3UA 3HK2A 1S1XA 2RF2A 3V1RA 3PO5A 5HRSA 4CJRA 1QSSA 3O3FA 4M3XA 4Z4IA 5CYQA 4FLTA 3VQEA 1L5UA 4W5RA 3VQ8A 4CGDA 2OPSA 4CJPA 4EZ9A 4C8MA 4FXDA 1SKSA 4NCAA 1RT1A 1NK6A 5SZTA 1SL2A 2P5GA 3AVAA 3AVMA 3NBPA 4DTOA 3U3YA 3ZSXA 3H08A 3VQ4A 4Z4HA 1UA1A 4LH5A 3T19A 4Z4GA 3G0ZA 3TWHA 4CFAA 2YV0X 1NJYA 2IC3A 5CY4A 4FLXA 2HHVA 1A5WA 2OA8A 1W9HA 4DF4A 2DFFA 1J53A 5CYMA 3ULDA 4BE1A 3SQ1A 3MECA 2G8HA 3LAKA 1IG9A 4FJ9A 4AHUA 4CEBA 2HB5A 3QNOA 1GOAA 4CIGA 3KLIA 4Q0BA 2KTQA 3CM6A 4HUGA 2Z1IA 2BANA 1YT3A 3C6UA 4DTRA 1BIUA 4KHYA 3K5NA 1C0TA 3AVFA 4HVJA 3EY1A 4HCCA 4FJNA 4E1MA 3SJJA 3HP6A 3KK1A 4W5TA 1WSIA 3QO9A 5HRPA 4N5SA 2I5JA 4OLAA 3O4NA 1EETA 4FZYA 3FFIA 4O0IA 4B3OA 4KHSA 3OYHA 4JS4A 3K2PA 4F2SA 1EP4A 3MEGA 4M41A 1S6QA 2HVIA 3CG7A 1C1CA 4AILC 2HNYA 4N76A 2R7YA 1U45A 3KJVA 1TVRA 4Z0UA 2OZSA 1HQEA 4CEOA 3HPGA 4CF2A 1NK0A 5J1EA 5J2MA 1CZBA 4C8OA 1SKRA 3BGRA 4ICLA 4NYNA 5SWMA 3VQQA 3F73A 2XY6A 1RDCA 2G8IA 1RTDA 3C6TA 2P1JA 2XY8A 3OYKA 1XC9A 4M3UA 5J2QA 3NE6A 4FM2A 4DTSA 4FJ8A 4PWDA 1QHTA 1A5XA 5FRMA 2YKMA 3IG1A 1RCHA 4FLUA 2Q3SA 1QS4A 4F3TA 3V9SA 1LV5A 4R5PA 4B8AB 3ZSQA 4IBNA 2KZZA 1RT5A 3MAQA 1ZBIA 1HNIA 1RT6A 3AVHA 3CFOA 4CEFA 1NK5A 4H8KA 3HP9A 3IAYA 4F4KA 1TL1A 3K58A 4E7HA 4DU4A 4IG3A 4M45A 1RDAA 4AH9A 3AVNA 3S3MA 1ZBHA 4N47A 4DSJA 3KD1E 1KFDA 2GBZA 3AO4A 4W5NA 1GOCA 2HVHA 2ITGA 4CIEA 3B6OA 3D0PA 3SQ0A 3NF8A 4HUFA 1RBVA 4FK2A 4FZZA 2ETJA 3QEWA 1TAUA 1UAXA 4CHOA 2HHWA 3HXMA 1TAQA 2D0BA 2VWJA 3V9WA 1CXQA 5KRSA 3MEEA 1X1PA 4WE1A 3ZSRA 1QQCA 3KK2A 4OJRA 4AHCA 3LWMA 1X9WA 4KRFA 3QEXA 1JXBA 3QERA 2Z1JA 1X9SA 3KD5E 1WAFA 5E41A 1Y97A 3OYEA 4ELUA 1BI4B 3MXJA 3TR8A 3TAGA 3V4IA 3AO3A 1XHXA 3M8PA 4OGCA 5KGXA 4CF0A 5FROA 4CK2A 3PX6A 1NOZA 3SUQA 3NGYA 4CHZA 4BDYA 4B9SA 3CYMA 3DRPA 4DG1A 3P83D 3NCIA 3ZT2A 1VK0A 4Q5VA 4FLYA 4DF8A 3O4QA 3TAFA 2XHBA 4ZTJA 1QSYA 4LSLA 3I8DA 4B9MA 3AVCA 4YFUA 3QIOA 4CJQA 1T05A 3WNGA 5JS1A 4Z4FA 4G1QA 3AA5X 3ZSZA 4N41A 3IS9A 1Z26A 1S9GA 3T1AA 3OYDA 4DQQA 4DSFA 3QNNA 3PX0A 1N5YA 4ELTA 4FW1A 3L2VA 1WSHA 4KHUA 1VSDA 2FBTA 4XIUA 2HHSA 1NOYA 2E4LA 4AHRA 4J2AA 3O3HA 4I7FA 3T3FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1N36K 2E5LK 3WNEA 1J54A 4DV2K 3LP1A 4CJWA 2A1SA 2P9KA 3LP2A 3THYB 5JICA 3KHYA 4DTPA 1MWKA 1VRTA 1HJRA 3BDPA 4DMNA 4H5VA 3AVKA 1C1BA 5HRRA 1VSEA 2P9LA 4CJEA 1T03A 3C95A 1S1WA 4AHSA 5AJ3K 4MFBA 2PZSA 2EWSA 2FF6A 4CGJA 1NJWA 3DI6A 2O8EB 4WYBA 4IFVA 3D45A 4H0XB 4YOWA 4C8KA 4CJKA 3VF2A 4QCLA 3SJHA 4FOIA 5FPMA 3J7YP 4FSVA 5AQMA 2QWOA 1NKCA 1KQSM 3LZIA 2VYPA 3KIOA 3DLGA 1NKEA 1RDWX 4LF4K 2ZGYA 4DV7K 1NBWA 4FJXA 2UU9K 3SQ4A 2QWRA 4FJJA 1G15A 2VCPA 1BU6O 5FPDA 1NWKA 4IEEA 5FRNA 1XNRK 5CR4A 1DT9A 1Z25A 3CQ8A 3ZSVA 4K43A 4EP4A 1N33K 2UXDK 3WXLA 4B9UA 3DYAA 4LF6K 3NHGA 3DRRA 1W7AA 2HMIA 4B9LA 1BISA 1N32K 1WSJA 1TKDA 1KD1O 4E7KA 2O8CA 3LP0A 3L2UA 3FR0A 2F8SA 4QS7A 1QTMA 4FJIA 1NK9A 3KVGA 2BE2A 4EIAA 3U3GA 4JRQA 3K9KA 4JD2A 2VG5A 1BGXT 4BDZA 3VA0A 4RW7A 4NXMK 3HSTB 3MCPA 2G8UA 3IUCA 4EZ6A 3QMLA 3A5NC 4GW6A 4UQGA 1KFSA 3OTOK 4X65K 3KZBA 5JMVA 2WTUA 2FBYA 3RMBA 1KCFA 2O4GA 2E6LA 3HO1A 2JLEA 4BQZA 3OW2M 3MWPA 2IVPA 4F8RA 3QEIA 4CHYA 3RMAA 3SPZA 3VEWA 1TKZA 3QIPA 4M3YA 4DKWA 1GLJO 1GLLO 5ADXH 5HROA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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