1RBTA

Structural study of mutants of escherichia coli ribonuclease hi with enhanced thermostability
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADGKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural study of mutants of Escherichia coli ribonuclease HI with enhanced thermostability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RIBONUCLEASE H
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
source organism Escherichia coli
total genus 53
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1rbtA00
1I3AA 1TK8A 2BANA 2FBVA 5CYMA 3SI6A 4DSIA 1ZBHA 2HHUA 3VQ5A 3M8SA 1YTUA 3NH2A 1RT3A 2HNDA 4CGDA 3LANA 5J1EA 2XY7A 1B9DA 2YNGA 3A2FA 1BQNA 2D0AA 3QO9A 4FJ7A 1RDCA 4IG3A 3M8PA 1LW0A 4FM0A 3V81A 3SPZA 4KPYA 3VQ7A 2DFEA 3CM5A 4CGIA 3B6PA 3DRRA 3SQ0A 1WSGA 4FJ5A 4L8RB 2O4IA 1UA1A 1KVCA 2X6NA 3ZT0A 4M3WA 2ZQBA 1SKWA 2A1SA 4F8RA 3P1GA 2DTUA 1QS4A 3CG7A 4CEOA 1D9DA 3LAKA 3TAFA 1VSLA 3TAMA 2AJQA 1NK6A 1NKBA 5J2QA 4QCLA 2HHXA 4CIEA 4PA1A 3MEDA 1ASWA 1WSIA 4FZZA 1BGXT 4DTNA 2LSNA 4O44A 2Y1JA 1REVA 2FC0A 4WE1A 1C1BA 2KZMA 3NF6A 2IS3A 3TABA 4KB0A 4N56A 3LP0A 3QEPA 5I3UA 4M3XA 5HRPA 3SV4A 5J2PA 4I2PA 1JKHA 4W5TA 1RT6A 4C8OA 4AHRA 3KLGA 1BCMA 4AILC 4J2EA 4CEQA 4ID5A 4CHPA 2HNZA 4CJTA 3CFRA 4QAGA 1IO2A 3LP1A 4N47A 4CEZA 3L2QA 3VQBA 4CIFA 2OZMA 1TK0A 1FK9A 1D8YA 4OKKA 4CCHA 3OYMA 1S1WA 4DSFA 4CEAA 2G8WA 2XY8A 3VQ9A 2YNIA 4OJRA 3TAQA 1RBTA 4TSXA 4CJFA 2KZZA 3FFIA 4CERA 3L2RA 3AA4A 1CXUA 2ITGA 1WAJA 3DRPA 1BCOA 2Q3SA 4RW7A 3ZSXA 4UQGA 3NH0A 3KK1A 4FLZA 1NK0A 1FXXA 2G8FA 3UIQA 1YT3A 1C1CA 1HRHA 4IDKA 3ITHA 4Y1CA 3E01A 3OYJA 2XO7A 4FM2A 3V9ZA 5C42A 2OYQA 4DSLA 4CGGA 4B3OA 3NH1A 4DLEA 3OYAA 3DRSA 4M45A 1NK5A 3P5JA 1BISA 4ID1A 3ZSZA 4DTJA 3HO1A 1KVAA 2XY5A 4FZXC 3L2VA 2VWJA 1U4BA 4DTUA 4DU4A 4JRPA 2OPPA 3AVBA 3G10A 4DFJA 2B6AA 2Z1JA 2Z1IA 1VSKA 4M3RA 4RW9A 4JS5A 4CGHA 2GV9A 4CHOA 1TAUA 1UOCA 2P1JA 3LZJA 5KTQA 3OYGA 4F3TA 4B9SA 4EZ6A 1O1WA 5HRNA 3OYIA 3HSTB 4DS4A 4CE9A 1SL2A 5T7BA 4MQ3A 5HRRA 3RMCA 2F96A 1TKDA 1EXQA 1Q9XA 1RT4A 4ICLA 1WN7A 3AVIA 3L3UA 3PX0A 1JLGA 3IAYA 1IKXA 3K5OA 4GW6A 3TAGA 1BIUA 2IAJA 2Z1HA 5FDLA 3F73A 1S1UA 4CEFA 4CJSA 4DTXA 4K8XA 1L5UA 4AH9A 4CJ5A 2BE2A 3HP6A 2RKIA 1ASVA 3LZIA 3HJFA 4E7IA 3DLBA 3ZSOA 3NHGA 3S3MA 1NK9A 3OYDA 4AHSA 1RCHA 2IOCA 4O5BA 2XHBA 3SNNA 3L2UA 4DU1A 4DMNA 3KD5E 1JLAA 3V4IA 1SL1A 4CJEA 4B9TA 1CZ9A 2PY5A 1SUQA 1BHLA 4CF9A 1L3VA 1JL2A 3RR7A 1SV5A 1RBVA 2JLEA 4KFBA 4HHTA 4FK2A 2QK9A 2XRIA 2KQ2A 4H8KA 2I5JA 4N5SA 4E3SA 3TAEA 3MEEA 4KB1A 4CF8A 4HCCA 4Z4HA 2BDPA 3VA3A 3HL8A 3QEIA 2ZE2A 3ALYA 3OYBA 4E1MA 1WSFA 4FYDA 3KIOA 3QEVA 4HUFA 4FW1A 3B6OA 1DTQA 4C8NA 4HCBA 3C95A 1VK0A 4M41A 1TGOA 1BI4B 2VG5A 3ZSRA 3DOLA 2YHAA 4RG8A 3AA2A 2FBXA 1S6PA 1RT2A 4F3OA 3OYEA 3ISNC 4KHSA 1IKYA 1HYVA 3KLIA 1RILA 3CQ8A 3KLFA 4DQQA 4Z4GA 3RRGA 1RTIA 2IC3A 2ZD1A 4OPKA 3OYCA 1T03A 4N41A 2HHWA 5HP1A 5CY4A 1NOZA 3LWLA 4DG1A 3K2PA 3JYTA 4CJWA 3PX4A 4O0IA 4KTWA 4LH4A 4CK3A 1DLOA 3DLRA 3ZT1A 4W5RA 1TL1A 4YFUA 3AV9A 4Z4IA 2YKMA 1X1PA 4NYNA 3MXMA 1HQUA 2QKKA 3ZSVA 3DLHA 3WNEA 4PUOA 3K5MA 1Z26A 4BE0A 3ZCMA 4R5PA 1J9AA 1ZBUA 1NKCA 3WNHA 4BDYA 1VRTA 2HHTA 2P5OA 1JLFA 3V9XA 2PYLA 1C6VA 4DU3A 3SQ2A 2X6SA 1RT5A 4DTPA 4OVLA 3NGZA 4CEEA 2VWKA 5SWMA 3AO2A 4CK1A 3MXIA 1EETA 3KK3A 3HPGA 2GBZA 4AHTA 2HW3A 3SPYA 3ZSYA 5DK5A 3H08A 4DS5A 4DTRA 4JRQA 3CFOA 1NJWA 2OPSA 3MECA 3L2WA 1LW2A 4B08A 1G15A 4Y1DA 1U47A 3WNFA 1VSFA 1A5XA 3C6UA 4AHCA 1D5AA 4FJMA 3S3OA 1CXQA 3AVHA 1LWCA 4DFMA 1NKEA 4FK4A 4KRFA 1BQMA 1BIZA 4FJ8A 4K8ZA 4BACA 1S9EA 3OY9A 2QKBA 4FZYA 4CF2A 4FJXA 3D0PA 4O0JA 2F8SA 1J5OA 3AO5A 4M3TA 3JSMA 1T7PA 3K5NA 4I7FA 1BI4A 4DQRA 4LSLA 4CGFA 1VSHA 3L8BA 2R7YA 1RBSA 2EHGA 3PO4A 4KTQA 2YNFA 3D45A 1RBRA 2KFNA 3VQ4A 3RMAA 1KRPA 4FLXA 4BE1A 1HNIA 4CF0A 3LDSA 3OVNA 3ZSQA 1B9FA 3RTVA 4ELVA 4IBNA 1IKWA 1F21A 1QQCA 3V1QA 3HVTA 2E4LA 2B4JA 4DSJA 3K59A 4W5NA 3WNGA 1S5JA 4E1NA 5C24A 5KRTA 4W5QA 4E0DA 4IG0A 3AVNA 1J54A 1JLBA 1HQEA 3C6TA 4CECA 4FW2A 3CFPA 3RMBA 1FKPA 4FLTA 2RN2A 3AVKA 3V6DA 4B8AB 4KHQA 5HROA 4CJ4A 4H4MA 4C8LA 1ASUA 3VQDA 4JS4A 4CESA 1ITGA 1W9HA 4Z4CA 2BGGA 2HHVA 3AVGA 3IS9A 3VQEA 2OZSA 4DFPA 4FCYA 4F4KA 1EP4A 3NBPA 4KO0A 3V1RA 3THVA 3SV3A 1IG9A 3NF7A 3AO1A 3SYZA 4O55A 4KTZA 3SJJA 3MAQA 4OGEA 4HVJA 3QETA 4J2AA 1NJXA 2JGUA 1XWLA 1YTAA 4CJRA 4IKFA 2DY4A 3LAMA 4G1QA 2IGIA 1BL3A 1T05A 2GUIA 4BDZA 4ELTA 1RT1A 2KTQA 5J2MA 4M3YA 2XY6A 4GMJB 4QOZB 1VSIA 1WSEA 3O3HA 1I39A 1WLJA 3PUFA 3SQ1A 1X9SA 3VQAA 1C0UA 1CZBA 4C8MA 3T3FA 3OJSA 1KFSA 3O3GA 3MXJA 3OYNA 4LD0A 3ZSWA 3TI0A 4OLBA 2D5RA 4CJPA 4KREA 2HVIA 3ASMA 4CHYA 4FJJA 1VSJA 1KFDA 4KI4A 1U04A 1XI1A 4XIUA 3VQCA 4KAZA 4DTOA 3O3FA 3RRHA 1TAQA 3AVCA 2IDOA 4C8KA 4FXDA 2KFZA 3T19A 3NGIA 1JXEA 3BGRA 1S1TA 1ZYQA 2D0CA 3QLHA 4Q5VA 1NK4A 4PY5A 4B9LA 1RNHA 1B92A 4CEDA 4FVMA 2HNYA 1LV5A 4I2QA 3DLEA 4CF1A 2G8HA 5E41A 1NK7A 2VG7A 3DOKA 2G8UA 4EP4A 4DQIA 2ETJA 4M42A 4FJGA 5JS1A 4DSKA 3EZ5A 1UAXA 3KLEA 4FLYA 3VQQA 5FRMA 1VSEA 5HLFA 1UWBA 4E7HA 4KV8A 4CHNA 4N76A 5CZ1A 4CFCA 4CFDA 4B8CA 3TANA 3TARA 4J2DA 4NCBA 1KTQA 4FJIA 1JLCA 1RTJA 4F2RA 3IRXA 3NFAA 4O4GA 4EZ9A 4BWMA 1QE1A 3F9KA 3TAPA 1NK8A 1L3UA 1WSHA 3P83D 4Z0UA 4CJLA 3OYHA 3VQ6A 4CHQA 3KLHA 1XC9A 5JS2A 4B9VA 3QINA 3T1AA 5FRNA 5KGXA 3SQ4A 4KHYA 3M8RA 3HPHA 4CEBA 4E7JA 2G8KA 1VRUA 5SZTA 1QSLA 4FJHA 3SUPA 3AVLA 3RMDA 4FLUA 3AO3A 1FKOA 3LP2A 2PYJA 2OPQA 4CFBA 4ELUA 4EP5A 4J2BA 3NGYA 4LH5A 2HHQA 3NAEA 1MU2A 4I9LA 5CZ2A 5K14A 3DM2A 4FLVA 2HMIA 3SUOA 4B9NA 3LPUA 3AVJA 4KHUA 4JLHA 3HM9A 1QSYA 1GOBA 3KKRA 3AO4A 2VG6A 3K5LA 1Z25A 3K58A 4PQUA 1CLQA 3AVFA 1A5WA 1TKXA 1QTMA 1HPZA 2EX3A 4MFBA 2OA8A 1NOYA 1HYSA 1WSJA 4DSEA 1R0AA 1L3TA 3SUQA 1XHXA 1C0TA 3I0SA 3QESA 1S6QA 1K6YA 1WAFA 3L3VA 2E6LA 3RR8A 2DFHA 3QIPA 3HT3A 3RWUA 2RF2A 2F8TA 1C0MA 3PO5A 1JXBA 4NYFA 4FJNA 2DFFA 2HVHA 3AA5X 3I8DA 3OS1A 3C94A 1Q9YA 4M3ZA 2ATQA 2E6MA 4LY7A 3OYFA 2Z1GA 4DFKA 1GOCA 1ZBIA 1HYZA 3BDPA 2QXFA 4BWJA 4CGJA 4DQSA 3QNOA 5D3GA 4E89A 1HMVA 1LWEA 4CJ3A 3NE6A 3I0RA 3LP3A 4E7KA 4RW8A 4NCAA 1J53A 2YV0X 2W42A 3V9SA 3PX6A 4CK2A 4B9UA 3HVRA 1X9MA 3U6FA 1Q8IA 5KGWA 1LWFA 3S9HA 2KW4A 3AVAA 1VSDA 4OKEA 4ZHRA 3KJVA 4IFVA 3OYLA 1RTDA 1JLEA 2WONA 4FJKA 4YNQA 3S3NA 3K57A 1TV6A 3PY8A 3VQPA 2X74A 1DTTA 5HRSA 2B5JA 1NJYA 3HP9A 1ZBFA 4FK0A 3KKSA 3KD1E 1JL1A 4LSNA 1KVBA 3V1OA 2G8VA 1QSSA 1N6QA 3TWHA 1UA0A 4HTUA 4HUGA 4OGCA 5EU7A 3U3GA 2FBTA 2HB5A 1NJZA 3O4NA 4OLAA 2YNHA 3OS0A 4M3UA 2P51A 4CJQA 3CM6A 3HPOA 1RBUA 3NF9A 1JLQA 4AHVA 2X78A 3NDKA 1TK5A 3LWMA 5C25A 4ZTJA 4ZTFA 3M8QA 4BE2A 4AHUA 2PZSA 2NUBA 1TKZA 3LALA 2G8IA 1SKRA 1RTHA 1N5YA 3OYKA 4F2SA 1TKTA 4CIGA 3QEXA 2HHSA 2FBYA 4CHZA 4B9MA 5I42A 1ZBLA 3O4QA 3VA0A 5J2NA 4DQPA 4Z4FA 1EX4A 3ZT3A 4OPJA 4E7LA 4RW4A 3KK2A 1RDDA 3U3YA 4KI6A 5KI6A 3HK2A 3NCIA 4DTMA 2A1RA 1L3SA 4KKOA 1KLMA 1WNSA 4Q0BA 1LAVA 4DF8A 3ULDA 1HJRA 2Y1IA 5FROA 3VQ8A 4PWDA 4GVMA 3QEWA 1U45A 1GOAA 3MEGA 3QIOA 3CYMA 3EYZA 4HUEA 1KSPA 4KHNA 1T8EA 1VSMA 4E19A 2OPRA 3KTQA 4W5OA 1IKVA 1TVRA 2O4GA 1SL0A 4OKJA 3HXMA 3TR8A 4BDPA 1TL3A 4DWIA 5DMRA 2P5GA 1KCFA 3DI6A 4CJUA 4DTSA 1HNVA 4CJVA 3SUNA 4FJLA 4KHWA 3DMJA 1RDAA 3OJUA 3DLGA 3DLKA 3ZT2A 3AVMA 4NCGA 1QHTA 3DYAA 3ZT4A 3V9WA 3PV8A 3SCXA 1XHZA 2YKNA 1SKSA 1KLNA 3NF8A 4CFAA 1EKEA 1RDBA 3IG1A 2D0BA 3OS2A 1C1AA 4I9QA 4H4OA 4RW6A 3V9UA 4FJ9A 1YVUA 1W0HA 3QNNA 2RPIA 4FLWA 1Y97A 1RT7A 4DLGA 1D9FA 3G0ZA 3EY1A 1S1VA 2WOMA 2YHBA 3AA3A 5CYQA 1U48A 3LPTA 4FM1A 3HYFA 1A5VA 4DF4A 3VN5A 1U49A 3SZ2A 5KRSA 1LAWA 1S1XA 1S9GA 4IFYA 1IH7A 4CJKA 1X9WA 5HBMA 3QERA 4Z4EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1TK8A 4BR2A 5CYMA 3SI6A 2HHUA 2DPNA 1RT3A 3LANA 2XY7A 1V4SA 3A2FA 4BRKA 4YOXA 1LW0A 3CCSN 3CM5A 3B6PA 4L8RB 3IDHA 3O9UA 2X6NA 3ZT0A 3LM9A 1Q81O 4BC3A 5GADP 2DTUA 4FWRA 1Q7YO 1D9DA 3TAFA 4H0VB 2AJQA 3F5TA 3TSQA 1NJIO 1WB9A 2HHXA 3KVGA 4FZZA 4DTNA 4MO4A 3NF6A 2IS3A 4KB0A 4I2PA 1RT6A 4CHPA 1ZC6A 3CFRA 2HNZA 3OA9A 3C6AA 2FSNA 5ADXH 5I9EB 4OKKA 2G8WA 3DAWA 1DT9A 1MWMA 4DR4K 4TSXA 3FFIA 2ITGA 3DRPA 2ITMA 3UIQA 1NK0A 2G8FA 3FE1A 5CHIA 1YT3A 3ZLJA 5C42A 1SAZA 3NH1A 5C2FA 3DRSA 1NK5A 3G25A 1BISA 1TUUA 3HO1A 1IBMK 2VWJA 4DU4A 3IFRA 3AVBA 1VSKA 2P9KB 2P9UB 2GV9A 2GX9A 5HOOA 2NRWA 1TAUA 4F3TA 2VCPA 3O1WA 4R79A 4B9SA 5HRNA 4EZ6A 4B1ZA 4CE9A 1VQ9N 2O8FB 3VOVA 2F96A 1ZBSA 2QW9A 2D0PA 1BIUA 2IAJA 5M1NA 1S1UA 4K43A 3O9QA 1WBDA 3HSCA 3KWIA 3MWTA 4K8XA 1GLLO 2BE2A 3CCVN 4E7IA 1XNRK 4QS7A 2JWKA 3D2FA 1RCHA 2F9TA 4DU1A 4GV6A 4CJEA 1CZ9A 1KAYA 2OANA 1BHLA 4H5WA 4LFAK 4ISFA 3RR7A 2JLEA 3MCPA 2QK9A 2XRIA 5DM6L 3MN5A 2I5JA 4N5SA 4KB1A 3MEEA 4FL9A 2BDPA 4CD3A 3HL8A 2ZE2A 4E1MA 3M1FA 3VTIA 3QEVA 1YJ9N 3B6OA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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