1RBSA

Structural study of mutants of escherichia coli ribonuclease hi with enhanced thermostability
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEACEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural study of mutants of Escherichia coli ribonuclease HI with enhanced thermostability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RIBONUCLEASE H
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
source organism Escherichia coli
total genus 48
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1rbsA00
3G0ZA 4CECA 1RBUA 5HRNA 3K58A 4HUGA 2G8KA 1A5VA 2X6NA 1S1UA 3WNHA 1ZBIA 2IS3A 4CJEA 1VSLA 3S3MA 3RR7A 1RT3A 3IRXA 1L3VA 2IOCA 4DFPA 2F8SA 1RTJA 2BE2A 3DLHA 1WSIA 1DLOA 3TAGA 1NK4A 4E1NA 4CF8A 1ASUA 4DWIA 1FXXA 1XHXA 4FK2A 3ZSRA 1RTHA 4KI6A 1KVAA 3VQPA 1VSKA 4CEAA 4OKJA 4CJ4A 2DTUA 4KKOA 1J5OA 1NKEA 1Q9XA 5CYQA 2DFHA 1TKXA 1JL2A 1UA0A 1C0MA 1Z26A 4W5QA 3K59A 3E01A 3SPZA 4KREA 1ASVA 1T7PA 1RDAA 1S1VA 3NBPA 4ICLA 4DLGA 3AO1A 1KSPA 4DS5A 1U4BA 2IAJA 4HCBA 1WAJA 4KTQA 1RBRA 1VSDA 5C25A 4E3SA 3VA0A 4GW6A 1U47A 1NK6A 1WSEA 1Q9YA 3KIOA 4CHQA 4NYFA 2HW3A 4GMJB 4RW4A 1IH7A 1TL3A 4Y1DA 1IKVA 4FJHA 3CG7A 3CM6A 4JRQA 4E7IA 4IKFA 1EXQA 5SWMA 1BI4A 3G10A 1NK8A 3LWLA 2XY5A 4B9MA 4J2EA 3VQ5A 3RMDA 1L3TA 3HVTA 1W0HA 4OKKA 4ELTA 1F21A 1J53A 3OYHA 1BIZA 1VSHA 2HB5A 1BQMA 2QXFA 1CLQA 4FZXC 4CFCA 4EP5A 4FJ5A 3AVCA 3EY1A 1NKBA 2X6SA 5SZTA 2Z1HA 4J2AA 1RT5A 1KCFA 3K5NA 1RBSA 1VSFA 3AV9A 3KKRA 3V9UA 4KHQA 1JLBA 2YKMA 1KRPA 1HYSA 5K14A 3VQ7A 3MXMA 1SUQA 3KLIA 4CF0A 4FLUA 3OS1A 1HQEA 3KK1A 1QSSA 1QSLA 4Q0BA 2FBYA 3TAEA 3TAPA 1IKYA 4JS4A 2G8WA 3P83D 5KI6A 4CFBA 3QIOA 4CJFA 2RN2A 4CJTA 3KLGA 1VSIA 2VG7A 2YNGA 3AVKA 1SKWA 4B9UA 4F4KA 4CESA 3DMJA 3DYAA 3OYCA 3PX4A 4BE2A 2QKBA 4CIFA 5J2NA 4W5OA 3ISNC 2HHSA 1ZBHA 1XI1A 4CHOA 1EETA 4LH5A 4FW2A 4CGFA 5JS1A 2HHTA 3S9HA 4CEZA 3U3YA 1BL3A 3F73A 4HUEA 1IO2A 4K8ZA 2JLEA 3ZSYA 3DRSA 1LWEA 4CJ3A 2WOMA 4CF1A 1CXQA 1BISA 1C0TA 3H08A 5FDLA 4ZTJA 4N41A 3NDKA 4KHSA 3BGRA 3OYJA 4CK1A 3L2VA 3NH1A 4BE0A 4DSFA 4CFDA 3OJSA 3SNNA 1U48A 4FJKA 4L8RB 3LPTA 4F3OA 4CHNA 1LAVA 3ZT4A 1TAUA 4FM2A 2G8UA 3SV3A 4C8MA 1A5XA 3F9KA 3WNFA 4KO0A 2XO7A 1S6PA 3K5OA 3V9WA 4DFMA 3NH0A 1Q8IA 4CJVA 2EX3A 1S9GA 1HQUA 3NGYA 3P1GA 4W5RA 4DSEA 2KZMA 2HHVA 1EX4A 4DQQA 1Y97A 3U6FA 2IGIA 1D5AA 1SL1A 1RBTA 1N6QA 2LSNA 1NK9A 5KTQA 5J1EA 3AA5X 3QESA 1JL1A 4HUFA 4I9QA 1K6YA 2EHGA 3SCXA 3NAEA 4B9LA 4FJ8A 3S3OA 1QE1A 2YKNA 4FZZA 1YTUA 4PQUA 4FW1A 1TKDA 3NH2A 3U3GA 1XWLA 3DM2A 3ZSWA 3HO1A 3NF6A 1NJWA 4KB1A 3PX0A 4CGDA 2RF2A 3LAKA 3D0PA 4E7LA 3SJJA 4B9SA 3QO9A 3AO2A 4FVMA 2HHQA 4FJJA 5EU7A 4FK0A 3THVA 4CEBA 1ZBUA 3HYFA 3L2RA 3ZCMA 3JYTA 5J2MA 4BWJA 1KLNA 3DLBA 4M3YA 3OYGA 4B8AB 1ZBFA 1J54A 5FROA 3VQ9A 1EKEA 3CM5A 3DRPA 1VSMA 4CE9A 3SV4A 3K5LA 3DOLA 1VRTA 3ZT3A 4Z4HA 1WNSA 1X9WA 3RRGA 1HNVA 4CJQA 4AHRA 4YNQA 4N56A 1T05A 4CJUA 4OLAA 2B5JA 4R5PA 4NYNA 4O44A 4CK2A 1Z25A 3TAMA 3PV8A 3AO5A 3TI0A 3RTVA 4OPJA 3UIQA 4FJNA 3VQCA 1B9FA 4CJRA 3SZ2A 4CGGA 1X1PA 3NF7A 4M3WA 4OPKA 4KTWA 5C24A 3NGZA 4IBNA 2D0CA 4AHVA 1NK5A 3L3VA 4AHUA 4E1MA 3OYIA 3TARA 2P5OA 2W42A 3V9SA 4KI4A 3D45A 2OPPA 4I2PA 3OS0A 4KHUA 4CCHA 3KKSA 2G8IA 4F3TA 1X9SA 5J2QA 3M8RA 3DLKA 3DLGA 4IFYA 1GOBA 1YT3A 3ZT1A 3NF9A 1VRUA 3OY9A 4JRPA 3ALYA 2G8VA 1GOAA 3CFPA 4IDKA 3LZIA 4FLXA 4DU4A 4RW8A 3OYLA 1WSGA 2VG5A 1RDDA 4M45A 3O4NA 4CF9A 4DMNA 1R0AA 4GVMA 3AVIA 3QIPA 3VQ4A 4FM0A 3CYMA 1N5YA 1RT7A 2HNYA 3HVRA 1BHLA 2XY8A 2HNDA 1CZ9A 1IG9A 4F2SA 3CFRA 1ITGA 4PWDA 1KVBA 3ZSQA 3ITHA 4DFKA 4FLTA 2VWJA 4ZHRA 2PYJA 4LD0A 4JLHA 4B3OA 1RTIA 5FRMA 3NFAA 5J2PA 4O4GA 3P5JA 5D3GA 4DQSA 3AVAA 3QNNA 3OYAA 1XHZA 2YNIA 3KLHA 1U45A 4ELUA 3LWMA 2FBTA 2GBZA 4RW7A 4KB0A 4DQIA 4N76A 1WAFA 1SKRA 1J9AA 3RR8A 4RW6A 4KHYA 4FLZA 4CJ5A 3PO5A 4DTXA 2XHBA 1JXEA 5E41A 3K57A 1C1BA 2E6MA 3VQAA 2G8HA 2X78A 1NJZA 1WSFA 1ASWA 4CGJA 4PUOA 1ZYQA 1JLQA 3DOKA 4LSNA 1KFSA 3TABA 1EP4A 1I3AA 1L3SA 1U49A 3V4IA 2KZZA 3RMCA 2OZMA 4I2QA 4M41A 2QKKA 3KLFA 3SUOA 2F8TA 5DMRA 4NCGA 4CEQA 3KD5E 4H8KA 2ITGA 5KGWA 1D8YA 2XRIA 2IC3A 3A2FA 4LY7A 1BGXT 2OA8A 3HSTB 3AVBA 3VN5A 5C42A 4DTSA 4QAGA 4FK4A 4DU3A 3SI6A 2GUIA 2Z1GA 4O0IA 4FJLA 3QNOA 3OVNA 2HMIA 3QERA 1KLMA 2GV9A 1RNHA 4DS4A 4DTOA 1FKPA 4XIUA 4O5BA 3PY8A 1LV5A 4FJ9A 3LZJA 4W5NA 1LAWA 2OYQA 1W9HA 4BDYA 3SUQA 3LP1A 4PY5A 3RRHA 4M3TA 3AVJA 1NKCA 3AA2A 4N5SA 3QEWA 3C6TA 3SUNA 1RDCA 1S9EA 4M42A 4OJRA 3B6OA 5I3UA 2ATQA 3QEIA 5CY4A 4IFVA 3T3FA 1RT6A 1I39A 3AO3A 2PYLA 4M3ZA 2ZQBA 4Z4GA 3PUFA 1JKHA 3VQBA 3OYKA 3JSMA 2R7YA 3TAQA 4E7JA 4HCCA 2HVIA 5CYMA 4Y1CA 3SPYA 4CIEA 1TK0A 4DLEA 3AVNA 4FLWA 1JLGA 1HMVA 3V6DA 4CGIA 1T8EA 4TSXA 4BE1A 3HPOA 3ZSXA 3PO4A 1HYVA 4DSJA 3I0SA 3HM9A 4E7HA 3CQ8A 1SV5A 2KFNA 2A1RA 2VWKA 4RG8A 3ASMA 5HRRA 4DF4A 3M8SA 3QETA 4J2DA 4CEDA 1VSEA 1BIUA 2P1JA 4Z4FA 1VSJA 4BACA 2FBXA 4H4MA 4B9TA 2AJQA 2D0AA 2ETJA 4KAZA 4FLYA 1TV6A 1KTQA 3AA4A 3MXJA 3L2UA 3S3NA 2BANA 2IDOA 2YNFA 4OGCA 4DTUA 3NF8A 4LH4A 2XY6A 3WNEA 1TK8A 5CZ1A 4DSKA 2I5JA 3LPUA 2YHAA 4AHTA 1LWCA 3PX6A 3HK2A 1BQNA 3ULDA 1GOCA 3OYDA 1S1WA 1C1CA 3HT3A 1DTQA 3ZSOA 5HRSA 2O4IA 1DTTA 4CFAA 5HROA 4C8KA 1UOCA 4ID1A 1FK9A 4HHTA 2BDPA 2PY5A 3VQQA 3MEEA 3VQDA 5KRTA 3SQ4A 1A5WA 3VA3A 3VQ8A 3O3GA 3OS2A 3O3FA 3VQEA 2HHUA 3V1QA 4HTUA 4EZ6A 2Y1IA 3RMBA 4E0DA 2A1SA 1S5JA 4WE1A 1TL1A 4DSIA 2OZSA 1O1WA 3FFIA 3KJVA 1QSYA 3ZT0A 3CFOA 3OYNA 4PA1A 5KRSA 4FLVA 4Z4EA 3OYMA 4O55A 3QINA 1NOYA 1YTAA 3QEXA 1RT4A 4CK3A 4KHNA 3MEDA 4KFBA 3EYZA 1SL0A 1JLEA 1VK0A 3NGIA 4CHZA 1RT2A 1NJXA 4BDZA 4CEOA 4LSLA 2ZD1A 2KW4A 1C6VA 4CEEA 4FXDA 2OPQA 3HP9A 3TAFA 1TK5A 3C94A 4UQGA 3V9XA 4N47A 4B8CA 3L2WA 2Q3SA 3LAMA 4G1QA 4FM1A 3L3UA 4DU1A 4FYDA 4E89A 3OJUA 4F8RA 1HNIA 1MU2A 2HVHA 4C8LA 3LDSA 4I7FA 3IG1A 5HRPA 2P5GA 1BCOA 2NUBA 3RWUA 2KQ2A 3HPGA 1NOZA 2G8FA 3LP0A 3VQ6A 1WN7A 3AVFA 4HVJA 3BDPA 3T19A 3LANA 1BCMA 2DFFA 5HBMA 3RMAA 2FBVA 4NCBA 4OVLA 3AO4A 3OYEA 3V81A 4ID5A 4I9LA 1YVUA 4H4OA 4C8NA 1LW0A 3KLEA 4DTMA 5HP1A 4M3UA 4OLBA 3MXIA 1S1XA 4FZYA 3KTQA 3ZSVA 3AVGA 2OPSA 4Q5VA 3QEPA 4KPYA 4FJ7A 5KGXA 1NK7A 3EZ5A 1LW2A 4FJGA 3NHGA 3DLRA 3AVMA 1QTMA 4B9VA 3QLHA 4AHCA 4DQRA 4Z0UA 4J2BA 1FKOA 1RBVA 2FC0A 2YV0X 3KK2A 2D0BA 2O4GA 1UWBA 1XC9A 4ELVA 4EZ9A 3O3HA 4FJIA 3V1OA 3HJFA 4DTPA 3NCIA 1UA1A 5HLFA 4M3RA 4B08A 4CGHA 3TANA 3HXMA 3O4QA 1KFDA 5JS2A 4CJPA 1D9FA 4F2RA 3HP6A 3OYFA 2HNZA 3ZT2A 4EP4A 1BI4B 1QS4A 3I0RA 1IKWA 2E4LA 1T03A 1UAXA 4AH9A 3IAYA 3DLEA 4KTZA 1B92A 1JXBA 1C0UA 3AVHA 1TAQA 4DSLA 4CJWA 4BDPA 4CF2A 5FRNA 4E7KA 1B9DA 1HPZA 1RCHA 3C6UA 1NK0A 4DFJA 3KK3A 4CERA 2B4JA 2JGUA 2YNHA 3C95A 4JS5A 4YFUA 4DTJA 4IG3A 4CHYA 4AILC 4MQ3A 3SUPA 3LP3A 4OKEA 4W5TA 1HJRA 3DI6A 4KRFA 2DY4A 2WONA 2RKIA 4M3XA 3T1AA 4BWMA 1NJYA 4FJXA 3DRRA 4DF8A 1QHTA 4C8OA 4CIGA 2Z1IA 3I8DA 1L3UA 4B9NA 3TR8A 4NCAA 1KVCA 1G15A 1WSHA 3AA3A 1RDBA 2F96A 2D5RA 2P51A 1JLAA 3K5MA 2YHBA 1RTDA 1CXUA 2KTQA 3LP2A 2Z1JA 4DQPA 1RT1A 4O0JA 4OGEA 3OYBA 2KFZA 5T7BA 1X9MA 4Z4CA 2X74A 1JLCA 3NE6A 3SQ2A 2VG6A 3SQ0A 4QOZB 1LWFA 1WSJA 1TKZA 2RPIA 4KHWA 4QCLA 2HHWA 1S1TA 1D9DA 1IKXA 3M8QA 1SKSA 3SQ1A 4CJKA 2Y1JA 2PZSA 1SL2A 1L5UA 1WLJA 2B6AA 4CEFA 4CHPA 4FJMA 2DFEA 1REVA 2E6LA 4CJLA 5I42A 3V1RA 4DG1A 1HRHA 2ZE2A 3AVLA 3ZSZA 3L8BA 1S6QA 3KD1E 4CJSA 3QEVA 3L2QA 3HL8A 3TWHA 1TGOA 4DTNA 2BGGA 1TVRA 1TKTA 3MAQA 2HHXA 5CZ2A 4IG0A 3SYZA 1QQCA 4DTRA 1RILA 3LALA 4K8XA 1CZBA 3K2PA 4E19A 4Z4IA 5DK5A 4AHSA 4RW9A 3MECA 2QK9A 4ZTFA 2OPRA 1ZBLA 1C1AA 1HYZA 4KV8A 1JLFA 3MEGA 3B6PA 3IS9A 4FCYA 3HPHA 3V9ZA 4MFBA 3M8PA 2XY7A 3WNGA 1U04A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HRNA 3P39A 4HUGA 5C2FA 2ZJQL 3GBTA 5AQSA 3WNHA 1ZBIA 4CJEA 3TSUA 3J81O 4I6MA 3IRXA 3ID8A 2IOCA 3VEYA 2F8SA 1RTJA 3DLHA 1WSIA 1SZ2A 3TAGA 4E1NA 4CF8A 2HF3A 4DWIA 3N4PA 4KI6A 1KVAA 4C1NI 4OKJA 4BRQA 1J5OA 2W6KA 5CYQA 4A2BA 1JL2A 4BC5A 4B1ZA 4BREA 4W5QA 4A5BA 1MDUB 1GLCG 4ICLA 1KSPA 1WAJA 1NGHA 4FO0A 3R9PA 4BVPA 2NRTA 4CZJA 4E3SA 1Q9YA 4CHQA 4KHPK 4NYFA 4KBOA 2HW3A 3O8MA 1IKVA 2Q1NA 3QMLA 3CETA 2XY5A 4J2EA 3RMDA 1W0HA 4OKKA 4H5WA 3QFPA 1CLQA 2BH1A 4FJ5A 2F9TA 3GG4A 3K5NA 5CHIA 1HKBA 1VSFA 2P9UB 3AV9A 2ASOA 1JLBA 1KRPA 1SUQA 3KLIA 5IT9O 2QWLA 3THYB 2G8WA 3P83D 2ITMA 3SAGA 1YHQN 1SKWA 1VSIA 2VG7A 2HBMA 3O1BA 4B9UA 4CESA 3DMJA 3OYCA 4BE2A 2AA4A 4OPHA 5J2NA 5M1PA 4W5OA 4JKEA 2P9IA 1BL3A 1IO2A 3FFKB 2WOMA 3H08A 3FR0A 3UKUA 5AQMA 4CW7B 3BF1A 4BE0A 4CFDA 4FJKA 4CZLA 5BPLA 4B3TK 4YOWA 2G8UA 3SV3A 2GEMA 3F9KA 4A2AA 2XO7A 1S6PA 1SQKA 4CJVA 2KZMA 3U6FA 1SL1A 3S41A 5HOOA 1JL1A 4H03B 3WEEB 1O13A 4IWVA 2EHGA 4WYBA 4FJ8A 3THWA 1YTUA 4FW1A 1J6ZA 3NH2A 2F7TA 2GUPA 4BGAA 1XWLA 3DM2A 5AZIA 5FPMA 4KB1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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