1RBSA

Structural study of mutants of escherichia coli ribonuclease hi with enhanced thermostability
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEACEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural study of mutants of Escherichia coli ribonuclease HI with enhanced thermostability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RIBONUCLEASE H
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
source organism Escherichia coli
total genus 48
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1rbsA00
3NH0A 1D5AA 3V1OA 3NGIA 4FJ8A 4CFDA 4ZTFA 3NBPA 1JLGA 3HXMA 1L5UA 2KFNA 1VSJA 5JS2A 1C1BA 4GVMA 1VK0A 3K5LA 1HPZA 2PY5A 4FW2A 1CXUA 2B4JA 2X78A 4CGFA 1WLJA 4CGHA 4C8LA 4PWDA 4AILC 1X9SA 3ZT2A 3LWLA 2G8IA 4JS4A 1N6QA 2R7YA 4E7HA 3RMAA 4J2DA 1XHXA 1K6YA 4DMNA 4FLVA 2BE2A 1RNHA 3OVNA 1L3TA 1S1WA 1TGOA 3AVHA 3E01A 4N5SA 3OYLA 2GUIA 3K2PA 1HQUA 4JS5A 1TKDA 3KLHA 2HHQA 3TWHA 3ZSYA 1RDDA 5DMRA 4CGIA 1SKWA 1WSJA 3RR7A 5HRRA 4CIFA 4CFAA 2Z1IA 3SCXA 1IKWA 5T7BA 1X9WA 1BI4B 1WSGA 1WAJA 4FK0A 4LD0A 1FXXA 1ZBHA 4DQQA 4E7LA 3KD5E 2HHUA 3KLFA 3QEPA 1U4BA 5J2QA 3AVIA 1D9FA 3DLKA 1NJXA 4OKJA 1QTMA 5J1EA 2EX3A 3HK2A 1HNVA 3RRHA 4MQ3A 1RBRA 4PQUA 4O0IA 1I3AA 4W5TA 4DQSA 1U04A 2YHBA 1U47A 1S9GA 3L8BA 4GMJB 4ID5A 1D9DA 1FKOA 2P5GA 3LZIA 1BHLA 4B8AB 3OS2A 5CZ1A 4CERA 4CEQA 3ISNC 1QSLA 3LP0A 3QO9A 3DYAA 3OYEA 1LW0A 4E7JA 2OPRA 4NYFA 4FLWA 4F3OA 3AVAA 3V1QA 3OYHA 3V9XA 1NK5A 3TAEA 4E3SA 3PO4A 2OPQA 1NOZA 3SUOA 1RT4A 3MXMA 3OYIA 3AA4A 2B5JA 3AA3A 1KFSA 1S5JA 4CJPA 3VQ8A 5J2NA 4F2RA 4AHVA 1KVCA 3AVGA 1S1VA 4CJWA 1F21A 5KRTA 1L3SA 3CFPA 2YNHA 1ZBLA 4CJSA 1L3VA 2HNYA 3T3FA 2IS3A 4FW1A 1T03A 5HRNA 1J9AA 2QKKA 4I9QA 4PUOA 4DSKA 5E41A 3K5MA 4DLGA 4M3ZA 3VQAA 2XHBA 5SWMA 4DTPA 1VSKA 4FCYA 4CF0A 4KHYA 2DFFA 3QESA 4Z4IA 3HO1A 1DLOA 4FJNA 4YFUA 4DFMA 1UA1A 1ZBFA 3RRGA 1UAXA 4AH9A 3FFIA 1JLAA 1IO2A 1KTQA 2G8VA 4FK2A 4FJGA 3MAQA 1VSLA 1ASVA 4EP4A 5FROA 3D45A 3OYDA 2KW4A 2FBVA 4CEBA 3BGRA 3PX0A 4CK2A 1JLBA 3VA0A 1NK0A 4FK4A 4YNQA 2KFZA 1XI1A 3I0SA 3QLHA 4H8KA 4BE2A 4F8RA 2IDOA 1YTAA 1WSFA 1Q9XA 4OJRA 3SQ2A 4AHSA 4KKOA 1UA0A 1TKZA 4KTZA 1NOYA 3SV4A 3NH2A 2RKIA 1RTJA 3RR8A 1QHTA 4IKFA 2WONA 3ZSWA 3NF9A 2OPSA 4RG8A 3OYBA 4B9TA 5CYMA 3G10A 1ZBUA 1YT3A 1NJZA 4BACA 4LY7A 3KK1A 1SKSA 4CJEA 1B9FA 2I5JA 3OYKA 3T1AA 3L3VA 3LWMA 4J2AA 4FJMA 4RW9A 3OS1A 2BGGA 3HSTB 3AA5X 3P83D 4M3RA 4E19A 3KD1E 3UIQA 4W5NA 3VA3A 3DLGA 3O4NA 4WE1A 4CESA 4CECA 1JKHA 3SZ2A 4DTJA 4CIGA 3AA2A 3HP9A 4G1QA 4H4OA 5CYQA 3CYMA 1KLMA 3K59A 1NKCA 4AHUA 1LAVA 3LALA 3NF6A 4KHWA 5KI6A 4NCGA 1S1XA 4HTUA 1U45A 4KI4A 3JYTA 2Z1GA 1KVBA 4Y1DA 3S3MA 2KQ2A 3OYCA 3F73A 2D0CA 4I2PA 4OGCA 1RDCA 4RW8A 1ZYQA 4M3UA 2DFHA 1GOAA 3HP6A 4OKEA 4ELUA 3CFRA 4FLYA 1LWEA 4Z4EA 2YHAA 4Z4FA 3AO2A 1C1AA 4O0JA 2ZE2A 3AO4A 4KO0A 3KKSA 4ID1A 4N56A 2Y1JA 4NCBA 1TVRA 1Z26A 4KHQA 3H08A 4CJUA 3DOLA 4DU3A 2HNDA 3V9WA 2VG5A 4DTMA 2KZZA 4FM1A 4CHZA 4F3TA 4IDKA 1UOCA 3CM5A 3DLRA 3OY9A 4DWIA 3LP1A 4QCLA 4B9MA 4C8NA 1LV5A 4KPYA 1RBUA 3WNEA 1HJRA 3V81A 1NJWA 2DFEA 4CF1A 4J2EA 1RT1A 3K5OA 1S9EA 3LAKA 4M45A 1B92A 1A5WA 3DI6A 3CQ8A 1QSYA 1RILA 3AVMA 4CGDA 1JL1A 4CCHA 2HB5A 2G8UA 4DTOA 4K8ZA 5HRSA 3HVRA 3OYAA 3NGYA 3F9KA 1RTDA 5CY4A 4DU4A 1QE1A 1WSHA 3NF8A 4CE9A 4CK3A 5KTQA 1IH7A 4Z4CA 2XY5A 3SUNA 4M3XA 3ZSXA 4E89A 3JSMA 3SQ4A 4OLBA 1KLNA 3TAQA 4KHUA 1CLQA 4M42A 3MXJA 3KIOA 3VQDA 3QETA 3L2UA 5K14A 4RW4A 4CJRA 3P5JA 4EZ6A 5J2MA 3AVBA 2YNGA 3AO3A 3DRPA 2PYLA 1SL2A 3U6FA 5D3GA 4DFJA 2YNIA 5FRNA 4FXDA 3S3NA 4E1NA 4CJFA 3KTQA 4CJ5A 3AO1A 3EYZA 4FM0A 1NKBA 1NK9A 4CK1A 1N5YA 5CZ2A 3ZT3A 4FJLA 3TAPA 2F8TA 3M8PA 1W9HA 1TAQA 4CFCA 1JL2A 3B6OA 1SL1A 1HNIA 2VWJA 5HRPA 4B9UA 4O5BA 3L2QA 3TANA 3WNGA 1ASWA 4RW6A 3KLGA 3DLEA 1IKVA 3NDKA 1NK7A 4I2QA 4DF8A 4CEAA 4JRQA 3QIPA 2D0BA 1C0TA 4O44A 3RMBA 1BCMA 3VQBA 3KLEA 2OYQA 3AVNA 4DSLA 1BGXT 4ZHRA 3D0PA 2PZSA 4E0DA 3NF7A 5J2PA 4DQPA 2FC0A 4CEZA 1LWFA 3SYZA 1GOBA 2BDPA 3ZSQA 4R5PA 1XHZA 1G15A 1VSMA 4HUGA 4BDYA 4O4GA 1SUQA 3QERA 3EZ5A 3V9UA 1CZ9A 1R0AA 4M3TA 4W5RA 1RCHA 4KB1A 1JLFA 4FJ5A 2F8SA 4QOZB 4DU1A 2EHGA 3M8SA 1QQCA 4DQIA 2Q3SA 1IG9A 1SV5A 4DTUA 2XY7A 2ZD1A 3VQEA 4Y1CA 3HPHA 4IG0A 3ZSRA 1J5OA 4H4MA 2RF2A 3LPUA 3M8QA 3T19A 1X1PA 4Z4GA 1SL0A 4CJ3A 1BIZA 3DLHA 3SNNA 3IS9A 3ZSVA 4HUFA 4B3OA 4TSXA 1CZBA 3OYMA 4HHTA 2LSNA 1U49A 4EZ9A 4I9LA 4LSNA 3SV3A 2OZMA 2GBZA 2XO7A 4HUEA 4LSLA 1KCFA 2IOCA 1BCOA 3MXIA 4CEOA 3O3GA 2IGIA 1ZBIA 3RMDA 1X9MA 3THVA 3OJUA 1TAUA 3PO5A 4CJKA 3MEEA 4CHOA 1DTTA 2PYJA 2O4GA 1A5VA 4UQGA 2NUBA 1REVA 4CJVA 4ELTA 3K58A 3ZSZA 3IRXA 1VSFA 4PA1A 2XRIA 4AHCA 3I0RA 1WN7A 4ZTJA 4OPJA 4Q5VA 1W0HA 4KREA 1JLCA 4CHNA 4CEEA 1XC9A 4ICLA 3A2FA 1TKXA 3TR8A 4OPKA 1NJYA 4CJLA 4KTWA 2FBTA 4HCCA 4N76A 4FZYA 3KKRA 5C24A 3ZT4A 4KB0A 1HQEA 3L2WA 4KRFA 1VRTA 3OYFA 1C0MA 4E7KA 4DFKA 3HPGA 4BWMA 4FJIA 1JXEA 4FJKA 3I8DA 1JLEA 2QK9A 1CXQA 5HLFA 3L2VA 3QEIA 3QNOA 1WAFA 2ITGA 2G8KA 4J2BA 3HL8A 1TL3A 3NFAA 4RW7A 1FK9A 1VSHA 4XIUA 4M3WA 4DFPA 1T7PA 1QSSA 1RDBA 3DMJA 4JRPA 1Z25A 3DRRA 4AHRA 2A1RA 3ZSOA 1VSIA 1NK4A 3HT3A 1NKEA 2P5OA 4KHNA 3AV9A 4OLAA 2A1SA 5HROA 3DLBA 1A5XA 3AVLA 3LP2A 3VN5A 4EP5A 3OYJA 3IG1A 1EXQA 4CJQA 4FVMA 1TKTA 4CGGA 1RT5A 3OYGA 5C25A 5FDLA 3ITHA 3DM2A 3O3FA 3L2RA 1GOCA 3U3YA 1WSEA 4NCAA 3NH1A 3BDPA 4W5QA 1RBTA 4JLHA 1BIUA 3C6TA 4FLTA 1QS4A 2YKNA 1KFDA 2G8HA 2IC3A 3TARA 3OS0A 4DG1A 3PY8A 2FBXA 3VQCA 1YTUA 4BE0A 2QKBA 3DOKA 2OA8A 4DTNA 5JS1A 2HHSA 1BQNA 1YVUA 2X6NA 4QAGA 3VQ4A 1S6PA 4HVJA 3HPOA 1ITGA 3LDSA 4HCBA 2JLEA 1RT2A 5HP1A 3PUFA 3VQPA 3K5NA 4K8XA 3ALYA 4OKKA 3LP3A 4OVLA 1Y97A 3SUQA 3G0ZA 1Q9YA 4DTXA 4DS5A 2HVHA 2DTUA 4IFVA 4B9NA 4FYDA 4Z0UA 1C0UA 1JLQA 5SZTA 2HHWA 4DSEA 1IKXA 1BI4A 2P1JA 1TK5A 2DY4A 4CHQA 4CEFA 2HVIA 3VQ5A 4B9VA 2VWKA 3VQQA 1NK6A 1J54A 3LAMA 3QNNA 1NK8A 2G8WA 3IAYA 3QINA 4CHYA 1KVAA 4DSFA 1BL3A 4N47A 3TABA 3SJJA 4BWJA 2HHTA 3CM6A 3ZT0A 2E4LA 2OZSA 4AHTA 1KSPA 3ZCMA 5EU7A 5KRSA 3K57A 2IAJA 1T8EA 3OYNA 4IFYA 4C8KA 4CF9A 3NCIA 3TAMA 4B9LA 1WSIA 4BDPA 4E7IA 3MECA 2ETJA 4B8CA 1RBVA 4CHPA 3QEXA 2HMIA 4B9SA 3L3UA 1O1WA 3PX4A 2RN2A 2WOMA 1TK0A 4KHSA 2FBYA 3ASMA 4FZXC 4L8RB 3AVJA 4IG3A 2XY8A 3C94A 4KI6A 4BDZA 5HBMA 1LW2A 4B08A 2QXFA 3HVTA 3SPYA 4IBNA 3KK3A 3LPTA 1C1CA 4OGEA 1TL1A 1RT7A 4I7FA 3DRSA 3KLIA 3RTVA 5FRMA 1EETA 2YKMA 3U3GA 3WNFA 3KJVA 3NAEA 2Y1IA 4C8OA 3VQ7A 2BANA 3M8RA 3NE6A 4FJJA 2B6AA 1RT6A 4MFBA 1BISA 2HHXA 3CFOA 4DF4A 1RBSA 3V9SA 3TI0A 2GV9A 2F96A 3RWUA 4DTSA 2D5RA 3OJSA 2KTQA 1S1TA 4FJ9A 4M3YA 4KV8A 2X74A 2W42A 4BE1A 2X6SA 4FZZA 2Z1JA 3QIOA 4FM2A 1IKYA 4DS4A 2O4IA 2HNZA 2XY6A 3ZT1A 3PV8A 3KK2A 4DSIA 2OPPA 2E6LA 4NYNA 3HYFA 3MEGA 1UWBA 1L3UA 1VSEA 4KAZA 2P51A 1WNSA 2D0AA 1U48A 3AO5A 3SQ0A 5I42A 1VRUA 4CFBA 2AJQA 1DTQA 1S6QA 5DK5A 4CIEA 3LANA 3O3HA 1VSDA 3C6UA 1RTIA 1HYZA 4E1MA 3ULDA 3TAFA 5I3UA 4DLEA 2G8FA 1I39A 4FLXA 4Q0BA 4DSJA 3PX6A 2JGUA 4ELVA 4Z4HA 4FJHA 2RPIA 2VG6A 3VQ6A 1HRHA 1ASUA 3LZJA 1D8YA 4FLZA 5C42A 2VG7A 3CG7A 3V1RA 3AVCA 3QEWA 1T05A 4FJ7A 4LH4A 2HW3A 1XWLA 3V9ZA 4KFBA 4DQRA 1KRPA 4CJ4A 5KGWA 3HJFA 4O55A 4GW6A 4KTQA 4C8MA 4F4KA 1JXBA 4M41A 1LAWA 1MU2A 1TK8A 3EY1A 3SQ1A 4CGJA 3P1GA 3S3OA 4CJTA 4FJXA 4N41A 2HHVA 1S1UA 2ATQA 4PY5A 3TAGA 2E6MA 3MEDA 2YNFA 4LH5A 1SKRA 1EX4A 1RT3A 3B6PA 3WNHA 4CF2A 3RMCA 1HYSA 1C6VA 4CEDA 1B9DA 1EP4A 3NHGA 1BQMA 1Q8IA 1HYVA 3NGZA 3AVFA 4FLUA 3V4IA 2YV0X 3QEVA 3SUPA 4CF8A 1EKEA 2ZQBA 3AVKA 1HMVA 1TV6A 5KGXA 3SI6A 3SPZA 1LWCA 4F2SA 1FKPA 3V6DA 4W5OA 3S9HA 1RDAA 1RTHA 2Z1HA 3C95A 4DTRA 1J53A 3VQ9A 3HM9A 2KZMA 3O4QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NH0A 3THYB 2VYPA 2P9SB 2F4VK 3NBPA 1L5UA 2UXBK 2KFNA 5AQPA 4CZHA 4HTLA 2X78A 1BA1A 3ZX0A 4C8LA 4PWDA 4E7HA 3G25A 1QZ6A 1XHXA 3TSUA 4A5AA 5BN8A 4DKWA 3OYLA 2HF4A 4JS5A 2UU9K 1K8KA 1RDDA 1SKWA 3RR7A 3WT0A 1Z6RA 4CFAA 5JLFA 5LY3A 1SQKA 4LD0A 1FXXA 4WYBA 3QEPA 1JCFA 1D9FA 1NJXA 4OKJA 4PKHA 1QTMA 1HNVA 3C0BA 4FSVA 1U04A 1S9GA 3L8BA 1D9DA 1FKOA 3SAHA 3OS2A 4JI7K 5CZ1A 3H1VX 4BC4A 1QSLA 1N34K 1GLJO 3WXMB 3O9RA 4E7JA 4F3OA 3V1QA 3OYHA 3PO4A 1NOZA 3CIPA 3OYIA 3AA3A 3M5RA 1S5JA 3VQ8A 3MK6A 5BR8K 4CZFA 1L3SA 1YAGA 5CR4A 3H46O 1J9AA 2QKKA 5E41A 1M1KO 2YX6A 2QA4N 5SWMA 3L4IA 4FWOA 4FCYA 3HO1A 3BY5A 5IT9O 4YFUA 1VQ6N 1HR0K 1NGDA 1V4TA 1UAXA 1NWKA 1KTQA 2G8VA 4FK2A 3OYDA 5AQGA 3FZFA 3PX0A 1VQLN 4CK2A 3VA0A 1NK0A 4FK4A 5AJ3K 4BE2A 4H8KA 4ILGB 2W6LA 1GLDG 4AHSA 3DXMA 3NH2A 2RKIA 2Q0RA 2WONA 3BUZB 2OPSA 4B9TA 4QS8A 4CW7B 4EHUA 1YT3A 1NJZA 4BRIA 3KK1A 3LWMA 4W5NA 4C1NK 4BRKA 1HNWK 4RW9A 1CZAN 3OS1A 4E19A 1TUYA 1HKCA 3UIQA 1JJ2M 2WC9A 1VQ4N 4CESA 4CECA 4JI4K 3CYMA 1KLMA 1U6ZA 1LAVA 3LALA 4NCGA 2AP1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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