1RBVA

Structural study of mutants of escherichia coli ribonuclease hi with enhanced thermostability
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADAKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
source organism Escherichia coli
publication title Structural study of mutants of Escherichia coli ribonuclease HI with enhanced thermostability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RIBONUCLEASE H
total genus 52
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1rbvA00
4FW2A 1C0UA 1GOBA 3ZT3A 3T3FA 5I42A 3QNOA 4OKJA 4IDKA 2VG7A 1BIUA 1ITGA 3V1OA 4KB1A 5FROA 2RPIA 3NAEA 3WNHA 4K8ZA 2KTQA 3V9ZA 4DU1A 3HT3A 4JRPA 4CHYA 3M8SA 4CHQA 1C0TA 1EX4A 5CY4A 3EZ5A 3AVIA 1Z26A 1LW2A 1W0HA 3AO1A 2E6LA 3K59A 3NH1A 3SPYA 1XHZA 1TAUA 2D5RA 5JS2A 1NK8A 2O4IA 1NOYA 4QOZB 5HRNA 2GUIA 1NKBA 1O1WA 3O3GA 4HHTA 2XY7A 3QEPA 3DMJA 1BHLA 4I9QA 1FKOA 1DLOA 1IKWA 3NGYA 4L8RB 3AA3A 3VQ5A 4FJLA 3ZSQA 1JXBA 2EHGA 4CFAA 3OYAA 3VQ4A 4DTRA 4F2SA 3NGIA 4DTXA 4FCYA 1FXXA 2Z1IA 4RG8A 3VQQA 1S1WA 4KTQA 2HHTA 2HB5A 3ZCMA 3QINA 1JL2A 1B9FA 1KVBA 1RDCA 4TSXA 4CGIA 2RF2A 3HO1A 5K14A 4YNQA 3NCIA 3O4NA 4BE0A 5KRTA 3OVNA 4HUFA 4JRQA 4B9VA 3NH0A 5FRNA 4WE1A 2QXFA 3HYFA 4DWIA 1UAXA 4DQIA 4KHSA 3HXMA 4Z4IA 4DTMA 4EZ6A 3LWMA 4PWDA 2FBXA 2B4JA 3CFOA 3HPGA 3QIOA 1RCHA 4DU3A 3MECA 2YNHA 3K57A 4E7KA 4OJRA 2X6NA 1BQMA 4PA1A 3SUQA 3OYIA 3MXIA 1JLBA 1ZBLA 4KAZA 4PUOA 2Z1GA 2HHQA 4I9LA 4MFBA 4CEOA 5CYQA 4B9UA 4FLYA 4E7IA 1HYVA 3ZSVA 1WLJA 3EY1A 1J53A 4Q5VA 4CK3A 3QNNA 1VSDA 1T7PA 4QCLA 3AVFA 3DRSA 3BGRA 4AHRA 4CEDA 1BQNA 4CJSA 4KREA 2G8IA 1RTHA 4Z4CA 4HTUA 1WAFA 1T03A 1NKCA 1YTAA 1ZBIA 2D0BA 4W5OA 2XHBA 4KI6A 4OLAA 4FJHA 3AO4A 4C8KA 3AVJA 1TK8A 4G1QA 3NE6A 4FXDA 3V9SA 2XY6A 3VA0A 4FJ5A 4BDZA 3PV8A 3L8BA 1S6QA 1LV5A 2G8HA 2BGGA 4N5SA 4E0DA 1TL1A 4BACA 4E89A 3HP6A 3RMBA 4FJNA 4PY5A 1X1PA 5EU7A 3RMCA 3LP1A 4CJRA 5C24A 1RT3A 4CEAA 2B5JA 3DLEA 4CJVA 2RKIA 3KJVA 2XY5A 3WNFA 3TANA 3IS9A 1NJWA 1NJXA 1WNSA 4KHQA 5CZ1A 2OPPA 4CEEA 2G8UA 1JL1A 4LSNA 5KTQA 4M3ZA 4BE1A 3LZJA 3O4QA 4EP4A 3V9UA 1L5UA 2PYLA 1JKHA 3LALA 1DTTA 3AVAA 4IFVA 4NYFA 3CG7A 4H8KA 2OPSA 4DQSA 4M3WA 4B8CA 2P5GA 4KO0A 1QTMA 4M3XA 4Q0BA 4C8LA 3ZT0A 3HVRA 1UA0A 2DFEA 3B6OA 4CIEA 1X9SA 4J2BA 3QO9A 2G8VA 1WSGA 4HCCA 1JLCA 3F9KA 2IDOA 3HL8A 3K5NA 4DTOA 3AV9A 3AA2A 3OYDA 3U6FA 1RT2A 4AHVA 3TWHA 3OYBA 2DY4A 3L3UA 4ID5A 2HHWA 5I3UA 4OPJA 1IO2A 1KVAA 4FJ8A 3OY9A 1ZBFA 3AA4A 1TKXA 2Y1JA 4J2AA 3DLHA 1VSMA 1HNIA 2WONA 3H08A 3SQ2A 3CM6A 4UQGA 4E1NA 1KLNA 4Z4EA 3RR7A 3AVBA 3O3HA 3KLIA 2YKNA 3NBPA 1KFDA 1U04A 1VSFA 1RT4A 1VRTA 3AVCA 4J2EA 4KV8A 3OYFA 4AHSA 2OPQA 4DTNA 3NF6A 3IRXA 1F21A 1TV6A 1WSHA 1JLAA 1L3VA 4DSKA 4KKOA 1YTUA 4FJMA 5CYMA 4DQQA 4IBNA 3V6DA 5KGXA 2VG6A 3NGZA 1KVCA 3DOLA 3TAEA 2QKBA 3CM5A 5T7BA 3P5JA 4ZTJA 2OA8A 1BCOA 3BDPA 3PO5A 4ELTA 1A5WA 3L2QA 4FM0A 4KTZA 2W42A 4C8OA 2BANA 3OS2A 1NJZA 5HLFA 3KK1A 3E01A 3ULDA 1XHXA 1BIZA 3CYMA 3LAKA 3KTQA 1KLMA 1YT3A 4FYDA 1LWFA 3VQDA 3OYMA 3KKRA 3QETA 2G8KA 4FJGA 4KI4A 4CGHA 1QSYA 4DSJA 1ASWA 1S1UA 4CK1A 3PX6A 2NUBA 3LDSA 1S1XA 4I2PA 4DSEA 1UA1A 4CECA 2D0CA 1UWBA 3ITHA 1SL0A 1JLGA 1U48A 1EP4A 1D8YA 3WNGA 4JLHA 3SUPA 4CE9A 4EZ9A 5J2NA 3LANA 4CJLA 1VSKA 3QEVA 3DYAA 2OZSA 1J5OA 4CJQA 4AH9A 1SKSA 3OYNA 4FZYA 2A1SA 2HMIA 3SUNA 3SCXA 1XWLA 1G15A 2F96A 3CQ8A 1VSJA 1VRUA 4DG1A 1TK5A 1QSLA 4HCBA 2DFFA 1BGXT 3LP0A 3KK2A 4GMJB 4HUEA 3ZT2A 3OS0A 3SUOA 3AO2A 4CHPA 3L2WA 4DFPA 3RMAA 1S9GA 3JSMA 2HNYA 2XY8A 4RW6A 3OYLA 2HHUA 2A1RA 4O5BA 4B8AB 2IOCA 3G10A 4FJJA 1RTDA 4GW6A 1DTQA 1BI4B 4M45A 4O0JA 5HRRA 1SKRA 4RW4A 3TAQA 4Z4FA 2KFNA 2X74A 1VSHA 1SV5A 2JLEA 3ZSRA 3ZT1A 4E7LA 1BI4A 3SQ4A 3DM2A 3MXJA 4KHWA 3AVLA 1ZYQA 3LZIA 1U45A 2Q3SA 1EXQA 4H4MA 4CF0A 2VWKA 3NH2A 3SJJA 4FK2A 2YNIA 3ALYA 3SZ2A 2HHVA 2IC3A 3C6TA 2IS3A 4DLGA 4LSLA 3AO3A 5FDLA 3VQ6A 4FVMA 4BWMA 3OJUA 1RDAA 3EYZA 5J2QA 1RTJA 3DLRA 4CCHA 5SZTA 1RT6A 1KSPA 1NKEA 4F3TA 3DLBA 1CLQA 5JS1A 2ZD1A 1WSFA 2YV0X 4KFBA 3VQ9A 4DF4A 4NCAA 3VQ7A 1GOAA 4CFBA 4B9NA 3VQEA 1RDDA 4FJKA 1RDBA 1B92A 4CGGA 4N56A 3JYTA 2BDPA 3MXMA 3D0PA 4FJIA 3ISNC 1U47A 1TK0A 1TKTA 3HPHA 3V9XA 2ETJA 4CJ5A 4DTUA 4CF1A 1LWCA 3AVHA 3L2UA 4DTJA 4FLZA 4B9TA 4M42A 1SL2A 4CEQA 4AILC 1VSLA 2AJQA 2HHSA 1CZBA 1U4BA 1QQCA 3LP2A 3MEGA 1HMVA 4KPYA 4PQUA 1VSIA 3I8DA 4CJ4A 1S9EA 4M3UA 2PY5A 3T19A 3AVKA 4W5NA 1VK0A 3HP9A 5DMRA 1NK0A 2QKKA 1U49A 3I0RA 4DFKA 1HPZA 1IKXA 3SI6A 1NK7A 3AO5A 4F8RA 3VQBA 3KLHA 4FLUA 2VG5A 5HRPA 4FK0A 2GBZA 4FK4A 3C94A 4J2DA 5J1EA 2F8TA 1TL3A 4F4KA 1EKEA 3K58A 1NK4A 4CEZA 5J2PA 3NF7A 3VN5A 4W5QA 2OPRA 4DS4A 2P51A 4NYNA 1MU2A 4BWJA 4CHZA 1NK5A 3A2FA 1WN7A 3LAMA 3HPOA 5HRSA 2RN2A 4DU4A 4I7FA 5CZ2A 4M41A 4E3SA 1K6YA 3D45A 3KLGA 3RTVA 4E7HA 4ZTFA 3S3MA 1KRPA 1TVRA 3LP3A 3KKSA 4RW7A 3ZSXA 1HNVA 1C1CA 1FKPA 2HNDA 2IAJA 4DQRA 4KRFA 1RBTA 4JS5A 2FBYA 4CJUA 3RWUA 3B6PA 4BDPA 4CF2A 2IGIA 3OYKA 3THVA 3KD1E 4Z4GA 4CERA 3DI6A 1ZBUA 4E19A 2XRIA 2YHAA 3LPTA 4EP5A 3S3NA 4JS4A 2KZZA 1TKDA 4CJ3A 3M8RA 3V1QA 3PY8A 3HVTA 1R0AA 3HK2A 4O55A 1SUQA 4CFCA 3IAYA 3C95A 4OGCA 3OYGA 1KTQA 4DTSA 3QEXA 4ELUA 4M3YA 5DK5A 1TAQA 1HQUA 5SWMA 4FM2A 4XIUA 2YNGA 4FLVA 1YVUA 4AHTA 1RT7A 3NFAA 3NHGA 4B9SA 3K5OA 1WAJA 2BE2A 3K5MA 3VA3A 2EX3A 3G0ZA 1QS4A 2PZSA 1J54A 2YKMA 2ATQA 4B08A 1I39A 3CFPA 1LW0A 3RMDA 4KTWA 4CHOA 1L3UA 1RT1A 4Z4HA 3AVMA 3L3VA 1A5XA 3QLHA 4KHNA 2QK9A 1C1BA 1KFSA 3K2PA 3WNEA 4DQPA 4Y1CA 2XO7A 1JXEA 1WSIA 2LSNA 1QSSA 3S9HA 1ASVA 1Q9XA 1S1TA 4OKKA 4AHCA 3O3FA 3ASMA 3F73A 4CGJA 4B9MA 1Y97A 1A5VA 1CXUA 3MEDA 4C8MA 4DSFA 4CJWA 2KW4A 4OGEA 4F2RA 4CJTA 1D9DA 4CF9A 2Z1HA 3M8PA 4Y1DA 4ZHRA 1N6QA 4K8XA 4DFMA 4DSLA 3SQ1A 1S1VA 1HYZA 3KK3A 1VSEA 4NCBA 2ZQBA 2HW3A 2Z1JA 4LH4A 1D5AA 3ZT4A 4Z0UA 4E7JA 2E4LA 3TAGA 4IG0A 3RRGA 3DRPA 4CEFA 4CJFA 3UIQA 4W5RA 4FJ7A 1CZ9A 3U3YA 2FC0A 3OYJA 1S5JA 4O44A 1RT5A 5C42A 3SYZA 3PUFA 2FBTA 3DRRA 4E1MA 1HQEA 3CFRA 1IH7A 2P1JA 4LY7A 5C25A 4O4GA 3ZSOA 2Y1IA 4FZXC 4ID1A 1ASUA 4CFDA 2HNZA 1T05A 2P5OA 4FLXA 4W5TA 3SNNA 2JGUA 4LD0A 1XI1A 4FLWA 1FK9A 4FW1A 1Z25A 4LH5A 2G8FA 4FJ9A 1WSEA 3QESA 3K5LA 1HYSA 1W9HA 4M3TA 3QERA 4B3OA 4OLBA 2KQ2A 3TI0A 3PX0A 4BDYA 1JLFA 3SQ0A 4CESA 2OYQA 2KZMA 2E6MA 3QIPA 3I0SA 1IKYA 1RBVA 3DOKA 3TAMA 4CIGA 4GVMA 3L2VA 3HM9A 2YNFA 4DLEA 4N76A 2X78A 3PO4A 3MEEA 2GV9A 4KHYA 1WSJA 3NDKA 4CJKA 4ICLA 4OKEA 1BL3A 3RRHA 3T1AA 4CK2A 4R5PA 4KB0A 3KLFA 1JLEA 3C6UA 3TABA 4BE2A 4IKFA 2PYJA 1C6VA 3MAQA 3DLGA 5J2MA 4ELVA 4CJPA 1LAVA 2FBVA 4AHUA 1ZBHA 3QEIA 4N47A 3LPUA 1C0MA 3DLKA 3FFIA 5HROA 2KFZA 1B9DA 1REVA 1IKVA 4NCGA 1KCFA 3ZSZA 3SV3A 2O4GA 4DSIA 3HJFA 4DTPA 1SKWA 5HBMA 1NK6A 1IG9A 3NF8A 1EETA 1J9AA 2G8WA 1JLQA 4MQ3A 3SV4A 1L3TA 2WOMA 1QHTA 4RW8A 3AVNA 3OYCA 2X6SA 5D3GA 3RR8A 4DS5A 3QEWA 1QE1A 3SPZA 4I2QA 4B9LA 2DFHA 1LWEA 3VQPA 4M3RA 5KGWA 3KD5E 1I3AA 1RILA 2HVIA 1LAWA 4IFYA 3ZSWA 3TR8A 1TGOA 3PX4A 4CJEA 4QAGA 2ITGA 5E41A 1HRHA 4CGDA 1CXQA 1GOCA 1RBSA 1BCMA 3TAPA 4N41A 3OS1A 3V4IA 3P83D 4OPKA 4FM1A 3U3GA 1RBUA 4O0IA 1X9MA 1S6PA 1D9FA 2F8SA 1HJRA 3OJSA 1L3SA 2YHBA 4FLTA 1Q8IA 3KIOA 4CEBA 4DF8A 3VQ8A 4CHNA 3AVGA 3HSTB 1BISA 3L2RA 5FRMA 4F3OA 3ZSYA 4IG3A 5KI6A 2R7YA 1T8EA 4RW9A 1SL1A 5KRSA 2I5JA 4YFUA 1NJYA 1C1AA 2OZMA 4FZZA 4OVLA 2D0AA 3IG1A 2B6AA 4CF8A 3OYEA 3VQAA 4HUGA 3LWLA 2HHXA 2DTUA 4H4OA 4DFJA 3V9WA 1RNHA 3P1GA 1RTIA 2VWJA 2HVHA 1NK9A 3M8QA 1N5YA 5HP1A 1NOZA 3V1RA 1X9WA 3S3OA 4DMNA 4C8NA 4CIFA 2ZE2A 4FJXA 4KHUA 4CGFA 3TAFA 3NF9A 1RBRA 3AA5X 3KLEA 1Q9YA 1UOCA 1TKZA 3V81A 1XC9A 4HVJA 3TARA 3OYHA 3VQCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GOBA 3LDLA 3IFRA 2VG7A 2WC9A 4KB1A 3OBYA 3NAEA 2D4WA 1FJGK 3VERA 4DU1A 4JRPA 3S41A 4JEPA 1T3VA 4AM7A 2ASMA 4DB3A 4U7BA 2A6AA 3CJ9A 5B8HA 3EZ5A 1Z26A 1LOTB 2E6LA 3VGKA 2D5RA 5JS2A 1NOYA 4QOZB 5FPNA 5BRFA 4H5RA 3QEPA 1BHLA 4I9QA 1IKWA 2UUCK 3VQ5A 3TTCA 4FJLA 3J7AP 2ASPA 4DTXA 2HHTA 4RG8A 3VQQA 5GAHP 1MA9B 2HB5A 1JL2A 3BY5A 4TSXA 5AQVA 5M1OA 5KRTA 4HUFA 1GLDG 4JI3K 3H3OB 4EHUA 5FRNA 4WE1A 4YDUA 4AM6A 2ZJQL 2I7NA 1NBWA 4IO8A 1UAXA 4KHSA 3HXMA 4E7KA 2Z1GA 2W6KA 4I9LA 3R8EA 5CYQA 3UKRB 4E7IA 1Z05A 5C2FA 4BR0A 3BGRA 3BZKA 2G8IA 1RTHA 1JJ2M 3VF4A 1WAFA 3P31A 1NKCA 1ZBIA 4W5OA 2P9PB 4YDUC 4BRFA 1TK8A 3NE6A 3V9SA 4PL8A 1S6QA 2BGGA 4N5SA 2UUAK 1TL1A 4JK9A 3DXMB 5JVHL 3DLEA 3IS9A 2W40A 2P9NA 1VQ9N 4CEEA 3BP8A 2VWBA 3LZJA 3AGKA 4K25A 3LALA 3CG7A 4M3WA 2P5GA 1QTMA 4C8LA 1EWQA 4DV4K 3QO9A 1WSGA 5JVGL 3OYDA 3AA2A 4BRQA 3KWGA 3L3UA 2HHWA 5I3UA 1VQ5N 1KVAA 3OY9A 4J2AA 1VHXA 3O9TA 3DLHA 4FWNA 3CERA 2BH1A 4B1ZA 3FGUA 1VRTA 3M3ZA 4DTNA 1TV6A 1WSHA 1L3VA 2F9TA 4KKOA 4FVUA 3GE1A 4FJMA 5CYMA 4DQQA 2ZGZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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