1RBVA

Structural study of mutants of escherichia coli ribonuclease hi with enhanced thermostability
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADAKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural study of mutants of Escherichia coli ribonuclease HI with enhanced thermostability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RIBONUCLEASE H
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
source organism Escherichia coli
total genus 52
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1rbvA00
1A5VA 1XHXA 4M41A 2FBVA 4Z4GA 3VQ7A 1IKVA 4CJEA 4BE2A 3KLIA 3QO9A 2Y1IA 1R0AA 1KFSA 4CERA 1F21A 4B9UA 1TAQA 4UQGA 4F2SA 2G8IA 1LAVA 3IAYA 3CM6A 1SL0A 2Z1GA 2QXFA 3ZT3A 4F3TA 1G15A 2E6LA 4IFYA 3U3GA 4KO0A 4Z4CA 4R5PA 4CF8A 3VA0A 3SQ2A 1TKDA 5KGWA 1RTHA 2FBTA 3DLHA 2RKIA 4DG1A 2VWJA 2X6NA 5DMRA 3TI0A 2HHSA 2P1JA 1KCFA 2KZMA 3DMJA 4B3OA 1FXXA 1KVCA 1RTIA 1W0HA 1EKEA 2VG5A 5EU7A 4AHUA 1SV5A 4HUFA 4KB1A 3G10A 3OYHA 5DK5A 3NBPA 4LSNA 3OYIA 3DLBA 4C8LA 4FJ9A 2Z1IA 4JS4A 4BDZA 4Y1DA 3HPOA 3DRSA 2EHGA 4J2DA 1SKWA 1LWEA 4FJJA 1SL1A 3HK2A 3AA2A 3OYCA 3HXMA 3L3UA 3KLHA 4M42A 4NYFA 2QK9A 1RBRA 3ZSVA 3OYJA 4ELTA 1J9AA 4OKEA 1K6YA 2KFZA 1KSPA 3V1QA 2RN2A 4Q5VA 3QNNA 4QAGA 4CCHA 1N5YA 2XY8A 2IC3A 2YNGA 2JGUA 3S9HA 1C1AA 3HSTB 1HQUA 4K8ZA 1RCHA 3SQ4A 3HP9A 4H8KA 3KLGA 3PX6A 3NHGA 1QTMA 4B9TA 3TAFA 3AO2A 3LWLA 1BCOA 4W5RA 1JLEA 3ASMA 4FLZA 2FBXA 4AH9A 1L3SA 4B9SA 1VSMA 2KQ2A 3RMAA 1UA0A 3D0PA 4FJXA 4AHCA 3JYTA 3QINA 4NYNA 1I3AA 4DLGA 1BQMA 1VSKA 3VQ9A 4Z4IA 5C24A 4FLUA 3VQAA 3MAQA 3AVBA 4DFKA 4FJ8A 2X78A 1FKOA 1UOCA 2OYQA 1JXEA 3BGRA 4E7LA 3ZT4A 1HRHA 3EZ5A 2ATQA 3NFAA 1JL1A 4MQ3A 4BWJA 3T19A 3NGZA 3SPZA 2OPSA 3MXMA 1WLJA 1NKCA 4CJFA 4M3ZA 1BISA 3K5OA 1N6QA 1U45A 1TK0A 1HYZA 3L2UA 4DTPA 1TL3A 4E19A 5J2PA 3LANA 2NUBA 2DFHA 2KTQA 1Q8IA 1CZ9A 1EETA 1C0MA 4KFBA 4KRFA 3D45A 5HRSA 3QEXA 3U3YA 1LV5A 3LDSA 3K57A 2PY5A 2HHUA 3NH2A 3EYZA 3SQ1A 2BDPA 3DI6A 2HMIA 4O0IA 4CFAA 1X9SA 3PUFA 4B9VA 3DLKA 3AA5X 1QSSA 1QE1A 1WSJA 4AHRA 1SKRA 4W5QA 1ZBUA 3LP2A 1UWBA 3NF7A 4G1QA 4LY7A 4AHTA 3AO5A 4DTNA 4J2AA 3SI6A 3HPGA 3VN5A 2OZSA 4PY5A 3AVNA 4CJRA 3S3OA 2YV0X 2HHVA 3CM5A 3VA3A 3U6FA 1NOZA 3TARA 2HB5A 2Z1JA 2R7YA 3PO4A 4AHSA 1JL2A 4DSLA 3HYFA 1GOBA 4F2RA 1T05A 4KAZA 4KV8A 4CE9A 1NJXA 4FJNA 4N76A 2Q3SA 1ZBIA 2HW3A 5CZ1A 4CGFA 4OLBA 4M45A 4Z4EA 1HYSA 2KFNA 4FM0A 4DSIA 4KTZA 4CJPA 1RDBA 3OVNA 4FLYA 4KREA 2VG7A 2ZE2A 4DLEA 4FK4A 3L2RA 4KHQA 1TK5A 4CGHA 3HVRA 1IH7A 1WSFA 4DQSA 1VSIA 3SZ2A 2G8HA 3PY8A 1X9MA 1QS4A 3ZT2A 4CFCA 1NOYA 3VQCA 4E7IA 3ISNC 4B08A 1C0TA 2HNDA 3NE6A 4EZ9A 4FLWA 3VQDA 3M8SA 1HMVA 2BANA 4FZYA 4AHVA 4W5NA 2D0AA 1KLNA 4CK2A 3QESA 4OKKA 4RW4A 2Y1JA 2XO7A 3ZCMA 3LZJA 4M3WA 1SKSA 2AJQA 1BI4A 3CG7A 3V9ZA 1DTTA 5JS1A 1SL2A 3NAEA 4FJKA 3OYAA 3MECA 4DSEA 2DY4A 3QETA 1LW2A 2ZD1A 4KTWA 3KLFA 1WSEA 4KB0A 2QKBA 1X9WA 1TV6A 3SCXA 1B92A 1EP4A 1SUQA 2RF2A 4Z0UA 1NK9A 3I0RA 3C6TA 4C8OA 3IRXA 3ZT0A 1GOAA 1X1PA 1RDDA 1WNSA 4I7FA 4CJ4A 1U4BA 3L2VA 4EP5A 3TAPA 2IOCA 3V1OA 3AVFA 1WAJA 3NF8A 3IG1A 4CGGA 2G8FA 3OS1A 4CF0A 2W42A 3DLEA 3O4NA 3O3FA 4HHTA 4DQIA 4CHPA 3AVJA 1ZBFA 3QEIA 2HVHA 4CHZA 1Q9XA 1FK9A 4FCYA 2ZQBA 4CF9A 4CEAA 4C8NA 3HJFA 2I5JA 4DTJA 3HL8A 4JLHA 4O0JA 3V1RA 1XHZA 1JLFA 3NGYA 3ZSWA 2F8TA 4E7KA 1ZBHA 3LP3A 2OPPA 1NK6A 4DSJA 2P5GA 2X74A 4DFMA 2IDOA 3A2FA 3KKSA 2D0CA 1ASWA 3TWHA 3K2PA 2WOMA 3HP6A 4B9NA 1HQEA 1WSGA 1WAFA 1UA1A 2PYJA 3LPTA 1XC9A 3LAMA 3HT3A 5FRMA 2YKNA 3VQ6A 4BDYA 3V9UA 4CJLA 4IBNA 1HJRA 3RRGA 3HPHA 1J54A 2YNFA 3HVTA 1S9GA 4B9MA 4KI4A 3HO1A 2HHXA 4M3UA 3RR7A 4RW9A 1S1XA 4OGCA 4DS4A 1XWLA 2KZZA 3O3GA 2PZSA 4E1MA 3G0ZA 2Z1HA 3SUOA 1JLAA 4ICLA 4DTOA 4ELVA 1U47A 3K5LA 2G8KA 2JLEA 3OYNA 4IDKA 2LSNA 3F73A 3OYMA 3V9WA 4K8XA 4EP4A 5CY4A 1T8EA 5HBMA 3S3NA 3QIOA 4DTUA 4ZTJA 4FK2A 1C1BA 4E7JA 3TAEA 4FLVA 4ID1A 1L3VA 4ELUA 4HCCA 4O55A 1HNVA 3P5JA 4FJIA 4XIUA 3KD5E 2P5OA 1WSIA 1A5XA 1KVAA 3OYDA 3L3VA 3NH0A 4PWDA 4DTSA 4DF8A 3V81A 5FRNA 4B8CA 1S1VA 1VSFA 4CEDA 3K5MA 4W5TA 4MFBA 1Y97A 1QHTA 1S1TA 1VRUA 5J2NA 4M3YA 2A1SA 1BL3A 4OGEA 2IAJA 2DTUA 4NCAA 1IG9A 3VQ5A 1JKHA 1I39A 1S6PA 1S9EA 4CEFA 4IKFA 4O44A 2HNYA 2OPQA 3DM2A 5E41A 4JRPA 4PA1A 3PX0A 1DTQA 3DOLA 4BWMA 2HVIA 3C95A 4CJUA 4HVJA 5KI6A 3T3FA 2G8UA 1B9FA 4DFPA 1RT5A 3MEEA 5JS2A 4CGDA 2B4JA 3V4IA 4F3OA 4KHUA 3M8QA 3DRRA 3QEPA 1IO2A 1L3TA 1T03A 3LAKA 1WSHA 4I2PA 4RW8A 4OPJA 4FW2A 1YT3A 3LALA 4BACA 3AV9A 3LZIA 1LAWA 3THVA 3TANA 4DQQA 1YTUA 4HUGA 3UIQA 1ZBLA 3L2WA 1RTDA 4CJ3A 3P1GA 3ZSQA 4CJ5A 3WNHA 5T7BA 4DQRA 3ZSOA 4DWIA 1TL1A 3K5NA 4CECA 2RPIA 4B8AB 1VSLA 3EY1A 4C8MA 1TKXA 2G8VA 4LH5A 3I8DA 3OYBA 1BIZA 4O4GA 4PUOA 3M8PA 4DU3A 1VSEA 4KHNA 2D5RA 2OZMA 4FYDA 3VQPA 4ID5A 4KHYA 3DLRA 5HROA 1JLGA 5C42A 5C25A 1CZBA 3K58A 1RT3A 1RDAA 1FKPA 1ITGA 5HRNA 3C6UA 4DF4A 4CEZA 4FM2A 4CK3A 3V9XA 2IS3A 1T7PA 4FVMA 2EX3A 2XRIA 4I9QA 1S6QA 4CEOA 4YNQA 3E01A 4CESA 3SUPA 3SJJA 5FDLA 1L5UA 1Z26A 1Q9YA 1KRPA 3AVCA 3AVHA 1TVRA 2X6SA 1EXQA 1D9DA 1BQNA 2D0BA 1BIUA 2OPRA 1U49A 1JXBA 4NCBA 4CJKA 4WE1A 5D3GA 1RNHA 4CJVA 4HCBA 2B5JA 5CZ2A 4YFUA 2E4LA 2VG6A 2BGGA 5SWMA 3AVIA 4CIGA 1J5OA 4FZZA 1L3UA 1TKZA 3ZT1A 2FBYA 3I0SA 3CFRA 4FJMA 3SNNA 3AVAA 2KW4A 5KRTA 1IKYA 1GOCA 3VQ8A 2XHBA 4GVMA 1KLMA 4HTUA 3QEVA 4BDPA 3C94A 4ZHRA 2IGIA 1Z25A 2YNIA 4KPYA 3RMCA 1XI1A 5HRPA 4Q0BA 1TGOA 3K59A 1NJZA 3T1AA 4LH4A 5CYQA 3NF6A 5KRSA 4DTMA 2XY5A 2DFFA 2BE2A 2DFEA 1NJWA 5HLFA 1TK8A 2YHBA 1RBUA 5I42A 3SUNA 4E7HA 4DU1A 1JLBA 1NK7A 4IG0A 4CHQA 3KK2A 4AILC 3NCIA 3NGIA 3KKRA 3NF9A 4J2BA 2HHWA 4DFJA 4OPKA 4O5BA 4CF2A 3HM9A 3SPYA 1NK0A 1O1WA 3LP0A 1JLQA 3KK1A 3KTQA 4I9LA 4Y1CA 3MXIA 1ZYQA 3PX4A 3DYAA 3AVLA 3QIPA 4GW6A 1JLCA 4E1NA 3TAGA 4W5OA 4BE1A 1NK5A 2O4GA 1BHLA 2B6AA 3B6PA 1S5JA 3V9SA 3SYZA 1C1CA 2ITGA 4B9LA 4RW6A 3KD1E 4Z4HA 1RILA 1NKEA 5HRRA 4N5SA 5J1EA 3MEGA 1D9FA 4N56A 3TR8A 1YVUA 3ZSRA 3IS9A 4CFDA 2A1RA 1NK4A 2ETJA 1IKXA 2GBZA 4DS5A 4CF1A 4FJGA 1BCMA 4CHYA 4QOZB 4RG8A 3AO1A 1C0UA 1DLOA 3DOKA 4N47A 3JSMA 1QQCA 1VSJA 4FW1A 4IG3A 1KFDA 3AA3A 3TAQA 3ZSYA 1ASVA 3ITHA 3VQ4A 4F4KA 1TKTA 3NDKA 4TSXA 1REVA 2XY7A 4M3TA 3ZSZA 3O3HA 3OYGA 4Z4FA 3RWUA 4BE0A 3QLHA 4CEQA 3VQEA 4DSKA 1IKWA 4CEBA 1B9DA 4KTQA 1VRTA 1U04A 2O4IA 2HHTA 3L8BA 3OYLA 3SV3A 4JRQA 3RMBA 3VQBA 3PV8A 4FJLA 1MU2A 3AVKA 3TAMA 1EX4A 3QERA 3RMDA 3H08A 2HNZA 3RTVA 1VSHA 2F96A 4DU4A 2YNHA 4NCGA 1NKBA 1S1WA 3DLGA 1LWCA 1YTAA 1D5AA 4LSLA 5I3UA 4FLXA 1D8YA 2QKKA 3ALYA 4FM1A 3ULDA 3AVMA 4C8KA 1LWFA 1RT7A 1ASUA 3LP1A 4KHWA 2YKMA 5FROA 3OYFA 1RT6A 1LW0A 1C6VA 2E6MA 3LPUA 3BDPA 1RT2A 1BI4B 1QSYA 1RT1A 1NK8A 4JS5A 4E0DA 3OYKA 3PO5A 4DTXA 4CHNA 1RTJA 4CJQA 1UAXA 3O4QA 4FXDA 4PQUA 3CYMA 4CEEA 3QNOA 2GUIA 4F8RA 4QCLA 3KLEA 4DSFA 4H4MA 4KKOA 3WNEA 2FC0A 4FJ7A 4N41A 3OY9A 4M3RA 4OLAA 2F8SA 3DRPA 3M8RA 3QEWA 4CGJA 2XY6A 5KTQA 1CXUA 4OJRA 1RBTA 3OS0A 2G8WA 4EZ6A 3B6OA 1HPZA 4CFBA 4I2QA 4CJTA 1HYVA 3CFPA 4DTRA 3KJVA 3KK3A 4CK1A 4DMNA 1NJYA 3KIOA 4OKJA 3RRHA 1BGXT 4HUEA 1KVBA 1RBSA 1U48A 1W9HA 4M3XA 3WNGA 3SQ0A 5K14A 4FJHA 4J2EA 1RDCA 2GV9A 2WONA 4E89A 5KGXA 4CJWA 4FJ5A 3AA4A 4LD0A 3OS2A 4E3SA 3OJSA 5J2QA 4FZXC 3WNFA 3MXJA 4H4OA 4RW7A 4KI6A 3V6DA 3S3MA 2PYLA 1J53A 4GMJB 1CXQA 4KHSA 1S1UA 3CFOA 3TABA 3L2QA 1WN7A 3VQQA 3AO4A 3P83D 1TAUA 3AVGA 4ZTFA 4IFVA 4CIFA 3ZSXA 1A5WA 1KTQA 1RBVA 3OYEA 3SUQA 4CIEA 4L8RB 4OVLA 3SV4A 2YHAA 4FK0A 2HHQA 1VK0A 5CYMA 1QSLA 4DQPA 4CJSA 3LWMA 3CQ8A 5J2MA 3F9KA 2P51A 2OA8A 3NH1A 3RR8A 4CHOA 1RT4A 4CGIA 3FFIA 4FLTA 5SZTA 2VWKA 3OJUA 3MEDA 1VSDA 1CLQA 3AO3A 5HP1A 1HNIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XHXA 4M41A 3VGMA 4FWNA 4CJEA 3CCSN 5GAGP 1F21A 3HTVA 3IAYA 4A5AA 4GKKK 3ULEB 3MX5A 4KO0A 3VA0A 4CF8A 4H5VA 2QM1A 2F9TA 2HHSA 3DMJA 3VERA 1KVCA 5GADP 2VG5A 4BVPA 4HUFA 2O8BA 4BY9C 5DK5A 3NBPA 2VGMA 4A57A 4FWMA 5AQLA 3CXCM 1DGKN 2NRVA 4M7XA 2EHGA 3VOVA 5FPEA 5DM7L 1LWEA 3KLHA 3TTCA 4C23A 3ZETA 3VEOA 3EE8A 4YOXA 4CZHA 3EKUA 3UKUB 3V1QA 4AQYK 2YX6A 4U67L 4CCHA 5AZJA 1C1AA 1W7AA 3HP9A 3NHGA 1BCOA 4W5RA 2F4VK 3MN7A 3N4PA 4FJXA 3JYTA 2ZGYA 4NYNA 4BGAA 1TUUA 4FJ8A 3MAQA 2D0PA 1WOQA 2GUPA 2OYQA 1SQKA 3BGRA 4E7LA 4JI7K 3NGZA 2KHOA 1TYQB 4M3ZA 3O9TA 1TK0A 4FWPA 4DTPA 2KTQA 3HM8A 3TTFA 2HF4A 5TKYA 3BZKA 3LANA 2HSTA 1C0MA 4KRFA 1LV5A 3QB0A 3K57A 3SQ1A 2BDPA 2HMIA 3VEXA 4O0IA 4CFAA 2YHWA 1QSSA 1WSJA 4AHRA 4W5QA 5AQFA 1UWBA 4LY7A 1XNQK 4BC5A 3T69A 2OZSA 4GV6A 2NRRA 2HHVA 4DR5K 4KHPK 2HB5A 1N8RO 2OCEA 1ZBIA 1K9MO 2A6AA 3L6QA 3ATUA 4JNEA 3D2FA 4ILGB 4DSIA 4CJPA 1RDBA 3OVNA 4FLYA 1TK5A 4CGHA 2E2OA 3CC7N 4BC4A 1VSIA 3PIOL 2G8HA 1QS4A 4CFCA 3VQCA 3ISNC 3LDLA 3VQDA 4IJAA 4FZYA 4AHVA 3Q7BA 2QI2A 4CK2A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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